View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0650_low_1 (Length: 547)

Name: NF0650_low_1
Description: NF0650
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0650_low_1
NF0650_low_1
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (12-480)||(7853913-7854381)
chr3 (12-435)||(54685202-54685625)
chr3 (12-436)||(33341812-33342236)
chr3 (47-480)||(17955836-17956274)
chr3 (43-480)||(45581591-45582030)
chr3 (55-480)||(54037980-54038406)
chr3 (34-436)||(30152893-30153297)
chr3 (55-480)||(3992522-3992949)
chr3 (91-480)||(2844201-2844590)
chr3 (55-436)||(23492346-23492728)
chr3 (62-436)||(53771020-53771397)
chr3 (91-436)||(16261463-16261809)
chr3 (62-436)||(38167894-38168269)
chr3 (217-480)||(55513006-55513269)
chr3 (181-436)||(28558271-28558526)
chr3 (194-436)||(18970034-18970277)
chr3 (12-344)||(19946629-19946962)
chr3 (197-469)||(15550714-15550986)
chr3 (66-215)||(16996172-16996322)
chr3 (62-215)||(19570801-19570954)
chr3 (194-359)||(48421690-48421855)
chr3 (71-215)||(50112164-50112309)
chr3 (62-241)||(22144358-22144539)
chr3 (62-215)||(317621-317775)
chr3 (87-215)||(12349843-12349970)
chr3 (71-241)||(16182032-16182203)
chr3 (62-215)||(13817495-13817646)
chr3 (91-239)||(6154419-6154567)
chr3 (62-215)||(35123677-35123830)
chr3 (62-241)||(53898541-53898721)
chr3 (87-241)||(6146832-6146986)
chr3 (62-215)||(14298402-14298555)
chr3 (62-215)||(14304029-14304182)
chr3 (62-215)||(17523002-17523156)
chr3 (62-215)||(14295418-14295573)
chr3 (67-215)||(17100638-17100787)
chr3 (67-215)||(17101323-17101472)
chr3 (12-151)||(47784924-47785064)
chr3 (48-215)||(17139474-17139643)
chr3 (404-480)||(19232089-19232165)
chr3 (55-215)||(54423986-54424146)
chr3 (62-208)||(11329081-11329228)
chr3 (55-215)||(14528124-14528286)
chr3 (12-294)||(9303141-9303425)
chr3 (404-480)||(15857119-15857195)
chr3 (62-202)||(12560362-12560503)
chr3 (67-215)||(19260952-19261101)
chr3 (404-480)||(16743997-16744073)
chr3 (74-156)||(28558198-28558282)
chr3 (62-215)||(14301045-14301200)
chr3 (67-215)||(12349652-12349806)
chr3 (241-329)||(14177017-14177105)
chr3 (55-181)||(55440996-55441123)
chr3 (39-218)||(12488835-12489017)
chr3 (62-215)||(14059325-14059480)
chr3 (158-220)||(34439451-34439513)
chr3 (49-188)||(17204667-17204807)
chr3 (92-203)||(8631801-8631912)
chr3 (237-381)||(17393590-17393735)
chr3 (243-389)||(11402752-11402898)
chr3 (194-344)||(14285075-14285225)
chr3 (89-215)||(17938582-17938708)
chr3 (194-278)||(8275902-8275986)
chr3 (194-294)||(16934015-16934115)
chr3 (89-215)||(16880131-16880258)
chr3 (40-166)||(38811170-38811297)
chr3 (39-151)||(1990759-1990873)
chr3 (241-331)||(12539066-12539156)
chr3 (40-121)||(17960520-17960602)
chr3 (48-164)||(9590918-9591035)
chr3 (34-189)||(12952915-12953072)
chr3 (194-278)||(8268802-8268886)
chr3 (62-218)||(3576547-3576705)
chr3 (68-189)||(15876054-15876176)
chr3 (87-215)||(11061118-11061247)
chr3 (40-151)||(34559857-34559969)
chr3 (260-331)||(37915290-37915361)
chr3 (402-477)||(38810868-38810943)
chr3 (399-477)||(13301323-13301401)
chr3 (399-477)||(13311979-13312057)
chr3 (226-288)||(38375736-38375798)
chr3 (404-437)||(15615137-15615170)
chr3 (67-218)||(17191526-17191679)
chr3 (420-477)||(17205019-17205076)
chr3 (194-235)||(39656453-39656494)
chr3 (399-436)||(51961031-51961068)
chr3 (404-436)||(2050115-2050147)
chr3 (404-436)||(2449152-2449184)
chr3 (404-436)||(8268650-8268682)
chr3 (404-436)||(8275750-8275782)
chr3 (15-51)||(8901257-8901293)
chr3 (197-288)||(10913001-10913093)
chr3 (404-436)||(14842487-14842519)
chr3 (404-436)||(16933869-16933901)
chr3 (404-436)||(17912398-17912430)
chr3 (404-436)||(18911300-18911332)
chr3 (404-436)||(19260749-19260781)
chr3 (193-241)||(38527841-38527889)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (47-480)||(35015013-35015447)
chr6 (12-480)||(18583264-18583716)
chr6 (47-480)||(19983148-19983581)
chr6 (56-436)||(26089710-26090091)
chr6 (55-436)||(18002395-18002777)
chr6 (62-436)||(23994902-23995279)
chr6 (55-436)||(15742120-15742505)
chr6 (12-435)||(4991002-4991427)
chr6 (171-440)||(15889601-15889871)
chr6 (171-440)||(22585441-22585711)
chr6 (171-440)||(22590272-22590542)
chr6 (12-294)||(18823429-18823712)
chr6 (170-412)||(15004831-15005072)
chr6 (197-436)||(25640456-25640694)
chr6 (12-278)||(18839300-18839567)
chr6 (71-215)||(32898779-32898924)
chr6 (62-210)||(25744331-25744480)
chr6 (87-215)||(22440941-22441068)
chr6 (62-215)||(31628248-31628402)
chr6 (55-215)||(18777119-18777280)
chr6 (87-215)||(13014822-13014949)
chr6 (94-215)||(18432656-18432777)
chr6 (71-215)||(16086007-16086151)
chr6 (34-208)||(18398890-18399065)
chr6 (74-215)||(18570271-18570413)
chr6 (47-208)||(18381803-18381965)
chr6 (197-343)||(32276756-32276902)
chr6 (12-123)||(17083383-17083496)
chr6 (40-218)||(22361874-22362054)
chr6 (62-215)||(16106502-16106650)
chr6 (197-328)||(19629447-19629578)
chr6 (71-189)||(25367376-25367495)
chr6 (199-288)||(26512260-26512349)
chr6 (199-288)||(26517376-26517465)
chr6 (194-294)||(16300022-16300122)
chr6 (210-306)||(21931333-21931429)
chr6 (62-187)||(28195234-28195360)
chr6 (237-331)||(17374924-17375018)
chr6 (48-153)||(18629786-18629892)
chr6 (62-121)||(15740209-15740269)
chr6 (43-189)||(25651197-25651345)
chr6 (404-437)||(1650020-1650053)
chr6 (420-477)||(21623506-21623563)
chr6 (404-436)||(16232199-16232231)
chr6 (404-436)||(19610325-19610357)
chr6 (40-123)||(25919571-25919655)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (43-480)||(32493902-32494341)
chr7 (73-480)||(126406-126814)
chr7 (55-480)||(111125-111550)
chr7 (47-480)||(1936873-1937290)
chr7 (62-436)||(42056188-42056565)
chr7 (55-436)||(2028893-2029276)
chr7 (91-436)||(2190085-2190431)
chr7 (67-436)||(3049568-3049937)
chr7 (12-215)||(7284173-7284376)
chr7 (298-432)||(15516765-15516900)
chr7 (62-211)||(39046740-39046890)
chr7 (197-388)||(39291457-39291648)
chr7 (194-434)||(13352065-13352306)
chr7 (55-215)||(11287390-11287551)
chr7 (62-239)||(35094797-35094974)
chr7 (62-215)||(12758968-12759121)
chr7 (62-215)||(15822544-15822698)
chr7 (55-215)||(3894998-3895159)
chr7 (87-241)||(47289788-47289942)
chr7 (62-215)||(26070377-26070531)
chr7 (62-215)||(26094164-26094318)
chr7 (87-241)||(44865234-44865391)
chr7 (62-189)||(45452305-45452432)
chr7 (55-215)||(12248233-12248395)
chr7 (71-215)||(16570118-16570264)
chr7 (71-215)||(16595398-16595544)
chr7 (404-477)||(3060271-3060344)
chr7 (48-215)||(13274753-13274922)
chr7 (48-215)||(49047786-49047955)
chr7 (87-241)||(143652-143800)
chr7 (43-215)||(12369953-12370127)
chr7 (405-480)||(7283912-7283987)
chr7 (12-165)||(14272049-14272203)
chr7 (173-357)||(15977820-15978004)
chr7 (40-189)||(16915067-16915217)
chr7 (47-208)||(17224058-17224220)
chr7 (40-189)||(48356602-48356752)
chr7 (39-189)||(13377485-13377637)
chr7 (194-294)||(371203-371303)
chr7 (241-381)||(18151259-18151399)
chr7 (171-306)||(8563369-8563505)
chr7 (402-477)||(13377849-13377924)
chr7 (104-215)||(13863042-13863154)
chr7 (257-331)||(17984753-17984827)
chr7 (39-118)||(4446168-4446249)
chr7 (420-477)||(13389693-13389750)
chr7 (39-118)||(14935319-14935400)
chr7 (39-118)||(15362912-15362993)
chr7 (420-469)||(17223797-17223846)
chr7 (399-436)||(25124445-25124482)
chr7 (245-381)||(44304959-44305096)
chr7 (404-436)||(7293333-7293365)
chr7 (404-436)||(11516544-11516576)
chr7 (404-436)||(13758677-13758709)
chr7 (404-436)||(14113903-14113935)
chr7 (404-436)||(15441478-15441510)
chr7 (404-436)||(15862226-15862258)
chr7 (404-436)||(15927875-15927907)
chr7 (404-436)||(16212071-16212103)
chr7 (404-436)||(18979938-18979970)
chr7 (404-436)||(30262043-30262075)
chr7 (40-123)||(34241393-34241477)
chr7 (404-436)||(36052971-36053003)
chr7 (139-274)||(46474059-46474195)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (62-480)||(79844-80263)
scaffold0034 (87-215)||(46171-46299)
scaffold0034 (87-215)||(40664-40792)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (47-480)||(31136-31570)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (47-480)||(41274-41708)
scaffold0078 (404-436)||(36980-37012)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (47-480)||(22274688-22275121)
chr2 (47-480)||(22283921-22284354)
chr2 (55-436)||(9652796-9653179)
chr2 (66-436)||(21273949-21274320)
chr2 (12-435)||(25212977-25213403)
chr2 (194-480)||(15633327-15633613)
chr2 (62-241)||(23836791-23836972)
chr2 (62-215)||(32465838-32465992)
chr2 (43-241)||(25876006-25876206)
chr2 (197-436)||(7321633-7321872)
chr2 (12-165)||(19433495-19433649)
chr2 (62-215)||(28974029-28974183)
chr2 (62-215)||(271151-271304)
chr2 (43-215)||(36890798-36890972)
chr2 (62-215)||(4448246-4448399)
chr2 (62-241)||(6879417-6879597)
chr2 (47-215)||(25601989-25602158)
chr2 (404-480)||(20627194-20627270)
chr2 (404-480)||(19794585-19794661)
chr2 (404-480)||(43642837-43642913)
chr2 (12-294)||(24826760-24827044)
chr2 (62-174)||(27261786-27261899)
chr2 (48-215)||(22579974-22580140)
chr2 (48-215)||(24571404-24571572)
chr2 (40-166)||(3403-3529)
chr2 (194-344)||(28031230-28031380)
chr2 (241-358)||(20279571-20279688)
chr2 (12-218)||(43645824-43646031)
chr2 (171-344)||(33128135-33128308)
chr2 (43-208)||(67952-68119)
chr2 (40-123)||(722353-722437)
chr2 (194-278)||(17204445-17204529)
chr2 (39-80)||(24884643-24884684)
chr2 (139-219)||(24341513-24341593)
chr2 (399-440)||(19666843-19666884)
chr2 (404-437)||(19689314-19689347)
chr2 (43-166)||(23821767-23821892)
chr2 (43-166)||(23830846-23830971)
chr2 (420-477)||(43646232-43646289)
chr2 (404-436)||(463043-463075)
chr2 (404-436)||(3798520-3798552)
chr2 (404-436)||(8944153-8944185)
chr2 (404-436)||(12635785-12635817)
chr2 (404-436)||(12641559-12641591)
chr2 (404-436)||(12728699-12728731)
chr2 (404-436)||(14906354-14906386)
chr2 (404-436)||(16935900-16935932)
chr2 (404-436)||(17006560-17006592)
chr2 (404-436)||(22863235-22863267)
chr2 (404-436)||(23820388-23820420)
chr2 (53-218)||(25305416-25305584)
chr2 (404-436)||(36982364-36982396)
chr2 (404-436)||(42177886-42177918)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (47-478)||(5941-6373)
scaffold0686 (290-478)||(5735-5923)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (55-480)||(21859984-21860410)
chr1 (52-478)||(44034829-44035255)
chr1 (34-435)||(15861327-15861728)
chr1 (34-359)||(22366970-22367296)
chr1 (343-480)||(41218667-41218804)
chr1 (62-215)||(49967631-49967784)
chr1 (62-215)||(35522432-35522585)
chr1 (87-241)||(22403196-22403350)
chr1 (62-215)||(41212049-41212206)
chr1 (62-215)||(21718209-21718362)
chr1 (43-215)||(35054716-35054890)
chr1 (404-480)||(41394527-41394603)
chr1 (55-215)||(27329868-27330026)
chr1 (48-187)||(51627805-51627945)
chr1 (40-123)||(27674755-27674838)
chr1 (87-189)||(9784239-9784341)
chr1 (41-123)||(22829629-22829712)
chr1 (40-189)||(17608886-17609036)
chr1 (40-123)||(19603055-19603139)
chr1 (194-294)||(21650081-21650181)
chr1 (40-120)||(38033882-38033962)
chr1 (406-477)||(27675120-27675191)
chr1 (47-218)||(20177140-20177313)
chr1 (197-294)||(20254430-20254527)
chr1 (48-223)||(21194980-21195157)
chr1 (141-215)||(9784177-9784248)
chr1 (40-218)||(37233969-37234149)
chr1 (404-437)||(45051726-45051759)
chr1 (197-288)||(20194140-20194232)
chr1 (155-219)||(20445754-20445818)
chr1 (155-219)||(20531519-20531583)
chr1 (404-436)||(37844374-37844406)
chr1 (230-306)||(40436291-40436367)
chr1 (404-436)||(46523695-46523727)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (47-480)||(25119063-25119498)
chr4 (47-480)||(5682384-5682817)
chr4 (34-436)||(14951713-14952117)
chr4 (62-436)||(15272211-15272588)
chr4 (205-440)||(19559483-19559719)
chr4 (62-215)||(53704846-53705000)
chr4 (47-241)||(34395222-34395418)
chr4 (62-215)||(44055895-44056049)
chr4 (71-211)||(55376714-55376855)
chr4 (62-215)||(16732149-16732303)
chr4 (62-241)||(23270020-23270201)
chr4 (71-215)||(44346816-44346961)
chr4 (334-436)||(15135907-15136010)
chr4 (74-215)||(21959576-21959718)
chr4 (103-215)||(30457925-30458037)
chr4 (62-215)||(53907812-53907963)
chr4 (87-215)||(820029-820153)
chr4 (12-294)||(16522748-16523032)
chr4 (194-477)||(34177502-34177781)
chr4 (194-388)||(49071800-49071994)
chr4 (103-215)||(8872584-8872699)
chr4 (62-215)||(12837313-12837466)
chr4 (62-215)||(30232609-30232763)
chr4 (12-294)||(9295624-9295908)
chr4 (404-480)||(54118124-54118200)
chr4 (87-215)||(45458968-45459096)
chr4 (55-189)||(18494467-18494602)
chr4 (71-215)||(13809622-13809768)
chr4 (194-344)||(14500208-14500358)
chr4 (71-188)||(27960961-27961078)
chr4 (12-189)||(7185983-7186159)
chr4 (39-218)||(15044784-15044966)
chr4 (87-208)||(52265628-52265749)
chr4 (194-294)||(14996241-14996341)
chr4 (40-123)||(37957230-37957314)
chr4 (40-149)||(7964890-7965000)
chr4 (39-274)||(41256423-41256660)
chr4 (245-310)||(21417471-21417536)
chr4 (223-344)||(32460699-32460820)
chr4 (194-294)||(8045058-8045158)
chr4 (39-189)||(15109488-15109640)
chr4 (141-219)||(10104374-10104452)
chr4 (39-285)||(15013325-15013573)
chr4 (40-188)||(18276392-18276541)
chr4 (47-123)||(47535251-47535328)
chr4 (194-294)||(9795330-9795430)
chr4 (251-311)||(12133626-12133686)
chr4 (139-219)||(15675213-15675293)
chr4 (40-123)||(19821981-19822065)
chr4 (139-219)||(31115688-31115768)
chr4 (197-288)||(16225211-16225301)
chr4 (402-477)||(41165808-41165883)
chr4 (141-219)||(40885678-40885756)
chr4 (47-123)||(14901197-14901274)
chr4 (404-437)||(14996445-14996478)
chr4 (47-218)||(41166055-41166228)
chr4 (404-436)||(7131982-7132014)
chr4 (404-436)||(13246737-13246769)
chr4 (404-436)||(15287162-15287194)
chr4 (404-436)||(15294271-15294303)
chr4 (404-436)||(16327840-16327872)
chr4 (404-436)||(16609013-16609045)
chr4 (404-436)||(17145574-17145606)
chr4 (194-294)||(19697414-19697514)
chr4 (194-294)||(19707999-19708099)
chr4 (404-436)||(20001030-20001062)
chr4 (404-436)||(26680517-26680549)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (47-478)||(162036-162469)
scaffold0016 (47-480)||(166120-166547)
scaffold0016 (71-215)||(164204-164349)
scaffold0016 (402-477)||(116410-116485)
scaffold0016 (47-151)||(116690-116795)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (47-480)||(24716718-24717152)
chr8 (55-436)||(41506709-41507091)
chr8 (74-480)||(39115267-39115674)
chr8 (55-480)||(274416-274842)
chr8 (55-480)||(641007-641433)
chr8 (55-480)||(826813-827239)
chr8 (91-436)||(24385652-24385988)
chr8 (43-294)||(16038923-16039176)
chr8 (195-345)||(22321437-22321587)
chr8 (197-436)||(21259391-21259630)
chr8 (194-440)||(17502274-17502521)
chr8 (194-412)||(23217990-23218208)
chr8 (62-241)||(19993141-19993321)
chr8 (93-241)||(22234890-22235038)
chr8 (72-215)||(41246648-41246792)
chr8 (194-388)||(4233968-4234162)
chr8 (87-241)||(37611675-37611829)
chr8 (62-215)||(20573305-20573458)
chr8 (43-215)||(20481565-20481739)
chr8 (404-480)||(16404856-16404932)
chr8 (71-219)||(20647938-20648087)
chr8 (71-215)||(20654018-20654163)
chr8 (48-215)||(39446878-39447046)
chr8 (74-215)||(21680994-21681137)
chr8 (40-202)||(38533607-38533770)
chr8 (40-189)||(5854572-5854722)
chr8 (62-127)||(20567200-20567265)
chr8 (62-151)||(20567335-20567424)
chr8 (62-151)||(20573528-20573617)
chr8 (87-163)||(25122543-25122618)
chr8 (241-358)||(18118259-18118376)
chr8 (204-344)||(21494452-21494592)
chr8 (73-144)||(29759933-29760005)
chr8 (40-189)||(22735977-22736127)
chr8 (194-344)||(22886440-22886590)
chr8 (47-208)||(23837163-23837325)
chr8 (40-189)||(26011452-26011602)
chr8 (197-294)||(22147555-22147652)
chr8 (155-219)||(20561740-20561804)
chr8 (195-294)||(2545061-2545160)
chr8 (39-189)||(33528383-33528533)
chr8 (62-123)||(15969799-15969860)
chr8 (197-294)||(18612523-18612620)
chr8 (197-294)||(18619428-18619525)
chr8 (194-294)||(3431322-3431422)
chr8 (40-189)||(15933256-15933406)
chr8 (197-306)||(16002113-16002223)
chr8 (47-218)||(21198261-21198434)
chr8 (39-164)||(23226240-23226368)
chr8 (39-165)||(23149736-23149865)
chr8 (48-189)||(27233206-27233348)
chr8 (402-436)||(31194217-31194251)
chr8 (245-381)||(20175720-20175857)
chr8 (245-381)||(20220447-20220584)
chr8 (404-436)||(5238404-5238436)
chr8 (404-436)||(13662182-13662214)
chr8 (404-436)||(13720845-13720877)
chr8 (404-436)||(16872968-16873000)
chr8 (39-189)||(18261610-18261762)
chr8 (39-153)||(22742717-22742833)
chr8 (404-436)||(22907128-22907160)
chr8 (404-436)||(24661162-24661194)
chr8 (404-436)||(43373392-43373424)
chr8 (404-436)||(43685863-43685895)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (55-436)||(2031783-2032165)
chr5 (73-435)||(11342675-11343039)
chr5 (55-423)||(21204898-21205268)
chr5 (55-436)||(21650668-21651050)
chr5 (12-436)||(16105573-16105999)
chr5 (13-215)||(11583982-11584188)
chr5 (34-215)||(1168317-1168500)
chr5 (62-215)||(28261501-28261655)
chr5 (71-241)||(21397078-21397253)
chr5 (206-358)||(22662653-22662805)
chr5 (194-432)||(25004929-25005165)
chr5 (62-241)||(24475563-24475738)
chr5 (43-215)||(20712036-20712210)
chr5 (62-241)||(21646826-21647006)
chr5 (62-215)||(11337299-11337452)
chr5 (62-215)||(4865242-4865397)
chr5 (90-215)||(21906729-21906851)
chr5 (12-294)||(108874-109158)
chr5 (87-215)||(24183245-24183370)
chr5 (48-215)||(19405503-19405672)
chr5 (405-480)||(11584374-11584449)
chr5 (72-181)||(23466447-23466557)
chr5 (40-208)||(7728378-7728547)
chr5 (39-208)||(3673818-3673989)
chr5 (194-344)||(7529014-7529164)
chr5 (39-202)||(23493875-23494040)
chr5 (40-189)||(21616974-21617124)
chr5 (197-294)||(17909622-17909719)
chr5 (194-294)||(9730424-9730524)
chr5 (56-218)||(19862183-19862347)
chr5 (13-51)||(24225596-24225634)
chr5 (48-123)||(16595474-16595550)
chr5 (40-123)||(32966352-32966436)
chr5 (39-189)||(6456580-6456732)
chr5 (39-218)||(5450952-5451134)
chr5 (139-288)||(11763544-11763694)
chr5 (404-436)||(7425631-7425663)
chr5 (404-436)||(20623286-20623318)
chr5 (404-436)||(21233442-21233474)
chr5 (155-219)||(22053957-22054021)
chr5 (404-436)||(23507270-23507302)
chr5 (404-436)||(25900320-25900352)
chr5 (404-436)||(35791015-35791047)
chr5 (404-436)||(37053061-37053093)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (47-480)||(30056-30493)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (52-480)||(308-736)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (55-436)||(12418-12802)
scaffold0039 (55-188)||(19049-19183)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (55-436)||(878-1261)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (55-436)||(55553-55936)
scaffold0032 (333-436)||(108075-108179)
scaffold0032 (40-127)||(93973-94061)
scaffold0032 (399-477)||(104477-104555)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (55-436)||(17304-17686)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (55-436)||(13285-13669)
scaffold0251 (62-264)||(21432-21636)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (57-436)||(6443-6823)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (55-437)||(193396-193770)
scaffold0004 (62-302)||(186560-186801)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (55-436)||(9882-10248)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (55-368)||(14921-15236)
scaffold0175 (404-436)||(882-914)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (190-436)||(4346-4593)
scaffold0303 (57-359)||(5-308)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (12-435)||(130486-130911)
scaffold0028 (142-219)||(89578-89655)
scaffold0028 (62-223)||(79519-79682)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (301-480)||(42574-42750)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (12-215)||(75-278)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (55-278)||(9565-9789)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (12-189)||(3230-3407)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (12-215)||(21442-21646)
scaffold0120 (12-215)||(31141-31345)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (12-215)||(24890-25092)
scaffold0158 (81-215)||(25212-25345)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (55-294)||(94948-95192)
scaffold0037 (55-215)||(24841-25002)
[»] scaffold0310 (5 HSPs)
scaffold0310 (12-215)||(227-430)
scaffold0310 (12-88)||(6603-6679)
scaffold0310 (405-480)||(6260-6335)
scaffold0310 (145-215)||(6521-6591)
scaffold0310 (405-442)||(4-41)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (171-440)||(44009-44279)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (194-469)||(1371-1643)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (194-477)||(219-499)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (62-241)||(32183-32363)
scaffold0091 (62-241)||(41940-42120)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (72-215)||(132363-132507)
scaffold0021 (55-214)||(11660-11821)
scaffold0021 (95-215)||(88289-88409)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (62-215)||(70735-70889)
scaffold0001 (62-208)||(60787-60933)
scaffold0001 (194-294)||(165007-165107)
scaffold0001 (404-436)||(172210-172242)
scaffold0001 (404-436)||(177913-177945)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (62-241)||(6932-7115)
scaffold0673 (62-215)||(935-1089)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (62-215)||(5359-5513)
scaffold0480 (71-215)||(8994-9140)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (62-215)||(22671-22825)
scaffold0008 (404-436)||(128095-128127)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (62-241)||(254900-255081)
scaffold0011 (62-241)||(261506-261687)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (71-215)||(11821-11965)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (62-241)||(14857-15034)
scaffold0083 (62-152)||(14197-14288)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (71-215)||(38287-38432)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (71-215)||(85321-85466)
scaffold0014 (55-219)||(159275-159438)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (43-215)||(15584-15761)
scaffold0077 (405-480)||(15323-15398)
scaffold0077 (404-437)||(36836-36869)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (62-215)||(689-843)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (55-208)||(109582-109736)
scaffold0035 (55-215)||(118076-118237)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (71-215)||(7561-7703)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (47-215)||(253102-253271)
scaffold0012 (404-436)||(247366-247398)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (48-215)||(9903-10071)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (62-215)||(631-785)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (71-215)||(1306-1451)
scaffold0359 (103-241)||(11740-11876)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (55-215)||(8960-9121)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (196-440)||(3732-3981)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (62-215)||(112658-112809)
scaffold0022 (48-189)||(109556-109698)
scaffold0022 (40-202)||(103048-103211)
scaffold0022 (197-288)||(67997-68089)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (43-215)||(146561-146735)
scaffold0025 (404-436)||(146906-146938)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (73-215)||(12-155)
scaffold0160 (73-151)||(3510-3589)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (12-118)||(28466-28573)
scaffold0150 (12-60)||(21637-21685)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (194-331)||(5996-6133)
[»] scaffold1164 (2 HSPs)
scaffold1164 (34-215)||(1332-1515)
scaffold1164 (405-480)||(1701-1776)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (62-215)||(11681-11834)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (47-215)||(4906-5075)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (87-220)||(48154-48286)
scaffold0068 (87-220)||(61602-61734)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (194-344)||(17812-17962)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (48-215)||(33840-34008)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (405-480)||(19806-19881)
scaffold0122 (405-480)||(24110-24185)
scaffold0122 (55-153)||(24372-24471)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (87-219)||(33668-33800)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (405-480)||(94-169)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (147-241)||(4351-4445)
scaffold0740 (62-127)||(4287-4353)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (62-215)||(3299-3454)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (405-480)||(20493-20568)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (48-186)||(31010-31149)
scaffold0031 (144-215)||(70676-70748)
scaffold0031 (40-123)||(97403-97487)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (71-215)||(1905-2050)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (197-344)||(5338-5485)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (194-336)||(5580-5722)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (47-208)||(76967-77129)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (171-344)||(61218-61391)
scaffold0023 (404-436)||(48903-48935)
scaffold0023 (404-436)||(153924-153956)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (40-189)||(69415-69565)
scaffold0009 (404-436)||(272330-272362)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (194-294)||(34454-34554)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (40-151)||(43975-44087)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (43-208)||(270-436)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (15-72)||(12990-13048)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (40-218)||(2483-2663)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (62-125)||(7814-7878)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (171-294)||(17355-17478)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (198-294)||(11862-11958)
scaffold0162 (47-178)||(7175-7307)
scaffold0162 (404-436)||(26340-26372)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (194-294)||(49889-49989)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (43-128)||(6622-6708)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (47-123)||(35444-35520)
scaffold0013 (241-294)||(7112-7165)
scaffold0013 (420-477)||(35816-35873)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (194-294)||(6257-6357)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-52)||(12694-12734)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (12-47)||(3392-3427)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (39-218)||(2425-2607)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (197-294)||(12637-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (55-125)||(22715-22786)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (251-381)||(2853-2984)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (40-189)||(197392-197545)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (47-104)||(1364-1422)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (55-215)||(4536-4698)
scaffold0447 (55-215)||(9150-9312)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (402-436)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (402-436)||(57392-57426)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (40-181)||(30978-31120)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (227-288)||(920-981)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (39-151)||(107967-108080)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (404-436)||(1431-1463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (404-436)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (404-436)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (404-436)||(2700-2732)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (404-436)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (404-436)||(1430-1462)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (404-436)||(22857-22889)
scaffold0141 (404-436)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (404-436)||(1496-1528)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 480
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854381
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7853913 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc 7854012  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7854013 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaa 7854112  T
Q  212 cataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctac 311  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7854113 cataatttaccaattatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctac 7854212  T
Q  312 cacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattat 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854213 aacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattat 7854312  T
Q  412 gataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7854313 gatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatga 7854381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685202
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54685625 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc 54685526  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685525 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 54685426  T
Q  212 cataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctac 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54685425 cataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctac 54685326  T
Q  312 cacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattat 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54685325 aacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattat 54685226  T
Q  412 gataaaaactaacccccttacctt 435  Q
     ||||| |||||||| ||||||||    
T  54685225 cataaagactaacccacttacctt 54685202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342236
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341812 acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 33341911  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341912 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 33342011  T
Q  212 cataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctac 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33342012 cataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatctctac 33342111  T
Q  312 cacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33342112 cacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattat 33342211  T
Q  412 gataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||| |||||||| |||||||||    
T  33342212 gataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17956274 - 17955836
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  17956274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 17956175  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17956174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgagtataatttacaaactactcattttcatacatcat 17956075  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956074 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 17955975  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17955974 ataatcacttattctcataatcgattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctcc 17955875  T
Q  446 aactattagct----ctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  17955874 aactattagctctacctagcttcacttttgctcctatga 17955836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 480
Target Start/End: Original strand, 45581591 - 45582030
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45581591 acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 45581690  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581691 caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 45581790  T
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581791 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaatcatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggt 45581890  T
Q  341 tcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa-cccccttaccttaatt 439  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45581891 tcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttaccttaatt 45581990  T
Q  440 atctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45581991 atctccaactattagctctagcttca-tttttctcctatga 45582030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 54038406 - 54037980
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||| | |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54038406 aaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaac 54038307  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038306 cattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 54038207  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  54038206 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcac 54038107  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54038106 ttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactatta 54038007  T
