View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0648_high_1 (Length: 456)

Name: NF0648_high_1
Description: NF0648
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0648_high_1
NF0648_high_1
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (98-435)||(15950709-15951047)
chr7 (98-435)||(7822728-7823066)
chr7 (98-435)||(7830039-7830377)
chr7 (98-435)||(27101555-27101893)
chr7 (98-435)||(27108903-27109241)
chr7 (98-435)||(27176433-27176771)
chr7 (98-435)||(38783647-38783985)
chr7 (95-435)||(15760029-15760370)
chr7 (95-355)||(18979936-18980197)
chr7 (95-355)||(15927648-15927909)
chr7 (95-355)||(13758450-13758711)
chr7 (95-355)||(14250813-14251074)
chr7 (89-303)||(48622575-48622788)
chr7 (89-316)||(10000279-10000505)
chr7 (89-316)||(16418618-16418844)
chr7 (98-268)||(2437625-2437794)
chr7 (96-268)||(18253759-18253931)
chr7 (95-298)||(13572816-13573015)
chr7 (98-268)||(10989577-10989746)
chr7 (98-268)||(13910939-13911108)
chr7 (98-268)||(16478879-16479046)
chr7 (94-317)||(13321134-13321369)
chr7 (96-181)||(15862174-15862259)
chr7 (94-268)||(47480941-47481127)
chr7 (92-172)||(7293289-7293370)
chr7 (92-172)||(30262038-30262119)
chr7 (222-268)||(11580789-11580835)
chr7 (92-153)||(11516520-11516581)
chr7 (92-153)||(14113898-14113959)
chr7 (92-153)||(15441473-15441534)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (95-435)||(1219435-1219776)
chr5 (98-435)||(35582036-35582374)
chr5 (98-435)||(21932299-21932637)
chr5 (98-435)||(21938469-21938807)
chr5 (102-435)||(22883006-22883340)
chr5 (98-435)||(36989688-36990026)
chr5 (95-435)||(7425324-7425665)
chr5 (98-402)||(17471506-17471811)
chr5 (95-435)||(35791013-35791355)
chr5 (98-355)||(10777888-10778146)
chr5 (95-355)||(23514641-23514902)
chr5 (98-435)||(11211983-11212321)
chr5 (95-316)||(23328678-23328898)
chr5 (95-316)||(24616282-24616502)
chr5 (95-316)||(24712658-24712878)
chr5 (95-316)||(24745676-24745896)
chr5 (98-268)||(25426796-25426965)
chr5 (95-298)||(27009981-27010180)
chr5 (98-268)||(18777907-18778076)
chr5 (98-268)||(19500067-19500236)
chr5 (98-268)||(22366396-22366565)
chr5 (98-268)||(29188201-29188368)
chr5 (98-268)||(12542-12711)
chr5 (98-268)||(4199900-4200069)
chr5 (98-268)||(21073510-21073679)
chr5 (98-268)||(43443312-43443479)
chr5 (178-411)||(32950717-32950952)
chr5 (96-315)||(34939398-34939628)
chr5 (178-268)||(18531073-18531163)
chr5 (178-268)||(23507132-23507222)
chr5 (388-435)||(23328558-23328605)
chr5 (92-153)||(20623262-20623323)
chr5 (92-153)||(21233437-21233498)
chr5 (388-433)||(24616165-24616210)
chr5 (388-433)||(24712541-24712586)
chr5 (388-433)||(24745559-24745604)
chr5 (92-153)||(25900315-25900376)
chr5 (92-153)||(37053037-37053098)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (95-435)||(34824475-34824816)
chr2 (95-435)||(12728392-12728733)
chr2 (98-435)||(11231256-11231594)
chr2 (95-435)||(16935593-16935934)
chr2 (95-435)||(17006253-17006594)
chr2 (98-435)||(22513103-22513441)
chr2 (98-435)||(28775725-28776063)
chr2 (98-435)||(24685699-24686037)
chr2 (96-435)||(23777961-23778301)
chr2 (95-355)||(8943926-8944187)
chr2 (95-355)||(12635783-12636044)
chr2 (95-355)||(42177884-42178145)
chr2 (92-355)||(12641554-12641818)
chr2 (95-355)||(3798518-3798779)
chr2 (145-435)||(21141895-21142187)
chr2 (95-316)||(23774257-23774477)
chr2 (89-316)||(5888539-5888765)
chr2 (98-268)||(19886576-19886745)
chr2 (96-268)||(7507756-7507940)
chr2 (94-268)||(25265300-25265486)
chr2 (94-268)||(462905-463078)
chr2 (178-268)||(43642963-43643053)
chr2 (92-172)||(17396562-17396643)
chr2 (92-153)||(14906349-14906410)
chr2 (92-153)||(23820364-23820425)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (98-435)||(49232436-49232774)
chr3 (98-435)||(1467657-1467995)
chr3 (98-435)||(25058739-25059077)
chr3 (96-435)||(12902006-12902346)
chr3 (95-431)||(5228317-5228653)
chr3 (98-402)||(22275242-22275547)
chr3 (98-402)||(15468258-15468563)
chr3 (98-435)||(12264710-12265049)
chr3 (95-355)||(18911073-18911334)
chr3 (98-338)||(12811938-12812179)
chr3 (90-361)||(54651531-54651803)
chr3 (89-435)||(44228985-44229332)
chr3 (98-266)||(18896962-18897130)
chr3 (319-435)||(18897139-18897255)
chr3 (96-268)||(15936551-15936723)
chr3 (98-268)||(55316387-55316555)
chr3 (96-268)||(15938393-15938565)
chr3 (98-268)||(41270243-41270411)
chr3 (92-268)||(15615001-15615174)
chr3 (98-297)||(16821280-16821474)
chr3 (178-413)||(11986172-11986408)
chr3 (222-353)||(17912532-17912662)
chr3 (178-268)||(15859030-15859120)
chr3 (178-268)||(51158024-51158114)
chr3 (92-268)||(13839061-13839237)
chr3 (92-172)||(13954799-13954880)
chr3 (178-268)||(12030153-12030243)
chr3 (92-153)||(2449147-2449208)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (98-435)||(22006176-22006514)
chr8 (95-435)||(13662180-13662521)
chr8 (98-435)||(271278-271616)
chr8 (98-435)||(644304-644642)
chr8 (98-435)||(830039-830377)
chr8 (98-435)||(22088712-22089050)
chr8 (98-435)||(15319077-15319415)
chr8 (98-435)||(15499446-15499784)
chr8 (95-355)||(13720843-13721104)
chr8 (95-355)||(16872966-16873227)
chr8 (90-435)||(16195230-16195577)
chr8 (95-268)||(24549149-24549319)
chr8 (98-268)||(6774175-6774342)
chr8 (100-298)||(21844490-21844684)
chr8 (95-268)||(16674305-16674476)
chr8 (98-298)||(21851881-21852077)
chr8 (98-268)||(30120890-30121060)
chr8 (99-315)||(17345690-17345917)
chr8 (92-172)||(22907123-22907204)
chr8 (222-268)||(16405025-16405071)
chr8 (222-268)||(24928841-24928887)
chr8 (92-153)||(5238380-5238441)
chr8 (92-153)||(24661157-24661218)
chr8 (92-153)||(43685839-43685900)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (95-435)||(153922-154263)
scaffold0023 (101-210)||(169830-169938)
scaffold0023 (98-265)||(36264-36430)
scaffold0023 (96-268)||(48765-48936)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (98-435)||(18168970-18169308)
chr4 (96-435)||(19020486-19020826)
chr4 (95-435)||(15287160-15287501)
chr4 (95-435)||(15294269-15294610)
chr4 (95-355)||(7131980-7132241)
chr4 (95-355)||(20000803-20001064)
chr4 (95-435)||(17145572-17145913)
chr4 (90-435)||(18248218-18248564)
chr4 (89-315)||(22738390-22738616)
chr4 (220-435)||(8374508-8374724)
chr4 (107-222)||(8378365-8378480)
chr4 (95-301)||(22351979-22352184)
chr4 (95-316)||(26339140-26339360)
chr4 (98-297)||(10644360-10644554)
chr4 (95-268)||(47357822-47357992)
chr4 (222-317)||(40885604-40885698)
chr4 (96-173)||(9795490-9795566)
chr4 (89-140)||(8378482-8378533)
chr4 (178-268)||(15675095-15675185)
chr4 (178-268)||(54118250-54118340)
chr4 (178-268)||(122056-122146)
chr4 (222-268)||(10104300-10104346)
chr4 (222-268)||(31115796-31115842)
chr4 (222-317)||(13048271-13048365)
chr4 (92-153)||(16609008-16609069)
chr4 (394-435)||(22738269-22738310)
chr4 (92-153)||(26680493-26680554)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (98-435)||(16376291-16376629)
chr6 (98-435)||(16383615-16383953)
chr6 (98-435)||(22225656-22225994)
chr6 (98-435)||(10488699-10489037)
chr6 (98-435)||(16556057-16556395)
chr6 (98-435)||(16632613-16632951)
chr6 (95-435)||(1556005-1556346)
chr6 (95-435)||(19610018-19610359)
chr6 (95-355)||(16231972-16232233)
chr6 (95-355)||(18086738-18086999)
chr6 (95-355)||(23977849-23978110)
chr6 (96-355)||(13620710-13620970)
chr6 (98-298)||(19299375-19299575)
chr6 (98-262)||(22251484-22251648)
chr6 (121-366)||(29665942-29666189)
chr6 (95-316)||(29869691-29869911)
chr6 (348-435)||(33314387-33314474)
chr6 (92-268)||(1650016-1650189)
chr6 (98-268)||(25175731-25175901)
chr6 (109-235)||(16825678-16825803)
chr6 (98-268)||(27653898-27654067)
chr6 (178-299)||(14626124-14626243)
chr6 (253-413)||(27740860-27741021)
chr6 (95-315)||(15862592-15862823)
chr6 (95-315)||(1657659-1657890)
chr6 (94-268)||(35009349-35009535)
chr6 (94-172)||(27751698-27751777)
chr6 (222-268)||(23153614-23153660)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (98-435)||(18059676-18060014)
chr1 (98-435)||(17004638-17004976)
chr1 (98-435)||(38055009-38055347)
chr1 (95-430)||(46523394-46523729)
chr1 (105-355)||(17148647-17148898)
chr1 (98-298)||(19962417-19962617)
chr1 (98-299)||(22227947-22228146)
chr1 (98-299)||(22232644-22232843)
chr1 (95-316)||(22035568-22035788)
chr1 (95-316)||(7640849-7641069)
chr1 (98-268)||(5072304-5072472)
chr1 (92-268)||(2116422-2116595)
chr1 (92-268)||(45051590-45051763)
chr1 (134-268)||(18601068-18601202)
chr1 (178-268)||(20445846-20445936)
chr1 (178-268)||(20531611-20531701)
chr1 (178-268)||(20913197-20913287)
chr1 (178-268)||(20931512-20931602)
chr1 (222-268)||(37844500-37844546)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (98-435)||(31309-31647)
scaffold0107 (147-435)||(39646-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (98-435)||(39103-39441)
scaffold0076 (98-298)||(43137-43333)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (95-435)||(1490-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (95-435)||(2392-2734)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (90-435)||(10249-10595)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (98-435)||(29162-29500)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (92-435)||(34070-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (95-355)||(1429-1690)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (185-435)||(1-252)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (98-435)||(7374-7712)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (94-435)||(54416-54759)
scaffold0066 (94-384)||(45081-45373)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (90-268)||(3890-4068)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (89-303)||(54008-54221)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (98-299)||(5130-5329)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (134-415)||(3434-3715)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (95-316)||(6718-6938)
scaffold0183 (388-435)||(6598-6645)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (95-268)||(3130-3302)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (98-210)||(10666-10778)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (98-298)||(21031-21228)
scaffold0139 (98-268)||(13977-14145)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (89-316)||(7330-7556)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (96-268)||(107914-108086)
scaffold0026 (95-298)||(64436-64640)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (98-268)||(13242-13409)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (89-268)||(9257-9433)
scaffold0215 (89-268)||(16155-16331)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (98-268)||(1220-1388)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (95-316)||(23664-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (95-269)||(202-372)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (178-413)||(56105-56341)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (101-265)||(31593-31756)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (89-202)||(12036-12149)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (96-173)||(13266-13342)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (178-301)||(3324-3447)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (96-268)||(34372-34556)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (94-268)||(13673-13859)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (96-268)||(41815-41998)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (178-269)||(12279-12370)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (178-268)||(540-630)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (178-268)||(6070-6160)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (178-268)||(3588-3678)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (178-268)||(962-1052)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (178-268)||(89460-89550)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (178-268)||(9016-9106)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (178-268)||(123170-123260)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (172-269)||(5695-5792)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (178-268)||(19373-19463)
scaffold0195 (178-268)||(21457-21547)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (178-264)||(8186-8272)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (222-268)||(48354-48400)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (178-268)||(51188-51278)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (92-153)||(22833-22894)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (92-153)||(1491-1552)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15951047
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950909 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtgattattgttaactgatgctattgtaagtg 15951008  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951009 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7823066 - 7822728
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7823066 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7822967  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7822966 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7822867  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822866 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 7822767  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822766 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7830377 - 7830039
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7830278  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7830178  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 7830078  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830077 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 27101555 - 27101893
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27101555 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27101654  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27101655 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27101754  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101755 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 27101854  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101855 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 27108903 - 27109241
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27108903 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27109002  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27109003 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27109102  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109103 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 27109202  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109203 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27176771 - 27176433
