View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0652_low_33 (Length: 254)

Name: NF0652_low_33
Description: NF0652
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0652_low_33
NF0652_low_33
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (23-157)||(18355545-18355679)
chr5 (23-156)||(11224638-11224771)
chr5 (23-156)||(11230450-11230583)
chr5 (23-156)||(24767912-24768045)
chr5 (23-156)||(11220052-11220185)
chr5 (23-156)||(11228461-11228594)
chr5 (23-156)||(20911545-20911678)
chr5 (23-152)||(15237478-15237607)
chr5 (23-156)||(40724260-40724384)
chr5 (23-101)||(22108023-22108101)
chr5 (23-156)||(19473329-19473453)
chr5 (31-113)||(10752564-10752646)
chr5 (23-81)||(11226546-11226604)
chr5 (23-96)||(20295235-20295309)
chr5 (35-89)||(33896167-33896221)
chr5 (128-156)||(20911689-20911717)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (23-156)||(31344467-31344600)
chr2 (23-156)||(1282717-1282850)
chr2 (23-156)||(9784339-9784472)
chr2 (23-156)||(30345660-30345784)
chr2 (23-95)||(41531649-41531721)
chr2 (23-156)||(24629123-24629248)
chr2 (23-156)||(27380076-27380201)
chr2 (23-156)||(27384122-27384247)
chr2 (23-156)||(27601129-27601254)
chr2 (23-95)||(10102297-10102370)
chr2 (23-95)||(24648744-24648817)
chr2 (33-96)||(24514919-24514982)
chr2 (33-96)||(36838904-36838967)
chr2 (23-59)||(12902160-12902196)
chr2 (41-96)||(17306187-17306242)
chr2 (33-96)||(28653758-28653821)
chr2 (33-82)||(24367393-24367442)
chr2 (34-82)||(32215481-32215529)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-157)||(208257-208391)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (23-156)||(21828683-21828816)
chr8 (23-156)||(21410254-21410387)
chr8 (23-156)||(21804746-21804879)
chr8 (31-156)||(14398498-14398623)
chr8 (23-156)||(18863314-18863447)
chr8 (23-156)||(23913600-23913733)
chr8 (23-156)||(21386662-21386795)
chr8 (23-156)||(30940746-30940870)
chr8 (23-156)||(44385290-44385418)
chr8 (23-95)||(21973225-21973298)
chr8 (23-95)||(21977316-21977389)
chr8 (23-156)||(22111268-22111393)
chr8 (23-156)||(43251148-43251273)
chr8 (84-156)||(15923992-15924064)
chr8 (41-104)||(5760109-5760172)
chr8 (33-99)||(37515140-37515206)
chr8 (23-82)||(16413823-16413882)
chr8 (33-96)||(42819188-42819251)
chr8 (33-89)||(18833030-18833086)
chr8 (34-82)||(32121396-32121444)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (23-156)||(7519684-7519817)
chr7 (23-156)||(13919139-13919272)
chr7 (23-156)||(15083500-15083633)
chr7 (23-156)||(39721570-39721703)
chr7 (23-156)||(2832841-2832974)
chr7 (23-156)||(1859468-1859601)
chr7 (23-156)||(12705303-12705436)
chr7 (23-156)||(25927887-25928020)
chr7 (23-156)||(2530798-2530931)
chr7 (23-156)||(26291701-26291834)
chr7 (23-113)||(18425032-18425122)
chr7 (23-156)||(20487134-20487258)
chr7 (23-156)||(45170675-45170799)
chr7 (35-156)||(12714301-12714413)
chr7 (23-101)||(18301685-18301763)
chr7 (23-156)||(71411-71536)
chr7 (23-156)||(75520-75645)
chr7 (23-156)||(12718005-12718130)
chr7 (23-156)||(12722916-12723041)
chr7 (23-156)||(16907855-16907980)
chr7 (23-156)||(18278740-18278865)
chr7 (23-156)||(18282703-18282828)
chr7 (23-156)||(32446-32571)
chr7 (23-156)||(16113578-16113703)
chr7 (23-156)||(16116731-16116856)
chr7 (33-96)||(32300747-32300810)
chr7 (33-97)||(14257822-14257886)
chr7 (33-96)||(16585087-16585150)
chr7 (33-96)||(14183867-14183930)
chr7 (33-96)||(16579188-16579251)
chr7 (33-96)||(16586411-16586474)
chr7 (33-96)||(20585135-20585198)
chr7 (33-82)||(14933150-14933199)
chr7 (33-82)||(15082374-15082423)
chr7 (33-82)||(15356585-15356634)
chr7 (33-82)||(15360699-15360748)
chr7 (34-82)||(24274742-24274790)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (23-156)||(23414234-23414367)
chr6 (23-156)||(22074630-22074763)
chr6 (23-156)||(1643839-1643972)
chr6 (23-156)||(31478628-31478761)
chr6 (23-156)||(2076801-2076934)
chr6 (23-157)||(16623682-16623816)
chr6 (23-97)||(27556064-27556138)
chr6 (23-95)||(22948506-22948578)
chr6 (23-95)||(22952462-22952534)
chr6 (23-95)||(23870950-23871022)
chr6 (23-95)||(23874906-23874978)
chr6 (23-156)||(14471551-14471675)
chr6 (38-156)||(18918035-18918144)
chr6 (23-156)||(11566199-11566324)
chr6 (23-156)||(12619486-12619611)
chr6 (23-156)||(16759574-16759699)
chr6 (23-156)||(22862283-22862408)
chr6 (23-156)||(23394405-23394530)
chr6 (23-156)||(8243170-8243295)
chr6 (30-104)||(19656817-19656891)
chr6 (23-156)||(23989257-23989382)
chr6 (33-156)||(17742690-17742813)
chr6 (33-96)||(19774141-19774204)
chr6 (52-156)||(19869926-19870021)
chr6 (33-89)||(22805370-22805426)
chr6 (33-104)||(20182303-20182374)
chr6 (33-104)||(22153617-22153688)
chr6 (33-89)||(15706050-15706106)
chr6 (117-156)||(27556021-27556060)
chr6 (40-96)||(27126664-27126720)
chr6 (33-96)||(7825378-7825441)
chr6 (34-82)||(23992080-23992128)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (23-156)||(14664982-14665115)
chr3 (23-156)||(14668138-14668271)
chr3 (23-156)||(15464431-15464564)
chr3 (23-156)||(19774899-19775032)
chr3 (23-156)||(4589557-4589690)
chr3 (23-156)||(8489828-8489961)
chr3 (23-145)||(12339044-12339165)
chr3 (31-156)||(14670394-14670519)
chr3 (33-156)||(14681916-14682039)
chr3 (23-152)||(17317772-17317901)
chr3 (23-156)||(37440281-37440405)
chr3 (23-113)||(16750985-16751075)
chr3 (23-156)||(15964285-15964409)
chr3 (23-156)||(15968209-15968333)
chr3 (23-156)||(15972133-15972257)
chr3 (23-156)||(4108043-4108168)
chr3 (23-156)||(4111895-4112020)
chr3 (23-101)||(16795895-16795973)
chr3 (41-101)||(12852972-12853032)
chr3 (58-156)||(5220484-5220573)
chr3 (23-156)||(11069408-11069533)
chr3 (23-156)||(14498665-14498790)
chr3 (23-156)||(22321004-22321129)
chr3 (23-156)||(22336059-22336184)
chr3 (23-156)||(27410288-27410413)
chr3 (23-156)||(28949062-28949187)
chr3 (23-156)||(7109036-7109161)
chr3 (23-156)||(7112971-7113096)
chr3 (30-104)||(14440975-14441049)
chr3 (23-156)||(30065320-30065445)
chr3 (23-156)||(55022205-55022330)
chr3 (23-95)||(11166173-11166246)
chr3 (23-95)||(15616766-15616839)
chr3 (35-96)||(10543097-10543158)
chr3 (34-96)||(18700954-18701016)
chr3 (35-96)||(43890295-43890356)
chr3 (33-96)||(2842742-2842805)
chr3 (33-96)||(35353303-35353366)
chr3 (95-145)||(11301027-11301077)
chr3 (95-145)||(11854183-11854233)
chr3 (34-96)||(19884859-19884921)
chr3 (23-60)||(14067315-14067352)
chr3 (34-82)||(13543632-13543680)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (23-157)||(33796847-33796981)
chr1 (23-157)||(39244563-39244697)
chr1 (23-157)||(39248118-39248252)
chr1 (23-156)||(20229651-20229784)
chr1 (23-156)||(21406685-21406818)
chr1 (23-125)||(41781942-41782044)
chr1 (23-113)||(41388663-41388753)
chr1 (23-156)||(1925798-1925922)
chr1 (23-156)||(20924812-20924936)
chr1 (23-101)||(48602865-48602943)
chr1 (23-101)||(22131524-22131602)
chr1 (23-156)||(1010060-1010185)
chr1 (23-96)||(16376102-16376176)
chr1 (23-95)||(52638930-52639003)
chr1 (40-104)||(23967335-23967399)
chr1 (33-102)||(20241555-20241624)
chr1 (33-96)||(42911750-42911813)
chr1 (33-96)||(48519847-48519910)
chr1 (33-89)||(4597107-4597163)
chr1 (34-82)||(14238784-14238832)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (23-156)||(10409-10542)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (23-156)||(20160515-20160648)
chr4 (23-156)||(20157839-20157972)
chr4 (23-156)||(20163293-20163426)
chr4 (23-113)||(15224414-15224504)
chr4 (23-96)||(10712244-10712317)
chr4 (23-96)||(10926014-10926087)
chr4 (23-95)||(25689292-25689364)
chr4 (23-156)||(14954836-14954960)
chr4 (23-101)||(631397-631475)
chr4 (23-149)||(27533355-27533472)
chr4 (23-101)||(17048753-17048831)
chr4 (23-156)||(5757574-5757699)
chr4 (23-156)||(9555867-9555992)
chr4 (23-156)||(12487022-12487147)
chr4 (23-156)||(14758071-14758196)
chr4 (23-156)||(33741717-33741842)
chr4 (23-156)||(4561969-4562094)
chr4 (48-95)||(17807517-17807564)
chr4 (33-96)||(35812713-35812776)
chr4 (24-96)||(37018300-37018372)
chr4 (117-156)||(10712207-10712246)
chr4 (117-156)||(10925977-10926016)
chr4 (34-96)||(16997226-16997288)
chr4 (34-82)||(3484747-3484795)
chr4 (33-96)||(14548411-14548474)
chr4 (33-96)||(25090386-25090449)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (23-156)||(6535-6668)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-156)||(36633-36766)
scaffold0109 (34-82)||(1144-1192)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (23-156)||(160-294)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (23-156)||(11300-11432)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (23-156)||(36755-36888)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (26-157)||(51300-51431)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-125)||(190046-190148)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (23-156)||(20850-20985)
[»] scaffold0486 (2 HSPs)
scaffold0486 (35-156)||(9180-9302)
scaffold0486 (40-95)||(8117-8172)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-157)||(79869-80004)
scaffold0029 (23-156)||(66168-66292)
scaffold0029 (30-156)||(62259-62376)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (23-113)||(73963-74053)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (24-101)||(8134-8211)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-95)||(14756-14828)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (23-101)||(3115-3193)
scaffold0165 (23-101)||(7178-7256)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (23-104)||(241-322)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (23-101)||(8234-8312)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (23-101)||(25240-25318)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (23-156)||(11759-11884)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (23-156)||(33330-33455)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (23-156)||(67945-68070)
scaffold0061 (33-96)||(19694-19757)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (23-95)||(5743-5816)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (33-101)||(7141-7209)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-95)||(59363-59436)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (24-96)||(4329-4401)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (33-96)||(13994-14057)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (97-145)||(6371-6419)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (33-96)||(116562-116625)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (40-89)||(7050-7099)
