View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0619_high_22 (Length: 308)

Name: NF0619_high_22
Description: NF0619
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0619_high_22
NF0619_high_22
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (1-271)||(22449064-22449334)
chr1 (1-268)||(17678386-17678651)
chr1 (1-257)||(8761431-8761688)
chr1 (1-269)||(18181919-18182187)
chr1 (1-268)||(3704863-3705130)
chr1 (1-268)||(45489542-45489809)
chr1 (1-231)||(24782899-24783129)
chr1 (1-268)||(18393762-18394031)
chr1 (1-193)||(21022767-21022959)
chr1 (1-268)||(45310165-45310434)
chr1 (1-228)||(16080243-16080470)
chr1 (1-201)||(22831176-22831375)
chr1 (1-218)||(36819107-36819323)
chr1 (1-201)||(6151976-6152176)
chr1 (131-225)||(20229074-20229168)
chr1 (1-186)||(42865009-42865195)
chr1 (131-231)||(33797358-33797458)
chr1 (81-235)||(3472804-3472957)
chr1 (170-257)||(21788009-21788097)
chr1 (162-268)||(33049985-33050091)
chr1 (1-232)||(33797610-33797840)
chr1 (170-269)||(22468663-22468763)
chr1 (1-231)||(1010800-1011030)
chr1 (151-231)||(20228757-20228838)
chr1 (1-231)||(19211943-19212174)
chr1 (163-231)||(1925095-1925160)
chr1 (163-231)||(20924109-20924174)
chr1 (151-231)||(16375406-16375487)
chr1 (151-231)||(21407432-21407513)
chr1 (163-212)||(39244107-39244156)
chr1 (163-212)||(39247662-39247711)
chr1 (163-212)||(41388207-41388256)
chr1 (151-231)||(52639618-52639699)
chr1 (1-212)||(21714659-21714871)
chr1 (131-199)||(1925394-1925462)
chr1 (131-199)||(20924408-20924476)
chr1 (1-105)||(33049886-33049989)
chr1 (1-59)||(21305563-21305621)
chr1 (3-128)||(20091273-20091398)
chr1 (1-37)||(22468494-22468530)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-269)||(18907161-18907429)
chr6 (1-268)||(20907780-20908047)
chr6 (1-268)||(18180545-18180810)
chr6 (7-262)||(22408110-22408363)
chr6 (1-256)||(21834688-21834941)
chr6 (1-268)||(27567408-27567675)
chr6 (1-231)||(17804274-17804504)
chr6 (2-268)||(19790579-19790845)
chr6 (1-231)||(22429829-22430059)
chr6 (175-269)||(21766745-21766839)
chr6 (148-269)||(16523330-16523450)
chr6 (1-201)||(21739820-21740020)
chr6 (1-173)||(22059541-22059713)
chr6 (131-231)||(23414721-23414821)
chr6 (131-231)||(27556479-27556579)
chr6 (131-225)||(31478075-31478169)
chr6 (1-231)||(25766967-25767197)
chr6 (131-225)||(1644455-1644549)
chr6 (163-269)||(27325569-27325677)
chr6 (131-231)||(27416123-27416223)
chr6 (1-231)||(14472347-14472577)
chr6 (167-257)||(22074176-22074267)
chr6 (1-215)||(25641981-25642196)
chr6 (3-201)||(15894229-15894427)
chr6 (1-110)||(27553406-27553515)
chr6 (1-231)||(22863023-22863253)
chr6 (1-111)||(27415741-27415851)
chr6 (151-231)||(1644782-1644863)
chr6 (163-231)||(16760370-16760435)
chr6 (151-228)||(19870670-19870748)
chr6 (163-231)||(31477776-31477841)
chr6 (151-231)||(8243938-8244019)
chr6 (151-231)||(11566939-11567020)
chr6 (163-212)||(22949199-22949248)
chr6 (163-212)||(22953155-22953204)
chr6 (151-231)||(23395145-23395226)
chr6 (163-212)||(23871643-23871692)
chr6 (163-212)||(23875599-23875648)
chr6 (1-216)||(16741298-16741513)
chr6 (131-199)||(16760068-16760136)
chr6 (151-230)||(18917214-18917294)
chr6 (1-212)||(19863089-19863301)
chr6 (1-212)||(19873231-19873443)
chr6 (132-199)||(22948881-22948948)
chr6 (132-199)||(22952837-22952904)
chr6 (132-199)||(23871325-23871392)
chr6 (132-199)||(23875281-23875348)
chr6 (151-218)||(23990011-23990078)
chr6 (151-225)||(12618793-12618867)
chr6 (163-231)||(16624207-16624272)
chr6 (151-231)||(18955711-18955792)
chr6 (1-90)||(23657219-23657308)
chr6 (135-199)||(14472044-14472108)
chr6 (135-199)||(18956032-18956096)
chr6 (1-128)||(16523201-16523328)
chr6 (1-51)||(22439073-22439123)
chr6 (159-257)||(15041508-15041605)
chr6 (1-37)||(16924677-16924713)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-263)||(15143-15404)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (1-263)||(4486-4748)
scaffold0676 (163-231)||(526-591)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-269)||(12321540-12321808)
chr7 (1-268)||(2760182-2760449)
chr7 (1-268)||(3271874-3272141)
chr7 (1-268)||(9445957-9446224)
chr7 (1-263)||(14429939-14430200)
chr7 (1-231)||(11312725-11312955)
chr7 (1-268)||(20569395-20569662)
chr7 (2-231)||(12318204-12318433)
chr7 (150-269)||(2832389-2832508)
chr7 (150-269)||(9751703-9751821)
chr7 (1-231)||(15580768-15580998)
chr7 (1-128)||(17137861-17137988)
chr7 (150-269)||(39267847-39267966)
chr7 (2-269)||(15605072-15605332)
chr7 (131-224)||(25927432-25927525)
chr7 (1-231)||(13635268-13635498)
chr7 (131-231)||(13918709-13918809)
chr7 (131-231)||(1859015-1859115)
chr7 (166-231)||(7519322-7519387)
chr7 (7-231)||(16583333-16583556)
chr7 (1-128)||(12187208-12187335)
chr7 (1-231)||(33184-33414)
chr7 (1-231)||(70564-70794)
chr7 (1-231)||(74673-74903)
chr7 (151-231)||(39722343-39722424)
chr7 (151-228)||(16114321-16114399)
chr7 (151-228)||(16117474-16117552)
chr7 (163-231)||(18425513-18425578)
chr7 (1-111)||(42205311-42205421)
chr7 (163-231)||(45169972-45170037)
chr7 (151-231)||(12714941-12715022)
chr7 (151-231)||(12718745-12718826)
chr7 (151-231)||(16907149-16907230)
chr7 (151-231)||(18279480-18279561)
chr7 (151-231)||(18283443-18283524)
chr7 (1-231)||(9593421-9593652)
chr7 (1-231)||(9644384-9644615)
chr7 (151-218)||(12723670-12723737)
chr7 (132-199)||(45170272-45170339)
chr7 (1-108)||(48593255-48593362)
chr7 (151-231)||(12704607-12704688)
chr7 (151-231)||(26292472-26292553)
chr7 (131-195)||(15083973-15084037)
chr7 (131-199)||(39722039-39722107)
chr7 (2-231)||(18858-19088)
chr7 (1-112)||(13461957-13462068)
chr7 (134-231)||(2530322-2530420)
chr7 (1-202)||(9703386-9703588)
chr7 (1-43)||(10508880-10508922)
chr7 (163-268)||(42204045-42204151)
chr7 (1-37)||(18154634-18154670)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-257)||(20465837-20466093)
chr8 (1-268)||(22010477-22010740)
chr8 (1-268)||(16861125-16861390)
chr8 (2-269)||(30643090-30643358)
chr8 (1-257)||(17926505-17926760)
chr8 (1-268)||(15602815-15603082)
chr8 (1-263)||(15611267-15611529)
chr8 (81-257)||(16410133-16410308)
chr8 (4-201)||(377399-377596)
chr8 (1-268)||(20856223-20856491)
chr8 (1-201)||(24755842-24756042)
chr8 (131-231)||(14398038-14398138)
chr8 (1-186)||(19899230-19899416)
chr8 (1-186)||(19983228-19983414)
chr8 (81-201)||(19259460-19259580)
chr8 (81-257)||(23776713-23776890)
chr8 (1-111)||(39094740-39094850)
chr8 (1-231)||(16231274-16231505)
chr8 (163-231)||(18862611-18862676)
chr8 (163-231)||(21827980-21828045)
chr8 (151-231)||(19278231-19278312)
chr8 (162-231)||(21383729-21383798)
chr8 (151-231)||(21972533-21972614)
chr8 (151-231)||(21976618-21976699)
chr8 (151-231)||(22111928-22112009)
chr8 (140-268)||(39094861-39094990)
chr8 (151-231)||(43251890-43251971)
chr8 (131-199)||(21828279-21828347)
chr8 (132-199)||(18862911-18862978)
chr8 (152-231)||(21387149-21387228)
chr8 (1-100)||(23834381-23834480)
chr8 (163-231)||(21411025-21411090)
chr8 (163-231)||(21805517-21805582)
chr8 (1-218)||(22028647-22028864)
chr8 (1-189)||(16184860-16185049)
chr8 (131-199)||(21410723-21410791)
chr8 (131-199)||(21805215-21805283)
chr8 (1-120)||(19976647-19976766)
chr8 (1-51)||(21161856-21161906)
chr8 (170-230)||(18678069-18678130)
chr8 (1-42)||(19259399-19259440)
chr8 (170-230)||(32121825-32121886)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-254)||(19090-19344)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-257)||(18454-18710)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-268)||(1288-1555)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-268)||(30543-30808)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-269)||(16919-17178)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (3-257)||(46527-46781)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-263)||(21367-21629)
scaffold0037 (131-225)||(80619-80713)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (3-269)||(209-476)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-268)||(23451399-23451664)
chr5 (1-263)||(23462909-23463169)
chr5 (1-263)||(23458648-23458908)
chr5 (1-269)||(21366464-21366731)
chr5 (1-268)||(24221928-24222195)
chr5 (1-268)||(22757176-22757443)
chr5 (1-268)||(12028364-12028631)
chr5 (2-268)||(1858776-1859042)
chr5 (150-269)||(24767493-24767612)
chr5 (1-257)||(20805614-20805868)
chr5 (1-268)||(26680633-26680897)
chr5 (1-268)||(26952240-26952504)
chr5 (1-268)||(17918950-17919217)
chr5 (84-254)||(20767039-20767207)
chr5 (131-231)||(18356033-18356133)
chr5 (131-231)||(20911100-20911200)
chr5 (1-129)||(23572272-23572400)
chr5 (1-128)||(22032510-22032637)
chr5 (5-128)||(18769806-18769929)
chr5 (131-225)||(10753111-10753205)
chr5 (1-268)||(123104-123371)
chr5 (1-246)||(18356390-18356634)
chr5 (1-108)||(17410647-17410754)
chr5 (146-231)||(17410517-17410603)
chr5 (1-186)||(14079283-14079469)
chr5 (1-111)||(20910599-20910709)
chr5 (1-251)||(21873322-21873570)
chr5 (1-231)||(23535388-23535616)
chr5 (163-231)||(10753439-10753504)
chr5 (151-231)||(20295924-20296005)
chr5 (131-199)||(11220521-11220589)
chr5 (131-199)||(11228930-11228998)
chr5 (131-199)||(11230919-11230987)
chr5 (3-201)||(23501145-23501344)
chr5 (133-199)||(11226940-11227006)
chr5 (151-231)||(19472668-19472749)
chr5 (1-217)||(37724008-37724225)
chr5 (131-195)||(11225111-11225175)
chr5 (1-111)||(31342315-31342424)
chr5 (151-231)||(15236728-15236809)
chr5 (1-137)||(26704251-26704387)
chr5 (1-137)||(26973984-26974120)
chr5 (131-199)||(40723852-40723920)
chr5 (1-108)||(20232750-20232857)
chr5 (1-145)||(33409391-33409535)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-268)||(24174851-24175118)
chr2 (1-268)||(24655137-24655404)
chr2 (1-268)||(24716329-24716594)
chr2 (1-268)||(21327365-21327633)
chr2 (1-268)||(25961333-25961600)
chr2 (1-268)||(21318434-21318702)
chr2 (1-269)||(22811710-22811978)
chr2 (81-257)||(25963595-25963770)
chr2 (174-266)||(21916070-21916162)
chr2 (9-268)||(24869931-24870190)
chr2 (1-268)||(40428514-40428783)
chr2 (5-225)||(19688559-19688779)
chr2 (1-231)||(24735480-24735710)
chr2 (1-173)||(44370097-44370269)
chr2 (81-268)||(37524726-37524905)
chr2 (131-231)||(31344953-31345053)
chr2 (1-215)||(22740758-22740973)
chr2 (1-257)||(22798924-22799181)
chr2 (170-257)||(23019673-23019761)
chr2 (1-231)||(10101444-10101674)
chr2 (1-172)||(21918114-21918285)
chr2 (1-71)||(45677953-45678023)
chr2 (1-201)||(24673697-24673897)
chr2 (163-231)||(1283464-1283529)
chr2 (163-231)||(30344957-30345022)
chr2 (151-231)||(41530958-41531035)
chr2 (151-231)||(12901460-12901541)
chr2 (151-231)||(24649434-24649515)
chr2 (151-231)||(27601873-27601954)
chr2 (151-231)||(24628427-24628508)
chr2 (151-231)||(27379381-27379462)
chr2 (151-231)||(27383427-27383508)
chr2 (131-199)||(41531269-41531337)
chr2 (1-212)||(22758513-22758725)
chr2 (131-199)||(30345256-30345324)
chr2 (131-199)||(1283162-1283230)
chr2 (167-230)||(25616278-25616342)
chr2 (1-128)||(23038229-23038356)
chr2 (151-201)||(15477711-15477761)
chr2 (1-51)||(40622006-40622056)
chr2 (157-201)||(45678074-45678118)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-272)||(5633-5903)
scaffold0476 (1-272)||(6828-7098)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-268)||(413849-414116)
scaffold0003 (131-231)||(71138-71238)
scaffold0003 (1-111)||(71510-71620)
scaffold0003 (1-100)||(139918-140017)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (1-268)||(11557183-11557450)
chr3 (1-268)||(12037751-12038018)
chr3 (1-268)||(1982609-1982876)
chr3 (1-268)||(12496308-12496575)
chr3 (1-269)||(18383715-18383982)
chr3 (1-269)||(19725710-19725977)
chr3 (1-257)||(11298327-11298582)
chr3 (1-268)||(11594938-11595205)
chr3 (95-263)||(11851637-11851805)
chr3 (1-263)||(322648-322909)
chr3 (81-269)||(11862843-11863031)
chr3 (1-231)||(20461299-20461529)
chr3 (150-269)||(14665451-14665570)
chr3 (1-268)||(3389734-3390002)
chr3 (1-201)||(16369528-16369728)
chr3 (1-201)||(16909870-16910070)
chr3 (150-269)||(14668607-14668726)
chr3 (1-269)||(3402754-3403023)
chr3 (1-231)||(326963-327193)
chr3 (2-231)||(7793146-7793378)
chr3 (1-111)||(26190807-26190917)
chr3 (1-201)||(15060412-15060612)
chr3 (1-128)||(856329-856456)
chr3 (1-231)||(2897622-2897852)
chr3 (1-201)||(15051636-15051836)
chr3 (1-231)||(15482740-15482969)
chr3 (131-231)||(5223140-5223240)
chr3 (131-231)||(12339542-12339642)
chr3 (131-225)||(4589038-4589132)
chr3 (131-231)||(11300695-11300795)
chr3 (131-231)||(15464941-15465041)
chr3 (131-225)||(19775515-19775609)
chr3 (81-268)||(42325992-42326180)
chr3 (1-231)||(14499405-14499635)
chr3 (1-231)||(30066026-30066256)
chr3 (118-201)||(12172924-12173007)
chr3 (1-231)||(55022947-55023177)
chr3 (1-230)||(11300310-11300539)
chr3 (1-231)||(15849884-15850113)
chr3 (1-231)||(11165328-11165558)
chr3 (163-231)||(4111215-4111280)
chr3 (50-227)||(11854817-11854994)
chr3 (163-231)||(15965047-15965112)
chr3 (163-231)||(15968971-15969036)
chr3 (163-231)||(15972895-15972960)
chr3 (163-231)||(16750554-16750619)
chr3 (163-231)||(19775843-19775908)
chr3 (163-231)||(37439602-37439667)
chr3 (151-231)||(7109778-7109859)
chr3 (151-231)||(7113713-7113794)
chr3 (151-231)||(22321744-22321825)
chr3 (151-231)||(22336799-22336880)
chr3 (151-231)||(27409592-27409673)
chr3 (151-231)||(28949804-28949885)
chr3 (188-231)||(8489458-8489501)
chr3 (132-199)||(15964745-15964812)
chr3 (132-199)||(15968669-15968736)
chr3 (132-199)||(15972593-15972660)
chr3 (1-108)||(31097353-31097460)
chr3 (163-231)||(4107363-4107428)
chr3 (151-231)||(11070148-11070229)
chr3 (151-231)||(15617454-15617535)
chr3 (179-231)||(11854493-11854545)
chr3 (131-199)||(37439901-37439969)
chr3 (1-100)||(17242180-17242279)
chr3 (132-201)||(23053006-23053076)
chr3 (170-230)||(12511150-12511211)
chr3 (170-230)||(46822358-46822419)
chr3 (1-37)||(15877626-15877662)
chr3 (1-145)||(38814547-38814691)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (4-268)||(422333-422597)
scaffold0001 (1-231)||(173367-173597)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-269)||(1882-2151)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-269)||(1544-1811)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (25-257)||(5338803-5339036)
chr4 (1-268)||(15353105-15353373)
chr4 (1-257)||(16356751-16357006)
chr4 (1-269)||(16487876-16488144)
chr4 (1-268)||(16351647-16351914)
chr4 (1-268)||(11250360-11250627)
chr4 (4-257)||(16348466-16348718)
chr4 (1-268)||(25555556-25555823)
chr4 (150-269)||(13812966-13813085)
chr4 (150-269)||(20157407-20157526)
chr4 (1-231)||(36133761-36133991)
chr4 (1-201)||(12570142-12570342)
chr4 (131-231)||(43256342-43256442)
chr4 (1-231)||(17810349-17810579)
chr4 (1-186)||(23843613-23843799)
chr4 (1-256)||(15093838-15094094)
chr4 (3-186)||(44675767-44675951)
chr4 (1-232)||(43255960-43256190)
chr4 (1-231)||(14757221-14757451)
chr4 (163-225)||(15224962-15225024)
chr4 (150-231)||(22634369-22634451)
chr4 (163-231)||(10712928-10712993)
chr4 (163-231)||(10926698-10926763)
chr4 (151-231)||(5756886-5756967)
chr4 (151-231)||(9556607-9556688)
chr4 (163-212)||(12487802-12487851)
chr4 (163-212)||(14954133-14954182)
chr4 (163-212)||(25689961-25690010)
chr4 (5-231)||(1951564-1951791)
chr4 (132-199)||(14954433-14954500)
chr4 (132-199)||(25689643-25689710)
chr4 (151-225)||(33742461-33742535)
chr4 (151-231)||(4561282-4561363)
chr4 (151-231)||(27534103-27534184)
chr4 (131-199)||(10712629-10712697)
chr4 (131-199)||(10926399-10926467)
chr4 (131-199)||(12487484-12487552)
chr4 (114-179)||(15125064-15125130)
chr4 (179-231)||(17152464-17152516)
chr4 (1-100)||(23139478-23139577)
chr4 (1-202)||(13569631-13569833)
chr4 (1-37)||(15124952-15124988)
chr4 (135-199)||(27533799-27533863)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-269)||(443-711)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (1-263)||(1848-2109)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (31-268)||(7522-7759)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (1-268)||(2234-2502)
scaffold0439 (1-268)||(10094-10362)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-257)||(959-1214)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (115-269)||(6221-6375)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (81-257)||(1892-2067)
scaffold0104 (81-266)||(9566-9749)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (81-256)||(6294-6468)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (81-269)||(42677-42860)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-231)||(66214-66444)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-231)||(53642-53872)
scaffold0031 (163-231)||(36052-36117)
scaffold0031 (131-199)||(36351-36419)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (1-268)||(8611-8878)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-201)||(6876-7076)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (81-257)||(44143-44318)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (1-268)||(340-597)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-154)||(485-638)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (150-269)||(9990-10109)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-154)||(45272-45425)
scaffold0109 (151-231)||(35891-35971)
scaffold0109 (135-199)||(36209-36273)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-268)||(35309-35577)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (150-269)||(2955-3074)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-268)||(4023-4292)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-137)||(21604-21740)
scaffold0210 (1-137)||(29496-29632)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-231)||(12981-13211)
scaffold0044 (1-231)||(19265-19495)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (162-269)||(73727-73833)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-263)||(192115-192378)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-201)||(2960-3160)
scaffold0158 (1-201)||(6626-6826)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (131-263)||(207767-207901)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (3-217)||(13288-13501)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-254)||(16147-16400)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (174-257)||(33609-33693)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (131-231)||(30960-31060)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-128)||(2070-2197)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (2-268)||(7070-7336)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (1-128)||(12952-13079)
scaffold0029 (131-225)||(80462-80556)
scaffold0029 (1-231)||(80790-81019)
scaffold0029 (151-231)||(65476-65557)
scaffold0029 (151-231)||(61560-61641)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-231)||(2472-2701)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (84-201)||(34791-34908)
scaffold0042 (1-39)||(34708-34746)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (131-231)||(6756-6856)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (1-240)||(11457-11687)
scaffold0410 (175-268)||(2219-2313)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (7-257)||(38283-38534)
scaffold0023 (115-231)||(23578-23695)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-207)||(10383-10588)
scaffold0004 (1-212)||(69905-70117)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (4-207)||(9467-9670)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (131-231)||(20394-20494)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-231)||(19816-20047)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-231)||(228172-228403)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-231)||(18431-18661)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-186)||(3877-4062)
scaffold0149 (1-186)||(8308-8493)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-127)||(7485-7611)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (178-257)||(4779-4859)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-231)||(3675-3904)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (118-201)||(13992-14075)
scaffold0056 (1-39)||(13875-13913)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-202)||(15467-15669)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (151-231)||(5049-5130)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (7-233)||(1031-1258)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (163-231)||(472-537)
[»] scaffold0229 (2 HSPs)
scaffold0229 (163-231)||(11467-11532)
scaffold0229 (131-199)||(11766-11834)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (163-231)||(14053-14118)
scaffold0141 (131-199)||(14352-14420)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-202)||(20102-20304)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (115-212)||(32544-32642)
scaffold0111 (1-37)||(32719-32755)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (163-231)||(189343-189408)
scaffold0012 (1-205)||(24767-24971)
scaffold0012 (131-199)||(189642-189710)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (163-212)||(32626-32675)
scaffold0157 (131-199)||(32925-32993)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-102)||(5799-5900)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (151-231)||(58667-58748)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-231)||(12499-12729)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-72)||(15217-15288)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (59-268)||(15066-15276)
scaffold0017 (59-268)||(19588-19798)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (1-231)||(5-236)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-231)||(3329-3560)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-186)||(18251-18437)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (151-204)||(956-1009)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (84-212)||(36567-36696)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-51)||(15672-15722)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-51)||(1611-1661)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-51)||(48258-48308)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (3-224)||(174864-175086)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (3-51)||(6374-6422)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-37)||(8755-8791)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-145)||(10066-10210)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22449064 - 22449334
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| || ||| ||    
T  22449064 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacata 22449163  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22449164 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaatg 22449263  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctact 271  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22449264 atcaagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctact 22449334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17678386 - 17678651
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  17678386 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 17678485  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||| | |  ||| ||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17678486 tttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 17678584  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17678585 attaagatgttgttgaaatgaattgttgttatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgct 17678651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 8761431 - 8761688
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  8761431 cgcctcgcgaacacttccagaactgagtgcttttgagaacgtcgtgacctgagttgcttggattggttaggaatggaactttaggtagtagtgaaaccta 8761530  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||   || |||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  8761531 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaata 8761630  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8761631 atcaagatgttgttgaaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctg 8761688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18181919 - 18182187
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||||| |||  ||| |||||||||| || ||| |    
T  18181919 cgccttgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatgg-actcttaggtagtaatgtgactt 18182017  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
       ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||  || ||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18182018 gtataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaat 18182117  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18182118 gatcaagatgttgttgaaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcta 18182187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 3704863 - 3705130
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||| |||| ||| ||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  3704863 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcttttgacaatgttatgacctgatttgtttggattggctaggaatggaactttaggtagtaatgaaaccta 3704962  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  3704963 tttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 3705062  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3705063 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgct 3705130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 45489542 - 45489809
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  45489542 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatg-gacattaggtagtaatgaaaccta 45489640  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||||     
T  45489641 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaata 45489740  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  45489741 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 45489809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24782899 - 24783129
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||| |   | || |||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||    
T  24782899 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaagttatagtgagaccta 24782998  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||  |||||||  |||||||| || ||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24782999 cttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattattattgaatg 24783097  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24783098 atcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 24783129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 18393762 - 18394031
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  18393762 cgcctcgcgagcacttatagaacggagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgaccta 18393861  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  18393862 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaata 18393961  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaa--tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  || ||||||||||    ||||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  18393962 accttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 18394031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21022959 - 21022767
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||   | |||||||||| || ||||||    
T  21022959 cgcctcgcgagcacttccagaactcagtactagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 21022860  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatatta 193  Q
      |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21022859 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcattacttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 45310165 - 45310434
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||    
T  45310165 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggccta 45310264  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||||     
T  45310265 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgcttgatttattcttgaata 45310364  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  || ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  45310365 accttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 45310434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16080243 - 16080470