Q  454 gctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  54038006 gctcaagcttcacttttgctcctatga 54037980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 436
Target Start/End: Original strand, 30152893 - 30153297
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  30152893 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 30152992  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152993 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 30153092  T
Q  232 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30153093 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 30153192  T
Q  332 agattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccctta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153193 agattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaaccccctta 30153292  T
Q  432 cctta 436  Q
    |||||    
T  30153293 cctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Original strand, 3992522 - 3992949
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  3992522 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 3992621  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3992622 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctg 3992721  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  3992722 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataatta 3992821  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992822 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatt 3992921  T
Q  453 agctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992922 agctctagcttcacttttgctcctatga 3992949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Original strand, 2844201 - 2844590
Alignment:
Q  91 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2844201 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacc 2844300  T
Q  191 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844301 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 2844400  T
Q  291 catattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaa 390  Q
    |||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2844401 catattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaattatgcatagaataagagaaa 2844500  T
Q  391 aagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844501 aagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 2844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 23492346 - 23492728
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  23492346 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 23492445  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492446 tattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 23492545  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492546 aatttcataatcaacaattcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcac 23492645  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23492646 ttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Original strand, 53771020 - 53771397
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | |||||    
T  53771020 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 53771119  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771120 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 53771219  T
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771220 atcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 53771319  T
Q  360 tcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53771320 tcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 91 - 436
Target Start/End: Original strand, 16261463 - 16261809
Alignment:
Q  91 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261463 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 16261562  T
Q  191 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16261563 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaa 16261662  T
Q  291 catattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaa 389  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16261663 catatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattacgcatagaatcaagagaa 16261762  T
Q  390 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16261763 aaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38168269
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  38167894 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 38167993  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttca 260  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167994 catgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttca 38168093  T
Q  261 tcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattct 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38168094 tcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcc 38168193  T
Q  361 cataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38168194 cataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 217 - 480
Target Start/End: Original strand, 55513006 - 55513269
Alignment:
Q  217 tttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  55513006 tttacaaactacccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacat 55513105  T
Q  317 aagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513106 aagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataa 55513205  T
Q  417 aaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513206 aaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 55513269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 181 - 436
Target Start/End: Original strand, 28558271 - 28558526
Alignment:
Q  181 atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28558271 atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatcatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttatc 28558370  T
Q  281 atcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28558371 atcaaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatgga 28558470  T
Q  381 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28558471 acaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccctcttacctta 28558526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 436
Target Start/End: Original strand, 18970034 - 18970277
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18970034 cataattcatcaattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacat 18970133  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  18970134 acttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgcatagaaaaagagaaaaga 18970233  T
Q  394 aattaactaaatgattatga-taaaaactaacccccttacctta 436  Q
    || ||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  18970234 aactaactaagtggttatgattgaaatctaacccccttacctta 18970277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19946962
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19946629 acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 19946728  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 209  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  19946729 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaa-catgtcataaatcatcaatta 19946827  T
Q  210 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctct 309  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| | |||  |||| |     
T  19946828 agcataatttcacaactactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaatttatcacc 19946927  T
Q  310 accacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19946928 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 19946962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 469
Target Start/End: Original strand, 15550714 - 15550986
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  15550714 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 15550813  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaat 396  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || ||||||||| ||  |||||  |  |||    
T  15550814 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataaaaagagagagtagaaat 15550913  T
Q  397 taactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 469  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||    
T  15550914 taactaagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 15550986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16996322 - 16996172
Alignment:
Q  66 cacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16996322 cacaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatg 16996223  T
Q  165 aaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16996222 aaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 16996172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19570954 - 19570801
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19570954 caacaacatctcatttctcaacaacaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatc 19570855  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19570854 atgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 19570801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Original strand, 48421690 - 48421855
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48421690 cataattcaccaattgaacataattctcaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaattatcatcaaattaacat 48421789  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    | | ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48421790 actcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50112164
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  50112309 ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact 50112210  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50112209 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 50112164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22144539 - 22144358
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  22144539 caacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaattgat 22144440  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  22144439 catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 22144358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 317775 - 317621
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  317775 caacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 317676  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  317675 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcata 317621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12349970 - 12349843
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349970 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac 12349872  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  12349871 tacgatgcataattcaccaattgagcata 12349843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16182203 - 16182032
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||     
T  16182203 ctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcattaaact 16182104  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  16182103 tatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttggcatattttcacaca-tacccattttcataca 16182032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 13817495 - 13817646
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||| ||||||    
T  13817495 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca---acaacaacaattgat 13817591  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13817592 catgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 13817646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6154567 - 6154419
Alignment:
Q  91 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  6154567 atgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaataaca 6154469  T
Q  191 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcata 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||    
T  6154468 atgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcata 6154419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 35123677 - 35123830
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  35123677 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 35123776  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35123777 atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata 35123830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53898721 - 53898541
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||  | |||||||||||   |||||||    
T  53898721 caacaacatctcatttctcaacataaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgatc 53898622  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  53898621 atgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 53898541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6146986 - 6146832
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6146986 aatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaac 6146888  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  6146887 aacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 6146832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14298402 - 14298555
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |  || ||||||| | |||||||    
T  14298402 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattgatc 14298501  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14298502 atgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 14298555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14304029 - 14304182
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |  || ||||||| | |||||||    
T  14304029 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattgatc 14304128  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14304129 atgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 14304182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17523156 - 17523002
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa-acatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | ||||||||||| | |||| |    
T  17523156 caacaacatctcatttctcaacacaaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttagcaacaacaacatcaattggt 17523057  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  17523056 catgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcata 17523002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14295418 - 14295573
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |  |||||||||| | ||||||    
T  14295418 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgat 14295517  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  14295518 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 14295573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 17100638 - 17100787
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  17100638 acaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatga 17100737  T
Q  166 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17100738 aacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 17100787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 17101323 - 17101472
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  17101323 acaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatga 17101422  T
Q  166 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17101423 aacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 17101472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784924
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  47785064 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag 47784965  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 151  Q
    |||||||| || | |||  | || ||| |||||||||||||    
T  47784964 ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaaca 47784924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 17139474 - 17139643
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||    
T  17139474 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa 17139573  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  17139574 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata 17139643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232165
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatga 19232165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 54423986 - 54424146
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 154  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |  | ||| | ||| ||||||| |     
T  54423986 aaaccaacaacaacaacttatttctcataacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatca 54424085  T
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  54424086 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 54424146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11329228 - 11329081
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  11329228 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 11329129  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  11329128 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 11329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528124
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | || ||| | ||||||||||| |    
T  14528286 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 14528187  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  14528186 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata 14528124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303141
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    ||| | |||||||    
T  9303425 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatggtatatgaacacccaag 9303326  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | ||  ||||  | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  9303325 ccataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacagcaa-catgtcataagtcatcaatt 9303227  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9303226 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 9303141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857119
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatga 15857119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12560503 - 12560362
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  12560503 caacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattgat 12560404  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  12560403 catgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattca 12560362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19261101 - 19260952
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || | | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19261101 acaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcatga 19261002  T
Q  166 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  19261001 aacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcata 19260952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16744073 - 16743997
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16744073 atgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatga 16743997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 28558198 - 28558282
Alignment:
Q  74 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa-caacaaccat 156  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28558198 atttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaatcaacaaccat 28558282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14301045 - 14301200
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | || ||| |  |||||||||| | ||||||    
T  14301045 caacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgat 14301144  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  14301145 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 14301200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12349806 - 12349652
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacc-----caagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| |  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  12349806 acaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 12349707  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12349706 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 12349652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14177105 - 14177017
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttc 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  14177105 atcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaatgaacatactgaaacatatcactacaacatgaggacgaatttc 14177017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 55441123 - 55440996
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | || ||| | || |||||||| |    
T  55441123 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatc 55441024  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattca 181  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  55441023 aattgatcatgaaacttatcacaattca 55440996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12489017 - 12488835
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| || ||  || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  | || ||    
T  12489017 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac 12488918  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    | | ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12488917 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt 12488835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14059480 - 14059325
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||  | |||||| |||| | |||||     
T  14059480 caacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaa 14059381  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca-ccaattgagcata 215  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| | |||||||||||    
T  14059380 catgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata 14059325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439451
Alignment:
Q  158 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattta 220  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34439513 gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttta 34439451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204807
Alignment:
Q  49 tttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaac 147  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | |||||||    
T  17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac 17204766  T
Q  148 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 188  Q
    |||| ||||| | |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  17204767 aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaa 17204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 203
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8631912
Alignment:
Q  92 tgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||  | ||||||| ||||||||| || ||||||| |    
T  8631801 tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa 8631900  T
Q  192 tgcataattcac 203  Q
     |||||||||||    
T  8631901 agcataattcac 8631912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 381
Target Start/End: Original strand, 17393590 - 17393735
Alignment:
Q  237 atacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagatt 336  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||   ||||||||| |||| ||   ||||||||||||||  |||    
T  17393590 atacagcatgaacatgcaatttcatcgtcaataattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaatt 17393689  T
Q  337 gggttcatgataatcacttattctca--taatcaattatgcatagaa 381  Q
      |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  17393690 aagttcataataatcactta-tctcaattaagcaattatgcatagaa 17393735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 389
Target Start/End: Original strand, 11402752 - 11402898
Alignment:
Q  243 catgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttc 342  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||||| |||  | || ||||||||||||||  |||  ||||    
T  11402752 catgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttc 11402851  T
Q  343 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 389  Q
    |  ||||||||||||||  |||| || || |||||||||| ||||||    
T  11402852 acaataatcacttattcaaataagcacttgtgcatagaactagagaa 11402898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Original strand, 14285075 - 14285225
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  14285075 cataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 14285174  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14285175 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcat 14285225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Original strand, 17938582 - 17938708
Alignment:
Q  89 tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||   | |||||| || ||||||    
T  17938582 tcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaa 17938681  T
Q  189 ccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    | | |||||||||| ||||| ||||||    
T  17938682 caaagcataattcatcaattaagcata 17938708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8275986 - 8275902
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattta 278  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  8275986 cataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 8275902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16934115 - 16934015
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16934115 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 16934016  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  16934015 a 16934015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880258
Alignment:
Q  89 tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | |||||| |||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16880131 tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa 16880230  T
Q  189 ccatgcataa-ttcaccaattgagcata 215  Q
    |   |||||| ||||| |||||||||||    
T  16880231 catagcataatttcacaaattgagcata 16880258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811170
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  | || |||     
T  38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 38811198  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaa 166  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  38811197 agcaacaacaacatcaattgaacatgaa 38811170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990873
Alignment:
Q  39 atcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || ||||||||||||| |||| |||  ||||  |    
T  1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 1990858  T
Q  137 taaacaacaacaaca 151  Q
    | |||||||||||||    
T  1990859 ttaacaacaacaaca 1990873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12539156 - 12539066
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| | || |||||| |||  |||  ||||||||||||||    
T  12539156 atcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaatttcaa 12539066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960520
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattat 121  Q
    |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattat 17960520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590918
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||||  ||| | ||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||    
T  9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 9590936  T
Q  147 caacaaccattgatcatg 164  Q
    ||||| | ||||| ||||    
T  9590935 caacatcaattgaacatg 9590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953072
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||    
T  12952915 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat 12953014  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||  || | ||||||||||| | ||| | ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  12953015 atctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaac 12953072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8268886 - 8268802
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattta 278  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  8268886 cataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 8268802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576547
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |  |||| ||| | ||||||||||| | ||  |     
T  3576705 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa 3576606  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    |||||  | |||||||||||| |||||||   ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  3576605 catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt 3576547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 189
Target Start/End: Original strand, 15876054 - 15876176
Alignment:
Q  68 caactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaa 166  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15876054 caactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaa 15876153  T
Q  167 acatatcacaattcatcaacaac 189  Q
     | |||||||||||| |||||||    
T  15876154 tcttatcacaattcaacaacaac 15876176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061118
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | || |||||||| | ||||| |||||    |||||||||||| ||||    
T  11061247 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaac 11061148  T
Q  187 aaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  11061147 aacatagcataattcaaccaattgagcata 11061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 151
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34559969
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || | ||| |||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 34559956  T
Q  139 aacaacaacaaca 151  Q
    | |||||||||||    
T  34559957 agcaacaacaaca 34559969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37915361 - 37915290
Alignment:
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||   ||||||||||||||    
T  37915361 atcatcaacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 37915290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38810943 - 38810868
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  38810943 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13301401 - 13301323
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  13301401 actaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13312057 - 13311979
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  13312057 actaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38375798 - 38375736
Alignment:
Q  226 tacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  38375798 tacccattttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaatt 38375736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615170
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Original strand, 17191526 - 17191679
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  | || ||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  17191526 acaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacatga 17191625  T
Q  166 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
      | |||||||||||| |||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17191626 ttcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt 17191679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Original strand, 39656453 - 39656494
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttt 235  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  39656453 cataattcaccaattgaatataattcacaaactacccatttt 39656494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 51961068 - 51961031
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  51961068 actaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050147
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8268682 - 8268650
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8268682 atgattatgataataactaacccccttacctta 8268650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8275782 - 8275750
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8275782 atgattatgataataactaacccccttacctta 8275750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Original strand, 8901257 - 8901293
Alignment:
Q  15 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 51  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8901257 tcatcaaaatcaaacttctccattttcaacccatttt 8901293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Original strand, 10913001 - 10913093
Alignment:
Q  197 aattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||| | || ||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  10913001 aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaatt 10913093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842487
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 18911300 - 18911332
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18911300 atgattatgataataactaacccccttacctta 18911332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260749
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38527889
Alignment:
Q  193 gcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||    