scaffold0111 (40-89)||(14169-14218)
scaffold0111 (33-96)||(20091-20154)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (23-59)||(4513-4549)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (33-96)||(102353-102416)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (33-95)||(10650-10712)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (34-82)||(10609-10657)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18355679 - 18355545
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355679 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 18355580  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18355579 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattac 18355545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11224771 - 11224638
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11224771 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11224672  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11224671 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 11224638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11230583 - 11230450
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11230583 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11230484  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11230483 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 11230450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 24767912 - 24768045
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24767912 atcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 24768011  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24768012 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 24768045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11220185 - 11220052
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11220185 atcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11220086  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11220085 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 11220052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11228594 - 11228461
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11228594 atcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctaggaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11228495  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11228494 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 11228461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20911545 - 20911678
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20911545 atcatctattagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaaatatataatgttgac 20911644  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  20911645 taagatatcgctatgttgtttaagatattgatta 20911678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Original strand, 15237478 - 15237607
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  15237478 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattgat 15237577  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattg 152  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15237578 tatgatattgttatgttgtttaacatattg 15237607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 40724260 - 40724384
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  40724260 atcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 40724350  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40724351 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 40724384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 22108023 - 22108101
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22108023 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22108101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 19473329 - 19473453
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  19473329 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 19473419  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  19473420 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 19473453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10752646 - 10752564
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752646 tgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 10752564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11226604 - 11226546
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatga 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11226604 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagctatga 11226546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20295309 - 20295235
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20295309 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 20295235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Original strand, 33896167 - 33896221
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  33896167 ttgttgagttatcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 33896221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 156
Target Start/End: Original strand, 20911689 - 20911717
Alignment:
Q  128 tgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911689 tgttgttatgttgtttaagatattgatta 20911717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31344600 - 31344467
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31344600 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaactatataaagttgac 31344501  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31344500 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 31344467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1282850 - 1282717
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1282850 atcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 1282751  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1282750 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 1282717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9784472 - 9784339
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9784472 atcatctatgagttgttgagttttcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagtttatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 9784373  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
     |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  9784372 caagatgttgccatgttgtctatgatattgatta 9784339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 30345660 - 30345784
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  30345660 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 30345750  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  30345751 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 30345784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 41531649 - 41531721
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41531649 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 41531721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 24629123 - 24629248
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  24629123 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 24629213  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24629214 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 24629248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 27380076 - 27380201
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  27380076 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27380166  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27380167 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 27380201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 27384122 - 27384247
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  27384122 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27384212  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27384213 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 27384247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27601254 - 27601129
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  27601254 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 27601164  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27601163 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 27601129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 10102297 - 10102370
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10102297 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgtcgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 10102370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24648817 - 24648744
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24648817 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtacgatgt 24648744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24514982 - 24514919
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  24514982 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 24514919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36838967 - 36838904
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  36838967 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 36838904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 12902160 - 12902196
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12902160 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 12902196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17306242 - 17306187
Alignment:
Q  41 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  17306242 agttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 17306187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 28653758 - 28653821
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  28653758 agttgttgagttgtcttctatccacatgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 28653821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24367442 - 24367393
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24367442 agttgttgagctgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 24367393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 32215481 - 32215529
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32215481 gttgttgagttgtattctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 32215529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 208257 - 208391