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  16080243 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcattcgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 16080342  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||  ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16080343 tttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattggatg 16080441  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgata 228  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16080442 atcaagaagttgttgaaaatgaattgata 16080470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22831176 - 22831375
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||| ||||| |||  ||| |||||||||| || |||||    
T  22831176 cgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatg-gactcttaggtagtaatgtgacct 22831274  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||||||||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22831275 atataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtt-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 22831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36819107 - 36819323
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  36819107 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 36819206  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||   ||  | ||||||||   ||||||| |||| || |||||||| |||| |||| | |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36819207 tttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgattatattgtgatttatttattgattgcatttcttgaattattattgaatg 36819305  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaa 218  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36819306 atcaagaagttgttgaaa 36819323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6152176 - 6151976
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  | || |||||| |||||| || || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||| || |||||    
T  6152176 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatgg-actcttaggtagtaatgtgacct 6152078  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6152077 atataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttagtgaat 6151978  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  6151977 ga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 20229074 - 20229168
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229074 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 20229168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42865009 - 42865195
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  42865009 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 42865108  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42865109 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 42865195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33797458 - 33797358
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33797458 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 33797359  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  33797358 a 33797358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3472957
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||    | |||||||||||  |||||||| || ||| ||| ||  |||||| |||||||||||  || |||    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgaccta-ttaagatgttaatgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaatt 3472902  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaa 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3472903 acttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaagtgatttgatattatgaa 3472957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 257
Target Start/End: Original strand, 21788009 - 21788097
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  21788009 ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctg 21788097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 268
Target Start/End: Original strand, 33049985 - 33050091
Alignment:
Q  162 tttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 261  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33049985 tttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgatgaaatggattgttattatgaaattatgaagttgttgtgatctgatta 33050084  T
Q  262 tgttgct 268  Q
    || ||||    
T  33050085 tgctgct 33050091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33797840 - 33797610
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||| |||||||  |  || ||||||| || |||||||||    
T  33797840 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattaattaggagaggaaccttaggtactaatgagaccta 33797741  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatatta-ttgaat 199  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||   || |||| |||| || ||||||||||||| | ||||| || | |||||||||| ||  |||| ||||||    
T  33797740 tttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgtt-aagtgattataatgtgatataatg-ttttatgcattactt-aagaattatttgaat 33797644  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattat 232  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33797643 attcaagatgttgttgaattgaaattgatattat 33797610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 22468663 - 22468763
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22468663 ttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct 22468762  T
Q  269 a 269  Q
    |    
T  22468763 a 22468763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1011030 - 1010800
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  1011030 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 1010931  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1010930 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 1010832  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  1010831 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 1010800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 20228757 - 20228838
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20228757 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 20228838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19212174 - 19211943
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  19212174 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgcttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 19212075  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
       ||||| ||| |||  | ||||||||   ||||||| |||| || ||||||||| |||  |||  ||||  ||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  19212074 taaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaat 19211976  T
Q  200 gatcaagatgttgttga-aatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  19211975 gatcaagaaattgttgagaatgaattgttatta 19211943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 1925095 - 1925160
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  1925095 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 1925160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 20924109 - 20924174
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  20924109 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 20924174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 16375406 - 16375487
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  16375406 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 16375487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21407513 - 21407432
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21407513 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 21407432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 39244107 - 39244156
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244107 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 39244156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 39247662 - 39247711
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247662 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 39247711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 41388207 - 41388256
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388207 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 41388256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52639699 - 52639618
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  52639699 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 52639618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21714871 - 21714659
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |   || |||||| || || ||| ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  21714871 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 21714772  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||  |||||   |||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  21714771 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 21714672  T
Q  200 gatcaagatgttg 212  Q
    |||  ||||||||    
T  21714671 gattgagatgttg 21714659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 1925394 - 1925462
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1925394 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 1925462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 20924408 - 20924476
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  20924408 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 20924476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 33049886 - 33049989
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  33049886 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtaacctgagttgaatgaattgattaggaatg-aacattaggtagtaatgaaaccta 33049984  T
Q  101 attaa 105  Q
     ||||    
T  33049985 tttaa 33049989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 21305621 - 21305563
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgctt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||    
T  21305621 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctt 21305563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 20091273 - 20091398
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| || || | | |||||| |  |||   | || ||||||| ||||||||| |    
T  20091273 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatt 20091372  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||    
T  20091373 taagaagttaactgcaatctgtgaag 20091398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22468494 - 22468530
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22468494 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 22468530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18907429 - 18907161
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  18907429 cgcctcgcgagcacttccagaacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 18907330  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907329 tttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 18907230  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18907229 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcta 18907161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20907780 - 20908047
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  20907780 cgcctcacgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaaccta 20907879  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||  |||||| ||||| |||| ||| |||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  20907880 tttaagatgttaactagaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatg 20907979  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20907980 atcaagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 20908047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18180810 - 18180545
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  18180810 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 18180711  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||| | |  ||| | ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18180710 tttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 18180612  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180611 attaagatgttgttgaaatgaattgttgttatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgct 18180545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Original strand, 22408110 - 22408363
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaag 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| || |||||    
T  22408110 gcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaac-ttaggtagtagtaagacttatttaag 22408208  T
Q  107 atgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaag 206  Q
    |||||   || |||||||||    ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22408209 atgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctag 22408307  T
Q  207 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 262  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  22408308 atgttgttgaaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattat 22408363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21834688 - 21834941
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | ||||||||||| |||   | ||  |||||| |  ||||||    
T  21834688 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgaccta 21834787  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  21834788 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattattgaatg 21834885  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatct 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21834886 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatct 21834941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 27567408 - 27567675
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   || | ||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  27567408 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgttttttataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgcttaggaatggaacattaggtagtactgaaaccta 27567507  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  |||  ||||||     
T  27567508 tttaagatgtcagccgaaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgatttatgcttgaata 27567607  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27567608 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattacgatgtttttgtgatctgattatgctgct 27567675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17804504 - 17804274
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  17804504 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 17804405  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17804404 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 17804306  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17804305 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 17804274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 19790579 - 19790845
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||     
T  19790579 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgtttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgg-acattaggtagtaatgaaacctat 19790677  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  19790678 ttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataa 19790777  T
Q  202 tcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
     |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  19790778 acttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgct 19790845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22429829 - 22430059
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  | || |||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||    
T  22429829 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatggtgagaccta 22429928  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| ||||  | |||||||||  ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22429929 tttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattaaatg 22430027  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  22430028 atcaagaaattgttgaaaatgaattgatatta 22430059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766745
Alignment:
Q  175 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgcta 21766745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 269
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523450
Alignment:
Q  148 tgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||   ||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataaagttg 16523428  T
Q  248 ttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgcta 16523450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21739820 - 21740020
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||  | ||| ||| ||||| |||  ||| |||||||||| || |||||    
T  21739820 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatgg-actcttaggtagtaatgtgacct 21739918  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  21739919 atataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 21740018  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  21740019 ga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 22059541 - 22059713
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  22059541 cgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgaggaatgaaactttaggtagtagtgagatata 22059640  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattat 173  Q
     || |||||||    | ||| |||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  22059641 gtttagatgttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattat 22059713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23414821 - 23414721
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23414821 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 23414722  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  23414721 a 23414721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27556579 - 27556479
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27556579 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 27556480  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  27556479 a 27556479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 31478075 - 31478169
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31478075 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25766967 - 25767197
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||| |||||  ||| ||||| || |||| ||||| || ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  25766967 cgcctcacgagccattctagaactgattgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 25767066  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | |||||||    ||||||| || ||| | |||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25767067 tttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagt-gattataatgtaatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 25767165  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25767166 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 25767197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1644549 - 1644455
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644549 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 1644455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 269
Target Start/End: Original strand, 27325569 - 27325677
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt--gaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatt 260  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  27325569 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgatt 27325668  T
Q  261 atgttgcta 269  Q
    ||| |||||    
T  27325669 atgctgcta 27325677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 27416123 - 27416223
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27416123 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 27416222  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  27416223 a 27416223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14472577 - 14472347
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  14472577 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 14472478  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14472477 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 14472379  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14472378 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 14472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 257
Target Start/End: Original strand, 22074176 - 22074267
Alignment:
Q  167 tgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22074176 tgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaaatgttgctgaaatgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctg 22074267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25641981 - 25642196
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| || ||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  25641981 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 25642080  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  25642081 tataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 25642180  T
Q  200 gatcaagatgttgttg 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25642181 gattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 15894229 - 15894427
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |  ||| || || | | ||| ||||  |||   | || ||||||| || ||||||      
T  15894229 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgtcctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 15894328  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    || ||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15894329 taggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 27553406 - 27553515
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  27553406 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 27553505  T
Q  101 attaagatgt 110  Q
     |||||||||    
T  27553506 tttaagatgt 27553515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22863253 - 22863023
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  22863253 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 22863154  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||  ||  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22863153 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 22863055  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || |  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22863054 attagaaagttgttgaaaatgaattgatatta 22863023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 27415741 - 27415851
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||  |  || ||||||| || |||||||||    
T  27415741 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagaccta 27415840  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  27415841 tttaagatgtt 27415851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1644863 - 1644782
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  1644863 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 1644782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16760435 - 16760370
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16760435 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 16760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19870748 - 19870670
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 228  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  19870748 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 19870670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 31477776 - 31477841
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  31477776 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 31477841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8244019 - 8243938
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  8244019 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 8243938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11567020 - 11566939
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  11567020 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 11566939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22949248 - 22949199
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22949248 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 22949199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22953204 - 22953155
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22953204 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 22953155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23395226 - 23395145
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  23395226 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 23395145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23871692 - 23871643
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871692 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 23871643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23875648 - 23875599
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23875648 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 23875599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16741513 - 16741298
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||| | ||| |||| |||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  16741513 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagtcgtttggattggttaggaaatgaactttaggtactagtgagaccta 16741414  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||| |||  |  |||||||   ||||||| |||| || ||||||||| |||  |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16741413 ttaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 16741315  T
Q  200 gatcaagatgttgttga 216  Q
    ||||||||  |||||||    
T  16741314 gatcaagaaattgttga 16741298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16760136 - 16760068
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16760136 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 16760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 230
Target Start/End: Original strand, 18917214 - 18917294
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatt 230  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  18917214 ttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 18917294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19863301 - 19863089
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||| ||  | | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  19863301 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 19863202  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||  |||||   |||| | | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  19863201 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaat 19863102  T
Q  200 gatcaagatgttg 212  Q
    |||  ||||||||    
T  19863101 gattgagatgttg 19863089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19873443 - 19873231
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||| || || | | || |||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  19873443 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 19873344  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||  |||||   |||| | | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  19873343 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaat 19873244  T
Q  200 gatcaagatgttg 212  Q
    |||  ||||||||    
T  19873243 gattgagatgttg 19873231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948881
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952837
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22952837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871325
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875281
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23990078 - 23990011
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 218  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23990078 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 23990011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 12618793 - 12618867
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  12618793 ttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttgaaatgaattg 12618867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16624272 - 16624207
