View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0652_low_2 (Length: 772)

Name: NF0652_low_2
Description: NF0652
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0652_low_2
NF0652_low_2
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (38-749)||(26811987-26812698)
chr4 (38-749)||(26821454-26822165)
chr4 (38-749)||(3242285-3242996)
chr4 (38-749)||(54689911-54690622)
chr4 (38-749)||(54699342-54700053)
chr4 (38-749)||(3917545-3918256)
chr4 (38-749)||(37058566-37059276)
chr4 (38-748)||(15842897-15843605)
chr4 (559-749)||(20884447-20884636)
chr4 (500-749)||(50516496-50516742)
chr4 (559-749)||(11482315-11482504)
chr4 (562-732)||(23622919-23623088)
chr4 (561-749)||(18125410-18125595)
chr4 (169-399)||(18125754-18125981)
chr4 (559-622)||(41902641-41902703)
chr4 (562-639)||(16489947-16490025)
chr4 (691-749)||(28256097-28256155)
chr4 (670-734)||(112634-112698)
chr4 (670-734)||(14917028-14917092)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (38-747)||(30454201-30454910)
chr5 (38-747)||(30459259-30459968)
chr5 (38-747)||(30444829-30445538)
chr5 (38-749)||(18568517-18569229)
chr5 (38-749)||(24412307-24413018)
chr5 (38-749)||(24421767-24422467)
chr5 (38-749)||(22488666-22489375)
chr5 (38-748)||(4635442-4636134)
chr5 (562-749)||(42732575-42732761)
chr5 (500-749)||(13815371-13815617)
chr5 (500-740)||(24244050-24244287)
chr5 (500-740)||(24290674-24290911)
chr5 (559-749)||(33955498-33955687)
chr5 (559-749)||(11223376-11223564)
chr5 (562-732)||(5600580-5600749)
chr5 (562-732)||(5610226-5610395)
chr5 (559-749)||(20035999-20036188)
chr5 (559-715)||(22118134-22118291)
chr5 (562-732)||(31150651-31150820)
chr5 (559-743)||(20834431-20834614)
chr5 (582-749)||(26652642-26652808)
chr5 (582-749)||(26924227-26924393)
chr5 (67-241)||(24278813-24278987)
chr5 (67-241)||(24383227-24383401)
chr5 (666-747)||(22448330-22448411)
chr5 (666-749)||(37514857-37514940)
chr5 (297-401)||(22118443-22118545)
chr5 (691-747)||(22457666-22457722)
chr5 (677-732)||(16111002-16111058)
chr5 (670-734)||(718954-719018)
chr5 (670-734)||(727934-727998)
chr5 (670-734)||(6331671-6331735)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (38-749)||(94429-95140)
scaffold0028 (38-749)||(103870-104581)
scaffold0028 (670-734)||(82272-82336)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (38-749)||(7592485-7593196)
chr7 (38-397)||(15172798-15173157)
chr7 (403-749)||(15174385-15174730)
chr7 (38-388)||(15202224-15202571)
chr7 (38-278)||(4118893-4119133)
chr7 (500-749)||(14634776-14635023)
chr7 (500-740)||(11634337-11634574)
chr7 (500-749)||(14644476-14644723)
chr7 (559-749)||(33292175-33292364)
chr7 (559-749)||(15947371-15947560)
chr7 (560-749)||(32817997-32818185)
chr7 (500-749)||(9736888-9737135)
chr7 (561-747)||(19352589-19352775)
chr7 (596-747)||(13874423-13874572)
chr7 (633-749)||(48710005-48710121)
chr7 (565-732)||(4306573-4306739)
chr7 (559-628)||(48711400-48711469)
chr7 (670-734)||(607218-607282)
chr7 (670-734)||(616313-616377)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (38-749)||(28367651-28368362)
chr3 (38-749)||(28375469-28376180)
chr3 (38-749)||(28383291-28384002)
chr3 (38-749)||(28351718-28352430)
chr3 (361-749)||(24794544-24794932)
chr3 (127-749)||(4951164-4951783)
chr3 (422-748)||(38529176-38529502)
chr3 (38-360)||(38529524-38529846)
chr3 (559-744)||(5385690-5385874)
chr3 (559-747)||(13328278-13328465)
chr3 (559-749)||(23487041-23487232)
chr3 (562-732)||(17529877-17530046)
chr3 (559-749)||(46305572-46305760)
chr3 (562-732)||(54624655-54624824)
chr3 (562-732)||(48978670-48978835)
chr3 (562-732)||(48988210-48988375)
chr3 (562-732)||(32877870-32878039)
chr3 (561-749)||(7783987-7784194)
chr3 (169-403)||(27168983-27169216)
chr3 (138-342)||(7784561-7784764)
chr3 (561-749)||(4361514-4361699)
chr3 (666-732)||(19388870-19388936)
chr3 (169-399)||(4361858-4362085)
chr3 (666-710)||(24285493-24285537)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (38-749)||(23895614-23896325)
chr6 (38-749)||(18420031-18420741)
chr6 (500-749)||(22066235-22066482)
chr6 (561-749)||(14102308-14102497)
chr6 (559-745)||(23884492-23884677)
chr6 (581-747)||(10259779-10259945)
chr6 (138-391)||(14101770-14102022)
chr6 (560-749)||(17512221-17512408)
chr6 (587-747)||(11421451-11421611)
chr6 (607-749)||(12173469-12173610)
chr6 (561-724)||(23110242-23110405)
chr6 (562-688)||(12415064-12415190)
chr6 (566-660)||(13218359-13218453)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (38-749)||(3012-3723)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (38-749)||(7789076-7789787)
chr8 (307-749)||(20713818-20714259)
chr8 (500-749)||(18143427-18143673)
chr8 (500-744)||(18883163-18883404)
chr8 (500-747)||(25051063-25051307)
chr8 (559-749)||(42712176-42712365)
chr8 (500-740)||(18232870-18233107)
chr8 (500-740)||(18242321-18242558)
chr8 (500-747)||(25037026-25037270)
chr8 (500-740)||(18251772-18252009)
chr8 (562-747)||(31575411-31575595)
chr8 (559-749)||(20030179-20030368)
chr8 (559-749)||(20044818-20045007)
chr8 (560-749)||(12925355-12925543)
chr8 (500-749)||(4843720-4843968)
chr8 (559-749)||(12767631-12767822)
chr8 (596-747)||(33592134-33592284)
chr8 (596-747)||(33601773-33601923)
chr8 (600-749)||(12915500-12915648)
chr8 (560-745)||(24096077-24096262)
chr8 (559-746)||(15833950-15834137)
chr8 (600-737)||(24634009-24634145)
chr8 (682-749)||(20714417-20714484)
chr8 (596-722)||(42896174-42896299)
chr8 (324-403)||(15833720-15833798)
chr8 (324-393)||(15827408-15827476)
chr8 (686-744)||(26194048-26194106)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (38-749)||(30821-31516)
scaffold0040 (71-748)||(9559-10230)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (38-749)||(31710464-31711162)
chr2 (42-749)||(24022740-24023445)
chr2 (474-749)||(14273121-14273394)
chr2 (103-393)||(14272600-14272889)
chr2 (559-749)||(35877516-35877705)
chr2 (559-749)||(35885005-35885194)
chr2 (559-749)||(36724718-36724907)
chr2 (562-732)||(1800493-1800662)
chr2 (562-732)||(22632402-22632571)
chr2 (559-745)||(3396923-3397108)
chr2 (562-732)||(1790999-1791164)
chr2 (581-749)||(18578707-18578875)
chr2 (666-735)||(16446670-16446739)
chr2 (677-749)||(29911278-29911350)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (38-559)||(26309-26812)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (38-347)||(412777-413086)
scaffold0001 (457-749)||(408226-408518)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (38-747)||(15809976-15810688)
chr1 (559-749)||(5378422-5378613)
chr1 (559-749)||(14272016-14272205)
chr1 (559-748)||(40999034-40999224)
chr1 (559-743)||(14281888-14282071)
chr1 (562-749)||(26906244-26906431)
chr1 (573-749)||(21633594-21633769)
chr1 (559-735)||(3470949-3471124)
chr1 (124-289)||(41000835-41001003)
chr1 (596-747)||(21919431-21919581)
chr1 (324-497)||(40999283-40999455)
chr1 (559-746)||(30676788-30676976)
chr1 (603-744)||(28310018-28310155)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (500-744)||(256901-257142)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (559-749)||(2109-2298)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (559-749)||(124047-124236)
scaffold0021 (581-732)||(100002-100152)
scaffold0021 (559-627)||(143169-143237)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (562-732)||(14830-14999)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (562-732)||(24593-24762)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (596-747)||(12548-12698)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (596-749)||(2259-2411)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (559-722)||(27078-27246)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (670-734)||(49501-49565)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 680; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 26811987 - 26812698
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26811987 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 26812086  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812087 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 26812186  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812187 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 26812286  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26812287 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 26812386  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812387 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26812486  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812487 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 26812586  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812587 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 26812686  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  26812687 ctgtgttattct 26812698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 26821454 - 26822165
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26821454 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 26821553  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821554 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 26821653  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821654 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 26821753  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26821754 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 26821853  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821854 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26821953  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821954 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 26822053  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822054 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 26822153  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  26822154 ctgtgttattct 26822165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 672; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 3242996 - 3242285
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3242996 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 3242897  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242896 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3242797  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242796 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 3242697  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3242696 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3242597  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242596 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 3242497  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3242496 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 3242397  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242396 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 3242297  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  3242296 ctgtgttattct 3242285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 668; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 54690622 - 54689911
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54690622 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 54690523  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690522 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 54690423  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690422 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 54690323  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54690322 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 54690223  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690222 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 54690123  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54690122 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 54690023  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690022 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 54689923  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  54689922 ctgtgttattct 54689911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 668; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 54700053 - 54699342
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54700053 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 54699954  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699953 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 54699854  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699853 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 54699754  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54699753 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 54699654  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699653 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 54699554  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54699553 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 54699454  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699453 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 54699354  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  54699353 ctgtgttattct 54699342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 3917545 - 3918256
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3917545 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 3917644  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917645 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3917744  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917745 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 3917844  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3917845 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3917944  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3917945 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagaaagaaaattc 3918044  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3918045 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatg 3918144  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918145 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 3918244  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  3918245 ctgtgttattct 3918256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 37058566 - 37059276
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37058566 gacatcatcagaagtgggcacaaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaaacaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 37058665  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37058666 agaacattttgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 37058765  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37058766 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 37058865  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37058866 actacaaacagagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 37058964  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37058965 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgagcttaatagttttgagatagaaaattc 37059064  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37059065 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtg 37059164  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059165 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 37059264  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  37059265 ctgtgttattct 37059276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 15843605 - 15842897
