View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0648_low_58 (Length: 253)

Name: NF0648_low_58
Description: NF0648
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0648_low_58
NF0648_low_58
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (48-241)||(1060-1253)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (48-241)||(27345642-27345835)
chr8 (48-241)||(23117135-23117328)
chr8 (48-241)||(10956697-10956890)
chr8 (56-241)||(26486032-26486217)
chr8 (48-241)||(14746532-14746724)
chr8 (56-241)||(16266882-16267066)
chr8 (56-241)||(40144306-40144490)
chr8 (58-241)||(3224695-3224878)
chr8 (58-239)||(3697580-3697760)
chr8 (48-228)||(23224772-23224950)
chr8 (31-229)||(16887322-16887519)
chr8 (31-229)||(14736845-14737042)
chr8 (31-229)||(27909608-27909806)
chr8 (31-229)||(27956027-27956225)
chr8 (31-229)||(36800466-36800664)
chr8 (105-245)||(11392614-11392753)
chr8 (46-229)||(14765513-14765694)
chr8 (55-229)||(28980658-28980831)
chr8 (55-229)||(28985878-28986051)
chr8 (46-229)||(4520758-4520939)
chr8 (106-241)||(14416586-14416720)
chr8 (58-189)||(31418800-31418935)
chr8 (35-229)||(35540962-35541155)
chr8 (48-166)||(6588040-6588158)
chr8 (41-229)||(14563464-14563648)
chr8 (56-229)||(9205374-9205547)
chr8 (58-189)||(31412618-31412753)
chr8 (115-241)||(29328188-29328313)
chr8 (106-239)||(43687384-43687515)
chr8 (105-238)||(25701583-25701715)
chr8 (115-239)||(29299092-29299214)
chr8 (115-239)||(29305638-29305760)
chr8 (58-137)||(5240015-5240094)
chr8 (58-205)||(23825059-23825210)
chr8 (41-166)||(213907-214030)
chr8 (41-166)||(238224-238347)
chr8 (41-166)||(727530-727653)
chr8 (41-166)||(800031-800154)
chr8 (41-166)||(851424-851547)
chr8 (58-137)||(30767112-30767191)
chr8 (58-181)||(21281993-21282119)
chr8 (184-241)||(6588132-6588189)
chr8 (100-239)||(23653816-23653957)
chr8 (31-103)||(13362115-13362186)
chr8 (163-239)||(20783932-20784006)
chr8 (105-189)||(23653095-23653182)
chr8 (182-229)||(214002-214049)
chr8 (182-229)||(238205-238252)
chr8 (182-229)||(727625-727672)
chr8 (182-229)||(800126-800173)
chr8 (182-229)||(851519-851566)
chr8 (123-190)||(39363480-39363550)
chr8 (116-181)||(18609786-18609853)
chr8 (123-183)||(22025700-22025762)
chr8 (123-183)||(22050201-22050263)
chr8 (123-183)||(22055719-22055781)
chr8 (123-183)||(22177586-22177648)
chr8 (115-157)||(27873790-27873832)
chr8 (187-241)||(27873818-27873871)
chr8 (115-157)||(27889920-27889962)
chr8 (187-241)||(27889948-27890001)
chr8 (115-157)||(27948578-27948620)
chr8 (187-241)||(27948606-27948659)
chr8 (115-181)||(14057724-14057792)
chr8 (163-239)||(19859550-19859626)
chr8 (123-187)||(21690544-21690611)
chr8 (147-187)||(21686220-21686260)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (56-241)||(21962937-21963122)
chr1 (48-241)||(4231112-4231305)
chr1 (48-241)||(17146182-17146374)
chr1 (48-241)||(42626124-42626317)
chr1 (56-241)||(20292612-20292797)
chr1 (48-241)||(20570666-20570858)
chr1 (48-205)||(52990639-52990796)
chr1 (31-229)||(18026762-18026960)
chr1 (48-195)||(24850025-24850171)
chr1 (56-208)||(9269865-9270017)
chr1 (31-229)||(28556512-28556709)
chr1 (48-229)||(20277262-20277441)
chr1 (48-229)||(3652709-3652888)
chr1 (31-229)||(6740426-6740623)
chr1 (46-229)||(37675317-37675498)
chr1 (46-229)||(37682010-37682191)
chr1 (42-229)||(38908064-38908249)
chr1 (46-229)||(39094245-39094426)
chr1 (32-229)||(22185614-22185809)
chr1 (31-229)||(18418032-18418229)
chr1 (55-229)||(39189691-39189864)
chr1 (48-210)||(20396906-20397067)
chr1 (106-239)||(49328016-49328148)
chr1 (31-208)||(36212042-36212218)
chr1 (115-241)||(29596855-29596980)
chr1 (56-229)||(31535310-31535483)
chr1 (56-229)||(31564027-31564200)
chr1 (56-229)||(48427785-48427958)
chr1 (58-189)||(23195584-23195718)
chr1 (56-166)||(20299290-20299400)
chr1 (110-239)||(47484094-47484222)
chr1 (139-241)||(29602290-29602391)
chr1 (58-189)||(24079486-24079621)
chr1 (58-189)||(24109133-24109268)
chr1 (159-245)||(20076945-20077031)
chr1 (115-241)||(21920788-21920913)
chr1 (105-239)||(43088373-43088507)
chr1 (106-239)||(36614918-36615051)
chr1 (58-205)||(21541991-21542142)
chr1 (58-205)||(42095994-42096145)
chr1 (140-208)||(20396864-20396932)
chr1 (184-241)||(20299374-20299431)
chr1 (121-202)||(10813614-10813697)
chr1 (163-239)||(15316566-15316641)
chr1 (123-183)||(29554560-29554623)
chr1 (123-183)||(3706877-3706939)
chr1 (105-181)||(19664246-19664324)
chr1 (123-183)||(22448378-22448440)
chr1 (123-187)||(30491550-30491617)
chr1 (123-183)||(20941971-20942034)
chr1 (163-238)||(21664203-21664278)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (48-241)||(817-1010)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (48-241)||(19533-19726)
scaffold0103 (48-241)||(23859-24052)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (56-241)||(94526-94711)
chr6 (48-241)||(4106621-4106814)
chr6 (48-241)||(8069726-8069918)
chr6 (48-239)||(14582730-14582919)
chr6 (48-229)||(29158992-29159174)
chr6 (31-229)||(30799481-30799677)
chr6 (31-229)||(1070525-1070723)
chr6 (31-229)||(17309581-17309779)
chr6 (31-229)||(24369096-24369292)
chr6 (53-229)||(34134014-34134189)
chr6 (31-229)||(15332166-15332364)
chr6 (48-229)||(25315689-25315868)
chr6 (48-229)||(26203183-26203362)
chr6 (31-229)||(25463747-25463946)
chr6 (105-241)||(27767341-27767476)
chr6 (21-229)||(22406520-22406728)
chr6 (115-241)||(10470768-10470893)
chr6 (115-241)||(10464246-10464371)
chr6 (56-229)||(16223702-16223875)
chr6 (58-205)||(5290235-5290384)
chr6 (106-239)||(13940416-13940549)
chr6 (48-157)||(19096819-19096928)
chr6 (58-189)||(26418774-26418909)
chr6 (115-239)||(29925687-29925810)
chr6 (58-189)||(23235037-23235171)
chr6 (106-239)||(12447234-12447367)
chr6 (105-239)||(17207776-17207909)
chr6 (105-187)||(17894611-17894693)
chr6 (106-239)||(23021387-23021520)
chr6 (58-205)||(24562217-24562368)
chr6 (160-241)||(13128303-13128383)
chr6 (31-166)||(24362521-24362654)
chr6 (106-205)||(25347065-25347167)
chr6 (32-93)||(17702046-17702105)
chr6 (123-181)||(19300787-19300846)
chr6 (122-159)||(13135927-13135964)
chr6 (105-181)||(15457447-15457524)
chr6 (105-181)||(15464042-15464119)
chr6 (163-239)||(23233468-23233544)
chr6 (184-229)||(24362628-24362673)
chr6 (122-183)||(1592758-1592821)
chr6 (163-239)||(17414038-17414113)
chr6 (123-183)||(19726606-19726668)
chr6 (163-239)||(19451326-19451402)
chr6 (163-239)||(19472384-19472460)
chr6 (123-187)||(22798631-22798698)
chr6 (163-239)||(10582900-10582975)
chr6 (163-203)||(19449332-19449372)
chr6 (126-183)||(21724875-21724934)
chr6 (105-137)||(25470854-25470886)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (48-241)||(19800382-19800574)
chr5 (48-241)||(22507434-22507627)
chr5 (48-241)||(19508038-19508230)
chr5 (48-241)||(22500856-22501046)
chr5 (48-241)||(597150-597341)
chr5 (31-229)||(25852832-25853031)
chr5 (31-229)||(25846200-25846399)
chr5 (21-229)||(15461321-15461527)
chr5 (31-229)||(5582331-5582528)
chr5 (31-229)||(10686003-10686200)
chr5 (31-229)||(40011026-40011223)
chr5 (31-229)||(14615004-14615202)
chr5 (31-229)||(22248295-22248493)
chr5 (31-219)||(11994994-11995182)
chr5 (44-229)||(38013606-38013789)
chr5 (31-229)||(43028899-43029096)
chr5 (55-229)||(7508069-7508242)
chr5 (55-229)||(14889046-14889219)
chr5 (32-229)||(1111732-1111927)
chr5 (36-229)||(5454351-5454544)
chr5 (46-229)||(17938938-17939119)
chr5 (55-229)||(14882369-14882542)
chr5 (55-229)||(24795070-24795243)
chr5 (55-229)||(24800437-24800610)
chr5 (48-229)||(18895049-18895228)
chr5 (36-229)||(37540012-37540204)
chr5 (36-229)||(37547556-37547748)
chr5 (115-241)||(28259915-28260040)
chr5 (115-241)||(20990293-20990418)
chr5 (56-166)||(29746666-29746776)
chr5 (106-239)||(5341762-5341894)
chr5 (106-239)||(24057583-24057715)
chr5 (58-239)||(24751589-24751772)
chr5 (105-241)||(41878046-41878181)
chr5 (58-189)||(27635985-27636119)
chr5 (48-229)||(30780942-30781120)
chr5 (115-241)||(7773690-7773814)
chr5 (106-239)||(23081782-23081915)
chr5 (58-239)||(24669051-24669234)
chr5 (58-239)||(24738820-24739003)
chr5 (105-241)||(37566020-37566155)
chr5 (106-236)||(23544907-23545037)
chr5 (106-239)||(23076334-23076467)
chr5 (105-239)||(26650385-26650517)
chr5 (105-239)||(26921970-26922102)
chr5 (115-241)||(16775084-16775209)
chr5 (48-166)||(18566509-18566626)
chr5 (48-166)||(20347062-20347180)
chr5 (48-166)||(20340458-20340576)
chr5 (106-239)||(25419803-25419936)
chr5 (106-239)||(18941257-18941388)
chr5 (110-239)||(39608916-39609044)
chr5 (106-236)||(19801931-19802061)
chr5 (106-236)||(19362581-19362711)
chr5 (56-137)||(33536239-33536319)
chr5 (184-241)||(29746635-29746692)
chr5 (187-241)||(18566603-18566657)
chr5 (58-205)||(1857594-1857745)
chr5 (58-205)||(21675562-21675713)
chr5 (187-241)||(20340553-20340607)
chr5 (187-241)||(20347157-20347211)
chr5 (184-241)||(41877876-41877932)
chr5 (106-157)||(22379509-22379560)
chr5 (58-94)||(20831713-20831749)
chr5 (163-239)||(21829546-21829621)
chr5 (123-183)||(758365-758427)
chr5 (123-183)||(22312943-22313005)
chr5 (184-239)||(22379543-22379597)
chr5 (123-157)||(41877915-41877949)
chr5 (105-181)||(22460084-22460161)
chr5 (105-181)||(28371543-28371620)
chr5 (105-181)||(38145870-38145947)
chr5 (105-181)||(42960064-42960141)
chr5 (163-239)||(23561669-23561744)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (48-241)||(45959757-45959950)
chr4 (48-241)||(54844963-54845156)
chr4 (50-245)||(42956033-42956228)
chr4 (48-241)||(34772041-34772234)
chr4 (48-241)||(5938798-5938991)
chr4 (48-241)||(45142565-45142757)
chr4 (48-241)||(1583783-1583976)
chr4 (48-241)||(7359122-7359314)
chr4 (48-241)||(7356129-7356321)
chr4 (56-241)||(47872437-47872622)
chr4 (48-229)||(21396689-21396871)
chr4 (56-239)||(11202448-11202630)
chr4 (56-241)||(35462627-35462810)
chr4 (31-229)||(29382792-29382991)
chr4 (48-203)||(45151372-45151526)
chr4 (31-229)||(3260019-3260216)
chr4 (31-229)||(52500408-52500605)
chr4 (48-229)||(391001-391180)
chr4 (31-229)||(23436010-23436207)
chr4 (42-229)||(29448704-29448889)
chr4 (42-229)||(29455388-29455573)
chr4 (46-229)||(11937031-11937212)
chr4 (31-208)||(50082117-50082293)
chr4 (48-229)||(26395559-26395739)
chr4 (105-241)||(19128358-19128493)
chr4 (105-241)||(31664992-31665127)
chr4 (105-239)||(33097026-33097159)
chr4 (105-241)||(20894926-20895061)
chr4 (48-229)||(39266265-39266443)
chr4 (115-241)||(2972748-2972873)
chr4 (105-239)||(42220364-42220497)
chr4 (56-229)||(3266647-3266820)
chr4 (105-241)||(20889307-20889442)
chr4 (105-241)||(49548599-49548734)
chr4 (115-234)||(21881534-21881652)
chr4 (115-241)||(33221312-33221437)
chr4 (56-229)||(49240872-49241045)
chr4 (56-229)||(49749586-49749759)
chr4 (58-189)||(13452162-13452295)
chr4 (106-239)||(46044887-46045020)
chr4 (115-241)||(36037505-36037630)
chr4 (106-239)||(899527-899659)
chr4 (106-239)||(30396132-30396262)
chr4 (58-189)||(37881331-37881466)
chr4 (123-241)||(49548384-49548502)
chr4 (106-236)||(41404726-41404856)
chr4 (31-156)||(15470652-15470776)
chr4 (48-103)||(3096699-3096752)
chr4 (105-189)||(10977129-10977216)
chr4 (184-229)||(391175-391220)
chr4 (163-239)||(15360884-15360959)
chr4 (123-183)||(23121599-23121661)
chr4 (123-181)||(27905211-27905270)
chr4 (115-181)||(14910577-14910645)
chr4 (163-239)||(16484640-16484716)
chr4 (123-187)||(18271262-18271329)
chr4 (163-239)||(18166347-18166422)
chr4 (147-187)||(18261324-18261364)
chr4 (163-203)||(53905413-53905453)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (48-241)||(48774667-48774859)
chr3 (48-241)||(38742842-38743034)
chr3 (48-236)||(12271449-12271636)
chr3 (48-241)||(9771965-9772156)
chr3 (58-210)||(20187628-20187780)
chr3 (31-229)||(54833248-54833447)
chr3 (31-229)||(10767647-10767844)
chr3 (31-217)||(21151530-21151715)
chr3 (31-229)||(43724125-43724323)
chr3 (44-229)||(29493457-29493641)
chr3 (48-229)||(45611575-45611754)
chr3 (41-229)||(10381841-10382027)
chr3 (41-229)||(10410494-10410680)
chr3 (46-229)||(53571295-53571476)
chr3 (55-229)||(3782813-3782986)
chr3 (48-229)||(2499105-2499285)
chr3 (51-226)||(14845232-14845406)
chr3 (32-229)||(50656049-50656244)
chr3 (115-241)||(16331643-16331768)
chr3 (105-239)||(30596910-30597043)
chr3 (106-239)||(8373976-8374108)
chr3 (106-239)||(32388068-32388200)
chr3 (105-241)||(54520024-54520159)
chr3 (115-241)||(9691457-9691582)
chr3 (56-229)||(28758814-28758987)
chr3 (56-229)||(50142830-50143003)
chr3 (105-241)||(29545212-29545347)
chr3 (115-241)||(16833209-16833334)
chr3 (115-241)||(29550911-29551036)
chr3 (106-239)||(12725175-12725306)
chr3 (58-189)||(12419326-12419460)
chr3 (115-241)||(46071160-46071285)
chr3 (106-239)||(11956647-11956778)
chr3 (56-229)||(47121063-47121235)
chr3 (56-229)||(47128431-47128603)
chr3 (122-241)||(19344202-19344320)
chr3 (115-241)||(20377290-20377415)
chr3 (140-241)||(20187754-20187854)
chr3 (58-189)||(10597842-10597976)
chr3 (123-241)||(54520256-54520374)
chr3 (62-239)||(11850722-11850901)
chr3 (58-189)||(18757071-18757206)
chr3 (106-239)||(49163134-49163265)
chr3 (58-181)||(31690713-31690839)
chr3 (58-205)||(8583385-8583536)
chr3 (58-205)||(14084466-14084617)
chr3 (58-205)||(14089867-14090018)
chr3 (58-137)||(49399408-49399487)
chr3 (58-157)||(31943376-31943477)
chr3 (106-174)||(18957746-18957814)
chr3 (115-167)||(27029558-27029610)
chr3 (115-167)||(27031726-27031778)
chr3 (85-205)||(13968924-13969048)
chr3 (85-205)||(13974399-13974523)
chr3 (184-241)||(3802554-3802610)
chr3 (184-241)||(3802716-3802772)
chr3 (184-241)||(54091786-54091842)
chr3 (105-157)||(3802519-3802571)
chr3 (58-98)||(13969063-13969103)
chr3 (58-98)||(13974538-13974578)
chr3 (105-157)||(15374662-15374714)
chr3 (140-190)||(17512558-17512609)
chr3 (115-157)||(54091825-54091867)
chr3 (184-241)||(15374697-15374753)
chr3 (90-205)||(24123294-24123413)
chr3 (163-239)||(11644878-11644953)
chr3 (123-183)||(14652830-14652892)
chr3 (123-183)||(16382994-16383056)
chr3 (123-186)||(17496119-17496185)
chr3 (123-157)||(3802699-3802733)
chr3 (163-205)||(11305863-11305905)
chr3 (149-186)||(15935106-15935143)
chr3 (170-239)||(18961002-18961070)
chr3 (126-183)||(14292706-14292765)
chr3 (115-183)||(18913998-18914069)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (48-241)||(35244048-35244241)
chr2 (48-241)||(22013126-22013319)
chr2 (48-241)||(27037170-27037363)
chr2 (48-241)||(33976-34169)
chr2 (48-229)||(2385947-2386129)
chr2 (48-230)||(28292645-28292827)
chr2 (58-241)||(11466008-11466190)
chr2 (48-229)||(24426866-24427048)
chr2 (31-229)||(44091114-44091311)
chr2 (31-219)||(27729418-27729605)
chr2 (41-229)||(20850110-20850296)
chr2 (31-229)||(4077330-4077527)
chr2 (44-229)||(11360265-11360448)
chr2 (46-229)||(4071570-4071751)
chr2 (31-229)||(21604673-21604871)
chr2 (46-229)||(24481625-24481806)
chr2 (46-229)||(30196540-30196721)
chr2 (55-229)||(36984591-36984764)
chr2 (42-229)||(1067018-1067203)
chr2 (58-189)||(28971387-28971521)
chr2 (42-217)||(1061635-1061808)
chr2 (55-229)||(31828547-31828719)
chr2 (55-229)||(31833899-31834071)
chr2 (105-239)||(15643311-15643444)
chr2 (115-241)||(27272244-27272370)
chr2 (31-208)||(71520-71697)
chr2 (105-241)||(13101194-13101329)
chr2 (100-241)||(17592553-17592695)
chr2 (106-239)||(32911504-32911637)
chr2 (32-203)||(35585269-35585438)
chr2 (122-241)||(14563832-14563950)
chr2 (121-239)||(36800556-36800673)
chr2 (58-189)||(21133361-21133496)
chr2 (106-236)||(25590226-25590354)
chr2 (106-239)||(45028492-45028625)
chr2 (58-137)||(6744487-6744566)
chr2 (58-137)||(43693336-43693415)
chr2 (58-181)||(19649660-19649787)
chr2 (58-205)||(27367674-27367825)
chr2 (59-205)||(200577-200727)
chr2 (116-183)||(23062494-23062564)
chr2 (123-183)||(2105577-2105640)
chr2 (163-239)||(24660500-24660576)
chr2 (123-183)||(20724032-20724095)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (48-241)||(13964056-13964249)
chr7 (48-241)||(37285134-37285327)
chr7 (58-237)||(46174260-46174439)
chr7 (48-229)||(2438809-2438990)
chr7 (48-241)||(46649695-46649887)
chr7 (56-245)||(2388607-2388795)
chr7 (48-229)||(20019737-20019917)
chr7 (56-241)||(17468306-17468490)
chr7 (56-241)||(17584724-17584908)
chr7 (31-229)||(18437232-18437430)
chr7 (31-229)||(11339678-11339877)
chr7 (31-229)||(11899375-11899574)
chr7 (31-229)||(17726398-17726597)
chr7 (31-229)||(642457-642656)
chr7 (24-229)||(11878969-11879173)
chr7 (62-241)||(49158683-49158860)
chr7 (46-229)||(5187309-5187491)
chr7 (55-229)||(2281019-2281192)
chr7 (48-219)||(33404579-33404749)
chr7 (36-229)||(26113821-26114014)
chr7 (32-229)||(1317675-1317872)
chr7 (46-229)||(8197265-8197446)
chr7 (46-229)||(8213336-8213517)
chr7 (48-219)||(32627324-32627493)
chr7 (46-229)||(42058474-42058655)
chr7 (32-229)||(40922988-40923183)
chr7 (31-229)||(2026290-2026487)
chr7 (31-229)||(26090016-26090215)
chr7 (36-229)||(26120434-26120627)
chr7 (41-229)||(11299719-11299903)
chr7 (41-229)||(11308083-11308267)
chr7 (105-239)||(16843927-16844059)
chr7 (106-236)||(19439295-19439424)
chr7 (55-229)||(49150517-49150691)
chr7 (55-229)||(49157207-49157381)
chr7 (106-239)||(23520986-23521117)
chr7 (56-229)||(40684828-40685001)
chr7 (48-166)||(15622094-15622212)
chr7 (58-239)||(32771430-32771614)
chr7 (56-229)||(749776-749949)
chr7 (58-189)||(37244414-37244549)
chr7 (56-229)||(48987986-48988159)
chr7 (58-189)||(15086029-15086163)
chr7 (106-239)||(13019691-13019823)
chr7 (115-239)||(12461510-12461633)
chr7 (58-185)||(18958539-18958670)
chr7 (58-189)||(16952343-16952477)
chr7 (56-166)||(37379869-37379978)
chr7 (58-205)||(4279898-4280049)
chr7 (58-205)||(19616230-19616381)
chr7 (58-189)||(3327734-3327869)
chr7 (56-167)||(13453884-13453986)
chr7 (56-167)||(21757279-21757381)
chr7 (184-241)||(37379952-37380009)
chr7 (76-189)||(26289874-26289991)
chr7 (58-181)||(36306152-36306278)
chr7 (184-241)||(13453854-13453911)
chr7 (184-241)||(21757354-21757411)
chr7 (31-166)||(30602946-30603080)
chr7 (32-103)||(12404103-12404172)
chr7 (184-239)||(30271838-30271892)
chr7 (182-229)||(30602927-30602974)
chr7 (123-183)||(11220227-11220290)
chr7 (163-239)||(14179066-14179141)
chr7 (185-229)||(15622187-15622231)
chr7 (123-183)||(14431989-14432051)
chr7 (123-183)||(15338826-15338888)
chr7 (123-183)||(15723330-15723392)
chr7 (123-183)||(16109181-16109243)
chr7 (123-183)||(35962852-35962914)
chr7 (105-183)||(13678264-13678345)
chr7 (163-205)||(15437697-15437739)
chr7 (105-181)||(147049-147126)
chr7 (105-181)||(14320683-14320760)
chr7 (105-181)||(14565690-14565767)
chr7 (163-239)||(46624886-46624962)
chr7 (105-137)||(12591798-12591830)
chr7 (105-137)||(12711063-12711095)
chr7 (105-137)||(13124134-13124166)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (48-239)||(15028-15218)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (48-241)||(512576-512768)
scaffold0001 (106-239)||(178986-179119)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (48-230)||(31565-31747)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (48-241)||(24967-25158)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (58-241)||(15240-15423)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (48-239)||(5766-5956)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (56-241)||(4680-4864)
scaffold0188 (58-189)||(31682-31816)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (31-229)||(12281-12480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (31-229)||(104196-104393)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (48-208)||(16099-16258)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (41-229)||(13326-13512)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (48-229)||(18473-18653)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (48-229)||(18577-18756)
scaffold0089 (105-183)||(1877-1958)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (32-229)||(49912-50107)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (105-241)||(606-741)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (115-241)||(2006-2131)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (115-241)||(7705-7830)
scaffold0310 (184-241)||(12921-12977)
scaffold0310 (122-157)||(12903-12938)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (106-239)||(74174-74306)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (105-241)||(65345-65480)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (122-241)||(101705-101823)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (58-239)||(26026-26210)
scaffold0104 (58-239)||(27408-27592)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (106-239)||(44-177)
scaffold0076 (58-205)||(30236-30387)
scaffold0076 (58-205)||(35637-35788)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (124-241)||(24648-24764)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (58-189)||(159-294)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (58-239)||(451-634)
[»] scaffold0113 (4 HSPs)
scaffold0113 (105-210)||(19152-19257)
scaffold0113 (140-245)||(19231-19335)
scaffold0113 (115-157)||(15152-15194)
scaffold0113 (184-245)||(15177-15237)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (139-239)||(30849-30948)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (48-181)||(10223-10359)
scaffold0034 (48-137)||(17566-17655)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (106-239)||(247003-247135)
scaffold0009 (106-239)||(253517-253649)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (106-189)||(143945-144028)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (58-205)||(38336-38487)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (106-203)||(41215-41311)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (58-205)||(174652-174803)
scaffold0011 (163-239)||(147050-147126)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (58-205)||(52475-52626)
scaffold0028 (58-205)||(47070-47220)
scaffold0028 (163-239)||(999-1075)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (58-181)||(254-381)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (58-189)||(5237-5372)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (58-181)||(2854-2980)
scaffold0348 (123-183)||(1841-1904)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (48-101)||(1-54)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (58-181)||(52753-52880)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (58-181)||(9937-10063)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (163-239)||(9268-9343)
scaffold0124 (163-239)||(44938-45013)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (123-183)||(141326-141388)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (161-239)||(3358-3435)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (115-189)||(4233-4310)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (56-90)||(64556-64590)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (105-181)||(14915-14992)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (163-239)||(8518-8593)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (163-239)||(8280-8355)
scaffold0298 (163-239)||(18364-18439)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (163-239)||(9281-9356)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (163-239)||(47882-47957)
scaffold0114 (123-183)||(41931-41993)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (116-181)||(103045-103112)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (123-183)||(3658-3720)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (123-183)||(6146-6208)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (123-183)||(14611-14673)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (123-183)||(5122-5184)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (123-183)||(63308-63370)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (105-183)||(157-238)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (105-183)||(16160-16241)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (163-239)||(1329-1405)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (115-184)||(60-132)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (163-239)||(18549-18625)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (163-239)||(2912-2988)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (123-181)||(51088-51148)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (105-137)||(117-149)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (163-239)||(5068-5143)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (161-189)||(44623-44651)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (123-183)||(27861-27924)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (163-239)||(17489-17564)


Alignment Details
Target: scaffold0560 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1060
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 1154  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1153 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 27345642 - 27345835
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345642 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 27345741  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27345742 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 27345835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 23117135 - 23117328
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23117135 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 23117234  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23117235 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 23117328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10956890 - 10956697
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10956890 caacaactaagactcatgcaaatgtcatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 10956791  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  10956790 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctc 10956697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26486217 - 26486032
