View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0648_low_12 (Length: 396)

Name: NF0648_low_12
Description: NF0648
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0648_low_12
NF0648_low_12
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-375)||(4199861-4200237)
chr5 (1-375)||(25426628-25427005)
chr5 (1-375)||(18777868-18778244)
chr5 (5-375)||(22366361-22366733)
chr5 (1-375)||(19499899-19500275)
chr5 (1-375)||(43443273-43443647)
chr5 (1-375)||(12374-12750)
chr5 (1-375)||(21073471-21073847)
chr5 (1-245)||(29188162-29188404)
chr5 (1-375)||(27009841-27010216)
chr5 (1-210)||(10777849-10778059)
chr5 (1-210)||(11211944-11212154)
chr5 (1-210)||(21932260-21932470)
chr5 (1-210)||(21938430-21938640)
chr5 (1-210)||(35582203-35582413)
chr5 (125-375)||(22053845-22054096)
chr5 (125-279)||(20623066-20623220)
chr5 (125-279)||(21233540-21233694)
chr5 (1-375)||(17471467-17471844)
chr5 (125-375)||(18531079-18531330)
chr5 (125-375)||(23506965-23507216)
chr5 (1-210)||(36989649-36989859)
chr5 (1-210)||(7425491-7425701)
chr5 (125-279)||(16536294-16536448)
chr5 (1-210)||(22882963-22883173)
chr5 (1-210)||(35790977-35791187)
chr5 (125-364)||(34939289-34939528)
chr5 (125-276)||(37052844-37052995)
chr5 (1-210)||(1219399-1219609)
chr5 (1-210)||(23514728-23514938)
chr5 (125-279)||(25900418-25900571)
chr5 (125-375)||(27182559-27182810)
chr5 (1-143)||(23328791-23328934)
chr5 (1-143)||(24616395-24616538)
chr5 (1-143)||(24712771-24712914)
chr5 (1-143)||(24745789-24745932)
chr5 (128-210)||(32950861-32950943)
chr5 (327-371)||(29190478-29190522)
chr5 (1-71)||(11343008-11343078)
chr5 (264-375)||(19862207-19862319)
chr5 (264-375)||(23493917-23494029)
chr5 (1-71)||(16105967-16106037)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-375)||(13910900-13911277)
chr7 (1-375)||(10989410-10989785)
chr7 (125-375)||(7293017-7293267)
chr7 (1-375)||(16478840-16479213)
chr7 (1-375)||(2437457-2437833)
chr7 (1-375)||(13572676-13573051)
chr7 (40-375)||(18253761-18254098)
chr7 (125-375)||(47481043-47481294)
chr7 (1-210)||(7822895-7823105)
chr7 (1-210)||(7830206-7830416)
chr7 (1-210)||(27101516-27101726)
chr7 (1-210)||(27108864-27109074)
chr7 (1-210)||(27176600-27176810)
chr7 (1-210)||(38783608-38783818)
chr7 (125-279)||(11516324-11516478)
chr7 (125-279)||(15441576-15441730)
chr7 (125-279)||(30262141-30262295)
chr7 (1-210)||(15950670-15950880)
chr7 (1-210)||(18979900-18980110)
chr7 (125-370)||(11580751-11580997)
chr7 (1-210)||(15759993-15760203)
chr7 (125-375)||(13037026-13037277)
chr7 (125-375)||(13321014-13321267)
chr7 (1-210)||(13758537-13758747)
chr7 (1-210)||(15927735-15927945)
chr7 (125-373)||(16211768-16212017)
chr7 (144-375)||(36052667-36052896)
chr7 (125-375)||(3059966-3060217)
chr7 (1-210)||(14250778-14250987)
chr7 (40-122)||(15862174-15862257)
chr7 (78-209)||(48622623-48622754)
chr7 (125-369)||(25292350-25292595)
chr7 (40-143)||(16418731-16418835)
chr7 (40-143)||(10000288-10000392)
chr7 (1-71)||(15516723-15516793)
chr7 (125-372)||(295978-296224)
chr7 (264-357)||(13274804-13274897)
chr7 (264-357)||(49047811-49047904)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-375)||(27653859-27654235)
chr6 (1-375)||(25175563-25175941)
chr6 (1-371)||(14626006-14626377)
chr6 (40-371)||(1650022-1650352)
chr6 (51-375)||(16825678-16826006)
chr6 (1-210)||(10488866-10489076)
chr6 (1-210)||(16376252-16376462)
chr6 (1-210)||(16383576-16383786)
chr6 (1-210)||(16556018-16556228)
chr6 (1-210)||(16632574-16632784)
chr6 (1-147)||(19299467-19299614)
chr6 (125-375)||(35009451-35009702)
chr6 (1-176)||(22251445-22251621)
chr6 (1-210)||(16232059-16232269)
chr6 (1-210)||(22225617-22225827)
chr6 (125-364)||(1657760-1657999)
chr6 (1-210)||(1556172-1556382)
chr6 (1-210)||(19610185-19610395)
chr6 (127-364)||(15862484-15862720)
chr6 (1-210)||(18086702-18086912)
chr6 (127-364)||(23153458-23153696)
chr6 (1-210)||(23977936-23978146)
chr6 (1-143)||(29869655-29869798)
chr6 (40-210)||(13620712-13620883)
chr6 (44-210)||(29666040-29666208)
chr6 (1-57)||(16814875-16814931)
chr6 (126-194)||(27751607-27751675)
chr6 (1-71)||(4991396-4991467)
chr6 (272-375)||(27740838-27740941)
chr6 (265-358)||(18381821-18381914)
chr6 (1-73)||(1657623-1657695)
chr6 (5-73)||(15862787-15862855)
chr6 (288-375)||(22361926-22362014)
chr6 (264-375)||(25367374-25367486)
chr6 (335-375)||(29665892-29665932)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-371)||(6774136-6774505)
chr8 (1-375)||(30120722-30121099)
chr8 (125-375)||(22907226-22907476)
chr8 (1-371)||(24548986-24549355)
chr8 (26-375)||(21851867-21852217)
chr8 (26-375)||(21844474-21844824)
chr8 (1-375)||(16674270-16674644)
chr8 (1-210)||(271239-271449)
chr8 (1-210)||(644471-644681)
chr8 (1-210)||(830206-830416)
chr8 (125-279)||(5238184-5238338)
chr8 (1-150)||(15319038-15319188)
chr8 (1-150)||(15499407-15499557)
chr8 (1-210)||(22006137-22006347)
chr8 (1-210)||(22088673-22088883)
chr8 (125-279)||(24661260-24661414)
chr8 (125-279)||(43685643-43685797)
chr8 (125-376)||(16193728-16193980)
chr8 (119-375)||(43373474-43373731)
chr8 (1-210)||(13720807-13721017)
chr8 (5-210)||(16195398-16195604)
chr8 (1-210)||(16872930-16873140)
chr8 (125-375)||(16404987-16405235)
chr8 (129-364)||(17345581-17345816)
chr8 (1-210)||(13662144-13662354)
chr8 (125-364)||(24928803-24929043)
chr8 (188-375)||(222754-222943)
chr8 (188-375)||(736377-736566)
chr8 (188-375)||(860272-860461)
chr8 (264-358)||(23837214-23837308)
chr8 (1-73)||(17345885-17345957)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-375)||(31551-31928)
scaffold0008 (125-375)||(128181-128431)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-375)||(36093-36469)
scaffold0023 (1-164)||(169788-169951)
scaffold0023 (1-210)||(153886-154096)
scaffold0023 (125-375)||(48598-48849)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-375)||(19886537-19886913)
chr2 (128-375)||(19794719-19794967)
chr2 (125-375)||(36982453-36982704)
chr2 (1-210)||(11231217-11231427)
chr2 (1-210)||(22513064-22513274)
chr2 (1-210)||(24685660-24685870)
chr2 (1-210)||(28775686-28775896)
chr2 (125-279)||(19689413-19689567)
chr2 (125-279)||(23820168-23820322)
chr2 (125-279)||(14906452-14906606)
chr2 (1-210)||(34824642-34824852)
chr2 (144-375)||(24341420-24341652)
chr2 (125-375)||(25265402-25265653)
chr2 (1-210)||(12728559-12728769)
chr2 (125-279)||(20015108-20015262)
chr2 (125-375)||(7507856-7508107)
chr2 (125-370)||(462743-462989)
chr2 (1-210)||(3798482-3798692)
chr2 (125-375)||(8891242-8891493)
chr2 (40-210)||(23777963-23778134)
chr2 (145-375)||(43642989-43643220)
chr2 (1-210)||(8944013-8944223)
chr2 (1-210)||(12635747-12635957)
chr2 (1-210)||(12641521-12641731)
chr2 (1-210)||(16935760-16935970)
chr2 (1-210)||(17006420-17006630)
chr2 (3-210)||(42177850-42178058)
chr2 (128-375)||(20627328-20627576)
chr2 (1-143)||(23774370-23774513)
chr2 (1-71)||(24826576-24826646)
chr2 (125-375)||(17396665-17396916)
chr2 (40-143)||(5888548-5888652)
chr2 (94-210)||(21142062-21142178)
chr2 (1-71)||(25213372-25213443)
chr2 (297-375)||(19669279-19669358)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (125-375)||(37078-37328)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (125-375)||(26680201-26680451)
chr4 (1-375)||(10644219-10644593)
chr4 (1-375)||(47357654-47358027)
chr4 (125-375)||(15675101-15675352)
chr4 (125-279)||(10488659-10488813)
chr4 (125-279)||(16327938-16328092)
chr4 (144-375)||(31115629-31115861)
chr4 (1-210)||(18169137-18169346)
chr4 (125-375)||(54118256-54118507)
chr4 (1-210)||(17145536-17145746)
chr4 (144-375)||(13246430-13246662)
chr4 (1-210)||(7131944-7132154)
chr4 (1-210)||(15287124-15287334)
chr4 (1-210)||(15294233-15294443)
chr4 (1-210)||(20000890-20001100)
chr4 (40-210)||(19020653-19020824)
chr4 (125-311)||(10104262-10104449)
chr4 (40-210)||(18248385-18248556)
chr4 (1-143)||(22351943-22352086)
chr4 (125-245)||(122020-122140)
chr4 (49-151)||(8378377-8378480)
chr4 (1-143)||(26339253-26339396)
chr4 (153-367)||(13048261-13048477)
chr4 (78-210)||(22738436-22738568)
chr4 (277-375)||(111395-111493)
chr4 (330-375)||(10104449-10104494)
chr4 (144-311)||(40885585-40885753)
chr4 (1-72)||(14996444-14996515)
chr4 (125-176)||(33240900-33240951)
chr4 (1-71)||(14952085-14952155)
chr4 (264-358)||(41166083-41166177)
chr4 (40-104)||(9795499-9795564)
chr4 (264-351)||(7185981-7186068)
chr4 (264-351)||(15044851-15044938)
chr4 (264-357)||(13809647-13809740)
chr4 (264-376)||(52265645-52265758)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (1-375)||(22227809-22228185)
chr1 (1-375)||(22232506-22232882)
chr1 (1-375)||(5072265-5072640)
chr1 (40-371)||(2116258-2116589)
chr1 (40-245)||(45051554-45051757)
chr1 (78-375)||(18601071-18601370)
chr1 (1-210)||(17004805-17005015)
chr1 (1-210)||(18059637-18059847)
chr1 (1-210)||(38054970-38055180)
chr1 (1-210)||(17148734-17148945)
chr1 (1-147)||(19962378-19962525)
chr1 (125-279)||(51452589-51452743)
chr1 (125-375)||(20931345-20931596)
chr1 (125-375)||(20445679-20445930)
chr1 (125-375)||(20531444-20531695)
chr1 (125-375)||(20893638-20893889)
chr1 (35-210)||(46523556-46523731)
chr1 (125-375)||(20913037-20913281)
chr1 (125-375)||(41394222-41394473)
chr1 (125-375)||(37844462-37844714)
chr1 (1-143)||(22035681-22035824)
chr1 (1-143)||(7640813-7640956)
chr1 (1-71)||(15861288-15861358)
chr1 (321-371)||(45051446-45051496)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-375)||(20992-21367)
scaffold0139 (1-375)||(13938-14312)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (128-375)||(16744130-16744377)
chr3 (1-375)||(41270075-41270450)
chr3 (1-375)||(55316219-55316594)
chr3 (125-375)||(17912495-17912744)
chr3 (1-375)||(16821139-16821513)
chr3 (40-371)||(15614838-15615168)
chr3 (40-375)||(15936553-15936890)
chr3 (1-210)||(49232603-49232813)
chr3 (40-372)||(15938395-15938729)
chr3 (1-375)||(14842449-14842824)
chr3 (125-375)||(15859036-15859287)
chr3 (125-376)||(51158030-51158282)
chr3 (1-210)||(1467618-1467828)
chr3 (1-375)||(15468219-15468596)
chr3 (1-375)||(22275209-22275586)
chr3 (125-279)||(2449250-2449404)
chr3 (1-210)||(12264671-12264881)
chr3 (1-176)||(12812042-12812218)
chr3 (1-210)||(18911160-18911370)
chr3 (1-210)||(25058906-25059116)
chr3 (125-364)||(13838905-13839145)
chr3 (125-375)||(12030159-12030410)
chr3 (125-375)||(2049810-2050061)
chr3 (1-176)||(18896923-18897099)
chr3 (40-210)||(12902008-12902179)
chr3 (1-210)||(5228480-5228689)
chr3 (1-209)||(54651625-54651834)
chr3 (125-375)||(13954902-13955153)
chr3 (125-375)||(13975734-13975985)
chr3 (125-375)||(45860805-45861056)
chr3 (266-375)||(47984650-47984759)
chr3 (266-375)||(48003224-48003333)
chr3 (94-210)||(44229152-44229268)
chr3 (266-375)||(47993937-47994046)
chr3 (266-375)||(48012510-48012619)
chr3 (128-210)||(11986181-11986263)
chr3 (1-72)||(8268612-8268683)
chr3 (1-72)||(8275712-8275783)
chr3 (1-71)||(23492696-23492766)
chr3 (264-357)||(11329098-11329191)
chr3 (264-357)||(17139525-17139618)
chr3 (287-374)||(38811168-38811256)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-371)||(2966-3338)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (4-245)||(13206-13445)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-375)||(3722-4099)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (40-371)||(9266-9596)
scaffold0215 (40-371)||(16164-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-245)||(1181-1424)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-375)||(5091-5466)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-375)||(42997-43372)
scaffold0076 (1-210)||(39270-39480)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (40-375)||(107747-108084)
scaffold0026 (1-375)||(64400-64780)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-375)||(35-408)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (125-375)||(19206-19457)
scaffold0195 (125-375)||(21290-21541)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-375)||(844-1218)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-210)||(31476-31686)
scaffold0107 (88-210)||(39813-39935)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (125-375)||(12115-12364)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (128-375)||(36928-37176)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (125-375)||(8849-9100)
scaffold0025 (144-375)||(148721-148953)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-375)||(5952-6326)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (125-279)||(22637-22791)
scaffold0141 (125-279)||(26892-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (125-279)||(1594-1748)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (125-375)||(48187-48438)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (125-373)||(3594-3843)
scaffold0266 (125-375)||(1124-1375)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (128-375)||(41648-41896)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (125-375)||(13506-13757)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-151)||(10627-10778)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-210)||(1454-1664)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (125-375)||(34472-34724)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (125-375)||(8878-9129)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-151)||(29388-29539)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-210)||(2559-2770)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (125-364)||(171916-172156)
scaffold0001 (125-364)||(177619-177859)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-210)||(7335-7545)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (125-375)||(5073-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (125-375)||(123176-123427)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-210)||(1393-1603)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (125-371)||(41733-41980)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (144-369)||(272031-272257)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (125-375)||(8192-8440)
scaffold0162 (125-375)||(26427-26678)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (125-375)||(546-797)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (125-364)||(247454-247694)
scaffold0012 (1-210)||(34037-34247)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-143)||(6831-6974)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (125-245)||(5660-5780)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (40-210)||(10257-10428)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (40-375)||(54416-54755)
scaffold0066 (40-210)||(45197-45369)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (125-245)||(51194-51314)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (78-209)||(3581-3712)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (119-206)||(3360-3447)
scaffold0361 (331-373)||(3210-3252)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (78-209)||(54042-54173)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (277-375)||(9382-9480)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (4-141)||(23631-23769)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (125-215)||(89466-89556)
scaffold0028 (1-71)||(130880-130950)
scaffold0028 (297-375)||(79537-79616)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (40-143)||(12045-12149)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (286-375)||(48514-48603)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (40-143)||(7443-7547)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (128-210)||(56114-56196)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (286-375)||(26-115)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-71)||(17171-17241)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (40-104)||(13268-13333)
scaffold0032 (298-375)||(104793-104871)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (126-210)||(1-85)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-64)||(154310-154373)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (297-358)||(2471-2532)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 4199861 - 4200237
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199861 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 4199960  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4199961 gaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 4200060  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||    
T  4200061 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttca 4200160  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200161 attgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25427005 - 25426628
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaaggg-ttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25427005 gagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgta 25426906  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25426905 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 25426806  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |    
T  25426805 attacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 25426706  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426705 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 18777868 - 18778244