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15843605 gacatcatcagcattgggcagcaaattatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 15843507  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843506 agaacattatgagaacgttatggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttgaacagctataaaaaacgtgtccaacagctctattttct 15843407  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15843406 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 15843307  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  15843306 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaaca 15843208  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15843207 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattt 15843108  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  15843107 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgcttaggttgataatacaggtgtaacagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtg 15843008  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15843007 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaagataactctc 15842908  T
Q  738 ctgtgttattc 748  Q
    |||||||||||    
T  15842907 ctgtgttattc 15842897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 20884636 - 20884447
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  20884636 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 20884540  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884539 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattct 20884447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 50516742 - 50516496
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |  || |  |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  50516742 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaag--caaagaattgtaacagcctgctgaggttgataatacaag 50516646  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50516645 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttct---accaacggaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 50516549  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50516548 ggactggaagtagtcgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattct 50516496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 11482315 - 11482504
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  11482315 gcaaagaattgtagaagccggctgaggttgataatacaggggttacggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 11482411  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11482412 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactagaagtagccgggtttggacaaccaggataactctcctacgttattct 11482504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 23622919 - 23623088
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  23622919 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 23623017  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  23623018 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 23623088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 561 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 18125595 - 18125410
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  18125595 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 18125499  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18125498 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgtcattct 18125410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18125981 - 18125754
Alignment:
Q  169 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 268  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  18125981 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 18125883  T
Q  269 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 367  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || | ||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  18125882 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctc-tagtaaaaatcatcactacatac-aagctcttcacaaacaaa-c 18125786  T
Q  368 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 399  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  18125785 aaataccaagctctctcattataccttttgga 18125754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 41902703 - 41902641
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgat 622  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  41902703 gcaaagaattgtataagcatgttgaagttgataataga-gtgtaactgactgatctggtgtgat 41902641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 562 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16490025 - 16489947
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgct 639  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  16490025 aagaatcgtagaagtctgctgaggttgataatactgagtgtaacagactgatatggtgtgatcaacaaattatagtgct 16489947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 691 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28256155 - 28256097
Alignment:
Q  691 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28256155 gtgtggggactgaaagtagccaactttgatgaaccacgataaatctcctgtgttattct 28256097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 112634 - 112698
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  112634 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 112698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 14917028 - 14917092
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14917028 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 14917092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 670; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 670; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 30454910 - 30454201
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454910 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30454811  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454810 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30454711  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454710 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30454611  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30454610 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30454511  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454510 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30454411  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30454410 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30454311  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454310 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 30454211  T
Q  738 ctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||    
T  30454210 ctgtgttatt 30454201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 666; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 30459968 - 30459259
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459968 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30459869  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459868 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30459769  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459768 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30459669  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30459668 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30459569  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459568 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30459469  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30459468 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgccgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30459369  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459368 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 30459269  T
Q  738 ctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||    
T  30459268 ctgtgttatt 30459259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 662; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 30445538 - 30444829
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445538 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30445439  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445438 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30445339  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445338 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30445239  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30445238 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30445139  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445138 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30445039  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30445038 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttatggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30444939  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30444938 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaatcaggataactctc 30444839  T
Q  738 ctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||    
T  30444838 ctgtgttatt 30444829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 661; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 18568517 - 18569229
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568517 gacatcatcagaagtggactgcaagttacacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 18568616  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568617 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 18568716  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568717 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 18568816  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18568817 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 18568916  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatag-ttttgagatagaaaatt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18568917 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttttgagatagaaaatt 18569016  T
Q  537 ccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 636  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18569017 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 18569116  T
Q  637 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569117 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 18569216  T
Q  737 cctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||    
T  18569217 cctgtgttattct 18569229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 656; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 24412307 - 24413018
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24412307 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 24412406  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412407 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 24412506  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412507 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 24412606  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24412607 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 24412706  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412707 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 24412806  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24412807 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 24412906  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24412907 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 24413006  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  24413007 ctgtgttattct 24413018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 618; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 24421767 - 24422467
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24421767 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 24421866  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421867 agaacattct-----------ggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccagcagctctattttct 24421955  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421956 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 24422055  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24422056 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 24422155  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422156 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 24422255  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24422256 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 24422355  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24422356 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 24422455  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  24422456 ctgtgttattct 24422467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 22488666 - 22489375
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22488666 gacatcatcagcattaggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 22488764  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22488765 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 22488864  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22488865 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 22488964  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  22488965 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaaca 22489063  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489064 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 22489163  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22489164 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtg 22489263  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489264 ctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 22489363  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  22489364 ctgtgttattct 22489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 748
Target Start/End: Original strand, 4635442 - 4636134
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4635442 gacatcatcagcagtgcgcaacaagttatacaactcattacaactggttctctcacgcgcaagcaa-gcaatagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 4635540  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4635541 agaacattttgagaacattctagctattttaaagaagaaaagaaaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgcatccaacagctctattttct 4635640  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4635641 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggtcataagctagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 4635740  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||                |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| |||||||||||    
T  4635741 act----------------gcaaacaaagcaaattccaagctccctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaactcaaaca 4635823  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635824 aagaattaagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 4635923  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  4635924 caacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataaaacaggtgtaacggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtg 4636023  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636024 ctggtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacgtgaggtgtggggactgaaaatagccgggtttggtgaaccaggataactctc 4636123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 562 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 42732761 - 42732575
