View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0652_low_18 (Length: 319)

Name: NF0652_low_18
Description: NF0652
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0652_low_18
NF0652_low_18
[»] chr3 (155 HSPs)
chr3 (91-319)||(6598397-6598625)
chr3 (91-319)||(6605077-6605305)
chr3 (91-319)||(16758770-16758999)
chr3 (91-319)||(16748038-16748268)
chr3 (91-316)||(3690300-3690525)
chr3 (91-316)||(20057604-20057828)
chr3 (91-316)||(14673400-14673625)
chr3 (91-318)||(53387202-53387430)
chr3 (91-286)||(53380550-53380745)
chr3 (91-316)||(417681-417906)
chr3 (91-316)||(16624254-16624479)
chr3 (91-316)||(20064242-20064466)
chr3 (91-318)||(10009962-10010189)
chr3 (95-316)||(6608141-6608362)
chr3 (91-307)||(31422752-31422968)
chr3 (92-307)||(5107084-5107299)
chr3 (91-318)||(10003315-10003542)
chr3 (91-316)||(10903907-10904132)
chr3 (91-316)||(10910579-10910804)
chr3 (91-307)||(37615083-37615299)
chr3 (97-316)||(23704972-23705191)
chr3 (97-316)||(23723428-23723647)
chr3 (97-316)||(23741884-23742103)
chr3 (91-297)||(10846483-10846689)
chr3 (91-283)||(5221119-5221311)
chr3 (91-307)||(13250409-13250625)
chr3 (91-307)||(13257055-13257271)
chr3 (97-316)||(41202002-41202221)
chr3 (97-283)||(15727136-15727322)
chr3 (91-283)||(16489864-16490056)
chr3 (94-265)||(10153937-10154108)
chr3 (97-298)||(5150187-5150388)
chr3 (91-316)||(16633511-16633736)
chr3 (91-316)||(16640121-16640346)
chr3 (91-316)||(43160786-43161011)
chr3 (91-316)||(43167023-43167248)
chr3 (91-280)||(48423064-48423253)
chr3 (91-298)||(1333281-1333488)
chr3 (98-280)||(48429842-48430024)
chr3 (91-298)||(26889155-26889362)
chr3 (97-283)||(41092565-41092751)
chr3 (91-274)||(15584932-15585115)
chr3 (91-274)||(15591590-15591773)
chr3 (97-274)||(12482139-12482316)
chr3 (91-228)||(13316399-13316536)
chr3 (91-286)||(26794594-26794792)
chr3 (127-280)||(22643539-22643692)
chr3 (91-274)||(15992316-15992502)
chr3 (97-274)||(5200937-5201114)
chr3 (97-274)||(5420524-5420701)
chr3 (97-274)||(5426931-5427108)
chr3 (91-228)||(10236607-10236744)
chr3 (91-228)||(19808781-19808918)
chr3 (91-274)||(15825370-15825556)
chr3 (91-283)||(10325546-10325742)
chr3 (100-283)||(55148680-55148866)
chr3 (97-228)||(410972-411103)
chr3 (106-283)||(28368673-28368854)
chr3 (106-283)||(28376491-28376672)
chr3 (106-283)||(28384313-28384494)
chr3 (97-286)||(15367151-15367343)
chr3 (97-286)||(15404716-15404908)
chr3 (91-274)||(7985409-7985596)
chr3 (91-228)||(17710806-17710943)
chr3 (103-286)||(15337152-15337338)
chr3 (97-228)||(1145773-1145904)
chr3 (97-228)||(8721377-8721508)
chr3 (97-228)||(9073264-9073395)
chr3 (97-228)||(15350470-15350601)
chr3 (100-274)||(24187488-24187665)
chr3 (97-286)||(12891094-12891288)
chr3 (103-286)||(15360410-15360596)
chr3 (97-286)||(17253280-17253474)
chr3 (97-228)||(15343826-15343957)
chr3 (91-283)||(13320668-13320865)
chr3 (97-228)||(30777447-30777578)
chr3 (103-286)||(15398104-15398290)
chr3 (97-280)||(4709999-4710185)
chr3 (134-291)||(29695943-29696103)
chr3 (127-228)||(26789013-26789114)
chr3 (100-283)||(838948-839134)
chr3 (91-217)||(16332935-16333062)
chr3 (100-217)||(20722772-20722889)
chr3 (97-186)||(15692482-15692571)
chr3 (182-283)||(15711579-15711680)
chr3 (98-199)||(4107858-4107957)
chr3 (98-199)||(4111710-4111809)
chr3 (98-199)||(7109247-7109346)
chr3 (98-199)||(7113182-7113281)
chr3 (98-199)||(27410103-27410202)
chr3 (98-199)||(55022416-55022515)
chr3 (98-199)||(3833482-3833580)
chr3 (98-199)||(15964495-15964593)
chr3 (98-199)||(15968419-15968517)
chr3 (98-199)||(15972343-15972441)
chr3 (98-208)||(30065490-30065598)
chr3 (98-199)||(11069619-11069718)
chr3 (98-199)||(11165988-11166087)
chr3 (98-199)||(14498876-14498975)
chr3 (98-199)||(15616925-15617024)
chr3 (99-199)||(16750802-16750899)
chr3 (98-199)||(19775118-19775217)
chr3 (98-199)||(28949273-28949372)
chr3 (100-199)||(15464650-15464746)
chr3 (98-199)||(1598679-1598777)
chr3 (98-199)||(38814192-38814290)
chr3 (99-199)||(16696593-16696690)
chr3 (98-199)||(22321215-22321314)
chr3 (98-199)||(22336270-22336369)
chr3 (100-199)||(12339251-12339347)
chr3 (98-199)||(5222873-5222970)
chr3 (98-199)||(15942104-15942202)
chr3 (103-199)||(4589378-4589471)
chr3 (100-199)||(16809082-16809177)
chr3 (127-199)||(37440123-37440195)
chr3 (103-199)||(8489652-8489745)
chr3 (102-199)||(17241782-17241874)
chr3 (100-185)||(16798255-16798336)
chr3 (129-199)||(15482473-15482542)
chr3 (126-195)||(31097779-31097847)
chr3 (169-228)||(4290920-4290979)
chr3 (129-208)||(7793586-7793667)
chr3 (129-208)||(20461736-20461817)
chr3 (129-208)||(327401-327482)
chr3 (129-208)||(14668349-14668430)
chr3 (153-208)||(14665193-14665247)
chr3 (129-208)||(2898058-2898140)
chr3 (98-152)||(12339322-12339372)
chr3 (240-316)||(10154132-10154208)
chr3 (99-149)||(11854266-11854313)
chr3 (153-208)||(14572376-14572431)
chr3 (155-209)||(14577112-14577166)
chr3 (98-152)||(15464721-15464771)
chr3 (240-316)||(15711751-15711827)
chr3 (240-316)||(15727393-15727469)
chr3 (91-148)||(11300963-11301017)
chr3 (240-283)||(15711694-15711737)
chr3 (240-283)||(15727336-15727379)
chr3 (152-199)||(49668364-49668411)
chr3 (240-274)||(5200894-5200928)
chr3 (153-199)||(9512706-9512752)
chr3 (153-199)||(9520681-9520727)
chr3 (240-274)||(12482096-12482130)
chr3 (153-199)||(16103566-16103612)
chr3 (103-152)||(410951-411000)
chr3 (103-152)||(1145752-1145801)
chr3 (103-152)||(8721356-8721405)
chr3 (103-152)||(9073243-9073292)
chr3 (103-152)||(15343805-15343854)
chr3 (103-152)||(15350449-15350498)
chr3 (103-152)||(15367130-15367179)
chr3 (91-124)||(55148815-55148848)
chr3 (92-124)||(839083-839115)
chr3 (291-319)||(6596936-6596964)
chr3 (103-151)||(15404695-15404743)
[»] chr6 (102 HSPs)
chr6 (91-316)||(8796872-8797097)
chr6 (91-316)||(20801438-20801663)
chr6 (91-316)||(27185373-27185598)
chr6 (91-316)||(27207209-27207434)
chr6 (91-316)||(27241794-27242019)
chr6 (91-316)||(27263642-27263867)
chr6 (91-316)||(28258655-28258880)
chr6 (91-316)||(28265279-28265504)
chr6 (91-316)||(28287036-28287261)
chr6 (91-316)||(28337404-28337629)
chr6 (91-316)||(28344028-28344253)
chr6 (91-316)||(27430484-27430709)
chr6 (91-316)||(28314234-28314459)
chr6 (91-297)||(2870336-2870542)
chr6 (91-297)||(2876951-2877157)
chr6 (91-282)||(30694077-30694268)
chr6 (91-316)||(26130148-26130373)
chr6 (91-307)||(20649991-20650207)
chr6 (91-307)||(30596916-30597132)
chr6 (91-316)||(6980341-6980566)
chr6 (91-316)||(20060330-20060555)
chr6 (91-307)||(30638351-30638567)
chr6 (91-280)||(8228583-8228772)
chr6 (91-316)||(29587901-29588126)
chr6 (91-316)||(29594042-29594267)
chr6 (116-312)||(14053784-14053980)
chr6 (91-298)||(18930754-18930961)
chr6 (91-316)||(27328257-27328482)
chr6 (91-316)||(27388997-27389222)
chr6 (127-316)||(4233708-4233897)
chr6 (91-280)||(12762420-12762608)
chr6 (97-281)||(1545263-1545447)
chr6 (97-274)||(1539164-1539341)
chr6 (97-270)||(14098312-14098485)
chr6 (97-274)||(16552239-16552416)
chr6 (97-274)||(16576537-16576714)
chr6 (97-274)||(16618666-16618843)
chr6 (97-274)||(16628795-16628972)
chr6 (97-274)||(32565461-32565638)
chr6 (91-286)||(3708697-3708895)
chr6 (91-274)||(25117148-25117334)
chr6 (91-283)||(19808221-19808417)
chr6 (91-286)||(4208295-4208494)
chr6 (97-274)||(17017141-17017318)
chr6 (91-228)||(25110594-25110731)
chr6 (100-283)||(34298841-34299027)
chr6 (97-286)||(34832346-34832539)
chr6 (91-286)||(4167615-4167814)
chr6 (97-228)||(24291267-24291398)
chr6 (97-228)||(24315295-24315426)
chr6 (97-228)||(31317307-31317438)
chr6 (91-283)||(25927990-25928186)
chr6 (91-283)||(34370189-34370385)
chr6 (99-286)||(20176632-20176824)
chr6 (91-228)||(22758604-22758741)
chr6 (99-286)||(5834708-5834900)
chr6 (99-224)||(22159167-22159294)
chr6 (97-210)||(17037553-17037666)
chr6 (98-199)||(1644058-1644157)
chr6 (98-199)||(11566410-11566509)
chr6 (98-199)||(12619301-12619400)
chr6 (98-199)||(14471761-14471860)
chr6 (98-199)||(16623902-16624001)
chr6 (98-199)||(19870138-19870237)
chr6 (98-199)||(22862494-22862593)
chr6 (98-199)||(23394616-23394715)
chr6 (98-199)||(23989468-23989567)
chr6 (98-199)||(25135871-25135970)
chr6 (100-199)||(1587932-1588029)
chr6 (100-199)||(5617016-5617113)
chr6 (98-199)||(16759817-16759915)
chr6 (98-199)||(22948631-22948729)
chr6 (98-199)||(22952587-22952685)
chr6 (98-199)||(23414453-23414551)
chr6 (98-199)||(23871075-23871173)
chr6 (98-199)||(23875031-23875129)
chr6 (98-199)||(8243381-8243480)
chr6 (98-199)||(27416387-27416484)
chr6 (99-199)||(12496117-12496214)
chr6 (107-199)||(21702095-21702185)
chr6 (100-199)||(20803755-20803852)
chr6 (100-197)||(9482494-9482588)
chr6 (98-199)||(27556211-27556309)
chr6 (99-199)||(31478444-31478542)
chr6 (103-199)||(12706498-12706590)
chr6 (127-199)||(18917895-18917967)
chr6 (102-199)||(2685522-2685614)
chr6 (102-199)||(16741016-16741108)
chr6 (102-199)||(19662579-19662671)
chr6 (129-225)||(27325854-27325950)
chr6 (129-199)||(22430255-22430327)
chr6 (129-208)||(17803986-17804067)
chr6 (97-148)||(14098461-14098513)
chr6 (98-148)||(16623978-16624025)
chr6 (99-148)||(1644134-1644180)
chr6 (99-148)||(14471837-14471883)
chr6 (258-309)||(25471728-25471779)
chr6 (240-274)||(32565647-32565681)
chr6 (103-152)||(24291246-24291295)
chr6 (103-152)||(24315274-24315323)
chr6 (103-152)||(31317286-31317335)
chr6 (91-124)||(34298859-34298892)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (91-316)||(28454430-28454655)
chr8 (91-314)||(19496072-19496294)
chr8 (91-314)||(19498120-19498342)
chr8 (91-316)||(8354966-8355191)
chr8 (91-312)||(22047630-22047850)
chr8 (91-286)||(5534639-5534834)
chr8 (97-316)||(16883378-16883597)
chr8 (97-316)||(29122767-29122986)
chr8 (94-316)||(21915772-21915994)
chr8 (91-316)||(22083511-22083736)
chr8 (91-307)||(17669770-17669986)
chr8 (91-298)||(22123586-22123793)
chr8 (91-307)||(17676422-17676638)
chr8 (97-316)||(18865010-18865229)
chr8 (91-282)||(22115922-22116113)
chr8 (91-280)||(19110943-19111131)
chr8 (91-280)||(19117234-19117422)
chr8 (91-274)||(22124730-22124913)
chr8 (103-316)||(18854642-18854855)
chr8 (91-228)||(20014063-20014200)
chr8 (91-228)||(20020140-20020277)
chr8 (100-283)||(20527151-20527337)
chr8 (97-286)||(23845984-23846176)
chr8 (97-274)||(18065040-18065217)
chr8 (97-286)||(26935400-26935594)
chr8 (91-225)||(19905252-19905387)
chr8 (97-228)||(20024150-20024281)
chr8 (97-286)||(3215953-3216147)
chr8 (98-199)||(21410473-21410571)
chr8 (98-199)||(21804965-21805063)
chr8 (98-199)||(21977131-21977230)
chr8 (98-199)||(22111479-22111578)
chr8 (98-199)||(43251359-43251458)
chr8 (100-199)||(32598486-32598583)
chr8 (100-199)||(32605018-32605115)
chr8 (98-199)||(15531697-15531795)
chr8 (98-199)||(15538256-15538354)
chr8 (98-199)||(18863130-18863228)
chr8 (98-199)||(21828499-21828597)
chr8 (98-199)||(30940562-30940660)
chr8 (98-225)||(17055579-17055703)
chr8 (140-273)||(20705896-20706032)
chr8 (98-199)||(21973040-21973139)
chr8 (98-198)||(24445706-24445803)
chr8 (100-199)||(23847216-23847312)
chr8 (100-199)||(30308954-30309050)
chr8 (98-199)||(17828782-17828880)
chr8 (98-199)||(14398308-14398406)
chr8 (102-199)||(22044693-22044786)
chr8 (127-199)||(15440393-15440465)
chr8 (98-199)||(21386881-21386979)
chr8 (102-199)||(16231679-16231771)
chr8 (102-199)||(23833982-23834074)
chr8 (127-198)||(19278748-19278821)
chr8 (240-274)||(18064997-18065031)
chr8 (91-124)||(20527286-20527319)
chr8 (103-152)||(23845963-23846012)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (91-316)||(37543720-37543945)
chr5 (91-316)||(23583819-23584044)
chr5 (91-307)||(27670628-27670844)
chr5 (91-316)||(33725538-33725763)
chr5 (91-307)||(22264634-22264850)
chr5 (97-316)||(22139370-22139589)
chr5 (97-316)||(22587776-22587995)
chr5 (97-316)||(29471565-29471784)
chr5 (97-318)||(20775545-20775766)
chr5 (91-316)||(22328363-22328588)
chr5 (91-316)||(27608420-27608645)
chr5 (91-316)||(37286981-37287206)
chr5 (91-316)||(37293684-37293909)
chr5 (91-307)||(27663989-27664205)
chr5 (91-307)||(34294752-34294968)
chr5 (91-307)||(41098422-41098638)
chr5 (97-316)||(22132678-22132897)
chr5 (97-316)||(25406105-25406324)
chr5 (97-316)||(29478160-29478379)
chr5 (97-283)||(17283781-17283967)
chr5 (91-316)||(17707129-17707354)
chr5 (91-316)||(19991564-19991788)
chr5 (91-316)||(27615026-27615251)
chr5 (91-283)||(18038868-18039060)
chr5 (91-307)||(24472447-24472662)
chr5 (91-282)||(1692637-1692828)
chr5 (91-265)||(22341802-22341976)
chr5 (91-316)||(16354504-16354729)
chr5 (91-316)||(16361163-16361388)
chr5 (91-316)||(34564497-34564722)
chr5 (91-316)||(34571152-34571377)
chr5 (91-316)||(41294634-41294859)
chr5 (91-283)||(15001880-15002072)
chr5 (91-280)||(40706838-40707027)
chr5 (91-280)||(40713480-40713669)
chr5 (91-298)||(25106461-25106668)
chr5 (91-298)||(25165554-25165761)
chr5 (91-298)||(27516450-27516657)
chr5 (91-298)||(27523087-27523294)
chr5 (91-283)||(14995237-14995429)
chr5 (91-274)||(22063082-22063266)
chr5 (91-282)||(27687529-27687720)
chr5 (91-274)||(22410811-22410994)
chr5 (127-307)||(23609619-23609799)
chr5 (127-307)||(23841015-23841195)
chr5 (91-228)||(23249707-23249844)
chr5 (91-286)||(41768950-41769148)
chr5 (91-286)||(41775524-41775722)
chr5 (116-282)||(27680912-27681078)
chr5 (97-274)||(29316128-29316305)
chr5 (91-283)||(15442171-15442367)
chr5 (97-274)||(21668025-21668202)
chr5 (97-274)||(22258700-22258877)
chr5 (100-283)||(21295481-21295667)
chr5 (91-228)||(19768101-19768238)
chr5 (100-283)||(25534690-25534876)
chr5 (97-228)||(19774697-19774828)
chr5 (91-283)||(14360034-14360230)
chr5 (91-228)||(24020037-24020174)
chr5 (97-228)||(22326150-22326282)
chr5 (97-286)||(22343187-22343381)
chr5 (97-271)||(23337511-23337689)
chr5 (97-228)||(22352648-22352781)
chr5 (100-283)||(24554233-24554422)
chr5 (98-199)||(11220271-11220369)
chr5 (98-199)||(11228680-11228778)
chr5 (98-199)||(11230669-11230767)
chr5 (98-199)||(15237294-15237393)
chr5 (98-199)||(19473177-19473276)
chr5 (91-199)||(40724068-40724174)
chr5 (100-199)||(25229607-25229704)
chr5 (100-199)||(25293763-25293860)
chr5 (98-199)||(11224857-11224955)
chr5 (98-199)||(11226690-11226788)
chr5 (98-199)||(20911394-20911492)
chr5 (98-199)||(10752738-10752837)
chr5 (98-199)||(20295395-20295494)
chr5 (100-199)||(4036026-4036123)
chr5 (100-199)||(17730608-17730705)
chr5 (98-208)||(21885389-21885495)
chr5 (98-199)||(33409036-33409134)
chr5 (100-199)||(21340968-21341064)
chr5 (98-208)||(26172264-26172370)
chr5 (98-199)||(18355765-18355863)
chr5 (100-199)||(16673961-16674057)
chr5 (102-199)||(18783856-18783948)
chr5 (102-199)||(26742950-26743042)
chr5 (126-199)||(18774013-18774085)
chr5 (102-199)||(20232361-20232453)
chr5 (102-199)||(42805230-42805322)
chr5 (126-199)||(26666354-26666426)
chr5 (126-199)||(26937951-26938023)
chr5 (126-208)||(24767786-24767867)
chr5 (126-199)||(24533271-24533343)
chr5 (129-200)||(23535791-23535861)
chr5 (103-152)||(19768204-19768253)
chr5 (168-199)||(17410278-17410309)
chr5 (91-121)||(20775715-20775745)
chr5 (91-121)||(23609778-23609808)
chr5 (91-121)||(23841174-23841204)
chr5 (91-124)||(21295499-21295532)
chr5 (91-124)||(25534825-25534858)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (91-316)||(16345975-16346200)
chr1 (91-316)||(47658894-47659119)
chr1 (101-316)||(16352634-16352849)
chr1 (91-314)||(41349052-41349274)
chr1 (91-314)||(41356489-41356711)
chr1 (97-316)||(21828394-21828613)
chr1 (91-316)||(20216127-20216352)
chr1 (91-283)||(18600306-18600498)
chr1 (91-316)||(43078099-43078324)
chr1 (91-282)||(41478778-41478969)
chr1 (91-298)||(46157542-46157749)
chr1 (91-316)||(44845084-44845309)
chr1 (91-280)||(51328879-51329068)
chr1 (91-280)||(51335513-51335702)
chr1 (97-274)||(27898878-27899055)
chr1 (97-274)||(43063495-43063672)
chr1 (97-274)||(49334282-49334459)
chr1 (97-274)||(18626503-18626680)
chr1 (97-274)||(33384780-33384957)
chr1 (97-274)||(44755815-44755992)
chr1 (144-316)||(21843968-21844140)
chr1 (91-274)||(19111112-19111299)
chr1 (100-283)||(23762913-23763099)
chr1 (97-228)||(21807422-21807553)
chr1 (97-228)||(21835119-21835250)
chr1 (97-228)||(33386445-33386576)
chr1 (97-228)||(33393090-33393221)
chr1 (97-274)||(19104463-19104636)
chr1 (97-283)||(8304836-8305026)
chr1 (97-286)||(50887976-50888170)
chr1 (91-228)||(20525431-20525569)
chr1 (98-199)||(41388478-41388577)
chr1 (98-199)||(1010271-1010370)
chr1 (98-199)||(16375917-16376016)
chr1 (98-199)||(52639089-52639188)
chr1 (98-199)||(1925614-1925712)
chr1 (98-199)||(20924628-20924726)
chr1 (98-199)||(21406904-21407002)
chr1 (98-198)||(20229466-20229564)
chr1 (99-199)||(39244380-39244477)
chr1 (99-199)||(39247935-39248032)
chr1 (100-199)||(20137892-20137988)
chr1 (100-199)||(33797067-33797163)
chr1 (102-199)||(19211677-19211769)
chr1 (127-199)||(46975299-46975371)
chr1 (126-199)||(18882200-18882273)
chr1 (102-199)||(12646680-12646772)
chr1 (129-208)||(36819536-36819614)
chr1 (129-208)||(21172801-21172882)
chr1 (129-208)||(21312917-21312998)
chr1 (129-199)||(16080645-16080712)
chr1 (99-148)||(20229443-20229489)
chr1 (240-274)||(18626689-18626723)
chr1 (240-274)||(27899064-27899098)
chr1 (240-274)||(43063681-43063715)
chr1 (240-274)||(44755772-44755806)
chr1 (240-274)||(49334239-49334273)
chr1 (103-152)||(21807401-21807450)
chr1 (103-152)||(21835222-21835271)
chr1 (91-124)||(23763048-23763081)
chr1 (103-152)||(33386424-33386473)
chr1 (103-152)||(33393069-33393118)
chr1 (177-225)||(34509528-34509577)
chr1 (98-126)||(39244354-39244382)
chr1 (98-126)||(39247909-39247937)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (91-316)||(56654-56879)
scaffold0003 (98-199)||(70877-70974)
scaffold0003 (102-199)||(139520-139614)
scaffold0003 (102-199)||(100880-100972)
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (91-316)||(18024629-18024854)
chr4 (91-316)||(18070848-18071073)
chr4 (91-316)||(12481329-12481554)
chr4 (91-316)||(12474699-12474924)
chr4 (91-307)||(19780489-19780705)
chr4 (91-307)||(23953837-23954053)
chr4 (91-307)||(23960499-23960715)
chr4 (97-316)||(386537-386756)
chr4 (97-316)||(6873584-6873803)
chr4 (91-298)||(15383693-15383899)
chr4 (97-283)||(40453633-40453819)
chr4 (97-283)||(40477862-40478048)
chr4 (91-316)||(14268655-14268880)
chr4 (91-316)||(14299029-14299254)
chr4 (97-283)||(26285115-26285301)
chr4 (91-316)||(15361812-15362037)
chr4 (91-316)||(16232043-16232268)
chr4 (91-316)||(22194299-22194524)
chr4 (91-316)||(36884936-36885161)
chr4 (91-316)||(14073489-14073714)
chr4 (91-296)||(15148157-15148362)
chr4 (91-316)||(15256267-15256492)
chr4 (91-316)||(29041121-29041346)
chr4 (91-298)||(8384511-8384718)
chr4 (91-316)||(17808072-17808297)
chr4 (91-280)||(18295341-18295530)
chr4 (91-298)||(8391166-8391373)
chr4 (91-298)||(17090200-17090407)
chr4 (97-283)||(15322314-15322500)
chr4 (97-283)||(7901392-7901578)
chr4 (97-316)||(51494023-51494234)
chr4 (91-228)||(4771865-4772002)
chr4 (91-228)||(8048696-8048833)
chr4 (91-228)||(8055309-8055446)
chr4 (97-274)||(12349793-12349970)
chr4 (127-316)||(14305662-14305851)
chr4 (91-298)||(9272372-9272578)
chr4 (97-307)||(17962553-17962763)
chr4 (97-274)||(55795159-55795336)
chr4 (97-274)||(12300117-12300294)
chr4 (100-283)||(23838135-23838321)
chr4 (97-228)||(23081341-23081472)
chr4 (97-228)||(27709498-27709629)
chr4 (100-283)||(41385963-41386149)
chr4 (97-286)||(53433065-53433259)
chr4 (91-283)||(12521777-12521973)
chr4 (97-228)||(19942376-19942507)
chr4 (100-283)||(14678664-14678851)
chr4 (100-283)||(14684872-14685059)
chr4 (97-228)||(16956873-16957004)
chr4 (127-283)||(35170349-35170508)
chr4 (127-283)||(35613661-35613820)
chr4 (91-199)||(14757877-14757985)
chr4 (98-199)||(14708834-14708933)
chr4 (98-199)||(4561784-4561883)
chr4 (98-199)||(5757389-5757488)
chr4 (98-199)||(9556078-9556177)
chr4 (98-199)||(12487233-12487332)
chr4 (98-199)||(17809822-17809921)
chr4 (98-199)||(33741928-33742027)
chr4 (98-199)||(14954652-14954750)
chr4 (99-199)||(23139080-23139177)
chr4 (100-199)||(2014587-2014683)
chr4 (98-199)||(45937957-45938055)
chr4 (99-199)||(15224590-15224687)
chr4 (99-199)||(26243865-26243962)
chr4 (98-199)||(42997650-42997749)
chr4 (102-197)||(19757804-19757896)
chr4 (102-197)||(19781910-19782002)
chr4 (100-199)||(18602932-18603029)
chr4 (100-199)||(9530243-9530339)
chr4 (103-199)||(18609507-18609601)
chr4 (100-199)||(3412606-3412703)
chr4 (127-199)||(25689417-25689489)
chr4 (100-196)||(27533528-27533621)
chr4 (100-199)||(18236700-18236796)
chr4 (127-208)||(28569646-28569726)
chr4 (127-199)||(10712403-10712475)
chr4 (127-199)||(10926173-10926245)
chr4 (102-199)||(18222582-18222674)
chr4 (168-286)||(30235277-30235398)
chr4 (170-283)||(21339968-21340084)
chr4 (100-198)||(16243601-16243696)
chr4 (102-196)||(1951965-1952054)
chr4 (126-199)||(18229077-18229149)
chr4 (130-222)||(36134176-36134271)
chr4 (179-228)||(13020537-13020586)
chr4 (126-199)||(17152710-17152782)
chr4 (129-208)||(20157680-20157761)
chr4 (129-208)||(22634626-22634707)
chr4 (91-131)||(20115007-20115047)
chr4 (240-316)||(40477772-40477848)
chr4 (240-283)||(40453576-40453619)
chr4 (240-274)||(12349979-12350013)
chr4 (91-121)||(14305653-14305683)
chr4 (103-152)||(16956852-16956901)
chr4 (103-152)||(23081444-23081493)
chr4 (103-152)||(27709601-27709650)
chr4 (91-124)||(35170484-35170517)
chr4 (91-124)||(35613796-35613829)
chr4 (91-124)||(41385981-41386014)
chr4 (92-124)||(14685008-14685040)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (91-316)||(1254-1479)
scaffold0052 (91-316)||(10018-10243)
scaffold0052 (91-316)||(56440-56665)
[»] chr7 (110 HSPs)
chr7 (91-316)||(16407495-16407720)
chr7 (97-316)||(20703196-20703415)
chr7 (91-316)||(9511211-9511436)
chr7 (97-316)||(18182457-18182676)
chr7 (97-316)||(32767356-32767575)
chr7 (97-283)||(18175818-18176004)
chr7 (91-283)||(18164873-18165065)
chr7 (97-283)||(1347207-1347393)
chr7 (97-283)||(11232504-11232690)
chr7 (91-316)||(12703608-12703833)
chr7 (91-283)||(15163021-15163213)
chr7 (91-307)||(40523561-40523777)
chr7 (97-283)||(11239191-11239377)
chr7 (91-316)||(14655617-14655842)
chr7 (91-316)||(49051052-49051277)
chr7 (91-283)||(11365910-11366102)
chr7 (91-298)||(21359-21566)
chr7 (91-286)||(60877-61072)
chr7 (91-298)||(8202296-8202503)
chr7 (91-298)||(15021806-15022013)
chr7 (94-283)||(15156373-15156562)
chr7 (91-280)||(44786675-44786864)
chr7 (91-280)||(44793316-44793505)
chr7 (91-282)||(13690807-13690998)
chr7 (91-282)||(13684176-13684367)
chr7 (91-283)||(4318758-4318951)
chr7 (91-228)||(14330555-14330692)
chr7 (91-228)||(14337139-14337276)
chr7 (97-274)||(8705705-8705882)
chr7 (97-274)||(18553751-18553928)
chr7 (97-274)||(8712376-8712553)
chr7 (100-283)||(14958865-14959051)
chr7 (91-274)||(18530949-18531136)
chr7 (97-274)||(23520182-23520359)
chr7 (100-283)||(11262030-11262216)
chr7 (91-265)||(20310-20488)
chr7 (103-274)||(10869175-10869347)
chr7 (103-274)||(10875255-10875427)
chr7 (100-283)||(12692197-12692383)
chr7 (100-283)||(26419701-26419887)
chr7 (100-283)||(11548484-11548671)
chr7 (100-283)||(11555080-11555267)
chr7 (97-286)||(6017395-6017589)
chr7 (103-274)||(18585497-18585669)
chr7 (91-228)||(9409698-9409836)
chr7 (157-283)||(20871301-20871427)
chr7 (97-218)||(13569655-13569776)
chr7 (126-274)||(14952935-14953086)
chr7 (91-217)||(7535947-7536074)
chr7 (126-283)||(44408554-44408714)
chr7 (134-274)||(15380528-15380671)
chr7 (98-199)||(15083719-15083817)
chr7 (98-199)||(32657-32756)
chr7 (98-199)||(12705118-12705217)
chr7 (98-199)||(12718216-12718315)
chr7 (98-199)||(12723127-12723226)
chr7 (98-199)||(16113789-16113888)
chr7 (98-199)||(16116942-16117041)
chr7 (98-199)||(18282914-18283013)
chr7 (98-199)||(18425208-18425307)
chr7 (98-199)||(26291920-26292019)
chr7 (98-199)||(1859285-1859382)
chr7 (100-199)||(14216732-14216829)
chr7 (100-199)||(15728132-15728229)
chr7 (98-199)||(39721789-39721887)
chr7 (98-199)||(71226-71325)
chr7 (98-199)||(75335-75434)
chr7 (98-199)||(18278951-18279050)
chr7 (103-199)||(12714436-12714530)
chr7 (100-199)||(13148963-13149059)
chr7 (103-199)||(7519531-7519623)
chr7 (98-226)||(18556752-18556877)
chr7 (98-199)||(45170491-45170589)
chr7 (100-199)||(8917235-8917331)
chr7 (98-199)||(25927701-25927799)
chr7 (100-195)||(2530616-2530708)
chr7 (100-199)||(13461568-13461664)
chr7 (127-199)||(13918981-13919053)
chr7 (100-199)||(16724831-16724928)
chr7 (100-199)||(17701845-17701942)
chr7 (103-199)||(16907675-16907769)
chr7 (127-199)||(16275323-16275395)
chr7 (130-199)||(35151448-35151517)
chr7 (100-208)||(14932976-14933081)
chr7 (100-208)||(15356411-15356516)
chr7 (100-208)||(15360525-15360630)
chr7 (102-198)||(16457561-16457652)
chr7 (126-199)||(6801021-6801093)
chr7 (102-199)||(9593155-9593247)
chr7 (126-199)||(20578-20650)
chr7 (129-199)||(16583065-16583134)
chr7 (126-195)||(2832682-2832750)
chr7 (129-208)||(12317925-12318006)
chr7 (129-208)||(9751984-9752065)
chr7 (129-198)||(14152229-14152300)
chr7 (129-208)||(15605497-15605579)
chr7 (129-181)||(13635696-13635747)
chr7 (240-283)||(4318965-4319008)
chr7 (91-126)||(11548502-11548537)
chr7 (91-126)||(11555098-11555133)
chr7 (170-209)||(13569609-13569648)
chr7 (99-148)||(18425284-18425330)
chr7 (99-148)||(26291996-26292042)
chr7 (240-274)||(8705662-8705696)
chr7 (240-274)||(8712333-8712367)
chr7 (103-152)||(26292016-26292063)
chr7 (91-124)||(11262165-11262198)
chr7 (91-124)||(12692332-12692365)
chr7 (91-124)||(14959000-14959033)
chr7 (103-151)||(13569749-13569797)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (91-307)||(67199-67415)
scaffold0028 (97-272)||(41248-41423)
scaffold0028 (97-272)||(56755-56930)
scaffold0028 (91-274)||(6710-6896)
scaffold0028 (91-274)||(13235-13421)
scaffold0028 (91-274)||(22763-22949)
scaffold0028 (98-199)||(59178-59277)
scaffold0028 (153-208)||(132473-132528)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (97-316)||(7741-7960)
scaffold0044 (91-307)||(30216-30432)
scaffold0044 (91-286)||(73098-73296)
scaffold0044 (98-199)||(62068-62167)
scaffold0044 (129-199)||(18998-19067)
scaffold0044 (129-199)||(12714-12783)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (97-316)||(306778-306997)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (91-307)||(22321186-22321402)
chr2 (91-307)||(22327339-22327555)
chr2 (91-312)||(10865858-10866078)
chr2 (91-312)||(10873223-10873443)
chr2 (91-316)||(23170718-23170943)
chr2 (91-316)||(23581975-23582200)
chr2 (98-283)||(24914173-24914358)
chr2 (91-298)||(1842781-1842988)
chr2 (97-283)||(12828785-12828971)
chr2 (94-283)||(27598977-27599166)
chr2 (91-316)||(27616978-27617203)
chr2 (97-283)||(29233243-29233429)
chr2 (97-283)||(29346542-29346728)
chr2 (91-316)||(9488576-9488801)
chr2 (91-316)||(9607837-9608062)
chr2 (91-280)||(13306811-13307000)
chr2 (91-280)||(16985639-16985828)
chr2 (91-316)||(28432134-28432359)
chr2 (91-298)||(9339960-9340167)
chr2 (91-298)||(16922209-16922416)
chr2 (91-274)||(19490146-19490329)
chr2 (91-298)||(27215743-27215950)
chr2 (91-280)||(16928072-16928261)
chr2 (91-280)||(16996766-16996955)
chr2 (91-280)||(17003399-17003588)
chr2 (91-286)||(26877767-26877962)
chr2 (97-274)||(27369012-27369189)
chr2 (97-274)||(44381420-44381597)
chr2 (97-274)||(27375522-27375699)
chr2 (100-283)||(24502812-24502998)
chr2 (91-283)||(11677142-11677338)
chr2 (97-274)||(44388090-44388267)
chr2 (91-228)||(37318029-37318166)
chr2 (97-228)||(13970591-13970722)
chr2 (97-228)||(24714465-24714596)
chr2 (97-228)||(41604954-41605085)
chr2 (97-228)||(41610851-41610982)
chr2 (97-228)||(45057647-45057778)
chr2 (91-273)||(24641178-24641364)
chr2 (97-286)||(30971203-30971397)
chr2 (104-283)||(21147517-21147700)
chr2 (103-286)||(24880494-24880682)
chr2 (103-228)||(24872609-24872736)
chr2 (98-199)||(10102112-10102211)
chr2 (98-199)||(12901975-12902074)
chr2 (98-199)||(24628938-24629037)
chr2 (98-199)||(24648903-24649002)
chr2 (98-199)||(27601340-27601439)
chr2 (127-283)||(27195446-27195605)
chr2 (98-199)||(30345476-30345574)
chr2 (98-199)||(27379891-27379990)
chr2 (98-199)||(27383937-27384036)
chr2 (100-199)||(19928703-19928799)
chr2 (98-197)||(41666759-41666855)
chr2 (99-199)||(18855659-18855756)
chr2 (107-199)||(60625-60715)
chr2 (98-199)||(26124992-26125090)
chr2 (98-199)||(31344685-31344783)
chr2 (100-199)||(23186884-23186980)
chr2 (100-199)||(23598147-23598243)
chr2 (127-199)||(1282936-1283008)
chr2 (127-199)||(41531491-41531563)
chr2 (163-228)||(30657567-30657632)
chr2 (102-199)||(22461393-22461485)
chr2 (129-208)||(24735192-24735273)
chr2 (170-208)||(19691914-19691952)
chr2 (153-199)||(22134501-22134547)
chr2 (103-152)||(13970570-13970619)
chr2 (91-124)||(24502947-24502980)
chr2 (103-152)||(24714568-24714617)
chr2 (97-126)||(24872631-24872660)
chr2 (97-126)||(24880516-24880545)
chr2 (91-124)||(27195581-27195614)
chr2 (103-152)||(41604933-41604982)
chr2 (103-152)||(41610830-41610879)
chr2 (103-152)||(45057626-45057675)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (91-312)||(37726-37947)
scaffold0141 (98-199)||(14572-14670)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (91-312)||(76865-77086)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (91-283)||(10016-10208)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (97-283)||(126326-126512)
scaffold0029 (91-283)||(106086-106278)
scaffold0029 (99-199)||(80090-80187)
scaffold0029 (98-199)||(65984-66082)
scaffold0029 (98-195)||(62068-62162)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (91-316)||(59661-59886)
scaffold0061 (98-199)||(67760-67859)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (91-316)||(25029-25254)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (91-316)||(138747-138972)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (91-307)||(38372-38588)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (99-283)||(26340-26524)
scaffold0109 (97-286)||(42950-43144)
scaffold0109 (98-199)||(39018-39117)
scaffold0109 (100-199)||(6769-6865)
scaffold0109 (100-199)||(36451-36547)
scaffold0109 (98-199)||(11501-11600)
scaffold0109 (97-151)||(43117-43172)
scaffold0109 (97-151)||(43145-43200)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (91-283)||(19792-19985)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (127-316)||(11988-12178)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (91-314)||(32530-32745)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (97-274)||(4297-4474)
scaffold0126 (240-274)||(4483-4517)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (97-274)||(8499-8676)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (91-228)||(12199-12336)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (91-283)||(25424-25619)
scaffold0242 (100-283)||(19277-19463)
scaffold0242 (100-152)||(25585-25637)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (91-228)||(77969-78106)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (91-274)||(9068-9255)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (97-274)||(21914-22091)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (100-283)||(241759-241945)
scaffold0010 (102-199)||(23026-23118)
scaffold0010 (91-124)||(241894-241927)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (91-228)||(9607-9744)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (97-286)||(15213-15406)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (97-228)||(73749-73880)
scaffold0009 (129-195)||(228598-228663)
scaffold0009 (103-152)||(73852-73901)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (92-284)||(9869-10065)
[»] scaffold0013 (5 HSPs)
scaffold0013 (91-283)||(9034-9230)
scaffold0013 (140-199)||(73818-73877)
scaffold0013 (129-208)||(2899-2977)
scaffold0013 (145-199)||(81468-81521)
scaffold0013 (103-151)||(9197-9245)
[»] scaffold0233 (2 HSPs)
scaffold0233 (100-283)||(14759-14945)
scaffold0233 (91-124)||(14777-14810)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (127-274)||(1063-1213)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (97-228)||(3893-4024)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (97-228)||(19-150)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (104-271)||(25198-25368)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (133-274)||(14699-14843)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (98-199)||(5558-5657)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (98-199)||(15144-15243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (98-199)||(11970-12069)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (98-199)||(33145-33244)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (98-199)||(16863-16962)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (99-199)||(4329-4427)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (98-208)||(77371-77477)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (98-196)||(1-97)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (98-199)||(9711-9809)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (98-199)||(36571-36669)
scaffold0031 (129-208)||(53354-53435)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (98-225)||(9118-9242)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (99-199)||(36116-36213)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (98-225)||(1658-1782)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (100-199)||(9229-9325)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (98-199)||(20664-20762)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (98-199)||(189862-189960)
scaffold0012 (100-208)||(25171-25275)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (100-199)||(6442-6538)
scaffold0546 (98-199)||(1707-1806)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (100-199)||(6489-6585)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (100-199)||(6201-6298)
scaffold0130 (127-199)||(8225-8297)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (98-199)||(208073-208171)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (98-198)||(8308-8405)
scaffold0111 (98-198)||(15428-15525)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (127-199)||(2-74)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (127-199)||(9400-9472)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (100-198)||(18164-18259)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (100-208)||(29352-29456)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (100-199)||(63663-63759)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (104-199)||(176-269)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (126-199)||(9889-9961)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (127-195)||(11523-11591)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (127-190)||(30725-30788)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (129-199)||(18859-18928)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (102-199)||(16487-16579)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (126-208)||(10283-10364)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (127-195)||(28880-28947)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (129-195)||(173106-173171)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (129-195)||(20243-20307)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (167-210)||(2651-2694)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (129-208)||(66651-66732)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (165-199)||(4-38)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (98-148)||(80979-81026)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (153-199)||(3397-3443)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 155)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 91 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6598625 - 6598397
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598625 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 6598526  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6598525 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 6598426  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggatacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598425 gttatgtttttcctaattattggatacac 6598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 91 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6605305 - 6605077
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605305 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 6605206  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6605205 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 6605106  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggatacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605105 gttatgtttttcctaattattggatacac 6605077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 91 - 319
Target Start/End: Original strand, 16758770 - 16758999
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758770 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16758869  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16758870 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattaa 16758969  T
Q  291 gttatg-tttttcctaattattggatacac 319  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16758970 gttatgttttttccaaattattggatacac 16758999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 319
Target Start/End: Original strand, 16748038 - 16748268
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748038 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16748137  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16748138 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtaatatgtgtttattgattaa 16748237  T
Q  291 gttatg--tttttcctaattattggatacac 319  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16748238 gttatgtttttttccaaattattggatacac 16748268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3690525 - 3690300
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690525 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 3690426  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3690425 gcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 3690326  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3690325 gttatgttattcctaatgattggata 3690300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 20057604 - 20057828
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057604 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20057703  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  20057704 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 20057802  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20057803 gttatgttattcctaattattggata 20057828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14673400 - 14673625