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16624272 ttaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 16624207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 18955711 - 18955792
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| || | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18955711 ttataatgtgattgattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatatta 18955792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 23657219 - 23657308
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagta 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| |||||||| | | |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  23657219 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgttcggattggttaagaatggaactttaggtagta 23657308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14472108 - 14472044
Alignment:
Q  135 tgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14472108 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14472044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Original strand, 18956032 - 18956096
Alignment:
Q  135 tgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18956032 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18956096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16523201 - 16523328
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  16523201 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgaccta 16523300  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||    
T  16523301 tttaagatgttaactgagatctgtgaag 16523328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 22439123 - 22439073
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  22439123 cgcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaatattgcgatctg 22439073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 15041508 - 15041605
Alignment:
Q  159 tggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||||| ||||| || | |||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  15041508 tggtttaatg--tatgtgcattacttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctg 15041605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 16924677 - 16924713
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16924677 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 16924713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15404 - 15143
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  15404 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcatttgagaatgttttgacctgagttgctttaattgatttggaatggaactttaggtagtagtgagacctt 15305  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15304 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 15205  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15204 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctg-tgttgtgatctgattatg 15143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4486
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4748 cgcctcgcgagcacttccagaactgagttcaagtgagaatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 4649  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      ||||| |||  ||| || |||||||    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4648 tataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatg 4549  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4548 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 4486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 526
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  591 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 12321540 - 12321808
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| || || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||| || |||||    
T  12321540 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatgg-actcttaggtagtaatgtgacct 12321638  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  |||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12321639 atataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaat 12321738  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12321739 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcta 12321808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2760449 - 2760182
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  2760449 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagattgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 2760350  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| | ||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2760349 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgagatattattgaatg 2760251  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2760250 atcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgct 2760182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3272141 - 3271874
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3272141 cgcctcacgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 3272042  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||   || ||| |||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  3272041 tataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttg-aatattattgaata 3271943  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3271942 atcaagatgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgct 3271874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 9445957 - 9446224
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  9445957 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgttgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacata 9446056  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  9446057 tttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 9446156  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446157 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgct 9446224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14430200 - 14429939
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  14430200 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 14430101  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14430100 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 14430001  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14430000 atcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatg-aagtatactgttgttgtgatctgattatg 14429939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11312955 - 11312725
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  11312955 cgcctcgggagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 11312856  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11312855 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 11312757  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11312756 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 11312725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20569395 - 20569662
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||   || | ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  20569395 cgcctcgcgagcacttctagaactgaatgttttttataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgg-acattaggtagtaatgaaaccta 20569493  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  20569494 tttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 20569593  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  20569594 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatatgattatgttgct 20569662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12318433 - 12318204
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| || | |||||||||| | || ||||||| |  |||||||||| || |||||||||     
T  12318433 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagaccggagttgcttggaatggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctat 12318334  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12318333 ttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 12318235  T
Q  202 tcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12318234 ttaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 12318204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832508
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatattgttgat 2832488  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  2832489 gggatctgattatgctgcta 2832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751821
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaatgaattgatattatg-aattatactgttgat 9751801  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgcta 9751821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15580998 - 15580768
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||| |   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  15580998 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatagtgagaccta 15580899  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||| ||||||  ||| || ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15580898 tttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattattgaatg 15580800  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15580799 ataaaaaagttgttgaaaatgaattgatatta 15580768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 17137861 - 17137988
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  17137861 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 17137960  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  17137961 tataagaagttaactgcaatctgtgaag 17137988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267966
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttttaatgttgtg 39267946  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  39267947 gtaatctgattatgctgcta 39267966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 15605072 - 15605332
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||| || | |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||     
T  15605072 gcctcgtgaccacttctagaactgagtgcatttgaggactttgagacccgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctat 15605171  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15605172 ttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15605270  T
Q  202 tcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||| ||||||| |||||||||       ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15605271 tcaagaagttgttgaaaatgaatt-------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcta 15605332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Original strand, 25927432 - 25927525
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 224  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927432 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 25927525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13635268 - 13635498
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattagg-aatgttactttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||| || |||| |||    
T  13635268 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattagataatga-accttaggtactaatgaggcct 13635366  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    | ||||||| ||  | |  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  13635367 atttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 13635465  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13635466 gatcaagaaattgttgaaaatgaattgatatta 13635498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 13918709 - 13918809
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13918709 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 13918808  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  13918809 a 13918809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 1859015 - 1859115
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1859015 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagaattgttatt 1859114  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  1859115 a 1859115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 7519322 - 7519387
Alignment:
Q  166 atgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7519322 atgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 7519387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16583556 - 16583333
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaag 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||| || |||||||||  ||||    
T  16583556 gcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaagtgaaccttaggtactaatgagacctatataag 16583457  T
Q  107 atgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaag 206  Q
    || ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16583456 atattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgattta-tgattgattgcattacttgaattattgttgaatgatcgag 16583359  T
Q  207 atgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||    
T  16583358 aaattgttgaaaatgaattgatatta 16583333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12187335 - 12187208
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| |||||||||    
T  12187335 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagaccta 12187236  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  12187235 tataagaagttaactgcaatctgtgaag 12187208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33414 - 33184
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||  | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  33414 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgtttggattaggaatggaactttaggtagtaatgagaccta 33315  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33314 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 33216  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  33215 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 33184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 70564 - 70794
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  70564 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagaccta 70663  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||     
T  70664 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaata 70762  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  70763 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 70794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 74673 - 74903
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  74673 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagaccta 74772  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||     
T  74773 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaata 74871  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  74872 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 74903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39722424 - 39722343
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  39722424 ttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgagttgatatta 39722343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16114399 - 16114321
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 228  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  16114399 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 16114321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16117552 - 16117474
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 228  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  16117552 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 16117474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18425578 - 18425513
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  18425578 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 18425513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 42205421 - 42205311
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  42205421 cgcctcgcggacacttccagaactgagttcttttgagaatgatgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgaccta 42205322  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     || |||||||    
T  42205321 tttgagatgtt 42205311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 45169972 - 45170037
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  45169972 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 45170037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12715022 - 12714941
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  12715022 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 12714941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12718826 - 12718745
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  12718826 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 12718745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 16907149 - 16907230
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  16907149 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 16907230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18279561 - 18279480
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  18279561 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 18279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18283524 - 18283443
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  18283524 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 18283443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9593652 - 9593421
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  9593652 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 9593553  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
    || ||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| | || || ||| ||||| ||   |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9593552 ataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaat-tttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 9593454  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  9593453 gatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9644615 - 9644384
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  9644615 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 9644516  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
    || ||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| | || || ||| ||||| ||   |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9644515 ataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaat-tttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 9644417  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  9644416 gatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12723737 - 12723670
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 218  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12723737 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 12723670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 45170272 - 45170339
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  45170272 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 45170339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 48593255 - 48593362
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  48593255 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagaccta 48593354  T
Q  101 attaagat 108  Q
     |||||||    
T  48593355 tttaagat 48593362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 12704607 - 12704688
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  12704607 ttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 12704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26292553 - 26292472
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  26292553 ttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 26292472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15084037 - 15083973
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattatt 195  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15084037 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 15083973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39722107 - 39722039
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  39722107 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 39722039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 18858 - 19088
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||  || |||||||||     
T  18858 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgctattgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctat 18957  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaatg 200  Q
    | ||||| ||| |||  | ||||||||   ||||||  |||| || ||| ||||| |||  |||  ||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18958 taaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgtt-aagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatg 19056  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||   |||||| |||||||||| |||||    
T  19057 atcaaggaattgttgaaaatgaattgttatta 19088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13462068 - 13461957
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| | || ||||||| |  |||||||||  || |||||||||    
T  13462068 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagaccta 13461969  T
Q  101 attaagatgttg 112  Q
     | |||||||||    
T  13461968 ttaaagatgttg 13461957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 2530322 - 2530420
Alignment:
Q  134 atgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  2530322 atgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttatta 2530420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9703588 - 9703386
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||| | || || | | ||||||||  |||   | || |||| || || ||||||    
T  9703588 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgaccta 9703489  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||| |||||   | | | ||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  9703488 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 9703389  T
Q  200 gat 202  Q
    |||    
T  9703388 gat 9703386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 10508880 - 10508922
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgtt 43  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  10508880 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgtt 10508922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42204151 - 42204045
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 261  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  || || |||||||||||||    
T  42204151 ttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgctgtgatctgatta 42204052  T
Q  262 tgttgct 268  Q
    || ||||    
T  42204051 tgctgct 42204045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 18154634 - 18154670
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18154634 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 18154670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 20465837 - 20466093
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |   | |||||||||| || ||||||    
T  20465837 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgaccta 20465936  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20465937 tataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 20466036  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20466037 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctg 20466093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 22010477 - 22010740
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  22010477 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 22010576  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  22010577 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatg 22010675  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||| |||   ||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  22010676 atctaga---tgttgaaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgct 22010740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 16861125 - 16861390
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16861125 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaatcgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacata 16861224  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||| ||| |||| ||||||| | |  ||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  16861225 tttaagaggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatg 16861323  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16861324 attaagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaa-tataatgttgttgtgatctgattatgctgct 16861390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 30643090 - 30643358
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||| ||||||  | ||   |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||     
T  30643090 gcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 30643189  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaa-gtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30643190 ttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 30643289  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30643290 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgcta 30643358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 17926505 - 17926760
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  17926505 cgcctcgcgagcactcccagaactgaatgcaaattagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 17926604  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||   || |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17926605 tttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 17926703  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17926704 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctg 17926760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 15602815 - 15603082
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||||||  ||   | ||| |||||| || ||||||    
T  15602815 cgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 15602914  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||| ||| |||  | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15602915 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtttgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 15603014  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15603015 atcaagatgttgttgaaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgct 15603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 15611267 - 15611529
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||||||  ||   | ||| |||||| || ||||||    
T  15611267 cgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 15611366  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||  ||| |||  | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15611367 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtttgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 15611466  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15611467 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatg 15611529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Original strand, 16410133 - 16410308
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||  ||| ||| ||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  16410133 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16410231  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410232 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 16410308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 377596 - 377399
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||  |    
T  377596 ctcgcgagcacttccagaactgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatat 377497  T
Q  104 aagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  377496 aagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatga 377399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20856223 - 20856491
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||||||    
T  20856223 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaaattcaggtagtaatgtgaccta 20856322  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     | |||||||| ||||  |||||||||   |||||||| || |||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  20856323 ttaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 20856422  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  20856423 acctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct 20856491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24756042 - 24755842
