View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0619_low_23 (Length: 357)

Name: NF0619_low_23
Description: NF0619
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0619_low_23
NF0619_low_23
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (130-357)||(21579887-21580115)
chr8 (130-357)||(29763549-29763775)
chr8 (160-357)||(41680833-41681029)
chr8 (130-272)||(42560208-42560350)
chr8 (170-281)||(32807285-32807396)
chr8 (138-322)||(18760514-18760698)
chr8 (239-346)||(22965704-22965811)
chr8 (161-267)||(27472391-27472496)
chr8 (161-267)||(38550086-38550191)
chr8 (160-267)||(1327119-1327225)
chr8 (151-357)||(39833805-39834023)
chr8 (138-229)||(3273212-3273302)
chr8 (200-272)||(39936813-39936885)
chr8 (189-267)||(20982747-20982825)
chr8 (197-268)||(21415211-21415281)
chr8 (231-357)||(6102532-6102669)
chr8 (200-248)||(19139966-19140014)
chr8 (318-350)||(21580131-21580163)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (130-357)||(12122202-12122429)
chr5 (130-357)||(21557726-21557953)
chr5 (130-357)||(21555060-21555288)
chr5 (132-357)||(31455634-31455862)
chr5 (130-357)||(30615700-30615926)
chr5 (132-357)||(31455021-31455249)
chr5 (189-357)||(17875158-17875326)
chr5 (143-282)||(24212387-24212526)
chr5 (143-281)||(35852643-35852781)
chr5 (130-272)||(36460199-36460341)
chr5 (130-282)||(5889092-5889245)
chr5 (160-267)||(5889269-5889375)
chr5 (160-322)||(29915167-29915328)
chr5 (160-269)||(21871656-21871763)
chr5 (160-269)||(21875936-21876043)
chr5 (318-350)||(12122445-12122477)
chr5 (227-303)||(21741557-21741633)
chr5 (188-272)||(21741653-21741738)
chr5 (223-252)||(21871593-21871622)
chr5 (223-252)||(21875873-21875902)
chr5 (223-252)||(22120217-22120246)
chr5 (318-350)||(21555304-21555336)
chr5 (318-350)||(31454973-31455005)
chr5 (318-350)||(31455586-31455618)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (130-357)||(33186046-33186273)
chr4 (143-281)||(15880717-15880855)
chr4 (130-306)||(13844567-13844744)
chr4 (161-357)||(362075-362272)
chr4 (141-272)||(35812182-35812312)
chr4 (160-267)||(52873251-52873357)
chr4 (170-272)||(9923326-9923427)
chr4 (170-272)||(11479432-11479533)
chr4 (130-306)||(46642862-46643038)
chr4 (160-272)||(46642750-46642861)
chr4 (160-266)||(13844461-13844566)
chr4 (160-269)||(15868794-15868901)
chr4 (163-269)||(630862-630966)
chr4 (211-279)||(15190360-15190428)
chr4 (176-268)||(21189751-21189842)
chr4 (138-209)||(14185252-14185323)
chr4 (211-279)||(15099393-15099461)
chr4 (200-264)||(19609509-19609573)
chr4 (318-357)||(10357358-10357398)
chr4 (188-271)||(15099265-15099349)
chr4 (223-252)||(630796-630825)
chr4 (223-252)||(13812831-13812860)
chr4 (223-252)||(15868731-15868760)
chr4 (322-357)||(10357306-10357342)
chr4 (322-357)||(15099169-15099205)
chr4 (322-357)||(19609418-19609454)
chr4 (318-350)||(33185998-33186030)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (130-357)||(31224635-31224862)
chr3 (162-357)||(31415348-31415543)
chr3 (130-357)||(15447681-15447905)
chr3 (130-272)||(11912950-11913092)
chr3 (147-281)||(6808157-6808291)
chr3 (160-356)||(49969963-49970170)
chr3 (130-267)||(1988912-1989050)
chr3 (160-267)||(20630191-20630297)
chr3 (170-267)||(49389772-49389870)
chr3 (160-267)||(18439941-18440047)
chr3 (191-272)||(40812015-40812096)
chr3 (160-272)||(12269486-12269597)
chr3 (170-272)||(5841958-5842061)
chr3 (211-306)||(18439845-18439940)
chr3 (187-272)||(30175304-30175389)
chr3 (186-306)||(12269598-12269718)
chr3 (200-272)||(40807173-40807245)
chr3 (200-272)||(22307386-22307458)
chr3 (211-282)||(1465419-1465490)
chr3 (200-272)||(17538284-17538356)
chr3 (211-306)||(49389639-49389734)
chr3 (188-272)||(1465531-1465616)
chr3 (223-252)||(12852390-12852419)
chr3 (322-357)||(1465675-1465711)
chr3 (160-267)||(12852453-12852559)
chr3 (318-350)||(15447921-15447953)
chr3 (318-357)||(17519823-17519863)
chr3 (318-357)||(17534685-17534725)
chr3 (322-357)||(22307505-22307541)
chr3 (322-357)||(30175436-30175472)
chr3 (318-350)||(31224878-31224910)
chr3 (318-350)||(31415300-31415332)
chr3 (322-357)||(41173241-41173277)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (137-357)||(36685938-36686158)
chr7 (130-357)||(30820937-30821164)
chr7 (162-357)||(38480181-38480376)
chr7 (130-281)||(11085019-11085170)
chr7 (139-281)||(11092757-11092899)
chr7 (143-281)||(9320423-9320561)
chr7 (131-272)||(15213728-15213869)
chr7 (160-357)||(8468256-8468454)
chr7 (160-357)||(14270138-14270336)
chr7 (161-357)||(45847735-45847932)
chr7 (130-264)||(15439322-15439457)
chr7 (130-267)||(37727607-37727745)
chr7 (160-272)||(17232537-17232648)
chr7 (142-272)||(11391870-11392001)
chr7 (200-272)||(12371455-12371527)
chr7 (200-272)||(13148275-13148347)
chr7 (211-306)||(9389705-9389800)
chr7 (191-272)||(8851959-8852040)
chr7 (200-272)||(11066645-11066717)
chr7 (211-306)||(17232649-17232744)
chr7 (223-252)||(39267712-39267741)
chr7 (322-357)||(59314-59350)
chr7 (230-282)||(8468472-8468524)
chr7 (322-357)||(8852087-8852123)
chr7 (322-357)||(11066562-11066598)
chr7 (200-272)||(12127967-12128039)
chr7 (322-357)||(12371372-12371408)
chr7 (160-256)||(18302100-18302194)
chr7 (318-350)||(30821180-30821212)
chr7 (203-263)||(32434396-32434456)
chr7 (322-357)||(32434511-32434547)
chr7 (318-350)||(36686174-36686206)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (131-357)||(1510-1736)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (131-357)||(24865452-24865678)
chr2 (142-357)||(22500933-22501148)
chr2 (142-357)||(22508867-22509082)
chr2 (131-347)||(7672240-7672450)
chr2 (138-246)||(2524418-2524526)
chr2 (138-357)||(6576307-6576537)
chr2 (189-272)||(24883630-24883713)
chr2 (189-256)||(22501128-22501195)
chr2 (189-256)||(22509062-22509129)
chr2 (170-272)||(24436221-24436321)
chr2 (200-272)||(24781643-24781715)
chr2 (200-272)||(5032127-5032199)
chr2 (318-357)||(9975019-9975059)
chr2 (322-357)||(5032246-5032282)
chr2 (318-350)||(20915151-20915183)
chr2 (318-350)||(22500885-22500917)
chr2 (318-350)||(22508819-22508851)
chr2 (322-357)||(22689774-22689810)
chr2 (322-357)||(22694370-22694406)
chr2 (322-357)||(24781762-24781798)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (130-357)||(6359-6585)
scaffold0737 (318-357)||(5634-5674)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (130-357)||(14284-14511)
scaffold0071 (318-350)||(14236-14268)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (130-357)||(20734128-20734354)
chr6 (143-281)||(2201139-2201277)
chr6 (145-281)||(22420987-22421123)
chr6 (137-272)||(34296957-34297092)
chr6 (130-282)||(27851220-27851373)
chr6 (164-356)||(19399692-19399895)
chr6 (130-306)||(25956537-25956714)
chr6 (160-267)||(25956715-25956821)
chr6 (170-272)||(18927853-18927954)
chr6 (161-267)||(31630622-31630727)
chr6 (160-269)||(27851087-27851195)
chr6 (200-272)||(27322221-27322293)
chr6 (170-272)||(28708651-28708754)
chr6 (200-272)||(18708677-18708749)
chr6 (200-272)||(23151069-23151141)
chr6 (322-356)||(27573027-27573061)
chr6 (322-357)||(17318992-17319028)
chr6 (322-357)||(18708594-18708630)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (143-357)||(10839-11053)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (151-357)||(51274290-51274496)
chr1 (132-267)||(12328538-12328673)
chr1 (143-251)||(8885447-8885555)
chr1 (130-306)||(28194365-28194542)
chr1 (130-302)||(43697405-43697578)
chr1 (170-252)||(51326892-51326974)
chr1 (160-256)||(28194543-28194638)
chr1 (160-267)||(43543031-43543137)
chr1 (160-267)||(43697294-43697400)
chr1 (211-306)||(49261357-49261452)
chr1 (161-267)||(46382652-46382755)
chr1 (217-306)||(20636866-20636955)
chr1 (191-272)||(48301040-48301121)
chr1 (199-272)||(20636764-20636837)
chr1 (241-281)||(8882176-8882216)
chr1 (289-357)||(41305818-41305888)
chr1 (211-306)||(35981696-35981791)
chr1 (200-271)||(41227507-41227578)
chr1 (188-272)||(35981808-35981893)
chr1 (322-357)||(35981952-35981988)
chr1 (322-357)||(48300957-48300993)
chr1 (318-350)||(51274512-51274544)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (174-335)||(450-611)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (130-272)||(4644-4786)
scaffold0599 (130-272)||(226-368)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (130-306)||(43700-43877)
scaffold0116 (130-306)||(47620-47797)
scaffold0116 (160-267)||(43878-43984)
scaffold0116 (160-200)||(47798-47837)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (160-272)||(6770-6882)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (138-281)||(59295-59437)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (141-278)||(15419-15556)
scaffold0061 (141-278)||(24477-24614)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (160-269)||(85167-85275)
scaffold0009 (211-306)||(85276-85371)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (160-267)||(36142-36248)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (138-272)||(3093-3226)
scaffold0371 (321-357)||(3010-3047)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (169-267)||(2966-3063)
scaffold0810 (130-199)||(3066-3136)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (170-272)||(834-935)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (160-267)||(10963-11069)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (160-267)||(362926-363032)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (170-272)||(5478-5579)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (170-272)||(76919-77019)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (200-272)||(10029-10101)
[»] scaffold1137 (3 HSPs)
scaffold1137 (211-306)||(2300-2395)
scaffold1137 (199-270)||(2424-2495)
scaffold1137 (322-357)||(2556-2592)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (170-272)||(2449-2552)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (201-272)||(9106-9177)
scaffold0375 (322-357)||(9224-9260)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (160-269)||(8379-8486)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (200-272)||(8189-8261)
scaffold0384 (322-357)||(8308-8344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (160-267)||(24739-24844)
scaffold0124 (223-252)||(24676-24705)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (200-272)||(9561-9633)
