View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0647_low_3 (Length: 629)

Name: NF0647_low_3
Description: NF0647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0647_low_3
NF0647_low_3
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (25-609)||(16254548-16255127)
chr4 (26-609)||(17150684-17151267)
chr4 (24-609)||(6693527-6694112)
chr4 (26-594)||(520375-520943)
chr4 (26-609)||(7844905-7845488)
chr4 (117-423)||(54698404-54698710)
chr4 (117-423)||(26813334-26813640)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (23-609)||(14892199-14892785)
chr8 (24-609)||(21211417-21212002)
chr8 (97-607)||(22832121-22832631)
chr8 (116-415)||(25035989-25036288)
chr8 (116-415)||(25050026-25050325)
chr8 (116-422)||(18233759-18234065)
chr8 (116-422)||(18243210-18243516)
chr8 (116-420)||(33600536-33600840)
chr8 (116-422)||(12916388-12916694)
chr8 (116-336)||(23749913-23750133)
chr8 (206-329)||(45497837-45497960)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (24-609)||(9543687-9544272)
chr7 (24-609)||(16140631-16141216)
chr7 (24-609)||(46498423-46499008)
chr7 (24-609)||(5389618-5390203)
chr7 (24-609)||(26304865-26305450)
chr7 (24-609)||(26361368-26361953)
chr7 (24-609)||(32099689-32100274)
chr7 (24-609)||(6535793-6536378)
chr7 (24-609)||(8502358-8502943)
chr7 (24-609)||(44898608-44899193)
chr7 (70-609)||(13283877-13284416)
chr7 (222-594)||(42596865-42597237)
chr7 (26-191)||(42596698-42596863)
chr7 (117-327)||(7582477-7582687)
chr7 (117-423)||(15175386-15175692)
chr7 (116-422)||(14643414-14643720)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (24-609)||(52979-53562)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (24-609)||(18161374-18161959)
chr6 (24-609)||(16899255-16899840)
chr6 (24-609)||(31358870-31359455)
chr6 (26-594)||(34766667-34767235)
chr6 (26-609)||(18710425-18711008)
chr6 (26-609)||(18704490-18705073)
chr6 (32-415)||(29541764-29542147)
chr6 (410-609)||(29561121-29561320)
chr6 (384-422)||(25895804-25895842)
chr6 (206-299)||(11375039-11375132)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (24-609)||(18362586-18363171)
chr5 (24-609)||(27413457-27414042)
chr5 (24-609)||(26200772-26201357)
chr5 (24-609)||(33940629-33941214)
chr5 (26-594)||(20949166-20949734)
chr5 (33-593)||(23375368-23375920)
chr5 (116-422)||(5601579-5601885)
chr5 (117-423)||(30453229-30453535)
chr5 (117-423)||(30458307-30458613)
chr5 (117-423)||(24413672-24413978)
chr5 (278-541)||(22456358-22456621)
chr5 (116-422)||(24299224-24299530)
chr5 (116-336)||(21083013-21083233)
chr5 (26-99)||(19781874-19781947)
chr5 (384-557)||(20037353-20037526)
chr5 (116-188)||(24289951-24290023)
chr5 (206-329)||(15329389-15329512)
chr5 (206-329)||(18709247-18709370)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (24-609)||(6423616-6424201)
chr3 (24-609)||(8974155-8974740)
chr3 (24-609)||(9538444-9539029)
chr3 (24-530)||(12387297-12387802)
chr3 (116-422)||(48979673-48979979)
chr3 (117-423)||(28366704-28367010)
chr3 (116-423)||(4384222-4384529)
chr3 (117-175)||(28374773-28374831)
chr3 (117-175)||(28382595-28382653)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (24-609)||(16156192-16156777)
chr1 (26-594)||(1987651-1988219)
chr1 (84-579)||(22959697-22960190)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (24-609)||(148017-148602)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (32-609)||(45015670-45016247)
chr2 (24-609)||(18652527-18653112)
chr2 (24-609)||(9512211-9512796)
chr2 (26-594)||(27168448-27169016)
chr2 (70-609)||(22903494-22904033)
chr2 (116-422)||(1791955-1792261)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (26-594)||(6030-6598)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (26-594)||(7080-7648)
scaffold0313 (26-594)||(10862-11430)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (24-444)||(20084-20504)
scaffold0141 (440-609)||(27670-27839)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (33-593)||(16545-17097)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (191-480)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (84-579)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (398-607)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (440-609)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (117-423)||(102918-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (116-422)||(257898-258204)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (248-327)||(5117-5196)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 609
Target Start/End: Original strand, 16254548 - 16255127
Alignment:
Q  25 catcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactct 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16254548 catcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtcacagaaaagagtacatggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactct 16254647  T
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  16254648 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagagg-----gataccttgaaaatac 16254742  T
Q  225 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254743 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 16254842  T
Q  325 gtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagt 424  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16254843 gtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagt 16254942  T
Q  425 gtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtac 524  Q
     ||||  ||| |||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16254943 atgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 16255042  T
Q  525 ttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255043 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 609
Target Start/End: Original strand, 17150684 - 17151267
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17150684 atcacagatggagactttgttccaacaaccaacgaaggaactgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaacttta 17150783  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150784 aagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 17150883  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150884 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 17150983  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150984 tatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 17151083  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    | ||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151084 tttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 17151183  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151184 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 6693527 - 6694112
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6693527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6693626  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  6693627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6693726  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6693826  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  6693827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6693926  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6694026  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694027 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 520943 - 520375
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  520943 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 520844  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  520843 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 520744  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520743 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 520644  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  520643 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 520544  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  520543 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 520444  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520443 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 7845488 - 7844905
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  7845488 atcacagatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctataaaggaaaagaaggcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactcta 7845389  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  7845388 aagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatata 7845289  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845288 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7845189  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845188 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 7845089  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    | ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7845088 tatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaagttgtact 7844989  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844988 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698404
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 54698411  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  54698410 ttccaag 54698404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Original strand, 26813334 - 26813640
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  26813334 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactct 26813433  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| ||||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  26813434 aaaaattcatcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 26813533  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||  | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26813534 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtc 26813633  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  26813634 ttccaag 26813640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 14892785 - 14892199
Alignment:
Q  23 atcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaact 122  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14892785 atcatcacatatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 14892686  T
Q  123 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14892685 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaat 14892586  T
Q  223 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14892585 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgag 14892486  T
Q  323 atgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaa 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14892485 atgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtcttccaa 14892386  T
Q  423 gtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgt 522  Q