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  208257 atcatctatgagttgtcgacttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 208356  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  208357 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattac 208391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 21828683 - 21828816
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21828683 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21828782  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21828783 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 21828816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21410387 - 21410254
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21410387 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21410288  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21410287 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 21410254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21804879 - 21804746
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21804879 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21804780  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21804779 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 21804746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Original strand, 14398498 - 14398623
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14398498 tgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacatatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgt 14398597  T
Q  131 tgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  14398598 tgctatgttgtttaagatattgatta 14398623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 18863314 - 18863447
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18863314 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgac 18863413  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  18863414 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 18863447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23913733 - 23913600
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23913733 atcatctatgagttgttaatttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 23913634  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23913633 taagatgttgctatgttgtctatgatattgatta 23913600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21386795 - 21386662
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||     
T  21386795 atcatctttgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacttataaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgat 21386696  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21386695 tataatgttatgatgttgtttaagatattgatta 21386662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 30940746 - 30940870
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  30940746 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 30940836  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  30940837 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 30940870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 44385290 - 44385418
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa-gaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||      | | ||||||     
T  44385290 atcatctatgtgttgttgagttgtcttctacccatgtgttattaaagggagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt------tgtcaagttgc 44385383  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44385384 ttatgatgttgttatgttgtttatgatattgatta 44385418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 21973225 - 21973298
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973225 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatacgatgt 21973298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 21977316 - 21977389
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977316 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatacgatgt 21977389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22111393 - 22111268
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  22111393 atcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22111303  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22111302 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 22111268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43251273 - 43251148
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         |||||||||||||| | |||||    
T  43251273 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 43251183  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  43251182 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 43251148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 15923992 - 15924064
Alignment:
Q  84 attatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15923992 attatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 15924064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5760172 - 5760109
Alignment:
Q  41 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5760172 agttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 5760109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37515206 - 37515140
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttat 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||    
T  37515206 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgtattgcttatgaagattatacgatgattat 37515140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 16413823 - 16413882
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  16413823 atcatccatgagttgttaagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 16413882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 42819188 - 42819251
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  42819188 agttgttgagttgtcttctatccacatgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 42819251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18833086 - 18833030
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  18833086 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgcagattata 18833030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 32121444 - 32121396
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32121444 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 32121396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 7519684 - 7519817
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7519684 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 7519783  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7519784 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 7519817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 13919139 - 13919272
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13919139 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 13919238  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13919239 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 13919272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15083633 - 15083500
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15083633 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 15083534  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15083533 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 15083500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39721703 - 39721570
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39721703 atcatccatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 39721604  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39721603 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 39721570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 2832841 - 2832974
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2832841 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 2832940  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2832941 taagatgttgctatgttgtttaaaatattgatta 2832974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 1859468 - 1859601
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1859468 atcatctacgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 1859567  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1859568 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 1859601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 12705303 - 12705436
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12705303 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 12705402  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12705403 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 12705436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 25927887 - 25928020
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25927887 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgac 25927986  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25927987 taagatgttgctatgttgtctatgatattgatta 25928020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 2530798 - 2530931
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  2530798 atcatctaagagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacccatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattataagatattgat 2530897  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2530898 tatgatgttgctatgttgtttaagatattgatta 2530931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26291834 - 26291701
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  26291834 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 26291735  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26291734 taagatgttgctatgttgtttaaggtgttgatta 26291701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18425122 - 18425032
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425122 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 18425032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20487258 - 20487134
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20487258 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatta---------tatgatgtgaattatatgatgttgac 20487168  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  20487167 taagatgttgctatgttatctatgatattgatta 20487134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 45170675 - 45170799