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa 661  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||      
T  42732761 aagaattgtagaagcctgttgaggttgataatacaggggttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct- 42732663  T
Q  662 gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42732662 gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 42732575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815371
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  13815617 aagtttattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataatacaag 13815521  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13815520 ggttacagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgg 13815424  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815423 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 13815371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 24244287 - 24244050
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  24244287 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24244191  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244190 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaact-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24244092  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24244091 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24244050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 24290911 - 24290674
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  24290911 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24290815  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24290814 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaact-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24290716  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24290715 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24290674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 33955687 - 33955498
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  33955687 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 33955591  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955590 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33955498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 11223376 - 11223564
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  11223376 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 11223472  T
Q  659 caa-gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||  | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11223473 cactgtatactataatggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttttgtgttattct 11223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 5600580 - 5600749
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5600580 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5600678  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5600679 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5600749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 5610226 - 5610395
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5610226 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5610324  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5610325 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5610395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 20035999 - 20036188
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  20035999 gcaaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatatagtggttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 20036095  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20036096 caactgtatactatagtggataatctcacatgatgtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 20036188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 559 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 22118291 - 22118134
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 657  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  22118291 gcaaataattgtagaagcatgctgatgttgataatacaggatgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgtta 22118192  T
Q  658 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggt 715  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22118191 gcaagacaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagtcgggt 22118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 31150820 - 31150651
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  31150820 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 31150722  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  31150721 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 31150651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 559 - 743
Target Start/End: Original strand, 20834431 - 20834614
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  20834431 gcaaagaattggagaagcctgctgaggttgattatacagtggttacgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 20834527  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 743  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20834528 caactgcatactatagtggataatctcacacggagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 20834614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 582 - 749
Target Start/End: Original strand, 26652642 - 26652808
Alignment:
Q  582 gaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 681  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26652642 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26652740  T
Q  682 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26652741 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattct 26652808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 582 - 749
Target Start/End: Original strand, 26924227 - 26924393
Alignment:
Q  582 gaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 681  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26924227 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26924325  T
Q  682 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924326 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattct 26924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24278987 - 24278813
Alignment:
Q  67 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 166  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24278987 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24278890  T
Q  167 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatca-aaaacgtgtccaacagctctattttctccct 241  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24278889 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24278813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 24383227 - 24383401
Alignment:
Q  67 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 166  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24383227 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24383324  T
Q  167 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatc-aaaaacgtgtccaacagctctattttctccct 241  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24383325 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24383401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 666 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 22448411 - 22448330
Alignment:
Q  666 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22448411 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 22448330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 666 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37514940 - 37514857
Alignment:
Q  666 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  37514940 actatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaaccagtataaatctcatgtgttattct 37514857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22118545 - 22118443
Alignment:
Q  297 aagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctct 395  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22118545 aagagttttgaaagcaaatattctctcaa-gtgaaaatcatcactacatacaaagctcttcacaaacaaatcaaattccaagc--tctcattatatctct 22118449  T
Q  396 tggatc 401  Q
    ||||||    
T  22118448 tggatc 22118443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 22457722 - 22457666
Alignment:
Q  691 gtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22457722 gtgtggggactggaagtagccggattgggtgaacaaggataactcttctgtgttatt 22457666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 677 - 732
Target Start/End: Original strand, 16111002 - 16111058
Alignment:
Q  677 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataa 732  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16111002 taatctcacacgaagtgtcgggactggaagtagccggcttttggtgaaccatgataa 16111058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 719018 - 718954
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  719018 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 718954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 727998 - 727934
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  727998 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 727934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 6331735 - 6331671
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  6331735 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 6331671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 664; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 664; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 95140 - 94429
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  95140 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 95041  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95040 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 94941  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94940 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 94841  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94840 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 94741  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94740 aagatttgagtatctattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 94641  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94640 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 94541  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94540 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctc 94441  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  94440 ctgtgttattct 94429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 664; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 104581 - 103870
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  104581 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 104482  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104481 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 104382  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104381 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 104282  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  104281 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 104182  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104181 aagatttgagtatctattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 104082  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  104081 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 103982  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103981 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaattagccgggtttggtgaaccaggataactctc 103882  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  103881 ctgtgttattct 103870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 82272 - 82336
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  82272 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 82336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 664; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 664; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 7592485 - 7593196
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7592485 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 7592584  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592585 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 7592684  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592685 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 7592784  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7592785 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 7592884  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592885 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 7592984  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592985 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 7593084  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7593085 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccaggtttggtgaaccaggataactctc 7593184  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
     |||||||||||    
T  7593185 ttgtgttattct 7593196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 397
Target Start/End: Original strand, 15172798 - 15173157
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15172798 gacatcatcagaagtgagcagcaagttatacagctcattatagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 15172897  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15172898 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 15172997  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15172998 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 15173097  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15173098 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccatgctctctcactatatctcttg 15173157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 403 - 749
Target Start/End: Original strand, 15174385 - 15174730
Alignment:
Q  403 tctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaag 502  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15174385 tctctcttgaatttgc-tcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaag 15174483  T
Q  503 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15174484 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataagcctgctgaggttgataatacaggtgta 15174583  T
Q  603 acggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174584 acggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 15174683  T
Q  703 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15174684 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataaatctcctgtgttattct 15174730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 38 - 388
Target Start/End: Original strand, 15202224 - 15202571
