View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0647_low_12 (Length: 413)

Name: NF0647_low_12
Description: NF0647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0647_low_12
NF0647_low_12
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (11-392)||(41394222-41394602)
chr1 (54-392)||(20931345-20931682)
chr1 (54-392)||(20913037-20913367)
chr1 (140-392)||(5072388-5072640)
chr1 (140-392)||(18601118-18601370)
chr1 (54-392)||(20893551-20893889)
chr1 (54-392)||(37844374-37844714)
chr1 (54-392)||(20445679-20446019)
chr1 (54-392)||(20531444-20531783)
chr1 (55-392)||(22227809-22228146)
chr1 (55-392)||(22232506-22232843)
chr1 (140-388)||(2116258-2116506)
chr1 (53-326)||(45051489-45051759)
chr1 (128-275)||(51452608-51452755)
chr1 (11-86)||(21860334-21860409)
chr1 (12-86)||(44034829-44034903)
chr1 (13-120)||(27675086-27675191)
chr1 (11-86)||(41218728-41218803)
chr1 (13-70)||(13376711-13376768)
chr1 (13-70)||(20177513-20177570)
chr1 (55-86)||(15861327-15861358)
chr1 (145-185)||(16646118-16646158)
chr1 (348-388)||(45051446-45051486)
chr1 (54-86)||(51452809-51452841)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (140-392)||(25175563-25175815)
chr6 (140-392)||(27653983-27654235)
chr6 (140-392)||(16825752-16826006)
chr6 (54-381)||(23153458-23153786)
chr6 (55-388)||(14626045-14626377)
chr6 (53-388)||(1650020-1650352)
chr6 (128-381)||(1657748-1657999)
chr6 (128-392)||(35009439-35009702)
chr6 (128-381)||(15862484-15862734)
chr6 (54-123)||(23148266-23148335)
chr6 (11-86)||(19983149-19983224)
chr6 (11-86)||(35015014-35015089)
chr6 (11-86)||(18583640-18583715)
chr6 (128-324)||(29665941-29666137)
chr6 (128-213)||(27751603-27751688)
chr6 (13-70)||(21623506-21623563)
chr6 (144-228)||(29605612-29605696)
chr6 (13-70)||(22361619-22361676)
chr6 (13-85)||(14152632-14152704)
chr6 (54-86)||(18002395-18002427)
chr6 (54-86)||(23995247-23995279)
chr6 (54-86)||(26090059-26090091)
chr6 (55-86)||(4991396-4991427)
chr6 (144-226)||(18629608-18629691)
chr6 (54-84)||(15742120-15742150)
chr6 (146-228)||(17083200-17083282)
chr6 (54-86)||(1657661-1657693)
chr6 (54-86)||(15862789-15862821)
chr6 (145-185)||(18399144-18399184)
chr6 (54-86)||(18823283-18823315)
chr6 (54-86)||(18839138-18839170)
chr6 (54-86)||(27751742-27751774)
chr6 (54-86)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (140-392)||(25426628-25426880)
chr5 (140-392)||(12374-12626)
chr5 (140-392)||(19499899-19500151)
chr5 (140-392)||(22366481-22366733)
chr5 (143-392)||(18777995-18778244)
chr5 (140-392)||(21073595-21073847)
chr5 (54-392)||(23506965-23507302)
chr5 (143-392)||(43443398-43443647)
chr5 (54-392)||(27182471-27182810)
chr5 (140-392)||(4199985-4200237)
chr5 (144-392)||(27009841-27010089)
chr5 (54-392)||(22053753-22054096)
chr5 (54-392)||(18530988-18531330)
chr5 (140-340)||(29188284-29188483)
chr5 (128-381)||(34939289-34939540)
chr5 (128-275)||(20623085-20623232)
chr5 (128-275)||(21233528-21233675)
chr5 (130-274)||(25900408-25900552)
chr5 (128-275)||(16536313-16536460)
chr5 (128-275)||(37052860-37053007)
chr5 (11-85)||(11584374-11584448)
chr5 (13-86)||(5450695-5450768)
chr5 (13-70)||(21222462-21222519)
chr5 (144-228)||(29918127-29918212)
chr5 (135-224)||(32950862-32950951)
chr5 (54-86)||(16105967-16105999)
chr5 (54-86)||(20623286-20623318)
chr5 (54-86)||(21233442-21233474)
chr5 (54-86)||(25900320-25900352)
chr5 (348-388)||(29190482-29190522)
chr5 (54-86)||(37053061-37053093)
chr5 (144-226)||(21310709-21310792)
chr5 (145-226)||(5450844-5450926)
chr5 (351-392)||(17471803-17471844)
chr5 (54-86)||(108728-108760)
chr5 (54-86)||(9730278-9730310)
chr5 (54-86)||(16536514-16536546)
chr5 (145-185)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (140-392)||(19886661-19886913)
chr2 (11-392)||(20627195-20627576)
chr2 (54-387)||(462743-463075)
chr2 (11-392)||(19794586-19794967)
chr2 (11-392)||(43642838-43643220)
chr2 (54-392)||(8891242-8891581)
chr2 (54-392)||(36982364-36982704)
chr2 (128-392)||(17396653-17396916)
chr2 (54-392)||(24341309-24341652)
chr2 (128-392)||(25265390-25265653)
chr2 (178-392)||(7507894-7508107)
chr2 (128-275)||(19689401-19689548)
chr2 (54-150)||(22863169-22863267)
chr2 (128-275)||(23820187-23820334)
chr2 (128-275)||(14906440-14906587)
chr2 (11-86)||(22275045-22275120)
chr2 (11-86)||(22284278-22284353)
chr2 (128-275)||(20015127-20015274)
chr2 (11-85)||(15633538-15633612)
chr2 (13-70)||(43646232-43646289)
chr2 (145-226)||(68156-68238)
chr2 (53-86)||(19689314-19689347)
chr2 (54-86)||(9652796-9652828)
chr2 (54-86)||(14906354-14906386)
chr2 (13-65)||(19660221-19660273)
chr2 (54-86)||(23820388-23820420)
chr2 (55-86)||(25213372-25213403)
chr2 (145-226)||(22775206-22775288)
chr2 (145-226)||(22780584-22780666)
chr2 (13-86)||(19666848-19666921)
chr2 (13-70)||(25305769-25305826)
chr2 (13-120)||(31146032-31146138)
chr2 (54-86)||(7507757-7507789)
chr2 (54-86)||(17396567-17396599)
chr2 (54-86)||(20015328-20015360)
chr2 (54-86)||(28031134-28031166)
chr2 (54-86)||(33128372-33128404)
chr2 (145-224)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-390)||(3508-3843)
scaffold0266 (54-392)||(1124-1462)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (140-392)||(47357654-47357906)
chr4 (11-392)||(54118125-54118507)
chr4 (54-392)||(13246430-13246769)
chr4 (144-392)||(10644219-10644467)
chr4 (54-292)||(121989-122226)
chr4 (128-384)||(13048221-13048477)
chr4 (54-392)||(15675009-15675352)
chr4 (54-324)||(10104170-10104445)
chr4 (128-392)||(26680201-26680463)
chr4 (155-392)||(31115629-31115865)
chr4 (54-191)||(33240900-33241043)
chr4 (128-275)||(10488678-10488825)
chr4 (128-275)||(16327926-16328073)
chr4 (11-86)||(25119064-25119139)
chr4 (295-392)||(111395-111492)
chr4 (54-160)||(31132545-31132657)
chr4 (11-86)||(5682385-5682460)
chr4 (144-226)||(40885570-40885652)
chr4 (13-86)||(41165808-41165881)
chr4 (145-226)||(15044992-15045074)
chr4 (13-70)||(47534933-47534990)
chr4 (348-392)||(10104450-10104494)
chr4 (54-86)||(14952085-14952117)
chr4 (54-86)||(15135907-15135939)
chr4 (54-86)||(15272211-15272243)
chr4 (54-86)||(16327840-16327872)
chr4 (54-86)||(16609013-16609045)
chr4 (54-86)||(26680517-26680549)
chr4 (145-226)||(15109350-15109432)
chr4 (54-86)||(8045272-8045304)
chr4 (54-86)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (54-392)||(14842487-14842824)
chr3 (140-392)||(55316219-55316471)
chr3 (140-392)||(41270075-41270327)
chr3 (54-392)||(2049810-2050147)
chr3 (54-392)||(12030073-12030410)
chr3 (54-381)||(13838905-13839232)
chr3 (11-392)||(16743998-16744377)
chr3 (165-392)||(16821139-16821366)
chr3 (128-392)||(13975722-13975985)
chr3 (91-392)||(15858986-15859287)
chr3 (128-392)||(45860805-45861068)
chr3 (118-393)||(51158008-51158282)
chr3 (128-392)||(13954890-13955153)
chr3 (135-392)||(15936634-15936890)
chr3 (135-389)||(15938476-15938729)
chr3 (11-191)||(19231981-19232164)
chr3 (53-388)||(15614838-15615170)
chr3 (128-392)||(17912483-17912744)
chr3 (54-174)||(19260749-19260869)
chr3 (128-275)||(2449238-2449385)
chr3 (11-89)||(15857120-15857198)
chr3 (11-86)||(3992873-3992948)
chr3 (11-86)||(55513193-55513268)
chr3 (11-86)||(2844514-2844589)
chr3 (11-86)||(54037981-54038056)
chr3 (11-86)||(17955837-17955916)
chr3 (11-86)||(7854305-7854380)
chr3 (25-86)||(45581954-45582016)
chr3 (13-70)||(17205019-17205076)
chr3 (13-86)||(38810868-38810941)
chr3 (279-392)||(47984650-47984763)
chr3 (279-392)||(47993937-47994050)
chr3 (279-392)||(48003224-48003337)
chr3 (279-392)||(48012510-48012623)
chr3 (13-68)||(12031849-12031904)
chr3 (135-224)||(11986173-11986262)
chr3 (13-86)||(13301323-13301396)
chr3 (13-86)||(13311979-13312052)
chr3 (144-185)||(14080715-14080756)
chr3 (351-392)||(15468555-15468596)
chr3 (13-70)||(17191879-17191936)
chr3 (54-86)||(2449152-2449184)
chr3 (144-228)||(4145814-4145898)
chr3 (54-86)||(16261777-16261809)
