View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0647_high_3 (Length: 465)

Name: NF0647_high_3
Description: NF0647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0647_high_3
NF0647_high_3
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (30-453)||(37962786-37963207)
chr2 (30-448)||(22874117-22874519)
chr2 (30-369)||(18800242-18800582)
chr2 (162-448)||(31732631-31732912)
chr2 (50-358)||(20146547-20146858)
chr2 (50-448)||(17897099-17897494)
chr2 (104-449)||(42923350-42923702)
chr2 (104-444)||(6258666-6259008)
chr2 (121-448)||(11577957-11578285)
chr2 (121-448)||(17849196-17849528)
chr2 (104-449)||(6263992-6264342)
chr2 (148-448)||(19007746-19008051)
chr2 (104-448)||(28459038-28459383)
chr2 (121-450)||(3022242-3022584)
chr2 (104-448)||(14837335-14837679)
chr2 (121-449)||(22287180-22287512)
chr2 (104-448)||(43623423-43623773)
chr2 (50-449)||(28196640-28197046)
chr2 (121-413)||(17848523-17848814)
chr2 (104-322)||(40699435-40699655)
chr2 (104-272)||(45239003-45239170)
chr2 (181-449)||(22707594-22707869)
chr2 (121-420)||(5375218-5375521)
chr2 (104-301)||(11739556-11739753)
chr2 (104-301)||(42452843-42453038)
chr2 (277-448)||(20592313-20592484)
chr2 (121-449)||(21520533-21520869)
chr2 (104-301)||(40032050-40032251)
chr2 (50-301)||(19502008-19502263)
chr2 (166-344)||(22407406-22407585)
chr2 (104-445)||(34979437-34979772)
chr2 (121-301)||(45279981-45280160)
chr2 (104-442)||(27104860-27105206)
chr2 (104-301)||(19504343-19504538)
chr2 (104-301)||(44289064-44289261)
chr2 (210-448)||(22162869-22163109)
chr2 (104-301)||(13910042-13910237)
chr2 (54-220)||(15539552-15539723)
chr2 (127-239)||(20589775-20589888)
chr2 (131-448)||(36558721-36559029)
chr2 (121-301)||(23452234-23452413)
chr2 (131-449)||(36560980-36561306)
chr2 (50-326)||(35107302-35107580)
chr2 (138-322)||(13828318-13828503)
chr2 (131-449)||(35217809-35218128)
chr2 (104-301)||(42064577-42064773)
chr2 (131-300)||(45332179-45332346)
chr2 (63-248)||(43139393-43139580)
chr2 (168-448)||(7462789-7463077)
chr2 (71-322)||(27136106-27136354)
chr2 (372-449)||(45332019-45332095)
chr2 (162-301)||(24162220-24162357)
chr2 (374-449)||(45238841-45238916)
chr2 (131-448)||(35215433-35215751)
chr2 (277-358)||(8173565-8173646)
chr2 (364-449)||(11739420-11739505)
chr2 (353-449)||(19504177-19504272)
chr2 (364-442)||(45279848-45279925)
chr2 (132-239)||(15693992-15694101)
chr2 (353-449)||(19501842-19501937)
chr2 (182-259)||(23870956-23871032)
chr2 (329-449)||(38414027-38414149)
chr2 (210-257)||(41303074-41303121)
chr2 (374-449)||(42453818-42453891)
chr2 (364-448)||(13909884-13909969)
chr2 (395-449)||(20146458-20146512)
chr2 (364-448)||(24162063-24162147)
chr2 (398-449)||(22405769-22405820)
chr2 (104-159)||(27583477-27583532)
chr2 (110-272)||(35028642-35028805)
chr2 (274-448)||(15539370-15539553)
chr2 (374-442)||(23452084-23452150)
chr2 (393-449)||(42923292-42923348)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (30-448)||(21482377-21482798)
chr8 (30-449)||(21480569-21480991)
chr8 (37-449)||(15956031-15956444)
chr8 (168-449)||(2467978-2468259)
chr8 (50-448)||(13858334-13858736)
chr8 (49-431)||(31162294-31162683)
chr8 (162-448)||(15185564-15185850)
chr8 (104-449)||(14419034-14419384)
chr8 (104-451)||(25952662-25953013)
chr8 (104-441)||(27106754-27107090)
chr8 (49-448)||(3005486-3005881)
chr8 (50-431)||(36865621-36866012)
chr8 (121-449)||(41382821-41383155)
chr8 (104-431)||(30480365-30480696)
chr8 (104-448)||(15072852-15073202)
chr8 (104-449)||(15068123-15068473)
chr8 (104-301)||(32339451-32339647)
chr8 (104-448)||(28251410-28251760)
chr8 (121-301)||(4424177-4424356)
chr8 (127-322)||(31035282-31035480)
chr8 (50-290)||(27911097-27911340)
chr8 (50-290)||(27957516-27957759)
chr8 (104-301)||(15809360-15809556)
chr8 (122-301)||(41384904-41385082)
chr8 (104-440)||(14807893-14808244)
chr8 (104-301)||(3874152-3874348)
chr8 (104-344)||(1225308-1225548)
chr8 (121-301)||(608893-609072)
chr8 (200-448)||(33541255-33541507)
chr8 (131-448)||(43082143-43082467)
chr8 (131-449)||(43079772-43080097)
chr8 (104-301)||(43530257-43530453)
chr8 (121-449)||(28283061-28283395)
chr8 (104-289)||(5372185-5372371)
chr8 (104-301)||(22684650-22684849)
chr8 (123-314)||(6376149-6376341)
chr8 (50-208)||(14477359-14477522)
chr8 (127-358)||(31578221-31578449)
chr8 (104-449)||(27827128-27827480)
chr8 (104-301)||(27829439-27829634)
chr8 (63-229)||(31573794-31573963)
chr8 (112-448)||(44720994-44721337)
chr8 (364-449)||(14477656-14477741)
chr8 (184-449)||(35872300-35872553)
chr8 (248-449)||(37214108-37214314)
chr8 (131-448)||(24873039-24873346)
chr8 (162-259)||(181702-181795)
chr8 (182-323)||(16833769-16833910)
chr8 (104-301)||(18813024-18813219)
chr8 (385-450)||(27911504-27911569)
chr8 (385-450)||(27957923-27957988)
chr8 (364-448)||(3883436-3883519)
chr8 (360-450)||(43530522-43530611)
chr8 (360-449)||(3874400-3874488)
chr8 (104-301)||(18810850-18811045)
chr8 (30-142)||(2468261-2468378)
chr8 (360-448)||(27829703-27829790)
chr8 (374-449)||(18811129-18811203)
chr8 (203-322)||(3896063-3896183)
chr8 (364-448)||(15809629-15809711)
chr8 (224-322)||(31566533-31566630)
chr8 (389-448)||(183251-183310)
chr8 (398-449)||(2467879-2467929)
chr8 (121-272)||(17847684-17847828)
chr8 (398-449)||(2467780-2467830)
chr8 (398-448)||(5372025-5372076)
chr8 (205-260)||(14419732-14419787)
chr8 (182-236)||(33020963-33021018)
chr8 (127-177)||(2267144-2267193)
chr8 (360-449)||(4424425-4424513)
chr8 (374-448)||(18813303-18813376)
chr8 (401-450)||(16833977-16834026)
chr8 (372-448)||(17847928-17848002)
chr8 (121-247)||(13985131-13985256)
chr8 (50-98)||(31035152-31035200)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (30-448)||(17795249-17795669)
chr3 (30-448)||(19103689-19104109)
chr3 (36-449)||(25635377-25635789)
chr3 (50-448)||(28761287-28761678)
chr3 (50-449)||(31151355-31151755)
chr3 (50-448)||(1313416-1313822)
chr3 (50-431)||(561640-562024)
chr3 (104-449)||(3314750-3315101)
chr3 (121-449)||(23633537-23633863)
chr3 (121-446)||(5926611-5926938)
chr3 (50-449)||(53917505-53917914)
chr3 (50-449)||(43421259-43421665)
chr3 (119-448)||(53915338-53915672)
chr3 (104-448)||(6484426-6484773)
chr3 (50-449)||(43423307-43423713)
chr3 (104-441)||(45883005-45883350)
chr3 (104-446)||(4666580-4666926)
chr3 (104-449)||(18162729-18163081)
chr3 (121-449)||(28101847-28102176)
chr3 (128-441)||(880302-880618)
chr3 (30-259)||(13420222-13420450)
chr3 (162-448)||(32263881-32264172)
chr3 (50-449)||(53597246-53597645)
chr3 (121-448)||(47148745-47149069)
chr3 (104-449)||(42990370-42990718)
chr3 (104-431)||(1626543-1626874)
chr3 (121-448)||(36011910-36012243)
chr3 (104-448)||(51674608-51674957)
chr3 (104-448)||(4308122-4308472)
chr3 (178-449)||(25634027-25634295)
chr3 (104-444)||(27101026-27101372)
chr3 (104-448)||(15780937-15781293)
chr3 (50-449)||(36871148-36871549)
chr3 (104-449)||(18099009-18099361)
chr3 (162-441)||(27635504-27635791)
chr3 (104-449)||(43226151-43226496)
chr3 (104-441)||(53468302-53468647)
chr3 (104-448)||(9604447-9604798)
chr3 (121-448)||(12267819-12268138)
chr3 (104-448)||(24979773-24980126)
chr3 (162-322)||(24181504-24181665)
chr3 (50-419)||(51943378-51943758)
chr3 (127-449)||(32219173-32219504)
chr3 (104-301)||(10956022-10956218)
chr3 (104-301)||(38890106-38890302)
chr3 (104-439)||(43228357-43228696)
chr3 (165-442)||(47701526-47701801)
chr3 (129-449)||(6231892-6232209)
chr3 (131-448)||(746851-747177)
chr3 (104-290)||(25688166-25688352)
chr3 (104-290)||(889779-889963)
chr3 (104-450)||(1321545-1321899)
chr3 (121-301)||(3306844-3307022)
chr3 (104-301)||(25533508-25533704)
chr3 (128-449)||(53591274-53591598)
chr3 (129-433)||(5886290-5886601)
chr3 (104-301)||(22114300-22114496)
chr3 (104-301)||(51727002-51727198)
chr3 (121-446)||(48361511-48361845)
chr3 (104-448)||(18096740-18097091)
chr3 (131-449)||(10621365-10621693)
chr3 (129-433)||(5899763-5900074)
chr3 (104-252)||(6561876-6562025)
chr3 (104-301)||(10958318-10958514)
chr3 (104-301)||(11170470-11170666)
chr3 (131-303)||(25388999-25389169)
chr3 (222-448)||(41849243-41849470)
chr3 (121-232)||(39715552-39715663)
chr3 (104-282)||(11168167-11168344)
chr3 (104-449)||(28412869-28413223)
chr3 (104-301)||(4103891-4104086)
chr3 (104-301)||(5191719-5191913)
chr3 (104-301)||(10084384-10084580)
chr3 (104-301)||(30005907-30006103)
chr3 (104-261)||(54884221-54884377)
chr3 (121-301)||(5522622-5522800)
chr3 (131-449)||(458378-458703)
chr3 (104-301)||(7606583-7606778)
chr3 (104-301)||(3859594-3859789)
chr3 (50-449)||(54691416-54691824)
chr3 (131-449)||(6065632-6065959)
chr3 (131-449)||(456001-456326)
chr3 (104-259)||(29956752-29956906)
chr3 (50-226)||(1673982-1674160)
chr3 (131-448)||(50494093-50494417)
chr3 (104-432)||(1620328-1620653)
chr3 (162-301)||(10191305-10191443)
chr3 (317-442)||(880090-880219)
chr3 (104-257)||(14634480-14634634)
chr3 (30-145)||(25633910-25634027)
chr3 (131-303)||(6063439-6063609)
chr3 (50-220)||(23637033-23637205)
chr3 (128-292)||(35917948-35918110)
chr3 (360-449)||(10958162-10958249)
chr3 (121-290)||(26720630-26720798)
chr3 (131-300)||(38210464-38210631)
chr3 (186-302)||(42992418-42992533)
chr3 (50-193)||(28100143-28100291)
chr3 (50-145)||(24177286-24177383)
chr3 (364-448)||(10955867-10955949)
chr3 (127-239)||(11007580-11007683)
chr3 (353-449)||(42992705-42992800)
chr3 (364-450)||(3859846-3859932)
chr3 (132-358)||(27420744-27420968)
chr3 (360-449)||(25389238-25389327)
chr3 (131-197)||(35777515-35777581)
chr3 (360-449)||(25533756-25533843)
chr3 (364-448)||(28181334-28181417)
chr3 (364-448)||(53893893-53893976)
chr3 (374-449)||(6063282-6063356)
chr3 (374-449)||(11170716-11170789)
chr3 (360-442)||(5191982-5192062)
chr3 (398-448)||(38210740-38210789)
chr3 (353-410)||(26720871-26720928)
chr3 (162-301)||(46966645-46966784)
chr3 (104-235)||(4560352-4560475)
chr3 (364-448)||(10084229-10084311)
chr3 (364-431)||(10191168-10191234)
chr3 (374-449)||(11168447-11168520)
chr3 (395-448)||(41038766-41038822)
chr3 (280-344)||(1674206-1674270)
chr3 (353-448)||(22114143-22114237)
chr3 (398-449)||(29897526-29897578)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (30-449)||(15719688-15720106)
chr6 (50-448)||(3027703-3028103)
chr6 (50-448)||(13057256-13057659)
chr6 (69-450)||(15367116-15367500)
chr6 (128-449)||(15540989-15541309)
chr6 (109-449)||(24338294-24338635)
chr6 (50-449)||(3631783-3632190)
chr6 (50-448)||(3629711-3630116)
chr6 (104-444)||(14466444-14466787)
chr6 (182-450)||(15346546-15346815)
chr6 (104-358)||(13039875-13040130)
chr6 (104-448)||(32280117-32280463)
chr6 (104-448)||(9020047-9020398)
chr6 (49-449)||(17012104-17012503)
chr6 (104-301)||(1069715-1069912)
chr6 (104-449)||(11982871-11983222)
chr6 (104-282)||(3390500-3390678)
chr6 (104-448)||(3233567-3233923)
chr6 (127-360)||(19696583-19696818)
chr6 (50-358)||(16455368-16455675)
chr6 (104-301)||(25477395-25477599)
chr6 (104-301)||(15532679-15532874)
chr6 (121-301)||(14458764-14458943)
chr6 (121-438)||(26945281-26945600)
chr6 (104-344)||(12186025-12186266)
chr6 (104-301)||(4816228-4816424)
chr6 (104-442)||(30728675-30729021)
chr6 (50-252)||(15530169-15530374)
chr6 (104-362)||(22857889-22858148)
chr6 (104-301)||(28241318-28241514)
chr6 (162-301)||(1230246-1230384)
chr6 (104-301)||(30967322-30967518)
chr6 (121-239)||(22490778-22490896)
chr6 (181-344)||(25465545-25465707)
chr6 (131-448)||(26065961-26066289)
chr6 (121-358)||(12937133-12937370)
chr6 (131-301)||(19704564-19704734)
chr6 (131-449)||(26068234-26068560)
chr6 (162-301)||(30034600-30034738)
chr6 (131-449)||(26932402-26932727)
chr6 (121-344)||(12161510-12161733)
chr6 (104-301)||(14507173-14507368)
chr6 (131-303)||(5273211-5273381)
chr6 (123-341)||(25078514-25078732)
chr6 (104-449)||(2628726-2629078)
chr6 (63-259)||(20526883-20527081)
chr6 (131-301)||(20915353-20915521)
chr6 (182-322)||(28078170-28078310)
chr6 (104-301)||(26065104-26065298)
chr6 (104-301)||(26085073-26085267)
chr6 (131-303)||(33309006-33309175)
chr6 (131-448)||(12195354-12195680)
chr6 (131-448)||(29754549-29754874)
chr6 (162-294)||(30445702-30445836)
chr6 (121-324)||(12911419-12911623)
chr6 (131-303)||(33311275-33311444)
chr6 (374-449)||(8717194-8717268)
chr6 (215-302)||(10584227-10584314)
chr6 (364-448)||(18322483-18322566)
chr6 (372-446)||(22491003-22491077)
chr6 (374-449)||(33309257-33309330)
chr6 (114-314)||(11262587-11262790)
chr6 (277-323)||(26455132-26455178)
chr6 (185-239)||(28037788-28037842)
chr6 (374-448)||(33311526-33311598)
chr6 (34-103)||(15346429-15346498)
chr6 (364-449)||(28241162-28241245)
chr6 (364-448)||(4816071-4816154)
chr6 (374-450)||(14458605-14458680)
chr6 (374-448)||(5273055-5273129)
chr6 (104-191)||(19227514-19227601)
chr6 (398-448)||(13040182-13040232)
chr6 (331-449)||(25480227-25480347)
chr6 (367-448)||(30967594-30967673)
chr6 (188-239)||(3833481-3833533)
chr6 (398-449)||(10584362-10584414)
chr6 (364-448)||(20915197-20915280)
chr6 (292-358)||(22610986-22611051)
chr6 (374-449)||(3394763-3394838)
chr6 (394-448)||(15530003-15530060)
chr6 (374-448)||(19704403-19704477)
chr6 (398-448)||(28037576-28037627)
chr6 (398-448)||(7294210-7294260)
chr6 (398-448)||(16455280-16455330)
chr6 (403-449)||(22857842-22857888)
chr6 (374-449)||(26065382-26065458)
chr6 (374-449)||(26085351-26085427)
chr6 (283-344)||(26505339-26505401)
chr6 (364-449)||(1230089-1230172)
chr6 (364-413)||(14507051-14507100)
chr6 (330-449)||(30034446-30034562)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (50-449)||(41997573-41997976)
chr4 (49-444)||(18534687-18535083)
chr4 (50-448)||(19322777-19323177)
chr4 (49-449)||(18537324-18537725)
chr4 (121-449)||(18409191-18409523)
chr4 (50-449)||(38890071-38890475)
chr4 (104-448)||(38928024-38928370)
chr4 (104-449)||(16453449-16453797)
chr4 (121-448)||(19096040-19096370)
chr4 (121-448)||(2891448-2891780)
chr4 (57-446)||(30136640-30137031)
chr4 (104-448)||(16455381-16455714)
chr4 (54-449)||(8756102-8756498)
chr4 (104-448)||(22800705-22801055)
chr4 (104-448)||(33415334-33415681)
chr4 (104-450)||(40091257-40091608)
chr4 (50-449)||(36378373-36378778)
chr4 (104-448)||(14787274-14787624)
chr4 (104-448)||(36380489-36380834)
chr4 (104-442)||(36919435-36919777)
chr4 (104-449)||(36921337-36921686)
chr4 (103-326)||(24880590-24880814)
chr4 (104-448)||(47274866-47275212)
chr4 (104-449)||(22802576-22802927)
chr4 (127-449)||(16185685-16186006)
chr4 (121-448)||(37312924-37313242)
chr4 (104-448)||(12102226-12102566)
chr4 (50-441)||(12400659-12401059)
chr4 (104-326)||(24879129-24879352)
chr4 (104-442)||(48486459-48486803)
chr4 (148-449)||(619297-619596)
chr4 (162-448)||(6765042-6765335)
chr4 (50-441)||(12395697-12396097)
chr4 (121-441)||(15032401-15032725)
chr4 (121-449)||(13547311-13547644)
chr4 (104-448)||(17662092-17662438)
chr4 (104-278)||(13544099-13544272)
chr4 (104-413)||(40637214-40637531)
chr4 (104-301)||(14633459-14633654)
chr4 (104-301)||(47868541-47868737)
chr4 (104-448)||(24888936-24889286)
chr4 (68-448)||(28453784-28454167)
chr4 (127-358)||(47150833-47151065)
chr4 (104-301)||(8631416-8631612)
chr4 (50-448)||(37089212-37089623)
chr4 (50-448)||(9863792-9864196)
chr4 (121-448)||(27499202-27499536)
chr4 (166-413)||(4215508-4215756)
chr4 (104-449)||(22046525-22046878)
chr4 (104-301)||(24348358-24348554)
chr4 (162-301)||(5635473-5635611)
chr4 (104-358)||(31983472-31983722)
chr4 (232-449)||(14789272-14789496)
chr4 (121-449)||(53405286-53405627)
chr4 (104-301)||(7941463-7941659)
chr4 (121-289)||(5198577-5198744)
chr4 (50-249)||(40998998-40999200)
chr4 (104-301)||(2484870-2485065)
chr4 (131-449)||(16931630-16931954)
chr4 (131-449)||(22782576-22782903)
chr4 (299-448)||(5664570-5664722)
chr4 (104-301)||(9148393-9148588)
chr4 (104-301)||(11435095-11435290)
chr4 (104-289)||(26085986-26086169)
chr4 (104-301)||(38409345-38409540)
chr4 (104-290)||(56030584-56030766)
chr4 (331-448)||(56030828-56030945)
chr4 (165-301)||(5101130-5101264)
chr4 (131-287)||(9176485-9176639)
chr4 (121-301)||(22044388-22044566)
chr4 (121-289)||(47210761-47210928)
chr4 (162-301)||(11437561-11437698)
chr4 (104-303)||(22132387-22132584)
chr4 (131-301)||(18847321-18847488)
chr4 (104-301)||(31849596-31849791)
chr4 (305-449)||(3937125-3937266)
chr4 (104-303)||(9174141-9174339)
chr4 (131-303)||(16934138-16934308)
chr4 (131-449)||(22780211-22780538)
chr4 (162-301)||(11006234-11006371)
chr4 (184-449)||(24446501-24446754)
chr4 (104-301)||(51015386-51015581)
chr4 (104-232)||(3824635-3824763)
chr4 (104-232)||(5637530-5637658)
chr4 (163-303)||(22134613-22134750)
chr4 (182-358)||(25357859-25358035)
chr4 (212-448)||(47563009-47563248)
chr4 (121-272)||(3982202-3982355)
chr4 (131-449)||(44599679-44600003)
chr4 (364-449)||(49088960-49089045)
chr4 (162-301)||(11008565-11008700)
chr4 (104-303)||(18709159-18709356)
chr4 (162-220)||(52942536-52942594)
chr4 (74-264)||(9022410-9022605)
chr4 (50-449)||(10112953-10113352)
chr4 (389-449)||(18311214-18311275)
chr4 (212-449)||(22295412-22295647)
chr4 (364-458)||(5101320-5101414)
chr4 (226-447)||(6133098-6133326)
chr4 (213-449)||(10114565-10114799)
chr4 (128-192)||(3937314-3937378)
chr4 (364-448)||(5198813-5198895)
chr4 (213-360)||(3578616-3578756)
chr4 (364-454)||(11006088-11006177)
chr4 (374-448)||(3824447-3824523)
chr4 (364-449)||(11008407-11008491)
chr4 (360-449)||(24348606-24348693)
chr4 (364-448)||(2484715-2484797)
chr4 (127-301)||(5336777-5336952)
chr4 (360-448)||(7941728-7941814)
chr4 (364-448)||(31849440-31849522)
chr4 (360-450)||(11437767-11437857)
chr4 (374-449)||(47868821-47868895)
chr4 (121-179)||(6133029-6133087)
chr4 (372-449)||(16933987-16934061)
chr4 (360-449)||(51015650-51015739)
chr4 (364-449)||(8631259-8631342)
chr4 (364-449)||(9173986-9174069)
chr4 (364-449)||(9176314-9176397)
chr4 (364-448)||(22044231-22044315)
chr4 (372-449)||(38269994-38270070)
chr4 (364-449)||(47210636-47210720)
chr4 (364-448)||(5635318-5635400)
chr4 (360-448)||(9148640-9148727)
chr4 (360-439)||(11435359-11435438)
chr4 (353-448)||(18709003-18709098)
chr4 (360-442)||(14633723-14633804)
chr4 (213-302)||(26557833-26557923)
chr4 (360-449)||(18847558-18847645)
chr4 (364-449)||(22134456-22134540)
chr4 (186-301)||(49088791-49088907)
chr4 (398-449)||(4558588-4558640)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (30-449)||(24465558-24465976)
chr7 (54-449)||(7188583-7188980)
chr7 (121-449)||(24748707-24749036)
chr7 (158-448)||(22393872-22394161)
chr7 (104-449)||(13099316-13099669)
chr7 (104-449)||(27832487-27832826)
chr7 (51-360)||(24817290-24817601)
chr7 (162-448)||(26295601-26295885)
chr7 (50-448)||(24813348-24813747)
chr7 (50-449)||(21678103-21678507)
chr7 (104-448)||(42330846-42331192)
chr7 (104-441)||(4295788-4296127)
chr7 (50-344)||(20137063-20137361)
chr7 (50-449)||(443632-444045)
chr7 (50-421)||(39145858-39146239)
chr7 (104-449)||(44724675-44725023)
chr7 (104-439)||(9679155-9679495)
chr7 (121-447)||(28487666-28488000)
chr7 (104-448)||(31434892-31435240)
chr7 (104-449)||(42223254-42223601)
chr7 (104-301)||(7092210-7092405)
chr7 (128-421)||(21990270-21990568)
chr7 (121-449)||(9680933-9681266)
chr7 (50-448)||(21680064-21680472)
chr7 (110-314)||(6332321-6332527)
chr7 (104-448)||(27306076-27306423)
chr7 (104-449)||(37411964-37412320)
chr7 (50-449)||(11355295-11355706)
chr7 (50-239)||(25276178-25276372)
chr7 (104-448)||(20626134-20626481)
chr7 (104-448)||(20630025-20630372)
chr7 (104-448)||(20642444-20642791)
chr7 (104-290)||(7094468-7094653)
chr7 (121-448)||(21591989-21592319)
chr7 (121-258)||(22828672-22828809)
chr7 (54-299)||(24258504-24258757)
chr7 (104-449)||(38394082-38394435)
chr7 (50-264)||(20091581-20091794)
chr7 (104-301)||(3878673-3878869)
chr7 (121-301)||(48457766-48457945)
chr7 (104-448)||(20299556-20299908)
chr7 (50-301)||(18345578-18345833)
chr7 (131-449)||(7351490-7351817)
chr7 (121-301)||(7470019-7470198)
chr7 (104-449)||(20297458-20297811)
chr7 (104-302)||(35725-35922)
chr7 (121-301)||(28485679-28485857)
chr7 (127-239)||(22251604-22251720)
chr7 (50-301)||(1850018-1850273)
chr7 (104-301)||(40836740-40836935)
chr7 (110-301)||(40946430-40946620)
chr7 (104-301)||(1046922-1047117)
chr7 (104-301)||(7471977-7472173)
chr7 (121-301)||(25542642-25542820)
chr7 (131-448)||(9027034-9027358)
chr7 (121-301)||(44677-44856)
chr7 (131-448)||(1606504-1606827)
chr7 (131-303)||(2935392-2935562)
chr7 (127-301)||(1049293-1049465)
chr7 (104-290)||(43253525-43253710)
chr7 (138-239)||(6348912-6349013)
chr7 (104-232)||(11757326-11757454)
chr7 (162-301)||(3035878-3036016)
chr7 (30-155)||(22392482-22392608)
chr7 (131-449)||(7349116-7349438)
chr7 (104-314)||(16297004-16297218)
chr7 (131-301)||(22108191-22108358)
chr7 (131-301)||(40549951-40550118)
chr7 (277-412)||(20091041-20091176)
chr7 (121-340)||(11081619-11081842)
chr7 (131-303)||(31155906-31156076)
chr7 (162-301)||(38396789-38396926)
chr7 (131-301)||(22137202-22137369)
chr7 (131-301)||(40552229-40552396)
chr7 (372-449)||(3878952-3879028)
chr7 (364-449)||(11759492-11759576)
chr7 (127-344)||(40281336-40281548)
chr7 (374-449)||(40550204-40550278)
chr7 (162-358)||(6046647-6046843)
chr7 (374-448)||(22137454-22137527)
chr7 (374-448)||(40552481-40552554)
chr7 (364-449)||(7471820-7471904)
chr7 (360-449)||(28485926-28486014)
chr7 (188-319)||(13290452-13290583)
chr7 (360-448)||(25542889-25542976)
chr7 (364-448)||(40946695-40946777)
chr7 (127-326)||(6067169-6067370)
chr7 (284-449)||(6349076-6349237)
chr7 (261-449)||(26804762-26804956)
chr7 (360-442)||(38397000-38397080)
chr7 (104-197)||(26804668-26804761)
chr7 (360-448)||(44925-45012)
chr7 (360-448)||(2935630-2935716)
chr7 (360-448)||(48458014-48458100)
chr7 (364-450)||(40836581-40836667)
chr7 (360-446)||(3036085-3036170)
chr7 (192-246)||(22280390-22280444)
chr7 (360-437)||(35990-36066)
chr7 (374-462)||(20136977-20137066)
chr7 (364-448)||(1850346-1850429)
chr7 (121-236)||(6048983-6049098)
chr7 (397-449)||(31153690-31153741)
chr7 (364-448)||(43253358-43253440)
chr7 (374-441)||(7092061-7092127)
chr7 (398-449)||(7094300-7094350)
chr7 (398-448)||(16104631-16104680)
chr7 (364-449)||(7469863-7469946)
chr7 (374-449)||(1046756-1046831)
chr7 (374-449)||(1049128-1049203)
chr7 (399-447)||(40281236-40281284)
chr7 (398-449)||(45366863-45366912)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (104-448)||(40134030-40134378)
chr1 (104-449)||(16429043-16429388)
chr1 (30-448)||(6114953-6115361)
chr1 (50-445)||(9240937-9241340)
chr1 (127-449)||(17185978-17186300)
chr1 (50-407)||(16428680-16429043)
chr1 (127-443)||(25127981-25128302)
chr1 (104-450)||(18839673-18840024)
chr1 (57-449)||(8348904-8349296)
chr1 (54-410)||(15669281-15669641)
chr1 (30-370)||(49495140-49495481)
chr1 (50-445)||(18800426-18800824)
chr1 (121-446)||(25251123-25251453)
chr1 (121-448)||(18307212-18307543)
chr1 (50-367)||(42922260-42922579)
chr1 (49-449)||(14183454-14183844)
chr1 (121-448)||(50248417-50248750)
chr1 (104-449)||(38925327-38925673)
chr1 (104-448)||(2949079-2949426)
chr1 (104-449)||(50307388-50307741)
chr1 (50-442)||(11457328-11457729)
chr1 (104-449)||(14097814-14098165)
chr1 (121-448)||(47906373-47906704)
chr1 (104-448)||(13215167-13215518)
chr1 (104-444)||(17324482-17324831)
chr1 (50-438)||(8347136-8347524)
chr1 (104-448)||(25248398-25248747)
chr1 (127-448)||(17318996-17319321)
chr1 (50-345)||(50076626-50076926)
chr1 (121-448)||(4131221-4131557)
chr1 (190-448)||(15916562-15916821)
chr1 (50-432)||(12302367-12302759)
chr1 (104-432)||(15823632-15823968)
chr1 (162-448)||(23816030-23816323)
chr1 (104-449)||(41647006-41647356)
chr1 (104-448)||(39462605-39462956)
chr1 (130-448)||(30790250-30790571)
chr1 (104-449)||(31424861-31425213)
chr1 (104-440)||(16432480-16432813)
chr1 (104-449)||(28998093-28998448)
chr1 (104-449)||(29003809-29004164)
chr1 (121-448)||(39932176-39932514)
chr1 (104-301)||(50078819-50079016)
chr1 (104-449)||(6995539-6995895)
chr1 (104-449)||(27338972-27339325)
chr1 (104-449)||(31489999-31490346)
chr1 (104-449)||(28206911-28207261)
chr1 (104-448)||(27336782-27337134)
chr1 (104-301)||(6823100-6823296)
chr1 (104-301)||(10399827-10400023)
chr1 (104-322)||(30738603-30738826)
chr1 (148-301)||(6756656-6756810)
chr1 (104-301)||(13761923-13762118)
chr1 (104-301)||(15294833-15295029)
chr1 (127-322)||(26613216-26613413)
chr1 (128-249)||(31422923-31423044)
chr1 (104-301)||(31735520-31735716)
chr1 (104-301)||(51750125-51750321)
chr1 (121-301)||(2510324-2510502)
chr1 (121-449)||(28842598-28842932)
chr1 (104-448)||(9459277-9459612)
chr1 (104-448)||(9463104-9463439)
chr1 (127-448)||(13125310-13125631)
chr1 (50-360)||(27916526-27916838)
chr1 (122-301)||(3579616-3579793)
chr1 (131-448)||(23785953-23786278)
chr1 (104-301)||(28840766-28840961)
chr1 (162-314)||(17324207-17324358)
chr1 (121-448)||(24325766-24326101)
chr1 (127-449)||(47451751-47452066)
chr1 (131-449)||(16226281-16226608)
chr1 (104-322)||(16561552-16561772)
chr1 (104-289)||(2617602-2617786)
chr1 (104-301)||(20291543-20291738)
chr1 (131-448)||(16231677-16232002)
chr1 (126-301)||(51752472-51752645)
chr1 (121-259)||(21948229-21948366)
chr1 (104-301)||(46431705-46431902)
chr1 (121-232)||(48665280-48665392)
chr1 (205-360)||(13127626-13127782)
chr1 (121-301)||(51757634-51757812)
chr1 (104-301)||(20302545-20302740)
chr1 (50-345)||(26520074-26520371)
chr1 (103-274)||(43104244-43104416)
chr1 (131-300)||(47179827-47179993)
chr1 (364-449)||(51757890-51757974)
chr1 (364-448)||(3579431-3579514)
chr1 (63-239)||(28279307-28279487)
chr1 (364-448)||(30780396-30780482)
chr1 (374-449)||(47177728-47177802)
chr1 (398-448)||(31422706-31422756)
chr1 (364-449)||(50078634-50078720)
chr1 (148-217)||(6824022-6824091)
chr1 (131-206)||(47177476-47177551)
chr1 (374-448)||(47180079-47180152)
chr1 (104-272)||(155792-155959)
chr1 (360-448)||(13762187-13762275)
chr1 (372-449)||(46431547-46431623)
chr1 (135-301)||(46783163-46783331)
chr1 (360-449)||(51750390-51750477)
chr1 (364-449)||(51752724-51752806)
chr1 (364-448)||(13447117-13447199)
chr1 (284-360)||(26332450-26332525)
chr1 (364-448)||(31735365-31735448)
chr1 (374-449)||(20291822-20291895)
chr1 (329-449)||(13358892-13359012)
chr1 (121-239)||(14353069-14353185)
chr1 (364-448)||(15294678-15294760)
chr1 (374-448)||(10399669-10399743)
chr1 (374-448)||(20302807-20302879)
chr1 (210-239)||(8213586-8213615)
chr1 (348-444)||(26519293-26519385)
chr1 (329-413)||(28840998-28841083)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (104-449)||(36208661-36209008)
chr5 (121-447)||(6661038-6661362)
chr5 (121-448)||(695980-696310)
chr5 (121-444)||(17818338-17818666)
chr5 (104-446)||(27912622-27912973)
chr5 (121-452)||(24126959-24127295)
chr5 (121-448)||(10474168-10474499)
chr5 (50-449)||(18511055-18511464)
chr5 (121-448)||(1189454-1189785)
chr5 (104-449)||(40221608-40221964)
chr5 (104-453)||(18596731-18597084)
chr5 (127-449)||(41585579-41585914)
chr5 (104-449)||(20505686-20506034)
chr5 (54-448)||(9020253-9020649)
chr5 (50-449)||(31472457-31472865)
chr5 (104-449)||(36402169-36402521)
chr5 (104-301)||(16092196-16092393)
chr5 (104-451)||(37705623-37705973)
chr5 (110-448)||(2954509-2954849)
chr5 (50-448)||(20053873-20054266)
chr5 (104-301)||(10529096-10529292)
chr5 (104-449)||(6745154-6745508)
chr5 (50-290)||(25804052-25804295)
chr5 (121-447)||(6756597-6756926)
chr5 (104-449)||(18466770-18467124)
chr5 (104-449)||(17072969-17073322)
chr5 (166-449)||(2724041-2724329)
chr5 (104-448)||(18469097-18469448)
chr5 (104-301)||(21948112-21948308)
chr5 (104-448)||(39854569-39854921)
chr5 (104-449)||(27910536-27910873)
chr5 (104-449)||(39798133-39798469)
chr5 (121-448)||(658204-658529)
chr5 (104-290)||(4236715-4236900)
chr5 (104-449)||(6747391-6747744)
chr5 (104-450)||(25904189-25904538)
chr5 (63-264)||(17413200-17413404)
chr5 (104-440)||(2818186-2818528)
chr5 (104-448)||(10586918-10587252)
chr5 (127-448)||(15445120-15445441)
chr5 (127-358)||(4897837-4898068)
chr5 (127-314)||(15143574-15143763)
chr5 (210-442)||(21288953-21289187)
chr5 (121-301)||(25921470-25921649)
chr5 (131-448)||(38959972-38960296)
chr5 (50-301)||(18509315-18509570)
chr5 (104-301)||(2175005-2175200)
chr5 (148-232)||(42770940-42771024)
chr5 (162-301)||(26097876-26098013)
chr5 (104-301)||(38882192-38882387)
chr5 (50-251)||(34530712-34530918)
chr5 (131-301)||(34479415-34479584)
chr5 (131-301)||(10749814-10749982)
chr5 (104-301)||(16776244-16776439)
chr5 (131-448)||(31179213-31179536)
chr5 (121-301)||(21684449-21684627)
chr5 (255-449)||(20043224-20043425)
chr5 (121-232)||(31466044-31466154)
chr5 (131-301)||(34477050-34477219)
chr5 (131-301)||(10757291-10757458)
chr5 (372-448)||(34530559-34530635)
chr5 (131-448)||(15552359-15552685)
chr5 (148-448)||(3372977-3373285)
chr5 (131-303)||(31545194-31545364)
chr5 (104-288)||(39398003-39398186)
chr5 (104-290)||(12555931-12556116)
chr5 (104-301)||(4410109-4410304)
chr5 (374-449)||(15354413-15354487)
chr5 (374-449)||(15356689-15356763)
chr5 (374-449)||(23665411-23665485)
chr5 (374-449)||(23793102-23793176)
chr5 (131-301)||(15354572-15354739)
chr5 (131-301)||(23665158-23665325)
chr5 (374-448)||(23741697-23741770)
chr5 (131-301)||(23793262-23793429)
chr5 (210-449)||(26098128-26098376)
chr5 (131-303)||(31542849-31543018)
chr5 (131-301)||(15356848-15357015)
chr5 (131-301)||(23741856-23742023)
chr5 (121-186)||(42770869-42770934)
chr5 (374-442)||(21948394-21948462)
chr5 (360-448)||(38882439-38882525)
chr5 (292-411)||(42771051-42771167)
chr5 (364-448)||(2175256-2175341)
chr5 (374-449)||(10750065-10750138)
chr5 (374-449)||(10757541-10757614)
chr5 (374-449)||(31465832-31465907)
chr5 (213-259)||(2144601-2144647)
chr5 (353-451)||(4410366-4410461)
chr5 (360-449)||(25804375-25804464)
chr5 (188-249)||(20045210-20045271)
chr5 (360-448)||(4236979-4237065)
chr5 (364-448)||(21684294-21684376)
chr5 (364-443)||(16776510-16776589)
chr5 (374-449)||(34476893-34476966)
chr5 (364-447)||(12555757-12555842)
chr5 (395-449)||(15143843-15143897)
chr5 (128-239)||(35430288-35430401)
chr5 (50-176)||(20043077-20043208)
chr5 (364-421)||(20045336-20045393)
chr5 (329-449)||(31543053-31543173)
chr5 (63-177)||(4754196-4754312)
chr5 (395-448)||(16093144-16093199)
chr5 (392-448)||(39397857-39397913)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (50-448)||(16501-16900)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (122-449)||(1492-1818)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (50-367)||(15752-16071)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (104-449)||(14230-14575)
scaffold0131 (104-360)||(15114-15367)
scaffold0131 (402-445)||(15393-15436)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (104-448)||(79280-79631)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (104-448)||(52106-52456)
scaffold0005 (104-301)||(183638-183833)
scaffold0005 (232-449)||(50234-50458)
scaffold0005 (372-442)||(183488-183557)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (104-448)||(4091-4437)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (104-442)||(85325-85667)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (104-448)||(69133-69484)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (104-449)||(79955-80306)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (121-447)||(11315-11649)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (104-301)||(41480-41676)
scaffold0038 (364-449)||(41324-41407)
[»] scaffold0370 (2 HSPs)
scaffold0370 (104-301)||(1450-1645)
scaffold0370 (364-432)||(1309-1376)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (121-244)||(4922-5046)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (104-449)||(6294-6647)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (131-303)||(164-334)
scaffold0267 (374-448)||(400-473)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (121-301)||(29283-29461)
scaffold0068 (364-448)||(29534-29616)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (353-449)||(12714-12809)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (104-251)||(2136-2282)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (374-449)||(22491-22565)
scaffold0140 (374-449)||(24766-24840)
scaffold0140 (131-301)||(22239-22406)
scaffold0140 (131-301)||(24514-24681)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (364-446)||(1294-1375)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (104-289)||(2975-3158)
scaffold0250 (329-445)||(3207-3322)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (187-272)||(57454-57539)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (374-442)||(35965-36033)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (387-439)||(2-53)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37963207 - 37962786
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| |||    
T  37963207 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtatagtttgctcttgacaacaaacaccatggttgtgttgattccccttagaaaacattattgaga 37963108  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||    
T  37963107 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattttt---ttgtaaagttattca 37963011  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963010 tcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 37962911  T
Q  329 gttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37962910 gttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttgattacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat 37962811  T
Q  429 ttttcatcgaattcacaacaagtat 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37962810 ttttcatcgaattcacaacaagtat 37962786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 22874117 - 22874519
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||| ||    
T  22874117 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactatggttgggttgattcaccttggaaaacagtattagga 22874216  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22874217 ttgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 22874316  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctca 327  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  22874317 tcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctct 22874416  T
Q  328 agttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
     ||||||                  |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22874417 cgttgtt------------------ttataacttccatacactttgttttagttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtga 22874498  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22874499 tttttcatcgaattcacaaca 22874519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18800582 - 18800242
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  18800582 gaaacaagggtttagaaatcaagctagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttgggttgattcaccttgggaaacactattagga 18800483  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18800482 ttgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcg 18800383  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| || |||| |  |||||||  |||||| |||||||||| |  ||||||||| | |||||||||     
T  18800382 tcattatagtgaaacggagggctactctctc-cccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctt 18800285  T
Q  327 aagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacac 369  Q
      | ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  18800284 ctgctgttttctacttttgcttgcgattataacttccatacac 18800242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31732912 - 31732631
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataact 360  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaa-ttcgtgtgttctc--tatcttttctctcgctgttttctacttttggtttgtgattataact 31732716  T
Q  361 tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31732715 tccatacactctgttttggttgcttgattataacttgcttcacacatcaa----attattcgtgtgattttttcatcgaattcacaaca 31732631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20146858 - 20146547
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| | || || |||||||||||||||||||      
T  20146858 aaactagggtttgtatagagtttgcccttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgg 20146759  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20146758 gaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 20146659  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    ||||| |||||| | || |||| || | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||      
T  20146658 ggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctctttcttttctctcgttgttttctacttttgc 20146559  T
Q  347 ttgtgattataa 358  Q
    ||||| ||||||    
T  20146558 ttgtgtttataa 20146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17897494 - 17897099
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||       
T  17897494 aaactagggtttgtatagagtttgctcttcgcaacaaacacta-ggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatga 17897396  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  17897395 gaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggat 17897296  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| | | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||      
T  17897295 ggctgctctctc-cccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctctcgttgttttctacttttgc 17897198  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||| ||||||||   ||  ||| |||||||||| ||| |||||   || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17897197 ttgtgtttataactgtcatcaactttgttttggttgcttgattat--tttgctccacacatcaagtattttattgatgt-attttttaacgaattcacaa 17897101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42923702 - 42923350
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42923702 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 42923603  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  42923602 gatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 42923504  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt---tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||   ||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||  ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||    
T  42923503 tttgtgttctctcttcttttctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttttggttgcttgattatctct 42923404  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||  || ||||||||||||||    
T  42923403 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttcacaacgaattcacaacaa 42923350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6259008 - 6258666
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||  ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6259008 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 6258911  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  6258910 gatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 6258812  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | |||||||||||||||  ||||| ||||||   ||| | ||||| |||||||||| | | |||||||||| |    
T  6258811 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttagcttgtgtttataattgttccagacactttgttttggttgcctgattatcacttgc 6258712  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||||||||    
T  6258711 tccacacatcaagtttgttattggtatgttttctcatcgaattcac 6258666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11578285 - 11577957
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  11578285 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaag 11578186  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| || |||| ||||| | |  ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||     
T  11578185 gttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttt 11578086  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
     ||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| ||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||    
T  11578085 ctttctctcgttgttttctacttttggcttgtgttta-aacttccatatactttattttggttgcttgattattacttgttccacacatcaagttt-tta 11577988  T
Q  419 ttgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11577987 ttaatgtgattttttcatcgaattcacaaca 11577957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 17849196 - 17849528
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  17849196 tattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaag 17849295  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | || ||||||| |||||||||   ||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  17849296 gttactcatcattatagtgaaac-gggggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 17849394  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||| ||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||     
T  17849395 tttctctcccgttgttttctacttttggcttgtgtttaaaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttg 17849494  T
Q  416 ttattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17849495 ttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 17849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6264342 - 6263992
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||   || |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  6264342 ttcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccatt 6264243  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  6264242 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 6264143  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctacttt-tatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||    ||||| | ||||   ||| ||||||| |||||||||| | | ||  |||||| |    
T  6264142 tttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttcggcttgtgttaataattgttccatacactttgttttggttgcctgatagtcacttgc 6264043  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6264042 tccacacatcaagtttgttattagtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 6263992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 448
Target Start/End: Original strand, 19007746 - 19008051
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  19007746 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaag 19007844  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt- 344  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||||||     
T  19007845 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctattcatttctctctcgttgttttctacttttg 19007944  T
Q  345 atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaatt 441  Q
      ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19007945 gcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcgaatt 19008044  T
Q  442 cacaaca 448  Q
    |||||||    
T  19008045 cacaaca 19008051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28459383 - 28459038
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| || ||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  28459383 ttcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 28459284  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||     
T  28459283 gatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct--tctctctacctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattc 28459186  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
    |  |||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||  |||||| |||||| |  || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  28459185 ttttgtgttctctctttcttt-ctctccctgttttctacttttggtttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgc 28459087  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28459086 tccacacatcaagtgttttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 28459038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 450
Target Start/End: Original strand, 3022242 - 3022584
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||    
T  3022242 tattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaa 3022340  T
Q  221 gttactcatca---------ttatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgtt 310  Q
    |||||||||||         ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||    
T  3022341 gttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3022440  T
Q  311 ctctttttc-ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacaca 406  Q
    |||| || | |||||||  |||||||||| |||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  3022441 ctctcttcctttttctctcgttgttttctgcttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacaca 3022540  T
Q  407 tcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||| |||||  |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3022541 tcaagtttgttatttgtgtgatctctcaccgaattcacaacaag 3022584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 14837335 - 14837679
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||      ||||||||||||  |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  14837335 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcatt 14837428  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |    
T  14837429 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattct 14837528  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | |||||| |||||||   ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  14837529 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttatacttttggcttgtgtttataattgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgc 14837628  T
Q  399 tccacacatcaagt-ttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14837629 tccacacatcaagtattgttattgatgtgatttctcatcgaattcacaaca 14837679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22287512 - 22287180
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||   || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||     
T  22287512 tattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaac 22287413  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  22287412 gttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 22287314  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctac-ttttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  | |||||||||| ||| | ||||  ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||     
T  22287313 tttctctctcgctgttttctacgtttgacttgtttttataattgttccatacactatgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttg 22287214  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22287213 ttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 22287180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43623773 - 43623423
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43623773 ttcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 43623674  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  43623673 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 43623575  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactct-gttttggttacttaattatcact 395  Q
      ||||||||| | ||||||||||     ||||||||||||||||   || |||||||||   ||| ||||||| |  |||||||| | | ||||||  |    
T  43623574 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttatgattataattgttccatacactttaattttggttgcctgattatctat 43623476  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43623475 tgctccacacatcaagttagttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 43623423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 28196640 - 28197046
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| | || ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  28196640 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 28196739  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  28196740 tgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacg 28196838  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactt 342  Q
     | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || | || ||||  | ||||||||||||    
T  28196839 aatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctactt 28196936  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||   ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||  | |||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28196937 ttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgctggactatcccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcgaa 28197036  T
Q  440 ttcacaacaa 449  Q
     |||||||||    
T  28197037 ctcacaacaa 28197046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 413
Target Start/End: Original strand, 17848523 - 17848814
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  17848523 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaac 17848618  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| | |||    
T  17848619 gttactcatcat-atagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttc 17848716  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctac-ttttatttgtgattataa--cttctatacact-ctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| |||| | ||||||   ||  ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17848717 ttttctctcgctgttttctactttttgtttgcgtttataattgtttcatacactgcgattttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtt 17848814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 322
Target Start/End: Original strand, 40699435 - 40699655
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |    
T  40699435 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaatcctt 40699534  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||| | | || ||| ||||| | ||||||||||    
T  40699535 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaacaaatt 40699634  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  40699635 tcgtgtgttctctctttcttt 40699655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45239170 - 45239003
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  45239170 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccatt 45239071  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  45239070 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggt 45239003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22707869 - 22707594
Alignment:
Q  181 gagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc--ccacactaggttaattt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  22707869 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaattt 22707771  T
Q  279 ggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactt-ttatttgtgattataa--cttctatacactctg 373  Q
    |||||||||| | | |||||||| |  |||||||||| || |||| ||||  | |||||||||||| |   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||    
T  22707770 ggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttctgccttgtgtttataattgttccatacactttg 22707671  T
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22707670 ttttggttgcttgattgttccttactccacacatcaaatttgttattggtgtggttttctcatcgaattcgcaacaa 22707594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5375521 - 5375218
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  5375521 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 5375423  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-tttt 318  Q
     |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  5375422 attactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 5375324  T
Q  319 cttttctcaagttg-ttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
     || ||||  | || |||| ||||||| | ||||  ||||||   ||| ||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5375323 tttctctcttgctgtttttttacttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagttt 5375224  T
Q  415 attatt 420  Q
     |||||    
T  5375223 gttatt 5375218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11739753 - 11739556
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11739753 ttcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccatt 11739654  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  11739653 gatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11739556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 42452843 - 42453038
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42452843 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 42452942  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  42452943 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42453038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 448
Target Start/End: Original strand, 20592313 - 20592484
Alignment:
Q  277 ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttt 376  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20592313 ttggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-ctcttgatattttctacttttgcttgtgattataacttccatacactttgttt 20592411  T
Q  377 tggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20592412 tggttgcttgattattacttgctctacacatcacgtattttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 20592484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21520869 - 21520533
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  |  |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  21520869 tattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 21520770  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||   | |||||||| |  |||||||||| ||      
T  21520769 gttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttcg 21520671  T
Q  320 ttt-tctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactct-gttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag 411  Q
    ||| ||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |  |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  21520670 tttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttaattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaag 21520571  T
Q  412 tttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  21520570 tttgttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaa 21520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40032251 - 40032050
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40032251 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccatt 40032152  T
Q  204 gatattt----cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    ||||| |    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40032151 gatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40032052  T
Q  300 tt 301  Q
    ||    
T  40032051 tt 40032050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19502263 - 19502008
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  19502263 aaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 19502164  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | |     
T  19502163 cgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcg 19502065  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
     ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19502064 aagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 19502008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22407585 - 22407406
Alignment:
Q  166 ggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccac 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  22407585 ggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 22407487  T
Q  266 actaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt 344  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||    
T  22407486 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgatgttttctactttt 22407406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34979772 - 34979437
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34979772 ttcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 34979673  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatct-ctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
     |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||  ||| | | |||| ||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||     
T  34979672 tatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc 34979573  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
    |  |||||||||         ||||  | |||||||||||||| | || || ||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||  |||||    
T  34979572 ttttgtgttctc---------tctc--gctgttttctacttttgacttatgtttataattgttccatacactttattttggttgctttattattccttac 34979484  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  34979483 tccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcattgaattcaca 34979437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45280160 - 45279981
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  45280160 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 45280061  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||    
T  45280060 gttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 45279981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 442
Target Start/End: Original strand, 27104860 - 27105206
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27104860 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27104959  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || |||||||  |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  27104960 gatttctc-tttgtaacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 27105057  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   |||   |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  27105058 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgcatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 27105157  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27105158 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattc 27105206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19504538 - 19504343
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19504538 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 19504440  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19504439 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 19504343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44289261 - 44289064
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| |  || ||||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||    
T  44289261 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgtt 44289162  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  44289161 gatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 44289064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22163109 - 22162869
Alignment:
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtg 308  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| |  ||||    
T  22163109 tcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 22163011  T
Q  309 ttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacac 405  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||||  || ||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  22163010 ttctctctt-cttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgcttataactgttccatacaatttgttttggttgcttgattatcccttgcttcacac 22162912  T
Q  406 atcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22162911 atcaaaattgttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaaca 22162869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13910237 - 13910042
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13910237 ttcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 13910138  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  13910137 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 13910042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15539723 - 15539552
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctg 148  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  |    
T  15539723 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacggg 15539624  T
Q  149 aagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15539623 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Original strand, 20589775 - 20589888
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  20589775 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctcttttgtgaagttac 20589874  T
Q  226 tcatcattatagtg 239  Q
    ||||||||||||||    
T  20589875 tcatcattatagtg 20589888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36559029 - 36558721
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  36559029 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 36558931  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagt 330  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||| ||| | ||      | ||||| || | |||    
T  36558930 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa-ttcctttg------tgttcttctcgc-agt 36558840  T
Q  331 tgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat 428  Q
    ||||||||||||||    | ||  |||    ||| |||| || |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36558839 tgttttctactttttggctcgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttattattggtgtgat 36558741  T
Q  429 ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36558740 ttttcatcgaattcacaaca 36558721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23452413 - 23452234
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  23452413 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 23452314  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  23452313 gatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 23452234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36561306 - 36560980
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  36561306 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 36561208  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||| |||| |||||      |    
T  36561207 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttct 36561109  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    ||||  |||||||||||||||||    | ||  |||    ||| |||| || |||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| || ||||    
T  36561108 tctcgcagttgttttctactttttggctcgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaag-ttgttat 36561010  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36561009 tggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 36560980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 326
Target Start/End: Original strand, 35107302 - 35107580
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |    ||||| | ||| |||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||      
T  35107302 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacag---ggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgg 35107398  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggc---gagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||     || |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  35107399 gaagagattgtgactttgggtagaattagattttga-agacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacg 35107496  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaat-ttcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||| | | |||||| ||| | | ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  35107497 gatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctttcttttctc 35107580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828318
Alignment:
Q  138 ttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattata 236  Q
    ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| |   || ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  237 gtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatt-tggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||| |||||   |||  |||||| || | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttct-tttttcttt 13828318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 35218128 - 35217809
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  35218128 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 35218030  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttcttttctc-a 327  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| ||||||  | |||||      
T  35218029 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttttgttcttctcgc 35217931  T
Q  328 agttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
     |||||||||||||||| | ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  35217930 cgttgttttctacttttgacttgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 35217832  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||| |||  |||||||||||    
