View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0631_high_27 (Length: 214)

Name: NF0631_high_27
Description: NF0631
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0631_high_27
NF0631_high_27
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (1-210)||(25191137-25191346)
chr3 (1-214)||(52138558-52138771)
chr3 (1-210)||(38849852-38850061)
chr3 (14-214)||(5168599-5168799)
chr3 (1-206)||(47542031-47542235)
chr3 (1-202)||(28245195-28245396)
chr3 (1-214)||(51448020-51448233)
chr3 (10-214)||(53519353-53519557)
chr3 (94-214)||(33272339-33272459)
chr3 (10-204)||(27917339-27917533)
chr3 (74-211)||(54278851-54278988)
chr3 (64-208)||(43695082-43695226)
chr3 (5-204)||(26490079-26490278)
chr3 (42-200)||(3186568-3186726)
chr3 (2-211)||(30345286-30345491)
chr3 (119-204)||(45728021-45728107)
chr3 (165-214)||(21995-22044)
chr3 (153-210)||(47233911-47233968)
chr3 (94-211)||(2341028-2341145)
chr3 (101-198)||(48953723-48953819)
chr3 (137-204)||(45236750-45236817)
chr3 (154-204)||(46568027-46568077)
chr3 (160-214)||(54128295-54128349)
chr3 (160-203)||(42510333-42510376)
chr3 (138-214)||(46367694-46367772)
chr3 (93-199)||(44395275-44395381)
chr3 (154-204)||(49841522-49841572)
chr3 (118-214)||(49503865-49503966)
chr3 (165-204)||(19736918-19736957)
chr3 (155-210)||(29817416-29817471)
chr3 (159-214)||(36820270-36820325)
chr3 (165-212)||(46431984-46432031)
chr3 (138-203)||(653859-653924)
chr3 (93-214)||(43308416-43308537)
chr3 (7-72)||(54425359-54425424)
chr3 (2-110)||(29817263-29817371)
chr3 (166-214)||(38054648-38054696)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-214)||(38606763-38606976)
chr7 (1-214)||(34869178-34869391)
chr7 (1-214)||(43281434-43281647)
chr7 (2-214)||(31004982-31005194)
chr7 (1-214)||(33350117-33350330)
chr7 (1-214)||(36651752-36651965)
chr7 (1-210)||(11593718-11593927)
chr7 (1-214)||(36869600-36869813)
chr7 (6-214)||(33072717-33072925)
chr7 (1-214)||(32630353-32630566)
chr7 (1-214)||(35906512-35906725)
chr7 (2-214)||(46356167-46356374)
chr7 (6-214)||(39906681-39906894)
chr7 (6-214)||(49029044-49029247)
chr7 (27-214)||(12841586-12841773)
chr7 (6-214)||(23404181-23404389)
chr7 (1-214)||(7272798-7273010)
chr7 (55-214)||(13859319-13859476)
chr7 (1-115)||(37616674-37616788)
chr7 (122-214)||(37617823-37617915)
chr7 (1-87)||(48919146-48919232)
chr7 (75-203)||(25579393-25579521)
chr7 (154-214)||(44855483-44855543)
chr7 (138-214)||(45836791-45836867)
chr7 (154-205)||(5335833-5335884)
chr7 (154-201)||(36514529-36514576)
chr7 (153-202)||(1740707-1740756)
chr7 (159-204)||(14593677-14593722)
chr7 (159-204)||(16013200-16013245)
chr7 (118-214)||(47848549-47848645)
chr7 (98-169)||(28628286-28628357)
chr7 (5-214)||(7189544-7189752)
chr7 (154-203)||(30200281-30200330)
chr7 (153-198)||(35559321-35559366)
chr7 (162-214)||(24598457-24598509)
chr7 (154-202)||(28542206-28542254)
chr7 (102-205)||(15681216-15681319)
chr7 (159-214)||(39811873-39811928)
chr7 (159-203)||(24550009-24550053)
chr7 (163-210)||(24434680-24434727)
chr7 (153-204)||(42187381-42187432)
chr7 (168-210)||(43282330-43282372)
chr7 (153-203)||(43491218-43491268)
chr7 (154-214)||(27022017-27022077)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (2-214)||(41197539-41197751)
chr2 (1-210)||(11992421-11992630)
chr2 (1-214)||(3865830-3866043)
chr2 (9-214)||(41763352-41763557)
chr2 (1-214)||(451933-452146)
chr2 (1-214)||(2610286-2610499)
chr2 (1-214)||(8180538-8180751)
chr2 (1-214)||(45367935-45368148)
chr2 (20-214)||(23997394-23997588)
chr2 (2-214)||(4807351-4807563)
chr2 (1-214)||(3243962-3244175)
chr2 (56-214)||(36183264-36183422)
chr2 (59-214)||(38429700-38429855)
chr2 (1-210)||(24583921-24584130)
chr2 (6-211)||(6238068-6238272)
chr2 (9-214)||(30743389-30743594)
chr2 (1-86)||(38453059-38453144)
chr2 (39-214)||(12734502-12734672)
chr2 (39-203)||(16097312-16097480)
chr2 (157-214)||(38453000-38453057)
chr2 (139-204)||(7825254-7825319)
chr2 (158-203)||(9647927-9647972)
chr2 (160-204)||(45077665-45077709)
chr2 (130-200)||(19337174-19337244)
chr2 (159-204)||(4598885-4598930)
chr2 (108-193)||(36039088-36039173)
chr2 (100-147)||(32443471-32443518)
chr2 (102-189)||(37281966-37282053)
chr2 (160-214)||(23714569-23714623)
chr2 (160-214)||(24102241-24102295)
chr2 (158-204)||(38434866-38434912)
chr2 (154-202)||(41779055-41779103)
chr2 (160-204)||(42092436-42092480)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-214)||(9706534-9706747)
chr6 (1-214)||(14030564-14030778)
chr6 (1-214)||(5258461-5258674)
chr6 (1-214)||(607917-608130)
chr6 (1-204)||(5631576-5631779)
chr6 (1-205)||(10100177-10100381)
chr6 (1-214)||(20427947-20428160)
chr6 (64-214)||(28085197-28085347)
chr6 (2-203)||(6056092-6056293)
chr6 (2-165)||(30679233-30679396)
chr6 (9-214)||(2689422-2689627)
chr6 (68-214)||(30031081-30031227)
chr6 (1-198)||(33495955-33496139)
chr6 (109-214)||(35043752-35043857)
chr6 (42-214)||(2065067-2065239)
chr6 (157-210)||(32755833-32755886)
chr6 (159-214)||(9594023-9594078)
chr6 (154-214)||(33998315-33998375)
chr6 (154-207)||(4948625-4948678)
chr6 (154-207)||(4955596-4955649)
chr6 (102-203)||(28027147-28027248)
chr6 (171-211)||(9568588-9568628)
chr6 (153-203)||(33083968-33084018)
chr6 (52-147)||(24631132-24631227)
chr6 (100-211)||(26291636-26291746)
chr6 (154-206)||(5080766-5080818)
chr6 (160-196)||(6293698-6293734)
chr6 (158-214)||(7150629-7150685)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (3-214)||(30202441-30202652)
chr1 (1-214)||(32083056-32083269)
chr1 (1-214)||(8391528-8391743)
chr1 (2-214)||(9592493-9592705)
chr1 (1-214)||(8671678-8671891)
chr1 (1-214)||(43240692-43240905)
chr1 (1-214)||(1210503-1210716)
chr1 (1-214)||(22089852-22090065)
chr1 (1-214)||(49347704-49347917)
chr1 (1-214)||(51441076-51441288)
chr1 (43-214)||(696069-696240)
chr1 (37-214)||(15085728-15085905)
chr1 (1-210)||(51601816-51602025)
chr1 (105-214)||(34792660-34792768)
chr1 (2-204)||(9599715-9599917)
chr1 (1-203)||(19936280-19936482)
chr1 (6-204)||(34827423-34827621)
chr1 (120-214)||(32231265-32231359)
chr1 (4-214)||(37463182-37463386)
chr1 (101-210)||(26016295-26016404)
chr1 (39-196)||(39140310-39140466)
chr1 (6-204)||(46226603-46226801)
chr1 (130-214)||(4001766-4001848)
chr1 (102-210)||(18469395-18469503)
chr1 (154-210)||(9509229-9509285)
chr1 (108-170)||(3192071-3192133)
chr1 (108-170)||(3200889-3200951)
chr1 (108-170)||(3209726-3209788)
chr1 (154-210)||(52442819-52442875)
chr1 (15-127)||(52831830-52831942)
chr1 (102-203)||(40419498-40419599)
chr1 (174-214)||(17275137-17275177)
chr1 (160-203)||(4379922-4379965)
chr1 (156-203)||(6641045-6641092)
chr1 (88-204)||(38807996-38808107)
chr1 (139-182)||(38877676-38877719)
chr1 (102-204)||(7814323-7814425)
chr1 (160-214)||(14226138-14226192)
chr1 (4-205)||(32404851-32405050)
chr1 (93-126)||(7921777-7921810)
chr1 (153-201)||(10200486-10200534)
chr1 (174-214)||(27848115-27848155)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (1-214)||(31960125-31960338)
chr4 (1-211)||(27450487-27450697)
chr4 (1-214)||(23906612-23906825)
chr4 (5-214)||(435991-436200)
chr4 (1-214)||(33226967-33227180)
chr4 (1-213)||(53707552-53707764)
chr4 (1-214)||(43433676-43433889)
chr4 (4-210)||(48174408-48174614)
chr4 (1-214)||(1777326-1777539)
chr4 (8-210)||(1211705-1211907)
chr4 (1-214)||(50286729-50286942)
chr4 (1-210)||(56375048-56375257)
chr4 (1-210)||(47265517-47265729)
chr4 (1-214)||(46583135-46583348)
chr4 (1-214)||(48622852-48623051)
chr4 (1-199)||(39708215-39708414)
chr4 (52-214)||(52569826-52569988)
chr4 (118-214)||(12494625-12494721)
chr4 (5-204)||(16002690-16002888)
chr4 (90-214)||(31458875-31458999)
chr4 (42-214)||(41009661-41009833)
chr4 (74-214)||(4440687-4440826)
chr4 (93-214)||(45205159-45205280)
chr4 (118-214)||(33191159-33191255)
chr4 (4-198)||(55578795-55578986)
chr4 (109-214)||(39100844-39100949)
chr4 (2-214)||(35690064-35690275)
chr4 (120-214)||(27983077-27983171)
chr4 (78-204)||(11389555-11389681)
chr4 (100-200)||(1793317-1793417)
chr4 (160-214)||(33709836-33709890)
chr4 (153-211)||(37773764-37773822)
chr4 (64-203)||(7092541-7092680)
chr4 (138-211)||(40933210-40933283)
chr4 (153-203)||(17900390-17900440)
chr4 (5-123)||(54914591-54914708)
chr4 (149-214)||(43070075-43070140)
chr4 (154-203)||(44860765-44860814)
chr4 (160-214)||(49987345-49987399)
chr4 (139-204)||(20105792-20105857)
chr4 (169-214)||(25967578-25967623)
chr4 (153-214)||(28236095-28236156)
chr4 (118-207)||(49739112-49739201)
chr4 (167-203)||(2588905-2588941)
chr4 (174-210)||(37797783-37797819)
chr4 (163-210)||(25755237-25755284)
chr4 (164-203)||(54470128-54470167)
chr4 (164-214)||(18966474-18966524)
chr4 (153-211)||(20601960-20602018)
chr4 (162-204)||(42293579-42293621)
chr4 (103-172)||(26037835-26037904)
chr4 (154-203)||(27991737-27991786)
chr4 (138-211)||(30853311-30853384)
chr4 (167-211)||(21106908-21106952)
chr4 (159-211)||(25257893-25257945)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-214)||(36565552-36565765)
chr8 (1-214)||(39946615-39946828)
chr8 (2-214)||(12492153-12492365)
chr8 (1-214)||(42854315-42854528)
chr8 (4-214)||(15215582-15215792)
chr8 (2-214)||(36544911-36545118)
chr8 (35-214)||(36395261-36395443)
chr8 (6-214)||(18124939-18125146)
chr8 (3-203)||(25288662-25288862)
chr8 (9-203)||(25300003-25300197)
chr8 (54-214)||(18752184-18752344)
chr8 (5-214)||(37077527-37077736)
chr8 (14-214)||(2796326-2796528)
chr8 (2-113)||(4032907-4033017)
chr8 (6-214)||(8879751-8879953)
chr8 (6-100)||(25439299-25439393)
chr8 (144-214)||(40813223-40813293)
chr8 (57-204)||(29735623-29735767)
chr8 (156-199)||(30456537-30456580)
chr8 (155-213)||(39760736-39760794)
chr8 (93-214)||(30783351-30783471)
chr8 (105-210)||(39953579-39953684)
chr8 (4-67)||(10824546-10824609)
chr8 (159-214)||(30748375-30748430)
chr8 (5-98)||(6510843-6510937)
chr8 (102-188)||(9905223-9905309)
chr8 (6-115)||(13984797-13984906)
chr8 (166-203)||(29520583-29520620)
chr8 (102-203)||(45512818-45512919)
chr8 (154-198)||(42493631-42493675)
chr8 (159-203)||(43732483-43732527)
chr8 (109-203)||(36143235-36143329)
chr8 (165-203)||(45419161-45419199)
chr8 (166-211)||(39051065-39051110)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (1-210)||(12492702-12492911)
chr5 (2-214)||(2075785-2075997)
chr5 (1-214)||(1275023-1275236)
chr5 (6-214)||(1287900-1288108)
chr5 (1-214)||(10639055-10639268)
chr5 (1-214)||(3301607-3301815)
chr5 (1-214)||(28977168-28977381)
chr5 (2-205)||(34272781-34272984)
chr5 (1-200)||(20318749-20318944)
chr5 (35-205)||(16347698-16347868)
chr5 (2-214)||(24178283-24178481)
chr5 (2-201)||(36200541-36200740)
chr5 (1-115)||(3394468-3394585)
chr5 (2-201)||(27653-27852)
chr5 (138-211)||(16454606-16454679)
chr5 (44-126)||(17340871-17340953)
chr5 (114-204)||(21952222-21952312)
chr5 (139-200)||(5848401-5848462)
chr5 (163-205)||(27998343-27998385)
chr5 (4-49)||(16347879-16347924)
chr5 (169-205)||(4496308-4496344)
chr5 (163-214)||(28186979-28187030)
chr5 (129-203)||(21093662-21093736)
chr5 (93-214)||(7678331-7678451)
chr5 (167-204)||(43558135-43558172)
chr5 (139-211)||(5305512-5305584)
chr5 (5-69)||(16779444-16779508)
chr5 (160-199)||(11002747-11002786)
chr5 (137-211)||(11728984-11729059)
chr5 (164-203)||(17340759-17340798)
chr5 (168-210)||(15489792-15489834)
chr5 (165-211)||(32516480-32516526)
chr5 (174-214)||(26885000-26885040)
chr5 (155-203)||(27553752-27553800)
chr5 (166-214)||(34039960-34040008)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-210)||(31226-31435)
scaffold0018 (139-203)||(44193-44257)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (1-201)||(2594-2794)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-214)||(82479-82692)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-214)||(11909-12122)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (118-214)||(25756-25852)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (3-81)||(29-107)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (118-214)||(4583-4679)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (6-199)||(86933-87128)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 25191137 - 25191346
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25191137 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagaccgga 25191236  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25191237 aatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagact 25191336  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||||||||    
T  25191337 agacatgata 25191346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 52138558 - 52138771
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  52138558 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtcttgtgcgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 52138657  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138658 gttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 52138757  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  52138758 agacatgataggat 52138771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 38849852 - 38850061
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| ||||| |||| |    
T  38849852 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataacaaagtaccacttaagttgaaagaaattttttatcggacaacagtcacaccgac 38849951  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38849952 gatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagact 38850051  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||||||||    
T  38850052 agacatgata 38850061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 5168599 - 5168799
Alignment:
Q  14 atggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5168599 atggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggt 5168698  T
Q  114 acaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatagga 213  Q
    ||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  5168699 acggagtgctgggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggatagga 5168798  T
Q  214 t 214  Q
    |    
T  5168799 t 5168799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47542235 - 47542031
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||    
T  47542235 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgaccggc 47542136  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542135 gttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaataa-gaaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 47542037  T
Q  201 agacat 206  Q
    ||||||    
T  47542036 agacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28245195 - 28245396
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  28245195 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcagttgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 28245294  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245295 gttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 28245394  T
Q  201 ag 202  Q
    ||    
T  28245395 ag 28245396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51448233 - 51448020
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |    
T  51448233 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacagcagtccgaccgac 51448134  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448133 gttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 51448034  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  51448033 agacaggataggat 51448020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 53519353 - 53519557
Alignment:
Q  10 tgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   |||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  53519353 tgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtg 53519452  T
Q  110 tggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgat 209  Q
    | ||||  ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  53519453 ttgtacggagtgttaagcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggat 53519552  T
Q  210 aggat 214  Q
    |||||    
T  53519553 aggat 53519557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33272459 - 33272339
Alignment:
Q  94 gaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtgg 193  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33272459 gaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtgg 33272360  T
Q  194 taagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33272359 taagactagacatgataggat 33272339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 27917339 - 27917533
Alignment:
