View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0619_low_19 (Length: 392)

Name: NF0619_low_19
Description: NF0619
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0619_low_19
NF0619_low_19
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (81-295)||(6781-6995)
scaffold0346 (81-240)||(3911-4070)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (81-294)||(5394-5607)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (81-294)||(21258-21473)
scaffold0004 (84-290)||(366687-366893)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (81-294)||(31159-31371)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (81-294)||(19781681-19781894)
chr1 (87-289)||(8649696-8649898)
chr1 (84-294)||(22466334-22466544)
chr1 (84-294)||(8950793-8951003)
chr1 (81-290)||(19773140-19773349)
chr1 (81-290)||(19773985-19774194)
chr1 (81-290)||(19774830-19775039)
chr1 (81-290)||(19775675-19775884)
chr1 (81-290)||(19776520-19776729)
chr1 (105-294)||(21802050-21802239)
chr1 (105-294)||(22844402-22844591)
chr1 (81-294)||(20234205-20234418)
chr1 (81-170)||(19777365-19777454)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (93-294)||(27720-27921)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (81-294)||(23616826-23617039)
chr6 (77-291)||(18301318-18301532)
chr6 (84-294)||(18008529-18008739)
chr6 (126-294)||(2653570-2653738)
chr6 (81-193)||(10716869-10716981)
chr6 (92-294)||(20019605-20019807)
chr6 (81-295)||(22596447-22596661)
chr6 (105-294)||(20103482-20103671)
chr6 (105-294)||(22770485-22770674)
chr6 (105-294)||(20166878-20167067)
chr6 (194-294)||(19561189-19561289)
chr6 (108-294)||(23521116-23521302)
chr6 (232-294)||(11216655-11216717)
chr6 (126-294)||(8727383-8727551)
chr6 (105-165)||(25587448-25587508)
chr6 (204-265)||(29683290-29683351)
chr6 (117-170)||(29683385-29683438)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (82-294)||(9813-10025)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (81-294)||(16528696-16528909)
chr7 (81-294)||(16764336-16764549)
chr7 (81-294)||(13654639-13654852)
chr7 (81-294)||(18596647-18596860)
chr7 (81-294)||(18614845-18615058)
chr7 (84-286)||(11958165-11958367)
chr7 (84-294)||(20104941-20105151)
chr7 (92-294)||(13670504-13670706)
chr7 (81-180)||(16763147-16763246)
chr7 (81-154)||(13372394-13372467)
chr7 (191-287)||(12738350-12738446)
chr7 (87-170)||(12752236-12752319)
chr7 (105-294)||(18276682-18276871)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (89-294)||(16679060-16679265)
chr4 (77-294)||(15263412-15263629)
chr4 (132-294)||(4900-5062)
chr4 (84-294)||(15858796-15859006)
chr4 (108-295)||(11919654-11919841)
chr4 (92-294)||(479-681)
chr4 (126-294)||(15251018-15251186)
chr4 (84-294)||(15304677-15304887)
chr4 (105-229)||(22107712-22107836)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (81-294)||(86-299)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (81-294)||(6784-6997)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (81-294)||(25119512-25119724)
chr5 (81-294)||(25178603-25178815)
chr5 (81-294)||(20441532-20441745)
chr5 (81-294)||(30766459-30766672)
chr5 (126-294)||(21273969-21274137)
chr5 (105-294)||(22320803-22320992)
chr5 (92-295)||(21384959-21385165)
chr5 (105-229)||(26780018-26780142)
chr5 (105-229)||(24966541-24966665)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (77-294)||(3342556-3342773)
chr3 (81-268)||(12163409-12163596)
chr3 (89-294)||(17452595-17452801)
chr3 (81-294)||(14068874-14069087)
chr3 (105-294)||(11877690-11877879)
chr3 (105-294)||(10163570-10163759)
chr3 (105-293)||(15641755-15641943)
chr3 (187-294)||(13200108-13200215)
chr3 (84-294)||(12381338-12381548)
chr3 (105-294)||(15632266-15632455)
chr3 (105-294)||(13139520-13139709)
chr3 (105-229)||(12190169-12190293)
chr3 (105-229)||(12196827-12196951)
chr3 (187-294)||(13076160-13076267)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (81-294)||(22868397-22868610)
chr2 (81-284)||(20303484-20303687)
chr2 (81-294)||(114187-114400)
chr2 (81-294)||(27620246-27620459)
chr2 (81-294)||(25374276-25374489)
chr2 (81-294)||(25136431-25136644)
chr2 (84-295)||(25147233-25147444)
chr2 (92-294)||(22290872-22291074)
chr2 (92-294)||(16772328-16772530)
chr2 (143-294)||(18991671-18991822)
chr2 (84-267)||(21894484-21894667)
chr2 (105-294)||(24798686-24798875)
chr2 (110-265)||(24172818-24172974)
chr2 (108-295)||(23248429-23248616)
chr2 (84-294)||(22047990-22048200)
chr2 (105-229)||(27624342-27624466)
chr2 (225-295)||(29954275-29954345)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (81-294)||(27172-27385)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (81-286)||(22877-23082)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (81-294)||(18401959-18402172)
chr8 (77-294)||(21824053-21824270)
chr8 (81-294)||(22287691-22287904)
chr8 (83-294)||(22828582-22828793)
chr8 (84-294)||(25458121-25458331)
chr8 (128-284)||(22360105-22360261)
chr8 (105-229)||(8311219-8311343)
chr8 (84-294)||(22036839-22037049)
chr8 (105-238)||(22095971-22096104)
chr8 (105-229)||(21335633-21335757)
chr8 (187-294)||(21952754-21952861)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (81-294)||(197292-197505)
scaffold0016 (126-256)||(205956-206086)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (81-265)||(593-777)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (81-234)||(6208-6361)
scaffold0326 (81-234)||(14110-14263)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (84-294)||(59780-59989)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (84-294)||(39699-39909)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (84-294)||(766-976)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (84-294)||(117634-117844)
scaffold0020 (84-286)||(113338-113540)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (132-294)||(37751-37913)
scaffold0075 (132-294)||(44481-44643)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (84-294)||(25412-25622)
scaffold0042 (194-294)||(52622-52722)
scaffold0042 (87-168)||(49858-49939)
[»] scaffold1589 (1 HSPs)
scaffold1589 (126-294)||(336-504)
[»] scaffold0802 (2 HSPs)
scaffold0802 (84-294)||(739-949)
scaffold0802 (84-294)||(1643-1853)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (84-288)||(36161-36365)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (84-294)||(51215-51425)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (187-294)||(773-880)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (207-294)||(803-890)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (227-294)||(8883-8950)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (84-249)||(47226-47391)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (132-294)||(4026-4188)
[»] scaffold0613 (1 HSPs)
scaffold0613 (105-238)||(9441-9574)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (84-217)||(2064-2197)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (105-290)||(21261-21446)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (84-169)||(1-86)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (117-170)||(12539-12592)


Alignment Details
Target: scaffold0346 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 295
Target Start/End: Original strand, 6781 - 6995
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6781 atcatagggcaatcatggtcataaacaatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 6880  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6881 ctatggggataacagaacgatcgactaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 6980  T
Q  281 aacactagctcctag 295  Q
    |||||||||||||||    
T  6981 aacactagctcctag 6995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 240
Target Start/End: Original strand, 3911 - 4070
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3911 atcatagggcattcatggtcttcctctatatcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacgtatccaa 4010  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4011 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctc 4070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 5394 - 5607
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5394 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacgaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacgtatccaa 5493  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5494 ctatgggaataacagaacgatcgactaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 5593  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  5594 aacactagctccta 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 21258 - 21473
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctat--cttaacggggatgtcctcagcgtatcc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21258 atcatagggcaatcatggtcttcctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatatcttaacggggatgtcctcaacgtatcc 21357  T
Q  179 aactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaa 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21358 aactatggggataacagaatgatcggctaatttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaa 21457  T
Q  279 ctaacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||||    
T  21458 ctaacactagctccta 21473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Original strand, 366687 - 366893
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  366687 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattctaacggggatgtcctcaacatatccgacag 366786  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  366787 gttggatatcagaacgatcggctaactttaatgttgtttcggtaggtttcaactcccctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacaaactaac 366886  T
Q  284 actagct 290  Q
    |||||||    
T  366887 actagct 366893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 31159 - 31371
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31159 atcatagggcaatcatggtcttcctctatgtcaacaaccacaaa-tcagtcgggatgtatatcccttctaccttaatggggatgtcctcaacgtatccaa 31257  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31258 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggataaaggcaacaaact 31357  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  31358 aacactagctccta 31371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19781894 - 19781681