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26486217 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 26486118  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26486117 accgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 26486032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14746724 - 14746532
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14746724 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaagtatgcatgtggtaccaaacaggaccg 14746626  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14746625 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctc 14746532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16267066 - 16266882
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16267066 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagaaaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 16266968  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16266967 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 16266882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40144490 - 40144306
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40144490 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 40144392  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40144391 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 40144306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3224878 - 3224695
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  3224878 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaatgatgcaaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcat 3224779  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3224778 cgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 3224695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 3697580 - 3697760
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3697580 gactcatgcaaatgacattacaacaccgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcac 3697678  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  3697679 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctc 3697760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23224950 - 23224772
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23224950 caacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtacca-acaggaccg 23224853  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23224852 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgttgagcaactagtactccagga 23224772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16887519 - 16887322
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  16887519 tcagataataactgaaatcaacaaccaagacacatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 16887423  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16887422 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 16887323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14737042 - 14736845
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  14737042 tcagataattactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 14736946  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14736945 ggggtaccaaacaggaccgacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 14736846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27909806 - 27909608
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  27909806 tcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 27909709  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27909708 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 27909609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27956225 - 27956027
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  27956225 tcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 27956128  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27956127 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 27956028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36800664 - 36800466
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaac-aacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  36800664 tcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 36800567  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36800566 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 36800467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11392753 - 11392614
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11392753 tcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagaattcatcaggaccgaagccctcaccgc 11392654  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctctgct 245  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11392653 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctctgct 11392614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 14765513 - 14765694
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  14765513 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 14765609  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14765610 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 14765694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 28980658 - 28980831
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28980658 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 28980755  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28980756 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 28980831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 28985878 - 28986051
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28985878 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 28985975  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28985976 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 28986051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4520939 - 4520758
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  4520939 aacaacaaccaagactcatgcagatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 4520843  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4520842 ccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 4520758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14416720 - 14416586
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14416720 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 14416621  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14416620 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 14416586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31418935 - 31418800
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  31418935 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 31418836  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31418835 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31418800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 35540962 - 35541155
Alignment:
Q  35 ataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtgg 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||    
T  35540962 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaagcgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtgg 35541058  T
Q  133 taccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  35541059 taccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactcgtactccaggac 35541155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 6588040 - 6588158
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  6588040 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggaccg 6588139  T
Q  148 aagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  6588140 aagccctcaccgctgttga 6588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 14563464 - 14563648
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||      
T  14563464 actgaaaca-caaccgagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaat 14563558  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14563559 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 14563648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9205547 - 9205374
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9205547 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 9205450  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9205449 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 9205374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31412753 - 31412618
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  31412753 gactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacagcaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 31412654  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412653 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31412618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 29328188 - 29328313
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  29328188 atgcatatatgcatgtcgtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 29328286  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29328287 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 29328313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 43687384 - 43687515
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  43687384 cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctcaccgct 43687482  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43687483 g-tgagcaactagtgctccaggacatgagtcctc 43687515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25701715 - 25701583
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  25701715 tcctcaaaatatgcaataatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctcaccgc 25701616  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcct 238  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25701615 tg-tgagcaactagtgctccaggacatgagtcct 25701583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29299214 - 29299092
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  29299214 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccgtccc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctg-tgaacaa 29299117  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  29299116 ctagtgctccaggacatgagtcctc 29299092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29305760 - 29305638
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  29305760 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctccc-gcttttgaatggtttaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctg-tgaacaa 29305663  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  29305662 ctagtgctccaggacatgagtcctc 29305638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 5240015 - 5240094
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5240015 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 5240094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 23825059 - 23825210
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  23825059 gactcatgcaaacgacatgacaacaccgctaagacaaccccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 23825158  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23825159 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 23825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Original strand, 213907 - 214030
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | ||||||||||||||||      
T  213907 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcatgtggtaccaat 214003  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  214004 caggaccgaagccctcaccgctgttga 214030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 238347 - 238224
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | ||||||||||||||||      
T  238347 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcatgtggtaccaat 238251  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  238250 caggaccgaagccctcaccgctgttga 238224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Original strand, 727530 - 727653
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | ||||||||||||||||      
T  727530 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcatgtggtaccaat 727626  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  727627 caggaccgaagccctcaccgctgttga 727653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Original strand, 800031 - 800154
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | ||||||||||||||||      
T  800031 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcatgtggtaccaat 800127  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  800128 caggaccgaagccctcaccgctgttga 800154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Original strand, 851424 - 851547
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | ||||||||||||||||      
T  851424 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcatgtggtaccaat 851520  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  851521 caggaccgaagccctcaccgctgttga 851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30767191 - 30767112
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30767191 gactcatgcaaatgacataacaacaccgctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 30767112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 21281993 - 21282119
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  21281993 gactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 21282092  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    || |||  | |||||||||||||||||    
T  21282093 accgctaatcgaatggttaaagcattc 21282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 6588132 - 6588189
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6588132 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 6588189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 23653816 - 23653957
Alignment:
Q  100 tagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagct 196  Q
    |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||  |||      
T  23653816 tagactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattaggacataagtc 23653915  T
Q  197 ctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  23653916 ctcaccgct-ttgaacaacaagtgttccaggacatgagtcctc 23653957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13362186 - 13362115
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttaga 103  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  13362186 tcagttaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttaga 13362115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783932
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaagc-ctcaccgct-ttgaacaataagtgtgccaggacatgagtcctc 20783932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23653182 - 23653095
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23653182 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttatcaggac 23653095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 214002 - 214049
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  214002 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 214049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 238252 - 238205
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  238252 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 238205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 727625 - 727672
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  727625 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 727672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 800126 - 800173
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  800126 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 800173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 851519 - 851566
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  851519 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 851566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 190
Target Start/End: Original strand, 39363480 - 39363550
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggacc 190  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363480 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcatcaggacc 39363550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 18609786 - 18609853
Alignment:
Q  116 tgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18609786 tgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc 18609853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025700
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22025700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050263
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22050263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055781
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22055781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177648
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 27873790 - 27873832
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27873790 atgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcac 27873832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 27873818 - 27873871
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27873818 gaccgaagccctcaccgttgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 27873871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 27889920 - 27889962
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27889920 atgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcac 27889962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 27889948 - 27890001
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27889948 gaccgaagccctcaccgttgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 27890001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 27948578 - 27948620
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27948578 atgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcac 27948620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 27948606 - 27948659
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27948606 gaccgaagccctcaccgttgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 27948659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14057792 - 14057724
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14057792 atgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc 14057724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 19859550 - 19859626
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  19859550 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 19859626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21690611 - 21690544
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccag---acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    |||||||||||||||    ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21690611 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 21690544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21686260 - 21686220
Alignment:
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21686260 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 21686220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Original strand, 21962937 - 21963122
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21962937 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 21963036  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21963037 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 21963122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 4231112 - 4231305
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4231112 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 4231211  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4231212 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 4231305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 17146182 - 17146374
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17146182 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtacca-acaggaccg 17146280  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17146281 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 17146374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 42626124 - 42626317
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42626124 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 42626223  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42626224 aagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctc 42626317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Original strand, 20292612 - 20292797
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20292612 aagaatcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 20292711  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20292712 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctc 20292797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 20570666 - 20570858
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20570666 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccaccttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 20570764  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20570765 aagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 20570858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 52990639 - 52990796
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52990639 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccg 52990738  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52990739 aaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18026960 - 18026762
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatg 129  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||   ||||| ||||||||    
T  18026960 tcagataataactgtaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgagtgcaa-tatgcatg 18026862  T
Q  130 tggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18026861 tggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 18026762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 24850025 - 24850171
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24850025 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 24850123  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850124 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 24850171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Original strand, 9269865 - 9270017
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9269865 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccctc 9269964  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9269965 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtt 9270017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28556709 - 28556512
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  28556709 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 28556613  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28556612 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 28556513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20277441 - 20277262
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20277441 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 20277345  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20277344 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 20277262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3652888 - 3652709
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3652888 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 3652792  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3652791 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 3652709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 6740426 - 6740623
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | |  ||| | |||||| |||||||    
T  6740426 tcagataataactgaaatcaacaacaaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcataatgaaatgcaa-tatgcat 6740522  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6740523 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 6740622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 37675317 - 37675498
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  37675317 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 37675413  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37675414 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 37675498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 37682010 - 37682191
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  37682010 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 37682106  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37682107 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 37682191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38908249 - 38908064
Alignment:
Q  42 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| | | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |    
T  38908249 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttaaacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatc 38908153  T
Q  141 aggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38908152 aggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 38908064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 39094245 - 39094426
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  39094245 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 39094341  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39094342 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 39094426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22185809 - 22185614
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  22185809 cagataataactgaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagataccatcttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 22185713  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22185712 ggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 22185614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 18418032 - 18418229
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  18418032 tcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 18418128  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  18418129 gtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccagga 18418228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39189864 - 39189691