scaffold0509 (322-357)||(9680-9716)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (326-357)||(313-344)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (197-268)||(1920-1990)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (223-252)||(9926-9955)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (223-252)||(7670-7699)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (322-357)||(57894-57930)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (318-350)||(46993-47025)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (318-350)||(145833-145865)
scaffold0026 (322-357)||(145881-145917)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580115
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21579986  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaagatgtctaag 328  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21579987 tgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21580086  T
Q  329 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21580087 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21580115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763775
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 29763648  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763649 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 29763747  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763748 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 29763775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 357
Target Start/End: Original strand, 41680833 - 41681029
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680833 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 41680932  T
Q  260 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680933 acttgctgcatatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 41681029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560350
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaat 42560307  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42560308 tgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 42560350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32807396 - 32807285
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32807396 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 32807297  T
Q  270 tatgtttaaatg 281  Q
    ||||| ||||||    
T  32807296 tatgtctaaatg 32807285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18760698 - 18760514
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18760698 atgaataagatgattaatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttatat 18760599  T
Q  238 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg 322  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||    |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18760598 ttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctattgtgatgtattaatatcattaagatg 18760514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22965811 - 22965704
Alignment:
Q  239 tgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22965811 tgatgattattattgatggtgatttgatgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttatgatgaatcaatactattaagatgtctaagttgttaagtt 22965712  T
Q  339 gtaagatg 346  Q
     |||||||    
T  22965711 ttaagatg 22965704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 27472391 - 27472496
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  27472391 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 27472489  T
Q  261 cttgctg 267  Q
    |||||||    
T  27472490 cttgctg 27472496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 38550086 - 38550191
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  38550086 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 38550184  T
Q  261 cttgctg 267  Q
    |||||||    
T  38550185 cttgctg 38550191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 1327119 - 1327225
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  1327119 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaacgatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 1327217  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  1327218 acttgctg 1327225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39834023 - 39833805
Alignment:
Q  151 ttaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg-ttatatatgatgattatt 249  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  39834023 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattatt 39833924  T
Q  250 attgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga-cactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat---------gtctaagttg-ttaagtt 338  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||          ||||||||| |||||||    
T  39833923 attgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatgattgccttgctgatgtgatgtattaatatcatgaagatctaatgttgatctaagttgtttaagtt 39833824  T
Q  339 gtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39833823 gtaagatgttgatccaaat 39833805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3273302 - 3273212
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3273302 atgaataagatgattaatgttatggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaat 3273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 39936813 - 39936885
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  39936813 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 39936885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 20982747 - 20982825
Alignment:
Q  189 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20982747 atatatatatattgtgaaagatattgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatttgctg 20982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 21415211 - 21415281
Alignment:
Q  197 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21415211 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 21415281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 357
Target Start/End: Original strand, 6102532 - 6102669
Alignment:
Q  231 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg-------- 322  Q
    ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||  || ||||    |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||            
T  6102532 gttatatttgatgattgttgttgatgttgacttgctccatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgtt 6102631  T
Q  323 --tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6102632 ggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 6102669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19140014 - 19139966
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattat 248  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19140014 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattat 19139966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 21580131 - 21580163
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21580131 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 21580163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122429
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 12122301  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12122302 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattgagatgtttaagt 12122401  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122402 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 12122429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557953
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21557825  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557826 tgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaattaataccattaagatgtctaagt 21557925  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557926 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21557953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555288
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaat 21555159  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaagatgtctaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21555160 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21555259  T
Q  329 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21555260 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21555288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455634
Alignment:
Q  132 gagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31455862 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaatcg 31455763  T
Q  232 ttatatatgat---gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaag 328  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31455762 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455663  T
Q  329 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31455662 ttgttaagttgtaagatgttgatacaaat 31455634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615700
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgattaatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatatt-atatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 30615828  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30615827 tgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaattaataccattaagatgtataagt 30615728  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30615727 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 30615700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455021
Alignment:
Q  132 gagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  31455249 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaatcg 31455150  T
Q  232 ttatatatgat---gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaag 328  Q
    ||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31455149 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455050  T
Q  329 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31455049 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31455021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17875326 - 17875158
Alignment:
Q  189 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactct 288  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  17875326 atatttatataatgataaagacgttgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattat 17875227  T
Q  289 cttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17875226 cttgctgttgtgaagaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatattgatccaaat 17875158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24212526 - 24212387