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27176771 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27176672  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27176671 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27176572  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176571 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 27176472  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176471 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 38783647 - 38783985
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  38783647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38783746  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38783747 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38783846  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783847 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 38783946  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783947 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 15760029 - 15760370
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15760029 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 15760128  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15760129 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15760228  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  15760229 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtga 15760328  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760329 gtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 18979936 - 18980197
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18979936 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18980035  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18980036 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18980135  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980136 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15927909 - 15927648
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  15927909 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcg 15927810  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15927809 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15927710  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927709 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13758711 - 13758450
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13758711 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 13758612  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13758611 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13758512  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758511 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 14250813 - 14251074
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14250813 tctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcg 14250912  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14250913 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 14251012  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14251013 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Original strand, 48622575 - 48622788
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48622575 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgcta 48622674  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||    
T  48622675 aattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgcataattgtt 48622773  T
Q  289 aagttatgaaattat 303  Q
    ||||| |||||||||    
T  48622774 aagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Original strand, 10000279 - 10000505
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |    
T  10000279 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtca 10000378  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  10000379 aattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 10000477  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000478 aagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16418844 - 16418618
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  16418844 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 16418745  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||| | || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  16418744 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 16418646  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418645 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2437794 - 2437625
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  2437794 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgc 2437696  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2437695 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 18253759 - 18253931
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18253759 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 18253858  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18253859 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18253931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13573015 - 13572816
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  13573015 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 13572918  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||  || |||||  ||||| |||||||    
T  13572917 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagtta 13572820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10989746 - 10989577
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  10989746 aaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgc 10989648  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10989647 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 13910939 - 13911108
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13910939 aaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 13911037  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13911038 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13911108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 16478879 - 16479046
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  16478879 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatttaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgc 16478975  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||  || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16478976 tcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16479046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13321369 - 13321134
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  13321369 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataatt 13321270  T
Q  182 gttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtct 281  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13321269 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtat 13321170  T
Q  282 aaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321169 aaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15862259 - 15862174
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862259 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 47480941 - 47481127
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| | || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  47480941 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 47481040  T
Q  182 gttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47481041 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgtt 47481127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7293370 - 7293289
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  7293370 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 7293289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 30262038 - 30262119
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  30262038 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 30262119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 11580789 - 11580835
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11580789 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 11580835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11516581 - 11516520
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  11516581 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 11516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 14113898 - 14113959
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  14113898 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14113959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 15441473 - 15441534
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  15441473 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 15441534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 1219435 - 1219776
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1219435 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1219534  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1219535 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1219634  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1219635 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattgatgtggttattgttaactgatgctattgtga 1219734  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219735 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35582374 - 35582036
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  35582374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 35582275  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35582274 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35582175  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582174 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 35582075  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582074 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 21932299 - 21932637
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21932299 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21932398  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21932399 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21932498  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21932499 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtg 21932598  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932599 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 21938469 - 21938807
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21938469 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21938568  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21938569 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21938668  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21938669 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtg 21938768  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938769 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 102 - 435
Target Start/End: Original strand, 22883006 - 22883340
Alignment:
Q  102 taagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctctt 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22883006 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctctt 22883105  T
Q  202 gatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaatt 301  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22883106 gctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 22883205  T
Q  302 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatc 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22883206 atgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatt 22883305  T
Q  401 atgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883306 atgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 36989688 - 36990026
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36989688 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 36989787  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36989788 tctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 36989887  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989888 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 36989987  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989988 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7425665 - 7425324
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7425665 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 7425566  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7425565 tgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 7425466  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  7425465 tgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtga 7425366  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7425365 gtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 98 - 402
Target Start/End: Original strand, 17471506 - 17471811
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17471506 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 17471605  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17471606 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatga 17471705  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  17471706 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatg 17471805  T
Q  397 aatcat 402  Q
    ||||||    
T  17471806 aatcat 17471811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 35791013 - 35791355
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35791013 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 35791112  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35791113 tgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 35791212  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgta 392  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | |||      
T  35791213 tgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgag 35791312  T
Q  393 agtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
     |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35791313 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 355
Target Start/End: Original strand, 10777888 - 10778146
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10777888 aaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10777987  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10777988 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10778087  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778088 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23514902 - 23514641