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  39189864 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcc 39189767  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39189766 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 39189691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20397067 - 20396906
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  20397067 caacaactaagacttatgcaaatgacatgacaacactactaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagggccg 20396969  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttga 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20396968 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgcttttga 20396906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 49328016 - 49328148
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49328016 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 49328115  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49328116 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 49328148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36212218 - 36212042
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  36212218 tcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 36212122  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36212121 gtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 36212042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29596980 - 29596855
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  29596980 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctg-tgaacaa 29596882  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29596881 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 29596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31535483 - 31535310
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31535483 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 31535386  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31535385 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 31535310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31564200 - 31564027
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31564200 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 31564103  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31564102 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 31564027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 48427785 - 48427958
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  48427785 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 48427882  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  48427883 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 48427958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23195718 - 23195584
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  23195718 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 23195619  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195618 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 23195584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 166
Target Start/End: Original strand, 20299290 - 20299400
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20299290 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 20299389  T
Q  156 actgcttttga 166  Q
    || ||||||||    
T  20299390 accgcttttga 20299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 47484094 - 47484222
Alignment:
Q  110 aatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttg 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||    
T  47484094 aataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctg-tg 47484192  T
Q  210 agcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47484193 aacaactagtgctccaggacatgagtcctc 47484222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29602391 - 29602290
Alignment:
Q  139 acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcct 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29602391 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 29602293  T
Q  239 ctc 241  Q
    |||    
T  29602292 ctc 29602290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 24079486 - 24079621
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  24079486 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 24079585  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24079586 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 24079621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24109268 - 24109133
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  24109268 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 24109169  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24109168 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 24109133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20077031 - 20076945
Alignment:
Q  159 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctctgct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20077031 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgct 20076945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 21920788 - 21920913
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21920788 atgcaattatgcatgtggtaccaaaaaagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 21920886  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21920887 ctagtactccaggacataagtcctctc 21920913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 43088373 - 43088507
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |||||||    
T  43088373 tcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcattaggacataagtcctcaccg 43088472  T
Q  204 ctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43088473 ctg-tgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc 43088507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 36614918 - 36615051
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  36614918 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgc 36615017  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36615018 tg-tgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc 36615051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 21541991 - 21542142
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  21541991 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 21542090  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  21542091 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 21542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42096145 - 42095994
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  42096145 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcagtaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 42096046  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  42096045 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 42095994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20396932 - 20396864
Alignment:
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20396932 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 20396864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 20299374 - 20299431
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20299374 caggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctc 20299431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10813697 - 10813614
Alignment:
Q  121 atatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcacc 202  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10813697 atatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagtcctcaccggagtttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagccctcacc 10813614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15316641 - 15316566
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  15316641 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 15316566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554560
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 29554560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706877
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3706877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19664324 - 19664246
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19664324 tcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc 19664246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448378
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcat 22448378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30491617 - 30491550
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccag---acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30491617 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagg 30491550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941971
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 20941971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 21664203 - 21664278
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| |||| | |||  ||||||||||||||||    
T  21664203 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcactgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcct 21664278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 817 - 1010
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  817 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaaccctgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagataggaccg 916  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  917 aagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 19533 - 19726
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19533 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccg 19632  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19633 aagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 19726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24052 - 23859
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  24052 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccttataggaccg 23953  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23952 aagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 23859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 94711 - 94526
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94711 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 94612  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94611 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 94526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 4106621 - 4106814
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4106621 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccg 4106720  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  4106721 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctc 4106814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8069918 - 8069726
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8069918 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactg 8069820  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8069819 aagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 8069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Original strand, 14582730 - 14582919
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14582730 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 14582828  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14582829 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 14582919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 29158992 - 29159174
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29158992 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 29159091  T
Q  148 aagccctcactgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29159092 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 29159174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30799677 - 30799481
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  30799677 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 30799581  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30799580 gtggtacca-acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 30799482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 1070525 - 1070723
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  1070525 tcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 1070622  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1070623 gtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 1070722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 17309581 - 17309779
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaac-aacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  17309581 tcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 17309678  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17309679 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 17309778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 24369096 - 24369292
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  24369096 tcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 24369192  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24369193 gtggtacca-acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 24369291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34134189 - 34134014
Alignment:
Q  53 accaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  34134189 accaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggc 34134092  T
Q  152 cctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34134091 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 34134014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15332364 - 15332166
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaac-aacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  15332364 tcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagataccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 15332267  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15332266 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 15332167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25315868 - 25315689
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  25315868 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgacc 25315772  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25315771 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 25315689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26203362 - 26203183
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26203362 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgacc 26203266  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26203265 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 26203183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 25463747 - 25463946
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctca-at-agatgcaaatatgca 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || | || | |||||| ||||||    
T  25463747 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgctaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttatatgaaatgcaattatgca 25463844  T
Q  128 tgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25463845 tgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagg 25463944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 27767341 - 27767476
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27767341 tcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 27767440  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27767441 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 27767476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 22406520 - 22406728
Alignment:
Q  21 acctcatcattcagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgca 119  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||    
T  22406520 acctcatcaatcagatagtaactgaaatgacaaccacgactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgca 22406617  T
Q  120 aatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctg-ttgagcaactag 218  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  22406618 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtttgagtaactag 22406717  T
Q  219 tgccccaggac 229  Q
    | | |||||||    
T  22406718 tactccaggac 22406728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10470893 - 10470768
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10470893 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 10470795  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10470794 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 10470768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10464371 - 10464246
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10464371 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 10464273  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10464272 ctagtgctccaggacatgagttctctc 10464246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16223875 - 16223702
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16223875 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 16223778  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16223777 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 16223702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5290384 - 5290235
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |||||||    
T  5290384 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgtagccctc 5290285  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  5290284 accgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct 5290235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 13940416 - 13940549
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13940416 cctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgc 13940515  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13940516 tg-tgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc 13940549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19096928 - 19096819
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19096928 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaatcaggaccg 19096829  T
Q  148 aagccctcac 157  Q
    ||||||||||    
T  19096828 aagccctcac 19096819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26418909 - 26418774
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||    
T  26418909 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccgaagccctc 26418810  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26418809 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 26418774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 29925687 - 29925810
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  29925687 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctg-tgaacaa 29925785  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  29925786 ctagtgttccaggacatgagtcctc 29925810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23235171 - 23235037
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||    
T  23235171 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaaaaataaaaatatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctc 23235072  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23235071 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 23235037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12447367 - 12447234
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12447367 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgc 12447268  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  12447267 tg-tgaacaacaagtgctctaggacatgagtcctc 12447234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17207909 - 17207776
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17207909 tcctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 17207811  T
Q  204 ctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
     |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17207810 at-atgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 17207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17894693 - 17894611
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17894693 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 17894611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23021520 - 23021387
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||    
T  23021520 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctcaccgc 23021421  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23021420 tg-tgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc 23021387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 24562217 - 24562368
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  24562217 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 24562316  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  24562317 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 24562368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13128383 - 13128303
Alignment:
Q  160 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13128383 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 13128303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 24362521 - 24362654
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| |||||||||    
T  24362521 tcagataataactgaaatcaactattaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcat 24362617  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24362618 gtggtacca-acaggaccgaagccctcaccgctgttga 24362654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Original strand, 25347065 - 25347167
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcacc 202  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  25347065 cctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggccctcacc 25347164  T
Q  203 gct 205  Q
    |||    
T  25347165 gct 25347167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 17702046 - 17702105
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagaca 93  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17702046 cagataataactgaaagaacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagaca 17702105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300787
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatatcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13135964 - 13135927
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactg 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13135964 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactg 13135927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 15457447 - 15457524
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  15457447 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 15464042 - 15464119
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  15464042 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23233544 - 23233468
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  23233544 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 23233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 24362628 - 24362673
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24362628 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 24362673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414113
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17414113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726668
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 19726668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451402
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 19451402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19472460 - 19472384
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  19472460 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 19472384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22798698 - 22798631
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccag---acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22798698 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagg 22798631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10582975 - 10582900
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  ||||||| |||||||||    
T  10582975 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacttgagtcctc 10582900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 19449332 - 19449372
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  19449332 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccg 19449372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724875
Alignment:
Q  126 catgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 21724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25470886 - 25470854
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25470886 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 25470854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19800574 - 19800382
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19800574 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 19800476  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19800475 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 19800382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 22507434 - 22507627
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  22507434 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacca 22507533  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22507534 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 22507627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 19508038 - 19508230
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19508038 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaa-tatacatgtggtaccaaacaggaccg 19508136  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19508137 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 19508230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 22500856 - 22501046