chr3 (54-86)||(16933869-16933901)
chr3 (54-86)||(17912398-17912430)
chr3 (54-86)||(23492696-23492728)
chr3 (54-86)||(38168237-38168269)
chr3 (54-86)||(53771365-53771397)
chr3 (145-226)||(30207380-30207462)
chr3 (13-70)||(3576290-3576347)
chr3 (144-228)||(6228625-6228710)
chr3 (20-85)||(15550922-15550987)
chr3 (351-392)||(22275209-22275250)
chr3 (54-86)||(11986080-11986112)
chr3 (54-86)||(13954804-13954836)
chr3 (145-185)||(14059214-14059254)
chr3 (54-86)||(14285289-14285321)
chr3 (54-86)||(19947026-19947058)
chr3 (54-86)||(30153265-30153297)
chr3 (54-86)||(33342204-33342236)
chr3 (54-86)||(45861122-45861154)
chr3 (54-86)||(51961031-51961063)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (13-392)||(3059966-3060344)
chr7 (140-392)||(10989410-10989661)
chr7 (139-392)||(2437457-2437710)
chr7 (54-390)||(16211768-16212103)
chr7 (54-392)||(13036938-13037277)
chr7 (140-392)||(13911024-13911277)
chr7 (54-387)||(11580661-11580997)
chr7 (54-392)||(36052667-36053003)
chr7 (144-392)||(13572676-13572924)
chr7 (135-392)||(18253842-18254098)
chr7 (128-386)||(25292338-25292595)
chr7 (128-392)||(47481031-47481294)
chr7 (165-392)||(16478987-16479213)
chr7 (128-392)||(7293017-7293279)
chr7 (129-392)||(13321014-13321278)
chr7 (128-275)||(11516343-11516490)
chr7 (128-275)||(15441564-15441711)
chr7 (128-275)||(30262129-30262276)
chr7 (11-86)||(32493903-32493978)
chr7 (11-86)||(126738-126813)
chr7 (11-86)||(1936874-1936949)
chr7 (11-86)||(111126-111201)
chr7 (13-120)||(13377819-13377924)
chr7 (56-241)||(295893-296079)
chr7 (11-85)||(7283913-7283987)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (54-160)||(36024372-36024485)
chr7 (145-226)||(13377693-13377775)
chr7 (54-86)||(2029244-2029276)
chr7 (54-86)||(7293333-7293365)
chr7 (54-86)||(11516544-11516576)
chr7 (54-86)||(14113903-14113935)
chr7 (54-86)||(15441478-15441510)
chr7 (54-123)||(15709428-15709501)
chr7 (13-69)||(16919870-16919926)
chr7 (54-86)||(30262043-30262075)
chr7 (54-86)||(42056188-42056220)
chr7 (144-226)||(16914928-16915011)
chr7 (54-86)||(371417-371449)
chr7 (54-86)||(3049905-3049937)
chr7 (54-86)||(13321334-13321366)
chr7 (128-160)||(14113989-14114021)
chr7 (128-160)||(14423639-14423671)
chr7 (58-86)||(15516765-15516793)
chr7 (54-86)||(25124450-25124482)
chr7 (54-86)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (54-392)||(48598-48935)
scaffold0023 (165-392)||(36093-36320)
scaffold0023 (54-86)||(61122-61154)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (54-393)||(16193643-16193980)
chr8 (140-392)||(30120722-30120974)
chr8 (54-392)||(43373392-43373731)
chr8 (202-392)||(222753-222943)
chr8 (202-392)||(736376-736566)
chr8 (202-392)||(860271-860461)
chr8 (140-392)||(16674392-16674644)
chr8 (11-392)||(16404857-16405235)
chr8 (54-381)||(24928716-24929043)
chr8 (144-392)||(21844576-21844824)
chr8 (144-392)||(21851969-21852217)
chr8 (140-388)||(6774258-6774505)
chr8 (140-388)||(24548986-24549233)
chr8 (128-392)||(22907214-22907476)
chr8 (128-381)||(17345581-17345832)
chr8 (128-275)||(5238203-5238350)
chr8 (128-275)||(24661248-24661395)
chr8 (128-275)||(43685662-43685809)
chr8 (11-86)||(274766-274841)
chr8 (11-86)||(641008-641083)
chr8 (11-86)||(826814-826889)
chr8 (11-86)||(24716719-24716794)
chr8 (202-264)||(691908-691970)
chr8 (11-86)||(39115598-39115673)
chr8 (13-70)||(17285543-17285600)
chr8 (13-70)||(21198005-21198062)
chr8 (54-86)||(5238404-5238436)
chr8 (54-86)||(22907128-22907160)
chr8 (54-86)||(24385652-24385684)
chr8 (54-86)||(24661162-24661194)
chr8 (54-86)||(43685863-43685895)
chr8 (144-226)||(26011658-26011741)
chr8 (54-86)||(2545265-2545297)
chr8 (54-86)||(3431176-3431208)
chr8 (54-86)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-392)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-392)||(882-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-392)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-392)||(12115-12450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-381)||(171916-172242)
scaffold0001 (54-381)||(177619-177945)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (165-392)||(42997-43224)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-388)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-392)||(36836-37176)
scaffold0077 (11-85)||(15324-15398)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (54-381)||(247366-247694)
scaffold0012 (54-86)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (57-392)||(19206-19543)
scaffold0195 (128-392)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (54-392)||(26340-26678)
scaffold0162 (128-275)||(8180-8327)
scaffold0162 (13-70)||(6877-6934)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (54-392)||(128095-128431)
scaffold0008 (165-392)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (64-392)||(4996-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-392)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (135-368)||(5552-5785)
scaffold0772 (54-86)||(5846-5878)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (144-392)||(35-283)
scaffold0116 (11-86)||(30417-30492)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-386)||(272031-272362)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (135-392)||(48187-48443)
scaffold0049 (11-85)||(20493-20567)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (144-392)||(64527-64780)
scaffold0026 (135-392)||(107747-108003)
scaffold0026 (143-185)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (56-274)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (139-392)||(21115-21367)
scaffold0139 (165-392)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (102-392)||(148721-149012)
scaffold0025 (54-392)||(8849-9192)
scaffold0025 (54-154)||(146838-146938)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (178-392)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (178-392)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (54-274)||(89378-89600)
scaffold0028 (54-179)||(107708-107835)
scaffold0028 (55-86)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (165-388)||(9374-9596)
scaffold0215 (165-388)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (140-286)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (128-392)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (128-392)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (128-392)||(37066-37328)
scaffold0078 (11-86)||(41632-41707)
scaffold0078 (54-86)||(36980-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (128-392)||(41648-41911)
scaffold0125 (54-94)||(41957-41997)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (286-392)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (139-388)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (128-392)||(13506-13769)
scaffold0132 (11-86)||(42677-42749)
scaffold0132 (54-86)||(13824-13856)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (286-392)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-296)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (128-275)||(26911-27058)
scaffold0141 (135-275)||(22656-22796)
scaffold0141 (54-86)||(22857-22889)
scaffold0141 (54-86)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (128-275)||(1582-1729)
scaffold0124 (54-86)||(1496-1528)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-86)||(80187-80262)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (11-87)||(166121-166197)
scaffold0016 (12-87)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-86)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-86)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-86)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-86)||(5941-6015)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (295-392)||(9382-9479)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-87)||(309-385)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (128-221)||(3360-3453)
