View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0651_low_1 (Length: 449)

Name: NF0651_low_1
Description: NF0651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0651_low_1
NF0651_low_1
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (80-429)||(30313578-30313927)
chr8 (80-429)||(22164625-22164974)
chr8 (73-429)||(19977965-19978321)
chr8 (80-429)||(22133475-22133824)
chr8 (80-429)||(16408479-16408828)
chr8 (73-429)||(15533378-15533734)
chr8 (73-429)||(22046372-22046727)
chr8 (73-429)||(32600142-32600498)
chr8 (73-429)||(21166964-21167320)
chr8 (73-429)||(21250940-21251295)
chr8 (73-429)||(21922162-21922518)
chr8 (73-429)||(21394292-21394648)
chr8 (73-429)||(21788785-21789141)
chr8 (73-429)||(23650039-23650395)
chr8 (73-429)||(17674450-17674806)
chr8 (73-429)||(19112688-19113044)
chr8 (73-429)||(20018177-20018533)
chr8 (120-429)||(22032030-22032339)
chr8 (73-429)||(22120601-22120957)
chr8 (73-429)||(19485297-19485653)
chr8 (73-429)||(22987199-22987555)
chr8 (188-429)||(15441179-15441420)
chr8 (86-414)||(20396565-20396893)
chr8 (154-429)||(23948887-23949162)
chr8 (73-282)||(22377880-22378089)
chr8 (73-282)||(22384055-22384264)
chr8 (86-392)||(21681910-21682216)
chr8 (121-393)||(20388133-20388405)
chr8 (136-429)||(1266237-1266530)
chr8 (137-414)||(6679124-6679401)
chr8 (86-429)||(21324849-21325193)
chr8 (137-414)||(804164-804441)
chr8 (136-411)||(20010390-20010665)
chr8 (93-411)||(22061880-22062198)
chr8 (86-411)||(20007866-20008191)
chr8 (86-411)||(23654943-23655268)
chr8 (92-429)||(31416920-31417257)
chr8 (155-429)||(16265127-16265401)
chr8 (137-414)||(14565155-14565432)
chr8 (136-429)||(19851409-19851702)
chr8 (136-429)||(19857445-19857738)
chr8 (137-414)||(6603671-6603948)
chr8 (86-411)||(21840433-21840758)
chr8 (137-414)||(29303917-29304194)
chr8 (137-429)||(12304756-12305048)
chr8 (86-393)||(31571282-31571589)
chr8 (152-414)||(28982370-28982632)
chr8 (152-414)||(28987590-28987852)
chr8 (104-270)||(21196960-21197126)
chr8 (217-414)||(27347239-27347436)
chr8 (93-270)||(20652780-20652957)
chr8 (90-189)||(23949158-23949257)
chr8 (107-270)||(16877556-16877719)
chr8 (107-270)||(22982593-22982756)
chr8 (107-254)||(22315364-22315511)
chr8 (73-151)||(18856853-18856931)
chr8 (136-272)||(22051018-22051154)
chr8 (107-270)||(21850798-21850961)
chr8 (73-124)||(22040162-22040213)
chr8 (80-261)||(19863223-19863404)
chr8 (80-261)||(19867860-19868041)
chr8 (101-251)||(25282307-25282457)
chr8 (107-168)||(22283255-22283316)
chr8 (397-429)||(22179309-22179341)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (73-429)||(23573606-23573962)
chr5 (78-429)||(23440089-23440440)
chr5 (80-429)||(18775641-18775990)
chr5 (73-429)||(23516405-23516761)
chr5 (73-429)||(21984471-21984827)
chr5 (81-429)||(25423053-25423401)
chr5 (81-394)||(20798659-20798972)
chr5 (73-429)||(22333053-22333409)
chr5 (73-429)||(22134532-22134888)
chr5 (73-429)||(14999905-15000261)
chr5 (73-429)||(27518271-27518627)
chr5 (73-429)||(40708644-40709000)
chr5 (73-429)||(41770706-41771062)
chr5 (73-425)||(26738871-26739223)
chr5 (73-429)||(27668656-27669012)
chr5 (73-429)||(34566358-34566714)
chr5 (73-429)||(16356366-16356722)
chr5 (73-429)||(19769824-19770180)
chr5 (73-429)||(27610218-27610574)
chr5 (73-429)||(27685566-27685922)
chr5 (73-429)||(37291662-37292018)
chr5 (83-429)||(23471093-23471439)
chr5 (73-429)||(29476239-29476595)
chr5 (73-404)||(22348314-22348643)
chr5 (86-429)||(20468275-20468618)
chr5 (215-429)||(21343666-21343880)
chr5 (80-348)||(21498209-21498477)
chr5 (188-429)||(20573385-20573626)
chr5 (121-392)||(21564180-21564451)
chr5 (95-411)||(22461816-22462132)
chr5 (86-411)||(21890938-21891263)
chr5 (86-402)||(23442472-23442788)
chr5 (121-411)||(28923982-28924272)
chr5 (137-414)||(14887221-14887498)
chr5 (86-411)||(24735790-24736115)
chr5 (86-411)||(24749733-24750058)
chr5 (137-414)||(25847936-25848213)
chr5 (136-411)||(24737014-24737289)
chr5 (93-411)||(20773624-20773942)
chr5 (78-429)||(21404700-21405035)
chr5 (86-432)||(22236099-22236445)
chr5 (121-411)||(28895156-28895446)
chr5 (137-414)||(37545726-37546004)
chr5 (137-414)||(20342143-20342420)
chr5 (137-414)||(24798627-24798904)
chr5 (141-429)||(22502525-22502813)
chr5 (137-429)||(22381045-22381337)
chr5 (93-429)||(23080275-23080611)
chr5 (93-429)||(20821299-20821635)
chr5 (167-414)||(21662300-21662546)
chr5 (167-393)||(21665761-21665986)
chr5 (73-217)||(21339452-21339596)
chr5 (86-393)||(17269512-17269819)
chr5 (93-270)||(11210880-11211057)
chr5 (107-270)||(27011089-27011252)
chr5 (107-270)||(21937388-21937551)
chr5 (93-254)||(23503464-23503625)
chr5 (107-270)||(24581216-24581379)
chr5 (153-250)||(25244598-25244695)
chr5 (153-250)||(25308750-25308847)
chr5 (341-414)||(21625397-21625470)
chr5 (181-254)||(24516580-24516653)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (73-429)||(12497799-12498155)
chr3 (73-429)||(17489401-17489757)
chr3 (80-429)||(14876729-14877078)
chr3 (73-429)||(16492404-16492760)
chr3 (80-429)||(16691711-16692060)
chr3 (73-429)||(16370964-16371320)
chr3 (73-429)||(9522270-9522626)
chr3 (73-429)||(16807149-16807505)
chr3 (73-429)||(10005151-10005507)
chr3 (73-429)||(10905761-10906117)
chr3 (73-429)||(13252241-13252597)
chr3 (73-429)||(15589615-15589971)
chr3 (73-429)||(15725157-15725512)
chr3 (73-429)||(20062277-20062633)
chr3 (79-429)||(48424998-48425348)
chr3 (81-429)||(15348476-15348824)
chr3 (73-429)||(16635324-16635680)
chr3 (73-429)||(43162648-43163004)
chr3 (73-429)||(5425153-5425508)
chr3 (73-411)||(53385241-53385579)
chr3 (73-429)||(15208442-15208798)
chr3 (73-429)||(15402733-15403089)
chr3 (73-422)||(26792622-26792971)
chr3 (73-429)||(6600298-6600654)
chr3 (73-429)||(15338820-15339176)
chr3 (73-429)||(16412505-16412861)
chr3 (73-429)||(16756808-16757164)
chr3 (73-402)||(15247725-15248054)
chr3 (121-411)||(15227228-15227518)
chr3 (136-402)||(13972395-13972661)
chr3 (86-429)||(13322877-13323220)
chr3 (86-429)||(18134571-18134914)
chr3 (137-414)||(47123520-47123797)
chr3 (137-416)||(10383543-10383822)
chr3 (86-429)||(14571409-14571752)
chr3 (86-393)||(15953193-15953500)
chr3 (101-411)||(10420285-10420595)
chr3 (140-414)||(16329938-16330212)
chr3 (136-402)||(14086261-14086527)
chr3 (128-363)||(12850546-12850781)
chr3 (94-411)||(12360775-12361092)
chr3 (73-290)||(15015967-15016184)
chr3 (86-393)||(8759307-8759614)
chr3 (86-393)||(13941621-13941928)
chr3 (86-393)||(41177119-41177426)
chr3 (139-429)||(11961312-11961602)
chr3 (87-429)||(11303999-11304341)
chr3 (121-393)||(16381190-16381459)
chr3 (93-270)||(15576470-15576647)
chr3 (140-316)||(16836789-16836965)
chr3 (107-270)||(8274656-8274819)
chr3 (93-270)||(16742946-16743123)
chr3 (86-411)||(44776826-44777151)
chr3 (93-254)||(18748401-18748562)
chr3 (285-411)||(31945051-31945177)
chr3 (107-219)||(17192865-17192977)
chr3 (287-411)||(31689049-31689173)
chr3 (107-270)||(13975302-13975465)
chr3 (152-270)||(6153141-6153259)
chr3 (152-254)||(21686681-21686783)
chr3 (376-432)||(320781-320836)
chr3 (107-219)||(6712666-6712778)
chr3 (83-120)||(14183145-14183182)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (73-429)||(65369-65724)
scaffold0042 (221-429)||(39924-40132)
scaffold0042 (73-173)||(39806-39906)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (73-429)||(33560-33916)
scaffold0109 (73-429)||(8559-8915)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (73-429)||(17045071-17045427)
chr1 (73-429)||(19106314-19106670)
chr1 (73-429)||(20249797-20250153)
chr1 (73-429)||(16078708-16079045)
chr1 (73-429)||(20136725-20137081)
chr1 (73-411)||(16350655-16350993)
chr1 (73-429)||(21747482-21747837)
chr1 (73-429)||(33391085-33391441)
chr1 (73-429)||(51333549-51333905)
chr1 (80-429)||(50620307-50620656)
chr1 (73-429)||(21830250-21830606)
chr1 (73-429)||(21836897-21837253)
chr1 (73-429)||(41354525-41354881)
chr1 (86-429)||(19760935-19761278)
chr1 (73-405)||(16369268-16369600)
chr1 (209-429)||(50612608-50612828)
chr1 (86-411)||(19664945-19665270)
chr1 (95-429)||(20856839-20857173)
chr1 (137-393)||(20940183-20940439)
chr1 (275-429)||(21163227-21163381)
chr1 (137-414)||(37677041-37677319)
chr1 (86-429)||(19854261-19854604)
chr1 (137-429)||(31550301-31550593)
chr1 (137-429)||(20294359-20294651)
chr1 (93-411)||(22433192-22433510)
chr1 (137-414)||(20075179-20075456)
chr1 (137-300)||(11382670-11382833)
chr1 (139-393)||(20244183-20244437)
chr1 (86-363)||(20835957-20836237)
chr1 (86-310)||(41307891-41308115)
chr1 (107-270)||(20831482-20831645)
chr1 (218-414)||(20395194-20395390)
chr1 (93-270)||(20914316-20914493)
chr1 (107-270)||(46518827-46518990)
chr1 (101-254)||(21202371-21202524)
chr1 (104-215)||(22135645-22135756)
chr1 (335-414)||(24476942-24477021)
chr1 (208-270)||(22142232-22142294)
chr1 (102-213)||(20184345-20184456)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (73-429)||(14323-14679)
scaffold0044 (73-429)||(583-939)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (73-429)||(16252169-16252525)
chr4 (73-429)||(16355169-16355525)
chr4 (73-429)||(14680499-14680855)
chr4 (80-429)||(18227177-18227526)
chr4 (73-429)||(12523608-12523964)
chr4 (73-429)||(7090365-7090720)
chr4 (83-396)||(15149740-15150053)
chr4 (73-429)||(8386344-8386700)
chr4 (73-429)||(18297137-18297493)
chr4 (73-429)||(19778517-19778873)
chr4 (86-429)||(14652240-14652583)
chr4 (73-429)||(14303702-14304057)
chr4 (73-429)||(27711268-27711624)
chr4 (73-429)||(12476532-12476888)
chr4 (73-429)||(29039128-29039484)
chr4 (80-429)||(14159424-14159773)
chr4 (80-429)||(40472972-40473321)
chr4 (73-429)||(23955679-23956035)
chr4 (73-429)||(14851090-14851446)
chr4 (73-429)||(8053347-8053703)
chr4 (73-429)||(14266623-14266979)
chr4 (164-429)||(15364318-15364583)
chr4 (86-411)||(15003361-15003686)
chr4 (241-429)||(14927151-14927339)
chr4 (137-414)||(3264842-3265119)
chr4 (73-224)||(16676427-16676578)
chr4 (137-414)||(11207279-11207556)
chr4 (86-411)||(16145862-16146187)
chr4 (137-414)||(29453585-29453862)
chr4 (86-429)||(15070345-15070688)
chr4 (137-429)||(44661914-44662206)
chr4 (136-429)||(1649324-1649617)
chr4 (86-411)||(15245874-15246199)
chr4 (137-414)||(20890930-20891206)
chr4 (137-414)||(33222865-33223142)
chr4 (80-217)||(1640156-1640293)
chr4 (122-261)||(15415059-15415198)
chr4 (86-393)||(51606178-51606485)
chr4 (342-429)||(18607823-18607910)
chr4 (86-312)||(15359087-15359313)
chr4 (107-270)||(13247736-13247899)
chr4 (93-288)||(27900459-27900654)
chr4 (93-254)||(12132413-12132574)
chr4 (107-270)||(14997407-14997570)
chr4 (182-393)||(42702871-42703082)
chr4 (136-289)||(16752665-16752818)
chr4 (107-270)||(9290926-9291089)
chr4 (107-270)||(16445230-16445393)
chr4 (232-374)||(18164332-18164474)
chr4 (107-268)||(55375376-55375537)
chr4 (107-270)||(15293175-15293338)
chr4 (84-294)||(9849473-9849683)
chr4 (78-261)||(18550049-18550234)
chr4 (83-211)||(8706068-8706196)
chr4 (319-411)||(15415209-15415301)
chr4 (107-254)||(12342881-12343028)
chr4 (359-429)||(15359327-15359397)
chr4 (86-171)||(15077825-15077910)
chr4 (302-411)||(15319533-15319642)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (79-427)||(278823-279171)
scaffold0005 (86-429)||(164709-165052)
scaffold0005 (73-429)||(308622-308978)
scaffold0005 (86-411)||(260289-260614)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (73-429)||(24675052-24675408)
chr2 (73-429)||(23188571-23188927)
chr2 (73-429)||(22756987-22757343)
chr2 (73-429)||(24708006-24708362)
chr2 (73-429)||(21325790-21326146)
chr2 (73-429)||(16924823-16925179)
chr2 (73-429)||(16998563-16998919)
chr2 (78-429)||(22325385-22325736)
chr2 (73-429)||(10868413-10868769)
chr2 (73-429)||(16981715-16982071)
chr2 (73-429)||(17063280-17063636)
chr2 (73-429)||(27217579-27217935)
chr2 (73-429)||(44386093-44386449)
chr2 (81-423)||(21145562-21145904)
chr2 (73-429)||(9609699-9610055)
chr2 (73-406)||(23063663-23063996)
chr2 (73-429)||(24709596-24709952)
chr2 (73-429)||(24261933-24262289)
chr2 (73-429)||(24878519-24878875)
chr2 (73-429)||(27370832-27371188)
chr2 (118-429)||(23138600-23138911)
chr2 (118-429)||(23550390-23550701)
chr2 (179-429)||(27377101-27377351)
chr2 (73-429)||(17066941-17067294)
chr2 (78-330)||(24825811-24826063)
chr2 (121-429)||(23087013-23087321)
chr2 (87-429)||(30211455-30211797)
chr2 (137-414)||(31830236-31830513)
chr2 (137-429)||(11358462-11358754)
chr2 (86-429)||(23293521-23293864)
chr2 (136-402)||(27365666-27365932)
chr2 (83-394)||(45529115-45529420)
chr2 (141-414)||(20832563-20832836)
chr2 (137-414)||(1063329-1063606)
chr2 (86-411)||(23276357-23276682)
chr2 (252-429)||(41609047-41609224)
chr2 (152-429)||(24653908-24654185)
chr2 (86-393)||(27787340-27787647)
chr2 (107-270)||(22276001-22276164)
chr2 (203-393)||(24944966-24945156)
chr2 (86-393)||(12573952-12574259)
chr2 (107-270)||(12640477-12640640)
chr2 (107-270)||(24831745-24831908)
chr2 (93-252)||(25128387-25128546)
chr2 (93-254)||(24570212-24570373)
chr2 (332-429)||(24833356-24833453)
chr2 (108-169)||(27368391-27368452)
chr2 (107-254)||(22762127-22762274)
chr2 (93-215)||(23817597-23817719)
chr2 (386-429)||(23599834-23599877)
chr2 (174-254)||(23817718-23817798)
chr2 (385-429)||(45676685-45676729)
chr2 (203-254)||(28144701-28144752)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (80-427)||(12497824-12498171)
chr6 (80-427)||(12510730-12511077)
chr6 (73-429)||(25765419-25765774)
chr6 (80-427)||(12505153-12505500)
chr6 (73-429)||(19864483-19864839)
chr6 (73-429)||(16963496-16963852)
chr6 (73-429)||(25609990-25610346)
chr6 (73-423)||(1543213-1543563)
chr6 (79-429)||(22078823-22079173)
chr6 (80-429)||(27331569-27331918)
chr6 (80-429)||(27392309-27392658)
chr6 (73-429)||(24313297-24313653)
chr6 (73-429)||(28263326-28263682)
chr6 (73-429)||(28342075-28342431)
chr6 (73-429)||(29592049-29592405)
chr6 (73-429)||(5839348-5839704)
chr6 (73-429)||(16626846-16627202)
chr6 (73-429)||(16927769-16928125)
chr6 (73-429)||(18408072-18408428)
chr6 (136-429)||(21833173-21833466)
chr6 (73-429)||(2874932-2875288)
chr6 (73-429)||(25112348-25112704)
chr6 (73-429)||(27187232-27187588)
chr6 (73-429)||(27261652-27262008)
chr6 (73-429)||(23078265-23078621)
chr6 (73-429)||(22762584-22762940)
chr6 (73-429)||(28292501-28292857)
chr6 (206-429)||(17032358-17032581)
chr6 (73-403)||(18197676-18198006)
chr6 (136-429)||(21471397-21471690)
chr6 (136-411)||(25750623-25750898)
chr6 (93-429)||(15459132-15459468)
chr6 (136-402)||(14131371-14131637)
chr6 (136-393)||(25768023-25768280)
chr6 (292-429)||(22433793-22433930)
chr6 (137-429)||(10469042-10469334)
chr6 (86-392)||(22796774-22797080)
chr6 (137-429)||(24364208-24364500)
chr6 (136-429)||(19879094-19879387)
chr6 (93-411)||(8766297-8766615)
chr6 (136-411)||(18794504-18794779)
chr6 (136-402)||(21564324-21564590)
chr6 (136-429)||(34645778-34646071)
chr6 (86-346)||(17415365-17415625)
chr6 (136-429)||(11287790-11288083)
chr6 (136-429)||(11280697-11280990)
chr6 (119-219)||(11291818-11291918)
chr6 (86-393)||(27560759-27561066)
chr6 (73-167)||(22433927-22434021)
chr6 (121-282)||(1640715-1640876)
chr6 (86-327)||(14381609-14381850)
chr6 (147-271)||(25750900-25751024)
chr6 (86-309)||(18800858-18801081)
chr6 (107-270)||(16098005-16098168)
chr6 (86-393)||(28282955-28283262)
chr6 (107-270)||(16382536-16382699)
chr6 (93-270)||(25743236-25743413)
chr6 (104-252)||(25655456-25655604)
chr6 (107-254)||(18571622-18571769)
chr6 (93-270)||(18838057-18838234)
chr6 (107-254)||(1648947-1649094)
chr6 (93-270)||(15078513-15078690)
chr6 (107-254)||(21413101-21413248)
chr6 (107-270)||(23996203-23996366)
chr6 (93-267)||(16233167-16233341)
chr6 (304-411)||(18787702-18787809)
chr6 (314-429)||(1640595-1640710)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (83-429)||(17319-17665)
chr7 (73-429)||(11553095-11553451)
chr7 (73-429)||(12687422-12687778)
chr7 (80-429)||(15154652-15155001)
chr7 (73-429)||(14954541-14954897)
chr7 (73-429)||(8198549-8198905)
chr7 (73-429)||(10870916-10871272)
chr7 (73-429)||(14332318-14332674)
chr7 (73-429)||(11237206-11237562)
chr7 (73-429)||(8707526-8707882)
chr7 (73-429)||(15161050-15161406)
chr7 (73-429)||(18177663-18178019)
chr7 (73-429)||(18551751-18552107)
chr7 (73-429)||(44791344-44791700)
chr7 (79-429)||(23516768-23517118)
chr7 (73-429)||(13685984-13686341)
chr7 (78-429)||(14037728-14038079)
chr7 (78-429)||(14347758-14348109)
chr7 (84-429)||(15203800-15204145)
chr7 (86-363)||(15624539-15624816)
chr7 (86-429)||(12206784-12207127)
chr7 (87-411)||(15102586-15102910)
chr7 (86-429)||(19147133-19147476)
chr7 (86-429)||(20746532-20746875)
chr7 (136-411)||(14264278-14264553)
chr7 (137-411)||(8212163-8212437)
chr7 (137-414)||(11306298-11306575)
chr7 (137-414)||(49152238-49152515)
chr7 (86-411)||(11388412-11388736)
chr7 (78-429)||(21661885-21662233)
chr7 (86-393)||(16950455-16950762)
chr7 (136-411)||(16072328-16072603)
chr7 (78-246)||(35964848-35965016)
chr7 (86-429)||(13665475-13665813)
chr7 (86-393)||(6413469-6413776)
chr7 (86-393)||(14286360-14286667)
chr7 (73-171)||(9596236-9596334)
chr7 (93-429)||(12455625-12455960)
chr7 (86-393)||(18053937-18054244)
chr7 (137-429)||(13021279-13021571)
chr7 (136-411)||(14129813-14130088)
chr7 (136-411)||(14433631-14433906)
chr7 (107-254)||(14936443-14936590)
chr7 (122-393)||(23199763-23200034)
chr7 (122-393)||(23505890-23506161)
chr7 (93-270)||(4440008-4440185)
chr7 (83-212)||(11772244-11772373)
chr7 (136-393)||(26288071-26288327)
chr7 (86-393)||(1391-1698)
chr7 (107-254)||(15364036-15364183)
chr7 (137-309)||(26118640-26118812)
chr7 (107-270)||(12368603-12368766)
chr7 (107-270)||(7823980-7824143)
chr7 (107-270)||(27107801-27107964)
chr7 (368-429)||(12254326-12254387)
chr7 (78-261)||(41144-41327)
chr7 (109-270)||(21674562-21674723)
chr7 (278-393)||(15340454-15340569)
chr7 (93-254)||(45146652-45146812)
chr7 (93-270)||(17923760-17923938)
chr7 (95-252)||(12193654-12193811)
chr7 (287-429)||(15479323-15479465)
chr7 (335-429)||(26118817-26118911)
chr7 (93-252)||(13378796-13378955)
chr7 (85-171)||(5764672-5764758)
chr7 (110-250)||(17145288-17145428)
chr7 (137-190)||(12456940-12456993)
chr7 (205-254)||(13353247-13353296)
chr7 (397-429)||(13634038-13634070)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (73-429)||(4392-4748)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (73-429)||(64018-64374)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (73-429)||(639-995)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (73-429)||(5977-6333)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (73-429)||(6335-6691)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (73-429)||(681-1036)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (81-429)||(5986-6334)
scaffold0120 (86-393)||(1524-1831)
scaffold0120 (93-270)||(22816-22993)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (73-429)||(127186-127542)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (73-429)||(180180-180536)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (73-429)||(219404-219760)
scaffold0012 (73-429)||(229006-229362)
scaffold0012 (107-270)||(33016-33179)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (73-429)||(5184-5540)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (73-423)||(43123-43473)
scaffold0028 (80-410)||(8467-8797)
scaffold0028 (92-224)||(13834-13966)
scaffold0028 (136-402)||(50564-50830)
scaffold0028 (107-270)||(106594-106757)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (73-429)||(9306-9662)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (73-429)||(377-733)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (79-429)||(1102-1452)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (95-429)||(16950-17284)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (80-429)||(7340-7689)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (81-429)||(14002-14350)
scaffold0106 (102-411)||(31391-31700)
scaffold0106 (73-174)||(17660-17761)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (73-411)||(109798-110136)
scaffold0029 (136-429)||(112522-112815)
scaffold0029 (93-411)||(96009-96327)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (80-429)||(15456-15804)
scaffold0333 (80-215)||(15832-15967)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (73-429)||(810-1165)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (78-429)||(32744-33095)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (136-429)||(32-325)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (86-429)||(15079-15422)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (73-429)||(14840-15196)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (109-429)||(162076-162396)
scaffold0001 (78-429)||(448022-448373)
scaffold0001 (86-393)||(90932-91239)
scaffold0001 (93-270)||(78636-78813)
scaffold0001 (228-303)||(175352-175427)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (73-429)||(6900-7258)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (95-429)||(3995-4329)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (83-429)||(26530-26876)
scaffold0011 (86-411)||(195703-196027)
scaffold0011 (136-429)||(148533-148826)
scaffold0011 (228-411)||(68582-68765)
scaffold0011 (107-270)||(121971-122134)
scaffold0011 (107-169)||(180147-180209)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (86-429)||(111984-112327)
scaffold0004 (136-414)||(203518-203796)
scaffold0004 (86-393)||(322703-323010)
scaffold0004 (86-411)||(117549-117874)
scaffold0004 (93-414)||(385797-386118)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (136-429)||(27930-28223)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (73-328)||(7854-8109)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (95-429)||(3103-3437)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (78-429)||(252-603)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (83-393)||(1-311)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (83-429)||(16462-16808)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (95-429)||(968-1301)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (78-429)||(16408-16759)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (73-327)||(21932-22186)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (78-429)||(12969-13320)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (86-429)||(116905-117248)
scaffold0037 (107-270)||(98137-98300)
scaffold0037 (173-270)||(23553-23650)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (86-429)||(25719-26062)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (80-379)||(49506-49805)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (86-414)||(886-1214)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (207-429)||(16920-17142)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (83-429)||(5588-5933)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (83-429)||(25068-25414)
scaffold0234 (140-287)||(16225-16372)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (81-267)||(7522-7708)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (78-315)||(9047-9284)
scaffold0507 (317-429)||(6940-7052)
scaffold0507 (104-270)||(351-517)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (73-291)||(767-985)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (121-429)||(10774-11082)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (78-429)||(86496-86847)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (86-429)||(27482-27825)
scaffold0139 (86-411)||(1149-1473)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (86-402)||(26132-26448)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (137-393)||(28820-29076)
scaffold0064 (137-393)||(40811-41067)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (136-348)||(58456-58668)
scaffold0058 (137-392)||(19120-19375)
scaffold0058 (152-254)||(74038-74140)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (86-411)||(13901-14226)
scaffold0034 (93-357)||(4960-5224)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (93-429)||(10090-10426)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (86-393)||(47123-47430)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (128-393)||(5956-6220)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (86-393)||(3874-4181)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (86-429)||(61-404)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (86-393)||(2750-3057)
scaffold0035 (80-255)||(13189-13364)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (136-402)||(7086-7352)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (86-411)||(18537-18862)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (87-411)||(13362-13686)
scaffold0298 (140-402)||(19973-20235)
scaffold0298 (87-411)||(17132-17456)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (93-411)||(6164-6483)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (86-393)||(37201-37508)
scaffold0026 (92-312)||(38180-38400)
scaffold0026 (136-312)||(27387-27563)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (121-411)||(172-462)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (86-411)||(9779-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (86-411)||(14067-14391)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (86-411)||(42333-42658)
scaffold0010 (86-411)||(47399-47724)
scaffold0010 (212-290)||(2252-2330)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (86-382)||(4760-5056)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (86-402)||(21671-21987)
scaffold0235 (107-192)||(26006-26091)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (87-411)||(10869-11193)
scaffold0124 (87-402)||(400-715)
scaffold0124 (107-270)||(7831-7994)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (137-429)||(16764-17056)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (141-393)||(51918-52170)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (92-411)||(14257-14576)
scaffold0203 (248-411)||(9039-9202)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (228-378)||(4567-4717)
scaffold0023 (314-429)||(36974-37089)
scaffold0023 (73-193)||(4441-4561)
scaffold0023 (341-393)||(18993-19045)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (137-429)||(16639-16931)
scaffold0113 (140-429)||(25919-26208)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (136-411)||(18830-19105)
scaffold0090 (136-309)||(23094-23267)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (140-402)||(1223-1485)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (93-411)||(61220-61538)
scaffold0067 (93-393)||(67608-67908)
scaffold0067 (93-411)||(52186-52504)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (86-411)||(27207-27531)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (86-411)||(39720-40045)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (92-411)||(3872-4191)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (86-393)||(5002-5309)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (104-411)||(20103-20410)
scaffold0114 (93-411)||(43486-43804)
scaffold0114 (93-411)||(44498-44816)
scaffold0114 (228-411)||(36036-36219)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (141-428)||(38942-39229)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (184-402)||(1167-1385)
scaffold0165 (368-429)||(26203-26264)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (93-411)||(49214-49532)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (137-429)||(26224-26516)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (136-411)||(509-784)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (136-411)||(57867-58141)
scaffold0053 (86-411)||(49033-49358)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (136-402)||(33727-33993)
scaffold0076 (107-270)||(40380-40543)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (93-393)||(248612-248912)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (86-393)||(12781-13088)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (182-411)||(4235-4464)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (86-393)||(7238-7543)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (93-429)||(42746-43082)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (332-427)||(6238-6333)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (93-254)||(14661-14822)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (73-177)||(3706-3810)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (107-270)||(14758-14921)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (233-402)||(136109-136278)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (107-287)||(28287-28467)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (107-270)||(46276-46439)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (243-393)||(2023-2173)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (93-270)||(14779-14956)
scaffold0132 (93-192)||(43738-43837)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (138-270)||(1916-2048)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (213-393)||(13380-13560)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (107-270)||(3281-3444)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (136-294)||(5311-5469)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (93-254)||(1061-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (93-270)||(393-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (93-270)||(8217-8394)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (93-270)||(13030-13207)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (93-237)||(1241-1385)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (107-270)||(3896-4059)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (107-254)||(3965-4112)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (116-270)||(940-1094)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (93-254)||(8898-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (93-254)||(9125-9286)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (73-141)||(12738-12806)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (107-270)||(24002-24165)
scaffold0008 (107-254)||(231696-231843)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (107-268)||(23518-23679)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (86-261)||(1-176)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (93-318)||(10843-11068)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (368-429)||(7498-7559)
scaffold0101 (101-177)||(5467-5543)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (122-254)||(10493-10625)
scaffold0447 (122-254)||(5879-6011)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (86-174)||(3355-3443)
scaffold0222 (305-411)||(3487-3593)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (294-402)||(45835-45943)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (107-192)||(26178-26263)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (122-254)||(8488-8620)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (107-267)||(10781-10941)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (93-246)||(13397-13550)
scaffold0021 (93-169)||(71442-71518)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (93-192)||(1431-1530)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (107-169)||(18332-18394)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (324-411)||(9200-9287)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (335-411)||(886-962)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 30313578 - 30313927
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30313578 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 30313677  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313678 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 30313777  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313778 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 30313877  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30313878 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 30313927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 22164625 - 22164974
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22164625 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 22164724  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22164725 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttat 22164824  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22164825 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22164924  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22164925 cttcggaagtatgtcccggatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22164974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19978321 - 19977965
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978321 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19978222  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978221 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19978122  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  19978121 gatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 19978022  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978021 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 19977965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 22133475 - 22133824
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22133475 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaag 22133574  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133575 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 22133674  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22133675 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22133774  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22133775 cttcggaagtatgtcccgaatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 16408479 - 16408828
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16408479 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 16408578  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408579 atcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16408678  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408679 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 16408778  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16408779 cttcggaagtgtgtcccggatctatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15533734 - 15533378
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533734 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15533635  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533634 aggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 15533535  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15533534 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgt 15533435  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15533434 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15533378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22046727 - 22046372
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22046727 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgc 22046628  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046627 aggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccga 22046528  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22046527 ggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 22046428  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22046427 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat-caaagtgatgatgt 22046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32600498 - 32600142
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32600498 aggaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 32600399  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32600398 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 32600299  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  32600298 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 32600199  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32600198 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatctatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 32600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21166964 - 21167320
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166964 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21167063  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21167064 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 21167163  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  21167164 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 21167263  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21167264 gtcgcaacttcgaaaatatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21167320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21251295 - 21250940
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21251295 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattaaagagaga-tgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgt 21251197  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251196 aggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21251097  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21251096 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21250997  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250996 gtcgcaacttcggaagtatgtaccagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21250940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21922162 - 21922518
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21922162 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgt 21922261  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21922262 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccga 21922361  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  21922362 gatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgt 21922461  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21922462 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagcgatgatgt 21922518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21394292 - 21394648
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394292 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21394391  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21394392 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21394491  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||    
T  21394492 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21394591  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394592 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21394648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21788785 - 21789141
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21788785 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21788884  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21788885 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21788984  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||    
T  21788985 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21789084  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789085 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21789141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23650395 - 23650039
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23650395 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 23650296  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23650295 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 23650196  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||    
T  23650195 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgt 23650096  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23650095 gttgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagtgataatgt 23650039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 17674450 - 17674806
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674450 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17674549  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674550 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17674649  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  17674650 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17674749  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  17674750 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 17674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19113044 - 19112688
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113044 aggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19112945  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19112944 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19112845  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  19112844 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19112745  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  19112744 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 19112688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 20018177 - 20018533
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20018177 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgt 20018276  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20018277 agaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20018376  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  20018377 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20018476  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20018477 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 20018533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 120 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032030
Alignment:
Q  120 aagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagt 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  220 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcg 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  320 tatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaa 22032040  T
Q  420 gtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||    
T  22032039 gtgatgatgt 22032030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 22120601 - 22120957
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120601 aggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22120700  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||    
T  22120701 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcga 22120800  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  22120801 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgt 22120900  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22120901 gtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 19485297 - 19485653
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485297 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19485396  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  19485397 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 19485496  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19485497 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19485596  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  19485597 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19485653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22987555 - 22987199
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    ||||||| | |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987555 aggagcataaattgttcaacaaactattgagaaagataatatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22987456  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22987455 aggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctga 22987356  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  22987355 agtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgt 22987256  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22987255 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 22987199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441179
Alignment:
Q  188 tttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 287  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  288 atcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  388 gtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15441220 gtatgttttggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15441179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 414
Target Start/End: Original strand, 20396565 - 20396893
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20396565 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttg 20396664  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||     
T  20396665 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtct 20396764  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||  |||||||||    
T  20396765 gtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcgg 20396864  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20396865 aagtgtgtttcggatccatctcatgtgat 20396893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948887
Alignment:
Q  154 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaag 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  254 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatt 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  354 tgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||| ||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatgt 23948887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 282
Target Start/End: Original strand, 22377880 - 22378089
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377880 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22377979  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22377980 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22378079  T
Q  273 gatttattgg 282  Q
    ||||||||||    
T  22378080 gatttattgg 22378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 282
Target Start/End: Original strand, 22384055 - 22384264
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384055 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22384154  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22384155 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22384254  T
Q  273 gatttattgg 282  Q
    ||||||||||    
T  22384255 gatttattgg 22384264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 392
Target Start/End: Original strand, 21681910 - 21682216
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  21681910 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 21682009  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  21682010 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 21682109  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21682110 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21682209  T
Q  386 aagtatg 392  Q
    |||||||    
T  21682210 aagtatg 21682216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20388405 - 20388133
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20388405 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 20388306  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||| | |    
T  20388305 actctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacat 20388206  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    || ||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20388205 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgt 20388133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1266530 - 1266237
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||   |||| |||    
T  1266530 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccgatgacgggt 1266431  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || |    
T  1266430 gtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgc 1266331  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  1266330 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 1266237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6679401 - 6679124
