View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0653_low_13 (Length: 489)

Name: NF0653_low_13
Description: NF0653
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0653_low_13
NF0653_low_13
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (91-480)||(32722-33110)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (91-480)||(81702-82090)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (91-480)||(28853507-28853895)
chr8 (91-480)||(6608444-6608842)
chr8 (109-480)||(17794971-17795341)
chr8 (91-480)||(45135097-45135495)
chr8 (175-480)||(17614559-17614864)
chr8 (200-480)||(22145561-22145838)
chr8 (161-403)||(7301310-7301550)
chr8 (277-480)||(24707982-24708186)
chr8 (200-480)||(22059565-22059830)
chr8 (90-302)||(17614513-17614724)
chr8 (91-343)||(7301487-7301738)
chr8 (109-338)||(19881726-19881955)
chr8 (109-304)||(22145694-22145891)
chr8 (110-340)||(44431492-44431723)
chr8 (166-342)||(7301448-7301623)
chr8 (101-339)||(44431562-44431800)
chr8 (109-346)||(19881766-19882003)
chr8 (109-263)||(21415544-21415698)
chr8 (101-302)||(7301372-7301571)
chr8 (109-261)||(363614-363767)
chr8 (188-345)||(22145731-22145891)
chr8 (169-342)||(19881747-19881921)
chr8 (161-302)||(21415544-21415685)
chr8 (109-302)||(43111909-43112100)
chr8 (161-341)||(43111922-43112100)
chr8 (109-302)||(19881845-19882038)
chr8 (161-343)||(44431583-44431764)
chr8 (109-306)||(22059686-22059883)
chr8 (109-263)||(20459875-20460028)
chr8 (90-234)||(44523193-44523338)
chr8 (109-265)||(32949543-32949698)
chr8 (101-300)||(44431640-44431840)
chr8 (200-397)||(22521830-22522031)
chr8 (188-346)||(21415539-21415698)
chr8 (227-346)||(44523199-44523319)
chr8 (200-410)||(15267131-15267344)
chr8 (109-265)||(362180-362336)
chr8 (98-220)||(38186102-38186225)
chr8 (227-342)||(17614532-17614647)
chr8 (109-220)||(21861647-21861758)
chr8 (188-346)||(32949543-32949701)
chr8 (254-411)||(362111-362270)
chr8 (228-341)||(44431492-44431606)
chr8 (227-339)||(363614-363727)
chr8 (129-302)||(22434599-22434778)
chr8 (188-306)||(44523200-44523319)
chr8 (188-410)||(363614-363839)
chr8 (227-345)||(22059764-22059883)
chr8 (188-345)||(43111909-43112066)
chr8 (162-306)||(362178-362322)
chr8 (188-346)||(20459875-20460033)
chr8 (227-338)||(21861647-21861758)
chr8 (161-306)||(22521882-22522031)
chr8 (166-341)||(22434599-22434780)
chr8 (277-346)||(15004071-15004140)
chr8 (161-306)||(15267131-15267280)
chr8 (240-410)||(44431739-44431912)
chr8 (200-274)||(44523193-44523266)
chr8 (129-262)||(20385147-20385284)
chr8 (227-346)||(19881726-19881846)
chr8 (227-338)||(38186102-38186214)
chr8 (161-260)||(21861647-21861745)
chr8 (109-195)||(20454263-20454348)
chr8 (227-341)||(15267118-15267237)
chr8 (245-346)||(22434676-22434780)
chr8 (277-346)||(22145810-22145880)
chr8 (205-346)||(22434635-22434780)
chr8 (305-346)||(22522003-22522044)
chr8 (109-205)||(44523183-44523279)
chr8 (245-394)||(20012146-20012297)
chr8 (227-341)||(22521925-22522044)
chr8 (161-249)||(38186114-38186201)
chr8 (109-183)||(15004830-15004905)
chr8 (245-339)||(23647586-23647681)
chr8 (305-346)||(15267118-15267159)
chr8 (109-261)||(23647586-23647741)
chr8 (90-186)||(24708120-24708216)
chr8 (277-340)||(15004830-15004894)
chr8 (277-346)||(22521961-22522033)
chr8 (278-346)||(15267130-15267201)
chr8 (429-480)||(363843-363896)
chr8 (109-261)||(20012202-20012357)
chr8 (200-265)||(15004074-15004138)
chr8 (279-319)||(20454315-20454355)
chr8 (227-345)||(362217-362336)
chr8 (188-262)||(15004830-15004905)
chr8 (202-261)||(21861525-21861584)
chr8 (101-182)||(363685-363767)
chr8 (188-265)||(24708120-24708197)
chr8 (277-346)||(43111920-43111989)
chr8 (429-480)||(44431916-44431969)
chr8 (447-480)||(7301251-7301284)
chr8 (109-146)||(17272816-17272853)
chr8 (188-237)||(20454303-20454351)
chr8 (361-394)||(24321567-24321600)
chr8 (239-306)||(15004072-15004139)
chr8 (166-240)||(22616614-22616690)
chr8 (360-407)||(43112124-43112172)
[»] chr4 (116 HSPs)
chr4 (109-480)||(33848481-33848851)
chr4 (91-480)||(4170557-4170955)
chr4 (91-480)||(14698249-14698647)
chr4 (136-480)||(31117209-31117550)
chr4 (161-480)||(55502904-55503222)
chr4 (109-480)||(16278282-16278653)
chr4 (200-480)||(16359168-16359449)
chr4 (90-480)||(41791201-41791601)
chr4 (188-480)||(15280257-15280551)
chr4 (188-480)||(28382475-28382769)
chr4 (207-480)||(286760-287035)
chr4 (112-426)||(15242333-15242648)
chr4 (180-480)||(10313358-10313660)
chr4 (227-480)||(47127000-47127256)
chr4 (90-426)||(6511376-6511713)
chr4 (109-306)||(14942621-14942817)
chr4 (227-472)||(53387899-53388149)
chr4 (91-306)||(55503039-55503253)
chr4 (109-342)||(16278536-16278771)
chr4 (109-346)||(27027547-27027792)
chr4 (109-306)||(16359115-16359313)
chr4 (109-341)||(56116105-56116338)
chr4 (90-265)||(10313347-10313521)
chr4 (101-410)||(56115837-56116149)
chr4 (109-346)||(15989835-15990076)
chr4 (200-441)||(9388293-9388520)
chr4 (122-302)||(15989930-15990111)
chr4 (124-339)||(56115949-56116166)
chr4 (101-339)||(56116029-56116267)
chr4 (170-410)||(14942555-14942795)
chr4 (161-343)||(56116065-56116246)
chr4 (90-265)||(15280395-15280570)
chr4 (109-345)||(15989757-15989997)
chr4 (161-343)||(56116143-56116325)
chr4 (109-265)||(28382475-28382631)
chr4 (109-268)||(286740-286900)
chr4 (112-263)||(15989960-15990111)
chr4 (187-394)||(15448344-15448550)
chr4 (98-222)||(33684861-33684985)
chr4 (161-346)||(15989930-15990116)
chr4 (109-220)||(24047832-24047943)
chr4 (109-246)||(9388398-9388533)
chr4 (177-303)||(15449758-15449882)
chr4 (122-306)||(31117344-31117525)
chr4 (109-228)||(47127135-47127256)
chr4 (109-223)||(53388033-53388149)
chr4 (227-346)||(21190072-21190191)
chr4 (200-306)||(21190073-21190178)
chr4 (227-345)||(33684856-33684974)
chr4 (168-304)||(286760-286897)
chr4 (109-222)||(21190078-21190191)
chr4 (227-346)||(13881366-13881486)
chr4 (108-223)||(16278421-16278535)
chr4 (188-302)||(53388033-53388149)
chr4 (188-346)||(13877707-13877858)
chr4 (110-225)||(15448396-15448509)
chr4 (175-265)||(3336976-3337066)
chr4 (101-265)||(15242417-15242580)
chr4 (188-304)||(47127138-47127256)
chr4 (133-225)||(3336973-3337066)
chr4 (277-346)||(20899754-20899823)
chr4 (161-262)||(33684861-33684961)
chr4 (240-342)||(15449758-15449860)
chr4 (227-338)||(24047832-24047943)
chr4 (168-260)||(24047832-24047923)
chr4 (227-345)||(9388416-9388533)
chr4 (206-306)||(13881385-13881485)
chr4 (254-345)||(3336976-3337068)
chr4 (161-225)||(3337103-3337167)
chr4 (188-263)||(20899759-20899834)
chr4 (200-268)||(47127135-47127203)
chr4 (227-306)||(3337090-3337169)
chr4 (149-306)||(15448394-15448549)
chr4 (256-345)||(15449793-15449882)
chr4 (109-186)||(3337090-3337167)
chr4 (149-264)||(15449758-15449872)
chr4 (240-310)||(3337001-3337072)
chr4 (109-225)||(13881366-13881483)
chr4 (277-346)||(16359126-16359196)
chr4 (91-141)||(31131813-31131863)
chr4 (166-264)||(8710551-8710652)
chr4 (109-184)||(15990035-15990111)
chr4 (227-302)||(20899759-20899834)
chr4 (109-263)||(13877707-13877853)
chr4 (166-265)||(18079574-18079676)
chr4 (109-155)||(18221103-18221149)
chr4 (166-244)||(4616084-4616164)
chr4 (109-184)||(20899759-20899834)
chr4 (267-410)||(3337090-3337235)
chr4 (295-346)||(15449832-15449882)
chr4 (129-185)||(10704514-10704572)
chr4 (129-185)||(10918284-10918342)
chr4 (254-340)||(15416935-15417025)
chr4 (429-480)||(56115780-56115833)
chr4 (245-346)||(18079533-18079638)
chr4 (304-345)||(20899794-20899835)
chr4 (109-200)||(3336989-3337079)
chr4 (166-224)||(10704512-10704572)
chr4 (166-224)||(10918282-10918342)
chr4 (166-305)||(18079533-18079677)
chr4 (274-342)||(10704501-10704572)
chr4 (274-342)||(10918271-10918342)
chr4 (200-394)||(15075301-15075498)
chr4 (161-223)||(20899759-20899821)
chr4 (304-342)||(13877706-13877744)
chr4 (304-342)||(21190154-21190192)
chr4 (274-340)||(4616106-4616175)
chr4 (360-405)||(13887713-13887758)
chr4 (361-394)||(16147730-16147763)
chr4 (245-342)||(32489754-32489854)
chr4 (129-195)||(8710553-8710621)
chr4 (361-397)||(14048379-14048415)
chr4 (362-410)||(15318099-15318146)
chr4 (166-240)||(15416917-15416993)
chr4 (287-339)||(24047750-24047802)
chr4 (166-224)||(32489794-32489854)
[»] chr7 (141 HSPs)
chr7 (91-480)||(21743475-21743873)
chr7 (161-480)||(124348-124666)
chr7 (109-480)||(13395639-13396013)
chr7 (90-480)||(38827779-38828176)
chr7 (90-480)||(4993040-4993430)
chr7 (109-480)||(48784887-48785258)
chr7 (163-480)||(8775968-8776292)
chr7 (188-480)||(13733707-13733995)
chr7 (102-480)||(16005961-16006347)
chr7 (109-345)||(13849916-13850153)
chr7 (109-345)||(48784847-48785083)
chr7 (91-343)||(8775855-8776107)
chr7 (200-472)||(17505966-17506241)
chr7 (200-472)||(17546973-17547248)
chr7 (91-306)||(124483-124697)
chr7 (109-411)||(16573090-16573392)
chr7 (109-411)||(16592270-16592572)
chr7 (90-342)||(16005870-16006122)
chr7 (245-411)||(15725455-15725622)
chr7 (109-346)||(14189273-14189508)
chr7 (161-346)||(13849955-13850140)
chr7 (163-342)||(13255644-13255820)
chr7 (161-345)||(8775886-8776071)
chr7 (109-302)||(14192072-14192263)
chr7 (90-265)||(13733839-13734014)
chr7 (108-302)||(8775951-8776144)
chr7 (109-411)||(13849811-13850113)
chr7 (227-403)||(35365939-35366113)
chr7 (109-302)||(17506100-17506294)
chr7 (109-302)||(17546920-17547114)
chr7 (161-346)||(14192067-14192250)
chr7 (129-346)||(7507533-7507759)
chr7 (162-300)||(21065462-21065600)
chr7 (109-220)||(13255430-13255541)
chr7 (202-342)||(13255604-13255743)
chr7 (109-196)||(711009-711096)
chr7 (109-216)||(47976002-47976108)
chr7 (109-223)||(16458907-16459021)
chr7 (200-306)||(48743296-48743401)
chr7 (228-346)||(48743284-48743402)
chr7 (161-299)||(16458920-16459056)
chr7 (159-339)||(11660775-11660956)
chr7 (149-261)||(21065462-21065575)
chr7 (98-265)||(48743233-48743399)
chr7 (227-338)||(13255430-13255541)
chr7 (199-397)||(21519211-21519411)
chr7 (109-346)||(40555751-40555998)
chr7 (124-308)||(13255644-13255825)
chr7 (209-306)||(709606-709702)
chr7 (240-339)||(21065462-21065563)
chr7 (202-345)||(13255644-13255784)
chr7 (227-338)||(11660764-11660874)
chr7 (227-341)||(14192149-14192263)
chr7 (198-342)||(709647-709779)
chr7 (129-264)||(7507496-7507636)
chr7 (109-220)||(11660764-11660874)
chr7 (109-224)||(13255706-13255820)
chr7 (227-338)||(17506182-17506294)
chr7 (227-338)||(17546920-17547032)
chr7 (162-225)||(709608-709670)
chr7 (161-260)||(13255443-13255541)
chr7 (159-346)||(709605-709779)
chr7 (200-338)||(16458920-16459056)
chr7 (199-397)||(15689878-15690081)
chr7 (199-397)||(15697471-15697674)
chr7 (166-346)||(7507574-7507761)
chr7 (241-339)||(21065502-21065600)
chr7 (109-186)||(709608-709684)
chr7 (166-265)||(15725455-15725555)
chr7 (109-225)||(35365939-35366054)
chr7 (129-225)||(15731802-15731902)
chr7 (227-341)||(15689866-15689984)
chr7 (227-341)||(15697459-15697577)
chr7 (254-411)||(15731733-15731895)
chr7 (267-339)||(21519348-21519423)
chr7 (161-234)||(711010-711083)
chr7 (166-264)||(12202048-12202149)
chr7 (129-264)||(4324975-4325115)
chr7 (109-274)||(22122626-22122797)
chr7 (255-341)||(16458935-16459021)
chr7 (109-155)||(13407740-13407786)
chr7 (245-346)||(12202085-12202189)
chr7 (166-342)||(7507496-7507679)
chr7 (160-223)||(15689878-15689944)
chr7 (160-223)||(15697471-15697537)
chr7 (280-343)||(21065538-21065600)
chr7 (227-338)||(21519309-21519423)
chr7 (208-342)||(22122677-22122816)
chr7 (208-342)||(40555878-40556017)
chr7 (190-225)||(47975966-47976001)
chr7 (133-342)||(4324897-4325115)
chr7 (429-480)||(21065333-21065386)
chr7 (429-480)||(35366118-35366171)
chr7 (166-264)||(8757395-8757496)
chr7 (166-264)||(12208662-12208763)
chr7 (98-155)||(13865424-13865481)
chr7 (167-265)||(15731802-15731903)
chr7 (305-338)||(42041338-42041371)
chr7 (227-303)||(711020-711096)
chr7 (305-345)||(21519383-21519423)
chr7 (279-342)||(11660777-11660839)
chr7 (268-311)||(13407835-13407878)
chr7 (268-311)||(13865332-13865375)
chr7 (206-306)||(15731800-15731903)
chr7 (200-339)||(16668543-16668685)
chr7 (200-339)||(17642913-17643055)
chr7 (166-239)||(39995836-39995911)
chr7 (151-186)||(47975966-47976001)
chr7 (277-342)||(711020-711085)
chr7 (205-342)||(12202048-12202189)
chr7 (227-261)||(14038580-14038614)
chr7 (305-339)||(14038580-14038614)
chr7 (227-261)||(14348610-14348644)
chr7 (305-339)||(14348610-14348644)
chr7 (277-346)||(16458918-16458987)
chr7 (305-339)||(16668664-16668698)
chr7 (227-261)||(16668664-16668698)
chr7 (277-342)||(17506217-17506283)
chr7 (277-342)||(17546931-17546997)
chr7 (305-339)||(17643034-17643068)
chr7 (227-261)||(17643034-17643068)
chr7 (101-182)||(21065462-21065544)
chr7 (361-394)||(2464491-2464524)
chr7 (361-394)||(2966110-2966143)
chr7 (361-394)||(3858321-3858354)
chr7 (166-264)||(7529106-7529207)
chr7 (245-342)||(8757395-8757496)
chr7 (361-394)||(10897149-10897182)
chr7 (245-346)||(12208699-12208803)
chr7 (305-346)||(15689866-15689907)
chr7 (305-346)||(15697459-15697500)
chr7 (361-394)||(16090208-16090241)
chr7 (227-260)||(17065656-17065689)
chr7 (305-338)||(17065656-17065689)
chr7 (361-394)||(29182008-29182041)
chr7 (208-261)||(41783099-41783152)
chr7 (109-141)||(12757143-12757175)
chr7 (109-181)||(16458986-16459056)
chr7 (166-260)||(21519270-21519364)
chr7 (284-346)||(39995847-39995911)
chr7 (318-346)||(47975963-47975991)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (109-480)||(23339343-23339713)
chr2 (161-480)||(31755563-31755881)
chr2 (161-480)||(24504305-24504632)
chr2 (90-480)||(21239297-21239696)
chr2 (90-480)||(21241847-21242246)
chr2 (91-343)||(31503118-31503370)
chr2 (91-343)||(31505684-31505936)
chr2 (122-403)||(31503188-31503470)
chr2 (122-403)||(31505754-31506036)
chr2 (188-480)||(44620584-44620873)
chr2 (227-480)||(41684937-41685193)
chr2 (90-302)||(25035944-25036157)
chr2 (91-306)||(31755532-31755746)
chr2 (99-306)||(24504282-24504488)
chr2 (109-300)||(28348691-28348882)
chr2 (161-339)||(28348704-28348882)
chr2 (227-480)||(20591276-20591539)
chr2 (109-268)||(28352516-28352674)
chr2 (109-225)||(23374883-23374999)
chr2 (109-268)||(44620584-44620743)
chr2 (277-403)||(12628122-12628249)
chr2 (200-411)||(24274168-24274379)
chr2 (200-341)||(25035944-25036085)
chr2 (188-343)||(25035982-25036138)
chr2 (227-411)||(23374883-23375068)
chr2 (109-228)||(41685072-41685193)
chr2 (161-304)||(28352529-28352671)
chr2 (166-342)||(31518252-31518435)
chr2 (110-221)||(10040234-10040345)
chr2 (161-306)||(24274235-24274379)
chr2 (129-342)||(31518254-31518476)
chr2 (90-186)||(12628182-12628279)
chr2 (188-343)||(28348691-28348846)
chr2 (101-221)||(28348762-28348882)
chr2 (161-339)||(10040152-10040333)
chr2 (216-345)||(24274273-24274403)
chr2 (188-304)||(41685075-41685193)
chr2 (277-346)||(22109449-22109518)
chr2 (188-343)||(28352516-28352671)
chr2 (109-181)||(24275709-24275781)
chr2 (200-410)||(22840930-22841143)
chr2 (227-345)||(28348691-28348810)
chr2 (228-339)||(10040234-10040345)
chr2 (200-268)||(41685072-41685140)
chr2 (227-345)||(28352516-28352635)
chr2 (109-223)||(20591424-20591539)
chr2 (245-346)||(31518252-31518357)
chr2 (245-346)||(23085339-23085442)
chr2 (205-346)||(23085339-23085483)
chr2 (166-264)||(25651228-25651329)
chr2 (161-306)||(22840930-22841079)
chr2 (188-265)||(12628182-12628260)
chr2 (129-273)||(21903105-21903251)
chr2 (188-265)||(22109438-22109515)
chr2 (166-265)||(23085379-23085480)
chr2 (166-264)||(20353406-20353507)
chr2 (166-306)||(23085339-23085482)
chr2 (284-346)||(21903182-21903246)
chr2 (129-244)||(31518418-31518537)
chr2 (274-346)||(31518241-31518316)
chr2 (417-480)||(12628064-12628129)
chr2 (109-186)||(22109438-22109515)
chr2 (109-265)||(24274237-24274392)
chr2 (369-410)||(28348917-28348958)
chr2 (188-302)||(20591424-20591539)
chr2 (227-274)||(23148580-23148627)
chr2 (227-274)||(23560370-23560417)
chr2 (284-341)||(25651228-25651287)
chr2 (227-273)||(22840917-22840963)
chr2 (101-186)||(31503324-31503410)
chr2 (101-186)||(31505890-31505976)
chr2 (304-345)||(22109437-22109478)
chr2 (305-346)||(22840917-22840958)
chr2 (305-342)||(23148580-23148617)
chr2 (305-342)||(23560370-23560407)
chr2 (167-240)||(24160247-24160323)
chr2 (254-346)||(21903112-21903205)
chr2 (245-306)||(21903182-21903245)
chr2 (208-342)||(25651191-25651329)
chr2 (245-346)||(24160205-24160311)
chr2 (305-339)||(24682759-24682793)
chr2 (227-261)||(24682759-24682793)
chr2 (284-392)||(31518498-31518610)
chr2 (360-406)||(38931510-38931556)
chr2 (361-394)||(9701-9734)
chr2 (277-345)||(10040267-10040335)
chr2 (361-394)||(25181797-25181830)
chr2 (361-394)||(29281120-29281153)
chr2 (447-480)||(31503496-31503529)
chr2 (447-480)||(31506062-31506095)
chr2 (205-238)||(43708265-43708298)
chr2 (101-153)||(28348840-28348892)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (149-480)||(10554034-10554365)
chr3 (109-480)||(16799369-16799752)
chr3 (109-480)||(2038665-2039036)
chr3 (109-480)||(2042406-2042777)
chr3 (188-480)||(14041295-14041590)
chr3 (188-480)||(14037827-14038122)
chr3 (200-480)||(2035158-2035439)
chr3 (101-403)||(54972954-54973256)
chr3 (101-403)||(54975564-54975866)
chr3 (101-403)||(54978174-54978476)
chr3 (200-478)||(18958558-18958839)
chr3 (109-345)||(2038996-2039233)
chr3 (109-345)||(2042737-2042974)
chr3 (188-403)||(15010388-15010604)
chr3 (91-342)||(54972865-54973118)
chr3 (91-342)||(54975475-54975728)
chr3 (91-342)||(54978085-54978338)
chr3 (161-397)||(14951722-14951945)
chr3 (109-345)||(52338998-52339235)
chr3 (109-410)||(10989803-10990106)
chr3 (227-403)||(603878-604055)
chr3 (109-302)||(179701-179894)
chr3 (163-341)||(10554010-10554187)
chr3 (277-480)||(55292595-55292807)
chr3 (227-480)||(39230431-39230670)
chr3 (109-304)||(2035296-2035492)
chr3 (161-342)||(52338963-52339143)
chr3 (169-343)||(54972904-54973079)
chr3 (169-343)||(54975514-54975689)
chr3 (169-343)||(54978124-54978299)
chr3 (109-346)||(23396053-23396291)
chr3 (90-265)||(15010448-15010623)
chr3 (161-306)||(6806015-6806159)
chr3 (109-268)||(14037827-14037987)
chr3 (101-303)||(52338963-52339164)
chr3 (109-265)||(14041295-14041452)
chr3 (109-265)||(6806017-6806172)
chr3 (101-265)||(10554065-10554228)
chr3 (277-402)||(54046475-54046601)
chr3 (90-225)||(14951841-14951977)
chr3 (188-345)||(179735-179894)
chr3 (176-342)||(6819002-6819170)
chr3 (200-346)||(179696-179841)
chr3 (109-192)||(17211138-17211221)
chr3 (90-225)||(603938-604074)
chr3 (219-343)||(14951841-14951966)
chr3 (161-394)||(1989226-1989462)
chr3 (101-261)||(10989875-10990035)
chr3 (110-263)||(18958546-18958701)
chr3 (188-346)||(6806014-6806172)
chr3 (109-300)||(1989281-1989475)
chr3 (109-346)||(6818902-6819133)
chr3 (98-219)||(10834465-10834586)
chr3 (227-346)||(179774-179894)
chr3 (227-342)||(10553995-10554110)
chr3 (90-184)||(7631915-7632010)
chr3 (180-304)||(14951841-14951966)
chr3 (207-306)||(603936-604035)
chr3 (205-346)||(3394996-3395142)
chr3 (129-263)||(3395001-3395140)
chr3 (109-226)||(39230431-39230548)
chr3 (129-264)||(6819033-6819170)
chr3 (200-410)||(12855881-12856092)
chr3 (104-186)||(54046459-54046542)
chr3 (148-303)||(6819013-6819170)
chr3 (277-346)||(30206553-30206623)
chr3 (109-186)||(30206556-30206634)
chr3 (259-345)||(14951878-14951966)
chr3 (109-265)||(12855946-12856105)
chr3 (138-186)||(15446413-15446461)
chr3 (281-343)||(10554010-10554071)
chr3 (161-231)||(17211151-17211221)
chr3 (188-265)||(30206556-30206634)
chr3 (188-265)||(54046464-54046542)
chr3 (168-340)||(10834381-10834555)
chr3 (188-263)||(7631934-7632010)
chr3 (166-244)||(18367772-18367852)
chr3 (227-306)||(30206554-30206634)
chr3 (109-261)||(9885-10040)
chr3 (417-480)||(603820-603885)
chr3 (227-336)||(1989365-1989475)
chr3 (277-342)||(2035415-2035481)
chr3 (417-480)||(15010330-15010395)
chr3 (277-341)||(7631945-7632010)
chr3 (305-342)||(12856068-12856105)
chr3 (227-304)||(17211138-17211215)
chr3 (245-341)||(15232139-15232239)
chr3 (245-341)||(15238007-15238107)
chr3 (205-340)||(15232139-15232278)
chr3 (205-340)||(15238007-15238146)
chr3 (109-195)||(6819053-6819139)
chr3 (429-480)||(10989746-10989799)
chr3 (161-225)||(30206556-30206621)
chr3 (447-480)||(54973282-54973315)
chr3 (447-480)||(54975892-54975925)
chr3 (447-480)||(54978502-54978535)
chr3 (245-339)||(9945-10040)
chr3 (227-338)||(12855990-12856105)
chr3 (245-394)||(15011967-15012117)
chr3 (109-184)||(18958626-18958701)
chr3 (109-140)||(55292787-55292818)
chr3 (277-346)||(1989395-1989464)
chr3 (304-342)||(30206597-30206635)
chr3 (227-261)||(35984719-35984753)
chr3 (361-394)||(12034312-12034345)
chr3 (361-394)||(14764095-14764128)
chr3 (361-394)||(14864967-14865000)
chr3 (188-225)||(15446424-15446461)
chr3 (267-304)||(15446424-15446461)
chr3 (361-394)||(17130875-17130908)
chr3 (361-394)||(51300281-51300314)
chr3 (447-480)||(54046627-54046660)
chr3 (166-263)||(15232139-15232239)
chr3 (166-263)||(15238007-15238107)
chr3 (188-271)||(17211138-17211221)
chr3 (245-337)||(18367756-18367852)
chr3 (129-195)||(18367782-18367850)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (90-480)||(45306844-45307234)
chr1 (91-403)||(20586715-20587026)
chr1 (91-403)||(20579022-20579333)
chr1 (90-480)||(2333147-2333545)
chr1 (188-480)||(296178-296464)
chr1 (200-480)||(20630980-20631261)
chr1 (207-480)||(36181245-36181520)
chr1 (161-480)||(22900426-22900745)
chr1 (188-480)||(14432528-14432818)
chr1 (90-302)||(22900566-22900777)
chr1 (109-302)||(18823462-18823655)
chr1 (109-410)||(293782-294086)
chr1 (227-403)||(24087129-24087306)
chr1 (318-480)||(37358254-37358417)
chr1 (109-346)||(21181391-21181628)
chr1 (109-304)||(20630927-20631123)
chr1 (109-263)||(296178-296331)
chr1 (161-341)||(18823475-18823655)
chr1 (109-306)||(20901018-20901214)
chr1 (109-268)||(14432658-14432818)
chr1 (109-320)||(21181336-21181549)
chr1 (109-268)||(36181225-36181385)
chr1 (161-347)||(21181430-21181615)
chr1 (109-225)||(28204698-28204815)
chr1 (161-346)||(20901031-20901215)
chr1 (109-224)||(16400612-16400729)
chr1 (90-225)||(24087110-24087246)
chr1 (109-223)||(18270200-18270315)
chr1 (109-223)||(18274854-18274969)
chr1 (90-186)||(37358183-37358279)
chr1 (200-304)||(36181278-36181382)
chr1 (109-220)||(28312084-28312195)
chr1 (188-345)||(18823462-18823621)
chr1 (161-265)||(28204698-28204802)
chr1 (227-342)||(22900643-22900758)
chr1 (109-195)||(19209424-19209511)
chr1 (101-261)||(293853-294014)
chr1 (161-263)||(18270213-18270315)
chr1 (161-263)||(18274867-18274969)
chr1 (227-346)||(18823462-18823582)
chr1 (188-306)||(24087129-24087248)
chr1 (227-345)||(28204696-28204815)
chr1 (161-259)||(19209438-19209536)
chr1 (227-338)||(28312084-28312195)
chr1 (227-346)||(18270200-18270320)
chr1 (227-346)||(18274854-18274974)
chr1 (131-224)||(44823105-44823202)
chr1 (161-260)||(28312097-28312195)
chr1 (277-346)||(20630938-20631008)
chr1 (417-480)||(24087299-24087364)
chr1 (161-264)||(16400625-16400729)
chr1 (254-342)||(44823105-44823197)
chr1 (239-337)||(19209437-19209536)
chr1 (227-342)||(16400612-16400729)
chr1 (254-346)||(21528853-21528948)
chr1 (227-338)||(24475316-24475431)
chr1 (245-394)||(24475376-24475526)
chr1 (429-480)||(294090-294143)
chr1 (227-305)||(37358202-37358280)
chr1 (166-264)||(8683035-8683136)
chr1 (166-264)||(21528816-21528917)
chr1 (305-338)||(25092495-25092528)
chr1 (170-264)||(44823105-44823202)
chr1 (245-339)||(24959986-24960081)
chr1 (161-225)||(37358215-37358279)
chr1 (277-346)||(19209436-19209505)
chr1 (277-346)||(28204735-28204804)
chr1 (245-346)||(8682995-8683099)
chr1 (361-394)||(20852030-20852063)
chr1 (361-394)||(20858656-20858689)
chr1 (361-394)||(21705401-21705434)
chr1 (227-260)||(24959926-24959959)
chr1 (305-338)||(24959926-24959959)
chr1 (361-410)||(32650339-32650388)
chr1 (209-303)||(44823105-44823202)
chr1 (360-408)||(7792755-7792803)
chr1 (447-479)||(20579359-20579391)
chr1 (274-341)||(45918166-45918237)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (161-480)||(43120803-43121120)
chr5 (161-480)||(43124336-43124653)
chr5 (90-480)||(16256108-16256498)
chr5 (90-480)||(29325412-29325811)
chr5 (90-480)||(26495416-26495815)
chr5 (200-480)||(23693122-23693403)
chr5 (161-480)||(16259741-16260060)
chr5 (161-480)||(22593460-22593779)
chr5 (161-480)||(22597015-22597334)
chr5 (161-480)||(22589905-22590224)
chr5 (90-339)||(22759004-22759253)
chr5 (91-306)||(43120772-43120985)
chr5 (91-306)||(43124305-43124518)
chr5 (188-480)||(26361256-26361552)
chr5 (109-346)||(27869691-27869925)
chr5 (90-302)||(16259881-16260092)
chr5 (305-480)||(4397478-4397654)
chr5 (90-302)||(22593600-22593811)
chr5 (90-302)||(22597155-22597366)
chr5 (90-302)||(22590045-22590256)
chr5 (109-275)||(22469777-22469943)
chr5 (180-341)||(23671472-23671633)
chr5 (109-223)||(8953034-8953148)
chr5 (109-410)||(22758892-22759194)
chr5 (161-392)||(22357860-22358093)
chr5 (188-345)||(22759076-22759234)
chr5 (227-341)||(23693109-23693223)
chr5 (98-302)||(22357911-22358117)
chr5 (109-264)||(24277605-24277762)
chr5 (109-264)||(24384451-24384608)
chr5 (161-313)||(23671493-23671644)
chr5 (161-303)||(24277605-24277749)
chr5 (161-303)||(24384464-24384608)
chr5 (90-260)||(26361399-26361571)
chr5 (227-346)||(22469777-22469896)
chr5 (98-263)||(23671469-23671633)
chr5 (161-302)||(23693122-23693262)
chr5 (188-346)||(22469777-22469936)
chr5 (227-342)||(16259958-16260073)
chr5 (129-244)||(21559443-21559562)
chr5 (227-342)||(22593677-22593792)
chr5 (227-342)||(22597232-22597347)
chr5 (227-342)||(22590122-22590237)
chr5 (188-342)||(24277605-24277762)
chr5 (188-342)||(24384451-24384608)
chr5 (431-480)||(22880122-22880171)
chr5 (109-186)||(4397438-4397516)
chr5 (245-346)||(21559459-21559564)
chr5 (129-394)||(22469836-22470122)
chr5 (161-263)||(8953034-8953135)
chr5 (277-342)||(23693081-23693146)
chr5 (227-346)||(8953029-8953148)
chr5 (166-271)||(21559456-21559564)
chr5 (188-302)||(8953034-8953148)
chr5 (245-346)||(7785121-7785224)
chr5 (129-244)||(21981036-21981155)
chr5 (166-262)||(26706359-26706458)
chr5 (166-262)||(26976093-26976192)
chr5 (277-346)||(24277682-24277751)
chr5 (277-346)||(24384462-24384531)
chr5 (305-341)||(17023001-17023037)
chr5 (227-263)||(17023001-17023037)
chr5 (305-345)||(23671480-23671520)
chr5 (284-341)||(26706359-26706418)
chr5 (284-341)||(26976093-26976152)
chr5 (227-265)||(4397478-4397516)
chr5 (166-238)||(7785160-7785234)
chr5 (429-476)||(22758839-22758888)
chr5 (129-184)||(7785162-7785219)
chr5 (361-394)||(19236026-19236059)
[»] scaffold0525 (3 HSPs)
scaffold0525 (91-480)||(11049-11440)
scaffold0525 (109-480)||(8722-9100)
scaffold0525 (109-338)||(8682-8910)
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (90-480)||(8522462-8522861)
chr6 (109-480)||(15538832-15539216)
chr6 (188-480)||(16101993-16102288)
chr6 (188-480)||(12595608-12595902)
chr6 (188-477)||(15686289-15686582)
chr6 (227-480)||(16829488-16829743)
chr6 (228-480)||(29492446-29492700)
chr6 (227-480)||(16812468-16812723)
chr6 (109-342)||(13763959-13764191)
chr6 (188-480)||(2288090-2288393)
chr6 (161-342)||(13764245-13764425)
chr6 (108-342)||(13764114-13764347)
chr6 (109-346)||(13764076-13764311)
chr6 (161-347)||(23621195-23621381)
chr6 (121-346)||(13764244-13764467)
chr6 (109-265)||(16101993-16102150)
chr6 (109-223)||(24440865-24440978)
chr6 (109-303)||(23621200-23621394)
chr6 (109-263)||(2288238-2288393)
chr6 (109-263)||(15686428-15686582)
chr6 (109-220)||(23352132-23352243)
chr6 (110-225)||(29492446-29492562)
chr6 (91-225)||(16829470-16829605)
chr6 (109-302)||(13764310-13764502)
chr6 (129-303)||(12389463-12389644)
chr6 (91-222)||(16812450-16812582)
chr6 (208-397)||(9185881-9186074)
chr6 (109-265)||(12595608-12595764)
chr6 (109-221)||(221635-221747)
chr6 (227-338)||(23352132-23352243)
chr6 (207-306)||(16829508-16829607)
chr6 (166-342)||(12389461-12389644)
chr6 (109-223)||(29848499-29848613)
chr6 (200-339)||(21469739-21469879)
chr6 (129-264)||(1639059-1639199)
chr6 (207-306)||(16812488-16812587)
chr6 (161-260)||(23352145-23352243)
chr6 (200-306)||(29492458-29492564)
chr6 (91-211)||(16804631-16804752)
chr6 (200-339)||(25772628-25772770)
chr6 (109-261)||(21469726-21469879)
chr6 (129-264)||(25806861-25807001)
chr6 (254-346)||(29848494-29848586)
chr6 (109-178)||(24266676-24266746)
chr6 (227-346)||(13763959-13764077)
chr6 (278-329)||(16804701-16804752)
chr6 (169-263)||(29848499-29848592)
chr6 (129-225)||(1584259-1584359)
chr6 (161-300)||(21469739-21469879)
chr6 (254-411)||(1584266-1584428)
chr6 (169-306)||(9185933-9186074)
chr6 (166-262)||(9185938-9186035)
chr6 (200-262)||(16812521-16812582)
chr6 (284-397)||(18137580-18137693)
chr6 (205-411)||(1639057-1639269)
chr6 (227-339)||(221635-221747)
chr6 (129-263)||(13751332-13751472)
chr6 (227-290)||(16804689-16804752)
chr6 (161-300)||(25772628-25772770)
chr6 (166-303)||(1639057-1639199)
chr6 (161-263)||(24440878-24440978)
chr6 (240-302)||(24440916-24440978)
chr6 (168-261)||(221655-221747)
chr6 (245-346)||(12389461-12389566)
chr6 (305-345)||(16804689-16804729)
chr6 (245-335)||(22346652-22346743)
chr6 (279-346)||(24440916-24440983)
chr6 (245-339)||(17027209-17027304)
chr6 (369-411)||(1590539-1590581)
chr6 (200-250)||(16804702-16804751)
chr6 (304-346)||(24266781-24266823)
chr6 (166-303)||(25806859-25807001)
chr6 (167-265)||(1584258-1584359)
chr6 (166-264)||(17526287-17526388)
chr6 (166-257)||(22346652-22346743)
chr6 (277-345)||(23352143-23352211)
chr6 (245-346)||(25806859-25806964)
chr6 (245-342)||(25806900-25807001)
chr6 (166-261)||(17027209-17027304)
chr6 (254-346)||(17526256-17526351)
chr6 (305-337)||(21469726-21469758)
chr6 (168-248)||(24266697-24266776)
chr6 (254-326)||(24266704-24266776)
chr6 (227-339)||(29265487-29265602)
chr6 (206-306)||(1584258-1584361)
chr6 (227-261)||(18137480-18137514)
chr6 (305-339)||(18137480-18137514)
chr6 (266-300)||(21476346-21476380)
chr6 (245-312)||(1590641-1590710)
chr6 (361-394)||(4476544-4476577)
chr6 (361-394)||(20008844-20008877)
chr6 (361-394)||(21365432-21365465)
chr6 (305-338)||(21476266-21476299)
chr6 (305-342)||(23621357-23621394)
chr6 (361-394)||(23969414-23969447)
chr6 (109-221)||(21476266-21476380)
chr6 (161-261)||(21476279-21476380)
[»] scaffold0004 (9 HSPs)
scaffold0004 (109-346)||(59166-59402)
scaffold0004 (129-264)||(205343-205483)
scaffold0004 (200-397)||(384104-384304)
scaffold0004 (227-338)||(384091-384206)
scaffold0004 (205-342)||(205343-205485)
scaffold0004 (166-303)||(205343-205485)
scaffold0004 (109-260)||(384091-384245)
scaffold0004 (305-342)||(384091-384128)
scaffold0004 (278-339)||(384103-384167)
[»] scaffold0395 (6 HSPs)
scaffold0395 (98-339)||(8881-9123)
scaffold0395 (122-410)||(8729-9021)
scaffold0395 (429-480)||(8672-8725)
scaffold0395 (227-273)||(10055-10101)
scaffold0395 (305-346)||(10060-10101)
scaffold0395 (161-234)||(10013-10088)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (109-346)||(40131-40368)
[»] scaffold0131 (5 HSPs)
scaffold0131 (252-469)||(1415-1634)
scaffold0131 (211-302)||(1414-1505)
scaffold0131 (172-263)||(1414-1505)
scaffold0131 (136-223)||(1417-1505)
scaffold0131 (361-391)||(149-179)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (110-339)||(137484-137714)
scaffold0003 (101-300)||(137554-137754)
scaffold0003 (161-343)||(137496-137678)
scaffold0003 (240-339)||(137653-137754)
scaffold0003 (372-410)||(137788-137826)
[»] scaffold0008 (8 HSPs)
scaffold0008 (161-392)||(12455-12688)
scaffold0008 (116-340)||(13071-13296)
scaffold0008 (120-302)||(12508-12690)
scaffold0008 (109-346)||(13025-13263)
scaffold0008 (109-223)||(12508-12623)
scaffold0008 (277-346)||(12622-12690)
scaffold0008 (110-278)||(13015-13185)
scaffold0008 (227-261)||(125038-125072)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (109-346)||(4317-4554)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (109-343)||(2009-2242)
scaffold0109 (161-339)||(2101-2278)
scaffold0109 (101-410)||(2080-2390)
scaffold0109 (429-480)||(2394-2447)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (109-346)||(50697-50936)
scaffold0042 (109-346)||(50775-51015)
[»] scaffold0026 (15 HSPs)
scaffold0026 (109-345)||(20803-21042)
scaffold0026 (109-306)||(20883-21079)
scaffold0026 (207-346)||(20823-20964)
scaffold0026 (109-346)||(20843-21080)
scaffold0026 (161-292)||(23894-24026)
scaffold0026 (227-346)||(23881-24002)
scaffold0026 (227-394)||(35578-35745)
scaffold0026 (277-346)||(20814-20884)
scaffold0026 (109-234)||(23881-24008)
scaffold0026 (205-261)||(35636-35691)
scaffold0026 (109-174)||(23961-24026)
scaffold0026 (166-261)||(24768-24863)
scaffold0026 (284-339)||(24808-24863)
scaffold0026 (304-346)||(23880-23922)
scaffold0026 (227-261)||(24708-24742)
[»] scaffold0500 (4 HSPs)
scaffold0500 (109-302)||(11688-11883)
scaffold0500 (161-346)||(11683-11870)
scaffold0500 (227-342)||(11767-11883)
scaffold0500 (304-342)||(11846-11884)
[»] scaffold0586 (3 HSPs)
scaffold0586 (109-263)||(1503-1657)