T  35217831 atttttgatcagattcacaacaa 35217809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 42064577 - 42064773
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42064577 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 42064676  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt-taatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  42064677 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42064773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45332346 - 45332179
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  45332346 gagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-tttgtaaaggtactcatc 45332248  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    | |||||||||   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||    
T  45332247 a-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Original strand, 43139393 - 43139580
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 160  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  43139393 tgtagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgaga 43139492  T
Q  161 ttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagg 248  Q
     ||| |||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43139493 ctttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggtacagagg 43139580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462789
Alignment:
Q  168 tagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacac 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||| ||| | ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  268 taggttaa-tttggactgaactggat-aaacaaatttcgtgtgttctct-ttttcttt-tctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--c 359  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| | ||| |||     |||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||       
T  7462978 taggtcaattttggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttctctttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattg 7462879  T
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  7462878 tttcatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttatcgatgtggttttctcaacgaattcgcaaca 7462789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27136354 - 27136106
Alignment:
Q  71 ttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggt 168  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||| |  |||| ||    
T  27136354 ttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagt 27136255  T
Q  169 agaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacac 267  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||       ||||  ||||||||| || |||||| || | ||    
T  27136254 agaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc-------tagtagaacagagggttgttctctccccaaaac 27136162  T
Q  268 taggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    || || | | |||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27136161 taagtcagtattggaccgaactgagtaaacaaattttatgtgttctctttttcttt 27136106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45332095 - 45332019
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45332095 tgttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 45332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24162357 - 24162220
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   || ||||| |||||| |    
T  24162357 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-tatagtggattggatggctgctctctccc 24162260  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||  ||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  24162259 ccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 24162220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45238916 - 45238841
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45238916 ttttggttgcttgactatcgcttggtccacacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 45238841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35215751 - 35215433
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  35215751 gagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 35215653  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttcttttctc-a 327  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| ||||||  | |||||      
T  35215652 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttttgttcttctcgc 35215554  T
Q  328 agttgttttctactttt-atttgtgatt-ataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgt 425  Q
     |||||||||||||||| | ||||  || || | ||| |||  || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||    
T  35215553 cgttgttttctacttttgacttgtatttaattatttc-atatgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt 35215456  T
Q  426 gatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||  ||||||||||    
T  35215455 gatttttgatcagattcacaaca 35215433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 358
Target Start/End: Original strand, 8173565 - 8173646
Alignment:
Q  277 ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  8173565 ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcactctttcttttctctcgttgttttttacctttgtttgtgtttataa 8173646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11739505 - 11739420
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| ||||||  || ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11739505 atacactttgtttttatttcttgactatcccttgctctacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 11739420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19504272 - 19504177
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgtttt-ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19504272 ttataacttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 19504177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45279925 - 45279848
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  45279925 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaattc 45279848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Original strand, 15693992 - 15694101
Alignment:
Q  132 agtctcttggtcacctgaagagattgaggt-tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||   || |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15693992 agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcat 15694091  T
Q  230 cattatagtg 239  Q
    |||| |||||    
T  15694092 cattttagtg 15694101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19501937 - 19501842
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgtttt-ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19501937 ttataacttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 19501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 259
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871032
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctc 23871032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38414149 - 38414027
Alignment:
Q  329 gttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgt 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |  || ||||||| |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||| ||| ||| || ||| |||    
T  38414149 gttgttttctacttttaccttgtgtttataattattccatacactttgttttcgttgcctaattatcacgtgctccacacaccaattttgtt-ttggtgt 38414051  T
Q  426 gatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38414050 gatttttcatggaattcacaacaa 38414027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41303121 - 41303074
Alignment:
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41303121 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagagctgttctc 41303074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 42453818 - 42453891
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42453818 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 42453891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13909969 - 13909884
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttc-atcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13909969 atacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtgactttttcgatcgaagtcacaaca 13909884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20146512 - 20146458
Alignment:
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20146512 ttacttcacacatcaagtattttattggtgtgatttttcaacgaattcacaacaa 20146458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24162147 - 24162063
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24162147 atacacttttttttggttgcttgattatctctttctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgtattcacaaca 24162063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22405820 - 22405769
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  22405820 ctccacacatcaagtttgttattgatgtgttttctcgttgaattcacaacaa 22405769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27583532 - 27583477
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgag 159  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27583532 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Original strand, 35028642 - 35028805
Alignment:
Q  110 ttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatat 208  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||   |||||||||||||| |   | | ||| |||||||||| |  || ||||    
T  35028642 ttggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatat 35028741  T
Q  209 ttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
     |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| ||| |||| |||||| |||  |||||||    
T  35028742 ctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctctcccccttactaggt 35028805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539370
Alignment:
Q  274 aatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctataca 368  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||| |  || |||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttttgcttgtgtttataattgttcaataca 15539454  T
Q  369 ctctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat-----ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||      ||||||||||||||||||||    
T  15539453 ctttgttttgattgcttgataatc-cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgaggtgagttttcatcgaattcacaaca 15539370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23452150 - 23452084
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23452150 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattc 23452084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42923348 - 42923292
Alignment:
Q  393 acttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||  || ||||||||||||||    
T  42923348 acttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttcacaacgaattcacaacaa 42923292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 21482377 - 21482798
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttgt-tcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||  ||| ||||| ||| | ||||||||    
T  21482377 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggttgagtcaccttgggaaacactattaaga 21482476  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21482477 ttgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 21482576  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21482577 tcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctc 21482676  T
Q  329 gttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacac--tctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21482677 gctgttttctacttttgtttgtgattataacttccatacactttattttttggttgcttcattatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtg 21482776  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21482777 atttttcatcgaattcacaaca 21482798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Original strand, 21480569 - 21480991
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||| |||| ||||| ||| | |||||  |    
T  21480569 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtatggagtttgctcttggcaacaaacactaggtttgggttgattcaccttgggaaacactattagaa 21480668  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21480669 ttgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 21480768  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  21480769 tcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggtaaaaaaaattcgtgtgttctctctttcttttctctc 21480868  T
Q  329 gttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctg--ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21480869 gttgttttcttcttttgtttgtgattataacttccatacactttgttttttggttgtttgattgtcacttactccacacatcaagtttattattggtgtt 21480968  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21480969 atttttcatcgaattcacaacaa 21480991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 449
Target Start/End: Original strand, 15956031 - 15956444
Alignment:
Q  37 gggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtc 135  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | | ||| |||||| ||    
T  15956031 gggtttagaaatcaaacgatggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatc 15956130  T
Q  136 tcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattat 235  Q
    | ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15956131 ttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 15956230  T
Q  236 agtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgtt 334  Q
    |||||||| ||||| |  |||||| | || | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |  ||| ||||| | ||||||||||  ||||||    
T  15956231 agtgaaacggagggtttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctc-tcttcttttctctcgttgtt 15956329  T
Q  335 ttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttca 434  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  || | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15956330 ttctactttcgtttgtgattataactttcatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttca 15956429  T
Q  435 tcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||    
T  15956430 tcgaattcacaacaa 15956444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 168 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2467978
Alignment:
Q  168 tagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacac 267  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  268 taggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctata 366  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgttgttttctaattttgttttgtgattataacttcccta 2468060  T
Q  367 cactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2468059 cactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 2467978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13858736 - 13858334
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| |    
T  13858736 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggtta 13858637  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858636 cgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 13858538  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||    
T  13858537 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattctttgtgttctccctttctttctctca--ctgttttctacttt 13858440  T
Q  344 t-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |   ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  13858439 tggcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttcttattggtgtgatttttcatcgaattt 13858340  T
Q  443 acaaca 448  Q
    ||||||    
T  13858339 acaaca 13858334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 431
Target Start/End: Original strand, 31162294 - 31162683
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt-gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacc 146  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  ||| | |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31162294 caaattagtgtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactaacgttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacc 31162393  T
Q  147 tgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     |||||||||| |  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31162394 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacaga 31162493  T
Q  247 gggctgatctct--ctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctc-tttttcttttctcaagttgttttctactt 342  Q
    |||||| |||||  | |||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31162494 gggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctcttttttcttttctctcgttgttttctactt 31162593  T
Q  343 tt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
    ||   ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  31162594 ttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttacttaattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 31162683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15185850 - 15185564
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  15185850 tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctccc 15185751  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15185750 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctttcttt-ctctcgttgttttctacttttgtttatgattataact 15185652  T
Q  361 tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15185651 tccatacactttgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcaccgaattcacaaca 15185564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14419384 - 14419034
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14419384 ttcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14419285  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  14419284 aatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 14419185  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |    
T  14419184 tttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggtttcctgattatcacttgc 14419085  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14419084 tccatacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 14419034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 451
Target Start/End: Original strand, 25952662 - 25953013
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||    
T  25952662 ttcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcatt 25952761  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  25952762 gatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 25952861  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||   ||||| |||||| | ||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  25952862 tttgtgttctctctttcttttctctcgccgttttctacttttggattgtgtttataattgcttcatacactttattttggttgcttgattatcactttct 25952961  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagt 451  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25952962 ccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaagt 25953013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27107090 - 27106754
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  27107090 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccata 27106991  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |    
T  27106990 gatatctcttttgtagggttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattat 27106892  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcca 402  Q
      |||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||    
T  27106891 tttgtgttttctctttcttt-ctctcgttgttttctacttttgtctgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcca 27106793  T
Q  403 cacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27106792 cacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 27106754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3005881 - 3005486
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| | || |||||  ||| ||||  |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||      
T  3005881 caaactagagtttgtatagagtttgctcttaacaacaaacaatagggttggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacgg 3005782  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  3005781 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggag 3005682  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    || || |||||| |||| || |||| |  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||  |||| ||| ||| |||      
T  3005681 gggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa-ttcttgtgttctccctttcttctctc--gttg-tttgtaccttttc 3005586  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3005585 ttgtatttataacttccatacactttg-tttggttgtttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaa 3005488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 431
Target Start/End: Original strand, 36865621 - 36866012
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| | || ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||   ||    
T  36865621 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt---ca 36865717  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36865718 cgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacg 36865817  T
Q  245 gagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttc--tctttttct-tttctcaagttgttttcta 339  Q
    ||  |||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  36865818 gaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctttttttctttctctcgttgttttcta 36865917  T
Q  340 ctttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
    |||||   || || ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36865918 cttttggcttttgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattgatgtggtttt 36866012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 41382821 - 41383155
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||     
T  41382821 tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 41382920  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  41382921 gttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 41383019  T
Q  320 ttttctc---aagttgttttctactt-ttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    |||||||     |||||||||||||| |   ||||| ||||||   ||| ||| ||| ||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41383020 ttttctctcgctgttgttttctacttctggcttgtgtttataattgttccataaactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 41383119  T
Q  414 tattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  41383120 tgttattggtgtggtttttcatcgaactcgcaacaa 41383155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30480696 - 30480365
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30480696 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 30480597  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  30480596 gatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30480498  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||  | ||||||||||||||   ||||  ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||    
T  30480497 tttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttac 30480398  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  30480397 tccacacatcaaatttgttattggtgtcatttt 30480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 15072852 - 15073202
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagaga-ttgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15072852 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccat 15072951  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||     
T  15072952 tgatatctcttttgtaacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatta 15073050  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
    |  ||||||||| | ||||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||| || ||| | |||| ||    
T  15073051 ttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttgattgcttgactatccct 15073149  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15073150 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 15073202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 15068123 - 15068473
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||   ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15068123 ttcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 15068222  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |    
T  15068223 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattct 15068321  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      ||||||| |   ||||||||||     ||||||||||||||||   ||||| || |||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| |||    
T  15068322 tttgtgttcac-ccttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttgtaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatccctt 15068420  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
      |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15068421 gttccacacatcaagtttgttgttggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 15068473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 32339451 - 32339647
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32339451 ttcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 32339550  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  32339551 gatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaatt 32339647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28251760 - 28251410
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  28251760 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccatt 28251661  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  28251660 gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28251562  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactt-ttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||||| ||  |||||||     |||||||||||||| |   ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| | | |||||  |||    
T  28251561 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttgtggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattcctt 28251462  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28251461 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 28251410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 4424177 - 4424356
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  4424177 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaac 4424276  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
     |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  4424277 attactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4424356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 322
Target Start/End: Original strand, 31035282 - 31035480
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  31035282 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttt-gtaaagttac 31035380  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacac--taggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31035381 tcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt 31035480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 290
Target Start/End: Original strand, 27911097 - 27911340
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  27911097 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 27911196  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27911197 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 27911295  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  27911296 gagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttggaccgaactgg 27911340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 290
Target Start/End: Original strand, 27957516 - 27957759
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  27957516 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 27957615  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27957616 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 27957714  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  27957715 gagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttggaccgaactgg 27957759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 15809360 - 15809556
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||| | |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15809360 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 15809459  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15809460 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15809556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 301
Target Start/End: Original strand, 41384904 - 41385082
Alignment:
Q  122 attaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaag 221  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| || |||||||||| |    
T  41384904 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 41385003  T
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  41385004 ttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 440
Target Start/End: Original strand, 14807893 - 14808244
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14807893 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14807992  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctg----------atctctctcccacactaggttaatttggactgaactggata 293  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||           |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |     
T  14807993 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 14808091  T
Q  294 aacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaat 388  Q
    |||||||| |  |||||||||| || | || ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| ||    
T  14808092 aacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgat 14808191  T
Q  389 tatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaat 440  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14808192 tatccgttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcgaat 14808244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 3874152 - 3874348
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3874152 ttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3874251  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3874252 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3874348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Original strand, 1225308 - 1225548
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  1225308 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcatt 1225407  T
Q  204 gatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||     
T  1225408 gacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 1225506  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    |  ||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  1225507 ttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttctactttt 1225548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 608893 - 609072
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  608893 tattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 608992  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  608993 gttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 609072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541255
Alignment:
Q  200 cattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | || |||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa-aaa 33541410  T
Q  300 tttcgt--gtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
    |||| |  ||||||||| || |||| ||||  | || |||||||||||   ||||| |||||| |  || ||||||| | ||||| || ||| ||||||     
T  33541409 tttcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgatttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttgattgcttgattatcc 33541310  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33541309 cttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttgatcgaattcacaaca 33541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 43082143 - 43082467
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  43082143 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 43082241  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||      |    
T  43082242 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgttct 43082340  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    |||| | ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  43082341 tctcgacgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttatt 43082439  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||    
T  43082440 ggtgtgatttttgatcagattcacaaca 43082467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Original strand, 43079772 - 43080097
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  43079772 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 43079870  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-------tctttttcttt 322  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||       ||||||  | |    
T  43079871 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttttgttct 43079969  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || |||||    
T  43079970 tctcgccgttgttttctacttttgacttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttaattatccattgctccacacatcaag-ttgttatt 43080068  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||| |||  |||||||||||    
T  43080069 ggtgtgatttttgatcagattcacaacaa 43080097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 43530257 - 43530453
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  43530257 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccatt 43530356  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  43530357 gatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43530453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28283395 - 28283061
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||| | || |||||||     
T  28283395 tattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaac 28283297  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||  | |||    
T  28283296 gttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttc 28283199  T
Q  320 tt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    ||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  ||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  28283198 tttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttatttttttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaa 28283099  T
Q  411 gtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28283098 g-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 28283061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5372371 - 5372185
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| |  |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  5372371 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcatt 5372272  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctct-ctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5372271 gatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactg 5372185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22684849 - 22684650
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatcc--- 200  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       
T  22684849 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaat 22684750  T
Q  201 attgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22684749 attgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 22684651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 314
Target Start/End: Original strand, 6376149 - 6376341
Alignment:
Q  123 ttaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||   | ||||| |||||||| | |  ||||||| || |||||||||    
T  6376149 ttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-tttgtaaag 6376247  T
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||| | | |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  6376248 ttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgttctct 6376341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 14477359 - 14477522
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| |||   ||||| |||||||||||||||| |    
T  14477359 aaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggtta 14477458  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatat 208  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477459 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31578449 - 31578221
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||||   || |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  31578449 gattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttac 31578350  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| || | ||||||| | | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||   ||    
T  31578349 tcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgctctctctttc---tc 31578253  T
Q  325 tcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31578252 tc--gttgttttctacttttgcttgtgtttataa 31578221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 27827128 - 27827480
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27827128 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27827227  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  27827228 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 27827325  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   |||||||||||||||| | ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||     
T  27827326 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcc 27827425  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27827426 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 27827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 27829439 - 27829634
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27829439 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27829538  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  27829539 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 27829634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31573963 - 31573794
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 160  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  31573963 tgtagagttttctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 31573864  T
Q  161 ttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
     ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31573863 ctttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 448
Target Start/End: Original strand, 44720994 - 44721337
Alignment:
Q  112 ggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttc 211  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  44720994 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 44721093  T
Q  212 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgtt 310  Q
     ||||||| | ||||||||| ||||||| |   ||| |||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  44721094 -tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 44721191  T
Q  311 ctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    ||  | |||||       |||||   |||||||||||||||| | ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  44721192 cttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttgacttgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactcc 44721291  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| || |||  ||||||||||    
T  44721292 acacatcaag-ttgttattggtgtgattattgatcagattcacaaca 44721337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 14477656 - 14477741
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14477656 atacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 14477741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872300
Alignment:
Q  184 acttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggact 283  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||           |||||||     
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctg--ctctctccca-----------tttggacc 35872468  T
Q  284 gaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataacttct--atacactctgttttgg 379  Q
    ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||   ||||| |||||| || |  ||||||| | ||||||    
T  35872467 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-cttttctctc-ttgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 35872370  T
Q  380 ttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35872369 ttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 35872300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214108
Alignment:
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttta 345  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||| ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||     
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttcctttctctctcgttgttttctacttttg 37214215  T
Q  346 t-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
      ||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  37214214 gcttgtgtttataattgttctatacactttgttttggttgcttgcttatctcttactccatacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcaaattc 37214115  T
Q  443 acaacaa 449  Q
    |||||||    
T  37214114 acaacaa 37214108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24873346 - 24873039
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  24873346 gagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 24873248  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagt 330  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||| ||  | |||||||||| ||||        ||||| || |  ||    
T  24873247 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatttc-tgtg--------ttcttctcgc-cgt 24873159  T
Q  331 tgttttctac--ttttatttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
    ||||||||||  |||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  24873158 tgttttctaccttttggcttgtatttataactttcatacactttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 24873060  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24873059 tttttcatcgaattcacaaca 24873039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Original strand, 181702 - 181795
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  181702 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatgactgctctctc 181795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 323
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833910
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttgg 280  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||| |||||| | || |||| || |  |||||    
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  281 actgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctttt 323  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16833869 ac-gaactgggtaaacaaaattcgtgtgttctctctctctttt 16833910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 18813024 - 18813219
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||  ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18813024 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18813123  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  18813124 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 18813219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 450
Target Start/End: Original strand, 27911504 - 27911569
Alignment:
Q  385 taattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27911504 taattatcacttgctccacacatcaagttttttattggtgtgatttttcaacaaattcacaacaag 27911569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 450
Target Start/End: Original strand, 27957923 - 27957988
Alignment:
Q  385 taattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27957923 taattatcacttgctccacacatcaagttttttattggtgtgatttttcaacaaattcacaacaag 27957988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3883519 - 3883436
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3883519 atacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagttg-ttattgatgtgatttttcatcgaattcgcaaca 3883436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 450
Target Start/End: Original strand, 43530522 - 43530611
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43530522 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcattgaattcgcaacaag 43530611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 3874400 - 3874488
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3874400 ttccatacactttgttttggttgcttggttatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcaacgaattcacaacaa 3874488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 18810850 - 18811045
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  || |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18810850 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18810949  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||    
T  18810950 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 18811045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2468378 - 2468261
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtaca----gtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | ||||    
T  2468378 gaaacaaggatttagaaatcaaactacggtttgtatatatagagtttgctcttggcaacaaatactagggttgggttgattcaccttgggaaacactatt 2468279  T
Q  125 aagattgagtctcttggt 142  Q
    |  |||||||||||||||    
T  2468278 agaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 27829703 - 27829790
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27829703 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 27829790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 18811129 - 18811203
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18811129 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 18811203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 322
Target Start/End: Original strand, 3896063 - 3896183
Alignment:
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||||| |||| | ||| | | | |||||  ||| ||  ||||||||||    
T  3896063 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatt 3896162  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  3896163 tcgtgtgttctctatttcttt 3896183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 15809629 - 15809711
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15809629 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 15809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31566630 - 31566533
Alignment:
Q  224 actcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31566630 actcatcattataatggaacagagagctg--ctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctctttcttt 31566533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Original strand, 183251 - 183310
Alignment:
Q  389 tatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  183251 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaaca 183310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2467929 - 2467879
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2467929 ctccacacatcaagtttattattggtgtga-ttttcatcgaattgacaacaa 2467879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 272
Target Start/End: Original strand, 17847684 - 17847828
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  17847684 tattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaa 17847782  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
    |       |||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17847783 a-------atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggt 17847828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2467830 - 2467780
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2467830 ctccatacatcaagtttattattagtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 2467780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5372076 - 5372025
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5372076 ctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttttatcgaattcaaaaca 5372025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419787
Alignment:
Q  205 atatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct 260  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctct 14419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33021018 - 33020963
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttctt-ttgtaaagttactcatcattata 236  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33021018 agactgattcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattata 33020963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2267193 - 2267144
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2267193 gattgagtctcttggtcacatgaagagatt-aggacttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 4424425 - 4424513
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgtttt-ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4424425 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacaccaagttg-ttattggtgtgatttt-catcgaattcacaacaa 4424513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 18813303 - 18813376
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18813303 ttttggttgcttgattatctcttgctctacatatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 18813376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 450
Target Start/End: Original strand, 16833977 - 16834026
Alignment:
Q  401 cacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16833977 cacacatcaagtattttattggtgtgacttttcaacgaattcacaacaag 16834026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Original strand, 17847928 - 17848002
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  17847928 tgttttggttgcttaatta--attttttccacacatcaagtattttattggtgtgattttttaacgaattcacaaca 17848002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13985256 - 13985131
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagatt-gaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | |  ||||||||||||||||   || ||| |||||||||| || |||  |  ||| || |||    
T  13985256 tattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaa--tctcttataa 13985159  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13985158 agttacccctcattatagtggaacagag 13985131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 31035152 - 31035200
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttg 98  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  31035152 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttg 31035200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 17795249 - 17795669
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  17795249 gaaacaagggtttagaaatcaaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgggttgattcactttgggaaaaactattagga 17795348  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17795349 ttgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 17795448  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctca 327  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||| || | ||||||| |||||| || ||| | | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  17795449 tcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctct 17795548  T
Q  328 agttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17795549 cgttgttttctacttttgtttgtgattataacttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtga 17795648  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17795649 tttttcatcgaattcacaaca 17795669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 19103689 - 19104109
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  19103689 gaaacaagggtttagaaatcaaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgggttgattcactttgggaaaaactattagga 19103788  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19103789 ttgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 19103888  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctca 327  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||| || | ||||||| |||||| || ||| | | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  19103889 tcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctct 19103988  T
Q  328 agttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19103989 cgttgttttctacttttgtttgtgattataacttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtga 19104088  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19104089 tttttcatcgaattcacaaca 19104109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 449
Target Start/End: Original strand, 25635377 - 25635789
Alignment:
Q  36 agggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgtt--gttcaacttggaaaatattattaagattgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |  ||||| ||||| ||| | ||||| |||| ||    
T  25635377 agggtttagaaatcaaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttag 25635476  T
Q  134 tctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcatt 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25635477 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatt 25635576  T
Q  234 atagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgt 333  Q
    || ||||||||||||| || |||||| ||    |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||    
T  25635577 atggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctcttctttctttcactcgttgt 25635676  T
Q  334 tttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc 433  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||  ||  |||| ||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||    
T  25635677 tttctacttttgcttgtgtttataactgttacccact-tgtattggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtat-ttattagtgtga-ttttc 25635773  T
Q  434 atcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||    
T  25635774 atcgaattcacaacaa 25635789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28761678 - 28761287
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcac 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || | ||||   | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  28761678 aaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttac 28761579  T
Q  146 ctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacag 245  Q
      ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28761578 aggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgg 28761479  T
Q  246 agggctgatctctctcccacactaggttaa-tttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||||             |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28761478 aggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaatt------------cttttgttttctctcgttgttttctactttt 28761391  T
Q  345 atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
      |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28761390 gcttgtgattataatttccatacactttattttggttgtttgattatcacttgctccacacatcaagattattattggtgtgatttttcatcgaattcac 28761291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 31151355 - 31151755
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || | ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  31151355 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 31151454  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  31151455 gaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggag 31151552  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaattt-ggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgtttt-ctactttt 344  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||| ||    
T  31151553 ggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctctt-cttttctctcgctgtttttctactctt 31151651  T
Q  345 atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31151652 acttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtat-ttattggtgtgatttttcatcgaattcac 31151750  T
Q  445 aacaa 449  Q
    |||||    
T  31151751 aacaa 31151755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 1313416 - 1313822
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| || |    
T  1313416 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagtta 1313515  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  1313516 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 1313614  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1313615 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgttgttttctacttt 1313713  T
Q  344 t-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaa 439  Q
    | | ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1313714 tgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaa 1313813  T
Q  440 ttcacaaca 448  Q
    ||| |||||    
T  1313814 ttcgcaaca 1313822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561640
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| ||||  | ||| ||||  |||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttcaggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgt 561925  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  561924 gaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaag 561825  T
Q  248 ggctgatctctctc-ccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||     
T  561824 ggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttctctctttctcttctctcgatgttttctacttttg 561725  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  561724 cttgtgtttataacttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttactccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 561640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 3314750 - 3315101
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3314750 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3314849  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  3314850 gatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 3314949  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctac-ttttatttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcactta 397  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | |||||||||| |||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||     
T  3314950 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacgtttggcttgtgtttataattgttccatacactttgcttttggttgcttgattatcccttg 3315049  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3315050 ctccacacatcaagtttattattggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaa 3315101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 23633537 - 23633863
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||    
T  23633537 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaa 23633635  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  23633636 gttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttc 23633734  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctactt-ttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
     ||||||  | |||||||||||| |   ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||| ||| | |||    
T  23633735 -tttctctcgatgttttctacttgtggcttgtgtttataaattccatacactttgttttggttgcttgattttcacttgcttcacacatctagtat-tta 23633832  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23633833 ttggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 23633863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5926938 - 5926611
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||     
T  5926938 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaag 5926839  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct 320  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||||| ||    
T  5926838 gttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctcttttcct 5926740  T
Q  321 tt-tctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    || ||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||   |||  |||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||| ||    
T  5926739 ttctctctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataattgttccttacactttgttttggttacttgattattccttacttcacacatgaagtttgtt 5926640  T
Q  418 attgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5926639 attggtgtgagttttcatcgaattcacaa 5926611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 53917914 - 53917505
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  53917914 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 53917815  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  53917814 cgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 53917716  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctac 340  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||     ||||||||||||    
T  53917715 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttgttttctac 53917617  T
Q  341 tttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcg 437  Q
    ||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  53917616 ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttttcatcg 53917517  T
Q  438 aattcacaacaa 449  Q
    | ||| ||||||    
T  53917516 atttcgcaacaa 53917505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43421665 - 43421259
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | |||||  ||||||||||||||| |    
T  43421665 aaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 43421566  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||| |||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43421565 cgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaaca 43421467  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||    
T  43421466 gatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttatacttt 43421368  T
Q  344 t-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    |   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43421367 tggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatatcttgctccacacatcaactttgttattggtgtgatttttcatcgaat 43421268  T
Q  441 tcacaacaa 449  Q
    || ||||||    
T  43421267 tcgcaacaa 43421259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 53915672 - 53915338
Alignment:
Q  119 attattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgta 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53915672 attattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 53915573  T
Q  219 aagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttt 317  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| | |    
T  53915572 atgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tct 53915475  T
Q  318 tcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag 411  Q
    |||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  |||||||  ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  53915474 tcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacacttggttttggttgcttgactatcccttgctccatacatcaag 53915375  T
Q  412 tttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53915374 tttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 53915338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 6484426 - 6484773
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6484426 ttcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccatt 6484525  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  6484526 gatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 6484624  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||| | || || ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |    
T  6484625 tttgtgttctc-tcttattctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgc 6484723  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  6484724 tccacacatcaaatttgttattagtgtgattttttattgaattcacaaca 6484773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43423713 - 43423307
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  43423713 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 43423614  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  43423613 cgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaact 43423515  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    ||| |||| |||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||    
T  43423514 gagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttctacttt 43423416  T
Q  344 t-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    |   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  43423415 tggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaactttgttattggtgtaatttttcatcgaat 43423316  T
Q  441 tcacaacaa 449  Q
    || ||||||    
T  43423315 tcgcaacaa 43423307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 441
Target Start/End: Original strand, 45883005 - 45883350