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673400 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14673499  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  14673500 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 14673599  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  14673600 gttatgttgttcataatgattggata 14673625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Original strand, 53387202 - 53387430
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387202 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 53387301  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga-cta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  53387302 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattggatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattta 53387401  T
Q  290 agttatgtttttcctaattattggataca 318  Q
     ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  53387402 tgtcttgttactcctaattattggataca 53387430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 53380550 - 53380745
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380550 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 53380649  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380650 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattggatatgtgattacgtgatatgtgtttattga 53380745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 417906 - 417681
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417906 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 417807  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  417806 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 417707  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||    
T  417706 gttatgttcctcataatgattggata 417681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 16624254 - 16624479
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624254 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16624353  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16624354 gcatgtaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattggttatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 16624453  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  16624454 gttatgttatccctaatgattggata 16624479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 20064242 - 20064466
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064242 cacgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20064341  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  20064342 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 20064440  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20064441 gttatgttattcctaattattggata 20064466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10010189 - 10009962
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010189 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10010090  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  10010089 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatacgtgcttattgattat 10009990  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggataca 318  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  10009989 gttatgttatccctaattaatggataca 10009962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6608362 - 6608141
Alignment:
Q  95 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608362 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 6608263  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagtta 294  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6608262 atatggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattatgtta 6608163  T
Q  295 tgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||  ||||||||| ||||||    
T  6608162 tgttactcctaattaatggata 6608141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 31422752 - 31422968
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422752 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 31422851  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  31422852 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 31422951  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  31422952 gttacgttgttcataat 31422968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 92 - 307
Target Start/End: Original strand, 5107084 - 5107299
Alignment:
Q  92 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107084 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 5107183  T
Q  192 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaag 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5107184 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattatg 5107283  T
Q  292 ttatgtttttcctaat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  5107284 ttacgttgttcgtaat 5107299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10003542 - 10003315
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003542 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10003443  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  10003442 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattatcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatacgtgcttattgattat 10003343  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggataca 318  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  10003342 gttatgttatccctaattaatggataca 10003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10904132 - 10903907
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10904132 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10904033  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  10904032 gcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgcttattgattat 10903933  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  10903932 gttatgttatccctaattaatggata 10903907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10910804 - 10910579
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910804 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10910705  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  10910704 gcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgcttattgattat 10910605  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  10910604 gttatgttatccctaattaatggata 10910579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37615299 - 37615083
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615299 cacgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 37615200  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  37615199 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 37615100  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  37615099 gttacgttgttcataat 37615083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 23704972 - 23705191
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704972 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23705071  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  23705072 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatatgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 23705171  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  23705172 ttgttcatgataattggata 23705191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 23723428 - 23723647
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723428 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23723527  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  23723528 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatatgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 23723627  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  23723628 ttgttcatgataattggata 23723647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 23741884 - 23742103
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741884 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23741983  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  23741984 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatatgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 23742083  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  23742084 ttgttcatgataattggata 23742103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Original strand, 10846483 - 10846689
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846483 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10846582  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  10846583 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgattaagtgataagtgtttattgattat 10846682  T
Q  291 gttatgt 297  Q
    |||||||    
T  10846683 gttatgt 10846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5221311 - 5221119
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221311 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 5221212  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5221211 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 5221119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13250625 - 13250409
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250625 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13250526  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  13250525 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 13250426  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  13250425 gttacgttgttcataat 13250409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13257271 - 13257055
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257271 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13257172  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  13257171 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 13257072  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  13257071 gttacgttgttcataat 13257055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 41202002 - 41202221
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41202002 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41202101  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  41202102 aaggagtttaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgtttacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 41202201  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  41202202 ttgttcatgataattggata 41202221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 15727136 - 15727322
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15727136 tattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 15727235  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15727236 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 15727322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 16489864 - 16490056
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489864 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16489963  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16489964 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 16490056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 265
Target Start/End: Original strand, 10153937 - 10154108
Alignment:
Q  94 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153937 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 10154036  T
Q  194 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10154037 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10154108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 97 - 298
Target Start/End: Original strand, 5150187 - 5150388
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5150187 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 5150286  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  5150287 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcgaatatgttatg 5150386  T
Q  297 tt 298  Q
    ||    
T  5150387 tt 5150388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16633736 - 16633511
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633736 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16633637  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  16633636 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 16633537  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16633536 gttatgttgtttataatgattggata 16633511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16640346 - 16640121
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640346 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16640247  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  16640246 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 16640147  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16640146 gttatgttgtttataatgattggata 16640121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43161011 - 43160786
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43161011 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 43160912  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  43160911 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 43160812  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  43160811 gttatgttgtttataatgattggata 43160786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43167248 - 43167023
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167248 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 43167149  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  43167148 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 43167049  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  43167048 gttatgttgtttataatgattggata 43167023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48423253 - 48423064
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48423253 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 48423154  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  48423153 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 48423064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 1333281 - 1333488
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333281 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 1333380  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  1333381 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 1333480  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  1333481 gttatgtt 1333488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48430024 - 48429842
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48430024 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 48429925  T
Q  198 aggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  48429924 aggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 48429842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26889362 - 26889155
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889362 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 26889263  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  26889262 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatacgtgattacgtgataagtgttcattgattat 26889163  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  26889162 gttatgtt 26889155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 41092565 - 41092751
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092565 tattaggagccttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41092664  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  41092665 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttat 41092751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 15584932 - 15585115
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584932 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacat 15585031  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15585032 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 15585115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 15591590 - 15591773
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591590 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacat 15591689  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15591690 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 15591773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12482316 - 12482139
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12482316 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 12482217  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12482216 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 12482139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 13316399 - 13316536
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316399 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13316498  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316499 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13316536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 26794594 - 26794792
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794594 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 26794693  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |  |||||   |||||||| | |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||    
T  26794694 gcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatgacgattgaataagtgaatacgtgatacttgtttattga 26794792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Original strand, 22643539 - 22643692
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22643539 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 22643638  T
Q  227 tgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22643639 tgattaagatgccttgttgataatgattgtatatgtgattacgtgataagtgtt 22643692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 15992316 - 15992502
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992316 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15992415  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  15992416 gcatataaggagtctaagtgcattgtcacattgtcatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 15992502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5201114 - 5200937
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5201114 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 5201015  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5201014 acagagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 5200937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 5420524 - 5420701
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5420524 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 5420623  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5420624 acggagtctaggagcattgtcacactgtcatgtctactatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 5420701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 5426931 - 5427108
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5426931 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 5427030  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5427031 acggagtctaggagcattgtcacactgtcatgtctactatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 5427108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 10236607 - 10236744
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10236607 cacgattattaggagctttgtcctgcgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10236706  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10236707 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10236744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19808918 - 19808781
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19808918 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtaccacat 19808819  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19808818 gcatataaggagtctaagagcatcgtcacattgtcatg 19808781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15825556 - 15825370
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825556 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15825457  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  15825456 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 15825370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10325742 - 10325546
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325742 cacgattattaggagctttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 10325643  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  10325642 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 10325546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55148866 - 55148680
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55148866 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag 55148767  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  55148766 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 55148680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 410972 - 411103
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410972 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 411071  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  411072 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 411103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368854
Alignment:
Q  106 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368673 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28368772  T
Q  205 taagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  28368773 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 28368854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376672
Alignment:
Q  106 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376491 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28376590  T
Q  205 taagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  28376591 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 28376672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384494
Alignment:
Q  106 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384313 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28384412  T
Q  205 taagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  28384413 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 28384494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 15367151 - 15367343
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15367151 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtaccacatgcatat 15367250  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||   |||||||| | |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  15367251 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaataagtgaatacgtgatatttgtttattga 15367343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 15404716 - 15404908
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15404716 tattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgaatat 15404815  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg---attaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   || | | |   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15404816 aaggagtctaagagcattgtcatattgtcatgtccataatgttatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatatttgtttattga 15404908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7985596 - 7985409
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7985596 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccaca 7985497  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  7985496 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgtttgaatatgtgattacgtgata 7985409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 17710806 - 17710943
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17710806 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17710905  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17710906 gcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 17710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337152
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15337338 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15337239  T
Q  203 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   |  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15337238 tctaagagcattgtcatattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatatttgtttattga 15337152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 1145773 - 1145904
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1145773 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1145872  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1145873 aaggagtttaagagcattgtcacattgtcatg 1145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 8721377 - 8721508
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721377 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 8721476  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721477 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8721508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 9073264 - 9073395
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073264 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 9073363  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073364 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9073395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 15350470 - 15350601
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15350470 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 15350569  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15350570 aaggagtctaatagcattgtcacattgtcatg 15350601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24187665 - 24187488
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24187665 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24187566  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24187565 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 24187488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12891288 - 12891094
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891288 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 12891189  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  12891188 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 12891094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360410
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360596 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15360497  T
Q  203 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||   |  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15360496 tctaagagcattgtcatatttttatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatatttgtttattga 15360410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 17253280 - 17253474
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253280 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 17253379  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  17253380 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 17253474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 15343826 - 15343957
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343826 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 15343925  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343926 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15343957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13320865 - 13320668
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320865 cacgattattaggagctttgtcctccgcacaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 13320766  T
Q  189 atgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  13320765 atgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttat 13320668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 30777447 - 30777578
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777447 tattagaagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 30777546  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30777547 aaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 30777578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 15398104 - 15398290
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 202  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15398104 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataaggag 15398203  T
Q  203 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   |  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15398204 tctaagagcattgtcatattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatatttgtttattga 15398290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4710185 - 4709999
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4710185 tattaggagctttgtcctctgcacgattattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 4710086  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||   |  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  4710085 aaagagtctaagagcattgcaacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatatttgtt 4709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 291
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696103
Alignment:
Q  134 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  29695943 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccat 29696042  T
Q  234 gatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaag 291  Q
    ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  || ||||||| ||||    
T  29696043 gatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttggttattgaataag 29696103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 26789013 - 26789114
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26789013 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 26789112  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  26789113 tg 26789114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 839134 - 838948
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  839134 taggagttttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 839035  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  839034 aattctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatggttgaatatgtgaatacgtgataattgtttat 838948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16333062 - 16332935
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333062 cacgattatcaggagttttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 16332963  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16332962 tgcatataaggagtctaagagcattgtc 16332935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20722889 - 20722772
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20722889 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20722790  T
Q  200 gagtctaagagcattgtc 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20722789 gagtctaagagcattgtc 20722772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 15692482 - 15692571
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15692482 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15692571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Original strand, 15711579 - 15711680
Alignment:
Q  182 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15711579 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttt 15711678  T
Q  282 at 283  Q
    ||    
T  15711679 at 15711680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 4107858 - 4107957
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107858 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 4107955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 4111710 - 4111809
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111710 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 4111807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7109346 - 7109247
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109346 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 7109249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7113281 - 7113182
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113281 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 7113184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 27410103 - 27410202
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410103 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27410200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 55022515 - 55022416
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022515 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 55022418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3833580 - 3833482
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3833580 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 3833484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15964593 - 15964495
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964593 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15968517 - 15968419
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968517 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15968421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15972441 - 15972343
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972441 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15972345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30065598 - 30065490
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065598 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30065501  T
Q  198 aggagtctaag 208  Q
    | | |||||||    
T  30065500 aagtgtctaag 30065490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11069718 - 11069619
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069718 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacatgcatata 11069621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 11165988 - 11166087
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165988 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcatccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11166085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14498975 - 14498876
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498975 attaggagctttgtcctccgcacatttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14498878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15617024 - 15616925
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617024 attaggagctttgtcctccgcacggttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15616927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 16750802 - 16750899
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750802 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16750898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19775217 - 19775118
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775217 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19775120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28949372 - 28949273
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949372 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgaaaaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 28949275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15464746 - 15464650
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464746 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15464650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 1598679 - 1598777
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598679 attaggagctttgtcctcctcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38814290 - 38814192
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814290 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcatgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 38814194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16696690 - 16696593
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16696690 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16696594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22321314 - 22321215
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321314 attaggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22321217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22336369 - 22336270
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336369 attaggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22336272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12339347 - 12339251
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339347 taggagctttgtcctccgcacgatt---agcagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12339251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5222970 - 5222873
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5222970 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 5222875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 15942104 - 15942202
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15942104 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatata 15942200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 4589378 - 4589471
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589378 gagctttgtcctccccacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4589471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 16809082 - 16809177
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16809082 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16809177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 37440123 - 37440195
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440123 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 37440195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 8489652 - 8489745
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8489652 gagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 8489745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17241874 - 17241782
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17241874 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17241782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 16798255 - 16798336
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16798255 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtac 16798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15482542 - 15482473
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482542 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15482473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 31097779 - 31097847
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31097779 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 31097847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4290979 - 4290920
Alignment:
Q  169 atgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4290979 atgatgacgattggcaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4290920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 7793586 - 7793667
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7793586 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 7793667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 20461736 - 20461817
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20461736 ggagctttgtcctccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaag 20461817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 327401 - 327482
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  327401 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14668430 - 14668349
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14668430 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 14668349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14665247 - 14665193
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14665247 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 14665193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 2898058 - 2898140
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2898058 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgaagtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 2898140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12339372 - 12339322
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12339372 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatta 12339322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 10154132 - 10154208
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  10154132 ttgttgataatgattgaatatttgattacgtgataagtgtttaatgattatgttatgttgttcatgatgattggata 10154208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11854313 - 11854266
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11854313 ttaggagctttgtcctccgcacgtt---taggagctttgtcctccgcacga 11854266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572376
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14572431 aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 14572376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577166
Alignment:
Q  155 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaga 209  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14577112 gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagacgtctaaga 14577166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15464771 - 15464721
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15464771 attaggagttttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatta 15464721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 15711751 - 15711827
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  15711751 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatgttgttcatgataattggata 15711827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 15727393 - 15727469
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  15727393 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatgttgttcatgataattggata 15727469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 11300963 - 11301017
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  11300963 cacgattattaggagttttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 11301017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 283
Target Start/End: Original strand, 15711694 - 15711737
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15711694 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 15711737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 283
Target Start/End: Original strand, 15727336 - 15727379
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15727336 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 15727379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 49668364 - 49668411
Alignment:
Q  152 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  49668364 aaagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 49668411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5200928 - 5200894
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5200928 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 5200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9512752 - 9512706
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  9512752 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 9512706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9520727 - 9520681
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  9520727 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 9520681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12482130 - 12482096
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12482130 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 12482096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16103612 - 16103566
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  16103612 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 16103566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 410951 - 411000
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  410951 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 411000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 1145752 - 1145801
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1145752 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 1145801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 8721356 - 8721405
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8721356 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 8721405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 9073243 - 9073292
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9073243 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 9073292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 15343805 - 15343854
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15343805 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 15343854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 15350449 - 15350498
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15350449 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 15350498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 15367130 - 15367179
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15367130 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 15367179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55148848 - 55148815
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55148848 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 55148815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 839115 - 839083
Alignment:
Q  92 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  839115 acgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 839083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6596964 - 6596936
Alignment:
Q  291 gttatgtttttcctaattattggatacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596964 gttatgtttttcctaattattggatacac 6596936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Original strand, 15404695 - 15404743
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt 151  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15404695 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt 15404743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 102)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8797097 - 8796872
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797097 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8796998  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8796997 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 8796898  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||    
T  8796897 gttatgctattcctaattaatggata 8796872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20801663 - 20801438
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801663 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20801564  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20801563 gcatataatgagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 20801464  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  20801463 gatatgttattcctaatgattggata 20801438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27185598 - 27185373
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185598 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27185499  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27185498 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 27185399  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||    
T  27185398 gttatgctattcctaattaatggata 27185373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27207434 - 27207209
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207434 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27207335  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27207334 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 27207235  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||    
T  27207234 gttatgctattcctaattaatggata 27207209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 27241794 - 27242019
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241794 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27241893  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27241894 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 27241993  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||    
T  27241994 gttatgctattcctaattaatggata 27242019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 27263642 - 27263867
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263642 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27263741  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27263742 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 27263841  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||    
T  27263842 gttatgctattcctaattaatggata 27263867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28258655 - 28258880
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258655 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28258754  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  28258755 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgaatgt 28258854  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28258855 gttatgttattcctaattattggata 28258880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28265279 - 28265504
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265279 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28265378  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  28265379 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgaatgt 28265478  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28265479 gttatgttattcctaattattggata 28265504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28287261 - 28287036
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287261 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28287162  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  28287161 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgaatgt 28287062  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28287061 gttatgttattcctaattattggata 28287036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28337404 - 28337629
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337404 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28337503  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  28337504 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgaatgt 28337603  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28337604 gttatgttattcctaattattggata 28337629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28344028 - 28344253
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344028 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28344127  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  28344128 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgaatgt 28344227  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28344228 gttatgttattcctaattattggata 28344253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 27430484 - 27430709
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430484 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27430583  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  27430584 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattggttatgtgattacgtgatatgtgtttattaattat 27430683  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  27430684 gatatgttattcctaatgattggata 27430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28314459 - 28314234
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314459 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28314360  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  28314359 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattccgtgatatgtgtttattgattat 28314260  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  28314259 gttatgttatccctaattaatggata 28314234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Original strand, 2870336 - 2870542
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870336 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 2870435  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  2870436 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgattaagtgataagtgtttattgattat 2870535  T
Q  291 gttatgt 297  Q
    |||||||    
T  2870536 gttatgt 2870542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Original strand, 2876951 - 2877157
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876951 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 2877050  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  2877051 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgattaagtgataagtgtttattgattat 2877150  T
Q  291 gttatgt 297  Q
    |||||||    
T  2877151 gttatgt 2877157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30694268 - 30694077
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694268 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30694169  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30694168 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgttta 30694077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26130373 - 26130148
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130373 cacgaatattaggagctttgtcccccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 26130274  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  26130273 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtggttatcgaatat 26130174  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  26130173 gttatgttgttcatgataattggata 26130148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 20649991 - 20650207
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649991 cacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20650090  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  20650091 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttggtaatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 20650190  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  20650191 gttacgttgttcataat 20650207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30597132 - 30596916
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597132 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30597033  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||     
T  30597032 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcacgattaagatgtcttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttgttgattat 30596933  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  30596932 gttatgttgttcataat 30596916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6980566 - 6980341
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980566 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 6980467  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  6980466 gcatatgaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgcctcgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 6980367  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  6980366 gttatgttgtttataatgattggata 6980341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20060555 - 20060330
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060555 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20060456  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  20060455 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgagtggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 20060356  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  20060355 gttatgttgtttataatgattggata 20060330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 30638351 - 30638567
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638351 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30638450  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  30638451 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 30638550  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  30638551 gttacgttgttcataat 30638567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8228772 - 8228583
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228772 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8228673  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  8228672 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 8228583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29587901 - 29588126
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29587901 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 29588000  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  29588001 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 29588100  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29588101 gttatgttgtttataatgattggata 29588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29594042 - 29594267
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29594042 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 29594141  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  29594142 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 29594241  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29594242 gttatgttgtttataatgattggata 29594267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 116 - 312
Target Start/End: Original strand, 14053784 - 14053980
Alignment:
Q  116 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14053784 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattg 14053883  T
Q  216 tcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  14053884 tcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattatgttatgttgttcataatgattg 14053980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18930961 - 18930754
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18930961 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18930862  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  18930861 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 18930762  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  18930761 gttatgtt 18930754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 27328257 - 27328482
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328257 cacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27328356  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||  | ||     
T  27328357 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataaatgtttatcaattat 27328456  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  27328457 gttatgttgttcatgataattggata 27328482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 27388997 - 27389222
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388997 cacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27389096  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||  | ||     
T  27389097 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataaatgtttatcaattat 27389196  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  27389197 gttatgttgttcatgataattggata 27389222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Original strand, 4233708 - 4233897
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233708 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 4233807  T
Q  227 tgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  4233808 tgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattatgttatgttattcataatgattggata 4233897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12762608 - 12762420
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762608 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttt-ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12762510  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12762509 gcataaaaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtt 12762420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 1545263 - 1545447
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545263 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1545362  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttt 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  1545363 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgatagaatatgtgattacgtgataagtgttt 1545447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 1539164 - 1539341
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1539164 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1539263  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1539264 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgata 1539341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14098485 - 14098312
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14098485 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgatgacgattggtaccacatgcatat 14098386  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14098385 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatacgtgattacgt 14098312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 16552239 - 16552416
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16552239 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16552338  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16552339 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 16552416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16576714 - 16576537
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16576714 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16576615  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16576614 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 16576537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 16618666 - 16618843
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618666 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16618765  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16618766 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 16618843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 16628795 - 16628972
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628795 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16628894  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16628895 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 16628972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 32565461 - 32565638
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32565461 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 32565560  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32565561 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 32565638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 3708697 - 3708895
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708697 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatcggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 3708796  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  3708797 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacctgtttattga 3708895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25117334 - 25117148
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25117334 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacat 25117235  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  25117234 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccaaaatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 25117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19808417 - 19808221
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808417 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 19808318  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  19808317 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgaatacgtgataattgtttat 19808221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4208494 - 4208295
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208494 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 4208395  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4208394 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 4208295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 17017141 - 17017318
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017141 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 17017240  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17017241 atggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 17017318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25110731 - 25110594
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25110731 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacat 25110632  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25110631 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25110594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 34298841 - 34299027
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298841 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 34298940  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  34298941 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 34299027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34832539 - 34832346
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34832539 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcata 34832440  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  34832439 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgataatgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 34832346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4167814 - 4167615
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167814 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 4167715  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4167714 tgcatataaggattctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 4167615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 24291267 - 24291398
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291267 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 24291366  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291367 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24291398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 24315295 - 24315426
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24315295 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 24315394  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24315395 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24315426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 31317307 - 31317438
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317307 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 31317406  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317407 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 31317438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25928186 - 25927990
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928186 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 25928087  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||   |||||||| |||||||| || |||| || ||||||  |||||||    
T  25928086 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctatgatgctatgttgttgatgatgattgaatacgtgaatatgtgataattgtttat 25927990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 34370189 - 34370385
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34370189 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgattgttaccaca 34370288  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |   |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  34370289 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgttatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacatgataaatgtttat 34370385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20176824 - 20176632
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20176824 ttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatat 20176725  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20176724 aaggagtctaagagcattgtcacattgttatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 20176632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22758741 - 22758604
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758741 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg-ttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 22758643  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758642 tgcatataaggagtctaagagaattgtcgcattgtcatg 22758604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Original strand, 5834708 - 5834900
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5834708 ttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatat 5834807  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  5834808 aaggagtctaagagcattgtcacattgttatgtccataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 5834900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Original strand, 22159167 - 22159294
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22159167 ttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatat 22159266  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159267 aaggagtctaagagcattgtcacattgt 22159294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Original strand, 17037553 - 17037666
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037553 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 17037652  T
Q  197 aaggagtctaagag 210  Q
    ||||||||||||||    
T  17037653 aaggagtctaagag 17037666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1644157 - 1644058
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644157 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1644060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11566509 - 11566410
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566509 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11566412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 12619301 - 12619400
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619301 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12619398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14471860 - 14471761
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471860 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14471763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16624001 - 16623902
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624001 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16623904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19870237 - 19870138
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870237 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22862593 - 22862494
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862593 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22862496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23394715 - 23394616
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394715 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23394618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23989567 - 23989468
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989567 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23989470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 25135871 - 25135970
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135871 attaggagctttgtcctccgcacgattta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 25135968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 1587932 - 1588029
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587932 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1588029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 5617016 - 5617113
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5617016 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5617113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16759915 - 16759817
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759915 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16759819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22948729 - 22948631
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948729 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22952685 - 22952587
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952685 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22952589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23414551 - 23414453
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414551 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23414455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23871173 - 23871075
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871173 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23871077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23875129 - 23875031
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23875129 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23875033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8243480 - 8243381
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243480 attaggagctttgtcctccgcacgtttca--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 8243383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 27416387 - 27416484
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416387 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27416482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12496214 - 12496117
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496214 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtccttcgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 12496118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21702185 - 21702095
Alignment:
Q  107 tttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702185 tttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21702095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 20803755 - 20803852
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803755 taggagctttgtcctctacacgtttta--ggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20803852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 197
Target Start/End: Original strand, 9482494 - 9482588
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482494 taggagctttctcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27556309 - 27556211
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| || | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556309 attaggagctttgtcctccacatgat---taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27556213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 31478444 - 31478542
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31478444 ttaggagctttgtccttcgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaaatgcatataa 31478541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12706590 - 12706498
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12706590 gagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12706498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 18917895 - 18917967
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917895 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18917967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 2685522 - 2685614
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2685522 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 2685614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16741108 - 16741016
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741108 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16741016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19662671 - 19662579
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662671 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19662579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Original strand, 27325854 - 27325950
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcacattgtc 225  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  27325854 ggagctttgttctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 27325950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Original strand, 22430255 - 22430327
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430255 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 22430327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17804067 - 17803986
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17804067 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 17803986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14098513 - 14098461
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14098513 tattaagagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 14098461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16624025 - 16623978
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  16624025 attaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 16623978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1644180 - 1644134
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  1644180 ttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 1644134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14471883 - 14471837
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  14471883 ttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 14471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25471779 - 25471728
Alignment:
Q  258 tatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaatta 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  25471779 tatgtgattacgtgatatgtgcttattgattatgttatgctattcctaatta 25471728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 32565647 - 32565681
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32565647 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 32565681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 24291246 - 24291295
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24291246 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 24291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 24315274 - 24315323
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24315274 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 24315323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 31317286 - 31317335
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31317286 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 31317335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 34298859 - 34298892
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298859 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 34298892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28454655 - 28454430
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454655 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28454556  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  28454555 gcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 28454456  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28454455 gttatgttattcctaatgattggata 28454430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19496294 - 19496072
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496294 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19496195  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  19496194 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 19496096  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattgga 314  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  19496095 gttatgatattcctaattattgga 19496072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19498342 - 19498120
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498342 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19498243  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  19498242 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 19498144  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattgga 314  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  19498143 gttatgatattcctaattattgga 19498120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 8354966 - 8355191
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8354966 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggcaccacat 8355065  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8355066 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 8355165  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  8355166 gttatgttgttcatgatgattggata 8355191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22047850 - 22047630
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047850 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22047751  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  22047750 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 22047652  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattg 312  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  22047651 gttatgatattcctaattattg 22047630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 5534639 - 5534834
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534639 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 5534738  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5534739 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgattacgtgataagtgtttattga 5534834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 16883378 - 16883597
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883378 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16883477  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  16883478 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 16883577  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  16883578 ttgttcatgataattggata 16883597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29122986 - 29122767
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29122986 tattaggagctttgtcctccgcacgttttatagtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29122887  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  29122886 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 29122787  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  29122786 ttgttcatgataattggata 29122767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 94 - 316
Target Start/End: Original strand, 21915772 - 21915994
Alignment:
Q  94 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915772 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 21915871  T
Q  194 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagtt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  21915872 tataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattatgtt 21915971  T
Q  294 atgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||| ||  |||| ||||||||    
T  21915972 atgttgtttataatgattggata 21915994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22083736 - 22083511
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083736 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22083637  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  22083636 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 22083537  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  22083536 gttatgttgtttataatgattggata 22083511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 17669770 - 17669986
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669770 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17669869  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  17669870 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgcttattgattat 17669969  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  17669970 gttacgttgttcataat 17669986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 22123586 - 22123793
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123586 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22123685  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  22123686 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgattatcgaatat 22123785  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  22123786 gttatgtt 22123793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 17676422 - 17676638
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676422 cacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17676521  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  17676522 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgcttattgattat 17676621  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  17676622 gttacgttgttcataat 17676638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18865229 - 18865010
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18865229 tattaggagctttgtccttcgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcacat 18865130  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  18865129 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 18865030  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  18865029 ttgttcctgataattggata 18865010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Original strand, 22115922 - 22116113
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115922 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22116021  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22116022 gcatataaggagtctaggagcattgtcacactgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtaattacgtgataagtgttta 22116113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19111131 - 19110943
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111131 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19111032  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  19111031 gcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 19110943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19117422 - 19117234
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19117422 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19117323  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  19117322 gcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 19117234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 22124730 - 22124913
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22124730 cacgattattaggagatttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacgt 22124829  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22124830 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtaattacgtgata 22124913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18854855 - 18854642
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 202  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854855 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 18854756  T
Q  203 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||    
T  18854755 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatgttgttc 18854656  T
Q  303 ctaattattggata 316  Q
     | || ||||||||    
T  18854655 ttgataattggata 18854642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 20014063 - 20014200
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014063 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20014162  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014163 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20014200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 20020140 - 20020277
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020140 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20020239  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020240 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20020277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20527337 - 20527151
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20527337 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaa 20527238  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20527237 gagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgatagttgtttat 20527151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 23845984 - 23846176
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23845984 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23846083  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||   |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23846084 aaggagtctatgagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgatgattgaataagtgaatacgtgatatttgtttattga 23846176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18065217 - 18065040
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18065217 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagatttgtcctccgcacgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcatgt 18065118  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18065117 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 18065040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 26935400 - 26935594
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935400 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 26935499  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  26935500 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 26935594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19905387 - 19905252
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905387 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 19905288  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19905287 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 19905252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 20024150 - 20024281
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20024150 tattaggagttttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacattcatat 20024249  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20024250 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20024281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3216147 - 3215953
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216147 tattaggagctttgtcctccgcacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 3216048  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  3216047 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 3215953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21410571 - 21410473
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410571 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21410475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21805063 - 21804965
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805063 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21804967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 21977131 - 21977230
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977131 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21977228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22111578 - 22111479
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111578 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22111481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43251458 - 43251359
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251458 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 43251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32598583 - 32598486
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32598583 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 32598486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32605115 - 32605018
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32605115 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 32605018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15531795 - 15531697
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531795 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15531699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15538354 - 15538256
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538354 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15538258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 18863130 - 18863228
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863130 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18863226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 21828499 - 21828597
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828499 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 30940562 - 30940660
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940562 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30940658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 17055579 - 17055703
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17055579 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata-c 17055674  T
Q  198 aggagtctaag-agcattgtcacattgtc 225  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17055675 aggagtctaagttgcattgtcgcattgtc 17055703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 273
Target Start/End: Original strand, 20705896 - 20706032
Alignment:
Q  140 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||    
T  20705896 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctagtatgct 20705995  T
Q  240 ---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgat 273  Q
       |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  20705996 atgttgttgatgacgattgaatatgtaattacgtgat 20706032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 21973040 - 21973139
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973040 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21973137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 24445706 - 24445803
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445706 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24445802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 23847216 - 23847312
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23847216 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23847312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 30308954 - 30309050
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308954 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30309050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 17828782 - 17828880
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828782 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 17828878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 14398308 - 14398406
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398308 attaggagctttgtcctccacacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatata 14398404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22044786 - 22044693
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044786 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22044693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15440465 - 15440393
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15440465 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15440393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21386979 - 21386881
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386979 attaggagctttgccatccgcacgttt---aggaactttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21386883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 16231679 - 16231771
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231679 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16231771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23834074 - 23833982
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834074 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23833982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Original strand, 19278748 - 19278821
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgca-cgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac-atgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19278748 taggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataa 19278821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18065031 - 18064997
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18065031 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 18064997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20527319 - 20527286
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527319 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 20527286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 23845963 - 23846012
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23845963 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 23846012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37543945 - 37543720
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543945 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 37543846  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37543845 gcatataaggagtctaagagcattgtcacagtgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 37543746  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  37543745 gatatgttattcctaatgattggata 37543720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23584044 - 23583819
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584044 cacgaatattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23583945  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  23583944 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 23583845  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  23583844 gttatgtcgttcataatgattggata 23583819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 27670628 - 27670844
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670628 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27670727  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  27670728 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 27670827  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  27670828 gttacgttgttcataat 27670844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33725763 - 33725538
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725763 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 33725664  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  33725663 gcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatacgtgcttattgattat 33725564  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  33725563 gttatgttatccctaattaatggata 33725538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22264850 - 22264634
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264850 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22264751  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  22264750 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 22264651  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  22264650 gttacgttgttcataat 22264634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22139589 - 22139370
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139589 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 22139490  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  22139489 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 22139390  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  22139389 ttgttcatgataattggata 22139370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22587995 - 22587776
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22587995 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 22587896  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  22587895 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 22587796  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  22587795 ttgttcatgataattggata 22587776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 29471565 - 29471784
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471565 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29471664  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  29471665 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 29471764  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  29471765 ttgttcatgataattggata 29471784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 97 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20775766 - 20775545
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20775766 tattaggagctttgtcctccgcacgaatattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 20775667  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  20775666 aaggagtctaagagcattgccacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattgattatgctatg 20775567  T
Q  297 tttttcctaattattggataca 318  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  20775566 ttactcctaattattggataca 20775545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 22328363 - 22328588
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328363 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22328462  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||     
T  22328463 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagataccttattgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttatcgaatac 22328562  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  22328563 gttatgttgttcatgataattggata 22328588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27608645 - 27608420
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608645 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27608546  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27608545 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 27608446  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  27608445 gttatgttgtttataatgattggata 27608420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 37286981 - 37287206
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286981 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 37287080  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  37287081 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgattatcgaatat 37287180  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  37287181 gttatgttgttcatgataattggata 37287206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 37293684 - 37293909
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293684 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 37293783  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  37293784 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgattatcgaatat 37293883  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  37293884 gttatgttgttcatgataattggata 37293909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 27663989 - 27664205
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663989 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27664088  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  27664089 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 27664188  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  27664189 gttacgttgttcataat 27664205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 34294752 - 34294968
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294752 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 34294851  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  34294852 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 34294951  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  34294952 gttacgttgttcataat 34294968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 41098422 - 41098638
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098422 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41098521  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  41098522 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattat 41098621  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  41098622 gttacgttgttcataat 41098638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22132897 - 22132678
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132897 tattaggagctttgtccttcgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 22132798  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  22132797 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 22132698  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  22132697 ttgttcatgataattggata 22132678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25406324 - 25406105
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406324 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 25406225  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  25406224 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 25406125  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  25406124 ttgttcatgataattggata 25406105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 29478160 - 29478379
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478160 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29478259  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  29478260 aaggagtctaagagcattgtcacattggcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 29478359  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  29478360 ttgttcatgataattggata 29478379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17283967 - 17283781
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17283967 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacatgcatat 17283868  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17283867 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 17283781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 17707129 - 17707354
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17707129 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccactt 17707228  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17707229 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 17707328  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  17707329 gttatgttgtttataatgattggata 17707354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19991788 - 19991564
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991788 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19991689  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||     
T  19991688 gcatataa-gagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttatcgaatat 19991590  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  19991589 gttatgttgttcatgataattggata 19991564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27615251 - 27615026
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615251 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27615152  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27615151 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 27615052  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  27615051 gttatgttgtttataatgattggata 27615026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 18038868 - 18039060
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038868 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttatatgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18038967  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  18038968 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 18039060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 24472447 - 24472662
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472447 cacgaatattaggagctt-gtcctccgcacgttttataagagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 24472545  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  24472546 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 24472645  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  24472646 gttacgttgttcataat 24472662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Original strand, 1692637 - 1692828
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692637 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 1692736  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  1692737 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgttta 1692828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 265
Target Start/End: Original strand, 22341802 - 22341976
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341802 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22341901  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22341902 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttcttgataatgattgattatgtgat 22341976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16354729 - 16354504
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354729 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16354630  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  16354629 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 16354530  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16354529 gttatgttgtttataatgattggata 16354504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16361388 - 16361163
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361388 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16361289  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  16361288 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 16361189  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16361188 gttatgttgtttataatgattggata 16361163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34564722 - 34564497
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34564722 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 34564623  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  34564622 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 34564523  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  34564522 gttatgttgtttataatgattggata 34564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34571377 - 34571152
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571377 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 34571278  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  34571277 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 34571178  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  34571177 gttatgttgtttataatgattggata 34571152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 41294634 - 41294859
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41294634 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41294733  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  41294734 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgttgatgactgaatacgtgattacatgataagtgtttattgattat 41294833  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  41294834 gttatgttgttcatgataattggata 41294859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 15001880 - 15002072
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001880 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15001979  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15001980 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 15002072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40707027 - 40706838
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707027 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40706928  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40706927 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 40706838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40713669 - 40713480
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40713669 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40713570  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40713569 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 40713480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25106668 - 25106461
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25106668 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 25106569  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  25106568 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 25106469  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  25106468 gttatgtt 25106461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25165761 - 25165554
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165761 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 25165662  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  25165661 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 25165562  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  25165561 gttatgtt 25165554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27516657 - 27516450
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27516657 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggtaccacat 27516558  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  27516557 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 27516458  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  27516457 gttatgtt 27516450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27523294 - 27523087
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27523294 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggtaccacat 27523195  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  27523194 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 27523095  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  27523094 gttatgtt 27523087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 14995237 - 14995429
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995237 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14995336  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14995337 gcatgtagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 14995429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 22063082 - 22063266
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063082 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22063181  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatg-attgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  22063182 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaattggatatatgattacgtgata 22063266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Original strand, 27687529 - 27687720
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687529 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27687628  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  27687629 gcatatagggagtctaagagcattgtcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgggataagtgttta 27687720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 22410811 - 22410994
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410811 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacat 22410910  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22410911 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 22410994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23609799 - 23609619
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23609799 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23609700  T
Q  227 tgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaat 307  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  23609699 tggttaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattatgttatgttgttcataat 23609619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23841195 - 23841015
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23841195 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23841096  T
Q  227 tgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaat 307  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  23841095 tggttaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattatgttatgttgttcataat 23841015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23249844 - 23249707
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249844 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23249745  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249744 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23249707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41769148 - 41768950
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769148 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41769049  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||   |||||||| | |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||    