Q  10 tgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgta 109  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  27917339 tgaaatagagaagagcctcatgtgttttatgtgataaaaaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacaccggcgatgttgta 27917438  T
Q  110 tggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||  ||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27917439 tggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaaacgagaatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagac 27917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Original strand, 54278851 - 54278988
Alignment:
Q  74 gttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgagg 173  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  54278851 gttctatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgagg 54278950  T
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54278951 atgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatag 54278988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43695226 - 43695082
Alignment:
Q  64 tgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagc 163  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | || ||| | ||||||||| | | ||||||||| |    
T  43695226 tgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtgtaac 43695127  T
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43695126 agagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatga 43695082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 26490079 - 26490278
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||| ||  || |||||||||| |||||  | |||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||    
T  26490079 gtggttgagatgaagaatagccttaga-gttttatgtaatgagaaaataccgcttaaatttaaaggaaaattatatcggacaacagtcagaccggcgatg 26490177  T
Q  105 ttgt--atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    ||||  ||||||   | ||||||||| ||||||  ||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26490178 ttgtgtatggtaagta-tgttgggcggttaagaaccaacaagagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaag 26490276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 3186568 - 3186726
Alignment:
Q  42 gataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaac 141  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||  | |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3186568 gataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaagttatatcggacaacagtcccaccaacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaac 3186667  T
Q  142 acgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||| | | |||| ||||||  ||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  3186668 acgagaatcaagtaaatgtagcgtagatgagaatcttatgttggatgagcggtaagact 3186726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 30345286 - 30345491
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||  ||||| | ||| | | |||||  | |     
T  30345286 tgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggaaaattctaccagacgaaaatcagattgacg 30345385  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||| ||| ||||  |||| |||||| ||||||  ||||| ||    ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |     
T  30345386 atgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatga----aaattaagtatagcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattg 30345481  T
Q  202 gacatgatag 211  Q
    ||||||||||    
T  30345482 gacatgatag 30345491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 45728021 - 45728107
Alignment:
Q  119 gtgttgggcgtttaagagtc-aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45728021 gtgttgggcggttaagagcccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagac 45728107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 214
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22044
Alignment:
Q  165 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggat 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47233968 - 47233911
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233968 gtaagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 47233911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2341145 - 2341028
Alignment:
Q  94 gaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtgg 193  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||| ||||||| | | |||| ||||| ||||| |||  ||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2341145 gaccagcattgttgtatgagacaaaatgttgggtggtaaagaatcaacgcgagaataaaataaggatagtggagatgaggatgttgcattggatgtgtgg 2341046  T
Q  194 taagactagacatgatag 211  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2341045 taagactagacatgatag 2341028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48953819 - 48953723
Alignment:
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||| |||   | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48953819 aatgttgtatgttacggagtgttgggcgtttaagatccaacacaagaaacaagtaagtgt-gcggagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaaga 48953723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Original strand, 45236750 - 45236817
Alignment:
Q  137 tcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45236750 tcaacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 45236817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 46568027 - 46568077
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  46568027 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagac 46568077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 54128295 - 54128349
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  54128295 tagcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggat 54128349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42510376 - 42510333
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42510376 tagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 42510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46367772 - 46367694
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttgg--atgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  46367772 caacacgagaataaaataagtgtagtagagatgaggatgttgtgttggatatgtgtggtaagactaaacattataggat 46367694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 44395275 - 44395381
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 192  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||| ||| |||  ||||  ||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||    
T  44395275 agaccggcaattttgtatgggacatagtgttgggcggtaaagaaccaacacaagaataagataagcatagaagagatgaggaagttgtgttgaatgtgtg 44395374  T
Q  193 gtaagac 199  Q
    |||||||    
T  44395375 gtaagac 44395381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 49841522 - 49841572
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  49841522 taagtgtagcatagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagac 49841572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49503966 - 49503865
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgtt-----ggatgagtggtaagactagacatgatagg 212  Q
    |||||||| || |||||| |||||| || | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  49503966 agtgttggacggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagactagacgagatagg 49503867  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  49503866 at 49503865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19736957
Alignment:
Q  165 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagac 19736957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 29817416 - 29817471
Alignment:
Q  155 aagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||    
T  29817416 aagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgata 29817471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36820325 - 36820270
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  36820325 gtagcaaagataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggat 36820270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46432031 - 46431984
Alignment:
Q  165 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatagg 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46432031 gagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacaggatagg 46431984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 653924 - 653859
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||| | ||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  653924 caacacgataataaagtacgcgtagcaaagatgaggattttgcgttggatgtgtggtaaaactaga 653859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Original strand, 43308416 - 43308537
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 192  Q
    |||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| | ||||  |||||||||| |||  |||  ||| | |||| || | |||||||||| ||  |||    
T  43308416 agaccggtgatgttgtatgggatggagtgttgggcggtaaagaaccaacacgagaataaaataatcgtaaccgagacgaaggtgttgcgttgaatttgtg 43308515  T
Q  193 gtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43308516 gtaagactagacatgataggat 43308537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 54425424 - 54425359
Alignment:
Q  7 ggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaa 72  Q
    |||||||||| | ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  54425424 ggttgaaatgaaaaagagtctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttggaaggaa 54425359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 29817263 - 29817371
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||   ||||||| || ||||||||| || | |||||| |||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |    
T  29817263 tgggtggttgaaatagagaatagtctgttatgttttatgtgataagaaagtaacgcttaagttgaaagaaaatttctaccggacaacagttagaccgata 29817362  T
Q  102 atgttgtat 110  Q
    |||||||||    
T  29817363 atgttgtat 29817371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054648
Alignment:
Q  166 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggat 38054648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 38606763 - 38606976
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38606763 ctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggc 38606862  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38606863 aatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagact 38606962  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38606963 agacatgataggat 38606976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34869178 - 34869391
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34869178 ctgggtggttgaattggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 34869277  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869278 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 34869377  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34869378 agacatgataggat 34869391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43281434 - 43281647
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  43281434 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaaccggc 43281533  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43281534 aatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgcaagagtaaagtaagtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagact 43281633  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    |||||  |||||||    
T  43281634 agacaatataggat 43281647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31004982 - 31005194
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||     
T  31004982 tgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcg 31005081  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005082 ttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 31005181  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||| ||||||||    
T  31005182 gacaggataggat 31005194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33350330 - 33350117
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  33350330 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgacaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 33350231  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33350230 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagact 33350131  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33350130 agacatgataggat 33350117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36651752 - 36651965
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||    
T  36651752 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgaccggc 36651851  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651852 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 36651951  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  36651952 agacaggataggat 36651965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 11593718 - 11593927
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||    
T  11593718 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgaccggc 11593817  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593818 gttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 11593917  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||| ||||    
T  11593918 agacaggata 11593927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36869813 - 36869600
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  36869813 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggggttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggccggc 36869714  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     ||||||||||||||  | ||||| |||  |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36869713 gatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaacacgtgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagact 36869614  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
     |||||||||||||    
T  36869613 ggacatgataggat 36869600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 33072717 - 33072925
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  33072717 tggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagaccggcgttgt 33072816  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072817 tgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaataagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 33072916  T
Q  206 tgataggat 214  Q
     ||||||||    
T  33072917 agataggat 33072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32630353 - 32630566
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |    
T  32630353 ctgggtagttgaaatggagaagagcctcgagtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcggacatcaatcagaccgac 32630452  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32630453 aatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagact 32630552  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  32630553 agacatgataggat 32630566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35906725 - 35906512
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  35906725 ctgggtggttgaaatggagaagatcttcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 35906626  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906625 gttgttgtatgatacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 35906526  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  35906525 agacaggataggat 35906512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46356374 - 46356167
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46356374 tgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccggca 46356275  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46356274 ttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaat----caagtgtagcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagacta 46356180  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||| ||||||||    
T  46356179 gacaggataggat 46356167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39906894 - 39906681
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  39906894 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgt 39906795  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagaga-----tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39906794 tgtatggtacggagtgttaggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagact 39906695  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  39906694 agacaggataggat 39906681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 49029044 - 49029247
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||  ||||  |||||   |||    
T  49029044 tggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaaataccactt-----gaaaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgt 49029138  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49029139 tgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagaca 49029238  T