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| || ||| || || | | ||| ||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  24756042 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 24755943  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      || ||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24755942 tataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatg 24755843  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  24755842 a 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 14398038 - 14398138
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14398038 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaatgaattgttatt 14398137  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  14398138 a 14398138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19899416 - 19899230
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  19899416 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 19899317  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19899316 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattacttga 19899230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19983414 - 19983228
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||  ||  | ||||||| || ||||||    
T  19983414 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaaatgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgaccta 19983315  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19983314 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga 19983228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 201
Target Start/End: Original strand, 19259460 - 19259580
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  19259460 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 19259559  T
Q  181 acttgaaatattattgaatga 201  Q
    |||||| || ||| |||||||    
T  19259560 acttgagatgttaatgaatga 19259580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Original strand, 23776713 - 23776890
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcat 179  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||| |||| |  |||| ||| ||||  | ||||| |||| |||||    
T  23776713 ttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatg-ttatgtgcat 23776811  T
Q  180 tacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  23776812 tacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctg 23776890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 39094740 - 39094850
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| ||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  39094740 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagaaatggaacttaaggtagtaatgtgaccta 39094839  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  39094840 tttaagatgtt 39094850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16231274 - 16231505
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||| | | |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  16231274 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgttcggattggttaggaaagggactttaggtactaatgagaccta 16231373  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||| |||  | ||||||||   ||||||| |||| || ||| ||||| |||  |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16231374 ttaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 16231472  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  16231473 gatcaagaatttgttgaaaatgaattgttatta 16231505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 18862611 - 18862676
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  18862611 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 18862676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 21827980 - 21828045
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  21827980 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 21828045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 19278231 - 19278312
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  19278231 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 19278312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21383798 - 21383729
Alignment:
Q  162 tttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21383798 tttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaatgaattgttatta 21383729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 21972533 - 21972614
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21972533 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 21972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 21976618 - 21976699
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21976618 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 21976699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22112009 - 22111928
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  22112009 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 22111928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 39094861 - 39094990
Alignment:
Q  140 tgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaatt 238  Q
    |||||| ||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  39094861 tgttaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagtt 39094960  T
Q  239 atgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  39094961 ataatgttgttgtgatctgaatatgctgct 39094990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43251971 - 43251890
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  43251971 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 43251890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 21828279 - 21828347
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  21828279 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21828347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862978
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387149
Alignment:
Q  152 tataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 21387149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23834480 - 23834381
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  23834480 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 23834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21411090 - 21411025
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21411090 ttaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 21411025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21805582 - 21805517
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21805582 ttaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 21805517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22028864 - 22028647
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||| | | |||| ||||||| |  |||||| ||| || |||||||||    
T  22028864 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgttcggattggttaggaaaggaactttaagtactaatgagaccta 22028765  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||| ||   | ||||||||   ||||||| |||| || ||| ||||| |||  |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22028764 ttgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 22028666  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaa 218  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  22028665 gatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16185049 - 16184860
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| || ||| || || | | ||||||||  |||   |  | ||||||| || ||||||    
T  16185049 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 16184950  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaat 189  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  | |||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16184949 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgcttgaaat 16184860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21410791 - 21410723
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  21410791 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21410723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21805283 - 21805215
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  21805283 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21805215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19976766 - 19976647
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||  ||  ||||||||| || ||||||    
T  19976766 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgaccta 19976667  T
Q  101 attaagatgttggctgcaat 120  Q
     |||||| |||  |||||||    
T  19976666 tttaagaagttaactgcaat 19976647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 21161856 - 21161906
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21161856 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctg 21161906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678130
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatatt 230  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatt 18678130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 19259399 - 19259440
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgt 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  19259399 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagaatgt 19259440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121825
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatatt 230  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatt 32121825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19090 - 19344
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19090 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 19189  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||   || |||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19190 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaata 19289  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19290 atcaagatgttgttgaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgat 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18710
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| || |||   | |||||||||| |||||||||    
T  18454 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagaccta 18553  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18554 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatg 18653  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18654 atcaagatgttgttgaaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctg 18710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 1288 - 1555
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  1288 cgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaatgatgagacctgagttgcttggattgactaggaatggaactttagttagtaatgtgaccta 1387  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1388 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattgaatg 1487  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1488 atcaagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgct 1555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 30543 - 30808
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30543 cgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcatttgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagttgtgagaccta 30642  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||| |||| ||| ||||||  ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30643 tttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 30741  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30742 ataaagatgtagttgaaatgaattgttgttatg-aagtataatgttgttgtgatccgattatgctgct 30808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 16919 - 17178
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16919 cgcctcgcgagcacttcaagaaccgagtgcatttgagaatgccgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 17018  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||        ||| | ||| |||||   |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17019 -ttaa--------ctgaattctatgaagctattataaactgt-aagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 17108  T
Q  201 atcaagatgttgtt-gaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17109 ttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgatgtgatctgattatgctgcta 17178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 46527 - 46781
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||||| |||  ||| |||||||||| || ||||||     
T  46527 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatgg-actcttaggtagtaatgtgacctat 46625  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46626 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatga 46725  T
Q  202 tcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46726 tcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctg 46781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 21367 - 21629
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | ||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  21367 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 21466  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||| |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21467 tttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaatattattgaatg 21566  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21567 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatg 21629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 80619 - 80713
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| |||  | ||||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80619 gttatgaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 80713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 209
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| | || || ||  |||||| || || | ||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||||    
T  476 cctcgcaagcacttctagaactgagtgcaagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaat 377  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgat 202  Q
    |||||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  376 taagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcattacttgaaatattattgaatgat 277  T
Q  203 caagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  276 caagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgcta 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23451664 - 23451399
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23451664 cgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 23451565  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23451564 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 23451466  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || | ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23451465 attatgatgttgttgaaaagaattgatgttatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgct 23451399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23463169 - 23462909
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23463169 cgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 23463070  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23463069 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 23462971  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    || | |||| |||||||| |||||| | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  23462970 attatgatgctgttgaaaagaattgctgttatg-aagtatagtgttgttgtgatctgattatg 23462909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23458908 - 23458648
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23458908 cgcctcgcaagcacttcaagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 23458809  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23458808 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 23458710  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    || | |||| |||||||| |||||| | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  23458709 attatgatgctgttgaaaagaattgctgttatg-aagtatagtgttgttgtgatctgattatg 23458648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21366464 - 21366731
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  21366464 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 21366563  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21366564 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 21366663  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21366664 atcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcta 21366731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24222195 - 24221928
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| || || |||| ||||||||  |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  24222195 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 24222096  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||| ||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  24222095 tttaagacgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 24221996  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24221995 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 24221928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22757443 - 22757176
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||    
T  22757443 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgg-acattaggtagttgtgaaaccta 22757345  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  22757344 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattattgaata 22757245  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22757244 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgct 22757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12028364 - 12028631
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  12028364 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatg-gacattaggtagtaatgaaaccta 12028462  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||||     
T  12028463 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaata 12028562  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  12028563 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 12028631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 1858776 - 1859042
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||     
T  1858776 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacttgagttgattgaattgattaggattggaactt-aggtagtagtgagacatat 1858874  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaa-tctgtgaagtggttatgaactgttaaat--tgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaa 198  Q
    ||||||||||   || || ||||||| |  ||| ||||||  ||| |  || || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1858875 ttaagatgttaattgaaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaattgttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaa 1858973  T
Q  199 tgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1858974 tgattatgatgttgttgaaatgaattgttgttatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgct 1859042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767612
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactattgat 24767592  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24767593 gtgatctgattatgctgcta 24767612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20805868 - 20805614
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || |||||| |||||| || ||   |||||||||||  |    | |||||||||| || ||||||    
T  20805868 cgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgaccta 20805769  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||| ||| ||  |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805768 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattgaatg 20805670  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20805669 atctagatgttgttg-aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctg 20805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26680897 - 26680633
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  26680897 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattaggaatg-gacattaggtagtaatgaaaccta 26680799  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat- 199  Q
     ||||||||||  |||  |  |||||||| |||| ||||   ||| ||| || ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  26680798 tttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaac---taagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaata 26680702  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
     | |  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26680701 aaccttgatgttattgaaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgct 26680633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26952504 - 26952240
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  26952504 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattaggaatg-gacattaggtagtaatgaaaccta 26952406  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat- 199  Q
     ||||||||||  |||  |  |||||||| |||| ||||   ||| ||| || ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  26952405 tttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaac---taagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaata 26952309  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
     | |  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26952308 aaccttgatgttattgaaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgct 26952240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17918950 - 17919217
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||    
T  17918950 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttaggaatgaaactttaggtagtaaggaaaccta 17919049  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||| ||||||  ||   |||||||    |||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  17919050 tttaatatgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaata 17919148  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||    
T  17919149 accttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgct 17919217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20767039
Alignment:
Q  84 ggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattact 183  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||  ||| ||| |  ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  184 tgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgat 254  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg-aatgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgat 20767039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18356133 - 18356033
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18356133 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 18356034  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  18356033 a 18356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 20911100 - 20911200
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20911100 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 20911199  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  20911200 a 20911200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23572400 - 23572272
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  23572400 cgcctcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 23572301  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagt 129  Q
      ||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  23572300 tataagaagttaactgcaatttgtgaagt 23572272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22032637 - 22032510
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| |||||||||    
T  22032637 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagaccta 22032538  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  22032537 tataagaagttaactgcaatctgtgaag 22032510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Original strand, 18769806 - 18769929
Alignment:
Q  5 tcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatta 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||  ||    
T  18769806 tcgcgagcacttccagaactgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatata 18769905  T
Q  105 agatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
    ||| |||  |||||||||||||||    
T  18769906 agaagttaactgcaatctgtgaag 18769929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10753205 - 10753111
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10753205 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 123104 - 123371
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||  ||||| || | |||||||| ||| |||| |||||||||  || |||||||||| |  ||||||    
T  123104 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcttttgttaatgtcgtaacctgagttgtttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaatatgaccta 123203  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      | |||||||  |||  |||||||| |  |||||||| ||||||  || || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  123204 tgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgaattattcttgaata 123302  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |    |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  123303 actttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct 123371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18356634 - 18356390
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||  |  || |||| || || |||||||||    
T  18356634 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttagatactaatgagaccta 18356535  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||   || |||| |||| || ||||||||||||| | ||||| || | |||||||||| | | ||  ||||||     
T  18356534 tttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgtt-aagtgattataatgtgatataatg-ttttatgcattacttaagaaatatttgaata 18356437  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgtt 246  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  18356436 ttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtt 18356390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17410754 - 17410647
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||  | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  17410754 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcacttgaggattttgatacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 17410655  T
Q  101 attaagat 108  Q
     |||||||    
T  17410654 tttaagat 17410647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17410603 - 17410517
Alignment:
Q  146 attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17410603 attgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatatta 17410517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14079469 - 14079283
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||   |  | ||||||| || ||||||    
T  14079469 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 14079370  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14079369 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga 14079283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 20910599 - 20910709
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||  |  ||  |||||| || |||||||||    
T  20910599 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccctaggtactaatgagaccta 20910698  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  20910699 tttaagatgtt 20910709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21873570 - 21873322
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | || || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  21873570 cgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatgaacccttgggtagtaatgtgaccta 21873471  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  21873470 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaagatattattgaat 21873372  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgt 251  Q
    | | ||||   ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  21873371 ggttaaga---tgttgaaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgt 21873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23535388 - 23535616
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  || || ||||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||| || ||||||||     