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  6679401 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 6679302  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  6679301 ttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 6679202  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  6679201 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 6679124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 21324849 - 21325193
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  21324849 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttg 21324948  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  21324949 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 21325048  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatc-tttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcg 384  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21325049 gtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 21325148  T
Q  385 gaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21325149 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 21325193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 804164 - 804441
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  804164 tcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 804263  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  804264 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgcc 804363  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  804364 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 804441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 20010390 - 20010665
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| |||    
T  20010390 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgatgacgggt 20010489  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  20010490 gtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgc 20010589  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  20010590 caccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 20010665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 22061880 - 22062198
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   | | || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22061880 agactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttca 22061979  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  22061980 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaa 22062079  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22062080 atatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  22062180 tagcggatccttcgcatgt 22062198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20008191 - 20007866
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20008191 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 20008092  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |  || ||||||||    
T  20008091 agttccaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtcc 20007992  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20007991 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20007892  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  20007891 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 20007866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23655268 - 23654943
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  23655268 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 23655169  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  23655168 agtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 23655069  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||  |||  | |||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23655068 gtatcagatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23654969  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  23654968 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 23654943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 429
Target Start/End: Original strand, 31416920 - 31417257
Alignment:
Q  92 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaa--tgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||    
T  31416920 cagactactgagaaagtcaagatgat--aagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtt 31417017  T
Q  190 tcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtat 289  Q
    |||||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  31417018 tcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtat 31417117  T
Q  290 cagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 389  Q
     |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  31417118 tagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagt 31417217  T
Q  390 atgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31417218 atgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 31417257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 429
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265401
Alignment:
Q  155 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  255 caaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaattt 354  Q
    | | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  355 gcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatgt 16265401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14565432 - 14565155
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  14565432 tcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 14565333  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  14565332 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 14565233  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  14565232 accacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 14565155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19851702 - 19851409
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| | |    
T  19851702 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggtt 19851603  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || |    
T  19851602 gtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgc 19851503  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  19851502 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 19851409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19857738 - 19857445
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| | |    
T  19857738 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggtt 19857639  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || |    
T  19857638 gtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgc 19857539  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  19857538 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 19857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6603948 - 6603671
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  6603948 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 6603849  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  6603848 ttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgcc 6603749  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  6603748 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 6603671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21840758 - 21840433
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || || | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  21840758 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttg 21840659  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||| | | || ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21840658 agtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 21840559  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21840558 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcgg 21840459  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  21840458 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 21840433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 29303917 - 29304194
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||||   |||| ||||    
T  29303917 tcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtg 29304016  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |   | || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  29304017 taggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggcttatagagttggtttgcc 29304116  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  29304117 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatgtagaggatccttcacatgtgat 29304194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12305048 - 12304756
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||    
T  12305048 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtg 12304949  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  12304948 ttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagttggtttgcc 12304849  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  12304848 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatgt 12304756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 31571282 - 31571589
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  31571282 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 31571381  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  31571382 agtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggccc 31571481  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  31571482 gtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 31571581  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  31571582 aagtatgt 31571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982370
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  252 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaa 351  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  352 tttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
     |||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgat 28982370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987590
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  252 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaa 351  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  352 tttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
     |||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgat 28987590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 270
Target Start/End: Original strand, 21196960 - 21197126
Alignment:
Q  104 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | || | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| || |    
T  21196960 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatc 21197059  T
Q  204 atgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  21197060 atgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcc 21197126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347239
Alignment:
Q  217 agtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtg 316  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  317 gcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    || |||  ||| || ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 27347239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 20652780 - 20652957
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||||    
T  20652780 agactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttca 20652879  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20652880 agttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23949257 - 23949158
Alignment:
Q  90 agcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23949257 agcaaactactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 16877556 - 16877719
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| ||||    
T  16877556 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 16877655  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16877656 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22982756 - 22982593
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||  || || ||||    
T  22982756 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22982657  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  22982656 cgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcc 22982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22315511 - 22315364
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||||  || || ||||    
T  22315511 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 22315412  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||| | || ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22315411 tgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18856931 - 18856853
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18856931 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22051154 - 22051018
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || ||||| ||||||| ||| ||||   |||| |||    
T  22051154 gtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggt 22051055  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22051054 gtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccga 22051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 21850798 - 21850961
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  21850798 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21850897  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  21850898 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcc 21850961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22040213 - 22040162
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagag 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040213 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagag 22040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19863404 - 19863223
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||||||| ||||| |||||| |  || || ||| |||| ||||| |||||||||||  | || |||     
T  19863404 gagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaaagaaggaaat 19863305  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
       | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19863304 cattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19863223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19868041 - 19867860
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||||||| ||||| |||||| |  || || ||| |||| ||||| |||||||||||  | || |||     
T  19868041 gagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaaagaaggaaat 19867942  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
       | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19867941 cattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25282457 - 25282307
Alignment:
Q  101 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||| | |||| | || |||||||||||| ||||| | || || ||  | |||||||| |  || |    
T  25282457 gagaaggttaagatcattcaagagaagatgagagtgtctcggagtaggcagaagagttatcataataagaggaggaaggacatcgagtttcaagttggtg 25282358  T
Q  201 accatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  25282357 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaaccagtgttggacgtactttga 25282307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22283316 - 22283255
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataa 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |  | |||||||||||||||||    
T  22283316 gttaagatgattcaggagaaaatgagagtgtctcagagtaggtagaagagttatcatgataa 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 429
Target Start/End: Original strand, 22179309 - 22179341
Alignment:
Q  397 ggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22179309 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 22179341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23573962 - 23573606
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573962 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23573863  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573862 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23573763  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23573762 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23573663  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23573662 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23440440 - 23440089
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23440440 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaa 23440341  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23440340 agatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagattt 23440241  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  23440240 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgc 23440141  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23440140 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23440089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18775990 - 18775641
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18775990 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagg 18775891  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775890 atcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 18775791  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775790 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18775691  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18775690 cttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 18775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23516761 - 23516405
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516761 aggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23516662  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516661 agaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23516562  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23516561 gatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgt 23516462  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23516461 gtcgcaacttcggaagtatttcccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23516405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21984471 - 21984827
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21984471 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgt 21984570  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984571 aggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21984670  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  21984671 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 21984770  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984771 gtcgcaacttcagaggtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 81 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25423401 - 25423053
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25423401 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 25423302  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25423301 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttatt 25423202  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  25423201 ggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaac 25423102  T
Q  381 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423101 ttcggaactatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25423053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20798972 - 20798659
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20798972 agattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaaga 20798873  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798872 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 20798773  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20798772 ggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaac 20798673  T
Q  381 ttcggaagtatgtt 394  Q
    ||||||| ||||||    
T  20798672 ttcggaaatatgtt 20798659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 22333053 - 22333409
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333053 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22333152  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333153 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22333252  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22333253 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22333352  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22333353 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22333409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22134888 - 22134532
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22134888 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 22134789  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22134788 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22134689  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22134688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22134589  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22134588 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22134532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 14999905 - 15000261
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 15000004  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15000005 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15000104  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15000105 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15000204  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15000205 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15000261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27518627 - 27518271
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518627 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27518528  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518527 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27518428  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  27518427 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27518328  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27518327 gtcacaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27518271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40709000 - 40708644
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709000 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 40708901  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40708900 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 40708801  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40708800 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 40708701  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  40708700 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 40708644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41771062 - 41770706
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771062 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41770963  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41770962 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 41770863  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  41770862 agttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 41770763  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41770762 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 41770706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 425
Target Start/End: Original strand, 26738871 - 26739223
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738871 aggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26738970  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26738971 agaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 26739070  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  26739071 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgt 26739170  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  26739171 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatctaaagagatg 26739223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 27668656 - 27669012
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668656 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27668755  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27668756 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27668855  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  27668856 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgt 27668955  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  27668956 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27669012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34566714 - 34566358
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566714 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 34566615  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34566614 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 34566515  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  34566514 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 34566415  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  34566414 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 34566358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16356722 - 16356366
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356722 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16356623  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16356622 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16356523  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  16356522 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgt 16356423  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16356422 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 16356366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19770180 - 19769824
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770180 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19770081  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19770080 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19769981  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  19769980 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 19769881  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  19769880 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19769824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27610574 - 27610218
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610574 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27610475  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610474 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27610375  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  27610374 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27610275  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  27610274 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27610218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 27685566 - 27685922
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685566 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27685665  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27685666 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27685765  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  27685766 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgt 27685865  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27685866 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27685922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 37291662 - 37292018
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291662 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgt 37291761  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  37291762 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccga 37291861  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  37291862 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 37291961  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  37291962 gtctcaacttcgaaagtaagttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 37292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23471439 - 23471093
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  23471439 attgttcaacaaactattgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagacc 23471340  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  23471339 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattgg 23471240  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23471239 tccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 23471140  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23471139 cggaagtatgttccggatccatcacatgtgatccaaagagatgatgt 23471093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 29476239 - 29476595
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476239 aggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29476338  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29476339 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacga 29476438  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  29476439 agttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29476538  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29476539 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 29476595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22348643 - 22348314
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348643 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgt 22348544  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22348543 agaaaa--tcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22348446  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22348445 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22348346  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 404  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22348345 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccat 22348314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 20468275 - 20468618
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20468275 gttcagcaaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 20468374  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20468375 aatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtcc 20468474  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    || |||||||| ||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20468475 gtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 20468574  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  20468575 aagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 20468618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 215 - 429
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343880
Alignment:
Q  215 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacgg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  315 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T
Q  415 ccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||| || |||||    
T  21343866 ccaaagagacgatgt 21343880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 348
Target Start/End: Original strand, 21498209 - 21498477
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  21498209 gagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatag 21498308  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    |  | |||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498309 acatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 21498408  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21498409 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttc 21498477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573385
Alignment:
Q  188 tttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 287  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  288 atcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 387  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  388 gtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20573426 gtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 20573385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 392
Target Start/End: Original strand, 21564180 - 21564451
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21564180 agagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 21564279  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||| |    
T  21564280 actcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcat 21564379  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564380 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22462132 - 22461816
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  22462132 actacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcagg 22462033  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    |||| |||||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || |||||    
T  22462032 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 22461933  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  22461932 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 22461833  T
Q  395 ccggatccatcccatgt 411  Q
    || ||||| || |||||    
T  22461832 ccagatccttcgcatgt 22461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 21890938 - 21891263
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  21890938 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 21891037  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21891038 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 21891137  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  21891138 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21891237  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  21891238 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 402
Target Start/End: Original strand, 23442472 - 23442788
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||    
T  23442472 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttg 23442571  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| |  || ||||||||    
T  23442572 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtcc 23442671  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||   |||||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23442672 gtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23442771  T
Q  386 aagtatgttccggatcc 402  Q
    ||||||||  |||||||    
T  23442772 aagtatgtagcggatcc 23442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 411
Target Start/End: Original strand, 28923982 - 28924272
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||     
T  28923982 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28924081  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28924082 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgt 28924181  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  28924182 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgt 28924272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 14887221 - 14887498
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  14887221 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 14887320  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  14887321 ttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgcc 14887420  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  14887421 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 14887498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 24735790 - 24736115
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24735790 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24735889  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24735890 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24735989  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||    
T  24735990 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24736089  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24736090 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24736115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 24749733 - 24750058
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24749733 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24749832  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24749833 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24749932  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||    
T  24749933 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24750032  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24750033 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24750058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25848213 - 25847936
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  25848213 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctttgacgggtg 25848114  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| || || ||    
T  25848113 ttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatacagagttggtttgcc 25848014  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  25848013 acctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 25847936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 24737014 - 24737289
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  24737014 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggt 24737113  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || |    
T  24737114 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgc 24737213  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24737214 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24737289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20773942 - 20773624
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  20773942 agactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttca 20773843  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    |||||| | |||||| ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  20773842 ggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 20773743  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20773742 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20773643  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    | || ||||| || |||||    
T  20773642 taccagatccttcgcatgt 20773624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21405035 - 21404700
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21405035 cagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21404936  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
                     ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||| | |||    
T  21404935 c----------------aaggagatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggttt 21404852  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| |    
T  21404851 attggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21404752  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  21404751 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgattccaagagatgatgt 21404700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 432
Target Start/End: Original strand, 22236099 - 22236445
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  22236099 gttcatcagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 22236198  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  22236199 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 22236298  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  22236299 gtatcagatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 22236398  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgtcca 432  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || |  || |||||||||||    
T  22236399 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagggatgatgtcca 22236445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 411
Target Start/End: Original strand, 28895156 - 28895446
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||     
T  28895156 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28895255  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  28895256 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgt 28895355  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  28895356 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgt 28895446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 37545726 - 37546004
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttt-tgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||| | |||| |||    
T  37545726 tcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggt 37545825  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || |    
T  37545826 gttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgc 37545925  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37545926 caccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 37546004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20342420 - 20342143
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||    
T  20342420 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtg 20342321  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  20342320 ttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 20342221  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  20342220 acctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 20342143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 24798627 - 24798904
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  24798627 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 24798726  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  24798727 ttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgcc 24798826  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24798827 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 24798904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22502813 - 22502525
Alignment:
Q  141 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 240  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  22502813 agagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttgg 22502714  T
Q  241 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 340  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||     
T  22502713 acgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacca 22502614  T
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  22502613 catctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatgt 22502525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22381337 - 22381045
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||||   |||| ||||    
T  22381337 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtg 22381238  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || || ||    
T  22381237 taggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggcttatagagttggtttgcc 22381138  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  22381137 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccgtcacatgtgattccaagagatgatgt 22381045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Original strand, 23080275 - 23080611
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||||||    
T  23080275 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttca 23080374  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  23080375 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23080474  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23080475 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  23080575 tagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatgt 23080611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20821635 - 20821299
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  20821635 agactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttca 20821536  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  20821535 ggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 20821436  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20821435 atttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20821336  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20821335 tacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 20821299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 414
Target Start/End: Original strand, 21662300 - 21662546
Alignment:
Q  167 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 266  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21662300 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21662399  T
Q  267 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgtttt 366  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  21662400 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21662498  T
Q  367 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
     || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  21662499 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgat 21662546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 393
Target Start/End: Original strand, 21665761 - 21665986
Alignment:
Q  167 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 266  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21665761 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21665860  T
Q  267 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgtttt 366  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  21665861 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21665959  T
Q  367 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    
T  21665960 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgt 21665986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Original strand, 21339452 - 21339596
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339452 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21339551  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgaga 217  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  21339552 aggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 17269512 - 17269819
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  17269512 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 17269611  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  17269612 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 17269711  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||    
T  17269712 gtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaactccgg 17269811  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  17269812 aagtatgt 17269819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 11210880 - 11211057
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  11210880 agactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttca 11210979  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || |||||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11210980 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27011252 - 27011089
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  27011252 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27011153  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27011152 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 27011089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 21937388 - 21937551
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  21937388 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21937487  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21937488 tgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 21937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23503625 - 23503464
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23503625 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 23503526  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
        || || ||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23503525 aattggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagt 23503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24581379 - 24581216
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |    
T  24581379 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 24581280  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||| | || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24581279 tgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 250
Target Start/End: Original strand, 25244598 - 25244695
Alignment:
Q  153 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 250  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25244598 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25244695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 250