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19781894 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 19781795  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19781794 ctatgggaataacagaacgatcgactaacttaaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 19781695  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  19781694 aacactagctccta 19781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8649898 - 8649696
Alignment:
Q  87 gggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatgg 186  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||         
T  8649898 gggcactcattgtcttcttctatgtcaagcaccataaaatcagtcgggatatatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccgacaggtt 8649799  T
Q  187 ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacact 286  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8649798 ggatagtagaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatcttcttaaagagggataagggtagcaaactaacact 8649699  T
Q  287 agc 289  Q
    |||    
T  8649698 agc 8649696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 22466334 - 22466544
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  22466334 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 22466433  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  22466434 gttggatatgagaacgataggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagaggggtaggggcaacaaactaac 22466533  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  22466534 actagctccta 22466544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 8950793 - 8951003
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||      
T  8950793 atagggcactcattgtcttcttctatgtcaagtaccataaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcataacgggaatgtcctggacatatccgacag 8950892  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  8950893 gttggatagtagaacggtcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcttattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 8950992  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  8950993 actagcaccta 8951003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 19773140 - 19773349
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  19773140 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatgtccaa 19773239  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
          |||||  | || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19773240 tgggttggatagtataatgatcaactaacttcaatgtcatctcggtaagttttaactctcttattcccatcttcttaaagagggataaaggcaacaaact 19773339  T
Q  281 aacactagct 290  Q
    ||||||||||    
T  19773340 aacactagct 19773349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 19773985 - 19774194
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  19773985 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatgtccaa 19774084  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
          |||||  | || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19774085 tgggttggatagtataatgatcaactaacttcaatgtcatctcggtaagttttaactctcttattcccatcttcttaaagagggataaaggcaacaaact 19774184  T
Q  281 aacactagct 290  Q
    ||||||||||    
T  19774185 aacactagct 19774194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 19774830 - 19775039
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  19774830 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatgtccaa 19774929  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
          |||||  | || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19774930 tgggttggatagtataatgatcaactaacttcaatgtcatctcggtaagttttaactctcttattcccatcttcttaaagagggataaaggcaacaaact 19775029  T
Q  281 aacactagct 290  Q
    ||||||||||    
T  19775030 aacactagct 19775039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 19775675 - 19775884
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  19775675 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatgtccaa 19775774  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
          |||||  | || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19775775 tgggttggatagtataatgatcaactaacttcaatgtcatctcggtaagttttaactctcttattcccatcttcttaaagagggataaaggcaacaaact 19775874  T
Q  281 aacactagct 290  Q
    ||||||||||    
T  19775875 aacactagct 19775884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 19776520 - 19776729
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  19776520 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatgtccaa 19776619  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
          |||||  | || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19776620 tgggttggatagtataatgatcaactaacttcaatgtcatctcggtaagttttaactctcttattcccatcttcttaaagagggataaaggcaacaaact 19776719  T
Q  281 aacactagct 290  Q
    ||||||||||    
T  19776720 aacactagct 19776729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 21802050 - 21802239
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  21802050 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctcgatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 21802149  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  21802150 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttaaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 21802239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22844591 - 22844402
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  22844591 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctcgatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 22844492  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  22844491 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 22844402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20234418 - 20234205
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||| |||  ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |    
T  20234418 atcatagggcactcactgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagtggggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgatatatccga 20234319  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |     ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || |||    
T  20234318 caggttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggctttaactctcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagact 20234219  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  20234218 aacacttgctccta 20234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 19777365 - 19777454
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctca 170  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19777365 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctca 19777454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 93 - 294
Target Start/End: Original strand, 27720 - 27921
Alignment:
Q  93 tcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataa 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27720 tcatggtcttcctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatctttacggggatgtcctcaacgtatccaactatggggataa 27819  T
Q  193 cagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcc 292  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27820 cggaacgatcggctaacttcactgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaactaacactagctcc 27919  T
Q  293 ta 294  Q
    ||    
T  27920 ta 27921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 23616826 - 23617039
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23616826 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcctgatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacgtatccaa 23616925  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23616926 ctatggggataatagaacgatctgctaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctatttccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 23617025  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  23617026 aacactagctccta 23617039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18301532 - 18301318
Alignment:
Q  77 tagtatcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtat 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18301532 tagtatcatagggcaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtat 18301433  T
Q  177 ccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagca 276  Q
    || ||||| ||||| || ||||| || || || || ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18301432 ccgactattgggatgaccgaacggtcagccaattttaatatcatctgggtaggtttcaattctcctattccaatctttttaaagagggataaaggcaaca 18301333  T
Q  277 aactaacactagctc 291  Q
    | |||||||| ||||    
T  18301332 agctaacactggctc 18301318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18008739 - 18008529
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  18008739 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtacatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 18008640  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18008639 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactcttctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 18008540  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  18008539 actagcaccta 18008529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2653738 - 2653570
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatgg-ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcg 224  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||| || |||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  2653738 tcagtccggatgtatatctcttctaccttaacggggatgtactcaacatatccgac-atgttggatagtagaacgatcagctaacttcaatgttgtttcg 2653640  T
Q  225 gtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2653639 gtaggtttcaactctcctattcccatcttcttaaagagggatagaggcaacaagctaacactagcaccta 2653570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 10716869 - 10716981
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  10716869 atcatagggcaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtatccag 10716968  T
Q  181 ctatggggataac 193  Q