Q  206 tgataggat 214  Q
    |||||||||    
T  49029239 tgataggat 49029247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12841773 - 12841586
Alignment:
Q  27 tcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttggg 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  12841773 tcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggg 12841674  T
Q  127 cgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
     | ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12841673 tggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggat 12841586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 23404181 - 23404389
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  23404181 tggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttctgagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgatat 23404280  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| || || ||||||| | | |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  23404281 tgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactataca 23404380  T
Q  206 tgataggat 214  Q
    |||||||||    
T  23404381 tgataggat 23404389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7272798 - 7273010
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||  ||||| |||| |    
T  7272798 ctgggtggttgagattgagaa-agcctcaggtattttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcggtcagcagtcaaaccgac 7272896  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  7272897 aatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaacacgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagact 7272996  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    | ||  ||||||||    
T  7272997 acacgggataggat 7273010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13859476 - 13859319
Alignment:
Q  55 cacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgt 154  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||    
T  13859476 cacttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagt 13859377  T
Q  155 aagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13859376 aagt--agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggat 13859319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 37616674 - 37616788
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||| |    
T  37616674 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagaccgac 37616773  T
Q  101 aatgttgtatggtac 115  Q
    | |||||||||||||    
T  37616774 attgttgtatggtac 37616788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 37617823 - 37617915
Alignment:
Q  122 ttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37617823 ttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggat 37617915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 48919146 - 48919232
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaa 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48919146 ctgggtagttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccccttaagttgaaaggaaggttatatcggacaa 48919232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25579521 - 25579393
Alignment:
Q  75 ttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgagga 174  Q
    ||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||    
T  25579521 ttctatcggacagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcgtagaggagatgagga 25579422  T
Q  175 tgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25579421 tgttgcgttggatgtgtggtaatactaga 25579393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44855543 - 44855483
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855543 taagtgtagcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggat 44855483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45836867 - 45836791
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  45836867 caacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggat 45836791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 5335833 - 5335884
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5335833 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagaca 5335884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36514576 - 36514529
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36514576 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacta 36514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 1740707 - 1740756
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1740707 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactag 1740756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 14593677 - 14593722
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14593677 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 14593722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 16013200 - 16013245
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16013200 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 16013245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 47848549 - 47848645
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  47848549 agtgttgggtggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggat 47848645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28628357 - 28628286
Alignment:
Q  98 ggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagat 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  28628357 ggcaatgttgtatggaacaaagtgttgggcggttgagaaccaacacgagaataaagtaagcgtagcagagat 28628286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7189752 - 7189544
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  ||||||||| ||  ||||||  ||||||  |  || ||| | ||| ||||||||||| | |||    
T  7189752 gtggttgaaatggagaaaagtctcaggtgttttatttgataagaaagtattacttaaattgaaagagaaattttatag-acagtagtcagaccgacgatg 7189654  T
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| | | | | |||||  |||  ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||    
T  7189653 ttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagac 7189554  T
Q  205 atgataggat 214  Q
      ||||||||    
T  7189553 gagataggat 7189544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30200330 - 30200281
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  30200330 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattaga 30200281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35559366 - 35559321
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559366 gtaagtgtagtaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 35559321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598457
Alignment:
Q  162 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggat 24598457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28542254 - 28542206
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28542254 taagtgtagcggagatgagggtgttgcgttggatgtgtggtaagactag 28542206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 15681216 - 15681319
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||| || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||    
T  15681216 atgttgtatggtatagagtgttgggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagtgtagtggagattagaatgtttcgttaaatgaacggtaaaacta 15681315  T
Q  202 gaca 205  Q
    ||||    
T  15681316 gaca 15681319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 39811873 - 39811928
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39811873 gtagcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggat 39811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24550053 - 24550009
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24550053 gtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactaga 24550009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24434727 - 24434680
Alignment:
Q  163 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24434727 cagagatgagaatgttgcgttgaatgcgtggtaatactagacatgata 24434680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 42187381 - 42187432
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  42187381 gtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagac 42187432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282372
Alignment:
Q  168 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgata 43282372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 43491218 - 43491268
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  43491218 gtaagtgtagccgagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattaga 43491268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27022077 - 27022017
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  27022077 taagtgtagcggcaatgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggat 27022017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41197751 - 41197539
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  41197751 tgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagaccagca 41197652  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41197651 atgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagacta 41197552  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||    
T  41197551 gacatgataggat 41197539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11992630 - 11992421
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  11992630 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgaccggc 11992531  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11992530 aatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatact 11992431  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||||||||    
T  11992430 agacatgata 11992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 3865830 - 3866043
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  3865830 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgac 3865929  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3865930 gttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagact 3866029  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  3866030 agacatgataggat 3866043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41763557 - 41763352
Alignment:
Q  9 ttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  41763557 ttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgt 41763458  T
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41763457 atggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaaga 41763358  T
Q  209 taggat 214  Q
    ||||||    
T  41763357 taggat 41763352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 452146 - 451933
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |    
T  452146 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgac 452047  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  452046 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagact 451947  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  451946 agacatgataggat 451933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2610286 - 2610499
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  2610286 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagactggc 2610385  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2610386 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagact 2610485  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| || |||||    
T  2610486 agacaggacaggat 2610499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8180538 - 8180751
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  8180538 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagagttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagaccagc 8180637  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8180638 gttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagact 8180737  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  8180738 agacatgataggat 8180751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45368148 - 45367935
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |    
T  45368148 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgac 45368049  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45368048 aatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagact 45367949  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  45367948 agacaagataggat 45367935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 23997394 - 23997588
Alignment:
Q  20 aagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaag 119  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  23997394 aagagccccaggtgttttgtgcgatgagaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaag 23997493  T
Q  120 tgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23997494 tgttgggcagttaagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggat 23997588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4807351 - 4807563
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |     
T  4807351 tgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacg 4807450  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4807451 ttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaata 4807550  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4807551 gacatgataggat 4807563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3244175 - 3243962
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  3244175 ctgggtggtagaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttatgttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 3244076  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3244075 gttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagact 3243976  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    | ||||||||||||    
T  3243975 acacatgataggat 3243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 36183264 - 36183422
Alignment:
Q  56 acttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgta 155  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||    
T  36183264 acttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagta 36183363  T
Q  156 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36183364 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 36183422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Original strand, 38429700 - 38429855
Alignment:
Q  59 taagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagt 158  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||    
T  38429700 taagctaaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagt 38429799  T
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429800 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 38429855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24584130 - 24583921
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  || | ||  ||||||| |    
T  24584130 ctgggtggtggaaatggagaatagcctcgtgtgttttgtgcgaaaagaaaataccacttaagttgaaagaaaagttctgttagatagtatccagaccgac 24584031  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24584030 gatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagact 24583931  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    | ||||||||    
T  24583930 aaacatgata 24583921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6238272 - 6238068
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | | ||||    
T  6238272 tggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgtgataa-aaaataccacttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagactgacgatgt 6238174  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| | |  ||| || |||  |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6238173 tgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaaataattgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagaca 6238074  T
Q  206 tgatag 211  Q
    ||||||    
T  6238073 tgatag 6238068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 30743389 - 30743594
Alignment:
Q  9 ttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgt 108  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |   ||||||||| | |||||||    
T  30743389 ttgaaattgagaagagcctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgt 30743488  T
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||  || ||| |||| |||| || |||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  ||    
T  30743489 atggtacggagagttaggcgattaaaagccaacacgagaatcaagtaagtgttgtggagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacggga 30743588  T
Q  209 taggat 214  Q
    ||||||    
T  30743589 taggat 30743594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38453144 - 38453059