scaffold0586 (161-302)||(1516-1657)
scaffold0586 (188-346)||(1503-1662)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (109-306)||(34873-35070)
scaffold0034 (168-345)||(34873-35050)
scaffold0034 (369-411)||(34807-34849)
[»] scaffold0151 (8 HSPs)
scaffold0151 (110-265)||(2122-2277)
scaffold0151 (110-265)||(8966-9121)
scaffold0151 (240-411)||(2173-2346)
scaffold0151 (240-411)||(9017-9190)
scaffold0151 (228-345)||(2122-2240)
scaffold0151 (228-345)||(8966-9084)
scaffold0151 (109-186)||(2200-2277)
scaffold0151 (109-186)||(9044-9121)
[»] scaffold0860 (4 HSPs)
scaffold0860 (161-346)||(165-350)
scaffold0860 (109-306)||(152-349)
scaffold0860 (188-345)||(152-310)
scaffold0860 (304-342)||(151-189)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (109-302)||(3943-4136)
scaffold0338 (168-394)||(3888-4116)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (90-263)||(2759-2931)
scaffold0107 (188-302)||(2818-2931)
scaffold0107 (240-346)||(2830-2936)
scaffold0107 (267-345)||(2818-2897)
[»] scaffold0126 (3 HSPs)
scaffold0126 (109-265)||(5700-5855)
scaffold0126 (161-306)||(5713-5857)
scaffold0126 (188-411)||(5700-5924)
[»] scaffold0381 (4 HSPs)
scaffold0381 (188-346)||(13981-14142)
scaffold0381 (109-263)||(13986-14142)
scaffold0381 (161-302)||(13986-14129)
scaffold0381 (304-342)||(14105-14143)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (109-265)||(6087-6242)
scaffold0044 (240-397)||(6032-6190)
scaffold0044 (161-306)||(6085-6229)
scaffold0044 (227-341)||(6127-6242)
scaffold0044 (101-186)||(6087-6171)
[»] scaffold0447 (3 HSPs)
scaffold0447 (98-335)||(13902-14143)
scaffold0447 (280-346)||(13965-14031)
scaffold0447 (241-346)||(13965-14073)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (98-335)||(11897-12138)
scaffold0383 (280-346)||(11960-12026)
scaffold0383 (241-346)||(11960-12068)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (109-265)||(10569-10725)
scaffold0413 (188-346)||(10569-10728)
[»] scaffold1276 (4 HSPs)
scaffold1276 (90-186)||(113-209)
scaffold1276 (161-225)||(145-209)
scaffold1276 (227-306)||(132-211)
scaffold1276 (277-411)||(143-278)
[»] scaffold0825 (3 HSPs)
scaffold0825 (175-346)||(1800-1971)
scaffold0825 (109-306)||(1801-1998)
scaffold0825 (227-345)||(1879-1998)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (227-480)||(134142-134379)
scaffold0021 (90-223)||(134263-134398)
scaffold0021 (188-302)||(134263-134379)
[»] scaffold0635 (4 HSPs)
scaffold0635 (110-221)||(6725-6836)
scaffold0635 (161-339)||(6737-6918)
scaffold0635 (228-339)||(6725-6836)
scaffold0635 (277-345)||(6735-6803)
[»] scaffold0556 (5 HSPs)
scaffold0556 (227-346)||(9619-9739)
scaffold0556 (206-306)||(9638-9738)
scaffold0556 (167-265)||(9638-9736)
scaffold0556 (109-154)||(9563-9608)
scaffold0556 (298-346)||(9612-9660)
[»] scaffold0491 (6 HSPs)
scaffold0491 (277-403)||(10478-10605)
scaffold0491 (98-184)||(10456-10542)
scaffold0491 (188-263)||(10467-10542)
scaffold0491 (227-302)||(10467-10542)
scaffold0491 (161-223)||(10480-10542)
scaffold0491 (304-345)||(10466-10507)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (200-394)||(21715-21913)
scaffold0011 (161-306)||(21764-21913)
scaffold0011 (305-346)||(21885-21926)
scaffold0011 (227-341)||(21807-21926)
scaffold0011 (277-346)||(21843-21915)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (109-221)||(223630-223742)
scaffold0012 (254-339)||(223630-223715)
scaffold0012 (175-261)||(223630-223715)
[»] scaffold1098 (8 HSPs)
scaffold1098 (161-292)||(1078-1210)
scaffold1098 (227-346)||(1065-1186)
scaffold1098 (109-234)||(1065-1192)
scaffold1098 (109-174)||(1145-1210)
scaffold1098 (166-261)||(1952-2047)
scaffold1098 (284-339)||(1992-2047)
scaffold1098 (304-346)||(1064-1106)
scaffold1098 (227-261)||(1892-1926)
[»] scaffold0069 (5 HSPs)
scaffold0069 (227-397)||(34476-34649)
scaffold0069 (284-397)||(29298-29411)
scaffold0069 (161-265)||(34489-34595)
scaffold0069 (109-265)||(29196-29357)
scaffold0069 (305-346)||(29196-29237)
[»] scaffold0007 (5 HSPs)
scaffold0007 (179-293)||(165629-165742)
scaffold0007 (247-332)||(165629-165714)
scaffold0007 (286-345)||(165654-165714)
scaffold0007 (109-175)||(165629-165694)
scaffold0007 (142-234)||(165648-165740)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (129-244)||(29340-29459)
scaffold0180 (245-342)||(29360-29461)
scaffold0180 (166-275)||(29349-29461)
[»] scaffold0364 (4 HSPs)
scaffold0364 (166-264)||(7087-7187)
scaffold0364 (205-342)||(7046-7187)
scaffold0364 (284-345)||(7087-7150)
scaffold0364 (129-186)||(7089-7148)
[»] scaffold0962 (4 HSPs)
scaffold0962 (129-264)||(1528-1668)
scaffold0962 (245-346)||(1565-1670)
scaffold0962 (205-342)||(1528-1670)
scaffold0962 (166-303)||(1528-1670)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (129-244)||(6554-6674)
scaffold0273 (166-264)||(6552-6653)
scaffold0273 (245-342)||(6552-6653)
[»] scaffold0106 (6 HSPs)
scaffold0106 (129-244)||(20683-20802)
scaffold0106 (166-278)||(20681-20796)
scaffold0106 (205-303)||(20681-20782)
scaffold0106 (245-342)||(20681-20782)
scaffold0106 (361-406)||(28778-28823)
scaffold0106 (360-405)||(36363-36408)
[»] scaffold1336 (2 HSPs)
scaffold1336 (227-394)||(789-957)
scaffold1336 (161-257)||(848-944)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (245-346)||(33623-33727)
scaffold0117 (205-411)||(33623-33834)
scaffold0117 (129-244)||(33625-33743)
scaffold0117 (166-275)||(33623-33734)
[»] scaffold0071 (3 HSPs)
scaffold0071 (138-186)||(15731-15779)
scaffold0071 (267-304)||(15731-15768)
scaffold0071 (188-225)||(15731-15768)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (255-346)||(183052-183147)
scaffold0016 (166-239)||(183041-183116)
scaffold0016 (109-155)||(120036-120082)
scaffold0016 (268-311)||(120131-120174)
scaffold0016 (176-263)||(183057-183147)
[»] scaffold0130 (5 HSPs)
scaffold0130 (285-342)||(2811-2869)
scaffold0130 (167-224)||(2811-2869)
scaffold0130 (206-264)||(2811-2869)
scaffold0130 (246-303)||(2811-2869)
scaffold0130 (129-185)||(2811-2868)
[»] scaffold0216 (3 HSPs)
scaffold0216 (277-338)||(21261-21322)
scaffold0216 (287-339)||(21352-21404)
scaffold0216 (109-261)||(21250-21404)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (129-263)||(30-170)
[»] scaffold0859 (3 HSPs)
scaffold0859 (166-244)||(165-245)
scaffold0859 (253-340)||(187-278)
scaffold0859 (129-183)||(187-243)
[»] scaffold0453 (2 HSPs)
scaffold0453 (129-264)||(2954-3094)
scaffold0453 (167-303)||(2953-3094)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (245-397)||(8649-8802)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (200-334)||(177923-178060)
scaffold0020 (227-339)||(177910-178026)
scaffold0020 (161-295)||(177923-178060)
[»] scaffold0371 (5 HSPs)
scaffold0371 (252-346)||(5320-5416)
scaffold0371 (287-345)||(5316-5375)
scaffold0371 (169-225)||(5316-5373)
scaffold0371 (305-338)||(7227-7260)
scaffold0371 (227-260)||(7227-7260)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (109-260)||(20776-20930)
scaffold0192 (245-338)||(20836-20930)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (252-346)||(28059-28155)
scaffold0149 (287-345)||(28100-28159)
scaffold0149 (169-225)||(28102-28159)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (245-339)||(19339-19434)
scaffold0322 (166-261)||(19339-19434)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (281-410)||(4843-4972)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (245-346)||(16110-16215)
scaffold0388 (166-305)||(16071-16215)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (447-480)||(162359-162392)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (205-261)||(524712-524768)
scaffold0001 (284-339)||(524712-524768)
scaffold0001 (278-339)||(524746-524809)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (202-261)||(17964-18023)
scaffold0165 (227-261)||(17866-17900)
scaffold0165 (305-339)||(17866-17900)
[»] scaffold0865 (2 HSPs)
scaffold0865 (305-339)||(30-64)
scaffold0865 (227-261)||(30-64)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (285-339)||(8674-8728)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (360-410)||(6004-6054)
scaffold0309 (360-410)||(8156-8206)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (360-394)||(884-918)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (305-339)||(27043-27077)
scaffold0133 (227-261)||(27043-27077)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (361-394)||(2814-2847)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (281-338)||(13698-13755)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (361-406)||(2123-2168)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (361-394)||(80390-80423)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (361-394)||(92099-92132)
scaffold0029 (361-394)||(97825-97858)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (205-261)||(3666-3722)


Alignment Details
Target: scaffold0141 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Original strand, 32722 - 33110
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32722 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 32821  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32822 aatgattaacattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacgagcattccagggca 32920  T
Q  291 tgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaact 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32921 tgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacctgtgtatatcagcatacaact 33020  T
Q  391 caactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33021 caactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 33110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 82090 - 81702
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82090 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 81991  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  81990 aatgattaacattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacgagcattccagggca 81892  T
Q  291 tgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaact 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  81891 tgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacctgtgtatatcagcatacaact 81792  T
Q  391 caactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81791 caactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 81702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Original strand, 28853507 - 28853895
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853507 ggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaacagattg 28853606  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28853607 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacgagcattccagggca 28853705  T
Q  291 tgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaact 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853706 tgagccctcaacggttgaacgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttcgtaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaact 28853805  T
Q  391 caactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853806 caactacgacagcaacaacatacgcgacggcaacgatcgtgcatcataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 28853895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6608842 - 6608444
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608842 ggtactattttcaactcaacgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacactttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 6608743  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6608742 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 6608644  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608643 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 6608544  T
Q  390 tcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    | |||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6608543 ttaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 6608444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 17794971 - 17795341
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17794971 ttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 17795069  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttg 307  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795070 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattccagggcataagccctccacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttg 17795168  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  17795169 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacagcgaca 17795268  T
Q  408 acataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795269 acataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 17795341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 45135495 - 45135097
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135495 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaacagattg 45135396  T
Q  191 aatgattaa-ca-ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagg 287  Q
    |||||  |  || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  45135395 aatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 45135298  T
Q  288 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45135297 gcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacataca 45135199  T
Q  388 actcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 478  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135198 actcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttacttcccaacttggtcaacatcaacaacctat 45135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 175 - 480
Target Start/End: Original strand, 17614559 - 17614864
Alignment:
Q  175 agccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17614559 agcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 17614657  T
Q  275 cgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtg 373  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17614658 caaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtg 17614755  T
Q  374 tatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaac 471  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17614756 tatatcagcatacaactcgactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaac 17614855  T
Q  472 aacctatga 480  Q
     ||||||||    
T  17614856 cacctatga 17614864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22145838 - 22145561
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22145838 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 22145739  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145738 caacagttaaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 22145640  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || || |||||       |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22145639 accacgacaac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 22145561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7301550 - 7301310
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7301550 cattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 7301452  T
Q  261 aacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7301451 aacat-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa 7301354  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7301353 ggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 7301310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 277 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24708186 - 24707982
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtat 376  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24708186 agcattccggggcataagccctcaacggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtat 24708088  T
Q  377 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaac 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708087 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaac 24707988  T
Q  475 ctatga 480  Q
    ||||||    
T  24707987 ctatga 24707982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22059830 - 22059565
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  22059830 cattccagggcatgagccctcaacagct-gaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacag-ttgaatgacatagcatccctgggcataagccct 22059733  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22059732 caacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 22059634  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||               |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22059633 aca---------------acgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 22059565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Original strand, 17614513 - 17614724
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  17614513 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcgtaagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaac-ggtt 17614611  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  17614612 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 17614710  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  17614711 catgagccctcaac 17614724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7301738 - 7301487
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301738 ggtactattttcaactcgttgaatgactaagcattccggggcataagccccaacaaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 7301639  T
Q  191 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccaggg 288  Q
    |||||  |  || | |||||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7301638 aatgacaaggcaattcagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccaggg 7301541  T
Q  289 catgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7301540 cataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacag 7301487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 338
Target Start/End: Original strand, 19881726 - 19881955
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||    
T  19881726 ttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 19881825  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19881826 ggcataagccgtcaacagtttgaatgataa-acattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaatt 19881924  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19881925 gaatgataaa-cattccagggcatgagccctc 19881955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22145891 - 22145694
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  22145891 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 22145792  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22145791 gggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttaaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 22145694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 44431492 - 44431723
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  44431492 tgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 44431591  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac-agtt 306  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||  |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |   ||    
T  44431592 gcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acatttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgcttt 44431689  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 340  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  44431690 gaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaa 44431723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7301623 - 7301448
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  7301623 cagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-g 7301526  T
Q  266 attgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
     ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7301525 gttgaatgattaacattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 7301448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 339
Target Start/End: Original strand, 44431562 - 44431800
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  44431562 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacatttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 44431660  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||| || |||||| | |||||||||  | ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  44431661 cattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaa-tggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 44431759  T
Q  300 aacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44431760 aacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 44431800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 19881766 - 19882003
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  19881766 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccgtcaacagtttgaatgataaacattccat 19881864  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt- 306  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  19881865 ggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcgacaattt 19881963  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19881964 gaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagttt 19882003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21415698 - 21415544
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  21415698 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaatt-gaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 21415600  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21415599 ggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 21415544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7301571 - 7301372
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-a 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |      
T  7301571 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaagg 7301473  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301472 cattccagggcataagccctcaaca-tttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 7301375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 363614 - 363767
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||    
T  363614 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcagtccag 363713  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  363714 ggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 363767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22145891 - 22145731
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22145891 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 22145792  T
Q  286 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22145791 gggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 22145731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Original strand, 19881747 - 19881921
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  19881747 ggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccgtcaacagttt 19881846  T
Q  269 gaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19881847 gaatgataaacattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaaca 19881921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21415685 - 21415544
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21415685 cattccagggcataagcccccagca-attgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 21415587  T
Q  261 aacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21415586 aacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 21415544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 43111909 - 43112100
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  43111909 ttgaatgactaagcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 43112008  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |   |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||    
T  43112009 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-atattccaaggcatgagccctcaacag-ttgaatgattaacattccaggacatgagtcctcaac 43112100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 341
Target Start/End: Original strand, 43111922 - 43112100
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43111922 cattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 43112021  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||    
T  43112022 aacag-ttgaatgattaatattccaaggcatgagccctcaacagttgaatgattaa-cattccaggacatgagtcctcaac 43112100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 19881845 - 19882038
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19881845 ttgaatga-taaacattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaaca-attgaatgataaacattccag 19881942  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19881943 ggcatgagccctcgacaatttgaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattctagggcataagccctcaac 19882038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 343
Target Start/End: Original strand, 44431583 - 44431764
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  44431583 cattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacatttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 44431681  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    | |   ||||||||| || | || |||||||| |||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44431682 accgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaatggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 44431764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22059883 - 22059686
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||    
T  22059883 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ctgaatgacaaagcattcca 22059785  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22059784 gggcataagccatcaacag-ttgaatgacatagcatccctgggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagt 22059687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 20459875 - 20460028
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  20459875 ttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattctag 20459973  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  20459974 ggcataagccgtcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagtcctcaac 20460028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44523338 - 44523193
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  44523338 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggt 44523240  T
Q  189 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44523239 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatga 44523193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 32949543 - 32949698
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||     
T  32949543 ttgaatgactaagcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccaa 32949642  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32949643 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 32949698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 44431640 - 44431840
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||  |  | || |||||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  44431640 tcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaatgg-ttgaatgattaa 44431738  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  44431739 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccct 44431838  T
Q  299 ca 300  Q
    ||    
T  44431839 ca 44431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22522031 - 22521830
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  22522031 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcattcacagggcataagc 22521932  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22521931 cctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 22521833  T
Q  395 tac 397  Q
    |||    
T  22521832 tac 22521830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21415698 - 21415539
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21415698 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagca-attgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 21415601  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21415600 gggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 21415539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44523319 - 44523199
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44523319 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 44523220  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44523219 ggcatgagccctcaacagttt 44523199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 410
Target Start/End: Original strand, 15267131 - 15267344
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  15267131 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagc 15267230  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |||||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15267231 cctcaacgattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 15267329  T
Q  395 tacgacaacaacaaca 410  Q
    ||| || |||||||||    
T  15267330 tacaac-acaacaaca 15267344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362180
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||  |   |||  ||    
T  362336 ttgaatgactaggtattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggtataagccctcaacagtttgaatgacaaggtattatag 362237  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  362236 ggcataagccctcaatag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 362180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38186225 - 38186102
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatt 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||      
T  38186225 ttttcaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaac-ggttgaatgaca 38186127  T
Q  198 aa-cattcca-gggcatgagccctc 220  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  38186126 aagcattccaggggcatgagccctc 38186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Original strand, 17614532 - 17614647
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17614532 ttgaatgactaagcattccggagcgtaagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagg 17614631  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17614632 gcatgagccctcaaca 17614647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21861758 - 21861647
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||  || ||||| ||    
T  21861758 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcagtag-ttgaatgacaaagcattctag 21861660  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  21861659 ggcatgagccctc 21861647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 32949543 - 32949701
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  32949543 ttgaatgactaagcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 32949641  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32949642 aggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 32949701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 362270 - 362111
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatgacgagc-attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaat 352  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  362270 agccctcaacagtttgaatgacaaggtattatagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttatgagt 362171  T
Q  353 catgaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
        || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  362170 gtacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacat 362111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 341
Target Start/End: Original strand, 44431492 - 44431606
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    |||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44431492 tgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 44431591  T
Q  327 gcatgagccctcaac 341  Q
    |||| ||||||||||    
T  44431592 gcataagccctcaac 44431606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Original strand, 363614 - 363727
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  363614 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcagtccag 363713  T
Q  326 ggcatgagccctca 339  Q
    ||||| ||||||||    
T  363714 ggcataagccctca 363727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22434778 - 22434599
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22434778 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaaca 22434680  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac 302  Q
    | ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22434679 gtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 22434599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44523319 - 44523200
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  44523319 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattcca 44523221  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44523220 gggcatgagccctcaacagtt 44523200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 410
