View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0651_low_8 (Length: 281)

Name: NF0651_low_8
Description: NF0651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0651_low_8
NF0651_low_8
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (18-269)||(43700-43962)
scaffold0116 (18-213)||(47620-47815)
scaffold0116 (50-184)||(43879-44012)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (18-269)||(25956537-25956799)
chr6 (18-269)||(27851111-27851373)
chr6 (18-195)||(20734128-20734304)
chr6 (40-176)||(22420981-22421117)
chr6 (31-176)||(2201133-2201277)
chr6 (21-139)||(34296953-34297070)
chr6 (53-138)||(19399810-19399895)
chr6 (40-188)||(18927826-18927973)
chr6 (212-269)||(19399814-19399870)
chr6 (212-269)||(31630649-31630705)
chr6 (214-269)||(18927880-18927934)
chr6 (167-213)||(19399882-19399928)
chr6 (50-184)||(25956716-25956849)
chr6 (224-269)||(18708704-18708749)
chr6 (224-269)||(23151069-23151114)
chr6 (224-269)||(27322221-27322266)
chr6 (90-126)||(18708712-18708748)
chr6 (90-126)||(23151070-23151106)
chr6 (90-126)||(27322222-27322258)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (18-269)||(5889092-5889353)
chr5 (97-265)||(21741538-21741707)
chr5 (18-195)||(12122202-12122378)
chr5 (18-185)||(21557726-21557892)
chr5 (18-195)||(21555060-21555236)
chr5 (18-185)||(30615761-30615926)
chr5 (31-176)||(24212382-24212526)
chr5 (20-194)||(31455686-31455862)
chr5 (20-194)||(31455073-31455249)
chr5 (31-176)||(35852637-35852781)
chr5 (18-182)||(36460178-36460341)
chr5 (100-185)||(17875219-17875304)
chr5 (212-269)||(29915195-29915251)
chr5 (223-269)||(21871693-21871739)
chr5 (223-269)||(21875973-21876019)
chr5 (50-138)||(5889270-5889357)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (18-266)||(13844485-13844744)
chr4 (97-265)||(15099295-15099464)
chr4 (18-213)||(46642844-46643038)
chr4 (18-195)||(33186097-33186273)
chr4 (97-168)||(15190360-15190431)
chr4 (42-170)||(15880717-15880845)
chr4 (18-185)||(35812171-35812336)
chr4 (40-188)||(9923299-9923446)
chr4 (40-126)||(11479413-11479498)
chr4 (212-269)||(52873279-52873335)
chr4 (50-138)||(46642773-46642860)
chr4 (214-269)||(9923353-9923407)
chr4 (214-269)||(11479452-11479506)
chr4 (214-269)||(35812231-35812285)
chr4 (223-269)||(630896-630942)
chr4 (167-213)||(15868765-15868811)
chr4 (90-188)||(19609474-19609572)
chr4 (212-269)||(362189-362245)
chr4 (224-269)||(19609528-19609573)
chr4 (225-269)||(46642777-46642821)
chr4 (50-118)||(52873252-52873319)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (18-269)||(28194365-28194627)
chr1 (18-269)||(43697316-43697578)
chr1 (97-265)||(35981693-35981862)
chr1 (97-265)||(20636795-20636964)
chr1 (97-229)||(49261322-49261455)
chr1 (40-195)||(51274290-51274445)
chr1 (20-153)||(12328538-12328670)
chr1 (31-135)||(8885452-8885555)
chr1 (59-139)||(51326894-51326974)
chr1 (212-269)||(43543053-43543109)
chr1 (50-138)||(28194544-28194631)
chr1 (223-269)||(46382687-46382733)
chr1 (50-118)||(43543069-43543136)
chr1 (47-118)||(46382649-46382717)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (18-157)||(15439318-15439457)
chr7 (97-265)||(9389702-9389871)
chr7 (95-269)||(17232564-17232749)
chr7 (18-195)||(30820937-30821113)
chr7 (21-195)||(36685934-36686107)
chr7 (18-138)||(37727607-37727727)
chr7 (51-195)||(38480232-38480376)
chr7 (18-176)||(11092751-11092908)
chr7 (95-269)||(8468370-8468548)
chr7 (18-176)||(11085013-11085170)
chr7 (31-176)||(9320423-9320567)
chr7 (19-182)||(15213707-15213869)
chr7 (212-269)||(14270166-14270222)
chr7 (212-269)||(45847762-45847818)
chr7 (90-188)||(12371428-12371526)
chr7 (47-118)||(45847732-45847802)
chr7 (50-184)||(8468320-8468453)
chr7 (90-188)||(13148276-13148374)
chr7 (224-269)||(12371482-12371527)
chr7 (224-269)||(13148275-13148320)
chr7 (90-126)||(11066680-11066716)
chr7 (50-118)||(14270139-14270206)
chr7 (225-269)||(37727679-37727723)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (97-265)||(1465416-1465585)
chr3 (18-195)||(31224635-31224811)
chr3 (100-269)||(18439845-18440025)
chr3 (18-213)||(12269580-12269773)
chr3 (18-195)||(15447681-15447854)
chr3 (18-138)||(1988912-1989032)
chr3 (51-195)||(31415399-31415543)
chr3 (97-201)||(49389636-49389740)
chr3 (18-182)||(11912929-11913092)
chr3 (152-269)||(20630147-20630275)
chr3 (40-152)||(6808175-6808287)
chr3 (27-138)||(49389740-49389852)
chr3 (50-138)||(49969964-49970052)
chr3 (167-269)||(49969934-49970048)
chr3 (225-269)||(1988984-1989028)
chr3 (50-138)||(18439942-18440029)
chr3 (214-269)||(5841985-5842039)
chr3 (223-269)||(23413371-23413417)
chr3 (90-188)||(40807146-40807244)
chr3 (224-269)||(17538311-17538356)
chr3 (224-269)||(40807200-40807245)
chr3 (90-126)||(40812050-40812086)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (99-265)||(2299-2466)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (18-195)||(14335-14511)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (34-173)||(39833889-39834029)
chr8 (18-195)||(21579887-21580063)
chr8 (18-195)||(29763549-29763724)
chr8 (50-195)||(41680834-41680979)
chr8 (18-145)||(42560208-42560334)
chr8 (59-176)||(32807279-32807396)
chr8 (18-138)||(18760587-18760706)
chr8 (212-269)||(27472418-27472474)
chr8 (212-269)||(38550113-38550169)
chr8 (212-269)||(1327147-1327203)
chr8 (47-184)||(38550083-38550219)
chr8 (18-118)||(3273212-3273310)
chr8 (214-269)||(18760591-18760645)
chr8 (47-118)||(27472388-27472458)
chr8 (223-269)||(20982757-20982803)
chr8 (224-269)||(19139969-19140014)
chr8 (132-185)||(22965754-22965807)
chr8 (224-269)||(39936813-39936858)
chr8 (90-126)||(19139977-19140013)
chr8 (90-126)||(39936814-39936850)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (19-183)||(24865452-24865615)
chr2 (31-183)||(22500996-22501147)
chr2 (31-183)||(22508930-22509081)
chr2 (19-195)||(7672240-7672409)
chr2 (20-138)||(6576426-6576543)
chr2 (18-135)||(2524410-2524526)
chr2 (214-269)||(6576430-6576484)
chr2 (90-188)||(24781644-24781742)
chr2 (211-269)||(24883657-24883714)
chr2 (89-145)||(22501128-22501184)
chr2 (89-145)||(22509062-22509118)
chr2 (52-123)||(24436258-24436328)
chr2 (90-126)||(24883665-24883701)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (95-269)||(85191-85376)
scaffold0009 (50-138)||(85187-85274)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (19-195)||(1561-1736)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (18-183)||(6359-6523)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (31-185)||(10900-11053)
[»] scaffold0810 (3 HSPs)
scaffold0810 (18-86)||(3068-3136)
scaffold0810 (212-269)||(2988-3044)
scaffold0810 (90-138)||(2984-3032)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (63-195)||(479-611)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (18-182)||(4623-4786)
scaffold0599 (18-182)||(205-368)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (26-188)||(59295-59455)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (18-188)||(3066-3234)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (31-126)||(15421-15515)
scaffold0061 (31-126)||(24479-24573)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (40-188)||(5459-5606)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (40-126)||(869-954)
scaffold0335 (223-269)||(861-907)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (50-138)||(6771-6859)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (40-126)||(76954-77038)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (167-269)||(8350-8462)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (212-269)||(10991-11047)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (212-269)||(36170-36226)
scaffold0100 (50-126)||(36143-36218)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (90-188)||(10030-10128)
scaffold0134 (224-269)||(10029-10074)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (224-269)||(8189-8234)
scaffold0384 (90-126)||(8190-8226)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (212-269)||(362948-363004)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (225-269)||(9106-9150)
scaffold0375 (90-126)||(9106-9142)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43962