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18777868 gagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtat 18777967  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18777968 gaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 18778067  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  18778068 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 18778167  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||  || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778168 aatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 375
Target Start/End: Original strand, 22366361 - 22366733
Alignment:
Q  5 tgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22366361 tgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaa 22366460  T
Q  105 atgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattac 204  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22366461 atgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattac 22366560  T
Q  205 atgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattg 302  Q
    ||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||    
T  22366561 atgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatg 22366660  T
Q  303 atgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366661 atgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19500275 - 19499899
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19500275 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtat 19500176  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19500175 gaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 19500076  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  19500075 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 19499976  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499975 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 43443273 - 43443647
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  43443273 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatat 43443370  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443371 gaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 43443470  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||    
T  43443471 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttca 43443570  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443571 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12750 - 12374
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12750 gagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtat 12651  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12650 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 12551  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  12550 ttacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 12451  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 21073471 - 21073847
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21073471 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtat 21073570  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21073571 gaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaa 21073670  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  21073671 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 21073770  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073771 aatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29188162 - 29188404
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29188162 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtat 29188259  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29188260 gaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 29188359  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||    
T  29188360 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27010216 - 27009841
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  27010216 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtat 27010118  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||    
T  27010117 gaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaa 27010018  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  27010017 ttacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttca 27009918  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009917 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10777849 - 10778059
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  10777849 gagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 10777948  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  10777949 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 10778048  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  10778049 attacatgttt 10778059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 11211944 - 11212154
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  11211944 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 11212043  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  11212044 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 11212143  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  11212144 attacatgttt 11212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21932260 - 21932470
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21932260 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 21932359  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  21932360 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 21932459  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  21932460 attacatgttt 21932470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21938430 - 21938640
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21938430 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 21938529  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  21938530 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 21938629  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  21938630 attacatgttt 21938640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35582413 - 35582203
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  35582413 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 35582314  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  35582313 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 35582214  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  35582213 attacatgttt 35582203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22054096
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 22054044  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054045 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623066
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233694
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 17471467 - 17471844
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || |||||||||||||    
T  17471467 gagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgta 17471566  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  17471567 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 17471666  T
Q  200 attacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatg-aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtg 296  Q
    |||||||||||  || |||||  | |||  |||| ||| ||||| | |  ||| |||| ||||||| ||||| |  ||||| | || | | |||| | |     
T  17471667 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatatt 17471765  T
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471766 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531330
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 18531278  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531279 gttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23506965
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 23507017  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507016 gttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 36989649 - 36989859
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||    
T  36989649 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgta 36989748  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  36989749 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 36989848  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  36989849 attacatgttt 36989859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7425701 - 7425491
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  7425701 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 7425602  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  7425601 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 7425502  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  7425501 attacatgttt 7425491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536294
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22882963 - 22883173
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22882963 gagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagataagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 22883062  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  22883063 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaa 22883162  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  22883163 attacatgttt 22883173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 35790977 - 35791187
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  35790977 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 35791076  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   ||||    
T  35791077 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaa 35791176  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  35791177 attacatgttt 35791187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgat 34939330  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34939329 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052844
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaat 37052896  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052895 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1219399 - 1219609
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  1219399 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 1219498  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  1219499 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1219598  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  1219599 attacatgttt 1219609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23514938 - 23514728
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  23514938 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 23514839  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  23514838 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 23514739  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  23514738 attacatgttt 23514728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900571
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182810
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 27182758  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182759 gttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23328934 - 23328791
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  23328934 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 23328835  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23328834 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24616538 - 24616395
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  24616538 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 24616439  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24616438 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24712914 - 24712771
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  24712914 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 24712815  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24712814 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24745932 - 24745789
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  24745932 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 24745833  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24745832 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950861
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 32950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 371
Target Start/End: Original strand, 29190478 - 29190522
Alignment:
Q  327 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190478 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11343078 - 11343008
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11343078 gagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19862319 - 19862207
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 362  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| |||||    
T  19862319 atgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattca 19862220  T
Q  363 tggattgatgatg 375  Q
    ||  |||||||||    
T  19862219 tgatttgatgatg 19862207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 362  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  363 tggattgatgatg 375  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16106037 - 16105967
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| |||   | |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16106037 gagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 13910900 - 13911277
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910900 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 13910999  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13911000 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaa 13911099  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| |    
T  13911100 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttc 13911199  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911200 aattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10989785 - 10989410
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10989785 gagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtat 10989686  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10989685 gaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 10989586  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| | | | ||||| | |||||||||| ||    
T  10989585 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttca 10989487  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989486 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293017
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 7293068  T
Q  325 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293067 ttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 16478840 - 16479213
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16478840 gagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtat 16478937  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16478938 gaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 16479037  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  |||    
T  16479038 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaa 16479137  T
Q  300 ttgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479138 ttgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2437833 - 2437457
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  2437833 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtat 2437734  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2437733 gaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 2437634  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||   ||| | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||    
T  2437633 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttca 2437534  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437533 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13573051 - 13572676
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  13573051 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtat 13572953  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  13572952 gaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaa 13572853  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  13572852 ttacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttca 13572753  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572752 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254098
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaa 238  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||||    
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  239 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 337  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 18254060  T
Q  338 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254061 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgat 47481242  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481243 gtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7823105 - 7822895
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  7823105 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 7823006  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  7823005 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 7822906  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  7822905 attacatgttt 7822895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7830416 - 7830206
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  7830416 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 7830317  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  7830316 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 7830217  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  7830216 attacatgttt 7830206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27101516 - 27101726