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24212526 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 24212427  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24212426 gattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatga 24212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35852781 - 35852643
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  35852781 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatacgat 35852682  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35852681 gattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatg 35852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460199
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 36460242  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36460241 tgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 36460199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 282
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889245
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 5889191  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 282  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5889192 ttgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatga 5889245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 5889269 - 5889375
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  5889269 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 5889367  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  5889368 acttgctg 5889375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 322
Target Start/End: Original strand, 29915167 - 29915328
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  29915167 atgatctactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 29915265  T
Q  260 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg 322  Q
    |||||||| | ||  || |||| |  |  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29915266 acttgctgtaaattattgaatggcgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg 29915328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 21871656 - 21871763
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  21871656 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 21871753  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||||||||    
T  21871754 acttgctgca 21871763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 21875936 - 21876043
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  21875936 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 21876033  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||||||||    
T  21876034 acttgctgca 21876043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 12122445 - 12122477
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122445 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 12122477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Original strand, 21741557 - 21741633
Alignment:
Q  227 aattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatg 303  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  21741557 aattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatg 21741633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 21741653 - 21741738
Alignment:
Q  188 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21741653 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaaatcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 21741738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 21871593 - 21871622
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21871593 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21871622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 21875873 - 21875902
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21875873 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21875902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 22120217 - 22120246
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120217 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 22120246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 21555304 - 21555336
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21555304 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 21555336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31455005 - 31454973
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31455005 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31454973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31455618 - 31455586
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31455618 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31455586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186046
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaat 33186174  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186173 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 33186074  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186073 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 33186046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15880855 - 15880717
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15880855 taagatgatcaatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 15880756  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15880755 gattattattgatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844567
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  13844644 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttactgttgtgatgaat 13844567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 362272 - 362075
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  362272 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttga 362174  T
Q  261 cttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  362173 cttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Original strand, 35812182 - 35812312
Alignment:
Q  141 aataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 240  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |    
T  35812182 aataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattgg 35812280  T
Q  241 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35812281 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 35812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 52873251 - 52873357
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  52873251 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 52873349  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  52873350 acttgctg 52873357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9923427 - 9923326
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9923427 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 9923329  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  9923328 tat 9923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 11479432 - 11479533
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11479432 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 11479530  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  11479531 tat 11479533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642862
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  || || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  46642939 ttgttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtgatgaat 46642862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46642861 - 46642750
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  46642861 atgatttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttg 46642763  T
Q  260 acttgctgcatat 272  Q
    || ||||||||||    
T  46642762 acgtgctgcatat 46642750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13844566 - 13844461
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||| ||    
T  13844566 atgatttactttgattattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattattgttgatgatg 13844468  T
Q  260 acttgct 266  Q
    |||||||    
T  13844467 acttgct 13844461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 15868794 - 15868901
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  15868794 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattatatctgatgattattgttgatgttg 15868891  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||||||||    
T  15868892 acttgctgca 15868901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 269
Target Start/End: Original strand, 630862 - 630966
Alignment:
Q  163 atttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgact 262  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  630862 atttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgact 630959  T
Q  263 tgctgca 269  Q
    |||||||    
T  630960 tgctgca 630966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15190428 - 15190360
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 279  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190428 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 268
Target Start/End: Original strand, 21189751 - 21189842
Alignment:
Q  176 attaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21189751 attaaaagtggaaatatttatatgttatgaaagatgttgatatca-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgc 21189842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14185323 - 14185252
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 209  Q
    |||||||||||||||||  ||  || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185323 atgaataagatgattaacgttgttgttttaagttgatggttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 14185252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15099461 - 15099393
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 279  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099461 gttgatatgaagttgaaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15099393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19609573 - 19609509
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 264  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  19609573 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttg 19609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Original strand, 10357358 - 10357398