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg------ 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||          
T  43800 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 43899  T
Q  212 ------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43900 gtgagaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47815
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat 213  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  47720 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgat 47815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 184
Target Start/End: Original strand, 43879 - 44012
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||  ||||| | |    
T  43879 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatga 43977  T
Q  150 cttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctg 184  Q
    |||| |||| ||  ||  ||||||||| |||||||    
T  43978 cttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctg 44012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956799
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg------ 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||          
T  25956637 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 25956736  T
Q  212 ------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25956737 gtgagaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 25956799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851111
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  27851373 cagagaggatgaataagatgattta-tattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 27851275  T
Q  118 tt-gttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg----- 211  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||         
T  27851274 tttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgctgaatatgatttactttgatgcttaa 27851175  T
Q  212 -------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851174 tgtgagaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 27851111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734304
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgattta-tattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 20734226  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  20734227 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaat 20734304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22421117 - 22420981
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22421117 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattatta 22421018  T
Q  140 atgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
     |||| || |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22421017 ttgatagtgacttgttgcatatgtctaaatggtgttg 22420981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2201277 - 2201133
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2201277 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatga 2201179  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
     |||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||    
T  2201178 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatggtgttg 2201133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 34296953 - 34297070
Alignment:
Q  21 agaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattg 120  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34296953 agaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattg 34297051  T
Q  121 ttatatatgaagattatta 139  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  34297052 ttatatatgatgattatta 34297070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399810
Alignment:
Q  53 tttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattatt 19399810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18927973 - 18927826
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||     
T  18927973 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattg 18927875  T
Q  140 atgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
     ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  18927874 ttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 18927826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19399870 - 19399814
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19399870 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgat 19399814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 31630649 - 31630705
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  31630649 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttgtattagatgat 31630705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18927934 - 18927880
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  18927934 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 18927880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19399928 - 19399882
Alignment:
Q  167 aatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat 213  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19399928 aatgatgttgtcttactgttgtgatgaatatggtttactttgatgat 19399882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 184
Target Start/End: Original strand, 25956716 - 25956849
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||  ||||| | |    
T  25956716 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatga 25956814  T
Q  150 cttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctg 184  Q
    |||| |||| ||  ||  ||||||||| |||||||    
T  25956815 cttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctg 25956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18708749 - 18708704
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  18708749 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 18708704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 23151069 - 23151114
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  23151069 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 23151114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 27322221 - 27322266
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  27322221 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 27322266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18708748 - 18708712
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18708748 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 18708712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 23151070 - 23151106
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23151070 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 23151106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 27322222 - 27322258
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27322222 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 27322258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889353
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 5889191  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg------ 211  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||          
T  5889192 ttgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtctt-ctgtcgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 5889290  T
Q  212 ------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5889291 gtgagaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 5889353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 21741538 - 21741707
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21741538 gttgttgataagaagtttaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgtata 21741637  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21741638 tgattgaatttgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaaatcgtaatggttgtatttga 21741707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122378
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 12122300  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12122301 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaat 12122378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557892