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  22500856 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttaga---ctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacca 22500952  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22500953 aaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctc 22501046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 597150 - 597341
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  597150 caacaaccaagactcatgcaaacgatacgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 597247  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  597248 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctc 597341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 25852832 - 25853031
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  25852832 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 25852930  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25852931 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 25853030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 25846200 - 25846399
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  25846200 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 25846298  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  25846299 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccagga 25846398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 15461321 - 15461527
Alignment:
Q  21 acctcatcattcagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgca 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||    
T  15461321 acctcatcaatcagataataactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgca 15461418  T
Q  120 aatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagt 219  Q
       |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15461419 tc-atgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 15461517  T
Q  220 gccccaggac 229  Q
     | |||||||    
T  15461518 actccaggac 15461527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5582528 - 5582331
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  5582528 tcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 5582432  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5582431 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 5582332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 10686003 - 10686200
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  10686003 tcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 10686099  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10686100 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 10686199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40011223 - 40011026
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  40011223 tcagataataactgaaatcatcaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 40011127  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40011126 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 40011027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14615202 - 14615004
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  14615202 tcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 14615105  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14615104 gtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 14615005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22248493 - 22248295
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  22248493 tcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 22248396  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22248395 gtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 22248296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 11994994 - 11995182
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  11994994 tcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 11995091  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagt 219  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995092 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11995182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Original strand, 38013606 - 38013789
Alignment:
Q  44 gaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacag 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  38013606 gaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcag 38013702  T
Q  143 gaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38013703 gaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 38013789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 43028899 - 43029096
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  43028899 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cattgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 43028995  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43028996 gtggtaccaatcaagaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 43029095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7508242 - 7508069
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7508242 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 7508145  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7508144 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 7508069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14889219 - 14889046
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14889219 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 14889122  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14889121 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 14889046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1111927 - 1111732
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  1111927 cagataataactaaaagaacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 1111831  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1111830 ggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 1111732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 5454351 - 5454544
Alignment:
Q  36 taatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtgg 132  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||| |||||||||||    
T  5454351 taataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaattgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtgg 5454447  T
Q  133 taccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5454448 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 5454544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17939119 - 17938938
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  17939119 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 17939023  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17939022 ccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 17938938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14882542 - 14882369
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  14882542 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccc 14882445  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14882444 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 14882369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24795243 - 24795070
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  24795243 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcc 24795146  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24795145 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 24795070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24800610 - 24800437
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  24800610 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcc 24800513  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24800512 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 24800437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18895228 - 18895049
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18895228 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 18895132  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18895131 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 18895049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37540204 - 37540012
Alignment:
Q  36 taatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggta 134  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||    
T  37540204 taataactgaaataacaaccgagacccatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggta 37540107  T
Q  135 ccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  37540106 ccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtactccaggac 37540012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37547748 - 37547556
Alignment:
Q  36 taatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggta 134  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||    
T  37547748 taataactgaaataacaaccgagacccatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggta 37547651  T
Q  135 ccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  37547650 ccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtactccaggac 37547556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28260040 - 28259915
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  28260040 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 28259942  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28259941 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 28259915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 20990293 - 20990418
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20990293 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 20990391  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20990392 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 20990418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29746776 - 29746666
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29746776 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 29746677  T
Q  156 actgcttttga 166  Q
    || ||| ||||    
T  29746676 accgctgttga 29746666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5341894 - 5341762
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5341894 cctcaataaatgtaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 5341795  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5341794 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 5341762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 24057583 - 24057715
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24057583 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 24057682  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24057683 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 24057715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24751772 - 24751589
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||    
T  24751772 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctc 24751673  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24751672 accgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24751589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41878181 - 41878046
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41878181 tcctcaaaatatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 41878082  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41878081 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 41878046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27636119 - 27635985
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  27636119 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataagtgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 27636020  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636019 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 27635985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 30780942 - 30781120
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30780942 caacaactaaaactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 30781037  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30781038 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 30781120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7773814 - 7773690
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  7773814 atgcaattatgcatgtggtacca-acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 7773717  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7773716 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 7773690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23081915 - 23081782
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23081915 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 23081816  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23081815 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 23081782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24669234 - 24669051
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |||||||    
T  24669234 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctc 24669135  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24669134 accgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24669051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24739003 - 24738820
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |||||||    
T  24739003 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctc 24738904  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24738903 accgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24738820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 37566020 - 37566155
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37566020 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgt 37566119  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  37566120 tg-tgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctc 37566155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23545037 - 23544907
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545037 cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 23544938  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23544937 tg-tgaacaactagtgccccaggacattagtc 23544907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23076467 - 23076334
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076467 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 23076368  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076367 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 23076334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 26650385 - 26650517
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26650385 tcctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 26650483  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26650484 tg-tgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc 26650517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 26921970 - 26922102
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26921970 tcctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 26922068  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26922069 tg-tgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc 26922102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16775209 - 16775084
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  16775209 atgcaattatgcatgtggcaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttg-tgaacaa 16775111  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16775110 ctagtgctccaggacatgagtcatctc 16775084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 18566509 - 18566626
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18566509 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacatgaccg 18566607  T
Q  148 aagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  18566608 aagccctcaccgctgttga 18566626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 20347062 - 20347180
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20347062 caacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccg 20347161  T
Q  148 aagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  20347162 aagccctcaccgctgttga 20347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 20340458 - 20340576
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20340458 caacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccg 20340557  T
Q  148 aagccctcactgcttttga 166  Q
    ||||| |||| ||| ||||    
T  20340558 aagccatcaccgctgttga 20340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 25419803 - 25419936
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25419803 cctcaataaatgcatttatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgc 25419902  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25419903 tg-tgaacaaatagtgctccaggacatgagtcctc 25419936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18941388 - 18941257
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  18941388 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcgccgct 18941290  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18941289 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagccctc 18941257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39609044 - 39608916
Alignment:
Q  110 aatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttg 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||    
T  39609044 aataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctg-tg 39608946  T
Q  210 agcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39608945 aacaactagtgctccaggacatgagtcctc 39608916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19802061 - 19801931
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  19802061 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgc 19801962  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19801961 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtc 19801931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Original strand, 19362581 - 19362711
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  19362581 cctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgc 19362680  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    || ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  19362681 tg-tgaacaacaagtgctccaggacatgagtc 19362711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 33536239 - 33536319
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33536239 aagactcatgcaatggacatgacaacaccgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtacca 33536319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29746692 - 29746635
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29746692 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 29746635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 18566603 - 18566657
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18566603 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 18566657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1857745 - 1857594
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  1857745 gactcatgcaaaggtcatgaccacaccgctaaaacaacaccctagactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccac 1857646  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  1857645 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 1857594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21675713 - 21675562
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  21675713 gactcatgcaaaggtcatgaccacaccgctaaaacaacaccctagactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccac 21675614  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  21675613 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 21675562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 20340553 - 20340607
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20340553 gaccgaagccatcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 20340607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 20347157 - 20347211
Alignment:
Q  187 gaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  20347157 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctc 20347211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41877932 - 41877876
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877932 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 41877876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Original strand, 22379509 - 22379560
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22379509 cctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcac 22379560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 20831713 - 20831749
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20831713 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaa 20831749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829621
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 21829621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758365
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312943
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22312943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Original strand, 22379543 - 22379597
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22379543 caggaccaaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 22379597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877915
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 41877915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 22460084 - 22460161
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca-gacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22460084 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcattgttatagaatggttaaagcattc 22460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28371620 - 28371543
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  28371620 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38145947 - 38145870
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38145947 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 42960064 - 42960141
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  42960064 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23561744 - 23561669
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| | || |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  23561744 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-tggaccaataagtgttccaggacatgagtcctc 23561669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45959950 - 45959757
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45959950 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 45959851  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45959850 aagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 45959757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54845156 - 54844963
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845156 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 54845057  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54845056 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 54844963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42956228 - 42956033
Alignment:
Q  50 acaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42956228 acaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaa 42956129  T
Q  150 gccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctctgct 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  42956128 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgct 42956033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 34772041 - 34772234
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34772041 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 34772140  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34772141 aagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 34772234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 5938798 - 5938991
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5938798 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 5938897  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5938898 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaagacatgagtcctctc 5938991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45142757 - 45142565
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45142757 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccg 45142659  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45142658 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 45142565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 1583783 - 1583976
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1583783 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactg 1583882  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  1583883 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctc 1583976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 7359122 - 7359314
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7359122 caacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 7359220  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7359221 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 7359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 7356129 - 7356321
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7356129 caacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 7356227  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7356228 aagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 7356321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47872622 - 47872437
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47872622 aagactcatgtaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 47872523  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47872522 accgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctc 47872437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 21396689 - 21396871
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21396689 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 21396788  T