    |||| ||||||||    
T  10716969 ctatcgggataac 10716981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Original strand, 20019605 - 20019807
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||   ||| ||||| |  ||||||    
T  20019605 atcatggtcctcctctatgtcaaccaccacgaaatcagtcgggatatatatcccttctattttgacaggtatgtcctcgatgtagccaacgagagggata 20019704  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctc 291  Q
      ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||| |    
T  20019705 gtagaacgatccgctaacttcaagatcatctcggtaggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataagggcaacaaacttacactagccc 20019804  T
Q  292 cta 294  Q
    |||    
T  20019805 cta 20019807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 295
Target Start/End: Original strand, 22596447 - 22596661
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  22596447 atcatagggcaatgatggtcctcttctgtgtcaactacaagaaaatcagccgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacaaatccaa 22596546  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
     |     ||||  |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  22596547 atggttagatagtagaacggtcagctaacttcaaggtcatctcggtacattttatttctcctattctcatcttcttaaagagggacaaaggcaacaagct 22596646  T
Q  281 aacactagctcctag 295  Q
    |||||||||||||||    
T  22596647 aacactagctcctag 22596661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20103671 - 20103482
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||| |  ||||||  ||||||||| |    
T  20103671 tctatgtcaaccaccacgaaatcagttgggatatatatcccttctattttgacgggtatgtcctcgatgtagccaacgagagggatagtagaacgatccg 20103572  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20103571 ctaacttcaagatcatctcggtaggtttaagctctcctattcccattcttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagccccta 20103482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 22770485 - 22770674
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  22770485 tctatgtcgaccactacaaaatcagttgggatatatatcccttctatcttaacgggtatgtcctcgatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 22770584  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22770585 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcagcaaacttacactagctccta 22770674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20167067 - 20166878
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  20167067 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctctatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 20166968  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  20166967 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 20166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 19561189 - 19561289
Alignment:
Q  194 agaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcct 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| |||    
T  19561189 agaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctatttccatctttttaaagagggataagggaaacaaacttacactagcacct 19561288  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  19561289 a 19561289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Original strand, 23521116 - 23521302
Alignment:
Q  108 atgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggcta 207  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |  ||||||| |   ||||   |||| |||| ||||    
T  23521116 atgtcaactaccacaaaatcagctgggatgtatatcccttttatcttaacgaggatgtcctcgacaaatccaaccagttggattgtagaatgatcagcta 23521215  T
Q  208 acttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||    
T  23521216 acttcaaggtcatcccagaaggtttcaactctcctattcccattctcttaaagagggacaaaggcaataagctaacacttgctccta 23521302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11216717 - 11216655
Alignment:
Q  232 tcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11216717 tcaactctccaattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaactaacactaactccta 11216655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 8727383 - 8727551
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcgg 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  8727383 tcagttgggatgtttatcccttcaattttaacggggatgtcctcaacatatccgacaggttggatatcagaacgatcatctaatttaaatgttatttcgg 8727482  T
Q  226 taggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||| || |||||||| || || | | |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  8727483 taggctttaactctcccatccctagccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 8727551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25587508 - 25587448
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgt 165  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25587508 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgt 25587448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29683351 - 29683290
Alignment:
Q  204 gctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagaggga 265  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||    
T  29683351 gctaatttcaaggtcatctcggtaggtttcaactcacctttacccatcttcttaaaaaggga 29683290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29683438 - 29683385
Alignment:
Q  117 accacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctca 170  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  29683438 accacaaaatcagttgggatatatatccctcctaccttaacgaggatgtcctca 29683385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 294
Target Start/End: Original strand, 9813 - 10025
Alignment:
Q  82 tcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaac 181  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9813 tcatagggcaatcatggtcttcttctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaac 9912  T
Q  182 tatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaacta 281  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9913 taggtggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatcttggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaacta 10012  T
Q  282 acactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||    
T  10013 acactagttccta 10025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16528909 - 16528696
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16528909 atcatagggcagtcatggtcttcctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcaggatctatatcccttctacctttacggggatgtcctcaacgtatccaa 16528810  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16528809 ctatggggataacggaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttatagagggatagaggcaacaaact 16528710  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  16528709 aacactagctccta 16528696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 16764336 - 16764549
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16764336 atcatagggcaatcatgtttttcctcgatgtcagcaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 16764435  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16764436 ctatggggataacagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagaaggatagaggcaacaaact 16764535  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  16764536 aacactagctccta 16764549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13654852 - 13654639
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||    
T  13654852 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacagggatgtcctcaacatatcaaa 13654753  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13654752 ctatggggataacggaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcctatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 13654653  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  13654652 aacactggctccta 13654639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 18596647 - 18596860
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  18596647 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatctgaacggggatgtcttcaacatatccag 18596746  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18596747 ctattaggataacagaacggtcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactcttctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 18596846  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||| ||||||    
T  18596847 aacactacctccta 18596860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18615058 - 18614845
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  18615058 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatctgaacggggatgtcttcaacatatccag 18614959  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18614958 ctattaggataacagaacggtcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactcttctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 18614859  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||| ||||||    
T  18614858 aacactacctccta 18614845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 286
Target Start/End: Original strand, 11958165 - 11958367
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  11958165 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatcagtcgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccga-ta 11958263  T
Q  184 tgg-ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaa 282  Q
     |  |||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11958264 ggttggatattagaatgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaa 11958363  T
Q  283 cact 286  Q
    ||||    
T  11958364 cact 11958367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20105151 - 20104941
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  || |    
T  20105151 atagggcactcattgtcttcttctatgttaagcaccataaaatcagtcgtgatgtatatcccttctatcttatcggggatgtcctcaacatatcggac-a 20105053  T
Q  184 tgg-ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaa 282  Q
    ||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||    
T  20105052 tgttggatagtagaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtatgtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataatgacaacaaactaa 20104953  T
Q  283 cactagctccta 294  Q
    ||||||| ||||    
T  20104952 cactagcaccta 20104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13670706 - 13670504
