View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0649_low_16 (Length: 286)

Name: NF0649_low_16
Description: NF0649
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0649_low_16
NF0649_low_16
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (5-282)||(6499512-6499789)
chr3 (5-282)||(9992442-9992719)
chr3 (5-282)||(5512105-5512382)
chr3 (5-282)||(12295352-12295629)
chr3 (5-282)||(41685085-41685362)
chr3 (5-282)||(4745149-4745426)
chr3 (5-282)||(5546153-5546430)
chr3 (17-282)||(5626521-5626786)
chr3 (5-282)||(12183825-12184102)
chr3 (17-282)||(39373512-39373777)
chr3 (17-282)||(24392616-24392881)
chr3 (17-282)||(24661327-24661592)
chr3 (17-282)||(5874806-5875071)
chr3 (17-282)||(38196182-38196447)
chr3 (29-282)||(8776115-8776368)
chr3 (29-282)||(18485448-18485701)
chr3 (5-282)||(12247977-12248254)
chr3 (17-282)||(28323361-28323626)
chr3 (29-282)||(13381825-13382078)
chr3 (29-282)||(13392419-13392672)
chr3 (29-282)||(23758691-23758944)
chr3 (29-282)||(16390097-16390350)
chr3 (5-282)||(10635568-10635845)
chr3 (39-282)||(6219220-6219463)
chr3 (39-282)||(19779848-19780091)
chr3 (29-282)||(20682289-20682542)
chr3 (39-282)||(13123134-13123377)
chr3 (39-282)||(14467060-14467303)
chr3 (101-282)||(37867913-37868094)
chr3 (101-282)||(37876431-37876612)
chr3 (101-282)||(29470412-29470593)
chr3 (150-282)||(19119240-19119372)
chr3 (84-222)||(17908578-17908716)
chr3 (101-222)||(15192680-15192801)
chr3 (101-258)||(4405825-4405982)
chr3 (101-222)||(13073307-13073428)
chr3 (75-222)||(11215232-11215379)
chr3 (143-222)||(1793091-1793170)
chr3 (143-222)||(7803179-7803258)
chr3 (143-222)||(9389815-9389894)
chr3 (143-222)||(14256545-14256624)
chr3 (143-222)||(18844848-18844927)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (5-282)||(26698325-26698602)
chr7 (5-282)||(1988978-1989255)
chr7 (5-282)||(8011283-8011560)
chr7 (5-282)||(40051300-40051577)
chr7 (17-282)||(9086667-9086932)
chr7 (5-282)||(11097452-11097729)
chr7 (17-282)||(24736163-24736428)
chr7 (17-282)||(26399304-26399569)
chr7 (29-282)||(42867268-42867521)
chr7 (17-282)||(11006627-11006892)
chr7 (29-282)||(2714857-2715110)
chr7 (29-282)||(466213-466466)
chr7 (29-282)||(19992636-19992889)
chr7 (41-282)||(6876475-6876716)
chr7 (29-282)||(168335-168588)
chr7 (39-282)||(17959305-17959548)
chr7 (101-282)||(5686972-5687153)
chr7 (39-282)||(8618830-8619073)
chr7 (29-282)||(4213464-4213717)
chr7 (101-282)||(9434676-9434857)
chr7 (39-282)||(22090619-22090862)
chr7 (101-282)||(21001700-21001881)
chr7 (84-282)||(15886921-15887119)
chr7 (143-222)||(9161258-9161337)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (5-282)||(23371179-23371456)
chr5 (5-282)||(9345210-9345487)
chr5 (5-282)||(23706026-23706303)
chr5 (5-282)||(24589411-24589688)
chr5 (5-282)||(42052038-42052315)
chr5 (5-282)||(6984968-6985245)
chr5 (5-282)||(27043566-27043843)
chr5 (17-282)||(30228803-30229068)
chr5 (5-282)||(36583856-36584133)
chr5 (5-282)||(37731309-37731586)
chr5 (17-282)||(22684685-22684950)
chr5 (17-282)||(23305528-23305793)
chr5 (5-282)||(24818198-24818475)
chr5 (17-282)||(39492244-39492509)
chr5 (5-282)||(15768010-15768287)
chr5 (17-282)||(14039279-14039544)
chr5 (17-282)||(14559415-14559680)
chr5 (17-282)||(17616301-17616566)
chr5 (17-282)||(17728158-17728423)
chr5 (17-282)||(27469243-27469508)
chr5 (17-282)||(14448383-14448648)
chr5 (17-282)||(31357775-31358040)
chr5 (29-282)||(35224756-35225009)
chr5 (5-282)||(31447154-31447431)
chr5 (29-282)||(31842659-31842912)
chr5 (29-282)||(15994640-15994893)
chr5 (78-281)||(36696917-36697120)
chr5 (101-282)||(5291924-5292105)
chr5 (29-282)||(22155746-22155999)
chr5 (39-279)||(40399671-40399911)
chr5 (39-282)||(39360952-39361195)
chr5 (101-282)||(27604803-27604984)
chr5 (39-218)||(20789310-20789489)
chr5 (101-282)||(1112680-1112861)
chr5 (84-282)||(24927549-24927747)
chr5 (84-222)||(20560983-20561121)
chr5 (75-222)||(19476586-19476733)
chr5 (75-282)||(23405112-23405319)
chr5 (101-222)||(34061263-34061384)
chr5 (143-222)||(17448158-17448237)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (5-282)||(243243-243520)
chr8 (5-282)||(208735-209012)
chr8 (5-282)||(722358-722635)
chr8 (5-282)||(796613-796890)
chr8 (17-282)||(3357799-3358064)
chr8 (5-282)||(29078141-29078418)
chr8 (5-282)||(32086851-32087128)
chr8 (17-282)||(36294360-36294625)
chr8 (17-282)||(9342565-9342830)
chr8 (17-282)||(13687158-13687423)
chr8 (29-282)||(36079365-36079618)
chr8 (16-281)||(44482579-44482844)
chr8 (29-282)||(15765753-15766006)
chr8 (29-282)||(15789890-15790143)
chr8 (29-282)||(6152537-6152790)
chr8 (39-282)||(26112717-26112960)
chr8 (140-282)||(19130187-19130329)
chr8 (101-222)||(30323906-30324027)
chr8 (84-282)||(19226380-19226578)
chr8 (75-282)||(23468008-23468215)
chr8 (143-222)||(19419911-19419990)
chr8 (143-222)||(18155317-18155396)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (5-282)||(25789127-25789404)
chr6 (17-282)||(12725977-12726242)
chr6 (5-282)||(27343126-27343403)
chr6 (5-282)||(27403866-27404143)
chr6 (5-282)||(26866191-26866468)
chr6 (5-282)||(3662743-3663020)
chr6 (17-282)||(16931793-16932058)
chr6 (17-282)||(26026818-26027083)
chr6 (29-282)||(27374182-27374435)
chr6 (5-281)||(4632310-4632586)
chr6 (5-281)||(32310191-32310467)
chr6 (29-282)||(12856348-12856601)
chr6 (5-282)||(27385835-27386112)
chr6 (5-282)||(27476248-27476525)
chr6 (84-282)||(17983345-17983543)
chr6 (29-282)||(27464535-27464792)
chr6 (29-282)||(34816327-34816580)
chr6 (101-282)||(9121757-9121938)
chr6 (29-282)||(32971030-32971283)
chr6 (5-282)||(25590608-25590885)
chr6 (39-282)||(12359544-12359787)
chr6 (143-222)||(18924667-18924746)
chr6 (143-282)||(32779903-32780042)
chr6 (143-222)||(20059170-20059249)
chr6 (143-222)||(25795389-25795468)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (5-282)||(10268375-10268652)
chr2 (5-282)||(43346792-43347069)
chr2 (17-282)||(11404005-11404270)
chr2 (17-282)||(35254426-35254691)
chr2 (17-282)||(35265035-35265300)
chr2 (17-282)||(27222813-27223078)
chr2 (65-282)||(10278952-10279169)
chr2 (29-282)||(9906732-9906985)
chr2 (29-282)||(34799364-34799617)
chr2 (29-282)||(40223726-40223979)
chr2 (29-282)||(9771903-9772156)
chr2 (39-282)||(24336946-24337189)
chr2 (29-282)||(22958875-22959128)
chr2 (29-282)||(4211329-4211582)
chr2 (101-282)||(43084084-43084265)
chr2 (84-282)||(29245642-29245840)
chr2 (75-282)||(35758960-35759167)
chr2 (75-258)||(21171016-21171199)
chr2 (75-222)||(24424033-24424180)
chr2 (83-218)||(28730470-28730605)
chr2 (75-222)||(20416204-20416351)
chr2 (145-222)||(28378430-28378507)
chr2 (110-222)||(26868594-26868706)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (5-282)||(51655023-51655300)
chr1 (5-282)||(38096458-38096735)
chr1 (17-282)||(7508672-7508937)
chr1 (17-282)||(36245591-36245856)
chr1 (17-282)||(35399703-35399968)
chr1 (17-282)||(3172995-3173260)
chr1 (29-282)||(5834599-5834852)
chr1 (17-282)||(35647228-35647493)
chr1 (17-282)||(47617097-47617362)
chr1 (29-282)||(12731882-12732135)
chr1 (29-282)||(12742475-12742728)
chr1 (39-282)||(4168650-4168893)
chr1 (39-282)||(5648939-5649182)
chr1 (39-282)||(12622359-12622602)
chr1 (101-282)||(19180334-19180515)
chr1 (39-282)||(21865071-21865314)
chr1 (29-148)||(13425190-13425309)
chr1 (41-258)||(7680674-7680891)
chr1 (101-282)||(152895-153076)
chr1 (143-222)||(26561945-26562024)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (5-282)||(36019762-36020039)
chr4 (5-282)||(55754364-55754641)
chr4 (17-282)||(10749716-10749981)
chr4 (17-282)||(10963485-10963750)
chr4 (17-282)||(24641742-24642007)
chr4 (17-282)||(27658075-27658340)
chr4 (17-282)||(18761632-18761894)
chr4 (6-270)||(4996977-4997241)
chr4 (29-282)||(30935651-30935904)
chr4 (29-282)||(21997843-21998096)
chr4 (29-282)||(452003-452256)
chr4 (39-282)||(24026608-24026851)
chr4 (39-282)||(40469162-40469405)
chr4 (29-282)||(16257357-16257610)
chr4 (39-282)||(17919541-17919784)
chr4 (39-282)||(19953525-19953768)
chr4 (101-222)||(16306716-16306837)
chr4 (100-222)||(19572584-19572706)
chr4 (143-222)||(3374427-3374506)
chr4 (110-222)||(15205976-15206088)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (17-282)||(32564-32829)
scaffold0133 (101-222)||(41500-41621)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (17-282)||(46142-46407)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (5-281)||(2718-2994)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (5-279)||(24077-24351)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (29-282)||(45955-46208)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (17-282)||(3706-3971)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (29-282)||(3096-3349)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (5-282)||(516-793)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (39-282)||(52156-52399)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (39-282)||(2923-3166)
scaffold0398 (39-282)||(11178-11421)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (39-222)||(2438-2621)
[»] scaffold2119 (1 HSPs)
scaffold2119 (39-182)||(922-1065)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (104-282)||(24004-24182)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (84-222)||(670-808)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (110-222)||(133-245)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (75-222)||(193511-193658)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (154-223)||(15460-15529)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 6499512 - 6499789
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499512 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 6499611  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6499612 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcttgtacctcctattcactatta 6499711  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6499712 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaagtgtgtctcatctcactc 6499789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 9992442 - 9992719
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9992442 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaaaacaactcaaactgaaccctcacccatccctgactatatcc 9992541  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9992542 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 9992641  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9992642 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaagtgtgtctcatctcactc 9992719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5512382 - 5512105
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5512382 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatct 5512283  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5512282 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 5512183  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5512182 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 5512105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 12295352 - 12295629
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12295352 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 12295451  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12295452 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 12295551  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12295552 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 12295629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41685362 - 41685085
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41685362 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 41685263  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41685262 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 41685163  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41685162 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 41685085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4745426 - 4745149
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4745426 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 4745327  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4745326 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 4745227  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4745226 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggattagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 4745149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 5546153 - 5546430
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5546153 caacaaccagattcacccactataataaacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 5546252  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5546253 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcatgcacctcctattcactatta 5546352  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5546353 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 5546430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 5626521 - 5626786
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5626521 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 5626620  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5626621 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 5626720  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5626721 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 5626786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12184102 - 12183825
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12184102 caacaaccagattcacctactataatagacttaacttctgaccaaccttccacatcaaatgcaactcaaactgaaccctcatccatccctgaccatatcc 12184003  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12184002 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagtttctgtacctcctattcactatta 12183903  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12183902 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 12183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39373777 - 39373512
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373777 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 39373678  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373677 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 39373578  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39373577 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 39373512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 24392616 - 24392881
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24392616 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 24392715  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24392716 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 24392815  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24392816 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 24392881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24661592 - 24661327
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24661592 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccaaatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 24661493  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661492 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 24661393  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24661392 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 24661327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 5874806 - 5875071