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggaca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38453144 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggaca 38453059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Original strand, 12734502 - 12734672
Alignment:
Q  39 tgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtc 138  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  12734502 tgcgacaagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatc-gacaacagtcaaaccatcgatgttgtatggtacagagtgttgggcggtttagagcc 12734600  T
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||| |||| |     ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12734601 aacatgagaat----caagtgtagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggat 12734672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16097480 - 16097312
Alignment:
Q  39 tgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgt----ttaag 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |   ||||||||||||| || | |||| ||     |||||    
T  16097480 tgcgataagaaggtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcaaacagcagtcagaccagtgttgttgtatggtacgaaatcttggacggacggttaag 16097381  T
Q  135 agtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16097380 agccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactaga 16097312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38453057 - 38453000
Alignment:
Q  157 gtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38453057 gtgtagcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggat 38453000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 7825254 - 7825319
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7825254 aacatgagaataaagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 7825319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9647972 - 9647927
Alignment:
Q  158 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9647972 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 9647927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 204
Target Start/End: Original strand, 45077665 - 45077709
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45077665 tagctgagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 45077709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19337244 - 19337174
Alignment:
Q  130 ttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19337244 ttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagact 19337174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4598930 - 4598885
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4598930 gtagcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 4598885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 36039088 - 36039173
Alignment:
Q  108 tatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtgg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  | | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36039088 tatggtacaaagtgttgggtggttaagaaactaaacgagaataaagtaatcgtagcagagatgaagatgttgtgttggatgtgtgg 36039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 147
Target Start/End: Original strand, 32443471 - 32443518
Alignment:
Q  100 caatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgaga 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  32443471 caatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaatcaacacgaga 32443518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 37281966 - 37282053
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatga 189  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||||| |||| |||||| | | |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  37281966 atgttgtatgatacagagtgttaagcggttaagaatcaatacgagaatcaagtaagtatagttgagatgaggatgttgtgttggatga 37282053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23714623 - 23714569
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  23714623 tagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggat 23714569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24102295 - 24102241
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24102295 tagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggat 24102241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Original strand, 38434866 - 38434912
Alignment:
Q  158 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  38434866 tgtagcggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagac 38434912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41779103 - 41779055
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41779103 taagcgtagcaaagatgagaatgttgcgttggatgtggggtaagactag 41779055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 204
Target Start/End: Original strand, 42092436 - 42092480
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42092436 tagcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagac 42092480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9706534 - 9706747
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  9706534 ctgggtggttgaaatggagaagagcatcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggc 9706633  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9706634 aatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagact 9706733  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  9706734 agacatgataggat 9706747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14030564 - 14030778
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  14030564 ctgggtggttgaaatggagaatagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaaactagc 14030663  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtgg-taagac 199  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14030664 aatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagac 14030763  T
Q  200 tagacatgataggat 214  Q
    |||||| ||||||||    
T  14030764 tagacaggataggat 14030778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5258674 - 5258461
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5258674 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttttgcgatgagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggc 5258575  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5258574 aatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaacacgagagcaaagtaagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagact 5258475  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  5258474 agacaagataggat 5258461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 607917 - 608130
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  607917 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagacatgaccacttaaactgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 608016  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  608017 aatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagact 608116  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||| | ||||||||    
T  608117 agataggataggat 608130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5631576 - 5631779
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  5631576 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgac 5631675  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5631676 aatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagccaacgcgagagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagact 5631775  T
Q  201 agac 204  Q
    ||||    
T  5631776 agac 5631779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10100381 - 10100177
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10100381 ctgggtggttggaatggagaagagcctcatgtgttttgtgagataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccgac 10100282  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10100281 gatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaagagccaagacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagact 10100182  T
Q  201 agaca 205  Q
    |||||    
T  10100181 agaca 10100177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20428160 - 20427947
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||        
T  20428160 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaactaaa 20428061  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  20428060 aatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaagagccaacacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggaca 20427961  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  20427960 agacaggataggat 20427947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 28085197 - 28085347
Alignment:
Q  64 tgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagc 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   || ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  28085197 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 28085296  T
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085297 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 28085347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6056293 - 6056092
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  6056293 tgggtggttgaaatgtagaagagcttcaagtgttttatgcgataagaaaatatcatttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgaca 6056194  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||| | ||||||  |||||||| | | | ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6056193 atgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtagaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 6056094  T
Q  202 ga 203  Q
    ||    
T  6056093 ga 6056092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 30679233 - 30679396
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  30679233 tgggtggttgaaatagagaagaggctcaggtgttttgagcgataagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgacg 30679332  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcag 165  Q
    |||||||||||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  30679333 atgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacgagaatcaagtaagtgtagcag 30679396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 2689422 - 2689627
Alignment:
Q  9 ttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  2689422 ttgaaatggagaagtgcctcatgtattttgtgtgataagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtcagaccgtcgatgttgt 2689521  T
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| || |||| ||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| | | ||    
T  2689522 atggtacggagtgttgggcggttaacagccaacgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaatagga 2689621  T
Q  209 taggat 214  Q
    ||||||    
T  2689622 taggat 2689627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Original strand, 30031081 - 30031227
Alignment:
Q  68 aggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagag 167  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | | || |||||||| |||    
T  30031081 aggaaagttctatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggag 30031180  T
Q  168 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30031181 atgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat 30031227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33495955 - 33496139
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||             ||| ||||||||| ||    
T  33495955 ctggatggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagtttaaagga-------------caacagtcagacctgc 33496041  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |  ||||| |||| | | ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33496042 aatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgttgcattggatgaatggtaaga 33496139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35043857 - 35043752
Alignment:
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  35043857 atggtacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatga 35043758  T
Q  209 taggat 214  Q
    ||||||    
T  35043757 taggat 35043752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2065239 - 2065067
Alignment:
Q  42 gataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaac 141  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||||||  |||||||||||||  || | || ||| ||||||||||||||  | |||||| || ||||||| ||||    
T  2065239 gataagaaagtacatcttaagttgaaaggaaacttctatcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacggttaagagccaac 2065140  T
Q  142 acgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||| | | ||| ||||||| |||||||||||| | |  |||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2065139 acgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggat 2065067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 32755833 - 32755886
Alignment:
Q  157 gtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755833 gtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgata 32755886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9594078 - 9594023
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9594078 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggat 9594023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33998375 - 33998315
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  33998375 taagcgtagcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggat 33998315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4948678 - 4948625
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatg 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4948678 taagtgtagcggagattaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacatg 4948625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4955649 - 4955596
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatg 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4955649 taagtgtagcggagattaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacatg 4955596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28027248 - 28027147
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||||  ||||| |||| | | |||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28027248 atgttgtatggtatggagtgttgggaggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagacta 28027149  T
Q  202 ga 203  Q
    ||    
T  28027148 ga 28027147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568628
Alignment:
Q  171 aggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatag 9568628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 33083968 - 33084018
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33083968 gtaagcgtagcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactaga 33084018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24631227 - 24631132
Alignment:
Q  52 taccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgaga 147  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  24631227 taccacttaagttgaaatgaaagttatatcggacaacaatcaaacttgcaatgttgtatgctacagagggttgggtgattaagagccaaaacgaga 24631132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 211
Target Start/End: Original strand, 26291636 - 26291746
Alignment:
Q  100 caatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| || |  ||||| |||| ||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26291636 caatgttgtatggtacggagtgttaggcgttgaa-aaccaacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtc 26291734  T
Q  200 tagacatgatag 211  Q
    ||||| ||||||    
T  26291735 tagacttgatag 26291746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 206
Target Start/End: Original strand, 5080766 - 5080818
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 206  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  5080766 taagtgtagtggagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacat 5080818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6293734 - 6293698
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6293734 tagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaa 6293698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7150685 - 7150629
Alignment:
Q  158 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  7150685 tgtagcagagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggat 7150629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30202652 - 30202441
Alignment:
Q  3 gggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||      
T  30202652 gggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgt 30202553  T
Q  103 tgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202552 tgttgtgtggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 30202453  T
Q  203 acatgataggat 214  Q