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27101516 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 27101615  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  27101616 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27101715  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  27101716 attacatgttt 27101726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27108864 - 27109074
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27108864 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 27108963  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  27108964 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27109063  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  27109064 attacatgttt 27109074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27176810 - 27176600
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27176810 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 27176711  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  27176710 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27176611  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  27176610 attacatgttt 27176600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 38783608 - 38783818
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  38783608 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 38783707  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  38783708 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 38783807  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  38783808 attacatgttt 38783818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516324
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441730
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262295
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15950670 - 15950880
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  15950670 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 15950769  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  15950770 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 15950869  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  15950870 attacatgttt 15950880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18979900 - 18980110
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  18979900 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 18979999  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  18980000 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18980099  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  18980100 attacatgttt 18980110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 370
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580997
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 11580950  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 370  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580951 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15759993 - 15760203
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  15759993 gagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 15760092  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||| |||| | ||||    
T  15760093 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaa 15760192  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  15760193 attacatgttt 15760203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037277
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |   | ||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgat 13037225  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037226 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt--aaatatgtgaag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |     
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  223 atgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 320  Q
    |||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  13321167 atgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaatt 13321069  T
Q  321 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321068 gatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13758747 - 13758537
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  13758747 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 13758648  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  13758647 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13758548  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  13758547 attacatgttt 13758537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15927945 - 15927735
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  15927945 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 15927846  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  15927845 tgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaa 15927746  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  15927745 attacatgttt 15927735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211768
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgat 16211818  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 373  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211817 gttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  244 gcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    ||  ||| | |||||||  | | |||||   | | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| | |||||||||| ||    
T  36052796 gctcaattggtgaattttgctaagttgt---taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 36052700  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052699 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3059966
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgca-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    || || || |||||||| |||  |||||| ||||||| |  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| ||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 3060019  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060018 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14250778 - 14250987
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||||||    
T  14250778 gagctgaattgaagcaagagtttgagtta-tcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgta 14250876  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  14250877 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaa 14250976  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  14250977 attacatgttt 14250987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaatt 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 48622623 - 48622754
Alignment:
Q  78 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 177  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  48622623 ttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 48622722  T
Q  178 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 209  Q
    |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  48622723 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 48622754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292595
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaag 25292449  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||| |||||| |||||||  ||| | |||||| |   | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||    
T  25292450 gataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 25292549  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattg 369  Q
     ||||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292550 attatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418731
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  139 tcttg 143  Q
    |||||    
T  16418735 tcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000392
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  139 tcttg 143  Q
    |||||    
T  10000388 tcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 15516723 - 15516793
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516723 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 372
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296224
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||| |||   || | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  295978 tgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaat 296077  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtg-caaaatggatgaatttgac-atgttgtagtt-gaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 321  Q
    || ||||||| |||||| |  | |||||| |||||||  | |  |||  ||| |||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| |    
T  296078 gagaagttataaaaattatatccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattg 296176  T
Q  322 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 372  Q
    |||||   |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  296177 atgtt---gttgatgaattactgattgggtatgcttattcatggattgatg 296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13274897 - 13274804
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 357  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||| |||||||||    
T  13274897 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcat 13274804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Original strand, 49047811 - 49047904
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 357  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  49047811 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcat 49047904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 27653859 - 27654235
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27653859 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtat 27653958  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27653959 gaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 27654058  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |     
T  27654059 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcc 27654158  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654159 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25175941 - 25175563
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaaggg-ttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatatt-ctcatgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  25175941 gagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataattttgcatttttctcatgttgt 25175842  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25175841 atgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 25175742  T
Q  199 aattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtg 296  Q
    ||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||     
T  25175741 aattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgtt 25175642  T
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175641 caaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 14626006 - 14626377
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctca--tgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | | ||| || |||||||  ||||||    
T  14626006 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgt 14626104  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
     ||||  || | | ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  14626105 ttgaat-tgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 14626203  T
Q  199 aattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||   ||| | |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  |    
T  14626204 aattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctc 14626303  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626304 aattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||||    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  240 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 338  Q
    ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||    
T  1650220 ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaa 1650319  T
Q  339 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650320 tcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  51 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  151 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--tgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| ||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  249 atggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 346  Q
    || | || ||||  |  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||   ||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  347 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10489076 - 10488866
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  10489076 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 10488977  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  10488976 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 10488877  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  10488876 attacatgttt 10488866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16376252 - 16376462
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16376252 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 16376351  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  16376352 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16376451  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16376452 attacatgttt 16376462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16383576 - 16383786
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16383576 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 16383675  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  16383676 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16383775  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16383776 attacatgttt 16383786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16556018 - 16556228
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16556018 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 16556117  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  16556118 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16556217  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16556218 attacatgttt 16556228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16632574 - 16632784
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16632574 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 16632673  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  16632674 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16632773  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16632774 attacatgttt 16632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19299614 - 19299467
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19299614 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 19299515  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19299514 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 35009650  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009651 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22251445 - 22251621
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22251445 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 22251544  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251545 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16232269 - 16232059
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  16232269 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 16232170  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  16232169 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 16232070  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16232069 attacatgttt 16232059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22225617 - 22225827
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22225617 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 22225716  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  22225717 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 22225816  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  22225817 attacatgttt 22225827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgat 1657958  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1657959 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1556382 - 1556172
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  1556382 gagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 1556283  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  1556282 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1556183  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  1556182 attacatgttt 1556172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19610395 - 19610185
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||    
T  19610395 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgta 19610296  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  19610295 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 19610196  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  19610195 attacatgttt 19610185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862484
Alignment:
Q  127 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||  | |||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  227 aaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 325  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| || |||| |||||    