Target Start/End: Original strand, 363614 - 363839
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  363614 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcagtcca 363712  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagc 382  Q
    |||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||    
T  363713 gggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc-accgctttatgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagc 363811  T
Q  383 atacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  363812 atacaactcaactacgacaacgacaaca 363839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22059883 - 22059764
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||| | |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22059883 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagctgaatgacaaagcattccag 22059784  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  22059783 ggcataagccatcaacagtt 22059764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Original strand, 43111909 - 43112066
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| || ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  43111909 ttgaatgactaagcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 43112007  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43112008 gggcataagccctcaacagttgaatgattaat-attccaaggcatgagccctcaacagtt 43112066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 362322 - 362178
Alignment:
Q  162 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  362322 attccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggtataagccctcaacagtttgaatgacaaggtattatagggcataagccctca 362223  T
Q  262 acagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362222 atag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 362178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 20459875 - 20460033
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||| |    
T  20459875 ttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcta 20459972  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  20459973 gggcataagccgtcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagtcctcaacggttt 20460033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21861758 - 21861647
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  21861758 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcagtagttgaatgacaaagcattctagg 21861659  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  21861658 gcatgagccctc 21861647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22522031 - 22521882
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||| |||||| | |||    
T  22522031 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcattcacagggcataagc 22521932  T
Q  257 cctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22521931 cctcaac-gattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagtt 22521882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22434780 - 22434599
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||    
T  22434780 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaa 22434682  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22434681 cagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 22434599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15004140 - 15004071
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15004140 agcattccagggcataagccctcaacagttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagttt 15004071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Original strand, 15267131 - 15267280
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||| |||||| | |||    
T  15267131 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagc 15267230  T
Q  257 cctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15267231 cctcaac-gattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcaacagtt 15267280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Original strand, 44431739 - 44431912
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccct 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  44431739 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccct 44431838  T
Q  338 caacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    | || | ||  |  | ||| ||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44431839 c-accgctttatgtttatgtaataaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 44431912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44523266 - 44523193
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44523266 cattccagggcatgagccctcaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatga 44523193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Original strand, 20385147 - 20385284
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattc-cagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  20385147 gggcataagccctcaacaatttgaacgaactagcattcacagggcatgagtcctcaacagtttgaatgattaacatccacaaggcatgagccctcaacag 20385246  T
Q  226 attgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  20385247 tttgaacgacaaggccttcacagggcataagccctcaa 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 19881726 - 19881846
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  19881726 ttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 19881825  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  19881826 ggcataagccgtcaacagttt 19881846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38186214 - 38186102
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca-g 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38186214 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacggttgaatgacaaagcattccagg 38186115  T
Q  326 ggcatgagccctc 338  Q
    |||||||||||||    
T  38186114 ggcatgagccctc 38186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21861745 - 21861647
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21861745 cattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcagtag-ttgaatgacaaagcattctagggcatgagccctc 21861647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 20454263 - 20454348
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20454263 ttgaatgactaagcatttcagggcataagcccctgataatttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacag-ttgaatga 20454348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Original strand, 15267118 - 15267237
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||    
T  15267118 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattc 15267217  T
Q  323 -cagggcatgagccctcaac 341  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  15267218 acagggcataagccctcaac 15267237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22434780 - 22434676
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22434780 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaac 22434681  T
Q  342 agttt 346  Q
    |||||    
T  22434680 agttt 22434676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22145880 - 22145810
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145880 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 22145810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22434780 - 22434635
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |  | | |||| ||||||||||||||||||    
T  22434780 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaa 22434682  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22434681 cagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 22434635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22522044 - 22522003
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22522044 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 22522003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44523279 - 44523183
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattcc 205  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  || ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44523279 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcc 44523183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20012297 - 20012146
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcca-gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20012297 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcaaagggcataagccctcaccgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcacca 20012199  T
Q  343 gtttcctaatcatgaaa-ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
     |||  | || ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20012198 attttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20012146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22522044 - 22521925
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||    
T  22522044 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcattc 22521945  T
Q  323 -cagggcatgagccctcaac 341  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  22521944 acagggcataagccctcaac 22521925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38186201 - 38186114
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccaggg 249  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  38186201 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaac-ggttgaatgacaaagcattccaggg 38186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15004905 - 15004830
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  15004905 ttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23647681 - 23647586
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23647681 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagagcatgagccctca 23647586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Original strand, 15267118 - 15267159
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267118 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 15267159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23647741 - 23647586
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc 204  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | | ||  | ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||  || |||||    
T  23647741 ttgaatgacaaaacattccagggcatgagcccccaccaatttgagcggttaaagcgttcacagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattc 23647642  T
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23647641 cagggcatgagccctcacca-attgaacgacaaggcgttccagagcatgagccctca 23647586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24708216 - 24708120
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24708216 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaac-ggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacag 24708120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15004894 - 15004830
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15004894 agcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22522033 - 22521961
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22522033 agcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 22521961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Original strand, 15267130 - 15267201
Alignment:
Q  278 gcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15267130 gcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 15267201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Original strand, 363843 - 363896
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363843 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 363896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20012357 - 20012202
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc 204  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| || ||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||    
T  20012357 ttgaatgacaaggcattccagggcttaagccctcaccaatttgaacgattaaagcgttcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattc 20012259  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
      ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20012258 aaagggcataagccctc-accgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 20012202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15004138 - 15004074
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15004138 cattccagggcataagccctcaacag-ttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacag 15004074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 319
Target Start/End: Original strand, 20454315 - 20454355
Alignment:
Q  279 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagca 319  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20454315 catttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagca 20454355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362217
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||  ||    
T  362336 ttgaatgactaggtattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggtataagccctcaacagtttgaatgacaaggtattatag 362237  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  362236 ggcataagccctcaatagtt 362217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15004905 - 15004830
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15004905 ttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21861584 - 21861525
Alignment:
Q  202 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21861584 ttccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21861525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 182
Target Start/End: Original strand, 363685 - 363767
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 182  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  363685 tcaacagattgaatgacaaagcagtccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 363767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24708197 - 24708120
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24708197 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacgg-ttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacag 24708120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 43111920 - 43111989
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| ||| || ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43111920 agcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 43111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Original strand, 44431916 - 44431969
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44431916 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacatatga 44431969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7301284 - 7301251
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7301284 actccccaacttggccaacatcaacaacctatga 7301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17272853 - 17272816
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaaca 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17272853 ttgaatgactaagcattccggagcataaacccccaaca 17272816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 20454303 - 20454351
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaa 237  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20454303 ttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaa 20454351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24321600 - 24321567
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24321600 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 24321567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15004139 - 15004072
Alignment:
Q  239 gcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15004139 gcattccagggcataagccctcaacag-ttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagtt 15004072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 240
Target Start/End: Original strand, 22616614 - 22616690
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc 240  Q
    |||||||| | |||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  22616614 cagggcataacccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggc 22616690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 407
Target Start/End: Original strand, 43112124 - 43112172
Alignment:
Q  360 ggactccactt-gtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 407  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43112124 ggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaaca 43112172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 116)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 33848481 - 33848851
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33848481 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 33848579  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttg 307  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848580 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttg 33848678  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848679 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 33848778  T
Q  408 acataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848779 acataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 33848851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Original strand, 4170557 - 4170955
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170557 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaaaattccagggcatgagccctcaacagattg 4170656  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4170657 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 4170755  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170756 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 4170855  T
Q  390 tcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4170856 tcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 4170955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Original strand, 14698249 - 14698647
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698249 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 14698348  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14698349 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 14698447  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698448 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagattcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 14698547  T
Q  390 tcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14698548 tcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 14698647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 136 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31117550 - 31117209
Alignment:
Q  136 agcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  31117550 agcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgac 31117452  T
Q  236 aaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 335  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117451 gag-cattccagggcatgagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 31117354  T
Q  336 ctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcata 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117353 ctcaacagttccctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcata 31117254  T
Q  436 ataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117253 ataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 31117209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 55503222 - 55502904
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55503222 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 55503123  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503122 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 55503024  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503023 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttgg 55502924  T
Q  461 tcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55502923 tcaacatcaacaacctatga 55502904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16278653 - 16278282
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  16278653 ttgaatgacaaagcattccggagcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 16278554  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278553 gggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 16278456  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16278455 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaac 16278356  T
Q  407 aacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278355 aacataggcaacgacaacgatcttgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16278282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Original strand, 16359168 - 16359449
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16359168 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccct 16359266  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359267 caacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 16359365  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359366 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16359449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 41791201 - 41791601
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccgggg-cataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791201 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccgggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagat 41791300  T
Q  189 tgaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  41791301 tgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 41791398  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41791399 gggcataagccctcatcggttgaatgacga-gcgttccaaggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacata 41791497  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 476  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41791498 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacctggtcaacatcaacaacct 41791597  T
Q  477 atga 480  Q
    ||||    
T  41791598 atga 41791601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15280551 - 15280257
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15280551 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 15280453  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15280452 gggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 15280354  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280353 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 15280257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 28382475 - 28382769
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  28382475 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 28382573  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382574 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagttttctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 28382672  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28382673 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 28382769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 207 - 480
Target Start/End: Original strand, 286760 - 287035
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  286760 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 286859  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  286860 tgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 286958  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  286959 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 287035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 112 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15242648 - 15242333
Alignment:
Q  112 aatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac--attccaggg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||||    
T  15242648 aatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccaggg 15242549  T
Q  210 catgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttga 308  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  15242548 cataagccctcaacag-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttaa 15242451  T
Q  309 atgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa-ggactccactt-gtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15242450 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-cctaatcataaaatggacttaactttgtgtatatcagcatataactcaactacgacaacgac 15242353  T
Q  407 aacataggtgacgacaacga 426  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  15242352 aacataggcaacgacaacga 15242333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 180 - 480
Target Start/End: Original strand, 10313358 - 10313660
Alignment:
Q  180 tcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag 278  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  10313358 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag-catcccagggcatgagccctcaacgg-ttgaatgacaag 10313455  T
Q  279 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtata 377  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10313456 cattccagagcacaagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 10313555  T
Q  378 tcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10313556 tcagcatacaattcaactacgacagcgacaacataggcaacaacaacgaccgtgtataataactatgactcactcctcaacttggtcaacatcaacaacc 10313655  T
Q  476 tatga 480  Q
    |||||    
T  10313656 tatga 10313660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 47127256 - 47127000
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| | |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47127256 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattcca 47127157  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaac 424  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47127156 gggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaac 47127058  T
Q  425 gatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || |||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47127057 gaccgtgcataataactatgactcactctccaacttgatcaacatcaacaacctatga 47127000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 426
Target Start/End: Original strand, 6511376 - 6511713
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6511376 tggtactattttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcataatcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcacgagccctcaacagttt 6511475  T
Q  190 gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6511476 gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagg 6511573  T
Q  288 gcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcat-gaaaggactccac-ttgtgtatatcagcat 384  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || |||||| || |||||||||||| |||    
T  6511574 gcataagccctcaacaatttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaacat 6511671  T
Q  385 acaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacga 426  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||   ||||||||||    
T  6511672 acaactcaactacatcaacgacaacgtagacaacgacaacga 6511713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14942817 - 14942621
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  14942817 ttgaatgactaagcattcaggtgcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataaacattctagg 14942718  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14942717 gcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 14942621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 53388149 - 53387899
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53388149 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 53388050  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaac 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |    
T  53388049 gggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacatc 53387950  T
Q  425 gatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 472  Q
    ||  ||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53387949 gactgtgcataataacttatgactcactccccaacttggccaacatcaaca 53387899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55503253 - 55503039
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503253 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 55503154  T
Q  191 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccaggg 288  Q
    |||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  55503153 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccaggg 55503057  T
Q  289 catgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55503056 catgagccctcaacagtt 55503039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16278771 - 16278536
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  16278771 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattcca 16278673  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag- 304  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  16278672 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccggagcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagt 16278574  T
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278573 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 16278536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 27027547 - 27027792
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  27027547 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 27027646  T
Q  208 ------ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctca 300  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  27027647 ggcataggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa-acatttcagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 27027745  T
Q  301 acagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||  ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27027746 acgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaacagttt 27027792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 16359115 - 16359313
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  16359115 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 16359214  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359215 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagt 16359312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56116338 - 56116105
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||    
T  56116338 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagtgcatgagccctcaacagattgaacgacaaggcattccag 56116239  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag-t 305  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  56116238 ggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagat 56116141  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  56116140 tgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaac 56116105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 265
Target Start/End: Original strand, 10313347 - 10313521
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  10313347 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagcatcccagggcatgagccctcaac-ggtt 10313445  T
Q  190 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||||  | |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10313446 gaatgacaagcattccagagcacaagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 10313521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 56116149 - 56115837
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    |||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  56116149 tcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaag 56116051  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  56116050 cattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagagcataagccct 56115951  T
Q  299 caacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaact 395  Q
    || || || ||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  |  | ||| || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  56115950 caccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc-accgctttatgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaact 56115852  T
Q  396 acgacaacaacaaca 410  Q
    |||||||| ||||||    
T  56115851 acgacaacgacaaca 56115837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 15989835 - 15990076
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-----catt 203  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||     ||||    
T  15989835 ttgaatgacaaagcattctagggtataagtcctcaacaatt-gaatgataaacatttcagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatccatt 15989933  T
Q  204 ccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  15989934 ccagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaaca 15990032  T
Q  304 gtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15990033 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 15990076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9388520 - 9388293
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  9388520 cattccggggcataagcccccaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 9388423  T