    || ||||  ||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14892385 gtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 14892286  T
Q  523 acttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892285 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 21212002 - 21211417
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21212002 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 21211903  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  21211902 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 21211803  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211802 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 21211703  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  21211702 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 21211603  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211602 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 21211503  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211502 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 97 - 607
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832631
Alignment:
Q  97 tgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgct 196  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  197 aaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 296  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  297 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaat 396  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaat 22832420  T
Q  397 cagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcatt 496  Q
    | |||| ||    ||||||||||||| | ||||  ||| ||| |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22832421 cggaaagattccgagatgtcttccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcatt 22832520  T
Q  497 ggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttg 596  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  22832521 ggttcactgagagctcctgaagtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtag 22832620  T
Q  597 ttgatgatgat 607  Q
     ||||||||||    
T  22832621 ctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25035989
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25035989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25050026
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18234065
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18234058  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  18234059 ctcccaa 18234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243516
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18243509  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  18243510 ctcccaa 18243516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600536
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  | ||| |||||  | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| | || ||||||| |||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaattaaggtcattgggaaaaatatactctcctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgt 33600541  T
Q  416 cttcc 420  Q
    |||||    
T  33600540 cttcc 33600536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916694
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcctctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 12916687  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  12916688 ctcccaa 12916694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23750133 - 23749913
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| |  |||||||  | |||||||||| |||||||  |||    
T  23750133 ttaaactataaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 23750034  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  23750033 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 23749934  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  23749933 tgatgagatgtttgcaagatt 23749913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45497960 - 45497837
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  45497960 tgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 45497861  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||| ||||| |||||||    
T  45497860 ccgaaaccatagatgaaatgtatg 45497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 9544272 - 9543687
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9544272 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9544173  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9544172 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaata 9544073  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544072 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9543973  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9543972 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtcttccaag 9543873  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9543872 tatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaagttgta 9543773  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543772 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 16141216 - 16140631
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16141216 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16141117  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16141116 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16141017  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141016 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16140917  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16140916 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16140817  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140816 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16140717  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140716 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 46498423 - 46499008
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  46498423 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 46498522  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  46498523 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 46498622  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498623 catcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 46498722  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  46498723 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 46498822  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498823 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 46498922  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498923 ctttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 5390203 - 5389618
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5390203 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 5390104  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5390103 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 5390004  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390003 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 5389904  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5389903 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 5389804  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5389803 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 5389704  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389703 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 26304865 - 26305450
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26304865 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26304964  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26304965 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26305064  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305065 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26305164  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26305165 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26305264  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305265 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26305364  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305365 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 26361953 - 26361368
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26361953 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26361854  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26361853 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26361754  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361753 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26361654  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26361653 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26361554  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361553 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26361454  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361453 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 32099689 - 32100274
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32099689 tcatcacaaatggagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactc 32099788  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  32099789 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 32099888  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099889 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 32099988  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  32099989 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 32100088  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32100089 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 32100188  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100189 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 6535793 - 6536378
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6535793 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6535892  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  6535893 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6535992  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535993 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6536092  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  6536093 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6536192  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536193 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6536292  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536293 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 8502358 - 8502943
