View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0638_high_11 (Length: 206)

Name: NF0638_high_11
Description: NF0638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0638_high_11
NF0638_high_11
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-198)||(29159662-29159859)
chr7 (6-190)||(20283956-20284140)
chr7 (6-191)||(33332496-33332681)
chr7 (6-191)||(4796713-4796901)
chr7 (1-191)||(9190049-9190238)
chr7 (1-191)||(49091528-49091717)
chr7 (6-191)||(23403059-23403244)
chr7 (6-191)||(2647742-2647928)
chr7 (6-191)||(46516356-46516542)
chr7 (43-191)||(9235638-9235788)
chr7 (1-191)||(2580254-2580446)
chr7 (8-191)||(9185213-9185393)
chr7 (6-191)||(35960680-35960867)
chr7 (10-191)||(21988772-21988955)
chr7 (1-190)||(21983149-21983340)
chr7 (10-191)||(47263546-47263725)
chr7 (6-191)||(55805-55998)
chr7 (20-191)||(2479205-2479374)
chr7 (1-171)||(44848725-44848896)
chr7 (1-191)||(18413509-18413695)
chr7 (1-191)||(18408632-18408819)
chr7 (1-172)||(21639695-21639864)
chr7 (1-128)||(5817311-5817438)
chr7 (1-121)||(28617266-28617386)
chr7 (54-115)||(22270143-22270204)
chr7 (1-172)||(21645893-21646062)
chr7 (9-86)||(30814560-30814637)
chr7 (9-76)||(27347941-27348009)
chr7 (9-76)||(48489555-48489623)
chr7 (9-69)||(41317417-41317478)
chr7 (9-76)||(4586285-4586353)
chr7 (9-76)||(14069809-14069877)
chr7 (9-76)||(14379837-14379905)
chr7 (9-76)||(31732945-31733013)
chr7 (9-76)||(41648987-41649055)
chr7 (9-76)||(47676112-47676180)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (6-191)||(10077211-10077396)
chr6 (6-191)||(31979379-31979564)
chr6 (4-191)||(18232711-18232898)
chr6 (4-191)||(5017513-5017703)
chr6 (26-191)||(22963565-22963731)
chr6 (26-191)||(23824662-23824828)
chr6 (1-191)||(31936454-31936643)
chr6 (1-191)||(5757519-5757707)
chr6 (56-191)||(21801445-21801581)
chr6 (1-191)||(4629828-4630010)
chr6 (1-191)||(31086514-31086693)
chr6 (1-191)||(21355904-21356092)
chr6 (101-191)||(5572737-5572827)
chr6 (1-193)||(22708883-22709074)
chr6 (6-101)||(5572287-5572382)
chr6 (6-193)||(24436017-24436199)
chr6 (142-191)||(26258181-26258230)
chr6 (9-76)||(9183007-9183075)
chr6 (98-153)||(31077079-31077134)
chr6 (9-76)||(16569146-16569214)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-189)||(34682375-34682563)
chr2 (1-191)||(10445485-10445676)
chr2 (1-191)||(8039926-8040116)
chr2 (4-191)||(20522086-20522273)
chr2 (1-191)||(31055908-31056100)
chr2 (6-191)||(33118002-33118187)
chr2 (4-191)||(33528665-33528852)
chr2 (13-191)||(16940262-16940440)
chr2 (13-191)||(17010927-17011105)
chr2 (4-191)||(17865069-17865256)
chr2 (6-179)||(39482808-39482982)
chr2 (8-191)||(34388725-34388907)
chr2 (1-191)||(21629816-21629999)
chr2 (1-191)||(23078511-23078703)
chr2 (1-191)||(13569194-13569384)
chr2 (6-191)||(14699053-14699229)
chr2 (1-191)||(8390191-8390384)
chr2 (14-191)||(36757816-36757992)
chr2 (1-191)||(42039710-42039900)
chr2 (1-190)||(10707293-10707483)
chr2 (1-172)||(28259218-28259389)
chr2 (8-157)||(2869741-2869892)
chr2 (1-191)||(3491619-3491806)
chr2 (38-161)||(35397408-35397530)
chr2 (1-191)||(25398361-25398551)
chr2 (1-191)||(40738707-40738898)
chr2 (1-191)||(25403499-25403689)
chr2 (94-191)||(40014794-40014890)
chr2 (1-74)||(1345582-1345657)
chr2 (9-76)||(38312364-38312432)
chr2 (9-74)||(36773686-36773752)
chr2 (85-138)||(28770899-28770952)
chr2 (9-76)||(723720-723788)
chr2 (9-76)||(34139746-34139814)
chr2 (9-75)||(17057346-17057413)
chr2 (9-75)||(17085329-17085396)
chr2 (84-154)||(39532835-39532906)
chr2 (10-74)||(11151569-11151634)
chr2 (6-54)||(2838076-2838124)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (8-191)||(775538-775721)
chr1 (6-191)||(47098870-47099054)
chr1 (1-191)||(19072792-19072984)
chr1 (1-191)||(19120682-19120874)
chr1 (1-191)||(47703977-47704168)
chr1 (1-191)||(27104413-27104599)
chr1 (6-190)||(47102887-47103070)
chr1 (6-191)||(13598262-13598449)
chr1 (6-191)||(29651676-29651862)
chr1 (6-191)||(16124562-16124748)
chr1 (1-190)||(9476130-9476317)
chr1 (1-189)||(32889307-32889495)
chr1 (78-191)||(40816850-40816964)
chr1 (1-190)||(26644938-26645127)
chr1 (1-191)||(3281574-3281764)
chr1 (1-191)||(21536610-21536800)
chr1 (1-191)||(37069634-37069826)
chr1 (84-189)||(9023956-9024059)
chr1 (1-124)||(13604664-13604788)
chr1 (56-157)||(50521199-50521299)
chr1 (1-191)||(19358884-19359076)
chr1 (1-191)||(19361473-19361666)
chr1 (1-191)||(19380113-19380306)
chr1 (1-172)||(24202810-24202979)
chr1 (64-128)||(17345623-17345687)
chr1 (9-76)||(37503533-37503601)
chr1 (9-76)||(3156989-3157057)
chr1 (9-76)||(28220202-28220270)
chr1 (98-186)||(22819296-22819388)
chr1 (9-74)||(28265532-28265598)
chr1 (85-147)||(48382607-48382669)
chr1 (1-58)||(1055040-1055096)
chr1 (32-76)||(30476422-30476467)
chr1 (9-76)||(834143-834211)
chr1 (9-76)||(28223397-28223465)
chr1 (9-76)||(44455284-44455352)
chr1 (9-76)||(49918474-49918542)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-191)||(26403271-26403461)
chr8 (1-191)||(9765860-9766051)
chr8 (6-176)||(4696642-4696812)
chr8 (1-191)||(19752435-19752624)
chr8 (6-190)||(5702529-5702713)
chr8 (1-191)||(6127085-6127277)
chr8 (6-189)||(23799623-23799807)
chr8 (1-172)||(19175795-19175965)
chr8 (1-191)||(4455894-4456084)
chr8 (1-191)||(31071270-31071459)
chr8 (1-191)||(26287769-26287957)
chr8 (1-191)||(26313020-26313208)
chr8 (29-157)||(6813583-6813711)
chr8 (1-128)||(7412269-7412397)
chr8 (1-172)||(1261995-1262163)
chr8 (81-191)||(5990681-5990790)
chr8 (9-76)||(4731782-4731850)
chr8 (9-76)||(15212910-15212978)
chr8 (84-138)||(28307481-28307535)
chr8 (9-76)||(4733830-4733898)
chr8 (1-191)||(26301014-26301214)
chr8 (9-76)||(33352274-33352342)
chr8 (9-76)||(43036547-43036615)
chr8 (109-159)||(7493210-7493261)
chr8 (84-118)||(9054961-9054995)
chr8 (1-57)||(18870603-18870658)
chr8 (9-76)||(27811402-27811470)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-191)||(17004001-17004190)
chr5 (6-189)||(42127456-42127638)
chr5 (6-191)||(19588612-19588797)
chr5 (6-191)||(24553552-24553737)
chr5 (6-191)||(28832126-28832310)
chr5 (1-191)||(31300637-31300826)
chr5 (1-191)||(14520095-14520286)
chr5 (1-191)||(3880169-3880355)
chr5 (53-189)||(11181925-11182063)
chr5 (1-191)||(15464399-15464588)
chr5 (1-191)||(11917013-11917206)
chr5 (1-191)||(9353373-9353561)
chr5 (1-160)||(12084216-12084376)
chr5 (1-191)||(36932391-36932580)
chr5 (1-124)||(6741784-6741908)
chr5 (1-136)||(33030981-33031118)
chr5 (1-191)||(38192039-38192229)
chr5 (1-191)||(38219264-38219454)
chr5 (32-121)||(28278463-28278553)
chr5 (43-121)||(38747163-38747241)
chr5 (1-172)||(35387549-35387718)
chr5 (84-157)||(2630127-2630204)
chr5 (1-85)||(10281722-10281807)
chr5 (9-76)||(28750631-28750699)
chr5 (9-76)||(5887410-5887478)
chr5 (9-76)||(19806487-19806555)
chr5 (9-76)||(32636948-32637016)
chr5 (84-161)||(34842499-34842577)
chr5 (9-69)||(8565930-8565990)
chr5 (9-76)||(30682899-30682966)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (7-191)||(25862069-25862253)
chr4 (6-190)||(39245860-39246045)
chr4 (6-191)||(10047245-10047430)
chr4 (1-191)||(3796560-3796752)
chr4 (8-191)||(42599622-42599808)
chr4 (26-191)||(54867048-54867215)
chr4 (1-190)||(38152480-38152670)
chr4 (1-191)||(5143125-5143315)
chr4 (1-191)||(5147543-5147733)
chr4 (6-191)||(5269237-5269425)
chr4 (1-191)||(24333677-24333865)
chr4 (20-191)||(3777416-3777586)
chr4 (9-191)||(16630729-16630911)
chr4 (1-191)||(5396712-5396905)
chr4 (6-191)||(6743461-6743651)
chr4 (1-115)||(36315270-36315384)
chr4 (1-115)||(36329479-36329593)
chr4 (1-191)||(31985675-31985863)
chr4 (10-172)||(8689533-8689695)
chr4 (1-191)||(28468570-28468757)
chr4 (95-191)||(16624144-16624240)
chr4 (84-184)||(18377244-18377345)
chr4 (6-161)||(34495869-34496024)
chr4 (1-92)||(16623334-16623426)
chr4 (98-183)||(1983436-1983522)
chr4 (9-76)||(12739526-12739594)
chr4 (9-76)||(26175612-26175680)
chr4 (9-76)||(34570390-34570458)
chr4 (136-191)||(36315386-36315443)
chr4 (136-191)||(36329595-36329652)
chr4 (84-138)||(37781782-37781836)
chr4 (78-115)||(21688441-21688478)
chr4 (9-76)||(12743901-12743969)
chr4 (9-76)||(12745290-12745358)
chr4 (9-74)||(9927436-9927502)
chr4 (9-74)||(48893616-48893682)
chr4 (140-169)||(7816396-7816425)
chr4 (9-76)||(5429803-5429871)
chr4 (1-57)||(45357325-45357380)
chr4 (9-76)||(54199883-54199950)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (1-191)||(3716033-3716223)
chr3 (6-191)||(1417526-1417710)
chr3 (6-191)||(26298848-26299039)
chr3 (8-191)||(40592820-40593004)
chr3 (6-191)||(48438080-48438265)
chr3 (6-190)||(40844519-40844702)
chr3 (6-172)||(3328392-3328558)
chr3 (1-191)||(6794744-6794933)
chr3 (1-191)||(8370517-8370708)
chr3 (1-178)||(21711102-21711279)
chr3 (4-191)||(24695198-24695384)
chr3 (6-191)||(30709826-30710012)
chr3 (8-191)||(37466157-37466340)
chr3 (1-190)||(16264216-16264406)
chr3 (6-146)||(18552919-18553059)
chr3 (1-191)||(39040023-39040212)
chr3 (1-191)||(33386697-33386887)
chr3 (1-190)||(36028972-36029149)
chr3 (78-191)||(8126567-8126680)
chr3 (1-191)||(27974983-27975170)
chr3 (1-191)||(27986477-27986665)
chr3 (1-191)||(32143189-32143377)
chr3 (21-187)||(35925352-35925519)
chr3 (1-135)||(25795702-25795837)
chr3 (6-112)||(1736341-1736447)
chr3 (78-186)||(27026816-27026923)
chr3 (78-186)||(27038161-27038268)
chr3 (90-191)||(1417132-1417232)
chr3 (105-191)||(47924007-47924090)
chr3 (1-190)||(1305818-1306004)
chr3 (1-157)||(4386958-4387115)
chr3 (1-127)||(26928632-26928757)
chr3 (43-191)||(1309722-1309868)
chr3 (1-101)||(27452914-27453014)
chr3 (84-159)||(25929556-25929633)
chr3 (32-121)||(34491359-34491449)
chr3 (143-191)||(47649607-47649655)
chr3 (6-70)||(47923942-47924006)
chr3 (1-162)||(8477258-8477418)
chr3 (9-76)||(29813187-29813255)
chr3 (9-76)||(51398938-51399006)
chr3 (9-69)||(23410312-23410373)
chr3 (9-76)||(29810992-29811060)
chr3 (9-76)||(40734622-40734690)
chr3 (9-76)||(40735507-40735575)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (6-191)||(2358-2543)
scaffold0006 (6-191)||(5547-5734)
scaffold0006 (1-124)||(133321-133445)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-190)||(10595-10785)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (4-191)||(17132-17316)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (1-191)||(44002-44190)
scaffold0087 (6-191)||(36878-37063)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (7-191)||(85551-85733)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (1-191)||(8460-8650)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-190)||(45122-45309)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (1-191)||(17993-18182)
scaffold0188 (1-191)||(24086-24275)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (135-191)||(1274-1330)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (9-76)||(20391-20459)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (94-157)||(29616-29678)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (94-157)||(43166-43228)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29159859 - 29159662
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29159859 agagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgcttt 29159760  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccctatgct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29159759 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccctttgct 29159662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20284140 - 20283956
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20284140 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcatttcttatctttattgctttgatta 20284041  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20284040 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagacactttatccattgattatcacttc 20283956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 33332496 - 33332681
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33332496 tgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgatttgatta 33332595  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33332596 tgcttatggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgtttggatacactttatctattgattaccacttcc 33332681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 4796713 - 4796901
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796713 tgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttggtgtgtttgttcctttctctcattgcttatctttattgctttgatta 4796812  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg---tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4796813 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagaaactttatctattgattaccacttcc 4796901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 9190049 - 9190238
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9190049 agagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgcttt 9190148  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9190149 gtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 9190238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49091717 - 49091528
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||    
T  49091717 agagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttggtgcgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gcttt 49091619  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091618 gattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 49091528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 23403059 - 23403244
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23403059 tgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaatcttagtgtgtttgttcctttctttcattgcttatatttattgctttgatta 23403158  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  23403159 tgcttgtggtgttgctctacacttacatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggaaacactttatccattgattatcacttcc 23403244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 2647742 - 2647928
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2647742 tgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttgatgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 2647841  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  2647842 tgcttgtggtgttgctctaaacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagatattttatctattgattaccatttcc 2647928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 46516356 - 46516542
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  46516356 tgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctctattgctttgatta 46516455  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516456 tgcttttggtgttgctttacacttagatttaagtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattaccacttcc 46516542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Original strand, 9235638 - 9235788