Q  300 aacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||            | || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9388422 aacagttgaatgacaaagcattccatggcataagc------------catagtcatgaaagaactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacga 9388335  T
Q  400 caacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataact 441  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  9388334 caacgacaacataggcaacgacaacaaccgtgcataataact 9388293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 302
Target Start/End: Original strand, 15989930 - 15990111
Alignment:
Q  122 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15989930 cattccagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaacattccagggcatgagccctc 15990028  T
Q  221 aacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15990029 aacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaac 15990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 56116166 - 56115949
Alignment:
Q  124 ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 222  Q
    |||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56116166 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcataagccctcaa 56116068  T
Q  223 cagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56116067 cagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcat 56115968  T
Q  321 tccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  56115967 tccagagcataagccctca 56115949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 56116267 - 56116029
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-a 199  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  |      
T  56116267 tcaacagattgaacgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaccaatttgaacgacaagg 56116169  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  56116168 cgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagggcataagccctc 56116070  T
Q  300 aacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56116069 aacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 56116029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14942795 - 14942555
Alignment:
Q  170 gcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattg 269  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  14942795 gcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataaa-cattctagggcatgagccctcaatagtttg 14942697  T
Q  270 aatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactcca 367  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || || ||| |    
T  14942696 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatgggctcaa 14942599  T
Q  368 c-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14942598 ctttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacgacaaca 14942555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56116246 - 56116065
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  56116246 cattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc 56116148  T
Q  261 aacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  56116147 aacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacag 56116065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15280570 - 15280395
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  15280570 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacag-t 15280472  T
Q  189 tgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15280471 tgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacag 15280395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Original strand, 15989757 - 15989997
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  || ||||| ||    
T  15989757 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataagcattccagggcatgagccttcaatag-ttgaatgacaaagcattctag 15989855  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-----gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    || || || |||||||| ||||||||| ||  |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |      ||||||||||||| | ||||||||    
T  15989856 ggtataagtcctcaaca-attgaatgataa-acatttcagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatccattccagggcataaaccctcaac 15989953  T
Q  303 a-gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15989954 atttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 15989997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56116325 - 56116143
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  56116325 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagtgcatgagccctcaacagattgaacgacaaggcattccagggcataagccctc 56116226  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  56116225 aac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacag 56116143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 28382475 - 28382631
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  28382475 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 28382573  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  28382574 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 28382631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 286740 - 286900
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||    
T  286740 ttgaatgactaagtatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattcca 286839  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  286840 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagatt 286900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 263
Target Start/End: Original strand, 15989960 - 15990111
Alignment:
Q  112 aatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggc 210  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  15989960 aatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggc 15990058  T
Q  211 atgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15990059 ataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaac 15990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15448550 - 15448344
Alignment:
Q  187 attgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||  | ||||| ||    
T  15448550 attgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-cttgaatgattaacattctag 15448452  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcat 384  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  ||| || |||||| || |||||||||||| |||    
T  15448451 ggcatgtgccctcaacaattgaatgattaa-cattccagagcatgagcccttaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacat 15448354  T
Q  385 acaactcaac 394  Q
    ||||||||||    
T  15448353 acaactcaac 15448344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33684985 - 33684861
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatt 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  33684985 ttttcaacatgttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgaca 33684887  T
Q  198 aa-cattccagggcatgagccctcaa 222  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  33684886 aagcattccagggcataagccctcaa 33684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Original strand, 15989930 - 15990116
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  || |||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  15989930 cattccagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaa-cattccagggcatgagccct 15990027  T
Q  260 caacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15990028 caacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaacggttt 15990116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24047943 - 24047832
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  24047943 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccag 24047845  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  24047844 ggcatgagccctc 24047832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9388533 - 9388398
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9388533 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 9388436  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9388435 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 9388398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449758
Alignment:
Q  177 ccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg 276  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||      
T  15449882 ccctcaaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatag-ttgaatgatt 15449785  T
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaaca 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  15449784 aacattccagggcatgagccctcaaca 15449758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31117525 - 31117344
Alignment:
Q  122 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctca 221  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31117525 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 31117427  T
Q  222 acagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    || | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117426 ac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 31117344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47127256 - 47127135
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattcca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  47127256 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattcca 47127157  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagatt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  47127156 gggcataagccctcaacagatt 47127135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 53388149 - 53388033
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  53388149 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 53388050  T
Q  207 gggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  53388049 gggcatgagccctcaac 53388033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21190191 - 21190072
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21190191 ttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaa-cattccag 21190093  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21190092 ggcatgagccctcaatagttt 21190072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21190178 - 21190073
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21190178 cattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgataaacattccagggcatgagccctc 21190080  T
Q  300 aacagtt 306  Q
    || ||||    
T  21190079 aatagtt 21190073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33684974 - 33684856
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33684974 ttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 33684875  T
Q  327 gcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  33684874 gcataagccctcaatagtt 33684856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 304
Target Start/End: Original strand, 286760 - 286897
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacaga 266  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||     
T  286760 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag- 286858  T
Q  267 ttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  286859 ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 286897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21190191 - 21190078
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21190191 ttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgataaacattccag 21190093  T
Q  208 ggcatgagccctcaa 222  Q
    |||||||||||||||    
T  21190092 ggcatgagccctcaa 21190078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 13881366 - 13881486
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13881366 ttgaatgactaagcaatctagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgacaaagcattccag 13881465  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13881466 agcatgagccctcaacagttt 13881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16278535 - 16278421
Alignment:
Q  108 attgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  16278535 attgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 16278438  T
Q  207 gggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  16278437 gggcatgagccctcaac 16278421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 53388149 - 53388033
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  53388149 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 53388050  T
Q  286 gggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||||||||||||||    
T  53388049 gggcatgagccctcaac 53388033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 13877707 - 13877858
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||| | ||||||||    
T  13877707 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaacgg-ttgaatgacaaagcattcca 13877805  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13877806 g--------ccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 13877858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15448509 - 15448396
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccaggg 209  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15448509 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-acttgaatgattaacattctagggcatgtgccctcaaca-attgaatgattaacattccagag 15448412  T
Q  210 catgagccctcaacag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  15448411 catgagcccttaacag 15448396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 265
Target Start/End: Original strand, 3336976 - 3337066
Alignment:
Q  175 agccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3336976 agcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 3337066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15242580 - 15242417
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta- 198  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  15242580 tcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaag 15242482  T
Q  199 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
     ||||||||||||| |||||||||| | || |||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15242481 gcattccagggcataagccctcaac-ggttaaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 15242417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47127256 - 47127138
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  47127256 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattcca 47127157  T
Q  286 gggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  47127156 gggcataagccctcaacag 47127138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 3336973 - 3337066
Alignment:
Q  133 ataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3336973 ataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 3337066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20899823 - 20899754
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20899823 agcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttt 20899754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33684961 - 33684861
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  33684961 cattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 33684863  T
Q  261 aa 262  Q
    ||    
T  33684862 aa 33684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15449860 - 15449758
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15449860 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 15449762  T
Q  339 aaca 342  Q
    ||||    
T  15449761 aaca 15449758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24047943 - 24047832
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||  |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24047943 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagg 24047844  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  24047843 gcatgagccctc 24047832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24047923 - 24047832
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24047923 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 24047832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9388533 - 9388416
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  9388533 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 9388436  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9388435 ggcatgagccctcaacagtt 9388416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 13881385 - 13881485
Alignment:
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13881385 agggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa-tggttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacag 13881483  T
Q  305 tt 306  Q
    ||    
T  13881484 tt 13881485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Original strand, 3336976 - 3337068
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3336976 agcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 3337068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 3337103 - 3337167
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3337103 cattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggtatgagccctcaacag 3337167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47127203 - 47127135
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47127203 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagatt 47127135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Original strand, 3337090 - 3337169
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3337090 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggtatgagccctcaacagtt 3337169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15448549 - 15448394
Alignment:
Q  149 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  ||||| ||    
T  15448549 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-cttgaatgatta-acattctag 15448452  T
Q  248 ggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15448451 ggcatgtgccctcaaca-attgaatgattaacattccagagcatgagcccttaacagtt 15448394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449793
Alignment:
Q  256 ccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15449882 ccctcaaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagtt 15449793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 3337090 - 3337167
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3337090 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggtatgagccctcaacag 3337167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15449872 - 15449758
Alignment:
Q  149 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| || |||||| || ||||||||  |  ||||||||    
T  15449872 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatag-ttgaatgatta-acattccag 15449775  T
Q  248 ggcgtgagccctcaaca 264  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15449774 ggcatgagccctcaaca 15449758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 3337001 - 3337072
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaat 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3337001 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaat 3337072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 13881366 - 13881483
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||  || |||||||    
T  13881366 ttgaatgactaagcaatctagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa-tggttgaatgacaaagcattcca 13881464  T
Q  207 gggcatgagccctcaacag 225  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13881465 gagcatgagccctcaacag 13881483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 16359126 - 16359196
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359126 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 16359196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31131863 - 31131813
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccc 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131863 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccc 31131813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 8710551 - 8710652
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  8710551 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 8710650  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  8710651 ca 8710652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 15990035 - 15990111
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaac 184  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15990035 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaac 15990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 13877707 - 13877853
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||  || ||||||     
T  13877707 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaac-ggttgaatgacaaagcattcc- 13877804  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
           |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13877805 -------agccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 13877853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Original strand, 18079574 - 18079676
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-catt-ccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  18079574 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaacagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaa 18079673  T
Q  263 cag 265  Q
    |||    
T  18079674 cag 18079676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Original strand, 18221103 - 18221149
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18221103 ttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 18221149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4616164 - 4616084
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 244  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  4616164 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagaattcacagggcatgagccctcaaaaatttgaatgataaggcattc 4616084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaac 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 410
Target Start/End: Original strand, 3337090 - 3337235
Alignment:
Q  267 ttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggac 363  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| || ||||    
T  3337090 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggtatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggac 3337187  T
Q  364 tccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    || || |||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||    
T  3337188 tcaactttgtgtatatcaacatatagctcaactacaactacaacaaca 3337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449832
Alignment:
Q  295 ccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15449882 ccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 15449832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 10704514 - 10704572
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10704514 gggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10704572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 10918284 - 10918342
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10918284 gggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10918342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15417025 - 15416935
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaa 340  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15417025 agccctcaacatattgaatgaactagcattcacagggcatgaaccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgaaccctcaa 15416935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 56115833 - 56115780
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56115833 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 56115780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 18079533 - 18079638
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  18079533 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaa 18079632  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  18079633 cagttt 18079638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20899835 - 20899794
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20899835 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagtt 20899794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 200
Target Start/End: Original strand, 3336989 - 3337079
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac 200  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  3336989 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaataattaac 3337079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Original strand, 10704512 - 10704572
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10704512 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10704572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Original strand, 10918282 - 10918342
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10918282 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10918342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 18079533 - 18079677
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc-agggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||| | | | |||||||||||    
T  18079533 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaa 18079632  T
Q  263 cagattgaatgac-gagcattc-cagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||| ||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18079633 cagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaacagt 18079677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 10704501 - 10704572
Alignment:
Q  274 acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10704501 acgagcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10704572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 10918271 - 10918342
Alignment:
Q  274 acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10918271 acgagcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10918342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Original strand, 15075301 - 15075498
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || || |||||| | ||||||| |||||| | |||    
T  15075301 cattccagggcatgagccctcactaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-atggaatgaactagcattcacagggcgtaagc 15075399  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaagga-ctccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||  || ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| || |||  | || ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15075400 cctctgcaattgaacgacgaggcgttccagggcatgagccctcaccaattta-tgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 15075498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20899821 - 20899759
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20899821 cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 13877706 - 13877744
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13877706 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 13877744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21190192 - 21190154
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21190192 gttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaaca 21190154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4616175 - 4616106
Alignment:
Q  274 acgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4616175 acgagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagaattcacagggcatgagccctcaa 4616106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 405
Target Start/End: Original strand, 13887713 - 13887758
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  13887713 ggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacaacaacaa 13887758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16147763 - 16147730
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16147763 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 16147730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 32489754 - 32489854
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32489754 cagggcataagccctcaac-gattgaatgaactagcactcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcataagccctcaa 32489852  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  32489853 ca 32489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 8710553 - 8710621
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8710553 gggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatga 8710621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 397
Target Start/End: Original strand, 14048379 - 14048415
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14048379 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaactac 14048415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Original strand, 15318099 - 15318146
Alignment:
Q  362 actccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  15318099 actccacttgtgtatatcaatatacaactcaactacaac-acaacaaca 15318146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15416993 - 15416917
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc 240  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||    
T  15416993 cagggcatgaaccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgaaccctcaatggtttgaacgacaaggc 15416917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24047802 - 24047750
Alignment:
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24047802 ggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 24047750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Original strand, 32489794 - 32489854
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-catt-ccagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  32489794 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcataagccctcaaca 32489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 141)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21743873 - 21743475
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743873 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 21743774  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21743773 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 21743675  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743674 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 21743575  T
Q  390 tcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21743574 tcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 21743475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 124666 - 124348
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  124666 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 124567  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124566 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 124468  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124467 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttgg 124368  T
Q  461 tcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  124367 tcaacatcaacaacctatga 124348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13396013 - 13395639
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  13396013 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 13395914  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13395913 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 13395815  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13395814 tgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 13395716  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13395715 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 13395639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 38827779 - 38828176
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38827779 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gat 38827877  T
Q  189 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38827878 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagg 38827977  T
Q  288 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 387  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827978 gcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag-ttcctaattatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 38828075  T
Q  388 actcaactacgacaacaacaacataggtgacg------acaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatg 479  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  |||      |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828076 actcaactacgacaacgacaacatgggcaacgacaaccacaacgatggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatg 38828175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 4993040 - 4993430
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993040 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccttggcataagccccctacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 4993139  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    ||||||||||||||||||||||| | || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||    