T  38527841 gcataattcaccaattgagcatattttcccacatacccattttcataca 38527889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015013
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  35015447 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 35015348  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015347 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 35015248  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015247 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 35015148  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015147 ataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 35015048  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015047 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 35015013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 480
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583716
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583264 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18583363  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    ||||||||||||||||                |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583364 catgaattatcatcaa----------------caacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 18583447  T
Q  212 cataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18583448 cataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatctctac 18583547  T
Q  312 cacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattat 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18583548 aacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatgatgcatagaacaggagaaaaagaattaactaaatgattat 18583647  T
Q  412 gataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18583648 gatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatga 18583716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983148
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  19983581 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 19983482  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19983481 acaacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgagcatagtttt-aaactacccattttcatacatcat 19983383  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19983382 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatg 19983283  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983282 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 19983183  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983182 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 19983148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 56 - 436
Target Start/End: Original strand, 26089710 - 26090091
Alignment:
Q  56 aaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca 155  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |    
T  26089710 aaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatcta 26089809  T
Q  156 ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26089810 ttgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaa 26089909  T
Q  256 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcactt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089910 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcactt 26090009  T
Q  356 attctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26090010 attctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18002777 - 18002395
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 154  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |  | ||| ||||||||||||| |     
T  18002777 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatct 18002678  T
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002677 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgca 18002578  T
Q  255 atttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcact 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002577 atttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcact 18002478  T
Q  355 tattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18002477 tatgcccataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Original strand, 23994902 - 23995279
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | |||||    
T  23994902 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 23995001  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995002 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 23995101  T
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23995102 atcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattc 23995201  T
Q  360 tcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23995202 tcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15742505 - 15742120
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa- 152  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||||     
T  15742505 aaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaac 15742406  T
Q  153 --ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaact 250  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15742405 atctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatatacaaattacccattttcatacatcatgaact 15742306  T
Q  251 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaa-catcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742305 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataa 15742206  T
Q  350 tcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15742205 tcacttattctcataatcaattatgcat-gaacaagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991427
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  4991002 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 4991101  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||  | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||||  | |||  || |   ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  4991102 ccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 4991200  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctc 308  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4991201 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaat-aacatatccaaacatatctc 4991299  T
Q  309 taccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatga 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  4991300 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataaaatcaagagaaaaagaattaaacaaatga 4991399  T
Q  408 ttatgataaaaactaacccccttacctt 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4991400 ttatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15889871 - 15889601
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15889871 atcacaattcatcaacaac-atgtcataattcatcagttgaacataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaca 15889773  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa 369  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| ||     
T  15889772 aatcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacac 15889673  T
Q  370 ttatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatga-taaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15889672 ttatgcatagaaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaatta 15889601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22585711 - 22585441
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22585711 atcacaattcaacaacaac-atgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaca 22585613  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa 369  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||     
T  22585612 attcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcac 22585513  T
Q  370 ttatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg-ataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    |||||||||||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  22585512 ttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaatta 22585441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22590542 - 22590272
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22590542 atcacaattcaacaacaac-atgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaca 22590444  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa 369  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||     
T  22590443 attcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcac 22590344  T
Q  370 ttatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg-ataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    |||||||||||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  22590343 ttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaatta 22590272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823429
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823712 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18823613  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 209  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  18823612 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 18823514  T
Q  210 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    ||||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18823513 agcataacttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 18823429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15005072 - 15004831
Alignment:
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaac 268  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  15005072 tatcacaattcaacaacaac-atgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaac 15004974  T
Q  269 aattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 368  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| ||    
T  15004973 aattcaatcaacatcaaatt-acatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagca 15004875  T
Q  369 attatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatg 412  Q
     |||||||||||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  15004874 cttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatg 15004831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25640694 - 25640456
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  25640694 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 25640595  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaat 396  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||  |  |||    
T  25640594 caaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagtagaaat 25640496  T
Q  397 taactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    || |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25640495 tacctaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 25640456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839300
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839567 acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18839468  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 209  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||     
T  18839467 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataa-catgtcataagtcatcaatta 18839369  T
Q  210 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattta 278  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18839368 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 18839300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 32898779 - 32898924
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  32898779 ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaattgatcatgaaact 32898878  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32898879 tatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 32898924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25744480 - 25744331
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25744480 caacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgat 25744381  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25744380 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga 25744331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Original strand, 22440941 - 22441068
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  22440941 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaac 22441039  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22441040 aacaatgcataattcaccaattgagcata 22441068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 31628248 - 31628402
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  31628248 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 31628347  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  31628348 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 31628402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 18777119 - 18777280
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||      
T  18777119 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatt 18777218  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  18777219 cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacata 18777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13014949 - 13014822
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13014949 aatcaagaatcatgcaa-cccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaac 13014851  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13014850 aacaatgcataattcaccaattgagcata 13014822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18432777
Alignment:
Q  94 aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||  | |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  18432656 aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaag 18432755  T
Q  194 cataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18432756 cataattcaccaattaagcata 18432777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 16086007 - 16086151
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| | | |||||||||||| |    
T  16086007 ctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaactt 16086106  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  16086107 atcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcata 16086151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399065
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacata 132  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  18398890 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaaca 18398989  T
Q  133 tgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    | ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  18398990 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Original strand, 18570271 - 18570413
Alignment:
Q  74 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 172  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |||    
T  18570271 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttat 18570370  T
Q  173 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18570371 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 18570413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381803
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  | || ||| | |||||    
T  18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 18381866  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  18381865 acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatt 18381803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32276902 - 32276756
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  32276902 aattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatact 32276803  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttca 343  Q
     |||| |||| | |  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  32276802 caaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 32276756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083383
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| | || | |||||||| | ||| | ||||||    
T  17083496 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa 17083397  T
Q  110 gccatgaattatca 123  Q
    ||||||||| ||||    
T  17083396 gccatgaatcatca 17083383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361874
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 22361955  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||    ||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22361954 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt 22361874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 16106502 - 16106650
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||     | ||||||||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| | | |||||    
T  16106502 caacaacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaa-----gtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatc 16106596  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  16106597 atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcata 16106650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 328
Target Start/End: Original strand, 19629447 - 19629578
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  19629447 aattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatact 19629546  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaattt 328  Q
     |||| |||| | || |||  |||||||||||    
T  19629547 caaacttatcaccacaacaagagcacgaattt 19629578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25367495 - 25367376
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |     
T  25367495 ctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatct 25367396  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaac 189  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25367395 tatcacaattcaacaacaac 25367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 288
Target Start/End: Original strand, 26512260 - 26512349
Alignment:
Q  199 ttcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  26512260 ttcatcaattgagcataattcacaaactacccatttatatatatcataaacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaatt 26512349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 288
Target Start/End: Original strand, 26517376 - 26517465
Alignment:
Q  199 ttcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  26517376 ttcatcaattgagcataattcacaaactacccatttatatatatcataaacatgtaatttcaacaacaacaattcaaatatcatcaaatt 26517465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16300122 - 16300022
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16300122 cataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 16300023  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  16300022 a 16300022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 306
Target Start/End: Original strand, 21931333 - 21931429
Alignment:
Q  210 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatc 306  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||    
T  21931333 agcataattcacaatatacccatttatacatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatatc 21931429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28195360 - 28195234
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  28195360 caacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgat 28195262  T
Q  161 catgaaa-catatcacaattcatcaaca 187  Q
    ||| ||| |  ||||||||||| |||||    
T  28195261 cataaaatctcatcacaattcaacaaca 28195234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17375018 - 17374924
Alignment:
Q  237 atacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||| |||| ||   ||||||||||||||    
T  17375018 atacaccatgaacatgtaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 17374924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629786
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||    
T  18629892 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 18629793  T
Q  147 caacaac 153  Q
    |||||||    
T  18629792 caacaac 18629786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 121
Target Start/End: Original strand, 15740209 - 15740269
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattat 121  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15740209 caacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattat 15740269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 25651197 - 25651345
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| |     
T  25651197 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 25651296  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  25651297 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 25651345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1650020
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 16232199 - 16232231
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232199 atgattatgataataactaacccccttacctta 16232231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 19610325 - 19610357
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19610325 atgattatgataataactaacccccttacctta 19610357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919655
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    ||||| |||||||||||  || |||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25919571 tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 25919655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 32494341 - 32493902
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32494341 acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaa 32494242  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494241 caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 32494142  T
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32494141 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggt 32494042  T
Q  341 tcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494041 tcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaatta 32493942  T
Q  441 tctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493941 tctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 32493902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 480
Target Start/End: Original strand, 126406 - 126814
Alignment:
Q  73 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacata 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126406 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacata 126505  T
Q  172 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126506 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 126605  T
Q  272 tcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126606 tcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt 126705  T
Q  372 atgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttg 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  126706 atgcatagaacaatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttg 126805  T
Q  472 ctcctatga 480  Q
    |||||||||    
T  126806 ctcctatga 126814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 111550 - 111125
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 154  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111550 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatttgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaacc 111451  T
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111450 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgca 111351  T
Q  255 atttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcact 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  111350 atttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcact 111251  T
Q  355 tattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattag 454  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  111250 tattttcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttag 111151  T
Q  455 ctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  111150 ctcaagcttcacttttgctcctatga 111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1937290 - 1936873
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1937290 atttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 1937191  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  1937190 acaacaaccattgatcat------------aattcatcaacaaccatacataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttt-----atcat 1937108  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937107 gaacttgcaatttcatcatgaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 1937008  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1937007 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctcc 1936908  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1936907 aactattaactctagcttcacttttgcttctatga 1936873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42056565 - 42056188
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||    
T  42056565 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattga 42056466  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056465 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattcacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 42056366  T
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056365 atcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 42056266  T
Q  360 tcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42056265 tcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 2028893 - 2029276
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |  | || ||| |||||| ||||||     
T  2028893 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacat 2028992  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2028993 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttg 2029092  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029093 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 2029192  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2029193 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 91 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2190431 - 2190085
Alignment:
Q  91 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190431 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 2190332  T
Q  191 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2190331 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaa 2190232  T
Q  291 catattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaa 389  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2190231 catatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaa 2190132  T
Q  390 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2190131 aaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaaccgccttacctta 2190085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 67 - 436
Target Start/End: Original strand, 3049568 - 3049937
Alignment:
Q  67 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  3049568 acaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatga 3049667  T
Q  166 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatc 265  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049668 aacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatattcatacatcatgaacttgcaatttcatcatc 3049767  T
Q  266 aacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataa 365  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049768 c-caattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataa 3049866  T
Q  366 tcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049867 tcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7284173
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7284376 acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc 7284277  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    |||||||||| |||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||    
T  7284276 catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaag 7284177  T
Q  212 cata 215  Q
    ||||    
T  7284176 cata 7284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 298 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15516900 - 15516765
Alignment:
Q  298 aaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaat 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15516900 aaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaat 15516801  T
Q  397 taactaaatgattatgataaaaactaacccccttac 432  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15516800 taaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39046890 - 39046740
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39046890 caacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 39046791  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39046790 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 39046740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39291648 - 39291457
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  39291648 aattcaccaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatact 39291549  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaga 388  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  39291548 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattcaaataagtacttatgcatagaaaaagaga 39291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 434
Target Start/End: Original strand, 13352065 - 13352306
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  13352065 cataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaatcaaatatcatcaaattaacat 13352164  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||      
T  13352165 actgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatgcatagaaaaagagagaaga 13352264  T
Q  394 aattaactaaatgattatg-ataaaaactaacccccttacct 434  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  13352265 aactaattaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacct 13352306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 11287390 - 11287551
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  11287390 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 11287489  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11287490 aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 11287551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Original strand, 35094797 - 35094974
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35094797 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaac-attgat 35094895  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcata 239  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  35094896 catgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcata 35094974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 12758968 - 12759121
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12758968 caacaacatctcatttctccacacaaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatc 12759067  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12759068 atgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgagcata 12759121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15822698 - 15822544
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  15822698 caacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 15822599  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15822598 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcata 15822544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 3894998 - 3895159
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  3894998 aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 3895097  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  3895098 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 3895159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 47289788 - 47289942
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   | |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47289788 aatcatgaatcatgcaa-cacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 47289886  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  47289887 aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 47289942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26070531 - 26070377
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  26070531 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26070432  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  26070431 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcata 26070377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26094318 - 26094164
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  26094318 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26094219  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  26094218 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcata 26094164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 44865234 - 44865391
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgact---aaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatc 183  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44865234 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatc 44865332  T
Q  184 aacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  44865333 aacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 44865391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45452432 - 45452305