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23514902 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 23514803  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23514802 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 23514703  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514702 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212321
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatga 11212182  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    |||||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  |||    
T  11212183 aattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtg 11212282  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
     || |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11212283 gattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23328898 - 23328678
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  23328898 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 23328799  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  23328798 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23328700  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328699 tgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24616502 - 24616282
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  24616502 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24616403  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  24616402 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24616304  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616303 tgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24712878 - 24712658
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  24712878 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24712779  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  24712778 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24712680  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712679 tgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24745896 - 24745676
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  24745896 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24745797  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  24745796 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24745698  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745697 tgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25426965 - 25426796
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25426965 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 25426867  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25426866 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27010180 - 27009981
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  27010180 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 27010083  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||  || |||||  ||||| |||||||    
T  27010082 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagtta 27009985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 18777907 - 18778076
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  18777907 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 18778005  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18778006 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19500236 - 19500067
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  19500236 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgc 19500138  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19500137 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19500067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 22366396 - 22366565
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  22366396 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgc 22366494  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22366495 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 29188201 - 29188368
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  29188201 aaggtaagggggttagtgattattataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgc 29188297  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29188298 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 29188368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12542
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 12613  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12612 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 4199900 - 4200069
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  4199900 aaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgc 4199998  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4199999 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 4200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 21073510 - 21073679
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgc 21073608  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  21073609 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 21073679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 43443312 - 43443479
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||    
T  43443312 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt---gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 43443408  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43443409 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950717
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  278 gtctaaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 375  Q
    || |||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |  | |    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctat 32950753  T
Q  376 taactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggt 411  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||    
T  32950752 taactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggt 32950717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34939628 - 34939398
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | || |||    
T  34939628 ctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataactgt 34939529  T
Q  184 tgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 283  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||  ||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaa 34939431  T
Q  284 atgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34939430 atgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 34939398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531163
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18531163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23507222 - 23507132
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23507222 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 23507132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23328605 - 23328558
Alignment:
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328605 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20623323 - 20623262
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  20623323 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20623262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 21233437 - 21233498
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  21233437 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 21233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24616210 - 24616165
Alignment:
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 433  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616210 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24712586 - 24712541
Alignment:
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 433  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712586 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24745604 - 24745559
Alignment:
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 433  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745604 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 25900315 - 25900376
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  25900315 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 25900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37053098 - 37053037
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  37053098 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 37053037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34824816 - 34824475
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34824816 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 34824717  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34824716 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 34824617  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34824616 tgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtga 34824517  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824516 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12728733 - 12728392
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12728733 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 12728634  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12728633 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 12728534  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12728533 tgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtga 12728434  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728433 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 11231256 - 11231594
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11231256 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 11231355  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11231356 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 11231455  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231456 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 11231555  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231556 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16935934 - 16935593
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  16935934 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattca 16935835  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16935834 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16935735  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16935734 tgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtga 16935635  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935634 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17006594 - 17006253
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  17006594 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattca 17006495  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17006494 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 17006395  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17006394 tgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtga 17006295  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006294 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 22513103 - 22513441
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22513103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22513202  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22513203 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22513302  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513303 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 22513402  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513403 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 28775725 - 28776063
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  28775725 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 28775824  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28775825 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 28775924  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775925 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 28776024  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776025 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24685699 - 24686037
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24685699 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 24685798  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24685799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 24685898  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685899 aattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 24685998  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24685999 aattatgatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 96 - 435
Target Start/End: Original strand, 23777961 - 23778301
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23777961 ctaaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 23778060  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23778061 gctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 23778160  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 394  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23778161 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgag 23778260  T
Q  395 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778261 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8944187 - 8943926
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8944187 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 8944088  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8944087 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 8943988  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8943987 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 12635783 - 12636044
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12635783 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcg 12635882  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12635883 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 12635982  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635983 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 42177884 - 42178145
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42177884 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 42177983  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42177984 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 42178083  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178084 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 92 - 355
Target Start/End: Original strand, 12641554 - 12641818
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12641554 tcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaat 12641653  T
Q  192 tggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaag 291  Q
    | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12641654 tcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 12641753  T
Q  292 ttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641754 ttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 3798518 - 3798779
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3798518 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 3798617  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3798618 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 3798717  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798718 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21141895
Alignment:
Q  145 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggt 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggt 21142088  T
Q  244 atgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgag 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||    
T  21142087 atgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgag 21141988  T
Q  343 atgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||  | |||||||||| | ||||  |||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21141987 atgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23774477 - 23774257
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  23774477 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 23774378  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  23774377 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23774279  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774278 tgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Original strand, 5888539 - 5888765
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  5888539 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 5888638  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||| | || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  5888639 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 5888737  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888738 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 19886576 - 19886745
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  19886576 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 19886674  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19886675 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7507940
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgt 183  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          |||| |||| |    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattat 7507855  T
Q  184 tgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 7507940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 25265300 - 25265486
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  25265300 atctaatgtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 25265399  T
Q  182 gttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25265400 gttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 25265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 463078 - 462905
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattg 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| | |||||||||||||||     
T  463078 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattc 462980  T
Q  194 gtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  462979 gtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 462905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 43642963 - 43643053
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43642963 aattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 17396562 - 17396643
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  17396562 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 17396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 14906349 - 14906410
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  14906349 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14906410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23820425 - 23820364
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  23820425 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 23820364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49232774 - 49232436
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232774 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 49232675  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49232674 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 49232575  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232574 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 49232475  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232474 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 1467657 - 1467995
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  1467657 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 1467756  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1467757 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1467856  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467857 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 1467956  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467957 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058739
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25058877 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaacttatgctattgtgagtg 25058778  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058777 aatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 96 - 435
Target Start/End: Original strand, 12902006 - 12902346
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  12902006 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgt 12902105  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902106 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12902205  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 394  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  12902206 gaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattattaactgatactattgtgag 12902305  T
Q  395 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12902306 tgaatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 95 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5228653 - 5228317
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5228653 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcg 5228555  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5228554 tgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagtta 5228455  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5228454 tgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtga 5228355  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgat 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228354 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22275547 - 22275242
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22275547 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22275448  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22275447 tcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 22275348  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22275347 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatg 22275248  T
Q  397 aatcat 402  Q
    ||||||    
T  22275247 aatcat 22275242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 98 - 402
Target Start/End: Original strand, 15468258 - 15468563
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15468258 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgc 15468357  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15468358 tcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 15468457  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  15468458 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatg 15468557  T
Q  397 aatcat 402  Q
    ||||||    
T  15468558 aatcat 15468563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12265049
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12264909  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagt 395  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||    
T  12264910 gattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggt 12265009  T
Q  396 gaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12265010 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18911334 - 18911073
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18911334 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18911235  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18911234 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18911135  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911134 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12812179 - 12811938
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12812179 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 12812080  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12812079 tcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12811980  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 338  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811979 atttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54651803 - 54651531
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54651803 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 54651704  T
Q  190 attggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtta 289  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  54651703 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgtta 54651604  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54651603 agttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 54651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 89 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44229332 - 44228985
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  44229332 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgtt 44229234  T
Q  188 aaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 287  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44229233 aaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 44229134  T
Q  288 taagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgct 386  Q
     ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  | |||||||||| |    
T  44229133 caagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgtt 44229034  T
Q  387 attgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
     ||||  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44229033 gttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 266
Target Start/End: Original strand, 18896962 - 18897130
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18896962 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 18897061  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897062 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 435
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897255
Alignment:
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatactta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatactta 18897238  T
Q  419 attgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897239 attgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 15936551 - 15936723
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    |||||||| |||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15936551 ctaaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 15936650  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15936651 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55316555 - 55316387
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  55316555 aaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 55316458  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55316457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 15938393 - 15938565
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  15938393 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgt 15938492  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  |   |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15938493 gctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15938565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41270411 - 41270243
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41270411 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 41270314  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  41270313 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15615174 - 15615001
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  15615174 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 15615078  T
Q  192 tggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | ||||||||  |||| || ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  15615077 ttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgtt 15615001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16821474 - 16821280
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||    
T  16821474 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgc 16821378  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  16821377 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 413
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986408
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  278 gtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtt 376  Q
    || | ||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |  | ||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatt 11986371  T
Q  377 aactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 413  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11986372 aactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtat 11986408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 353
Target Start/End: Original strand, 17912532 - 17912662
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 320  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||  |||||  |||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  17912532 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaattt 17912629  T
Q  321 gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 353  Q
    |||||||| |  ||||| |||| | ||||||||    
T  17912630 gatatgttgtagttgaattgagctatgattcat 17912662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158114
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 51158114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13839237 - 13839061
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||   || ||| || | |||||  ||||||||||||  | | || ||||| |||||||||||||    