scaffold0361 (336-390)||(3210-3264)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-85)||(1701-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-85)||(19807-19881)
scaffold0122 (11-85)||(24111-24185)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-85)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-85)||(6261-6335)
scaffold0310 (48-85)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-86)||(1363-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (135-224)||(56106-56195)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-70)||(35816-35873)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (144-226)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (145-226)||(2317-2399)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-70)||(442-499)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-70)||(76699-76756)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (53-86)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (54-86)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (54-86)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (54-86)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (54-86)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (54-86)||(57392-57424)
scaffold0058 (144-185)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (54-86)||(55904-55936)
scaffold0032 (54-86)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (54-97)||(18015-18058)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (178-224)||(45198-45244)
scaffold0066 (54-86)||(45338-45370)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (13-70)||(632-689)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (13-70)||(6999-7056)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (144-185)||(1546-1587)
scaffold0456 (144-185)||(8691-8732)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (13-70)||(43651-43708)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-70)||(31357-31414)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (145-185)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (54-86)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (54-86)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (54-86)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-86)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (54-86)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (54-86)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (145-185)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (54-86)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394222
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 41394503  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  41394502 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttgg 41394403  T
Q  211 tgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattctt 310  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||    
T  41394402 tgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattctt 41394304  T
Q  311 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    | |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394303 gctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 20931384  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931383 aataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatg 20913076  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913075 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 20893848  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893849 tgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtta-tg 250  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||   || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  251 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 350  Q
    || |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 37844672  T
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844673 atgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  151 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatg 250  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||| ||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  251 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 350  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttg 20445721  T
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445720 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531444
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||| ||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20531485  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531484 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||     
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22227848  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227847 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||     
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22232545  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232544 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 338  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  339 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    | ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860334
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675086
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgtt 27675094  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  27675093 gtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218728
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  238 atgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  338 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttga 23153488  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153487 tgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 388
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 154  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  155 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaaga 254  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  255 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 354  Q
    |||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  355 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 388
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650352
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttga 1650315  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650316 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| | |||||  | |||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983224
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015089
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583640
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-ca 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  227 ta-tatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 324  Q
     | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 213  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623506
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 228  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361676
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 22361676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 84
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 228  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 143 - 392
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 242  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  243 aggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 342  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  343 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 23507004  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507003 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 143 - 392