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5874806 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatctctgaccatatcctggagtctgagt 5874905  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5874906 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgataagtggat 5875005  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5875006 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 5875071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38196447 - 38196182
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196447 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 38196348  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196347 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 38196248  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  38196247 ggatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 38196182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8776368 - 8776115
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776368 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 8776269  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8776268 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 8776169  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8776168 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 8776115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18485701 - 18485448
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485701 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 18485602  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18485601 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 18485502  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18485501 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 18485448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 12247977 - 12248254
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  12247977 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatcc 12248076  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248077 ttgaaactgagtatatagaggaacagctgatcagactcagtgacgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 12248176  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12248177 tgatcagtggatggatctggagaagagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 12248254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 28323361 - 28323626
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323361 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 28323460  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323461 atatagaggaacagccgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 28323560  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28323561 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggaccaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 28323626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 13381825 - 13382078
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13381825 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 13381924  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13381925 aactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 13382024  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13382025 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 13382078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 13392419 - 13392672
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13392419 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 13392518  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13392519 aactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 13392618  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13392619 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 13392672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23758944 - 23758691
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23758944 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 23758845  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23758844 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 23758745  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23758744 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 23758691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 16390097 - 16390350
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16390097 atagacttaacctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaaactgaaccctcacccattcctgacaatatcctagagtctgagtatatagatgaac 16390196  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||    
T  16390197 agctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcagtggatgaatctgaagaa 16390296  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16390297 gagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcatctcactc 16390350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 10635568 - 10635845
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10635568 caacaaccagcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccctcctcatcaaacacaaatcaaactgaaccctcacccattcctgacaatatcc 10635667  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10635668 ttgagactgagtatattgaggaacaactgatcagacttagtgaggagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatta 10635767  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||  ||  |||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  10635768 tgatcagtggatggatctggagaaaagctttgttgatctgatgagtcagctcataaccaaatgtgtctcatctcactc 10635845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 6219220 - 6219463
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6219220 cctctgaccaaccctccgcatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 6219319  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  6219320 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctaaaaaagagttttgat 6219419  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  6219420 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 6219463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19780091 - 19779848
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19780091 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 19779992  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||    
T  19779991 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctgaaaaagagttttaat 19779892  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  19779891 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 19779848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 20682289 - 20682542
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  20682289 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 20682388  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  20682389 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 20682488  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  20682489 gagttttgatgacctgctggataagctaagttctaagtgtgtctcatctcactc 20682542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13123377 - 13123134
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||     
T  13123377 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaacagttaatcaa 13123278  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  13123277 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 13123178  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  13123177 gacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 13123134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14467303 - 14467060
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||     
T  14467303 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaacagttaatcaa 14467204  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  14467203 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 14467104  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  14467103 gacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 14467060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37868094 - 37867913
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37868094 atcctagaatctgagtatatagatgaacaactaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 37867995  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  37867994 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 37867913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37876612 - 37876431
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876612 atcctagaatctgagtatatagatgaacaactaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 37876513  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  37876512 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 37876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 29470412 - 29470593
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29470412 atcctagaatctgagtatatagatgatcagcttatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcact 29470511  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || | ||||| |||||||||||  ||||    ||| ||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  29470512 atcaagatcaatggatggatctgaagaaagattttaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 29470593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 282
Target Start/End: Original strand, 19119240 - 19119372
Alignment:
Q  150 agattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactgga 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||  | ||| ||||||| |||||    
T  19119240 agattcagacactgattcttcgcagaacagttcctctacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaaaggttttaatgagctgctgga 19119339  T
Q  250 tcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  19119340 tcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 19119372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 17908578 - 17908716
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17908578 cacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagtcactgattcttctcagaacagttcc 17908677  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  17908678 tgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 17908716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 15192680 - 15192801
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15192680 atcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcact 15192779  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||  |||||| |||||||||||    
T  15192780 atcttgatcaatggatggatct 15192801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4405982 - 4405825
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  4405982 atcctggaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcctgtacccccaattcact 4405883  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttag 258  Q
    ||  |||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  4405882 atcttgatcaatggatggatctgaagaaggattttaatgagctgctggatcaacttag 4405825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13073428 - 13073307
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13073428 atcctggaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagtccctgtacctcctattcact 13073329  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||  |||||| |||||||||||    
T  13073328 atcttgatcaatggatggatct 13073307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 11215232 - 11215379
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  11215232 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgattatattgatgaacagcttatcaggttaagtgatgcgattcagagactgattcttctcag 11215331  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||   |||||| |||||||||||    
T  11215332 aacagttcctgtacctctcattcactaccttgatcaatggatggatct 11215379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 1793091 - 1793170
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  1793091 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcaatgaatggatct 1793170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 7803179 - 7803258
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7803179 agtgatgagattcagtcactaattcttctcagaacagttcttgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 7803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 9389815 - 9389894
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||    
T  9389815 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcactacattgatcaatggatggatct 9389894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 14256545 - 14256624
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  14256545 agtgatgagatttagagagtgattcttctcagaacagttcctgtacctccaattcactatcttgatcaatggatggatct 14256624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 18844848 - 18844927
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||   |||||| |||||||||||    
T  18844848 agtgatgagattcagagactgattcttctcaaaacagttcatgtacccccaattcactaacttgatcaatggatggatct 18844927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 26698325 - 26698602
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26698325 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 26698424  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26698425 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 26698524  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26698525 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 26698602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1989255 - 1988978
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1989255 caacaaccagattcacccactataatagacttaacccctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 1989156  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989155 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 1989056  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1989055 tgatcagtggatggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 1988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 8011283 - 8011560
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8011283 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 8011382  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011383 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 8011482  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8011483 tgatcagtggatggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 8011560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 40051300 - 40051577
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40051300 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 40051399  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40051400 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 40051499  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40051500 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 40051577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9086932 - 9086667
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9086932 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 9086833  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086832 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 9086733  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9086732 ggatcttcagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 9086667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11097729 - 11097452
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11097729 caacaaccagattcaccccctataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 11097630  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11097629 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 11097530  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11097529 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcctctcactc 11097452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24736428 - 24736163