T  4993140 gaatgacaaggcaattccagggcatgagccctcaacgg-ttcaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggcaaggcattccag 4993237  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4993238 ggcataagccctcaatggttgaatgattaat-attccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 4993336  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993337 aactcaactacgacagcaacatcttaggcaacgacaacgatcgtgcatattaactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 4993430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 48784887 - 48785258
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  48784887 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 48784984  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48784985 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 48785082  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48785083 tgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 48785181  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48785182 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 48785258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 480
Target Start/End: Original strand, 8775968 - 8776292
Alignment:
Q  163 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8775968 ttccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa 8776066  T
Q  263 cagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaagg 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8776067 cag-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagattgaatggcga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaagg 8776164  T
Q  362 actccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccc 452  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||        ||||||||||  ||| ||||||||   | ||| ||||||    
T  8776165 actcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgaataataacttatgacttactccc 8776264  T
Q  453 caacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776265 caacttggtcaacatcaacaacctatga 8776292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13733995 - 13733707
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  13733995 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgacatagtattcca 13733897  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13733896 gggcatgagccctcaacgattgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 13733798  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||      ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733797 caactcaactacg------acaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 13733707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 102 - 480
Target Start/End: Original strand, 16005961 - 16006347
Alignment:
Q  102 caacacattgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |      
T  16005961 caacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagg 16006059  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16006060 cattccagggtataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 16006157  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16006158 caacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacg 16006256  T
Q  399 acaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16006257 acaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacttatga 16006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13850153 - 13849916
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  13850153 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 13850054  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-tt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13850053 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaatag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttt 13849955  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13849954 gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 13849916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Original strand, 48784847 - 48785083
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  48784847 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 48784945  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48784946 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 48785043  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48785044 tgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 48785083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Original strand, 8775855 - 8776107
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8775855 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaatagattg 8775954  T
Q  191 aatgatta-aca-ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagg 287  Q
    |||||  |  || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  8775955 aatgacaaggcagttccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 8776052  T
Q  288 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776053 gcataagccctcaacagttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 8776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 17506241 - 17505966
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||||||| | ||||||| || | | |||||     
T  17506241 cattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacgg-ttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccc 17506144  T
Q  299 caacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17506143 caacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 17506044  T
Q  398 gacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 472  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17506043 gacaacgacaacataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaaca 17505966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 472
Target Start/End: Original strand, 17546973 - 17547248
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||||||| | ||||||| || | | |||||     
T  17546973 cattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacgg-ttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccc 17547070  T
Q  299 caacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17547071 caacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 17547170  T
Q  398 gacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 472  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547171 gacaacgacaacataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaaca 17547248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 124697 - 124483
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124697 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 124598  T
Q  191 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccaggg 288  Q
    |||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  124597 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccaggg 124501  T
Q  289 catgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||||    
T  124500 catgagccctcaacagtt 124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 411
Target Start/End: Original strand, 16573090 - 16573392
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  16573090 ttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataaacattccaggacatgagccatcaacggtttgaatgacaaagcattccag 16573189  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttg 307  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16573190 ggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggtataagccctcaacagttg 16573288  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcat-gaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||  |||  ||  || |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16573289 aatgattaa-cattccagggcatgagccatcaacaattt-ataagtatacaatggactcgactttatgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaa 16573386  T
Q  406 caacat 411  Q
    ||||||    
T  16573387 caacat 16573392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16592572 - 16592270
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  16592572 ttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataaacattccaggacatgagccatcaacggtttgaatgacaaagcattccag 16592473  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttg 307  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16592472 ggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggtataagccctcaacagttg 16592374  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcat-gaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||  |||  ||  || |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16592373 aatgattaa-cattccagggcatgagccatcaacaattt-ataagtatacaatggactcgactttatgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaa 16592276  T
Q  406 caacat 411  Q
    ||||||    
T  16592275 caacat 16592270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 342
Target Start/End: Original strand, 16005870 - 16006122
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16005870 tggtactattttcaacacattgaatgactaaacattccggggcataagctcccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagcccccaacagatt 16005969  T
Q  190 gaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  16005970 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 16006067  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    || || |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  16006068 ggtataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 16006122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 15725455 - 15725622
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725455 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaaagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 15725554  T
Q  343 gtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15725555 gtt-cctaattatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacat 15725622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14189508 - 14189273
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  14189508 ttgaatgactaggcgttccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccttcaac-ggttgaatgacaaagcattccag 14189410  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  14189409 ggcataagccctcaaaag-ttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataatccctcaacaatt 14189311  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14189310 gaatgataaa-cattctagggcatg-gccctcaacggttt 14189273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13850140 - 13849955
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13850140 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 13850041  T
Q  261 aacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13850040 aacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaatagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 13849955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 342
Target Start/End: Original strand, 13255644 - 13255820
Alignment:
Q  163 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  13255644 ttcccgggcatgagccctcacca-attgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaa 13255741  T
Q  263 cagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13255742 ca-attgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagcactcaaca 13255820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 345
Target Start/End: Original strand, 8775886 - 8776071
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggca-ttccagggcgtgagccct 259  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  8775886 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaatagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccct 8775985  T
Q  260 caacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8775986 caac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 8776071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14192263 - 14192072
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||    
T  14192263 ttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccggggcataagccctcaccag-ttgaatgacaaggcattccag 14192165  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  14192164 ggcataagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcaac 14192072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13734014 - 13733839
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13734014 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gat 13733916  T
Q  189 tgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13733915 tgaatgacatagtattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacag 13733839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 302
Target Start/End: Original strand, 8775951 - 8776144
Alignment:
Q  108 attgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcc 205  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||    
T  8775951 attgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 8776049  T
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776050 agggcataagccctcaacag-ttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagattgaatggcgagcattccagggcatgagccctcaac 8776144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13850113 - 13849811
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  || || |    
T  13850113 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatcta 13850015  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13850014 gggcataagccctcaatag-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 13849917  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaaca 404  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  13849916 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttatgagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactaaaacaaca 13849818  T
Q  405 acaacat 411  Q
    |||||||    
T  13849817 acaacat 13849811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 403
Target Start/End: Original strand, 35365939 - 35366113
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  35365939 ttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccag-ttgaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 35366036  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366037 ggcatgagccctcaacagtt-cctaatcataaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 35366113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17506294 - 17506100
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  17506294 ttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattcca 17506196  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17506195 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17506100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 17546920 - 17547114
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  17546920 ttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaagcattcca 17547018  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17547019 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17547114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14192250 - 14192067
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14192250 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccggggcataagccctcaccag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 14192152  T
Q  261 aacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||| | ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14192151 aacgg-ttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 14192067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7507759 - 7507533
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  7507759 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaaca 7507660  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcat 320  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||    
T  7507659 gtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtat 7507560  T
Q  321 tc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  7507559 tcacagggcatgaaccctcaacagttt 7507533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065462
Alignment:
Q  162 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  21065600 attccatggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctca 21065502  T
Q  262 acagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctca 300  Q
     ||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  21065501 ccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 13255430 - 13255541
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  13255430 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataaacattccagggcataagccttcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 13255528  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  13255529 ggcatgagccctc 13255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Original strand, 13255604 - 13255743
Alignment:
Q  202 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaa 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  13255604 ttccaggtcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttcccgggcatgagccctcacca-attgaatgataaacattccagggcataagccctcaa 13255702  T
Q  302 cagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13255703 cagttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaaca 13255743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 711096 - 711009
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  711096 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagtgcatgagccctcaacaatttgaatgat 711009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47976108 - 47976002
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  47976108 ttgaattactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcatgagtcctcaacag-ttgaacgattaacatttcagg 47976010  T
Q  209 gcatgagc 216  Q
     |||||||    
T  47976009 acatgagc 47976002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 16458907 - 16459021
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  16458907 ttgaataactaagcattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataaccattccagg 16459006  T
Q  209 gcatgagccctcaac 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  16459007 gcataagccctcaac 16459021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 48743296 - 48743401
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  48743296 cattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattccagggcataagccctcaaca-attgaatgattaacattccagggcatgagccctc 48743394  T
Q  300 aacagtt 306  Q
    |||||||    
T  48743395 aacagtt 48743401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 346
Target Start/End: Original strand, 48743284 - 48743402
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  48743284 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaa-cattccagg 48743382  T
Q  327 gcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48743383 gcatgagccctcaacagttt 48743402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 16458920 - 16459056
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | |||||||    
T  16458920 cattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataa-ccattccagggcataagccctc 16459018  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    ||| | ||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  16459019 aac-ggttgaatgattaacattctagggcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 339
Target Start/End: Original strand, 11660775 - 11660956
Alignment:
Q  159 aacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccc 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11660775 aacattccagggcataagccctaaaca-attgaatgataaacattccagggcataagctctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccc 11660872  T
Q  259 tcaacaga-ttgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||  | || |||||||     ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11660873 tc-ccggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 11660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21065575 - 21065462
Alignment:
Q  149 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||    
T  21065575 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccag 21065476  T
Q  248 ggcgtgagccctca 261  Q
    ||| ||||||||||    
T  21065475 ggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 48743233 - 48743399
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgat 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  48743233 ttttcaacatgttgaatgactaagcattctggggcataag-ccccaacaatctgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatgac 48743331  T
Q  197 ta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
     |   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48743332 aagggattccagggcataagccctcaaca-attgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 48743399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 13255430 - 13255541
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255430 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataaacattccagggcataagccttcaacagttgaatgacaaagcattccagg 13255529  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  13255530 gcatgagccctc 13255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21519411 - 21519211
Alignment:
Q  199 acattccagggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  21519411 acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataag 21519314  T
Q  295 ccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaa 393  Q
    |||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21519313 ccctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctctccagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaa 21519215  T
Q  394 ctac 397  Q
    ||||    
T  21519214 ctac 21519211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40555998 - 40555751
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc 204  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  40555998 ttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgatccctcaacaatttgaatgattaagcattc 40555899  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctca 300  Q
     || ||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||   ||||||| || ||||||||||||||    
T  40555898 acatggcatggaccctcaacaatttgaatgacaagacattcacagggcatgaaccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctca 40555799  T
Q  301 ac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    || | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  40555798 acaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggttt 40555751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Original strand, 13255644 - 13255825
Alignment:
Q  124 ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaa 222  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   || ||||||||||||| |||||||||    
T  13255644 ttcccgggcatgagccctcaccaatt-gaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaa 13255741  T
Q  223 cagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagttga 308  Q
    || ||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  13255742 ca-attgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagcactcaacaattga 13255825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709606
Alignment:
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaaca-attgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 709606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21065563 - 21065462
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccct 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21065563 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccct 21065464  T
Q  338 ca 339  Q
    ||    
T  21065463 ca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 345
Target Start/End: Original strand, 13255644 - 13255784
Alignment:
Q  202 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctca 300  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||    
T  13255644 ttcccgggcatgagccctcacca-attgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgccaaagcattccagggcataagccctca 13255740  T
Q  301 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13255741 acaattgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagtt 13255784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 11660764 - 11660874
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11660764 ttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaaca-attgaatgataaacattccagggcataagctctcaacaattgaatgacaaagcattccagg 11660862  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  11660863 gcatgagccctc 11660874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14192263 - 14192149
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14192263 ttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccggggcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagg 14192164  T
Q  327 gcatgagccctcaac 341  Q
    |||| ||||||||||    
T  14192163 gcataagccctcaac 14192149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 709779 - 709647
Alignment:
Q  198 aacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||             ||||||||||    
T  709779 aacattccagggcatgagccctcaacagtttaaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagtttgaatga-------------gcatgagccc 709693  T
Q  298 tcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  709692 tcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaaca 709647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7507636 - 7507496
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  7507636 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaaca 7507537  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  7507536 gtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7507496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 11660764 - 11660874
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  11660764 ttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaa-ttgaatgataaacattccagggcataagctctcaaca-attgaatgacaaagcattccag 11660861  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  11660862 ggcatgagccctc 11660874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 13255706 - 13255820
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  13255706 ttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaacaa-ttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 13255803  T
Q  208 ggcatgagccctcaaca 224  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  13255804 ggcataagcactcaaca 13255820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17506294 - 17506182
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17506294 ttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattccag 17506195  T
Q  326 ggcatgagccctc 338  Q
    ||||| |||||||    
T  17506194 ggcataagccctc 17506182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 17546920 - 17547032
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17546920 ttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattccag 17547019  T
Q  326 ggcatgagccctc 338  Q
    ||||| |||||||    
T  17547020 ggcataagccctc 17547032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 709670 - 709608
Alignment:
Q  162 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  709670 attccagggcataagccctcaaca-attgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 709608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Original strand, 13255443 - 13255541
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13255443 cattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataaacattccagggcataagccttcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 13255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 709779 - 709605
Alignment:
Q  159 aacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||              || ||||||    
T  709779 aacattccagggcatgagccctcaacagtttaaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagtttgaatga--------------gcatgagcc 709694  T
Q  258 ctcaacagattgaatgacgagca-ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||  ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  709693 ctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 709605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 16458920 - 16459056
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  16458920 cattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataaccattccagggcataagccctc 16459018  T
Q  300 aacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  16459019 aacggttgaatgattaa-cattctagggcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 397
Target Start/End: Original strand, 15689878 - 15690081
Alignment:
Q  199 acattccagggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgag 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||| ||    
T  15689878 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac-ggttgaatgaactagcattcacagggcataag 15689976  T
Q  295 ccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactc 391  Q
    ||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||  | || ||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15689977 ccctcaacgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaacaattt-atgattatgcaatggactccactttgtgtatatcaacatacaactc 15690075  T
Q  392 aactac 397  Q
    ||||||    
T  15690076 aactac 15690081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 397
Target Start/End: Original strand, 15697471 - 15697674
Alignment:
Q  199 acattccagggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgag 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||| ||    
T  15697471 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac-ggttgaatgaactagcattcacagggcataag 15697569  T
Q  295 ccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactc 391  Q
    ||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||  | || ||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15697570 ccctcaacgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaacaattt-atgattatgcaatggactccactttgtgtatatcaacatacaactc 15697668  T
Q  392 aactac 397  Q
    ||||||    
T  15697669 aactac 15697674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7507761 - 7507574
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||| |||||| ||| |||||||    
T  7507761 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaa 7507662  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||| ||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7507661 cagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 7507574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065502
Alignment:
Q  241 attccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21065600 attccatggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctca 21065502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 709684 - 709608
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  709684 ttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 709608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Original strand, 15725455 - 15725555
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15725455 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaaag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 15725553  T
Q  264 ag 265  Q
    ||    
T  15725554 ag 15725555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 35365939 - 35366054
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || || ||||||  |  ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35365939 ttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccagtt-gaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 35366036  T
Q  208 ggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35366037 ggcatgagccctcaacag 35366054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15731902 - 15731802
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15731902 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 15731803  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  15731802 g 15731802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Original strand, 15689866 - 15689984
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||     
T  15689866 ttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttgaatgaactagcattca 15689965  T
Q  323 cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15689966 cagggcataagccctcaac 15689984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Original strand, 15697459 - 15697577
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||     
T  15697459 ttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttgaatgaactagcattca 15697558  T
Q  323 cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15697559 cagggcataagccctcaac 15697577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15731895 - 15731733
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcct 349  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  15731895 agccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt-at 15731797  T
Q  350 aatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
