View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0648_high_12 (Length: 277)

Name: NF0648_high_12
Description: NF0648
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0648_high_12
NF0648_high_12
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-254)||(26812445-26812698)
chr4 (1-254)||(26821912-26822165)
chr4 (1-254)||(3242285-3242538)
chr4 (1-254)||(37059023-37059276)
chr4 (1-254)||(54689911-54690164)
chr4 (1-254)||(54699342-54699595)
chr4 (1-254)||(3918003-3918256)
chr4 (1-253)||(15842897-15843149)
chr4 (5-254)||(20884447-20884694)
chr4 (5-254)||(50516496-50516742)
chr4 (5-254)||(11482257-11482504)
chr4 (67-237)||(23622919-23623088)
chr4 (66-254)||(18125410-18125595)
chr4 (64-127)||(41902641-41902703)
chr4 (67-144)||(16489947-16490025)
chr4 (196-254)||(28256097-28256155)
chr4 (175-239)||(112634-112698)
chr4 (175-239)||(14917028-14917092)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-254)||(23895614-23895867)
chr6 (1-254)||(18420488-18420741)
chr6 (5-254)||(22066235-22066482)
chr6 (5-250)||(23884434-23884677)
chr6 (66-254)||(14102308-14102497)
chr6 (5-254)||(17512221-17512467)
chr6 (86-252)||(10259779-10259945)
chr6 (92-252)||(11421451-11421611)
chr6 (112-254)||(12173469-12173610)
chr6 (66-229)||(23110242-23110405)
chr6 (67-193)||(12415064-12415190)
chr6 (71-165)||(13218359-13218453)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-252)||(30454201-30454452)
chr5 (1-252)||(30459259-30459510)
chr5 (1-252)||(30444829-30445080)
chr5 (1-254)||(24422214-24422467)
chr5 (1-254)||(18568975-18569229)
chr5 (1-254)||(24412765-24413018)
chr5 (1-254)||(22489122-22489375)
chr5 (1-253)||(4635882-4636134)
chr5 (5-254)||(13815371-13815617)
chr5 (5-245)||(24244050-24244287)
chr5 (5-245)||(24290674-24290911)
chr5 (5-254)||(42732575-42732818)
chr5 (5-254)||(33955498-33955745)
chr5 (5-254)||(11223318-11223564)
chr5 (5-254)||(20035941-20036188)
chr5 (67-237)||(5600580-5600749)
chr5 (67-237)||(5610226-5610395)
chr5 (64-220)||(22118134-22118291)
chr5 (5-248)||(20834373-20834614)
chr5 (67-237)||(31150651-31150820)
chr5 (87-254)||(26652642-26652808)
chr5 (87-254)||(26924227-26924393)
chr5 (171-252)||(22448330-22448411)
chr5 (171-254)||(37514857-37514940)
chr5 (196-252)||(22457666-22457722)
chr5 (182-237)||(16111002-16111058)
chr5 (175-239)||(718954-719018)
chr5 (175-239)||(727934-727998)
chr5 (175-239)||(6331671-6331735)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (1-254)||(28367651-28367904)
chr3 (1-254)||(28375469-28375722)
chr3 (1-254)||(28383291-28383544)
chr3 (1-254)||(24794544-24794797)
chr3 (1-254)||(28351718-28351971)
chr3 (1-253)||(38529176-38529428)
chr3 (7-254)||(4951537-4951783)
chr3 (5-249)||(5385632-5385874)
chr3 (5-254)||(46305572-46305818)
chr3 (64-252)||(13328278-13328465)
chr3 (5-254)||(23486983-23487232)
chr3 (67-237)||(17529877-17530046)
chr3 (67-237)||(54624655-54624824)
chr3 (67-237)||(48978670-48978835)
chr3 (67-237)||(48988210-48988375)
chr3 (67-237)||(32877870-32878039)
chr3 (66-254)||(7783987-7784194)
chr3 (66-254)||(4361514-4361699)
chr3 (171-237)||(19388870-19388936)
chr3 (171-215)||(24285493-24285537)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-254)||(30821-31074)
scaffold0040 (5-253)||(9986-10230)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-254)||(94429-94682)
scaffold0028 (1-254)||(103870-104123)
scaffold0028 (175-239)||(82272-82336)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-254)||(408265-408518)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-254)||(7592943-7593196)
chr7 (1-254)||(15174477-15174730)
chr7 (5-254)||(14634776-14635023)
chr7 (5-245)||(11634337-11634574)
chr7 (5-254)||(14644476-14644723)
chr7 (5-254)||(33292175-33292422)
chr7 (9-254)||(15947371-15947614)
chr7 (5-254)||(9736888-9737135)
chr7 (5-254)||(32817939-32818185)
chr7 (66-252)||(19352589-19352775)
chr7 (101-252)||(13874423-13874572)
chr7 (138-254)||(48710005-48710121)
chr7 (70-237)||(4306573-4306739)
chr7 (5-133)||(48711400-48711526)
chr7 (175-239)||(607218-607282)
chr7 (175-239)||(616313-616377)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-254)||(3470-3723)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-254)||(7789076-7789329)
chr8 (1-254)||(20714006-20714259)
chr8 (5-254)||(18143427-18143673)
chr8 (5-249)||(18883163-18883404)
chr8 (5-252)||(25051063-25051307)
chr8 (5-245)||(18232870-18233107)
chr8 (5-245)||(18242321-18242558)
chr8 (5-252)||(25037026-25037270)
chr8 (5-254)||(42712176-42712423)
chr8 (5-245)||(18251772-18252009)
chr8 (5-252)||(31575411-31575652)
chr8 (5-254)||(20044760-20045007)
chr8 (5-254)||(4843720-4843968)
chr8 (5-254)||(12925296-12925543)
chr8 (5-254)||(20030121-20030368)
chr8 (5-254)||(12767573-12767822)
chr8 (101-252)||(33592134-33592284)
chr8 (101-252)||(33601773-33601923)
chr8 (105-254)||(12915500-12915648)
chr8 (65-250)||(24096077-24096262)
chr8 (64-251)||(15833950-15834137)
chr8 (105-242)||(24634009-24634145)
chr8 (187-254)||(20714417-20714484)
chr8 (101-227)||(42896174-42896299)
chr8 (191-249)||(26194048-26194106)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-254)||(31710464-31710717)
chr2 (1-254)||(24022740-24022993)
chr2 (5-254)||(14273146-14273394)
chr2 (5-254)||(35877458-35877705)
chr2 (5-254)||(35884947-35885194)
chr2 (5-254)||(36724660-36724907)
chr2 (5-250)||(3396865-3397108)
chr2 (67-237)||(1800493-1800662)
chr2 (67-237)||(22632402-22632571)
chr2 (67-237)||(1790999-1791164)
chr2 (86-254)||(18578707-18578875)
chr2 (171-240)||(16446670-16446739)
chr2 (182-254)||(29911278-29911350)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (64-254)||(5378422-5378613)
chr1 (16-252)||(15809976-15810217)
chr1 (64-254)||(14272016-14272205)
chr1 (64-253)||(40999034-40999224)
chr1 (64-248)||(14281888-14282071)
chr1 (67-254)||(26906244-26906431)
chr1 (5-254)||(21633524-21633769)
chr1 (64-240)||(3470949-3471124)
chr1 (101-252)||(21919431-21919581)
chr1 (64-251)||(30676788-30676976)
chr1 (108-249)||(28310018-28310155)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (5-249)||(256901-257142)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (5-254)||(2051-2298)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (64-254)||(124047-124236)
scaffold0021 (86-237)||(100002-100152)
scaffold0021 (5-132)||(143111-143237)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (67-237)||(14830-14999)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (67-237)||(24593-24762)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (101-252)||(12548-12698)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (101-254)||(2259-2411)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (1-64)||(26309-26372)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (64-227)||(27078-27246)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (175-239)||(49501-49565)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26812445 - 26812698
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812445 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 26812544  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812545 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 26812644  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812645 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 26812698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26821912 - 26822165
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821912 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 26822011  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822012 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 26822111  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822112 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 26822165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3242538 - 3242285
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242538 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 3242439  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242438 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 3242339  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242338 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 3242285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37059023 - 37059276
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059023 ctcaaagtctattgagcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 37059122  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059123 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 37059222  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059223 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 37059276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54690164 - 54689911
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690164 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 54690065  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690064 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 54689965  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54689964 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 54689911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54699595 - 54699342
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699595 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 54699496  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699495 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 54699396  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699395 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 54699342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 3918003 - 3918256