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||| || |||||||    
T  45452432 caacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatc 45452333  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45452332 atgaaacttatcacaattcatcaacaac 45452305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248233
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  | || ||| | ||||||||||| |    
T  12248395 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 12248296  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  12248295 cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 12248233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16570264 - 16570118
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  16570264 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 16570165  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  16570164 tatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 16570118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 16595398 - 16595544
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  16595398 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 16595497  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  16595498 tatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 16595544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 477
Target Start/End: Original strand, 3060271 - 3060344
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060271 atgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 13274753 - 13274922
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | || ||| | ||||||    
T  13274753 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 13274852  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  13274853 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 13274922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49047955 - 49047786
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | || ||| | ||||||    
T  49047955 ttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaa 49047856  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  49047855 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcata 49047786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 143652 - 143800
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||      ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  143652 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcattaacaacatgacttaacaacaacaa------ttgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 143744  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  143745 aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 143800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12370127 - 12369953
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |  | || ||| |     
T  12370127 acccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttag 12370028  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12370027 caacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcata 12369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283912
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatga 7283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14272049
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | || ||||    
T  14272203 acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag 14272104  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||||| |||| |||  |||| | | | ||||||||||| | ||||| |||||    
T  14272103 ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatga 14272049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15978004 - 15977820
Alignment:
Q  173 cacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaat 271  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |  || || |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15978004 cacaattcaacaacaac-atgtcataattcatcatttgagtataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataat 15977906  T
Q  272 tcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttat 357  Q
    ||| ||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| ||   |||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15977905 tcaattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcacttat 15977820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16915067
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||     
T  16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt 16915118  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  16915117 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 16915067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17224058
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | || ||| | |||||    
T  17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca 17224121  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||| | ||||| |||||  | ||  |||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  17224120 acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356752
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 48356701  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  48356702 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 48356752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377637
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 13377584  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  13377585 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 13377637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 371203 - 371303
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  371203 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 371302  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  371303 a 371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18151399 - 18151259
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 340  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||   || |||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  18151399 atcatgaacatacaaattcgtcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacctaatcatatcactacaacatgagcacgaatttcaacggttaagt 18151300  T
Q  341 tcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 381  Q
    |||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  18151299 tcacaataatcacttattcaaataagaatttatgcatagaa 18151259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8563505 - 8563369
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattca-ccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||| ||| ||||||||   || |||||| ||| |||||||||| | ||||  ||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8563505 atcacaaatcaacaacaacctaacacaattcatccatttgagcataactcacaatatactcatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcaacaaca 8563406  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatc 306  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||| | |||||||||    
T  8563405 attcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatc 8563369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 477
Target Start/End: Original strand, 13377849 - 13377924
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  13377849 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13863154 - 13863042
Alignment:
Q  104 acccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-a 202  Q
    |||||||||||| || || | |||  |||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| |    
T  13863154 acccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 13863055  T
Q  203 ccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||    
T  13863054 ccaattgagcata 13863042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17984827 - 17984753
Alignment:
Q  257 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||   ||||||||| |||  |||  ||||||||||||||    
T  17984827 ttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaatttcaa 17984753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446249
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  4446168 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaat 4446249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935400
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||||| ||||||||    
T  14935319 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaat 14935400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15362993
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||||| ||||||||    
T  15362912 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaat 15362993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17223846 - 17223797
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  17223846 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcttagcccaagcttcacttt 17223797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 436
Target Start/End: Original strand, 25124445 - 25124482
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25124445 actaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44305096 - 44304959
Alignment:
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||||||| |||| ||   || |||||||||||  |||  |||||     
T  44305096 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 44304997  T
Q  345 gataatcacttat-tctcataatcaattatgcatagaa 381  Q
     |||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  44304996 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaa 44304959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 13758677 - 13758709
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13758677 atgattatgataataactaacccccttacctta 13758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 15862226 - 15862258
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15862226 atgattatgataataactaacccccttacctta 15862258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 15927875 - 15927907
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15927875 atgattatgataataactaacccccttacctta 15927907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212103
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18979970 - 18979938
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18979970 atgattatgataataactaacccccttacctta 18979938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241393
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || | |||||||| | ||| | || |||||||||||| ||||    
T  34241477 tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatca 34241393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053003
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 46474059 - 46474195
Alignment:
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttca 237  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||| ||| |||||||   ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||| ||    
T  46474059 aacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattaacaatatacacatttcca 46474158  T
Q  238 tacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 274  Q
     | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46474159 catattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattca 46474195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 480
Target Start/End: Original strand, 79844 - 80263
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  79844 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaat 79943  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79944 catgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttca 80043  T
Q  261 tcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattct 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80044 tcatcaacaatttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattct 80143  T
Q  361 cataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctag 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  80144 cataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaag 80243  T
Q  461 cttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  80244 cttcacttttgctcctatga 80263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Original strand, 46171 - 46299
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  46171 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaac 46270  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||    
T  46271 aacatagcataattcaccaattgagcata 46299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Original strand, 40664 - 40792
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||    
T  40664 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaac 40763  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||    
T  40764 aatatagcataattcaccaattgagcata 40792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31570 - 31136
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  31570 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 31471  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31470 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 31371  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31370 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 31271  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31270 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 31171  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31170 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 31136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41708
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 41373  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41374 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 41473  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41474 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 41573  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41574 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 41673  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 41708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 22274688 - 22275121
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  22274688 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatca 22274786  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22274787 acaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatcat 22274886  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274887 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22274986  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22274987 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctcc 22275086  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275087 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 22275121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284354
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  22283921 atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatca 22284019  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22284020 aaaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttactaactattcattttcatacatcat 22284119  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22284120 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatg 22284219  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22284220 ataatcacttattctcataatcaaatatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctcc 22284319  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22284320 aactattagctctaacttcacttttgctcctatga 22284354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9653179 - 9652796
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||| |||||     
T  9653179 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacat 9653080  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653079 ctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 9652980  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652979 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 9652880  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9652879 cttattcccataatcaattatgcatagaacaagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 66 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21274320 - 21273949
Alignment:
Q  66 cacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 163  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  21274320 cacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcta-cccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 21274222  T
Q  164 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatca 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274221 gaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatca 21274122  T
Q  264 tcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcat 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274121 tcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcat 21274022  T
Q  364 aatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21274021 aatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 21273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213403
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt--ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaa 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||   ||| | ||||||    
T  25212977 acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa 25213076  T
Q  110 gccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaat 207  Q
    ||||| | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  25213077 gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaat 25213175  T
Q  208 tgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatct 307  Q
    | ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  25213176 taagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatcaa-ttaacatatccaaacatatct 25213274  T
Q  308 ctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatg 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  25213275 ctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatg 25213374  T
Q  407 attatgataaaaactaacccccttacctt 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25213375 attatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 480
Target Start/End: Original strand, 15633327 - 15633613
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  15633327 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 15633426  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633427 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 15633526  T
Q  394 aattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15633527 aattaactaagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatga 15633613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23836972 - 23836791
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23836972 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaattgat 23836873  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  23836872 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacatacccattttcataca 23836791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 32465838 - 32465992
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32465838 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgat 32465937  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32465938 catgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcata 32465992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25876206 - 25876006
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25876206 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaa 25876107  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcata 239  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  25876106 caataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcata 25876008  T
Q  240 ca 241  Q
    ||    
T  25876007 ca 25876006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 436
Target Start/End: Original strand, 7321633 - 7321872
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  7321633 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 7321732  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaat 396  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||  ||||||||| | ||||||  |  |||    
T  7321733 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattcaaataagcacgtatgcataggaaaagagagtagaaat 7321832  T
Q  397 taactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7321833 taactaagtgattataatgaattctaacccccttacctta 7321872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433495
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  19433649 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag 19433550  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    |||||||| |||| |||  ||||  || | ||||||||||| | ||||| |||||    
T  19433549 ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatga 19433495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 28974029 - 28974183
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  28974029 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgat 28974128  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  28974129 catgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcata 28974183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 271151 - 271304
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  271151 caacaacatctcattcctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 271250  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  271251 atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcata 271304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36890972 - 36890798
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| |     
T  36890972 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttag 36890873  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  36890872 caacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcata 36890798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4448399 - 4448246
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  4448399 caacaacatctcatttttcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 4448300  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  4448299 atgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattgaacata 4448246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 6879417 - 6879597
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||| | | |||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6879417 caacaacatctcaattctcaacaacaaaccaagaattatttaaacccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgat 6879516  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  6879517 cattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttcacaca-tacccattttcataca 6879597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602158
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||  | |||||    
T  25601989 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaaca 25602088  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  25602089 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcata 25602158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627194
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 20627194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794585
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatga 19794585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43642913 - 43642837
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642913 atgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 43642837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826760
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||   |||   |||||||    
T  24827044 acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatgataaatgagcacccaag 24826945  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  |  |  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  24826944 ccataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatt 24826846  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24826845 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 24826760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Original strand, 27261786 - 27261899
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||| | | ||||||    
T  27261786 caacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaattgat 27261885  T
Q  161 catgaaacatatca 174  Q
    |||||||| |||||    
T  27261886 catgaaacttatca 27261899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22579974
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| ||| || |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | || ||     
T  22580140 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag 22580041  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||   |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22580040 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaat---tcaacaacaaagcataattcaaccaattgagcata 22579974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571404
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||  | || ||| ||||||||    
T  24571572 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa 24571474  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | || ||||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  24571473 caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcata 24571404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3403
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaa 139  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||| |    
T  3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta 3430  T
Q  140 acaacaacaacaaccattgatcatgaa 166  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  3429 gcaacaacaacatcaattgaacatgaa 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28031380 - 28031230
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||    
T  28031380 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacat 28031281  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28031280 actaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 28031230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 358
Target Start/End: Original strand, 20279571 - 20279688
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  20279571 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagt 20279670  T
Q  341 tcatgataatcacttatt 358  Q
    |||  |||||||||||||    
T  20279671 tcaccataatcacttatt 20279688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646031
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||  |  || ||  |||||||||| ||| | |||||||     
T  43645824 acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaagt 43645923  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttga 210  Q
    ||||||| |||  |||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||  | || |||| |||| |||||||   |||||||||| ||| ||||    
T  43645924 catgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttga 43646023  T
Q  211 gcataatt 218  Q
    ||||||||    
T  43646024 gcataatt 43646031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 344
Target Start/End: Original strand, 33128135 - 33128308
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||    
T  33128135 atcacaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaaca 33128233  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||| | |  |||  ||||||||  | |||||||||||||||    
T  33128234 attcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcat 33128308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68119
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||  |||| ||| |     
T  67952 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 68051  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  68052 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722437
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  722353 tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 722437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 17204445 - 17204529
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattta 278  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  17204445 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 17204529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884684
Alignment:
Q  39 atcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctc 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctc 24884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24341593 - 24341513
Alignment:
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24341593 aacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 24341513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 440
Target Start/End: Original strand, 19666843 - 19666884
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  19666843 actaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta 19666884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821767
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||| |     
T  23821892 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23821793  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaa 166  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  23821792 caacaacaacatcaattgaacatgaa 23821767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830846
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||| |     
T  23830971 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23830872  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaa 166  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  23830871 caacaacaacatcaattgaacatgaa 23830846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463075
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3798552 - 3798520
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3798552 atgattatgataataactaacccccttacctta 3798520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 8944153 - 8944185
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8944153 atgattatgataataactaacccccttacctta 8944185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12635817 - 12635785
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12635817 atgattatgataataactaacccccttacctta 12635785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12641591 - 12641559
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12641591 atgattatgataataactaacccccttacctta 12641559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 12728699 - 12728731
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12728699 atgattatgataataactaacccccttacctta 12728731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 16935900 - 16935932
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16935900 atgattatgataataactaacccccttacctta 16935932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 17006560 - 17006592
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17006560 atgattatgataataactaacccccttacctta 17006592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863267
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 25305416 - 25305584
Alignment:
Q  53 caaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 151  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||  | || ||| | | |||||||||    
T  25305416 caaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaaca 25305515  T
Q  152 accattgatcatgaaacatatcacaattcatcaa-caaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
     | ||||| |||||  | || ||||||||| ||| ||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25305516 tcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 25305584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982364
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42177918 - 42177886
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42177918 atgattatgataataactaacccccttacctta 42177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 5941
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||    
T  6373 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca 6274  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6273 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 6174  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6173 gaacttgcaatttcatcattaacaaatcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 6074  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6073 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctcc 5974  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctat 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973 aactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 290 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5735
Alignment:
Q  290 acatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 389  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  390 aaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 478  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Original strand, 21859984 - 21860410