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 242  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  243 aggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 342  Q
    | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  343 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 27182769  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182770 tgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtt 247  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  248 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 347  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 22054051  T
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054052 ttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  149 cgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtta 248  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  249 tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 348  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  349 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  130 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  230 atgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 274  Q
    |||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||   |||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584374
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5450768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 5450768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222519
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttag 21222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 228  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 388
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627576
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaat 20627294  T
Q  110 gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttg 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||    
T  20627295 attgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttg 20627394  T
Q  210 gtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattct 309  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  20627395 gtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattct 20627493  T
Q  310 tgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627494 tgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattga 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19794967
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaa-tttcaaatg 19794684  T
Q  111 ttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  19794685 ttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 19794784  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  19794785 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattc 19794883  T
Q  309 ttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794884 ttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43643220
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 43642937  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgtt 208  Q
    |||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  43642938 ttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 43643037  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  43643038 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattc 43643136  T
Q  309 ttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643137 ttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891242
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttga 8891283  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891282 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  151 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatg 250  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  251 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 350  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttg 36982662  T
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982663 atgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtt 247  Q
    || |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  | |||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  248 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 347  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||        
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctg 24341607  T
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341608 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 392
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 277  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  278 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 376  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  377 tcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275045
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284278
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633538
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646232
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660221
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 19660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666848
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 19666848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25305826 - 25305769
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25305826 taggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttag 25305769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 31146032 - 31146138
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||    | ||  ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||    
T  31146032 taggagctaaagtgaagcttgggctagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgt 31146129  T
Q  112 tgtatgaat 120  Q
    |||||||||    
T  31146130 tgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagg 3806  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3807 aataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  153 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaa 252  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  253 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 352  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgat 1164  T
Q  353 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1163 gaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118507
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatg 54118224  T
Q  111 ttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  54118225 ttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 54118324  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | || ||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| ||||||    
T  54118325 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattc 54118423  T
Q  309 ttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118424 ttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 13246471  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246470 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 292  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 384  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtt 247  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  248 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 347  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 15675307  T
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675308 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 324
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtt 247  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  248 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 324  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  155 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaaga 254  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  | ||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  255 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 354  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  355 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240900