Alignment:
Q  43 tgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9235638 tgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacatttagatttaggtctg 9235737  T
Q  143 --tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9235738 tttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 9235788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2580446 - 2580254
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctc---tctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  2580446 agagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctcttttttcattgcttatctttattgc 2580347  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2580346 tttggttatacttgtggtgtatctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattaccacttcc 2580254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 9185213 - 9185393
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9185213 ctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgt--ttgttcctctctttcattgcttatctttattgctttgtttatg 9185310  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9185311 cttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 9185393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35960867 - 35960680
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  35960867 tgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttcattaatttcttatctttattgctttattta 35960768  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt--ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35960767 tgctggtggtgtttctctacacttagatttaggcctgttttgttgttgttgttgcttggaaacactttatctattgattaccacttcc 35960680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21988955 - 21988772
Alignment:
Q  10 ctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgctttgattatgc 108  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21988955 ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatctttattgctttgattatgt 21988856  T
Q  109 ttgtggtgttgctctacacttagatttaggcct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  21988855 ttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggtgacactttacacattgattaccacttcc 21988772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21983340 - 21983149
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| | || || |||||||||| ||||||||    
T  21983340 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgcatttgttccttttctttcgttgcttatctctattgctt 21983241  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  21983240 tgattatgtttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggagatactttacacattgattaccacttc 21983149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47263725 - 47263546
Alignment:
Q  10 ctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47263725 ctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tatttcattgcttatctttatt-ctttgtttatg 47263628  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47263627 cttgtggtgttgctctacact-agact-aggtctatttttgtttttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 47263546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 55998 - 55805
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctc-attgcttatctttattgctttgatt 104  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| | |||||||||    
T  55998 tgctctctccccag-attaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcctttccttccattgcttatctttgt-gctttgatt 55901  T
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgt---------ttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||         |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  55900 atgcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttttttattttattgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 55805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2479374 - 2479205
Alignment:
Q  20 gattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgt 117  Q
    ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  2479374 gattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgcttgtggtgt 2479277  T
Q  118 tgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2479276 tgctctacact-agact-aggtctgtttttgttgttgttgcttagagacactttacacattgattaccacttcc 2479205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 44848725 - 44848896
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  44848725 agagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtatgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 44848822  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg---tttttgttgttgttgcttggagacacttt 171  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44848823 ttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagacacttt 44848896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18413695 - 18413509
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||| | |||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||  |||||    
T  18413695 agagctgctctctccccag-attaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttctt-tctttc-ttgcttatcttggttgct 18413600  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  18413599 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 18413509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18408819 - 18408632
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||  |||||    
T  18408819 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttctt-tctttc-ttgcttatcttgtttgct 18408723  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | || ||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||    
T  18408722 ttgtatttgtttgtggtgttgctctacac-taga-ctacggctgtttttgttgttgttgcgtggagacactttacacatagattaccacttcc 18408632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21639864 - 21639695
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  21639864 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 21639768  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639767 tttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 21639695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5817311 - 5817438
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| |||||||||||| | | || ||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |    
T  5817311 agagctgctctctccccag-agtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctttggtgtgtttgttcctttcttacattgcttatcattattgtgt 5817409  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacact 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5817410 tgattatgcttgtggtgttgttctacact 5817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 28617266 - 28617386
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttg-ttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||  || || |||||||||||| ||||||    
T  28617266 agagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgttttcttcctttc-ttgcttatctttgttgctt 28617364  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgct 121  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  28617365 tgaatatgcttgtggtgttgct 28617386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 22270143 - 22270204
Alignment:
Q  54 tcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggt 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22270143 tcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctttattgctttgattatgattgtggt 22270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21646062 - 21645893
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| |||||||| |||  ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  |||     
T  21646062 agagctgctctcttccctagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgt 21645966  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645965 tttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 21645893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814637
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgctt 86  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcctttctttcattgctt 30814637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27348009
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 27348009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489623
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 48489623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317417
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 41317417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 4586285 - 4586353
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttg-gtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4586285 tctctcccccatattatgtcaacttggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgtttgttcctctct 4586353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069809
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||  ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctct 14069809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379837
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||  ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctct 14379837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732945
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgagtttgttcctctct 31732945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41648987
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 41648987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 47676180 - 47676112
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47676180 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 47676112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 10077211 - 10077396
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10077211 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 10077310  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10077311 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 10077396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31979564 - 31979379
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979564 tgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctatttcattgcttatctttattgctttgatta 31979465  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979464 tgcttgtgatgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccacttcc 31979379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18232898 - 18232711
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18232898 gttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcatcgcttatctttattgctttgat 18232799  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18232798 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 18232711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 5017513 - 5017703
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5017513 gttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttt-gtgctttgat 5017611  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5017612 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttttttttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 5017703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22963731 - 22963565
Alignment:
Q  26 gtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctac 125  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963731 gtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcatagcttatctctattgctttgattatgcttgtggtgttgctctac 22963632  T
Q  126 acttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22963631 acttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattaccacttcc 22963565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 23824662 - 23824828
Alignment:
Q  26 gtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctac 125  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23824662 gtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcatagcttatctctattgctttgattatgcttgtggtgttgctctac 23824761  T
Q  126 acttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23824762 acttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattaccacttcc 23824828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31936643 - 31936454
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||| ||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31936643 agagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctatctttcattgcttatctttattgcttt 31936544  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  31936543 gtttatgcttgtggtgttgctctacactttgattaaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 31936454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 5757519 - 5757707
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  5757519 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 5757616  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5757617 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-agatt-aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 5757707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Original strand, 21801445 - 21801581
Alignment:
Q  56 ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21801445 ttggtgtgtttgttcctttctttcattacttatctttattgctttgattatgattgtggtattgttctacacttagatttaggtctgatttttgttgttg 21801544  T
Q  155 ttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21801545 ttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 21801581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4630010 - 4629828
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttgg-tgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630010 agagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctttgatgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctt 4629911  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4629910 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgt---------ttggagacattttatctattgattaccacttcc 4629828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31086514 - 31086693
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||    
T  31086514 agagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gcttt 31086612  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |          || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31086613 g----------tgatgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 31086693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21356092 - 21355904
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||    
T  21356092 agagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 21355995  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21355994 ttgtatatgcttgtggtgttgctctacact-agact-aggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattaccacttcc 21355904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 5572737 - 5572827