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8502358 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8502457  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  8502458 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 8502557  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8502558 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaa 8502657  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  8502658 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8502757  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502758 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8502857  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502858 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 44898608 - 44899193
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44898608 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 44898707  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  44898708 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 44898807  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898808 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgaga 44898907  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  44898908 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 44899007  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44899008 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 44899107  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899108 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 13284416 - 13283877
Alignment:
Q  70 caaagataagagtgcatg-gtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaag 168  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13284416 caaagaaaagagtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcactaaccatggaagaaag 13284317  T
Q  169 tgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 268  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284316 tgaaagagttgatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 13284217  T
Q  269 ggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttg 368  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13284216 ggagtcaaaaagtttgaa-tctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttg 13284118  T
Q  369 gaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaattt 468  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  13284117 ggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgccttccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagattt 13284018  T
Q  469 aaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttg 568  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13284017 gaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttg 13283918  T
Q  569 aaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283917 aaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 222 - 594
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597237
Alignment:
Q  222 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatga 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  322 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttcca 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgccttcca 42597064  T
Q  422 agtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttg 521  Q
    ||| |||   ||| |||||||||  |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42597065 agtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaagttg 42597164  T
Q  522 tacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597165 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 42596698 - 42596863
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42596698 atcacagatggagactttgttccaaagaccaaaaaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactcta 42596797  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaaga 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  42596798 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtgatgaatgcaaga 42596863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 327
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582687
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  317 gatgagatgta 327  Q
    ||||| |||||    
T  7582677 gatgaaatgta 7582687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175692
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |  || |||||||| ||||| ||  |    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttacggcaaaagaggtttgggacactct 15175485  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  15175486 aaaaattcatcatgaagaaactagccacataaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 15175585  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  15175586 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 15175685  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  15175686 ttccaag 15175692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14643720 - 14643414
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |   |||||| |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  14643720 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaactatggaggaaagtgaaagaatctatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14643621  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| || ||||| || ||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14643620 taaaaattcaccatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14643521  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14643520 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 14643421  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  14643420 ctcccaa 14643414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 53562 - 52979
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  53562 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 53463  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53462 taaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaata 53363  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53362 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 53263  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  53262 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtcttccaag 53165  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | | ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  53164 tatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaagttata 53065  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53064 cttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 18161374 - 18161959
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18161374 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18161473  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18161474 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18161573  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161574 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18161673  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18161674 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18161773  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161774 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18161873  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161874 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 16899255 - 16899840
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16899255 tcatcacagatggagactatgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16899354  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  16899355 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaata 16899454  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899455 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16899554  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16899555 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16899654  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899655 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16899754  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899755 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 31358870 - 31359455
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  31358870 tcatcacaaatgaagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 31358969  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  31358970 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 31359069  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359070 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 31359169  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  31359170 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 31359269  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359270 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 31359369  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359370 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Original strand, 34766667 - 34767235
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34766667 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 34766766  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34766767 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 34766866  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766867 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 34766966  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34766967 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 34767066  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34767067 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 34767166  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767167 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18711008 - 18710425
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  18711008 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18710909  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||    
T  18710908 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18710809  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710808 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 18710709  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  18710708 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18710609  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18710608 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18710509  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710508 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18705073 - 18704490
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  18705073 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18704974  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||    