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21859984 aaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 21860083  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21860084 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcattcatcatgaacttgc 21860183  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860184 aatttcatcattaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 21860283  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860284 ttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 21860383  T
Q  454 gctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21860384 gctctagcttcacttttgctcctatga 21860410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 44035255 - 44034829
Alignment:
Q  52 acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 150  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44035255 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaac 44035157  T
Q  151 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaact 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035156 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaact 44035057  T
Q  251 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataat 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035056 tgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataat 44034957  T
Q  351 cacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaacta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034956 cacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaacta 44034857  T
Q  451 ttagctctagcttcacttttgctcctat 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034856 ttagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 34 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861327
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  15861728 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaat 15861629  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 231  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861628 atgactaaacaa--acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 15861531  T
Q  232 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15861530 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 15861431  T
Q  332 agattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccctta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15861430 agattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 15861331  T
Q  432 cctt 435  Q
    ||||    
T  15861330 cctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 22366970 - 22367296
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  22366970 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat 22367069  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22367070 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcata-ttcaccaattgagcataatttacaaactactca 22367168  T
Q  232 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22367169 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 22367268  T
Q  332 agattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367269 agattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218804
Alignment:
Q  343 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 442  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 41218766  T
Q  443 tccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41218767 accaactattagctcaagcttcacttttgctcctatga 41218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 49967631 - 49967784
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  49967631 caacaacatctcattcctcaacaacaaccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatc 49967730  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49967731 atgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcata 49967784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35522585 - 35522432
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  35522585 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattgatc 35522486  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35522485 atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22403350 - 22403196
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22403350 aatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaac 22403252  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  22403251 aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 22403196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 41212049 - 41212206
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaaca---acaacaacaaccatt 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||| |||    
T  41212049 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaatt 41212148  T
Q  158 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  41212149 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcata 41212206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 21718209 - 21718362
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  21718209 caacaacatctcatttctcaagaacaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 21718308  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  21718309 atgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 21718362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 35054716 - 35054890
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||    
T  35054716 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaa 35054815  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  35054816 caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcata 35054890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394603
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatga 41394603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27330026 - 27329868
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 154  Q
    |||||| |||| |||||| ||||  ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| ||    
T  27330026 aaaccaacaacaacaacttatttgacaacaa--attatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatcc 27329929  T
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27329928 attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 27329868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627805
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaaca 145  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatc-aacatcatcacttagcaaca 51627847  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaca 187  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  51627846 acaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaaca 51627805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27674838
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 27674838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9784341 - 9784239
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  9784341 aatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaac 9784242  T
Q  187 aac 189  Q
    |||    
T  9784241 aac 9784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829629
Alignment:
Q  41 caacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22829712 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 22829629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609036
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||  | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  17608886 tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 17608985  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  17608986 aacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 17609036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603139
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatca 19603139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21650181 - 21650081
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21650181 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 21650082  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  21650081 a 21650081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033882
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta 120  Q
    |||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccatgaatta 38033882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 477
Target Start/End: Original strand, 27675120 - 27675191
Alignment:
Q  406 gattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  27675120 gattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177313
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||  | || ||| | |||||    
T  20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 20177239  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    |||||| | ||||| | |||    || ||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20177240 acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 20177313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 20254430 - 20254527
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20254430 aattcatcaattaagcataatttcataacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 20254527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 223
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195157
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||    
T  21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 21195079  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatttacaa 223  Q
    |||||   ||| | |||||  |  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21195080 caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaa 21195157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9784177
Alignment:
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||   |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  9784248 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaat---tcaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 9784177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37233969
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||||| || ||| || ||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||  |||| |||     
T  37234149 tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt 37234050  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt-gagcataatt 218  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| | |||||   |||||||||| || || ||||||||||    
T  37234049 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataatt 37233969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051759
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Original strand, 20194140 - 20194232
Alignment:
Q  197 aattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  20194140 aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattatcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaatt 20194232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 20445754 - 20445818
Alignment:
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20445754 attgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 20445818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 20531519 - 20531583
Alignment:
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20531519 attgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 20531583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844374
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40436367 - 40436291
Alignment:
Q  230 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatc 306  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| || | ||||| |||||||||    
T  40436367 cattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatc 40436291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 46523695 - 46523727
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46523695 atgattatgataataactaacccccttacctta 46523727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119063
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaac 144  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||    
T  25119498 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac 25119399  T
Q  145 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25119398 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcataatttacaaactatccattttcatacatca 25119299  T
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25119298 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcat 25119199  T
Q  345 gataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctc 444  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25119198 gataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctc 25119099  T
Q  445 caactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119098 caactattagctctagcttcacttttgctcctatga 25119063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 5682817 - 5682384
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||  |||||| |||| ||||    
T  5682817 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaaca 5682718  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5682717 acaacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatcat 5682618  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682617 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 5682518  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5682517 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaggaaaa-aattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcacc 5682419  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5682418 aactattagctcatgcttcacttttgctcctatga 5682384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 436
Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14952117
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  14951713 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 14951812  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951813 atgactaaataacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactaccca 14951912  T
Q  232 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14951913 ttttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 14952012  T
Q  332 agattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccctta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14952013 agattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaaccccctta 14952112  T
Q  432 cctta 436  Q
    |||||    
T  14952113 cctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 62 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15272588 - 15272211
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | |||||    
T  15272588 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 15272489  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272488 tcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 15272389  T
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272388 atcatcaaccattcgtttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 15272289  T
Q  360 tcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15272288 tcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 205 - 440
Target Start/End: Original strand, 19559483 - 19559719
Alignment:
Q  205 aattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacata 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  19559483 aattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacatgctcaaacata 19559582  T
Q  305 tctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaa 404  Q
    || |||| |||| |||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||     
T  19559583 tcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaattaactaat 19559682  T
Q  405 tgattatg-ataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  19559683 tgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaatta 19559719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53705000 - 53704846
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53705000 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 53704901  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704900 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 53704846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395418
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||    
T  34395222 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca 34395321  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  34395322 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 34395418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 44055895 - 44056049
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  44055895 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaattgat 44055994  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44055995 catgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 44056049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 55376855 - 55376714
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  55376855 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaact 55376756  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  55376755 tatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgag 55376714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 16732149 - 16732303
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||| | ||||||    
T  16732149 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaattgat 16732248  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16732249 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 16732303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23270201 - 23270020
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  23270201 caacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat 23270102  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  23270101 catgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccattttcataca 23270020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44346961
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44346816 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca 44346915  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44346916 tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcata 44346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135907
Alignment:
Q  334 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  433 ctta 436  Q
    ||||    
T  15135910 ctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21959718 - 21959576
Alignment:
Q  74 atttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 172  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  21959718 atttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 21959619  T
Q  173 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  21959618 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 21959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Original strand, 30457925 - 30458037
Alignment:
Q  103 aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30457925 aacccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattca 30458024  T
Q  203 ccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||    
T  30458025 ccaattgagcata 30458037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53907963 - 53907812
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||   |||||    
T  53907963 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaacaa---ttgat 53907867  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53907866 catgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcata 53907812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 820153 - 820029
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  820153 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaa---ttgatcatgaaacttatcacaattcatcaac 820058  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  820057 aacaatgcataattcaccaattgagcata 820029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16523032
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  16522748 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 16522847  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  16522848 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatt 16522946  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16522947 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 16523032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 34177781 - 34177502
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  34177781 cataattcaccaattgaacataattctcaa-ctacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaattatcatgtaattaacat 34177683  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||   ||| || |||| |||| |||||  ||||       
T  34177682 actcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaa--- 34177586  T
Q  394 aatta-actaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||  || |     |||||||||||||||||| |||||||    
T  34177585 aattacactaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttagatcaattccctagctctagcttcactttagctccta 34177502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 388
Target Start/End: Original strand, 49071800 - 49071994
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |  || ||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49071800 cataattcatcaattgagcatatttcatcaagtattcatatacatatatcatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaacatcaaattaacat 49071899  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaga 388  Q
    | | ||||||||| |||| | || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  49071900 actcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagaga 49071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8872699 - 8872584
Alignment:
Q  103 aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca---ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataat 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8872699 aacccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataat 8872600  T
Q  200 tcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  8872599 tcaccaattgagcata 8872584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12837466 - 12837313
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |||||||     
T  12837466 caacaacaacttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgac 12837368  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12837367 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 12837313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232609
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30232763 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 30232664  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  30232663 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcata 30232609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295908
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  9295624 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 9295723  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  9295724 ccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatt 9295822  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9295823 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcattaccaacaattcatttatcattcaattaacata 9295908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118124
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatga 54118124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45459096 - 45458968
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||  | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45459096 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaacaac 45458997  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    | | | |||||||||||||||||| ||||    
T  45458996 agcaaagcataattcaccaattgaacata 45458968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18494602 - 18494467
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | || ||| |||||||||| ||||    
T  18494602 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaac 18494503  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
     |||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  18494502 aattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaac 18494467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13809768 - 13809622
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | || | | | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  13809768 ctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatct 13809669  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| || |||||||||||    
T  13809668 tatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcata 13809622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14500358 - 14500208
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  14500358 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaataattcatttatcattaaattaacat 14500259  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14500258 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 14500208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Original strand, 27960961 - 27961078
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |     
T  27960961 ctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatct 27961059  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaa 188  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  27961060 tataacaattcaacaacaa 27961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185983
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||| ||||||||| ||||| || | |||||||| | ||  | ||||||    
T  7186159 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaa---aacaacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa 7186063  T
Q  110 gccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||  || | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  7186062 gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 7185983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15044966
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || ||| || |||| |||| | |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  15044784 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 15044883  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15044884 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt 15044966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265628
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  52265749 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac 52265650  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||  ||||||||||| |||||    
T  52265649 aacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 14996241 - 14996341
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  14996241 cataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcttttatcattcaattaacat 14996340  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  14996341 a 14996341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957230
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatca 37957230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964890
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 7964901  T
Q  139 aacaacaacaa 149  Q
    | |||||||||    
T  7964900 agcaacaacaa 7964890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256423
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  ||||  |    
T  41256660 atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc 41256561  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatttacaaactacccatttt 235  Q
    | ||||||||||||| | ||| | ||||   |  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||    
T  41256560 ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatata-tcatttt 41256462  T
Q  236 catacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 274  Q
    || | |  |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  41256461 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattca 41256423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 310
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417536
Alignment:
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctcta 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctcta 21417536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32460820 - 32460699
Alignment:
Q  223 aactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcac 322  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| | |||  |||  | |  |||  |||||    
T  32460820 aactaccccttttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcac 32460721  T
Q  323 gaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  32460720 gaaattcaaagattgggttcat 32460699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 8045058 - 8045158
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  8045058 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 8045157  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  8045158 a 8045158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109488
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || ||| || |||| |||| | |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  15109640 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 15109541  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  15109540 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 15109488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104374
Alignment:
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10104452 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 10104374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15013573 - 15013325
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||| |||| |||||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  |    
T  15013573 atcaacccatttttataaaacaaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 15013474  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatttacaaactacccatttt 235  Q
    | ||||||||||| | | ||| | |||||  |  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  |   ||||||    
T  15013473 ttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatat-gtcatttt 15013375  T
Q  236 catacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaa 285  Q
    || | |  |||||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  15013374 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaa 15013325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276541
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |  | |||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |||  |||| |||     
T  18276392 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt 18276491  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 188  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  18276492 tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa 18276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47535251
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  47535328 attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatca 47535251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 9795330 - 9795430
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||   |||||| |||||| | |||| |||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  9795330 cataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgacacattatgaacatgttatttcatcaccaagaattcatttatcattcaattaacat 9795429  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  9795430 a 9795430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12133686 - 12133626
Alignment:
Q  251 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctac 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  12133686 tgcaatttcatcattaacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactac 12133626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15675293 - 15675213
Alignment:
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15675293 aacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 15675213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821981
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    ||||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  19822065 tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 19821981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 31115688 - 31115768
Alignment:
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||||    
T  31115688 aacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattt 31115768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16225301 - 16225211
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||| || ||||| | || ||||||||||  || |||||||||    
T  16225301 aattcatcaattgagcataattcacaaactacccatttatata-ttcatgaacatgtaatttaaacaacaacaattcaaataccatcaaatt 16225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 41165883 - 41165808
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  41165883 aaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40885756 - 40885678
Alignment:
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||   ||| | |||||||||||||||||||||    
T  40885756 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt 40885678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901274
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  14901197 attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatca 14901274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Original strand, 14996445 - 14996478