Q  148 aagccctcactgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21396789 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 21396871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11202630 - 11202448
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11202630 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 11202532  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11202531 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctc 11202448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35462810 - 35462627
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35462810 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 35462712  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35462711 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 35462627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29382991 - 29382792
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  29382991 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 29382893  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29382892 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 29382793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45151526 - 45151372
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45151526 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccg 45151428  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45151427 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3260216 - 3260019
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  3260216 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 3260120  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3260119 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 3260020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 52500408 - 52500605
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  52500408 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 52500504  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52500505 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 52500604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 391001 - 391180
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  391001 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 391097  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  391098 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 391180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23436207 - 23436010
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  23436207 tcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cgctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 23436111  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23436110 gtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 23436011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29448889 - 29448704
Alignment:
Q  42 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |    
T  29448889 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatc 29448793  T
Q  141 aggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29448792 aggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 29448704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29455573 - 29455388
Alignment:
Q  42 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |    
T  29455573 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatc 29455477  T
Q  141 aggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29455476 aggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 29455388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 11937031 - 11937212
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  11937031 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 11937127  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11937128 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 11937212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Original strand, 50082117 - 50082293
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaac-aacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  50082117 tcagataataactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 50082213  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50082214 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 50082293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 26395559 - 26395739
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||| | || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  26395559 caacaaccaaaactcatgcaaatgacatgac--cactgctaaaacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 26395656  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26395657 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 26395739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19128493 - 19128358
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19128493 tcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgagtggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 19128394  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19128393 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 19128358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 31664992 - 31665127
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664992 tcctcaaaatatgcagttatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 31665091  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31665092 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 31665127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 33097026 - 33097159
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33097026 tcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 33097125  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33097126 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 33097159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 20894926 - 20895061
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20894926 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgc 20895025  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20895026 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 20895061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39266443 - 39266265
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  | |||||| | || ||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  39266443 caacaactaagactcatgcacatgacatgacaac--tgctaagacacaatcttagacttcttaatgaaatg-aattatgcatgtggtacca-acaggacc 39266348  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39266347 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 39266265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2972873 - 2972748
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  2972873 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcactcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 2972775  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2972774 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 2972748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 42220364 - 42220497
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42220364 tcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgc 42220463  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42220464 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 42220497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3266820 - 3266647
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  3266820 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 3266723  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3266722 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 3266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 20889307 - 20889442
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20889307 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcgccgc 20889406  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20889407 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctc 20889442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49548734 - 49548599
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49548734 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgc 49548635  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  49548634 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagttctctc 49548599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 21881534 - 21881652
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21881534 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 21881632  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  21881633 ctagtgctccaggacatgag 21881652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 33221312 - 33221437
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  33221312 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 33221410  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33221411 ctagtgctccaggacacgagtcctctc 33221437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49241045 - 49240872
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  49241045 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 49240948  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49240947 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 49240872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49749759 - 49749586
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  49749759 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 49749662  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49749661 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 49749586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 13452162 - 13452295
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  13452162 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac-acaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 13452260  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452261 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 13452295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46045020 - 46044887
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  46045020 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctcaccgc 46044921  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46044920 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 46044887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 36037505 - 36037630
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  36037505 atgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 36037603  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  36037604 ctaatgttccaggacatgagtcctctc 36037630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 899527 - 899659
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||    
T  899527 cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaacataagccatcaccgct 899626  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  899627 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 899659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 30396132 - 30396262
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30396132 cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttt-gaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaacgct 30396229  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30396230 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 30396262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 37881331 - 37881466
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||    
T  37881331 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccctc 37881430  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37881431 accgctattttgaatggttaaagcattcatcaggac 37881466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49548502 - 49548384
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  49548502 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgc 49548404  T
Q  222 cccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||||||||||||    
T  49548403 tccaggacatgagtcctctc 49548384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41404856 - 41404726
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  41404856 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaactggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctcaccgc 41404757  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    || ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  41404756 tg-tgaacaactagtgttccaggacatgagtc 41404726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15470776 - 15470652
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||| | |||||||    
T  15470776 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-attatgcat 15470680  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctca 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15470679 gtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3096752 - 3096699
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  3096752 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttaga 3096699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10977216 - 10977129
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10977216 tcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcaggac 10977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 391175 - 391220
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  391175 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 391220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15360959 - 15360884
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||   |||  |||||||||||||||||    
T  15360959 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataggtgttccaggacatgagtcctc 15360884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121661
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 23121661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905270
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27905211 atgcatgtggtaccatatcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 27905270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Original strand, 14910577 - 14910645
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14910577 atgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 16484640 - 16484716
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  16484640 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 16484716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 18271262 - 18271329
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccag---acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    |||||||||||||||    ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18271262 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 18271329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166347
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| | |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccg-ttttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 18166347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 18261324 - 18261364
Alignment:
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 187  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18261324 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 18261364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53905453 - 53905413
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  53905453 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccg 53905413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48774859 - 48774667
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48774859 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 48774761  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48774760 aagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 48774667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 38742842 - 38743034
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38742842 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatttgcatgtggtaccaaacaggaccg 38742940  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38742941 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 38743034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12271636 - 12271449
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  12271636 caacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaaaacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgttgtaccaaagaggaccg 12271538  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12271537 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtc 12271449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9772156 - 9771965
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9772156 caacaaccaagactcatgcaaacgacatgacgacactactaagacaacacctcagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 9772059  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9772058 aagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 9771965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Original strand, 20187628 - 20187780
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  20187628 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccttcac 20187727  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttga 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20187728 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgcttttga 20187780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54833447 - 54833248
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  54833447 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 54833349  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54833348 gtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtactccagga 54833249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 10767647 - 10767844
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  10767647 tcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 10767743  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10767744 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 10767843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21151715 - 21151530
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  21151715 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 21151619  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21151618 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaacta 21151530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43724323 - 43724125
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  43724323 tcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 43724226  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43724225 gtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 43724126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Original strand, 29493457 - 29493641
Alignment:
Q  44 gaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacag 142  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |||    
T  29493457 gaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcag 29493554  T
Q  143 gaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29493555 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 29493641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 45611575 - 45611754
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45611575 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgccaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 45611671  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45611672 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 45611754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 10381841 - 10382027
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||||| |||||      
T  10381841 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtgataccaat 10381937  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10381938 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 10382027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 10410494 - 10410680
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||||| |||||      
T  10410494 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtgataccaat 10410590  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10410591 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 10410680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53571476 - 53571295
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  53571476 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacagga 53571380  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  53571379 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 53571295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3782986 - 3782813
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  3782986 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 3782889  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3782888 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 3782813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2499285 - 2499105
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggac 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2499285 caacaacccagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggac 2499189  T
Q  146 cgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2499188 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 2499105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14845406 - 14845232
Alignment:
Q  51 caaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  14845406 caaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgag 14845309  T
Q  150 gccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccag 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14845308 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtgctccag 14845232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50656244 - 50656049
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  ||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  50656244 cagataataactgaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cattgctaagacaccattttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 50656148  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50656147 ggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 50656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16331768 - 16331643
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  16331768 atgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct-atgaacaa 16331670  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16331669 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 16331643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30597043 - 30596910
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30597043 tcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 30596944  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  30596943 tg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 30596910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8374108 - 8373976
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8374108 cctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgct 8374009  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8374008 g-tgaagaactagtgctccaggacatgagtcctc 8373976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32388200 - 32388068
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32388200 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 32388101  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32388100 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 32388068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 54520024 - 54520159
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54520024 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 54520123  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54520124 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 54520159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9691582 - 9691457
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  9691582 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 9691484  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9691483 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 9691457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 28758814 - 28758987
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28758814 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 28758911  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28758912 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 28758987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50143003 - 50142830
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  50143003 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 50142906  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50142905 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 50142830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29545347 - 29545212
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29545347 tcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgc 29545248  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29545247 tg-tgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctc 29545212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 16833209 - 16833334
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  16833209 atgcaattatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 16833307  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16833308 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 16833334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 29550911 - 29551036
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  29550911 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctg-tgaacaa 29551009  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  29551010 ctagtgctctaggacatgagtcctctc 29551036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12725306 - 12725175