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  45883005 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 45883104  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  45883105 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 45883203  T
Q  302 tcgtgtgttctct----ttttcttttctcaagttgttttctactt-ttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
    |  ||||||||||    | ||||||||||  | |||||||||||| |   ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  45883204 ttttgtgttctctcttctcttcttttctcttgctgttttctacttctggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttaactatccc 45883303  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45883304 ttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 45883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 446
Target Start/End: Original strand, 4666580 - 4666926
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagaga--cttattcttgtaatcca 201  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  4666580 ttcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatcca 4666679  T
Q  202 ttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4666680 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 4666776  T
Q  302 -tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
     |  |||||||||| || | || ||||  | |||||| |||||||  |||||  ||||||   ||  ||||||| | |||||||| | | || |||||||    
T  4666777 cttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttatacttttggtttgtttttataattgtttcatacactttattttggttgcatgataatcactt 4666876  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4666877 actccacacatcaaatttattattggtgtgatttttcttcaaattcacaa 4666926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 18162729 - 18163081
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  18162729 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 18162828  T
Q  204 gatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa-tt 301  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| ||    
T  18162829 gatatttattttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac-gaactgtgtcaacaaattt 18162926  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagtt---gttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcac 394  Q
    |  |||||||||| ||  |||||||  | |   |||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| |    
T  18162927 ttttgtgttctctcttctttttctctcgctgcagttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccc 18163026  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18163027 ttactccacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaattcataacaa 18163081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28102176 - 28101847
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28102176 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 28102077  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || ||||| |||||| || |  |||||| |||||||||  |||| | | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  28102076 gttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 28101978  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||   |||||  | ||| | |||| |||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28101977 tttctctctcgctgttttctacttttgggttgtg--tttaattgctatccactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttat 28101880  T
Q  417 tattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28101879 tattggtgtaatttttcatcgaattcacaacaa 28101847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 880618 - 880302
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  880618 attgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 880519  T
Q  228 atcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    |||| |||||| |||  |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| || |||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||    
T  880518 atca-tatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctc 880421  T
Q  327 aagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgat 423  Q
      | ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||   ||| ||||||||||||||||| |||| | |    
T  880420 tcgctgttttctacttttggtttgtgattataactgttccatacactttgttttggttgcttgattaatccttgctccacacatcaagtttgttatgggt 880321  T
Q  424 gtga-tttttcatcgaatt 441  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  880320 gtgattttttcatcgaatt 880302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13420450 - 13420222
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  13420450 gaaacaagggttta--aatcaaactagggtttgtatagagttttctctaggcaacaaacactagggttgagttgattcaccttgggaaacactattagga 13420353  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13420352 ttgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactca 13420253  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    | |||||| || ||| ||| |||| ||||||    
T  13420252 ttattataatggaacggagagctgctctctc 13420222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32264172 - 32263881
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct 260  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||     
T  32264172 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 32264073  T
Q  261 cccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa 358  Q
    |||| |||||||  ||||||||  |||||||| ||||| | |  |||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  32264072 cccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataa 32263973  T
Q  359 --cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
       ||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32263972 ttgttccatacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgatttttcttcgaattcacaaca 32263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 53597246 - 53597645
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgt-gttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||       
T  53597246 aaactaggggttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatga 53597345  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  53597346 gaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggag 53597445  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    || || |||||| | || ||||||| | | |||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||||||| ||||      
T  53597446 ggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggtaagctaatttcgtgtgttctctcctttctttctctcgttgttttctatttttgc 53597545  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
    ||||| |||||| ||||   |||  || | |||||| ||| |||||   || |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53597546 ttgtgtttataa-ttcttcccacgttgatattggttgcttgattat--tttgctccacacataaagtattttattggtgtga-ttttcatcgaattcaca 53597641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47149069 - 47148745
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  47149069 tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatc 47148970  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| || ||||||| | ||||| | | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  47148969 gttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctcttcc 47148871  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||||||  || ||||||       |||||||||||||||     
T  47148870 tttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgattatc-------ccacacatcaagtttg 47148778  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47148777 ttattggtgtgagttttcatcaaattcacaaca 47148745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 42990370 - 42990718
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  42990370 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 42990469  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  42990470 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 42990568  T
Q  303 cgtgtgttctct----ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcactta 397  Q
      ||||||||||    ||||||| || |  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| | | |||||| |||     
T  42990569 tttgtgttctctctccttttcttctcgc-cgttgttttctacttttggcttgtatttataacttacatacactttgttttggttgcctgattatcccttg 42990667  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42990668 ctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 42990718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1626874 - 1626543
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1626874 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccatt 1626775  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  1626774 gatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattct 1626676  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  ||||||||  |||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| |    
T  1626675 tttgtgttctctcttcctttctctctcgttgtttttcacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgtttttgttgcttgattattccttgc 1626576  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1626575 tccacacatcaagtttgttattggtgtggtttt 1626543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 36011910 - 36012243
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  36011910 tattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 36012009  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||      
T  36012010 gttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttct 36012108  T
Q  320 ttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    |||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36012109 ttttctctcgctgttgttttctacttttcgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccatacatcaagtt 36012208  T
Q  414 tattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36012209 tgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 36012243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51674957 - 51674608
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51674957 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 51674858  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  51674857 gatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattct 51674759  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattata--acttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||  | ||||||||||||||   ||||| |||||    ||| |||| | ||  ||||||| ||| |||||  ||| |    
T  51674758 tttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttatatttgttccatacccacttgtttggttgcttgattattccttgc 51674659  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51674658 tccatacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaattcacaaca 51674608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4308472 - 4308122
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4308472 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4308373  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  4308372 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 4308274  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||  |||    
T  4308273 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgttggattattcctt 4308174  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  4308173 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 4308122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 449
Target Start/End: Original strand, 25634027 - 25634295
Alignment:
Q  178 cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||  ||| ||||||  ||||    
T  25634027 cgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatt 25634126  T
Q  278 tggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgtttt 377  Q
    || || ||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||  || |||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| |  ||  |||| ||| ||    
T  25634127 tgcaccgaactaggtaaacaaattttgtgtgttctctcctttcttactcttgttgttttctacttttgcttgtgtttataattgttacccact-tgtatt 25634225  T
Q  378 ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25634226 ggttgcttgattattacttgctccccacattaagtat-ttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 25634295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27101372 - 27101026
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  27101372 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 27101273  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27101272 gatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattct 27101174  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctac-ttttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||||| || ||||||||     |||||||||||| ||||  ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| | | |||||   ||    
T  27101173 tttgtgttctctcttccttttctcttgctgttgttttctactttttgcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattcatt 27101074  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcac 444  Q
     |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27101073 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcac 27101026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 15780937 - 15781293
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  15780937 ttcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 15781036  T
Q  204 gata----tttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaggg---ctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaac 296  Q
    ||||    | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  15781037 gatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 15781136  T
Q  297 aaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattat 391  Q
    ||||| |  ||| |||||| || | || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||  | ||| |||||    
T  15781137 aaattcttttgttttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataactgttccatacactttattttgcctgcttgattat 15781236  T
Q  392 cacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15781237 cccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttccatcgaattcacaaca 15781293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36871549 - 36871148
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| || | ||||  | ||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||      
T  36871549 aaactagggcttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttaggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacgg 36871450  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     ||||||||| |  ||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  36871449 aaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctcttt-gtaaagttaatcatcattatagtggaacgga 36871351  T
Q  247 gggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttcta-ctttt 344  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| |||||    
T  36871350 gggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgttctctctttattttctctcgctgttttctatctttt 36871251  T
Q  345 atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattca 443  Q
      ||||| ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  36871250 gcttgtgtttataactgtcacccact-tgttttggttgcttgattat-tcttgctccacacatcaagtat-ttatcggtgtgattttttcaacgaattca 36871154  T
Q  444 caacaa 449  Q
    ||||||    
T  36871153 caacaa 36871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18099361 - 18099009
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18099361 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18099262  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||| |    
T  18099261 gatttctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattct 18099163  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||||||  || ||||     ||||||||||||||||   ||||| ||| ||   ||| ||||||| || |||| ||| ||| |||||| ||    
T  18099162 tttgtgttctcttttctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttacaattgttccatacactttgatttttgttgcttgattatccct 18099063  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18099062 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcccaacaa 18099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27635791 - 27635504
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27635791 tttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct----ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgatta 355  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||||    | ||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| |||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgttta 27635593  T
Q  356 taa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaatt 441  Q
    |||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27635592 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaatt 27635504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 43226151 - 43226496
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43226151 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 43226250  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  43226251 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 43226348  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctcaagttgt--tttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
     |||||||||| || ||||||||  | |||  |||||||||||   |||| ||| |||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  43226349 ttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgtttctacttttggcttgt-attttaattgttccatacact-tgttttggttgcttgattatctcttgc 43226446  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43226447 tccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaattcgcaacaa 43226496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 53468647 - 53468302
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  | |||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53468647 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 53468548  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc--acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  53468547 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 53468448  T
Q  302 -tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
     |  |||||||||| || |||| ||||  | | |||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||   ||    
T  53468447 cttttgtgttctctcttcctttctctctcgctattttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggctgctccattattcatt 53468348  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaatt 441  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  53468347 gctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 53468302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9604798 - 9604447
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9604798 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 9604699  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa---t 300  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||| | | ||||||   |    
T  9604698 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattct 9604600  T
Q  301 ttcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||     ||||||||||| ||||    |||||||||||   ||  ||||||| || ||||||||||| |||||  |    
T  9604599 tttgtgttctctcttcttcttttctctcgctgttgttttctatttttggcctgtgattataattgtttcatacactttggtttggttacttgattattcc 9604500  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9604499 ttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 9604447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12268138 - 12267819
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||||||||||     
T  12268138 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-----------tcttttgtaac 12268050  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||      
T  12268049 gttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 12267951  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
    || ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||  | | ||||||||||||| ||| |    
T  12267950 ttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactattccctgctccacacatcaaatttgt 12267851  T
Q  417 tattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12267850 tattggtgtaatttttcatcgagttcacaaca 12267819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 24979773 - 24980126
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||    
T  24979773 ttcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaatt 24979872  T
Q  204 gatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||     
T  24979873 aatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc 24979971  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttg----ttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatca 393  Q
    |  |||||||||| ||  |||||||  ||||    ||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | ||||||     
T  24979972 ttttgtgttctctcttctttttctctcgttgttgtttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcc 24980071  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  24980072 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaaca 24980126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 322
Target Start/End: Original strand, 24181504 - 24181665
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||      
T  24181504 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcct 24181603  T
Q  262 ccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||| ||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24181604 ccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt 24181665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 419
Target Start/End: Original strand, 51943378 - 51943758
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  51943378 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 51943477  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  51943478 cgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 51943575  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct----ttttcttttctcaagttgttttcta 339  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||    | ||||||||||  | |||||||||    
T  51943576 gatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttcta 51943675  T
Q  340 ctttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    |||||   ||||| ||||||   ||| | ||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51943676 cttttggcttgtgtttataattgttccaaacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttat 51943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 449
Target Start/End: Original strand, 32219173 - 32219504
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa-gttac 225  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  32219173 gattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttac 32219272  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||  |||||    
T  32219273 tcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttc 32219371  T
Q  325 tc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    ||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  32219372 tctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgtt 32219471  T
Q  418 attgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32219472 atttgtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 32219504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10956218 - 10956022
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  10956218 ttcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 10956119  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10956118 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10956022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 38890106 - 38890302
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38890106 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 38890205  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38890206 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38890302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 439
Target Start/End: Original strand, 43228357 - 43228696
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43228357 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccatt 43228456  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  43228457 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattct 43228555  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||||| || |||| |||     ||||||||||| ||||   |||| ||| |||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  43228556 tttgtgttctctcttcctttactctcgctgttgttttctaattttggcttgt-attttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctctt 43228654  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
     |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  43228655 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaa 43228696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701526
Alignment:
Q  165 gggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccca 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 47701703  T
Q  265 cactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--ct 360  Q
     | ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |  || ||||||  |||| ||||||   |||||||||||||||   ||||| | ||||   |    
T  47701702 gattaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctc--tttcctttctctcattgttttctacttttggcttgtgttcataattgt 47701605  T
Q  361 tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||  |   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701604 tccatacactttgttttcgttgcttgattattacttgat---cacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattc 47701526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 449
Target Start/End: Original strand, 6231892 - 6232209
Alignment:
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6231892 ttgagtctcttggttacgggaagagattg-ggatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactca 6231990  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctca 327  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| | |||| |||  | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||  || ||||     
T  6231991 tcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttctctct 6232089  T
Q  328 agttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
     | |||||| || |||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||| ||||    |||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  6232090 cgctgttttttatttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgatta----ttactccacacatcaaatttgttattagtg 6232185  T
Q  425 tgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  6232186 tga-ttttcatcgaattcgcaacaa 6232209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 746851 - 747177
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  746851 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 746949  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| | | |||| ||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||           
T  746950 a-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 747048  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||  |||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  747049 ttctcgcagttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgtta 747147  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  747148 ttggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 747177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25688352 - 25688166
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25688352 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 25688253  T
Q  204 gatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  25688252 gatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 25688166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 889963 - 889779
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |    
T  889963 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccact 889865  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  889864 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 450
Target Start/End: Original strand, 1321545 - 1321899
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1321545 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 1321644  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  1321645 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 1321743  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| | | ||||||     
T  1321744 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcctgattatcc 1321843  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1321844 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaag 1321899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 3306844 - 3307022
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3306844 tattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 3306943  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || ||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  3306944 gttactcatcattatagtgaaaaggatggttg--ctctctcctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaatt 3307022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 25533508 - 25533704
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25533508 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 25533607  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25533608 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 25533704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 449
Target Start/End: Original strand, 53591274 - 53591598
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  53591274 attgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactc 53591373  T
Q  228 atcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaa---atttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||| |||||||||||  |||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| | | |||||    |||  ||| ||||| | ||||||||    
T  53591374 atca-tatagtgaaacgaagggatgctctctc-cccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaattttttttttgtattctc-tcttcttttc 53591470  T
Q  325 tcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    ||  | |||||||| ||||| | || || ||||||   ||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  53591471 tctcgctgttttctgcttttgacttatgtttataattgttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgttccacacatcaaatttgttattg 53591570  T
Q  422 atgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  53591571 atgtgttttctcattgaattcacaacaa 53591598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 433
Target Start/End: Original strand, 5886290 - 5886601
Alignment:
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||| || ||||||||    
T  5886290 ttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtc-tttgaaacgttactca 5886388  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttc-----tctttttct-- 320  Q
    ||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||     |||||||||      
T  5886389 tca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctattctttttcttc 5886487  T
Q  321 tttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    || ||   ||||||||||||||||   |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| || ||    
T  5886488 ttgctgttgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttg-tttggttgcttgtttatcccttgctccacacatcaag-ttgtt 5886585  T
Q  418 attgatgtgatttttc 433  Q
    |||| |||||||||||    
T  5886586 attggtgtgatttttc 5886601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22114496 - 22114300
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22114496 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22114397  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||| |||| || | || ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22114396 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22114300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51727198 - 51727002
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   |||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51727198 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 51727099  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  51727098 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 51727002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 48361845 - 48361511
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| || ||||||| ||     
T  48361845 tattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaac 48361746  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct----t 315  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| |  ||||||||||    |    
T  48361745 gttactcat-aatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 48361647  T
Q  316 tttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagt 412  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||   ||  |||| |||| ||||    
T  48361646 cttcttttctctcgttgttttctacttttgacttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattcattgttccatacattaagt 48361547  T
Q  413 ttattattgatgt--gatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    || ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  48361546 ttgttattgatgtaagtttttccatcgaattcacaa 48361511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18097091 - 18096740
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  18097091 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatt 18096992  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||| | | ||| |||| |    
T  18096991 gatttcccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattct 18096893  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  || ||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| ||    
T  18096892 tttgtgttctctcttctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccct 18096793  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  18096792 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtaatttttcatcgaattcgcaaca 18096740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10621693 - 10621365
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  10621693 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 10621595  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||| | |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||           
T  10621594 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 10621496  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg--ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||    
T  10621495 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttggtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgtt 10621397  T
Q  418 attgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10621396 attggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 10621365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 433
Target Start/End: Original strand, 5899763 - 5900074
Alignment:
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||| || ||||||||    
T  5899763 ttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgcaacgttactca 5899861  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttc-----tctttttct-- 320  Q
    ||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||     |||||||||      
T  5899862 tca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctattctttttcttc 5899960  T
Q  321 tttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    || ||   ||||||||||||||||   |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| || ||    
T  5899961 ttgctgctgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttg-tttggttgcttgtttatcccttgctccacacatcaag-ttgtt 5900058  T
Q  418 attgatgtgatttttc 433  Q
    |||| |||||||||||    
T  5900059 attggtgtgatttttc 5900074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 252
Target Start/End: Original strand, 6561876 - 6562025
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6561876 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 6561975  T
Q  204 gatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctg 252  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  6561976 gatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctg 6562025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10958514 - 10958318
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |   ||||||  |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  10958514 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 10958415  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10958414 gatttctcttttgtaacgttactcttca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10958318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 11170470 - 11170666
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11170470 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 11170569  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  11170570 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 11170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 25388999 - 25389169
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  25388999 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 25389097  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25389098 a-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttc 25389169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 448
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849470
Alignment:
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt---tcgtgtgttctcttttt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||   | ||||  |||||| ||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 41849341  T
Q  319 cttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
     || ||||  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||    
T  41849342 tttctctctcgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgtt 41849440  T
Q  418 attgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41849441 attggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 41849470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 39715552 - 39715663
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  39715552 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaa 39715651  T
Q  221 gttactcatcat 232  Q
    ||||||||||||    
T  39715652 gttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Original strand, 11168167 - 11168344
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11168167 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccatt 11168266  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggac 282  Q
    ||| | |||||||||| |||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  11168267 gatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 11168344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28413223 - 28412869
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattga-gtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28413223 ttcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 28413124  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||| | ||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||| | | | |||||||||    
T  28413123 tgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaattt 28413026  T
Q  303 cgt--gtgttct-ctttttcttt-------tctcaa-gttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaatta 390  Q
    | |  ||||||| ||| ||||||       ||||   |||||||||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28413025 cttttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttgacttgtatttataactttcatacact-tgttttggttacttgatta 28412927  T
Q  391 tcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28412926 tcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgttttttcatcgaattcacaacaa 28412869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4104086 - 4103891
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4104086 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4103987  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  4103986 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4103891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 5191719 - 5191913
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  5191719 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccatt 5191818  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  5191819 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 5191913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10084580 - 10084384
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  10084580 ttcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgtt 10084481  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10084480 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 30005907 - 30006103
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  30005907 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 30006006  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| || | | ||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  30006007 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 261
Target Start/End: Original strand, 54884221 - 54884377
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||   ||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||    
T  54884221 ttcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctatt 54884319  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  54884320 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggcttttctctctc 54884377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5522800 - 5522622
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||     
T  5522800 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 5522702  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  5522701 gatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 5522622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Original strand, 458378 - 458703
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  458378 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 458476  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  458477 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 458575  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  458576 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 458674  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  458675 tggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 458703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7606778 - 7606583
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  7606778 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 7606679  T
Q  204 gatatttct-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7606678 g--atttctatttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 7606583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 3859594 - 3859789
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  3859594 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 3859693  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | |  ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3859694 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3859789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 54691824 - 54691416
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||| | | ||||| |    
T  54691824 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggtta 54691725  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
       |||||||||  || |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||     
T  54691724 tgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacg 54691626  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctc-aagttgttttctact 341  Q
    |||||||| |||||| || | |||| || |||||| |||||||| | |  ||||||| |  | |||| ||| || |||| ||||   |||||||||||||    
T  54691625 gagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttcctttctctctcggttgttttctact 54691526  T
Q  342 ttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcga 438  Q
    |||   ||||| ||||||   ||  ||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  54691525 tttggcttgtgtttataattgtttcatacattttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacat-aaatttgttattgatgtgttttctcatcga 54691427  T
Q  439 attcacaacaa 449  Q
    |||||||||||    
T  54691426 attcacaacaa 54691416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6065959 - 6065632
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  |||||||    
T  6065959 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 6065861  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-------ctttttctt- 321  Q
    || |||||| |   || ||||| |||||| || | ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||       |||| | ||     
T  6065860 at-atagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttc 6065762  T
Q  322 ttctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  6065761 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgtta 6065663  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6065662 ttggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 6065632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Original strand, 456001 - 456326
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  456001 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 456099  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| |||||||    |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  456100 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 456198  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  456199 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 456297  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  456298 tggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 456326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 259
Target Start/End: Original strand, 29956752 - 29956906
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  29956752 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 29956851  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  29956852 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 29956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 1673982 - 1674160
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||| |||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||      
T  1673982 aaactagtgtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg 1674081  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  1674082 gaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 50494093 - 50494417
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  |||||||    
T  50494093 gagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 50494191  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-ctttttctttt----- 323  Q
    || |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| || | ||||||| ||| |||||||         
T  50494192 at-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttcttttgttct 50494290  T
Q  324 -ctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
     |||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  50494291 tctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttatt 50494389  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50494390 ggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 50494417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1620653 - 1620328
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||   || | ||  ||||||||| || |    
T  1620653 ttcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctt 1620554  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| | | ||||||  |||| | | |||||| |    
T  1620553 tgatatctcttt-gtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaaact 1620455  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||  || |||||||||||||  ||||| ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| ||||  | || ||||    
T  1620454 ttgtgtgttctctcattcttttatctcgtggttttctacttttgcttgtgtttataactgtcacccact-tgttttggttgcttgatta--attttctcc 1620358  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgattttt 432  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1620357 acatatcaagttt-ttattggtgtgattttt 1620328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10191443 - 10191305
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |    
T  10191443 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 10191345  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
      | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10191344 taagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 880219 - 880090
Alignment:
Q  317 ttcttttctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||| ||||||  || ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  880219 ttcttttctctcgttgttttctacttttggtttgtgattataactgtttcatacactttgttttctttgcttgattattccttactccacacatcaagtt 880120  T
Q  414 tattattgatgtga-tttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  880119 tattattggtgtgactttttcatcgaattc 880090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14634634 - 14634480
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||   || |||| |||||||||| || |    
T  14634634 ttcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctt 14634535  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctc 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| |||||    
T  14634534 tgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctc 14634480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 25633910 - 25634027
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaag 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| || || | ||| |||| ||||| | | ||||||| |    
T  25633910 gaaacaaggttttagaaatcaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggctgggattgattcaccttgggagacattattagg 25634009  T
Q  128 attgagtctcttggtcac 145  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25634010 attgagtctcttggtcac 25634027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6063609 - 6063439
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  6063609 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 6063511  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6063510 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttc 6063439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Original strand, 23637033 - 23637205
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt-gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||| |||| | |||| || | ||||  ||| | ||||| |||||||||||||| |||       
T  23637033 aaactagggtttgtatagagtctgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgg 23637132  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23637133 gaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35918110 - 35917948
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| || |  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  35918110 attgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 35918011  T
Q  228 atcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggat 292  Q
    || | ||||||| ||| ||| |||| |||||| | || ||| ||| ||||| ||| |||||||||    
T  35918010 atta-tatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggat 35917948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10958249 - 10958162
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10958249 ttctatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 10958162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 290
Target Start/End: Original strand, 26720630 - 26720798
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||     
T  26720630 tattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaac 26720729  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| || | ||| |||||| || | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  26720730 gatactcatca-tatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgg 26720798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Original strand, 38210464 - 38210631
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  38210464 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 38210562  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    | ||||||| |   ||| |||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||    
T  38210563 a-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 302
Target Start/End: Original strand, 42992418 - 42992533
Alignment:
Q  186 ttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactga 285  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| | | |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  42992418 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 42992516  T
Q  286 actggataaacaaattt 302  Q
    ||||| | |||||||||    
T  42992517 actgggtcaacaaattt 42992533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28100291 - 28100143
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| |||||||||   ||||| |||||||||| ||||| |    
T  28100291 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggtta 28100192  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattctt 193  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28100191 cgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 24177286 - 24177383
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt-gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcac 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  24177286 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcac 24177383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10955949 - 10955867
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10955949 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 10955867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007580
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||         | |||||||||  | |||| || |||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  227 catcattatagtg 239  Q
    |||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtg 11007580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Original strand, 42992705 - 42992800
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42992705 ttataacttccatacactttgttttggttgtctgattatcccttgctctacacatcaagtttgttattagtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 42992800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Original strand, 3859846 - 3859932
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaacaag 450  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3859846 atacactttgttttggttgcttaactatcccttattccacacatcaag-ttgttattggtgtgacttttcgatcgaattcacaacaag 3859932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 358
Target Start/End: Original strand, 27420744 - 27420968
Alignment:
Q  132 agtctcttggtcacctgaagagatt-gaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||   || |||| |||||||||| || |||  ||  |||||||||||||||||||    
T  27420744 agtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaat--cttttgtaaagttactcat 27420841  T
Q  230 cattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    ||||||| || |||| || | || |||||| |||| | ||||| |  ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||| | | ||||||||     
T  27420842 cattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattccatgtgttctctctct-ttttctca- 27420939  T
Q  329 gttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
     ||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  27420940 -ttgttttatacttttgcttgtgtttataa 27420968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 25389238 - 25389327
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25389238 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtatgattttttcatcgaattcacaacaa 25389327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 197
Target Start/End: Original strand, 35777515 - 35777581
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaa 197  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35777515 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 35777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 25533756 - 25533843
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25533756 ttccatacactttgttttggttgcttgat-atctcttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 25533843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 28181334 - 28181417
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  28181334 atacactttgttttggttgtttgattgtc-cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttgttcgaattcacaaca 28181417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 53893976 - 53893893
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  53893976 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttcgatcgaatttacaaca 53893893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6063356 - 6063282
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6063356 ttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaag-ttgttatcggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 6063282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 11170716 - 11170789
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11170716 ttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaag-ttgttattaatgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 11170789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 442
Target Start/End: Original strand, 5191982 - 5192062
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5191982 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattc 5192062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Original strand, 38210740 - 38210789
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38210740 ctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 38210789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Original strand, 26720871 - 26720928
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26720871 ttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaa 26720928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46966784 - 46966645
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct 260  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||| |  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||     
T  46966784 tttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctctc- 46966687  T
Q  261 cccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46966686 cccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaatt 46966645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4560475 - 4560352
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||   |||    |||||| |||||    
T  4560475 ttcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc-ag---ctt----ttgtaacccatt 4560384  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattat 235  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4560383 aatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10084311 - 10084229
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  10084311 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcggattcgcaaca 10084229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10191234 - 10191168
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt 431  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10191234 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 10191168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 11168447 - 11168520
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11168447 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 11168520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41038822 - 41038766
Alignment:
Q  395 ttactccacacatcaagtttatt---attgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41038822 ttactccacacatcaaatttgttgttattgatgtgatttttcaacgaattcacaaca 41038766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 1674206 - 1674270
Alignment:
Q  280 gactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  1674206 gaccgaactgggtaaacaaattttgtgtattctctctttcttttctctcgatgttttctaatttt 1674270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22114237 - 22114143
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22114237 ttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgctattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 22114143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29897578 - 29897526
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29897578 ctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 29897526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Original strand, 15719688 - 15720106
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||| | ||||| ||    
T  15719688 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgagttgattcaccttggaaaacactattagga 15719787  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15719788 ttgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 15719887  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctct-ctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctca 327  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| | | |||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  15719888 tcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatttcatgtgttctctctttcttttctct 15719987  T
Q  328 agttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactct-gttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| || ||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15719988 cgctgttttctatttttgtttgtgattataacttccatacactttatttttgattgcttgactatcact---tccacacatcaagtttattattgacgtg 15720084  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  15720085 a-ttttcatcgaattcataacaa 15720106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3028103 - 3027703
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3028103 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgt 3028004  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3028003 gaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 3027904  T
Q  248 ggctgatctct-ctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt- 344  Q
    ||||| ||| | | |||| ||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  3027903 ggctgctctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctctcgttgttttctacttttg 3027805  T
Q  345 atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    | ||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  3027804 acttgtatttataacttccatacact-ttatttggttgctcgattattacttgctccacacatcaaatat-ttatcggtgtgatttttcattgaattcac 3027707  T
Q  445 aaca 448  Q
    ||||    
T  3027706 aaca 3027703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 13057256 - 13057659
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| |    
T  13057256 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtta 13057355  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13057356 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg 13057455  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  13057456 gagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctctatctgttttctacttt 13057555  T
Q  344 tatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattca 443  Q
    | ||||||||||||| |  |   |||| | | |||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  13057556 tgtttgtgattataattgttgcccact-tttattggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcg 13057654  T
Q  444 caaca 448  Q
    |||||    
T  13057655 caaca 13057659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 450
Target Start/End: Original strand, 15367116 - 15367500
Alignment:
Q  69 gtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttggg 167  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||   ||||||    
T  15367116 gtttgctcttggcaacaaacactagggttgggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttggg 15367215  T
Q  168 tagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct-cccaca 266  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |    
T  15367216 taaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctctccccaga 15367314  T
Q  267 ctaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttct 363  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||||   ||||| ||||||   |||     
T  15367315 ctaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttc-tttctctcgtatttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 15367413  T