     | |||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  15731796 gagcatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacatctacaacat 15731733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21519423 - 21519348
Alignment:
Q  267 ttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21519423 ttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacagttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctca 21519348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 711083 - 711010
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  711083 cattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagtgcatgagccctcaacaatttgaatga 711010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12202149 - 12202048
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  12202149 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 12202050  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  12202049 ca 12202048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 4324975 - 4325115
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4324975 gggcataagccctcaacaatttgaatcaactagcattcacagggcataagcccccaacaacttgaatgattaagcattcacagggtatgagccatcaaca 4325074  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  4325075 gtttgaatgacaatgcattcacagggcataagccctcaaca 4325115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22122797 - 22122626
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc 204  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  22122797 ttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgatccctcaacaatttgaatgattaagcattc 22122698  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
     || ||||||  |||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  22122697 acatggcatggaccctcaacaatttgaatgacaanacattcacagggcatgaaccctcaacaatttgaatga 22122626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 341
Target Start/End: Original strand, 16458935 - 16459021
Alignment:
Q  255 gccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16458935 gccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataac-cattccagggcataagccctcaac 16459021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Original strand, 13407740 - 13407786
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13407740 ttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 13407786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12202189 - 12202085
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12202189 cagggcataagccctcaac-gattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaa 12202091  T
Q  341 cagttt 346  Q
    | ||||    
T  12202090 cggttt 12202085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7507679 - 7507496
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||  |  ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||    
T  7507679 cagggcatgaaccctcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaa 7507580  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||| |||||| |  | | |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  7507579 cagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7507496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 15689878 - 15689944
Alignment:
Q  160 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15689878 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac 15689944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 15697471 - 15697537
Alignment:
Q  160 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15697471 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac 15697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065538
Alignment:
Q  280 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21065600 attccatggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 21065538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21519423 - 21519309
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaat-gac-gagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  21519423 ttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 21519325  T
Q  323 cagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||| |||||||    
T  21519324 cagggcataagccctc 21519309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22122816 - 22122677
Alignment:
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaac-a 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||  ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22122816 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgatccctcaacaa 22122717  T
Q  304 gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
     ||||||||  |||||||| || ||||||  |||||||||    
T  22122716 tttgaatgattaagcattcacatggcatggaccctcaaca 22122677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40556017 - 40555878
Alignment:
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaac-a 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||  ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  40556017 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgatccctcaacaa 40555918  T
Q  304 gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
     ||||||||  |||||||| || ||||||  |||||||||    
T  40555917 tttgaatgattaagcattcacatggcatggaccctcaaca 40555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47976001 - 47975966
Alignment:
Q  190 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47976001 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 47975966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 4324897 - 4325115
Alignment:
Q  133 ataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagatt 228  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  4324897 ataagcccttaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagacctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacaattt 4324996  T
Q  229 gaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-c 323  Q
    |||| |    |||||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  4324997 gaatcaactagcattcacagggcataagcccccaacaacttgaatgattaagcattcacagggtatgagccatcaacagtttgaatgacaatgcattcac 4325096  T
Q  324 agggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4325097 agggcataagccctcaaca 4325115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21065386 - 21065333
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21065386 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 21065333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Original strand, 35366118 - 35366171
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366118 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 35366171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8757496 - 8757395
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  8757496 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaa 8757397  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  8757396 ca 8757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12208763 - 12208662
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | |||| ||||    
T  12208763 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccttcaa 12208664  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  12208663 ca 12208662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13865481 - 13865424
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 155  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13865481 ttttcaacgtatcgaatgactgagcattccggcgcatgagcccccaacaatttgaatg 13865424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15731903 - 15731802
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||    
T  15731903 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 15731804  T
Q  264 ag 265  Q
    ||    
T  15731803 ag 15731802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 42041338 - 42041371
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42041338 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 42041371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 711096 - 711020
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  711096 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagtgcatgagccctcaaca 711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21519423 - 21519383
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519423 ttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacagtt 21519383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 11660777 - 11660839
Alignment:
Q  279 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  11660777 cattccagggcataagccctaaacaattgaatgataaa-cattccagggcataagctctcaaca 11660839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Original strand, 13407835 - 13407878
Alignment:
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatg 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13407835 tgaatgacaagcattccagggcatgagcccccaacaattgaatg 13407878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13865375 - 13865332
Alignment:
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatg 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13865375 tgaatgacaagcattccagggcatgagcccccaacaattgaatg 13865332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15731903 - 15731800
Alignment:
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15731903 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 15731804  T
Q  303 agtt 306  Q
    ||||    
T  15731803 agtt 15731800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16668685 - 16668543
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcc-agggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||  ||||||| |||    
T  16668685 cattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgagctagcattcatagggcataagc 16668587  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16668586 cctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 16668543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17643055 - 17642913
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcc-agggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||  ||||||| |||    
T  17643055 cattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgagctagcattcatagggcataagc 17642957  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17642956 cctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 17642913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39995911 - 39995836
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaagg 239  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  39995911 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaagg 39995836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47976001 - 47975966
Alignment:
Q  151 gaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47976001 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 47975966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 711085 - 711020
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  711085 agcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagtgcatgagccctcaaca 711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12202189 - 12202048
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcc-agggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  12202189 cagggcataagccctcaac-gattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaa 12202091  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    | ||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  12202090 cggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 12202048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 14038580 - 14038614
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14038580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14038614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Original strand, 14038580 - 14038614
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14038580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14038614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 14348610 - 14348644
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14348610 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14348644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Original strand, 14348610 - 14348644
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14348610 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14348644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 16458918 - 16458987
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16458918 agcattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggcatgagacctcaacagttt 16458987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16668698 - 16668664
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16668698 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 16668664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16668698 - 16668664
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16668698 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 16668664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17506283 - 17506217
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17506283 agcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 17506217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 17546931 - 17546997
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17546931 agcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 17546997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17643068 - 17643034
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17643068 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17643068 - 17643034
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17643068 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21065544 - 21065462
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 182  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||||||    
T  21065544 tcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 2464491 - 2464524
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2464491 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2464524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 2966110 - 2966143
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2966110 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2966143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3858354 - 3858321
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3858354 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 3858321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 7529106 - 7529207
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||| |||||| | |||||||||    
T  7529106 cagggcataagccctcaacaattggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaatgcgttcgcagggcataagccctcaa 7529205  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  7529206 ca 7529207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8757496 - 8757395
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  8757496 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaa 8757397  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  8757396 ca 8757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10897182 - 10897149
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10897182 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 10897149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12208803 - 12208699
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12208803 cagggcataagccctcaacaaatt-aatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaa 12208705  T
Q  341 cagttt 346  Q
    | ||||    
T  12208704 cggttt 12208699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Original strand, 15689866 - 15689907
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15689866 ttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagttt 15689907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Original strand, 15697459 - 15697500
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15697459 ttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagttt 15697500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 16090208 - 16090241
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16090208 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 16090241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 260
Target Start/End: Original strand, 17065656 - 17065689
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17065656 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 17065689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 17065656 - 17065689
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17065656 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 17065689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29182041 - 29182008
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29182041 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 29182008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41783152 - 41783099
Alignment:
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41783152 ggcatgagccctcaccactttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 41783099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12757175 - 12757143
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12757175 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccc 12757143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Original strand, 16458986 - 16459056
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctc 181  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16458986 ttgaatga-taaccattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattctagggcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21519364 - 21519270
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21519364 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagccctctcca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc 21519270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39995911 - 39995847
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39995911 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 39995847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47975991 - 47975963
Alignment:
Q  318 cattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975991 cattccagggcatgagccctcaacagttt 47975963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23339713 - 23339343
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23339713 ttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 23339615  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttg 307  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339614 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttg 23339516  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23339515 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaaca 23339416  T
Q  408 acataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339415 acataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 23339343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Original strand, 31755563 - 31755881
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31755563 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 31755662  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755663 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 31755761  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755762 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaataacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttgg 31755861  T
Q  461 tcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31755862 tcaacatcaacaacctatga 31755881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Original strand, 24504305 - 24504632
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24504305 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 24504404  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504405 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 24504503  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||    
T  24504504 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactcc 24504603  T
Q  452 ccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24504604 ccaacttggtcaacatcaacaatctatga 24504632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21239696 - 21239297
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239696 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 21239597  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  21239596 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 21239499  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21239498 ggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatatcaacatac 21239400  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21239399 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaaccta 21239300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21242246 - 21241847
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21242246 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 21242147  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  21242146 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 21242049  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21242048 ggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatatcaacatac 21241950  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21241949 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaaccta 21241850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Original strand, 31503118 - 31503370
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503118 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 31503217  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31503218 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 31503316  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31503317 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 31503370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Original strand, 31505684 - 31505936
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31505684 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 31505783  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31505784 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccagggca 31505882  T
Q  291 tgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31505883 tgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 31505936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 403
Target Start/End: Original strand, 31503188 - 31503470
Alignment:
Q  122 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 220  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  31503188 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 31503287  T
Q  221 aacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc 318  Q
    ||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31503288 aacgg-ttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggc 31503385  T
Q  319 attccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503386 attccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 31503470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 403
Target Start/End: Original strand, 31505754 - 31506036
Alignment:
Q  122 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 220  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||    
T  31505754 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctc 31505853  T
Q  221 aacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc 318  Q
    ||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31505854 aacgg-ttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggc 31505951  T
Q  319 attccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31505952 attccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 31506036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 44620584 - 44620873
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  44620584 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 44620682  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620683 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 44620781  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||       |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44620782 caactcaactacgacaacgacaac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 44620873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 41685193 - 41684937
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41685193 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 41685094  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaac 424  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41685093 gggcataagccctcaacagattcctaatcat-aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaac 41684995  T
Q  425 gatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41684994 gaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacgtcaacaacctatga 41684937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25036157 - 25035944
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25036157 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gat 25036059  T
Q  189 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25036058 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagg 25035959  T
Q  288 gcatgagccctcaac 302  Q
    |||| ||||||||||    
T  25035958 gcataagccctcaac 25035944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Original strand, 31755532 - 31755746
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755532 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 31755631  T
Q  191 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccaggg 288  Q
    |||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  31755632 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccaggg 31755728  T
Q  289 catgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31755729 catgagccctcaacagtt 31755746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 24504282 - 24504488
Alignment:
Q  99 tttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta 198  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  24504282 tttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaa 24504381  T
Q  199 -acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagcc 296  Q
      |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24504382 ggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 24504478  T
Q  297 ctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||    
T  24504479 ctcaacagtt 24504488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 300
Target Start/End: Original strand, 28348691 - 28348882
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  28348691 ttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 28348790  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctca 300  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  28348791 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 28348704 - 28348882
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28348704 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 28348803  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28348804 aacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20591539 - 20591276
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  20591539 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcag 20591440  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaa------cataggtgacg 419  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||     |||    
T  20591439 ggtatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaagactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaactttttcattttcaacg 20591340  T
Q  420 acaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591339 acaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 20591276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 28352516 - 28352674
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  28352516 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccag 28352615  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    | ||| |||| ||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28352616 gacataagccatcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagatt 28352674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 23374883 - 23374999
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  23374883 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 23374981  T
Q  208 ggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23374982 ggcatgagccctcaacag 23374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 44620584 - 44620743
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  44620584 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 44620682  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44620683 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagatt 44620743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12628249 - 12628122
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgta 375  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12628249 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacgtgtgta 12628150  T
Q  376 tatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12628149 tatcagcatacaactcatctacgacaac 12628122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24274379 - 24274168
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagc-attccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||    
T  24274379 cattccagggcataagccctcaatag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcgagggcataagccct 24274281  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaacta 396  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24274280 caacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaacta 24274183  T
Q  397 cgacaacaacaacat 411  Q
    | |||||||| ||||    
T  24274182 caacaacaacgacat 24274168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25036085 - 25035944
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  25036085 cattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccct 25035988  T
Q  299 caacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25035987 caacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 25035944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25036138 - 25035982
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccag 286  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  25036138 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgattaacattccag 25036040  T
Q  287 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25036039 ggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacag 25035982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 411
Target Start/End: Original strand, 23374883 - 23375068
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374883 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 23374982  T
Q  327 gcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23374983 gcatgagccctcaacagcttatgagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacatcaacaacat 23375068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41685193 - 41685072
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  41685193 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 41685094  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagatt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  41685093 gggcataagccctcaacagatt 41685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 28352529 - 28352671
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||    
T  28352529 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccaggacataagccatc 28352628  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28352629 aacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 28352671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 342
Target Start/End: Original strand, 31518252 - 31518435
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31518252 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaa 31518351  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||   ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  31518352 cagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctaaaca 31518435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10040345 - 10040234
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  10040345 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagg 10040247  T
Q  209 gcatgagccctca 221  Q
    |||| ||||||||    
T  10040246 gcataagccctca 10040234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24274379 - 24274235
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  24274379 cattccagggcataagccctcaatag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcgagggcataagccct 24274281  T
Q  260 caacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274280 caacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 24274235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 31518254 - 31518476