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10357358 agatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 10357398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15099349 - 15099265
Alignment:
Q  188 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15099349 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcata 15099265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 630796 - 630825
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  630796 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 630825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 13812831 - 13812860
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812831 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 13812860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 15868731 - 15868760
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868731 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 15868760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 10357306 - 10357342
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10357306 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 10357342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15099205 - 15099169
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15099205 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 15099169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19609454 - 19609418
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19609454 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 19609418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33186030 - 33185998
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186030 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 33185998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224862
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 31224734  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31224735 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtttaagt 31224834  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224835 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31224862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 162 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31415543 - 31415348
Alignment:
Q  162 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415543 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 31415444  T
Q  262 ttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415443 ttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31415348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447905
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 15447780  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447781 tgttatat---atgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 15447877  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15447878 tgttaagttgtaagatattgatccaaat 15447905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912950
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11912993  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11912992 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 11912950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6808291 - 6808157
Alignment:
Q  147 atgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6808291 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatataatgatt 6808192  T
Q  247 attattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  6808191 attattgatggtgacttccttcatatgtctaaatg 6808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 356
Target Start/End: Original strand, 49969963 - 49970170
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  49969963 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttg 49970062  T
Q  260 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat----------gtctaagttg-ttaagttgtaagatgtt 348  Q
    |||||||||||||  || ||||  |||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49970063 acttgctgcatattatttaatggtactgccttgctgttgtgatgtattattatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgtt 49970162  T
Q  349 gatccaaa 356  Q
    ||||||||    
T  49970163 gatccaaa 49970170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989050
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 1989011  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1989012 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 1989050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 20630191 - 20630297
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  20630191 atgatttactttgacgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 20630289  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  20630290 acttgctg 20630297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 267
Target Start/End: Original strand, 49389772 - 49389870
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatattta--tatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  49389772 ttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtgaa-gttgttgatatgaagttgtaattgttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 49389870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 18439941 - 18440047
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  18439941 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 18440039  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    || |||||    
T  18440040 acctgctg 18440047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40812096 - 40812015
Alignment:
Q  191 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40812096 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40812015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12269597 - 12269486
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  12269597 atgatttaagttgatgattaa-tgtgagaagatttataaattttgaaggacgttgatatgaagttgtaatgattatatttgatgattattgttgatgttg 12269499  T
Q  260 acttgctgcatat 272  Q
    || ||||||||||    
T  12269498 acgtgctgcatat 12269486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5842061 - 5841958
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5842061 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgc 5841962  T
Q  269 atat 272  Q
    ||||    
T  5841961 atat 5841958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18439940
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 18439940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 272
Target Start/End: Original strand, 30175304 - 30175389
Alignment:
Q  187 aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  30175304 aaatatttatatactgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggatatatgggatgattattgttgatgttgacttgcttcatat 30175389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12269718 - 12269598
Alignment:
Q  186 aaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacac 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||| |||||| || |||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||  |    
T  12269718 aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtattttttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgc 12269619  T
Q  286 tctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  12269618 tgccttgctgttgtcatgaat 12269598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40807245 - 40807173
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40807245 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40807173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 22307386 - 22307458
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22307386 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 22307458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 282
Target Start/End: Original strand, 1465419 - 1465490
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1465419 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatga 1465490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17538356 - 17538284
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17538356 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 17538284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 49389639 - 49389734
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||  ||||  || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  49389639 gttggtatgaagttgaaattgttatacatgaagatcattattaatgggtacttattgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 49389734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 1465531 - 1465616
Alignment:
Q  188 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1465531 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttggatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 1465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 12852390 - 12852419
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852390 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 12852419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 1465675 - 1465711
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1465675 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 1465711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 12852453 - 12852559
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagtt-gtaattgttatatatgatgattattattgatggt 258  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||| |||||  || ||| ||||||||||| |||||| |    
T  12852453 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagtttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgtt 12852550  T
Q  259 gacttgctg 267  Q
    |||||||||    
T  12852551 gacttgctg 12852559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 15447921 - 15447953
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15447921 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 15447953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Original strand, 17519823 - 17519863
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17519823 agatgtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaat 17519863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Original strand, 17534685 - 17534725
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17534685 agatgtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaat 17534725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 22307505 - 22307541