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15202224 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacaactcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgcttttaaagccagacaaatcagaa 15202323  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15202324 agaacattcatagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 15202423  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  15202424 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaag---atatctctctaagtgaaaatcatc 15202520  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcacta 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15202521 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaaggaaattccaagctctctcacta 15202571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4119133 - 4118893
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4119133 gacatcatcagaagtgagcaacaagttatacagctcattaaagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 4119034  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4119033 agaacattctgagaacgttttggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 4118934  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4118933 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 4118893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 14635023 - 14634776
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||| | ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14635023 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14634927  T
Q  598 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 697  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14634926 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagct-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14634828  T
Q  698 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634827 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 11634574 - 11634337
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  11634574 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 11634478  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11634477 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 11634379  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11634378 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 11634337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 14644723 - 14644476
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||| | ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14644723 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14644627  T
Q  598 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14644626 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 14644530  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14644529 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14644476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 33292364 - 33292175
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  33292364 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 33292268  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292267 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33292175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15947560 - 15947371
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  15947560 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 15947464  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947463 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggtgactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 15947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 560 - 749
Target Start/End: Original strand, 32817997 - 32818185
Alignment:
Q  560 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |    
T  32817997 caaaaaattgtagaagcctgcggaggttgataatacaggggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---acc 32818093  T
Q  660 aa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32818094 aactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggaccggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 32818185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Original strand, 9736888 - 9737135
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||| | ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9736888 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 9736984  T
Q  598 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 697  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||   || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9736985 gggctacagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaact-gaatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 9737083  T
Q  698 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737084 gactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgttattct 9737135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 561 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 19352775 - 19352589
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||  || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19352775 aaagaagtgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaacggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagc 19352676  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19352675 aggaga-ctatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaaccagtataactctcctgtattatt 19352589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 596 - 747
Target Start/End: Original strand, 13874423 - 13874572
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 693  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13874423 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtg 13874519  T
Q  694 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13874520 tggggactggaagtag-cggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 13874572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 48710121 - 48710005
Alignment:
Q  633 tagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg-actggaagtagccgggtttggtgaaccaggata 731  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  48710121 tagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtgaaccagaata 48710023  T
Q  732 actctcctgtgttattct 749  Q
     |||||||||||||||||    
T  48710022 tctctcctgtgttattct 48710005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4306739 - 4306573
Alignment:
Q  565 aattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgtta-cggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaag 662  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| ||| ||||||||| |||   |    
T  4306739 aattgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaacat--agtgctattcataagtttctgatagttgg 4306642  T
Q  663 aaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    | | ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  4306641 ata-ctatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaactaggataa 4306573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 48711469 - 48711400
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagat 628  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48711469 gcaaagaattatagaagcctgttgaggttgataatacatgtgttccgaactgatatggtgtgatcaagat 48711400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 607218 - 607282
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  607218 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 607282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 616313 - 616377
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  616313 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 616377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 661; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 661; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28368362 - 28367651
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28368362 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28368263  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368262 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28368163  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368162 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28368064  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28368063 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28367964  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367963 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28367864  T
Q  537 ccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 636  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367863 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28367764  T
Q  637 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367763 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28367664  T
Q  737 cctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||    
T  28367663 cctgtgttattct 28367651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 661; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28376180 - 28375469
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28376180 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28376081  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376080 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28375981  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375980 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28375882  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28375881 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28375782  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375781 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28375682  T
Q  537 ccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 636  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375681 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28375582  T
Q  637 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375581 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28375482  T
Q  737 cctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||    
T  28375481 cctgtgttattct 28375469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 661; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28384002 - 28383291
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28384002 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28383903  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383902 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28383803  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383802 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28383704  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28383703 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28383604  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383603 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28383504  T
Q  537 ccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 636  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383503 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28383404  T
Q  637 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383403 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28383304  T
Q  737 cctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||    
T  28383303 cctgtgttattct 28383291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 657; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28352430 - 28351718
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28352430 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacaactcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28352331  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352330 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28352231  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352230 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28352131  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28352130 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28352031  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatcc-aaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352030 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28351931  T
Q  537 ccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 636  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28351930 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctaaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28351831  T
Q  637 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28351830 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagcataactct 28351731  T
Q  737 cctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||    
T  28351730 cctgtgttattct 28351718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 361 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 24794932 - 24794544
Alignment:
Q  361 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794932 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatc 24794833  T
Q  461 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24794832 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgc 24794733  T
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794732 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 24794633  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794632 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 24794544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 127 - 749
Target Start/End: Original strand, 4951164 - 4951783
Alignment:
Q  127 gcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacag 226  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4951164 gcaaatcagacataacattatgagaacgttcttcctatttttaagaagaaaagagaaatcaattgagactttagacagttatcaaaaacgtgtccaacaa 4951263  T
Q  227 ctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaaga-gttttgcaagctaatat-ctctcaa 324  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  4951264 ctctagtttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggtta-aagatagaagttttgcaagtaaatattctctcaa 4951362  T
Q  325 agtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttg 424  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||    
T  4951363 -gtgaaaatcaccactacaaacaaaactctttgcaaacaaagcaaattccaagttctctcactatgtctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattg 4951460  T
Q  425 ttaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaac-aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttt 522  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4951461 taaaatctcaaacaaagtgttgagtatttatttgatccaaaccaaatctcattgtacaatg--tgttgtatttctcat-gtctatttggcttaatagttt 4951557  T
Q  523 tgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgat 622  Q
     ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  4951558 -gagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgtaaagaattgtagaaggctgttgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgac 4951656  T
Q  623 caagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtga 722  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  4951657 caataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctcacacgaggtgtgaggacttgaagtagtcgagtttggtga 4951756  T
Q  723 accaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||    
T  4951757 accaagataactctcatgtgttattct 4951783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 422 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 38529502 - 38529176
Alignment:
Q  422 ttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtt 521  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38529502 ttgtaaaactaaaacaaagtattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtaattctcaaagtctattgggcttaatcgtt 38529403  T
Q  522 ttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtga 621  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  38529402 ttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctactgaggttgataatacaagtgtaacagactcatctggtgtga 38529303  T
Q  622 tcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtg 721  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38529302 tcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggcactggaagtagccgggtttggtg 38529203  T
Q  722 aaccaggataactctcctgtgttattc 748  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  38529202 aactatgataactctcctgtattattc 38529176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38529846 - 38529524
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||  | |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38529846 gacatcatcaacattgggcaacaagttaaacaactcattacagctggttctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagtcagacaattcagaa 38529748  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaaga-gaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttc 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38529747 agaacattctgagaacggtctggctattttaaagaagaaaaaaagaaatcaattgagactttggacaactataaaaaacgtgtccaacaactctattttc 38529648  T
Q  237 tcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcat 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38529647 tcccttgatcaccaagacactcctcgcctataaatacaagggcctttgaagattataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcat 38529548  T
Q  337 cactacaaacaaagctcttcgcaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38529547 cactacaaacaaagctcttcgcaa 38529524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 559 - 744
Target Start/End: Original strand, 5385690 - 5385874
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | ||    
T  5385690 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgatgatacagtggttacatactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcag 5385789  T
Q  659 caagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 744  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5385790 ct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 5385874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 559 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13328465 - 13328278
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||||||||||   |     
T  13328465 gcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaagggttacggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttct---ac 13328369  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13328368 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaaccaagataactctcctgtgttatt 13328278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 23487041 - 23487232
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  23487041 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaagggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 23487137  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg--gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487138 caactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 23487232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17530046 - 17529877
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  17530046 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 17529948  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  17529947 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 17529877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 46305760 - 46305572
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  46305760 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 46305664  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46305663 caactgtatactaaagtggataatctca-acgaagtgtggggactggaagtagccgggtttgatgaaccaagataactctcctgtgttattct 46305572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 54624655 - 54624824
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54624655 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 54624754  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  54624755 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 54624824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 48978670 - 48978835
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48978670 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48978764  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48978765 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48978835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 48988210 - 48988375
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48988210 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48988304  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48988305 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48988375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 32877870 - 32878039
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| || |||||    
T  32877870 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcagaagtttatgatagca 32877969  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  32877970 tgata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 32878039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 561 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 7784194 - 7783987
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7784194 aaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctgttagc 7784095  T
Q  660 ------------------aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgt 741  Q
                      |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  7784094 aagacagtttctgttagcaagacaactgtagtggataatctcacatgtggtgtgggaactggaagtagtcaggtttggtgaaccagaacagttctcctgt 7783995  T
Q  742 gttattct 749  Q
    ||||||||    
T  7783994 gttattct 7783987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 403
Target Start/End: Original strand, 27168983 - 27169216
Alignment:
Q  169 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 268  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||     |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27168983 aagaagaaaagtgaaatcaattgaatcgttggacagctgcactaaacgtgtccaacacctctattttcactcttgatcaccaagtcactcctcacctata 27169082  T
Q  269 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 367  Q
    || ||||| |   | ||||||  ||   |||||||||| |||  |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||      
T  27169083 aacacaagtggtctagaaggttctatataagagttttgaaagtaagcattctctc-aagtgaaaatcatcactacatacaaagttcttcacaaacaaa-a 27169180  T
Q  368 aaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 403  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27169181 aaatttcaagctctctcattatatcttttggatcat 27169216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7784764 - 7784561
Alignment:
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||     
T  7784764 agaacattctaagaacattctgtctgttt-aaagaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggaaagctgccaaaaacatgtccaacaacactattttca 7784666  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 336  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  | |||||||   ||| |||||||||  |||| | || |||||| |||||||||||||    
T  7784665 ctcttgatcaccaaggcactgctcacctataaatacaagtggttatgaaggttgaaagtaagagttttaaaagcaagtattctctc-aagtgaaaatcat 7784567  T
Q  337 cactac 342  Q
    ||||||    
T  7784566 cactac 7784561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 561 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 4361699 - 4361514
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  4361699 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 4361603  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4361602 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgtcattct 4361514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 666 - 732
Target Start/End: Original strand, 19388870 - 19388936
Alignment:
Q  666 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19388870 actatagtcgataatctcacacgaagtgtggggacttgaagtagccgattttggtgaaccaggataa 19388936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4362085 - 4361858
Alignment:
Q  169 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 268  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  4362085 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 4361987  T
Q  269 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 367  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || | ||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  4361986 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctc-tagtaaaaatcatcactacatac-aagctcttcacaaacaaa-c 4361890  T
Q  368 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 399  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  4361889 aaataccaagctctctcattataccttttgga 4361858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 710
Target Start/End: Original strand, 24285493 - 24285537
Alignment:
Q  666 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagc 710  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24285493 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggagtggaagtagc 24285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 656; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 656; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 23896325 - 23895614
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23896325 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 23896226  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896225 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 23896126  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896125 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 23896026  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23896025 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 23895926  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895925 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 23895826  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895825 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 23895726  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895725 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 23895626  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  23895625 ctgtgttattct 23895614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 18420031 - 18420741
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18420031 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 18420130  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420131 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 18420230  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420231 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 18420330  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18420331 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattcaaagctctctcactatatctcttggatcttctcacttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 18420429  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18420430 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaattc 18420529  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  18420530 caacctttcttttgctattgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtg 18420629  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18420630 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtgtataatctcacacgaggtgtcgggactggaagtagccgggttttgtgaaccaggataactatc 18420729  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  18420730 ctgtgttattct 18420741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Original strand, 22066235 - 22066482
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||| | ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22066235 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 22066331  T
Q  598 gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22066332 tggttacggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 22066428  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066429 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 22066482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 561 - 749
Target Start/End: Original strand, 14102308 - 14102497
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14102308 aaagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacaggctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattcttcagtgttattct 14102497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 745
Target Start/End: Original strand, 23884492 - 23884677
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  23884492 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 23884588  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 745  Q
    |||  | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23884589 caactgcatactatagtggacaatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 23884677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 581 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10259945 - 10259779
Alignment:
Q  581 tgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 679  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||    
T  10259945 tgaggtttataatacagggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagcaggata-ctatagtggagaa 10259847  T
Q  680 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10259846 tcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaaccagaataattctcctgtgttatt 10259779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 391
Target Start/End: Original strand, 14101770 - 14102022
Alignment:
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  14101770 agaacattctgagaacgttcttcccgttttaatgaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggacagctgccaaaaacgtatccaacaactctattttca 14101869  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 336  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||| || | | |||||||||||  |||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  14101870 ctcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaattggttttgaatgttaaatgcaagagtttttaaagcaaatattatctc-aagtgaaaatcat 14101968  T
Q  337 cactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatat 391  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  14101969 cactacatacaaaactcttcacaattaaaacaaactccaa-ctctctcactatat 14102022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 560 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 17512408 - 17512221
Alignment:
Q  560 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |    
T  17512408 caaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatacagg-gttacagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttct---acc 17512313  T
Q  660 aa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17512312 aactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtggggactgaaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttctgtgttattct 17512221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 587 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11421611 - 11421451