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918003 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagaaagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 3918102  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918103 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 3918202  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918203 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 3918256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15843149 - 15842897
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15843149 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgcttaggttgataatac 15843050  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843049 aggtgtaacagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 15842950  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15842949 gggactggaagtagccgagtttggtgaaccaagataactctcctgtgttattc 15842897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20884694 - 20884447
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20884694 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20884598  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20884597 tggttacggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20884501  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884500 gggactggaagtagccgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattct 20884447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50516742 - 50516496
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  || |  |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  50516742 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaag--caaagaattgtaacagcctgctgaggttgataatacaag 50516646  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50516645 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttct---accaacggaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 50516549  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50516548 ggactggaagtagtcgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattct 50516496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 11482257 - 11482504
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11482257 aagtctattcggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagccggctgaggttgataatacag 11482353  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11482354 gggttacggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 11482450  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11482451 gggactagaagtagccgggtttggacaaccaggataactctcctacgttattct 11482504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 23622919 - 23623088
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  23622919 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 23623017  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  23623018 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 23623088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18125595 - 18125410
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  18125595 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 18125499  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18125498 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgtcattct 18125410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41902703 - 41902641
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgat 127  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  41902703 gcaaagaattgtataagcatgttgaagttgataataga-gtgtaactgactgatctggtgtgat 41902641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16490025 - 16489947
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgct 144  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  16490025 aagaatcgtagaagtctgctgaggttgataatactgagtgtaacagactgatatggtgtgatcaacaaattatagtgct 16489947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28256155 - 28256097
Alignment:
Q  196 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28256155 gtgtggggactgaaagtagccaactttgatgaaccacgataaatctcctgtgttattct 28256097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 112634 - 112698
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  112634 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 112698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 14917028 - 14917092
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14917028 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 14917092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23895867 - 23895614
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895867 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 23895768  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895767 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 23895668  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895667 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 23895614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18420488 - 18420741
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420488 ctcaaagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaattccaacctttcttttgctattgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 18420587  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18420588 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtgtataatctcacacgaggtgtc 18420687  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18420688 gggactggaagtagccgggttttgtgaaccaggataactatcctgtgttattct 18420741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 22066235 - 22066482
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22066235 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 22066331  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22066332 tggttacggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 22066428  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066429 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 22066482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 23884434 - 23884677
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23884434 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 23884530  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23884531 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggacaatctcacacgaagtgtg 23884627  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23884628 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 23884677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Original strand, 14102308 - 14102497
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14102308 aaagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacaggctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattcttcagtgttattct 14102497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17512467 - 17512221
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  |||  ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17512467 aagtctattgggcttaatagtttt-agataggaaaagttccaacctttctcgtgc--gtaaacaaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatacag 17512371  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17512370 g-gttacagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtg 17512275  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17512274 gggactgaaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttctgtgttattct 17512221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10259945 - 10259779
Alignment:
Q  86 tgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 184  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||    
T  10259945 tgaggtttataatacagggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagcaggata-ctatagtggagaa 10259847  T
Q  185 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10259846 tcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaaccagaataattctcctgtgttatt 10259779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11421611 - 11421451
Alignment:
Q  92 tgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcac 190  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  11421611 tgataatacatggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgata-ctatagtggataatctcac 11421513  T
Q  191 acgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | || |||||||||    
T  11421512 acgaggtgtggggactggaagtagccggatttgatgaactaggataattatcttgtgttatt 11421451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 12173469 - 12173610
Alignment:
Q  112 actgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  12173469 actgatctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgata-ctatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaag 12173567  T
Q  212 tagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  12173568 tagccgagtttggtgaactatgataaatctcaggtgttattct 12173610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23110405 - 23110242
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  || ||| |  |||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23110405 aaagaattttagaagcctgttgatgttgataatattgggtgtaatagacttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagc 23110306  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 229  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23110305 c-gaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaagtagctggttttcgtgaac 23110242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Original strand, 12415064 - 12415190
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||       
T  12415064 aagaatcgtagaagcctgctatggttaataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgata-ag 12415162  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacg 193  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||    
T  12415163 aggatactataatggataatctcacacg 12415190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Original strand, 13218359 - 13218453
Alignment:
Q  71 attgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||   || || |||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13218359 attgtataagcttgttgaggttgataatatagtgattccgaactggtctggtgtgatcaataccttatagttctagtcaaaagtttctgttagca 13218453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30454452 - 30454201