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 21557824  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557825 ttgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 21557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555236
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||| || |||||||||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaa 21555158  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21555159 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 21555236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615761
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatat-tatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 30615829  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30615828 ttgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgt 30615761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24212526 - 24212382
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212526 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 24212428  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
     ||||| || ||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24212427 tgattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatgatgttg 24212382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455686
Alignment:
Q  20 gagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatt 119  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||   |||||||||||||||||||     
T  31455862 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaatc 31455764  T
Q  120 gttatatatgaa---gattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaa 194  Q
    |||||| ||||    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31455763 gttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaa 31455686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455073
Alignment:
Q  20 gagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatt 119  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||   |||||||| ||||||||||     
T  31455249 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaatc 31455151  T
Q  120 gttatatatgaa---gattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaa 194  Q
    |||||| ||||    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31455150 gttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaa 31455073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35852781 - 35852637
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35852781 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatacga 35852683  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
     |||||||| |||||||  |||| || |||||| |||||| |||||    
T  35852682 tgattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatggtgttg 35852637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460178
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 36460243  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgc 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||| || ||||  || |||| |||||||||||    
T  36460242 ttgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgc 36460178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17875304 - 17875219
Alignment:
Q  100 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  17875304 gttgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattatcttgctgt 17875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 29915195 - 29915251
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29915195 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 29915251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 21871693 - 21871739
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21871693 attgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgat 21871739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 21875973 - 21876019
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21875973 attgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgat 21876019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 5889270 - 5889357
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  5889270 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 5889357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844485
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgat------- 210  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||           
T  13844644 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttactgttgtgatgaatatgatttactttgattattaat 13844545  T
Q  211 -----gatatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgat 266  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13844544 gtgagaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgat 13844485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15099464 - 15099295
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15099464 gttgttgatatgaagttgaaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaaagatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 15099365  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15099364 tgattgactttgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttga 15099295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642844
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat 213  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  46642939 ttgttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtgatgaatatgatttaatttgatgat 46642844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186097
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaa 33186175  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  33186174 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaat 33186097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15190431 - 15190360
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15190431 gttgttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15880845 - 15880717
Alignment:
Q  42 aatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15880845 aatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattatt 15880746  T
Q  142 gatggttacttgttgtatatgtttaaatg 170  Q
    |||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  15880745 gatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 35812171 - 35812336
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35812171 cagagagtataaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaa 35812268  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
    | |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  |  |||||||||||||||||||    
T  35812269 tggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatgatgttgtcttgctgt 35812336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9923446 - 9923299
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||     
T  9923446 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattg 9923348  T
Q  140 atgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
     ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  9923347 ttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 9923299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Original strand, 11479413 - 11479498
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11479413 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 11479498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 52873279 - 52873335
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52873279 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 52873335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46642860 - 46642773
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  46642860 tgatttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattatt 46642773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9923407 - 9923353
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  9923407 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 9923353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Original strand, 11479452 - 11479506
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  11479452 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 11479506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Original strand, 35812231 - 35812285