Alignment:
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572737 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgctgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 5572827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22709074 - 22708883
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| | |||||||||| ||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  22709074 agagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaattttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatctttattgct 22708977  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccct 193  Q
    |||  ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
T  22708976 ttggatacacttgtggtgttgctctaca-ttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactcccct 22708883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Original strand, 5572287 - 5572382
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttg 101  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5572287 tgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttctttcactgcttatatttattgctttg 5572382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Original strand, 24436017 - 24436199
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctca-ttgcttatctttattgctttgatt 104  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||  ||| |||   || ||||||||| |||||||| ||    
T  24436017 tgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggttacca-tcttggtgtgtttgttt-tctttcttgctttcttatctttgttgctttgttt 24436114  T
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccct 193  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||   | || || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24436115 atgcttgttgtgt--ctctacacttagatttag--atcttatttttgttgttgtttgtagacactttatctattgattaccatttccct 24436199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 26258181 - 26258230
Alignment:
Q  142 gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  26258181 gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattggttaccacttcc 26258230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9183075 - 9183007
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9183075 tctctcctccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctct 9183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Original strand, 31077079 - 31077134
Alignment:
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgtt 153  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  31077079 tttgattatgcttatgatgttgttctacacttagatttaagtctatttttgttgtt 31077134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569214
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||| || ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 16569214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 34682375 - 34682563
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  34682375 agagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatatttatttgttt 34682474  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34682475 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 34682563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 10445485 - 10445676
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10445485 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgcttt 10445584  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10445585 gattatgcttgtggttttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 10445676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8040116 - 8039926
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8040116 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttgatgtattttttcctctccttcattgcttatctttattgcttt 8040017  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040016 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccacttcc 8039926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20522273 - 20522086
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20522273 gttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcatttcttatctttattgctttgat 20522174  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20522173 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctttttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 20522086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31056100 - 31055908
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  31056100 agagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatctttattgct 31056001  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31056000 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 31055908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33118187 - 33118002
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33118187 tgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattactttgatta 33118088  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33118087 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgatgtttgaagacactttatctattgattaccacttcc 33118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 33528665 - 33528852
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33528665 gttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctttattgctttgat 33528764  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33528765 tatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggggacactttatccattgattaccacttcc 33528852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 16940262 - 16940440
Alignment:
Q  13 tcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16940262 tcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgattatgctttt 16940361  T
Q  113 ggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16940362 ggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacactttattcattgattaccacttcc 16940440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 17010927 - 17011105
Alignment:
Q  13 tcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17010927 tcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgattatgctttt 17011026  T
Q  113 ggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17011027 ggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacactttattcattgattaccacttcc 17011105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17865256 - 17865069
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17865256 gttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttggtgtgattgttcctttctttcattgattatctttattgctttgat 17865157  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17865156 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgtttttgttgttgttggttggagacattttatccattgattaccacttcc 17865069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39482982 - 39482808
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39482982 tgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgtttatctttattgctttggtta 39482883  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattg 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39482882 tgcttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattg 39482808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34388907 - 34388725
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  34388907 ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcctttctttctttgtttatctttgt-gctttgattttg 34388809  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34388808 cttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacatattgattaccacttcc 34388725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21629999 - 21629816
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21629999 agagctgctctctccccag-attaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgcttt 21629901  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    || |     ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21629900 gaat-----tgtggtgctgctctacacttagatctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 21629816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 23078511 - 23078703
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||    
T  23078511 agagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattcttttggtgtgtttgttccattctttcattgcttatctttgt-gct 23078609  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23078610 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 23078703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13569384 - 13569194
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  13569384 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttattcctttctttcattgattatcttt-gtgcttt 13569286  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13569285 gattatgcttgtggtgtttctctatacttagatctaagcctgttttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattaccacttcc 13569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 14699053 - 14699229
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||             |||||||||    
T  14699053 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattg-------------ctttgatta 14699139  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14699140 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgctttttgttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 14699229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8390191 - 8390384
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  8390191 agagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcatttctttcatcgcttatcttt-gtgcttt 8390289  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8390290 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctggtttttgttgttgttgttgtttggatacactttatccattgattaccacttcc 8390384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 36757816 - 36757992
Alignment:
Q  14 cccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  36757816 cccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gctttgtttatgcttg 36757914  T
Q  112 tggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  36757915 tggtgttgctctacactaag-tctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 36757992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 42039710 - 42039900
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  42039710 agagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttttggtgtgcttgctcctttctttcattgcttatctttgt-gct 42039808  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42039809 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacactta-atctaggtatgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 42039900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 10707293 - 10707483
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||  ||||||    
T  10707293 agagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttattcatttctttctttgcttatcttt-gtgcttt 10707391  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt--ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  10707392 gattatgcttgcagtgttgctctacacttagatctaggtatattttcttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttc 10707483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 28259218 - 28259389
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||    
T  28259218 agagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 28259315  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg--tttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28259316 ttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttttgttattgttgcttggagacacttta 28259389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 2869741 - 2869892
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc-ctctctctcattgcttatctttattgctttgattat 106  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||  || |  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  2869741 ctctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgttctcttcctttatttgcttatctttgttgctttgaatat 2869840  T
Q  107 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttg 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  2869841 gcttatggtgttgctctacacttagatttaggtctatttgttgttgttgttg 2869892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3491806 - 3491619
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||    
T  3491806 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgct 3491710  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  3491709 ttctatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 3491619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35397530 - 35397408
Alignment:
Q  38 cgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttag 137  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35397530 cgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgtttccttctttcattgcttatattgattgctttgattatgcttgtggttttgctctgcacatagatttag 35397431  T
Q  138 gcctgtttttgttgttgttgcttg 161  Q
    |  |  ||||||||||||||||||    
T  35397430 gtat-attttgttgttgttgcttg 35397408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25398551 - 25398361
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  25398551 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 25398455  T
Q  98 tttg-attatgct-tgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| |  | ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  25398454 tttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 25398361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40738898 - 40738707
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||    
T  40738898 agagctgctctc-cccccagattaggtcatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-tagcttatctttattgct 40738803  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacact----tagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    ||||| | ||  | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40738802 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagatct-ggttttttgttgttgttgttgcttggagacactttacatatagattaccacttcc 40738707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25403689 - 25403499
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  25403689 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggct-gaactgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 25403593  T
Q  98 tttg-attatgct-tgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| |  | ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  25403592 tttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 25403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40014890 - 40014794
Alignment:
Q  94 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||||||    