T  18704973 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18704874  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18704873 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaattttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatt 18704774  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  18704773 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18704674  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18704673 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18704574  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704573 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 415
Target Start/End: Original strand, 29541764 - 29542147
Alignment:
Q  32 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541764 gatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 29541863  T
Q  132 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541864 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 29541963  T
Q  232 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29541964 gggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 29542063  T
Q  332 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542064 agatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 410 - 609
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  410 agatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  510 ctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 422
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895842
Alignment:
Q  384 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaa 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaa 25895842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Original strand, 11375039 - 11375132
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatga 299  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || |||||||    
T  11375039 tgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaatga 11375132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 18362586 - 18363171
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18362586 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18362685  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18362686 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18362785  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362786 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18362885  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18362886 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18362985  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362986 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18363085  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363086 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 27413457 - 27414042
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |     
T  27413457 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattt 27413556  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  27413557 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 27413656  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413657 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 27413756  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  27413757 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 27413856  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413857 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 27413956  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413957 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 26201357 - 26200772
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26201357 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26201258  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26201257 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26201158  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201157 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26201058  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26201057 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26200958  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200957 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26200858  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200857 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 33940629 - 33941214
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  33940629 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 33940728  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  33940729 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 33940828  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940829 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 33940928  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  33940929 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 33941028  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33941029 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 33941128  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941129 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Original strand, 20949166 - 20949734
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20949166 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 20949265  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20949266 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 20949365  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949366 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 20949465  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20949466 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 20949565  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20949566 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 20949665  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949666 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 23375920 - 23375368
Alignment:
Q  33 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctag 132  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23375920 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 23375821  T
Q  133 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgag 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  || | | |||  |||||     
T  23375820 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 23375721  T
Q  233 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  23375720 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 23375621  T
Q  333 gatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||  |    
T  23375620 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 23375526  T
Q  433 acatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagga 532  Q
    || |||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  23375525 acctatgg---atgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 23375429  T
Q  533 gataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 593  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375428 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601885
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  5601779 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 5601878  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    |||||||    
T  5601879 cttccaa 5601885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453229
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30453236  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  30453235 ttccaag 30453229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458307
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30458314  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  30458313 ttccaag 30458307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24413978
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgaaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 24413971  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  24413972 ttccaag 24413978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 22456621 - 22456358
Alignment:
Q  278 aaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcat 377  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| | | |||||||||  |||| ||  | |||||   ||    
T  22456621 aaatttgaaatcttcgaaatgaatgaagaggaaaacattgatgaaatgtatttcagatttacttctaaagtaaatgagttgaggtcattgggaaaaatat 22456522  T
Q  378 aatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctat 477  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||||| ||  |    
T  22456521 attctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcctt 22456422  T
Q  478 gaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaacca 541  Q
    |    |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  22456421 ggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299224
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtattcatgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 24299231  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  24299230 ctcccaa 24299224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083013
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| |  |||||||  | |||||||||| |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  21083033 tgatgagatgtttgcaagatt 21083013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 19781874 - 19781947
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatga 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || || || ||||||||||| ||||||||    
T  19781874 atcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtaaaggaaaatagtgcatggtccacagatga 19781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 557
Target Start/End: Original strand, 20037353 - 20037526
Alignment:
Q  384 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacct 483  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||  ||| |||||| |||||||| ||||| |||||  || |||| ||  ||    |    
T  20037353 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatcactcaagccaacgatctaaattccttggcttt 20037452  T
Q  484 gaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaa 557  Q
      || ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20037453 agaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289951
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgta 188  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgta 24289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15329512 - 15329389
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  15329512 tgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 15329413  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  15329412 ccgaaaccattgatgaaatgtatg 15329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Original strand, 18709247 - 18709370
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  18709247 tgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 18709346  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  18709347 ccgaaaccattgatgaaatgtatg 18709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 6423616 - 6424201