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  35812231 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 35812285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 630896 - 630942
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  630896 attgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgat 630942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Original strand, 15868765 - 15868811
Alignment:
Q  167 aatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat 213  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15868765 aatgatgttgttttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatgat 15868811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19609572 - 19609474
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | |||||||  ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  19609572 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgttacatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 19609474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 362245 - 362189
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  362245 atatttatata-ttgtgaaagacgttgatatgaagttataatggttgtattagatgat 362189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19609573 - 19609528
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19609573 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 19609528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 46642821 - 46642777
Alignment:
Q  225 tgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46642821 tgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgat 46642777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 52873252 - 52873319
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52873252 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 52873319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194627
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg------ 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||          
T  28194465 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 28194564  T
Q  212 ------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
          |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194565 gtgagaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 28194627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697316
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatga----- 212  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||         
T  43697478 atgttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtcttgctgttgtgataaatatgatttactttgatgattaat 43697379  T
Q  213 -------tatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
           |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43697378 gtgagattattgatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgat 43697316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 35981693 - 35981862
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35981693 gttgttgatatgaagttgaaattgttgcacatgaagattactaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 35981792  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35981793 tgattgactttgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttga 35981862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20636964 - 20636795
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20636964 gttgttgacatgaagttgtaattgttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 20636865  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20636864 tgattttctttgatgaatttttatataattgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttga 20636795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49261455 - 49261322
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  49261455 gttgttgatatgaagttgtaattgttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgatactgtcttgctgtcgtgatgaata 49261356  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtga 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49261355 tgatttactttgatgaatatttatataattgtga 49261322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 195
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274445
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattatta 51274389  T
Q  140 atgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
     ||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||| ||| ||| || ||||||    
T  51274390 ttgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaat 51274445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328670
Alignment:
Q  20 gagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatt 119  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaatt 12328636  T
Q  120 gttatatatgaagattattaatgatggttacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12328637 gttatatatgatgattattattgatggtgacttg 12328670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8885555 - 8885452
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8885555 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgtaatatatga 8885457  T
Q  131 agatt 135  Q
     ||||    
T  8885456 tgatt 8885452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51326974 - 51326894
Alignment:
Q  59 ttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51326974 ttgatgattaaatgtgaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgttgattatta 51326894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43543109 - 43543053
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  43543109 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgat 43543053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 28194544 - 28194631
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  28194544 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 28194631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 46382687 - 46382733
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  46382687 attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttttattagatgat 46382733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43543136 - 43543069
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43543136 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 43543069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 46382649 - 46382717
Alignment:
Q  47 tgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46382649 tgttgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatt--gtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 46382717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439318
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 15439358  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15439357 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgt 15439318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 9389702 - 9389871
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9389702 gttgttgatatgaagttgaaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 9389801  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9389802 tgattgactttgatgaatctttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttga 9389871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17232749 - 17232564
Alignment:
Q  95 aagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaa 194  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  17232749 aagttgttgatatggagttgcaaatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtcatgctgttgtgatgaa 17232650  T
Q  195 tatgatttactttgatg------------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17232649 tatgatttactttgatgattaatgtgagaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttggaatggttgtattagatgat 17232564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821113
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||   ||||||||||||||||||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaa 30821035  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  30821036 ttgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaat 30821113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 36685934 - 36686107
Alignment:
Q  21 agaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattg 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  36685934 agaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattg 36686032  T