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14996445 atgattatgataataactaacccccttaccttaa 14996478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41166055
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| | ||||||||||||| | |||| |||  | || ||| | |||||    
T  41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca 41166129  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |  ||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41166128 acaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 41166055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 7132014 - 7131982
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7132014 atgattatgataataactaacccccttacctta 7131982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246769
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15287194 - 15287162
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15287194 atgattatgataataactaacccccttacctta 15287162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15294303 - 15294271
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15294303 atgattatgataataactaacccccttacctta 15294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17145606 - 17145574
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17145606 atgattatgataataactaacccccttacctta 17145574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19697514 - 19697414
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| || |||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19697514 cataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattcatttatcattcaattaacat 19697415  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  19697414 a 19697414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19708099 - 19707999
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||| || |||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19708099 cataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattcatttatcattcaattaacat 19708000  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  19707999 a 19707999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 20001030 - 20001062
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20001030 atgattatgataataactaacccccttacctta 20001062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 162469 - 162036
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaa-c 144  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |    
T  162469 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaac 162370  T
Q  145 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  162369 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttacatacatca 162270  T
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162269 tgaacttgcaatttcatcatcaacaaatcatttaatatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 162170  T
Q  345 gataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  162169 gataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctc 162070  T
Q  445 caactattagctctagcttcacttttgctcctat 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162069 caactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166120
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |       |||    
T  166547 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatta-------aca 166455  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  166454 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttacatacatcat 166355  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166354 gaacttgcaatttcatcatcaacaaatcatttaatatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 166255  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166254 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctcc 166155  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166154 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 166120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 164204 - 164349
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  164204 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca 164303  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  164304 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 164349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 116485 - 116410
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  116485 aaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116690
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | |||||    
T  116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 116696  T
Q  146 acaaca 151  Q
    ||||||    
T  116695 acaaca 116690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24716718
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  24717152 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 24717053  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24717052 acaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcgt 24716953  T
Q  246 gaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24716952 gaacttgcaatttcattatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatg 24716853  T
Q  346 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcc 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24716852 ataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcacc 24716753  T
Q  446 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716752 aactattagctctagcttcacttttgctcctatga 24716718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506709
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41507091 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 41506992  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506991 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 41506892  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506891 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcac 41506792  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41506791 ttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 41506709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 480
Target Start/End: Original strand, 39115267 - 39115674
Alignment:
Q  74 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 172  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115267 atttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 39115366  T
Q  173 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatt 272  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115367 cacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcataatttacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatt 39115466  T
Q  273 catttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39115467 catttaacatcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatta 39115566  T
Q  373 tgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgc 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39115567 tgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgc 39115666  T
Q  473 tcctatga 480  Q
    ||||||||    
T  39115667 tcctatga 39115674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Original strand, 274416 - 274842
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  274416 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 274515  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  274516 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgc 274615  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  274616 aatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataac 274715  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274716 ttattctcataatcaattatgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 274815  T
Q  454 gctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  274816 gctctagcttcacttttgctcctatga 274842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 641433 - 641007
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  641433 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 641334  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  641333 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgc 641234  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  641233 aatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataac 641134  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641133 ttattctcataatcaattatgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 641034  T
Q  454 gctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  641033 gctctagcttcacttttgctcctatga 641007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 55 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 827239 - 826813
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  827239 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 827140  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  827139 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgc 827040  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  827039 aatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataac 826940  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826939 ttattctcataatcaattatgcataggacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactatta 826840  T
Q  454 gctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  826839 gctctagcttcacttttgctcctatga 826813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 91 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24385988 - 24385652
Alignment:
Q  91 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||| |         |||||||||||||||     
T  24385988 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatcatta---------caattcatcaacaaca 24385898  T
Q  191 atgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaa 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24385897 atgcttaattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattat 24385798  T
Q  291 catattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaa 390  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385797 catattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaa 24385698  T
Q  391 aagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24385697 aggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16039176 - 16038923
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |  | || ||| ||    
T  16039176 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaa 16039077  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 240  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16039076 caacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatac 16038977  T
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16038976 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacata 16038923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22321587 - 22321437
Alignment:
Q  195 ataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22321587 ataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacata 22321488  T
Q  295 ttgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 345  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321487 ttcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21259630 - 21259391
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  21259630 aattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaaattaacatact 21259531  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaat 396  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||  |  |||    
T  21259530 caaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagtagaaat 21259431  T
Q  397 taactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21259430 taactaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 21259391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 440
Target Start/End: Original strand, 17502274 - 17502521
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17502274 cataattcatcaattgaacataattcacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacat 17502373  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||      
T  17502374 actcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaaga 17502473  T
Q  394 aattaactaaatgattatg-ataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    || ||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| || |||||    
T  17502474 aactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttatctcaatta 17502521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 412
Target Start/End: Original strand, 23217990 - 23218208
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23217990 cataattcatcaattgaacataattcacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacat 23218089  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||      
T  23218090 actcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaaga 23218189  T
Q  394 aattaactaaatgattatg 412  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  23218190 aactaactaagtgattatg 23218208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19993321 - 19993141
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19993321 caacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 19993222  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  19993221 gatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcataca 19993141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22235038 - 22234890
Alignment:
Q  93 gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat 192  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22235038 gaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat 22234939  T
Q  193 gcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  22234938 gcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcataca 22234890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 41246648 - 41246792
Alignment:
Q  72 tcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  41246648 tcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaactt 41246747  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41246748 atcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcata 41246792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 388
Target Start/End: Original strand, 4233968 - 4234162
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  4233968 cataattcatcaattgaaaataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacat 4234067  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaga 388  Q
    | | ||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  4234068 actcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagaga 4234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 37611675 - 37611829
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37611675 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 37611773  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  37611774 aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 37611829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20573458 - 20573305
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  20573458 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 20573359  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20573358 atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcata 20573305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 20481565 - 20481739
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||    
T  20481565 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaa 20481664  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20481665 caacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcata 20481739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404856
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 16404856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20648087 - 20647938
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  20648087 ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact 20647988  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20647987 tatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataattt 20647938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20654163 - 20654018
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  20654163 ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact 20654064  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  20654063 tatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcata 20654018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39447046 - 39446878
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||| | ||||||    
T  39447046 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa 39446948  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| ||||||    
T  39446947 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata 39446878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Original strand, 21680994 - 21681137
Alignment:
Q  74 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 172  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | ||  ||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  21680994 atttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaat 21681093  T
Q  173 cacaattcatcaacaaccatgcataa-ttcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  21681094 cacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcata 21681137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533770
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||      
T  38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct 38533706  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  38533707 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattca 38533770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854722
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 5854671  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  5854672 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 5854722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20567265 - 20567200
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 127  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20567265 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 20567200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20567424 - 20567335
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 151  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  20567424 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 20567335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20573617 - 20573528
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 151  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  20573617 caacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 20573528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 25122543 - 25122618
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25122543 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18118376 - 18118259
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggt 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||   |||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||  ||    
T  18118376 atcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagt 18118277  T
Q  341 tcatgataatcacttatt 358  Q
    |||  |||||||||||||    
T  18118276 tcacaataatcacttatt 18118259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21494592 - 21494452
Alignment:
Q  204 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacat 303  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| | |||  |    
T  21494592 caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaatt 21494493  T
Q  304 atctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21494492 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 21494452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 29759933 - 29760005
Alignment:
Q  73 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaac 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  29759933 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaac 29760005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735977
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  | || | |     
T  22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt 22736028  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||| ||||||| | ||||| |||||| | ||||||||| || |||||||    
T  22736027 agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaac 22735977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Original strand, 22886440 - 22886590
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  22886440 catagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 22886539  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||  | |  |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  22886540 actcaaacttattaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggattcat 22886590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837325
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  | || ||| | |||||    
T  23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 23837262  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||| | ||||| |||||  | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  23837263 acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011602
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 26011551  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  26011552 agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 26011602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 22147555 - 22147652
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22147555 aattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 22147652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20561804 - 20561740
Alignment:
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20561804 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataattt 20561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 294
Target Start/End: Original strand, 2545061 - 2545160
Alignment:
Q  195 ataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2545061 ataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttcacacattatgaatatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 2545160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528533
Alignment:
Q  39 atcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgact 137  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||  ||    
T  33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaaa-atatctct 33528481  T
Q  138 aaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
     | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  33528482 tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 33528533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 123
Target Start/End: Original strand, 15969799 - 15969860
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15969799 caacaacaactcatttctcctctacaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 15969860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 18612523 - 18612620
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18612523 aattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 18612620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 18619428 - 18619525
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18619428 aattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 18619525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3431422 - 3431322
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  3431422 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 3431323  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  3431322 a 3431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933406
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |  | |||||||| | |   | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  15933256 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 15933355  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  15933356 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 15933406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 306
Target Start/End: Original strand, 16002113 - 16002223
Alignment:
Q  197 aattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatat 295  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | |||     
T  16002113 aattcaacaattagagcacaatttacaatatactcattttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatatac 16002212  T
Q  296 tgaaacatatc 306  Q
    | |||||||||    
T  16002213 tcaaacatatc 16002223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198261
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||   | || ||| | |||||    
T  21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca 21198335  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    |||||| | ||||| |||||  | || ||||||||| |||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21198334 acaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt 21198261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23226368 - 23226240
Alignment:
Q  39 atcaacccattt--tacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatga 135  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||||||  | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |    
T  23226368 atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 23226269  T
Q  136 ctaaacaacaacaacaaccattgatcatg 164  Q
    || ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  23226268 cttaacaacaacaacatcaattgaacatg 23226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23149865
Alignment:
Q  39 atcaacccattt--tacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatga 135  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||| || | |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  | || |    
T  23149736 atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23149835  T
Q  136 ctaaacaacaacaacaaccattgatcatga 165  Q
    || | |||||| |||||| ||||| |||||    
T  23149836 cttagcaacaaaaacaactattgaacatga 23149865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233206
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  | | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||    
T  27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 27233249  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||| | ||| | |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  27233248 caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 27233206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31194251 - 31194217
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31194251 aaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 31194217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20175857 - 20175720
Alignment:
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||||||| |||| ||   || |||||||||||  |||  |||||     
T  20175857 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 20175758  T
Q  345 gataatcacttat-tctcataatcaattatgcatagaa 381  Q
     |||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  20175757 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaa 20175720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20220584 - 20220447
Alignment:
Q  245 tgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||||||| |||| ||   || |||||||||||  |||  |||||     
T  20220584 tgaacatgcaatttctacatcaacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcac 20220485  T
Q  345 gataatcacttat-tctcataatcaattatgcatagaa 381  Q
     |||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  20220484 aataatcacttatctcaaataagcacttatgcatagaa 20220447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13662214 - 13662182
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13662214 atgattatgataataactaacccccttacctta 13662182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13720877 - 13720845
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13720877 atgattatgataataactaacccccttacctta 13720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16873000 - 16872968
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16873000 atgattatgataataactaacccccttacctta 16872968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261610
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||  ||||  |    
T  18261762 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 18261663  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||||| | ||| | |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  18261662 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 18261610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22742833
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| | | || | ||| | |||||||||| |||| |||| |||  ||||  |    
T  22742717 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcc 22742816  T
Q  137 taaacaacaacaacaac 153  Q
    | |||||||||||||||    
T  22742817 tcaacaacaacaacaac 22742833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373392
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 2031783 - 2032165
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2031783 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 2031882  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031883 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 2031982  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031983 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 2032082  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2032083 ttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttacctta 2032165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 435
Target Start/End: Original strand, 11342675 - 11343039
Alignment:
Q  73 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaa-caacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11342675 catttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 11342774  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342775 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaa 11342874  T
Q  271 ttcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342875 ttcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaat 11342974  T
Q  371 tatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342975 tatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 11343039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 55 - 423
Target Start/End: Original strand, 21204898 - 21205268
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||  | || ||| ||||||||||||||    
T  21204898 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaacaacaacaacaa 21204997  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21204998 atattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 21205097  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205098 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 21205197  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaa 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21205198 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa 21205268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 21650668 - 21651050
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  21650668 aaaccaacaacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatc 21650767  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650768 tattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 21650867  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650868 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 21650967  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21650968 ttattcccataatcaactatgcacagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttacctta 21651050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105999
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | ||| |||    
T  16105573 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaag 16105672  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  16105673 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 16105771  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctc 308  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16105772 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatcaa-ttaacatatccaaacatatctc 16105870  T
Q  309 taccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatga 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  16105871 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatga 16105970  T
Q  408 ttatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16105971 ttatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584188
Alignment:
Q  13 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaa-cccaagc 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaaacccaagc 11584081  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat---gcataattcaccaatt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||    
T  11584082 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaatt 11584181  T
Q  209 gagcata 215  Q
    |||||||    
T  11584182 gagcata 11584188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168317
