View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0647_low_38 (Length: 274)
Name: NF0647_low_38
Description: NF0647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF0647_low_38 |
 | |
|
| [»] scaffold0525 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0586 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 55292327 - 55292472
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55292327 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
55292426 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55292427 |
atatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
55292472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10554633 - 10554488
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10554633 |
aggatgtttataatgtttattgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
10554534 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10554533 |
atatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
10554488 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54973584 - 54973439
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
54973584 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
54973485 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54973484 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
54973439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54976194 - 54976049
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
54976194 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
54976095 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54976094 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
54976049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54978804 - 54978659
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
54978804 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
54978705 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54978704 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
54978659 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 45134828 - 45134973
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
45134828 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
45134927 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45134928 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
45134973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 7300985 - 7301130
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7300985 |
aggacgtttgtaatgtttaatgacatcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
7301084 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7301085 |
atatgatggttattatggtcgttgtctcgctgcttgttattatatg |
7301130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 6608177 - 6608321
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6608177 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaacgaggg-gatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
6608275 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6608276 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
6608321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 21415149 - 21415297
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21415149 |
aggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatacttgttgt |
21415248 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatgatg |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21415249 |
atatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattatatgatg |
21415297 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8523130 - 8522985
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8523130 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
8523031 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8523030 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
8522985 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 15686023 - 15686168
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15686023 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggatatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
15686122 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15686123 |
atatgatggttattattgctgttgtctcgctgcttattattatatg |
15686168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41791870 - 41791725
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
41791870 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
41791771 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41791770 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
41791725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 16278013 - 16278158
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16278013 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgtttatatgagtcctacttgttgt |
16278112 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16278113 |
atatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
16278158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 53387626 - 53387768
Alignment:
| Q |
4 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtata |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53387626 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata |
53387725 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53387726 |
tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
53387768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14698914 - 14698770
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14698914 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
14698816 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14698815 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
14698770 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4171222 - 4171078
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4171222 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaaaatgttgatatgagtcctacttgttgt |
4171124 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4171123 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
4171078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 21189768 - 21189851
Alignment:
| Q |
59 |
ttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtatatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattatta |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21189768 |
ttatatgttatgaaagatgttgatatcagttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgcttattatta |
21189851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21239028 - 21239173
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
21239028 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
21239127 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21239128 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
21239173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21241578 - 21241723
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
21241578 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
21241677 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21241678 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
21241723 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24504901 - 24504756
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
24504901 |
aggatgtttgtaatgtttaatgatgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
24504802 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24504801 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
24504756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31503797 - 31503652
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31503797 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctacttgttgt |
31503698 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31503697 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
31503652 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31506363 - 31506218
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31506363 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctacttgttgt |
31506264 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31506263 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
31506218 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 20591011 - 20591153
Alignment:
| Q |
4 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtata |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20591011 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagattttgatatgagtcctacttgttgtata |
20591110 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20591111 |
tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
20591153 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8776558 - 8776413
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8776558 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttaatatgagtcctactcgttgt |
8776459 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8776458 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
8776413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 17505693 - 17505835
Alignment:
| Q |
4 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtata |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17505693 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata |
17505792 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17505793 |
tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
17505835 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17547521 - 17547379
Alignment:
| Q |
4 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtata |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17547521 |
atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata |
17547422 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17547421 |
tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
17547379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006616 - 16006471
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
16006616 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagataattatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
16006517 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16006516 |
atatgatggttattattgttgtagtctcgctgcttattattatatg |
16006471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21743208 - 21743352
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21743208 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt |
21743306 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21743307 |
atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatg |
21743352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26496084 - 26495939
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
26496084 |
aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgtaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
26495985 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26495984 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
26495939 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 29325143 - 29325288
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
29325143 |
aggatgtctgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
29325242 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29325243 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatg |
29325288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 108
Target Start/End: Original strand, 27869341 - 27869390
Alignment:
| Q |
59 |
ttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgtatatgatg |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27869341 |
ttatatatcatgaaagatgttgatatgagttacacttgttgtatatgatg |
27869390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0525 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:
Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9369 - 9224
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
9369 |
aggatgttggtaaggtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
9270 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9269 |
atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattgttatatg |
9224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20579663 - 20579522
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
20579663 |
aggatgtttgtagtgtttaatgacgtcgacttaggtcgatgaacaaatgaggagatagttatatgttatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt |
20579564 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattat |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20579563 |
atatgatggttattattgttg-tgtctcgctacttattattat |
20579522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0586 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:
Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2052 - 1904
Alignment:
| Q |
1 |
aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaataaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctgcttgttgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2052 |
aggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatacttgttgt |
1953 |
T |
|
| Q |
101 |
atatgatggttattatcgttgttgtcttgctgcttattattatatgatg |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1952 |
atatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattagatgatg |
1904 |
T |
|
Back To:
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