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22307505 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22307541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 30175436 - 30175472
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30175436 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 30175472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 31224878 - 31224910
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31224878 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31224910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31415332 - 31415300
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31415332 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31415300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 41173241 - 41173277
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41173241 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 41173277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 137 - 357
Target Start/End: Original strand, 36685938 - 36686158
Alignment:
Q  137 gatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttata 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  36685938 gatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattgttata 36686037  T
Q  237 tatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36686038 tatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaag 36686137  T
Q  337 ttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36686138 ttgtaagatgttgatccaaat 36686158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821164
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaat 30821036  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821037 tgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 30821136  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821137 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 30821164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 162 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38480376 - 38480181
Alignment:
Q  162 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38480376 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 38480277  T
Q  262 ttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38480276 ttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatatctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 38480181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085019
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11085071  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11085070 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatg 11085019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11092899 - 11092757
Alignment:
Q  139 tgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatata 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11092899 tgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaattgttatata 11092800  T
Q  239 tgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11092799 tgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatg 11092757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 281
Target Start/End: Original strand, 9320423 - 9320561
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9320423 taagatgattaatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 9320522  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9320523 gattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatg 9320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213728
Alignment:
Q  131 agagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaatt 15213770  T
Q  231 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15213769 gttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 15213728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8468454 - 8468256
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  8468454 atgatttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 8468356  T
Q  260 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaa 356  Q
    |||||||| | ||  || ||||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8468355 acttgctgtaaattatttaatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaa 8468257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 357
Target Start/End: Original strand, 14270138 - 14270336
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  14270138 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 14270236  T
Q  260 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaa 356  Q
    |||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14270237 acttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaa 14270335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 357
Target Start/End: Original strand, 45847735 - 45847932
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  45847735 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 45847833  T
Q  261 cttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45847834 cttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 45847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439322
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 15439358  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15439357 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttg 15439322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727745
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || | |||||||||||||    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaa 37727706  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37727707 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 37727745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17232648 - 17232537
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| || ||    
T  17232648 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttggaatggttgtattagatgattattgttgctgttg 17232550  T
Q  260 acttgctgcatat 272  Q
    |||||||| ||||    
T  17232549 acttgctgtatat 17232537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 272
Target Start/End: Original strand, 11391870 - 11392001
Alignment:
Q  142 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 240  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  11391870 ataagatgattaatgttgtggatttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 11391969  T
Q  241 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11391970 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 11392001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12371527 - 12371455
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12371527 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 12371455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 13148275 - 13148347
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13148275 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 13148347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 9389705 - 9389800
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  9389705 gttgatatgaagttgaaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 9389800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Original strand, 8851959 - 8852040
Alignment:
Q  191 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8851959 atttatatattgtgaaagattttgatataaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttactgcatat 8852040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11066717 - 11066645
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  11066717 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttatattggatgatcattgttgttgttgacttgctgcatat 11066645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17232744 - 17232649
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  17232744 gttgatatggagttgcaaatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtcatgctgttgtgatgaat 17232649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 39267712 - 39267741
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267712 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 39267741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 59314 - 59350
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  59314 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 59350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8468524 - 8468472
Alignment:
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 282  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8468524 tgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatga 8468472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 8852087 - 8852123
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8852087 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 8852123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11066598 - 11066562
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11066598 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 11066562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 12127967 - 12128039
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12127967 ttgtgaaagatgtttatatgaagttgtaatggatatattggacgattattgttgatgttgacttactgcatat 12128039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12371408 - 12371372
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12371408 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 12371372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18302194 - 18302100
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  18302194 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgaagatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatg 18302100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 30821180 - 30821212
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30821180 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 30821212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Original strand, 32434396 - 32434456
Alignment:
Q  203 tgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 263  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||    
T  32434396 tgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgctgatgttgactt 32434456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 32434511 - 32434547
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32434511 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 32434547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 36686174 - 36686206