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454452 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 30454353  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454352 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 30454253  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454252 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 30454201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30459510 - 30459259
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30459510 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgccgaggttgataatac 30459411  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459410 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 30459311  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459310 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 30459259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30445080 - 30444829
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445080 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 30444981  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30444980 aggtgttatggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 30444881  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30444880 gggactggaagtagccgggtttggtgaatcaggataactctcctgtgttatt 30444829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24422214 - 24422467
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422214 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 24422313  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422314 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 24422413  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422414 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 24422467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18568975 - 18569229
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagtttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568975 ctcaaagtctattgggcttaatagtttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataata 18569074  T
Q  100 caggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569075 cagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 18569174  T
Q  200 ggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569175 ggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 18569229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24412765 - 24413018
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412765 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 24412864  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412865 agaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 24412964  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412965 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 24413018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22489122 - 22489375
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22489122 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatac 22489221  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489222 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 22489321  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489322 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 22489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4635882 - 4636134
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4635882 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataaaac 4635981  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4635982 aggtgtaacggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtgctggtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacgtgaggtgtg 4636081  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4636082 gggactgaaaatagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattc 4636134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815371
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  13815617 aagtttattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataatacaag 13815521  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13815520 ggttacagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgg 13815424  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815423 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 13815371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24244287 - 24244050
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  24244287 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24244191  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244190 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24244092  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24244091 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24244050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24290911 - 24290674
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  24290911 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24290815  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24290814 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24290716  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24290715 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24290674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42732818 - 42732575
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42732818 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagtttcaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcctgttgaggttgataatacagg 42732725  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42732724 ggttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 42732626  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42732625 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 42732575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33955745 - 33955498
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33955745 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33955649  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33955648 tggttacgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33955552  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955551 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33955498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 11223318 - 11223564
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11223318 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 11223414  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa-gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | ||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11223415 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accactgtatactataatggataatctcacacgaagtgtgg 11223511  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11223512 ggactggaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttttgtgttattct 11223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 20035941 - 20036188
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||| || ||| |  |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  20035941 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaaccttttttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatatag 20036037  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20036038 tggttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacatgatgtgtg 20036134  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20036135 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 20036188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 5600580 - 5600749
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5600580 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5600678  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5600679 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5600749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 5610226 - 5610395
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5610226 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5610324  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5610325 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5610395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22118291 - 22118134
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 162  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  22118291 gcaaataattgtagaagcatgctgatgttgataatacaggatgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgtta 22118192  T
Q  163 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggt 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22118191 gcaagacaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagtcgggt 22118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 20834373 - 20834614
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20834373 aagtctattgggcttaatagttt-gacataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattggagaagcctgctgaggttgattatacag 20834469  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20834470 tggttacgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacggagtgtg 20834566  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20834567 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 20834614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31150820 - 31150651
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  31150820 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 31150722  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  31150721 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 31150651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Original strand, 26652642 - 26652808
Alignment:
Q  87 gaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 186  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26652642 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26652740  T
Q  187 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26652741 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattct 26652808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Original strand, 26924227 - 26924393
Alignment:
Q  87 gaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 186  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26924227 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26924325  T
Q  187 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924326 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattct 26924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22448411 - 22448330
Alignment:
Q  171 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22448411 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 22448330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37514940 - 37514857
Alignment:
Q  171 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  37514940 actatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaaccagtataaatctcatgtgttattct 37514857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22457722 - 22457666
Alignment:
Q  196 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22457722 gtgtggggactggaagtagccggattgggtgaacaaggataactcttctgtgttatt 22457666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Original strand, 16111002 - 16111058
Alignment:
Q  182 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataa 237  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16111002 taatctcacacgaagtgtcgggactggaagtagccggcttttggtgaaccatgataa 16111058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 719018 - 718954
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  719018 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 718954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 727998 - 727934
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  727998 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 727934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6331735 - 6331671
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  6331735 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 6331671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28367904 - 28367651
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367904 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 28367805  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367804 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 28367705  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367704 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 28367651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28375722 - 28375469
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375722 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 28375623  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375622 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 28375523  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375522 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 28375469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28383544 - 28383291
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383544 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 28383445  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383444 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 28383345  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383344 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 28383291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24794797 - 24794544
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794797 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 24794698  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794697 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 24794598  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794597 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 24794544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28351971 - 28351718
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28351971 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctaaggttgataatac 28351872  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28351871 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 28351772  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28351771 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattct 28351718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38529428 - 38529176
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38529428 ctcaaagtctattgggcttaatcgttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctactgaggttgataatac 38529329  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | |||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38529328 aagtgtaacagactcatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 38529229  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  38529228 ggcactggaagtagccgggtttggtgaactatgataactctcctgtattattc 38529176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 4951537 - 4951783
Alignment:
Q  7 gtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgt 106  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4951537 gtctatttggcttaatagttt-gagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgtaaagaattgtagaaggctgttgaggttgataatacaggtgt 4951635  T
Q  107 tacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggact 206  Q
     || |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4951636 aacagactgatctggtgtgaccaataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctcacacgaggtgtgaggact 4951735  T
Q  207 ggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
     ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4951736 tgaagtagtcgagtttggtgaaccaagataactctcatgtgttattct 4951783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 5385632 - 5385874
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5385632 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgatgatacag 5385728  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 202  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5385729 tggttacatactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcagct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 5385827  T
Q  203 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5385828 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 5385874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46305818 - 46305572
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46305818 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 46305722  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  46305721 tggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactaaagtggataatctca-acgaagtgtg 46305626  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46305625 gggactggaagtagccgggtttgatgaaccaagataactctcctgtgttattct 46305572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13328465 - 13328278
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 163  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||||||||||   |     
T  13328465 gcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaagggttacggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttct---ac 13328369  T
Q  164 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13328368 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaaccaagataactctcctgtgttatt 13328278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 23486983 - 23487232
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23486983 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaagctttcttgtgcaaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaa 23487079  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23487080 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 23487176  T
Q  201 gggactg--gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487177 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 23487232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17530046 - 17529877
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  17530046 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 17529948  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  17529947 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 17529877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 54624655 - 54624824
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54624655 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 54624754  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  54624755 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 54624824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 48978670 - 48978835
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48978670 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48978764  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48978765 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48978835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 48988210 - 48988375
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48988210 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48988304  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48988305 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48988375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 32877870 - 32878039
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| || |||||    
T  32877870 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcagaagtttatgatagca 32877969  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  32877970 tgata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 32878039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7784194 - 7783987