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24736428 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaatcttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 24736329  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24736328 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 24736229  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24736228 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 24736163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 26399304 - 26399569
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26399304 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 26399403  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26399404 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 26399503  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26399504 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 26399569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42867521 - 42867268
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867521 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 42867422  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42867421 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 42867322  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  42867321 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 42867268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11006892 - 11006627
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006892 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 11006793  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11006792 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgattagtggat 11006693  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11006692 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggaccaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 11006627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 2714857 - 2715110
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2714857 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaattcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 2714956  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2714957 aactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattctttgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 2715056  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2715057 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 2715110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 466213 - 466466
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  466213 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 466312  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  466313 agctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 466412  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  466413 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 466466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 19992636 - 19992889
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19992636 atagacttaacctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaaattgaaccctcatccatccctgacaatatactagagtatgagtatatagatgaac 19992735  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||    
T  19992736 agctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcaaaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggacctgaagaa 19992835  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19992836 gagtttcaatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtctcatctcactc 19992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 6876475 - 6876716
Alignment:
Q  41 tctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagac 140  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||| |    
T  6876475 tctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaggc 6876574  T
Q  141 ttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6876575 ttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctaaaaaagagttttgatga 6876674  T
Q  241 gctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  6876675 cctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 6876716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 168588 - 168335
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  168588 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 168489  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  168488 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 168389  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  168388 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 168335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 17959305 - 17959548
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||     
T  17959305 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaa 17959404  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  17959405 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 17959504  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  17959505 gacctgctggataagctaagttctaagtgtgtctcatctcactc 17959548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5687153 - 5686972
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5687153 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 5687054  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5687053 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctacgcactaagtgtgtttcatctcactc 5686972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8619073 - 8618830
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||     
T  8619073 cctctgaccaaccctccatatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaa 8618974  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  8618973 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 8618874  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  8618873 gacctgctggataagctaagttctaagtgtgtctcatctcactc 8618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4213717 - 4213464
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  4213717 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctaactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 4213618  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  4213617 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 4213518  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||| | || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  4213517 gagttttgataacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 4213464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9434857 - 9434676
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434857 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactaattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 9434758  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9434757 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcatctcactc 9434676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22090862 - 22090619
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||     
T  22090862 cctctgaccaatcctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaa 22090763  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  22090762 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 22090663  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  22090662 gacctgctggataagctaagttctaagtgtgtctcatctcactc 22090619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 21001700 - 21001881
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21001700 atcctaaaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggtttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 21001799  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21001800 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcatctcactc 21001881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Original strand, 15886921 - 15887119
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15886921 cacccatcccagacaccatcctagaatctgagtatatagatgaacagcttatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcc 15887020  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||  | ||| ||||||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||||    
T  15887021 tgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaaaggttttaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtttctcatctcactc 15887119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9161337 - 9161258
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  9161337 agtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcatgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 9161258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 23371179 - 23371456
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371179 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 23371278  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371279 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 23371378  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23371379 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 23371456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 9345210 - 9345487
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9345210 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 9345309  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9345310 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 9345409  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9345410 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 9345487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 23706026 - 23706303
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23706026 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 23706125  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23706126 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 23706225  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23706226 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 23706303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24589688 - 24589411
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24589688 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 24589589  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24589588 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 24589489  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24589488 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 24589411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 42052038 - 42052315
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42052038 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 42052137  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42052138 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 42052237  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42052238 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 42052315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 6984968 - 6985245
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6984968 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcactcatccctgaccatatcc 6985067  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6985068 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 6985167  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6985168 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 6985245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27043843 - 27043566
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27043843 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccatatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 27043744  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27043743 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 27043644  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27043643 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 27043566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30229068 - 30228803
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30229068 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 30228969  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228968 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 30228869  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30228868 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 30228803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36584133 - 36583856
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36584133 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcactcatccctgaccatatcc 36584034  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36584033 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 36583934  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36583933 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 36583856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37731586 - 37731309
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37731586 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 37731487  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37731486 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 37731387  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37731386 tgatcagtggatggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 37731309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 22684685 - 22684950
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22684685 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 22684784  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684785 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 22684884  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22684885 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 22684950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 23305528 - 23305793
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23305528 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 23305627  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23305628 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 23305727  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23305728 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 23305793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24818475 - 24818198
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24818475 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaacgtttcacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 24818376  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24818375 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 24818276  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24818275 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 24818198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39492509 - 39492244
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39492509 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 39492410  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39492409 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 39492310  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39492309 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 39492244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 15768010 - 15768287