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgt 15862523  T
Q  326 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862522 tgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18086702 - 18086912
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  18086702 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 18086801  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  18086802 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18086901  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  18086902 attacatgttt 18086912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153458
Alignment:
Q  127 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatga 226  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  227 aaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 325  Q
     ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||    
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgt 23153497  T
Q  326 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153496 tgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23978146 - 23977936
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  23978146 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 23978047  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  23978046 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 23977947  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  23977946 attacatgttt 23977936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 29869655 - 29869798
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  29869655 gagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgta 29869754  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29869755 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620883
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgttt 13620883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29666040
Alignment:
Q  44 taagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 141  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||  || ||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  142 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
     ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 29666040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16814875 - 16814931
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16814875 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagagggttagtg 16814931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751607
Alignment:
Q  126 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttg 194  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttg 27751607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4991467 - 4991396
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggtt-agagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991467 gagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  272 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  372 gatg 375  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 358
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  265 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 358  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 1657623 - 1657695
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt 73  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | | |||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  1657623 gagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgt 1657695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15862855 - 15862787
Alignment:
Q  5 tgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt 73  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  15862855 tgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgt 15862787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  288 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 375  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367486
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 362  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |  | ||| | |||| |||||||| ||||| |||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattca 25367473  T
Q  363 tggattgatgatg 375  Q
    || |||| |||||    
T  25367474 tgaattgttgatg 25367486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29665932 - 29665892
Alignment:
Q  335 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29665932 tgaatcatgacttgggtatgcatattcatggattggtgatg 29665892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 6774136 - 6774505
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  6774136 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatat 6774233  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6774234 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 6774333  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  |||    
T  6774334 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaa 6774433  T
Q  300 ttgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774434 ttgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30121099 - 30120722
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  30121099 gagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgta 30121000  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30120999 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaa 30120900  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |    
T  30120899 attacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttc 30120800  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120799 aattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907476
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 22907425  T
Q  325 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907426 ttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24549355 - 24548986
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  24549355 gagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtat 24549258  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24549257 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 24549158  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  |||    
T  24549157 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaa 24549058  T
Q  300 ttgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549057 ttgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 21851867 - 21852217
Alignment:
Q  26 gataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21851867 gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcat 21851965  T
Q  126 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatg 225  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  21851966 gtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatg 21852065  T
Q  226 aaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    | |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||    
T  21852066 ataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 21852165  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852166 attatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 21844474 - 21844824
Alignment:
Q  26 gataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcat 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21844474 gataatcaacttcaacggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcat 21844572  T
Q  126 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatg 225  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21844573 gtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatg 21844672  T
Q  226 aaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    | |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | |||    
T  21844673 ataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 21844772  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844773 attatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 16674270 - 16674644
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  16674270 gagctgaattgaagcaagagtt-gagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtat 16674367  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16674368 gaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaa 16674467  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  16674468 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttca 16674567  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674568 aatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 271239 - 271449
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  271239 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 271338  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  271339 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 271438  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  271439 attacatgttt 271449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 644681 - 644471
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  644681 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 644582  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  644581 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 644482  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  644481 attacatgttt 644471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 830416 - 830206
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  830416 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 830317  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  830316 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 830217  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  830216 attacatgttt 830206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238184
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15319038 - 15319188
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15319038 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 15319137  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 150  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15319138 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15499407 - 15499557
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15499407 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 15499506  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 150  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15499507 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22006137 - 22006347
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  22006137 gagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22006236  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  22006237 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 22006336  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  22006337 attacatgttt 22006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22088673 - 22088883
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22088673 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 22088772  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  22088773 tgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaa 22088872  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  22088873 attacatgttt 22088883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661414
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685643
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 376
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193980
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 16193927  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 376  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193928 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 375
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373731
Alignment:
Q  119 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 43373573  T
Q  219 gaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgcta 317  Q
     || |||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || ||    
T  43373574 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgtta 43373673  T
Q  318 atagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373674 attgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 13720807 - 13721017
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  13720807 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 13720906  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  13720907 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13721006  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  13721007 attacatgttt 13721017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16195604 - 16195398
Alignment:
Q  5 tgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaa 103  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16195604 tgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaa 16195505  T
Q  104 aatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaatta 203  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||    
T  16195504 aatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatta 16195405  T
Q  204 catgttt 210  Q
    |||||||    
T  16195404 catgttt 16195398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16872930 - 16873140
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  16872930 gagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 16873029  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  16873030 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 16873129  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16873130 attacatgttt 16873140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405235
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgat 16405183  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405184 gttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  129 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaa 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || |||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  229 agttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtta 327  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||| || |||| ||||||     
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttg 17345618  T
Q  328 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17345617 ttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 13662144 - 13662354
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  13662144 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 13662243  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  13662244 tgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13662343  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  13662344 attacatgttt 13662354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24929043
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgat 24929002  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24929003 gttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  188 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  286 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  188 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  286 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  188 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  286 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 358  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17345957 - 17345885
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt 73  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  17345957 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcttaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgt 17345885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 31551 - 31928
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31551 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 31650  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31651 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 31750  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||||| || | |||||  || |||| |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| |    
T  31751 ttacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttc 31850  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| |  ||| || |  || ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31851 aattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128431
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggt 128280  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| |  ||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  128281 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggat 128379  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128380 gttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36469 - 36093
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36469 gagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 36370  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36369 gaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 36270  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||| || | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||    
T  36269 ttacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttca 36170  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||| |  ||| || | |||  |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36169 atagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 169788 - 169951