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7784194 aaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctgttagc 7784095  T
Q  165 ------------------aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgt 246  Q
                      |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  7784094 aagacagtttctgttagcaagacaactgtagtggataatctcacatgtggtgtgggaactggaagtagtcaggtttggtgaaccagaacagttctcctgt 7783995  T
Q  247 gttattct 254  Q
    ||||||||    
T  7783994 gttattct 7783987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4361699 - 4361514
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  4361699 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 4361603  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4361602 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgtcattct 4361514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 237
Target Start/End: Original strand, 19388870 - 19388936
Alignment:
Q  171 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19388870 actatagtcgataatctcacacgaagtgtggggacttgaagtagccgattttggtgaaccaggataa 19388936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 24285493 - 24285537
Alignment:
Q  171 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24285493 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggagtggaagtagc 24285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31074 - 30821
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31074 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 30975  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30974 aggtgttactgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtgttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 30875  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30874 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 30821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Original strand, 9986 - 10230
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggt 104  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9986 aagtctattatgcttaatagttt-gagatagaaaattctaacatttatttttctagtg--caaagaattgtagaagcctattgaggttgataatacaggt 10082  T
Q  105 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 204  Q
    || || |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10083 gtaacagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacggggtgtgggga 10182  T
Q  205 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10183 ctggaa-tagccgtgtttggtgaaccaagataactctcatgtgttattc 10230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 94682 - 94429
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94682 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 94583  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94582 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 94483  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94482 gggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgttattct 94429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 104123 - 103870
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104123 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 104024  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104023 agaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 103924  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103923 gggactggaattagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 103870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 82272 - 82336
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  82272 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 82336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 408265 - 408518
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  408265 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgaagaggttgataatac 408364  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408365 aggtgttacggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 408464  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408465 gggactggaagtagacgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 408518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 7592943 - 7593196
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7592943 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatac 7593042  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7593043 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatggataatctcacacgaggtgtg 7593142  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7593143 gggactggaagtagccaggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 7593196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15174477 - 15174730
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15174477 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataagcctgctgaggttgataatac 15174576  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174577 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 15174676  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15174677 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataaatctcctgtgttattct 15174730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14635023 - 14634776
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14635023 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14634927  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 202  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14634926 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagct-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14634828  T
Q  203 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634827 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11634574 - 11634337
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  11634574 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 11634478  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11634477 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 11634379  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11634378 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 11634337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14644723 - 14644476
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14644723 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14644627  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14644626 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 14644530  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14644529 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14644476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33292422 - 33292175
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33292422 aagtctattgggctcaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33292326  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33292325 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33292229  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292228 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33292175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15947614 - 15947371
Alignment:
Q  9 ctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15947614 ctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggt 15947518  T
Q  107 tacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15947517 tacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggtga 15947421  T
Q  205 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947420 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 15947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 9736888 - 9737135
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9736888 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 9736984  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 202  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||   || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9736985 gggctacagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaact-gaatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 9737083  T
Q  203 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737084 gactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgttattct 9737135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 32817939 - 32818185
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| ||| |     |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32817939 aagtctattgggcttaatagttta-agataggaaagttcgaacctttcttgtgcgaaaa--caaaaaattgtagaagcctgcggaggttgataatacagg 32818035  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32818036 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 32818132  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32818133 ggaccggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 32818185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19352775 - 19352589
Alignment:
Q  66 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||  || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19352775 aaagaagtgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaacggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagc 19352676  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19352675 aggaga-ctatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaaccagtataactctcctgtattatt 19352589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 13874423 - 13874572
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13874423 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtg 13874519  T
Q  199 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13874520 tggggactggaagtag-cggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 13874572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48710121 - 48710005
Alignment:
Q  138 tagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg-actggaagtagccgggtttggtgaaccaggata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  48710121 tagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtgaaccagaata 48710023  T
Q  237 actctcctgtgttattct 254  Q
     |||||||||||||||||    
T  48710022 tctctcctgtgttattct 48710005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4306739 - 4306573
Alignment:
Q  70 aattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaag 167  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| ||| ||||||||| |||   |    
T  4306739 aattgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaacat--agtgctattcataagtttctgatagttgg 4306642  T
Q  168 aaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    | | ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  4306641 ata-ctatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaactaggataa 4306573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48711526 - 48711400
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||  |  |  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |    
T  48711526 aagtctattgtgcttaatagttt-gagatagaaaagttttaacctttcttgtgtgaaag--caaagaattatagaagcctgttgaggttgataatacatg 48711430  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagat 133  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48711429 tgttccgaactgatatggtgtgatcaagat 48711400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 607218 - 607282
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  607218 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 607282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 616313 - 616377
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  616313 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 616377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3723
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3470 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 3569  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3570 agaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 3669  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3670 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattct 3723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7789329 - 7789076
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789329 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 7789230  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789229 agaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 7789130  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7789129 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattct 7789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 20714006 - 20714259
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20714006 ctcaaagtatattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatac 20714105  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20714106 aggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactataatggataatgtcacacgaggtgtg 20714205  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714206 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20714259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18143673 - 18143427
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  18143673 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctactgaggttgataatacaag 18143577  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||   ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18143576 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagttt---ttaccaactgaatgctatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18143480  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143479 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaagataactctcctgtgttattct 18143427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18883404 - 18883163
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  18883404 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 18883308  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18883307 gggtacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18883211  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18883210 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 18883163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051063
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25051307 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25051211  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25051210 ggttacagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25051114  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25051113 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25051063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 18232870 - 18233107
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  18232870 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18232966  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232967 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18233065  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18233066 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18233107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 18242321 - 18242558
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  18242321 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18242417  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242418 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18242516  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18242517 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18242558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037026
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25037270 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25037174  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037173 ggttacagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25037077  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25037076 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42712423 - 42712176
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42712423 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 42712327  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42712326 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 42712230  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42712229 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 42712176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 18251772 - 18252009
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  18251772 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18251868  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251869 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18251967  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18251968 actggaagtagccggatttggtgaatcaggataactctcctg 18252009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31575652 - 31575411
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31575652 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcttgctgaggttgataatacagg 31575559  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31575558 ggttctggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 31575460  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31575459 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 31575411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 20044760 - 20045007
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20044760 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20044856  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20044857 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatcgtggataatctcacacgaagtgtg 20044953  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20044954 gggactggatgtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20045007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843720
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgata--ataca 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgatgaggttgataatataca 4843872  T
Q  102 ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 199  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4843871 agggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtcttggttagaaatttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgt 4843775  T
Q  200 ggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4843774 ggggactggaagtagccggatttagtgaaccaggataactctcctttgttattct 4843720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 12925296 - 12925543
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925296 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaaa--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12925392  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12925393 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 12925489  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12925490 gggactggaagtagtcgggtttcgtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12925543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 20030121 - 20030368
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20030121 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20030217  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20030218 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20030314  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20030315 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 20030368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 12767573 - 12767822
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12767573 aagtctattgagcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12767669  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12767670 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 12767766  T