T  40014890 ttgctttgattatgcttgtggtgatgttttacacttagttttaggactgtttgttgttgttgttgcttgaggacactt--tccattgattactacttcc 40014794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 1345582 - 1345657
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaa--tcttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  1345582 agaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtttctct 1345657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312432
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctct 38312432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773752
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctct 36773752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Original strand, 28770899 - 28770952
Alignment:
Q  85 ttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttagg 138  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  28770899 ttatattttttgctttgattatgcttgtggtgttgcttcacacttagatctagg 28770952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723720
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 723720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139746
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 34139746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057346
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctc 75  Q
    |||||||||| || || ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 17057346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085329
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctc 75  Q
    |||||||||| || || ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctc 17085329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39532906 - 39532835
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttg 154  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  39532906 cttatctttattgcttaggttatgtttgtggtgttgcttcgcacttagatttaggtctatttattgttgttg 39532835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151569
Alignment:
Q  10 ctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctct 11151569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838124
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaat 54  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 775721 - 775538
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  775721 ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttgatgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgattatg 775622  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  775621 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattggttaccacttcc 775538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 47098870 - 47099054
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47098870 tgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttgattgcttatctttattgctttgatta 47098969  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098970 tacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttacttggagacactttatctattgattaccacttcc 47099054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19072984 - 19072792
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19072984 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgttt 19072885  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19072884 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattactacttcc 19072792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19120874 - 19120682
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19120874 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgttt 19120775  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19120774 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattactacttcc 19120682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 47703977 - 47704168
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47703977 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttttttcctttctttcattgcttatctttattgcttt 47704076  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47704077 gattaaacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctattttttgttgttgctgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 47704168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27104413 - 27104599
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  27104413 agagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttatttcattgcttatctttattgcttt 27104512  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104513 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtt----ttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 27104599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 47102887 - 47103070
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47102887 tgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcctttctttgattgcttatctttattgctttgatta 47102986  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102987 tacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgctttgagacactttatctattgattaccacttc 47103070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13598449 - 13598262
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598449 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 13598350  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgtt---gttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13598349 tgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacac-ttaactattgattaccacttcc 13598262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29651862 - 29651676
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29651862 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 29651763  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29651762 tgcttgtggtgttgctctacacttagatctaagtctgttttttgttgttgttgattatagacactttattcattgattaccacttcc 29651676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 16124562 - 16124748
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgctttgatt 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16124562 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgctttgatt 16124661  T
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  16124662 atgtttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggacacattttattcattgattaccacttcc 16124748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9476317 - 9476130
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  9476317 agagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatcttttttgcttt 9476218  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  9476217 gattatgcttgtgatgtt-ttctacacttatatttatgtctg-ttttgttattgttgcttggagacactttatccattaattactacttc 9476130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32889495 - 32889307
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctct-cattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| |||||| |||||| || || ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  32889495 agagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttggtgtgtttgttcctctcttttcattgcttatctttattgctt 32889396  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  32889395 tggttatacttgtggtgttgctctacacttagatttagatctg-ttttgttgttattgcttggagacactttacacattgattatcactt 32889307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Original strand, 40816850 - 40816964
Alignment:
Q  78 tcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatcta 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40816850 tcattacttatctttattgctttgattatgctcgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatcta 40816949  T
Q  177 ttgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||    
T  40816950 ttgattaccacttcc 40816964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 26644938 - 26645127
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  26644938 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttt-gtgct 26645036  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||    
T  26645037 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctgcttttgttgttgttgcttaaagacactttacacattgattaccacttc 26645127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3281764 - 3281574
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  3281764 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttttgatgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttt-gtgct 3281666  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||  || | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3281665 ttgtttattcttgtggtgttgctctacacaaag-tctatgtctttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 3281574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 21536610 - 21536800
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||    
T  21536610 agagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcatcgcttatctttgt-gct 21536708  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | || | |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21536709 ttgtctatgcttgtggtgttgctctacagtaag-tctaggtctatttttgttgttgttgattggagacactttacacattgattaccacttcc 21536800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37069826 - 37069634
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  ||||    
T  37069826 agagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttatttcgttgcttatcttt-gtgct 37069728  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg--tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||  | || | |||  ||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37069727 ttgtttatgcttgtggtgttgctctaca-ttaagtctaagtctgtttttttttttttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 37069634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 189
Target Start/End: Original strand, 9023956 - 9024059
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatta 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  9023956 cttatctttattgcattgattatgcttgtggtgttgctatacacttagatttagg--tatgtttgttgttattgcttggggctactttatccattgatta 9024053  T
Q  184 ccactt 189  Q
    ||||||    
T  9024054 ccactt 9024059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13604664 - 13604788
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||| | | || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  13604664 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattacttatctttattgct 13604762  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctcta 124  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||    
T  13604763 ttgtatatgcttgtgatgttgctcta 13604788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 50521199 - 50521299
Alignment:
Q  56 ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||| ||  ||||||||||||    
T  50521199 ttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttctctttattgctttgattatgtttgtggtgttgttctacactaggacttaggtct-attttgttgttgt 50521297  T
Q  156 tg 157  Q
    ||    
T  50521298 tg 50521299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19358884 - 19359076
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||    
T  19358884 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgact-gaactgggtcaacaatcttttgatgtgtttgttcttccttttc-ttgcttatcttggttgct 19358981  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  19358982 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtatttttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 19359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19361473 - 19361666
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||    
T  19361473 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgact-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttccttttc-ttgcttatcttggttgct 19361570  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||     ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  19361571 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 19361666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19380113 - 19380306
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||    
T  19380113 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgact-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttccttttc-ttgcttatcttggttgct 19380210  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-----tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||     ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  19380211 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 19380306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 24202810 - 24202979
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  24202810 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 24202906  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttg-ttgcttggagacacttta 172  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24202907 tttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-tag-tttagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagacacttta 24202979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 17345623 - 17345687
Alignment:
Q  64 tttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacact 128  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17345623 tttgttcatttctttcattgcttatctttatggctttgattatgcttatggtgttgttctacact 17345687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 37503601 - 37503533
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37503601 tctctcccccagattatgtcaagttggatcgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 37503533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157057
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 3157057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220202
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctct 28220202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22819388 - 22819296
Alignment:
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt----ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 186  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||| | ||||||    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  22819388 tttgattatgcttgtggtgatgttttacatttagttttaagactgtttgttgttgttgttgttgcttaaggacactttatccattgattacca 22819296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265532
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctct 28265532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 48382607 - 48382669
Alignment:
Q  85 ttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttttt 147  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || |||||    
T  48382607 ttatctttgttgctttaattatgtttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtctattttt 48382669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 1055040 - 1055096