T  23535388 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcattttaggattgtgagacctgagttgcttggtttgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctg 23535487  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||   ||  | ||||||||    |||||| || ||| | |||||||  ||| |||| ||||   ||||||||||| || ||||||||||||    
T  23535488 tttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagt-gattatac-gtgatttattgatagattgcattactttaattattattgaatg 23535585  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23535586 atcaagaaattgttgaaatgaattgatatta 23535616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10753504 - 10753439
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10753504 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10753439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20296005 - 20295924
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  20296005 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 20295924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11220589 - 11220521
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11220589 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11228998 - 11228930
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11228998 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11228930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11230987 - 11230919
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11230987 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 23501145 - 23501344
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| || |  | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||      
T  23501145 cctcgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 23501244  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||| |||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| |||||   | ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23501245 taagaagttaattgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 23501344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226940
Alignment:
Q  133 tatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11226940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 19472668 - 19472749
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  19472668 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 19472749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37724225 - 37724008
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  37724225 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagaccta 37724126  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgtta-aattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||  |||||   |||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  37724125 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttttgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 37724026  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaa 217  Q
    |||  |||||||| ||||    
T  37724025 gattgagatgttgatgaa 37724008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11225175 - 11225111
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattatt 195  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  11225175 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11225111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31342424 - 31342315
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   |||| || || |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||  || |||||    
T  31342424 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgtttttgataacgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatg-gacattaggtagtaaggaaaccta 31342326  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  31342325 tttaagatgtt 31342315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 15236728 - 15236809
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  15236728 ttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 15236809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26704387 - 26704251
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |   ||||||||| || || ||| ||||||||| |||   | || ||||||| |||||| ||    
T  26704387 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacata 26704288  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatga 137  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  26704287 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 26704251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26974120 - 26973984
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |   ||||||||| || || ||| ||||||||| |||   | || ||||||| |||||| ||    
T  26974120 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacata 26974021  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatga 137  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  26974020 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 26973984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 40723852 - 40723920
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  40723852 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaatattattgaat 40723920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20232857 - 20232750
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| ||||  |||||| |  |||||||||| || | |||||||    
T  20232857 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattgggtaggaaagaaactttaggtactaataagaccta 20232758  T
Q  101 attaagat 108  Q
     |||||||    
T  20232757 tttaagat 20232750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33409535 - 33409391
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || |||  ||| ||||||| |  |||||||||| || || ||||||    
T  33409535 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgaccta 33409436  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa 145  Q
     | |||||  || |||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  33409435 ttaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaa 33409391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24175118 - 24174851
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  24175118 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 24175019  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  24175018 tttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 24174919  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24174918 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 24174851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24655137 - 24655404
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| || || |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  24655137 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataaagtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 24655236  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  24655237 tttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 24655336  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655337 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgct 24655404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24716329 - 24716594
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24716329 cgcctcgcgagcacttctagagccgagtgcaattgagaatgttgagacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 24716428  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| || |||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  24716429 tttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattactagacatattattgaatg 24716527  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || | |||||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24716528 attatgatgttgttgaaatgaattgttgttatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgct 24716594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 21327365 - 21327633
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  21327365 cgcctcgcgagcactcccagaactgagtgtatttgagaatgttttgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacata 21327464  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||| |||||   || | |||||||||  |||||||||| ||||  || |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21327465 tttaaaatgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaata 21327564  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  21327565 atcaagatgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgct 21327633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 25961333 - 25961600
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  25961333 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 25961432  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  25961433 tttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttg-ttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaatg 25961531  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961532 atctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgct 25961600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 21318434 - 21318702
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  21318434 cgcctcgcgagcactcccagaactaagtgtatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacata 21318533  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||   || | | |||||||  | |||||||| ||||  || |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21318534 tttaagatgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaata 21318633  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21318634 atcaagatgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgct 21318702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22811710 - 22811978
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||  || | | ||||||||||   ||   |||||||||||| || ||||||    
T  22811710 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttt-cataaattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgaccta 22811808  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattat-ttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
     ||||||||||   || |||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  22811809 tttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgcattacctgaagtattattgaat 22811908  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22811909 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgcta 22811978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Original strand, 25963595 - 25963770
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||   || |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  25963595 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 25963693  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963694 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 25963770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 266
Target Start/End: Original strand, 21916070 - 21916162
Alignment:
Q  174 ttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21916070 ttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttg 21916162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24870190 - 24869931
Alignment:
Q  9 gagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagat 108  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| || || |||| ||||||||  |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  24870190 gagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatgaaacattaggtagtaatgaaacctatttaagat 24870091  T
Q  109 gttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat 208  Q
    ||| || | ||||||||| || |||| |||||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| |||| |||||| | | ||||    
T  24870090 gttagccggaatctgtgaggttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatacattactcgaattattcttgaataaactagat 24869991  T
Q  209 gttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  24869990 gttgttgaaatgaattgttgttatgaatttatgattttgttgtgatctgattatgctgct 24869931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40428783 - 40428514
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaa-cggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacct 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || |||||    
T  40428783 cgcctcgcgagcacttccagaaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacct 40428684  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    | ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||    
T  40428683 atttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttaaat 40428584  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
     | |  |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||    
T  40428583 aaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgct 40428514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 19688559 - 19688779
Alignment:
Q  5 tcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatta 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||| || ||||||||| |||    
T  19688559 tcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctattta 19688658  T
Q  105 agatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatca 204  Q
    |||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19688659 agatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 19688757  T
Q  205 agatgttgttgaa-atgaattg 225  Q
    |||  |||||||| ||||||||    
T  19688758 agaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24735710 - 24735480
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||  | | |||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  24735710 cgcctcgcgagcacttccagaactgattgcatttgaggattttgacacccgagttgcttggattgattaagaaaggaactttaggtactaatgagaccta 24735611  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||    
T  24735610 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgatcgcattacttgaattattattgaatg 24735512  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24735511 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 24735480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 44370097 - 44370269
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  44370097 cgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgaggaatgaaactttaggtagtagtgagatata 44370196  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattat 173  Q
     || |||||||    | ||| |||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  44370197 gtttagatgttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattat 44370269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37524905 - 37524726
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||   || | |||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||       ||||||    
T  37524905 ttaggtagtaatgtgaccta-ttaagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgatttaat-------tgcatt 37524814  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37524813 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaatgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgct 37524726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31345053 - 31344953
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31345053 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 31344954  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  31344953 a 31344953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 22740758 - 22740973
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  22740758 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 22740857  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  22740858 tataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 22740957  T
Q  200 gatcaagatgttgttg 215  Q
    ||| ||||||||||||    
T  22740958 gattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 22798924 - 22799181
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | || || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   |  | ||||||| || ||||||    
T  22798924 cgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 22799023  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  22799024 tataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgccttacttaagatattattgaat 22799122  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22799123 gattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctg 22799181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 257
Target Start/End: Original strand, 23019673 - 23019761
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23019673 ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctg 23019761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10101444 - 10101674
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | ||||||  ||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  10101444 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatgaattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 10101543  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10101544 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 10101642  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10101643 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 10101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 21918114 - 21918285
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | ||||||||| |  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  21918114 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 21918213  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgatta 172  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21918214 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatta 21918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 45677953 - 45678023
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattagg 71  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  45677953 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagg 45678023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24673897 - 24673697
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| | || |||||| |||||| || || | |||||||||||  ||  ||| ||| |||||| || |||||    
T  24673897 cgcctcgcgagcacttccacaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttgg-actcttaagtagtaatgtgacct 24673799  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||| ||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  24673798 atataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 24673699  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24673698 ga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1283529 - 1283464
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  1283529 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 1283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 30344957 - 30345022
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  30344957 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 30345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 41530958 - 41531035
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  41530958 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 41531035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 12901460 - 12901541
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  12901460 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 12901541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24649515 - 24649434
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  24649515 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 24649434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27601954 - 27601873
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  27601954 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 27601873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 24628427 - 24628508
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  24628427 ttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 24628508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 27379381 - 27379462
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  27379381 ttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 27379462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 27383427 - 27383508
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  27383427 ttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 27383508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 41531269 - 41531337
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  41531269 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcnaaatattattgaat 41531337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22758513 - 22758725
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  22758513 cgcctcgtgagcactttcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 22758612  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      |||||  ||  ||||||||| |||||  |||||||  ||||||  |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  22758613 tataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 22758712  T
Q  200 gatcaagatgttg 212  Q
    |||  ||||||||    
T  22758713 gattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 30345256 - 30345324
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  30345256 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 30345324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1283230 - 1283162
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1283230 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgattaaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 1283162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25616342 - 25616278
Alignment:
Q  167 tgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatatt 230  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  25616342 tgattatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatt 25616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23038356 - 23038229
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||| || || ||| ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  23038356 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagaccta 23038257  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  23038256 tataagaagttatctgcaatctgtgaag 23038229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15477761 - 15477711
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15477761 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 40622006 - 40622056
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  40622006 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctg 40622056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 45678074 - 45678118
Alignment:
Q  157 tgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45678074 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 45678118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5903 - 5633
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |  |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  5903 cgcctcgcgagcacttccataactgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgaccta 5804  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  |||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5803 -ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatg 5705  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5704 atcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatg-aactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactg 5633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7098 - 6828
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |  |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  7098 cgcctcgcgagcacttccataactgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgaccta 6999  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  |||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6998 -ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatg 6900  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6899 atcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatg-aactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 413849 - 414116
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||  || || ||    
T  413849 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgtaattgagaatgttatgacctgagttgcttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaaagaaacata 413948  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  413949 tataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatg 414048  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  414049 atctagatgttgttgaaacgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct 414116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 71238 - 71138
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71238 gttatgaactgttaagttgtttgtaatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 71139  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  71138 a 71138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 71620 - 71510
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||  |  || ||||||| || |||||||||    
T  71620 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagaccta 71521  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  71520 tttaagatgtt 71510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 140017 - 139918
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || ||| |||| ||||||| |  |||||||||  ||||||||||||    
T  140017 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagaccta 139918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 11557183 - 11557450
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  11557183 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaaccta 11557282  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  11557283 tttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 11557382  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |   |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557383 aattagatgttgatgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 11557450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12037751 - 12038018
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||   |  |  |||| |  | || |||    
T  12037751 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacctgagttgcttgaattgatttagaatggacccctgagtagcaacgtgatcta 12037850  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||| ||||||   || ||||||||||    || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12037851 tttaggatgtttaatgaaatctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatg 12037950  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12037951 atcaagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct 12038018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 1982609 - 1982876
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||   | |||||||||| || ||||||    
T  1982609 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtacatttgagaagtttgagacctgagttgtttggattggttaggaatggagccttaggtagtaatgtgaccta 1982708  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  1982709 attaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagtt-attgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaactatttttgaatg 1982807  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | | ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1982808 acctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgct 1982876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12496575 - 12496308
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  12496575 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 12496476  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12496475 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 12496377  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12496376 atcaagatgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgct 12496308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18383715 - 18383982
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  18383715 cgcctcgcgagcacttcaagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 18383814  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18383815 tttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 18383914  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18383915 atcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatg-aagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcta 18383982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19725710 - 19725977