T  41769048 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatgacgattgaataagtgaatacgtgatacttgtttattga 41768950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41775722 - 41775524
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775722 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41775623  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||   |||||||| | |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||    
T  41775622 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatgacgattgaataagtgaatacgtgatacttgtttattga 41775524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 282
Target Start/End: Original strand, 27680912 - 27681078
Alignment:
Q  116 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27680912 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattg 27681011  T
Q  216 tcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  27681012 tcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacctgataagtgttta 27681078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29316305 - 29316128
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316305 tattaggagctttgtcctccgcacaattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29316206  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29316205 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 29316128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 15442171 - 15442367
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442171 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 15442270  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  15442271 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaacatgtgattacgtgataattgtttat 15442367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 21668025 - 21668202
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21668025 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 21668124  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  21668125 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgactacatgata 21668202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 22258700 - 22258877
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258700 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 22258799  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22258800 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 22258877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 21295481 - 21295667
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295481 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21295580  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  21295581 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 21295667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19768238 - 19768101
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768238 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19768139  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768138 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19768101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25534876 - 25534690
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25534876 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25534777  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  25534776 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatggttgaatatgtgattacgtgataattgtttat 25534690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19774828 - 19774697
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774828 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 19774729  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774728 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19774697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 14360034 - 14360230
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360034 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 14360133  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  14360134 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgaatacgtgataattgtttat 14360230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24020174 - 24020037
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020174 cacgattattaggagctttgtactccgtacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 24020075  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020074 gcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24020037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 22326150 - 22326282
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326150 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 22326249  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326250 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22326282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22343381 - 22343187
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22343381 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcat 22343282  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  22343281 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 22343187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Original strand, 23337511 - 23337689
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23337511 tattaggagctttgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcata 23337610  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  23337611 taaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatgattgaatacgtgaatacgtg 23337689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22352781 - 22352648
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352781 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 22352682  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352681 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22352648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24554422 - 24554233
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttt---tataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554422 taggagctttgtcctccgcacgattatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 24554323  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |   |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  24554322 aaggaatctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgttatgttgttgatgatgattgaatacttgattacgtgataattgtttat 24554233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11220369 - 11220271
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220369 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11228778 - 11228680
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228778 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11228682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11230767 - 11230669
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230767 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11230671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 15237294 - 15237393
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237294 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15237391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 19473177 - 19473276
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473177 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19473274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 40724068 - 40724174
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724068 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaga--agctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40724165  T
Q  191 gcatataag 199  Q
    |||||||||    
T  40724166 gcatataag 40724174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 25229607 - 25229704
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229607 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25229704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 25293763 - 25293860
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293763 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25293860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11224955 - 11224857
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11224955 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatata 11224859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11226788 - 11226690
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226788 attaagagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11226692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 20911394 - 20911492
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911394 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20911490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10752837 - 10752738
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752837 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 10752740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20295494 - 20295395
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295494 attaggagctttgtcctcctcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20295397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4036123 - 4036026
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4036123 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 4036026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 17730608 - 17730705
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17730608 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 17730705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Original strand, 21885389 - 21885495
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21885389 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatata 21885485  T
Q  198 aggagtctaag 208  Q
    | |||||||||    
T  21885486 a-gagtctaag 21885495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33409134 - 33409036
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409134 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagttttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33409038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 21340968 - 21341064
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340968 taggagctttgtcctccgcactttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21341064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26172370 - 26172264
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26172370 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatata 26172274  T
Q  198 aggagtctaag 208  Q
    | |||||||||    
T  26172273 a-gagtctaag 26172264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18355863 - 18355765
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18355863 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatata 18355767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16674057 - 16673961
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16674057 taggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatataag 16673961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18783948 - 18783856
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783948 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18783856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 26742950 - 26743042
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26742950 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataag 26743042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18774085 - 18774013
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774085 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18774013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20232453 - 20232361
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20232453 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtatcacatgcatataag 20232361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42805322 - 42805230
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805322 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-aatgatgacgattggtaccacatgcatataag 42805230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 26666354 - 26666426
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26666354 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatataag 26666426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 26937951 - 26938023
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26937951 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatataag 26938023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 24767786 - 24767867
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24767786 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaag 24767867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 24533271 - 24533343
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24533271 ataggagctttgtcctccacacgattaaaatatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataag 24533343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 23535791 - 23535861
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23535791 ggagcttcgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatcacgattgataccacatgcatataagg 23535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19768253 - 19768204
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19768253 gagcttagtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatta 19768204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17410309 - 17410278
Alignment:
Q  168 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410309 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17410278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20775745 - 20775715
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20775745 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 20775715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23609808 - 23609778
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609808 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23609778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23841204 - 23841174
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841204 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23841174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 21295499 - 21295532
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295499 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 21295532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25534858 - 25534825
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25534858 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 25534825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 16345975 - 16346200
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16345975 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16346074  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16346075 gcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattat 16346174  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||    
T  16346175 gttatgctattcctaatgattggata 16346200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47659119 - 47658894
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47659119 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 47659020  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||     
T  47659019 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgctttttgattat 47658920  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||    
T  47658919 gttatgttatccctaattaatggata 47658894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 316
Target Start/End: Original strand, 16352634 - 16352849
Alignment:
Q  101 aggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16352634 aggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaga 16352733  T
Q  201 agtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  16352734 agtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattatgttatgctat 16352833  T
Q  301 tcctaattattggata 316  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16352834 tcctaatgattggata 16352849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 41349052 - 41349274
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349052 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41349151  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  41349152 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 41349250  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattgga 314  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  41349251 gttatgatattcctaattattgga 41349274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 41356489 - 41356711
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356489 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41356588  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||     
T  41356589 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgttatttga-tat 41356687  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattgga 314  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  41356688 gttatgatattcctaattattgga 41356711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21828613 - 21828394
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828613 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 21828514  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  21828513 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 21828414  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  21828413 ttgttcatgataattggata 21828394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 20216127 - 20216352
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216127 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20216226  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  20216227 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 20216326  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  20216327 gttatgttgtttataatgattggata 20216352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 18600306 - 18600498
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600306 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18600405  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18600406 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatacatgattacgtgataagtgtttat 18600498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43078324 - 43078099
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078324 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 43078225  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  43078224 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 43078125  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  43078124 gttatgttgtttataatgattggata 43078099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Original strand, 41478778 - 41478969
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478778 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41478877  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  41478878 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgttta 41478969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 46157542 - 46157749
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46157542 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 46157641  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  46157642 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 46157741  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  46157742 gttatgtt 46157749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 44845084 - 44845309
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845084 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttacaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 44845183  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  44845184 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagataccttgttgatgatgagtggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 44845283  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  44845284 gttatgttgtttataatgattggata 44845309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 51328879 - 51329068
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328879 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 51328978  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  51328979 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 51329068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 51335513 - 51335702
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335513 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 51335612  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  51335613 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 51335702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 27898878 - 27899055
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898878 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 27898977  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27898978 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 27899055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 43063495 - 43063672
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43063495 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 43063594  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43063595 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 43063672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49334459 - 49334282
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49334459 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 49334360  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49334359 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 49334282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 18626503 - 18626680
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18626503 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 18626602  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18626603 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 18626680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33384957 - 33384780
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33384957 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 33384858  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33384857 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 33384780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44755992 - 44755815
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44755992 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 44755893  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44755892 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattttgtgattacgtgata 44755815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21844140 - 21843968
Alignment:
Q  144 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21844140 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgt 21844041  T
Q  244 tgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  21844040 tgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatgttgttcatgataattggata 21843968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19111299 - 19111112
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111299 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 19111200  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19111199 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgtattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 19111112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23763099 - 23762913
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23763099 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23763000  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  23762999 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 23762913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 21807422 - 21807553
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807422 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 21807521  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807522 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21807553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21835250 - 21835119
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835250 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 21835151  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835150 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 33386445 - 33386576
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386445 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 33386544  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386545 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 33393090 - 33393221
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393090 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 33393189  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393190 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33393221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19104636 - 19104463
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104636 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 19104537  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19104536 taaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaaga-----tgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 19104463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8305026 - 8304836
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305026 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 8304927  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  8304926 taaggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgttatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 8304836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 50887976 - 50888170
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887976 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 50888075  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  50888076 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 50888170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 20525431 - 20525569
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525431 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 20525530  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20525531 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20525569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 41388478 - 41388577
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388478 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41388575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1010370 - 1010271
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010370 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1010273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 16375917 - 16376016
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375917 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16376014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52639188 - 52639089
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639188 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 52639091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 1925614 - 1925712
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925614 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1925710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 20924628 - 20924726
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924628 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20924724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21407002 - 21406904
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407002 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21406906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 20229466 - 20229564
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229466 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20229563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 39244380 - 39244477
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244380 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 39244476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 39247935 - 39248032
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247935 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 39248031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20137988 - 20137892
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137988 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20137892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33797163 - 33797067
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33797163 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatataag 33797067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19211769 - 19211677
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19211769 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19211677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46975371 - 46975299
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975371 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 46975299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18882273 - 18882200
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18882273 ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatataag 18882200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12646772 - 12646680
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12646772 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttttcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggaaccacatgcatataag 12646680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 36819536 - 36819614
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  36819536 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaag 36819614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21172882 - 21172801
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21172882 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 21172801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21312998 - 21312917
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21312998 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 21312917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Original strand, 16080645 - 16080712
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080645 ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 16080712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 20229443 - 20229489
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  20229443 ttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 20229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 18626689 - 18626723
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18626689 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 18626723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 27899064 - 27899098
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27899064 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 27899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 43063681 - 43063715
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43063681 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 43063715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44755806 - 44755772
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44755806 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 44755772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49334273 - 49334239
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49334273 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 49334239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 21807401 - 21807450
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21807401 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 21807450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21835271 - 21835222
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21835271 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 21835222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23763081 - 23763048
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23763081 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 23763048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 33386424 - 33386473
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33386424 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 33386473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 33393069 - 33393118
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33393069 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 33393118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34509577 - 34509528
Alignment:
Q  177 gattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcacattgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  34509577 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcacattgtc 34509528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 126
Target Start/End: Original strand, 39244354 - 39244382
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244354 attaggagctttgtcctccgcacgtttta 39244382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 126
Target Start/End: Original strand, 39247909 - 39247937
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247909 attaggagctttgtcctccgcacgtttta 39247937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 56879 - 56654
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56879 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 56780  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  56779 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattggttatgtgattacgtgatatgtgtttattaattat 56680  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  56679 gatatgttattcctaatgattggata 56654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 70974 - 70877
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70974 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 70879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 139614 - 139520
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139614 ggagctttgtcctccgcacgttt---aggtgctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 139520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 100972 - 100880
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  100972 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tattatgatgattggtaccacatgcatataag 100880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 18024629 - 18024854
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024629 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18024728  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  18024729 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 18024828  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18024829 gttatgttgttcataatgattggata 18024854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18071073 - 18070848
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071073 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18070974  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  18070973 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgtttattaattat 18070874  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  18070873 gatatgttattcctaatgattggata 18070848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12481554 - 12481329
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481554 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12481455  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  12481454 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 12481355  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||    
T  12481354 gttatgttcctcataatgattggata 12481329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12474924 - 12474699
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474924 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12474825  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  12474824 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtaataagtgtttattgattat 12474725  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||    
T  12474724 gttatgttcctcataatgattggata 12474699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 19780489 - 19780705
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780489 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19780588  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  19780589 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 19780688  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  19780689 gttacgttgttcataat 19780705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23954053 - 23953837
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954053 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23953954  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  23953953 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattat 23953854  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  23953853 gttacgttgttcataat 23953837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23960715 - 23960499
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960715 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23960616  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  23960615 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattat 23960516  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  23960515 gttacgttgttcataat 23960499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 386537 - 386756
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  386537 tattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 386636  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  386637 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 386736  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  386737 ttgttcatgataattggata 386756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 6873584 - 6873803
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873584 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 6873683  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  6873684 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 6873783  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  6873784 ttgttcctgataattggata 6873803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 15383693 - 15383899