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||| |  ||||||    
T  13670706 atcatggtcctcctctatgtcaaccaccacgaaatcagtcgggatatatatcccttctattttgacgggtatgtcctcgatgtagccaacgagagggata 13670607  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctc 291  Q
      ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||| ||| |||| |    
T  13670606 gtagaacgatccgctaacttcaagatcatctcggtaggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataagggcaacaaacttacattagccc 13670507  T
Q  292 cta 294  Q
    |||    
T  13670506 cta 13670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Original strand, 16763147 - 16763246
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16763147 atcatagggcaatcatgtttttcctcgatgtcagcaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 16763246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 13372394 - 13372467
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatctt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13372394 atcatagggcaatcatggtcttcttctatgtcaacaaccacagagtcagtcgggatgtatatcccttctatctt 13372467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12738446 - 12738350
Alignment:
Q  191 aacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacacta 287  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  12738446 aacataacgatcagctaatttcagtgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatcttcttaaagagggataagggtaacaaactaacacta 12738350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12752319 - 12752236
Alignment:
Q  87 gggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctca 170  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12752319 gggcactcattgtcttcttctatgtcaagcaccataaaatcaattgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctca 12752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18276871 - 18276682
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  18276871 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtccttgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 18276772  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || | ||  || |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  18276771 ctaacttcaatgttgtttcggtaggctttagcttgcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 18276682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16679265 - 16679060
Alignment:
Q  89 gcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatgggg 188  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16679265 gcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatatccaactatgggg 16679166  T
Q  189 ataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16679165 ataacagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaactaacactgg 16679066  T
Q  289 ctccta 294  Q
    ||||||    
T  16679065 ctccta 16679060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 15263412 - 15263629
Alignment:
Q  77 tagtatcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtat 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15263412 tagtatcatagggcaattgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtat 15263511  T
Q  177 ccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagca 276  Q
    ||  |||| ||||| || || || || || || || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15263512 ccggctatcgggatgaccgagcggtcagccaattttagtatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaaca 15263611  T
Q  277 aactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||| |||||||    
T  15263612 aactaacactggctccta 15263629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Original strand, 4900 - 5062
Alignment:
Q  132 gggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4900 gggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacagattggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtt 4999  T
Q  232 tcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  5000 tcaactcccctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 5062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15859006 - 15858796
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||  ||      
T  15859006 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatcagtcgggatgtatatcccttctattttaatagggatgtcctcaacatatctgacag 15858907  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  15858906 gttggatattagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacaaactaac 15858807  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  15858806 actagcaccta 15858796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 11919654 - 11919841
Alignment:
Q  108 atgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggcta 207  Q
    |||||||  |||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | | |  ||||  |||||||||  |||    
T  11919654 atgtcaattaccataaaatcagccaggatggatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacaaatccagccaggtagatagtagaacgatcaacta 11919753  T
Q  208 acttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcctag 295  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11919754 acttcaaggtcatctcggaaggtttcaactcacctacacccatcctcttaaagagggacaaaggcaacaagctaacactagctcctag 11919841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Original strand, 479 - 681
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||| |||  ||||||    
T  479 atcatggtcctcttctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttgacgggtatgtcctcaatgtagccagctagagggata 578  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctc 291  Q
      ||||||||| ||||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |    
T  579 gtagaacgatctgctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagccc 678  T
Q  292 cta 294  Q
    |||    
T  679 cta 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15251186 - 15251018
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcgg 225  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15251186 tcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgatatatccgacaggttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcgg 15251087  T
Q  226 taggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||| || ||||||||||  |||| | || ||||||||| ||  |||| || ||||||||| |||||||    
T  15251086 taggctttaactctcctaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaacacttgctccta 15251018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15304887 - 15304677
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  15304887 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacaa 15304788  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| |  |||| | |||||||||||| ||  ||||  | ||||||    
T  15304787 gttggatatcagaacaatcggctagctttaatgttgtttcggtaggctttaactctccgaaccccagccttttaaagaggggtaagggcaatagactaac 15304688  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  15304687 actagctccta 15304677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22107836 - 22107712
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  22107836 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctatcttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 22107737  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  22107736 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 22107712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 86 - 299
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  86 atcataaggcaatcaaggtcttcctcgatgtcaacaaccgcaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 185  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  186 ctatggggataacggaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatcattttaaagagggatagaggcaacaaact 285  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  286 aacactagctccta 299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6997 - 6784
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  6997 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacagggatgtcttcaacatatccaa 6898  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6897 ctatggggataatagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 6798  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  6797 aacactggctccta 6784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 25119512 - 25119724
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  25119512 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatct-aacggggatgtcttcaacatatccaa 25119610  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25119611 ctatggggataacagaactatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 25119710  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  25119711 aacactggctccta 25119724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 25178603 - 25178815
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  25178603 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatct-aacggggatgtcttcaacatatccaa 25178701  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25178702 ctatggggataacagaactatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 25178801  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  25178802 aacactggctccta 25178815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 20441532 - 20441745
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  20441532 atcatagggcaatcatggttttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatatccag 20441631  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20441632 ctatggggataacagaacgatcagctaactttaacgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 20441731  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  20441732 aacactggctccta 20441745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 30766459 - 30766672
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  30766459 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatatccag 30766558  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30766559 ctatcgggataacagaacgatcggctaactttaatatcatcttggtaggtttcaattctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 30766658  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
     ||||| |||||||    
T  30766659 gacactggctccta 30766672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 21273969 - 21274137