Target Start/End: Original strand, 25308750 - 25308847
Alignment:
Q  153 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 250  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25308750 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21625470 - 21625397
Alignment:
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||   |||||| || ||||||||    
T  21625470 catctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgat 21625397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24516653 - 24516580
Alignment:
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||||  || || |||||| | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24516653 tcttgagtttcaggttggtgatcatgtgctctttagagtaaatcatgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 24516580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12498155 - 12497799
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498155 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12498056  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498055 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 12497956  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12497955 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 12497856  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12497855 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 12497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17489757 - 17489401
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489757 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17489658  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489657 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 17489558  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  17489557 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 17489458  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489457 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 17489401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 14876729 - 14877078
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876729 gagattgttcagcagactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 14876828  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876829 accttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 14876928  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14876929 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 14877028  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14877029 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 14877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16492404 - 16492760
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492404 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16492503  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16492504 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccga 16492603  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16492604 gatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 16492703  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492704 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16492760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16692060 - 16691711
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |    
T  16692060 gagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaagg 16691961  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691960 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16691861  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16691860 tgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaa 16691761  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691760 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16691711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16371320 - 16370964
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371320 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16371221  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371220 aggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16371121  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  16371120 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgt 16371021  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16371020 gtcgcaacttcggaagtatgttctagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16370964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9522626 - 9522270
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9522626 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 9522527  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522526 agaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 9522427  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  9522426 gatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 9522327  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522326 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9522270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16807149 - 16807505
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  16807149 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgc 16807248  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16807249 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctga 16807348  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16807349 gatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgt 16807448  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16807449 gtcgcaacttcggaattatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16807505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10005507 - 10005151
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005507 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10005408  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10005407 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10005308  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  10005307 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10005208  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  10005207 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 10005151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10906117 - 10905761
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906117 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10906018  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906017 agaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10905918  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10905917 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10905818  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  10905817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 10905761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13252597 - 13252241
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252597 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13252498  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252497 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13252398  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  13252397 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 13252298  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  13252297 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 13252241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 15589615 - 15589971
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589615 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15589714  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15589715 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15589814  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  15589815 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 15589914  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15589915 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 15589971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 15725157 - 15725512
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725157 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15725255  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15725256 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 15725355  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15725356 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15725455  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15725456 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 15725512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 20062277 - 20062633
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062277 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 20062376  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20062377 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20062476  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  20062477 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20062576  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  20062577 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 20062633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48425348 - 48424998
Alignment:
Q  79 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425348 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 48425249  T
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  48425248 gatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 48425149  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48425148 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 48425049  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  48425048 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 48424998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 81 - 429
Target Start/End: Original strand, 15348476 - 15348824
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348476 agattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 15348575  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  15348576 tcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcatt 15348675  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15348676 ggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 15348775  T
Q  381 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15348776 ttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15348824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16635680 - 16635324
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635680 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16635581  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16635580 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16635481  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16635480 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16635381  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16635380 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 16635324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43163004 - 43162648
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163004 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 43162905  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43162904 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43162805  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  43162804 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 43162705  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  43162704 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 43162648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 5425153 - 5425508
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425153 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 5425252  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5425253 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgcttt-gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 5425351  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  5425352 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 5425451  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  5425452 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 5425508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 73 - 411
Target Start/End: Original strand, 53385241 - 53385579
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385241 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 53385340  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  53385341 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccga 53385440  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  53385441 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 53385540  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53385541 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 53385579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15208798 - 15208442
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15208798 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15208699  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||| |  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  15208698 aggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccga 15208599  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15208598 ggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 15208499  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15208498 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 15208442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 15402733 - 15403089
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15402832  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15402833 agaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15402932  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15402933 tgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15403032  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  15403033 gtcgcaacttcgaaagtatgttccagatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15403089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 422
Target Start/End: Original strand, 26792622 - 26792971
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792622 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26792721  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792722 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 26792821  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  26792822 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 26792921  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtg 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26792922 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtg 26792971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6600654 - 6600298
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600654 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 6600555  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6600554 agaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 6600455  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6600454 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 6600355  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  6600354 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 6600298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15339176 - 15338820
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15339176 aggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15339077  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15339076 agaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15338977  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15338976 agttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15338877  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  15338876 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15338820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16412505 - 16412861
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16412505 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgt 16412604  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16412605 aggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16412704  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  16412705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgt 16412804  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16412805 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 16412861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16756808 - 16757164
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16756808 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 16756907  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16756908 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 16757007  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||| || |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16757008 agttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16757107  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  16757108 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtcattcagagtgacgatgt 16757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 73 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15248054 - 15247725
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15248054 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15247955  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||| |   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15247954 aggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 15247855  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  15247854 ggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 15247755  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15247754 gtcgcaacttcggaaatatgttctggatcc 15247725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 121 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15227518 - 15227228
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15227518 agagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 15227419  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  15227418 actcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcat 15227319  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15227318 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15227228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 13972395 - 13972661
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  13972395 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 13972494  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  13972495 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattac 13972594  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  13972595 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatcc 13972661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 13322877 - 13323220
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13322877 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttg 13322976  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  13322977 ggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 13323076  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||  || ||  ||||||| ||||| ||| |  | || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13323077 gtatcagatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcgg 13323176  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  13323177 aagtatgtagcggatccgtcgcatgttattccaagagatgatgt 13323220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 18134571 - 18134914
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || |||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  18134571 gttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 18134670  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || | ||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  18134671 agtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 18134770  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18134771 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18134870  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  18134871 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 18134914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47123797 - 47123520
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  47123797 tcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 47123698  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  47123697 ttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgcc 47123598  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  47123597 accacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatgttgcggatccttctcatgtgat 47123520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10383822 - 10383543
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  10383822 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 10383723  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | || |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  10383722 tcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 10383623  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatcc 416  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  10383622 accacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatcc 10383543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14571752 - 14571409
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| || |  ||||    
T  14571752 gttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttg 14571653  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  14571652 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtcc 14571553  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  14571552 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14571453  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||  || ||||||||    
T  14571452 aagtacgtagcggatccttcgcatgttatcccgagagatgatgt 14571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 15953193 - 15953500
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  15953193 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 15953292  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||| | |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |    
T  15953293 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttc 15953392  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15953393 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15953492  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  15953493 aagtatgt 15953500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 411
Target Start/End: Original strand, 10420285 - 10420595
Alignment:
Q  101 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggag 200  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  10420285 gagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtg 10420384  T
Q  201 accatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaga 300  Q
    | ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||    
T  10420385 atcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcaga 10420484  T
Q  301 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 400  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||| || |||    
T  10420485 aagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgat 10420584  T
Q  401 ccatcccatgt 411  Q
    || || |||||    
T  10420585 ccttcacatgt 10420595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 414
Target Start/End: Original strand, 16329938 - 16330212
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  16329938 cagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttg 16330037  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccacc 339  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||    
T  16330038 gacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 16330137  T
Q  340 gcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
     |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16330138 acatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 16330212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14086527 - 14086261
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  14086527 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 14086428  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| || |    
T  14086427 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgc 14086328  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  14086327 cccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 14086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 363
Target Start/End: Original strand, 12850546 - 12850781
Alignment:
Q  128 atgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  ||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  12850546 atgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctg 12850645  T
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    |||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  12850646 tgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 12850745  T
Q  328 gggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgt 363  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  12850746 gggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgt 12850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Original strand, 12360775 - 12361092
Alignment:
Q  94 gactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcag 193  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||    
T  12360775 gactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcag 12360874  T
Q  194 gaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaga 293  Q
    || || || ||||| ||| ||||||| |||  | ||||  |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  12360875 gagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 12360974  T
Q  294 tatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | ||||| |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12360975 tttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 12361074  T
Q  394 tccggatccatcccatgt 411  Q
      ||||||| || |||||    
T  12361075 agcggatccttcgcatgt 12361092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 290
Target Start/End: Original strand, 15015967 - 15016184
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||   ||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15015967 aggaccagaaattgttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgt 15016066  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  | |||||||    
T  15016067 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccga 15016166  T
Q  273 gatttattggtccgtatc 290  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  15016167 ggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 8759307 - 8759614
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  8759307 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 8759406  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  8759407 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 8759506  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||    
T  8759507 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcgg 8759606  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  8759607 aagtatgt 8759614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13941928 - 13941621
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13941928 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 13941829  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  13941828 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 13941729  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  13941728 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 13941629  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  13941628 aagtatgt 13941621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41177426 - 41177119
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  41177426 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 41177327  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  41177326 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 41177227  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  41177226 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 41177127  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  41177126 aagtatgt 41177119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 429
Target Start/End: Original strand, 11961312 - 11961602
Alignment:
Q  139 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 238  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | ||||  ||||     
T  11961312 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgta 11961411  T
Q  239 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccac 338  Q
     ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| |||| |  || || |    
T  11961412 cgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccc 11961511  T
Q  339 cgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  11961512 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagagatgatgt 11961602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 429
Target Start/End: Original strand, 11303999 - 11304341
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| ||| |||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | ||||||    
T  11303999 ttcatcaggctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttga 11304098  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    |||||| || || || ||||| ||| |||||||    | | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  11304099 gtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccg 11304198  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||    
T  11304199 tatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcaga 11304298  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  11304299 agtatgtagcggatccttcgcatgttattcctagtgatgatgt 11304341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 393
Target Start/End: Original strand, 16381190 - 16381459
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||     
T  16381190 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca---gagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagtt 16381286  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| |    
T  16381287 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcat 16381386  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    || |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  16381387 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagcttcggaaatatgt 16381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15576647 - 15576470
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  15576647 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 15576548  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||  || || |||||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15576547 ggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 316
Target Start/End: Original strand, 16836789 - 16836965
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||| |    
T  16836789 cagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtag 16836888  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtg 316  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  16836889 gacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtg 16836965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 8274656 - 8274819
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  8274656 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 8274755  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8274756 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 8274819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 16742946 - 16743123
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||    
T  16742946 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtca 16743045  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || |||||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16743046 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44777151 - 44776826
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || |  ||||    
T  44777151 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttg 44777052  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||| || || || || ||||| ||| | ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||| ||    
T  44777051 agttccaagagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggccc 44776952  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||  | |||    
T  44776951 gtatcagatttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 44776852  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  44776851 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 44776826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18748562 - 18748401
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||  |  ||||||||||    
T  18748562 agactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttca 18748463  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     |  || || ||||||||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18748462 agttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945051
Alignment:
Q  285 cgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcg 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  385 gaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgt 31945051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17192977 - 17192865
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  17192977 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 17192878  T
Q  207 tgtttttgagagt 219  Q
    ||||||| |||||    
T  17192877 tgttttttagagt 17192865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689173
Alignment:
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgt 31689173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 13975302 - 13975465
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  13975302 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 13975401  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  13975402 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcc 13975465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 270
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153259
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| |  || || ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  252 agtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||  |  |||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcc 6153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21686783 - 21686681
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| | |||||| || | |||||||||||||||||    
T  21686783 aagagttatcattataagaggagaaaagatattcagtttcaagttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttga 21686684  T
Q  252 agt 254  Q
    |||    
T  21686683 agt 21686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 320836 - 320781
Alignment:
Q  376 gcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgtcca 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  320836 gcaacttcggaagtatgctccggatccatctc-cgtgatccaaagagatgatgtcca 320781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 6712666 - 6712778
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||||   | |  ||||    
T  6712666 gttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcagggttgtgttcatg 6712765  T
Q  207 tgtttttgagagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  6712766 tgtttttgagagt 6712778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 120
Target Start/End: Original strand, 14183145 - 14183182
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14183145 attgttcagcagactattgagaaggttaagatgattca 14183182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 65724 - 65369
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65724 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 65625  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65624 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 65525  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  65524 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 65425  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  65424 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc-aagtgatgatgt 65369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 221 - 429
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40132
Alignment:
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaag 420  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  421 tgatgatgt 429  Q
    |||||||||    
T  40124 tgatgatgt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 173
Target Start/End: Original strand, 39806 - 39906
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39806 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 39905  T
Q  173 a 173  Q
    |    
T  39906 a 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 33560 - 33916
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33560 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33659  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33660 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 33759  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33760 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 33859  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33860 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 33916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8559
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8915 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8816  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8815 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 8716  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8715 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 8616  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8615 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 17045071 - 17045427
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17045071 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 17045170  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17045171 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 17045270  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17045271 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 17045370  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17045371 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 17045427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19106670 - 19106314
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19106670 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgg 19106571  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19106570 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccga 19106471  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19106470 agtttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19106371  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  19106370 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatctagagtgacgatgt 19106314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20250153 - 20249797
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20250153 aggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20250054  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20250053 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccga 20249954  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20249953 aatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20249854  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249853 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 20249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16078708 - 16079045
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16078708 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg- 16078806  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
                      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16078807 ------------------caggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 16078888  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16078889 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16078988  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16078989 gtcgcaactacggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16079045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20137081 - 20136725
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20137081 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20136982  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20136981 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 20136882  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20136881 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20136782  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20136781 gtcgcaacttcggaagtatgtttttgatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 20136725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 73 - 411
Target Start/End: Original strand, 16350655 - 16350993
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350655 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16350754  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16350755 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16350854  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16350855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16350954  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16350955 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 16350993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21747837 - 21747482
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21747837 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgt 21747738  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21747737 agaaa-gatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccga 21747639  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21747638 gatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21747539  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747538 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtaatccaaagtgatgatgt 21747482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 33391085 - 33391441
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391085 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33391184  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391185 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 33391284  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  33391285 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 33391384  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  33391385 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 33391441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 51333549 - 51333905
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333549 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 51333648  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51333649 agaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 51333748  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  51333749 agttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 51333848  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51333849 gtcgcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 51333905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 50620307 - 50620656
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50620307 gagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 50620406  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | ||||||||||| || | ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50620407 accttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttat 50620506  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  50620507 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaa 50620606  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50620607 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21830606 - 21830250
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830606 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 21830507  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830506 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21830407  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21830406 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 21830307  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21830306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21830250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21837253 - 21836897
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21837253 aggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgt 21837154  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21837153 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21837054  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  21837053 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 21836954  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21836953 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 41354525 - 41354881
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354525 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41354624  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41354625 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 41354724  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41354725 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 41354824  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  41354825 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41354881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 19760935 - 19761278
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19760935 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 19761034  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19761035 agtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggacc 19761134  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  19761135 gtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcgg 19761234  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  19761235 tagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 19761278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16369600 - 16369268
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||| || || |||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369600 aggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgt 16369501  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16369500 aggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcga 16369401  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16369400 ggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 16369301  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369300 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatc 16369268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 209 - 429
Target Start/End: Original strand, 50612608 - 50612828
Alignment:
Q  209 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttg 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612608 tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttg 50612707  T
Q  309 gaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatccca 408  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50612708 gaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatccatctca 50612807  T
Q  409 tgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50612808 tgtgatccaaagtgatgatgt 50612828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 19664945 - 19665270
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19664945 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttg 19665044  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  19665045 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtcc 19665144  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19665145 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 19665244  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19665245 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 19665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 429