Alignment:
Q  587 tgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcac 685  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  11421611 tgataatacatggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgata-ctatagtggataatctcac 11421513  T
Q  686 acgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | || |||||||||    
T  11421512 acgaggtgtggggactggaagtagccggatttgatgaactaggataattatcttgtgttatt 11421451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 607 - 749
Target Start/End: Original strand, 12173469 - 12173610
Alignment:
Q  607 actgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaag 706  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  12173469 actgatctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgata-ctatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaag 12173567  T
Q  707 tagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  12173568 tagccgagtttggtgaactatgataaatctcaggtgttattct 12173610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 561 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 23110405 - 23110242
Alignment:
Q  561 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  || ||| |  |||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23110405 aaagaattttagaagcctgttgatgttgataatattgggtgtaatagacttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagc 23110306  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 724  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23110305 c-gaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaagtagctggttttcgtgaac 23110242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 688
Target Start/End: Original strand, 12415064 - 12415190
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||       
T  12415064 aagaatcgtagaagcctgctatggttaataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgata-ag 12415162  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacg 688  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||    
T  12415163 aggatactataatggataatctcacacg 12415190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 660
Target Start/End: Original strand, 13218359 - 13218453
Alignment:
Q  566 attgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||   || || |||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13218359 attgtataagcttgttgaggttgataatatagtgattccgaactggtctggtgtgatcaataccttatagttctagtcaaaagtttctgttagca 13218453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 648; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 648; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Original strand, 3012 - 3723
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 3111  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3112 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3211  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3212 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatc 3311  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3312 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3411  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 3511  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3512 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 3611  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3612 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctc 3711  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  3712 ctgtgttattct 3723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 648; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 648; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 7789787 - 7789076
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789787 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 7789688  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789687 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 7789588  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7789587 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatc 7789488  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7789487 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 7789388  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789387 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 7789288  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7789287 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 7789188  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7789187 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctc 7789088  T
Q  738 ctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||    
T  7789087 ctgtgttattct 7789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 307 - 749
Target Start/End: Original strand, 20713818 - 20714259
Alignment:
Q  307 caagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctc 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20713818 caagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctc 20713917  T
Q  407 tcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtcta 506  Q
    | | |||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20713918 tttcgaatttgc-tattgtaaatctcaaacaaagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcctcataaaaagtgtgttgtatttctcaaagtata 20714016  T
Q  507 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacgg 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20714017 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacag 20714116  T
Q  607 actgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaag 706  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20714117 actgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactataatggataatgtcacacgaggtgtggggactggaag 20714216  T
Q  707 tagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714217 tagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20714259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 18143673 - 18143427
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  18143673 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctactgaggttgataatacaag 18143577  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||   ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18143576 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagttt---ttaccaactgaatgctatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18143480  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143479 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaagataactctcctgtgttattct 18143427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 500 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18883404 - 18883163
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  18883404 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 18883308  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18883307 gggtacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18883211  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18883210 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 18883163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 500 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051063
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25051307 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25051211  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25051210 ggttacagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25051114  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25051113 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25051063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 42712365 - 42712176
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  42712365 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 42712269  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42712268 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 42712176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Original strand, 18232870 - 18233107
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  18232870 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18232966  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232967 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaact-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18233065  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18233066 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18233107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Original strand, 18242321 - 18242558
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  18242321 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18242417  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242418 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaact-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18242516  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18242517 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18242558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037026
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25037270 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25037174  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037173 ggttacagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25037077  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25037076 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 500 - 740
Target Start/End: Original strand, 18251772 - 18252009
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  18251772 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18251868  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 698  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251869 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18251967  T
Q  699 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctg 740  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18251968 actggaagtagccggatttggtgaatcaggataactctcctg 18252009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 562 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31575595 - 31575411
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa 661  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||      
T  31575595 aagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaggggttctggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct- 31575497  T
Q  662 gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31575496 gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 31575411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 20030179 - 20030368
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   |     
T  20030179 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---ac 20030275  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20030276 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 20030368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 20044818 - 20045007
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  20044818 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 20044914  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20044915 caactgtatactatcgtggataatctcacacgaagtgtggggactggatgtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20045007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 560 - 749
Target Start/End: Original strand, 12925355 - 12925543
Alignment:
Q  560 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |    
T  12925355 caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---acc 12925451  T
Q  660 aa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12925452 aactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttcgtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12925543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 500 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843720
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataata--ca 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgatgaggttgataatataca 4843872  T
Q  597 ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 694  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4843871 agggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtcttggttagaaatttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgt 4843775  T
Q  695 ggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4843774 ggggactggaagtagccggatttagtgaaccaggataactctcctttgttattct 4843720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 12767631 - 12767822
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   ||     
T  12767631 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---tac 12767727  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggac--tggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767728 caactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12767822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 596 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 33592284 - 33592134
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33592284 aggtgttctggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33592186  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33592185 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 33592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 596 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 33601923 - 33601773
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33601923 aggtgttctggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33601825  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33601824 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 33601773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 600 - 749
Target Start/End: Original strand, 12915500 - 12915648
Alignment:
Q  600 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12915500 gttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 12915596  T
Q  698 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12915597 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12915648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 560 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 24096262 - 24096077
Alignment:
Q  560 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 659  Q
    |||||||||| | |||  || |||||||||||||||| |    | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24096262 caaagaattgaagaagtttgttgaggttgataatacaaggaaaatggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagc 24096163  T
Q  660 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg-actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 745  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24096162 aagata-ctatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactggaagtagtcgagtttggtgaaccagaataaatctcctgtgtta 24096077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 559 - 746
Target Start/End: Original strand, 15833950 - 15834137
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggt-gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 657  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||  || ||| ||| ||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15833950 gcaaagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaacgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagtta 15834049  T