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36686174 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 36686206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1510
Alignment:
Q  131 agagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 230  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1736 agagaggattaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 1637  T
Q  231 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1636 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 1537  T
Q  331 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1536 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865678
Alignment:
Q  131 agagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24865452 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatt 24865551  T
Q  231 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24865552 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 24865651  T
Q  331 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24865652 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 24865678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22501148 - 22500933
Alignment:
Q  142 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22501148 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22501049  T
Q  242 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 341  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501048 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22500949  T
Q  342 agatgttgatccaaat 357  Q
    |||| |||||||||||    
T  22500948 agatattgatccaaat 22500933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22509082 - 22508867
Alignment:
Q  142 ataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22509082 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22508983  T
Q  242 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 341  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22508982 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22508883  T
Q  342 agatgttgatccaaat 357  Q
    |||| |||||||||||    
T  22508882 agatattgatccaaat 22508867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 347
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672450
Alignment:
Q  131 agagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        
T  7672240 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgt---- 7672335  T
Q  231 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 330  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7672336 --tatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 7672433  T
Q  331 gttaagttgtaagatgt 347  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7672434 gttaagtcgtaagatgt 7672450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Original strand, 2524418 - 2524526
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  2524418 atgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaattgttacat 2524517  T
Q  238 atgatgatt 246  Q
    |||||||||    
T  2524518 atgatgatt 2524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6576537 - 6576307
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  6576537 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 6576438  T
Q  238 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat----------gtctaa 327  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||   ||  |||||| |||||||| | ||||| |||||||||          ||||||    
T  6576437 ttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctattgtgatgtaataatatcattaagatgctaatgttggtctaa 6576338  T
Q  328 gttg-ttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6576337 gttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 6576307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24883713 - 24883630
Alignment:
Q  189 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24883713 atatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24883630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22501195 - 22501128
Alignment:
Q  189 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22501195 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22509129 - 22509062
Alignment:
Q  189 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22509129 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24436321 - 24436221
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24436321 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaatggttacattggatgatt-ttgttgatgttgacttgctgca 24436224  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  24436223 tat 24436221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 24781643 - 24781715
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24781643 ttgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24781715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 5032127 - 5032199
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5032127 ttgtgaaaaatgttgatatgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 5032199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9975059 - 9975019
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9975059 agatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9975019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 5032246 - 5032282
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5032246 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 5032282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20915183 - 20915151
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20915183 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 20915151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22500917 - 22500885
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22500917 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 22500885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22508851 - 22508819
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22508851 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 22508819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22689810 - 22689774
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22689810 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22689774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22694406 - 22694370
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22694406 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22694370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 24781762 - 24781798
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24781762 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 24781798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6585
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgattaataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 6458  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6459 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagt 6557  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 6585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5674
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5634 agatctctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14284
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 14412  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14411 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 14312  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14311 tgttaagttgtaagattttgatccaaat 14284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14268 - 14236
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14268 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 14236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734354
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgatttatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 20734227  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20734228 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagt 20734326  T
Q  330 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734327 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 20734354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2201277 - 2201139
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2201277 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 2201178  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2201177 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatg 2201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22421123 - 22420987
Alignment:
Q  145 agatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatga 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22421123 agatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatga 22421024  T
Q  245 ttattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  22421023 ttattattgatagtgacttgttgcatatgtctaaatg 22420987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 272
Target Start/End: Original strand, 34296957 - 34297092
Alignment:
Q  137 gatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttata 236  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34296957 gatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttata 34297056  T
Q  237 tatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34297057 tatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 34297092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851220
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa- 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  27851373 cagagaggatgaataagatgatttatattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 27851274  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  27851273 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatga 27851220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399692
Alignment:
Q  164 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgactt 19399796  T
Q  264 gctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat----------gtctaagttg-ttaagttgtaagatgttgatc 352  Q
    |||||||||  || ||||   ||  |||||| |||||||| |||| || |||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19399795 gctgcatattatttaatggttctgccttgcttttgtgatgtattattatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatc 19399696  T
Q  353 caaa 356  Q
    ||||    