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 191  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119139
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  295 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  148 tcgtgctccaact 160  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682460
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885652
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165881
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcat 41165881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 392
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||     
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatg 14842785  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842786 aataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||     
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatg 2049849  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049848 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
     ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatg 12030371  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030372 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  153 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaa 252  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  253 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 352  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13838934  T
Q  353 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838933 gaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744377
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 16744097  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||    
T  16744098 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttgg 16744197  T
Q  211 tgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattctt 310  Q
    | ||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | ||||||||    
T  16744198 ttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattctt 16744295  T
Q  311 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744296 gtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 392
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  91 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  189 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgtt 288  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  289 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  389 gatg 392  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 118 - 393
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  118 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 217  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  218 acatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaa 317  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  318 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 393  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||| | |||||||||  |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 135 - 392
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 389  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19231981
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaat 19232065  T
Q  110 gttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 191  Q
    ||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232064 gttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614838
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttga 15614875  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614874 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  154 tccaactatgttgttatgttt 174  Q
    || || |||| || |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992873
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513193
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844514
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038056
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955916
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854305
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205019
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810941
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 38810941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  279 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 378  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  379 atggattgatgatg 392  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  279 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 378  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  379 atggattgatgatg 392  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  279 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 378  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  379 atggattgatgatg 392  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  279 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 378  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  379 atggattgatgatg 392  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301396
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13301396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312052
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13312052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191879
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17191879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 228  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 3576290 - 3576347
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  3576290 taggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttag 3576347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 228  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15550987 - 15550922
Alignment:
Q  20 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  15550987 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatca 15550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059966
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  113 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 212  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||    
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  213 aaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgt 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  313 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 139 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  239 tgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 338  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  339 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16211805  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 390  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211804 attcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttga 13037236  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037237 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 338  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  339 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 387
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  150 gtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttat 249  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  250 gaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 349  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggtt 11580959  T
Q  350 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 387  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580960 gatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttga 36052708  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052707 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 135 - 392