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| | || |||||| ||||||  | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || |||| |    
T  19725710 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatacaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccca 19725809  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||   ||| ||||||||||   | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19725810 tttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatg 19725909  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19725910 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatg-agtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgcta 19725977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 11298327 - 11298582
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||| ||||||  |  | | | |||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  11298327 cgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaatttagtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 11298426  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  ||| ||| ||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11298427 tttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 11298525  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11298526 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctg 11298582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 11594938 - 11595205
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  11594938 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgg-acattaggtagtaatgaaaccta 11595036  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  11595037 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 11595136  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  11595137 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 11595205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11851805 - 11851637
Alignment:
Q  95 gacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattat 194  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11851805 gacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattat 11851706  T
Q  195 tgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  11851705 tgaatgaacaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatg 11851637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 322909 - 322648
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||| |||||   | || | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  322909 cgcctcgcgagcacttccagaactaaatgcaagttagtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 322810  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||   ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  322809 tttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 322710  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||||||||    
T  322709 atcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatg-aagtataatattgttgtgatctgattatg 322648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11863031 - 11862843
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||   || |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11863031 ttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcatt 11862932  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || | |||||||||||||| |||||    
T  11862931 acttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgcta 11862843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20461299 - 20461529
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  20461299 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttaaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 20461398  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20461399 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 20461497  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20461498 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 20461529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665451
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattttaaagttatactgttgat 14665471  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14665470 gtgatctgattatgttgcta 14665451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 3389734 - 3390002
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  3389734 cgccttgcgagcacttccagaactaagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgaccta 3389833  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||      
T  3389834 tttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaaaa 3389933  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  3389934 accttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 3390002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16369728 - 16369528
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    | |||||||||| || || |||    
T  16369728 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgatatgtgttgcttgaattgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatcta 16369629  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| || ||| ||||||    
T  16369628 tataagatgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttgagatgttaatgaatg 16369529  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  16369528 a 16369528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16910070 - 16909870
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  16910070 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 16909971  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
       ||||||||  |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| || ||| ||||||    
T  16909970 tacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattttattacttgagatgttaatgaatg 16909871  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  16909870 a 16909870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668607
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactgttgat 14668627  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14668626 gtgatctgattatgctgcta 14668607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 3402754 - 3403023
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  3402754 cgcctcgcgagcacttccagaactaagtacttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatgaaactttaggtagtaatgtgaccta 3402853  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||   ||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||||     
T  3402854 tttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattccttgatttattcttgaata 3402953  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  3402954 accttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgcta 3403023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 326963 - 327193
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||| || |  || ||||||| || |||||||||    
T  326963 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagaccta 327062  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  327063 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 327161  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  327162 atcaagaaattgttgaagatgaattgatatta 327193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 7793146 - 7793378
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgatta---ggaatgttactttaggtagtagtgagacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||   |||| |  |||||||||| || |||||||    
T  7793146 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattattaggaaaggaactttaggtactaatgagacc 7793245  T
Q  99 taattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaa 198  Q
    || ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  7793246 tatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttgttgattgattgcattacttgaattattattgaa 7793344  T
Q  199 tgatcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7793345 tgatcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 7793378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 26190807 - 26190917
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  26190807 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcatgacctgagttgcttggattgattaggaatggaactttaggtagtaatgagaccta 26190906  T
Q  101 attaagatgtt 111  Q
     ||||||||||    
T  26190907 tttaagatgtt 26190917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15060612 - 15060412
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| | || |||||| |||||| || || ||||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  15060612 cgcctcgcgagcacttccaggactgattgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgaccta 15060513  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      ||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||||    
T  15060512 tataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatg 15060413  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  15060412 a 15060412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 856456 - 856329
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  856456 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 856357  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  856356 tataagaagttaactgcaatctgtgaag 856329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2897622 - 2897852
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  ||| || |||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  2897622 cgcctcgcgagcacttccagaacttagtgcatttgaggagtttgagacctgagttgcttagattgattaggagtggaactttaggtaatagtgaggccta 2897721  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2897722 tttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactggaattattattgaatg 2897820  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  2897821 atcaagaagttgatgaaaataaattgatatta 2897852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15051836 - 15051636
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| | || ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  15051836 cgcctcgcgagcacttctaggactgaatgcaagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgaccta 15051737  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  ||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || ||| ||||||    
T  15051736 tataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacctgagatgttaatgaatg 15051637  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  15051636 a 15051636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15482969 - 15482740
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||| || |||||||||    
T  15482969 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactt-aggtactaatgagaccta 15482871  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15482870 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 15482772  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
     ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15482771 ctcaagaaattgttgaaaatgaattgatatta 15482740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5223240 - 5223140
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5223240 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 5223141  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  5223140 a 5223140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12339642 - 12339542
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12339642 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 12339543  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  12339542 a 12339542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 4589038 - 4589132
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589038 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 4589132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 11300695 - 11300795
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || |||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11300695 gttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 11300794  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  11300795 a 11300795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15465041 - 15464941
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15465041 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 15464942  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  15464941 a 15464941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19775609 - 19775515
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19775609 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325992
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||  |  |||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||| |||| | |||| | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 42325992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14499635 - 14499405
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14499635 cgcctcgcgagcacatctagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatgaaactttaggtagtaatgagaccta 14499536  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| ||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14499535 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaa-ttgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 14499437  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14499436 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 14499405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30066256 - 30066026
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  30066256 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 30066157  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30066156 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 30066058  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  30066057 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 30066026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12173007 - 12172924
Alignment:
Q  118 aatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12173007 aatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55023177 - 55022947
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  ||||||| || || |||||||||    
T  55023177 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttagatactaatgagaccta 55023078  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  55023077 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 55022979  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  55022978 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 55022947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11300310 - 11300539
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  11300310 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 11300409  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  |  ||| |||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11300410 tctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 11300508  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  11300509 atcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15849884 - 15850113
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  | || | |||| ||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||    
T  15849884 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtacttggattgattaggattggaactttaggtactaatgagaccta 15849983  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||   ||  ||| ||||||   ||||||| || |||| |||||||| |||| | ||  ||||  |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  15849984 tttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaa-tgattatattgtgatatatggattgattgcataacttgaattattgttgaatg 15850082  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  15850083 atcaagaaattgtgaaaatgaattgttatta 15850113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11165328 - 11165558
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  11165328 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 11165427  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || ||||||    |  |||| ||  || | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11165428 tctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 11165526  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  11165527 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 11165558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 4111215 - 4111280
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  4111215 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 4111280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11854994 - 11854817
Alignment:
Q  50 tgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattg 149  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||  |||||||||  |||  |  |||||||   |  |||| || ||| | |    
T  11854994 tgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagt-g 11854896  T
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgat 227  Q
     |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11854895 tttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgat 11854817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15965112 - 15965047
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15965112 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15965047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15969036 - 15968971
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15969036 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15968971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15972960 - 15972895
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15972960 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15972895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 16750554 - 16750619
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  16750554 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 16750619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19775908 - 19775843
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  19775908 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 19775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 37439602 - 37439667
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  37439602 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 37439667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7109859 - 7109778
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  7109859 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 7109778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7113794 - 7113713
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  7113794 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 7113713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22321825 - 22321744
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  22321825 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 22321744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22336880 - 22336799
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  22336880 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 22336799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 27409592 - 27409673
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  27409592 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 27409673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28949885 - 28949804
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  28949885 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 28949804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 8489458 - 8489501
Alignment:
Q  188 atattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8489458 atattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 8489501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964745
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15964745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968669
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972593
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15972593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 31097353 - 31097460
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  31097353 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagaccta 31097452  T
Q  101 attaagat 108  Q
     |||||||    
T  31097453 tttaagat 31097460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 4107363 - 4107428
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  4107363 ttaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 4107428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11070229 - 11070148
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  11070229 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 11070148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15617535 - 15617454
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15617535 ttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatatta 15617454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854493
Alignment:
Q  179 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaatgaattgttatta 11854493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 37439901 - 37439969
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  37439901 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 37439969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17242279 - 17242180
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || ||| |||| ||||||| |  |||||||||  ||||||||||||    
T  17242279 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagaccta 17242180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 201
Target Start/End: Original strand, 23053006 - 23053076
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaat-attattgaatga 201  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23053006 ttatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaaatgattaatgaatga 23053076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12511211 - 12511150
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatatt 230  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  12511211 ttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatt 12511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822358
Alignment:
Q  170 ttatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatatt 230  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatt 46822358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 15877626 - 15877662
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15877626 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 15877662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38814691 - 38814547
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || |||  ||| ||||||| |  |||||||||| || || ||||||    
T  38814691 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgcgaccta 38814592  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa 145  Q
     | |||||  || |||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  38814591 ttaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaa 38814547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 422333 - 422597
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  422333 ctcgcgagcacttccagaacagagtgcttttgaggatgtaatgatctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctattt 422432  T
Q  104 aagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatc 203  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||| |||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  422433 aagatgttaactagaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcattacttgaattattcttgaatgatc 422532  T
Q  204 aagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  422533 tagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgct 422597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 173597 - 173367
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||  ||||||||    
T  173597 cgcctcgcgagcacttccataactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaaagagaccta 173498  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     | ||||| ||  |||  | || |||||   ||||||| || | || |||||||| |||| | || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  173497 ttaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgct-aagtgattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 173399  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || ||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  173398 ataaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 173367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 1882 - 2151
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  1882 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 1981  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaac-tgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
     ||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||||||||  || ||| ||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  1982 tttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcattgaat 2081  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2082 gatcaagatgttgttgaaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgcta 2151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1811 - 1544
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  |||| | |||||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  1811 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 1712  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1711 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatg 1612  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  1611 atcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataaagttgttgtgatctgattatgctgcta 1544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Original strand, 5338803 - 5339036
Alignment:
Q  25 gagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgt 124  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||   || ||||||     
T  5338803 gagtgcatttgagaatgtcgtgacctgaattgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctga 5338902  T
Q  125 gaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 224  Q
    ||||  |||||||||  ||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5338903 gaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttgaaatgaatt 5339002  T
Q  225 gat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5339003 gataattatgaagttatgctgttgttgtgatctg 5339036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 15353105 - 15353373
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  15353105 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaaccta 15353204  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  ||| ||| |||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  15353205 tctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaata 15353304  T
Q  201 at-caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15353305 atccttgatgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgct 15353373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16356751 - 16357006
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||||||  ||   | |||||||||| || ||||||    
T  16356751 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 16356850  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16356851 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 16356949  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356950 atcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 16357006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 16487876 - 16488144
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||| || |||   | |||||||||| || | ||||    
T  16487876 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtccta 16487975  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||   ||  ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16487976 tttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 16488075  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16488076 atcaagatgttgttgaaaagaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgcta 16488144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 16351647 - 16351914