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15768010 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccatatcaaatacaactcaaaccgaaccttcacccatccctgaccatatcc 15768109  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768110 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagactcagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 15768209  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15768210 tgatcagtggatggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcaacttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 15768287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 14039279 - 14039544
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14039279 tcacccactataatagacttaacctctaaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 14039378  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039379 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgaaattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 14039478  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14039479 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 14039544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14559680 - 14559415
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14559680 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 14559581  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14559580 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattttgatcagtggat 14559481  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14559480 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 14559415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 17616301 - 17616566
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17616301 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 17616400  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616401 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 17616500  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17616501 ggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 17616566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 17728158 - 17728423
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17728158 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 17728257  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728258 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 17728357  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17728358 ggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 17728423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 27469243 - 27469508
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27469243 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacattcaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 27469342  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469343 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgtagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 27469442  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27469443 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 27469508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14448648 - 14448383
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448648 tcacccactataatagacttaacccctgaccaaccttctacatcaaatacaactcaaacagaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 14448549  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448548 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgatccttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 14448449  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14448448 ggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 14448383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 31357775 - 31358040
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31357775 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 31357874  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357875 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 31357974  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31357975 ggatcttcagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 31358040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 35224756 - 35225009
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224756 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 35224855  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35224856 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 35224955  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  35224956 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 35225009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 31447154 - 31447431
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31447154 caacaaccagcatcacctactttaatagacttaacctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaaactgaaccctcacccattcctgacaatatcc 31447253  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  31447254 tagagtctgagtatatagatgaacaggtaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatct 31447353  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  31447354 tgatcagtggatggatctgaagaagagttttgaggagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcagctcactc 31447431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 31842659 - 31842912
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31842659 atagatttagcctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaacctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 31842758  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31842759 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 31842858  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31842859 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 31842912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15994893 - 15994640
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15994893 atagacttaacctctgatcaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaacctacaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 15994794  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15994793 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 15994694  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15994693 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 15994640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 36696917 - 36697120
Alignment:
Q  78 aaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaac 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36696917 aaccatcacccattcctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaac 36697016  T
Q  178 agttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatct 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||||| ||||| |||||||| |||||     
T  36697017 agttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatcttctgagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcc 36697116  T
Q  278 cact 281  Q
    ||||    
T  36697117 cact 36697120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5292105 - 5291924
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5292105 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcatattcact 5292006  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5292005 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtttcatctcactc 5291924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 22155746 - 22155999
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  22155746 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 22155845  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  22155846 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtatctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 22155945  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  22155946 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 22155999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Original strand, 40399671 - 40399911
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40399671 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 40399770  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  40399771 acttagtgatgggattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatccgtggatggatctgaaaaagagttttgat 40399870  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctca 279  Q
    || || ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||    
T  40399871 gacctgctggatcagctaagttctaagtgcgtctcatctca 40399911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 39360952 - 39361195
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||    
T  39360952 cctctgaacaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcag 39361051  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||    
T  39361052 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcattatcttgatcagtggatgaatctgaaaaagagttttgat 39361151  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  39361152 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 39361195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27604984 - 27604803
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27604984 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcact 27604885  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  27604884 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 27604803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 20789310 - 20789489
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||||| |||||    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20789310 cctctgaccaaccctccacatctcaaacaactcattctgaaccttcacccatacctgataccatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 20789409  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatgg 218  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20789410 gcttagtgatgagattcatgcactgattctttgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcagtggatgg 20789489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1112861 - 1112680
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1112861 atcctagaatctgagtatatagatgatcagcttatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcact 1112762  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || | ||||| |||||||||||  ||||    ||| ||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  1112761 atcaagatcaatggatggatctgaagaaagattttaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 1112680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24927747 - 24927549
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  24927747 cacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataagtttaagtgatgagattcagtcactgattcttctcagaatagttcc 24927648  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||  || | || |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  24927647 tgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatctaaagaaaagcttcaataaactgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 24927549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 20560983 - 20561121
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20560983 cacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcc 20561082  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20561083 tgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 20561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 19476586 - 19476733
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19476586 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgaatttattgatgaacaacttatcaggttaagtgatgagattcagggactgattcttctcag 19476685  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  19476686 aacagtttctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 19476733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 282
Target Start/End: Original strand, 23405112 - 23405319
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23405112 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgattatattgatgaataacttatcaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcag 23405211  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttca 274  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||| |||||||| || || || || ||||| |||    
T  23405212 aacaattcatgtacctcccattcactaccttgatcaatggatggatctgaagaagaacttcaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctca 23405311  T
Q  275 tctcactc 282  Q
     |||||||    
T  23405312 actcactc 23405319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 34061263 - 34061384
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34061263 atcctggaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcatgtacctcctattcact 34061362  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||  |||||| |||||||||||    
T  34061363 atcttgatcattggatggatct 34061384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17448237 - 17448158
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  17448237 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcatgtacccccaattcactatcttgatcaatggatgaatct 17448158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 243520 - 243243
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  243520 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaattgaaccttcacccatccctgaccatatcc 243421  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  243420 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 243321  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  243320 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 243243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 208735 - 209012
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  208735 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaattgaaccttcacccatccctgaccatatcc 208834  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208835 tggagtctaagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 208934  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  208935 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 209012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 722358 - 722635
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  722358 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaattgaaccttcacccatccctgaccatatcc 722457  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  722458 tggagtctaagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 722557  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  722558 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 722635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 796890 - 796613
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  796890 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaattgaaccttcacccatccctgaccatatcc 796791  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  796790 tggagtctaagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 796691  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  796690 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 796613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 3357799 - 3358064
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3357799 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 3357898  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3357899 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 3357998  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3357999 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 3358064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29078418 - 29078141