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6423616 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6423715  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6423716 taaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 6423815  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423816 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6423915  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  6423916 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtcttccaag 6424015  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424016 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6424115  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424116 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 8974155 - 8974740
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8974155 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8974254  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  8974255 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 8974354  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974355 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 8974454  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  8974455 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8974554  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974555 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8974654  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974655 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 9538444 - 9539029
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9538444 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9538543  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9538544 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaata 9538643  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538644 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9538743  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9538744 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9538843  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538844 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9538943  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538944 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 530
Target Start/End: Original strand, 12387297 - 12387802
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  12387297 tcatcacagatggagactttgttccaaaaaccaaagaaggaactgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactc 12387396  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  12387397 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaagagtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagta 12387495  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387496 catcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtcataaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 12387595  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12387596 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgccttccaag 12387695  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | || || ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  12387696 tatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaagttgta 12387795  T
Q  524 cttcaag 530  Q
    |||||||    
T  12387796 cttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48979979
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48979873 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 48979972  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    |||||||    
T  48979973 cttccaa 48979979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28367010 - 28366704
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  28367010 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactct 28366911  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| ||||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  28366910 aaaaattcatcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 28366811  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  28366810 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaattttaagatgtc 28366711  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  28366710 ttccaag 28366704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384222
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| ||||||||| || ||| |||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||| || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  | | |||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaataaaataacat 4384330  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||| ||  | || ||| |  |||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  4384329 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaattaagatcacttgggaaaacttattctgccgatgacataattaaaaaaatattaaaatgt 4384230  T
Q  416 cttccaag 423  Q
    ||||||||    
T  4384229 cttccaag 4384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28374831 - 28374773
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 175  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374831 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28382653 - 28382595
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 175  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382653 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 16156192 - 16156777
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16156192 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16156291  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16156292 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16156391  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156392 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16156491  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16156492 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 16156591  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156592 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16156691  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156692 cttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 1988219 - 1987651
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1988219 atcacagatggagactttgttccattaaccaaagaaggaatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 1988120  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1988119 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 1988020  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988019 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 1987920  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  1987919 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgacttccaagta 1987820  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987819 tgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 1987720  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987719 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 579
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22960190
Alignment:
Q  84 catggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtga 183  Q
    ||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  184 atgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 283  Q
    |||||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  284 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatcta 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||  | |    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatacca 22959995  T
Q  384 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacct 483  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||   |    
T  22959996 ctcatgatagaatcaggaagatactaagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 22960095  T
Q  484 gaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 579  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960096 ggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 148017 - 148602
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  148017 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactc 148116  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  148117 ttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaata 148216  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  148217 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgaga 148316  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148317 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 148416  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  148417 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgacgttgta 148516  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148517 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 609
Target Start/End: Original strand, 45015670 - 45016247
Alignment:
Q  32 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 131  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  45015670 gatgaagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactctaaagcta 45015769  T
Q  132 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015770 gagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 45015869  T
Q  232 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45015870 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 45015969  T
Q  332 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||      
T  45015970 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 45016069  T
Q  432 gacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagg 531  Q
    ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016070 gacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagg 45016169  T
Q  532 agataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016170 agacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Original strand, 18652527 - 18653112
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18652527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18652626  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  18652627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 18652726  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18652826  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18652827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18652926  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18653026  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653027 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 9512796 - 9512211