Q  201 gggac--tggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767767 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12767822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33592284 - 33592134
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33592284 aggtgttctggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33592186  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33592185 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 33592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33601923 - 33601773
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33601923 aggtgttctggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33601825  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33601824 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 33601773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Original strand, 12915500 - 12915648
Alignment:
Q  105 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12915500 gttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 12915596  T
Q  203 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12915597 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12915648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24096262 - 24096077
Alignment:
Q  65 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 164  Q
    |||||||||| | |||  || |||||||||||||||| |    | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24096262 caaagaattgaagaagtttgttgaggttgataatacaaggaaaatggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagc 24096163  T
Q  165 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg-actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 250  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24096162 aagata-ctatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactggaagtagtcgagtttggtgaaccagaataaatctcctgtgtta 24096077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 15833950 - 15834137
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggt-gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 162  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||  || ||| ||| ||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15833950 gcaaagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaacgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagtta 15834049  T
Q  163 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttat 251  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15834050 gcatgata-ctataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaaccaagataaatctcttgtgttat 15834137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 242
Target Start/End: Original strand, 24634009 - 24634145
Alignment:
Q  105 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24634009 gttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatatcacacgaagtgtgggga 24634107  T
Q  205 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  24634108 ctggaagtagtcgggtttgaggaaccaggataactctc 24634145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Original strand, 20714417 - 20714484
Alignment:
Q  187 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714417 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20714484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42896299 - 42896174
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42896299 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcaact-gaaatctatagtggataatctcacacgaagtgtg 42896201  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtga 227  Q
    | |||||||||||||||| || |||||    
T  42896200 gagactggaagtagccggattgggtga 42896174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26194106 - 26194048
Alignment:
Q  191 acgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 249  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26194106 acgaagtgtggggactagaagtagttgggtttgatgaaccaggataactctcatgtgtt 26194048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31710717 - 31710464
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31710717 ctcaaagtctattgggcttactagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatac 31710618  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710617 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 31710518  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31710517 gggactggaagtagccgggtttggtgaacaaggataactctcatgtgttattct 31710464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24022993 - 24022740
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24022993 ctcaaagtctattggggttaatagttttgagatagaaaatttcaaccttccttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgttgaggttgataatac 24022894  T
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24022893 aggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 24022794  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  24022793 ggaattggaagtagccgggtttggtgaacgaggataactctccaatgttattct 24022740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 14273146 - 14273394
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14273146 aagtctattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatataggt 14273244  T
Q  105 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 204  Q
    || || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14273245 gtaacagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggaga 14273344  T
Q  205 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14273345 ctgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcgtgtgttattct 14273394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 35877458 - 35877705
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35877458 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35877554  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35877555 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35877651  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35877652 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 35877705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 35884947 - 35885194
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35884947 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35885043  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35885044 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35885140  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35885141 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 35885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 36724660 - 36724907
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36724660 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 36724756  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36724757 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 36724853  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36724854 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 36724907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 3396865 - 3397108
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||     
T  3396865 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattttagaagtctgctgaggttgataatacaa 3396961  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3396962 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 3397058  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 250  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3397059 gggactagaagtagctgggtttggtgaaccatgataactctcctgtgtta 3397108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 1800493 - 1800662
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  1800493 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 1800591  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1800592 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1800662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 22632402 - 22632571
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22632402 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagc- 22632500  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  22632501 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 22632571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 1790999 - 1791164
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  1790999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 1791093  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1791094 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1791164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 18578707 - 18578875
Alignment:
Q  86 tgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||| | || |  ||  ||| ||||    
T  18578707 tgaggttgataatacagggtgtaacagattggtctggtgttatcaagaacttatagtcctagtcaaaagtttctgttaggaggatat-tactgtgaataa 18578805  T
Q  185 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  18578806 tctcacacaaggtgtggggactgaaagtagtcgggtttgatgaacatggataaatctcatgtgttattct 18578875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Original strand, 16446670 - 16446739
Alignment:
Q  171 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16446670 actatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtgatccaggataactc 16446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Original strand, 29911278 - 29911350
Alignment:
Q  182 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  29911278 taatctcacacgaggtgaggggactggaagcagctggatttggttaaccatgataaatctcatgtgttattct 29911350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5378613 - 5378422
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 162  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  5378613 gcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgtta 5378514  T
Q  163 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5378513 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcctgtgttattct 5378422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15810217 - 15809976