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttg 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  1055040 agagttgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 1055096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30476467 - 30476422
Alignment:
Q  32 ttggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30476467 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 30476422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834143
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| || || ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 834143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223397
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctct 28223397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 44455284 - 44455352
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  || || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44455284 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacgatctttggtgtgtttgttcctctct 44455352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 49918474 - 49918542
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 49918542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26403271 - 26403461
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  26403271 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctcgttttcattgcttatctttattgcttt 26403370  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26403371 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttattgcttggagacacattatctattgattaccacttcc 26403461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 9765860 - 9766051
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9765860 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgtttgttcccttctttcattgcttatctttattgctt 9765959  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9765960 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattatcacttcc 9766051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 4696642 - 4696812
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696642 tgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgatta 4696741  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatcta 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696742 tgtttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatcta 4696812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19752435 - 19752624
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  19752435 agagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattacttatctctattgcttt 19752534  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19752535 gattatgcttgtggtgttgcactacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttatatattgattaccacttcc 19752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 5702529 - 5702713
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5702529 tgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttccttcatagcttatctctattgctttaatta 5702628  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5702629 tgcttgtggtgatgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctaggagacactttattcattgattaccacttc 5702713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6127277 - 6127085
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttgg-tgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6127277 agagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatatttgatgtgtttgttcatctctttcattgcttatctttagtgctt 6127178  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6127177 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatttatatctgttttttgttgttgttgcttggagacacttaatctattgattaccacttcc 6127085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 23799623 - 23799807
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23799623 tgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctctattgctttgatta 23799722  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    || |||||||  | |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23799723 tgtttgtggtacttctctacacttagatctaggtctattttttgttgttgtttcttggagacactttatctattgattaacactt 23799807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 19175795 - 19175965
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  19175795 agagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttt-gtgct 19175893  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19175894 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctg-ctttgttgttgttgcttggagacacttta 19175965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4456084 - 4455894
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  4456084 agagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gct 4455986  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4455985 ttgtttatgcttgttgtgttgctctacactaag-tccaggtctgtttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 4455894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31071270 - 31071459
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  31071270 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgc 31071367  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  31071368 tttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 31071459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26287957 - 26287769
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  26287957 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgc 26287861  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  26287860 tttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 26287769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26313208 - 26313020
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  26313208 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgc 26313112  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  26313111 tttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 26313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6813711 - 6813583
Alignment:
Q  29 atattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacac 127  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6813711 atattggaccgaactgggttaacaatctttggtatgtttgttcctttctttcatttcttatctttattgctttgattatgcttgtgatgttgttctacac 6813612  T
Q  128 ttagatttaggcctgtttttgttgttgttg 157  Q
    | ||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  6813611 taagacttaagtct-attttgttgttgttg 6813583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7412397 - 7412269
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaa---tcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||   || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |    
T  7412397 agagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-c 7412300  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacact 128  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7412299 tttgtatatgcttgtggtgttgctctacact 7412269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 1261995 - 1262163
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||    
T  1261995 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggtt-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttctat-cttatcttgtttgc 1262091  T
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262092 ttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 1262163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 5990681 - 5990790
Alignment:
Q  81 ttgcttatctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattg 179  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||  |  |||||||| ||||    
T  5990681 ttgcttatctttgttgcttttgaatatgcttgtggttttgttctacacttagatttagg--tctatttgttgttgttgcttgatgctactttatccattg 5990778  T
Q  180 attaccacttcc 191  Q
    ||||| ||||||    
T  5990779 attactacttcc 5990790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 4731782 - 4731850
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4731782 tctctcccccagattcggtcaagttggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 4731850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212978
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 15212978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28307535 - 28307481
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttagg 138  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  28307535 cttatatttattgctttgtttatgcttgtggtgctgttatacacttagatttagg 28307481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733898
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacagtctttggtgtgtttgttcctctct 4733898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26301214 - 26301014
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  26301214 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgc 26301118  T
Q  98 tttgattatgcttgtggt-gttg---ctctacacttagatt------taggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccac 187  Q
    ||||  | |||||||||| ||||   || ||||| ||||||      |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||   || |||||||||    
T  26301117 tttgtatttgcttgtggttgttgacactttacacatagattaggccatagggctgtttttgttgttgttgcttgttgacactttacacatagattaccac 26301018  T
Q  188 ttcc 191  Q
    ||||    
T  26301017 ttcc 26301014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352342
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctct 33352342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036615
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||| || ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 43036615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 159
Target Start/End: Original strand, 7493210 - 7493261
Alignment:
Q  109 ttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  7493210 ttgtggtgttgctctacacttagatttagatctatttgttgttgttgttgct 7493261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 118
Target Start/End: Original strand, 9054961 - 9054995
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9054961 cttatctttattgctttgattatacttgtggtgtt 9054995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18870603 - 18870658
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt 57  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18870603 agagctgctctctcccccagattaggccatattggat-gaactgggtcaacaatctt 18870658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811470
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttttttcccctct 27811470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 17004001 - 17004190
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17004001 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttttttgcttt 17004100  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004101 gattatgcttgtggtgttgct-tacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 17004190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 42127456 - 42127638
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42127456 tgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgttttgatta 42127555  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42127556 tgcttgtggtgttgctctacaattagatttaagtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 42127638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19588797 - 19588612
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||   |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19588797 tgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctttgagtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 19588698  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19588697 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctttttttgttgttgttgcttggagacgctttatctattgattaccacttcc 19588612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 24553552 - 24553737
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553552 tgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 24553651  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24553652 tgcttgtggtgtttctctacacttagatttaggtctgtttttgttgatgttgcttggagacactttatccattgattatcacttcc 24553737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28832310 - 28832126
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28832310 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgtttgtttctttcattgcttatctttattgatttgatta 28832211  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28832210 tgcttgtggtgttgctctacacttaga-ttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatccattgattaccacttcc 28832126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31300637 - 31300826
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31300637 agagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgtttt 31300736  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31300737 gattacacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgtttttgcttgaaaacactttatctattgattaccagttcc 31300826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14520286 - 14520095
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||    
T  14520286 agagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcagtgcttatctttgt-gct 14520188  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14520187 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 14520095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3880355 - 3880169
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||| || | ||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3880355 agagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttggtgtgtt-gttcctttctttcattgcttatctttattgcttt 3880257  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3880256 gattatgcttgtggtgttgctttacacttagatttaggtctgtttttgtt---gttgattgaagacactttatctattgattaccacttcc 3880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Original strand, 11181925 - 11182063
Alignment:
Q  53 atcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg--tttttgtt 150  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||    
T  11181925 atcttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtattgctctacacttagatttaagtctgtttttttgtt 11182024  T
Q  151 gttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11182025 gttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 11182063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15464588 - 15464399
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  15464588 agagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttattgtt 15464490  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15464489 ttggttatacttgtggtgttgctctacact-agact-aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 15464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 11917013 - 11917206