Q  658 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttat 746  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15834050 gcatgata-ctataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaaccaagataaatctcttgtgttat 15834137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 600 - 737
Target Start/End: Original strand, 24634009 - 24634145
Alignment:
Q  600 gttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 699  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24634009 gttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatatcacacgaagtgtgggga 24634107  T
Q  700 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  24634108 ctggaagtagtcgggtttgaggaaccaggataactctc 24634145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 682 - 749
Target Start/End: Original strand, 20714417 - 20714484
Alignment:
Q  682 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714417 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20714484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 596 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 42896299 - 42896174
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42896299 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcaact-gaaatctatagtggataatctcacacgaagtgtg 42896201  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtga 722  Q
    | |||||||||||||||| || |||||    
T  42896200 gagactggaagtagccggattgggtga 42896174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Original strand, 15833720 - 15833798
Alignment:
Q  324 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  15833720 aagtgaaaatcatcactacatacaaagctcctcacaaacaaa-caaattgcaagccctctcattatatcttttggatcat 15833798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 393
Target Start/End: Original strand, 15827408 - 15827476
Alignment:
Q  324 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatct 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15827408 aagtgaaaatcatcactacatacaaagtttttcacaaacaaa-caaattccaagctatctcattatatct 15827476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26194106 - 26194048
Alignment:
Q  686 acgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 744  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26194106 acgaagtgtggggactagaagtagttgggtttgatgaaccaggataactctcatgtgtt 26194048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 591; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 31516 - 30821
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31516 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 31417  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31416 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 31317  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31316 cccttgttcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 31217  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31216 actacaaacaaagc----------------aaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 31133  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatgtctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 31033  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31032 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttactgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtg 30933  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30932 ttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 71 - 748
Target Start/End: Original strand, 9559 - 10230
Alignment:
Q  71 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 170  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9559 ctcattatagctggttctttcactcgcaagcaa-gcaacagagcaagcaaagctaggcaaatcagacagaacattctgagaacgttctagctatttttaa 9657  T
Q  171 gaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 270  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9658 gaagaaaagtgaaaacaaatgagactttggacagctatcaaaaatgtgtccatcaactctattttcacccttgatcaccaagacactcctcacctatata 9757  T
Q  271 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaa 369  Q
    |||||     ||||||||| | | |||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9758 tacaaatagttttgaaggttaaaggcaagagttttgaaagaaaatattctctc-aagtgaaaaacatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaa 9856  T
Q  370 attccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-caa 467  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||  | |||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||| |||||||| |||    
T  9857 atttcaagctctctcactatatcacttggatattctctttcaaatttg-ttattgtaaaatctcaaac-aggtgttgagtatttatttgatccaaaccaa 9954  T
Q  468 atctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaat 567  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||  ||| |||  |||||||||||    
T  9955 atctcattatacaaagtgtgttgtaattctc-aagtctattatgcttaatag-tttgagatagaaaattctaacatttatttttcta--gtgcaaagaat 10050  T
Q  568 tgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaac 667  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10051 tgtagaagcctattgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaac 10150  T
Q  668 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 748  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10151 tatagtggataatctcacacggggtgtggggactggaa-tagccgtgtttggtgaaccaagataactctcatgtgttattc 10230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 31711162 - 31710464
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31711162 gacatcatcagcattgggcaacaagttatacagctcattacaactggttctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggaaaatcagaa 31711064  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31711063 agaacattctg-----------gctatttttaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgcgtccaacaactctattttct 31710975  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31710974 cacttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 31710875  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| | |||| |||||||||||    
T  31710874 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgagtttgc-tattgtaaaactcaaaca 31710776  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31710775 aagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttactagttttgagatagaaaattc 31710676  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 637  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31710675 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtg 31710576  T
Q  638 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctc 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31710575 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaacaaggataactctc 31710476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 24023445 - 24022740
Alignment:
Q  42 tcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaa 141  Q
    ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24023445 tcatcagaattgagcgacaagttaaacagctcattacagttggttctctcacgcgcaag-aaagcaacagtgctttcaaagtaaggcaattcagacagaa 24023347  T
Q  142 cattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctccct 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24023346 cattctaagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggatagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24023247  T
Q  242 tggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcacta 341  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24023246 tgatcactaagacactcctcacctataaatacaagggcttttgaaggttataaccaagacttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcacta 24023147  T
Q  342 caaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaaga 441  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||     
T  24023146 caaacaaagctcttcgcaaataaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-ctattgtaaaactcaaacaaagt 24023048  T
Q  442 tttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagc 541  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  24023047 attgagtatttatttgatccaaagaaatttcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattggggttaatagttttgagatagaaaatttcaac 24022948  T
Q  542 ctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctag 641  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24022947 cttccttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgttgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctag 24022848  T
Q  642 tcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgt 741  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  24022847 tcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggaattggaagtagccgggtttggtgaacgaggataactctccaat 24022748  T
Q  742 gttattct 749  Q
    ||||||||    
T  24022747 gttattct 24022740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 474 - 749
Target Start/End: Original strand, 14273121 - 14273394
Alignment:
Q  474 tcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtata 573  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14273121 tcatacaaagtgtattgtatttctcaa-gtctattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtaga 14273218  T
Q  574 agcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagt 673  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14273219 agcctgctgaggttgataatataggtgtaacagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagt 14273318  T
Q  674 ggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14273319 ggataatctcacacgaggtgtggagactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcgtgtgttattct 14273394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 393
Target Start/End: Original strand, 14272600 - 14272889
Alignment:
Q  103 aagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggac 202  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14272600 aagcaacaatgctttcaaagttaggcaattcagacagaacattctgaaaacgttctggctatttataagtagaaaagagaaatcaattgagactttggac 14272699  T
Q  203 agctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||    
T  14272700 agctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggttaaaggtaagagt 14272799  T
Q  303 tttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatct 393  Q
    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14272800 tttgaaagcaaacattctcttgaa-tgaaaatcatcactacatacaaaactcttcacaaacaaaacaaactccaa-ctctctcactatatct 14272889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 35877516 - 35877705
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  35877516 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 35877612  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35877613 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 35877705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 35885005 - 35885194
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  35885005 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 35885101  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35885102 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 35885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 36724718 - 36724907
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  36724718 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 36724814  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36724815 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 36724907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 1800493 - 1800662
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  1800493 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 1800591  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1800592 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1800662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 22632402 - 22632571
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22632402 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagc- 22632500  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  22632501 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 22632571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 559 - 745
Target Start/End: Original strand, 3396923 - 3397108
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  3396923 gcaaagaattttagaagtctgctgaggttgataatacaatggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 3397019  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 745  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3397020 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactagaagtagctgggtttggtgaaccatgataactctcctgtgtta 3397108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 1790999 - 1791164
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  1790999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 1791093  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1791094 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1791164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 581 - 749
Target Start/End: Original strand, 18578707 - 18578875
Alignment:
Q  581 tgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 679  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||| | || |  ||  ||| ||||    
T  18578707 tgaggttgataatacagggtgtaacagattggtctggtgttatcaagaacttatagtcctagtcaaaagtttctgttaggaggatat-tactgtgaataa 18578805  T
Q  680 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  18578806 tctcacacaaggtgtggggactgaaagtagtcgggtttgatgaacatggataaatctcatgtgttattct 18578875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 735
Target Start/End: Original strand, 16446670 - 16446739
Alignment:
Q  666 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16446670 actatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtgatccaggataactc 16446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 749
Target Start/End: Original strand, 29911278 - 29911350
Alignment:
Q  677 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  29911278 taatctcacacgaggtgaggggactggaagcagctggatttggttaaccatgataaatctcatgtgttattct 29911350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26812 - 26309
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26812 gacatcatcagcattgggcagcaagttatacagctcattacagctgattaactcatgcgcatacaa-gcaacagtgctttcaaagccagacaaatcagaa 26714  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26713 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggatagctatcaaaaatgtgtccaacatctctattttct 26614  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26613 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 26514  T
Q  338 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaaca 437  Q
    ||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26513 actacaaaca----------------aagcaaattccaagctctctcactatatcccttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 26431  T
Q  438 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 537  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26430 aagatttgagtatttattttatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26331  T
Q  538 cagcctttcgtttgctagtgtg 559  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  26330 caacctttcttttgctagtgtg 26309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 38 - 347
Target Start/End: Original strand, 412777 - 413086