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  45170675 atcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 45170765  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  45170766 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 45170799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12714413 - 12714301
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgtt 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||||| || ||| |    
T  12714413 ttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgct 12714323  T
Q  135 atgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12714322 atgttgtttaagatattgatta 12714301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18301763 - 18301685
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18301763 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacacgatgttcatga 18301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 71411 - 71536
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  71411 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 71501  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  71502 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 71536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 75520 - 75645
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  75520 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 75610  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  75611 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 75645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12718130 - 12718005
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  12718130 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 12718040  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  12718039 ctaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 12718005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12723041 - 12722916
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  12723041 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 12722951  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  12722950 ctaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 12722916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 16907855 - 16907980
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  16907855 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 16907945  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16907946 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 16907980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18278865 - 18278740
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  18278865 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 18278775  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  18278774 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 18278740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18282828 - 18282703
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  18282828 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 18282738  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  18282737 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 18282703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32571 - 32446
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  32571 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 32481  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  32480 ctaaaatattgctacgttgtttaaaatattgatta 32446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16113703 - 16113578
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  16113703 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16113613  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16113612 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 16113578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16116856 - 16116731
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  16116856 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16116766  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16116765 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 16116731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32300810 - 32300747
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32300810 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtt 32300747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14257886 - 14257822
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttt 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  14257886 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgttt 14257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16585150 - 16585087
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  16585150 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16585087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 14183867 - 14183930
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  14183867 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 14183930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16579251 - 16579188
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  16579251 agttgttgagttgtcttctacccaggtgttgttatcgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16579188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 16586411 - 16586474
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  16586411 agttgttgagttgtcttctacccaggtgttgttatcgaagtgctgatgaagattatatgatgtt 16586474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20585198 - 20585135
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  20585198 agttgttgagttgtcttctatccacatgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 20585135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 14933150 - 14933199
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14933150 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 14933199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 15082374 - 15082423
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15082374 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttattaatgaagtacttatgaa 15082423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 15356585 - 15356634
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15356585 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 15356634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 15360699 - 15360748
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15360699 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 15360748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24274790 - 24274742
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24274790 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 24274742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23414367 - 23414234
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23414367 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 23414268  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23414267 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 23414234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 22074630 - 22074763
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22074630 atcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 22074729  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22074730 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 22074763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1643972 - 1643839
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  1643972 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 1643873  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1643872 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 1643839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 31478628 - 31478761
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  31478628 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 31478727  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31478728 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 31478761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2076934 - 2076801
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  2076934 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgcatgatgtttatgatgtgaattttatgatgttgac 2076835  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  2076834 taagatgttgctatgttgtctatgatattgatta 2076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16623816 - 16623682
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  16623816 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaaaaagtacctacgaaaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 16623717  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16623716 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgattac 16623682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27556138 - 27556064
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556138 atcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttt 27556064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22948578 - 22948506
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22948578 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 22948506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22952534 - 22952462
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22952534 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 22952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23871022 - 23870950
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23871022 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 23870950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23874978 - 23874906
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23874978 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 23874906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14471675 - 14471551
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| |  |||||    
T  14471675 atcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatattgac 14471585  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14471584 taagatgatgctatgttgtttaacatattgatta 14471551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 18918035 - 18918144
Alignment:
Q  38 tcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatg 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  18918035 tcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatg 18918125  T
Q  138 ttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||| || |||||||    