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  11917013 agagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcctttctctcattgcttatctttattgcact 11917112  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcc---tgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |   | ||||| || || ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11917113 gtttatgcttgtggtgttgctctacactaagatctaggtctttttttttttttttttttgcttgaagacactttacacattgattaccacttcc 11917206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 9353373 - 9353561
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  9353373 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 9353470  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  9353471 ttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgtttaccacttcc 9353561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 12084216 - 12084376
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  12084216 agagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaatattttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gct 12084314  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgctt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  12084315 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgtttttgttgctt 12084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 36932391 - 36932580
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||    
T  36932391 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tttttcattgcttatctttgtt-ct 36932488  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  36932489 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattacctcttcc 36932580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6741908 - 6741784
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||||||||| | |||| || || || |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6741908 agagctgctctatcccccagagtatgtcatattgaaccgaactgtgttaataatctttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctt 6741809  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctcta 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  6741808 tgattatgcttgtggtgttgttcta 6741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 33030981 - 33031118
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttgg-tgtgtttgttcctctctct-cattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||  | ||||||||| | ||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||    
T  33030981 agagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccgaactgaattaacaatctttgatgtgtttgttcctttattttcattggttatctttattgct 33031080  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagattta 136  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33031081 ttgattattctcgtggtattgctctacacttagattta 33031118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38192229 - 38192039
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  38192229 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 38192133  T
Q  98 tttg-attatgct-tgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| |  | ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  38192132 tttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 38192039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38219454 - 38219264
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  38219454 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 38219358  T
Q  98 tttg-attatgct-tgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| |  | ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  38219357 tttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 38219264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Original strand, 28278463 - 28278553
Alignment:
Q  32 ttggatcgaattgggtcaacaat-cttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgct 121  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28278463 ttggaccgaactgggtgaacaattcttggtgtgtttctttctttctttcattgcttatctttattgctttgattatgattgtggttttgct 28278553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 121
Target Start/End: Original strand, 38747163 - 38747241
Alignment:
Q  43 tgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgct 121  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38747163 tgggtcaataatcttggtggatttgttcctttctttaattgcttatctttattgctttgattatgattgtggttttgct 38747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35387718 - 35387549
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || || || ||||||||||   ||||    
T  35387718 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaattgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatctcgtttgc 35387622  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    |||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387621 tttgtattct-cttgtggagttgctctacact-agact-agggttgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 35387549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2630204 - 2630127
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcc----tgtttttgttgttgttg 157  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  2630204 cttatctctattgctttaaatatgcttgtggtgttgctctgcacttagatttaggcctatttgtttttgttgttgttg 2630127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10281807 - 10281722
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctctcattgct 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  10281807 agagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctttctttgct 10281722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28750699 - 28750631
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28750699 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgtttgttcctctct 28750631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5887478 - 5887410
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5887478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattggatcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 5887410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806555
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgtttgttcctctct 19806555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32637016
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctct 32637016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34842577 - 34842499
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgcttg 161  Q
    ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  34842577 cttatctttgttgcttcggatatgcttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtttgtttattgttgttgctgcttg 34842499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8565990 - 8565930
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgtt 69  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8565990 tctctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgtt 8565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30682966 - 30682899
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30682966 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgg-tcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 30682899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 25862069 - 25862253
Alignment:
Q  7 gctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattat 106  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25862069 gctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttattcctttctttcattgcttatctttattgctttgattat 25862168  T
Q  107 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25862169 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 25862253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39246045 - 39245860
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39246045 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgttttgatta 39245946  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245945 tgcctgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattaccacttc 39245860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10047430 - 10047245
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10047430 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctttattgctttgatta 10047331  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10047330 tgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctatttttgttgttattgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 10047245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 3796560 - 3796752
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3796560 agagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgctt 3796659  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3796660 tgattatgcttgtgatgttactctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattatcacttcc 3796752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 42599622 - 42599808
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42599622 ctctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgattatg 42599721  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgt---ttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42599722 cttgtggtgttgctctacatttagatctaggtttgtttgttttgttgttgttgcttggagtcactttatctattgattaccacttcc 42599808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54867215 - 54867048
Alignment:
Q  26 gtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctac 125  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867215 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattactttgattatgcttgtggtgttgctctac 54867116  T
Q  126 acttagatttaggcctg--tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867115 acttagatctatgtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 54867048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 38152480 - 38152670
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  38152480 agagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatcttt-gtgcttt 38152578  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt--ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  38152579 gattatgcttgtggtgttgctatacacttagatctaggtctgttttattgttgttgttgcttggaaacacttcatacattgattaccacttc 38152670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5143315 - 5143125
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  5143315 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctcagtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctctattgtttt 5143216  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5143215 gattatgtttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattaccacttcc 5143125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5147733 - 5147543
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  5147733 agagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctctattgtttt 5147634  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5147633 gattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttattgttgttgtttcttggagacactttacacattgattaccacttcc 5147543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 5269237 - 5269425
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5269237 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgttgtgtttgttcctttctttcatttcttatatttattgctttgatta 5269336  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt---ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5269337 tgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatatttttgttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 5269425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24333865 - 24333677
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24333865 agagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttggtgtgtttgtttctttctttcattgcttatctttattgcttt 24333766  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24333765 gattatgctt---gtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattaccacttcc 24333677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3777586 - 3777416
Alignment:
Q  20 gattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttg 119  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  3777586 gattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gctttgattatgcttgtggttttg 3777488  T
Q  120 ctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3777487 ttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 3777416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 16630729 - 16630911
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16630729 tctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatctttgtt-ctttgattatg 16630827  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  16630828 cttgtggtgttgctttacacttagatctaggtttgtttttgttgttgctgcttggagacactttacacattgattaccagttcc 16630911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 5396712 - 5396905
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  5396712 agagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttcttcctttctttcattgcttatcttt-gtgct 5396810  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacac---ttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5396811 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaattag-tctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 5396905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 6743461 - 6743651
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttat-tgctttgatt 104  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  6743461 tgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca-tcttggtgtgtttgttcctttcttccatttcttatctctatatgctttgatt 6743559  T
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacac------ttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743560 atgcttgtggtgttgctctacactcagatttagatttaggtttg-ttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattaccacttcc 6743651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 36315270 - 36315384
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  36315270 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctctattgcttt 36315369  T
Q  101 gattatgcttgtggt 115  Q
    |||||||||||||||    
T  36315370 gattatgcttgtggt 36315384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 36329479 - 36329593
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  36329479 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctctattgcttt 36329578  T
Q  101 gattatgcttgtggt 115  Q
    |||||||||||||||    
T  36329579 gattatgcttgtggt 36329593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31985675 - 31985863
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  31985675 agagctgctctctccccag-attaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatctttattgct 31985771  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  31985772 ttgtatatgcttgtggagttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 31985863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 8689533 - 8689695