Target Start/End: Original strand, 20856839 - 20857173
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||    
T  20856839 actacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcagg 20856938  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    |||| |||||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || |||||    
T  20856939 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 20857038  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  20857039 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 20857138  T
Q  395 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20857139 ccagatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 20857173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 393
Target Start/End: Original strand, 20940183 - 20940439
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||    
T  20940183 tcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 20940282  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  20940283 taggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgcc 20940382  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20940383 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 20940439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163227
Alignment:
Q  275 tttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgt 21163282  T
Q  375 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21163281 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 37677319 - 37677041
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgttt-ttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||||| ||||||| | |||| |||    
T  37677319 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggt 37677220  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || |    
T  37677219 gttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgc 37677120  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37677119 caccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 37677041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19854604 - 19854261
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  19854604 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 19854505  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||     
T  19854504 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 19854405  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  19854404 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 19854305  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  19854304 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 19854261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 31550301 - 31550593
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  31550301 tcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 31550400  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||    
T  31550401 ttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcc 31550500  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  31550501 accacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatgt 31550593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20294651 - 20294359
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  20294651 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 20294552  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  20294551 ttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 20294452  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  20294451 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatgt 20294359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 22433192 - 22433510
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  22433192 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttca 22433291  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||| ||||||||    
T  22433292 ggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcag 22433391  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||| ||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22433392 atttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  22433492 tagcggatccttcacatgt 22433510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 20075179 - 20075456
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||    
T  20075179 tcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtg 20075278  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||| || || ||    
T  20075279 ttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgcc 20075378  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  20075379 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgtgat 20075456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11382833 - 11382670
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  11382833 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11382734  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaga 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11382733 ttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcaga 11382670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244183
Alignment:
Q  139 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 238  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  239 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccac 338  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  339 cgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 20244183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 363
Target Start/End: Original strand, 20835957 - 20836237
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |  |||     
T  20835957 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggccctta 20836056  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc---aaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    ||||| |||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||| | || |||||    |||||||||||||| |  || |||||    
T  20836057 agttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattgg 20836156  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgt 363  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  20836157 tccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41308115 - 41307891
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    ||||    
T  41308115 gttcatcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttg 41308016  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  41308015 agtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtcc 41307916  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttgga 310  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  41307915 gtatcagatatctgagagggttgga 41307891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 20831482 - 20831645
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  20831482 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 20831581  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  20831582 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 20831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 414
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395390
Alignment:
Q  218 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 317  Q
    ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  318 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    | ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 20395390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20914493 - 20914316
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  20914493 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttca 20914394  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||| |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20914393 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 46518990 - 46518827
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  46518990 gttaagatgattcaggagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46518891  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46518890 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46518827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Original strand, 21202371 - 21202524
Alignment:
Q  101 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||  | || |||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||  || |    
T  21202371 gagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtg 21202470  T
Q  201 accatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    | ||| ||||||||||||| | || | | || |||||||||||| |||||||||    
T  21202471 atcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 22135645 - 22135756
Alignment:
Q  104 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||||||| | ||||| ||  || |||||||||  || ||||    
T  22135645 aaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgacc 22135744  T
Q  204 atgtgtttttga 215  Q
    ||||||||||||    
T  22135745 atgtgtttttga 22135756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24477021 - 24476942
Alignment:
Q  335 ccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  24477021 ccaccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgat 24476942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 270
Target Start/End: Original strand, 22142232 - 22142294
Alignment:
Q  208 gtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22142232 gtttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 22142294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20184456 - 20184345
Alignment:
Q  102 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||   ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||| |  || ||    
T  20184456 agaaagtgaagatgatccaagagaagatgtgagtgtctcagagtaggcagaagagttataatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagtgggtga 20184357  T
Q  202 ccatgtgttttt 213  Q
     |||||||||||    
T  20184356 tcatgtgttttt 20184345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14679 - 14323
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14679 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14580  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14579 aggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 14480  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14479 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgt 14380  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379 gtcgaaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 939 - 583
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  939 aggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgt 840  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  839 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 740  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  739 agttcattggtccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 640  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  639 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16252169 - 16252525
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252169 aggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16252268  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252269 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16252368  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16252369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16252468  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16252469 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16252525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16355169 - 16355525
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  16355169 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgc 16355268  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355269 aggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16355368  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16355369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 16355468  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16355469 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16355525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14680855 - 14680499
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14680855 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14680756  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14680755 aggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccga 14680656  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14680655 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 14680556  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14680555 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 18227177 - 18227526
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  18227177 gagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaga 18227276  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227277 atcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttat 18227376  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227377 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18227476  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18227477 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 18227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12523964 - 12523608
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12523964 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgt 12523865  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12523864 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12523765  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12523764 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgt 12523665  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12523664 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12523608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7090720 - 7090365
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7090720 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 7090621  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090620 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 7090521  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  7090520 gatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 7090422  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090421 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 7090365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 83 - 396
Target Start/End: Original strand, 15149740 - 15150053
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15149740 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatc 15149839  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15149840 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 15149939  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15149940 tccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 15150039  T
Q  383 cggaagtatgttcc 396  Q
    ||||||||||||||    
T  15150040 cggaagtatgttcc 15150053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8386700 - 8386344
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386700 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8386601  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8386600 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8386501  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8386500 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8386401  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  8386400 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 8386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18297493 - 18297137
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297493 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18297394  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18297393 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18297294  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18297293 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 18297194  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  18297193 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 18297137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 19778517 - 19778873
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778517 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19778616  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778617 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19778716  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  19778717 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19778816  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  19778817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19778873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14652583 - 14652240
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14652583 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 14652484  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14652483 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 14652384  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  14652383 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 14652284  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14652283 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 14652240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 14303702 - 14304057
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303702 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14303801  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303802 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccga 14303900  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  14303901 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 14304000  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14304001 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 14304057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27711624 - 27711268
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711624 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27711525  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27711524 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27711425  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  27711424 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27711325  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  27711324 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcaaagtgacgatgt 27711268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12476888 - 12476532
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476888 aggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12476789  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12476788 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 12476689  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  12476688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 12476589  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  12476588 atcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 12476532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 29039128 - 29039484
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039128 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29039227  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29039228 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29039327  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  29039328 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29039427  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  29039428 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 29039484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14159773 - 14159424
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159773 gagattgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaag 14159674  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14159673 atcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttat 14159574  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14159573 tggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaa 14159474  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14159473 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatgt 14159424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40473321 - 40472972
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40473321 gagattgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaag 40473222  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  40473221 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 40473122  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473121 tggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 40473022  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473021 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 40472972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23956035 - 23955679
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956035 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23955936  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23955935 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 23955836  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||||||    
T  23955835 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgt 23955736  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  23955735 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 23955679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 14851090 - 14851446
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851090 aggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14851189  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14851190 aggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccga 14851289  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  14851290 ggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgt 14851389  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  14851390 gtcgcaaattcggaagtatgttccggatccatctcatgtgctcccaagagatgatgt 14851446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 8053347 - 8053703
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8053347 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 8053446  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8053447 agaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8053546  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  8053547 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 8053646  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8053647 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 8053703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 14266623 - 14266979
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266623 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14266722  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14266723 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14266822  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14266823 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 14266922  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  14266923 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 14266979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 164 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364318
Alignment:
Q  164 gataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  264 tgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgt 363  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgt 15364384  T
Q  364 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15364383 tttccatatgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 15364318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 15003361 - 15003686
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||    
T  15003361 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttg 15003460  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  15003461 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatcc 15003560  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15003561 atatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15003660  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  15003661 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 15003686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 241 - 429
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927339
Alignment:
Q  241 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 340  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14927339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 3264842 - 3265119
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  3264842 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 3264941  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  3264942 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 3265041  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  3265042 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 3265119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 16676427 - 16676578
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16676427 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16676526  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactc 224  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16676527 aggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 11207279 - 11207556
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  11207279 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11207378  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  11207379 ttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 11207478  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11207479 acctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 11207556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16146187 - 16145862
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  16146187 gttcatcagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 16146088  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  16146087 agtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16145988  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16145987 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcgg 16145888  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  16145887 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 16145862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 29453585 - 29453862
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  29453585 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 29453684  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  29453685 ttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 29453784  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  29453785 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 29453862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15070688 - 15070345
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  15070688 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttg 15070589  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||  |||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||    
T  15070588 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtcc 15070489  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     || |||||||  || ||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15070488 ataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15070389  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||   ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  15070388 aagtatgcagcggatccttcgcatgtgattccaagagatgatgt 15070345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 44661914 - 44662206
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||    
T  44661914 tcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 44662013  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  44662014 ttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgcc 44662113  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  44662114 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatgt 44662206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 1649324 - 1649617
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |||| | |||| |||    
T  1649324 gtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggt 1649423  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||| |||| || || |    
T  1649424 gtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcatatagagttgggttgc 1649523  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  1649524 cacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgtaattccaagggatgatgt 1649617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15246199 - 15245874
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||  |||| || ||||||||   ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |   |||    
T  15246199 gttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttg 15246100  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || | | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  15246099 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 15246000  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||| |    
T  15245999 gtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 15245900  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  15245899 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 15245874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20891206 - 20890930
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  20891206 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 20891107  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |  |||| || ||    
T  20891106 ttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataggatggg-tttcc 20891008  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20891007 aacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 20890930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33223142 - 33222865
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  33223142 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 33223043  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | |||||||| |||||||| | ||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  33223042 taggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgcc 33222943  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  33222942 accccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 33222865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Original strand, 1640156 - 1640293
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1640156 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaag 1640255  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgaga 217  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  1640256 accttgagttccaagaaggagatcatgtatttttgaga 1640293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Original strand, 15415059 - 15415198
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15415059 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 15415158  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15415159 ctcttgtgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaa 15415198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 51606178 - 51606485
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||    
T  51606178 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttg 51606277  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  51606278 agtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 51606377  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  51606378 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 51606477  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  51606478 aagtatgt 51606485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607910
Alignment:
Q  342 atctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgaagatgt 18607910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Original strand, 15359087 - 15359313
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||    
T  15359087 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttg 15359186  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || |||||||     
T  15359187 agtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 15359286  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaac 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15359287 gtatcagatatcagagagggttggaac 15359313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13247899 - 13247736
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  || || ||||    
T  13247899 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatg 13247800  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    | |||||||| || | ||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  13247799 tatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13247736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27900654 - 27900459
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27900654 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 27900555  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgta 288  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| || |||| | ||||  |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  27900554 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 12132413 - 12132574
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| | || ||||||| |||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  12132413 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 12132512  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     |  || || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132513 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14997570 - 14997407
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  14997570 gttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 14997471  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14997470 tgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14997407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42703082 - 42702871
Alignment:
Q  182 cttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 281  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||    
T  42703082 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 42702983  T
Q  282 gtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaact 381  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  42702982 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 42702883  T
Q  382 tcggaagtatgt 393  Q
    ||||||||||||    
T  42702882 tcggaagtatgt 42702871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16752818 - 16752665
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| |||    
T  16752818 gtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggt 16752719  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtat 289  Q
    || |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16752718 gtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9291089 - 9290926
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  9291089 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcagg 9290990  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    | |||||||| || | || |||||| | |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  9290989 tatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 9290926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 16445230 - 16445393
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  16445230 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16445329  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| || || | || ||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16445330 tgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 374
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  232 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 331  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||     
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  332 ttaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgt 374  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 55375376 - 55375537
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  55375376 gttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 55375475  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 268  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375476 tgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 15293175 - 15293338
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  | || || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  15293175 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 15293274  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || ||||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15293275 tgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 9849473 - 9849683
Alignment:
Q  84 ttgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 183  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |  | ||||||| ||||||||| |  || || ||| |    
T  9849473 ttgttcagcagactatggagaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcatcgtagagtaggtagaagagttgtcatgataaacagaggaaggatat 9849572  T
Q  184 tgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 283  Q
    ||| ||||| |  ||||| ||  |||||||||||||    |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  9849573 tgaatttcaagtcggagatcaaatgtttttgagagttgacctagtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtccaagaagttgacaccgtgttttattggt 9849672  T
Q  284 ccgtatcagat 294  Q
    || ||||||||    
T  9849673 ccttatcagat 9849683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 18550049 - 18550234
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaa--atgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaga 175  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||| |  ||||| |  || || | | |||||||||| |||||||||||||| ||     
T  18550049 cagagattgttcagcagacgacagaaaaagtcaaaatgattcgagagagagaatgaaagcatcacaaaatagacaaaagagctatcatgataagcgaagg 18550148  T
Q  176 aaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
    |||    | |||||||||||| |  | ||| ||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18550149 aaatcattggagtttcaggaaaggtatcatttgtttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 18550234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8706196 - 8706068
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||| | ||   ||| || ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  8706196 attgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagacc 8706097  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgttt 211  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  8706096 ttgaatttaaggaaggagattatgtgttt 8706068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 411
Target Start/End: Original strand, 15415209 - 15415301
Alignment:
Q  319 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15415209 gtatagagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15415301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 12342881 - 12343028
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| || | || ||| |||||| | || |||||||||||||||||| | || ||  || ||||||||||||  || || ||||    
T  12342881 gttaagatgattcaagagaatataagggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaagaatattgagtttcaggttggtgatcatg 12342980  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    | ||||| |||||   || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  12342981 tattttttagagtgtatcctgtaaccgatgttagacgtgctttgaagt 12343028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 429
Target Start/End: Original strand, 15359327 - 15359397
Alignment:
Q  359 gatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15359327 gatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 15359397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15077910 - 15077825
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 171  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077910 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15319642 - 15319533
Alignment:
Q  302 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 401  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||| | |||||||| ||| |||| ||||| || | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  15319642 agagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtagcggatc 15319543  T
Q  402 catcccatgt 411  Q
    | || |||||    
T  15319542 cttcgcatgt 15319533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 79 - 427
Target Start/End: Original strand, 278823 - 279171
Alignment:
Q  79 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278823 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 278922  T
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 279022  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  279023 taggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgca 279122  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  279123 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 164709 - 165052
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164709 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 164808  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  164809 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 164908  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  164909 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 165008  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  165009 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 165052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 308978 - 308622
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308978 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 308879  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  308878 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaa 308779  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  308778 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 308679  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  308678 gtcgtaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 308622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 260614 - 260289
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || ||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  260614 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 260515  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  260514 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 260415  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  || |||||||||| ||| ||||  | || |||||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  260414 gtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 260315  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  260314 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 260289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24675408 - 24675052
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675408 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24675309  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675308 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 24675209  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  24675208 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 24675109  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24675108 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 24675052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23188927 - 23188571
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23188927 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23188828  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23188827 aggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaa 23188728  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23188727 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23188628  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23188627 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 22756987 - 22757343
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22756987 aggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaaggtgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 22757086  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22757087 aggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccga 22757186  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22757187 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 22757286  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22757287 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22757343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 24708006 - 24708362
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  24708006 aggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgc 24708105  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708106 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccta 24708205  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24708206 gattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgt 24708305  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24708306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccacagtgatgatgt 24708362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 21325790 - 21326146
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21325790 aggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21325889  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325890 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21325989  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21325990 gatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgt 21326089  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21326090 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21326146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16925179 - 16924823
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925179 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16925080  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925079 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16924980  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16924979 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16924880  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16924879 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 16924823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16998919 - 16998563
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998919 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16998820  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16998819 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16998720  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16998719 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16998620  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16998619 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 16998563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 22325385 - 22325736
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325385 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 22325484  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||     
T  22325485 agatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttc 22325584  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22325585 attggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgc 22325684  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22325685 aacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22325736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10868769 - 10868413