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367414 atacactttgttttggttgcttgattatcacatgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaag 15367500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15541309 - 15540989
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15541309 attgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattc 15541210  T
Q  228 atcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||| || ||||    
T  15541209 atca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttttttctctc 15541111  T
Q  327 aagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
      ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||   ||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  15541110 tcgttgttttctaattttgtttgtgattataactgttaccaact-tgttttggtttcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtttg 15541012  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  15541011 atttttcatcgaagtcgcaacaa 15540989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 109 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24338635 - 24338294
Alignment:
Q  109 cttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatat 208  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |    |||||||| ||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24338635 cttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatat 24338536  T
Q  209 ttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat-ttcgtgt 307  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||    
T  24338535 ctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgt 24338438  T
Q  308 gttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccaca 404  Q
    ||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||||    
T  24338437 gttatc-tcttcttttctctcgttgttttctacttttggtttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatctcttgctccaca 24338339  T
Q  405 catcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338338 catcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 24338294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3632190 - 3631783
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| || |    
T  3632190 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgtta 3632091  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |   ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3632090 cggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg 3631991  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc-ttttctcaagttgttttctactt 342  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||| ||| || | |||||||  | ||||||||||||    
T  3631990 gagggctg--ctctgtcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttttctctcgatgttttctactt 3631893  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  3631892 ttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcacttgctccacacgtcaagtttgttattggtgtgttttttcatcgaa 3631793  T
Q  440 ttcacaacaa 449  Q
    ||||||||||    
T  3631792 ttcacaacaa 3631783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3630116 - 3629711
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| |    
T  3630116 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtta 3630017  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||     
T  3630016 cgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaact 3629918  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3629917 gagggctgctctctc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgttgttttctacttt 3629820  T
Q  344 t--atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    |    ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||    
T  3629819 ttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaa 3629720  T
Q  440 ttcacaaca 448  Q
    |||||||||    
T  3629719 ttcacaaca 3629711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 444
Target Start/End: Original strand, 14466444 - 14466787
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  14466444 ttcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcatt 14466543  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | || | ||| | | || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  14466544 gatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattct 14466643  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctc-aagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactc 400  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||| | |||||||| ||     
T  14466644 cttgtgttctctctttctttctctcgctgctgttttctacttttgtttgtgattataactttcatacattttgttttggttgcttgactatcacttgctg 14466743  T
Q  401 cacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14466744 cacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaattcac 14466787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 182 - 450
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346815
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttgga 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 15346644  T
Q  282 ctgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttg 378  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||| ||| |||||||    
T  15346645 ccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctcttgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatatactttgttttg 15346743  T
Q  379 gttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346744 gttgcttgattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatttacaacaag 15346815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Original strand, 13039875 - 13040130
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13039875 ttcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 13039974  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |    
T  13039975 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 13040074  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
      |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13040075 tttgtgttctctctttcttttctctcgttgttttctacttttgtttatgattataa 13040130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 32280117 - 32280463
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32280117 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 32280216  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | || ||||| |    
T  32280217 gatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattct 32280316  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactc 400  Q
    | |||||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||   ||||  |||||| |  ||  |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  32280317 cttgtgttctctcttcctttctctcatgttattttctacttttggcttgtatttataattgttacccact-tgtattggttgcttgattatcacttactc 32280415  T
Q  401 cacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  32280416 catacatcaagtttgttatttgtgtgattttttatcgaattcacaaca 32280463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 9020047 - 9020398
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9020047 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 9020146  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  9020147 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 9020245  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  ||||||||     ||||||||||||||||   ||||  ||||||   ||| ||||||| ||||||||||   | |||||| ||    
T  9020246 tttgtgttctctcttcccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgtctgattatctct 9020345  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9020346 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 9020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 449
Target Start/End: Original strand, 17012104 - 17012503
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacc 146  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| |||   ||| | ||||| |||||||||||||||||||     
T  17012104 caaactagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacg 17012203  T
Q  147 tgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  17012204 agaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacata 17012302  T
Q  247 gggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt 344  Q
    | | | ||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||| | ||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||    
T  17012303 gagatcatctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatttc--atattctctctttctttctctca--ctattttctactttt 17012398  T
Q  345 -atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattca 443  Q
       ||||| || |||| |  ||||||| |||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17012399 ggcttgtg-ttttaacgttcatacactttgttttggttgcttgattattatttgctccacacatcaagtattttattgttgtgatttttcatcgaattca 17012497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1069912 - 1069715
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1069912 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 1069813  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1069812 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11983222 - 11982871
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11983222 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 11983123  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  11983122 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 11983024  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| || | |||||||     ||||||||||||||||   |||||||| |||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  11983023 tttgtgttctctcttcttttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattgtaattgttccatacactttgttttggttgcttgattattcct 11982924  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11982923 tgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 11982871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Original strand, 3390500 - 3390678
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3390500 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3390599  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggac 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  3390600 gatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggac 3390678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3233923 - 3233567
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||    
T  3233923 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcatt 3233824  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaattt-----ggactgaactggataaacaa 298  Q
    || || |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||     | |||||||||| | |||||    
T  3233823 gacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaa 3233725  T
Q  299 att-tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaatta 390  Q
    ||| |  |||||||||| || ||||||||     ||||||||||||||||  |||||| ||||||   ||  || |||| || |||||||| | | ||||    
T  3233724 attcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggtttgtgtttataattgtttcatgcactttgattttggttgcctgatta 3233625  T
Q  391 tcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3233624 tcacttactccacacatcaaatttgttattgatgtgttttctcatcgaattcgcaaca 3233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 360
Target Start/End: Original strand, 19696583 - 19696818
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||  ||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  19696583 gattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttat 19696682  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19696683 tcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttc 19696781  T
Q  325 tcaagttg-ttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
    ||  | || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19696782 tctcgctgtttttctacttttgtttgtgtttataact 19696818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16455675 - 16455368
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||| |||| || |||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| | | ||| |||| ||||||||| ||||      
T  16455675 aaactagggtttgtacagagttttctcttggcaacgaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacgg 16455576  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  16455575 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggag 16455476  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||| ||   | ||||||||||||| |    
T  16455475 ggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttc----tttcttttatctcatggttttctacttttgt 16455380  T
Q  347 ttgtgattataa 358  Q
    ||||| ||||||    
T  16455379 ttgtgtttataa 16455368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 25477395 - 25477599
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25477395 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 25477494  T
Q  204 gatatttcttttgtaa-------agttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaac 296  Q
    ||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | |||    
T  25477495 gatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaac 25477594  T
Q  297 aaatt 301  Q
    |||||    
T  25477595 aaatt 25477599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15532874 - 15532679
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15532874 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccatt 15532775  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || || | ||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  15532774 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctatc-cctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaatt 15532679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14458943 - 14458764
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  14458943 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 14458844  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14458843 gttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14458764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 438
Target Start/End: Original strand, 26945281 - 26945600
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26945281 tattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaa 26945380  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctcttttt 318  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||| | |||| | || || |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  26945381 agttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtcttctctcttt 26945480  T
Q  319 cttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||| || |||| ||  || ||||| ||||  | |||| ||||||| | ||    
T  26945481 cttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataacttccttacactttg-tttgattctttgattattacttgtttcacatatcaagtgtttt 26945579  T
Q  418 attgatgtgatttttcatcga 438  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  26945580 attggtgtgatttttcatcga 26945600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12186266 - 12186025
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  12186266 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcat 12186167  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  | |  ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||     
T  12186166 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaacaaatta 12186067  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  12186066 ttttgtgttctctctttc-tttctctcgctgttttctactttt 12186025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4816424 - 4816228
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4816424 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4816325  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  4816324 gatttctcttttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30729021 - 30728675
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  30729021 ttcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcatt 30728922  T
Q  204 gata----tttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    ||||    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||||| | || ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||    
T  30728921 gatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 30728823  T
Q  300 tt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
    || |  |||||| ||| || |||| ||||  | |||||||||||||| | ||||  ||||||   ||| ||||||| ||||||||||  || | |||| |    
T  30728822 ttcttttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatccc 30728723  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  30728722 ttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcaacgaattc 30728675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15530374 - 15530169
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  15530374 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 15530275  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  15530274 cgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacg 15530177  T
Q  245 gagggctg 252  Q
    ||||||||    
T  15530176 gagggctg 15530169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22858148 - 22857889
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| |||||   || |||| |||||||||| || |    
T  22858148 ttcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaaccctt 22858049  T
Q  203 t-gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||    
T  22858048 ttgatatatcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaat 22857950  T
Q  301 ttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttc 362  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  22857949 ttcgtgtgttctctctttc-tttctctcgctgttttgtacttttgcttgtgtttataacttc 22857889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28241514 - 28241318
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  28241514 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccatt 28241415  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  28241414 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 28241318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1230384 - 1230246
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |    
T  1230384 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 1230286  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1230285 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1230246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 30967322 - 30967518
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  30967322 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 30967421  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  30967422 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30967518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 22490778 - 22490896
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  22490778 tattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 22490877  T
Q  221 gttactcatcattatagtg 239  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22490878 attactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25465707 - 25465545
Alignment:
Q  181 gagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttg 279  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| || | | |||    
T  25465707 gagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtattg 25465609  T
Q  280 gactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  25465608 gaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttc-tttctctcgctgttttctactttt 25465545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26066289 - 26065961
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||    
T  26066289 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatc 26066191  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||           
T  26066190 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttcttttgt 26066092  T
Q  322 --ttctc-aagttgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
      |||||  |||||||||||||||||    ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  26066091 tcttctcgcagttgttttctactttttggcttgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgt 26065993  T
Q  417 tattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26065992 tattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 26065961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12937370 - 12937133
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||   ||| ||||||||||||   || | || |||||||||| |  || |||| ||||| ||||    
T  12937370 tattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctcttt-gtaa 12937272  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt-taatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctcttttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  12937271 agttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttctatcttt 12937173  T
Q  319 cttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12937172 cttttctctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataa 12937133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19704734 - 19704564
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttct-tttgtaaagttactcat 229  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| | |||||||    
T  19704734 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcat 19704635  T
Q  230 cattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19704634 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 19704564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26068560 - 26068234
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||| ||||||    
T  26068560 gagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttgctcatc 26068462  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-ctttttctttt----- 323  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| |||||||         
T  26068461 aa-atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgttct 26068363  T
Q  324 -ctca-agttgttttctacttttat--ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
     |||  |||||||||||||||||    ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||    
T  26068362 tctcgcagttgttttctactttttggcttgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttg-ttat 26068264  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26068263 tggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 26068234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30034738 - 30034600
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||| |||||| |    
T  30034738 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctccc 30034640  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  30034639 ccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30034600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26932727 - 26932402
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  26932727 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 26932629  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctt-------tt 323  Q
    | ||||||| |   ||||| || |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||| | |||  |||| |||||       ||    
T  26932628 a-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttctttgtgttctt 26932530  T
Q  324 ctc-aagttg-ttttcta-cttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    |||   |||| ||||||| ||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  26932529 ctcgccgttgtttttctacctttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttatt 26932431  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26932430 ggtgtgatttttcatcaaattcacaacaa 26932402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12161733 - 12161510
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||  ||| |||| ||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  12161733 tattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 12161634  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |  |||||||||| || |    
T  12161633 gttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctc-cctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttcc 12161536  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt 344  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||    
T  12161535 tttctctctcgctgttttctactttt 12161510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14507368 - 14507173
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14507368 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 14507269  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14507268 gatttctc-tttgtaacgatacttatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14507173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5273381 - 5273211
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  5273381 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 5273283  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
     |||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  5273282 -ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttc 5273211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25078732 - 25078514
Alignment:
Q  123 ttaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||  | ||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  25078732 ttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaag 25078634  T
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct 320  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||||  |||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  25078633 ttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttctt 25078535  T
Q  321 tttctcaagttgttttctact 341  Q
    |||||| |  |||||||||||    
T  25078534 tttctctaactgttttctact 25078514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2629078 - 2628726
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggc-gagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  2629078 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaga-atttattcttgtaacccat 2628980  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    |||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||     
T  2628979 tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 2628882  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattat 391  Q
    |  ||||||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  2628881 ttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgattttggttgcttgattat 2628782  T
Q  392 cacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2628781 cccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 2628726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 20526883 - 20527081
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||     
T  20526883 tgtagagtttgctcttgacaacaaacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaaga 20526982  T
Q  161 ttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
     ||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| |  ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  20526983 cttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20915521 - 20915353
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  20915521 gagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 20915423  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  20915422 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20915353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078170
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaa-tttgg 280  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | | | ||| |||||| | || ||||||| || ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  281 actgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 28078170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 26065104 - 26065298
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26065104 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 26065203  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||  | || ||||||| ||||||| | | ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  26065204 gacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 26085073 - 26085267
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26085073 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 26085172  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||  | || ||||||| ||||||| | | ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  26085173 gacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 33309006 - 33309175
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  33309006 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 33309103  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33309104 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 33309175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12195680 - 12195354
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  |||||||    
T  12195680 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 12195582  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-ctttttcttt------ 322  Q
    || |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||| |||| | ||||||| ||| ||||||          
T  12195581 at-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 12195483  T
Q  323 -tctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
     ||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||    
T  12195482 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttg-tta 12195384  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12195383 ttggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 12195354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29754874 - 29754549
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  29754874 gagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 29754776  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||| |||| |||||      |    
T  29754775 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttct 29754677  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    ||||  |||||||||||||||||    | ||  |||    ||| |||| || |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  29754676 tctcgcagttgttttctactttttggctcgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 29754578  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29754577 tggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 29754549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 294
Target Start/End: Original strand, 30445702 - 30445836
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct 260  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||     
T  30445702 tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcc 30445801  T
Q  261 cccacactaggttaat-ttggactgaactggataa 294  Q
     ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  30445802 accatactaggtcagtattggactgaactggataa 30445836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12911623 - 12911419
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||  ||| |||||| |||||   || | || |||||||||| |  || |||| ||||| ||||    
T  12911623 tattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctcttt-gtaa 12911525  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt-taatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctcttttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  12911524 agttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttctatcttt 12911425  T
Q  319 cttttc 324  Q
    ||||||    
T  12911424 cttttc 12911419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 33311275 - 33311444
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  33311275 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 33311372  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    |  |||||| | | |||||||| | |||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33311373 a-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 33311444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8717268 - 8717194
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8717268 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 8717194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584314
Alignment:
Q  215 tgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattt 10584314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 18322483 - 18322566
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  18322483 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatagaattcgcaaca 18322566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 446
Target Start/End: Original strand, 22491003 - 22491077
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcactta-ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22491003 tgttttggttgcttgattatc-cttagctccacacattaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaa 22491077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 33309257 - 33309330
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33309257 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 33309330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 11262587 - 11262790
Alignment:
Q  114 aaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaa--tccatt-gatatt 209  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||   || |||| |||||| |||  ||| || |||||     
T  11262587 aaaagattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagatttagg-tagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatc 11262685  T
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtg 308  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| || ||| |||  ||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  11262686 tcttt-gtaaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtg 11262784  T
Q  309 ttctct 314  Q
    ||||||    
T  11262785 ttctct 11262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26455178 - 26455132
Alignment:
Q  277 ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctttt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26455178 ttggactgaactggataaacaaatttcatgtgttctctctttctttt 26455132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28037842 - 28037788
Alignment:
Q  185 cttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtg 239  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28037842 cttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtg 28037788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 33311526 - 33311598
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33311526 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 33311598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 15346429 - 15346498
Alignment:
Q  34 caagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  15346429 caagggtttagaattcaaactagggtttgtataaaatttgctcttggcaacaaacactagggttgggttg 15346498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28241245 - 28241162
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28241245 atacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 28241162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4816154 - 4816071
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  4816154 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttgatcagattcacaaca 4816071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14458680 - 14458605
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14458680 ttttggttgcctgattatccattactccacacatcaagct-attattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaag 14458605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5273129 - 5273055
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5273129 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 5273055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19227601 - 19227514
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattc 191  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19227601 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Original strand, 13040182 - 13040232
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13040182 ctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 13040232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 449
Target Start/End: Original strand, 25480227 - 25480347
Alignment:
Q  331 tgttttctactttt-atttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||| ||  | |||| ||||||| ||||||||| | | |||||| |||||    
T  25480227 tgttttctacttttgacttgtgattataattgtttcatacactttattttggttgctcgactatcccttactctacacatcaaatat-ttattggtgtga 25480325  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25480326 tttttcatcgaattcacaacaa 25480347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 448
Target Start/End: Original strand, 30967594 - 30967673
Alignment:
Q  367 cactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30967594 cactttgttttggttacttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcaacgaattcgcaaca 30967673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833533
Alignment:
Q  188 attcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagtt-actcatcattatagtg 239  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtg 3833533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Original strand, 10584362 - 10584414
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10584362 ctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 10584414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20915280 - 20915197
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  20915280 atacactttgttttggttgcttgattaccccttgccccacacatcaag-ttattattggtgtgatttttgatcagattcacaaca 20915197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 358
Target Start/End: Original strand, 22610986 - 22611051
Alignment:
Q  292 taaacaaatttcgtgtgttctctttttc-ttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  22610986 taaacaaatttcgtgtgttctctctttctttttctca--ttgttttctacttttgcttgtgtttataa 22611051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 3394763 - 3394838
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3394763 ttttggttgcttgattatccatttctccacacatcaagatttttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaa 3394838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15530060 - 15530003
Alignment:
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtga---tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  15530060 cttactccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttctcatcgaattcacaaca 15530003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19704477 - 19704403
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  19704477 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcgatcgaattcacaaca 19704403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28037627 - 28037576
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagt-ttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28037627 ctccacacatcaagtatttttattggtgtgatttttcaacgaattcacaaca 28037576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Original strand, 7294210 - 7294260
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  7294210 ctccacacatcaagtattttattggtgtgattttttaacgaattcacaaca 7294260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16455330 - 16455280
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16455330 ctccacatatcaagtattttattggtttgatttttcatcgaattcacaaca 16455280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22857888 - 22857842
Alignment:
Q  403 cacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22857888 cacatcaagtattttattggtgtgatttttcaacgaattcacaacaa 22857842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 26065382 - 26065458
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt--tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26065382 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaacaa 26065458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 26085351 - 26085427
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt--tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26085351 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaacaa 26085427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26505401 - 26505339
Alignment:
Q  283 tgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttc-ttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26505401 tgaattgggtaaacaaatttcatgtgttctctctttctttttctctcgttgttttctactttt 26505339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1230172 - 1230089
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1230172 atacactttattttggttgcttgattatctcttgatccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttt-atcgaattcgcaacaa 1230089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14507100 - 14507051
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14507100 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtt 14507051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30034562 - 30034446
Alignment:
Q  330 ttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30034562 ttgttttctacttttagcttgtatttataactttcatacactttgttt-ggttgcttgattatc-cttgctccatacatcaagttg-ttattggtgtgat 30034466  T
Q  429 ttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  30034465 ttt-catcgaattcgcaacaa 30034446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 41997573 - 41997976
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| || |    
T  41997573 aaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagtta 41997672  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  41997673 cgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacg 41997772  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  41997773 gagggccgctctctc-cccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatttcataagttctctctttctttgctctcgctgttttctactttt 41997871  T
Q  345 atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  41997872 gtttgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtttattattggtgtgttttttcatcaaattaac 41997971  T
Q  445 aacaa 449  Q
    |||||    
T  41997972 aacaa 41997976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18535083 - 18534687
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacc 146  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||     
T  18535083 caaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 18534984  T
Q  147 tgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  18534983 agaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacgga 18534884  T
Q  247 gggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
    ||| || |||| | |||| ||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||||||||     
T  18534883 ggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctctcgctattttctacttttg 18534785  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18534784 tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtga-gtttcatcgaattcac 18534687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 19322777 - 19323177
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt-gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  19322777 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 19322876  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19322877 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 19322976  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
    || || |||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||     
T  19322977 ggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctctttc-tttctccaggtgttttatacttttg 19323075  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
     | ||| |||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19323076 ctcgtgtttataacttccatacactttattttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtga-ttttcatcgaattcaca 19323174  T
Q  446 aca 448  Q
    |||    
T  19323175 aca 19323177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18537725 - 18537324
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacc 146  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||| ||||| | ||| |||| ||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||     
T  18537725 caaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 18537626  T
Q  147 tgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18537625 ggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 18537526  T
Q  247 gggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||| |  ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||     
T  18537525 gggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctctttc-tttctctcgttgttttatacttttg 18537427  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||| | |||||   |||||||||||||||    
T  18537426 tttgtgtttataacttccatacactttgttttgattgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttataggtgtga-acttcatcgaattcaca 18537328  T
Q  446 acaa 449  Q
    ||||    
T  18537327 acaa 18537324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18409523 - 18409191
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  18409523 tattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa- 18409425  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtg---tgttctctttt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||   | || | ||||    
T  18409424 gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatttcgtgtttttttttttttt 18409325  T
Q  318 tcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
    | |||||||  | | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18409324 ttttttctctcgctattttctacttttgtcttgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttat 18409225  T
Q  417 tattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409224 tattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 18409191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38890475 - 38890071
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||  |||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||      
T  38890475 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacattagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg 38890376  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38890375 gaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagag 38890276  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-a 345  Q
    ||||| |||||| || | | ||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||      
T  38890275 ggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgttttctaattttgc 38890176  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga--tttttcatcgaattca 443  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||  ||| ||||||| ||||| | | |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  38890175 cttgtgtttataacttccatacactttg-tttggttgctagattattccttgctccacatatcaaatattttattggtgtgattttttttatcgaattca 38890077  T
Q  444 caacaa 449  Q
    ||||||    
T  38890076 caacaa 38890071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38928370 - 38928024
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  38928370 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 38928271  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  38928270 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 38928172  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||   |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  38928171 tttgtgttctc-tcttcttttatctcgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 38928073  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38928072 ccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 38928024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 16453449 - 16453797
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16453449 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 16453548  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg-gataaacaaattt 302  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |  ||| || | |    
T  16453549 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattct 16453648  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||   |||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||    
T  16453649 tttgtgttctc-tcttcttttctctcactgttttctacttttggcttgtgattataactgtttcatacactttgttttggttgcctgattatcacttgct 16453747  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16453748 ccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 16453797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 19096040 - 19096370
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||   | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  19096040 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 19096139  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||||||| ||||    
T  19096140 gttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttc 19096238  T
Q  320 ----ttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
        |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19096239 tttattttctctcgttgttttctacttttgtttgtgattataactgttacccact-tgtattggttgcttgactatcccttactccacacatcaaattta 19096337  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19096338 ttattagtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 19096370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 2891448 - 2891780
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  2891448 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 2891547  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||   || |||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  2891548 gttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 2891647  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||||     
T  2891648 tttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattattctttgctccacacatcaagtttg 2891747  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2891748 ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 2891780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 446
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30137031
Alignment:
Q  57 ggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagaga 154  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | || || ||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  30136640 ggtttgtatagagtttactcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaa 30136739  T
Q  155 ttgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgat 254  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30136740 ttgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgct 30136839  T
Q  255 ctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtga 352  Q
    |||||  | | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||     
T  30136840 ctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctcttgttgttttctacttttggtttgtgt 30136939  T
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30136940 ttataacttctatacact-ttatttggttgtttgattattacttgttccacatatcaaatat-ttattgatgtgattttacatcgaatttacaa 30137031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 16455381 - 16455714
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  16455381 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 16455480  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  16455481 gatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 16455579  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactc 400  Q
     ||||||||||              | ||||||||| |||||  || ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||    
T  16455580 ttgtgttctct-------------cgctgttttctagttttagcttatgattataactgttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctc 16455666  T
Q  401 cacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16455667 cacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 16455714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8756498 - 8756102
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctctt-ggtcacctgaa 150  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | || || ||||||||||||| ||||||  |||    
T  8756498 taggatttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaa 8756399  T
Q  151 gagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggc 250  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||     
T  8756398 gagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggt 8756299  T
Q  251 tgatctctctcccacactaggt-taatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttg 349  Q
    || ||||||  ||| |||||||    ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||  |||    
T  8756298 tgctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttc-tttctctcgttgttttttacttttgcttg 8756200  T
Q  350 tgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8756199 tgtttataactgtcacccact-tgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 8756102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22801055 - 22800705
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22801055 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22800956  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  22800955 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 22800857  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||||| ||  |||||||     |||| |||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||| ||| |||||||||| ||| | |||| |||    
T  22800856 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgttccatatactttgttttggttgcttgactatccctt 22800757  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22800756 gctccccacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 22800705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33415681 - 33415334
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33415681 ttcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 33415582  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||  |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |    
T  33415581 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattct 33415483  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   | | ||||||| || |||||||| ||| | |||| ||| |    
T  33415482 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtcccatacactttgattttggttgcttgactatcccttgc 33415384  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||||    
T  33415383 tccacacatcaagtttgttatttgtgtgatttctcatcggattcgcaaca 33415334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40091608 - 40091257
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40091608 ttcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 40091509  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  40091508 gatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 40091410  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||  | | ||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||  || |    
T  40091409 tttgtgttctctcttcttttctctcttgctattttctacttttggcttgtgtttataattattccatacactttattttggttgcttgattatcttttgc 40091310  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtg-atttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40091309 tccacacatcaagtttgttattggtgtgaatttttcatcgaattcgcaacaag 40091257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 36378373 - 36378778
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggttgt---gttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||     |||| |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| || |    
T  36378373 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagtta 36378472  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  36378473 cgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacg 36378572  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||    
T  36378573 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctc-tcttcttttctcctgctgttttctacttt 36378671  T
Q  344 t-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    |  |||||| ||||||   ||  ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  36378672 tcgtttgtgtttataattgtttcatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccacatatcaagtattttattggtgtga-ttttcatcgaat 36378769  T
Q  441 tcacaacaa 449  Q
    || ||||||    
T  36378770 tcgcaacaa 36378778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14787624 - 14787274
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||    
T  14787624 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 14787525  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct--cccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||    
T  14787524 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 14787426  T
Q  302 -tcgtg-tgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
     | ||| | ||||||| || || |||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  14787425 cttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccctt 14787326  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14787325 gctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 14787274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 36380489 - 36380834
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  36380489 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 36380588  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  36380589 gatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattct 36380688  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| || |||| || ||| || || |||||||    
T  36380689 tttgtgttctc-tcttcttttctccttctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttg-tttgattgcttgatcattacttact 36380786  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36380787 ccacacatcaaatattttattggtgtga-ttttcatcgaattgacaaca 36380834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36919777 - 36919435
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919777 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 36919678  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  36919677 gatatctcttttgtaacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 36919579  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||||| | | |||||| ||| |    
T  36919578 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcctgattatcccttgc 36919479  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36919478 tccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattc 36919435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36921686 - 36921337
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36921686 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 36921587  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  36921586 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 36921488  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| | |||||||| | | |||||| ||| |    
T  36921487 tttgtgttctctcttcttttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttattttggttgcctgattatcccttgc 36921388  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36921387 tccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 36921337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Original strand, 24880590 - 24880814
Alignment:
Q  103 gttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24880590 gttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 24880689  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  24880690 tgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24880788  T
Q  302 -tcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
     || |||||||||| || ||||||||    
T  24880789 ctcttgtgttctctcttccttttctc 24880814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 47274866 - 47275212
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||   || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47274866 ttcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 47274965  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||||| |    
T  47274966 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattct 47275063  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||  | ||  ||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   |||||||||||   ||||| || ||| |||||| ||||||    
T  47275064 tttgtgttcttctcttgatttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattattctatacacttcattttgattgcttgattatcccttact 47275163  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  47275164 ccacacatcaagtttgttattgatgtgttttcacaacgaattcacaaca 47275212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22802927 - 22802576
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22802927 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22802828  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  |||||| |||| ||||||| |||||| || ||||| | | |||||||| |    
T  22802827 gatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattct 22802729  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||||| | ||  |||||||     |||| |||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  22802728 tttgtgttctatcttctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccctt 22802629  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22802628 gctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 22802576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16186006 - 16185685
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16186006 gattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatcttt-gtaaagttac 16185908  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |     
T  16185907 tcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctcttttttgtt 16185808  T
Q  325 tcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| ||||  | || ||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  16185807 tctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataactgtcacccact-tgttttggttgcttgatta--atttgctccatacatcaagtattttattggtg 16185711  T
Q  425 tgat-ttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16185710 tgatcttttcaacgaattcacaacaa 16185685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37313242 - 37312924
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  37313242 tattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaa 37313143  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||| |||| || |||||||||  || ||||| ||||||||             |||| |    
T  37313142 gttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaatt------------cttttgt 37313055  T
Q  321 tttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatt 417  Q
    ||||||  | ||||||||||||||   || |||||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37313054 tttctctcgctgttttctacttttggcttatgattataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttatt 37312955  T
Q  418 attgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  37312954 attggtgtgatttttcatcaaattcgcaaca 37312924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 12102226 - 12102566
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||     
T  12102226 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccac 12102325  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12102326 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatt 12102425  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    |||| || ||||| ||||   |||||   |||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||   |||| |||| ||||    
T  12102426 tcgtatgctctctctttc---tctca--ctgttttttacttttgcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgctcggttattacttgctcc 12102520  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12102521 acacatcaagtagtttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 12102566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12401059 - 12400659
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  12401059 aaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 12400960  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  12400959 cgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacg 12400861  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa-tttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactt 342  Q
    | |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||| | |  |||||||||| || |||| | ||  ||||| ||||||||    
T  12400860 gggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctactt 12400761  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||    |||| ||||||   ||| |||| || |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||    
T  12400760 ttggcatgtgtttataatttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcattgaa 12400661  T
Q  440 tt 441  Q
    ||    