Alignment:
Q  10 ctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  8689533 ctctcccccatattagatcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgttactttctttcattgcttatctttgt-gctttgtttatg 8689631  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    |||||||||||||||| || | || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8689632 cttgtggtgttgctctgcattaag-tctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacacttta 8689695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28468570 - 28468757
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||    
T  28468570 agagctgctctctcctccagattaggtcatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgct 28468666  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  28468667 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 28468757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 16624144 - 16624240
Alignment:
Q  95 tgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  16624144 tgctttgattattcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattatcacttcc 16624240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18377345 - 18377244
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatt 182  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18377345 cttatttttgttgctttgattatgcttgtggttatgctttacacttagttttaggactgtttgttgttgttgttgcttgaggacactttatccattgatt 18377246  T
Q  183 ac 184  Q
    ||    
T  18377245 ac 18377244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 34495869 - 34496024
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc-ctctctctcattgcttatctttattgctttgatt 104  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| | ||| | || ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  34495869 tgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaactaggttacca-tcttggtgtgtttgttttctttctttcattgcttgt-tttattgctttgatt 34495966  T
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgcttg 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  34495967 atgcttgtgttgatgctttacacttagttttgggactgtttgttgttgttgttgcttg 34496024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 16623334 - 16623426
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctctcattgcttatcttt 92  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16623334 agagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatcttt 16623426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 1983436 - 1983522
Alignment:
Q  98 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt-ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatta 183  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  1983436 tttgattatgtttgtggtgatgctttacacttagatttaagtcagtttgttgttgttgttgcttgaacccactttatccattgatta 1983522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739526
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 12739526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175612
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 26175612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 34570458 - 34570390
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34570458 tctctcccccagattaggttaagttggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 34570390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Original strand, 36315386 - 36315443
Alignment:
Q  136 aggcctgtttttgttgttgttgcttggagacac--tttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  36315386 aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattaccacttcc 36315443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Original strand, 36329595 - 36329652
Alignment:
Q  136 aggcctgtttttgttgttgttgcttggagacac--tttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  36329595 aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattaccacttcc 36329652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37781836 - 37781782
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttagg 138  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  37781836 cttatctttgttgctttgaatatgcttgtggtgttgcttcacacttagatctagg 37781782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Original strand, 21688441 - 21688478
Alignment:
Q  78 tcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21688441 tcattgcttatctttattgctttgattatgattgtggt 21688478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743901
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 12743901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745290
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 12745290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927436
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcctct 9927436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893616
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 74  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctct 48893616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 169
Target Start/End: Original strand, 7816396 - 7816425
Alignment:
Q  140 ctgtttttgttgttgttgcttggagacact 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7816396 ctgtttttgttgttgttgcttggagacact 7816425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429871
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| || |  ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctct 5429871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 45357325 - 45357380
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt 57  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  45357325 agagctgctctctcccccagattatgccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 45357380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 54199950 - 54199883
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54199950 tctctcccccagattaggtcaagttgga-cgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcctctct 54199883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 3716033 - 3716223
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  3716033 agagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgttgt 3716132  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3716133 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttgtagacactttatctattgattaccacttcc 3716223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 1417526 - 1417710
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417526 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgctttgatta 1417625  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417626 tgcttgtgatgttactctacacttagatttatgtatg-ttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccacttcc 1417710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26299039 - 26298848
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26299039 tgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcgttgcttatctttattgctttgatta 26298940  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgtt------gttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26298939 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgttgttgtttggagacactttatccattgattaccacttcc 26298848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 40592820 - 40593004
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctctcattgcttatctttattgctttgattat 106  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40592820 ctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatctatattgctttgattat 40592919  T
Q  107 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40592920 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttatccattgattaccacttcc 40593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48438265 - 48438080
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  48438265 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttggtgtgtttgttcctttctgtcattgtttatctttattgttttgatta 48438166  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48438165 tgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagatactttatctattgattaccatttcc 48438080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40844702 - 40844519
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40844702 tgctctctccccag-attaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttggtgtgttcgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgatta 40844604  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40844603 tgcttgtagtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 40844519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 3328392 - 3328558
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3328392 tgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgttttgatta 3328491  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3328492 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagacacttta 3328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6794744 - 6794933
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6794744 agagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctctattgcttt 6794843  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6794844 gattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttttctattgattaccacttcc 6794933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8370517 - 8370708
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  8370517 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gct 8370615  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  8370616 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattacctcttcc 8370708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21711279 - 21711102
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21711279 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctctattgcttt 21711180  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctatt 178  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711179 gattatgcctatggtgttgctctacatggtgatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctatt 21711102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 24695198 - 24695384
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24695198 gttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttctttcattgtttatctttattgctttgat 24695297  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24695298 tatgcttgt-gtgttgctctatacttagatttagctctgtttttgttgttgttgcttgaagacattttatctattgattaccacttcc 24695384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 30709826 - 30710012
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30709826 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gctttgat 30709924  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30709925 tatgcttatggtgttgctctaaacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 30710012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37466340 - 37466157
Alignment:
Q  8 ctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatg 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37466340 ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgattatg 37466241  T
Q  108 cttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37466240 cttgtaatgttgctctacacttagattaatgtctgttttttttttttttttttggagacacttaatccattgattaccatttcc 37466157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16264406 - 16264216
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttg--gtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||    
T  16264406 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcctttctttcattgtttatctttgt-gct 16264308  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16264307 ttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggattgtttttgttgttgtttcttggagacactttacacattgattaccacttc 16264216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Original strand, 18552919 - 18553059
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18552919 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtatttgttcctttctttcattgattatctttattgctttgatta 18553018  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttt 146  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18553019 tgtttgtggtgttgctctacacttagatttagttctgtttt 18553059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 39040023 - 39040212
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  39040023 agagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttgt-gct 39040121  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  39040122 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 39040212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 33386697 - 33386887
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  33386697 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttattgtt 33386795  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33386796 ttggttatacttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 33386887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36029149 - 36028972
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||          
T  36029149 agagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttat------ 36029056  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
          |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  36029055 ------gcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttc 36028972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8126680 - 8126567
Alignment:
Q  78 tcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8126680 tcattgcttatctttattgctttgattatgagtgtggtgttgctctacacttagatttaggtatgtttttgttgttgttggttggagacattgtatctat 8126581  T
Q  178 tgattaccacttcc 191  Q
    ||| ||||||||||    
T  8126580 tgaataccacttcc 8126567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27974983 - 27975170
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  27974983 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 27975080  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  27975081 ttatttatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ttaggtctg-ttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattatcacttcc 27975170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27986477 - 27986665
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  27986477 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcat-tctttc-ttgcttatctttattgct 27986574  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||    
T  27986575 ttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctatttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccacttcc 27986665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32143377 - 32143189