Q  121 ttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36686033 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 36686107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727727
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaa 37727706  T
Q  118 ttgttatatatgaagattatt 138  Q
    | ||| ||| ||| |||||||    
T  37727707 tggttgtatttgatgattatt 37727727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38480376 - 38480232
Alignment:
Q  51 gatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttac 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  38480376 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 38480277  T
Q  151 ttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38480276 ttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 38480232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11092908 - 11092751
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11092908 cagagagtgtgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaa 11092810  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11092809 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatggtgttg 11092751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8468548 - 8468370
Alignment:
Q  95 aagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaa 194  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| || |||||    
T  8468548 aagttgttgatatggagttgcagatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatga-------ttgctgttgtgatgaa 8468456  T
Q  195 tatgatttactttgatg------------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8468455 tatgatttactttgatgattaatgtgataatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 8468370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085013
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 11085072  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||| | ||||||| |||||    
T  11085071 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatggtgttg 11085013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Original strand, 9320423 - 9320567
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9320423 taagatgatt-aatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatga 9320521  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttg 176  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  9320522 tgattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatggtgttg 9320567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213707
Alignment:
Q  19 agagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||   |||||||||| |||||||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaat 15213771  T
Q  119 tgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgc 182  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||||    
T  15213770 tgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgc 15213707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 14270166 - 14270222
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14270166 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 14270222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 45847762 - 45847818
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45847762 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 45847818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12371526 - 12371428
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||||||||||    
T  12371526 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgt 12371428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 45847732 - 45847802
Alignment:
Q  47 tgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45847732 tgttgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 45847802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8468453 - 8468320
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||  ||||| | |    
T  8468453 tgatttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 8468355  T
Q  150 cttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctg 184  Q
    |||| |||| ||  || |||| ||||| |||||||    
T  8468354 cttgctgtaaattatttaatggtgttgccttgctg 8468320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Original strand, 13148276 - 13148374
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  13148276 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 13148374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12371527 - 12371482
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12371527 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 12371482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 13148275 - 13148320
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13148275 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgat 13148320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11066716 - 11066680
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11066716 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttatat 11066680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 14270139 - 14270206
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14270139 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 14270206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 37727679 - 37727723
Alignment:
Q  225 tgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37727679 tgtgaaagttgtagatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 37727723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 1465416 - 1465585
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1465416 gttgttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatgatgttgtcttgctgccgtgatgaata 1465515  T
Q  197 tgatttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  1465516 tgattgactttgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttggatttga 1465585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224811
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 31224733  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31224734 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 31224811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 269
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18440025
Alignment:
Q  100 gttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatga 199  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatga 18439944  T
Q  200 tttactttgatgat----------atttatata-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||||||          || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18439945 tttactttgatgattaatgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 18440025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12269773 - 12269580
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||     
T  12269773 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tga-aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtat 12269676  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat 213  Q
    || ||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  12269675 tttttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtcatgaatatgatttaagttgatgat 12269580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447854
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 15447779  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15447780 ttgttatatat---gattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 15447854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989032
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 1989011  T
Q  118 ttgttatatatgaagattatt 138  Q
    | ||| ||| ||| |||||||    
T  1989012 tggttgtatttgatgattatt 1989032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31415543 - 31415399
Alignment:
Q  51 gatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttac 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  31415543 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 31415444  T
Q  151 ttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31415443 ttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 31415399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 49389636 - 49389740