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  169788 gagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtat 169887  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatg 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169888 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 153886 - 154096
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  153886 gagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 153985  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  153986 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 154085  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
     ||||||||||    
T  154086 gttacatgttt 154096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48598
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgat 48650  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48649 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 19886537 - 19886913
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19886537 gagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtat 19886636  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19886637 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 19886736  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  19886737 ttacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 19886836  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886837 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794967
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaa 227  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||||     
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  228 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 326  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| ||||||    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgtt 19794918  T
Q  327 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794919 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982704
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgat 36982652  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982653 gttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 11231217 - 11231427
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11231217 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 11231316  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  11231317 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 11231416  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  11231417 attacatgttt 11231427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22513064 - 22513274
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22513064 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 22513163  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  22513164 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 22513263  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  22513264 attacatgttt 22513274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24685660 - 24685870
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24685660 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 24685759  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  24685760 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 24685859  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  24685860 attacatgttt 24685870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 28775686 - 28775896
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28775686 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 28775785  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  28775786 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 28775885  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  28775886 attacatgttt 28775896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689567
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820168
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906606
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34824852 - 34824642
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  34824852 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 34824753  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  34824752 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 34824653  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  34824652 attacatgttt 34824642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 375
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||  ||||| ||||||||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  244 gcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   |||||||||||||    
T  24341520 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcat 24341619  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341620 tgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 25265601  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265602 gttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12728769 - 12728559
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  12728769 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 12728670  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  12728669 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12728570  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  12728569 attacatgttt 12728559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015108
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
     | |||||||||||||||||   ||| | |||||||| | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | ||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttga 7508054  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508055 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462743
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 462790  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 370  Q
    ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462789 gtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 3798482 - 3798692
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  3798482 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgta 3798581  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  3798582 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 3798681  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  3798682 attacatgttt 3798692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891242
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgat 8891294  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891293 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778134
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 23778134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 375
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  145 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtg 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||  ||||| |||||||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  245 caaaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 343  Q
    |  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||| |    
T  43643089 ctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcact 43643188  T
Q  344 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643189 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8944223 - 8944013
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  8944223 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 8944124  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||    
T  8944123 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaa 8944024  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  8944023 attacatgttt 8944013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12635747 - 12635957
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||    
T  12635747 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgta 12635846  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  12635847 tgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12635946  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  12635947 attacatgttt 12635957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12641521 - 12641731
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  12641521 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 12641620  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  12641621 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaa 12641720  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  12641721 attacatgttt 12641731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16935970 - 16935760
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  16935970 gagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 16935871  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   ||||    
T  16935870 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaa 16935771  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  16935770 attacatgttt 16935760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17006630 - 17006420
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  17006630 gagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 17006531  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   ||||    
T  17006530 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaa 17006431  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  17006430 attacatgttt 17006420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 42177850 - 42178058
Alignment:
Q  3 gctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatg 101  Q
    |||||||||||||||| |||   | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  42177850 gctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatg 42177949  T
Q  102 aaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaat 201  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||||    
T  42177950 aaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaat 42178049  T
Q  202 tacatgttt 210  Q
    |||||||||    
T  42178050 tacatgttt 42178058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627576
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaa 227  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||     
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgat 20627427  T
Q  228 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 326  Q
    || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | | || |||| | ||||    
T  20627428 aacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgtt 20627527  T
Q  327 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627528 gtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23774513 - 23774370
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||| ||| || ||||||||||    
T  23774513 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgta 23774414  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23774413 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 24826576 - 24826646
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  24826576 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaaaggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396916
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 17396863  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||  || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396864 tattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888652
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  139 tcttg 143  Q
    |||||    
T  5888648 tcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21142178 - 21142062
Alignment:
Q  94 gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgtt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| ||||     
T  21142178 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtg 21142079  T
Q  194 gttgaaattacatgttt 210  Q
    | |||||||||||||||    
T  21142078 gatgaaattacatgttt 21142062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25213443 - 25213372
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggtt-agagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213443 gagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669358
Alignment:
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatg 19669358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37328
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 37277  T
Q  325 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37278 ttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680201
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 26680252  T
Q  325 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680251 ttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10644593 - 10644219
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  10644593 gagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtat 10644496  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  10644495 gaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaa 10644396  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| |||||||| || |||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||    
T  10644395 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttca 10644296  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644295 attgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47358027 - 47357654
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  47358027 gagctgaattgaagcaagagttgg-gttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtat 47357931  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47357930 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaa 47357831  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  47357830 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttca 47357731  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357730 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675352
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgat 15675300  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675301 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488659
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328092
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || |||  ||||| |||||||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  244 gcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||    
T  31115761 gctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcat 31115662  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115661 tgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18169346 - 18169137
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  18169346 gagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 18169248  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  18169247 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18169148  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  18169147 attacatgttt 18169137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118507
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   |  |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgat 54118455  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118456 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17145536 - 17145746
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  17145536 gagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 17145635  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  17145636 tgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 17145735  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  17145736 attacatgttt 17145746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||| ||||||||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  244 gcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    ||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||    
T  13246562 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcat 13246463  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246462 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 7131944 - 7132154
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||    
T  7131944 gagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttata 7132043  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  7132044 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 7132143  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  7132144 attacatgttt 7132154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15287124 - 15287334
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  15287124 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 15287223  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  15287224 tgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 15287323  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  15287324 attacatgttt 15287334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15294233 - 15294443
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  15294233 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 15294332  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  15294333 tgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 15294432  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  15294433 attacatgttt 15294443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20001100 - 20000890