T  18918126 ttgtttaacatgttgatta 18918144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11566324 - 11566199
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  11566324 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11566234  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11566233 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 11566199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 12619486 - 12619611
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  12619486 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 12619576  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12619577 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 12619611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16759699 - 16759574
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  16759699 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16759609  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16759608 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 16759574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22862408 - 22862283
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  22862408 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22862318  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22862317 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 22862283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23394530 - 23394405
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  23394530 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 23394440  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  23394439 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 23394405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8243295 - 8243170
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||| |||||||||||||| | |||||    
T  8243295 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttga 8243205  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8243204 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 8243170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 19656817 - 19656891
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656817 atgagttgttgagttgtcttctatctatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 19656891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23989382 - 23989257
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  23989382 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctgcgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 23989292  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  23989291 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 23989257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17742813 - 17742690
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt--ttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgt 130  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||    | ||||| ||||| || |||||    
T  17742813 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgttattatgatgt--tgtttataatgttgattatgatgt 17742716  T
Q  131 tgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  17742715 tgttatgttgtttatgatattgatta 17742690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 19774141 - 19774204
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19774141 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 19774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19870021 - 19869926
Alignment:
Q  52 acccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaagatatt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||| || ||    
T  19870021 acccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgtt 19869931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22805426 - 22805370
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  22805426 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 22805370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20182374 - 20182303
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20182374 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaaatgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 20182303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Original strand, 22153617 - 22153688
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22153617 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaaatgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 22153688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Original strand, 15706050 - 15706106
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  15706050 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagactata 15706106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27556060 - 27556021
Alignment:
Q  117 gttgactaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27556060 gttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 27556021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 27126664 - 27126720
Alignment:
Q  40 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  27126664 gagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 27126720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7825441 - 7825378
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  7825441 agttgttgagttgtcttctatccacgagttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 7825378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23992128 - 23992080
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23992128 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 23992080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14665115 - 14664982
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14665115 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 14665016  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14665015 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 14664982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14668271 - 14668138
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14668271 atcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 14668172  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14668171 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 14668138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15464564 - 15464431
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15464564 atcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 15464465  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15464464 taaaatattgctatgttgtttaagatattgatta 15464431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19775032 - 19774899
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  19775032 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 19774933  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19774932 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 19774899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 4589557 - 4589690
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  4589557 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttcac 4589656  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4589657 taagatgttgctatgttgtttaagataatgatta 4589690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 8489828 - 8489961
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||     
T  8489828 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgat 8489927  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8489928 tataatgttatgatgttgtttaagatattgatta 8489961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12339165 - 12339044
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12339165 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacc-atgtgttgttaaagaagtacctatgaagattttacgatgtttatgatgtgaattatataatgttgac 12339067  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaa 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  12339066 taagatgtttctatgttgtttaa 12339044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14670519 - 14670394
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgt 130  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  14670519 tgagttgttgagttgtcttcaacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgt 14670420  T
Q  131 tgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  14670419 tgctatgttgtttatgatattgatta 14670394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14682039 - 14681916
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttg 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14682039 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttg 14681940  T
Q  133 ttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
     |||||||| || |||||||||||    
T  14681939 ctatgttgtctatgatattgatta 14681916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Original strand, 17317772 - 17317901
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17317772 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtaccaacgaatattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 17317871  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattg 152  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17317872 aaagatgttgctatgttgtttaacatattg 17317901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 37440281 - 37440405
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  37440281 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 37440371  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37440372 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 37440405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 16750985 - 16751075
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16750985 atcatctatgagttgttaagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatgatgtgaattatat 16751075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15964409 - 15964285
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||    
T  15964409 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15964319  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15964318 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 15964285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15968333 - 15968209
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||    