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||     |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21273969 tcagtcgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcatcaacatatccgacaggttggatattagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcgg 21274068  T
Q  226 taggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||    
T  21274069 taggtttcaactctcctattcccatccttttaaggagggataagggcaagaaactaacactagcaccta 21274137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 22320803 - 22320992
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  22320803 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 22320902  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||| | |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22320903 ctaactttaatgttgtttcggtaggctttaactctcccatccccagccttttaaagaggggtaagggcaacaaactaacactagctccta 22320992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21385165 - 21384959
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |||||    
T  21385165 atcatggtcctcttctatatcaactaccataaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaataaatccaactggttggata 21385066  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtagg---tttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactag 288  Q
      |||||| || |||| |||||| ||||| | ||||||   ||| || |||| ||||| |||| |||| |||||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  21385065 gtagaacgttcagctagcttcaaggtcatcttggtaggtttttttaattctcttattctcatccttttgaagaggggcaagggcaacaaactaacactag 21384966  T
Q  289 ctcctag 295  Q
    |||||||    
T  21384965 ctcctag 21384959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26780142 - 26780018
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||     ||||| |||||||||||     
T  26780142 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcatcaacatatccaacaggttggatatcagaacgatcga 26780043  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
     ||||||||||||  ||||||||||    
T  26780042 ataacttcaatgttgtttcggtagg 26780018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 24966541 - 24966665
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| |||||||||| |    
T  24966541 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctatcctaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcag 24966640  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  24966641 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 24966665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 3342556 - 3342773
Alignment:
Q  77 tagtatcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtat 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3342556 tagtatcatagggcaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgagatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtat 3342655  T
Q  177 ccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagca 276  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3342656 ccagctatcgggataaccgaacgatcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaaca 3342755  T
Q  277 aactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||| |||||||    
T  3342756 aactaacactggctccta 3342773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Original strand, 12163409 - 12163596
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12163409 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 12163508  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatag 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12163509 ctatggggataacggaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatatttttaaagaaggatag 12163596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17452801 - 17452595
Alignment:
Q  89 gcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatgggg 188  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17452801 gcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatatccaactatgggg 17452702  T
Q  189 -ataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacacta 287  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  17452701 gataacagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatttttttaaagagggatagaggaaacaaactaacactg 17452602  T
Q  288 gctccta 294  Q
    |||||||    
T  17452601 gctccta 17452595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 14068874 - 14069087
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  14068874 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccatgaaatcagtcaggatgtatatcccttctatcttaacggggatttcctcaacatatccaa 14068973  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |     |||||  ||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  14068974 ccggttggatagtagaacgatcagctaactttaatttcgtttctgtaggtttcaactctcctattcccatcttcttaaagagggataaaggcgacaaact 14069073  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||| ||||    
T  14069074 aacactagcaccta 14069087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 11877690 - 11877879
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  11877690 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctcgatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 11877789  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  11877790 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttaaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 11877879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 10163570 - 10163759
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  10163570 tctatgtcgaccacaacaaaatccgtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctctatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 10163669  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10163670 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 10163759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15641943 - 15641755
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||  |||||| || |    
T  15641943 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgagatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctcgatgtagccagctagggggatagtagaacggtctg 15641844  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcct 293  Q
    |||  || ||  |||| || || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  15641843 ctagttttaagatcatctcagttggtttaagctctcctattcccatccttttaaagagggataaaggcaacaagcttacactagctcct 15641755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 13200108 - 13200215
Alignment:
Q  187 ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacact 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  13200108 ggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgttttggtaggttttaactcccctattcccagccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacact 13200207  T
Q  287 agctccta 294  Q
    | ||||||    
T  13200208 atctccta 13200215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12381548 - 12381338
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  12381548 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtttatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 12381449  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| || || | | |||||||||||| ||   ||| || ||||||    
T  12381448 gttggatattagaatgatcggctaacttcaatgttgtttctgtaggctttaactctcccatccctagccttttaaagagggttaagtgcaacagactaac 12381349  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  12381348 actagctccta 12381338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 15632266 - 15632455
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  15632266 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaatggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 15632365  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || | ||| || |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  15632366 ctaacttcaatgttgtttcggtaggctttagctcgcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 15632455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 13139520 - 13139709
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| |||||| |||||    
T  13139520 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacaatcgg 13139619  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| || | ||  || |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  13139620 ctaatttcaatgttgtttcggtaggctttagcttgcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 13139709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 12190169 - 12190293
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  12190169 tctatgtcaagtaccatgaaatcagttgggatttctatcccttctattttgacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 12190268  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12190269 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 12190293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 12196827 - 12196951
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  12196827 tctatgtcaagtaccatgaaatcagttgggatttctatcccttctattttgacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 12196926  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12196927 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 12196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13076267 - 13076160
Alignment:
Q  187 ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacact 286  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||   || | |||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  13076267 ggatatcagaacgatcttctaacttcaatgttgtttcggtaggcattaactctcctatcaacagccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacact 13076168  T
Q  287 agctccta 294  Q
    ||||||||    
T  13076167 agctccta 13076160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22868610 - 22868397
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22868610 atcatagggcaatcatggtcttcctcgttgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 22868511  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22868510 ctatggggataacggaacgatcgactaactttaatgtcatctctctaggcttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 22868411  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  22868410 aacactggctccta 22868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 20303484 - 20303687