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31518254 gggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaaca 31518353  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcat 320  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||   |||||    
T  31518354 gtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctaaacaatttgaatgaactagcat 31518453  T
Q  321 tc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  31518454 tcacagggcattagccctcaaca 31518476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12628279 - 12628182
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12628279 tggtactattttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 12628182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 28348691 - 28348846
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28348691 ttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 28348789  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28348790 gggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 28348846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 28348762 - 28348882
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28348762 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 28348860  T
Q  200 cattccagggcatgagccctca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  28348861 cattccagggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10040333 - 10040152
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10040333 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 10040235  T
Q  261 aac-agattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    | | |  |||||||     ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10040234 accgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10040152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24274403 - 24274273
Alignment:
Q  216 ccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgac 313  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24274403 ccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 24274305  T
Q  314 aaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    || | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24274304 aaggtattcgagggcataagccctcaacagtt 24274273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41685193 - 41685075
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41685193 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 41685094  T
Q  286 gggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  41685093 gggcataagccctcaacag 41685075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 22109449 - 22109518
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22109449 agcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 22109518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 28352516 - 28352671
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28352516 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattcca 28352614  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28352615 ggacataagccatcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 28352671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24275781 - 24275709
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24275781 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatagacattccagggcatgaaccctc 24275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 410
Target Start/End: Original strand, 22840930 - 22841143
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||  | | |||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  22840930 cattacagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctccgcggtttgaatgaactagcattcacagggcataagc 22841029  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22841030 cctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatgtcaacatacaactcaac 22841128  T
Q  395 tacgacaacaacaaca 410  Q
    ||| || |||||||||    
T  22841129 tacaac-acaacaaca 22841143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Original strand, 28348691 - 28348810
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| |  |||||| |||| | ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28348691 ttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 28348790  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  28348791 ggcataagccctcaacagtt 28348810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10040345 - 10040234
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaggg 327  Q
    |||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10040345 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaggg 10040246  T
Q  328 catgagccctca 339  Q
    ||| ||||||||    
T  10040245 cataagccctca 10040234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41685140 - 41685072
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41685140 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagatt 41685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Original strand, 28352516 - 28352635
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  28352516 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccag 28352615  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    | ||| |||| |||||||||    
T  28352616 gacataagccatcaacagtt 28352635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20591539 - 20591424
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg--atgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||  || |||| |    
T  20591539 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatg-gcattccagggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcatttc 20591442  T
Q  206 agggcatgagccctcaac 223  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20591441 agggtatgagccctcaac 20591424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 31518252 - 31518357
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31518252 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaa 31518351  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  31518352 cagttt 31518357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 23085339 - 23085442
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23085339 cagggcatgagccctcaaca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaac 23085437  T
Q  342 agttt 346  Q
    |||||    
T  23085438 agttt 23085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Original strand, 23085339 - 23085483
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |  | | |||| ||||||||||||||||||    
T  23085339 cagggcatgagccctcaaca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaa 23085436  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23085437 cagtttgaatgaaaaagcattcacagggcataagccctcaacagttt 23085483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 25651228 - 25651329
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  25651228 cagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcctagggcatgagccctcaacgggttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 25651327  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  25651328 ca 25651329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Original strand, 22840930 - 22841079
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagc 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||    |||||| |||||| | |||    
T  22840930 cattacagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctccgcggtttgaatgaactagcattcacagggcataagc 22841029  T
Q  257 cctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22841030 cctcaac-gattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagtt 22841079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12628260 - 12628182
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12628260 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 12628182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 273
Target Start/End: Original strand, 21903105 - 21903251
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  21903105 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggc--gagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaaca 21903201  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg 273  Q
    | ||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21903202 gtttgaatgactaagcattcacatggcatgagccctcaacagtttgaatg 21903251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 22109438 - 22109515
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  22109438 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 22109515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Original strand, 23085379 - 23085480
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| | |||||||||    
T  23085379 cagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattcacagggcataagccctcaa 23085477  T
Q  263 cag 265  Q
    |||    
T  23085478 cag 23085480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20353507 - 20353406
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20353507 caggacatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcatagggcataagcactcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 20353408  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  20353407 ca 20353406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 306
Target Start/End: Original strand, 23085339 - 23085482
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||    
T  23085339 cagggcatgagccctcaaca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaa 23085436  T
Q  263 cagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||| ||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23085437 cagtttgaatgaaaaagcattcacagggcataagccctcaacagtt 23085482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Original strand, 21903182 - 21903246
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21903182 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgactaagcattcacatggcatgagccctcaacagttt 21903246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Original strand, 31518418 - 31518537
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaaca--ttccagggcatgagccctcaaca 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||    
T  31518418 gggcataagccctaaacaatttgaatgaactagcattcacagggcattagccctcaacaatttgaatgattaagaagtcacagggcatgagccctcaaca 31518517  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
      ||||||||||||||||||    
T  31518518 atttgaatgacaaggcattc 31518537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 346
Target Start/End: Original strand, 31518241 - 31518316
Alignment:
Q  274 acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31518241 acgagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 31518316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12628129 - 12628064
Alignment:
Q  417 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628129 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 12628064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 22109438 - 22109515
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22109438 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 22109515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24274392 - 24274237
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |   |||| |    
T  24274392 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa-tagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcga 24274294  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24274293 gggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 24274237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 410
Target Start/End: Original strand, 28348917 - 28348958
Alignment:
Q  369 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28348917 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 28348958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20591539 - 20591424
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||  |||||| ||    
T  20591539 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcatttca 20591441  T
Q  286 gggcatgagccctcaac 302  Q
    ||| |||||||||||||    
T  20591440 gggtatgagccctcaac 20591424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 23148580 - 23148627
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23148580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 23148627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 23560370 - 23560417
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23560370 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 23560417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 25651228 - 25651287
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25651228 cagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcctagggcatgagccctcaac 25651287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Original strand, 22840917 - 22840963
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22840917 ttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagtttgaatg 22840963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Original strand, 31503324 - 31503410
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31503324 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 31503410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Original strand, 31505890 - 31505976
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31505890 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 31505976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 345
Target Start/End: Original strand, 22109437 - 22109478
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22109437 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagtt 22109478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Original strand, 22840917 - 22840958
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22840917 ttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagttt 22840958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Original strand, 23148580 - 23148617
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23148580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 23148617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Original strand, 23560370 - 23560407
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23560370 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 23560407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Original strand, 24160247 - 24160323
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc 240  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24160247 agggcataagccctcaacagtttgaatgatttaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggc 24160323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Original strand, 21903112 - 21903205
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21903112 agccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggc--gagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagttt 21903205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 21903182 - 21903245
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21903182 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgactaagcattcacatggcatgagccctcaacagtt 21903245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 342
Target Start/End: Original strand, 25651191 - 25651329
Alignment:
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcc-agggcatgagccctcaac-a 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||      
T  25651191 ggcataagccctcaac-gattgaatgaacttgcattcacagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcctagggcatgagccctcaacgg 25651289  T
Q  304 gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  25651290 gttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 25651329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 24160205 - 24160311
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcc-agggcatgagccctcaacagtt-gaatgaca-aagcattcc-agggcatgagccctca 339  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24160205 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcagagggcataagccctcaacagtttgaatgatttaagcattcccagggcatgagccctca 24160304  T
Q  340 acagttt 346  Q
    || ||||    
T  24160305 acggttt 24160311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24682793 - 24682759
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24682793 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 24682759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24682793 - 24682759
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24682793 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 24682759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 392
Target Start/End: Original strand, 31518498 - 31518610
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactc--cacttgtgtatat 378  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||  || ||||||||||    
T  31518498 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcaaaagccctcaacggttt-ataagcatgcaatggactcaacatttgtgtatat 31518596  T
Q  379 cagcatacaactca 392  Q
    || |||||||||||    
T  31518597 caacatacaactca 31518610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38931556 - 38931510
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  38931556 ggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacaacaacaac 38931510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 9701 - 9734
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9701 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 9734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10040335 - 10040267
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10040335 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattcctgggcatgagccctcaacagtt 10040267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25181830 - 25181797
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25181830 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 25181797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 29281120 - 29281153
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29281120 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 29281153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 31503496 - 31503529
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31503496 actccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 31503529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 31506062 - 31506095
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31506062 actccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 31506095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43708298 - 43708265
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43708298 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaag 43708265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 28348840 - 28348892
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaa 153  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  28348840 tcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcactaatttgaa 28348892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 149 - 480
Target Start/End: Original strand, 10554034 - 10554365
Alignment:
Q  149 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  10554034 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccag 10554133  T
Q  248 ggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttc 347  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554134 ggcatgagccctcaacgg-ttgaatgacgagcattctagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttc 10554232  T
Q  348 ctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactca 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554233 ctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactca 10554332  T
Q  448 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554333 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 10554365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 16799369 - 16799752
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  16799369 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 16799468  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16799469 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagt 16799567  T
Q  306 t-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaaca 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16799568 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacg 16799667  T
Q  405 acaacataggtgacgacaacgat------cgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16799668 acaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggttaacatcaacaacctatga 16799752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2039036 - 2038665
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  2039036 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 2038939  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2038938 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 2038841  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2038840 tgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 2038742  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2038741 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2038665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2042777 - 2042406
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  2042777 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 2042680  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2042679 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 2042582  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2042581 tgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 2042483  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2042482 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2042406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 14041295 - 14041590
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  14041295 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14041394  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14041395 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 14041493  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14041494 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14041590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 14037827 - 14038122
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  14037827 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14037926  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14037927 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 14038025  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038026 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14038122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2035439 - 2035158
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  2035439 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 2035341  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2035340 caacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 2035242  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2035241 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2035158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 403
Target Start/End: Original strand, 54972954 - 54973256
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  54972954 tcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaa 54973052  T
Q  200 -cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccc 297  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  54973053 gcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacat-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccc 54973151  T
Q  298 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54973152 tcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 54973250  T
Q  398 gacaac 403  Q
    ||||||    
T  54973251 gacaac 54973256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 403
Target Start/End: Original strand, 54975564 - 54975866
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  54975564 tcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaa 54975662  T
Q  200 -cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccc 297  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  54975663 gcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacat-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccc 54975761  T
Q  298 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54975762 tcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 54975860  T
Q  398 gacaac 403  Q
    ||||||    
T  54975861 gacaac 54975866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 403
Target Start/End: Original strand, 54978174 - 54978476
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagca-ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  54978174 tcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaa 54978272  T
Q  200 -cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccc 297  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  54978273 gcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacat-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccc 54978371  T
Q  298 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54978372 tcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 54978470  T
Q  398 gacaac 403  Q
    ||||||    
T  54978471 gacaac 54978476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 200 - 478
Target Start/End: Original strand, 18958558 - 18958839
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaa-tgacaaggcatt-ccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagcc 296  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  18958558 cattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagcc 18958656  T
Q  297 ctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaacta 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958657 ctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaacta 18958755  T
Q  397 cgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 478  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18958756 cgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactagatcaacatcaacaacctat 18958839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2039233 - 2038996
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  2039233 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcca 2039134  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2039133 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 2039036  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2039035 tgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2038996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2042974 - 2042737
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  2042974 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcca 2042875  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2042874 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 2042777  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042776 tgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2042737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15010604 - 15010388
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15010604 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctgaacag-ttgaatgacaaagcattcca 15010506  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  15010505 gggcatgagccctcagcagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaagggactcaacgtgtgtatatcagcata 15010406  T
Q  386 caactcaactacgacaac 403  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15010405 caactcatctacgacaac 15010388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 54972865 - 54973118
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54972865 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 54972964  T
Q  191 aatgatta--acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    |||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||     
T  54972965 aatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccaga 54973062  T
Q  288 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54973063 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 54973118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 54975475 - 54975728
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975475 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 54975574  T
Q  191 aatgatta--acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    |||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||     
T  54975575 aatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccaga 54975672  T
Q  288 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54975673 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 54975728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 54978085 - 54978338
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978085 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 54978184  T
Q  191 aatgatta--acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagg 287  Q
    |||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||     
T  54978185 aatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccaga 54978282  T
Q  288 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54978283 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 54978338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14951945 - 14951722
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14951945 cattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 14951847  T
Q  260 caacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||||             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14951846 caacag-------------cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa 14951760  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951759 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 14951722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52339235 - 52338998
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  52339235 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccatggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 52339136  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-agt 305  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||  |  |||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52339135 ggcataagccatcaacag-ttgaatgatta-acatttcagggcatgagctctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatt 52339038  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52339037 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 52338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10990106 - 10989803
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  10990106 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 10990007  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac-agt 305  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| | | |    
T  10990006 ggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattacagggcataagccctcaccaatt 10989909  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10989908 tgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc-accgctttatgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaaaac 10989810  T
Q  404 aacaaca 410  Q
     ||||||    
T  10989809 gacaaca 10989803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 604055 - 603878
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||  |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604055 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 603956  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  603955 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacgtgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaac 603878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 179894 - 179701
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  179894 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacag-ttgaatgacaaatcattcca 179796  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  179795 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 179701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 341
Target Start/End: Original strand, 10554010 - 10554187
Alignment:
Q  163 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  10554010 ttccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaa 10554108  T
Q  263 cagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10554109 caatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgac-gagcattctagggcatgagccctcaac 10554187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 55292807 - 55292595
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtat 376  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55292807 agcattccggggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaagactcgacttgtgtat 55292708  T