T  12400660 tt 12400659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Original strand, 24879129 - 24879352
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24879129 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 24879228  T
Q  204 gatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  24879229 gatatctcttttgtaaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 24879327  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    || |||||||||| || ||||||||    
T  24879328 tcttgtgttctctcttccttttctc 24879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 442
Target Start/End: Original strand, 48486459 - 48486803
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  48486459 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 48486558  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  48486559 gaaatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattat 48486657  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||| ||| || ||||||||   | ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| || |||| |||||| ||| ||| |||||| |||    
T  48486658 tttgtgttttctcttccttttctcttgatgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccattcactttgttttagttgcttgattatcgctt 48486757  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
      ||||| |||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  48486758 gttccacgcatcaaatttgttattggtgtgttttctcatcgaattc 48486803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 619596 - 619297
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  619596 gaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggat 619498  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    | ||| |||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||      
T  619497 gactgctctctc-ccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttcttctctgctgttgttttctacttttgc 619399  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||    
T  619398 ttgtgattataactgtgatccact-tgtattggttgcttgactatcccttactccacacatcaaatttattattggtgtgttttctcatcgaatccgcaa 619300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Original strand, 6765042 - 6765335
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |    
T  6765042 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 6765140  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctacttttatttgtga 352  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||  | |||||       |||||   |||||||||||||||   ||||      
T  6765141 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttggtgttcttctcgccgttgttttctactttggcttgtat 6765240  T
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6765241 ttataa-ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 6765335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12396097 - 12395697
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  12396097 aaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 12395998  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  12395997 cgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacg 12395899  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa-tttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactt 342  Q
    | |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||| | |  |||||||||| || |||| | ||  ||||| ||||||||    
T  12395898 gggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctactt 12395799  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||    |||| ||||||   ||| |||| || |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||    
T  12395798 ttggcatgtgtttataatttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcattgaa 12395699  T
Q  440 tt 441  Q
    ||    
T  12395698 tt 12395697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15032725 - 15032401
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||  |  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15032725 tattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 15032626  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaact-ggataaacaaatttcgtgtgttctcttttt 318  Q
    |||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||| | |||    
T  15032625 gttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgttctttcttt 15032526  T
Q  319 ct---tttctcaagttg-ttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
    ||   ||||||  | || |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||| |    
T  15032525 ctttctttctctcgctgtttttctacttttgtttatgtttataacttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccgcacatcaagtat 15032427  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||    
T  15032426 tttattggtgtga-ttttcatcgaatt 15032401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 13547311 - 13547644
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  13547311 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaa 13547410  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa-tttcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| | | || ||| |||  |||||||||| || |    
T  13547411 gttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttcc 13547509  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
    ||| ||||  | | ||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || ||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13547510 tttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacacatcaagttt 13547609  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     |||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  13547610 gttattggtgtgttttctcattgaatgcacaacaa 13547644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17662438 - 17662092
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17662438 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 17662339  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  17662338 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17662240  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| ||  |||||||   ||||||||||||||||    |||||||||||   ||| ||||||| || |||| || ||| |||||| ||| |    
T  17662239 tttgtgttctctcttctttttctcgctgttgttttctacttttggcatgtgattataattgttccatacactttggtttgattgcttgattatcccttgc 17662140  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  17662139 tccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcaacgaattcgcaaca 17662092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 278
Target Start/End: Original strand, 13544099 - 13544272
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13544099 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 13544198  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaattt 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  13544199 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 413
Target Start/End: Original strand, 40637214 - 40637531
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40637214 ttcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 40637313  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  40637314 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 40637412  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg--ttttggttacttaattatcac 394  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| ||  |||||||| ||| |||||  |    
T  40637413 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttttggttgcttgattattcc 40637512  T
Q  395 ttactccacacatcaagtt 413  Q
    || ||||||||||||||||    
T  40637513 ttgctccacacatcaagtt 40637531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 14633459 - 14633654
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14633459 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14633557  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14633558 gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14633654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 47868541 - 47868737
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47868541 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 47868640  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  47868641 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 47868737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 24888936 - 24889286
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  24888936 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccatt 24889035  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  24889036 gatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24889134  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
      |||||| ||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||  |||    
T  24889135 tttgtgttatctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgttagattattcctt 24889234  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  24889235 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 24889286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 448
Target Start/End: Original strand, 28453784 - 28454167
Alignment:
Q  68 agtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttg 165  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | | ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |   |||    
T  28453784 agtttgctcttggcaagaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttg 28453883  T
Q  166 ggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccac 265  Q
    ||||||||||||    ||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||  |||||| ||||     
T  28453884 ggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccag 28453983  T
Q  266 actaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct---tttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataactt 361  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| |     
T  28453984 actaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctttctccggttgttttctacttttgcttgtgtttataattg 28454083  T
Q  362 ctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
      || |||| |||||||||| ||| |||||   || || ||||||||||||    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  28454084 tcatccactttgttttggtttcttgattat--tttgcttcacacatcaagtaatatattggtgtga-ttttcaacgaattcacaaca 28454167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47151065 - 47150833
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |    
T  47151065 gattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgc 47150966  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || | |||| || | ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  47150965 tcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctctttc-tttc 47150867  T
Q  325 tcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  47150866 tctcgttgtcttctacttttgtttgtgtttataa 47150833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8631612 - 8631416
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8631612 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 8631513  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8631512 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 8631416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37089623 - 37089212
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | |    
T  37089623 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgatta 37089524  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  37089523 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacg 37089426  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttt 335  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||  | |||||       |||||   |||||||    
T  37089425 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttt 37089326  T
Q  336 tctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttca 434  Q
    |||||||||   ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37089325 tctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttca 37089226  T
Q  435 tcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| |||||    
T  37089225 tcgaattcgcaaca 37089212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 9863792 - 9864196
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg--ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||   |||| ||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||||      
T  9863792 aaactagggtttgt--agagtttgttcttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgg 9863889  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcat---tatagtgaaac 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||    
T  9863890 gaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcatcattatagtggaac 9863988  T
Q  244 agagggctgatctctctcccaca--ctaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctac 340  Q
     ||| |||| |||||| ||| ||  ||| || | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  9863989 ggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctctcgttgttttctac 9864087  T
Q  341 ttttatttgtga--ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcga 438  Q
    ||||  ||||||  ||||||| | |   |||| | |||||||| ||| |||||   ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  9864088 ttttgcttgtgattttataac-tgttcccactttattttggtttcttgattattttttcttccacacatcaagtattttattgatgtgatttttcaacga 9864186  T
Q  439 attcacaaca 448  Q
    ||||||||||    
T  9864187 attcacaaca 9864196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 27499202 - 27499536
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |   | |||| ||||||||||     
T  27499202 tattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaag 27499298  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  27499299 gttactcatcattatattgaaacgaagggctgctctttc-cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 27499397  T
Q  320 ttt-------tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatca 409  Q
    |||       ||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||   || ||||||||||||    
T  27499398 tttctctctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccataaactttgttttggttgcttggttattcattgctccacacatca 27499497  T
Q  410 agtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27499498 agtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcagaaca 27499536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 413
Target Start/End: Original strand, 4215508 - 4215756
Alignment:
Q  166 ggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| ||||     
T  4215508 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccag 4215606  T
Q  266 actaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--ctt 361  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||||   ||||||||||||   ||    
T  4215607 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc--tttcttttctctcgcagttttctacttttggcttgtgattataattgtt 4215704  T
Q  362 ctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
      ||||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||    
T  4215705 tcatacactttgtttttgttgcttgattattccttgcttcacacatcaagtt 4215756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22046878 - 22046525
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22046878 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22046779  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  22046778 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 22046681  T
Q  303 cgtgtgttc------tctttttctt-ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      |||||||      ||||||| || |||||   |||||||||||||||| | ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  22046680 tttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgtcgttgttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 22046581  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22046580 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgatcgaattcacaacaa 22046525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 24348358 - 24348554
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24348358 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccatt 24348457  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  24348458 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24348554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5635611 - 5635473
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |    
T  5635611 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 5635513  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  5635512 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 5635473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31983722 - 31983472
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||   || |||||||| |||||| || |    
T  31983722 ttcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaaccctt 31983623  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| | | || |||  |||||| ||||||||||    
T  31983622 tgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-ccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaacaaatt 31983524  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||||||||||    |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31983523 tcgtgtgttc----tttc-tttctctcgttgttttctacttttacttgtgtttataa 31983472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14789496 - 14789272
Alignment:
Q  232 ttatagtgaaacagagggctgatctctctcccaca--ctaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtg-ttctctttttcttttctca 327  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||  ||||||| || || ||||     
T  14789496 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctct 14789397  T
Q  328 agttgttttctacttttat-ttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||| |  |  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14789396 agttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtg 14789297  T
Q  425 tgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  14789296 tgatttttcatcgaattcgcaacaa 14789272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 53405286 - 53405627
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattctt------gtaatccattgatatttcttt 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||||  ||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||      |||| |||||||| | |||||    
T  53405286 tattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttt 53405385  T
Q  215 tgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttct- 312  Q
    || || | |||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |  | ||||||     
T  53405386 tgaaacgatactcatcat-atagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttctt 53405482  T
Q  313 -----cttt---ttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccac 403  Q
         ||||   |||||||| |  | ||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  53405483 ctcttctttgtgttcttttcgcc-gatgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccac 53405581  T
Q  404 acatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  53405582 acatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 53405627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 7941463 - 7941659
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7941463 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 7941562  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7941563 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 7941659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Original strand, 5198577 - 5198744
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  5198577 tattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 5198676  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5198677 gatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 5198744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40999200 - 40998998
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||      
T  40999200 aaactaggggttgtatagagtttgctcttgacaacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgg 40999101  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||    ||||||   | |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40999100 gaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacaga 40999001  T
Q  247 ggg 249  Q
    |||    
T  40999000 ggg 40998998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2485065 - 2484870
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2485065 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccatt 2484966  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2484965 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 2484870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16931954 - 16931630
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  16931954 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 16931856  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc------tctttttctttt 323  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||      ||||||  | ||    
T  16931855 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttttgttctt 16931757  T
Q  324 ctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    |||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  16931756 ctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacattaag-ttgttattg 16931658  T
Q  422 atgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16931657 gtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 16931630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22782903 - 22782576
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  22782903 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatc 22782805  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  22782804 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 22782706  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  22782705 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgtta 22782607  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22782606 ttggtgtgatttttcgtcgaattcgcaacaa 22782576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 448
Target Start/End: Original strand, 5664570 - 5664722
Alignment:
Q  299 atttcgtgtgttctctttttcttttctcaagtt---gttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||   |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  5664570 atttcgtgtgttctctctttcttttctctcgttaatgttttctacttttggtttgtcattataacttccatacactttgttttggttgcttgattattac 5664669  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5664670 cttctccacacatcaagtattttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 5664722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 9148393 - 9148588
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9148393 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 9148492  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  9148493 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9148588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 11435095 - 11435290
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11435095 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 11435194  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  11435195 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11435290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26086169 - 26085986
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26086169 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 26086070  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    | | | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | || ||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26086069 gttttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactg 26085986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 38409345 - 38409540
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38409345 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccatt 38409444  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38409445 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38409540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Original strand, 56030584 - 56030766
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  56030584 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 56030683  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||     |||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  56030684 gacatttcttttgtaacgttattcatcat----atgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgg 56030766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 448
Target Start/End: Original strand, 56030828 - 56030945
Alignment:
Q  331 tgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgattt 430  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| | | | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  56030828 tgttttctacttttgtttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcgtgactatctcttgctccacatatcaagtttattattggtgtgattt 56030927  T
Q  431 ttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||| |||||    
T  56030928 ttcatcgaattcgcaaca 56030945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 301
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101264
Alignment:
Q  165 gggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccca 264  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||| ||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatctc-ccca 5101227  T
Q  265 cactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  5101228 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 5101264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9176639 - 9176485
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  9176639 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 9176541  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaac 287  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9176540 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 9176485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22044566 - 22044388
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||     
T  22044566 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 22044468  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22044467 gttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22044388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47210928 - 47210761
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  47210928 tattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 47210829  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  47210828 gatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactg 47210761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 11437561 - 11437698
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |    
T  11437561 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 11437658  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  11437659 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11437698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22132584 - 22132387
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22132584 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22132485  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22132484 gatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttc 22132387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 18847321 - 18847488
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  18847321 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 18847419  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18847420 a-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 18847488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31849791 - 31849596
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31849791 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccatt 31849692  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||    
T  31849691 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3937266 - 3937125
Alignment:
Q  305 tgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccaca 404  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||    
T  3937266 tgtgttctctctttcttt-ctctcgttgttttctacttttgtttgtgattttatcttccatacactttg-tttggttgcttgattatcccttgctcctca 3937169  T
Q  405 catcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3937168 catcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 3937125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9174339 - 9174141
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattga-gtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||    
T  9174339 ttcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcat 9174240  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  9174239 tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 9174142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16934308 - 16934138
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  16934308 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 16934210  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  16934209 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 16934138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22780538 - 22780211
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  22780538 gagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatc 22780440  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  22780439 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 22780341  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||   ||||||||||||||||   || |  |||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  22780340 ttctcgccgttgttttctacttttggcttatatttataactttgatacgctttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgtta 22780242  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780241 ttggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 22780211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11006371 - 11006234
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |    
T  11006371 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 11006274  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  11006273 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaatt 11006234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446501
Alignment:
Q  184 acttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggact 283  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||           |||||||     
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctg--ctctctccca-----------tttggacc 24446669  T
Q  284 gaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataacttct--atacactctgttttgg 379  Q
    ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||   ||||| |||||| || |  ||||||| | ||||||    
T  24446668 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-cttttctctc-ttgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 24446571  T
Q  380 ttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24446570 ttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 24446501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 51015386 - 51015581
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51015386 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 51015485  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || |||||||   ||||||||| ||||||| | | |||| ||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  51015486 gatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51015581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3824763 - 3824635
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3824763 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3824664  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcat 232  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  3824663 gatttctcttttgtaacgttactcatcat 3824635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5637658 - 5637530
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  5637658 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccatt 5637559  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcat 232  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  5637558 gatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22134750 - 22134613
Alignment:
Q  163 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcc 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| ||    
T  22134750 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cc 22134654  T
Q  263 cacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22134653 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttc 22134613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 358
Target Start/End: Original strand, 25357859 - 25358035
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttgg 280  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||| |||||| || | ||||||| | | ||||    
T  25357859 agacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattgg 25357958  T
Q  281 actgaactggataaacaaa-tttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  25357959 acctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctctt--ctttctctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataa 25358035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563248
Alignment:
Q  212 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgtt 310  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  ||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 47563107  T
Q  311 ctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacat 407  Q
    |||| || |||| |||  | ||||||||||||||   || || |||||| |  || ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||    
T  47563108 ctctcttccttt-ctctcgctgttttctacttttggcttatgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacat 47563206  T
Q  408 caagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  47563207 caagtttgttattggtgtggttttctcatcaaattcacaaca 47563248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3982355 - 3982202
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggt-tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgta 218  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||  ||  |||||||||||||| |   || |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  3982355 tattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgta 3982256  T
Q  219 aagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | || |||||||    
T  3982255 aagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggt 3982202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 44600003 - 44599679
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  44600003 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 44599905  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||      |    
T  44599904 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttcttttgttct 44599806  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    ||||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  44599805 tctcgccgttgttttctacttttgccttgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatc-cttgctccacacatcaag-ttgttatt 44599708  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  44599707 ggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 44599679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 49088960 - 49089045
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49088960 atacactttgttttggttgcttgactatcccttactcaacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 49089045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11008700 - 11008565
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |    
T  11008700 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttc-tttgtaatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 11008605  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  11008604 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 11008565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18709356 - 18709159
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  18709356 ttcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 18709257  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||| ||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  18709256 gatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 18709159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52942594 - 52942536
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52942594 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 9022410 - 9022605
Alignment:
Q  74 ctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttgga-aaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtag 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||| |||||| ||| | ||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |    
T  9022410 ctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttg 9022509  T
Q  171 aattaggcgaga-gacttattcttgtaa--tccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccca 264  Q
    |||||||   || |||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  9022510 aattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 10112953 - 10113352
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  10112953 aaactagggtttgt--agagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacgg 10113050  T
Q  148 g-aagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccatt-gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    | ||||||||  |  |||||||||||||||    || |||| |||||||||| |  || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||      
T  10113051 ggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctcttt-gtaatgttactaatcattatagtggaatg 10113149  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct-tttctcaagttgttttctactt 342  Q
    ||| |||| |||||| || | ||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||  |||| |||||||    
T  10113150 gagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggtaaaaaaaattcatgtgttctttctttctctctctcaa--tgttatctactt 10113247  T
Q  343 ttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||  ||||| |||||| |   |  |||| |||||||||| ||| |||||   || ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  10113248 ttgcttgtgtttataaatgtcacccactttgttttggttgcttgattat--tttgctccacacatcaaatattttattggtgtgatttttcaacgacttc 10113345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18311275 - 18311214
Alignment:
Q  389 tatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18311275 tatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 18311214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 449
Target Start/End: Original strand, 22295412 - 22295647
Alignment:
Q  212 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgtt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   || |||||| |||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22295412 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgtt 22295511  T
Q  311 ctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatca 409  Q
    ||| | ||| ||||||  | |||||||||| |||  ||||| |||||| || |   ||| ||| | |||||||||| |||||   || ||| | ||||||    
T  22295512 ctc-tcttcctttctctcgctgttttctacctttgcttgtgtttataa-ttgttcccacactgatattggttacttgattat--tttgctctagacatca 22295607  T
Q  410 agtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  22295608 agtattttattggtgtgattttttaacgaattcacaacaa 22295647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 458
Target Start/End: Original strand, 5101320 - 5101414
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagtataatct 458  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  5101320 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgatccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaactacaatct 5101414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133326
Alignment:
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-t 323  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||| ||| | |||||||| |  |||||||||| ||  ||| |    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 6133197  T
Q  324 ctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |  |  ||||||| ||||| |||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6133198 ctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttcggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttatt 6133297  T
Q  421 gatgtgattttt--catcgaattcacaac 447  Q
    | ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  6133298 ggtgtaattttttccatcgaattcacaac 6133326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 449
Target Start/End: Original strand, 10114565 - 10114799
Alignment:
Q  213 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttc 311  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||  || |||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||| | | |||||||||||| |||||||    
T  10114565 tttgtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgttc 10114664  T
Q  312 tctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag 411  Q
    ||| |||| ||||||  |||||| ||||| |||  ||||| ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| || ||   ||| ||||||||||||     
T  10114665 tctctttc-tttctctcgttgttatctaccttttcttgtgtttataactatcacccactttgttttggttgctttataat--tttattccacacatcaaa 10114761  T
Q  412 tttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  10114762 tattttattggtgtgatttttcaacgaactcacaacaa 10114799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3937378 - 3937314
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattct 192  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3937378 attgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 5198813 - 5198895
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5198813 atacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaag-ttattattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 5198895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3578756 - 3578616
Alignment:
Q  213 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||| |||| ||||||  | | || ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  3578756 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtactc 3578658  T
Q  312 tctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
    ||       ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3578657 tc-------tttctctcgttgttttctacttttatttgtgtttataact 3578616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11006177 - 11006088
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagtata 454  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  11006177 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgtttttcgatcgaattcacaacaattata 11006088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3824523 - 3824447
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt--tcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3824523 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaaca 3824447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11008491 - 11008407
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  11008491 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgtttttcgatcgaattcacaacaa 11008407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 24348606 - 24348693
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24348606 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 24348693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2484797 - 2484715
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2484797 atacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 2484715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5336952 - 5336777
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||  | |||| |||||   ||||  |     
T  5336952 gattgagtctcttggtcacgggaagagattg-ggacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctttgtaaaagaaat 5336854  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| || | | ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  5336853 tcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaatt 5336777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 7941728 - 7941814
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7941728 ttccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttgttggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 7941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31849522 - 31849440
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31849522 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 31849440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 450
Target Start/End: Original strand, 11437767 - 11437857
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgtttt-ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||| ||||||| |||||| || | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437767 ttccatacactttgtttttggctgcttgattatctcttgctccatacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaag 11437857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 47868821 - 47868895
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47868821 ttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 47868895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 179
Target Start/End: Original strand, 6133029 - 6133087
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcg 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6133029 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg 6133087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16934061 - 16933987
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| |||||||  | ||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934061 tgttttggttgcttaatt--cccttgctccacacattaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 16933987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 51015650 - 51015739
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  51015650 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgttttttcgaacgaattcacaacaa 51015739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8631342 - 8631259
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8631342 atacactttgttttagttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 8631259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9174069 - 9173986
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9174069 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattagtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 9173986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9176397 - 9176314
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9176397 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcgtcgaattcgcaacaa 9176314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22044315 - 22044231
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  22044315 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgttatttttcgatcaaattcacaaca 22044231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38270070 - 38269994
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  38270070 tgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg-ttttctatcgaattcccaacaa 38269994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 47210720 - 47210636
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  || ||||||| ||||||    
T  47210720 atacactttgttttggttgctttattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttcacaacgaattcgcaacaa 47210636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5635400 - 5635318
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5635400 atacactttgttttggttgattgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 5635318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 9148640 - 9148727
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  9148640 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgttccacacatcaag-ttgttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaaca 9148727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 439
Target Start/End: Original strand, 11435359 - 11435438
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgtttt-ggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11435359 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaa 11435438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18709098 - 18709003
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgt-gatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  18709098 ttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatgccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtggttttttcatcaaattcacaaca 18709003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 442
Target Start/End: Original strand, 14633723 - 14633804
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14633723 ttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaattc 14633804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 302
Target Start/End: Original strand, 26557833 - 26557923
Alignment:
Q  213 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| |||| || | | |||||| ||||| | |||||||||||    
T  26557833 tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattt 26557923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 18847558 - 18847645
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  18847558 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttgatcagattcacaacaa 18847645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22134540 - 22134456
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||  |||||||||||    
T  22134540 atacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattattgatcagattcacaacaa 22134456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 301
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088907
Alignment:
Q  186 ttattcttgtaatccattgatat-ttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctct-ctcccacactaggttaatttggact 283  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | |||| ||||||| ||||||| |     
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatca-tatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggcc 49088889  T
Q  284 gaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  49088890 gaactgggtcaacaaatt 49088907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Original strand, 4558588 - 4558640
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4558588 ctccacgcatcaagtttattattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 4558640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Original strand, 24465558 - 24465976
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  24465558 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtatagcgtttgctcttggcaacaaacactagggttgaattgattcaccttgggaaacaatattagga 24465657  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24465658 ttgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaagt-actca 24465756  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    |||||||| |||||| |  | ||| |||||| |||| ||||| | ||| || || ||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||      
T  24465757 tcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatttcgtgt--tctctctttcttttctctc 24465854  T
Q  329 gttgttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24465855 gctgttttctacttttggtttgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgaatatcacttgttccacacatcaaatttattattggtgtga 24465954  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24465955 tttttcatcgaattcacaacaa 24465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 449
Target Start/End: Original strand, 7188583 - 7188980
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaag 151  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||     
T  7188583 tagggtttgtatagggtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaat 7188682  T
Q  152 agattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggct 251  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||    
T  7188683 agattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggct 7188782  T
Q  252 gatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgt 350  Q
    | |||||  ||||  ||| || |  ||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||  ||||    
T  7188783 gctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaattttgcgtgttctc--tttcttttctctcgctgttttctacttttgcttgt 7188880  T
Q  351 gattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7188881 gtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattttttgatcgaattcacaacaa 7188980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 24748707 - 24749036
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  24748707 tattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 24748806  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |  |||||||||| |||     
T  24748807 gttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttt- 24748905  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
     ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24748906 atttctctcgttgttttctacttttgtttgtgattataacttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttat 24749005  T
Q  420 tgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24749006 tggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 24749036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 158 - 448
Target Start/End: Original strand, 22393872 - 22394161
Alignment:
Q  158 aggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctc 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  22393872 aggttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctc 22393971  T
Q  258 tctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgatta 355  Q
    || || | ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22393972 tcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttc-tttctctcgttgttttctacttttggtttgtgatta 22394070  T
Q  356 taacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  22394071 taacttccatacactttgttttggttgtttgactatcacttgctc--cacatcaagtttattattggtggaatttttcatcgaattcacaaca 22394161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13099669 - 13099316
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  13099669 ttcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccatt 13099570  T
Q  204 gatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  13099569 gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 13099470  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
    |  |||||||||| || ||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||||||  || |  ||| ||    
T  13099469 ttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgacgatccct 13099370  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099369 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 13099316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27832826 - 27832487
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27832826 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27832727  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||     |||||| |||||||||| |    
T  27832726 gatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttg-----aactgggtaaacaaatt-c 27832633  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  | | ||||    
T  27832632 ttgtgttatctctttctttctctcac--tgttttctacttttggtttgtgattataacttccatacactttgttttggttacttgattatttcctgctcc 27832535  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27832534 acacattaagtttgttattggtatgatttttcatcgaattcacaacaa 27832487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24817601 - 24817290
Alignment:
Q  51 aactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctga 149  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  24817601 aactagggtttgtatagagtttgctctttgcaacaaacactagggttgggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacggga 24817502  T
Q  150 agagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaggg 249  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  24817501 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgg 24817402  T
Q  250 ctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttattt 348  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  24817401 ctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaacttggtaaacgagtttcgtgtgttctgtctttcttttctctcgttgttttctaattttgttt 24817302  T
Q  349 gtgattataact 360  Q
    ||| ||||||||    
T  24817301 gtgtttataact 24817290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Original strand, 26295601 - 26295885
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||      
T  26295601 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcct 26295700  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataact 360  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||   ||||||||||||||||   ||||| |||||| |    
T  26295701 ccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaa-ttcttgtgttatctctttc-tttctttcgttgttttctacttttggcttgtgtttataatt 26295798  T
Q  361 tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |  ||||||| ||||||| || ||| |||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  26295799 ttcatacactttgttttgattgcttgattatcacgtgctccatacatcaagtat-ttattggtgtgatttttcatcaatttcacaaca 26295885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24813747 - 24813348
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctg 148  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  24813747 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaagaaacactagggttgggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacggg 24813648  T
Q  149 aagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagg 248  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  24813647 aagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatg 24813548  T
Q  249 gctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatt 347  Q
    |||| | |||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  24813547 gctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttccttttctctcgttgttttctacttttgtt 24813448  T
Q  348 tgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    | || |||||| || |   |||  || | |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24813447 tatgtttataa-ttgttaccacgttgatattggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtga-ttttcatcgaactcacaa 24813350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 21678103 - 21678507
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  21678103 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 21678202  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21678203 cgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaaca 21678301  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt 344  Q
    | |||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21678302 gtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaa-ttcttgtgttctc-tcttcttttctcccgctgttttctactttt 21678399  T
Q  345 -atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
       ||||| ||||||   |||  |||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  21678400 ggcttgtgtttataattgttccttacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacaaatcaagtttgttatcggtgtgatttttcatcgaatt 21678499  T
Q  442 cacaacaa 449  Q
    ||||||||    
T  21678500 cacaacaa 21678507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42331192 - 42330846
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggt--cacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatcca 201  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  42331192 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 42331093  T
Q  202 ttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  42331092 ttgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42330994  T
Q  302 -tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactta 397  Q
     |  |||||||||| ||||   ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||     
T  42330993 cttttgtgttctctctttc---tctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattg 42330897  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  42330896 ctccacacatcaagtttattattggcgtgatttctcatcgaattcgcaaca 42330846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4296127 - 4295788
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  4296127 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 4296028  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  4296027 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattct 4295929  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||| | ||||||||||  |   ||||||||||||   ||||| |||| |   ||||||||||| |||||||||| ||| || ||  ||| ||    
T  4295928 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgccattttctacttttggcttgtgtttattattgttctatacactttgttttggttgcttgatgattccttgct 4295830  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4295829 ccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 4295788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20137361 - 20137063
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |    
T  20137361 aaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgatta 20137262  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20137261 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacg 20137162  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||    
T  20137161 gagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttctacttt 20137064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 443632 - 444045
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | |    
T  443632 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgatta 443731  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  443732 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacg 443830  T
Q  245 gagggctgatctctctcccac-actaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt---tctcaagttgttttcta 339  Q
     ||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || ||||   ||||  | |||||||||    
T  443831 aagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctcgctgttttcta 443930  T
Q  340 ctttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga--tttttca 434  Q
    |||||   ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    
T  443931 cttttggcttgtgattataattgttcaatacactttgttttggttgcttgactattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgagttttctca 444030  T
Q  435 tcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||    
T  444031 tcgaattcacaacaa 444045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 39146239 - 39145858
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggttgt---gttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||     |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  39146239 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtta 39146140  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39146139 cgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg 39146040  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactt 342  Q
    | |||||| ||| |  || | ||||||| |||||| || ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  39146039 gggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactt 39145940  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    ||  |||||| ||||||   ||  ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39145939 ttggtttgtgtttataattgtttaatacaatttgttttggttgcttgattatcacttactccacacatcaagtttgttattg 39145858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 44724675 - 44725023
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44724675 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 44724774  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  44724775 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 44724873  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa---cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||    ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |    
T  44724874 tttgtgttctc-tcttcatttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataatatgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgc 44724972  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  44724973 tccacacatcaagtttgttattggtgtgttttcccatcgaattcgcaacaa 44725023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 439
Target Start/End: Original strand, 9679155 - 9679495