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10868769 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 10868670  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10868669 aggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10868570  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10868569 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10868470  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  10868469 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 10868413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16982071 - 16981715
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982071 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16981972  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16981971 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16981872  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16981871 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16981772  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16981771 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 16981715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17063636 - 17063280
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063636 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17063537  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17063536 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17063437  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  17063436 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17063337  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  17063336 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 17063280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27217935 - 27217579
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217935 aggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27217836  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27217835 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 27217736  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27217735 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 27217636  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27217635 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 27217579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 44386093 - 44386449
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386093 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44386192  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44386193 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 44386292  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
     ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  44386293 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44386392  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  44386393 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 44386449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 81 - 423
Target Start/End: Original strand, 21145562 - 21145904
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145562 agattgtccagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 21145661  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  21145662 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttatt 21145761  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    | || |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21145762 gatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 21145861  T
Q  381 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21145862 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 21145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9610055 - 9609699
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610055 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9609956  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9609955 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 9609856  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9609855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 9609756  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  9609755 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 9609699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 73 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23063996 - 23063663
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23063996 aggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgt 23063897  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063896 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23063797  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23063796 gatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 23063697  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  23063696 gtcgcaacttcagaagtatgtaccagatccatcc 23063663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24709952 - 24709596
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709952 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24709853  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24709852 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24709753  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || | |||||||||||    
T  24709752 agttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgt 24709653  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24709652 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24709596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24262289 - 24261933
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262289 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24262190  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24262189 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24262090  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24262089 agttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24261990  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24261989 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24261933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 24878519 - 24878875
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878519 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24878618  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24878619 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 24878718  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |    
T  24878719 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatct 24878818  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  24878819 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcaagtaatccagagtgacgatgt 24878875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27371188 - 27370832
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27371188 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 27371089  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371088 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27370989  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  27370988 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27370889  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27370888 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27370832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23138911 - 23138600
Alignment:
Q  118 tcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgaga 217  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  23138911 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23138812  T
Q  218 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138811 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23138712  T
Q  318 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatcca 417  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23138711 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23138612  T
Q  418 aagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||    
T  23138611 aagtgatgatgt 23138600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23550701 - 23550390
Alignment:
Q  118 tcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgaga 217  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  23550701 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23550602  T
Q  218 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550601 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23550502  T
Q  318 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatcca 417  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23550501 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23550402  T
Q  418 aagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||    
T  23550401 aagtgatgatgt 23550390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 179 - 429
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377351
Alignment:
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 27377351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17067294 - 17066941
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067294 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17067195  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17067194 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17067095  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  17067094 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgcac-acgtttttcatgt 17066997  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  17066996 gtcgc-acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 17066941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Original strand, 24825811 - 24826063
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24825811 cagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaa 24825910  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24825911 agaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 24826010  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24826011 attggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagtggg 24826063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23087321 - 23087013
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23087321 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 23087222  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23087221 actcttgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgt 23087122  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaag 420  Q
    || ||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||    
T  23087121 atagagtgtgtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaag 23087022  T
Q  421 tgatgatgt 429  Q
     ||||||||    
T  23087021 agatgatgt 23087013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 429
Target Start/End: Original strand, 30211455 - 30211797
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  30211455 ttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttga 30211554  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||    
T  30211555 gtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccg 30211654  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    |||||||| || |||| ||||||   ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  30211655 tatcagatttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgga 30211754  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  30211755 agtatgttttggatcaatctcatgtgattccaagagatgatgt 30211797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31830513 - 31830236
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  31830513 tcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 31830414  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  31830413 ttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgcc 31830314  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  31830313 accacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 31830236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 11358462 - 11358754
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  11358462 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11358561  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  11358562 ttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 11358661  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  11358662 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatgt 11358754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23293864 - 23293521
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23293864 gttcatcagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23293765  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  23293764 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 23293665  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23293664 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23293565  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || |||||  |||||||    
T  23293564 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattcaaagatatgatgt 23293521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 27365666 - 27365932
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||| |||    
T  27365666 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggt 27365765  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  27365766 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattac 27365865  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||    
T  27365866 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatcc 27365932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45529420 - 45529115
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||| || ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  45529420 attgttcaacagactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatc 45529321  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||| |      ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||     
T  45529320 ttgagtttga------agaccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattga 45529227  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || || |  ||||| || |||||||| ||||||    
T  45529226 cccatatcagatttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaactt 45529127  T
Q  383 cggaagtatgtt 394  Q
    |||||| |||||    
T  45529126 cggaagcatgtt 45529115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20832836 - 20832563
Alignment:
Q  141 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 240  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  20832836 agagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttgg 20832737  T
Q  241 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 340  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || |||||     
T  20832736 tcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacca 20832637  T
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  20832636 catctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 20832563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1063606 - 1063329
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  1063606 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 1063507  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| |  || ||    
T  1063506 ttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgcc 1063407  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  1063406 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 1063329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23276682 - 23276357
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23276682 gttcatcagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23276583  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| ||||| | |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |  || ||||||||    
T  23276582 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtcc 23276483  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  23276482 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcga 23276383  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  23276382 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 23276357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 429
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609224
Alignment:
Q  252 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaa 351  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  352 tttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41609224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653908
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  252 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaa 351  Q
    |||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||  |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  352 tttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatttagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 24653908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27787647 - 27787340
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| ||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  27787647 gttcaggagactacagaaaaagtcaaggtgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 27787548  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  27787547 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 27787448  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  27787447 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 27787348  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  27787347 aagtatgt 27787340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22276164 - 22276001
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  22276164 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 22276065  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  22276064 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcc 22276001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24945156 - 24944966
Alignment:
Q  203 catgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaa 302  Q
    ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||| | |    
T  24945156 catgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaaga 24945057  T
Q  303 gagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24945056 gggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 24944966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12574259 - 12573952
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  12574259 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttg 12574160  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | || || || |   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  12574159 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 12574060  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||  | |||    
T  12574059 gtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 12573960  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  12573959 aagtatgt 12573952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 12640477 - 12640640
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| ||||    
T  12640477 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 12640576  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  12640577 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12640640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 24831745 - 24831908
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  24831745 gttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 24831844  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || | ||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24831845 tgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25128546 - 25128387
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| |  | || || ||  ||||||||||    
T  25128546 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttca 25128447  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 252  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25128446 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 24570212 - 24570373
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||   ||| |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  24570212 agactacggaaaaggttaagatgaatcaagagaagatgaaaacgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 24570311  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||  || || ||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24570312 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 429
Target Start/End: Original strand, 24833356 - 24833453
Alignment:
Q  332 ttaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  24833356 ttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattcgaagagatgatgt 24833453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 27368391 - 27368452
Alignment:
Q  108 ttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368391 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 22762127 - 22762274
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |  | |||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||||  || || ||||    
T  22762127 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtaggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22762226  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22762227 tgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggtttgaagt 22762274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Original strand, 23817597 - 23817719
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  23817597 agactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 23817696  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttga 215  Q
    ||  || || |||||||||||||    
T  23817697 ggttggtgatcatgtgtttttga 23817719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23599877 - 23599834
Alignment:
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23599877 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23599834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 254
Target Start/End: Original strand, 23817718 - 23817798
Alignment:
Q  174 gaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23817718 gaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 23817798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 429
Target Start/End: Original strand, 45676685 - 45676729
Alignment:
Q  385 gaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  45676685 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 45676729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28144752 - 28144701
Alignment:
Q  203 catgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28144752 catgtgtttttgagagtgaatcttgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 28144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 80 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12498171 - 12497824
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12498171 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12498072  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12498071 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12497972  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12497971 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12497872  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12497871 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12497824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 80 - 427
Target Start/End: Original strand, 12510730 - 12511077
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12510730 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12510829  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12510830 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12510929  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12510930 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12511029  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12511030 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 25765419 - 25765774
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25765419 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 25765518  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765519 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 25765617  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  25765618 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgttccatgt 25765717  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25765718 gtcgtaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 25765774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 80 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12505500 - 12505153
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12505500 gagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12505401  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12505400 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12505301  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  12505300 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12505201  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12505200 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12505153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19864839 - 19864483
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19864839 aggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 19864740  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864739 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19864640  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  19864639 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgt 19864540  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19864539 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 19864483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16963496 - 16963852
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16963496 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16963595  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16963596 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccga 16963695  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16963696 gatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgt 16963795  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16963796 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16963852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 25609990 - 25610346
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25609990 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 25610089  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25610090 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccga 25610189  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  25610190 gatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgt 25610289  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25610290 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25610346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 73 - 423
Target Start/End: Original strand, 1543213 - 1543563
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1543213 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 1543312  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1543313 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 1543412  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1543413 agttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 1543512  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1543513 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 1543563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 79 - 429
Target Start/End: Original strand, 22078823 - 22079173
Alignment:
Q  79 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 178  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22078823 agagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgattccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaa 22078922  T
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22078923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagattta 22079022  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  22079023 ttcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagca 22079122  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22079123 acttcggaagtatgttcctgatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22079173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 27331569 - 27331918
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27331569 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27331668  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27331669 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27331768  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  27331769 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27331868  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331869 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27331918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 27392309 - 27392658
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392309 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27392408  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27392409 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27392508  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  27392509 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27392608  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392609 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 24313297 - 24313653
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24313297 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcat 24313396  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24313397 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24313496  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24313497 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24313596  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24313597 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24313653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 28263326 - 28263682
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263326 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28263425  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28263426 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28263525  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28263526 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28263625  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  28263626 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 28342075 - 28342431
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342075 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28342174  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342175 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28342274  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28342275 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28342374  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  28342375 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28342431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 29592049 - 29592405
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592049 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29592148  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29592149 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29592248  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  29592249 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29592348  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  29592349 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 29592405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 5839348 - 5839704
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5839348 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 5839447  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5839448 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcga 5839547  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5839548 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgt 5839647  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5839648 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 5839704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16626846 - 16627202
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626846 aggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16626945  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16626946 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16627045  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  16627046 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 16627145  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16627146 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 16627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 16927769 - 16928125
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16927769 aggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgc 16927868  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927869 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16927968  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||    
T  16927969 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgt 16928068  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16928069 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatacagagtgatgatgt 16928125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 18408072 - 18408428
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18408072 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgt 18408171  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18408172 aggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 18408271  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  18408272 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 18408371  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408372 gtcgcaacttcgaaagtatgcaccggattcatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 18408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 21833173 - 21833466
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21833173 gtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggt 21833272  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21833273 gttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattac 21833372  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21833373 caccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 21833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 2874932 - 2875288
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874932 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 2875031  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2875032 agaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccga 2875131  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2875132 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 2875231  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  2875232 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 2875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25112704 - 25112348
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112704 aggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgt 25112605  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25112604 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 25112505  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25112504 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 25112405  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  25112404 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 25112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27187588 - 27187232
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27187588 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27187489  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27187488 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27187389  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
     ||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27187388 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27187289  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  27187288 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27187232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 27261652 - 27262008
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27261652 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27261751  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27261752 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27261851  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
     ||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27261852 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27261951  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  27261952 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27262008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23078621 - 23078265
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078621 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23078522  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23078521 aggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 23078422  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  23078421 gatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgt 23078322  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23078321 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23078265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 22762584 - 22762940
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22762584 aggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgt 22762683  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22762684 aggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22762783  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||    
T  22762784 gatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgt 22762883  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22762884 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccctcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22762940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 28292501 - 28292857
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28292501 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 28292600  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28292601 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccga 28292700  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28292701 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28292800  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  28292801 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28292857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 206 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17032581 - 17032358
Alignment:
Q  206 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagag 305  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17032581 gtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagag 17032482  T
Q  306 ttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatc 405  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032481 ttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatc 17032382  T
Q  406 ccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  17032381 tcatgtgatccagagtgacgatgt 17032358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 73 - 403
Target Start/End: Original strand, 18197676 - 18198006
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197676 aggaccagcgattgtttaacagactactgagaaggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18197775  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
     | ||||| ||| ||||||| || ||| | ||||| ||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18197776 cggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccga 18197875  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18197876 ggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 18197975  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 403  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18197976 ttcgcaacttcggaagtatgttctggatcca 18198006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21471690 - 21471397
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||     
T  21471690 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggg 21471591  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  21471590 gtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgc 21471491  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  21471490 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagagatgatgt 21471397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25750898 - 25750623
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  25750898 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggt 25750799  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  25750798 gtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgc 25750699  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  25750698 caccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 25750623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15459468 - 15459132
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15459468 agactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttca 15459369  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  15459368 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 15459269  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||  | ||||||||||    
T  15459268 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtatcacagttgcggaagtatg 15459169  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15459168 tacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 15459132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 14131371 - 14131637
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||| |||    
T  14131371 gtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcctatgacaggt 14131470  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |    
T  14131471 gtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgc 14131570  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    |||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||    
T  14131571 cacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatcc 14131637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 136 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25768280 - 25768023
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||    
T  25768280 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttatgacgggt 25768181  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  25768180 gtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgc 25768081  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  25768080 caccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgt 25768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 292 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22433930 - 22433793
Alignment:
Q  292 gatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22433930 gatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 22433831  T
Q  392 gttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22433830 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22433793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 10469042 - 10469334
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  10469042 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 10469141  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  10469142 ttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 10469241  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  10469242 accacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatgt 10469334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 392
Target Start/End: Original strand, 22796774 - 22797080
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    || || ||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  22796774 gttcatcagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 22796873  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||     
T  22796874 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtct 22796973  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22796974 gtatcatatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 22797073  T
Q  386 aagtatg 392  Q
    |||||||    
T  22797074 aagtatg 22797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24364500 - 24364208
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  24364500 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 24364401  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  24364400 ttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 24364301  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  24364300 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatgt 24364208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19879387 - 19879094
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  19879387 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatggcaggt 19879288  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  19879287 gtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttac 19879188  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  19879187 cccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 19879094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 8766297 - 8766615
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8766297 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8766396  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||| |||| || |||  | ||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  8766397 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 8766496  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8766497 atttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  8766597 tagcggatccttcgcatgt 8766615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18794779 - 18794504
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  18794779 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 18794680  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  18794679 gtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggtttgc 18794580  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || |||||    
T  18794579 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacgaaagtatgtaccggatccgtcgcatgt 18794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 21564324 - 21564590
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  21564324 gtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctttgacaggt 21564423  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  21564424 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagtgggtttgc 21564523  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    | || |||||||  |||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21564524 cgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatgtaccggatcc 21564590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 34645778 - 34646071
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||| |||    
T  34645778 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggt 34645877  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  34645878 gtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattac 34645977  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | |||||||| || || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  34645978 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtacgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 34646071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17415625 - 17415365
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    || || ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||    
T  17415625 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttg 17415526  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17415525 agtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 17415426  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctt 346  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  17415425 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 11287790 - 11288083