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  20001100 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 20001001  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  20001000 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaa 20000901  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  20000900 attacatgttt 20000890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020653
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 19020653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 311
Target Start/End: Original strand, 10104262 - 10104449
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  10104262 tgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 10104361  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 311  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104362 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248385
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttg-catattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 18248385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22351943 - 22352086
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  22351943 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgta 22352042  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22352043 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 122020
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 122041  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  122040 gataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  49 gggttagtgattatcataatcatgtgtaattttg-catattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  148 gatg 151  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26339396 - 26339253
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  26339396 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 26339297  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26339296 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 367
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  153 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatgg 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||  ||| |    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  253 atgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttggg 350  Q
    ||||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || |||||  |||  || |||||| ||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  351 tatgcatattcatggat 367  Q
    | |||||||||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738436
Alignment:
Q  78 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  178 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 22738436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  277 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  330 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885753
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaa-tatgtgaagatgaaaagttatgaaaattg 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||  | |||  |||||||| |||||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaatta 40885683  T
Q  243 tgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 311  Q
    |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14996515 - 14996444
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatg 72  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14996515 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 176  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14952155 - 14952085
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952155 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 358
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 358  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795499
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatgaaa 9795499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 351
Target Start/End: Original strand, 7185981 - 7186068
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 351  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7185981 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggt 7186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 351  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| ||||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809740
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 357  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||| | |||| |||||| |||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggatatgcat 13809740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 376
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 362  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||   |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  363 tggattgatgatgt 376  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227809
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttca 22227886  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227885 attgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232506
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttca 22232583  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232582 attgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 5072265 - 5072640
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||| |||||||    
T  5072265 gagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcaagttgtat 5072363  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5072364 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 5072463  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  5072464 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttca 5072563  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072564 aatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116258
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  240 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 337  Q
    | ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||    
T  2116391 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 2116292  T
Q  338 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116291 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051554
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  240 ttgtgc 245  Q
    ||||||    
T  45051559 ttgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 375
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601370
Alignment:
Q  78 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 177  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  178 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttg 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| |||     
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  276 aattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17005015 - 17004805
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17005015 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 17004916  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  17004915 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 17004816  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  17004815 attacatgttt 17004805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18059637 - 18059847
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18059637 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgta 18059736  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  18059737 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 18059836  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  18059837 attacatgttt 18059847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 38054970 - 38055180
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  38054970 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgta 38055069  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  38055070 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 38055169  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  38055170 attacatgttt 38055180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17148945 - 17148734
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaaggggg-ttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  17148945 gagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggtaaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgt 17148846  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||    
T  17148845 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 17148746  T
Q  199 aattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||    
T  17148745 aattacatgttt 17148734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 19962378 - 19962525
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19962378 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 19962477  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19962478 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452589
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 51452644  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452643 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931345
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 20931397  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931396 gttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445679
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | ||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||  ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgat 20445731  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445730 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531444
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | ||    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20531596  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||  ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  20531595 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgat 20531496  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531495 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 20893638 - 20893889
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  20893638 tgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaat 20893737  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||    
T  20893738 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgat 20893837  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893838 gttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523556
Alignment:
Q  35 cttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattc 134  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  135 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||| |||| | |||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgttt 46523556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913037
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 20913089  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913088 cttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394222
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 41394274  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394273 gttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844714
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | ||    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 37844561  T
Q  225 gaaaagtta-tgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    || ||  || ||||||||||||  |||  ||||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||    
T  37844562 gataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 37844661  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844662 tgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22035824 - 22035681
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  22035824 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgta 22035725  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22035724 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 7640813 - 7640956
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| || ||||||||||    
T  7640813 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgta 7640912  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7640913 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 15861288 - 15861358
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861288 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051446
Alignment:
Q  321 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 20992 - 21367
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  20992 gagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtat 21091  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||  |||||    
T  21092 gaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaa 21191  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| |||    
T  21192 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaa 21291  T
Q  300 ttgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||| |  ||| || | ||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21292 ttgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 13938 - 14312
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  13938 gagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtat 14037  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||    
T  14038 gaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaa 14136  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| |||    
T  14137 ttacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaa 14236  T
Q  300 ttgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||| |  ||| |  | ||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14237 ttaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744377
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaa 227  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaa 16744229  T
Q  228 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16744230 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttg 16744329  T
Q  328 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744330 tagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41270450 - 41270075
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  41270450 gagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatctactcatgttgtat 41270352  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41270351 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaa 41270252  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  41270251 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttca 41270152  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270151 aatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 55316594 - 55316219
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  55316594 gagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtat 55316496  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55316495 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 55316396  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  55316395 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttca 55316296  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316295 aatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 17912495 - 17912744
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 17912593  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| || |||| ||||    
T  17912594 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatg 17912693  T
Q  325 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912694 ttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16821513 - 16821139
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  16821513 gagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtat 16821416  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16821415 gaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 16821316  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    ||||||||| |||||||| || |||  ||| |||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||    
T  16821315 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttca 16821216  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821215 attgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||| |    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  240 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 338  Q
    | ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  15614970 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 15614871  T
Q  339 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614870 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936890
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaa 238  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||||    
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  239 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 337  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 15936852  T
Q  338 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936853 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49232813 - 49232603
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  49232813 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 49232714  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  49232713 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 49232614  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  49232613 attacatgttt 49232603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938729
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaa 238  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||||    