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9679155 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 9679254  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||   ||||| | |||||||| |    
T  9679255 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattct 9679353  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcactta 397  Q
      |||||| ||| || |||| ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | ||||||||||     
T  9679354 tttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcacttg 9679453  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||    
T  9679454 ctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaa 9679495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 447
Target Start/End: Original strand, 28487666 - 28488000
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  28487666 tattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 28487765  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||    
T  28487766 gttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttcttttc 28487864  T
Q  320 tt----ttc-tcaa---gttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    ||    ||| || |   |||||||||||||||| | ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  28487865 tttgtgttcttctagccgttgttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaa 28487964  T
Q  411 gtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaac 447  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28487965 g-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaac 28488000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31435240 - 31434892
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  31435240 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccatt 31435141  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||| | |||||||| |    
T  31435140 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattct 31435041  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   |||  |||||| | ||||| || ||| |||||  ||| ||    
T  31435040 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccttacactttattttgattgcttgattattccttgct 31434942  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31434941 ccacacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaattcgcaaca 31434892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 42223254 - 42223601
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || | |||    
T  42223254 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctatt 42223353  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| | |||||||| |    
T  42223354 gatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaatt-c 42223451  T
Q  304 gtgtgttctcttt-ttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
     | |||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||   ||||| ||||||   || |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  42223452 ttttgttttctctcttcttttctctcattgttttctacttttgccttgtgtttataattgttttatacactttattttggttgcttgattatcccttact 42223551  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  42223552 ccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttttatcgaattcgcaacaa 42223601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7092405 - 7092210
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7092405 ttcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 7092306  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7092305 gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 7092210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 421
Target Start/End: Original strand, 21990270 - 21990568
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21990270 attgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactc 21990369  T
Q  228 atcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tct 325  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |||| |||    
T  21990370 atca-tatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctct 21990468  T
Q  326 caagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    |  | ||||| ||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21990469 ctcgctgtttgctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttattattg 21990568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 9680933 - 9681266
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  9680933 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaa 9681032  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa-tttcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| | | || ||| |||  |||||||||| || |    
T  9681033 gttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttcc 9681131  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
    ||| ||||  | | ||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || ||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9681132 tttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacacatcaagttt 9681231  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     |||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  9681232 gttattggtgtgttttctcattgaatgcacaacaa 9681266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 21680064 - 21680472
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  21680064 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 21680163  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    || |||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21680164 ccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaaca 21680262  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaa---ctggataaacaaat-ttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctac 340  Q
    ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||   |||| | |||||||  |  | ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  21680263 gagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctc-tcttcttttctctcgttgttttctac 21680361  T
Q  341 tttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcg 437  Q
    ||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||| ||| | | |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||    
T  21680362 ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttgttgcatgattattccttgcttcacacatcaagcttgttattggtgtgggttttcatcg 21680461  T
Q  438 aattcacaaca 448  Q
    |||||||||||    
T  21680462 aattcacaaca 21680472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 314
Target Start/End: Original strand, 6332321 - 6332527
Alignment:
Q  110 ttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatat 208  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| || || ||||    
T  6332321 ttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatat 6332420  T
Q  209 ttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgt 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| || | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6332421 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 6332520  T
Q  308 gttctct 314  Q
    |||||||    
T  6332521 gttctct 6332527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27306423 - 27306076
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27306423 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccatt 27306324  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||  |||||| | |||||| |||    
T  27306323 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa-ttc 27306226  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactta 397  Q
     ||||||||| | ||||||||||     |||||||||| |||||   ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| |||     
T  27306225 ttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttgttttcttcttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttg 27306127  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  27306126 ttccacacatcaagtttgttattggtgtgatctctcatcgaattcgcaaca 27306076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37412320 - 37411964
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  37412320 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 37412221  T
Q  204 gatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| || | ||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||||     
T  37412220 gatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattc 37412121  T
Q  302 tcgtgtgttctc----tttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
    |  |||||||||     | ||||||||||  ||||||||||| ||||   ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  |    
T  37412120 ttttgtgttctcccttctcttcttttctctcgttgttttctagttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattcc 37412021  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtga--tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  37412020 ttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgagttttctcatcaaattcacaacaa 37411964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Original strand, 11355295 - 11355706
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  11355295 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 11355394  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11355395 caggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaaca 11355493  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttct--tttctcaagttgttttctact 341  Q
    ||| |||| |||||| || | |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||||||| || ||  | ||||  |||||||||||||    
T  11355494 gagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctcttacttctctctcttgttgttttctact 11355593  T
Q  342 ttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatc 436  Q
    |||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  11355594 tttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttattattggtgtgattttttcatc 11355693  T
Q  437 gaattcacaacaa 449  Q
    |||||| ||||||    
T  11355694 gaattcccaacaa 11355706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Original strand, 25276178 - 25276372
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  25276178 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 25276277  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtg 239  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276278 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 25276372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 20626134 - 20626481
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  20626134 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20626233  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  20626234 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20626332  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||||  |  |||||||     ||||||||||||||||   || |  |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  20626333 tttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgc 20626432  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20626433 tccacacatc-aggttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 20626481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 20630025 - 20630372
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  20630025 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20630124  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  20630125 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20630223  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||||  |  |||||||     ||||||||||||||||   || |  |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  20630224 tttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgc 20630323  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20630324 tccacacatc-aggttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 20630372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 20642444 - 20642791
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  20642444 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20642543  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  20642544 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20642642  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||||  |  |||||||     ||||||||||||||||   || |  |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  20642643 tttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgc 20642742  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20642743 tccacacatc-aggttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 20642791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7094653 - 7094468
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7094653 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 7094554  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7094553 gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgg 7094468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21592319 - 21591989
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||     
T  21592319 tattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 21592220  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-tttt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  21592219 gttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 21592121  T
Q  319 cttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
     || ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| | ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||     
T  21592120 tttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacact-ttttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtttg 21592022  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21592021 ttatagccgtgttttctcatcgaattcgcaaca 21591989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22828809 - 22828672
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22828809 tattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 22828710  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctct 258  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22828709 attactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Original strand, 24258504 - 24258757
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctg 148  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||||   | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |    
T  24258504 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 24258603  T
Q  149 aagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc---attatagtgaaacag 245  Q
    || ||||||||  ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |    
T  24258604 aaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacgg 24258703  T
Q  246 agggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  24258704 agggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaa 24258757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 38394082 - 38394435
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38394082 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 38394181  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  38394182 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 38394280  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  38394281 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 38394380  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38394381 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 38394435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20091794 - 20091581
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| | || ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| |||| | ||||||||||||      
T  20091794 aaactagggtttgtatagagtttgctattggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgg 20091695  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||    
T  20091694 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggag 20091598  T
Q  248 ggctgatctctctccca 264  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  20091597 ggctgctctctccccca 20091581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 3878673 - 3878869
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3878673 ttcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3878772  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3878773 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 48457766 - 48457945
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  48457766 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 48457865  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  48457866 gttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 48457945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 20299556 - 20299908
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20299556 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 20299655  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  20299656 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20299754  T
Q  303 cgtgtgttct------ctttttctt-ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||      |||| | || |||||  |||||||||||||||||   ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  20299755 tttgtgttcttctctcctttgtgttcttctcgcagttgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatct 20299854  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20299855 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcaaattcacaaca 20299908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 301
Target Start/End: Original strand, 18345578 - 18345833
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||| | ||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  18345578 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 18345677  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    | |||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | |     
T  18345678 cgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcg 18345776  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||| | ||||||||    
T  18345777 gagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaatt 18345833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7351817 - 7351490
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  |||||||    
T  7351817 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 7351719  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-ctttttcttt------ 322  Q
    || |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| ||||||          
T  7351718 at-atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 7351620  T
Q  323 -tctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
     ||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  7351619 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttaattatcccttactccacacatcaag-ttgttat 7351521  T
Q  420 tgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7351520 tggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 7351490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7470198 - 7470019
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  7470198 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 7470099  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7470098 gttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 7470019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 20297458 - 20297811
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  20297458 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccatt 20297557  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |    
T  20297558 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattct 20297656  T
Q  303 cgtgtgtt------ctctttttctt-ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||      |||||| | || |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  20297657 tttgtgttcttctcctctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatct 20297756  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20297757 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 20297811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 302
Target Start/End: Original strand, 35725 - 35922
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35725 ttcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 35824  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35825 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattt 35922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 28485679 - 28485857
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  28485679 tattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaac 28485778  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  28485779 gttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctctc-ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 28485857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22251720 - 22251604
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgata----tttcttttgtaaagt 222  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||||||||    
T  22251720 gattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagt 22251621  T
Q  223 tactcatcattatagtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  22251620 tactcatcattatagtg 22251604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 301
Target Start/End: Original strand, 1850018 - 1850273
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| | |    
T  1850018 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgctta 1850117  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||  || |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  1850118 cgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 1850216  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1850217 gagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1850273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40836935 - 40836740
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40836935 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 40836836  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  40836835 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40836740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 301
Target Start/End: Original strand, 40946430 - 40946620
Alignment:
Q  110 ttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatt 209  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |     
T  40946430 ttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttc 40946529  T
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |  ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  40946530 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40946620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1047117 - 1046922
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1047117 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 1047018  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1047017 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1046922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7472173 - 7471977
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7472173 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccatt 7472074  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7472073 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 7471977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 25542642 - 25542820
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||     
T  25542642 tattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 25542740  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  25542741 gttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25542820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9027358 - 9027034
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  9027358 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 9027261  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttctcttt-----ttcttttc 324  Q
    |  |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||  ||     || | |||    
T  9027260 a-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttcttcttattaattatgttc 9027162  T
Q  325 -tcaa---gttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
     || |   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  9027161 ttctagccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 9027063  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  9027062 tggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 9027034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 44677 - 44856
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  44677 tattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 44776  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||  |||| | |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  44777 gttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 44856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 1606504 - 1606827
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  1606504 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 1606601  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt-cgtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||| | |  |||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||| |||||      |    
T  1606602 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttcttcttcttcttttgttct 1606700  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    ||||   ||||||||||||||||   ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  1606701 tctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttatt 1606799  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606800 ggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 1606827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 2935392 - 2935562
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  2935392 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 2935490  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2935491 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 2935562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1049465 - 1049293
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||    
T  1049465 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatact 1049367  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1049366 catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1049293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43253710 - 43253525
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||   |||||  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  43253710 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 43253611  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| | || ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  43253610 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgg 43253525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349013
Alignment:
Q  138 ttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatag 237  Q
    ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  6349012 tg 6349013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 11757326 - 11757454
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11757326 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 11757425  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcat 232  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  11757426 gatttctcttttgtaacgttactcatcat 11757454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 3035878 - 3036016
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |    
T  3035878 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 3035976  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3035977 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3036016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 22392482 - 22392608
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  22392482 gaaacaagggtttataaatcaaactagggtttgtatagaatttgctattggcaacaaacactagggttgggttgattcaccttgggaaacactattagga 22392581  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagat 155  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22392582 ttgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7349438 - 7349116
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  |||||||    
T  7349438 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 7349340  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-ctttttcttt------ 322  Q
    || |||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||| |     |||||||||| | ||||||| ||| ||||||          
T  7349339 at-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaagtc----aacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgcgttc 7349245  T
Q  323 -tctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
     ||||   |||||||| |||||||   ||||  |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  7349244 ttctcgccgttgtttt-tacttttggcttgtatttataactttcatacactttattttggttgcttaattatcccttactccacacatcaag-ttgttat 7349147  T
Q  420 tgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349146 tggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 7349116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16297218 - 16297004
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatcc-a 201  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    | ||| | |||||||||| ||      
T  16297218 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaaccctt 16297119  T
Q  202 ttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||| || | |||| || | | |||||| ||||||  |||||||||    
T  16297118 ttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaat 16297019  T
Q  301 tt-cgtgtgttctct 314  Q
    || ||||||||||||    
T  16297018 ttccgtgtgttctct 16297004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 22108191 - 22108358
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  22108191 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 22108288  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  22108289 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 22108358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 40549951 - 40550118
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  40549951 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 40550048  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  40550049 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 40550118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20091176 - 20091041
Alignment:
Q  277 ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctttt-ctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgt- 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||     
T  20091176 ttggaccgaactggataaataaatt-cgtgtgttctctctttctttttctctcgttgttttctacttttacttgtg-ttataacttccatacactttgta 20091079  T
Q  375 tttggttacttaattatcacttactccacacatcaagt 412  Q
    | ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  20091078 tctggttgcttgattattacttgctcaacacatcaagt 20091041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 11081619 - 11081842
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatcc--attgatatttcttttgt 217  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||| ||   ||||||| |||| |||    
T  11081619 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgt 11081718  T
Q  218 aaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctcttt 316  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||| || || || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  11081719 aaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 11081818  T
Q  317 ttcttttctcaagttgttttctac 340  Q
    || ||| |||  | ||||||||||    
T  11081819 ttttttcctctcgctgttttctac 11081842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31156076 - 31155906
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||||||||    
T  31156076 gagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 31155978  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
      ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31155977 -ctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 31155906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 38396789 - 38396926
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||  |||||||||| ||||||| | | |||||||  |||||| |    
T  38396789 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccc 38396886  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38396887 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38396926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 22137202 - 22137369
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  22137202 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 22137299  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  22137300 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 22137369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 40552229 - 40552396
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  40552229 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 40552326  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  40552327 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 40552396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 3878952 - 3879028
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3878952 tgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt-attattgatgtgatttctcatcgaattcgcaacaa 3879028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 11759492 - 11759576
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11759492 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 11759576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40281548 - 40281336
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||| || |||||       ||||||||||||    
T  40281548 gattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgat-------ttgtaaagttac 40281456  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    ||||| || | ||| |||  |||| || |||||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40281455 tcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaattttgtgtgttctctctttcttttc 40281356  T
Q  325 tcaagttgttttctactttt 344  Q
    || || ||||||||| ||||    
T  40281355 tctagctgttttctaatttt 40281336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 40550204 - 40550278
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40550204 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 40550278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 358
Target Start/End: Original strand, 6046647 - 6046843
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct 260  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||     
T  6046647 tttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcc 6046745  T
Q  261 cccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    |||| ||||||| | | |||||| ||| |||||| |||||||  |  |||||||| | | |||||||  ||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6046746 cccagactaggtcagtattggaccgaattggatagacaaattatgcatgttctctctct-ttttctctcgtttttttctacttttgcttgtgtttataa 6046843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 22137454 - 22137527
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22137454 ttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaaca 22137527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 40552481 - 40552554
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40552481 ttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaaca 40552554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7471904 - 7471820
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7471904 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcattgaattcgcaacaa 7471820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 28485926 - 28486014
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28485926 ttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccacatatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 28486014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13290583 - 13290452
Alignment:
Q  188 attcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaa 286  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||| | || ||| ||| | | |||||| |||    
T  13290583 attcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaa 13290485  T
Q  287 ctggataaacaaatttcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13290484 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc 13290452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 25542889 - 25542976
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||| | ||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25542889 ttccatacattttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 25542976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 40946695 - 40946777
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40946695 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattgatgtga-ttctcatcgaattcacaaca 40946777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6067370 - 6067169
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||| |||||   ||||  ||    
T  6067370 gatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaac 6067272  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttctttt 323  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||||    
T  6067271 tcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttcttcttttctttt 6067172  T
Q  324 ctc 326  Q
    |||    
T  6067171 ctc 6067169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 449
Target Start/End: Original strand, 6349076 - 6349237
Alignment:
Q  284 gaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttac 383  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||  | | ||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |    
T  6349076 gaactgggtaaacaaatttcctgt--tctctctttcttt-ctctcgctattttctacttttgcttgtgtttataacttccgtacactttgttttggttgc 6349172  T
Q  384 ttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| |||| ||||| || |||||| | |||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  6349173 ttgattattacttgctccatacgtcaagtat-ttattggtgtgagttttgaacgatttcacaacaa 6349237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804956
Alignment:
Q  261 cccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgatta 355  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || ||||||||   | |||||||||||||||| | ||||| |||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-cttttctctcgatgttgttttctacttttgacttgtgttta 26804860  T
Q  356 taact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |  || ||||||| |||||||||| ||| | ||||  || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26804861 taattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttctcatcaaattcgcaacaa 26804956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 442
Target Start/End: Original strand, 38397000 - 38397080
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38397000 ttctatacactttgttttggttgctttattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattc 38397080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 26804668 - 26804761
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaa 197  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26804668 ttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 44925 - 45012
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  44925 ttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaattcgcaaca 45012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 2935630 - 2935716
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2935630 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgcttcacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 2935716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 48458014 - 48458100
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  48458014 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 48458100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40836667 - 40836581
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttc-atcgaattcacaacaag 450  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40836667 atacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgatcgaattcgcaacaag 40836581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 446
Target Start/End: Original strand, 3036085 - 3036170
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3036085 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaaattg-ttattggtgtgatttctcatcgaattcacaa 3036170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22280444 - 22280390
Alignment:
Q  192 ttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22280444 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaacaga 22280390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 437
Target Start/End: Original strand, 35990 - 36066
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcg 437  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  35990 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcg 36066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20137066 - 20136977
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgattttt-catcgaattcacaacaagtataatctaccc 462  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  20137066 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaaatttattattcgtatgattttttcatcgaattcacaacaaaaataatcaaccc 20136977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 1850346 - 1850429
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||   ||||||||| |||||    
T  1850346 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttcaaatcgaattcgcaaca 1850429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 6048983 - 6049098
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||||||   | |||| ||||||| ||| || |||||| | | |||||||    
T  6048983 tattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgata-tccctttgtaa 6049081  T
Q  220 agttactcatcattata 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  6049082 agttactcatcattata 6049098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31153741 - 31153690
Alignment:
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31153741 actccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 31153690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43253440 - 43253358
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  43253440 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa-attgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 43253358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7092127 - 7092061
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 441  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  7092127 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaatt 7092061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7094350 - 7094300
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7094350 ctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 7094300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Original strand, 16104631 - 16104680
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  16104631 ctccacacgtcaagtttattattggtgtga-ttttcaccgaattcacaaca 16104680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7469946 - 7469863
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7469946 atacactttgttttagttgcttgattatccctg-ctccacacatcaaattg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 7469863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1046831 - 1046756
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  1046831 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcttcgaattcgcaacaa 1046756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1049203 - 1049128
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg-atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  1049203 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgaatttttcttcgaattcgcaacaa 1049128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 40281284 - 40281236
Alignment:
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaac 447  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  40281284 tccacacatcaagtattttattgttgtgacttttcaacgaattcacaac 40281236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Original strand, 45366863 - 45366912
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  45366863 ctccacacatcaagttt--tattgatttgattttacaacgaattcacaacaa 45366912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 40134030 - 40134378
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  40134030 ttcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 40134129  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  40134130 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattct 40134229  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaat--tatcacttact 399  Q
      |||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||  |||||||| ||    
T  40134230 tttgtgttctctattctttttctctcgttgttttctacttttggcttgagattataacttccatacactttgttttggttgcctgattatatcacttgct 40134329  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134330 ccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 40134378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 16429043 - 16429388
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  16429043 ttcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 16429142  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| |    
T  16429143 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattct 16429242  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
      ||||||||| | ||||||||||  | ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  16429243 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttttc-acttttggtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctcc 16429340  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16429341 acacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 16429388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6115361 - 6114953
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttgttcaacttggaaaatattattaagat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |      || || |||||     |||| |||| |||| | ||||| |||    
T  6115361 gaaacaagggtttagaaatcaaattagggtttgtatagagtttgctcttgtc------tatta-ggttga----ttcaccttgaaaaacactattaggat 6115273  T
Q  130 tgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6115272 tgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttttgtaaaattactcat 6115173  T
Q  230 cattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaa 328  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||      
T  6115172 cattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctc-tcttcttttctctc 6115074  T
Q  329 gttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
    ||||| |||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| | | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  6115073 gttgtcttctacttttgacttgtatttataacttccatacattttattttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtatattaccggtgtga 6114974  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  6114973 tttttcattgaattcataaca 6114953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9241340 - 9240937
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  9241340 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggtta 9241241  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9241240 cgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 9241141  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |  | |||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||    
T  9241140 gagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctttc-tttctctcgctgttttctacttt 9241042  T
Q  344 t-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    |  |||||  ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  9241041 tggtttgtatttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacttcaagtttgttattggtgtgattttttatcgaat 9240942  T
Q  441 tcaca 445  Q
    |||||    
T  9240941 tcaca 9240937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17186300 - 17185978
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||     |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17186300 gattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttact 17186201  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttct 325  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||    
T  17186200 catcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-ct 17186102  T
Q  326 caagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgt 425  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17186101 ctcgctgttttctacttttgtttgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacatatcaagtttattattggtgt 17186002  T
Q  426 gatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  17186001 gatttttcatcaaattcacaacaa 17185978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 407
Target Start/End: Original strand, 16428680 - 16429043
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  16428680 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 16428779  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  16428780 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacg 16428879  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||    
T  16428880 gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgatgttttctacttt 16428978  T
Q  344 t-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacat 407  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  16428979 tggtttgtgtttataacttctatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacat 16429043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 443
Target Start/End: Original strand, 25127981 - 25128302
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25127981 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttact 25128080  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttct---tt 322  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || ||   ||    
T  25128081 catcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctt 25128180  T
Q  323 tctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  25128181 tctctcgctgttttctacttttatttgtgattataattgctatccactttgattttggttgcttgattattccttgctctacacatcaagtttgttattg 25128280  T
Q  422 atgtgatttttcatcgaattca 443  Q
    | |||| ||||||| |||||||    
T  25128281 acgtgagttttcattgaattca 25128302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 450
Target Start/End: Original strand, 18839673 - 18840024
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18839673 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18839772  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa---t 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||   |    
T  18839773 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 18839872  T
Q  301 ttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactta 397  Q
    |||||||  |||||| || || ||||  | ||||||||| ||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||| | |||||| |||||  |||     
T  18839873 ttcgtgttctctcttctt-ttctctctcgctgttttctagttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttcgattacttgattattccttg 18839971  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18839972 ctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaag 18840024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8349296 - 8348904
Alignment:
Q  57 ggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg--ttgttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagaga 154  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |  || |||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||    
T  8349296 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagaga 8349197  T
Q  155 ttgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgat 254  Q
    ||  |  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |    
T  8349196 ttaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgtt 8349097  T
Q  255 ctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgat 353  Q
    ||||| || | |||| || |  ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |    
T  8349096 ctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttc-tttctctaattgttttctacttttgtttgtgtt 8348998  T
Q  354 tataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8348997 tataacttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttgttccacacgtcaagttt-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 8348904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15669641 - 15669281
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaag 151  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  15669641 tagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 15669542  T
Q  152 agattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggct 251  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  15669541 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggct 15669442  T
Q  252 gatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcg-tgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttg 349  Q
    | |||||| || | ||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||    
T  15669441 gctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctttcttttctctcgctgtgttatacttttgtttg 15669342  T
Q  350 tgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| | || || ||||||||||    
T  15669341 tgtttataacttcgatacactttgttttgattgcttgattattatttgcttcacacatcaa 15669281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49495481 - 49495140
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaaatcaaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtgttg-ttcaacttggaaaatattattaaga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||| | || ||| |    
T  49495481 gaaacaagggtttataaatcaaactagggtttgcatatagtttgctcttggcaacaaacactatggttgagttgattcaccttgggaaacactaataaaa 49495382  T
Q  129 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49495381 ttgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 49495282  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttt-tctc 326  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||| || ||||| ||| ||||| | |||| ||||| |  ||| ||| || ||||||| ||||    
T  49495281 tcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattcttatgtattccctctttctttctctc 49495182  T
Q  327 aagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacact 370  Q
    |   |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  49495181 a--ctgttttttacttttgtttgtgattatatcttccatacact 49495140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18800824 - 18800426
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||| |||| | ||  ||| | ||||| |||||||||||| ||||||      
T  18800824 aaactacggtttgtatagagtttgctcttggccacaaatactagggttggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgg 18800725  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    | |||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18800724 gtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggag 18800625  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-a 345  Q
      ||| |||||| |||| |||||||||  |||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||      
T  18800624 aactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttgttttctctcgttgttttctacttttgg 18800525  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| | || ||| ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18800524 cttgtgtttataacttccatacactttgttttgattgcttgattattatttgctctacacatcaagtattttgttggtgtga-ttttcatcgaattcaca 18800426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25251453 - 25251123
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  25251453 tattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaag 25251354  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  25251353 gttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 25251254  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||     
T  25251253 tttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgattataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttg 25251154  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25251153 ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaa 25251123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 18307212 - 18307543
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  18307212 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaa 18307311  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  18307312 gttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 18307410  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  18307411 tttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcatttgctccacacatcaagtttg 18307510  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  18307511 ttattgatgtattttctcatcgaattcgcaaca 18307543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 42922260 - 42922579
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  42922260 aaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgg 42922359  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  42922360 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggag 42922459  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    | ||| |||||  |||  ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  42922460 gactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttc-tttctcccgttgttttctacttttgt 42922558  T
Q  347 ttgtgattataacttctatac 367  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  42922559 ttgtgtttataacttccatac 42922579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14183844 - 14183454
Alignment:
Q  49 caaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacc 146  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||     
T  14183844 caaactagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacg 14183745  T
Q  147 tgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 246  Q
     |||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14183744 ggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 14183645  T
Q  247 gggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
     ||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||            ||||| |  ||||  |||||||||| |||||     
T  14183644 tggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt------------tttttgtggtctctcgttgttttcttcttttg 14183557  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14183556 cttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaagtattttattggtgtgattttt-atcgaattcaca 14183458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50248750 - 50248417
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||     
T  50248750 tattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaag 50248651  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc--acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||||| |  |||||||||| ||    
T  50248650 gttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 50248552  T
Q  318 tcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
     |||| ||||  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  50248551 cctttctctctcgttgttttcaacttttggcttgtggttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaaatt 50248452  T
Q  414 tattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  50248451 tgttattggtgtgatttatcatcgaattcacaaca 50248417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38925673 - 38925327
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38925673 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccatt 38925574  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |    
T  38925573 gatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtaaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattct 38925478  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg--ttttggttacttaattatcactta 397  Q
      ||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||  |||||||| | | |||||||||||    
T  38925477 tttgtgttctc-tcttcttttctctcattgttttctacttttggcttgtgtttataaatgttccatacactttgatttttggttgcctgattatcactta 38925379  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  38925378 ctccacacatcaagtttattattggtgtgttttctcatcaaattcacaacaa 38925327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2949426 - 2949079
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||  ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  2949426 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 2949327  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  2949326 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 2949229  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  2949228 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgc 2949129  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949128 tccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 2949079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50307741 - 50307388
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  50307741 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 50307642  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat--t 301  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||  |    
T  50307641 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 50307543  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcac 394  Q
    |  |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| |    
T  50307542 ttttgtgttctctcttatttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccc 50307443  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50307442 ttgctccagacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaattcccaacaa 50307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11457729 - 11457328
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgct-cttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||| |||||| ||||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  11457729 aaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 11457630  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11457629 cgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 11457531  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactt 342  Q
    || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| || | || ||||  | ||||||||||||    
T  11457530 gatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctactt 11457431  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    ||   ||||| ||| ||   ||| ||| ||| |||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11457430 ttggcttgtgtttaaaattgttccatatactttgttttggttgcctgattatcacttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaa 11457331  T
Q  440 ttc 442  Q
    |||    
T  11457330 ttc 11457328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14098165 - 14097814
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||   | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  14098165 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccatt 14098066  T
Q  204 gatatttcttttgtaaa-gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  14098065 gatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 14097967  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcactt 396  Q
    |  |||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||    
T  14097966 ttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctctt 14097867  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     || |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14097866 gcttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttttcttcgaattcgcaacaa 14097814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 47906373 - 47906704
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  47906373 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 47906472  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | |||    
T  47906473 gttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttc 47906570  T
Q  320 ttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  47906571 ttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttggtttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-t 47906669  T
Q  414 tattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47906670 tgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 47906704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 13215167 - 13215518