T  15968333 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15968243  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15968242 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 15968209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15972257 - 15972133
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||    
T  15972257 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15972167  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15972166 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 15972133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 4108043 - 4108168
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  4108043 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4108133  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4108134 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgatta 4108168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 4111895 - 4112020
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  4111895 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4111985  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4111986 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgatta 4112020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16795973 - 16795895
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16795973 atcatctatgagttgctgagttgtattctactcatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 16795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 101
Target Start/End: Original strand, 12852972 - 12853032
Alignment:
Q  41 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12852972 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 12853032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5220573 - 5220484
Alignment:
Q  58 gtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5220573 gtgttgttaaagaagtacctatgaagattata---------tgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 5220484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11069533 - 11069408
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  11069533 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11069443  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11069442 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 11069408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14498790 - 14498665
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  14498790 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 14498700  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14498699 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 14498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22321129 - 22321004
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  22321129 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22321039  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22321038 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 22321004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22336184 - 22336059
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  22336184 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22336094  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22336093 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 22336059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 27410288 - 27410413
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  27410288 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27410378  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27410379 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 27410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28949187 - 28949062
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  28949187 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 28949097  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    | || || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28949096 ccaaaattttgctatgttgtttaagatgttgatta 28949062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7109161 - 7109036
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  7109161 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 7109071  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  7109070 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 7109036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7113096 - 7112971
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  7113096 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 7113006  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  7113005 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 7112971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14441049 - 14440975
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441049 atgagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 14440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30065445 - 30065320
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  30065445 atcatccatgagtttgtcgagtggtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 30065355  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  30065354 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 30065320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55022330 - 55022205
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         |||||||||||||| | |||||    
T  55022330 atcatccatgagtttgtcgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 55022240  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  55022239 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 55022205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 11166173 - 11166246
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11166173 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacaaagattatacgatgt 11166246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15616839 - 15616766
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15616839 atcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 15616766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 10543097 - 10543158
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  10543097 ttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 10543158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Original strand, 18700954 - 18701016
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  18700954 gttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgctcatgaagattatatgatgtt 18701016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 43890295 - 43890356
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43890295 ttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtttatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 43890356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 2842742 - 2842805
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  2842742 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 2842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35353366 - 35353303
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  35353366 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 35353303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Original strand, 11301027 - 11301077
Alignment:
Q  95 tttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11301027 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgctgtttaa 11301077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11854233 - 11854183
Alignment:
Q  95 tttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11854233 tttatgatgagaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaa 11854183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Original strand, 19884859 - 19884921
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19884859 gttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 19884921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 14067315 - 14067352
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtg 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14067315 atcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtg 14067352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13543680 - 13543632
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13543680 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 13543632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33796981 - 33796847
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33796981 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacccatgtgttattaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 33796882  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33796881 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattac 33796847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 39244563 - 39244697
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  39244563 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 39244662  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  39244663 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgattac 39244697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 39248118 - 39248252
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  39248118 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 39248217  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  39248218 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgattac 39248252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20229651 - 20229784
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  20229651 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccgcctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 20229750  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20229751 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 20229784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21406818 - 21406685
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21406818 atcatctatgagctgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21406719  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||    
T  21406718 taagaggttgctatgttgtttaacatgttgatta 21406685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Original strand, 41781942 - 41782044
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41781942 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 41782041  T
Q  123 taa 125  Q
    |||    
T  41782042 taa 41782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 41388663 - 41388753