Alignment:
Q  97 gttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 196  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49389636 gttgttggtatgaagttgaaattgttatacatgaagatcattattaatgggtacttattgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 49389735  T
Q  197 tgatt 201  Q
    |||||    
T  49389736 tgatt 49389740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912929
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 11912994  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgc 182  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||||    
T  11912993 ttgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgc 11912929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Original strand, 20630147 - 20630275
Alignment:
Q  152 tgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatg------------atatttatataattgtgaaagatgctga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |            |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20630147 tgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtaatgaatatgatttactttgacgattaatgtgagaatatttatat-attgtgaaagatgttga 20630245  T
Q  240 tatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20630246 tatgaagttgtaatggttgtattagatgat 20630275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6808287 - 6808175
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6808287 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatataatgattatta 6808188  T
Q  140 atgatggttactt 152  Q
     ||||||| ||||    
T  6808187 ttgatggtgactt 6808175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 138
Target Start/End: Original strand, 49389740 - 49389852
Alignment:
Q  27 tgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatct--atactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |  |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49389740 tgactaagatgaattaatattgttgtttaaagttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtg-aagttgttgatatgaagttgtaattgttat 49389838  T
Q  125 atatgaagattatt 138  Q
    || ||| |||||||    
T  49389839 atttgatgattatt 49389852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 49969964 - 49970052
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  49969964 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattatt 49970052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 49969934 - 49970048
Alignment:
Q  167 aatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat-------------atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtatt 253  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||             ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  49969934 aatgatgttgtcttcctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 49970032  T
Q  254 ggttgtatttgatgat 269  Q
    |||| |||||||||||    
T  49970033 ggttatatttgatgat 49970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 1988984 - 1989028
Alignment:
Q  225 tgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1988984 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 1989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 18439942 - 18440029
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||   |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  18439942 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 18440029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5842039 - 5841985
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5842039 atttatata-ttgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatatttgatgat 5841985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 23413371 - 23413417
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23413371 attgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgat 23413417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40807244 - 40807146
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  40807244 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 40807146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17538356 - 17538311
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  17538356 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtattgattatattggatgat 17538311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40807245 - 40807200
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  40807245 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 40807200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40812086 - 40812050
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40812086 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 40812050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2466
Alignment:
Q  99 tgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2299 tgttgatatgaagttgaaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtcttgctgtcgtgatgaatatg 2398  T
Q  199 atttactttgatg-atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttga 265  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2399 attgactttgatgaatacttatataattgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttga 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14335
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 14413  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14412 ttgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 14335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39834029 - 39833889
Alignment:
Q  34 gatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttg-taattgttatatatgaag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  39834029 gatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaag 39833930  T
Q  133 attattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatg 173  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39833929 attattattgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatg 39833889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580063
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 21579985  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21579986 ttgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 21580063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763724
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 29763647  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  29763648 ttgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaat 29763724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 195
Target Start/End: Original strand, 41680834 - 41680979
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggtta 149  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  41680834 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 41680933  T
Q  150 cttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    |||| || ||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||    
T  41680934 cttgctgcatatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaat 41680979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560334
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaa 42560306  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42560307 ttgttatatatgatgattattattgatg 42560334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32807396 - 32807279
Alignment:
Q  59 ttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgta 158  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |    
T  32807396 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 32807297  T
Q  159 tatgtttaaatgatgttg 176  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  32807296 tatgtctaaatggtgttg 32807279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18760706 - 18760587
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18760706 cagagagtatgaataagatgatt-aatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataa 18760608  T
Q  118 ttgttatatatgaagattatt 138  Q
    | ||||||| ||| |||||||    
T  18760607 tggttatatttgatgattatt 18760587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 27472418 - 27472474
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27472418 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 27472474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 38550113 - 38550169