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  32143377 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatctttattgct 32143280  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  32143279 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 32143189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35925519 - 35925352
Alignment:
Q  21 attatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgtt 118  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  35925519 attaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttttctttcattgctcatctttgt-gttttgattatgcttgtggtgtt 35925421  T
Q  119 gctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccac 187  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  35925420 gctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacattttacacattgattaccac 35925352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25795837 - 25795702
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  25795837 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatttttattgttt 25795738  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagattt 135  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25795737 ttattatgcttgtggtgttgctctacacttagattt 25795702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 1736341 - 1736447
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1736341 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatattggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatgtttattgctttgatta 1736440  T
Q  106 tgcttgt 112  Q
    |||||||    
T  1736441 tgcttgt 1736447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27026923 - 27026816
Alignment:
Q  78 tcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctat 177  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  27026923 tcattgcttatctttgt-gctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttcttgttgttgcttggagacactttacacat 27026825  T
Q  178 tgattacca 186  Q
    |||||||||    
T  27026824 tgattacca 27026816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27038268 - 27038161
Alignment:
Q  78 tcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctat 177  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  27038268 tcattgcttatctttgt-gctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctagatctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacat 27038170  T
Q  178 tgattacca 186  Q
    |||||||||    
T  27038169 tgattacca 27038161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1417232 - 1417132
Alignment:
Q  90 tttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1417232 tttattgctttgattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 1417134  T
Q  190 cc 191  Q
    ||    
T  1417133 cc 1417132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Original strand, 47924007 - 47924090
Alignment:
Q  105 atgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47924007 atgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt---ttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc 47924090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1306004 - 1305818
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||| |||||||  ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||    
T  1306004 agagctgctatctcccctagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgct 1305908  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  1305907 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttc 1305818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 4386958 - 4387115
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttgg-tgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||| || |   || ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4386958 agagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctttgatgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgttt 4387057  T
Q  100 tgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttg 157  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  4387058 tgattatgcatgtggcgttgttctacattaagacttaggtcttttttttttgttgttg 4387115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 26928632 - 26928757
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||    
T  26928632 agagttgctctctcccccagattaggtcatattggct-gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttctt-tctttc-tagcttatctttattgct 26928728  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacac 127  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26928729 ttgtatttgcttgtggtgttgctctacac 26928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1309868 - 1309722
Alignment:
Q  43 tgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcc 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  1309868 tgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agact-agggc 1309773  T
Q  141 tgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||    
T  1309772 tgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccacttcc 1309722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27453014 - 27452914
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc--ttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  27453014 agagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttc-ttgcttatctttattgct 27452917  T
Q  99 ttg 101  Q
    |||    
T  27452916 ttg 27452914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Original strand, 25929556 - 25929633
Alignment:
Q  84 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgttt--ttgttgttgttgct 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  25929556 cttatctttgttgctttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttaggtttgttttgttgttgttgttgct 25929633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Original strand, 34491359 - 34491449
Alignment:
Q  32 ttggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgct 121  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34491359 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttgattatgattgtggttttgct 34491449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47649655 - 47649607
Alignment:
Q  143 tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47649655 tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 47649607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 47923942 - 47924006
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc 70  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923942 tgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc 47924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8477418 - 8477258
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| || |||||||||||  ||||    
T  8477418 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttcttggtgtgtttgttctt-tctttc-ttgcttatcttgtttgc 8477322  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttgg 162  Q
    |||| |||||  ||||||||||| |||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8477321 tttgtattatctttgtggtgttgttctacact-ag-tctagggctggttttgttgttgttgcttgg 8477258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 29813187 - 29813255
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctct 29813255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51399006
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctct 51399006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23410373 - 23410312
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 69  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23410373 tctctcccccaaattaggtcaagttggaacgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 29810992 - 29811060
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29810992 tctctcccccagattaggtcaagttaaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcatctct 29811060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734690
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    ||||||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgtttgttcctctct 40734690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735575
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcagcaatctttggtgtatttgttcctctct 40735575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2543 - 2358
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2543 tgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 2444  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2443 tgcttgtggtgttgttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatcaacacttcc 2358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5734 - 5547
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgatta 105  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttctttcattgcttatctttattgctttgatta 5635  T
Q  106 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgtt---gttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5634 tgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacac-ttaactattgattaccacttcc 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 133321 - 133445
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||| | | || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  133321 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattacttatctttattgct 133419  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctcta 124  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||    
T  133420 ttgtatatgcttgtgatgttgctcta 133445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10785 - 10595
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10785 agagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcctctctttcattgcttatctttattgcttt 10686  T
Q  101 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  10685 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagtaactttatctatcgattaccacttc 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 102; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17316 - 17132
Alignment:
Q  4 gttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17316 gttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgctcctttctttcatttcttatctttattgctttaat 17217  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17216 tatgcttgtggtgttgctctatacttagatttaggtatgtttttgttgttgt---ttggagacattttatctattgattaccacttcc 17132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 94; Significance: 4e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 44002 - 44190
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  44002 agagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct-tctttcattgcttatctttgtt-ct 44099  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44100 ttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-agatt-aggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 44190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 36878 - 37063
Alignment:
Q  6 tgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgat 103  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||| |    
T  36878 tgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttcttttattgcttatctttgt-gctttgtt 36976  T
Q  104 tatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  36977 tatacttgtggtgttggtctacaccaag-tctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 37063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 85733 - 85551
Alignment:
Q  7 gctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgctttgattat 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  85733 gctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctagatgtgtttgttcttttctttcattgcttatcttt-gtgctttggttat 85635  T
Q  107 gcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  85634 gcttgtgatgttgctctacacttagatctaggtctg-ttttattgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 85551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8460 - 8650
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  8460 agagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttct-tctttcattgcttatctttattgtt 8558  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8559 ttggttatacttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttattgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45309 - 45122
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt--ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgct 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||    
T  45309 agagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatcttttggtgtgtttgttcat-tctttcattgcttatctttgtt-ct 45212  T
Q  99 ttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttc 190  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  45211 ttgtatatgtttgtggtgttgctctacact-agactt-ggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttc 45122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 17993 - 18182
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||    
T  17993 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgc 18089  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  18090 tttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-tag-tctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 18182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 24086 - 24275
Alignment:
Q  1 agagttgctctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctctctctcattgcttatctttattgc 97  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| || || || || ||||||||  || |    
T  24086 agagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc-ctttcttt-cttatcttgttttc 24182  T
Q  98 tttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctg-tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  24183 tttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttcc 24275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1330 - 1274
Alignment:
Q  135 taggcctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1330 taggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20391
Alignment:
Q  9 tctctcccccggattatgtcatattggatcgaattgggtcaacaa-tcttggtgtgtttgttcctctct 76  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcctctct 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 29616 - 29678
Alignment:
Q  94 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  ||| ||||||||||||||    
T  29616 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctttacacatagtttttgaactg-ttttgttgttgttg 29678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43228 - 43166
Alignment:
Q  94 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggcctgtttttgttgttgttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  ||| ||||||||||||||    
T  43228 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctttacacatagtttttgaactg-ttttgttgttgttg 43166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3626 times since January 2019
Visitors: 4039