T  19399695 caaa 19399692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956714
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  25956637 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 25956714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 25956715 - 25956821
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25956715 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 25956813  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  25956814 acttgctg 25956821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18927954 - 18927853
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18927954 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 18927856  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  18927855 tat 18927853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 31630622 - 31630727
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  31630622 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttga 31630720  T
Q  261 cttgctg 267  Q
    |||||||    
T  31630721 cttgctg 31630727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27851195 - 27851087
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | |||| ||    
T  27851195 atgatttactttgatgcttaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttg 27851097  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||||||||    
T  27851096 acttgctgca 27851087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 27322221 - 27322293
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27322221 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 27322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28708754 - 28708651
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28708754 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 28708655  T
Q  269 atat 272  Q
    ||||    
T  28708654 atat 28708651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18708749 - 18708677
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  18708749 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgtttatgttgacttgctgcatat 18708677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 23151069 - 23151141
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  23151069 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 23151141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 27573027 - 27573061
Alignment:
Q  322 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaa 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27573027 gtctaagttgtgaagttgtaagatgttgatccaaa 27573061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 17318992 - 17319028
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17318992 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 17319028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18708630 - 18708594
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18708630 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 18708594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10839
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  11053 taagatgattaatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattgttatatatgat 10954  T
Q  243 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaa 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953 gattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaa 10854  T
Q  343 gatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||||||    
T  10853 gatgttgatccaaat 10839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 151 - 357
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274496
Alignment:
Q  151 ttaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattatta 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattatta 51274389  T
Q  251 ttgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51274390 ttgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 51274489  T
Q  351 tccaaat 357  Q
    |||||||    
T  51274490 tccaaat 51274496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328673
Alignment:
Q  132 gagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaattg 12328637  T
Q  232 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328638 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 12328673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8885555 - 8885447
Alignment:
Q  143 taagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  8885555 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgtaatatatgat 8885456  T
Q  243 gattattat 251  Q
    |||| ||||    
T  8885455 gattgttat 8885447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194542
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  28194465 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 28194542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697405
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgat 302  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  43697478 atgttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtcttgctgttgtgat 43697405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 51326974 - 51326892
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51326974 ttgatgattaaatgtgaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgttgattattatt 51326892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 256
Target Start/End: Original strand, 28194543 - 28194638
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28194543 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatg 28194638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 43543137 - 43543031
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||    
T  43543137 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttg 43543039  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  43543038 acttgctg 43543031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 43697400 - 43697294
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  43697400 atgatttactttgatgattaa-tgtgagattattgatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattattgttgatgatg 43697302  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  43697301 acttgctg 43697294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49261452 - 49261357
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  49261452 gttgatatgaagttgtaattgttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgatactgtcttgctgtcgtgatgaat 49261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 46382652 - 46382755
Alignment:
Q  161 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  46382652 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttata--ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttttattagatgattattgttgatgttga 46382748  T
Q  261 cttgctg 267  Q
    |||||||    
T  46382749 cttgctg 46382755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20636955 - 20636866
Alignment:
Q  217 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  20636955 atgaagttgtaattgttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 20636866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48301121 - 48301040
Alignment:
Q  191 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48301121 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatat 48301040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20636837 - 20636764
Alignment:
Q  199 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20636837 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 20636764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8882216 - 8882176
Alignment:
Q  241 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8882216 atgattattattgatggtaacttgctgcatatgtctaaatg 8882176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 357
Target Start/End: Original strand, 41305818 - 41305888
Alignment:
Q  289 cttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41305818 cttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 41305888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 35981696 - 35981791
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  35981696 gttgatatgaagttgaaattgttgcacatgaagattactaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 35981791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 271
Target Start/End: Original strand, 41227507 - 41227578
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 271  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  41227507 ttgtgaaagatgtttatatgaagttttaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcata 41227578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 35981808 - 35981893
Alignment:
Q  188 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  35981808 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgttgcatat 35981893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 35981952 - 35981988
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35981952 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 35981988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48300993 - 48300957
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48300993 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 48300957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 51274512 - 51274544
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51274512 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 51274544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 450
Alignment:
Q  174 tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 512  T
Q  274 tttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaa 335  Q
    || ||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  511 ttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatatcattaagatgtctaagttgttaa 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4644
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4786 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 4687  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4686 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 4644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 226
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  368 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 269  T
Q  230 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  268 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43877