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38550113 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 38550169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 1327147 - 1327203
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1327147 atatttatata-ttgtgaacgatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 1327203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 38550083 - 38550219
Alignment:
Q  47 tgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatgg 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||  |||||     
T  38550083 tgttgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgt 38550181  T
Q  147 ttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctg 184  Q
    | ||||| |||| ||  ||  ||| |||||||||||||    
T  38550182 tgacttgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgctg 38550219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3273310 - 3273212
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3273310 cagagagtatgaataagatgatt-aatgttatggatttaagttgatgattaaatgtg-aaagatttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaa 3273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18760645 - 18760591
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18760645 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttatatttgatgat 18760591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 27472388 - 27472458
Alignment:
Q  47 tgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27472388 tgttgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 27472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 20982757 - 20982803
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20982757 attgtgaaagatattgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 20982803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19140014 - 19139969
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19140014 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 19139969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22965807 - 22965754
Alignment:
Q  132 gattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
    |||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22965807 gattattattgatggtgatttgatgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgt 22965754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 39936813 - 39936858
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  39936813 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 39936858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19140013 - 19139977
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19140013 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 19139977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 39936814 - 39936850
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39936814 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 39936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865615
Alignment:
Q  19 agagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24865452 agagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 24865550  T
Q  119 tgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgct 183  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24865551 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgct 24865615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22501147 - 22500996
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22501147 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22501049  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgct 183  Q
     ||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  22501048 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgct 22500996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22509081 - 22508930
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22509081 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22508983  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgct 183  Q
     ||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  22508982 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgct 22508930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672409
Alignment:
Q  19 agagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||||      |    
T  7672240 agagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaag------t 7672332  T
Q  119 tgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  7672333 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtcttgctgttgtgatgaat 7672409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6576543 - 6576426
Alignment:
Q  20 gagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatt 119  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6576543 gagagtatgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatg 6576445  T
Q  120 gttatatatgaagattatt 138  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  6576444 gttatatttgatgattatt 6576426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 2524410 - 2524526
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||||||| || ||||||    
T  2524410 cagagagtatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaa 2524508  T
Q  118 ttgttatatatgaagatt 135  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  2524509 ttgttacatatgatgatt 2524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6576484 - 6576430
Alignment:
Q  214 atttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6576484 atttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgat 6576430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Original strand, 24781644 - 24781742
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || ||||||| || |||| ||||||    
T  24781644 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgatgctgccttgatgtcgt 24781742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24883714 - 24883657
Alignment:
Q  211 gatatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24883714 gatatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 24883657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22501184 - 22501128
Alignment:
Q  89 atgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatg 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  22501184 atgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22509118 - 22509062
Alignment:
Q  89 atgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatg 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  22509118 atgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24436328 - 24436258
Alignment:
Q  52 atttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgtta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24436328 atttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaatggtta 24436258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24883701 - 24883665
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24883701 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 24883665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 85376 - 85191
Alignment:
Q  95 aagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaa 194  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  85376 aagttgttgatatggagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatgaagttgtcttgctgttgtgatgaa 85277  T
Q  195 tatgatttactttgatg------------atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  85276 tatgatttactttgatgattaatgtgagaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgat 85191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 85274 - 85187
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  85274 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattatt 85187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1561
Alignment:
Q  19 agagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 118  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1736 agagaggattaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 1638  T