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12725306 cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctct 12725208  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12725207 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 12725175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 12419326 - 12419460
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||    
T  12419326 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcgataaatgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaagccctc 12419425  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12419426 actgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 12419460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46071285 - 46071160
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  46071285 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcccttatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 46071187  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46071186 ctagtgctccaggacatgagtcttctc 46071160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11956778 - 11956647
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11956778 cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaacaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctccccgct 11956680  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11956679 g-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 11956647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 47121063 - 47121235
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  47121063 aagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 47121159  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47121160 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 47121235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 47128431 - 47128603
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  47128431 aagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 47128527  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47128528 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 47128603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19344320 - 19344202
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  19344320 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgc 19344222  T
Q  222 cccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||| ||||||||| ||||    
T  19344221 tccagaacatgagtcatctc 19344202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20377415 - 20377290
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20377415 atgcaattatgcatgtggtaccaaataagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 20377317  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20377316 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 20377290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 20187754 - 20187854
Alignment:
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20187754 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 20187852  T
Q  240 tc 241  Q
    ||    
T  20187853 tc 20187854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10597976 - 10597842
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||    
T  10597976 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtc 10597877  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10597876 accactgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 10597842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520374
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgc 54520354  T
Q  222 cccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||||||||||||    
T  54520355 tccaggacatgagtcctctc 54520374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11850901 - 11850722
Alignment:
Q  62 catgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactg 159  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| |    
T  11850901 catgcaactcacatgacaacattgctaagacaacaccttaaactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccg 11850802  T
Q  160 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  11850801 ctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 11850722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18757206 - 18757071
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  18757206 gactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttaaacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 18757107  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18757106 accgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggac 18757071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 49163134 - 49163265
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  49163134 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttcaagcattcatcaggacataagccctcaccgct 49163232  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  49163233 g-tgaacaaccaatgctccaggacatgagtcctc 49163265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31690839 - 31690713
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  31690839 gactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaataccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 31690740  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    || |||  | |||||||||||||||||    
T  31690739 accgctaatcgaatggttaaagcattc 31690713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8583536 - 8583385
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  8583536 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 8583437  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  8583436 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 8583385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 14084466 - 14084617
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  14084466 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 14084565  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  14084566 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 14084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 14089867 - 14090018
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  14089867 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 14089966  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  14089967 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 14090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 49399408 - 49399487
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49399408 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 49399487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 31943376 - 31943477
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  31943376 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccctagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 31943475  T
Q  156 ac 157  Q
    ||    
T  31943476 ac 31943477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 174
Target Start/End: Original strand, 18957746 - 18957814
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaa 174  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18957746 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27029610 - 27029558
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaa 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27029610 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27031778 - 27031726
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaa 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27031778 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13969048 - 13968924
Alignment:
Q  85 gctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcat--t 180  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  13969048 gctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 13968949  T
Q  181 catcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||||| |||  |||||||||    
T  13968948 catcaggacctaagtcctcaccgct 13968924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13974523 - 13974399
Alignment:
Q  85 gctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcat--t 180  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  13974523 gctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 13974424  T
Q  181 catcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||||| |||  |||||||||    
T  13974423 catcaggacctaagtcctcaccgct 13974399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 3802554 - 3802610
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3802554 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 3802610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 3802716 - 3802772
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3802716 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 3802772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54091842 - 54091786
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54091842 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 54091786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 3802519 - 3802571
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3802519 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 3802571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13969103 - 13969063
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13969103 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacacc 13969063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13974578 - 13974538
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13974578 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacacc 13974538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 15374662 - 15374714
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15374662 tcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcac 15374714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Original strand, 17512558 - 17512609
Alignment:
Q  140 caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggacc 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512558 cagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacc 17512609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54091867 - 54091825
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54091867 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 54091825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 15374697 - 15374753
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15374697 caggaccgaagtcctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 15374753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24123413 - 24123294
Alignment:
Q  90 gacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcat--tcatca 185  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  24123413 gacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatca 24123314  T
Q  186 ggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    ||||| |||  |||||||||    
T  24123313 ggacctaagtcctcaccgct 24123294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644878
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 11644878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652830
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382994
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16382994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Original strand, 17496119 - 17496185
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcatcag 186  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17496119 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcag 17496185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 157
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802733
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 3802733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11305905 - 11305863
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  11305905 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 11305863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15935143 - 15935106
Alignment:
Q  149 agccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcag 186  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15935143 agccctcactgaatttgaatggttaaagcattcatcag 15935106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 239
Target Start/End: Original strand, 18961002 - 18961070
Alignment:
Q  170 gttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18961002 gttaaagcattcatcgggacataagccctcaccgctg-tgaacaacaagtgcttcaggacatgagtcctc 18961070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 183
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292765
Alignment:
Q  126 catgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Original strand, 18913998 - 18914069
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  18913998 atgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 18914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35244241 - 35244048
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35244241 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 35244142  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35244141 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 35244048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22013319 - 22013126
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22013319 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 22013220  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22013219 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctc 22013126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 27037170 - 27037363
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27037170 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 27037269  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27037270 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 27037363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 33976 - 34169
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33976 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 34075  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34076 aagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 34169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2386129 - 2385947
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2386129 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 2386030  T
Q  148 aagccctcactgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2386029 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 2385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 28292645 - 28292827
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292645 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 28292744  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggaca 230  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28292745 aagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaca 28292827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Original strand, 11466008 - 11466190
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11466008 gactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggatcgaagccctcac 11466106  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11466107 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctc 11466190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24427048 - 24426866
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24427048 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacagcttagacttctcaatggatgcgaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 24426949  T
Q  148 aagccctcactgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24426948 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 24426866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44091311 - 44091114
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  44091311 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 44091215  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44091214 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 44091115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 27729418 - 27729605
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  27729418 tcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 27729514  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27729515 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 27729605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 20850110 - 20850296
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||      
T  20850110 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaat 20850206  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20850207 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 20850296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 4077330 - 4077527
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  4077330 tcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcat 4077426  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4077427 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 4077526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11360448 - 11360265
Alignment:
Q  44 gaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacag 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||    
T  11360448 gaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcag 11360352  T
Q  143 gaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11360351 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 11360265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4071751 - 4071570
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  4071751 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 4071655  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4071654 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 4071570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 21604673 - 21604871
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  21604673 tcagataacaactgaaatcaaccaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 21604770  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21604771 gtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 21604870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24481806 - 24481625
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  24481806 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 24481710  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24481709 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 24481625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30196721 - 30196540
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30196721 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacagga 30196625  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30196624 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 30196540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36984764 - 36984591
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  36984764 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 36984667  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36984666 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 36984591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 1067018 - 1067203
Alignment:
Q  42 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |    
T  1067018 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatc 1067114  T
Q  141 aggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1067115 aggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 1067203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28971521 - 28971387
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28971521 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctc 28971422  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28971421 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 28971387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 1061635 - 1061808
Alignment:
Q  42 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |    
T  1061635 ctgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatc 1061731  T
Q  141 aggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1061732 aggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaacta 1061808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 31828547 - 31828719
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31828547 caagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 31828643  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31828644 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 31828719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 31833899 - 31834071
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31833899 caagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 31833995  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31833996 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 31834071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15643444 - 15643311
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15643444 tcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcgccgc 15643345  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15643344 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 15643311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 27272244 - 27272370
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27272244 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtcgagcaa 27272343  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||    
T  27272344 ccagtgctctaggacatgagtcctctc 27272370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 71697 - 71520
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  71697 tcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactactaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcat 71600  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  71599 gtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 71520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13101329 - 13101194
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101329 tcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 13101230  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13101229 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctc 13101194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17592695 - 17592553
Alignment:
Q  100 tagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggac--cgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctc 197  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17592695 tagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccc 17592596  T
Q  198 tcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17592595 tcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctc 17592553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32911637 - 32911504
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32911637 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 32911538  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32911537 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 32911504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Original strand, 35585269 - 35585438
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  ||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  35585269 cagataataactgaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--caatgctaagacaccatattagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 35585365  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35585366 ggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14563950
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaaaactagtgc 14563930  T
Q  222 cccaggacatgagtcctctc 241  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  14563931 tccaggacatgattcctctc 14563950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 36800556 - 36800673
Alignment:
Q  121 atatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  36800556 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtg 36800654  T
Q  221 ccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | |||||||||||||||||    
T  36800655 ctccaggacatgagtcctc 36800673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21133496 - 21133361
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||    
T  21133496 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacatcttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtagtaccatattcagggccgaagccctc 21133397  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21133396 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 21133361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25590354 - 25590226
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25590354 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactcaccgct 25590256  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    | ||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  25590255 g-tgaacaactagtgaaccaggacataagtc 25590226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 45028492 - 45028625
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  45028492 cctcgataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgt 45028591  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  45028592 tg-tgaacaactagttctccaggacatgagtcctc 45028625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6744566 - 6744487
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6744566 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagattcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 6744487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 43693336 - 43693415
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43693336 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 43693415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19649787 - 19649660
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacac-cttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccct 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  19649787 gactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 19649688  T