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  1168500 tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac 1168401  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1168400 atgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcata 1168317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 28261501 - 28261655
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28261501 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 28261600  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28261601 cataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 28261655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Original strand, 21397078 - 21397253
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa---caacaaccattgatcatgaa 166  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  21397078 ctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatcatgaa 21397177  T
Q  167 acatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  21397178 acttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 21397253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22662805 - 22662653
Alignment:
Q  206 attgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatat 305  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22662805 attgaacataattctcaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatat 22662706  T
Q  306 ctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 358  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662705 cactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 432
Target Start/End: Original strand, 25004929 - 25005165
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| | | |||||||||     
T  25004929 cataaatcaccaattgagcataattctcaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaattatccttaaattaacac 25005028  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | | || |||| |||| |||||  |||||      
T  25005029 actcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcatacaacaattgaaaa-- 25005126  T
Q  394 aattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttac 432  Q
    | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25005127 actaaactaaatgattatgatgaagactaacccccttac 25005165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 24475563 - 24475738
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  24475563 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca---attgat 24475659  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  24475660 catgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcataca 24475738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 20712036 - 20712210
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||    
T  20712036 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaa 20712135  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20712136 caacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 20712210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21647006 - 21646826
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21647006 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaa-catcatgactaaacaacaacagcaacaattga 21646908  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  21646907 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacat-attttcatacatacccattttcataca 21646826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11337452 - 11337299
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  11337452 caacaacatctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattgatc 11337353  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||    
T  11337352 atgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcata 11337299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 4865242 - 4865397
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaa-ttatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| | |||||| |||||    
T  4865242 caacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaacaaccataacaacaattga 4865341  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4865342 tcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcata 4865397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 215
Target Start/End: Original strand, 21906729 - 21906851
Alignment:
Q  90 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21906729 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacatca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 21906825  T
Q  190 catgcataattcaccaattgagcata 215  Q
       |||||||||| ||||||| ||||    
T  21906826 atagcataattcatcaattgaacata 21906851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 108874
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  109158 acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 109059  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  109058 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatt 108960  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
     ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  | ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  108959 aagcataatttcacaacaatccattttcatacattatgaacatgttaattcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 108874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24183370 - 24183245
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||  | |||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24183370 aatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaac---atgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaac 24183274  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24183273 aacaaagcataattcaccaattgagcata 24183245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405672
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| ||| || |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | ||  ||    
T  19405503 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa 19405602  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||| || |||||||||||    
T  19405603 caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcata 19405672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584449
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatga 11584449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Original strand, 23466447 - 23466557
Alignment:
Q  72 tcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  23466447 tcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatc-aacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 23466545  T
Q  170 tatcacaattca 181  Q
    ||||||||||||    
T  23466546 tatcacaattca 23466557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728547
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||  | || |||     
T  7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt 7728477  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  7728478 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3673989
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| || ||| || ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  |  |    
T  3673818 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgc 3673917  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    | | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  3673918 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 3673989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Original strand, 7529014 - 7529164
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  7529014 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 7529113  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  7529114 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcat 7529164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 23493875 - 23494040
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  23493875 atcaactcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 23493974  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  23493975 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 23494040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617124
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||  |||| |||     
T  21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcactt 21617073  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  21617074 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 21617124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Original strand, 17909622 - 17909719
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17909622 aattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 17909719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9730524 - 9730424
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  9730524 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 9730425  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  9730424 a 9730424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 19862183 - 19862347
Alignment:
Q  56 aaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 154  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |     
T  19862183 aaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatca 19862282  T
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    ||||  |||||  | |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862283 attgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 19862347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
Q  13 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 24225596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Original strand, 16595474 - 16595550
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16595474 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatca 16595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966352
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatca 32966352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456732
Alignment:
Q  39 atcaacccattt-tacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  |    
T  6456580 atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctc 6456679  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||||| | ||| | |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  6456680 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 6456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450952
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||| | |||   | |||||||| |||| ||||||||  | || ||    
T  5451134 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcac 5451035  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    | | ||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5451034 ttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt 5450952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11763694 - 11763544
Alignment:
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttca 237  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |  ||||||| ||| |||||||   ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||  |    
T  11763694 aacaacaacaacaacaattaaacatgaatcccatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttata 11763595  T
Q  238 tacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
     || |||||||| || |||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||    
T  11763594 cacctcatgaacatgaaatttcatcaacatcaactcaattatcatcaaatt 11763544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 7425631 - 7425663
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7425631 atgattatgataataactaacccccttacctta 7425663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22054021 - 22053957
Alignment:
Q  155 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22054021 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 22053957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507302
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35791047 - 35791015
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35791047 atgattatgataataactaacccccttacctta 35791015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 30056 - 30493
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30056 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca 30155  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgca---taattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30156 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatacaatttcaaacaacaattgagcataatttacaaactacccattttcatacat 30255  T
Q  243 catgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30256 catgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttc 30355  T
Q  343 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30356 atgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaataattaactaaatgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatc 30455  T
Q  443 tccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30456 accaattattaactcaagcttcacttttgcttctatga 30493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 308
Alignment:
Q  52 acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 150  Q
    ||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||| | |||||||    
T  736 acaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaac 637  T
Q  151 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaact 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  636 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactattcattttcatacatcatgaact 537  T
Q  251 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataat 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  536 tgcaatttcatcatctacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataat 437  T
Q  351 cacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaacta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  436 cacttattctcataatcaattatgcatagaacaagag-aaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaacta 338  T
Q  451 ttagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  337 ttagctcaagcttcacttttgctcctatga 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12802 - 12418
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12802 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac 12703  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 12603  T
Q  254 aatttcatcatcaacaatt--catttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatc 351  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12602 aatttcatcatcaacaattcacattaatcatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataata 12503  T
Q  352 acttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12502 acttattcccataatcaattatgcatagaacaaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19183 - 19049
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19183 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac 19084  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19083 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 878
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| |||||||||||||     
T  1261 aaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacat 1162  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1161 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 1062  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 962  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  961 cttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 55553 - 55936
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  55553 aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 55652  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55653 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttg 55752  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55753 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 55852  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55853 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 333 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 108075
Alignment:
Q  333 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccctta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  432 cctta 436  Q
    |||||    
T  108079 cctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93973
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 127  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||  ||||||||||||||||    
T  94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaa 93973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 104555 - 104477
Alignment:
Q  399 actaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  104555 actaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaattagcacaaattcttagcccaagcttcactttagctccta 104477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17686 - 17304
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  17686 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 17587  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17586 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 17487  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17486 aatttcatcatcaacaattcatttaaaatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaa 17387  T
Q  354 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17386 ttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13285
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  13669 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 13570  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 13470  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13469 caatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 13370  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13369 cttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21636 - 21432
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | |||||    
T  21636 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 21537  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 21437  T
Q  260 atcat 264  Q
    |||||    
T  21436 atcat 21432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 57 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6823 - 6443
Alignment:
Q  57 accagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca 155  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||| | | |    
T  6823 accaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatcta 6724  T
Q  156 ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 255  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6723 ttgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 6624  T
Q  256 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcactt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6623 tttcatcatcaacaattcatttgacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacct 6524  T
Q  356 attctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6523 attatcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 193770 - 193396
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  193770 aaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 193671  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193670 ctattgatcatgaaacatatcacaata-atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 193572  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  193571 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctct---------gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatca 193481  T
Q  353 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  193480 cttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 62 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 186801 - 186560
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 159  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||    
T  186801 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 186702  T
Q  160 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 259  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186701 tcatgaaacatatcacaata-atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 186603  T
Q  260 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaaca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  186602 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaaca 186560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 9882
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  10248 aaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 10149  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10148 cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt-----------------tacccattttcatacatcatgaacttgc 10066  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065 aatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcac 9966  T
Q  354 ttattctcataatcaa-ttatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9965 ttattttcataatcaatttatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 55 - 368
Target Start/End: Original strand, 14921 - 15236
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  14921 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 15020  T
Q  153 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15021 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaaataaacattttcatacatcatgaacttg 15120  T
Q  253 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15121 caatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatca 15220  T
Q  353 cttattctcataatca 368  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15221 cttattcccataatca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 882
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 190 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4593 - 4346
Alignment:
Q  190 catgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4593 catgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatta 4494  T
Q  290 acatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagaga 388  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4493 acatatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaatgaagaga 4394  T
Q  389 aaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4393 aaaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 57 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 5
Alignment:
Q  57 accagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca 155  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||   |    
T  308 accaacaacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattta 209  T
Q  156 ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 255  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208 ttgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 109  T
Q  256 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcactt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcactt 9  T
Q  356 attc 359  Q
    ||||    
T  8 attc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130911
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  130486 acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 130585  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 208  Q
    |||| | | || |||||  | ||  || ||||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  130586 ccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 130684  T
Q  209 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctc 308  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  130685 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatcaa-ttaacgtatccaaacatatctc 130783  T
Q  309 taccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaactaaatga 407  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  130784 tacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaatcaaatga 130883  T
Q  408 ttatgataaaaactaacccccttacctt 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  130884 ttatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89578
Alignment:
Q  142 aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  89655 aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcacaattt 89578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79682
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| | |||||     
T  79519 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 79618  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcataatttacaa 223  Q
    ||||   || |||| |||||| |||||||    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  79619 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataattcacaa 79682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 301 - 480
Target Start/End: Original strand, 42574 - 42750
Alignment:
Q  301 catatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42574 catatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaac 42673  T
Q  401 taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674 taaatgattatgataaaaactaacccccttacct---ttatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 42750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 75 - 278
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 174  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  175 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 274  T
Q  212 cata 215  Q
    ||||    
T  275 cata 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9789 - 9565
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |  | ||| ||||||||||||| |    
T  9789 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatc 9690  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgc 253  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9689 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgc 9590  T
Q  254 aatttcatcatcaacaattcattta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9589 aatttcatcatcaacaattcattta 9565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3407
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3230 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 3329  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3330 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21646
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21442 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 21541  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21542 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 21641  T
Q  211 gcata 215  Q
    |||||    
T  21642 gcata 21646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31345
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31141 acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 31240  T
Q  111 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | |||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||    
T  31241 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattga 31340  T
Q  211 gcata 215  Q
    |||||    
T  31341 gcata 31345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25092
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24890 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgc-aacccaagc 24988  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24989 catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag 25088  T
Q  212 cata 215  Q
    ||||    
T  25089 cata 25092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Original strand, 25212 - 25345
Alignment:
Q  81 aacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  25212 aacaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattc 25310  T
Q  181 atcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  25311 aacaacaacaaaacataattcaccaattgagcata 25345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 294
Target Start/End: Original strand, 94948 - 95192
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  | || ||| | ||||||||||| |    
T  94948 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatc 95047  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttac----aaactacccattttcatacatcatgaac 249  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||    
T  95048 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataatttacaaataaactatctattttcatacatcatgaac 95147  T
Q  250 ttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  95148 ttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacata 95192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25002 - 24841
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  25002 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatc 24903  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  24902 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 24841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 227
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 331  T
Q  112 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 211  Q
     |||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||| ||    
T  330 tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaag 231  T
Q  212 cata 215  Q
    ||||    
T  230 cata 227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  6679 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6260
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatga 6260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6521
Alignment:
Q  145 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||| ||||||    
T  6591 aacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcata 6521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44279 - 44009
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44279 atcacaattcaacaacaac-atgtcataattcgtcaattgagcataactcacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaca 44181  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa 369  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||     
T  44180 attcaattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcac 44081  T
Q  370 ttatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatga-taaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
    |||||||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||    
T  44080 ttatgcatagcaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgattgaaatctaaccccgttacctcaatta 44009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1371
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1643 cataattcatcaattgagcataattctcaaactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacat 1544  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||   ||| || |||| |||| |||||  ||||       
T  1543 actcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaa--- 1447  T
Q  394 aattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 469  Q
    | |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||| |||||||||||    
T  1446 actacactaaatgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 477
Target Start/End: Original strand, 219 - 499
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  219 cataattcaacaattgagcataattcacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacat 318  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaag 393  Q
    | | ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||| || |||| |||| |||||  ||||       
T  319 actcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaa--- 415  T
Q  394 aattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    | |  ||||||||||||  || ||  ||||||||||||||| | ||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  416 actacactaaatgattacaatgaattctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 32183 - 32363
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32183 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 32282  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32283 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcat-attttcaaacatacccattttcataca 32363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42120 - 41940
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42120 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 42021  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42020 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatatttt-caaacatacccattttcataca 41940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 132507 - 132363
Alignment:
Q  72 tcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  132507 tcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaactt 132408  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  132407 atcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcata 132363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 11660 - 11821
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  | ||| | ||||||||||| |    
T  11660 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc 11759  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcat 214  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  11760 aattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcat 11821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 88289 - 88409
Alignment:
Q  95 atcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgc 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  88289 atcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagc 88388  T
Q  195 ataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  88389 ataattcaccaattgatcata 88409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 70889 - 70735