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29078418 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 29078319  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29078318 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgataagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 29078219  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29078218 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 29078141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 32086851 - 32087128
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32086851 caacaaccagattcacccattataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 32086950  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32086951 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 32087050  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32087051 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 32087128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36294625 - 36294360
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294625 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 36294526  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294525 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 36294426  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36294425 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 36294360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9342830 - 9342565
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9342830 tcacccactataatagacttaacctctggccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaatcttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 9342731  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342730 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 9342631  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9342630 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 9342565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 13687158 - 13687423
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687158 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 13687257  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687258 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 13687357  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  13687358 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 13687423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36079618 - 36079365
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079618 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 36079519  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36079518 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 36079419  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  36079418 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 36079365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44482844 - 44482579
Alignment:
Q  16 ttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgag 115  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44482844 ttcacctactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgatcatatcctagagtctgag 44482745  T
Q  116 tatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtgga 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482744 tatatagaggaacaactgatcagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtgga 44482645  T
Q  216 tggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcact 281  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  44482644 tggatctacaaaagagcttcaatgatcttctgagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccact 44482579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 15765753 - 15766006
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15765753 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 15765852  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15765853 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 15765952  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||  ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15765953 gagctttcttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 15766006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 15789890 - 15790143
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15789890 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccttgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 15789989  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15789990 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 15790089  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||  ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15790090 gagctttcttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 15790143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6152790 - 6152537
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6152790 atagatttagcctctgactaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatatagatgaac 6152691  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  6152690 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 6152591  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  6152590 gagttttgatgacctactggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 6152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26112960 - 26112717
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26112960 cctctgatcaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 26112861  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  26112860 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 26112761  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||    
T  26112760 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtatctcatctcactc 26112717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19130329 - 19130187
Alignment:
Q  140 cttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatg 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  19130329 cttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcgtgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatg 19130230  T
Q  240 agctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  19130229 agctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 19130187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 30323906 - 30324027
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323906 atcctagaatctgagtatatagatgaacagcttatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcact 30324005  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  30324006 atcaagatcaatggatggatct 30324027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19226578 - 19226380
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19226578 cacccatcccagacaccatcctagaatctgagtatatagatgaacagcttattaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcc 19226479  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||  ||||  | ||| ||||||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||||    
T  19226478 tgtacctctcattcactatctggatcaatggatggatctgaagaaaggttttaatgagctgctggatcaactaagcacaaaatgtatctcatctcactc 19226380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 282
Target Start/End: Original strand, 23468008 - 23468215
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  23468008 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgattatattgatgaacagcttatcaggttaagtgatgagattcagacattgattcttctcag 23468107  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttca 274  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||  |||||  |||  ||||||| |||||||| || || || || ||||| |||    
T  23468108 aacagttcatgtacctcccattcactaccttgatcaatggatggatctgaagaaggacttcaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctca 23468207  T
Q  275 tctcactc 282  Q
     |||||||    
T  23468208 actcactc 23468215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19419990 - 19419911
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  19419990 agtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 19419911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18155396 - 18155317
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  18155396 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcttgtacccctaattcactatcttgatcaatggatgaatct 18155317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25789404 - 25789127
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25789404 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 25789305  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25789304 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 25789205  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25789204 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 25789127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 12725977 - 12726242
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12725977 tcacccactataatagacttaacccctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 12726076  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726077 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 12726176  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12726177 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 12726242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27343403 - 27343126
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27343403 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccatatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 27343304  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27343303 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 27343204  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27343203 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 27343126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27404143 - 27403866
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27404143 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccatatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 27404044  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27404043 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 27403944  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27403943 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 27403866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26866468 - 26866191
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26866468 caacaaccagattcacccattataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 26866369  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26866368 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgtttcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatta 26866269  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26866268 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 26866191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3663020 - 3662743
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3663020 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatattc 3662921  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3662920 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttaatgatgagatttaggcactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatta 3662821  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3662820 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 3662743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16932058 - 16931793
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16932058 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 16931959  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931958 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 16931859  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16931858 ggatcttcagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 16931793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26027083 - 26026818
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26027083 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaacttctacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 26026984  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026983 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 26026884  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26026883 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 26026818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27374435 - 27374182
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374435 atagacttaacctctgaccaaccctccacatcaaatacaactcaaactggaccctcacccatccctgacaatatcctagagtctgagtatatagaggaac 27374336  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27374335 agctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcatgatcagtggatggatctgcagaa 27374236  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27374235 gagctttgatgaactgatgaatcagcttagaactaagtgtgtctcatctcactc 27374182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4632586 - 4632310
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4632586 caacaaccagattcacctactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 4632487  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632486 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 4632387  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcact 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4632386 tgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatcttctgagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccact 4632310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 281
Target Start/End: Original strand, 32310191 - 32310467
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32310191 caacaaccagattcacctactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 32310290  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310291 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 32310390  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcact 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  32310391 tgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatcttctgagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccact 32310467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12856601 - 12856348
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12856601 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 12856502  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12856501 aactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 12856402  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12856401 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 12856348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27386112 - 27385835
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27386112 caacaaccagattcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttcctcatcaaatacaactccaatgcaaccatcacccattcctgaccatatcc 27386013  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27386012 tggagtctgagtatatagaggaacaactgattagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 27385913  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27385912 tgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatctactaagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccactc 27385835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27476525 - 27476248
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27476525 caacaaccagattcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttcctcatcaaatacaactccaatgcaaccatcacccattcctgaccatatcc 27476426  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476425 tggagtctgagtatatagaggaacaactgattagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 27476326  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27476325 tgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatctactaagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccactc 27476248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Original strand, 17983345 - 17983543