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  20303484 atcatagggcaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtatccag 20303583  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20303584 ctatcgggataactgaacgatcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 20303683  T
Q  281 aaca 284  Q
    ||||    
T  20303684 aaca 20303687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 114400 - 114187
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  114400 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatctgaacggggatgtcttcaacatatccag 114301  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  114300 ctattgggataacagaacggtcagctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 114201  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  114200 aacactggctccta 114187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27620459 - 27620246
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||     
T  27620459 atcatagggcaatcatggtcttccttgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatccgaacggggatgtcttcaacatatccag 27620360  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27620359 ctattgggataacagaacggtcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 27620260  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||||| |||||||    
T  27620259 aacactggctccta 27620246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 25374276 - 25374489
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  25374276 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagtcgggatgtacatcccttctatcttaacggggatgtcctctacatatccaa 25374375  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |     |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25374376 caggttggatagtagaacgaccagctaacttcaatgtcatcttggtaggtttcaaccctcctattcccatcttcttaaagagggatagaggcaacaaact 25374475  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||| ||||||    
T  25374476 aacactaactccta 25374489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 25136431 - 25136644
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  25136431 atcatagagcaatcacggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagtcgggatgtatatccattctatcttaacggggatgtcctcaacatatccag 25136530  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |     |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25136531 caggttggatagtagaccgatcagctaacttcaatgtcatcttggtaggtttcaactatcctattcccatctttttaaagagggatagagggaacaaact 25136630  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||| ||||||||||    
T  25136631 aacgctagctccta 25136644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 295
Target Start/End: Original strand, 25147233 - 25147444
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||  ||      
T  25147233 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatcagtcgggatgtatatcccttctattttaattgggatgtcctcaacatatctgacag 25147332  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25147333 gttggatattagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccttccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 25147432  T
Q  284 actagctcctag 295  Q
    |||||| |||||    
T  25147433 actagcacctag 25147444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22291074 - 22290872
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||  ||||||    
T  22291074 atcatggtcctcttctatgtcaaccaccacgaaatcagtcgggatatatatcccttctatcttgacgggtatgtcctcaatgtagccaactagagggata 22290975  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctc 291  Q
      ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |    
T  22290974 gtagaacgatccgctaatttcaagatcatctcggtaggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaactcacactagccc 22290875  T
Q  292 cta 294  Q
    |||    
T  22290874 cta 22290872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16772530 - 16772328
Alignment:
Q  92 atcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggata 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||| |  ||||||    
T  16772530 atcatggtcctcctctatgtcaaccaccacgaaatcagtcgggatatatatcccttctattttgacgggtatgtcctcgatgtagccaacgagagggata 16772431  T
Q  192 acagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctc 291  Q
      ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||| |    
T  16772430 gtagaacgatccgctaacttcaagatcatctcggtaggtttaagctctcctattcccatccttttgaagagggataagggcaacaaacttacactagccc 16772331  T
Q  292 cta 294  Q
    |||    
T  16772330 cta 16772328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 294
Target Start/End: Original strand, 18991671 - 18991822
Alignment:
Q  143 cccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     |||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18991671 cccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatcctacgggttggatagtagaacgattagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcct 18991770  T
Q  243 attcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  18991771 attcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaacactagcaccta 18991822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21894667 - 21894484
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  21894667 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatgtcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 21894568  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggata 267  Q
       ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894567 gttggatatcagaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactcacctattcccatccttttaaagagggata 21894484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Original strand, 24798686 - 24798875
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||| |||||||  |||||| || |    
T  24798686 tctatgtcgaccactacaaaatcagtcgggatatatatcccttctattttaacgggtatgtcctcgatgtagccaactagggggatagtagaacggtctg 24798785  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||  || ||  |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  24798786 ctagttttaagatcatctcggtcggtttaagctctcttattcccatccttttgaagagggataaaggcaacaaacttacactagctccta 24798875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 24172818 - 24172974
Alignment:
Q  110 gtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaac 209  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    |||||  ||||||||| ||||||    
T  24172818 gtcaactaccataaaatcagccgggatgtatatcccttctatcttaatggggatgtcctcaacaaatccaactggttggatagtagaacgatcagctaac 24172917  T
Q  210 ttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctatt-cccatctttttaaagaggga 265  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    |||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  24172918 ttcaaggtcatctcggtaggtttttgttctcatattccccatcttcttaaagaggga 24172974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 23248429 - 23248616
Alignment:
Q  108 atgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggcta 207  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||| |||   | |||||   |||||||| ||||    
T  23248429 atgtcaactaccataaaatcagccgggatatatatcccttctattttaacggggatatcctcaacaaatctaacagggcggatagtggaacgatcagcta 23248528  T
Q  208 acttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcctag 295  Q
    ||||||| ||| | ||| | ||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23248529 acttcaaggtcgtctcgattggtttcaacttacctatacccatcctcttaaagagggacaaaggcaacaatctaacactagctcctag 23248616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 22047990 - 22048200
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||      
T  22047990 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacag 22048089  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || ||||||    
T  22048090 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggctttaactcgcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaac 22048189  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  22048190 actagctccta 22048200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27624466 - 27624342
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  27624466 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctatcttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 27624367  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  27624366 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 27624342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29954345 - 29954275
Alignment:
Q  225 gtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcctag 295  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  29954345 gtaggtttcaactcgcctatgcaaatcctcttaaagagggataagggaagcaagctaacactagctcctag 29954275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27385 - 27172
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  27385 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatatataccccttctatcttaacggtgatgtcttcaacatatccaa 27286  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  27285 ctatggggataacagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaattctcctattcccatcttcttaaagagggatagaggcaacagact 27186  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  27185 aacactagctccta 27172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 22877 - 23082
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  22877 atcatagggcaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacgtatccag 22976  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22977 ctattgggataaccgaacgatcggctaactttaatatcatctcggtaggtttcagctctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaact 23076  T
Q  281 aacact 286  Q
    ||||||    
T  23077 aacact 23082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18402172 - 18401959
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |    
T  18402172 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccacaaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacgggaatctcctcaacatatccca 18402073  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18402072 ctagtgggataatagaacgatcggctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagagacaacaaact 18401973  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  18401972 aacactagctccta 18401959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21824270 - 21824053