    ||||||||||||    
T  30202452 acatgataggat 30202441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32083269 - 32083056
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |    
T  32083269 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttctatgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgac 32083170  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32083169 aatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagact 32083070  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| | ||||||    
T  32083069 agacagggtaggat 32083056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8391528 - 8391743
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8391528 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagaccggc 8391627  T
Q  101 aatgt--tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8391628 aatgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaaga 8391727  T
Q  199 ctagacatgataggat 214  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  8391728 ctacacaagataggat 8391743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9592493 - 9592705
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |     
T  9592493 tgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaatagtcagactgacg 9592592  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592593 ttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 9592692  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9592693 gacatgataggat 9592705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8671678 - 8671891
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8671678 ctgggtggttaaaatggagaagagactcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccggc 8671777  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671778 gttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 8671877  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  8671878 agacatgataggat 8671891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43240905 - 43240692
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  43240905 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 43240806  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240805 gttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 43240706  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  43240705 agacatgataggat 43240692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1210503 - 1210716
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||    
T  1210503 ctgggtggttgaaatgaagaagagcctgaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgaccggc 1210602  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210603 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 1210702  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  1210703 agacaggataggat 1210716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22089852 - 22090065
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  22089852 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgcaataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 22089951  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22089952 gttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagact 22090051  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  22090052 agacaggataggat 22090065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49347917 - 49347704
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||| ||||  |    
T  49347917 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgaccaac 49347818  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347817 cttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 49347718  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  49347717 agacaggataggat 49347704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51441288 - 51441076
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |    
T  51441288 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtttt-tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgac 51441190  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51441189 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagact 51441090  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  51441089 agacatgataggat 51441076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 696069 - 696240
Alignment:
Q  43 ataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaaca 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||    
T  696069 ataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaaca 696168  T
Q  143 cgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  696169 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggat 696240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 15085728 - 15085905
Alignment:
Q  37 tgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagag 136  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  15085728 tgtgcgataagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagag 15085827  T
Q  137 tcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15085828 ccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggat 15085905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 51601816 - 51602025
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51601816 ctgggtggtggaaatagagaagagtctcaggtgttttgttcgataagaaagtaccccttaagttgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgaccggc 51601915  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51601916 gttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagact 51602015  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||||||||    
T  51602016 agacatgata 51602025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34792768 - 34792660
Alignment:
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34792768 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagac 34792670  T
Q  205 atgataggat 214  Q
    ||||||||||    
T  34792669 atgataggat 34792660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9599917 - 9599715
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| |||| ||| || ||||| |||  ||||||| |||   ||||||||| ||     
T  9599917 tgggtggtttaaatggataagagcctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttcagttgaaatgaaaattctatcagaccgcagtcagaccagcg 9599818  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| || |||  |||||| | | | | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9599817 atgtggtatgatacaaagtgttgtgcggttgagaaccaacacaataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagacta 9599718  T
Q  202 gac 204  Q
    |||    
T  9599717 gac 9599715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19936280 - 19936482
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||||| |||| |||||  |||||||||  || |||||||||  ||| ||||| ||    
T  19936280 ctgggtggttgaaatggataagaacctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttagaccagc 19936379  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||| || |||| | ||||||||||| ||||||  ||||| |||| | |  ||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19936380 aatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagact 19936479  T
Q  201 aga 203  Q
    |||    
T  19936480 aga 19936482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34827621 - 34827423
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||  |||||  |||||||||  || ||| |||||| ||||||| |  | ||||    
T  34827621 tggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttatgtgataagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagatcaacgatgt 34827522  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||  |||||||| |   |  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34827521 tgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaacacgaaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagac 34827423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32231359 - 32231265
Alignment:
Q  120 tgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32231359 tgttgggcggttaagggtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggat 32231265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37463386 - 37463182
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaat 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||  ||||||||  ||   ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  37463386 ggtggttgatatggagaagagccttaggtgttaggtg--ataagaaagcactgattaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaat 37463289  T
Q  104 gttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||| |     ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37463288 gttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaagaat----caagtgtagaggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactaga 37463193  T
Q  204 catgataggat 214  Q
    || | ||||||    
T  37463192 caggttaggat 37463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Original strand, 26016295 - 26016404
Alignment:
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||| ||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26016295 aatgttttatgggacaaagtgttgggcggtaaagaaccaacaagaacataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagact 26016394  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||| ||||    
T  26016395 agacaggata 26016404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 39140310 - 39140466
Alignment:
Q  39 tgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtc 138  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||  ||||||  |    
T  39140310 tgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggcaaattctatcggacagcagtcagaccggtgatgttgtatggtacga-gtgttgggcagttaagaacc 39140408  T
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 196  Q
    | || || | | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39140409 atcatgaaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 39140466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46226801 - 46226603
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| || | ||||||| ||   |||||| |||||| ||  ||||||| |||||  |||| |  | | ||||    
T  46226801 tggttgaaatggagaagagcatcaagtgttttatgtgctaagaaagtagtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatagtgacgatgt 46226702  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||| || ||||| ||  |||| |  |||||||||| | | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46226701 tgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaaccaacacgagaatcaagtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtgagactagac 46226603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4001848 - 4001766
Alignment:
Q  130 ttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4001848 ttaagagtcaacacgagagtaaagtaagt--agcgaagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggat 4001766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18469503 - 18469395
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||  |||||||||| | | ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18469503 atgttgtatgatactaagtactgggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagacta 18469404  T
Q  202 gacatgata 210  Q
    |||||||||    
T  18469403 gacatgata 18469395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 9509229 - 9509285
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9509229 taagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggata 9509285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 3192071 - 3192133
Alignment:
Q  108 tatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatg 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  3192071 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3192133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 3200889 - 3200951
Alignment:
Q  108 tatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatg 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  3200889 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 3209726 - 3209788
Alignment:
Q  108 tatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatg 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  3209726 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3209788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52442875 - 52442819
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52442875 taagcgtagcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagata 52442819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 52831830 - 52831942
Alignment:
Q  15 tggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggta 114  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |  || ||||  |||||| ||  || |||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  52831830 tggagaagagcctcatgtgttttatgcgataagaaagtgtcatttaaattgaaagaaaaattgtatcggacgacagttagaccgacaatgttgtatgata 52831929  T
Q  115 caaagtgttgggc 127  Q
    | |||||||||||    
T  52831930 cgaagtgttgggc 52831942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 40419498 - 40419599
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| | | ||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  40419498 atgttgtacggaacagagtgttgggtggtaaagaaccaacacgaacataaagtaagtgtagcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaacta 40419597  T
Q  202 ga 203  Q
    ||    
T  40419598 ga 40419599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275177
Alignment:
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggat 17275177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Original strand, 4379922 - 4379965
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4379922 tagctgagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactaga 4379965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 6641045 - 6641092
Alignment:
Q  156 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6641045 agtgtagcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtatgactaga 6641092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38808107 - 38807996
Alignment:
Q  88 tagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggat 187  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    ||||||| | | ||||| || || || |||||||||||| |||||||    
T  38808107 tagtccgaccggcgatgttgtacggtacagagtgttgggaggttaagag----cacgagaattaagtaagcgtggcggatatgaggatgttgtgttggat 38808012  T
Q  188 gagtggtaagactagac 204  Q
     ||||||||||| ||||    
T  38808011 -agtggtaagaccagac 38807996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38877719 - 38877676
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgt 182  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38877719 aacacgagaataaaataagtgtagcagagatgaggatgttgcgt 38877676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 7814323 - 7814425
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||  | ||||||  |||||||||| ||| |||| ||| | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  7814323 atgttgtatggaacagaatgttggatggttaagaaccaacacgagaataaagtaattgttgtatagatgaggatgttacgttgaatgtgtgataagacta 7814422  T
Q  202 gac 204  Q
    |||    
T  7814423 gac 7814425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14226192 - 14226138
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14226192 tagcagatacgaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggat 14226138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32405050 - 32404851
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttg-tgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaa 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||  ||||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||| | ||      
T  32405050 ggtggttgaaatggatacgagcctcgggtgtttttatgcgatacgaaaggaccactcaagttgaagggaaaattctatcggacaattgtcagatcagcgt 32404951  T
Q  103 tgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatg-taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||    ||||||||||||  ||| |   ||||| ||| ||| |  |||  ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  32404950 tgttgtatgg----aagtgttgggcgggtaaaaacaaacacaagaataaagcaaagcatagcgaagatgaggatgttgcgttagatgcgtggtaagaata 32404855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 126
Target Start/End: Original strand, 7921777 - 7921810
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttggg 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7921777 agaccgacaatgttgtatggtacaaagtgttggg 7921810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10200534 - 10200486
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10200534 gtaagcgtagcggagatgaggatattgcgttagatgagttgtaagacta 10200486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27848115