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13215167 ttcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 13215266  T
Q  204 gatatt----tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    ||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||    
T  13215267 gatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaa 13215366  T
Q  300 tttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
     ||| | |||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||||||  || | |||| ||    
T  13215367 -ttcttttgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatccct 13215465  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  13215466 tgctccacacatcaagtttattattggtgtgttttctcaacgaattcacaaca 13215518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17324831 - 17324482
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  17324831 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 17324732  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  17324731 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17324633  T
Q  303 cgtgtgttctct----ttttcttttctcaagttgttttctactt--ttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcac 394  Q
      ||||||||||    | ||||||||||  | ||||||||||||  |   || |||||||||   |||||| |||| |||| ||| | ||| | |||| |    
T  17324632 tttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctactttctggcttatgattataattgttctattcactttgttatggctgcttgactatccc 17324533  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcac 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17324532 ttactccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaattcac 17324482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8347524 - 8347136
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggtt-gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| || | |||| | |||| |||| ||| | ||| | ||||| |||||||||||||| ||||      
T  8347524 aaactagggtttgtatagagattgctcttggcaacaaacaccaaggttagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgg 8347425  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  8347424 gaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggag 8347325  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    || || ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||      
T  8347324 ggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatttcgtgtgttctctctttc-tttctatcgctgttttctacttttgc 8347226  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcga 438  Q
    || || |||||||||  ||| ||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  8347225 ttatgtttataactttcatatactttg-tttggttgcttgattattacttactccacgcatcaagtat-ttacttgtgtgatttttcatcga 8347136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25248747 - 25248398
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25248747 ttcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 25248648  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  25248647 gatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 25248548  T
Q  303 cgtgtgttctctttttc-ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||| | | || |  | ||||  | |||||||||||||| | || || ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| | |||  |||||    
T  25248547 tttgtgttttatcttccggtgtctctcgctgttttctacttttgacttttgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactattccttac 25248448  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25248447 tccacacatcaagtttgttattgttgtgatttttcatcgaattcacaaca 25248398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Original strand, 17318996 - 17319321
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17318996 gattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttact 17319095  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttc 324  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || | || ||    
T  17319096 catcattatagtaaaacggagggctgctctctc-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctc 17319194  T
Q  325 tcaagttgttttctactttt-atttgtgattataac--ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    ||  | | ||||||||||||   ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17319195 tctcgctattttctacttttggcttgtgtttataactattccatacactttgttttggttgtttgattattccttactccacacatcaaatttgttattg 17319294  T
Q  422 atgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  17319295 gtgcgatttttcatcgaattcacaaca 17319321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50076926 - 50076626
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  50076926 aaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 50076827  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50076826 cgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 50076727  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    || | ||| |||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||    
T  50076726 gatgactgctctctc-cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgttgttttctacttt 50076628  T
Q  344 ta 345  Q
    ||    
T  50076627 ta 50076626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4131557 - 4131221
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatattt----cttttg 216  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    ||||||    
T  4131557 tattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttg 4131459  T
Q  217 taaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||   | |||||||| |  ||||||||||     
T  4131458 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctctg 4131359  T
Q  315 ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag 411  Q
    || | || ||||  ||||||||||| ||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  4131358 ttcttttctctctcgttgttttctatttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccgcacatcaag 4131259  T
Q  412 tttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4131258 tttgttattggtgtgagtttttcatcgaattcgcaaca 4131221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916821
Alignment:
Q  190 tcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaa-tttggactgaact 288  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  289 ggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttg-ttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttactta 386  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||     
T  15916662 gggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttt-tctcgctgtttttctacttttggcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttg 15916760  T
Q  387 attatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15916761 attgttacttgctccacacatcaagtat-ttattggtgtgacttttcatcgaattcacaaca 15916821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12302759 - 12302367
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  12302759 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 12302660  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  12302659 cgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 12302561  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactt 342  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || | || ||||  ||||||||||||||    
T  12302560 gagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctactt 12302461  T
Q  343 tt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgattttt 432  Q
    || | ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12302460 ttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggtttcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttt 12302367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 432
Target Start/End: Original strand, 15823632 - 15823968
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15823632 ttcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 15823731  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |    
T  15823732 gatatctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 15823830  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcac 394  Q
      |||||||||| || | |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||| | |    
T  15823831 tttgtgttctctcttcttttttctcttgttgttgttttctacttttgccttgtgattataattgttccatacactttgattttggttgcctgattacccc 15823930  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgattttt 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15823931 ttactccacacatcaagtttgttattggtgtgattttt 15823968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Original strand, 23816030 - 23816323
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| || | | ||||| || |||||| |    
T  23816030 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatggatcggagggatgctctctccc 23816128  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa---tttcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgatt 354  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||     |||||||||||||||| | ||||||||    
T  23816129 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttcttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgatt 23816228  T
Q  355 ataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23816229 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 23816323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 41647006 - 41647356
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  41647006 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcatt 41647105  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   || |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  41647106 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 41647204  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcactta 397  Q
    | |||||||||| || |||| ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||  ||||||| || ||||||||   | ||||||||||     
T  41647205 cttgtgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttgacttgtgtttataattatttcatacactttgattttggttgtctgattatcacttg 41647304  T
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41647305 ctccgcacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 41647356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 39462605 - 39462956
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  39462605 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaacccttt 39462704  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  39462705 gatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 39462803  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||| ||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || ||||| || | | |||||| ||    
T  39462804 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctaattttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttgattgcctgattatccct 39462903  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39462904 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 39462956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30790571 - 30790250
Alignment:
Q  130 tgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactca 228  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||| |||  |||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30790571 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 30790472  T
Q  229 tcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt-tctc 326  Q
    ||||||||||| ||  || | ||| ||||| ||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  30790471 tcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 30790373  T
Q  327 aagttgtttt--ctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
        | ||||  ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||| || | |||||| ||    
T  30790372 gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 30790273  T
Q  425 tgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  30790272 tga-ttttcatcgaattcacaaca 30790250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31425213 - 31424861
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagt---ctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatcc 200  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |    
T  31425213 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactc 31425114  T
Q  201 attgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  31425113 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 31425015  T
Q  301 t-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
    | |  |||||||||| || | || ||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   | | ||||| | |||| ||||| ||| | |||  ||    
T  31425014 tcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtcccatacattttgttatggttgcttgagtattcct 31424915  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31424914 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcattgaattcgcaacaa 31424861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 440
Target Start/End: Original strand, 16432480 - 16432813
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||   |||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||    
T  16432480 ttcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccatt 16432579  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt- 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||     
T  16432580 gatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 16432679  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactc 400  Q
    |  ||||||||| | |||||||||   ||  ||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||| ||||||| || | | ||||| |||| |||    
T  16432680 ttttgtgttctc-tcttcttttct---gt--ttttctacttttggtttatgtttataactttcatacactgtgttttgattgcctgattattacttgctc 16432773  T
Q  401 cacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16432774 cacacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcgaat 16432813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28998448 - 28998093
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  28998448 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 28998349  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  28998348 gacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28998250  T
Q  303 cgtgtgttctc----tttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg---ttttggttacttaattatc 392  Q
      |||||||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||    ||||||| | | ||||||    
T  28998249 tttgtgttctctcttttcttcttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattctttggttgcctgattatc 28998150  T
Q  393 acttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  28998149 acttgctccacacatcaagtttgtcattggtgtgttttctcttcgaattcacaacaa 28998093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29004164 - 29003809
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  29004164 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 29004065  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  29004064 gacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 29003966  T
Q  303 cgtgtgttctc----tttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg---ttttggttacttaattatc 392  Q
      |||||||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||    ||||||| | | ||||||    
T  29003965 tttgtgttctctcttttcttcttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattctttggttgcctgattatc 29003866  T
Q  393 acttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  29003865 acttgctccacacatcaagtttgtcattggtgtgttttctcttcgaattcacaacaa 29003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 39932176 - 39932514
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  39932176 tattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 39932275  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctc-tctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctcttttt 318  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| |  ||||||||  | ||    
T  39932276 gatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctt 39932374  T
Q  319 ctt-------ttctc-aagttg-ttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatc 408  Q
    |||       |||||   |||| ||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  39932375 ctttgtgttcttctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatc 39932474  T
Q  409 aagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932475 aagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 39932514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50079016 - 50078819
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  50079016 ttcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccatt 50078917  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  50078916 gatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaatt 50078819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6995895 - 6995539
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||    
T  6995895 ttcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcatt 6995796  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  6995795 gacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 6995697  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttc----ttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattata--acttctatacactctgttttggttacttaattat 391  Q
      |||||||||| || ||    |||||||     ||||||||||||||||   ||||| |||||    ||| ||||||| ||||||| || ||| | |||    
T  6995696 tttgtgttctctcttctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttatagttgttccatacactttgttttgattgcttgactat 6995597  T
Q  392 cacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6995596 cccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 6995539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27339325 - 27338972
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27339325 ttcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccatt 27339226  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  27339225 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 27339128  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| || ||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| ||    
T  27339127 tttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccct 27339028  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt--tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27339027 tgttccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttctcaacgaattcacaacaa 27338972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 31489999 - 31490346
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| | ||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  31489999 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcatt 31490098  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31490099 gatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattct 31490196  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || | || ||||    |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||  ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  31490197 tttgtgttctctcttattttctctctccctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgc 31490296  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31490297 tccacacatcaagttt-gtattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 31490346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28207261 - 28206911
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| || ||||  || ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  28207261 ttcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcatt 28207162  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  28207161 gacatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28207065  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||||||    
T  28207064 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcact 28206965  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28206964 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcacaacaa 28206911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27337134 - 27336782
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27337134 ttcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27337035  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  27337034 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 27336937  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| || ||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||||| | | |||||| ||    
T  27336936 tttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccct 27336837  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt--tcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27336836 tgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttctcaacgaattcacaaca 27336782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 6823100 - 6823296
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  6823100 ttcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 6823199  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6823200 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6823296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10400023 - 10399827
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10400023 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 10399924  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10399923 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10399827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30738826 - 30738603
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |    
T  30738826 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctt 30738727  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatc--attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaa 299  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| | | ||||||  |||| | ||||||||    
T  30738726 tgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaa 30738627  T
Q  300 tttcgtgtgttctct-ttttcttt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  30738626 tttcgtgtgttctctcttttcttt 30738603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 6756656 - 6756810
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6756656 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaa 6756755  T
Q  248 ggctgatctct-ctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | ||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6756756 gactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaatt 6756810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 13761923 - 13762118
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13761923 ttcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 13762022  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13762023 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 13762118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15295029 - 15294833
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  15295029 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccatt 15294930  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15294929 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26613413 - 26613216
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  26613413 gattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttac 26613314  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| | ||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26613313 taatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttcttt 26613216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31423044 - 31422923
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactc 227  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31423044 attgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactc 31422945  T
Q  228 atcattatagtgaaacagaggg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  31422944 atcattatagtgaaagagaggg 31422923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31735716 - 31735520
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31735716 ttcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatt 31735617  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  31735616 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 31735520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 51750125 - 51750321
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51750125 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 51750224  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  51750225 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51750321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2510502 - 2510324
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  2510502 tattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaa 2510404  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  2510403 gttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 2510324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Original strand, 28842598 - 28842932
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||     
T  28842598 tattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 28842696  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  ||||||||  | |||    
T  28842697 gttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttctcttc 28842795  T
Q  320 tt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    ||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28842796 tttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaa 28842895  T
Q  411 gtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | || |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28842896 g-ttgttattagtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 28842932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9459612 - 9459277
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattga-gtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9459612 ttcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccat 9459513  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||    
T  9459512 tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 9459415  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    | | ||      | ||||| || |  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  9459414 c-tttg------tgttcttctcgc-cgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 9459323  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9459322 acacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 9459277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9463439 - 9463104
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattga-gtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9463439 ttcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccat 9463340  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||    
T  9463339 tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 9463242  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    | | ||      | ||||| || |  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  9463241 c-tttg------tgttcttctcgc-cgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcc 9463150  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9463149 acacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 9463104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13125631 - 13125310
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  13125631 gattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 13125532  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | || |||| | |||  ||||||| | | | |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  13125531 tcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctcttttctttc 13125432  T
Q  325 tcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||   |  |||| |||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||   |||||| ||    
T  13125431 tctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataactgtcacccact-tgttttggttgcttgattat-ttttgctccacacatcaagtaatttattggtg 13125334  T
Q  425 tgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| | ||||||| |||||    
T  13125333 tgatttttgaacgaattcgcaaca 13125310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 360
Target Start/End: Original strand, 27916526 - 27916838
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||| |||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |    
T  27916526 aaactagggtttgt--agagtttgctcttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacat 27916623  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatc--cattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||   || |||| |||||| ||| |  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  27916624 gaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacg 27916722  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttt 343  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  27916723 gagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatttcacatgttctcttttt-ttctctctcgttgttttctacttt 27916821  T
Q  344 tatttgtgattataact 360  Q
    || ||||| ||||||||    
T  27916822 tacttgtgtttataact 27916838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3579793 - 3579616
Alignment:
Q  122 attaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaag 221  Q
    |||| |||||||||||||| | ||   ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3579793 attaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 3579694  T
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |  || |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3579693 ttactcatcat--tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3579616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 23785953 - 23786278
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  23785953 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 23786051  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt-cgtgtgttc-tctttttctt------t 322  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||| |||||      |    
T  23786052 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttcttcttcttcttttgttct 23786150  T
Q  323 tctc-aagttgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    ||||   ||||||||||||||||    ||||  |||    ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  23786151 tctcgccgttgttttctactttttggcttgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 23786249  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23786250 tggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 23786278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 28840766 - 28840961
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28840766 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 28840865  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  28840866 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 28840961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 314
Target Start/End: Original strand, 17324207 - 17324358
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccc 17324306  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct 314  Q
    |   ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||| ||| ||||||||||    
T  17324307 catgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgtgttctct 17324358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 24325766 - 24326101
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  24325766 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaat 24325865  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  | ||||| |||||| |||| |||| || ||||| ||| ||||||| | |||||||| |  ||||| || || |||    
T  24325866 gttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttc 24325964  T
Q  320 tt-------ttctca-agttgttttcta-cttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaa 410  Q
    ||       ||||||  |||||||| || |||| | ||||  |||    ||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24325965 tttgtgttcttctcaccgttgttttttacctttgacttgtatttaattgttccatacactttactttggttgcttgattatcccttactccacacatcaa 24326064  T
Q  411 gtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24326065 g-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 24326101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 449
Target Start/End: Original strand, 47451751 - 47452066
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  47451751 gattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 47451850  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctc 326  Q
    ||||| |||||||||||  | | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |            |||| || ||||||||    
T  47451851 catca-tatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacca------------ctctcttccttttctc 47451937  T
Q  327 aagttgt---tttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
      |||||   |||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  47451938 tcgttgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcgacacatcaaatttgttatt 47452037  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47452038 gatgtgatttttcattgaattcacaacaa 47452066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Original strand, 16226281 - 16226608
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  16226281 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 16226379  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  16226380 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 16226478  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  16226479 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgtta 16226577  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226578 ttggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 16226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 322
Target Start/End: Original strand, 16561552 - 16561772
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||| |||   || ||||||||  ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| || |    
T  16561552 ttcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaaccctt 16561651  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||| |  | ||||||| | | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  16561652 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 16561751  T
Q  302 tcgtgtgttctctttttcttt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16561752 tcgtgtgttctctctttcttt 16561772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 289
Target Start/End: Original strand, 2617602 - 2617786
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  2617602 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 2617701  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2617702 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactg 2617786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 20291543 - 20291738
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20291543 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 20291642  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | | ||||||| ||||||| | | ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  20291643 gatttctc-tttgtaacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20291738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 16231677 - 16232002
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  16231677 gagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 16231775  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||| ||  ||||||| |||| |||||           
T  16231776 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgg-tcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 16231873  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttatta 418  Q
    |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| || |||    
T  16231874 ttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaag-ttgtta 16231972  T
Q  419 ttgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16231973 ttggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 16232002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 301
Target Start/End: Original strand, 51752472 - 51752645
Alignment:
Q  126 agattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| | |||    
T  51752472 agattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatac 51752570  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| || ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  51752571 tcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51752645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21948366 - 21948229
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||   || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  21948366 tattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 21948267  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21948266 gttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46431902 - 46431705
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46431902 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 46431803  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctct--ctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  46431802 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 46431705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 48665280 - 48665392
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctg-aagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48665280 tattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 48665379  T
Q  220 agttactcatcat 232  Q
     ||||||||||||    
T  48665380 cgttactcatcat 48665392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127626
Alignment:
Q  205 atatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T
Q  304 gtgtgttctct-ttttcttt-tctcaagttgttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
     |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  13127682 atgtgttctctcttttctttatctca--ttgttttctccttttgcttgtgtttataact 13127626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 51757634 - 51757812
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||     
T  51757634 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctc-tttgtaac 51757732  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | |||||| || ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  51757733 gatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 51757812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 20302545 - 20302740
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |   ||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20302545 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 20302644  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | |||||||||  |||||| | | |||| ||  |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  20302645 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 20302740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26520371 - 26520074
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  26520371 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacag 26520272  T
Q  148 ------gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtga 240  Q
          |||||||||| |  ||||||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||||||        |||||||| || || |||||||||     
T  26520271 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtgg 26520180  T
Q  241 aacagagggctgatctctctcccacactaggttaattt-ggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttcta 339  Q
    ||| ||||| || ||| || |||| | ||||| | ||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  26520179 aacggagggttgctctttcccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgttttcta 26520080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Original strand, 43104244 - 43104416
Alignment:
Q  103 gttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttatt-cttgtaatcc 200  Q
    ||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||   || || || || ||||||| ||    
T  43104244 gttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccc 43104343  T
Q  201 attgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta 274  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||| |||||| |||||||||    
T  43104344 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc-ctcccagactaggtta 43104416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Original strand, 47179827 - 47179993
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  47179827 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 47179925  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaat 300  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||    
T  47179926 a-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 51757890 - 51757974
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51757890 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtcatttttcatcgaattcacaacaa 51757974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3579514 - 3579431
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| | |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3579514 atacactttattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg-tttttcatcgaattcacaaca 3579431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 28279307 - 28279487
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttgga-aaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgag 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||  |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| |    
T  28279307 tgtagagtttgctcttgacaacaaacactagggttgggattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattggg 28279406  T
Q  160 gttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtg 239  Q
      ||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28279407 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 28279487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 30780396 - 30780482
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccaca--catcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30780396 atacactttgttttggttgcttgattattccttactccacacacatcaagtttgttattggtgtgagttttcatcgaattcacaaca 30780482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 47177728 - 47177802
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47177728 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttgatcgaattcacaacaa 47177802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31422756 - 31422706
Alignment:
Q  398 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31422756 ctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaattcgcaaca 31422706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50078720 - 50078634
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50078720 atacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaattcgcaacaa 50078634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 217
Target Start/End: Original strand, 6824022 - 6824091
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgt 217  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  6824022 gaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 206
Target Start/End: Original strand, 47177476 - 47177551
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgat 206  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47177476 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 47177551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 47180079 - 47180152
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  47180079 ttttgattgcttaattatcccttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttgatcgaattcacaaca 47180152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Original strand, 155792 - 155959
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||   || || | |||||||||| |  |    
T  155792 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaaccttt 155891  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||||    
T  155892 tgttatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc-cccaaactaggt 155959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 13762187 - 13762275
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13762187 ttccatacactttgttttggttgcttgattatccctttctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttctcatcgaattcgcaaca 13762275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 46431623 - 46431547
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46431623 tgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 46431547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 46783163 - 46783331
Alignment:
Q  135 ctcttggtcacctgaagagattgaggt-tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcat 232  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||   || |||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  46783163 ctcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcat 46783261  T
Q  233 tatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||  ||| | || || ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  46783262 tatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 51750390 - 51750477
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51750390 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttt-atcgaattcgcaacaa 51750477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 51752724 - 51752806
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51752724 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacat-aagtt-attattggtgtgatttt-catcgaattcacaacaa 51752806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13447199 - 13447117
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  13447199 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 13447117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26332525 - 26332450
Alignment:
Q  284 gaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26332525 gaactgggtaaacaaatttcgtgtgtcctctctct-ttttctcccgttgttttctacttttgtttgtgtttataact 26332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31735448 - 31735365
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  31735448 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtaatttctcatcgaattcgcaaca 31735365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 20291822 - 20291895
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20291822 ttttggttacttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 20291895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 449
Target Start/End: Original strand, 13358892 - 13359012
Alignment:
Q  329 gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| || |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13358892 gttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgactatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtg 13358990  T
Q  427 atttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  13358991 a-ttttcatcgaattcgcaacaa 13359012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 14353069 - 14353185
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagatt-gaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaa 219  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||||||| || |||| ||  |||||||||    
T  14353069 tattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaact-attcttgtaaccctttgaaat--cttttgtaa 14353165  T
Q  220 agttactcatcattatagtg 239  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  14353166 agttattcatcattatagtg 14353185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15294760 - 15294678
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  15294760 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaaatcgcaaca 15294678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10399743 - 10399669
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10399743 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 10399669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 20302807 - 20302879
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20302807 ttttggttacttgattatctcttgctccagacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 20302879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8213615 - 8213586
Alignment:
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213615 tcttttgtaaagttactcatcattatagtg 8213586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26519385 - 26519293
Alignment:
Q  348 tgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcac 444  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||  |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26519385 tgtgtttataacttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccacaca--aagtattttattggtgtgatttt-catcgaattcac 26519293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 413
Target Start/End: Original strand, 28840998 - 28841083
Alignment:
Q  329 gttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  28840998 gttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccactcatcaagtt 28841083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 36208661 - 36209008
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgag-agacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||    
T  36208661 ttcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccat 36208760  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  36208761 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt- 36208858  T
Q  303 cgtgtgtt-ctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
    | | |||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  36208859 cttttgtttctctctttcttt-ctctcgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgc 36208957  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208958 tctacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 36209008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6661362 - 6661038
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6661362 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 6661263  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||| || | ||| |||||| | || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6661262 gttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctc--tttc 6661165  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| | | | ||    
T  6661164 ttttctctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataacttccatacactttattttggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatatttaat 6661065  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaac 447  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  6661064 tggtgtga-ttttcatcgaattcacaac 6661038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Original strand, 695980 - 696310
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  695980 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 696079  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||||    
T  696080 gttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttc 696179  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataac--ttctatacactctgttttgg-ttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
     ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  696180 -tttctc-tgttgttttctacttttgtttgtgtttataactgttccatacactttattttggttttcttgattatctcttgctccacacatcaagtctgt 696277  T
Q  417 tattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  696278 tattggtatgattttctcatcgaattcacaaca 696310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17818666 - 17818338
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17818666 tattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 17818567  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||||||| |    
T  17818566 gttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctcttttcc 17818470  T
Q  320 ttt---tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtt 413  Q
    |||   ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17818469 tttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtt 17818370  T
Q  414 tattattgatgtgatttt-tcatcgaattcac 444  Q
    | |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  17818369 tgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 17818338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 446
Target Start/End: Original strand, 27912622 - 27912973
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27912622 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27912721  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  27912722 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 27912820  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  27912821 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttagcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 27912920  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27912921 cttactccacacatcaagtttgttattggtgggatttttcatcgaattcacaa 27912973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 452
Target Start/End: Original strand, 24126959 - 24127295
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  24126959 tattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaag 24127058  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||||    
T  24127059 gttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttc 24127157  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||| | || || ||||||   ||  ||||||| || |||| |||   | |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  24127158 tttctctctcgttgttttctacttttgacttatgtttataattgtttcatacactttgttttttgttgtctgattatcccttgctccacacattaagttt 24127257  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagta 452  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127258 gttatttgtgtgatttttcatcgaattcacaacaagta 24127295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10474499 - 10474168
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||     
T  10474499 tattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaag 10474400  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  |||||||||| || |    
T  10474399 gttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcc 10474301  T
Q  320 ttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttta 415  Q
    ||| ||||  | |  |||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10474300 tttctctctcgctaatttctacttttcgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttacttgattattccttgctccacacatcaagttta 10474201  T
Q  416 ttattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10474200 ttattgatgtaatttttcatcgaatacacaaca 10474168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18511464 - 18511055
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  18511464 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 18511365  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18511364 cgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 18511266  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctac 340  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||     ||||||||||||    
T  18511265 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttcttttctctcgctgttgttttctac 18511167  T
Q  341 -ttttatttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcg 437  Q
     ||||  ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||| ||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18511166 tttttgcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttagttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttatcatcg 18511067  T
Q  438 aattcacaacaa 449  Q
    ||||| ||||||    
T  18511066 aattcgcaacaa 18511055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1189785 - 1189454
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1189785 tattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaag 1189686  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctct-ctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctcttttt 318  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| ||     
T  1189685 gttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1189586  T
Q  319 cttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagttt 414  Q
    |||| ||||  |  |||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||| | |||||||||  ||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  1189585 ctttctctctcgcagttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacattttgttttggtggcttgattattccttgctccacacatcaagttt 1189486  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
      ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1189485 gatattggtgtg--ttttcatcgaattcacaaca 1189454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 40221608 - 40221964
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40221608 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 40221707  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  40221708 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattat 40221807  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-------tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatc 392  Q
      |||| ||||| || ||||       ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  40221808 tttgtgctctctcttcctttctctctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatc 40221907  T
Q  393 acttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
      || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  40221908 ctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcaaatttacaacaa 40221964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 453
Target Start/End: Original strand, 18596731 - 18597084
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  18596731 ttcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcatt 18596830  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| |    
T  18596831 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattct 18596930  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      |||||||   | ||||||||||  | |||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| | |||||| |   | |||||||||| ||    
T  18596931 tttgtgttcgactcttcttttctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggatgtctgattatcacttgct 18597030  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagtat 453  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18597031 ccatacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatttgcaacaagtat 18597084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41585914 - 41585579
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttact 226  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41585914 gattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggagacttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttact 41585815  T
Q  227 catcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct--------ttt 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||||        | |    
T  41585814 catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctgttctatct 41585716  T
Q  318 tcttt--tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagt 412  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||    
T  41585715 tcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgccccacacatcaagt 41585616  T
Q  413 ttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41585615 ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 41585579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20506034 - 20505686
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  20506034 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 20505935  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  20505934 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20505838  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg---ttttggttacttaattatcactt 396  Q
      ||||||||| | || |||||||  ||||||||||| ||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||   |||||||| | | ||||| ||||    
T  20505837 tttgtgttctc-tcttattttctctcgttgttttctagttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttttggttgcctgattattactt 20505739  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20505738 gctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcattgaattcacaacaa 20505686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 448
Target Start/End: Original strand, 9020253 - 9020649
Alignment:
Q  54 tagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgt-gttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaag 151  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  9020253 tagggtttgtatagagtt-gctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaag 9020351  T
Q  152 agattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggct 251  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||    
T  9020352 agattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggct 9020451  T
Q  252 gatctctctcccacactaggt-taatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctct-ttttcttttctcaagttgttttctacttttattt 348  Q
    | ||||||  ||| | ||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||   ||| ||||||||||||  ||    
T  9020452 gctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctctcttcttttctatcgttattttctacttttgctt 9020551  T
Q  349 gtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||| | || ||||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9020552 gtgtttataacttcaatacact-ttatttggttgcttgattattaattgctccacagatcaaatattttattcgtgtga-ttttcattgaattcacaaca 9020649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31472865 - 31472457
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  31472865 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 31472766  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||  | | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31472765 cgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacg 31472666  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaa---tttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctact 341  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||   ||| ||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| |    
T  31472665 gagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttcttttctctcattgttttctaat 31472566  T
Q  342 ttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg-atttttcatcgaa 439  Q
    |||  ||||| |||||||||  ||  |||| ||| |||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  31472565 tttggtttgtaattataactgttacccact-tgtattggttgcttgagtatctcttacttcacacatcaagtttgttatcggtgtgtatttttcatcgaa 31472467  T
Q  440 ttcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||    
T  31472466 ttcgcaacaa 31472457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36402521 - 36402169
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||  || |||||||    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36402521 ttcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccatt 36402422  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||| | | |||||||| |    
T  36402421 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattct 36402323  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttta-tttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||||||     |||||||||||||||||  ||||| ||||||   ||||||||||| || |||||||| | | |||||| ||    
T  36402322 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttagcttgtgtttataattgttctatacactttgattttggttgcctgattatccct 36402223  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36402222 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 36402169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16092393 - 16092196
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16092393 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 16092294  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16092293 gagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaatt 16092196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37705973 - 37705623
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  37705973 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 37705874  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||| |||    
T  37705873 gatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttc 37705776  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