Alignment:
Q  16 gcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15810217 gcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctggtt--caaagaattgtagaagcatgccgaagttgataatacaggtgtaacggactg 15810121  T
Q  116 atctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga--------ctg 207  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  15810120 atctggtgtgatcaagaccttatagtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtggataatctcacacgaggtgtggggactcgaactctg 15810021  T
Q  208 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15810020 gaagtagtcggatttggtgaaccaggataattctcttgtgttatt 15809976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14272205 - 14272016
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14272205 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14272109  T
Q  164 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14272108 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14272016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40999224 - 40999034
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 162  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40999224 gcaaagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaacaaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgtta 40999125  T
Q  163 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40999124 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaaccaggataactcttatgtgttattc 40999034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14282071 - 14281888
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14282071 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14281975  T
Q  164 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 248  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14281974 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14281888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26906431 - 26906244
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26906431 aagaattgtaaaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaaca 26906332  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26906331 agatat-tataatggataatctcacacgaggtatggggactagaagtagcctggtttggtgaaccaggataaatctcgtgtgttattct 26906244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 21633524 - 21633769
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  |  |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  21633524 aagtctattgggcataatagttt-gagatagaaaagttccaacatttcttgtgtgaaag--caaggaatt-tagaagcctgctgaggttgataatacagt 21633619  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  21633620 tgttccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactag-tagaatactatagtggataatctcacaaaaagtgtgggg 21633718  T
Q  204 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||    
T  21633719 actagacgtagccgggtttggtgaaccagaatatttatcttgtgttattct 21633769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3471124 - 3470949
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || || || | || |||||||||   ||     
T  3471124 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttataatgttggttagaagtttc---tac 3471028  T
Q  164 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 240  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3471027 caattgtatactacagtggataatctcacatgaagtgtgggggctggaagtaaccgggtttggtgaaccaggataactc 3470949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21919581 - 21919431
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21919581 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtg 21919485  T
Q  199 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21919484 tggggactggaagtagccggattgggtgaatcaggataactctcctgtgttatt 21919431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 30676788 - 30676976
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 162  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||   | |||||||| ||| ||||||||  ||    
T  30676788 gcaaagaattatataagtatgttgagattgataatacagagtgtaacagactgatcttgtgtgatcaagaacatatagtgctattcataagtttcttata 30676887  T
Q  163 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttg-gtgaaccaggataactctcctgtgttat 251  Q
    ||  ||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  30676888 gc-tgaatattgtaatggataatctcacacgaagtgtggggactgaaagtagtctgctttgtgtgaaccatgataaatcttgtgtgttat 30676976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28310155 - 28310018
Alignment:
Q  108 acggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||||| || |||| || | ||||||||||||||   ||||||  ||||||  || |    
T  28310155 acggactgatctggtgtgatcaacaacttatagtgttattcggaagtttttgatagc-aggatactatagtggataa--ccacacgtagtgtggaaaccg 28310059  T
Q  208 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 249  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28310058 gaagtagcc-ggttaggtgaatcaggataaatctcttgtgtt 28310018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257142
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  256901 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacaga 256997  T
Q  104 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 201  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  256998 ggttacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgg 257094  T
Q  202 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257095 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 257142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2298
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2051 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 2147  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2148 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 2244  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2245 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 254
Target Start/End: Original strand, 124047 - 124236
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  124047 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 124143  T
Q  164 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124144 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtaacaggatttgatgaaccaggataactctcctgtgttattct 124236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Original strand, 100002 - 100152
Alignment:
Q  86 tgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 184  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||    
T  100002 tgaggttgataatacagagtgtaacagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatactataatggataa 100100  T
Q  185 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||    
T  100101 tctcacacgtagtgtggggactggacatagcc-ggttaggcgaaccaggataa 100152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 143111 - 143237
Alignment:
Q  5 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  143111 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 143207  T
Q  103 gtgttacggactgatctggtgtgatcaaga 132  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  143208 tggttacggactgatctggtgtgatcaaga 143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14999 - 14830
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  14999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 14901  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  14900 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 24593 - 24762
Alignment:
Q  67 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  24593 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 24691  T
Q  166 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 237  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||    
T  24692 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtag-ctggttaggcgaaccaggataa 24762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12698 - 12548
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 200  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12698 aggtgttctggactaatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaacta-aaaactatagtggataatctcacacgaagtgta 12600  T
Q  201 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 252  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12599 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctatgttatt 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2411 - 2259
Alignment:
Q  101 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||    
T  2411 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtg 2315  T
Q  199 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 254  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2314 tggggactagaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 2259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26309
Alignment:
Q  1 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26372 ctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 26309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27246 - 27078
Alignment:
Q  64 gcaaagaattgta-taagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||   | ||||| || | ||||||||||| |    
T  27246 gcaaagaattgtaataagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacgaattgatctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgat 27147  T
Q  162 agcaagaaaactatag----tggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtga 227  Q
    ||   | | |||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27146 ag-ttggatactatagtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtagccgactttggtga 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 49501 - 49565
Alignment:
Q  175 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 239  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  49501 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 49565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3423 times since January 2019
Visitors: 4035