T  13839237 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atgaataattgttgctaaa 13839139  T
Q  191 ttggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    || ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13839138 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 13954799 - 13954880
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13954799 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttga 13954880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 12030153 - 12030243
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12030153 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 12030243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 2449147 - 2449208
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  2449147 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 2449208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006514
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22006376 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgttattgtgagtg 22006475  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22006476 aatcatgatttgggtatacttaattgtggactgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 13662180 - 13662521
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13662180 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcg 13662279  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13662280 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13662379  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13662380 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtga 13662479  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13662480 gtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 271278 - 271616
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  271278 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 271377  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  271378 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 271477  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271478 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 271577  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271578 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 644642 - 644304
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  644642 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 644543  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  644542 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 644443  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644442 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 644343  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644342 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 830377 - 830039
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 830278  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 830178  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 830078  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830077 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 22088712 - 22089050
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22088712 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22088811  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22088812 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22088911  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088912 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 22089011  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089012 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15319077 - 15319415
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15319077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15319176  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15319177 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15319276  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319277 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 15319376  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319377 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15499446 - 15499784
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15499446 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15499545  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15499546 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15499645  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499646 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 15499745  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499746 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 13720843 - 13721104
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13720843 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 13720942  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13720943 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13721042  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721043 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 16872966 - 16873227
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16872966 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 16873065  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16873066 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16873165  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873166 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 90 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16195577 - 16195230
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195577 catcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 16195478  T
Q  190 attggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtta 289  Q
    ||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16195477 attcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 16195378  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgcta 387  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| |     
T  16195377 agttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttg 16195278  T
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||   |||||| |||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195277 ttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24549319 - 24549149
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  24549319 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcg 24549223  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24549222 tgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24549149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 6774175 - 6774342
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  6774175 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 6774271  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6774272 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6774342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844684
Alignment:
Q  100 ggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctc 199  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21844587  T
Q  200 ttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaa 298  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||  ||||| |||||||||||    
T  21844588 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Original strand, 16674305 - 16674476
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  16674305 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcg 16674402  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||  ||||||| ||| || || |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16674403 tgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 21851881 - 21852077
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||    
T  21851881 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 21851978  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||  || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21851979 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatga 21852076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30121060 - 30120890
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30121060 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 30120961  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30120960 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17345917 - 17345690
Alignment:
Q  99 aggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttgc 186  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||||||||    
T  17345917 aggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgc 17345818  T
Q  187 taaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 286  Q
     ||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||  |||||    
T  17345817 gaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaaatg 17345720  T
Q  287 ttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17345719 tgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 17345690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 22907123 - 22907204
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  22907123 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 22907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 16405025 - 16405071
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16405025 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16405071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 24928841 - 24928887
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24928841 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5238441 - 5238380
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  5238441 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 5238380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 24661157 - 24661218
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  24661157 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 24661218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43685900 - 43685839
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  43685900 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 43685839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 153922 - 154263
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  153922 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 154021  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  154022 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 154121  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  154122 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggttattgttaacttatgctattgtgg 154221  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154222 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Original strand, 169830 - 169938
Alignment:
Q  101 gtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  169830 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 169928  T
Q  201 tgatgtgatg 210  Q
    || |||||||    
T  169929 tgctgtgatg 169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36430 - 36264
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  36430 aaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 36332  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat 265  Q
    |||||  |||||| ||| ||  | || ||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  36331 tcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 36264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48936 - 48765
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||||||||| ||    
T  48936 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgt 48838  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48837 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18168970
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  18169108 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaataatgctattgtgagtg 18169009  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18169008 aatcatgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 96 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19020826 - 19020486
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19020826 ctaaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 19020727  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19020726 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19020627  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 394  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19020626 gaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgag 19020527  T
Q  395 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020526 tgaatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 15287160 - 15287501
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |    
T  15287160 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcg 15287259  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15287260 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15287359  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15287360 tgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtga 15287459  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287460 gtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 15294269 - 15294610
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |    
T  15294269 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcg 15294368  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15294369 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagtta 15294468  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15294469 tgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtga 15294568  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294569 gtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 7131980 - 7132241
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7131980 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 7132079  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7132080 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 7132179  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132180 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20001064 - 20000803
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20001064 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 20000965  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20000964 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 20000865  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000864 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 17145572 - 17145913