Q  155 cactgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19649687 caccgctaattgaatggttaaagcattc 19649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27367825 - 27367674
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  27367825 gactcatgcaaatgacatgacaactccgctaaaactacaccctaggctcctcgataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 27367726  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  27367725 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 27367674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 200577 - 200727
Alignment:
Q  59 actcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctca 156  Q
    ||||||||||| | |||||| |||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||    
T  200577 actcatgcaaaggtcatgaccacaacgctaaaacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccaca 200676  T
Q  157 ctgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    | ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  200677 ccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 200727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 183
Target Start/End: Original strand, 23062494 - 23062564
Alignment:
Q  116 tgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23062494 tgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 23062564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105640
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga---caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 2105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 24660500 - 24660576
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24660500 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24660576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724095
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 20724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13964249 - 13964056
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13964249 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 13964150  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13964149 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 13964056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 37285134 - 37285327
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37285134 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 37285233  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  37285234 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctc 37285327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 46174260 - 46174439
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  46174260 gactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcac 46174359  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcc 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46174360 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcc 46174439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 2438809 - 2438990
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2438809 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 2438908  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2438909 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 2438990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 46649695 - 46649887
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46649695 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 46649794  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46649795 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 46649887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2388795 - 2388607
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2388795 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 2388697  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctctgct 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2388696 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgct 2388607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20019917 - 20019737
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019917 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcgtcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 20019819  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20019818 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 20019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17468490 - 17468306
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17468490 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 17468392  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17468391 accgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 17468306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Original strand, 17584724 - 17584908
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17584724 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 17584822  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17584823 accgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 17584908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18437430 - 18437232
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatg 129  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||  |||||| ||||||||    
T  18437430 tcagataataactgtaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaatgcaa-tatgcatg 18437332  T
Q  130 tggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18437331 tggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 18437232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 11339678 - 11339877
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  11339678 tcagataataactgcaatcaacaactaagactcatgcacatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagactcctcaatgaaatgcaa-tatgcat 11339776  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11339777 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 11339876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11899574 - 11899375
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  11899574 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 11899476  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11899475 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 11899376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17726597 - 17726398
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  17726597 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 17726499  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17726498 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgttgagcaactagtactccagga 17726399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 642457 - 642656
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||| |||||||    
T  642457 tcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaataacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcat 642555  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  642556 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccagga 642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 11878969 - 11879173
Alignment:
Q  24 tcatcattcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaa 121  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | ||||||     
T  11878969 tcatccttcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa- 11879065  T
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11879066 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11879165  T
Q  222 cccaggac 229  Q
     |||||||    
T  11879166 tccaggac 11879173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 49158683 - 49158860
Alignment:
Q  62 catgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgct 161  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  49158683 catgcaaacgacacgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgct 49158780  T
Q  162 tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49158781 tttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctc 49158860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5187491 - 5187309
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  5187491 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctaaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcagga 5187394  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5187393 ccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 5187309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 2281019 - 2281192
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  2281019 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 2281116  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2281117 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 2281192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Original strand, 33404579 - 33404749
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  33404579 caacaactaagactcatgcaagtgacatgactacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaataggaccg 33404677  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33404678 aagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 33404749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26114014 - 26113821
Alignment:
Q  36 taatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtgg 132  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||| |||||||||||    
T  26114014 taataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaattgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtgg 26113918  T
Q  133 taccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26113917 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 26113821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 1317675 - 1317872
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatg 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||    
T  1317675 cagataataactgaaagaacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatg 1317772  T
Q  130 tggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1317773 tggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 1317872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8197446 - 8197265
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  8197446 aacaacaatcaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 8197350  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8197349 ccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 8197265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8213517 - 8213336
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  8213517 aacaacaatcaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 8213421  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8213420 ccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 8213336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Original strand, 32627324 - 32627493
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32627324 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgttaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 32627420  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagt 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32627421 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 32627493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 42058474 - 42058655
Alignment:
Q  46 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  42058474 aacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcagga 42058570  T
Q  145 ccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42058571 ccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 42058655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40923183 - 40922988
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  40923183 cagataataactgaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cattgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 40923087  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  40923086 ggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtactccaggac 40922988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2026487 - 2026290
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||    
T  2026487 tcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cgctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcat 2026391  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2026390 gtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 2026291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26090215 - 26090016
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgca 127  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||    
T  26090215 tcagataacaactgaaatcaaccaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgca 26090118  T
Q  128 tgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26090117 tgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagg 26090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26120627 - 26120434
Alignment:
Q  36 taatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtgg 132  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||| |||||||||||    
T  26120627 taataactgaaatcaacaaccaagattcatgcaattgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtgg 26120531  T
Q  133 taccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26120530 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcacgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 26120434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11299903 - 11299719
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||      
T  11299903 actgaaaca-caaccgagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaat 11299809  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11299808 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 11299719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11308267 - 11308083
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||      
T  11308267 actgaaaca-caaccgagactcatgcaa-tgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaat 11308173  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11308172 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 11308083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16844059 - 16843927
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16844059 tcctcaataaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 16843961  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16843960 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 16843927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Original strand, 19439295 - 19439424
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19439295 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 19439394  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtc 236  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19439395 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtc 19439424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 49150517 - 49150691
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagcc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  49150517 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggcc 49150614  T
Q  153 ctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49150615 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 49150691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 49157207 - 49157381
Alignment:
Q  55 caagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagcc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  49157207 caagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggcc 49157304  T
Q  153 ctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49157305 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 49157381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 23520986 - 23521117
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23520986 cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 23521084  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23521085 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 23521117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40685001 - 40684828
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40685001 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 40684904  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40684903 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 40684828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 166
Target Start/End: Original strand, 15622094 - 15622212
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15622094 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaataggaccg 15622193  T
Q  148 aagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  15622194 aagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 32771430 - 32771614
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  32771430 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 32771529  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  32771530 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 32771614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 749776 - 749949
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  749776 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 749873  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  749874 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 749949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37244549 - 37244414
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  37244549 gactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 37244450  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37244449 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 37244414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48988159 - 48987986
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  48988159 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 48988062  T
Q  154 tcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  48988061 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 48987986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15086163 - 15086029
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||    
T  15086163 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctc 15086064  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15086063 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 15086029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 13019691 - 13019823
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  13019691 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgct 13019790  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13019791 g-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 13019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 12461510 - 12461633
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  12461510 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattcaccgctg-tgaacaa 12461608  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  12461609 ctagtgctccatgacatgagccctc 12461633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18958670 - 18958539
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  18958670 gactcatgcaactgacataacaacactgctaagacaacacattagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 18958571  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatca 185  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18958570 accgctgttttgaatggttaaagcattcatca 18958539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16952477 - 16952343
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||| ||||    
T  16952477 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaaagcaaatatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacctc 16952378  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16952377 accgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggac 16952343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 166
Target Start/End: Original strand, 37379869 - 37379978
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37379869 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 37379967  T
Q  156 actgcttttga 166  Q
    || ||| ||||    
T  37379968 accgctgttga 37379978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 4279898 - 4280049
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  4279898 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 4279997  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  4279998 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 4280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 19616230 - 19616381
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  19616230 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 19616329  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  19616330 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 19616381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 3327734 - 3327869
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacac-cttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccct 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||    
T  3327734 gactcatgcaaatgacatggcaacatcgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccct 3327833  T
Q  155 cactgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3327834 caccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggac 3327869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13453986 - 13453884
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13453986 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcct---------caaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 13453896  T
Q  156 actgcttttgaa 167  Q
    || ||| |||||    
T  13453895 accgctgttgaa 13453884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Original strand, 21757279 - 21757381
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21757279 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcct---------caaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctc 21757369  T
Q  156 actgcttttgaa 167  Q
    || ||| |||||    
T  21757370 accgctgttgaa 21757381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 37379952 - 37380009
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37379952 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 37380009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26289991 - 26289874
Alignment:
Q  76 gacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcac--tgcttttgaatggt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||| |||||||||||||||| |  || | || ||||||||||  |  |||||||||||    
T  26289991 gacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaggaatgcaattatgcatgtggtaccataatcaaggccaaagccctcaccgttgttttgaatggt 26289892  T
Q  172 taaagcattcatcaggac 189  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26289891 taaagcattcatcaggac 26289874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36306278 - 36306152
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  36306278 gactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccctc 36306179  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||  ||  | |||||||||||||||||    
T  36306178 accactagtcgaatggttaaagcattc 36306152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13453911 - 13453854
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13453911 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 13453854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 21757354 - 21757411
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21757354 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 21757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30603080 - 30602946
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | ||| || |||||||    
T  30603080 tcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgtcatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgtaa-tatgcat 30602984  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttga 166  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30602983 gtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 30602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12404172 - 12404103
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttaga 103  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  12404172 cagataataactggaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttaga 12404103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30271892 - 30271838
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30271892 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 30271838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30602974 - 30602927
Alignment:
Q  182 atcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30602974 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 30602927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220227
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 11220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14179141 - 14179066
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  14179141 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 14179066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Original strand, 15622187 - 15622231
Alignment:
Q  185 aggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15622187 aggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 15622231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432051
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14432051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15338888
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15338888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723330
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15723330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109181
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962852
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 35962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Original strand, 13678264 - 13678345