Alignment:
Q  77 tagtatcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtat 176  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  21824270 tagtatcatagggaaatcgtggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatat 21824171  T
Q  177 ccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagca 276  Q
    ||  |||| ||||| || ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21824170 ccggctatcgggatgaccgaacggtcagccaattttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaaca 21824071  T
Q  277 aactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21824070 aactaacactggctccta 21824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22287904 - 22287691
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22287904 atcatagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 22287805  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    | |   |||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  22287804 caagttggatagtagaacgatcagctatcttcaatgtcgtttcggtaggttttaactctcctattcccatcttcttaaagagggataaaggcaagaaact 22287705  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||    
T  22287704 aacactagctccta 22287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22828793 - 22828582
Alignment:
Q  83 catagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaact 182  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  22828793 catagggcaatcatggtcctcttctatgtcaactaccataaaatcagccgagatatatattcgttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaacc 22828694  T
Q  183 atggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaa 282  Q
        |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||    
T  22828693 ggttggatagtagaacgatcagctaactttaatgtcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatcttcttaaaaagggatagagacaacagactaa 22828594  T
Q  283 cactagctccta 294  Q
    ||||||||||||    
T  22828593 cactagctccta 22828582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25458331 - 25458121
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  25458331 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagaaccatgaaatcagtcgggatgtatatcccttctattttaatggggatgtcctcaacatatccga-ta 25458233  T
Q  184 tgggg-ataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaa 282  Q
     |  | |||  ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||    
T  25458232 ggttgtatagtagagcgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggaaacaaactaa 25458133  T
Q  283 cactagctccta 294  Q
     |||||| ||||    
T  25458132 tactagcaccta 25458121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22360261 - 22360105
Alignment:
Q  128 agtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggta 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||     |||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  22360261 agtcgggatatatatcccttctactttaacggggatgtcctcaacatatccgacaggttggatattagaacgatcggctagcttcaatgttgtttcggta 22360162  T
Q  228 ggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaaca 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22360161 ggtttctactctcctattcccatccttttaaagagggatacgggcaacaaactaaca 22360105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8311343 - 8311219
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  8311343 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctatcttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 8311244  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  8311243 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 8311219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 22036839 - 22037049
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||| ||      
T  22036839 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatttccgacag 22036938  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||| |  |||| | ||| |||||||| ||  |||| ||  |||||    
T  22036939 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaagctttaactctcccaaccccagcctttaaaagaggggtaagggcaacaggctaac 22037038  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  22037039 actagctccta 22037049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22096104 - 22095971
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  22096104 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 22096005  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  22096004 ctaacttcaatgttgtttcggtaggctttaactc 22095971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21335757 - 21335633
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||| ||||||    
T  21335757 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctatcttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaatgatcgg 21335658  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtagg 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  21335657 ctaacttcaatgttgtttcggtagg 21335633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21952861 - 21952754
Alignment:
Q  187 ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacact 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||| |  |||| | |||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  21952861 ggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggctataactctcccaaccccagccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacact 21952762  T
Q  287 agctccta 294  Q
     |||||||    
T  21952761 tgctccta 21952754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Original strand, 197292 - 197505
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  197292 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcaacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctaccttaacggggatgtcttcaacatatccag 197391  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaact 280  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  197392 ctatcgggataacagaacggtcggccaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaataaact 197491  T
Q  281 aacactagctccta 294  Q
    |||| | |||||||    
T  197492 aacagtggctccta 197505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Original strand, 205956 - 206086
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcgg 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  205956 tcagtcaggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacaaatccaactggttggatagtagaacgatcagctaacttcaaggtcatctcgg 206055  T
Q  226 taggtttcaactctcctattcccatcttttt 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  206056 taggttttaattctcctattcccatcctttt 206086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 593 - 777
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  593 atcatagggcaatcatggtcttcctcgatgtcgacaaccacaaagtcagttgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcttcaacatatccag 692  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagaggga 265  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 ctatcgggataacagaacggtcggccaactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagaggga 777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6361 - 6208
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6361 atcatagggcaatcatggtcttcttctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 6262  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttca 234  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6261 ctagggggataatagaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttca 6208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14263 - 14110
Alignment:
Q  81 atcatagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14263 atcatagggcaatcatggtcttcttctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccaa 14164  T
Q  181 ctatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttca 234  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14163 ctagggggataatagaacgatcggctaacttcaatgtcatctcggtaggtttca 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 59780 - 59989
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  59780 atagggcactcattgtcttt-tctatgtcaagcaccataaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccgacgg 59878  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  59879 gttggatagtagaacgatcagctaacttcaatgttgttttggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 59978  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  59979 actagcaccta 59989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39909 - 39699
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  39909 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacaa 39810  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  39809 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcgataggtttcaactctcctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacaaactaac 39710  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  39709 actagcaccta 39699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 766
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  976 atagggcactcattgtcttcttctatgtcaagcaccataaaatcagtcaggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 877  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||    
T  876 gttggatagtagaacgatcaactaacttcaatgttatttcggtaggtttcaactctcatattcccatccttttaaagagggataagggtaacaaactaac 777  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  776 actagcaccta 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 117844 - 117634
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||      
T  117844 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccaacag 117745  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||    
T  117744 gttggatatcaaaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagaggggtaagggaaacaaactaac 117645  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||||||||    
T  117644 actagctccta 117634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 113540 - 113338
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||      