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383693 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15383792  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  15383793 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacg-gataagtgtttattgattat 15383891  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  15383892 gttatgtt 15383899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40453819 - 40453633
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40453819 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 40453720  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40453719 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 40453633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40478048 - 40477862
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40478048 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 40477949  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40477948 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 40477862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14268655 - 14268880
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268655 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14268754  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  14268755 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttatcaattat 14268854  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  14268855 gttatgttgttcatgataattggata 14268880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14299029 - 14299254
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299029 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14299128  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  14299129 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattacgtgattatgtgataagtggttatcgagtat 14299228  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  14299229 gttatgttgttcatgataattggata 14299254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 26285115 - 26285301
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26285115 tattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgaggattggtaccacatgcatat 26285214  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26285215 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 26285301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15362037 - 15361812
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362037 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15361938  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15361937 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 15361838  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  15361837 gttatgttgtttataatgattggata 15361812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 16232043 - 16232268
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232043 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16232142  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  16232143 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 16232242  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16232243 gttatgttgtttataatgattggata 16232268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22194524 - 22194299
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194524 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22194425  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  22194424 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgagtggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 22194325  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  22194324 gttatgttgtttataatgattggata 22194299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36884936 - 36885161
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884936 cacgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 36885035  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  36885036 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 36885135  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  36885136 gttatgttgtttataatgattggata 36885161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14073714 - 14073489
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073714 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14073615  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  14073614 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 14073515  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  14073514 gttatgttgtttataatgattggata 14073489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15148362 - 15148157
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148362 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15148263  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15148262 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgagtggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 15148163  T
Q  291 gttatg 296  Q
    ||||||    
T  15148162 gttatg 15148157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15256492 - 15256267
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15256492 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15256393  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  15256392 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 15256293  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  15256292 gttatgttgtttataatgattggata 15256267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29041121 - 29041346
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041121 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 29041220  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  29041221 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 29041320  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29041321 gttatgttgtttataatgattggata 29041346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8384718 - 8384511
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8384718 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8384619  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  8384618 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 8384519  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  8384518 gttatgtt 8384511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17808297 - 17808072
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17808297 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattgaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17808198  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  17808197 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgaatat 17808098  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  17808097 gttatgttgtttataatgattggata 17808072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18295530 - 18295341
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295530 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18295431  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18295430 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 18295341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8391373 - 8391166
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391373 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8391274  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  8391273 gcatatagggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 8391174  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  8391173 gttatgtt 8391166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 17090200 - 17090407
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090200 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17090299  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  17090300 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggaaatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 17090399  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  17090400 gttatgtt 17090407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 15322314 - 15322500
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322314 tattacgagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 15322413  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15322414 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 15322500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 7901392 - 7901578
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901392 tattaggagctttgttctctgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 7901491  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  7901492 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttat 7901578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 51494023 - 51494234
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51494023 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 51494122  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  51494123 aaggagtctaagag--------cattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 51494214  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  51494215 ttgttcatgataattggata 51494234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4772002 - 4771865
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772002 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 4771903  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4771902 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 4771865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 8048696 - 8048833
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048696 cacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8048795  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048796 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8048833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 8055309 - 8055446
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055309 cacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8055408  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055409 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8055446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 12349793 - 12349970
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349793 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 12349892  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12349893 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Original strand, 14305662 - 14305851
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14305662 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 14305761  T
Q  227 tgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  14305762 tgattaagatgccttgttgatgatgattgattacgtgattatgtgataagtggttatcgagtatgttatgttgttcatgataattggata 14305851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 9272372 - 9272578
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9272372 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacat 9272471  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| ||||| | || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  9272472 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgat-aatgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaaataa 9272570  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  9272571 gttatgtt 9272578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 307
Target Start/End: Original strand, 17962553 - 17962763
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962553 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 17962652  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |    
T  17962653 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgatgagtgtttattgattatgttacg 17962752  T
Q  297 tttttcctaat 307  Q
    || ||| ||||    
T  17962753 ttgttcataat 17962763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 55795336 - 55795159
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55795336 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 55795237  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55795236 acggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 55795159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 12300117 - 12300294
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300117 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 12300216  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12300217 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 12300294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23838321 - 23838135
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838321 taggagctttgtcctccgcacgatatttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23838222  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  23838221 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaataagtgattacgtgataattgtttat 23838135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23081472 - 23081341
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081472 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23081373  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081372 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23081341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27709629 - 27709498
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709629 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 27709530  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709529 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 27709498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 41385963 - 41386149
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385963 taggagctttgtcttccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41386062  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  41386063 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgttatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 41386149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53433259 - 53433065
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433259 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 53433160  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  53433159 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 53433065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12521973 - 12521777
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12521973 cacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 12521874  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||   |||||||| | | |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12521873 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatactatgttgttgatgacggttgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 12521777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 19942376 - 19942507
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942376 tattatgagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 19942475  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942476 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19942507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14678851 - 14678664
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678851 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14678752  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaa-gatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||    
T  14678751 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatgattgaatatgcgattacgtgataattgtttat 14678664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14685059 - 14684872
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14685059 taggagctttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtaccacatgcatataag 14684960  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaa-gatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||    
T  14684959 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatgattgaatatgcgattacgtgataattgtttat 14684872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 16956873 - 16957004
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16956873 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16956972  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16956973 aaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 16957004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35170508 - 35170349
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35170508 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 35170409  T
Q  227 tgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||  |||||||||   |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||    
T  35170408 tgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgaatatgtgataattgtttat 35170349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35613820 - 35613661
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35613820 taggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 35613721  T
Q  227 tgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||  |||||| ||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  35613720 tgtctaagatactatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 35613661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 14757877 - 14757985
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757877 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14757976  T
Q  191 gcatataag 199  Q
    |||||||||    
T  14757977 gcatataag 14757985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 14708834 - 14708933
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708834 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14708931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 4561784 - 4561883
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561784 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 4561881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 5757389 - 5757488
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757389 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5757486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9556177 - 9556078
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556177 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9556080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12487332 - 12487233
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487332 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17809921 - 17809822
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809921 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 17809824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33742027 - 33741928
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742027 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33741930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 14954652 - 14954750
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954652 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14954748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23139177 - 23139080
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139177 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 23139081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2014683 - 2014587
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2014683 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 2014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45938055 - 45937957
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45938055 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatata 45937959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15224687 - 15224590
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224687 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 15224591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 26243865 - 26243962
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243865 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaa---gagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 26243961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 42997650 - 42997749
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42997650 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtatcacgtgcatata 42997747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 19757804 - 19757896
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757804 ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19757896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19782002 - 19781910
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782002 ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 18602932 - 18603029
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18602932 taggagatttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 18603029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9530339 - 9530243
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530339 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggatctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9530243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 18609507 - 18609601
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18609507 gagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttagtaccacatgcatataag 18609601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3412703 - 3412606
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3412703 taggagctttgtcctccacatgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatataag 3412606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25689489 - 25689417
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689489 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25689417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27533621 - 27533528
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27533621 taggagctttgtcctccgcatgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatat 27533528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18236796 - 18236700
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18236796 taggagctttgtcctccacacgttt---aggatctttgtcctccgcacgattaaagtatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatataag 18236700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 28569646 - 28569726
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28569646 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaag 28569726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10712475 - 10712403
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712475 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10712403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10926245 - 10926173
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926245 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10926173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 18222582 - 18222674
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18222582 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18222674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 286
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235398
Alignment:
Q  168 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  30235277 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtga 30235376  T
Q  265 ttacgtgatatgtgtttattga 286  Q
     |||||||||  ||||||||||    
T  30235377 atacgtgatacttgtttattga 30235398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21340084
Alignment:
Q  170 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgatt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||   |||||||| |||||||| |||||||||    
T  21339968 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatactatgttgttgatgatgattgaatatgtgatt 21340067  T
Q  267 acgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21340068 acgtgataattgtttat 21340084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 16243601 - 16243696
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16243601 taggagcttagtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatataa 16243696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 1951965 - 1952054
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951965 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat 1952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 18229077 - 18229149
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18229077 ataggagctttgtcttccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccatatgcatataag 18229149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 36134176 - 36134271
Alignment:
Q  130 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcacatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  36134176 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcacatt 36134271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 13020537 - 13020586
Alignment:
Q  179 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13020537 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13020586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 17152710 - 17152782
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17152710 ataggagctttgttctccacacgattaaagtatattaatac-tacgatgacgattggtactacatgcatataag 17152782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 20157680 - 20157761
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgatt---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20157680 ggagctttgtcctccccacgatgctgaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 20157761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 22634626 - 22634707
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22634626 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 22634707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20115047 - 20115007
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagga 131  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20115047 cacgaataataggagttttgtcctccgcacgttttatagga 20115007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40477848 - 40477772
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||||||||    
T  40477848 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatgttgttcatgataattggata 40477772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40453619 - 40453576
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40453619 ttgttgagaatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 40453576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 12349979 - 12350013
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12349979 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 12350013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Original strand, 14305653 - 14305683
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305653 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 14305683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 16956852 - 16956901
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16956852 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 16956901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23081493 - 23081444
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23081493 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 23081444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27709650 - 27709601
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27709650 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 27709601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35170517 - 35170484
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35170517 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 35170484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35613829 - 35613796
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35613829 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 35613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 41385981 - 41386014
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385981 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 41386014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14685040 - 14685008
Alignment:
Q  92 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685040 acgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 14685008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 1254 - 1479
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 1353  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  1354 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcgattat 1453  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  1454 gttatgttgttcatgataattggata 1479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10243 - 10018
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10243 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10144  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  10143 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 10044  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  10043 gttatgttgtttataatgattggata 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 56665 - 56440
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56665 cacgaaaattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 56566  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  56565 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 56466  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  56465 gttatgttgtttataatgattggata 56440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 110)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 16407495 - 16407720
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407495 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16407594  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  16407595 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgattattgattat 16407694  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  16407695 gttatgttgttgataatgattggata 16407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 20703196 - 20703415
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703196 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 20703295  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  20703296 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 20703395  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  20703396 ttgttcatgataattggata 20703415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 9511211 - 9511436
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511211 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9511310  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  9511311 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 9511410  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  9511411 gttatgttgtttataatgattggata 9511436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18182676 - 18182457
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182676 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 18182577  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  18182576 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 18182477  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  18182476 ttgttcatgatcattggata 18182457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32767575 - 32767356
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767575 tattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 32767476  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  32767475 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 32767376  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  32767375 ttgttcatgataattggata 32767356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18176004 - 18175818
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18176004 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 18175905  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18175904 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 18175818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 18164873 - 18165065
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164873 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18164972  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  18164973 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttat 18165065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1347393 - 1347207
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347393 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1347294  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  1347293 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 1347207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 11232504 - 11232690
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232504 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 11232603  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  11232604 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttat 11232690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 12703608 - 12703833
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703608 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12703707  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||     
T  12703708 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcataattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgttcattaattat 12703807  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  12703808 gttatgttgtttataatgattggata 12703833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 15163021 - 15163213
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163021 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15163120  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15163121 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 15163213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 40523561 - 40523777
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523561 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40523660  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  40523661 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgcttattgattat 40523760  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  40523761 gttacgttgttcataat 40523777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 11239191 - 11239377
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239191 tattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 11239290  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  11239291 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtgtttat 11239377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14655617 - 14655842
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655617 cacgattactaggagctttgtcctccgcacgttatataggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14655716  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  14655717 gcatttaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattat 14655816  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  14655817 gttatgttgttcatgataattggata 14655842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49051277 - 49051052
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051277 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 49051178  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  49051177 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgccatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 49051078  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  49051077 gttatgttgtttataatgattggata 49051052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11366102 - 11365910
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366102 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 11366003  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  11366002 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 11365910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21566 - 21359
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 21467  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  21466 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 21367  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  21366 gttatgtt 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 60877 - 61072
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60877 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 60976  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  60977 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgagtggatatgtgattacgtgataagtgttcattga 61072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 8202296 - 8202503
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8202296 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 8202395  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  8202396 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 8202495  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  8202496 gttatgtt 8202503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15022013 - 15021806
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15022013 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 15021914  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  15021913 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 15021814  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  15021813 gttatgtt 15021806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 283
Target Start/End: Original strand, 15156373 - 15156562
Alignment:
Q  94 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 193  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156373 gaataatagaagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 15156472  T
Q  194 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15156473 tatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 15156562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 44786675 - 44786864
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44786675 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 44786774  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  44786775 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 44786864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 44793316 - 44793505
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44793316 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 44793415  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  44793416 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 44793505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13690998 - 13690807