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  13678264 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15437739 - 15437697
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15437739 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgct 15437697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 147049 - 147126
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  147049 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14320760 - 14320683
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  14320760 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 14565690 - 14565767
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  14565690 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 46624886 - 46624962
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  46624886 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 46624962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12591830 - 12591798
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12591830 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 12591798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12711095 - 12711063
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12711095 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 12711063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13124166 - 13124134
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13124166 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 13124134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Original strand, 15028 - 15218
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15028 caacaatcaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 15126  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15127 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctc 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 512768 - 512576
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512768 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgttaagacaacaccttagactactcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 512670  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  512669 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctc 512576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 178986 - 179119
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  178986 cctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgc 179085  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  179086 tg-tgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc 179119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 31565 - 31747
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31565 caacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctatgacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 31664  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggaca 230  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31665 aagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaca 31747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 24967 - 25158
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24967 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaaca-acaggaccg 25064  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25065 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctattgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 25158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15423 - 15240
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15423 gactcatgcaaatgttatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtactaaacaggaccgaagccctcac 15324  T
Q  158 tgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15323 cgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctc 15240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5956 - 5766
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5956 caacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 5858  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5857 aagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctc 5766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4864 - 4680
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4864 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctc 4766  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4765 accgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctc 4680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31816 - 31682
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||| |||    
T  31816 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaac-ccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccaaagcactc 31718  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31717 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12480 - 12281
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||    
T  12480 tcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcag-tatgcat 12382  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12381 gtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 12282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 104196 - 104393
Alignment:
Q  31 tcagataatcactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||| | |||||  |||||||    
T  104196 tcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcat 104292  T
Q  129 gtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccagga 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  104293 gtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagga 104392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16258 - 16099
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  16258 caacaactaagactcatgcaaatgacatgaaaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacca 16160  T
Q  148 aagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16159 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 16099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 13326 - 13512
Alignment:
Q  41 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| | || ||| | |||||  ||||||||||||||||      
T  13326 actgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagataccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaat 13422  T
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13423 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18653 - 18473
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaataga--tgcaaatatgcatgtggtaccagacaggac 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||  ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18653 caacaaccaagactcatgcaattgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggac 18557  T
Q  146 cgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18556 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18756 - 18577
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| | || ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18756 caacaaccaagactcatgcacatgacatgac--cactgctaagacaccttcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacaggacc 18660  T
Q  147 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18659 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 18577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1958
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  1877 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 49912 - 50107
Alignment:
Q  32 cagataatcactgaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaat-agatgcaaatatgcatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  49912 cagataataactgaaataacaaccgagactcatgcaaatgacatgac--cattgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgt 50008  T
Q  131 ggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggac 229  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  50009 ggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtactccaggac 50107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 606 - 741
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  606 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 705  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  706 t-ctgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 2006 - 2131
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  2006 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 2104  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2105 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 2131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 7705 - 7830
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||    
T  7705 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgatg-tgaacaa 7803  T
Q  215 ctagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7804 ctagtgctccaggacatgagtcctctc 7830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 12921 - 12977
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12921 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 12977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 157
Target Start/End: Original strand, 12903 - 12938
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12903 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 12938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 74306 - 74174
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74306 cctcaattaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 74207  T
Q  206 gttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    | ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  74206 g-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 74174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 65480 - 65345
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  65480 tcctcaaaatatgcaattattcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgt 65381  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctc 241  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  65380 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctc 65345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 101823 - 101705
Alignment:
Q  122 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgc 221  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  101823 tatgcatctggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctg-tgaacaactagtgc 101725  T
Q  222 cccaggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||||||||||||    
T  101724 tccaggacatgagtcctctc 101705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 26026 - 26210
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  26026 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 26125  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  26126 accgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 26210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 27408 - 27592
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  27408 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 27507  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  27508 accgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 27592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 44 - 177
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaaaccctcaccgc 143  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  144 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30387 - 30236
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  30387 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 30288  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  30287 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 30236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35788 - 35637
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  35788 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 35689  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  35688 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 35637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 24648 - 24764
Alignment:
Q  124 tgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  24648 tgcatgtggtaccagacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctc 24746  T
Q  224 caggacatgagtcctctc 241  Q
     |||||||||||||||||    
T  24747 taggacatgagtcctctc 24764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 159 - 294
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||    
T  159 gactcatgcaactgacatgacaacactactaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccctc 258  T
Q  156 actgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  259 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 451
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||    
T  634 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctc 535  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||  || | ||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  534 accactgtagaatgattaaagcattcatcagagcataagctctcaccgct-ttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 19152 - 19257
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19152 tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggacggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 19251  T
Q  205 tgttga 210  Q
    | ||||    
T  19252 ttttga 19257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19335
Alignment:
Q  140 caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  19231 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgttccaggacatgagtcctc 19329  T
Q  240 tctgct 245  Q
    ||||||    
T  19330 tctgct 19335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15194
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 157  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15152 atgcaattatgcatgtggtactagacaggaccgaagccctcac 15194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Original strand, 15177 - 15237
Alignment:
Q  184 caggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctctctgct 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15177 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgttccaagacatgagtcctctctgct 15237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 30849 - 30948
Alignment:
Q  139 acaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcct 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30849 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 30947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10359 - 10223
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggac 145  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  10359 caacaacacagactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggc 10260  T
Q  146 cgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  10259 cgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17655 - 17566
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17655 caacaacacagactcatgcaaatgacataacaacaccgctaaggtaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 17566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 247003 - 247135
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  247003 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgc 247101  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  247102 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 247135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 253517 - 253649
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 204  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  253517 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgc 253615  T
Q  205 tgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  253616 tg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 253649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 143945 - 144028
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143945 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 144028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 38336 - 38487
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  38336 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 38435  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  38436 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 203
Target Start/End: Original strand, 41215 - 41311
Alignment:
Q  106 cctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccg 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41215 cctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccg 41311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 174803 - 174652
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  174803 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 174704  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  174703 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 174652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 147050 - 147126
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  147050 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52626 - 52475
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  52626 gactcatgcaaaggacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 52527  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  52526 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 52475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47220 - 47070
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| |    
T  47220 gactcatgcaag-gacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccac 47122  T
Q  156 actgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagctctcaccgct 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  47121 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 47070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 999 - 1075
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaac-tagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacagagtgttccaggacatgagtcctc 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 254 - 381
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacac-cttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccct 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  254 gactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 353  T
Q  155 cactgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  354 caccgctaattgaatggttaaagcattc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5372 - 5237
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacac-cttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccct 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  5372 gactcatgcaaatgacataacaacaccactaagacaacactcctagactcctcaacaaacacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 5273  T
Q  155 cactgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5272 caccactaattgaatggttaaagcattcatcaggac 5237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 2854 - 2980
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca--gacaggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |  | ||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  2854 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctacactcctcaacaattacaaatatgcatgtggtaccatgttcagggccgaagccctc 2953  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    || |||  | |||||||||||||||||    
T  2954 accgctaatcgaatggttaaagcattc 2980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1841
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 1
Alignment:
Q  48 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacacctta 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacacctta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52880 - 52753
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacac-cttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccct 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  52880 gactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgctgatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 52781  T
Q  155 cactgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||    
T  52780 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 52753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 9937 - 10063
Alignment:
Q  58 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagagtcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctc 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || | || ||||   ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||    
T  9937 gactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcttcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctc 10036  T
Q  156 actgct-tttgaatggttaaagcattc 181  Q
    || |||  | |||||||||||||||||    
T  10037 accgctaatcgaatggttaaagcattc 10063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9343
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  9268 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 44938 - 45013
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  44938 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 45013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141388
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3435 - 3358
Alignment:
Q  161 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  || |  |||||||||||||||||    
T  3435 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagggttccaggacatgagtcctc 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4233
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4310 atgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcatcaggac 4233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 90
Target Start/End: Original strand, 64556 - 64590
Alignment:
Q  56 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaag 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64556 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaag 64590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14992 - 14915
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga-caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  14992 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 8518 - 8593
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  8518 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 8593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8355
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  ||||||||||| |||||    
T  8280 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 18364 - 18439
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  ||||||||||| |||||    
T  18364 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 18439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9356
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||| ||||||||||||    
T  9281 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctc 9356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47957 - 47882
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  | |||||||||||||||    
T  47957 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttctaggacatgagtcctc 47882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 41931 - 41993
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 103112 - 103045
Alignment:
Q  116 tgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  103112 tgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcattc 103045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3720
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6146
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14611
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5122
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63308
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 63308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Original strand, 157 - 238
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  157 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16241 - 16160
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  16241 tcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattcat 16160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 1329 - 1405
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  1329 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 60
Alignment:
Q  115 atgcaaatatgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgct-tttgaatggttaaagcattcatc 184  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  132 atgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 18549 - 18625
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  18549 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct-ttgaacaacgaggtgttccaggacatgagtcctc 18625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 2912 - 2988
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaacta-gtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||    
T  2912 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgct-ttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 2988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 51088
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattc 181  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 117
Alignment:
Q  105 tcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  149 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 5068
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  ||||  ||| |||||||||||||    
T  5143 ttgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgct-ttgaacaataagtgttccacgacatgagtcctc 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 44623 - 44651
Alignment:
Q  161 ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44623 ttttgaatggttaaagcattcatcaggac 44651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 27861 - 27924
Alignment:
Q  123 atgcatgtggtaccaga--caggaccgaagccctcactgctt-ttgaatggttaaagcattcat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 27924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17564 - 17489
Alignment:
Q  163 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgccccaggacatgagtcctc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17564 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcactgct-ttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3199 times since January 2019
Visitors: 4030