T  113540 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccaacag 113441  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       ||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||    
T  113440 gttggatatcaaaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagaggggtaagggaaacaaactaac 113341  T
Q  284 act 286  Q
    |||    
T  113340 act 113338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Original strand, 37751 - 37913
Alignment:
Q  132 gggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37751 gggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacagattggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtt 37850  T
Q  232 tcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  37851 tcaactcccctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 37913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Original strand, 44481 - 44643
Alignment:
Q  132 gggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44481 gggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacagattggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtt 44580  T
Q  232 tcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||    
T  44581 tcaactcccctattcccatccttttaaagaggggtaagggcaacagactaacactagctccta 44643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 25412 - 25622
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||      
T  25412 atagggcactcattgtcttgatctatgtcaagcaccatgaaattagtcgggatgtatatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatcggacag 25511  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||    
T  25512 gttggatattagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggttttaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggtaacaaactaac 25611  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  25612 actagcaccta 25622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 52622 - 52722
Alignment:
Q  194 agaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctcct 293  Q
    |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  52622 agaacgatcaactaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaagtatcttattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaacactagcacct 52721  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  52722 a 52722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 49858 - 49939
Alignment:
Q  87 gggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcct 168  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49858 gggcactcattgtcttcttctatgtcaagcactataaaatcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcct 49939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1589 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1589
Description:

Target: scaffold1589; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 336 - 504
Alignment:
Q  126 tcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||     |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  336 tcagtcgggatgtatatcccttctattttaacggaaatgtcctcaacatatccgacaggttggatattagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcag 435  T
Q  226 taggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  436 taggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaacactagcaccta 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 739 - 949
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || |  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  739 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatttgtcgggatatatatcccttctactttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 838  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       | |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  839 gttgaatattagaacgatcgactaacttcaatgttatttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 938  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  939 actagcaccta 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1853 - 1643
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || |  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  1853 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatttgtcgggatatatatcccttctactttaacggggatgtcctcaacatatccgacag 1754  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       | |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1753 gttgaatattagaacgatcgactaacttcaatgttatttcggtaggtttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 1654  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  1653 actagcaccta 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 288
Target Start/End: Original strand, 36161 - 36365
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |    
T  36161 atagggcactcattgtcttcttctatgtcaagcaccaaaaaatcagtcgggatgtctatcccttctatctaaacggggatgtcctcaacatatccgacaa 36260  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       |||||  || ||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  36261 gttggatagtagtacgatcaactaacttcaacgttgtttcggtaggtttcaactctcctattcccgtcttcttaaagagggataaagctaacaaactaac 36360  T
Q  284 actag 288  Q
    |||||    
T  36361 actag 36365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 51215 - 51425
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||      
T  51215 atagggcactcattgtcttcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaatagggatgtcctcaacatatccgacag 51314  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaac 283  Q
       | |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  51315 gttgaatattacaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtagctttcaactctcctattcccatccttttaaagagggataagggcaacaaactaac 51414  T
Q  284 actagctccta 294  Q
    |||||| ||||    
T  51415 actagcaccta 51425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 773 - 880
Alignment:
Q  187 ggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacact 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  773 ggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggtttcaactcccctattcccaccattttaaagaggggtaagggcaacagactaacact 872  T
Q  287 agctccta 294  Q
    ||||||||    
T  873 agctccta 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 890 - 803
Alignment:
Q  207 aacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  890 aactttaatatcatctcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaactaacattggctccta 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 8883 - 8950
Alignment:
Q  227 aggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8883 aggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcaacaaactaacactagctccta 8950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Original strand, 47226 - 47391
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||      
T  47226 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtatatcccttctattttaacgaggatgtcctcaacatatccgacag 47325  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattccca 249  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  47326 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgttgtttcggtaggctttaactcccctattccca 47391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4188 - 4026
Alignment:
Q  132 gggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcggctaacttcaatgtcatttcggtaggtt 231  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |    
T  4188 gggatgtttatcccttctattttaacggggatgtcctcaacatatccgacaggttggatatcagaacgatcagctaacttcaatgttgtttcggtaggct 4089  T
Q  232 tcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagctccta 294  Q
    | |||||||  || ||||   |||||||||||| ||  |||| || ||||||  |||||||||    
T  4088 ttaactctctcatccccagtcttttaaagaggggtaagggcaacagactaacgttagctccta 4026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0613 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0613
Description:

Target: scaffold0613; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Original strand, 9441 - 9574
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||     ||||| ||||||||||||    
T  9441 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtccatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcagaacgatcgg 9540  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  9541 ctaacttcaatgttgtttcggtaggctttaactc 9574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Original strand, 2064 - 2197
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaacta 183  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||      
T  2064 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggggatgtcctcgacatatccgacag 2163  T
Q  184 tggggataacagaacgatcggctaacttcaatgt 217  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2164 gttggatatcagaacgatcggctaacttcaatgt 2197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21446 - 21261
Alignment:
Q  105 tctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctcagcgtatccaactatggggataacagaacgatcgg 204  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||| ||     ||||| || |||||||||    
T  21446 tctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgtctatcccttctattttaacggagatgtcctcgacatatccgacaggttggatatcaaaacgatcgg 21347  T
Q  205 ctaacttcaatgtcatttcggtaggtttcaactctcctattcccatctttttaaagagggatagaggcagcaaactaacactagct 290  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || | ||| || |  |||| | || ||||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  21346 ctaacttcaatgttgtttcggtaggctttagctcgcccaaccccagccttgtaaagaggggtaagggcaacagactaacactagct 21261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 1
Alignment:
Q  84 atagggcaatcatggtctttctctatgtcaacaaccacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctc 169  Q
    |||||||| |||| ||| |  ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  86 atagggcactcattgtcctcatctatgtcaagcaccatgaaatcagttgggatgttaatcccttctattttaacggggatgtcctc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12592 - 12539
Alignment:
Q  117 accacaaagtcagtcgggatgtatatcccttctatcttaacggggatgtcctca 170  Q
    ||||| || |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12592 accactaaatcagccgggttatatatcccttctattttaacggggatgtcctca 12539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 156 times since January 2019
Visitors: 3833