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41388663 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatggtgtgaattatat 41388753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 1925798 - 1925922
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  1925798 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 1925888  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  1925889 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 1925922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20924812 - 20924936
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  20924812 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 20924902  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  20924903 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 20924936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48602943 - 48602865
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48602943 atcatctatgagttgctgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 48602865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 22131524 - 22131602
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22131524 atcatctatgagttgttgagctgtcatctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22131602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1010185 - 1010060
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  1010185 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 1010095  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  1010094 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 1010060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 16376102 - 16376176
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16376102 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 16376176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52639003 - 52638930
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639003 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 52638930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23967399 - 23967335
Alignment:
Q  40 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967399 gagttgtcttctacatatgtgttgttaatgaagtacttatgaagattatacgatgtttatgatgt 23967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20241624 - 20241555
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgat 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20241624 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaggattatatgatgtttatgat 20241555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42911813 - 42911750
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  42911813 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 42911750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 48519910 - 48519847
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  48519910 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 48519847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Original strand, 4597107 - 4597163
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4597107 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 4597163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 14238784 - 14238832
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14238784 gttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 14238832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 10409 - 10542
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10409 atcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 10508  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10509 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20160515 - 20160648
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20160515 atcatctatgaattgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20160614  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20160615 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 20160648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20157839 - 20157972
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20157839 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaataagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20157938  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20157939 tgagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 20157972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20163293 - 20163426
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20163293 atcatctatgagttgtcgggttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20163392  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20163393 taagatgtttctatgttgtttaagatattgatta 20163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15224504 - 15224414
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224504 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 15224414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10712317 - 10712244
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712317 atcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10712244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10926087 - 10926014
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926087 atcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25689364 - 25689292
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25689364 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 25689292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 14954836 - 14954960
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  14954836 atcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 14954926  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14954927 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 14954960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 631397 - 631475
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  631397 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27533472 - 27533355
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | ||||||    
T  27533472 atcatccatgagttgtcgagttgcgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 27533382  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagata 149  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27533381 taaaatgttgctatgttgtttaagata 27533355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 17048753 - 17048831
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17048753 atcatctatgagttgctgagttgtattatacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 5757574 - 5757699
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  5757574 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 5757664  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  5757665 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 5757699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9555992 - 9555867
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  9555992 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 9555902  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  9555901 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 9555867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12487147 - 12487022
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  12487147 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 12487057  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12487056 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 12487022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 14758071 - 14758196
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  14758071 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 14758161  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14758162 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 14758196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33741842 - 33741717
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  33741842 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 33741752  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  33741751 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 33741717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 4561969 - 4562094
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  4561969 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaggattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4562059  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  4562060 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 4562094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17807564 - 17807517
Alignment:
Q  48 ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17807564 ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattttacgatgt 17807517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 35812713 - 35812776
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  35812713 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 35812776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37018372 - 37018300
Alignment:
Q  24 tcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37018372 tcatccataagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttcatgaagtacttatgaagattatatgatgtt 37018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10712246 - 10712207
Alignment:
Q  117 gttgactaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10712246 gttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 10712207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10926016 - 10925977
Alignment:
Q  117 gttgactaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10926016 gttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 10925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16997288 - 16997226
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  16997288 gttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16997226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3484795 - 3484747
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3484795 gttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 3484747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14548474 - 14548411
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  14548474 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaaaattatatgatgtt 14548411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 25090449 - 25090386