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||    
T  11287790 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccctatgacgggt 11287889  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  11287890 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttac 11287989  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||| | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  11287990 cccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatgt 11288083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 11280697 - 11280990
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| | | |||| |||    
T  11280697 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacacctatgacaggt 11280796  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||| ||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  11280797 gtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttac 11280896  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||| | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  11280897 cccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatgt 11280990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  119 caagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagag 218  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 27560759 - 27561066
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  27560759 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 27560858  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  27560859 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 27560958  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  27560959 gtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcgg 27561058  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  27561059 aagtatgt 27561066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22434021 - 22433927
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434021 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1640876 - 1640715
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1640876 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtc 1640777  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    || | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1640776 acccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 14381609 - 14381850
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  14381609 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttg 14381708  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  14381709 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 14381808  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14381809 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagt 14381850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750900
Alignment:
Q  147 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 246  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  247 tttgaagtcaaagaagttgactccg 271  Q
     ||||| || ||||||| |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactccg 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18801081 - 18800858
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18801081 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18800982  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| |||||  ||||||  |||||||| ||| |||||||| | |  || ||||||||    
T  18800981 agtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtcc 18800882  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttgg 309  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  18800881 atatcagatatcagagagggttgg 18800858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16098168 - 16098005
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  16098168 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 16098069  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16098068 tgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 28282955 - 28283262
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  28282955 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 28283054  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||    
T  28283055 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggccc 28283154  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||  | |||    
T  28283155 gtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 28283254  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  28283255 aagtatgt 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 16382536 - 16382699
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  16382536 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16382635  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16382636 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 16382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 25743236 - 25743413
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  25743236 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 25743335  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || || ||||||||||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25743336 agttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 25743413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25655604 - 25655456
Alignment:
Q  104 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || |    
T  25655604 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatc 25655505  T
Q  204 atgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 252  Q
    |||||||||||||||| | ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  25655504 atgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgctttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18571769 - 18571622
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  18571769 gttaagatgattcaggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 18571670  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    | |||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18571669 tatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagt 18571622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 18838057 - 18838234
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  18838057 agactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18838156  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || |||||||||||| | || | || |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18838157 agttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 18838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 1648947 - 1649094
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  1648947 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 1649046  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1649047 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 15078513 - 15078690
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| | ||||||||    
T  15078513 agactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttca 15078612  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||  || || ||||| ||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15078613 ggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 21413101 - 21413248
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || |||     
T  21413101 gttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcata 21413200  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    |||| ||| |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21413201 tgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23996366 - 23996203
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |    
T  23996366 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 23996267  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23996266 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16233341 - 16233167
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  16233341 agactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 16233242  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 267  Q
     |  || || ||||||||||| || || | || |||||| || ||||| ||||| |||||||  | |||||||||    
T  16233241 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787702
Alignment:
Q  304 agttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 403  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||     
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatcct 18787710  T
Q  404 tcccatgt 411  Q
    || |||||    
T  18787709 tcgcatgt 18787702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1640710 - 1640595
Alignment:
Q  314 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtga 413  Q
    ||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| |    
T  1640710 gtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttcacatgtta 1640611  T
Q  414 tccaaagtgatgatgt 429  Q
    | | ||| ||||||||    
T  1640610 ttccaagagatgatgt 1640595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 17319 - 17665
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  17319 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatc 17418  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17419 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 17518  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519 cccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 17618  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17619 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaactgatgatgt 17665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 11553095 - 11553451
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11553095 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgc 11553194  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11553195 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 11553294  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11553295 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 11553394  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  11553395 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 11553451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12687778 - 12687422
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12687778 aggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 12687679  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12687678 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12687579  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12687578 agtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgt 12687479  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12687478 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12687422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Original strand, 15154652 - 15155001
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154652 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 15154751  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154752 atcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 15154851  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  15154852 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaa 15154951  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15154952 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15155001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14954897 - 14954541
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14954897 aggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14954798  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  14954797 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaa 14954698  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14954697 agtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 14954598  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14954597 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14954541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8198905 - 8198549
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8198806  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8198805 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8198706  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8198705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 8198606  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  8198605 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 8198549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10871272 - 10870916
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871272 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10871173  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10871172 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10871073  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  10871072 ggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10870973  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  10870972 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 10870916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14332674 - 14332318
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14332674 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 14332575  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14332574 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14332475  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  14332474 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 14332375  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332374 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 11237206 - 11237562
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237206 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 11237305  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237306 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 11237405  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  11237406 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 11237505  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  11237506 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 11237562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8707882 - 8707526
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707882 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8707783  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707782 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8707683  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8707682 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8707583  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8707582 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 8707526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 15161050 - 15161406
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161050 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15161149  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15161150 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15161249  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15161250 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15161349  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15161350 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15161406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18178019 - 18177663
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178019 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18177920  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18177919 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18177820  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18177819 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 18177720  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  18177719 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 18177663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 18551751 - 18552107
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551751 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18551850  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18551851 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 18551950  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  18551951 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 18552050  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  18552051 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 18552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 44791344 - 44791700
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791344 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44791443  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44791444 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccga 44791543  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  44791544 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44791643  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  44791644 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagcgacgatgt 44791700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 429
Target Start/End: Original strand, 23516768 - 23517118
Alignment:
Q  79 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516768 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 23516867  T
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23516868 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 23516967  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23516968 ttggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 23517067  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  23517068 acttcggaagtatattccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 23517118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13686341 - 13685984
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686341 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13686242  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13686241 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13686142  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatg-ttttccatg 371  Q
      || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  13686141 agttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatg 13686042  T
Q  372 tgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13686041 tgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 13685984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14038079 - 14037728
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038079 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14037980  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14037979 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14037880  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  14037879 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14037780  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14037779 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14037728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14348109 - 14347758
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14348109 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14348010  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14348009 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14347910  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  14347909 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14347810  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14347809 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14347758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 84 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15204145 - 15203800
Alignment:
Q  84 ttgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 183  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15204145 ttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacct 15204046  T
Q  184 tgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15204045 tgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggt 15203946  T
Q  284 ccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttc 383  Q
    | |||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15203945 ctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 15203846  T
Q  384 ggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  15203845 ggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcgaaagagatgatgt 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15624816 - 15624539
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15624816 gttcatcaaactacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttg 15624717  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  15624716 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttc 15624617  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgt 363  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15624616 atatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 12206784 - 12207127
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||||||||| || || || ||  ||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  12206784 gttcagcagactacagaaaaggtcaaattgataaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatctta 12206883  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |    
T  12206884 agtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttc 12206983  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12206984 gtaccagatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 12207083  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  12207084 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 12207127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 411
Target Start/End: Original strand, 15102586 - 15102910
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||    
T  15102586 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttga 15102685  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||    
T  15102686 gtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccg 15102785  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15102786 tatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 15102885  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  15102886 agtatgtagcggatccttcgcatgt 15102910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19147476 - 19147133
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19147476 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 19147377  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19147376 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 19147277  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  19147276 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 19147177  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  19147176 aagtatgtagcggatccttcacatgttattctaagagatgatgt 19147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20746875 - 20746532
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  20746875 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 20746776  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20746775 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 20746676  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  20746675 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20746576  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20746575 aagtatgtagcggatccttcacatgttattctaagagatgatgt 20746532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 14264278 - 14264553
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||    
T  14264278 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggt 14264377  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || |    
T  14264378 gtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgc 14264477  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||    
T  14264478 caccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 14264553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 411
Target Start/End: Original strand, 8212163 - 8212437
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  8212163 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 8212262  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||    
T  8212263 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcc 8212362  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  8212363 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 8212437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Original strand, 11306298 - 11306575
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  11306298 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 11306397  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  11306398 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 11306497  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11306498 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 11306575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 49152515 - 49152238
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  49152515 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 49152416  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||    
T  49152415 ttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcc 49152316  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  49152315 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 49152238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 11388412 - 11388736
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | ||    
T  11388412 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatg 11388511  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11388512 agtttcaaga-ggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 11388610  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||    
T  11388611 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 11388710  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  11388711 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 11388736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21662233 - 21661885
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||  ||| || ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21662233 cagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21662134  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | |||||||| |||    
T  21662133 ggatcttgagtttca---aggagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggttt 21662037  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |    
T  21662036 attggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21661937  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |  ||||||||| |  ||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  21661936 aactacaaaagtatgtttcatatccatctcatgtgattccaagagatgatgt 21661885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 16950455 - 16950762
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||    
T  16950455 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatg 16950554  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  16950555 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16950654  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  16950655 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcgg 16950754  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  16950755 aagtatgt 16950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 16072328 - 16072603
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||    
T  16072328 gtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggt 16072427  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |    |||||| || |    
T  16072428 gtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggtttgc 16072527  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16072528 caccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 246
Target Start/End: Original strand, 35964848 - 35965016
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35964848 cagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 35964947  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 246  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  35964948 ggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13665813 - 13665475
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |  ||||    
T  13665813 gttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttg 13665714  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |     ||    
T  13665713 agtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----cc 13665619  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  13665618 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 13665519  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  13665518 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 13665475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6413776 - 6413469
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||    
T  6413776 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttg 6413677  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || |||||| |    
T  6413676 agtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttc 6413577  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |    
T  6413576 gaatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcag 6413477  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  6413476 aagtatgt 6413469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 14286360 - 14286667
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||    
T  14286360 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttg 14286459  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||     
T  14286460 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtct 14286559  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14286560 gtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14286659  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  14286660 aagtatgt 14286667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9596334 - 9596236
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596334 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12455960 - 12455625
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||    
T  12455960 agactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttca 12455861  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |  || ||||||| |||||||    
T  12455860 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcag 12455761  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| ||| || | || || ||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12455760 atttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  12455661 tagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatgt 12455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 18053937 - 18054244
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  18053937 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttg 18054036  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||    
T  18054037 agtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggccc 18054136  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  18054137 gtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 18054236  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  18054237 aagtatgt 18054244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13021571 - 13021279
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| || |    
T  13021571 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcg 13021472  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |   |||||| |||||||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  13021471 taaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttcc 13021372  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || |||||||| | ||| ||||||||    
T  13021371 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatctttcacatgtgattccaagagatgatgt 13021279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14130088 - 14129813
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||   ||||  ||    
T  14130088 gtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagt 14129989  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||| |||| ||| |||| || || |    
T  14129988 gtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgc 14129889  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  14129888 caccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 14129813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14433906 - 14433631
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||   ||||  ||    
T  14433906 gtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagt 14433807  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||| |||| ||| |||| || || |    
T  14433806 gtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgc 14433707  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  14433706 caccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 14433631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14936590 - 14936443
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || ||||    
T  14936590 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 14936491  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14936490 tgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 393
Target Start/End: Original strand, 23199763 - 23200034
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||| |    
T  23199763 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23199862  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgta 321  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||| || | ||    
T  23199863 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23199962  T
Q  322 tcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23199963 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23200034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 393
Target Start/End: Original strand, 23505890 - 23506161
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||| |    
T  23505890 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23505989  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgta 321  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||| || | ||    
T  23505990 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23506089  T
Q  322 tcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23506090 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23506161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4440185 - 4440008
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  4440185 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 4440086  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||  || || ||||||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4440085 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 4440008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 11772244 - 11772373
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11772244 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacc 11772343  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11772344 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttt 11772373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 393
Target Start/End: Original strand, 26288071 - 26288327
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || |||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| |||    
T  26288071 gtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggt 26288169  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || ||||| || |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||| |||| || || |    
T  26288170 gtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagttggtttgc 26288269  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  26288270 caccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaaatatgt 26288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 1391 - 1698
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||    || || ||||| | ||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |  ||||    
T  1391 gttcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttg 1490  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| ||| ||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||     
T  1491 agtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtct 1590  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  1591 gtatcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcgg 1690  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||| ||||    
T  1691 aaggatgt 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15364183 - 15364036
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || ||||    
T  15364183 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 15364084  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15364083 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 309
Target Start/End: Original strand, 26118640 - 26118812
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  26118640 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 26118739  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgg 309  Q
    |||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26118740 ttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagatagagttgg 26118812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 12368603 - 12368766
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||  || || || |    
T  12368603 gttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacg 12368702  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  12368703 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12368766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7824143 - 7823980
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  7824143 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7824044  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  7824043 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 7823980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 27107801 - 27107964
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  27107801 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27107900  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  27107901 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 27107964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 12254326 - 12254387
Alignment:
Q  368 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12254326 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 12254387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 41144 - 41327
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || | |||||  ||| ||||||| |  || || | | |||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  41144 cagagattgttcagcagacgaccgagaaggtcaaaacgattcgggaggaaatgaaagcatcacaaattagacagaagagctatcatgataaacgaagaaa 41243  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
    | |  | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  41244 ataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 270
Target Start/End: Original strand, 21674562 - 21674723
Alignment:
Q  109 taagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||| ||||| |  || || ||||||    
T  21674562 taagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtg 21674661  T
Q  209 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21674662 tttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcc 21674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15340569 - 15340454
Alignment:
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  15340569 attggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcac 15340470  T
Q  378 aacttcggaagtatgt 393  Q
    | ||||||||||||||    
T  15340469 agcttcggaagtatgt 15340454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45146812 - 45146652
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||  | | |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||    
T  45146812 agactacggaaaatgttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtaaatagaagagttatcattataagagtaggaaggacattgtgtttca 45146713  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     |  || || ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45146712 agttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatg-gactggtgttggacgtgctttgaagt 45146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17923938 - 17923760
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | | || ||||||| |||||||||| | || |  ||  ||||||||||    
T  17923938 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagaataggcagaagagttgtcatgataagaggaggatggacattgagtttca 17923839  T
Q  193 ggaaggagaccatgtg-tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||  || || |||||| ||||| ||||| | ||  || || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17923838 ggttggtgatcatgtgttttttaagagtgaatccggtaaccggtggtggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcc 17923760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12193811 - 12193654
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| | || ||||||||||||| |||| | || || ||  |||| |||||||    
T  12193811 actacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgttaagaggaggaatgacattgattttcagg 12193712  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 252  Q
      || || ||||| |||||||| || | || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12193711 ttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaa 12193654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 429
Target Start/End: Original strand, 15479323 - 15479465
Alignment:
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||  | ||||    
T  15479323 tatcagatctctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcgga 15479422  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15479423 agtatgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 15479465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 429
Target Start/End: Original strand, 26118817 - 26118911
Alignment:
Q  335 ccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  26118817 ccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatgt 26118911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13378955 - 13378796
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||||| |||| ||| ||||| |||||||| | |||||  |  ||||||||||    
T  13378955 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttca 13378856  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 252  Q
    ||  || || ||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||| |||||||||||    
T  13378855 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaa 13378796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5764758 - 5764672
Alignment:
Q  85 tgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||| |   | || ||||||||||||| ||||||    
T  5764758 tgttcaacagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaggatgaaggcatcgcaaatcaggcagaagagttatcatggtaagcg 5764672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 17145288 - 17145428
Alignment:
Q  110 aagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgt 209  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  || |||||| | || |||||||||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |  ||||  |||||||    
T  17145288 aagatgattcaagaaaatatgaaagcttctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggagctcatgtgt 17145387  T
Q  210 ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 250  Q
    |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||| ||||    
T  17145388 ttttaagagtgaataatgtaaccggtgttggacgtgttttg 17145428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12456993 - 12456940
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12456993 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13353296 - 13353247
Alignment:
Q  205 tgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353296 tgtgtttctgagagtgaatactgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 13353247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 429
Target Start/End: Original strand, 13634038 - 13634070
Alignment:
Q  397 ggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13634038 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 13634070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 4392 - 4748
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 4491  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4492 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 4591  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4592 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 4691  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4692 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 64018 - 64374
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64018 aggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgt 64117  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  64118 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtga 64217  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  64218 gattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 64317  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  64318 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 64374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 639
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  995 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcat 896  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  895 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 796  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  795 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 696  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  695 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 5977
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6333 aggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgc 6234  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6233 aggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6134  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  6133 gatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 6034  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6033 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6691 - 6335
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6691 aggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 6592  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6591 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6492  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||    
T  6491 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgt 6392  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6391 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatcctaggtgatgatgt 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 681 - 1036
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 780  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  781 aggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttt-gagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 879  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  880 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgt 979  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  980 ggagcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtggtgatgt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 81 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6334 - 5986
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6334 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 6235  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6234 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttatt 6135  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  6134 ggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaac 6035  T
Q  381 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6034 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 5986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 1524 - 1831
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  ||||    