Alignment:
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat 27848115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31960338 - 31960125
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  31960338 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcatatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 31960239  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960238 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 31960139  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  31960138 agacaggataggat 31960125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27450697 - 27450487
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  27450697 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagaccgac 27450598  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27450597 aatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagact 27450498  T
Q  201 agacatgatag 211  Q
    |||||||||||    
T  27450497 agacatgatag 27450487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23906825 - 23906612
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  23906825 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 23906726  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23906725 gttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagact 23906626  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  23906625 agacaagataggat 23906612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 435991 - 436200
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  435991 gtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttg 436090  T
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  436091 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagac 436190  T
Q  205 atgataggat 214  Q
    ||||||||||    
T  436191 atgataggat 436200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33226967 - 33227180
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  33226967 ctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtacgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 33227066  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33227067 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagact 33227166  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33227167 agacatgataggat 33227180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 53707552 - 53707764
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | || |||||||    
T  53707552 ctgggtggttgaaatggagaagagactcagatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggccagcattccgaccggc 53707651  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53707652 gttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagact 53707751  T
Q  201 agacatgatagga 213  Q
    |||||||||||||    
T  53707752 agacatgatagga 53707764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43433676 - 43433889
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  43433676 ctgggtgattgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtgtcacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatcagaccggc 43433775  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43433776 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagact 43433875  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  43433876 agacaagataggat 43433889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48174614 - 48174408
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  48174614 ggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgtt 48174515  T
Q  104 gttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| || | | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174514 gttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 48174415  T
Q  204 catgata 210  Q
    |||||||    
T  48174414 catgata 48174408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1777539 - 1777326
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  1777539 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccgac 1777440  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||| |||  |||||||   | ||||||||||||| || | | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777439 gttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 1777340  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  1777339 agacatgataggat 1777326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1211907 - 1211705
Alignment:
Q  8 gttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  1211907 gttgaaatggagaagagcctcaaatgttttgtatgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggtgatgttg 1211808  T
Q  108 tatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatg 207  Q
    | ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  1211807 tgtggtacagagtgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatg 1211708  T
Q  208 ata 210  Q
    |||    
T  1211707 ata 1211705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 50286729 - 50286942
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |    
T  50286729 ctgggtggttgaaatgaagaagagtcacatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagatcgac 50286828  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50286829 gttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagact 50286928  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  50286929 agacatgataggat 50286942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 56375048 - 56375257
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||    
T  56375048 ctgggtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaatttgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagaccagc 56375147  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      | |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375148 gttattgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaacaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 56375247  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||| ||||    
T  56375248 agacaagata 56375257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47265729 - 47265517
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaata---ccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagacc 97  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  47265729 ctgggtgattgaaatgaagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtagtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtcagacc 47265630  T
Q  98 ggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaag 197  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47265629 agcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagtcaacacgagaatcaagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaag 47265530  T
Q  198 actagacatgata 210  Q
    |||||||||||||    
T  47265529 actagacatgata 47265517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46583348 - 46583135
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  46583348 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtattttgtgcgataagaaagtatcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagatcggc 46583249  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  46583248 gctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagact 46583149  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    |||||  |||||||    
T  46583148 agacagcataggat 46583135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48623051 - 48622852
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  48623051 ctgggtggttgaaatggagaaaagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 48622952  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      | |||||||||              | ||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48622951 gttattgtatggt--------------ggttaggagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagact 48622866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 39708215 - 39708414
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatg-ttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccgg 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || || |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||     
T  39708215 ctggatggttgaaatggataagagccttaggtggttttttgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcaacagtccgatcga 39708314  T
Q  100 caatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39708315 caatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaggcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgcagatgaggatgttgcgttggatgagcagtaagac 39708414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52569988 - 52569826
Alignment:
Q  52 taccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||| |||| | |    
T  52569988 taccacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgagaatca 52569889  T
Q  152 tgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52569888 agtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggat 52569826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 12494625 - 12494721
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494625 agtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 12494721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 16002690 - 16002888
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| || ||| |||| ||||  ||| ||||| || |||    
T  16002690 gtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatg 16002789  T
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||||   ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16002790 ttgtat-gaacgaagtgttgggaggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagac 16002888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31458999
Alignment:
Q  90 gtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatga 189  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttga 31458974  T
Q  190 gtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31458975 gtggtaagactagacatgataggat 31458999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41009833 - 41009661
Alignment:
Q  42 gataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaac 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |  || ||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  41009833 gataagaaaataccacttaagttgggaaaaaagttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaac 41009734  T
Q  142 acgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    | |||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  41009733 atgagaatcaagtaagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggat 41009661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 214
Target Start/End: Original strand, 4440687 - 4440826
Alignment:
Q  74 gttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgagg 173  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||| |||   ||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  4440687 gttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtgttgg-cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattagg 4440785  T
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440786 atgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggat 4440826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45205159
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtg 45205181  T
Q  193 gtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  45205180 gtaagactagacgggataggat 45205159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33191255 - 33191159
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  33191255 agtgttgggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggat 33191159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 55578795 - 55578986
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaat 103  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |   |  | |||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  55578795 ggtggttaaaatggagaagatcttcagatgttttatgtgataaca---tgtcgcttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaat 55578891  T
Q  104 gttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| | |  ||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  55578892 gttgtatggtatgaagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaatcaattaagtgtagcatatatgaggatgttgtgttgaataagtggtaaga 55578986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39100949 - 39100844
Alignment:
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatga 208  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  39100949 atggtacagagtgttggacagttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatga 39100850  T
Q  209 taggat 214  Q
    ||||||    
T  39100849 taggat 39100844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 35690064 - 35690275
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||   | | |||||| || ||||||||| | ||  ||||| ||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||| |     
T  35690064 tgggtggttgaaatggagaagagtg-cgggtgttttatgtgataagaaagtgccgtttaagttgagaggaaaattctatcagacaacagttagaccgacg 35690162  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||||||||| ||   | ||||| | | ||||||  ||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35690163 atgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagtgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagacta 35690262  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||  ||||||||    
T  35690263 gacgagataggat 35690275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 27983077 - 27983171
Alignment:
Q  120 tgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27983077 tgttgagcggttaagagtcaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggat 27983171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Original strand, 11389555 - 11389681
Alignment:
Q  78 tatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgt 177  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11389555 tatcggacagttgtaagaccgacaatgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagagatgaggatgt 11389654  T
Q  178 tgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  11389655 tggattggatgtgtggtaaaactagac 11389681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 1793317 - 1793417
Alignment:
Q  100 caatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1793317 caatgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagac 1793416  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  1793417 t 1793417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 33709836 - 33709890
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33709836 tagcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggat 33709890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37773822 - 37773764
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37773822 gtaagtgtaggagagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatag 37773764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7092680 - 7092541
Alignment:
Q  64 tgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagc 163  Q
    |||||||||  ||||||  ||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||| || |||  ||||||  ||||||||||   | |||||||||||    
T  7092680 tgaaaggaaaattctattagacagcagttagatcggcgatgttgtatggtacggagttttaggcagttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagc 7092581  T
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  7092580 agagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctaga 7092541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40933283 - 40933210
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  40933283 caacacgagagtaaaataagtgtagcgtagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatag 40933210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 17900390 - 17900440
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17900390 gtaagcgtagcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 17900440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 54914708 - 54914591
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||  ||||||||  | ||      
T  54914708 gtggttgaaatggagaaaagctttgg-tgttttatgtgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaaattctatcggtcaggagtcagactagtaaca 54914610  T
Q  105 ttgtatggtacaaagtgtt 123  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  54914609 ttgtacggtacaaagtgtt 54914591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43070140 - 43070075
Alignment:
Q  149 taatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  43070140 taatttaagtgtagcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggat 43070075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 44860765 - 44860814