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690998 cacgaataataggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13690899  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  13690898 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgatcacgtgataagtgttta 13690807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13684367 - 13684176
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13684367 cacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13684268  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgttta 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  13684267 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgatcacgtgataagtgttta 13684176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 4318758 - 4318951
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4318758 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccaca 4318857  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4318858 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 4318951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14330692 - 14330555
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330692 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14330593  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330592 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14330555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14337276 - 14337139
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337276 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14337177  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337176 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14337139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8705882 - 8705705
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8705882 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 8705783  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8705782 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 8705705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 18553751 - 18553928
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18553751 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 18553850  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18553851 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtttattatgctatgttgatgatgtttgattatgtgattacgtgata 18553928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8712553 - 8712376
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8712553 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 8712454  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8712453 acggagtctaggagcattgtcaaattgtcatttctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 8712376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14959051 - 14958865
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14959051 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14958952  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14958951 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 14958865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18531136 - 18530949
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531136 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 18531037  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  18531036 tgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgcgattacgtgata 18530949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 23520182 - 23520359
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520182 tattaggatctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 23520281  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23520282 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattaattatgtgattacgtgata 23520359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11262216 - 11262030
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11262216 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 11262117  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11262116 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 11262030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 265
Target Start/End: Original strand, 20310 - 20488
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20310 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 20409  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| ||||||||    
T  20410 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgat 20488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10869347 - 10869175
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 201  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10869347 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10869248  T
Q  202 gtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10869247 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 10869175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10875427 - 10875255
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 201  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10875427 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10875328  T
Q  202 gtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10875327 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 10875255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12692383 - 12692197
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692383 taggagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12692284  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  12692283 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattatgtgataattgtttat 12692197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26419887 - 26419701
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26419887 taggagctttgtcctccacacgattattaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 26419788  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  26419787 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 26419701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 11548484 - 11548671
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548484 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 11548583  T
Q  199 ggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11548584 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 11548671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 11555080 - 11555267
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555080 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 11555179  T
Q  199 ggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11555180 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 11555267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 6017395 - 6017589
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017395 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 6017494  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  6017495 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 6017589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Original strand, 18585497 - 18585669
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 201  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18585497 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatatacgga 18585596  T
Q  202 gtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18585597 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtttattatgctatgttgatgatgtttgattatgtgattacgtgata 18585669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9409836 - 9409698
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata-ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9409836 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatttggagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 9409737  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9409736 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9409698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871427
Alignment:
Q  157 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattga 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20871301 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 20871400  T
Q  257 ttatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||    
T  20871401 atgtgtgattacgtgataagtgtttat 20871427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13569776 - 13569655
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13569776 tattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcataa 13569677  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13569676 aaggagtctaagagcattgtca 13569655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14953086 - 14952935
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14953086 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14952987  T
Q  226 atgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
     ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14952986 gtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 14952935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7536074 - 7535947
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7536074 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccaca 7535975  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7535974 tgcatataaggagtctaagagcattgtc 7535947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 44408554 - 44408714
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44408554 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 44408653  T
Q  226 atgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
     ||   ||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  44408654 gtgtccaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattatgtgataattgtttat 44408714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380528
Alignment:
Q  134 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaa 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||    
T  15380671 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaa 15380572  T
Q  234 gatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15380571 gatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 15380528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15083817 - 15083719
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083817 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15083721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32756 - 32657
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 32659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 12705118 - 12705217
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705118 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12705215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12718315 - 12718216
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718315 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12718218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12723226 - 12723127
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723226 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12723129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16113888 - 16113789
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113888 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16113791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16117041 - 16116942
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117041 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16116944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18283013 - 18282914
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283013 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18282916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18425307 - 18425208
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425307 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18425210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26292019 - 26291920
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292019 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 26291922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 1859285 - 1859382
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859285 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1859380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14216829 - 14216732
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14216829 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14216732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15728229 - 15728132
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15728229 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15728132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39721887 - 39721789
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721887 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgttctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 39721791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 71226 - 71325
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71226 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 71323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 75335 - 75434
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75335 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 75432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18279050 - 18278951
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279050 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18278953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714436
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714530 gagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12714436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13149059 - 13148963
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149059 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13148963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519623
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519531 gagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 7519623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18556877 - 18556752
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18556877 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatata 18556781  T
Q  198 aggagtctaag-agcattgtcacattgtca 226  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||    
T  18556780 a-gtgtctaagttgcattgtcacattgtca 18556752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 45170491 - 45170589
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45170491 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaagcatata 45170587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8917331 - 8917235
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917331 taggagcttagtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8917235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 25927701 - 25927799
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927701 attaggagctttgtcctccacacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 25927797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 2530616 - 2530708
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530616 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 2530708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13461664 - 13461568
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13461664 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatataag 13461568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 13918981 - 13919053
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918981 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13919053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 16724831 - 16724928
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724831 taggagccttgtcctccacaggttttc--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16724928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 17701845 - 17701942
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701845 taggagccttgtcctccacaggttttc--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17701942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Original strand, 16907675 - 16907769
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907675 gagctttgtcctcaccacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatataaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16907769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16275395 - 16275323
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275395 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16275323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35151517 - 35151448
Alignment:
Q  130 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35151517 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 35151448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 14932976 - 14933081
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga-cgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14932976 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagagattggtaccacatgcatataa 14933071  T
Q  199 ggagtctaag 208  Q
    |  |||||||    
T  14933072 gaggtctaag 14933081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 15356411 - 15356516
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga-cgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15356411 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagagattggtaccacatgcatataa 15356506  T
Q  199 ggagtctaag 208  Q
    |  |||||||    
T  15356507 gaggtctaag 15356516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 15360525 - 15360630
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga-cgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15360525 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagagattggtaccacatgcatataa 15360620  T
Q  199 ggagtctaag 208  Q
    |  |||||||    
T  15360621 gaggtctaag 15360630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 16457561 - 16457652
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16457561 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgacctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16457652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6801093 - 6801021
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6801093 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatttaag 6801021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9593247 - 9593155
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9593247 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctcccaacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatataag 9593155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 20578 - 20650
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20578 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccaaatgcatataag 20650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16583134 - 16583065
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16583134 ggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccacatgcatgtaag 16583065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 2832682 - 2832750
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2832682 ataggagccttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 2832750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12318006 - 12317925
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12318006 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 12317925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752065
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  9751984 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaag 9752065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 14152229 - 14152300
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14152229 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatataa 14152300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 15605497 - 15605579
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15605497 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 15605579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 181
Target Start/End: Original strand, 13635696 - 13635747
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13635696 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattg 13635747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 283
Target Start/End: Original strand, 4318965 - 4319008
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4318965 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgataaatgtttat 4319008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 126
Target Start/End: Original strand, 11548502 - 11548537
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548502 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta 11548537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 126
Target Start/End: Original strand, 11555098 - 11555133
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555098 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta 11555133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13569648 - 13569609
Alignment:
Q  170 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13569648 tgatgacgattggtaccacaggcataaaaggagtctaaga 13569609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18425330 - 18425284
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  18425330 ttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 18425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26292042 - 26291996
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  26292042 ttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 26291996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8705696 - 8705662
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8705696 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 8705662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8712367 - 8712333
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8712367 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 8712333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26292063 - 26292016
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26292063 gagctttgtcctcaccacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatta 26292016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11262198 - 11262165
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11262198 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 11262165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12692365 - 12692332
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692365 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 12692332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14959033 - 14959000
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14959033 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 14959000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13569797 - 13569749
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt 151  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13569797 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt 13569749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 67415 - 67199
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67415 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 67316  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  67315 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattacgtgataagtgtttattgattat 67216  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  67215 gttacgttgttcataat 67199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41423 - 41248
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41423 tattaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41324  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtga 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41323 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtga 41248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 56930 - 56755
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56930 tattaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 56831  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtga 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56830 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtga 56755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6896 - 6710
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6896 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 6797  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  6796 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 6710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13421 - 13235
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13421 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13322  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  13321 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 13235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22949 - 22763
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22949 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacat 22850  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  22849 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatgtccatgatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgata 22763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 59178 - 59277
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  59178 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtatcacatgcatata 59275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 132528 - 132473
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  132528 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 132473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7741
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7960 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 7861  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  7860 aagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaactatgttatg 7761  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  7760 ttgttcatgataattggata 7741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30432 - 30216
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30432 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30333  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  30332 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgcttattgattat 30233  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  30232 gttacgttgttcataat 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 73098 - 73296
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73098 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 73197  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||   |||||||| | |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||    
T  73198 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatgacgattgaataagtgaatacgtgatacttgtttattga 73296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 62167 - 62068
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62167 attaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 62070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19067 - 18998
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19067 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatataag 18998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12783 - 12714
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12783 ggagttttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatataag 12714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 306997 - 306778
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  306997 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 306898  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  306897 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattatgttatg 306798  T
Q  297 tttttcctaattattggata 316  Q
    || ||| | || ||||||||    
T  306797 ttgttcatgataattggata 306778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 22321186 - 22321402
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321186 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22321285  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  22321286 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattat 22321385  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  22321386 gttacgttgttcataat 22321402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 22327339 - 22327555
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327339 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22327438  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  22327439 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtttattgattat 22327538  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  22327539 gttacgttgttcataat 22327555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10866078 - 10865858
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10866078 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10865979  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||     
T  10865978 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgagtgaatatgtaattacgtgataagtgttatttga-tat 10865880  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattg 312  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  10865879 gttatgatattcctaattattg 10865858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10873443 - 10873223
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873443 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10873344  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||     
T  10873343 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgagtgaatatgtaattacgtgataagtgttatttga-tat 10873245  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattg 312  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  10873244 gttatgatattcctaattattg 10873223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23170943 - 23170718
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23170943 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23170844  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  23170843 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattat 23170744  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  23170743 gttatgttgttcatgataattggata 23170718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23582200 - 23581975
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582200 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 23582101  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  23582100 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttatcaattat 23582001  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  23582000 gttatgttgttcatgataattggata 23581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 24914173 - 24914358
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914173 attaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24914272  T
Q  198 aggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24914273 aggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 24914358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1842988 - 1842781
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1842988 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 1842889  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| || ||     
T  1842888 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgataatgattgattacgtgattatgtgataagtggttatcgagtat 1842789  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  1842788 gttatgtt 1842781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12828971 - 12828785
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828971 tattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 12828872  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12828871 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 12828785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27599166 - 27598977
Alignment:
Q  94 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599166 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 27599067  T
Q  194 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  27599066 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagaggccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 27598977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27617203 - 27616978
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617203 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27617104  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27617103 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 27617004  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  27617003 gttatgttgtttataatgattggata 27616978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29233429 - 29233243
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233429 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29233330  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  29233329 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 29233243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29346728 - 29346542
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346728 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 29346629  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  29346628 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgattacgtgataagtgtttat 29346542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9488801 - 9488576
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488801 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9488702  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  9488701 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 9488602  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  9488601 gttatgttgtttataatgattggata 9488576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9608062 - 9607837
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608062 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9607963  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  9607962 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 9607863  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  9607862 gttatgttgtttataatgattggata 9607837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Original strand, 13306811 - 13307000
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306811 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13306910  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  13306911 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 13307000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16985828 - 16985639
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985828 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16985729  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16985728 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 16985639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28432134 - 28432359
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432134 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 28432233  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  28432234 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 28432333  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  28432334 gttatgttgtttataatgattggata 28432359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9340167 - 9339960
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340167 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9340068  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  9340067 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 9339968  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  9339967 gttatgtt 9339960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16922416 - 16922209
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16922416 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16922317  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  16922316 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 16922217  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  16922216 gttatgtt 16922209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 19490146 - 19490329
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490146 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19490245  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  19490246 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatatgattacgtgata 19490329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27215950 - 27215743
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215950 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27215851  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||     
T  27215850 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtcttcattgattat 27215751  T
Q  291 gttatgtt 298  Q
    ||||||||    
T  27215750 gttatgtt 27215743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16928261 - 16928072
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928261 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16928162  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16928161 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 16928072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16996955 - 16996766
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996955 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16996856  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16996855 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 16996766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17003588 - 17003399
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003588 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17003489  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  17003488 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgattatgtgataagtgtt 17003399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Original strand, 26877767 - 26877962
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877767 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 26877866  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26877867 gcatataaggagtctaggagaattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattga 26877962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27369189 - 27369012