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  412777 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaaagcaatagtgctttcaaagtcagacaaatcagaa 412876  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  412877 agaacattatgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaaagagtccaacaactctattttct 412976  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412977 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 413076  T
Q  338 actacaaaca 347  Q
    ||||||||||    
T  413077 actacaaaca 413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 457 - 749
Target Start/End: Original strand, 408226 - 408518
Alignment:
Q  457 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagt 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  408226 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagt 408325  T
Q  557 gtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408326 gtgcaaagaattgtataagcctgaagaggttgataatacaggtgttacggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 408425  T
Q  657 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408426 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagacgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 408518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 38 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 15810688 - 15809976
Alignment:
Q  38 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 137  Q
    ||||| ||||||| || ||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||||||||     
T  15810688 gacataatcagaattgagcaacaagtaaaacagctcattacagctggttctctcactcgcaagcaa-gcaacagtgcaagcaaagttatgcaaatcagac 15810590  T
Q  138 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 237  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |     
T  15810589 ataacattctgagatcattctgtctatttttaagaagaaaaatgaaatcaattaggactttggacagctatcaaaaatgtgtccaacaactctatttgca 15810490  T
Q  238 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcat 336  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  | | | |||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  15810489 ccattgatcaccaagacactcatcacctataaatacaagtggttttgaattttaaaggcaagagttttgaaagaaaatattctctcaa-gtgaaaaacat 15810391  T
Q  337 cactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaa-ctcaaa 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  15810390 cactacaaacaaagctcctcgcaaacaaagcaaatttcaagctctctcactatatctcttgcatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaatctcaaa 15810292  T
Q  436 caaagatttgagtatttattcgatccaaac-aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa 534  Q
    ||| |  |||||||||||||  |||||||| |||| || | |||||||| |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15810291 caa-gtgttgagtatttattttatccaaaccaaatatcattatacaaagtgtgttgtaattctcaa-gtatgttgagcttaatagttt-gagatagaaaa 15810195  T
Q  535 ttccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgta 634  Q
    ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  15810194 ttccaacctttcttttgctggtt--caaagaattgtagaagcatgccgaagttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaccttata 15810097  T
Q  635 gtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga--------ctggaagtagccgggtttggtgaacca 726  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15810096 gtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtggataatctcacacgaggtgtggggactcgaactctggaagtagtcggatttggtgaacca 15809997  T
Q  727 ggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  15809996 ggataattctcttgtgttatt 15809976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5378613 - 5378422
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagg-tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 657  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  5378613 gcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgtta 5378514  T
Q  658 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5378513 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcctgtgttattct 5378422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 14272205 - 14272016
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14272205 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14272109  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14272108 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14272016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 559 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 40999224 - 40999034
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataataca-ggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 657  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40999224 gcaaagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaacaaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgtta 40999125  T
Q  658 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 748  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40999124 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaaccaggataactcttatgtgttattc 40999034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 559 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 14282071 - 14281888
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14282071 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14281975  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 743  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14281974 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14281888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 26906431 - 26906244
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26906431 aagaattgtaaaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaaca 26906332  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26906331 agatat-tataatggataatctcacacgaggtatggggactagaagtagcctggtttggtgaaccaggataaatctcgtgtgttattct 26906244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 573 - 749
Target Start/End: Original strand, 21633594 - 21633769
Alignment:
Q  573 aagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatag 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||    
T  21633594 aagcctgctgaggttgataatacagttgttccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactag-tagaatactatag 21633692  T
Q  673 tggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||    
T  21633693 tggataatctcacaaaaagtgtggggactagacgtagccgggtttggtgaaccagaatatttatcttgtgttattct 21633769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 559 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 3471124 - 3470949
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || || || | || |||||||||   ||     
T  3471124 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttataatgttggttagaagtttc---tac 3471028  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 735  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3471027 caattgtatactacagtggataatctcacatgaagtgtgggggctggaagtaaccgggtttggtgaaccaggataactc 3470949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41001003 - 41000835
Alignment:
Q  124 caggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaa---cgtgtc 220  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||    
T  41001003 caggcaaatcagacataacattctgagatctttctgcccaattttaagaagaaaagtgaaatcaaatgagactttggacatctataaaaaaaaacgtgtc 41000904  T
Q  221 caacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggt 289  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41000903 caacatctctattttcactcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggt 41000835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 596 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21919581 - 21919431
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 693  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21919581 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtg 21919485  T
Q  694 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21919484 tggggactggaagtagccggattgggtgaatcaggataactctcctgtgttatt 21919431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 324 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40999455 - 40999283
Alignment:
Q  324 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctctt 423  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |    
T  40999455 aagtgaaaaacatcactacatacaaagctcttcgcaaacaaagtaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-cttat 40999357  T
Q  424 gttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttct 497  Q
    || || ||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| || ||||| ||||    
T  40999356 gtaaatctcaaac-aagtgttgagaatttatttgatccaaaccaaatctcatcttacaaagtgtattgtaattct 40999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 559 - 746
Target Start/End: Original strand, 30676788 - 30676976
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 657  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||   | |||||||| ||| ||||||||  ||    
T  30676788 gcaaagaattatataagtatgttgagattgataatacagagtgtaacagactgatcttgtgtgatcaagaacatatagtgctattcataagtttcttata 30676887  T
Q  658 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttg-gtgaaccaggataactctcctgtgttat 746  Q
    ||  ||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  30676888 gc-tgaatattgtaatggataatctcacacgaagtgtggggactgaaagtagtctgctttgtgtgaaccatgataaatcttgtgtgttat 30676976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 28310155 - 28310018
Alignment:
Q  603 acggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||||| || |||| || | ||||||||||||||   ||||||  ||||||  || |    
T  28310155 acggactgatctggtgtgatcaacaacttatagtgttattcggaagtttttgatagc-aggatactatagtggataa--ccacacgtagtgtggaaaccg 28310059  T
Q  703 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 744  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28310058 gaagtagcc-ggttaggtgaatcaggataaatctcttgtgtt 28310018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 500 - 744
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257142
Alignment:
Q  500 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccagcctttcgtttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacagg 598  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  256901 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacaga 256997  T
Q  599 tgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 696  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  256998 ggttacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgg 257094  T
Q  697 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257095 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 257142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 2109 - 2298
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   |     
T  2109 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---ac 2205  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2206 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattct 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 559 - 749
Target Start/End: Original strand, 124047 - 124236
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 658  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  124047 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 124143  T
Q  659 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124144 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtaacaggatttgatgaaccaggataactctcctgtgttattct 124236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 581 - 732
Target Start/End: Original strand, 100002 - 100152
Alignment:
Q  581 tgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 679  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||    
T  100002 tgaggttgataatacagagtgtaacagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatactataatggataa 100100  T
Q  680 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||    
T  100101 tctcacacgtagtgtggggactggacatagcc-ggttaggcgaaccaggataa 100152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 627
Target Start/End: Original strand, 143169 - 143237
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaaga 627  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  143169 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaaga 143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14999 - 14830
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  14999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 14901  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  14900 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 562 - 732
Target Start/End: Original strand, 24593 - 24762
Alignment:
Q  562 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 660  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  24593 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 24691  T
Q  661 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 732  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||    
T  24692 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtag-ctggttaggcgaaccaggataa 24762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 596 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 12698 - 12548
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 695  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12698 aggtgttctggactaatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaacta-aaaactatagtggataatctcacacgaagtgta 12600  T
Q  696 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 747  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12599 gggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctatgttatt 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 2411 - 2259
Alignment:
Q  596 aggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtg 693  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||    
T  2411 aggtgttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtg 2315  T
Q  694 tggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 749  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2314 tggggactagaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 2259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 559 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27246 - 27078
Alignment:
Q  559 gcaaagaattgta-taagcctgctgaggttgataatacag-gtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 656  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||   | ||||| || | ||||||||||| |    
T  27246 gcaaagaattgtaataagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacgaattgatctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgat 27147  T
Q  657 agcaagaaaactatag----tggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtga 722  Q
    ||   | | |||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27146 ag-ttggatactatagtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtagccgactttggtga 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 734
Target Start/End: Original strand, 49501 - 49565
Alignment:
Q  670 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataact 734  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  49501 tagtggataatctcacacttg-tgtggggagtggaagtagccggcgtttggcgaaccacgataact 49565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University