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44860765 taagtgtagcagaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactaga 44860814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 49987345 - 49987399
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  49987345 tagcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggat 49987399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20105857 - 20105792
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20105857 aacacaagaataatataaatgtagcggagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagac 20105792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967578
Alignment:
Q  169 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggat 25967578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Original strand, 28236095 - 28236156
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  28236095 gtaagtgtagcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggat 28236156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49739201 - 49739112
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatg 207  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49739201 agtgttgggcgataaagaaccaacaagagagtaaaataagcgtagtggaaatggggatgttgcgttagatgtgtggtaagactagacatg 49739112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2588941
Alignment:
Q  167 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 2588941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37797819
Alignment:
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgata 37797819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 25755237 - 25755284
Alignment:
Q  163 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25755237 cagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgata 25755284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470167
Alignment:
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 54470167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Original strand, 18966474 - 18966524
Alignment:
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  18966474 agagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggat 18966524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20602018 - 20601960
Alignment:
Q  153 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||    
T  20602018 gtaagtgtagcggatatgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatag 20601960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42293621 - 42293579
Alignment:
Q  162 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42293621 gcagagatggggatgttgtgttggatgcgtggtaagactagac 42293579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037835
Alignment:
Q  103 tgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgag 172  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatgag 26037835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27991786 - 27991737
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  27991786 taagtgtagcagaaatgaagatgttgtgttggatgtgtggtaagattaga 27991737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Original strand, 30853311 - 30853384
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||| |||  |||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30853311 caacacgagaataaaataagcgcagcggagatgaagatgttgtgttggatgtatggtaagactagacaagatag 30853384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21106952
Alignment:
Q  167 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatag 21106952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25257945 - 25257893
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25257945 gtagcaaagatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatag 25257893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36565765 - 36565552
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  36565765 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 36565666  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36565665 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagact 36565566  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  36565565 agacaggataggat 36565552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 39946615 - 39946828
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  39946615 ctggatggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaggccggc 39946714  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39946715 gatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 39946814  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  39946815 agacatgataggat 39946828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12492365 - 12492153
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||     
T  12492365 tgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagatgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccggcg 12492266  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492265 ttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 12492166  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||    
T  12492165 gacatgataggat 12492153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42854528 - 42854315
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |    
T  42854528 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagaccgac 42854429  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42854428 aatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagact 42854329  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    |||||  |||||||    
T  42854328 agacagaataggat 42854315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15215792 - 15215582
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  15215792 ggtggttgaaatggagaagagcctccagtgtcttgtgcggtaagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaat 15215693  T
Q  104 gttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  15215692 gttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactata 15215593  T
Q  204 catgataggat 214  Q
    || ||||||||    
T  15215592 caggataggat 15215582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 36544911 - 36545118
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||   ||| || ||| ||     
T  36544911 tgggtggttgaaatggataagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcgga---tag-ca-accagcg 36545005  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36545006 ttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagacta 36545105  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||||||||||||    
T  36545106 gacatgataggat 36545118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36395443 - 36395261
Alignment:
Q  35 tttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaag 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  36395443 tttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 36395344  T
Q  135 agtcaacacgagagtaatgtaag---tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||| |||| | | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36395343 agtcaacatgagaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggat 36395261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 18124939 - 18125146
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  18124939 tggttgaaatggagaaaaacctcaggtgttttatgtgataagaaagtaccactta-gttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccaacaatgt 18125037  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  18125038 tgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagaca 18125137  T
Q  206 tgataggat 214  Q
    |||||||||    
T  18125138 tgataggat 18125146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 25288662 - 25288862
Alignment:
Q  3 gggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||  ||||||| |    
T  25288662 gggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcga 25288761  T
Q  103 tgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactag 202  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25288762 tgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactag 25288861  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  25288862 a 25288862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 25300003 - 25300197
Alignment:
Q  9 ttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||  ||||||| |||||||    
T  25300003 ttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgt 25300102  T
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  25300103 atgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactaga 25300197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18752344 - 18752184
Alignment:
Q  54 ccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatg 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |    
T  18752344 ccacttaagctcaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaag 18752245  T
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18752244 taagtgtagcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggat 18752184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 37077527 - 37077736
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| | ||| | || ||||| |||||||||| | |||    
T  37077527 gtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgtgataagtaagtaccacttaagttgaaagggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatg 37077626  T
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
     ||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37077627 ctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagac 37077726  T
Q  205 atgataggat 214  Q
      ||||||||    
T  37077727 gagataggat 37077736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 2796326 - 2796528
Alignment:
Q  14 atggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggt 113  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |  |||| ||||||    
T  2796326 atggagaagagccttcggtgttctgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggt 2796425  T
Q  114 acaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac--tagacatgatag 211  Q
    ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2796426 accgagtcttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgatag 2796525  T
Q  212 gat 214  Q
    |||    
T  2796526 gat 2796528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4033017 - 4032907
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  4033017 tgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgaca 4032918  T
Q  102 atgttgtatggt 113  Q
    | ||||||||||    
T  4032917 a-gttgtatggt 4032907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8879953 - 8879751
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||  | ||||    
T  8879953 tggttgaaatagagaagaaccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgt 8879854  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||       |||||||||| | ||||| || ||| ||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||||| |||     
T  8879853 tgtatg------tgtgttgggcggtgaagagccagcacaagaatcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggact 8879760  T
Q  206 tgataggat 214  Q
     ||||||||    
T  8879759 agataggat 8879751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Original strand, 25439299 - 25439393
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  25439299 tggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagtcagaccggc 25439393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Original strand, 40813223 - 40813293
Alignment:
Q  144 gagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40813223 gagaataaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggat 40813293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Original strand, 29735623 - 29735767
Alignment:
Q  57 cttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaa 156  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | ||||||| | | |||| |  |||||||||| | |  |||    
T  29735623 cttaagttgaaatgaaaattctatcggacagtagtcagaacg---atgttgtatggtaaagagtgttgagtgattaaaaaccaacacgagaatgaaataa 29735719  T
Q  157 gtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    | ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29735720 gcgtagtggagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagac 29735767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30456580 - 30456537
Alignment:
Q  156 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30456580 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagac 30456537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39760794 - 39760736
Alignment:
Q  155 aagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatagga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  39760794 aagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagatagga 39760736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30783471 - 30783351
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 192  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||   |||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||    
T  30783471 agaccagcgatgttgtatggaacaaagtgttgggcgtg-aagaaccaacacgataatagaataagtgtagtggagatgaggatcttgcgttggatctgtg 30783373  T
Q  193 gtaagactagacatgataggat 214  Q
    | ||||||||| | ||||||||    
T  30783372 gcaagactagataggataggat 30783351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39953684 - 39953579
Alignment:
Q  105 ttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||   ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  39953684 ttgtatgggacagagtgttgagcggtaaagaaccaacacgaacataaagttagcgtagcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaac 39953585  T
Q  205 atgata 210  Q
    ||||||    
T  39953584 atgata 39953579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10824609 - 10824546
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  10824609 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgtgatacgaaaataccagttaagttgaa 10824546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 30748375 - 30748430
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  30748375 gtagcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggat 30748430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6510937 - 6510843
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttg-tgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccg 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||| || ||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  6510937 gtggttgaaatggagaagagtctcatgtggtttgatgtgataagaaagtactgcttaagttgaaaggaaagttctaacagacattagtcagaccg 6510843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9905309 - 9905223
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatg 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| |  |||||||||| ||| || ||| || | |||||||||||||||| |||||||    
T  9905309 atgttgtatggtacatagtgttggacggttaataaccaacacgagaataaagttagtataacggagatgaggatgttgcattggatg 9905223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 13984797 - 13984906
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    ||||| | |||||||  |||||| ||||||  || |||||  ||||||    
T  13984797 tggttgaaatgaagaagagcctcaagtgttttatgtgataagaaaatattgtttaagttaaaaggaaaattctattggacaaccgtaagaccaacaatgt 13984896  T
Q  106 tgtatggtac 115  Q
    ||||||||||    
T  13984897 tgtatggtac 13984906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 203
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520620
Alignment:
Q  166 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 29520620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45512919 - 45512818
Alignment:
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | || ||||  |||||||| | |||  ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45512919 atgttgtatggaacatagtgttggacattgaagaaccaacacgaaaataaaataagcatagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagacta 45512820  T
Q  202 ga 203  Q
    ||    
T  45512819 ga 45512818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42493675 - 42493631
Alignment:
Q  154 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42493675 taagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaaga 42493631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 43732483 - 43732527
Alignment:
Q  159 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43732483 gtagcagaaatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagactaga 43732527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 36143235 - 36143329
Alignment:
Q  109 atggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  36143235 atggaacagagtgttgggcggtgaagaaccaacacgagaataaaatcaacgtagcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactaga 36143329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 203
Target Start/End: Original strand, 45419161 - 45419199
Alignment:
Q  165 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45419161 gagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactaga 45419199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 211
Target Start/End: Original strand, 39051065 - 39051110
Alignment:
Q  166 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  39051065 agatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatag 39051110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12492911 - 12492702
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  12492911 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggc 12492812  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12492811 tttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagact 12492712  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||| ||||    
T  12492711 agacaggata 12492702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2075997 - 2075785
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||     
T  2075997 tgggtggttgaaatgaagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcg 2075898  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2075897 ttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagacta 2075798  T
Q  202 gacatgataggat 214  Q
    |||| ||||||||    
T  2075797 gacaagataggat 2075785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1275023 - 1275236
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  1275023 ctgggtggttgaaatgaagaagagcctaaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggc 1275122  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275123 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacgagtcaacatgagaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 1275222  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  1275223 agacatggtaggat 1275236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1288108 - 1287900
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| || ||||  |||    
T  1288108 tggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgatcggcgttgt 1288009  T
Q  106 tgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1288008 tgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 1287909  T
Q  206 tgataggat 214  Q
    |||||||||    
T  1287908 tgataggat 1287900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10639055 - 10639268
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| |    
T  10639055 ctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgaccgac 10639154  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639155 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 10639254  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    |||||  |||||||    
T  10639255 agacagaataggat 10639268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 3301607 - 3301815
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |    
T  3301607 ctgggtggttgaaatagagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagactgac 3301706  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||     || ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3301707 aatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagccaacacg-----aaagtaagtgtagcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagact 3301801  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  3301802 agacatgataggat 3301815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28977381 - 28977168
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || || |    
T  28977381 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaacgac 28977282  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  28977281 gttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaact 28977182  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  28977181 agaaatgataggat 28977168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 34272781 - 34272984
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| | ||| |     
T  34272781 tgggtggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtccggccgacg 34272880  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34272881 ttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagacta 34272980  T
Q  202 gaca 205  Q
    ||||    
T  34272981 gaca 34272984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20318749 - 20318944
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |  |||| |||||||    
T  20318749 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataag----taccacttaagttgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgaccggc 20318844  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20318845 gttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 20318944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16347868 - 16347698
Alignment:
Q  35 tttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaag 134  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  16347868 tttgtgcaataagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttgagcggttaag 16347769  T
Q  135 agtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347768 agccaacacgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 16347698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 24178283 - 24178481
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |     
T  24178283 tgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagaccgac- 24178381  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
      |||||           ||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178382 --gttgt-----------tgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 24178468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 36200541 - 36200740
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| |   ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||    
T  36200541 tgggtggttgaaatggagaagagactcatgtgttttatgtgataagaaaatgctgtttaagttgaaaggaaaattctaccggacaacagtcaaactggca 36200640  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||  ||||  |||| | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200641 atgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaagcgtatcagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagacta 36200740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 3394468 - 3394585
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaa---aggaaggttctatcggacaatagtcagacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  3394468 ctgggtggttgaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaggaaagttctatcggacagcagtcagacc 3394567  T
Q  98 ggcaatgttgtatggtac 115  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  3394568 ggcaatgttgtatagtac 3394585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 27653 - 27852
Alignment:
Q  2 tgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggca 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||   ||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | |     
T  27653 tgggtggtggaaatagagaagagtctcgagtgttttacgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaattctatctgacaatagtcggacagacg 27752  T
Q  102 atgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacta 201  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| |||| | | |||||  || | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  27753 atgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaacta 27852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Original strand, 16454606 - 16454679
Alignment:
Q  138 caacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16454606 caacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcattggatgtttggtaaaactagacatgatag 16454679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17340953 - 17340871
Alignment:
Q  44 taagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttggg 126  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17340953 taagagaataccgcttaagttgaaaagaaaattgtatcggacaatagtcagaccgacaatgttatatgatacaaagtgttggg 17340871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 21952222 - 21952312
Alignment:
Q  114 acaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21952222 acaaagtgttgggcgcttaagaaccaacacgaacttaaattaagtgtagaaaagatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagac 21952312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5848462 - 5848401
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5848462 aacatgagagtaaaataagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagact 5848401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  163 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16347924 - 16347879
Alignment:
Q  4 ggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16347924 ggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaa 16347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496344
Alignment:
Q  169 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 4496344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186979
Alignment:
Q  163 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggat 28186979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 203
Target Start/End: Original strand, 21093662 - 21093736
Alignment:
Q  129 tttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||||  |||||||||| |||  |||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21093662 tttaagaaccaacacgagaataaaataagtgtagtggatatgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactaga 21093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Original strand, 7678331 - 7678451
Alignment:
Q  93 agaccggcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 192  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||    
T  7678331 agaccagcgatgttgtatggaacggagtgttgggcgtg-aagaaccaacacgagaatagaacaagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtg 7678429  T
Q  193 gtaagactagacatgataggat 214  Q
    | ||||||||| | ||||||||    
T  7678430 gcaagactagataggataggat 7678451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  167 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 211
Target Start/End: Original strand, 5305512 - 5305584
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5305512 aacacgagaataaaataagaatagcaaagacggggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatag 5305584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Original strand, 16779444 - 16779508
Alignment:
Q  5 gtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaag 69  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||| | ||| ||||||    
T  16779444 gtggttgaaatggagaagagactcagatgttttatgtgatacgaaagtaccattcaagttgaaag 16779508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11002786 - 11002747
Alignment:
Q  160 tagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11002786 tagcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagac 11002747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 211
Target Start/End: Original strand, 11728984 - 11729059
Alignment:
Q  137 tcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgagga-tgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    |||||||||||||||  || |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  11728984 tcaacacgagagtaaaatacgaatagcagagatgaggaatgttgcgttagatgtatgataagactagacatgatag 11729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340759
Alignment:
Q  164 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactaga 17340759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15489834 - 15489792
Alignment:
Q  168 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 210  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15489834 atgaggatgctgcgttagatgtgtggtaagactagacatgata 15489792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516526
Alignment:
Q  165 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatag 211  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatag 32516526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26885000
Alignment:
Q  174 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggat 26885000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Original strand, 27553752 - 27553800
Alignment:
Q  155 aagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27553752 aagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgaatagtaagactaga 27553800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040008
Alignment:
Q  166 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggat 34040008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 31226 - 31435
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31226 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggc 31325  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31326 ggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 31425  T
Q  201 agacatgata 210  Q
    ||||| ||||    
T  31426 agacaggata 31435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44257 - 44193
Alignment:
Q  139 aacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 203  Q
    ||||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44257 aacacgagaataaaataagcgcagcggagatgaggatgttgcgttggatgtgcggtaagactaga 44193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2794 - 2594
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |    
T  2794 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagactgac 2695  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2694 gttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaacatgataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagact 2595  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  2594 a 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 82479 - 82692
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  82479 ctgggtggttgcaatgggaaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtactccttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgac 82578  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
     || |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  82579 gatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagact 82678  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  82679 agacatgataggat 82692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12122 - 11909
Alignment:
Q  1 ctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| |||     
T  12122 ctgggtcgttgaaatggagaagaacctcaagtgttttgtgcgataagaaagtacctcttaagttaaaaggaaagttttatcggtcagcaatcagaacgga 12023  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 200  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12022 gttgttgcatggtacaaaatgttgggcgggtaagagtcaacatgagaatcaagtatgtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagact 11923  T
Q  201 agacatgataggat 214  Q
    |||||| |||||||    
T  11922 agacataataggat 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25852 - 25756
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25852 agtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 25756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 29
Alignment:
Q  3 gggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaaggttctatc 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  107 gggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatc 29  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4679 - 4583
Alignment:
Q  118 agtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggat 214  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4679 agtgttggacggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggat 4583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 87128 - 86933
Alignment:
Q  6 tggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaaataccacttaagctgaaaggaag-----gttctatcggacaatagtcagaccggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||      | ||||| |||||  |||||||||  |    
T  87128 tggttgaaatggagaaaagcctcgggggttttatgcaataagaaagtatcacttaagttgaaaagaaaaaaaagctctattggacagcagtcagaccaac 87029  T
Q  101 aatgttgtatggtacaaagtgttgggcgtttaagagtcaacacgagagtaatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagac 199  Q
     || ||||||||||||  ||||||| || ||||||| | ||| |||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  87028 gattttgtatggtaca--gtgttgg-cggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagac 86933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1027 times since January 2019
Visitors: 4109