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983345 cacccatccctgaccatatcctggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 17983444  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17983445 tgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 17983543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27464792 - 27464535
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464792 atagacttaacctctgaccaaccctccacatcaaatacaactcaaactgg-ccctcacccatccctgacaatatcctagagtctgagtatatagaggaac 27464694  T
Q  129 agctgatc-agactta--gtgatgag-attcagg-cactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatcta 223  Q
    |||| ||| || |||   |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27464693 agctaatcgaggctttaggtgatgagtattcaagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcatgatcagtggatggatctg 27464594  T
Q  224 cagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27464593 cagaagagctttgatgaactgatgaatcagcttagaactaagtgtgtctcatctcactc 27464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 34816327 - 34816580
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  34816327 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 34816426  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  34816427 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 34816526  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  34816527 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 34816580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 9121757 - 9121938
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9121757 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 9121856  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9121857 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcatctcactc 9121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 32971030 - 32971283
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  32971030 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 32971129  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  32971130 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcattatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 32971229  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  32971230 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 32971283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25590885 - 25590608
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| ||  |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||  | |||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25590885 caacaaccagcaccacccactataatagactgaacccctgaccaaccctcctcatctcaaacaacctaacctgaaccttcacccatccctgacaatatcc 25590786  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  25590785 tagagtctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgaaattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatct 25590686  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||  |||| || ||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25590685 tgatcagtggatggatataaagaaaagattaaatgaactgctgaaacaactaagaacaaagtgtgtctcatctcactc 25590608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12359787 - 12359544
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  12359787 cctctgaccaaccttcaacatctcaaacaacccattctgaaccttcacccatccctgacactatcctagaatctgagtatattgatgaacagcttgtcag 12359688  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||  | ||| ||    
T  12359687 gctaagtgatgagattcagacactgattcttcgcataacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaatggttttaat 12359588  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||||    
T  12359587 gagctgctggatcaactaagcacaaaatgtatctcatctcactc 12359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 18924667 - 18924746
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18924667 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatct 18924746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Original strand, 32779903 - 32780042
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagc 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||  ||||  |||| |    
T  32779903 agtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctctcattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaaaggcttcaatgaac 32780002  T
Q  243 tactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    | |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  32780003 tgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 32780042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 20059170 - 20059249
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  20059170 agtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcattatcttgatcaatggatggatct 20059249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25795468 - 25795389
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25795468 agtgatgagattcagagactgattcttcgcagaacagtccctgtacccccaattcactatcttgatcagtggatggatct 25795389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10268652 - 10268375
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10268652 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 10268553  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10268552 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 10268453  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10268452 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 10268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43347069 - 43346792
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43347069 caacaaccagattcacccactataatatacttaacgtctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 43346970  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346969 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 43346870  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43346869 tgatcagtggatggatctacagaagaactttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 43346792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 11404005 - 11404270
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11404005 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 11404104  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404105 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 11404204  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11404205 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 11404270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35254691 - 35254426
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254691 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 35254592  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254591 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 35254492  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  35254491 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 35254426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35265300 - 35265035
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35265300 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 35265201  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35265200 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 35265101  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  35265100 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 35265035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27223078 - 27222813
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223078 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 27222979  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222978 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 27222879  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27222878 ggatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 27222813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10279169 - 10278952
Alignment:
Q  65 acaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactga 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10279169 acaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactga 10279070  T
Q  165 ttcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10279069 ttcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaa 10278970  T
Q  265 gtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||    
T  10278969 atgtgtgtcatctcactc 10278952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 9906732 - 9906985
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  9906732 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatcgctgacagtatccttgagacttagtatatagaggaac 9906831  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9906832 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 9906931  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  9906932 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 9906985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 34799364 - 34799617
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34799364 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 34799463  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34799464 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcacagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 34799563  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  |   |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34799564 gagctttgttgatctgataagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 34799617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40223979 - 40223726
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40223979 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 40223880  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40223879 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcacggattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 40223780  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  40223779 gagctttgttgatctgatgagtcagatcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 40223726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 9771903 - 9772156
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9771903 atagatttagcctctgaccaaccttccacatcaaattcaaatcaaactcaaacctcacccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 9772002  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9772003 agctgatcaaacttagtgatgagattcaggcactgattcttcacagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 9772102  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  9772103 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 9772156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 24336946 - 24337189
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24336946 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 24337045  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  24337046 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 24337145  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  24337146 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 24337189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 22958875 - 22959128
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  22958875 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 22958974  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  22958975 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 22959074  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  22959075 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 22959128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4211582 - 4211329
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  4211582 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 4211483  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  4211482 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 4211383  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  4211382 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 4211329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43084265 - 43084084
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084265 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 43084166  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  43084165 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctcatctcactc 43084084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29245840 - 29245642
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29245840 cacctatccctgacaccatcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcc 29245741  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  29245740 tgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 29245642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 282
Target Start/End: Original strand, 35758960 - 35759167
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35758960 ctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcag 35759059  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  35759060 aacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctgaaaaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtctca 35759159  T
Q  275 tctcactc 282  Q
    ||||||||    
T  35759160 tctcactc 35759167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Original strand, 21171016 - 21171199
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21171016 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctagaatctgagtatattgatgaacaacttatcaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcag 21171115  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttag 258  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  21171116 aacagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaagggctttaatgagctgctggatcaacttag 21171199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 24424033 - 24424180
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24424033 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgattatattgatgaacagcttatcaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcag 24424132  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  24424133 aacagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 24424180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Original strand, 28730470 - 28730605
Alignment:
Q  83 tcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttc 182  Q
    ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28730470 tcacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaacagcttatcaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttc 28730569  T
Q  183 ctgtacctcctattcactattatgatcagtggatgg 218  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||    
T  28730570 ctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatgg 28730605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 20416204 - 20416351
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    |||||||  |||||||||| |||   ||||| || ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20416204 ctgaacctacacccatcccagacaccatcctggaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcag 20416303  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20416304 aacagttcctatacctcctattcactatcttgatcaatggatggatct 20416351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 28378430 - 28378507
Alignment:
Q  145 tgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  28378430 tgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcatgtacccccaattcactatcttgatcaatggatggatct 28378507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26868706 - 26868594
Alignment:
Q  110 tctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatc 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||  | |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| |    
T  26868706 tctgaatatattgatgaacagctcataaggttaagtgatgaaattcagagactgattcttctcagaacagttcttgtacctccaattcactttcttgacc 26868607  T
Q  210 agtggatggatct 222  Q
    | |||||||||||    
T  26868606 aatggatggatct 26868594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 51655023 - 51655300
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51655023 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 51655122  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51655123 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcctcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 51655222  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51655223 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 51655300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38096735 - 38096458
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38096735 caacaaccagattcacccactataatagacttaacccctgacaaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 38096636  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096635 tagagtctgagtatatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 38096536  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38096535 tgatcagtggatggatctacagaaaagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 38096458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7508937 - 7508672
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7508937 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 7508838  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508837 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 7508738  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7508737 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 7508672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 36245591 - 36245856
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36245591 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 36245690  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36245691 atatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 36245790  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36245791 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 36245856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 35399703 - 35399968
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35399703 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 35399802  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35399803 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 35399902  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  35399903 ggatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 35399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3173260 - 3172995
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3173260 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 3173161  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3173160 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 3173061  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  3173060 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 3172995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5834852 - 5834599
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834852 atagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 5834753  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5834752 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggatggatcttcagaa 5834653  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5834652 gagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 5834599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 35647228 - 35647493
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647228 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 35647327  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647328 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 35647427  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  35647428 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 35647493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 47617097 - 47617362
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617097 tcacccactataatagacttaacccctgaccaaccttctacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 47617196  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617197 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 47617296  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  47617297 ggatctacagaaaagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 47617362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12732135 - 12731882
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12732135 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 12732036  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12732035 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 12731936  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12731935 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 12731882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12742728 - 12742475
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12742728 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 12742629  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12742628 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 12742529  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12742528 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4168893 - 4168650
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  4168893 cctctgaccaatcctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgattatatagatgaacagctaatcag 4168794  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  4168793 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 4168694  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  4168693 gagctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 4168650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 5648939 - 5649182
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5648939 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 5649038  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  5649039 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttaatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 5649138  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  5649139 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 5649182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 12622359 - 12622602
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||     
T  12622359 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaa 12622458  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  12622459 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 12622558  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||| ||| |||||||||||    
T  12622559 gacctactggataagctaagttctaagtatgtctcatctcactc 12622602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19180515 - 19180334
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180515 atcctagaatctgagtatatagatgaacagctaatcaggcttagtgatgagattcagacactaattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 19180416  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19180415 atcttgatcagtggatggatctgaagaagagttttgatgagctgctggatcagctaagcactaagtgtgtttcatctcactc 19180334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21865314 - 21865071
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||     
T  21865314 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcaa 21865215  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  21865214 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 21865115  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  21865114 gacctgctggataagctaagttctaagtgtgtctcatctcactc 21865071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 13425190 - 13425309
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13425190 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactaaaccatcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 13425289  T
Q  129 agctgatcagacttagtgat 148  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13425290 agctgatcagacttagtgat 13425309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7680891 - 7680674
Alignment:
Q  41 tctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagac 140  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||     
T  7680891 tctgaccgaccttccacatctcaaacaacccatcctgaaccttcacccatccctgacaccatcctagaatctgagtacattgatgaacagcttatcagat 7680792  T
Q  141 ttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatga 240  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  |||||  |||| ||||    
T  7680791 taagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcatgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatctgaagaaggactttaatga 7680692  T
Q  241 gctactggatcagcttag 258  Q
    |||  ||||||| |||||    
T  7680691 gctgatggatcaacttag 7680674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 152895 - 153076
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  152895 atcctagaatctgagtatatagatgatcagcttatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcttgtacctcccattcact 152994  T
Q  201 attatgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || | ||||| |||||||||||  ||||    ||| ||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  152995 atcaagatcaatggatggatctgaagaaagattttaatgagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 153076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26562024 - 26561945
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  26562024 agtgatgagattcagtcactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatgaatct 26561945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36020039 - 36019762
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36020039 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 36019940  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36019939 tggagtctgagtatatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 36019840  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36019839 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctgttggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 36019762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 55754364 - 55754641
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55754364 caacaaccagattcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 55754463  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55754464 tagagtctgagtatatagaggaacagctgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactatta 55754563  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  55754564 tgatcagtagatggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 55754641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 10749716 - 10749981
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10749716 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccaaatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 10749815  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749816 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 10749915  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10749916 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 10749981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 10963485 - 10963750
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10963485 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccttccaaatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 10963584  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963585 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 10963684  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10963685 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 10963750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24642007 - 24641742
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642007 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 24641908  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641907 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 24641808  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  24641807 ggatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 24641742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27658340 - 27658075
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27658340 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 27658241  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27658240 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 27658141  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27658140 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 27658075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 18761632 - 18761894
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18761632 tcacccactattatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgag- 18761730  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18761731 atatagaggaacagttgatca-act-agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 18761828  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  18761829 ggatcttcagaagagctttgatgagctgctggatcagctcagaactaaatgtgtgtcatctcactc 18761894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 4996977 - 4997241
Alignment:
Q  6 aacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcct 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4996977 aacaacctgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaattcaactcaaactcaaccctcacccatccctgacagtatcct 4997076  T
Q  106 agagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattat 205  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4997077 tgaaactgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattat 4997176  T
Q  206 gatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgt 270  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||||||||||||    
T  4997177 gatcagtggatggatctggagaagagctttgttgatctgatgagtcagctcagaactaagtgtgt 4997241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 30935651 - 30935904
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30935651 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 30935750  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30935751 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 30935850  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30935851 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 30935904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21998096 - 21997843
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  21998096 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactaagtatatagaggaac 21997997  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21997996 agttgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 21997897  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  21997896 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 21997843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 452256 - 452003