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  239 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 337  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 15938694  T
Q  338 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 372  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938695 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 14842449 - 14842824
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctca--tgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | |||||| |||||||  ||||||    
T  14842449 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgttgt 14842547  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    |||||  || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  14842548 atgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtga 14842646  T
Q  199 aattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||| |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |    
T  14842647 aattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 14842746  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842747 aattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859287
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   | ||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 15859235  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859236 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 376
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158282
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 51158229  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 376  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158230 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1467618 - 1467828
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1467618 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 1467717  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  1467718 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 1467817  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  1467818 attacatgttt 1467828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 15468219 - 15468596
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  15468219 gagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgta 15468318  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  15468319 tgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 15468418  T
Q  200 attacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatg-aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtg 296  Q
    |||||||||||  || |||||  | |||  |||| ||| ||||| | |  ||| |||| ||||||| ||||| |  ||||| |||| | | |||| | |     
T  15468419 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 15468517  T
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468518 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22275586 - 22275209
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  22275586 gagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgta 22275487  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  22275486 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 22275387  T
Q  200 attacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatg-aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtg 296  Q
    |||||||||||  || |||||  | |||  |||| ||| ||||| | |  ||| |||| ||||||| ||||| |  ||||| |||| | | |||| | |     
T  22275386 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 22275288  T
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275287 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449404
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12264671 - 12264881
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  12264671 gagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 12264770  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  12264771 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12264870  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  12264871 attacatgttt 12264881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12812218 - 12812042
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  12812218 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgta 12812119  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  12812118 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18911370 - 18911160
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  18911370 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 18911271  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  18911270 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18911171  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  18911170 attacatgttt 18911160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25059116 - 25058906
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  25059116 gagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgta 25059017  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  25059016 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 25058917  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  25058916 attacatgttt 25058906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13838905
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 13839046  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  13839045 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 13838946  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13838945 gttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030410
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||| ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgat 12030358  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030359 gttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049810
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgat 2049862  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049861 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18896923 - 18897099
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || |||||||||||||    
T  18896923 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgta 18897022  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897023 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902179
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 12902179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5228689 - 5228480
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||| |||||||||  ||    
T  5228689 gagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgtta 5228590  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  5228589 tgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 5228491  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  5228490 attacatgttt 5228480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54651834 - 54651625
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||    
T  54651834 gagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgta 54651735  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||    
T  54651734 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaa 54651635  T
Q  200 attacatgtt 209  Q
    ||| ||||||    
T  54651634 attgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955153
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13955100  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955101 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975985
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13975932  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975933 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860805
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 45860858  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860857 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  266 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 365  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  366 attgatgatg 375  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  266 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 365  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  366 attgatgatg 375  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44229268 - 44229152
Alignment:
Q  94 gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgtt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||     
T  44229268 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtg 44229169  T
Q  194 gttgaaattacatgttt 210  Q
    | |||||||||||||||    
T  44229168 gatgaaattacatgttt 44229152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  266 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 365  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  366 attgatgatg 375  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  266 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 365  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  366 attgatgatg 375  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986263
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 8268612 - 8268683
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatg 72  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8268612 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 8275712 - 8275783
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatg 72  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8275712 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23492766 - 23492696
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23492766 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Original strand, 11329098 - 11329191
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 357  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  11329098 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcat 11329191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17139618 - 17139525
Alignment:
Q  264 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 357  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  17139618 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcat 17139525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 374
Target Start/End: Original strand, 38811168 - 38811256
Alignment:
Q  287 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgat 374  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  38811168 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgat 38811256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3338 - 2966
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||   | |||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3338 gagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttgtat 3239  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  3238 gaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 3139  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgca 298  Q
    ||||||||| || ||||| || |||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |    
T  3138 ttacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgtttta 3039  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    ||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3038 attgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 13206 - 13445
Alignment:
Q  4 ctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaa 103  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13206 ctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaa 13303  T
Q  104 aatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaatta 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13304 aatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 13403  T
Q  204 catgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||    
T  13404 catgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4099 - 3722
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  4099 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 4000  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  3999 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 3900  T
Q  200 attacatgtttaaatatgt-gaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| |    
T  3899 attacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 3800  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3799 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9596
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  240 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 338  Q
    | ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  9464 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 9563  T
Q  339 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9564 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16494
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  140 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaa 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  240 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 338  Q
    | ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  16362 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 16461  T
Q  339 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16462 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1181 - 1424
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  1181 gagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcatgttgtat 1279  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1280 gaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaa 1379  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| |||||||||| |||||||    
T  1380 ttacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 5091 - 5466
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  5091 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgta 5190  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5191 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 5290  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  5291 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttca 5390  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5391 attgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43372 - 42997
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatatt-ctcatgttgta 99  Q
    |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  43372 gagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgta 43275  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  43274 tgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 43175  T
Q  200 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    |||||||||| |||||||| || |||  |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |    
T  43174 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttc 43075  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43074 aagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39480 - 39270
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  39480 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 39381  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  39380 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 39281  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  39280 attacatgttt 39270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107747
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaa 238  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || |||| ||||| | |||    
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  239 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 337  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 107785  T
Q  338 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107784 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 64400 - 64780
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  64400 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtat 64498  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-----attgatgttagttgtatgattgttgt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||| |  ||||||||||||||     
T  64499 gaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttgg 64598  T
Q  196 tgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattctt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| |||    
T  64599 tgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgctt 64698  T
Q  294 gtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64699 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 408 - 35
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtat 100  Q
    ||||||||||||||| || ||| |   |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| |||    
T  408 gagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcat-tgctcatgttatat 312  T
Q  101 gaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  311 gaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaa 212  T
Q  201 ttacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 298  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||| | |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||    
T  211 ttacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttca 112  T
Q  299 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  111 aatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19206
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgat 19258  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19257 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgat 21342  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21341 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 844 - 1218