T  1524 gttcatcagactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttg 1623  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||  | ||| ||||| |||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  1624 agtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtcc 1723  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  1724 gtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 1823  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  1824 aagtatgt 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22993 - 22816
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  22993 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 22894  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22893 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 22816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 127186 - 127542
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  127186 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 127285  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  127286 aggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 127385  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  127386 gatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgt 127485  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  127486 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 127542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 180536 - 180180
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180536 aggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 180437  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180436 agaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccga 180337  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  180336 gatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagt 180237  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  180236 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgttgatgt 180180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 219404 - 219760
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219404 aggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 219503  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  219504 aggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccga 219603  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  219604 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 219703  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  219704 atcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 219760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 229362 - 229006
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  229362 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 229263  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  229262 agaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 229163  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||    
T  229162 gatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgt 229063  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  229062 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 229006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 33016 - 33179
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  33016 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 33115  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33116 tgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 33179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5540 - 5184
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  5540 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgc 5441  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5440 aggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccga 5341  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  5340 gatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 5241  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5240 gtcgcaacttcgtaattatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 73 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 43473 - 43123
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  43473 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgc 43374  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43373 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43274  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43273 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 43174  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43173 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 43123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8797 - 8467
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8797 gagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 8698  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  8697 atcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 8598  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8597 tggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 8498  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8497 cttcggaagtatgttccggatccatctcatg 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13966 - 13834
Alignment:
Q  92 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 191  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  13966 cagactactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttt 13867  T
Q  192 aggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactc 224  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13866 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 50564 - 50830
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  50564 gtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 50663  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| || |    
T  50664 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgc 50763  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  50764 cccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatcc 50830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 106594 - 106757
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |  || |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  106594 gttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 106693  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  106694 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcc 106757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9662 - 9306
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 aggaccagagattgtttaacaaactaccgagtaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9563  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9562 aggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactccta 9463  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  9462 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 9363  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9362 gtcgcaacttcgaaagtatgttctagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 377
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 634  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  633 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 534  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
     ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  533 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 434  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  433 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 79 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1452 - 1102
Alignment:
Q  79 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 178  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||    
T  1452 agagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaa 1353  T
Q  179 gatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 1253  T
Q  279 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  1252 ttgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgca 1153  T
Q  379 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1152 acttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 95 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17284 - 16950
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17284 actactgtgaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 17185  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17184 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 17085  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17084 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 16985  T
Q  395 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16984 ctggatgcatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7689 - 7340
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7689 gagactgttcaacagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 7590  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  7589 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 7490  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7489 tggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 7390  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7389 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 81 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14350 - 14002
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14350 agattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagaga 14251  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14250 tcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttatt 14151  T
Q  281 ggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaac 380  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||||||||    
T  14150 ggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaac 14051  T
Q  381 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14050 ttccgaagtatgtacagaatccattccatgtgatccaaactgatgatgt 14002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31700 - 31391
Alignment:
Q  102 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 201  Q
    ||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||| |    
T  31700 agaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggata 31601  T
Q  202 ccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaa 301  Q
     ||||||||| ||||||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||     
T  31600 tcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgat 31501  T
Q  302 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 401  Q
    ||  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31500 aggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatc 31401  T
Q  402 catcccatgt 411  Q
    | || |||||    
T  31400 cttcgcatgt 31391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17761 - 17660
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17761 aggaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgt 17662  T
Q  173 ag 174  Q
    ||    
T  17661 ag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 411
Target Start/End: Original strand, 109798 - 110136
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109798 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 109897  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  109898 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 109997  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
      || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  109998 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgt 110097  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  110098 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccctctcatgt 110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 112815 - 112522
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  112815 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 112716  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  112715 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttac 112616  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  112615 cccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 112522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 96009 - 96327
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  96009 agactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttca 96108  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  96109 ggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 96208  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  96209 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 96308  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    | || ||||| || |||||    
T  96309 tacctgatccttcacatgt 96327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15804 - 15456
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15804 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15705  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | || |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15704 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 15605  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  15604 tggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaa 15506  T
Q  380 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15505 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15967 - 15832
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15967 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15868  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttga 215  Q
    | || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15867 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 810 - 1165
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  810 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgt 909  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgt-tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 1008  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  1009 gatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgt 1108  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1109 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 32744 - 33095
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32744 cagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 32843  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32844 agatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagattt 32943  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32944 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 33043  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33044 aacttcggaagtatgttacggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 32 - 325
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32 gtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgactggt 131  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  132 gttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtgagtttac 231  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  232 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 15079 - 15422
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15079 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 15178  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||     
T  15179 agtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtct 15278  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15279 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15378  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  15379 aagtatgtttcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatgt 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15196 - 14840
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  15196 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagctt 15097  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15096 aggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccga 14997  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgt 372  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  14996 ggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 14897  T
Q  373 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14896 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagagatgatgt 14840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 109 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 162396 - 162076
Alignment:
Q  109 taagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtg 208  Q
    |||||||||| |||| | | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||     
T  162396 taagatgatttaagaaagagtgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgta 162297  T
Q  209 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttg 308  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  162296 tttttgagagtcactcctatgactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttg 162197  T
Q  309 gaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatccca 408  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162196 gaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatccca 162097  T
Q  409 tgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  162096 tgtgatccaaagtgatgatgt 162076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 448373 - 448022
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  448373 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaa 448274  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  448273 agaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 448174  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  448173 attggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgc 448074  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  448073 aacttcggaagtattttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 448022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 90932 - 91239
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  90932 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 91031  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||    
T  91032 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtcc 91131  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  91132 atattagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcgg 91231  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  91232 aagtatgt 91239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 78636 - 78813
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||  |||| |||||||  || |||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  78636 agactacggaaaaggttatgatgattcagtagaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 78735  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  78736 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 78813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175352
Alignment:
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaag 303  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaag 175352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7258 - 6900
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7258 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 7159  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtg-tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccg 271  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7158 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccg 7059  T
Q  272 agatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgca-tctttccaatttgcacgatgttttccat 370  Q
    |  || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  7058 aagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccat 6959  T
Q  371 gtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6958 gtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 95 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 3995
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  4329 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaag 4230  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4229 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagat 4130  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4129 atcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 4030  T
Q  395 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4029 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 3995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 26530 - 26876
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26530 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 26629  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26630 ttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattgg 26729  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||    
T  26730 cccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaactt 26829  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  26830 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagataatgt 26876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 195703 - 196027
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  195703 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 195802  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  195803 agtttcaggagggtgatcatgt-tttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtcc 195901  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  195902 gtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 196001  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  196002 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 196027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 148826 - 148533
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  | || || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| |||    
T  148826 gtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggt 148727  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||  |||| || || |    
T  148726 gtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgc 148627  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  148626 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 148533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Original strand, 68582 - 68765
Alignment:
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  68582 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 68681  T
Q  328 gggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  68682 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 68765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 121971 - 122134
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  121971 gttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 122070  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  122071 tatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 180209 - 180147
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  180209 gttaagatgattcaggagaagatgaagtcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 180147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 112327 - 111984
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| |||| ||||| || ||||  |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  112327 gttcaacaaactattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttg 112228  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  112227 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtcc 112128  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  112127 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 112028  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  112027 aagtatgtttcggatccatctcatgtgatcccaagagatgatgt 111984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 136 - 414
Target Start/End: Original strand, 203518 - 203796
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||    
T  203518 gtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttgtgacaggt 203617  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |    
T  203618 gctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgc 203717  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  203718 caccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgat 203796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 323010 - 322703
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  323010 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 322911  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  322910 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 322811  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  322810 atatcagatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 322711  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  322710 aagtatgt 322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 117874 - 117549
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  117874 gttcatcatactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 117775  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  117774 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 117675  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  117674 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 117575  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  117574 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 117549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 386118 - 385797
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  386118 agactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttca 386019  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
     || ||||| ||| | ||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| | || |||    
T  386018 agagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccag 385919  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  385918 atatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  385818 tagcggatccttcgcatgtgat 385797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28223 - 27930
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  28223 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggt 28124  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  28123 gttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttac 28024  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28023 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 27930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8109 - 7854
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8109 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 8010  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8009 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 7910  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7909 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtg 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 95 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3103
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  3437 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaag 3338  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  3337 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagat 3238  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3237 atttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 3138  T
Q  395 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  3137 ccggatccatcttacgtgatccaacgagatgatgt 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 252 - 603
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||    
T  252 cagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaa 351  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  352 agacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagattt 451  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  452 attggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 551  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  552 aacttcggaagtatgttatggatccatctcatgtgatcccaagagacgatgt 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 1
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  311 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgagtcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatc 212  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  211 ttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattgg 112  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  111 tccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcatatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 12  T
Q  383 cggaagtatgt 393  Q
    |||||||||||    
T  11 cggaagtatgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 16462 - 16808
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16462 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 16561  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  16562 ttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactgg 16661  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |   |||||    
T  16662 tccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatatgttccatgtattaaaactt 16761  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16762 cagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 968
Alignment:
Q  95 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 194  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  1301 actactgagaaggttaagacgatt-aagaaaaagtgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaag 1203  T
Q  195 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1202 aaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggat 1103  T
Q  295 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 394  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1102 atcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatgtt 1003  T
Q  395 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1002 ctggatccatcttatgtgatccaaggtgatgatgt 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 16408 - 16759
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16408 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggga 16507  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
     ||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16508 ggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagattt 16607  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  16608 attggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgc 16707  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16708 aacttcggaagtatgttcgggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 73 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22186 - 21932
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22186 aggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 22087  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22086 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21987  T
Q  273 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13320
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12969 cagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 13068  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13069 agatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagattt 13168  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||  ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  13169 attagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgc 13268  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  13269 aacttcagaagtatttttcggatccatctcatatgatcctaagagatgatgt 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 116905 - 117248
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  116905 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 117004  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  117005 agtttcaagaaagagaacaagtatttttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtcc 117104  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  117105 gtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcgg 117204  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  117205 aagtatgtttcagatctatctcatgtgattccaagggatgatgt 117248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 98300 - 98137
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |    
T  98300 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 98201  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  98200 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 98137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Original strand, 23553 - 23650
Alignment:
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || || |||||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23553 agaaaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Original strand, 25719 - 26062
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||    
T  25719 gttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttg 25818  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||  |||||||||||    
T  25819 agtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtcc 25918  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  25919 gtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 26018  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  26019 aagtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagggatgatgt 26062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49805 - 49506
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49805 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaag 49706  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 279  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49705 accttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 49606  T
Q  280 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 379  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  49605 tggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaa 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 886
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||||| || || || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1214 gttcagcaaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 1115  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1114 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtcc 1015  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||| ||    
T  1014 atatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttgg 915  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgat 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  914 aagtatgtttcggatccatctcatgtgat 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 207 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16920
Alignment:
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  307 tggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcc 406  Q
    |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccattt 16943  T
Q  407 catgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  16942 catgtgatccagagtgatgatgt 16920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 5588 - 5933
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| |||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  5588 attgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatc 5686  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| |||| |||    
T  5687 ttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatgg 5786  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    | ||||||| || ||| |||||||||| || || |||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  5787 ttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacat 5886  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  5887 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgattccaagggatgatgt 5933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 25068 - 25414
Alignment:
Q  83 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 182  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||| | ||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  25068 attgttcaccagactacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatc 25167  T
Q  183 ttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 282  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  25168 ttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattgg 25267  T
Q  283 tccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  25268 ctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 25367  T
Q  383 cggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  25368 cggaagtatgtatcggatccatcacatgtgattccaagggatgatgt 25414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 16225 - 16372
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| | || ||||| |  || || ||||||||||| || || | || |||||| ||||||     
T  16225 cagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggtgttt 16324  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 287  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  16325 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccgt 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7708 - 7522
Alignment:
Q  81 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7708 agattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaaga 7609  T
Q  181 tcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9284 - 9047
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9284 cagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaa 9185  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 agaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 9085  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggt 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9084 attggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7052 - 6940
Alignment:
Q  317 gcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatcc 416  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7052 gcgtatcgagtgggtttgccaccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 6953  T
Q  417 aaagtgatgatgt 429  Q
    |||| ||||||||    
T  6952 aaagagatgatgt 6940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 270
Target Start/End: Original strand, 351 - 517
Alignment:
Q  104 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  204 atgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 291
Target Start/End: Original strand, 767 - 985
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  767 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 866  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  867 agaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccga 966  T
Q  273 gatttattggtccgtatca 291  Q
      || ||||||||||||||    
T  967 agttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 429
Target Start/End: Original strand, 10774 - 11082
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10774 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 10873  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| |    
T  10874 actcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcat 10973  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaag 420  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | |||    
T  10974 atagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccaag 11073  T
Q  421 tgatgatgt 429  Q
     ||||||||    
T  11074 agatgatgt 11082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 86496 - 86847
Alignment:
Q  78 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||| || ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  86496 cagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaa 86595  T
Q  178 agatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 277  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  ||||| |||| |||    
T  86596 ggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggttt 86695  T
Q  278 attggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgc 377  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| || |||||||| |    
T  86696 attggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcac 86795  T
Q  378 aacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  86796 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgattctaagagatgatgt 86847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27825 - 27482
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  27825 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 27726  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  27725 agtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27626  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  27625 gtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 27526  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  27525 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 27482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1473
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  1149 gttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 1248  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||| || | |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1249 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccga-agttattggtcc 1347  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   ||| || ||   ||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  1348 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 1447  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  1448 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 1473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26448 - 26132
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || || | ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||    
T  26448 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttg 26349  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26348 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 26249  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  26248 gtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 26149  T
Q  386 aagtatgttccggatcc 402  Q
    ||||||||  |||||||    
T  26148 aagtatgtagcggatcc 26132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 393
Target Start/End: Original strand, 28820 - 29076
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28820 tcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtg 28919  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| |  ||    
T  28920 tctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttaccc 29019  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | | ||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29020 atcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 29076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 393
Target Start/End: Original strand, 40811 - 41067
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40811 tcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtg 40910  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| |  ||    
T  40911 tctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttaccc 41010  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    | | ||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  41011 atcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 41067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 136 - 348
Target Start/End: Original strand, 58456 - 58668
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  58456 gtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatgtgaccggt 58555  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  58556 gttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagtgggtttac 58655  T
Q  336 caccgcatctttc 348  Q
    |||||||||||||    
T  58656 caccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19375 - 19120
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||    
T  19375 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 19276  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  19275 taggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgcc 19176  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19175 accacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 74140 - 74038
Alignment:
Q  152 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 251  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |  || ||||||||| ||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||    
T  74140 aagagctatcatgataagagcaggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttga 74041  T
Q  252 agt 254  Q
    |||    
T  74040 agt 74038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 13901 - 14226
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13901 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 14000  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  14001 agtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtcc 14100  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14101 gtatcagatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14200  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  14201 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 14226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5224
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4960 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 5059  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| |  || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  5060 ggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 5159  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgca 357  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  5160 atatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Original strand, 10090 - 10426
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10090 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 10189  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  10190 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcag 10289  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  10290 agttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 10389  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    | |||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10390 taccggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 10426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 47430 - 47123
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  47430 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttg 47331  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  47330 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtcc 47231  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  47230 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 47131  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  47130 aagtatgt 47123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Original strand, 5956 - 6220
Alignment:
Q  128 atgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatg 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||| |     
T  5956 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactccta 6055  T
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6056 tgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagt 6155  T
Q  328 gggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6156 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgtttt-catgtgtcgcaacttcggaagtatgt 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3874
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | |||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  4181 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttg 4082  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4081 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 3982  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  3981 atatcagatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 3882  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  3881 aagtatgt 3874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 61
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    || || ||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  ||||    
T  404 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttg 305  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  304 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 205  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  204 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 105  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    || |||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  104 aaatatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3057 - 2750