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  17145572 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcg 17145671  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17145672 tgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttg 17145771  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||      
T  17145772 tgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgg 17145871  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17145872 gtgaattatgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 90 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18248564 - 18248218
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18248564 catcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaa 18248465  T
Q  190 attggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtta 289  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18248464 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 18248365  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctat 388  Q
    || ||||||||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | |    
T  18248364 agatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgt 18248265  T
Q  389 tgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||  |||||| |||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18248264 tgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22738616 - 22738390
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||    
T  22738616 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgtta 22738517  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22738516 aattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 22738417  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738416 aagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  220 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatactta 418  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  |||||| |||  |||||||||| ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  419 attgtggattgatgatg 435  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378365
Alignment:
Q  107 gggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgt 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  207 gatgctattttcttgt 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378380 gatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 301
Target Start/End: Original strand, 22351979 - 22352184
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||      
T  22351979 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattca 22352078  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  22352079 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 22352177  T
Q  295 tgaaatt 301  Q
    |||||||    
T  22352178 tgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26339360 - 26339140
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  26339360 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 26339261  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||     
T  26339260 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttg 26339162  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339161 tgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10644554 - 10644360
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||    
T  10644554 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 10644458  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10644457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47357992 - 47357822
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  47357992 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcg 47357896  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||| ||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  47357895 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 47357822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Original strand, 40885604 - 40885698
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40885604 tgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9795566 - 9795490
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 173  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795566 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8378533 - 8378482
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaattttt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8378533 acatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatcatgtacaattttt 8378482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675185
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15675185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 54118250 - 54118340
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54118250 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 54118340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 122146 - 122056
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  122146 aattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 122056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 10104300 - 10104346
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10104300 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10104346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31115842 - 31115796
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31115842 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 31115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Original strand, 13048271 - 13048365
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||  ||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  13048271 tgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13048365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 16609008 - 16609069
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  16609008 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26680554 - 26680493
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  26680554 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 26680493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 16376291 - 16376629
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16376291 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16376390  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16376391 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16376490  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376491 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 16376590  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376591 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 16383615 - 16383953
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16383615 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16383714  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16383715 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16383814  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383815 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 16383914  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383915 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 22225656 - 22225994
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22225656 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22225755  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22225756 tctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22225855  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225856 aattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 22225955  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225956 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10489037 - 10488699
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  10489037 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 10488938  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10488937 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10488838  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488837 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 10488738  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488737 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 16556057 - 16556395
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16556057 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16556156  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16556157 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16556256  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556257 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 16556356  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556357 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 16632613 - 16632951
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16632613 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16632712  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16632713 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16632812  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632813 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 16632912  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632913 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1556346 - 1556005
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1556346 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1556247  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1556246 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1556147  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  1556146 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtga 1556047  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556046 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19610359 - 19610018
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19610359 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 19610260  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19610259 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 19610160  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  19610159 taaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtga 19610060  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610059 gtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16232233 - 16231972
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232233 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 16232134  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16232133 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16232034  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232033 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 18086738 - 18086999
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18086738 tctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18086837  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18086838 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18086937  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086938 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23978110 - 23977849
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23978110 tctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 23978011  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23978010 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 23977911  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977910 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 13620710 - 13620970
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    |||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13620710 ctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 13620809  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13620810 gctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 13620909  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620910 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19299575 - 19299375
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  19299575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19299476  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19299475 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19299376  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  19299375 a 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 262
Target Start/End: Original strand, 22251484 - 22251648
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22251484 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22251583  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatta 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22251584 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29666189 - 29665942
Alignment:
Q  121 cataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttct 219  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  29666189 cataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttct 29666090  T
Q  220 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 318  Q
    | || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||      
T  29666089 tatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaatt 29665990  T
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 366  Q
    ||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  29665989 ttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 29869691 - 29869911
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  29869691 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 29869790  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||     
T  29869791 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttg 29869889  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869890 tgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 435
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  348 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Original strand, 1650016 - 1650189
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  1650016 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 1650112  T
Q  192 tggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | ||||||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1650113 tcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25175901 - 25175731
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||    
T  25175901 aaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataatttt-gcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 25175803  T
Q  197 ctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||| |||| || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25175802 ctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825803
Alignment:
Q  109 gttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtga 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 16825776  T
Q  209 tgctattttcttgtgcatgaattgatg 235  Q
    || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  16825777 tgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 27653898 - 27654067
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  27653898 aaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgc 27653996  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| |||  |  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27653997 tcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 27654067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  278 gtctaaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||  ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740860
Alignment:
Q  253 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattc 351  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| || ||  |  ||||| |||||| ||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  352 atattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 413  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||| |||||| | ||||   ||||||||| |||||||||    
T  27740921 atgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtat 27740860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15862823 - 15862592
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattg 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||||    
T  15862823 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattg 15862724  T
Q  183 ttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtcta 282  Q
    || ||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || ||||| ||    
T  15862723 ttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtata 15862626  T
Q  283 aatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15862625 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 15862592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Original strand, 1657659 - 1657890
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattg 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | |||||    
T  1657659 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattg 1657758  T
Q  183 ttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtcta 282  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||  |    
T  1657759 ttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaa 1657856  T
Q  283 aatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1657857 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 1657890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 35009349 - 35009535
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  35009349 atctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaagaaatggataatt 35009448  T
Q  182 gttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35009449 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 35009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27751777 - 27751698
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt-tgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27751777 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgtgtatgaatatgggttga 27751698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23153660 - 23153614
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23153660 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 23153614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 18059676 - 18060014
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18059676 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 18059775  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18059776 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18059875  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18059876 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctattgtaagtg 18059975  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059976 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17004976 - 17004638
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  17004976 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 17004877  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17004876 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17004777  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004776 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 17004677  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004676 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 38055009 - 38055347
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  38055009 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38055108  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    | ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38055109 ttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38055208  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055209 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 38055308  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055309 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 95 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 46523729 - 46523394
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46523729 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 46523631  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46523630 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 46523531  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  46523530 tgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtga 46523431  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattga 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46523430 gtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 105 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17148898 - 17148647
Alignment:
Q  105 gggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgat 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  17148898 gggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgtt 17148799  T
Q  205 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatg 304  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17148798 gtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattata 17148699  T
Q  305 cttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148698 cttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 19962417 - 19962617
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  19962417 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19962516  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19962517 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19962616  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  19962617 a 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227947
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22227949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232644
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22232646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22035788 - 22035568
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  22035788 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 22035689  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  22035688 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 22035590  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035589 tgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 7640849 - 7641069
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  7640849 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 7640948  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  7640949 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 7641047  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641048 tgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 5072304 - 5072472
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5072304 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 5072401  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5072402 tcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2116595 - 2116422
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2116595 tcatttaaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 2116499  T
Q  192 tggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | ||||| ||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2116498 tcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 2116422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45051763 - 45051590
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  45051763 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt---gattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 45051667  T
Q  192 tggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | ||| ||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45051666 tcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 45051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Original strand, 18601068 - 18601202
Alignment:
Q  134 aatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18601068 aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 18601167  T
Q  234 tgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    || |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18601168 tgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20445936 - 20445846
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20445936 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20531701 - 20531611
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20531701 aattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20531611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913197
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 20913197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931512
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 20931512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 37844500 - 37844546
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37844500 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31647 - 31309
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 31548  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31547 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 31448  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31447 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 31348  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31347 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 147 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39646
Alignment:
Q  147 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  247 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  346 tgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735 ttattcatatttcattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39441 - 39103
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  39441 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 39342  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39341 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39242  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 39142  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39141 aattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 43137
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtg 196  Q
    ||||||||||||||||| | || || || |||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||| |||    
T  43333 aaggtaagggggttagttactatcacaaacatgt---aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtg 43237  T
Q  197 ctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatg 296  Q
    |||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  43236 ctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 43139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Original strand, 1490 - 1831
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1490 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcg 1589  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1590 tgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1689  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaa 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  1690 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgttattgttaactgatgctattgtga 1789  T
Q  394 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1790 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 95 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2734 - 2392
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaa-tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2734 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattc 2635  T
Q  194 gtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtt 293  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2634 gtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtc 2535  T
Q  294 atgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgta 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  2534 atgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtg 2435  T
Q  393 agtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2434 agtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 90 - 435
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10595
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10249 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 10348  T
Q  190 attggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtta 289  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10349 attcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgcta 10448  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctat 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10449 agttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttgttgttaactgatgctat 10548  T
Q  389 tgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10549 tgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29500 - 29162
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29500 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 29401  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29400 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  29300 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaatttatgttattgttagtg 29201  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29200 aattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 92 - 435
Target Start/End: Original strand, 34070 - 34414
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34070 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaa 34168  T
Q  191 ttggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaa 290  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34169 ttcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaa 34268  T