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctca--tgttgt 98  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | | |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||| || |||||||  ||||||    
T  844 gagctgaattgaatcaagagttggggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgt 942  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    |||||  || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  943 atgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 1041  T
Q  199 aattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| |    
T  1042 aattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttc 1140  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||||| | |||| ||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1141 aagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31686 - 31476
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31686 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 31587  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  31586 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 31487  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  31486 attacatgttt 31476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39813
Alignment:
Q  88 tctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatg 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  188 attgttgttgaaattacatgttt 210  Q
     |||| | |||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgttt 39813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12115
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgat 12167  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166 gttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37176
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaa 227  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||     
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 37027  T
Q  228 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 326  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||    
T  37028 aagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgtt 37127  T
Q  327 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37128 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8849
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgat 8901  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8900 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  244 gcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||| | |||||||||||||    
T  148853 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcat 148754  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148753 tgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 5952 - 6326
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctca--tgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||    || |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | |||||| |||||||  ||||||    
T  5952 gagctgaattgaagcaagagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattt-tcactttgcaaattctcaaatgttgt 6050  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    |||||  || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  6051 atgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 6149  T
Q  199 aattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 297  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| |    
T  6150 aattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttc 6248  T
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    || ||||||| | |||| ||||   ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6249 aagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22637
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26892
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1748
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48187
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgat 48239  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238 gttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 373
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3843
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgat 3793  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 373  Q
    ||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3794 gttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1124
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 1176  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1175 attgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41648
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaa 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  228 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 326  Q
    ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||  ||||||    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgtt 41697  T
Q  327 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41696 gttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13506
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 13558  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13557 gttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 10627 - 10778
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  10627 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 10726  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10727 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1664
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  1454 gagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 1553  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||    
T  1554 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1653  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  1654 attacatgttt 1664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 34472 - 34724
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| || ||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaat 34571  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaataga 322  Q
       ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | ||    
T  34572 atgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttga 34671  T
Q  323 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34672 tgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8878
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgat 8930  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8929 gttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29539 - 29388
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29539 gagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 29440  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29439 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2770 - 2559
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa--ttttgcatattctcatgttgt 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||    
T  2770 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgt 2671  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||    
T  2670 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtga 2571  T
Q  199 aattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||    
T  2570 aattacatgttt 2559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 172156 - 171916
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  172156 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 172057  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  172056 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 171957  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  171956 gttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 177859 - 177619
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  177859 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 177760  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  177759 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 177660  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  177659 gttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 7335 - 7545
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||    
T  7335 gagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgta 7434  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | ||||    
T  7435 tgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaa 7534  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  7535 attacatgttt 7545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 5073 - 5324
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  5073 tgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 5172  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  5173 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 5272  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5273 gttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123427
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 123375  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123376 gttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1603
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||   | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  1393 gagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 1492  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | ||||    
T  1493 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 1592  T
Q  200 attacatgttt 210  Q
    |||||||||||    
T  1593 attacatgttt 1603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41733
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |    
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgtt 41781  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 371  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41780 gttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  144 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaagttatgaaaattgt 243  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||| ||||||||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  244 gcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 342  Q
    || |||| | |||||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||    
T  272157 gctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcat 272058  T
Q  343 tgcttgggtatgcatattcatggattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  272057 tgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8440
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    |  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 8388  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8389 gttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26678
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 26626  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26627 gttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Original strand, 546 - 797
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    ||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgat 745  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  746 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247694
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |   | ||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 323  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | | |||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgat 247653  T
Q  324 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 364  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247654 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 34037 - 34247
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcat-gttgt 98  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||    
T  34037 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgt 34136  T
Q  99 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttga 198  Q
    |||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||    
T  34137 atgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 34235  T
Q  199 aattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||    
T  34236 aattacatgttt 34247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6974 - 6831
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  6974 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgta 6875  T
Q  100 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6874 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5660
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    || |||| ||||| |||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10428
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  139 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54416
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 137  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  138 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaagttatg 235  Q
      |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||  || |||||  | |||  ||||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg 54556  T
Q  236 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 334  Q
     ||||||| |  ||| | |||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||| | || |     
T  54555 -aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtggg 54457  T
Q  335 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54456 tgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45197
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt-ttgcatattctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 137  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  138 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 45197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51314
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  225 gaaaagttatgaaaattgtgc 245  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3581
Alignment:
Q  78 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 177  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  178 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 209  Q
    |  | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgtt 3581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  119 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3252 - 3210
Alignment:
Q  331 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 373  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3252 ttgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 54042
Alignment:
Q  78 ttttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 177  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||  | ||||||||||||||     
T  54173 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatga 54074  T
Q  178 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 209  Q
    |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  54073 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 54042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  277 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Original strand, 23631 - 23769
Alignment:
Q  4 ctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatga 102  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23631 ctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatga 23730  T
Q  103 aaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 141  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23731 aaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 215
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89556
Alignment:
Q  125 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaata 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaata 89556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 130950 - 130880
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  130950 gagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 79616 - 79537
Alignment:
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  79616 caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 79537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatg-ttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  138 ctcttg 143  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  286 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7443
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatca-tgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 138  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  139 tcttg 143  Q
    |||||    
T  7447 tcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56196
Alignment:
Q  128 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttt 56196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 375
Target Start/End: Original strand, 26 - 115
Alignment:
Q  286 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 17171 - 17241
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcat 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17171 gagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13333
Alignment:
Q  40 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa-ttttgcatattctcatgttgtatgaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  298 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 375  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 1 - 85
Alignment:
Q  126 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 154310 - 154373
Alignment:
Q  1 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatca 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  154310 gagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  297 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3201 times since January 2019
Visitors: 4030