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  16351647 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaaccta 16351746  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     |||||||||| || | ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  16351747 tttaagatgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 16351846  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16351847 aactagatgttgttgaaatgaattgttgttatgaatttatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 16351914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 11250360 - 11250627
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  11250360 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatg-gacattaggtagtaatgaaaccta 11250458  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | || |||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||||     
T  11250459 tttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacatgaattattcttgaata 11250558  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  11250559 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgct 11250627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 16348466 - 16348718
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||||||  ||   | |||||||||| || |||||| ||    
T  16348466 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 16348565  T
Q  104 aagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatc 203  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||   || | ||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16348566 aagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattatc 16348664  T
Q  204 aagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348665 aagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 16348718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25555823 - 25555556
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| || ||    
T  25555823 cgcctcacgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgg-acattaggtagtaatgaaactta 25555725  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  25555724 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 25555625  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  25555624 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 25555556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813085
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttttaatgttgtg 13813065  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  13813066 gtaatctgattatgctgcta 13813085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157526
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttataccgttgat 20157506  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20157507 gtgatctgattatgctgcta 20157526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36133761 - 36133991
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  36133761 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaagaaactttaggtattaatgagaccta 36133860  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  36133861 tttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgagttattattgaatg 36133959  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  36133960 atcaggaagttgttgaagatgaatggatatta 36133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12570342 - 12570142
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| || ||| || || | | ||| ||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  12570342 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 12570243  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      || ||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12570242 tataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatg 12570143  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  12570142 a 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 43256342 - 43256442
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43256342 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 43256441  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  43256442 a 43256442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17810579 - 17810349
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  17810579 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 17810480  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| |||||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17810479 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 17810381  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  17810380 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 17810349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23843799 - 23843613
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||| ||| || ||||||    
T  23843799 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgaccta 23843700  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23843699 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttga 23843613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15094094 - 15093838
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || | ||||| || ||||||    
T  15094094 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgaccta 15093995  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  ||||||||| |||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  15093994 tataagaagttaactgcaatctctgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaatatattattgaat 15093896  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatct 256  Q
    ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15093895 gattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctgttgttgtgatct 15093838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44675951 - 44675767
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| || || | | ||||||||  |||   |  ||||||||| || |||||| |    
T  44675951 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatt 44675852  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44675851 taagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga 44675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43255960 - 43256190
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  || || ||||||||| |||||||||||  |  || ||||||| || |||||||||    
T  43255960 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcatttgaggatttttagacctaagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagaccta 43256059  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatatta-ttgaat 199  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||   || |||| |||| || ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||    
T  43256060 tttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgtt-aagtgattataatgtgatataat-attatatgcattactt-aagaattatttgaat 43256156  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattat 232  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43256157 attcaagatgttgttgaattgaaattgatattat 43256190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14757221 - 14757451
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||| | |||| || |||||| | |||| | |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  14757221 cgccttgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaagttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 14757320  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14757321 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 14757419  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14757420 attaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 14757451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15225024 - 15224962
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15225024 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttaaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634451
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatatta 22634451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10712993 - 10712928
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10712993 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10712928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10926763 - 10926698
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10926763 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10926698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 5756886 - 5756967
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  5756886 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 5756967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9556688 - 9556607
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  9556688 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 9556607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12487851 - 12487802
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487851 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 12487802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 14954133 - 14954182
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954133 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 14954182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25690010 - 25689961
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690010 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 25689961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 1951564 - 1951791
Alignment:
Q  5 tcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatta 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  || || |||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |    
T  1951564 tcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttgaattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataa 1951663  T
Q  105 agatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaatgatc 203  Q
    |||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| | || || ||| ||||| ||   |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1951664 agatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaat-tttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 1951762  T
Q  204 aagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  1951763 aagaaattgttgaaaatgaattgttatta 1951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954500
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689643
Alignment:
Q  132 ttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 25689643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33742535 - 33742461
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  33742535 ttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttgaaatgaattg 33742461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 4561282 - 4561363
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||    
T  4561282 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatatta 4561363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27534184 - 27534103
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27534184 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatatta 27534103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10712697 - 10712629
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  10712697 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 10712629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10926467 - 10926399
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  10926467 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 10926399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12487552 - 12487484
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  12487552 gttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 12487484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 15125064 - 15125130
Alignment:
Q  114 ctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcat 179  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15125064 ctgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Original strand, 17152464 - 17152516
Alignment:
Q  179 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  17152464 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaatgaattgttatta 17152516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23139577 - 23139478
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || ||| |||| ||||||| |  |||||||||  ||||||||||||    
T  23139577 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagaccta 23139478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13569833 - 13569631
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||| | || || | | ||||||||  |||   | || |||| || || ||||||    
T  13569833 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgaccta 13569734  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| |||||   | ||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  13569733 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 13569634  T
Q  200 gat 202  Q
    |||    
T  13569633 gat 13569631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 15124952 - 15124988
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15124952 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 15124988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27533863 - 27533799
Alignment:
Q  135 tgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27533863 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatataatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 27533799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 711 - 443
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||  | || | | |||||| || |||   | |||||||||| || ||||||    
T  711 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgaccta 612  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||   ||  ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  611 tttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 512  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  511 atcaagatgtcgttgaaaagaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcta 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 1848
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  2109 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgccccgagttgattgaatttattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 2010  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||   || ||| ||||| |  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2009 tataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 1911  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    || | |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1910 ataacgatgttattgaaatgaattgtggttatgaacttataatgttgttgtggtctgattatg 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7522
Alignment:
Q  31 aattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtg 130  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||| ||||||||||||     
T  7759 aattgagaatgttatgacctgagttgcttagattggttaggaatggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagtt 7660  T
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    |||| |||||||||| ||| || ||||| | ||||| || ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  7659 gttaagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaatgaattgttgtt 7560  T
Q  231 atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7559 atgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgct 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 2234 - 2502
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  2234 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaaccta 2333  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      | |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||     
T  2334 tcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaata 2433  T
Q  201 at-caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2434 atccttgatgttgttgaattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10362
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  10094 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaaccta 10193  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      | |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||     
T  10194 tcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaata 10293  T
Q  201 at-caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    || |  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10294 atccttgatgttgttgaattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgct 10362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 959
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || |||||| |||||| || ||   |||||||||||  ||   | ||| |||||| || ||||||    
T  1214 cgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 1115  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||| ||| ||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1114 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatg 1016  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1015 atcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Original strand, 6221 - 6375
Alignment:
Q  115 tgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt 214  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6221 tgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgtt 6320  T
Q  215 gaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6321 gaaatgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgcta 6375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1892
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||  | | ||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  2067 ttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 1969  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1968 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9749 - 9566
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||  | | ||||||||||   ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  9749 ttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 9651  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9650 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatg-agttatgctgttgatgtgatctgattatgttg 9566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 256
Target Start/End: Original strand, 6294 - 6468
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  6294 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 6392  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatct 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6393 actcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatct 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42677
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgcta 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgatattatgaagtta--atgttgttgtgatctgattatgctgcta 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 66214 - 66444
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  66214 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 66313  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  66314 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 66412  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  66413 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 66444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53872 - 53642
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  53872 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 53773  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53772 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 53674  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  53673 atcaagaagttgttgaagatgaattgatatta 53642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 36052 - 36117
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  36052 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 36117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 36351 - 36419
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  36351 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8878 - 8611
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  8878 cgcctcgcgagcatttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattggttaggaatgg-acattaggtagtaatgaaaccta 8780  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  8779 tttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 8680  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  8679 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgct 8611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6876 - 7076
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||| |||   | |||||||||| || ||||||    
T  6876 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgaccta 6975  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  6976 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatg 7075  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  7076 a 7076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44318 - 44143
Alignment:
Q  81 ttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt 180  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||   || | ||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  44318 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 44220  T
Q  181 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44219 acttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 44143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 597 - 340
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |  |||||  || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  597 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaaattaagatgttaagacctcagttgcttgaattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgaccta 498  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||| |           ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  497 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca-----------tgaataattgcattactttaaatattattgaatg 409  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  408 atcaagatgttgttgaaatgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgct 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 485
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  638 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 539  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattat 154  Q
      |||||||||   || |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  538 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaactattaagctgattat 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10109
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactattgat 10089  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10090 gtgatctgattatgctgcta 10109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45425 - 45272
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  45425 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacaataggtagtagtgagaccta 45326  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattat 154  Q
      |||||||||   || |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  45325 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaactattaagctgattat 45272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 35891 - 35971
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  35891 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaattaattgatatta 35971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Original strand, 36209 - 36273
Alignment:
Q  135 tgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  36209 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 35309 - 35577
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||   ||||| |||||| || ||||||    
T  35309 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgacgtgacctgagttgaatgagttgagtaggaatggagctttatgtagtaatgtgaccta 35408  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     || |||||||  |||  | ||||||||  |||||||| | ||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  35409 tttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaata 35508  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35509 accttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct 35577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2955
Alignment:
Q  150 attataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaattaattgatattataaagttatattgttgat 2975  T
Q  250 gtgatctgattatgttgcta 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  2974 gtgatctgattatgctgcta 2955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 4023 - 4292
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  4023 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacttgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgaccta 4122  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  || ||||||   |||||||| ||||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  4123 tttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaata 4222  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    | |  || ||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  4223 accttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatcgaattataatgctgttgtgatctgattatgttgct 4292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 21604 - 21740
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  21604 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 21703  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatga 137  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  21704 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 21740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 29496 - 29632
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  29496 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 29595  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatga 137  Q
      |||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  29596 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 29632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 12981
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||| || |||||||||    
T  13211 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagaccta 13112  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||| ||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13111 tttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 13013  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  13012 atcaagaaattgttgaagatgaattgatatta 12981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19495 - 19265
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||  ||||||||||||    ||||| |||| || |||||  ||    
T  19495 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttagattgattaggaaatgaactttcggtactaatgagatata 19396  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||| ||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19395 tttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatg 19297  T
Q  201 atcaagatgttgttgaa-atgaattgatatta 231  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19296 atcaagaaattgttgaagatgaattgatatta 19265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 269
Target Start/End: Original strand, 73727 - 73833
Alignment:
Q  162 tttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  73727 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatg-aagtataatgttgttgtgatctgatta 73825  T
Q  262 tgttgcta 269  Q
    || |||||    
T  73826 tgctgcta 73833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 192115 - 192378
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || ||||||    
T  192115 cgcctcgtgagcacttccagaattgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgatttgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgaccta 192214  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||| | ||||  || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||     
T  192215 tttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaatt 192314  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  192315 accttgatgttgttgaaaatgaattgttataatgaagttataatgttgttgtgatttgaatatg 192378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3160 - 2960
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||| || || | |||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  3160 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttgg-actcttaggtagtagtgtgacct 3062  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  3061 atataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 2962  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  2961 ga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6826 - 6626