Q  119 tgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  1637 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaat 1561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6523
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgatt-aataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 6457  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgct 183  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6458 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgct 6523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10900
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatga 130  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11053 taagatgatt-aatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattgttatatatga 10955  T
Q  131 agattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 185  Q
     |||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10954 tgattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgt 10900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctata 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctata 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3044 - 2988
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3044 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgat 2988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3032 - 2984
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  3032 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattatt 2984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 479
Alignment:
Q  63 tgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatg 162  Q
    |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 512  T
Q  163 tttaaatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaat 195  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  511 ttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4623
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4786 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 4688  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgc 182  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||||    
T  4687 ttgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgc 4623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 205
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  368 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 270  T
Q  118 ttgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgc 182  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||||    
T  269 ttgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgc 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59455
Alignment:
Q  26 atgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttata 125  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59295 atgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttata 59392  T
Q  126 tatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |  || |||||||  ||||| | ||||| || |||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  59393 ttggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatggtgttgccttgctgtcgt 59455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3234 - 3066
Alignment:
Q  18 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactat-gtgaaagttgttgatatgaagttgta 116  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3234 cagagagtatgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttata-tatcgtgaaaaatgttgatatgaagttgta 3138  T
Q  117 attgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    || |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| |||| ||||||    
T  3137 atggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgttgttgccttgttgtcgt 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Original strand, 15421 - 15515
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15421 taagatgatt-aatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatat 15515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Original strand, 24479 - 24573
Alignment:
Q  31 taagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24479 taagatgatt-aatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatat 24573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5606
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatta 139  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||     
T  5459 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaatgtttatattggatgattattg 5557  T
Q  140 atgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
     ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  5558 ttgatgttaacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 5606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 954 - 869
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  954 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gattaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 861
Alignment:
Q  223 attgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  907 attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 6771 - 6859
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattatt 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  6771 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaatgattatatttgatgattatt 6859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 77038 - 76954
Alignment:
Q  40 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||   |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  77038 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa--atttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaatggttatat 76954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 8350 - 8462
Alignment:
Q  167 aatgatgttgtcttgctgtcgtaatgaatatgatttactttgatgat----------at-ttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattgg 255  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||          || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  8350 aatgatgctgtcttgttgtcgtgatgaatatgatttactttgatgattaatgagagaatattatata-ttgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatga 8448  T
Q  256 ttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||||||    
T  8449 ttgtatttgatgat 8462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 10991 - 11047
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10991 atatttatata-ttgtaaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgat 11047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 36170 - 36226
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  36170 atatttatata-ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgat 36226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 126
Target Start/End: Original strand, 36143 - 36218
Alignment:
Q  50 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36143 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 36218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Original strand, 10030 - 10128
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||| || || |||||||||||    
T  10030 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgt 10128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 10029 - 10074
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  10029 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 10074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8234
Alignment:
Q  224 ttgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8189 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 8234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 8190 - 8226
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8190 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 8226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 363004 - 362948
Alignment:
Q  212 atatttatataattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  363004 atatttatatattt-tgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgat 362948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9150
Alignment:
Q  225 tgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9142
Alignment:
Q  90 tgtgaaagttgttgatatgaagttgtaattgttatat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatat 9142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University