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9512796 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9512697  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  9512696 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 9512597  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512596 catcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9512497  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9512496 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9512397  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 523  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512396 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9512297  T
Q  524 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512296 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27169016 - 27168448
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27169016 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 27168917  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27168916 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 27168817  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168816 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 27168717  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27168716 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 27168617  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27168616 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 27168517  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168516 tcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 609
Target Start/End: Original strand, 22903494 - 22904033
Alignment:
Q  70 caaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903494 caaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 22903593  T
Q  170 gaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 269  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903594 gaaagagttgatgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattacatcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 22903693  T
Q  270 gagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgg 369  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903694 gagttagaaagtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttgg 22903793  T
Q  370 aaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaattta 469  Q
    |||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||     
T  22903794 aaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgccttccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttg 22903893  T
Q  470 aaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttga 569  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  22903894 aaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaa 22903993  T
Q  570 aagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903994 aagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792261
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1792155 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 1792254  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    |||||||    
T  1792255 cttccaa 1792261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6030
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6598 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 6499  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6498 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 6399  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6398 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 6299  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6298 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 6199  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6198 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 6099  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6098 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Original strand, 7080 - 7648
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7080 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 7179  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7180 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 7279  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7379  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7380 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 7479  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7480 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 7579  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7580 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 594
Target Start/End: Original strand, 10862 - 11430
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10862 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 10961  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10962 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 11061  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 11161  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11162 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 11261  T
Q  426 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 525  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11262 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 11361  T
Q  526 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 594  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11362 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 24 - 444
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20504
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  20084 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactc 20183  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | ||    
T  20184 caaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaagagttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagta 20283  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284 catcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 20383  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20384 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaag 20483  T
Q  424 tgtgtgaggacatatggtcac 444  Q
      ||||  ||| |||||||||    
T  20484 aatgtggagacctatggtcac 20504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 609
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  440 gtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaac 539  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  540 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 593
Target Start/End: Original strand, 16545 - 17097
Alignment:
Q  33 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctag 132  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16545 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 16644  T
Q  133 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgag 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  || | | |||  |||||     
T  16645 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 16744  T
Q  233 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  16745 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 16844  T
Q  333 gatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||  |    
T  16845 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 16939  T
Q  433 acatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagga 532  Q
    || |||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16940 acctatgg---atgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 17036  T
Q  533 gataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 593  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17037 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 191 - 480
Target Start/End: Original strand, 1 - 290
Alignment:
Q  191 aatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  291 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatga 200  T
Q  391 tagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaa 480  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  201 aagaataagaaaaataatgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 84 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189005
Alignment:
Q  84 catggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtga 183  Q
    ||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  184 atgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 283  Q
    |||||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  284 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatcta 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||    |    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagca 189200  T
Q  384 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacct 483  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||   ||  | | |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||   |    
T  189199 ctcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatggaggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 189100  T
Q  484 gaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 579  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189099 ggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 398 - 607
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  398 agaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattg 497  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  498 gttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 597  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  598 tgatgatgat 607  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  440 gtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaac 539  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  540 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 609  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 102918
Alignment:
Q  117 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 102925  T
Q  417 ttccaag 423  Q
    |||||||    
T  102924 ttccaag 102918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 422
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258204
Alignment:
Q  116 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttggtgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |  || |||||  |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 415  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  258098 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 258197  T
Q  416 cttccaa 422  Q
    || ||||    
T  258198 ctcccaa 258204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 327
Target Start/End: Original strand, 5117 - 5196
Alignment:
Q  248 aaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgta 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5117 aaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactatttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatgaaatgta 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University