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    || || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  3057 gttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 2958  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  || ||||||||    
T  2957 agtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtcc 2858  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2857 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 2758  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  2757 aagtatgt 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13364
Alignment:
Q  80 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 179  Q
    |||||||||||||| || || || || || || ||||||| ||||| |||||| |  || || ||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||     
T  13189 gagattgttcagcaaacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaacgaaggaaat 13288  T
Q  180 atcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc 255  Q
       | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13289 cattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcaatccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 13364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7352
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||| | |||| |||    
T  7086 gtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggt 7185  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  7186 gtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagtgggtttgc 7285  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7286 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatcc 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 18537 - 18862
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18537 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18636  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||      
T  18637 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggttt 18736  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18737 gtatcagatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18836  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  18837 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 18862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 411
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13686
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  13362 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 13461  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  13462 gtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 13561  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  13562 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 13661  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  13662 agtatgtagcggatccttcgcatgt 13686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20235 - 19973
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |    
T  20235 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtag 20136  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccacc 339  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  20135 gacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacc 20036  T
Q  340 gcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
     |||||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20035 acatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 19973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 411
Target Start/End: Original strand, 17132 - 17456
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  17132 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 17231  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  17232 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 17331  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  17332 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 17431  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  17432 agtatgtagcggatccttcgcatgt 17456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6483 - 6164
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6483 agactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 6384  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgttt-ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 291  Q
    |||||| |||||||| |||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||    
T  6383 ggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 6284  T
Q  292 gatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 391  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| || | || || ||| | | |||||| |||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||    
T  6283 gatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtat 6184  T
Q  392 gttccggatccatcccatgt 411  Q
    || || ||||| || |||||    
T  6183 gtaccagatccttcgcatgt 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37508 - 37201
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   |||    
T  37508 gttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattg 37409  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| |   |||| ||||||||| | |||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  37408 agtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtct 37309  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  37308 atatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcgg 37209  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  37208 aagtatgt 37201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 312
Target Start/End: Original strand, 38180 - 38400
Alignment:
Q  92 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||| | | ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  ||||||||||    
T  38180 cagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 38279  T
Q  192 aggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 291  Q
    | || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38280 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatca 38379  T
Q  292 gatatcagaaagagttggaac 312  Q
    |||||| || || ||||||||    
T  38380 gatatctgagagggttggaac 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 27387 - 27563
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| |||    
T  27387 gtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggt 27486  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaac 312  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27487 gtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaac 27563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 172
Alignment:
Q  121 agagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtc 220  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||     
T  462 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggtt 363  T
Q  221 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 320  Q
    |||| | |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  362 actcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcat 263  T
Q  321 atcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    || |||| || || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  262 atagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9779
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |     | ||    
T  10099 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtg 10005  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10004 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 9905  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9904 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 9805  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  9804 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 9779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14391 - 14067
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||    
T  14391 gttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttg 14292  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  14291 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttc 14192  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||   |||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  14191 gtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14093  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  14092 aagtatgtagcggatccttcacatgt 14067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 42333 - 42658
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  42333 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 42432  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  42433 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 42532  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42533 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 42632  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  42633 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 42658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 47399 - 47724
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  47399 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 47498  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||  ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  47499 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 47598  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47599 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 47698  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  47699 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 47724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2252
Alignment:
Q  212 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 290  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2330 ttgagagtcactctagtgataggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5056 - 4760
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5056 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 4957  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  4956 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtcc 4857  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 382  Q
    |||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4856 gtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 402
Target Start/End: Original strand, 21671 - 21987
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  21671 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 21770  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||  ||||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||    
T  21771 agtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtcc 21870  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21871 gtataagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21970  T
Q  386 aagtatgttccggatcc 402  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21971 aagtatgtagcggatcc 21987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26091 - 26006
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  26091 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 26006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11193 - 10869
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  11193 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 11094  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  11093 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 10994  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  10993 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 10894  T
Q  387 agtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||  ||||||| || |||||    
T  10893 agtatgtagcggatccttcgcatgt 10869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 402
Target Start/End: Original strand, 400 - 715
Alignment:
Q  87 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  400 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 499  T
Q  187 gtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 286  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  500 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 599  T
Q  287 tatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgga 386  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||||||||    
T  600 tatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 699  T
Q  387 agtatgttccggatcc 402  Q
    |||||||  |||||||    
T  700 agtatgtagcggatcc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 7831 - 7994
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  7831 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7930  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7931 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 7994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 16764 - 17056
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  16764 tcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 16863  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    | || |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||    
T  16864 tcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgcc 16963  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  16964 acctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccaagggatgatgt 17056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 393
Target Start/End: Original strand, 51918 - 52170
Alignment:
Q  141 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 240  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  51918 agagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtagg 52017  T
Q  241 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 340  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||     
T  52018 acatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacca 52117  T
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52118 catctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgt 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 411
Target Start/End: Original strand, 14257 - 14576
Alignment:
Q  92 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 191  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||||  |||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||     
T  14257 cagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttt 14356  T
Q  192 aggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 291  Q
    |||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  14357 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 14456  T
Q  292 gatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 391  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14457 gatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtat 14556  T
Q  392 gttccggatccatcccatgt 411  Q
    || |||||||| || |||||    
T  14557 gtaccggatccttcgcatgt 14576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 411
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9202
Alignment:
Q  248 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 347  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  348 ccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    | || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4717
Alignment:
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  328 gggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 378  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatctgtcgca 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 429
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37089
Alignment:
Q  314 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtga 413  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctgatgtga 37073  T
Q  414 tccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||| | |||||||||    
T  37074 tccagaatgatgatgt 37089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4561
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4441 aggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 4540  T
Q  173 agaaaagatcttgagtttcag 193  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  4541 aggaaagatctcgagtttcag 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 18993 - 19045
Alignment:
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18993 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 19045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16931 - 16639
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  16931 tcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 16832  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||| | || || || ||    
T  16831 ttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgttggtttgcc 16732  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  16731 accacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatgt 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 429
Target Start/End: Original strand, 25919 - 26208
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |    
T  25919 cagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtag 26018  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccacc 339  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26019 gatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacc 26118  T
Q  340 gcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
     |||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  26119 acatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatgt 26208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19105 - 18830
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  19105 gtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 19006  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || |    
T  19005 gtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggtttgc 18906  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| || |||||    
T  18905 cacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattgtggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 18830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23267 - 23094
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  23267 gtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 23168  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgg 309  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  23167 gtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Original strand, 1223 - 1485
Alignment:
Q  140 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |    
T  1223 cagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtag 1322  T
Q  240 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccacc 339  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||   | | || || |||||    
T  1323 gacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaataggtttgccacc 1422  T
Q  340 gcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
     |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1423 acatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 61220 - 61538
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  61220 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 61319  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  61320 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 61419  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  61420 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  61520 tagcggatccttcgcatgt 61538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 393
Target Start/End: Original strand, 67608 - 67908
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  67608 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 67707  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  67708 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 67807  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  67808 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T
Q  393 t 393  Q
    |    
T  67908 t 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 52186 - 52504
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  52186 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 52285  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  52286 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 52385  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52386 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  52486 tagcggatccttcgcatgt 52504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27531 - 27207
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | | || |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |  ||||    
T  27531 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttg 27433  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  27432 aatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27333  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  27332 gtatcagatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 27233  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    || |||||  ||||||| || |||||    
T  27232 aaatatgtagcggatccttcgcatgt 27207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40045 - 39720
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||    
T  40045 gttcatcagactaacgagaaagtcaagattataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttg 39946  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  39945 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 39846  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  39845 gtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 39746  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  39745 aagtatgtagcggatccttctcatgt 39720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4191 - 3872
Alignment:
Q  92 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 191  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  4191 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 4092  T
Q  192 aggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 291  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||    
T  4091 aagatggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatca 3992  T
Q  292 gatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 391  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| ||   ||| |  || || || |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3991 gatatctgagagggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 3892  T
Q  392 gttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3891 gtagcggatccttcgcatgt 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 5002 - 5309
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5002 gttcatcagaccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 5101  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5102 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttc 5201  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||  |||| ||   |||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  5202 gtatcagatatctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 5301  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  5302 aagtatgt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20410 - 20103
Alignment:
Q  104 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 203  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || |    
T  20410 aaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatc 20311  T
Q  204 atgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaag 303  Q
    |||||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  20310 atgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagag 20211  T
Q  304 agttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 403  Q
     |||||||  ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||     
T  20210 tgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatcct 20111  T
Q  404 tcccatgt 411  Q
    || |||||    
T  20110 tcgcatgt 20103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43804 - 43486
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || ||||| | |||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  43804 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 43705  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  43704 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 43605  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43604 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  43504 tagcggatccttcgcatgt 43486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44816 - 44498
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || ||||| | |||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  44816 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 44717  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  44716 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 44617  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44616 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  44516 tagcggatccttcgcatgt 44498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36036
Alignment:
Q  228 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 327  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||| ||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  328 gggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 36036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 428
Target Start/End: Original strand, 38942 - 39229
Alignment:
Q  141 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  38942 agagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcgg 39041  T
Q  241 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 340  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || || |||||     
T  39042 tcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccacca 39141  T
Q  341 catctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatg 428  Q
    |||||||  || |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  39142 catctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcagagggatgatg 39229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1167
Alignment:
Q  184 tgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 283  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  284 ccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttc 383  Q
    | ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  384 ggaagtatgttccggatcc 402  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatcc 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 26203 - 26264
Alignment:
Q  368 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26203 catgtatcgtaacttcggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 26264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 411
Target Start/End: Original strand, 49214 - 49532
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49214 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 49313  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
     || || || ||||||||| |||| |||| || | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  49314 agagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 49413  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49414 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T
Q  393 ttccggatccatcccatgt 411  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  49514 tagcggatccttcgcatgt 49532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26516 - 26224
Alignment:
Q  137 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||    
T  26516 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 26417  T
Q  237 ttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacc 336  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||| |||  || || ||    
T  26416 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgcc 26317  T
Q  337 accgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||  || |||||||| | ||| ||||||||    
T  26316 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatctttcgcatgtgattccaagggatgatgt 26224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 509
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| |||    
T  784 gtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactcctatgacaggt 685  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || ||  |||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  684 gtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgc 585  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  584 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgt 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 57867 - 58141
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| |||    
T  57867 gtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggt 57965  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| || || |    
T  57966 gtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgc 58065  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  58066 caccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 58141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 411
Target Start/End: Original strand, 49033 - 49358
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  49033 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 49132  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| || | | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  49133 agtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 49232  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  49233 gtatcagatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 49332  T
Q  386 aagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  49333 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 49358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 402
Target Start/End: Original strand, 33727 - 33993
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  33727 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggt 33826  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattac 335  Q
    || || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| || |    
T  33827 gtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgc 33926  T
Q  336 caccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    | || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  33927 cccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40380
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  40543 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 40444  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  40443 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 40380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 248912 - 248612
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  248912 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 248813  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  248812 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 248713  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| | ||||||||  ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  248712 atttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T
Q  393 t 393  Q
    |    
T  248612 t 248612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 12781 - 13088
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || ||||| | |||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  12781 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 12880  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||  || ||||||||    
T  12881 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtcc 12980  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  12981 gtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 13080  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  13081 aagtatgt 13088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 411
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4464
Alignment:
Q  182 cttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 281  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |    
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  282 gtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaact 381  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 4434  T
Q  382 tcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  4435 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgt 4464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 7238 - 7543
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||     
T  7238 gttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggccctta 7337  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 285  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||  | |||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  7338 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 7437  T
Q  286 gtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 385  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  7438 gtatcagatttcagaa--ggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 7535  T
Q  386 aagtatgt 393  Q
    ||||||||    
T  7536 aagtatgt 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43082 - 42746
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || ||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  43082 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 42983  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  42982 ggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 42883  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 392  Q
    || ||||| |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  42882 atttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatc 42783  T
Q  393 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  42782 tagcggatccttcacatgttattccaagggatgatgt 42746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 6238
Alignment:
Q  332 ttaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6333 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14822 - 14661
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  14822 agactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 14723  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||  || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14722 ggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3810
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 172  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706 aggaccagagatagttcagcaaactaacgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 3805  T
Q  173 agaaa 177  Q
    |||||    
T  3806 agaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 14758 - 14921
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||  || || ||||    
T  14758 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatg 14857  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14858 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136109
Alignment:
Q  233 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggat 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  333 taccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 402  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 136109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 28287 - 28467
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| || | ||| || ||||    
T  28287 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatg 28386  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 287  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  28387 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgatttgttggaccgt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 46439 - 46276
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||||    
T  46439 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46340  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    |||||||||| || | || ||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46339 tgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 393
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2173
Alignment:
Q  243 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgca 342  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  343 tctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14956 - 14779
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  14956 agactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 14857  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||||||||| || || | || ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14856 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43837 - 43738
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43837 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 43738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1916
Alignment:
Q  138 cgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  2048 cgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgt 1949  T
Q  238 tggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1948 aggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 393
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13560
Alignment:
Q  213 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaac 312  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||  |||||||||||| || || ||||||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  313 ggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
     ||| | ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 13560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3444 - 3281
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||  || || ||||    
T  3444 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatg 3345  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3344 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 3281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5469 - 5311
Alignment:
Q  136 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggt 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||   |||| |||    
T  5469 gtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggt 5370  T
Q  236 gttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 294  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  5369 gtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagat 5311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1222
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  1061 agactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttct 1160  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||  || || ||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1161 ggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 393 - 570
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 492  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || |  |||||||||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  493 agttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8394 - 8217
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  8394 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 8295  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
     |  || || ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  8294 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcc 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13030
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  13207 agactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 13108  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||  || || |||||||| |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13107 ggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 237
Target Start/End: Original strand, 1241 - 1385
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1241 agactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 1340  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgt 237  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || |||| | |||| |||||    
T  1341 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 3896 - 4059
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || ||||    
T  3896 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatg 3995  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  3996 tgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 3965 - 4112
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  3965 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 4064  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4065 tgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Original strand, 940 - 1094
Alignment:
Q  116 attcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttga 215  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  940 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 1039  T
Q  216 gagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    | || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1040 gggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 8898 - 9059
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  8898 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 8997  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||  || || ||| |||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  8998 ggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagt 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9286 - 9125
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  9286 agactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagatgagaaaggatattgagtttca 9187  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||  || || ||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9186 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12806 - 12738
Alignment:
Q  73 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgca 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12806 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24165 - 24002
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |  || || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  24165 gttaagatgattcaggagaagattaaagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 24066  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 270  Q
    ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24065 tgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 231843 - 231696
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||   |||||  |||||   || |||||||||||||||||| |  | || ||  ||||||||||||  || || ||||    
T  231843 gttaagatgattcaagggaagatgggagtgtcttagagtaagcagaagagttatcatgataagaggcggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 231744  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  231743 tgttttttagagtgaatcatgtaacatgtgttggacgtgctttgaagt 231696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23518
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |   | || || |    
T  23679 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacg 23580  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 268  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  23579 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 1
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 185  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||| | |||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  176 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 77  T
Q  186 agtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 261  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  76 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11068 - 10843
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | |||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  11068 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 10969  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 292  Q
    ||| || || ||||||||| | || || |||  | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  10968 ggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 10869  T
Q  293 atatcagaaagagttggaacggtggc 318  Q
    || ||||| ||  ||||||| |||||    
T  10868 atttcagagaggattggaacagtggc 10843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 7498 - 7559
Alignment:
Q  368 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 429  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7498 catgtgtcgcaacttcggaagtttgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 5467 - 5543
Alignment:
Q  101 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 177  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5467 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || |||||||||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || |||||||||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 174
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3443
Alignment:
Q  86 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 174  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3355 gttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 411
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3593
Alignment:
Q  305 gttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 404  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatcctt 3586  T
Q  405 cccatgt 411  Q
    | |||||    
T  3587 cacatgt 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45943 - 45835
Alignment:
Q  294 tatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 393  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45943 tatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 45844  T
Q  394 tccggatcc 402  Q
      |||||||    
T  45843 agcggatcc 45835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Original strand, 26178 - 26263
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  26178 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 26263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  122 gagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtca 221  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || |||||||||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  222 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 254  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10941 - 10781
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||| | || |||||||| ||||||||| | || || ||  ||||||||||||  || || ||||    
T  10941 gttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcatagtaggcagaagagttaccatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 10842  T
Q  207 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 267  Q
    ||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  10841 tgtttttgagagtgaattttgtaaccggtgttggacgtgctttcaagtgttagaagttgac 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13550 - 13397
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| || | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  13550 agactacagaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 13451  T
Q  193 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 246  Q
    ||  || || || || || |||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  13450 ggttggtgatcacgtattcttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 71518 - 71442
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 169  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  71518 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1530
Alignment:
Q  93 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| || | ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  1431 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18394 - 18332
Alignment:
Q  107 gttaagatgattcaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18394 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 18332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9287 - 9200
Alignment:
Q  324 gagtgggattaccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||  | ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  9287 gagtgggattgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgt 9200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 411
Target Start/End: Original strand, 886 - 962
Alignment:
Q  335 ccaccgcatctttccaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 411  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  886 ccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2723 times since January 2019
Visitors: 4011