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43800 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 43877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47797
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  229 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  47720 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 47797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 43878 - 43984
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  43878 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 43976  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  43977 acttgctg 43984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Original strand, 47798 - 47837
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47798 atgatttactttgatgatt-aatgtgagaatatttatatat 47837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Original strand, 6770 - 6882
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  6770 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaatgattatatttgatgattattgttcatgttg 6869  T
Q  260 acttgctgcatat 272  Q
    |||||||||||||    
T  6870 acttgctgcatat 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 281
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59437
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  59295 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatat 59393  T
Q  238 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 281  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  59394 tggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatg 59437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 278
Target Start/End: Original strand, 15419 - 15556
Alignment:
Q  141 aataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 240  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  15419 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 15518  T
Q  241 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 278  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  15519 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 278
Target Start/End: Original strand, 24477 - 24614
Alignment:
Q  141 aataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 240  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  24477 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 24576  T
Q  241 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 278  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24577 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 85275 - 85167
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  85275 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattattgttgatgttg 85177  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||||||||    
T  85176 acttgctgca 85167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 85371 - 85276
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  85371 gttgatatggagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatgaagttgtcttgctgttgtgatgaat 85276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 36142 - 36248
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  36142 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttg 36240  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  36241 acttgctg 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 3093
Alignment:
Q  138 atgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  3226 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatatcgtgaaaaatgttgatatgaagttgtaatggttatat 3128  T
Q  238 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
      |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3127 tggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3047 - 3010
Alignment:
Q  321 tgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3047 tgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 3010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3063 - 2966
Alignment:
Q  169 tttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 267  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3063 tttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctg 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3066
Alignment:
Q  130 cagagatgatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatata 199  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatata 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 834
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  935 ttgatgattaaatgtgaaag-attaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 837  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  836 tat 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 10963 - 11069
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  10963 atgatttactttgatgattta-tgtgagaatatttatatattgtaaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 11061  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  11062 acttgctg 11069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 363032 - 362926
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||    
T  363032 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattttgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttg 362934  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  362933 acttgctg 362926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 5478 - 5579
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  5478 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaatgtttatattggatgattattgttgatgttaacttgctgca 5576  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  5577 tat 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 77019 - 76919
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 269  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  ||| ||||| ||    
T  77019 ttgatgattaaatgtgaaaat--ttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgattttgatttgctaca 76922  T
Q  270 tat 272  Q
    |||    
T  76921 tat 76919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 10029 - 10101
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10029 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2395
Alignment:
Q  211 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 306  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2300 gttgatatgaagttgaaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtcttgctgtcgtgatgaat 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 270
Target Start/End: Original strand, 2424 - 2495
Alignment:
Q  199 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcat 270  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2424 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcat 2495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 2556 - 2592
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2556 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 2592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2552
Alignment:
Q  170 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2449 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 2548  T
Q  269 atat 272  Q
    ||||    
T  2549 atat 2552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 272
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9177
Alignment:
Q  201 tgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 9224 - 9260
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9224 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8486
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8379 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 8476  T
Q  260 acttgctgca 269  Q
    ||||| ||||    
T  8477 acttgttgca 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8261
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  8189 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatat 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 8308 - 8344
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8308 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 8344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 24739 - 24844
Alignment:
Q  160 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24739 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 24836  T
Q  260 acttgctg 267  Q
    ||||||||    
T  24837 acttgctg 24844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 24676 - 24705
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 24705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 9561 - 9633
Alignment:
Q  200 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 272  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  9561 ttgtgaaagatgttaatatgaagttgtaatggttatattggatgattaccgttgatgttgacttgctgcatat 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Original strand, 9680 - 9716
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9680 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 313
Alignment:
Q  326 aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  344 aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1920
Alignment:
Q  197 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 268  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1990 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9955 - 9926
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 9926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 252
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7699
Alignment:
Q  223 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7670 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 7699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 57930 - 57894
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57930 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 57894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 46993 - 47025
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46993 agatgtctaagttgttaagttgtaaaatgttga 47025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 145865 - 145833
Alignment:
Q  318 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  145865 agatgtctaagttgttaaattgtaagatgttga 145833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 145917 - 145881
Alignment:
Q  322 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145917 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2948 times since January 2019
Visitors: 3831