Q  291 gttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctatt 389  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  34269 gttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttgctattaactgatgctatt 34368  T
Q  390 gtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34369 gtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 1429 - 1690
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1429 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1528  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1529 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1628  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1629 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 185 - 435
Target Start/End: Original strand, 1 - 252
Alignment:
Q  185 gctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaa 284  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  285 tgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgat 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  101 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgat 200  T
Q  384 gctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 gctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 7374 - 7712
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  7374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgc 7473  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  7474 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 7573  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtg 396  Q
    |||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  || || |||||||||| | |||| ||||    
T  7574 aattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgttattaactgatgttgttgtgagtg 7673  T
Q  397 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7674 aattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54759 - 54416
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 192  Q
    ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54759 atctaaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaatt 54660  T
Q  193 ggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagt 292  Q
     |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54659 cgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagt 54560  T
Q  293 tatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgt 391  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||    
T  54559 tatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 54460  T
Q  392 aagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
      ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  54459 gggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45373 - 45081
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaatt 45274  T
Q  193 ggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagt 292  Q
     |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45273 cgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagt 45174  T
Q  293 tatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatg 384  Q
    | ||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||||    
T  45173 tttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatg 45081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4068 - 3890
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4068 catcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaa 3969  T
Q  190 attggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3968 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54221 - 54008
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54221 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgcta 54122  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  54121 aattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgtt 54023  T
Q  289 aagttatgaaattat 303  Q
    ||||| |||||||||    
T  54022 aagttgtgaaattat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 5130 - 5329
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  5130 aaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgc 5229  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  5230 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3715 - 3434
Alignment:
Q  134 aatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3715 aatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattga 3616  T
Q  234 tgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaattgatatgttttgat 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |  ||||| |||| ||   |||| ||| |    
T  3615 tgattatggtatgattgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatacccaattggtgaatttttgatgtgttgtt 3517  T
Q  334 -tgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatg-ctattgtaagtgaatcatgatttgggtatac 415  Q
      ||||| |||||||||||||  | | || |||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  3516 gagaaataagatgtgattcatgct-ctttgatgttgttgttgttaactgatgattattgtgagtgaaccatgacttgggtatac 3434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6938 - 6718
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  6938 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 6839  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  6838 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 6740  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  6739 tgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6645 - 6598
Alignment:
Q  388 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 435  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6645 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3302 - 3130
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3302 tctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcg 3204  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3203 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 210
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10778
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10666 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10765  T
Q  198 tcttgatgtgatg 210  Q
    ||||| |||||||    
T  10766 tcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 21031 - 21228
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21031 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 21129  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | | ||| |||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  21130 tcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 21227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 13977 - 14145
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  13977 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgc 14074  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| |   | |||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||    
T  14075 tcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgtt 14145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7556 - 7330
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  7556 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 7457  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtt 288  Q
    |||| ||||||||| | || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  7456 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 7358  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7357 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 108086 - 107914
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  108086 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 107987  T
Q  196 gctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  107986 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 107914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Original strand, 64436 - 64640
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  64436 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 64533  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatga-----attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgtta 289  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||     ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||  ||||| ||    
T  64534 tgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgata 64631  T
Q  290 agttatgaa 298  Q
    |||||||||    
T  64632 agttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13409
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  13242 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgta--attttt-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 13338  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13339 tcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9433
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  9257 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 9353  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9354 aattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16331
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  16155 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 16251  T
Q  189 aattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16252 aattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1388
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  1220 aaggtaggggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 1317  T
Q  198 tcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1318 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 23664 - 23884
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |    
T  23664 tctaagttaagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcg 23763  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagtta 294  Q
    |||||| | | || || | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  23764 tgctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23862  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23863 tgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 202
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattgg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  372 tctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgtaa---ttttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 277  T
Q  195 tgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  276 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 413
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56341
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  278 gtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtt 376  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |  | ||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatt 56304  T
Q  377 aactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 413  Q
    || ||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  56305 aattgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtat 56341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 31593 - 31756
Alignment:
Q  101 gtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattggtgctct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31593 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 31691  T
Q  201 tgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat 265  Q
    ||  |||||| ||| ||    |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  31692 tgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12149
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12036 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgtt 12134  T
Q  188 aaattggtgctcttg 202  Q
    ||||| |||||||||    
T  12135 aaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 13266 - 13342
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 173  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13266 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3324
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||  ||  | |||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  278 gtctaaatgttaagttatgaaatt 301  Q
    || ||||| | |||||||||||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 34372 - 34556
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattgt 183  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | |||| |    
T  34372 ctaaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattat 34471  T
Q  184 tgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13859 - 13673
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  13859 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 13760  T
Q  182 gttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13759 gttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41998 - 41815
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgtt 184  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||||| |||||||||          || | |||||||    
T  41998 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgtt 41899  T
Q  185 gctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | |||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41898 gttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3678
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 962 - 1052
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 9016
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 123170 - 123260
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  123170 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 123260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5695
Alignment:
Q  172 atgaacaattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19373
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 19373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21457
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 21457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8272
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattaca 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  8186 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattaca 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48400 - 48354
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48400 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 51188 - 51278
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattggtgctcttgatgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  51188 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 51278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22894 - 22833
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  22894 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 22833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1552
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  1491 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2910 times since January 2019
Visitors: 4018