     || ||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| || |||   ||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||  ||| ||    
T  37705775 ttgcgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttttaattattccatatactttgttttggttgcttggttattccttgct 37705676  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaagt 451  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37705675 ccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 37705623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 448
Target Start/End: Original strand, 2954509 - 2954849
Alignment:
Q  110 ttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatt 209  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  2954509 ttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatc 2954608  T
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtg 308  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |  ||||    
T  2954609 tc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 2954706  T
Q  309 ttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgat-tataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccaca 404  Q
    ||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| |  ||||   ||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  2954707 ttctc-tcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgttacataattgttccatacactttgttttggttgtctgattatcacttactccaca 2954805  T
Q  405 catcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  2954806 catcaaatttgttattggtgtgttttctcatcgaattcagaaca 2954849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 20053873 - 20054266
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    |    
T  20053873 aaactagagtttatataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt---t 20053969  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |  ||||||| |  |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  20053970 g--gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaa 20054064  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaattt-ggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta 345  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||| | ||| |||| ||||||  |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||     
T  20054065 ggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctctcttcgttttctacttttg 20054164  T
Q  346 tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  20054165 tttgtgtttataactttcatacactttgttttggttgcttgattattacttgctctacacatcaagtattttattagtgtgattttt-atcgaattcaca 20054263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10529292 - 10529096
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10529292 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 10529193  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  10529192 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10529096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 6745154 - 6745508
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6745154 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 6745253  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  6745254 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 6745352  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg---ttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||||| ||||||||||     ||||||||| ||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||   |||||| | ||| | ||||     
T  6745353 tttgtgttctcttattcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttttggctgcttgactatct 6745452  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6745453 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaa 6745508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 290
Target Start/End: Original strand, 25804052 - 25804295
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  25804052 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 25804151  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  25804152 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacg 25804250  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  25804251 gagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgg 25804295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 447
Target Start/End: Original strand, 6756597 - 6756926
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||     
T  6756597 tattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaag 6756694  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaac-aaatttcgtgtgttctct-tttt 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | ||| |||| |  |||||||||| || |    
T  6756695 gttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttct 6756793  T
Q  319 cttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag-ttt 414  Q
     || ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6756794 tttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttgattgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttt 6756893  T
Q  415 attattgatgtgatttttcatcgaattcacaac 447  Q
     |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  6756894 gttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaac 6756926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 18466770 - 18467124
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   |||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18466770 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18466869  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| |||| || ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  18466870 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 18466968  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||| ||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||     
T  18466969 tttgttttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttgattgcttgattatcc 18467068  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18467069 cttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 18467124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 17072969 - 17073322
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||| || ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  17072969 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcatt 17073068  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  17073069 gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17073168  T
Q  303 cgtgtgttctct-ttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcact 395  Q
      ||  |||||| |||  |||||||     |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||| ||| ||| || ||||||    
T  17073169 tttgctttctctctttatttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttagttgcttgatcatcact 17073268  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||  |||   ||||||||||||||||    
T  17073269 tgctccacacatcaaatttattattggtgtattttcggatcgaattcacaacaa 17073322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 449
Target Start/End: Original strand, 2724041 - 2724329
Alignment:
Q  166 ggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccac 265  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  2724041 ggtagaattaggcgggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 2724139  T
Q  266 actaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc-ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--ct 360  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||| || | ||||||   | ||||||||||||||   ||||| ||||||   |    
T  2724140 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctttcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 2724239  T
Q  361 tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga-tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  2724240 tccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctatacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcaaattcgcaacaa 2724329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 18469097 - 18469448
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  18469097 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccatt 18469196  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||  ||||| |||  || ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  18469197 gatttctcttttgtaacgatactcatcatc-tagtggaacgaagagctg--ctctctcccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattct 18469293  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-------tctcaa-gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      || |||||  | ||||||       ||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  18469294 tttgcgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 18469393  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18469394 cttgctccacacatcaagtttgttattggtatgatttttcatcgaattcacaaca 18469448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 21948112 - 21948308
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |   ||||||  || |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  21948112 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaacccctt 21948211  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21948212 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 21948308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 39854569 - 39854921
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39854569 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 39854668  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  39854669 gatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 39854767  T
Q  303 cgtgtgttctctttttc-ttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactct-gttttggttacttaattatcac 394  Q
      |||||||||| || | |||||||     |||||||| |||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |  |||||||| ||||| |||| |    
T  39854768 tttgtgttctctcttcctttttctctcgctgttgttttttacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttatttttggttgcttaactatccc 39854867  T
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39854868 ttgctccacatatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 39854921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 27910536 - 27910873
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27910536 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 27910635  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| |||| || ||| ||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  27910636 gatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 27910733  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcca 402  Q
     | ||      | ||||| || |  |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||  || |||||| ||| |||||    
T  27910734 ttttg------tgttcttctcgc-cgttgttttatacttttagcttgtatttataacttccatacactttattttggttgattgattatcccttgctcca 27910826  T
Q  403 cacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27910827 cacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 27910873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 39798133 - 39798469
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39798133 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 39798232  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||| | |||||| ||| | ||||||||  ||||||| | | |||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||  ||||||| | |||||| |||    
T  39798233 gatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa-ttc 39798330  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcca 402  Q
     | ||      | ||||| || |  ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  39798331 ttttg------tgttcttctcgc-cgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctcca 39798423  T
Q  403 cacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39798424 cacatcaa-attgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaacaa 39798469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 658529 - 658204
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  658529 tattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 658430  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |  ||||||||| | |||    
T  658429 gttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc-tcttc 658335  T
Q  320 ttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttat 416  Q
    |||||||  | ||||||||||||||   || || |||| |   |||  |||||| |||||||||| | | |||||  ||| ||||||||||||| ||| |    
T  658334 ttttctcttgctgttttctacttttggcttatgtttattattgttccgtacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttgt 658235  T
Q  417 tattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  658234 tattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 658204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Original strand, 4236715 - 4236900
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4236715 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4236814  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  4236815 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 6747391 - 6747744
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  6747391 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 6747490  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| | | |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  6747491 gat-ttctttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 6747588  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg---ttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||||| ||||||||||     ||||||||| ||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| ||   |||||||| ||| ||||||     
T  6747589 tttgtgttctcttcttcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtgtttttggttgcttgattatct 6747688  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  6747689 cttgctctacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatccaattcgcaacaa 6747744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 450
Target Start/End: Original strand, 25904189 - 25904538
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  25904189 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacatt 25904288  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  25904289 gatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattat 25904387  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      |||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||  |||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||  || ||| | |||| ||| |    
T  25904388 tttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggtttgtgtttataattgttccatacactttgttttcattgcttgactatcccttgc 25904487  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaag 450  Q
     ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  25904488 accacacatcaaatttatta-tggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaag 25904538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17413404 - 17413200
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 160  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  17413404 tgtagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgaga 17413305  T
Q  161 ttttgggtagaattaggcgagaga-cttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
     ||| ||||||||||||   || | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  17413304 ctttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctc 17413205  T
Q  260 tccca 264  Q
     ||||    
T  17413204 cccca 17413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2818528 - 2818186
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  || |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  2818528 ttcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 2818429  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| |    
T  2818428 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattct 2818330  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||||| | | | |||||| ||    
T  2818329 tttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggatgcctgattatccct 2818230  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaat 440  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  2818229 tgctccatacatcaagtttgttattggtgtg-tttttcatcgaat 2818186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 10586918 - 10587252
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||| | ||   |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  10586918 ttcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccatt 10587017  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    ||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||     
T  10587018 gatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt- 10587114  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    | | |||       ||||| || |  |||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  10587115 cttttgtg------ttcttctcgcc-gttgttttctacttttgacttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatc-cttgctcc 10587206  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10587207 acacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 10587252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15445441 - 15445120
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggt---cacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagt 222  Q
    |||||||||||||||    ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||   || || | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  15445441 gattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagt 15445342  T
Q  223 tactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctt 321  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  15445341 tactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttc-t 15445244  T
Q  322 ttctcaagttgttttcta-cttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    |||||  | ||||||||| |||||  ||||| |||||| ||  || |||  ||||||| || ||| |||||   || ||||||||||||||| | |||||    
T  15445243 ttctctcgatgttttctatcttttgcttgtgtttataattttcatccacgttgttttgattgcttgattat--tttgctccacacatcaagtattttatt 15445146  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||  |||| | |||||||||||||    
T  15445145 ggtgtg--tttttaacgaattcacaaca 15445120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Original strand, 4897837 - 4898068
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  4897837 gattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagttac 4897936  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttc 324  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| | |||| |||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||    
T  4897937 tcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattttttgtgttc-ctctttc-tttc 4898034  T
Q  325 tcaagttgttttctacttttatttgtgattataa 358  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  4898035 tctcgttgttttctacttttgcttgtgtttataa 4898068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 314
Target Start/End: Original strand, 15143574 - 15143763
Alignment:
Q  127 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttac 225  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  15143574 gattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 15143673  T
Q  226 tcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct 314  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||| | |||| || | ||||||| | | || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15143674 tcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 15143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Original strand, 21288953 - 21289187
Alignment:
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtg 308  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |  |||     
T  21288953 tcttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtt 21289051  T
Q  309 ttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacac 405  Q
    |||||| ||| | |||||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||    
T  21289052 ttctctcttt-tgttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttattattcttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacac 21289150  T
Q  406 atcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21289151 atcaagtttgatattggtgtgatttttcatcgaattc 21289187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25921649 - 25921470
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  25921649 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 25921550  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  25921549 gttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25921470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38960296 - 38959972
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  38960296 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 38960199  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttct--ctttttctttt---- 323  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||   ||||||||||        
T  38960198 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttttttcttttgttc 38960100  T
Q  324 ---ctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
        |   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  38960099 ttcttgtcgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttat 38960001  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  38960000 tggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 38959972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18509570 - 18509315
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  18509570 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 18509471  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  ||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18509470 cgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 18509372  T
Q  245 gagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    | |||||| |||||| || | ||||||| |||||| || ||||| | | ||||||||    
T  18509371 gtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaatt 18509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 2175005 - 2175200
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2175005 ttcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 2175104  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  2175105 gatttctc-tttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 2175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771024
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcat 232  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 26097876 - 26098013
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctc 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||      
T  26097876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacaga-ggctgctctctcct 26097973  T
Q  262 ccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||    
T  26097974 ccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 26098013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 38882192 - 38882387
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38882192 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccatt 38882291  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38882292 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38882387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34530918 - 34530712
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggttgt---gttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||     |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||  |    
T  34530918 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggcta 34530819  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    |  |||||||||  |  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  34530818 cgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaaga 34530719  T
Q  245 gagggct 251  Q
    |||||||    
T  34530718 gagggct 34530712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34479584 - 34479415
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  34479584 gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 34479486  T
Q  230 cattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  34479485 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34479415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 10749814 - 10749982
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  10749814 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 10749912  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  10749913 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 10749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 16776244 - 16776439
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16776244 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccatt 16776342  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||| | |||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  16776343 gatttctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 16776439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31179536 - 31179213
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||| |  |||||||    
T  31179536 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatc 31179438  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttctt-------tt 323  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||  | |||||       ||    
T  31179437 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc-tgtgttcttctcttctttgtgttctt 31179340  T
Q  324 ctc-aagttgtt-ttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattatt 420  Q
    |||   |||||| ||||||||||   ||||| |||    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  31179339 ctcgccgttgttcttctacttttggcttgtgtttaattattccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccatacatcaag-ttgttatt 31179241  T
Q  421 gatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31179240 ggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 31179213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21684627 - 21684449
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||     
T  21684627 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaac 21684529  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
      ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21684528 aatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21684449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 449
Target Start/End: Original strand, 20043224 - 20043425
Alignment:
Q  255 ctctctcccaca--ctaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgt 350  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||   ||||    
T  20043224 ctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgt 20043323  T
Q  351 gattataa--cttctatacactctgttttggttactt-aattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaac 447  Q
    | ||||||   ||| ||||||| |||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  20043324 gtttataattgttccatacactttgttttggctgcttgatttatcacttgctccacaaatcaagtttgttattgatgtgttttctcattgaatccacaac 20043423  T
Q  448 aa 449  Q
    ||    
T  20043424 aa 20043425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31466154 - 31466044
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  31466154 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatatctattttgtaaa 31466056  T
Q  221 gttactcatcat 232  Q
    ||||||||||||    
T  31466055 gttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34477219 - 34477050
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcat 229  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  34477219 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 34477121  T
Q  230 cattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  34477120 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34477050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 10757291 - 10757458
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10757291 gagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-tttgtaacgttactcatc 10757388  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  || ||| ||||||| | ||||||||    
T  10757389 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaatt 10757458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34530635 - 34530559
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34530635 tgttttggttgcttgattatcacttgctcgacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaaca 34530559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 15552359 - 15552685
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  15552359 gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 15552457  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc-gtgtgttc-tctttttctt------- 321  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||           
T  15552458 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 15552556  T
Q  322 ttctc-aagttgttttctactttta-tttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    |||||    || |||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||| || ||||    
T  15552557 ttctcgccattattttctacttttagcttgtatttataactttcatacactttgttttagttgcttgattatcccttacttcacgcatcaag-ttgttat 15552655  T
Q  420 tgatgtga-tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15552656 tggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 15552685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3373285 - 3372977
Alignment:
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   |||    
T  3373285 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggag 3373188  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttcgt-gtgttct-------ctttttcttttctcaa-gttgttttct 338  Q
    || || |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||       ||||| || |||||   ||||||||||    
T  3373187 ggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgctcttctcgccgttgttttct 3373088  T
Q  339 acttttat-ttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatc 436  Q
    ||||||   ||||  |||    ||| |||| || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  3373087 acttttggcttgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatc 3372989  T
Q  437 gaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||    
T  3372988 gaattcacaaca 3372977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 31545194 - 31545364
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||   ||||||||    
T  31545194 gagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatc 31545292  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31545293 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 31545364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39398186 - 39398003
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  39398186 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccatt 39398087  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaact 288  Q
    ||||| |||||||| | |||||  || | |||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| |||||    
T  39398086 gatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaact 39398003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12556116 - 12555931
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||    
T  12556116 ttcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattggagttttgg-tagaattagacaagagactttttcttgtaactcatt 12556018  T
Q  204 gatatttctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactgg 290  Q
    || || |||||| |||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12556017 gacatctctttttgtaacgttactcatc-ttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgg 12555931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Original strand, 4410109 - 4410304
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  4410109 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatt 4410208  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   ||| |||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  4410209 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 4410304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15354487 - 15354413
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15354487 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 15354413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15356763 - 15356689
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15356763 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 15356689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 23665411 - 23665485
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23665411 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 23665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23793176 - 23793102
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23793176 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 23793102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15354739 - 15354572
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||     
T  15354739 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatt 15354642  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  15354641 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15354572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 23665158 - 23665325
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  23665158 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 23665255  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||  |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  23665256 a-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23665325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23741770 - 23741697
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23741770 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaaca 23741697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23793429 - 23793262
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  23793429 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 23793332  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||  |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  23793331 a-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23793262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26098376 - 26098128
Alignment:
Q  210 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctccc-acactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgt 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |  | |    
T  26098376 tcttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttat 26098278  T
Q  308 gttctctttttcttt---tctcaagttgttttctacttttat-ttgtgattataact--tctatacactctgttttggttacttaattatcacttactcc 401  Q
    ||||||| || ||||   ||||  | ||||||||||||||   ||||| |||||| |  || ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||    
T  26098277 gttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctcc 26098178  T
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtga--tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  26098177 acacatcaagtttgatattggtgtgagttttctcatcgaattcgcaacaa 26098128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 31542849 - 31543018
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | || |||||||   ||||||||    
T  31542849 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatc 31542946  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31542947 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 31543018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15357015 - 15356848
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||     
T  15357015 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatt 15356918  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||  ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  15356917 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15356848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741856
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 23741926  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||  |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  23741925 a-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23741856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Original strand, 42770869 - 42770934
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagact 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  42770869 tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 442
Target Start/End: Original strand, 21948394 - 21948462
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21948394 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattc 21948462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 38882439 - 38882525
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38882439 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 38882525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 411
Target Start/End: Original strand, 42771051 - 42771167
Alignment:
Q  292 taaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattat 391  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||   |  ||||||||||| |||||    
T  42771051 taaacaaatttcgtgtgttctc-tcttcatttctcttgctgttttctacctttgcttgtgtttataacttccataca--tttatttggttacttgattat 42771147  T
Q  392 cacttactccacacatcaag 411  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  42771148 tacttgctccacacatcaag 42771167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 2175256 - 2175341
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga--tttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2175256 atacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgacttttttgatcgaattcacaaca 2175341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 10750065 - 10750138
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10750065 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttgatcgaattcacaacaa 10750138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 10757541 - 10757614
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10757541 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttgatcgaattcacaacaa 10757614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31465907 - 31465832
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31465907 ttttggttgcttaattattccttgttccacacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcaaattcgcaacaa 31465832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2144647 - 2144601
Alignment:
Q  213 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 2144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 451
Target Start/End: Original strand, 4410366 - 4410461
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaagt 451  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  4410366 ttataacttccatacac-cttttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcaacgaattcgcaacaagt 4410461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 449
Target Start/End: Original strand, 25804375 - 25804464
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  25804375 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaatacgcaacaa 25804464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045271
Alignment:
Q  188 attcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaggg 249  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggaggg 20045271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Original strand, 4236979 - 4237065
Alignment:
Q  360 ttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  4236979 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcaacgaattcacaaca 4237065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21684376 - 21684294
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  21684376 atacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 21684294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 443
Target Start/End: Original strand, 16776510 - 16776589
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattca 443  Q
    ||||||| ||||||| || | | |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16776510 atacactttgttttgattgcctgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcaatgaattca 16776589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34476966 - 34476893
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34476966 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaacaa 34476893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12555842 - 12555757
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga--tttttcatcgaattcacaac 447  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12555842 atacactttattttggttgcttgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgagttttctcatcgaattcacaac 12555757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 449
Target Start/End: Original strand, 15143843 - 15143897
Alignment:
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  15143843 ttactccacacatcaattattttattggtatgatttttcaacgaattcacaacaa 15143897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 35430288 - 35430401
Alignment:
Q  128 attgagtctcttggtcacctgaagagattgaggt-tttgggtagaattaggcgaga-gacttattcttgtaatccatt-gatatttcttttgtaaagtta 224  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||  ||| ||||||||||||||||   || |||| ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||    
T  35430288 attgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttgatatctcttt-gtaaagtta 35430386  T
Q  225 ctcatcattatagtg 239  Q
    |||||||||||||||    
T  35430387 ctcatcattatagtg 35430401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 20043077 - 20043208
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttg-ctcttgacaacaaatactatggtt---gtgttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtca 144  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||   | |||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  20043077 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 20043176  T
Q  145 cctgaagagattgaggttttgggtagaattag 176  Q
    |  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  20043177 cgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 421
Target Start/End: Original strand, 20045336 - 20045393
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattg 421  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  20045336 atacactttgttttggttgcttgattatcatttgcttcacacatcaagtttgttattg 20045393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 449
Target Start/End: Original strand, 31543053 - 31543173
Alignment:
Q  329 gttgttttctacttttat-ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtga 427  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  31543053 gttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattaacccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 31543151  T
Q  428 tttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || || |||  |||||||||||    
T  31543152 ttattgatcagattcacaacaa 31543173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Original strand, 4754196 - 4754312
Alignment:
Q  63 tgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 160  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| |||| |||| | |||||  |||||| |||||||||||  |||||||||| |     
T  4754196 tgtagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtga 4754295  T
Q  161 ttttgggtagaattagg 177  Q
     ||||| ||||||||||    
T  4754296 ctttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16093199 - 16093144
Alignment:
Q  395 ttactccacacatcaagtttattattgatgtgattttt--catcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||    
T  16093199 ttactccacgcatcaagtttattattggtgtggtttttcacaacgaattcacaaca 16093144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39397913 - 39397857
Alignment:
Q  392 cacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  39397913 cacttgctccacacgtcaagtttgtaattggtgtgatttctcgtcgaattcacaaca 39397857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16900 - 16501
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||| | ||| | ||||| ||||||||| |||||| ||      
T  16900 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgg 16801  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  16800 gaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaag 16701  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    || | ||||||| |||| || |||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||      
T  16700 ggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctctttcttttctctcgttgttttctatttttgc 16601  T
Q  347 ttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||  |||||||||| || |||| || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  16600 ttgtatttataacttccatgcactttg-tttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtataattttt-atcgaattcacaa 16503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1818 - 1492
Alignment:
Q  122 attaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaag 221  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1818 attaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 1719  T
Q  222 ttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggtta-atttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttct 320  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1718 ttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttct 1619  T
Q  321 tttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattat 419  Q
    ||||||   |||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| | | ||||    
T  1618 tttctctcattgttttctacttttggcttgtgtttataacttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatat-ttat 1521  T
Q  420 tgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1520 tggtgtga-ttttcattgaattcacaacaa 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16071 - 15752
Alignment:
Q  50 aaactagggtttgtgtacagtttgctcttgacaacaaatactatggttgtg-ttg-ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacct 147  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||      
T  16071 aaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgg 15972  T
Q  148 gaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 247  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  15971 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggag 15872  T
Q  248 ggctgatctctctcccacactaggttaat-ttggactgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttat 346  Q
    | ||| |||||  |||  ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  15871 gactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttc-tttctcccgttgttttctacttttgt 15773  T
Q  347 ttgtgattataacttctatac 367  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  15772 ttgtgtttataacttccatac 15752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14575 - 14230
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14575 ttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14476  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  14475 gatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 14378  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
     |||||||||| || |||| ||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  14377 ttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 14278  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14277 ccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 360
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15367
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15114 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccatt 15213  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||  | |||||| |||    
T  15214 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaa-ttc 15311  T
Q  304 gtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctacttttatttgtgattataact 360  Q
     ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15312 ttgtgttctc-tcttcttttatcatgttgttttctacttttgtttgtgattataact 15367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 445
Target Start/End: Original strand, 15393 - 15436
Alignment:
Q  402 acacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcaca 445  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15393 acacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcaca 15436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 79280 - 79631
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  79280 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 79379  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |    
T  79380 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattat 79478  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||||||||| ||  |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||| || |||||||| | |||||||| ||    
T  79479 tttgtgttctctcttctttttctcttgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttgattttggttgcctaattatccct 79578  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  79579 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcattgaattcgcaaca 79631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 52106 - 52456
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||    
T  52106 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 52205  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctct--cccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||    
T  52206 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 52304  T
Q  302 -tcgtg-tgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcactt 396  Q
     | ||| | ||||||| || || |||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  52305 cttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccctt 52404  T
Q  397 actccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52405 gctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaattcgcaaca 52456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 183833 - 183638
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  183833 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183735  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  183734 gatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 183638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 449
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50458
Alignment:
Q  232 ttatagtgaaacagagggctgatctctctcccaca--ctaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtg-ttctctttttcttttctca 327  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||| | |||||||| | ||||  ||||||| || || ||||     
T  50234 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctct 50333  T
Q  328 agttgttttctacttttat-ttgtgattataacttct--atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatg 424  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||| |  |  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  50334 agttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtg 50433  T
Q  425 tgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  50434 tgatttttcatcgaattcgcaacaa 50458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 183557 - 183488
Alignment:
Q  372 tgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  183557 tgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcatcgaattc 183488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Original strand, 4091 - 4437
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||   || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4091 ttcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4190  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||||| |    
T  4191 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattct 4288  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctgttttggttacttaattatcacttact 399  Q
      ||||||||  | ||  ||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||||   |||||||||||   ||||| || ||| |||||| ||||||    
T  4289 tttgtgttcttctcttgatttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattattctatacacttcattttgattgcttgattatcccttact 4388  T
Q  400 ccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  4389 ccacacatcaagtttgttattgatgtgttttcacaacgaattcacaaca 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 442
Target Start/End: Original strand, 85325 - 85667
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | || || |||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  85325 ttcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccatt 85424  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |    
T  85425 gatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattct 85524  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctcaagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcacttac 398  Q
      ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||| ||||||| || ||||||||  || |||||| ||| |    
T  85525 tttgtgttctc-tcttcttttctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtttgattatctcttgc 85623  T
Q  399 tccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  85624 tccacacattaagattgttattggtgtgatttttcatcgaattc 85667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 69484 - 69133
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  69484 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 69385  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  69384 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 69287  T
Q  303 cgtgtgttctctttttctt-------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatca 393  Q
      ||||||||  | |||||       |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||     
T  69286 tttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacattttgttttggttgcctgattatcc 69187  T
Q  394 cttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  69186 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaaca 69133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 79955 - 80306
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||  ||||    
T  79955 ttcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcatt 80053  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-t 302  Q
    || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  80054 gacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattct 80152  T
Q  303 cgtgtgttctctttttcttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacactctg-ttttggttacttaattatcact 395  Q
      |||| ||||| || ||||||||     ||||||||||||||||   ||||| ||||||   ||| ||||||| || |||| ||| | | ||||| |||    
T  80153 tttgtgatctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttgattttcgttgcctgattattact 80252  T
Q  396 tactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  80253 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaattcgcaacaa 80306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11649 - 11315
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||     
T  11649 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 11550  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt-tcgtgtgttctctttttc 319  Q
    ||||||||||| ||||||| |   ||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||||| |  |||||||||| ||      
T  11549 gttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 11451  T
Q  320 ttttctc---aagttgttttctactttt-atttgtgattataa--cttctatacac--tctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaag 411  Q
    |||||||     ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| ||||||  | | |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11450 ttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttattttttcgttgcttaattattccttactccacacatcaag 11351  T
Q  412 tttattattgatgtgat-ttttcatcgaattcacaac 447  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  11350 -ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaac 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41676 - 41480
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  41676 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccatt 41577  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  41576 gatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41407 - 41324
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41407 atacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcacaacaa 41324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1645 - 1450
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1645 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 1546  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    ||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1545 gatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1376 - 1309
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgattttt 432  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  1376 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttt 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Original strand, 4922 - 5046
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttc-ttttgtaa 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  4922 tattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaa 5021  T
Q  220 agttactcatcattatagtgaaaca 244  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  5022 agatactcatcattatagtggaaca 5046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 449
Target Start/End: Original strand, 6294 - 6647
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattga-gtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccat 202  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  6294 ttcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccat 6393  T
Q  203 tgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaattt 302  Q
    |||| | || ||||||| |||||||||||  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||  | |||||||||    
T  6394 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaattt 6491  T
Q  303 c-gtgtgttc-tctttttctt------ttctc-aagttgttttctactttt-atttgtgattataacttctatacactctg-ttttggttacttaattat 391  Q
    |  ||||||| |||| |||||      |||||   ||||||||||||||||   ||||  |||| | ||| |||| || || |||||||| |||||||||    
T  6492 ctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggcttgtatttatta-ttccatacgctttgattttggttgcttaattat 6590  T
Q  392 cacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    | ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6591 cccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcatcgaattcacaacaa 6647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 164 - 334
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  164 gagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 262  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatttc 303  Q
    | ||||||| |   |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  263 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 448
Target Start/End: Original strand, 400 - 473
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  400 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttctcaacgaattcacaaca 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 29283 - 29461
Alignment:
Q  121 tattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||     
T  29283 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaac 29381  T
Q  221 gttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
      ||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  29382 aatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 29461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Original strand, 29534 - 29616
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaaca 448  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29534 atacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga-ttttcatcgaattcgcaaca 29616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12809 - 12714
Alignment:
Q  353 ttataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12809 ttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtcatttttcatcgaattcacaacaa 12714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 2136 - 2282
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  || |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  2136 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccatt 2235  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggct 251  Q
     || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  2236 aatttctcttttgtaacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggct 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 22491 - 22565
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22491 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 22565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 24766 - 24840
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaacaa 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24766 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgtcgaattcacaacaa 24840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 22239 - 22406
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  22239 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 22336  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  22337 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 22406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 24514 - 24681
Alignment:
Q  131 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatc 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  24514 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 24611  T
Q  231 attatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactggataaacaaatt 301  Q
    |  |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  24612 a-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 24681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1294
Alignment:
Q  364 atacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattcacaa 446  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1375 atacactttgttttggttgcttgattatctttttctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaattcacaa 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 289
Target Start/End: Original strand, 2975 - 3158
Alignment:
Q  104 ttcaacttggaaaatattattaagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggttttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccatt 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |   ||||||  |  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2975 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 3074  T
Q  204 gatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggttaatttggactgaactg 289  Q
    ||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||| | |||| || | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  3075 gatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactg 3158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 445
Target Start/End: Original strand, 3207 - 3322
Alignment:
Q  329 gttgttttctactttt--atttgtgattataacttctatacactctgttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtg 426  Q
    ||||||||||||||||  | ||||  |||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  3207 gttgttttctactttttgacttgtatttataactttcatacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 3304  T
Q  427 atttttcatcgaattcaca 445  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3305 a-ttttcatcgaattcaca 3322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 57539 - 57454
Alignment:
Q  187 tattcttgtaatccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgatctctctcccacactaggt 272  Q
    ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  57539 tattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 57454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 442
Target Start/End: Original strand, 35965 - 36033
Alignment:
Q  374 ttttggttacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaattc 442  Q
    |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35965 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtaatttttcatcgaattc 36033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 439
Target Start/End: Original strand, 2 - 53
Alignment:
Q  387 attatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaa 439  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  2 attatctcttgctccacacatcaagttg-ttattggtgtgatttttcatcgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 558 times since January 2019
Visitors: 4090