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27369189 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 27369090  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27369089 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 27369012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 44381420 - 44381597
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381420 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 44381519  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44381520 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 44381597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27375699 - 27375522
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27375699 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 27375600  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27375599 acggattctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 27375522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24502998 - 24502812
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24502998 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag 24502899  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24502898 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 24502812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11677338 - 11677142
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677338 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 11677239  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11677238 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 11677142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 44388090 - 44388267
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44388090 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 44388189  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44388190 acgaagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 44388267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37318166 - 37318029
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37318166 cacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacat 37318067  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37318066 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 37318029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 13970591 - 13970722
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970591 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 13970690  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970691 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24714596 - 24714465
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714596 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 24714497  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714496 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24714465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 41604954 - 41605085
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41604954 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41605053  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41605054 aaggagtctaagagcattttcacattgtcatg 41605085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 41610851 - 41610982
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610851 tattaggagctttgtcctccgcacgattattagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41610950  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610951 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41610982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 45057647 - 45057778
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45057647 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat 45057746  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45057747 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 45057778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 24641178 - 24641364
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641178 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 24641277  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  24641278 tgcatataaggagtctaagagcattatcgcattgtcatgtctagtatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgat 24641364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 30971203 - 30971397
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971203 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 30971302  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  30971303 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 30971397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 21147517 - 21147700
Alignment:
Q  104 agctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21147517 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 21147616  T
Q  203 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||   |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||  |||||||    
T  21147617 tctaagagcattgtcacattgttatgtctataatgctatgttgttgataacgattgaatatgtgaatacatgataattgtttat 21147700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 24880494 - 24880682
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 200  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880494 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24880593  T
Q  201 agtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  24880594 agtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaattcgtgatacttgtttattga 24880682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 24872609 - 24872736
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 200  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872609 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24872708  T
Q  201 agtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872709 agtctaagagcattgtcacattgtcatg 24872736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 10102112 - 10102211
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102112 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 10102209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 12901975 - 12902074
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901975 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12902072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 24628938 - 24629037
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628938 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24629035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24649002 - 24648903
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649002 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24648905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27601439 - 27601340
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601439 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27601342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27195605 - 27195446
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  27195605 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataaggagtctaagagcaatgtcgcattgtcg 27195506  T
Q  227 tgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||  || ||||||   |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||    
T  27195505 tgtctatgatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgaatatgtgataattgtttat 27195446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 30345476 - 30345574
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345476 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 27379891 - 27379990
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379891 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatata 27379988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 27383937 - 27384036
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383937 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatata 27384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 19928703 - 19928799
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928703 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19928799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41666855 - 41666759
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41666855 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41666759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 18855659 - 18855756
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855659 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcttccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 18855755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 60715 - 60625
Alignment:
Q  107 tttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60715 tttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 60625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26125090 - 26124992
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125090 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgattggtaccacatgcatata 26124994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31344783 - 31344685
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344783 attagaagctttgtcctccgcacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 31344687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23186980 - 23186884
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23186980 taggagctttgtcctccacacgttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23186884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23598243 - 23598147
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598243 taggagctttgtcctccacacgttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23598147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1283008 - 1282936
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283008 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1282936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 41531491 - 41531563
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531491 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41531563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657632
Alignment:
Q  163 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657567 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30657632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 22461393 - 22461485
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22461393 ggagctttgtcctccacacg----atatgagctttgtcctccacacgattaaagtatattaaaact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 22461485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24735273 - 24735192
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24735273 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 24735192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 208
Target Start/End: Original strand, 19691914 - 19691952
Alignment:
Q  170 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19691914 tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 19691952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Original strand, 22134501 - 22134547
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  22134501 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 22134547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 13970570 - 13970619
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970570 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 13970619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24502980 - 24502947
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24502980 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 24502947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24714617 - 24714568
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24714617 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 24714568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 24872631 - 24872660
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872631 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 24880516 - 24880545
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880516 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27195614 - 27195581
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27195614 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 27195581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 41604933 - 41604982
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41604933 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 41604982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 41610830 - 41610879
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41610830 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 41610879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 45057626 - 45057675
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45057626 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 45057675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37947 - 37726
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcc-tccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37947 cacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 37848  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgacta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| ||    
T  37847 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtgatttga-ta 37749  T
Q  290 agttatgtttttcctaattattg 312  Q
     |||||| | |||||||||||||    
T  37748 tgttatgatattcctaattattg 37726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 14572 - 14670
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 76865 - 77086
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcc-tccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76865 cacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 76964  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgacta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| ||    
T  76965 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtgatttga-ta 77063  T
Q  290 agttatgtttttcctaattattg 312  Q
     |||||| | |||||||||||||    
T  77064 tgttatgatattcctaattattg 77086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 10016 - 10208
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10016 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 10115  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10116 gcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattatgtgataagtgtttat 10208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 126326 - 126512
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  126326 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccgcatgcatat 126425  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  126426 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgcttat 126512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 106086 - 106278
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  106086 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggaactacat 106185  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  106186 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgcgttgttgataatgattgaataagtgattacgtgataagtgcttat 106278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 80187 - 80090
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 80091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 65984 - 66082
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65984 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 66080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 62068 - 62162
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62068 attaggagctttgtcctccgcatgatt---aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 62162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 59661 - 59886
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59661 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 59760  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  59761 gcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 59860  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  59861 gttatgttgtttataatgattggata 59886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 67760 - 67859
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67760 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 67857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25254 - 25029
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25254 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 25155  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||     
T  25154 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatggatatgtgattatgtgataagtgttatttgattat 25055  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  25054 gttatgttgtttataatgattggata 25029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 138972 - 138747
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138972 cacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 138873  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  138872 gcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatgaatggatatgtgattacgtgataagtgttcattgattat 138773  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  138772 gttatgttgtttataatgattggata 138747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38588 - 38372
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 38489  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  38488 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccccgttgataatgaacgaatatgtgattacgtgataagtgcttattgattat 38389  T
Q  291 gttatgtttttcctaat 307  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  38388 gttacgttgttcataat 38372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26524 - 26340
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26524 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtaccacatgcatataa 26425  T
Q  199 ggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26424 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43144 - 42950
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43144 tattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 43045  T
Q  195 ataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  43044 ataacgagtctaagagcattgtcacattgtgatgtctataatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgctacttgtttattga 42950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 39018 - 39117
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39018 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 39115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6769
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6865 taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 36451 - 36547
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36451 taggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 36547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 11501 - 11600
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11501 attaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43172 - 43117
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacgatt 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43172 tattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatt 43117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43200 - 43145
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacgatt 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43200 tattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19985
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19792 cacgattattaggagctttatcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 19891  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19892 tgcatataaggagtctaaaagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgataagtgtttat 19985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Original strand, 11988 - 12178
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa-gagcattgtcacattgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11988 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaggagcattgtcacagtgtc 12087  T
Q  226 atgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaagttatgtttttcctaattattggata 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||    
T  12088 atgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgattatgatatgttattcctaatgattggata 12178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 32530 - 32745
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32530 cacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 32629  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattgactaa 290  Q
    ||||||| |||||||| |||        |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  32630 gcatatacggagtctaggag--------cattgtcatgattaagatgccttgttgttaatgattgaatatgtgattacgtgatatgtgcttattgattat 32721  T
Q  291 gttatgtttttcctaattattgga 314  Q
    |||||||| | |||||||| ||||    
T  32722 gttatgttatccctaattaatgga 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 4297 - 4474
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4297 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 4396  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4397 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 4483 - 4517
Alignment:
Q  240 ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4483 ttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 4517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8499
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8676 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatat 8577  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8576 acggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 8499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12336 - 12199
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12336 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12237  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12236 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25619 - 25424
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25619 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacat 25520  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25519 gcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgctaagttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgatatttgtttat 25424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19277
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19463 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 19364  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19363 gagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgctaagttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgatagttgtttat 19277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25637 - 25585
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25637 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatta 25585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 78106 - 77969
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78106 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 78007  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78006 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 77969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9255
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 9167  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  9168 tgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgata 9255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22091 - 21914
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22091 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 21992  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991 atggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgattacgtgata 21914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 241945 - 241759
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241945 taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 241846  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  241845 gagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgataattgtttat 241759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23118 - 23026
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23118 ggagctttgtcctccacacg----gtaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaattc-tatgatgacgattggcaccacatgcatataag 23026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 241927 - 241894
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  241927 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 241894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9744 - 9607
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9744 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9645  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9644 gcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 286
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15406
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213 tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 15312  T
Q  196 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttattga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  15313 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgttatgttgttgatgacgattgaatatgtgaatacgtgatacttgtttattga 15406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 73880 - 73749
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73880 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 73781  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73780 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 73749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 228598 - 228663
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  228598 ggagctttgtcctctacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcata 228663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 73901 - 73852
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  73901 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatta 73852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10065 - 9869
Alignment:
Q  92 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065 acgattattacgagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 9966  T
Q  191 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9965 gcatataaggagtctaagagcattttcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataattgtttatt 9869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9230 - 9034
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 189  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9230 cacgattaataggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 9131  T
Q  190 tgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  9130 tgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgacgattgaatatgtgattacgtgataaatgtttat 9034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 73818 - 73877
Alignment:
Q  140 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73818 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 73877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 2899 - 2977
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  2899 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaag 2977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Original strand, 81468 - 81521
Alignment:
Q  145 cacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  81468 cacgattaaagtatattaatact-atgatgaagattggtaccacatgcatataag 81521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9245 - 9197
Alignment:
Q  103 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt 151  Q
    |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9245 gagcttagtcctcaccacgattaataggagctttgtcctccgcacgatt 9197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 14759 - 14945
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759 taggagctttgtcatccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14858  T
Q  200 gagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgatatgtgtttat 283  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  14859 aagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctatgttgatgatgatgattgaatatgtgaatacgtgataattgtttat 14945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 14777 - 14810
Alignment:
Q  91 cacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777 cacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 14810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1063
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1213 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 1114  T
Q  227 tgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    ||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1113 tgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtgata 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 3893 - 4024
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 3992  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3993 aaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 19 - 150
Alignment:
Q  97 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19 tattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 118  T
Q  197 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 228  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  119 aaggagataaagagcattgtcacattgtcatg 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Original strand, 25198 - 25368
Alignment:
Q  104 agctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagt 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198 agctttgtcctccacacgattattaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtaccacatgcatataaggagt 25297  T
Q  204 ctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtg 271  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25298 ctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattacgtg 25368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14843 - 14699
Alignment:
Q  133 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgatta 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||    
T  14843 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgttgtgtcta 14744  T
Q  233 agatgct---ttgttgataatgattgattatgtgattacgtgata 274  Q
    |||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  14743 agatgctatgttgttgatgatgattgaatatgtgattccgtgata 14699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 5558 - 5657
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5558 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15243 - 15144
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15243 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12069 - 11970
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12069 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 11972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 33145 - 33244
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33145 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 16863 - 16962
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 attaggagttttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 4329 - 4427
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4329 ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 4426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Original strand, 77371 - 77477
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77371 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 77467  T
Q  198 aggagtctaag 208  Q
    | |||||||||    
T  77468 a-gagtctaag 77477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 97 - 1
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9711
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9809 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 36571 - 36669
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36571 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 36667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 53435 - 53354
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53435 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 53354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9242 - 9118
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtattttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9146  T
Q  198 aggagtctaag-agcattgtcacattgtc 225  Q
    | |||||||||  |||||||| |||||||    
T  9145 a-gagtctaagttgcattgtcgcattgtc 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36213 - 36116
Alignment:
Q  99 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36213 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 36117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1782 - 1658
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1782 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagccttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1686  T
Q  198 aggagtctaag-agcattgtcacattgtc 225  Q
    | |||||||||  |||||||| |||||||    
T  1685 a-gagtctaagttgcattgtcgcattgtc 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9325 - 9229
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 20664 - 20762
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20664 attaggagctttgtcctccacacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 189862 - 189960
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189862 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 189958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 25171 - 25275
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25171 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctcagcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataag 25266  T
Q  200 gagtctaag 208  Q
      |||||||    
T  25267 atgtctaag 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 6442 - 6538
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6442 taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1806 - 1707
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1806 attaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 1709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6585 - 6489
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6585 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag 6489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 6201 - 6298
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6201 taggagctttgtcctctacaagtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8297
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8225 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 208073 - 208171
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208073 attaagagctttgtcctccgcgcgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 208169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8405 - 8308
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8405 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatata 8309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15428
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15525 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatata 15429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 2 - 74
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9472 - 9400
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9472 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18259 - 18164
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259 taggagctttgtcctccgcacgttt---agtagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 18164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29456 - 29352
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29456 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataag 29361  T
Q  200 gagtctaag 208  Q
      |||||||    
T  29360 aggtctaag 29352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 63759 - 63663
Alignment:
Q  100 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  63759 taggagctttgtcctccgcacattt---aggagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 63663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 176
Alignment:
Q  104 agctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  269 agctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccactcgattaaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 9889 - 9961
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9889 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11591 - 11523
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11591 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcata 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30788 - 30725
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Original strand, 18859 - 18928
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16487
Alignment:
Q  102 ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttttcctccacacgattacagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 10283 - 10364
Alignment:
Q  126 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  10283 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaag 10364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28880
Alignment:
Q  127 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28947 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 28880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 173171 - 173106
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  173171 ggagctttgtcctgcacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcata 173106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 20243 - 20307
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 195  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20243 ggagctttgtcctca-cacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcata 20307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2651
Alignment:
Q  167 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 2651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 66651 - 66732
Alignment:
Q  129 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  66651 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 66732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38 - 4
Alignment:
Q  165 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 148
Target Start/End: Original strand, 80979 - 81026
Alignment:
Q  98 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  80979 attaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 81026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Original strand, 3397 - 3443
Alignment:
Q  153 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 199  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  3397 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University