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  70889 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaatgat 70790  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  70789 catgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcata 70735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 208
Target Start/End: Original strand, 60787 - 60933
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||    
T  60787 caacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc 60886  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  60887 atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 60933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 165107 - 165007
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  165107 cataattcatcaattaagcataatttcataagaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 165008  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  165007 a 165007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172242
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 177913 - 177945
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 6932
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca---tt 157  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |   ||    
T  7115 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaatt 7016  T
Q  158 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  7015 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcataca 6932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 935
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  1089 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaacaattgat 990  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  989 catgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcata 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5513 - 5359
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  5513 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgat 5414  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5413 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcata 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9140 - 8994
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  9140 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 9041  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  9040 tatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 8994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 22671 - 22825
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22671 caacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaattgat 22770  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22771 catgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcata 22825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128095
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 255081 - 254900
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  255081 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 254982  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  254981 catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 254900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 261687 - 261506
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  261687 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 261588  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  261587 catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 261506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11965 - 11821
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  11965 ctcatttctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactt 11866  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11865 atcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 11821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 14857 - 15034
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||| ||||||    
T  14857 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca---acaacaacaattgat 14953  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  14954 catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacaca-tacccattttcataca 15034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 152
Target Start/End: Original strand, 14197 - 14288
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 152  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14197 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaa 14288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 38287 - 38432
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  38287 ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaattgatcatgaaact 38386  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38387 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcata 38432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 85321 - 85466
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  85321 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 85420  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  85421 tatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcata 85466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 159275 - 159438
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||   | || ||| | ||||||||||| |    
T  159275 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatca---acatcacttagcaacaacaacatc 159371  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcataattt 219  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  159372 aattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataattt 159438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15584
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||| | |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||    
T  15761 acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaa 15662  T
Q  141 caacaacaacaacca---ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15661 caacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15323
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatga 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36836
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaa 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 843 - 689
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  843 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgat 744  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  743 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcata 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 109736 - 109582
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  109736 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 109637  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  109636 aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 118237 - 118076
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  118237 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 118138  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  118137 aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacata 118076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7703
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacat 170  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  7561 ctcatttctcaacaaccaac--gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaactt 7658  T
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7659 atcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcata 7703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 253102
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  253271 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa 253172  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  253171 acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcata 253102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247366
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10071
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| ||| || |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||    
T  9903 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa 10002  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10003 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata 10071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 785 - 631
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||| | ||||||    
T  785 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaattgat 686  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  685 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcata 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1451
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  1306 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 1405  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  1406 tatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11876 - 11740
Alignment:
Q  103 aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11876 aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaa---ttgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattca 11780  T
Q  203 ccaattgagcataatttacaaac-tacccattttcataca 241  Q
    | ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  11779 ctaattgagcatattttcaacacatacccattttcataca 11740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 8960 - 9121
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  8960 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 9059  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
     | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9060 aagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3981 - 3732
Alignment:
Q  196 taattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatat 295  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||     
T  3981 taattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatcatcatcaaattaacatac 3882  T
Q  296 tgaaac----atatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaa 391  Q
    | ||||    ||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  3881 tcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaa 3782  T
Q  392 agaattaactaaatgattatg-ataaaaactaacccccttaccttaatta 440  Q
      || ||||||| ||||||||  | ||| |||||||| |||||| |||||    
T  3781 gaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccctttacctcaatta 3732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 112809 - 112658
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||||||   ||||||    
T  112809 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcaacaac---atgacttaacaacaacaacataaattgat 112713  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  112712 catgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcata 112658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Original strand, 109556 - 109698
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||    
T  109556 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa 109655  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    ||||| | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  109656 caacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 109698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 103048
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||     
T  103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt 103112  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 202  Q
    |  ||||| |||| | ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  103111 agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 103048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 68089 - 67997
Alignment:
Q  197 aattcaccaatt-gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||    
T  68089 aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattttcacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaatt 67997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 146561 - 146735
Alignment:
Q  43 acccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaa 140  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||    
T  146561 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaa 146660  T
Q  141 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  146661 caacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcata 146735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 146906 - 146938
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Original strand, 12 - 155
Alignment:
Q  73 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacata 171  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  12 catttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta 111  T
Q  172 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  112 tcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcata 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Original strand, 3510 - 3589
Alignment:
Q  73 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 151  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  3510 catttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaaca 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28573
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| | |||||||    
T  28466 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag 28565  T
Q  111 ccatgaat 118  Q
    ||||||||    
T  28566 ccatgaat 28573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21685
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaacca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21637 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaacca 21685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Original strand, 5996 - 6133
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  5996 cataaatcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaatttaacat 6095  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaa 331  Q
    | | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  6096 actcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaa 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1515
Alignment:
Q  34 tcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 131  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  1332 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac 1431  T
Q  132 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||  | ||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    ||||||||| ||||||||||||    
T  1432 atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcata 1515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1776
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatga 1776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11834 - 11681
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 161  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||   |||||||    
T  11834 caacaacatctcatttctccacacaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatc 11735  T
Q  162 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  11734 atgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcata 11681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5075
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||||    
T  4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 5005  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata 215  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  5006 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcata 5075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 48154 - 48286
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48154 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 48252  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataattta 220  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48253 aacaaaacataattcaccaattgagcatatttta 48286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 61602 - 61734
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  61602 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 61700  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataattta 220  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  61701 aacaaaacataattcaccaattgagcatatttta 61734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 344
Target Start/End: Original strand, 17812 - 17962
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  17812 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 17911  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17912 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 17962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34008 - 33840
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||| | ||||||    
T  34008 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa 33910  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| ||||||    
T  33909 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata 33840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19806
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatga 19806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24110
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatga 24110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24372
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||||    
T  24471 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaac 24372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33800
Alignment:
Q  87 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33668 aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaac 33767  T
Q  187 aaccatgcataattcaccaattgagcataattt 219  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||||||||    
T  33768 aacatagcataattcaccaattaaacataattt 33800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 94 - 169
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctccaatga 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 4351 - 4445
Alignment:
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataattt-acaaactacccattttcataca 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  4351 caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttcacaca-tacccattttcataca 4445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 127
Target Start/End: Original strand, 4287 - 4353
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 127  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4287 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaa 4353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 3299 - 3454
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| | ||||| ||||| | ||||||    
T  3299 caactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgat 3398  T
Q  161 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatt-caccaattgagcata 215  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||   ||||||||  ||||||||||||||    
T  3399 catgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcata 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 480
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20568
Alignment:
Q  405 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatga 480  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatga 20568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31149
Alignment:
Q  48 ttttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 146  Q
    |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | ||  | || |||    
T  31010 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa 31109  T
Q  147 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 186  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31110 caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaac 31149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70748
Alignment:
Q  144 caacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcata 70748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 97487 - 97403
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| | || | |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  97487 tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatca 97403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2050
Alignment:
Q  71 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||   | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  1905 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatct 2004  T
Q  170 tatcacaattcatcaacaaccat-gcataattc-accaattgagcata 215  Q
    ||| |||| ||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2005 tataacaaatcaacaaca--catagcataattcaaccaattgagcata 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 344
Target Start/End: Original strand, 5338 - 5485
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatt 296  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  5338 aattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatact 5437  T
Q  297 gaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
     |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5438 caaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 5485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5722 - 5580
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5722 cataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 5623  T
Q  294 attgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagatt 336  Q
    | | |||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||    
T  5622 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagatt 5580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76967
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||| | |||||    
T  77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca 77030  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||| | ||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  77029 acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 61391 - 61218
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||    
T  61391 atcacaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaaca 61293  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 344  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||| | |  |||  ||||||||  | |||||||||||||||    
T  61292 attcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcat 61218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48935
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 153956 - 153924
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  153956 atgattatgataataactaacccccttacctta 153924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69565
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 69514  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  69515 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 69565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272362
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34554 - 34454
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  34554 cataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 34455  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  34454 a 34454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43975
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 43988  T
Q  139 aacaacaacaaca 151  Q
    | |||||||||||    
T  43987 agcaacaacaaca 43975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 270 - 436
Alignment:
Q  43 acccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaac 141  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||| |||| | || ||| | |    
T  270 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc 369  T
Q  142 aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 208  Q
    |||||||||| | ||||| |||||  | || ||||||||| ||| |||   |||||||||| |||||    
T  370 aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12990
Alignment:
Q  15 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaact 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2663
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| || | |||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  |||| |||     
T  2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt 2582  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt-gagcataatt 218  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||   |||||||||| || || ||||||||||    
T  2583 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt 2663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 125
Target Start/End: Original strand, 7814 - 7878
Alignment:
Q  62 caaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc 125  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7814 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatc 7878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17478 - 17355
Alignment:
Q  171 atcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaca 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   | | |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||    
T  17478 atcacaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaaca 17380  T
Q  270 attcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  17379 attcatttatcattcaattaacata 17355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 294
Target Start/End: Original strand, 11862 - 11958
Alignment:
Q  198 attcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  11862 attcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 11958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7175
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 145  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| ||| | || ||    
T  7307 attttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagca 7208  T
Q  146 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaat 178  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |||||||||    
T  7207 acaacatcaattgaacatgattcttatcacaat 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26340
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49989 - 49889
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  49989 cataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 49890  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  49889 a 49889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6708
Alignment:
Q  43 acccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaa 128  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaa 6708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35520
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 123  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35444 attttacaaaaccaccaac-acaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 35520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7165 - 7112
Alignment:
Q  241 atcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  7165 atcatgaacatgcaaattcatcatcaacaattcaattatcaacaagttaacata 7112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  420 ctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6357 - 6257
Alignment:
Q  194 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  6357 cataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 6258  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  6257 a 6257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12734
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttta 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12694 acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
Alignment:
Q  12 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2425
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 136  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||| || |||  ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  2607 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 2508  T
Q  137 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 218  Q
    | |  |||||||||| | ||||| |||||  | ||||| |||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2507 ttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12637
Alignment:
Q  197 aattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||  |||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||    
T  12734 aattcatcaattgagcataatttatcaattattcatttatatataacatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattatcaacaagttaacata 12637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22786 - 22715
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc 125  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  22786 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatc 22715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Original strand, 2853 - 2984
Alignment:
Q  251 tgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattgaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataat 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||   ||||||||||||||  |||  |||||  |||||    
T  2853 tgcaatttctacatcaacaattcagttatcatcagattcacataccgaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcacaataat 2952  T
Q  351 cacttat-tctcataatcaattatgcatagaa 381  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  2953 cacttatctcaaataagcacttatgcatagaa 2984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197392
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaac---cagcaaccacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatga 135  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| |||||||| |||||| || |||  ||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  |||| |    
T  197545 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca 197446  T
Q  136 ctaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 189  Q
    || | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  197445 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 197392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1422
Alignment:
Q  47 attttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaa 104  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1364 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaa 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4698
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |    
T  4536 aaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 4635  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
     |||||  |||||   |||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  4636 aattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 9150 - 9312
Alignment:
Q  55 aaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |    
T  9150 aaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 9249  T
Q  154 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagcata 215  Q
     |||||  |||||   |||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  9250 aattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 9312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6024 - 5990
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6024 aaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 57426 - 57392
Alignment:
Q  402 aaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57426 aaatgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31120
Alignment:
Q  40 tcaacccattttacaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 138  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| || | |||| ||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||   ||| |||     
T  30978 tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcactt 31077  T
Q  139 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattca 181  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||||||||||    
T  31078 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattca 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 920
Alignment:
Q  227 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 288  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  981 acccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaatt 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108080
Alignment:
Q  39 atcaacccatttt-acaaaaccagcaaccacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgact 137  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| ||| | |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||  ||||  ||    
T  107967 atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatct 108066  T
Q  138 aaacaacaacaaca 151  Q
     |||||||||||||    
T  108067 taacaacaacaaca 108080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1431
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1463 atgattatgataataactaacccccttacctta 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1492
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1524 atgattatgataataactaacccccttacctta 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9215
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 2700 - 2732
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2700 atgattatgataataactaacccccttacctta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1462
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  404 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 562 times since January 2019
Visitors: 4090