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 386
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  129 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  228 a-tatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 325  Q
    | |||| | |||||  | |||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  326 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493978
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126738
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936949
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111201
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377819
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgtt 13377827  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  13377826 gtatgaat 13377819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296079
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 241  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatga 296079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7283987
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  147 ttcgtgctccaact 160  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtta 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 160
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114021
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14114021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 160
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423671
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||     
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatg 48637  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48636 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 393
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16193940  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193941 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttga 43373690  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373691 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 202 - 392
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  202 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  302 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 202 - 392
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  202 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  302 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 202 - 392
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  202 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  302 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16405235
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatg 16404955  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16404956 ttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 16405055  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | ||||||    
T  16405056 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattc 16405151  T
Q  309 ttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405152 ttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  153 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaa 252  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  253 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 352  Q
     |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgat 24929014  T
Q  353 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929015 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 388
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 339  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  340 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274766
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641083
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826889
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716794
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  202 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115598
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285543
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198062
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttag 21198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||     
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatg 6287  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||     
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 1179  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1180 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||     
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 8917  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8916 aataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  153 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaa 252  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| ||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  253 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 352  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcat 12155  T
Q  353 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12154 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||     
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 171944  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171943 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||     
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 177647  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177646 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||     
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatg 41768  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41767 aatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 392
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  151 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatg 250  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  251 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 350  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttg 37134  T
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37135 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15398
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 381
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||| ||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 351  Q
    | |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 247664  T
Q  352 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247665 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34107
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 57 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  57 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  153 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaa 252  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  253 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 352  Q
     ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgat 26638  T
Q  353 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26639 gaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
     |||| |||||||  | ||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6934
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || || ||| ||||     
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatg 128392  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128393 aataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 363  Q