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  452256 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 452157  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  452156 aactgattagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcttattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 452057  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  452056 gagctttgttgatctgatgagtcagctcagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 24026608 - 24026851
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24026608 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 24026707  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  24026708 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 24026807  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  24026808 gacctgctggataagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 24026851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 40469162 - 40469405
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  40469162 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaacctgaaccttcacccttacctgacactatcctagagtctgagtatatagatgaacaactaatcag 40469261  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| ||  ||    
T  40469262 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggacttaaagaagagtttcaat 40469361  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  40469362 gagctgctggatcaactaagcacaaagtgtgtctcatctcactc 40469405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16257610 - 16257357
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  16257610 atagatttagcctctgaccaaccttccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactatatccttgaatctgagtatattgatgaac 16257511  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||    
T  16257510 agttaatcaagcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaa 16257411  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  16257410 gagttttgatgacctgctggataagcttagttcaaagtgtgtctcatctcactc 16257357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17919784 - 17919541
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17919784 cctctgatcaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagctaatcag 17919685  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  17919684 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctatacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctgaaaaagagttttgat 17919585  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  17919584 gacctactggataagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 17919541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 19953525 - 19953768
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||    
T  19953525 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcaaccatccctgactctatccttgaatctgagtatatagatgaacagttaatcag 19953624  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | || || ||||||    
T  19953625 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatctgaaaaatagttttgat 19953724  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  19953725 gacctgctggatcagctaagctctaagtgtgtctcatctcactc 19953768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16306837 - 16306716
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16306837 atcctggaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcctgtacctcctattcact 16306738  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||  |||||| |||||||||||    
T  16306737 atattgatcaatggatggatct 16306716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19572706 - 19572584
Alignment:
Q  100 tatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||    
T  19572706 tatcctagaatctgagtatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgaaattcagagactgattcttctcaaaacagttcctgtacccccaattcac 19572607  T
Q  200 tattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||  |||||| |||||||||||    
T  19572606 tatcttgatcaatggatggatct 19572584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3374506 - 3374427
Alignment:
Q  143 agtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||| |||||||||||    
T  3374506 agtgatgagattcagagactgattcttctcagaacagttcctgtacctctcattcactaccttgatcaatggatggatct 3374427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Original strand, 15205976 - 15206088
Alignment:
Q  110 tctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatc 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||  | |||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  15205976 tctgaatatattgatgaacagctcataaggttaagtgatgaaattcagagactgattcttctcaaaacagtttctgtacctccaattcactattttgacc 15206075  T
Q  210 agtggatggatct 222  Q
    | |||||||||||    
T  15206076 aatggatggatct 15206088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32829 - 32564
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32829 tcacccactataatagacttaacctctgacaaaccttccacatcacatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctggagtctgagt 32730  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32729 atatagaggaacaactgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 32630  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32629 ggatctacagaagagctttgatgagctgctggatcagcttagaactaaatgtgtgtcatctcactc 32564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 41500 - 41621
Alignment:
Q  101 atcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcact 200  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41500 atcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcact 41599  T
Q  201 attatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||  |||||| |||||||||||    
T  41600 atcttgatcaatggatggatct 41621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 46142 - 46407
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46142 tcacccactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 46241  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46242 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgcacctcctattcactattatgatcagtggat 46341  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  46342 agatcttcagaagagctttgatgagttgctggatcaactcagaaccaaatgtgtgtcatctcactc 46407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2718
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2994 caacaaccagattcacctactataatagacttaacctctgaccaaccaaccacatcaaatacaactcaaactgaaccttcacccatccctgaccatatcc 2895  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2894 tagagtctgagtatatagaggaacaactgatcagtcttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 2795  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcact 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2794 tgatcagtggatggatctacaaaagagcttcaatgatcttctgagtcagctaagaaccaagtgtgtatcatcccact 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24351 - 24077
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24351 caacaaccagattcacccactataatagacttatcctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaacatgaaccctcacccatccctgaccatatcc 24252  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24251 tagaatctgagtttatagaggaacagttgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 24152  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctca 279  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24151 tgatcagtggatggatttacaaaagagcttcaatgatctgctaagtcagctcagaacaaagtgtgtatcatctca 24077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 45955 - 46208
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45955 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaacttaatctgaaccttcaaccatccctgacagtatccttgagactgagtatatagaggaac 46054  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  46055 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctggagaa 46154  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||| ||| ||  ||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  46155 gagctttgttgatctgatgagtcagcttagaacaaaatgtgtgtcatctcactc 46208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3971 - 3706
Alignment:
Q  17 tcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3971 tcacccactattatagacttaacctctgaccaaccctcctcatctcaaacaacccaaccagaaccttcacccatccctgactatatcctagagtctgagt 3872  T
Q  117 atatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggat 216  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3871 atatagatgaacagctaattaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatcatgatcagtggat 3772  T
Q  217 ggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||  |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3771 ggatctgaagaaaagttttgatgatttgctggatcagcttagaaccaagtgtgtctcatctcactc 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 3096 - 3349
Alignment:
Q  29 atagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaac 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3096 atagacttaacttctgaccaaccctcctcatcaactacaactcaaactcaaccctcacccattcctgacactatccttgaaactgagtatatagaggaac 3195  T
Q  129 agctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3196 agctgatcagacttagtgaggagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtaccttctattcactattatgatcagtggatggatctgcagaa 3295  T
Q  229 gagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||||   ||| ||  ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3296 gagcttcactgatctgatgagtcagctcagaaccaagtgtgtttcatctcactc 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 516
Alignment:
Q  5 caacaacccgcttcacccactttcatagacttaacctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcc 104  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  793 caacaaccagcatcacccactataatagacttaacctctgaccaaccctccacatctcacacaactcaacctgaaccctcacccatccctgactctatcc 694  T
Q  105 tagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatta 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  693 tagaatctgagtatatagatgaacatctaatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatct 594  T
Q  205 tgatcagtggatggatctacagaagagctttgatgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||  ||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  593 tgatcagtggatggattttaagaagagtttcaatgagctgttggatcaactaagcacaaagtgtgtctcatctcactc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 52156 - 52399
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52156 cctctgaccaaccctccacatctcatacaactcaatctgaaccttcacccatccctgactctatccttaaatctgagtatatagatgaacagcttatcag 52255  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||  ||    
T  52256 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcttgtacctcctattcactatcttgatcagtggatggatttaaagaagagtttcaat 52355  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  52356 gagctgctggatcacctgagcacaaagtgtgtctcatctcactc 52399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 2923 - 3166
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||| ||   |||||| ||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  2923 cctctgaccaaccttcaacatctcaaacaacccatcttgaaccttcacccatccctgataccatcatagaatctgagtatatagatgaacagcttattag 3022  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  3023 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgtagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctaaagaagggttttaat 3122  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  3123 gagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 3166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 11178 - 11421
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||| ||   |||||| ||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  11178 cctctgaccaaccttcaacatctcaaacaacccatcttgaaccttcacccatccctgataccatcatagaatctgagtatatagatgaacagcttattag 11277  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatctacagaagagctttgat 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  11278 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgtagaacagttcatgtacctcctattcactatcttgatcaatggatggatctaaagaagggttttaat 11377  T
Q  239 gagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  11378 gagctgctggatcaactgagcacaaaatgtgtctcatctcactc 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2621
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  | ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2438 cctctgaccgaccttccacctctcaaacaacccatccagaaccttcacccatccctgataccatcctagaatctgagtatatagatgaacagcttatcag 2537  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||    
T  2538 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcccatacactatcttgatcaatggatggatct 2621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2119 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold2119
Description:

Target: scaffold2119; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 182
Target Start/End: Original strand, 922 - 1065
Alignment:
Q  39 cctctgaccaaccttccacatcaaatacaactcaaactgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  922 cctctgaccaaccctccacatctcacacaactcaacctgaaccttcacccatccctgactctatcctggaatctgagtgtatagatgaacagcttatcag 1021  T
Q  139 acttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttc 182  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1022 gcttagtgatgagattcagacactgattcttcgcagaacagttc 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24182 - 24004
Alignment:
Q  104 ctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactatt 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  24182 ctagaatctgagtatatagatgaacagcttatcaggcttagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcctgtacctcccattcactata 24083  T
Q  204 atgatcagtggatggatctacagaagagctttga-tgagctactggatcagcttagaactaagtgtgtttcatctcactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||  |||| || ||| | |||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  24082 aagatcaatggatggatctgaagaa-agattttactgagctgctggatcaactgagcacgaaatgtgtctcatctcactc 24004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 670 - 808
Alignment:
Q  84 cacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcc 183  Q
    |||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  670 cacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcc 769  T
Q  184 tgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  770 tgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatct 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 133
Alignment:
Q  110 tctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatc 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  245 tctgaatatattgatgaacagcttataaggttaagtgatgagattcagacactgattcttctcagaacagttcttgtacctcccattcactatcttgatc 146  T
Q  210 agtggatggatct 222  Q
    | |||||||||||    
T  145 aatggatggatct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 193658 - 193511
Alignment:
Q  75 ctgaaccctcacccatccctgaccatatcctagagtctgagtatatagaggaacagctgatcagacttagtgatgagattcaggcactgattcttcgcag 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  193658 ctgaaccttcacccatcccagacaccatcctggaatctgaatatattgatgaagagcttataaggttaagtgatgagattcagagactgattcttctcag 193559  T
Q  175 aacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatct 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||    
T  193558 aacagttcctgtacctcccattcactaccttgatcaatggatggatct 193511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15529
Alignment:
Q  154 tcaggcactgattcttcgcagaacagttcctgtacctcctattcactattatgatcagtggatggatcta 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  15460 tcagtcactgattcttctcagaatagttcctgtacctcccattcactatcttgatcaatggatggatcta 15529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3416 times since January 2019
Visitors: 4035