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttact-ttaggtagtagtgagacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||| || || | |||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  6826 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttgg-actcttaggtagtagtgtgacct 6728  T
Q  100 aattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    |  || ||||||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6727 atataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 6628  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  6627 ga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Original strand, 207767 - 207901
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt--gaaatgaattgata 228  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  207767 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgata 207866  T
Q  229 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 263  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||    
T  207867 ttatgaagttatactgttgatatgatatgattatg 207901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 13288 - 13501
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||    | |||||||| || ||||||||| |    
T  13288 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaattttaggtactaatgagacctatt 13387  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgat 202  Q
    |||||| ||  |||  | ||||| ||   ||||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13388 taagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgct-aagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgat 13486  T
Q  203 caagatgttgttgaa 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  13487 caagaagttgttgaa 13501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16147 - 16400
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||| |||||| || || | | ||||||||   ||   | || ||||||| |  ||||||    
T  16147 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgaccta 16246  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16247 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaagatattattgaat 16345  T
Q  200 gatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgat 254  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  16346 gattaagatgttgttgaaattaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgat 16400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33693 - 33609
Alignment:
Q  174 ttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33693 ttgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttgaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctg 33609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31060 - 30960
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31060 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 30961  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  30960 a 30960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2197 - 2070
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  2197 cgcctcgcgagcacttcgagaactgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 2098  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||    
T  2097 tataagaagttaactgcaatctgtgaag 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 7070 - 7336
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| || | |||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |  || |||     
T  7070 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtaacctgagttgtttggattgtttaggaatggaactttaggtagtattatgatctat 7169  T
Q  102 ttaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
     | |||||||  |||  |||||||| |  ||||||||  |||||| || || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  |||| |||||| |    
T  7170 gtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataa 7268  T
Q  202 tcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
        |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7269 ctttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgct 7336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12952
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   | |||||||||| |||||||||    
T  13079 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagaccta 12980  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaag 128  Q
      ||||| |||  ||||||| |||||||    
T  12979 tataagaagttaactgcaatttgtgaag 12952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 80556 - 80462
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 225  Q
    ||||||||||  ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80556 gttatgaactactaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 81019 - 80790
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  81019 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 80920  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||  ||  |||| || ||| | | |||||||||| |||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  80919 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattattgaatg 80821  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  80820 atcaggaagatgttgaaatgaattgttatta 80790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 65476 - 65557
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  65476 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 65557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 61560 - 61641
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  61560 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 61641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2472 - 2701
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||  | |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||| || |||||||||    
T  2472 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagaccta 2571  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  |  |||||||   |||||||||| | || |||||||| |||| | || |||||  ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2572 tttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgct-aagtgattatattgtgatatattgattgattggattacttgaattgttattgaatg 2670  T
Q  201 atcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2671 atcaagaaattgttgaaatgaattgttatta 2701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 34791 - 34908
Alignment:
Q  84 ggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattact 183  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  184 tgaaatattattgaatga 201  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 34708 - 34746
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaa 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34708 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaa 34746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6756
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6856 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 6757  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  6756 a 6756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11687 - 11457
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| ||||||  || |||||    
T  11687 cgcctcgcgagcacttccataactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttatgtagtaaggaaaccta 11588  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||          ||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  11587 tttaagatgttaactggaatctgtgaag----------ctgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaata 11498  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattat 240  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  11497 aacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattat 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2219
Alignment:
Q  175 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgct 268  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2313 tgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatttgattatgctgct 2219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Original strand, 38283 - 38534
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaag 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||| || || | | ||||||||   ||   | || ||||||| || ||||||  ||||    
T  38283 gcgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 38382  T
Q  107 atgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaa 205  Q
    | ||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  38383 aagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaa 38481  T
Q  206 gatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||    
T  38482 gatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctg 38534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 23578 - 23695
Alignment:
Q  115 tgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgt 213  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| | ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23578 tgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgt 23676  T
Q  214 tgaaatg-aattgatatta 231  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23677 tgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10383 - 10588
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||    |||||| ||| || |||||||||    
T  10383 cgcctcgcgagcacttcaagaaatgagtgcatttaagaattttgagacctgagttgcttggattgataaggaaaagaactttaagtactaatgagaccta 10482  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     ||||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| |  ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10483 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 10581  T
Q  201 atcaaga 207  Q
    |||||||    
T  10582 atcaaga 10588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 70117 - 69905
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  70117 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 70018  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||  |||||   |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  70017 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 69918  T
Q  200 gatcaagatgttg 212  Q
    |||  ||||||||    
T  69917 gattgagatgttg 69905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 9467 - 9670
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||| ||| |||||||||||| |  || ||||||| || ||||||||| ||    
T  9467 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattatgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattt 9566  T
Q  104 aagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaatgat 202  Q
    ||||| ||  |||  | ||||||||   ||||||| | || || ||||||||||||| |||| |||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9567 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaat-tttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcatttacttgaattattattgaatgat 9665  T
Q  203 caaga 207  Q
    |||||    
T  9666 caaga 9670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20494
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 230  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20394 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaatgaattgttatt 20493  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  20494 a 20494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19816 - 20047
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  19816 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 19915  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt-acttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||   ||  | ||||||||   |||||||  ||||| | |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19916 ttaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaat 20014  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  20015 gatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 20047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 228172 - 228403
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  || ||||||| || |||||||||    
T  228172 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagaccta 228271  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     ||||||| ||  |||  | |||||||||  ||||||| || | || ||||||||  ||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  228272 cttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgct-aagtgattatatagtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaat 228370  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  | |||| |||||||||| |||||    
T  228371 gatcaagaaatagttgaaaatgaattgttatta 228403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18431 - 18661
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || |||||||| ||| |||  ||||||| |  |||||||||| |  |||||||||    
T  18431 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattagttaggaagggaactttaggtactgctgagaccta 18530  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
     | ||||| |||  ||  | ||||||||   ||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18531 ttaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatttttgaatg 18629  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||  || ||| |||||||||| |||||    
T  18630 atcaagaaattattgaaaatgaattgttatta 18661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4062 - 3877
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||  | || | | ||||||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  4062 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 3964  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
      |||||| ||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3963 tataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8493 - 8308
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||  | || | | ||||||||  |||   | || ||||||| || ||||||    
T  8493 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 8395  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
      |||||| ||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8394 tataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7611 - 7485
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||    
T  7611 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 7512  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaa 127  Q
      ||||| |||  ||||||||| ||||    
T  7511 tataagaagttaactgcaatctatgaa 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Original strand, 4779 - 4859
Alignment:
Q  178 attacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  4779 attacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctg 4859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3904
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  3675 cgcctcgcgagcacatccagaattgagtgct-ttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 3773  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      | |||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3774 tctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatg 3872  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  3873 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 3904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 13992 - 14075
Alignment:
Q  118 aatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13992 aatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaatgaatga 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 13875 - 13913
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaa 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13875 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaa 13913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15467 - 15669
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||| || |||||||||| || |||| | ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||    
T  15467 cgcctcgcgatcacttctagaacttagtgcaagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 15566  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  15567 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 15666  T
Q  200 gat 202  Q
    |||    
T  15667 gat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 5049 - 5130
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  5049 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 5130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 1031 - 1258
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaag 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| || || | | ||||||||  |||   | || ||||||| |  ||||||  ||||    
T  1031 gcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataag 1130  T
Q  107 atgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaa 205  Q
    | |||  |||||||| ||||||  |||||||| | ||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  1131 aagttaactgcaatcagtgaagctgttatgaaatattaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaa 1229  T
Q  206 gatgttgttgaaatg-aattgatattatg 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1230 gatgttgttgaaatgaaattgatattatg 1258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 472
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  537 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 11467 - 11532
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  11467 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 11532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 11766 - 11834
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11766 gttatgaactgctaagttgtttttaatgcgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 14053 - 14118
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  14053 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 14352 - 14420
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14352 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20304 - 20102
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||| ||||| || || ||| ||||||||| |||   | || ||||||| |||||||||    
T  20304 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggataatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagaccta 20205  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgtta-aattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
      ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||  |||||   |||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  20204 tataagaagttaactgcaacctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 20105  T
Q  200 gat 202  Q
    |||    
T  20104 gat 20102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32642 - 32544
Alignment:
Q  115 tgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||  ||||||||    
T  32642 tgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgattgagatgttg 32544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 32755 - 32719
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32755 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 32719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 189343 - 189408
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  189343 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 189408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24767 - 24971
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  24767 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 24866  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||| |||  | ||||||||   ||| ||| |||| || ||||||||| |||  |||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24867 ttaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgtt-aagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 24965  T
Q  200 gatcaa 205  Q
    ||||||    
T  24966 gatcaa 24971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 189642 - 189710
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  189642 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 32626 - 32675
Alignment:
Q  163 ttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32626 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 32675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 32925 - 32993
Alignment:
Q  131 gttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  32925 gttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 32993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 5799 - 5900
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  5799 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagaccta 5898  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  5899 at 5900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 58667 - 58748
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  58667 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 58748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12729 - 12499
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||  ||||| |  ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  12729 cgcctcgcgagcacatctagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagaccta 12630  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatg 200  Q
      |||||||||  |||  || |||||||   |  |||| || ||| | | |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12629 tctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattaaatg 12531  T
Q  201 atcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||||||||    
T  12530 attgggaagttgttgaaaatgaattgatatta 12499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 15217 - 15288
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattagga 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  15217 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctttgattgattagga 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Original strand, 15066 - 15276
Alignment:
Q  59 tgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatg 158  Q
    ||||| || ||||||||  ||||  ||||||| || |||||| ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| || |||   | || |||||    
T  15066 tgaatcgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatg 15165  T
Q  159 tggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    || |||||||||||  ||||||||| |   |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  15166 tgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctg 15265  T
Q  258 attatgttgct 268  Q
    | |||| ||||    
T  15266 aatatgatgct 15276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Original strand, 19588 - 19798
Alignment:
Q  59 tgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatg 158  Q
    ||||| || ||||||||  ||||  ||||||| || |||||| ||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| || |||   | || |||||    
T  19588 tgaatcgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatg 19687  T
Q  159 tggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg 257  Q
    || |||||||||||  ||||||||| |   |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19688 tgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctg 19787  T
Q  258 attatgttgct 268  Q
    | |||| ||||    
T  19788 aatatgctgct 19798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 236 - 5
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || |||||||| ||| |||| ||||||  |  |||||||||| || |||||| ||    
T  236 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggataggaactttaggtactaatgagactta 137  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgcatt-acttgaaatattattgaat 199  Q
     | || || ||| |||  | ||||||||   ||||||| |||||| | || ||||| |||  |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  136 ttaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagt-gaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaat 38  T
Q  200 gatcaagatgttgttga-aatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  37 gatcaagaaattgttgagaatgaattgttatta 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3329 - 3560
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || || || ||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||| || ||||||| |    
T  3329 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagaccttagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagaccca 3428  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaattgattataatgtggtttaatgattatttgca-ttacttgaaatattattgaat 199  Q
     | ||||| ||| |||  | ||||||||   ||||||| |||| || ||| ||||  |||  |||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  3429 ttaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgtt-aagtgaatatagagtgaattatggattgattgcatttacttgaattgttattgaat 3527  T
Q  200 gatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 231  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  3528 gatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18251 - 18437
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||| || || || | | ||||||||  |||   |  | ||||||| || ||||||    
T  18251 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 18350  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa-attgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttga 186  Q
     |||||| |||  || ||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  18351 tttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattacttga 18437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 956 - 1009
Alignment:
Q  151 ttataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatgatca 204  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  956 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36696 - 36567
Alignment:
Q  84 ggtagtagtgagacctaattaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgtta-aattgattataatgtggtttaatgattatttgcattac 182  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||  |||||   |||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  36696 ggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattac 36597  T
Q  183 ttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 212  Q
    ||||| ||| | ||||||||  ||||||||    
T  36596 ttgaactatgaatgaatgattgagatgttg 36567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15722 - 15672
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  15722 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctg 15672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1661 - 1611
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  1661 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctg 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 48258 - 48308
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  48258 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgcgatctg 48308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 175086 - 174864
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagacctaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |   || |||||| || || ||| ||||||||  |||   | || ||||||| |||||||||      
T  175086 cctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctata 174987  T
Q  103 taagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaaa-ttgattataatgtggtttaatgattatttgcattacttgaaatattattgaatga 201  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||   ||||||  |||||   |||| ||| | ||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  174986 taagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatga 174887  T
Q  202 tcaagatgttgttgaaatgaatt 224  Q
    |  ||||||||||||| ||||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatt 174864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 6422 - 6374
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctg 51  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  6422 cctcgcgagcacttccagaactgtgtgcaagtgaggatgttgcgatctg 6374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 8755 - 8791
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8755 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 8791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10210 - 10066
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacggagtgcaattgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatgttactttaggtagtagtgagaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  || || ||||| || |||  ||| ||||||| |  |||||||||| || || ||||||    
T  10210 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgaccta 10111  T
Q  101 attaagatgttggctgcaatctgtgaagtggttatgaactgttaa 145  Q
     | |||||  || |||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  10110 ttaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaa 10066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1228 times since January 2019
Visitors: 3841