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25090449 agttgttgagttgtcttctatccacttgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 25090386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6668
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6535 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 6634  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6635 taagatgttgctatgttgtctatgatattgatta 6668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 36633 - 36766
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  36633 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 36732  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36733 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 36766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1192
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1144 gttgttgagttgtgttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 160 - 294
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  160 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttga 259  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  260 ctaagatgttgctgtgttgtttaagatattgatta 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11432 - 11300
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11432 atcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtcttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11333  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11332 taagatattgctatg-tgtttaagatattgatta 11300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 36755 - 36888
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  36755 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgac 36854  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  36855 taagatgttgctatgttgtctatgatattgatta 36888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Original strand, 51300 - 51431
Alignment:
Q  26 atctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaa 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  51300 atctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaa 51399  T
Q  126 gatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  51400 gatgttgctatgttgtttaacatgttgattac 51431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Original strand, 190046 - 190148
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  190046 atcatctatgagttgtcgagttgtcttcttcccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 190145  T
Q  123 taa 125  Q
    |||    
T  190146 taa 190148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 20850 - 20985
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa--gaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttg 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  20850 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttg 20949  T
Q  121 actaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20950 actaagatgttgctatgttgtatatgatattgatta 20985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9302 - 9180
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaaga-ttatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgt 133  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  9302 ttgtcgagctgtcttatacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgc 9203  T
Q  134 tatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9202 tatgttgtttaagatattgatta 9180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8172 - 8117
Alignment:
Q  40 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||| |||||    
T  8172 gagttgtcttctacccatgtgttgtttatggagtgcttatgaagattatatgatgt 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 80004 - 79869
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  80004 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacctatgtgttattaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatggtgttga 79905  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgattac 157  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  79904 ctaagatgttgctatgtcgtttaacatgttgattac 79869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 66168 - 66292
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||         |||||||||||||| | ||||||    
T  66168 atcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 66258  T
Q  123 taagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  66259 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 66292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 62259 - 62376
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttgactaagatg 129  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  62259 atgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatg 62349  T
Q  130 ttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||    
T  62350 ttgctatgttgtttaacatgttgatta 62376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 73963 - 74053
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  73963 atcatctaagagttgtcgagttgtcttctacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttaagatgtgaattatat 74053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8211
Alignment:
Q  24 tcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8134 tcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 14756 - 14828
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14756 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattttacgatgt 14828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 3115
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3193 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7256 - 7178
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7256 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 241
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  322 atcatctatgagttgctgagttttattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 8234 - 8312
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8234 atcatctttgagttgctaagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 25240 - 25318
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25240 atcatctacgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 25318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11884 - 11759
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| | |||||    
T  11884 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11794  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11793 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 33330 - 33455
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  33330 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 33420  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  33421 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 33455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 67945 - 68070
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatataaagttga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| | |||||    
T  67945 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 68035  T
Q  122 ctaagatgttgttatgttgtttaagatattgatta 156  Q
    |||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  68036 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatta 68070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 19694 - 19757
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  19694 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttgtgaagattatatgatgtt 19757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 5743 - 5816
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5743 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 5816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7209 - 7141
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7209 agttgttgagttgtctgctacccctgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 59363 - 59436
Alignment:
Q  23 atcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  59363 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgatgattatacgatgt 59436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4401 - 4329
Alignment:
Q  24 tcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4401 tcatccatgagtcgttaagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14057
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  13994 agttgttgagttatcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 14057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6419 - 6371
Alignment:
Q  97 tatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgttatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6419 tatgatgtgaattatataatgctgactaagatgttgctatgttgtttaa 6371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 116625 - 116562
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||||    
T  116625 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgtttttgaagattatatgatgtt 116562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7099 - 7050
Alignment:
Q  40 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7099 gagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 7050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14218 - 14169
Alignment:
Q  40 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  14218 gagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 14169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 20091 - 20154
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  20091 agttgttgagttgtcttctatccacgtgtcgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 20154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4549
Alignment:
Q  23 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4513 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 102353 - 102416
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  102353 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaatattatatgatgtt 102416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10712 - 10650
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  10712 agttgttgagttatcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgt 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10657 - 10609
Alignment:
Q  34 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 82  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10657 gttgttgagttgtgttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 10609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University