      |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  364 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  64 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  163 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgcta 262  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  263 aaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 362  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  363 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  151 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatg 250  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  251 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 350  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 123385  T
Q  351 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123386 atgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 368  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 243  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  244 ggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 343  Q
     |||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  344 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30492 - 30417
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30492 catagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  154 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaag 253  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||     
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  254 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 353  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  354 aataattgcttgggtatgcatattcatggattg 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272063 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 135 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20493
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 238  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  239 tgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  339 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 135 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 334  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  335 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 185
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 274
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 155  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  156 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagat 255  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  256 tgtgctaaaggggtgaatt 274  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 392
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  239 tgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 338  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  339 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  102 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  200 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag 299  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  300 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8849
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  148 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggtt 247  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  248 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 347  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |      
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttg 8894  T
Q  348 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8893 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  154 t 154  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 392
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 277  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  278 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 377  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  378 catggattgatgatg 392  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 276  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  277 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 376  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  377 tcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89600
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatga 251  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||| ||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  252 agattgtgctaaaggggtgaatt 274  Q
    | |||||||| ||  ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  152 gctccaactatgttgttatgtttgtatg 179  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  165 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  265 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 364  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  365 gggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 286
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 286  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    ||| | | |||||||  ||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 326  Q
     | || ||||||   | ||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  327 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41632
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | ||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  286 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 385  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  386 gatgatg 392  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  239 tgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 337  Q
    ||  | ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  338 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 388  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 327  Q
     |||| |||||||  | ||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T
Q  328 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13570 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42677
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  286 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 385  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  386 gatgatg 392  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  240 gataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 296  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  235 aaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  228 atatgcaaaaatgataggttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 275  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80187
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166197
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116483
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31212
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  295 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 392  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 309 - 385
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  336 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 390  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1701
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19807 - 19881
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24185
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  15 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  48 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1436
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35816
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76756
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttag 76756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    
T  689 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6999
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7056 taggagctaaagtgaaggttgggctaggaattggtgataattatggtaagggggttag 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43708
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 43708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31357
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 31357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 766 times since January 2019
Visitors: 4099