Q  377 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||    
T  55292707 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 55292608  T
Q  468 caacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||    
T  55292607 caacaacctatga 55292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 39230431 - 39230670
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39230431 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccag 39230529  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacg 425  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||    
T  39230530 ggcataagccctcaacagactcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaca---------------acgacaacg 39230613  T
Q  426 atcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39230614 accgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 39230670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2035492 - 2035296
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  2035492 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcca 2035393  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2035392 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 2035296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52339143 - 52338963
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52339143 cattccagggcataagccatcaacag-ttgaatgattaacatttcagggcatgagctctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 52339045  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  52339044 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 52338963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 54972904 - 54973079
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc-attccagggcgtgagccctcaacagat 267  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |    
T  54972904 ggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggt 54973002  T
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54973003 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacag 54973079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 54975514 - 54975689
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc-attccagggcgtgagccctcaacagat 267  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |    
T  54975514 ggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggt 54975612  T
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54975613 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacag 54975689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 54978124 - 54978299
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggc-attccagggcgtgagccctcaacagat 267  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |    
T  54978124 ggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggt 54978222  T
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54978223 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacag 54978299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23396291 - 23396053
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| || ||||||||  || ||||||||    
T  23396291 ttgaatgactaagtatatcggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagtcatcaatag-ttgaatgacaaagcattccag 23396193  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaaca-gtt 306  Q
    ||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23396192 ggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacatttt 23396093  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  23396092 gaatgacaaggcattccagggcataagcgctcaacggttt 23396053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15010623 - 15010448
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15010623 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctgaacag-t 15010525  T
Q  189 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15010524 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcagcag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 15010448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6806159 - 6806015
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6806159 cattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 6806060  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6806059 aacag-ttgaatgattagcattccagggcatgagccctcaacagtt 6806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 14037827 - 14037987
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  14037827 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14037926  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14037927 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagatt 14037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52339164 - 52338963
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-a 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |      
T  52339164 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccatcaac-agttgaatgattaacatttcagggcatgagctctcaacaatttgaatgacaagg 52339066  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  52339065 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 52338967  T
Q  300 aaca 303  Q
    ||||    
T  52338966 aaca 52338963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 14041295 - 14041452
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  14041295 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14041394  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14041395 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 14041452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6806172 - 6806017
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||    
T  6806172 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 6806073  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6806072 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-gcattccagggcatgagccctcaacag 6806017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 10554065 - 10554228
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |     
T  10554065 tcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacgag 10554163  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10554164 cattctagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 10554228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 402
Target Start/End: Original strand, 54046475 - 54046601
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgta 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  54046475 agcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacgtgtgta 54046574  T
Q  376 tatcagcatacaactcaactacgacaa 402  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54046575 tattagcatacaactcatctacgacaa 54046601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14951977 - 14951841
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14951977 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-t 14951879  T
Q  189 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14951878 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 179894 - 179735
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||    
T  179894 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacag-ttgaatgacaaatcattcca 179796  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  179795 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 179735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 342
Target Start/End: Original strand, 6819002 - 6819170
Alignment:
Q  176 gccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac 275  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||     
T  6819002 gccctctacagtttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgat 6819101  T
Q  276 gagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
     | |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||    
T  6819102 aaacatttcatggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataatccctcaaca 6819170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 179841 - 179696
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  179841 cattccagggcgtaagccctcaacag-ttgaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 179743  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  179742 caacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 179696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 17211138 - 17211221
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211138 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 17211221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 604074 - 603938
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  604074 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-t 603976  T
Q  189 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  603975 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 603938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14951966 - 14951841
Alignment:
Q  219 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 317  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14951966 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 14951867  T
Q  318 cattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14951866 cattccagggcatgagccctcaacag 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1989462 - 1989226
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  1989462 cattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataaacattctagggcatgaaccctcaacagtttgaatgacaagacattccagggcatgcgccccc 1989363  T
Q  261 aacagattgaatgacga--gcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg- 356  Q
    | ||  |||||||   |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | || |||     
T  1989362 accaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctcaccaattt-atgattatgc 1989264  T
Q  357 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1989263 aatgaactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1989226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10990035 - 10989875
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  10990035 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 10989937  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10989936 cattacagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10989875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Original strand, 18958546 - 18958701
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaa-tgatgaa-catt-ccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||    
T  18958546 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcc 18958644  T
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18958645 agggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 18958701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6806172 - 6806014
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  6806172 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 6806074  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6806073 gggcataagccctcaacagttgaatgatta-gcattccagggcatgagccctcaacagttt 6806014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1989475 - 1989281
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  1989475 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataaacattctagggcatgaaccctcaacagtttgaatgacaagacattccag 1989376  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctca 300  Q
    |||||| |||| || ||  |||||| |  || |||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1989375 ggcatgcgcccccaccaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 1989281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 6818902 - 6819133
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||    
T  6818902 ttgaatgactaagaattccgggt-ataagcccccaacaatttgaatgataaacattacaggacataagccctcaacagtttgaatgacaatgcattctag 6819000  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag-t 305  Q
    |      |||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  6819001 g------gccctctacagtttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtt 6819093  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  6819094 tgaatgataaa-catttcatggcataagccctcaacagttt 6819133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10834586 - 10834465
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-t 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  10834586 ttttcaacatgttgaatgactaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcataagccctcaaca-attgaatgaca 10834488  T
Q  197 taacattccagggcatgagccct 219  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  10834487 aaacactccagggcatgagccct 10834465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 179894 - 179774
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  179894 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagttgaatgacaaatcattccag 179795  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  179794 ggcatgagccctcaacagttt 179774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Original strand, 10553995 - 10554110
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10553995 ttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccag 10554093  T
Q  326 ggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  10554094 ggcataagcccccaaca 10554110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 184
Target Start/End: Original strand, 7631915 - 7632010
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaac 184  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7631915 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14951966 - 14951841
Alignment:
Q  180 tcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-ga 277  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |    
T  14951966 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaa 14951868  T
Q  278 gcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14951867 gcattccagggcatgagccctcaacag 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 604035 - 603936
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  604035 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagt 603937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3395142 - 3394996
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3395142 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 3395043  T
Q  302 c-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    | | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3395042 caatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggttt 3394996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3395140 - 3395001
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3395140 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 3395041  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
      |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  3395040 atttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 3395001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 39230431 - 39230548
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  39230431 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaac-agttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 39230528  T
Q  207 gggcatgagccctcaacaga 226  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  39230529 gggcataagccctcaacaga 39230548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 6819033 - 6819170
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagat 227  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  6819033 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataaacatttcatggcataagccctcaacagtt 6819132  T
Q  228 tgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  6819133 tgaatgacaaggcattcacagggcataatccctcaaca 6819170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12856092 - 12855881
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattcc-agggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||   || ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  12856092 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagc 12855994  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||  || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||   | || ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12855993 cctctccaattgaacggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt--atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcgacatacaactcaac 12855896  T
Q  395 tacgacaacaacaaca 410  Q
    ||| || |||||||||    
T  12855895 tacaac-acaacaaca 12855881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 186
Target Start/End: Original strand, 54046459 - 54046542
Alignment:
Q  104 acacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54046459 acacgttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 54046542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 303
Target Start/End: Original strand, 6819013 - 6819170
Alignment:
Q  148 tttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 246  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||| ||    
T  6819013 tttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataa-acatttca 6819111  T
Q  247 gggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||    
T  6819112 tggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataatccctcaaca 6819170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30206623 - 30206553
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30206623 agcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 30206553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30206634 - 30206556
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30206634 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 30206556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14951966 - 14951878
Alignment:
Q  259 tcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14951966 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 14951878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12856105 - 12855946
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||  || |||||    
T  12856105 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattc 12856007  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
     |||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12856006 acagggcataagccctctcca-attgaacggcaaggcattccagggcatgagccctcaacag 12855946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Original strand, 15446413 - 15446461
Alignment:
Q  138 cccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15446413 cccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15446461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 343
Target Start/End: Original strand, 10554010 - 10554071
Alignment:
Q  281 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10554010 ttccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 10554071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Original strand, 17211151 - 17211221
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaa 231  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211151 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 17211221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30206634 - 30206556
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  30206634 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 30206556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 54046464 - 54046542
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54046464 ttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 54046542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10834555 - 10834381
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacaga- 266  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||||   | ||     
T  10834555 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcataagccctcaaca-attgaatgacaaaacactccagggcatgagccct-tccggat 10834458  T
Q  267 ttgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||||     ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10834457 ttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaa 10834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 263
Target Start/End: Original strand, 7631934 - 7632010
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7631934 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18367852 - 18367772
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 244  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18367852 cagggcatgagcccgcaacaatttgaatgatttagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 18367772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30206634 - 30206554
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30206634 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 30206554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 9885 - 10040
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc 204  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||| | | ||  | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||    
T  9885 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaacggttaaagcgttcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattc 9983  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
     |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9984 acagggcataagccctc-accgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 603885 - 603820
Alignment:
Q  417 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603885 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 603820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1989475 - 1989365
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||   |||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  1989475 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataaacattctagggcatgaaccctcaacagtttgaatgacaagacattccag 1989376  T
Q  326 ggcatgagccc 336  Q
    |||||| ||||    
T  1989375 ggcatgcgccc 1989365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2035481 - 2035415
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2035481 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 2035415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15010395 - 15010330
Alignment:
Q  417 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010395 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 15010330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Original strand, 7631945 - 7632010
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7631945 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12856105 - 12856068
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856105 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 12856068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 17211138 - 17211215
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17211138 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 17211215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 341
Target Start/End: Original strand, 15232139 - 15232239
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15232139 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15232238  T
Q  341 c 341  Q
    |    
T  15232239 c 15232239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 341
Target Start/End: Original strand, 15238007 - 15238107
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15238007 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15238106  T
Q  341 c 341  Q
    |    
T  15238107 c 15238107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 15232139 - 15232278
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcc-agggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15232139 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15232238  T
Q  302 cagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    | |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  15232239 cggttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15232278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 15238007 - 15238146
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcc-agggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15238007 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15238106  T
Q  302 cagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    | |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  15238107 cggttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15238146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 6819053 - 6819139
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  || | |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6819053 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataaacatttcatggcataagccctcaacagtttgaatga 6819139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10989799 - 10989746
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989799 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 10989746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30206621 - 30206556
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30206621 cattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 30206556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 54973282 - 54973315
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973282 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54973315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 54975892 - 54975925
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975892 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54975925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 54978502 - 54978535
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978502 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54978535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10040
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9945 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaccgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12856105 - 12855990
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     |||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  12856105 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 12856006  T
Q  323 cagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||| |||||||    
T  12856005 cagggcataagccctc 12855990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15012117 - 15011967
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  15012117 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcacca 15012019  T
Q  343 gtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
     |||  | || ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15012018 attt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15011967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 18958626 - 18958701
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaac 184  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  18958626 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 18958701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55292818 - 55292787
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagccc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292818 ttgaatgactaagcattccggggcataagccc 55292787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1989464 - 1989395
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagt-tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1989464 agcattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataaa-cattctagggcatgaaccctcaacagttt 1989395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30206635 - 30206597
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30206635 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 30206597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 35984719 - 35984753
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35984719 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 35984753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12034345 - 12034312
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12034345 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 12034312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14764128 - 14764095
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14764128 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 14764095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 14864967 - 14865000
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14864967 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 14865000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 15446424 - 15446461
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15446424 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15446461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 304
Target Start/End: Original strand, 15446424 - 15446461
Alignment:
Q  267 ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15446424 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15446461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 17130875 - 17130908
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17130875 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 17130908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 51300281 - 51300314
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51300281 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 51300314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 54046627 - 54046660
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54046627 actccccaacttggtcaacatcaacaaactatga 54046660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 15232139 - 15232239
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc-agggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||| | |||||||||||    
T  15232139 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15232238  T
Q  263 c 263  Q
    |    
T  15232239 c 15232239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 15238007 - 15238107
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc-agggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||| | |||||||||||    
T  15238007 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaa 15238106  T
Q  263 c 263  Q
    |    
T  15238107 c 15238107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Original strand, 17211138 - 17211221
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaa 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17211138 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaa 17211221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18367852 - 18367756
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccct 337  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18367852 cagggcatgagcccgcaacaatttgaatgatttagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcatagggcatgagccct 18367756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18367850 - 18367782
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatga-tgaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18367850 gggcatgagcccgcaacaatttgaatgatttagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatga 18367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 45306844 - 45307234
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306844 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccccccacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 45306943  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||    
T  45306944 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggcaaggcattccag 45307041  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45307042 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcagcatac 45307140  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45307141 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 45307234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 91 - 403
Target Start/End: Original strand, 20586715 - 20587026
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20586715 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 20586814  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  20586815 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaaacattccagggc 20586913  T
Q  290 atgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20586914 ataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaac 20587012  T
Q  390 tcaactacgacaac 403  Q
    ||||||||||||||    
T  20587013 tcaactacgacaac 20587026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 91 - 403
Target Start/End: Original strand, 20579022 - 20579333
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579022 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacgttccagggcatgagccctcaacagattg 20579121  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  20579122 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaaacattccagggc 20579220  T
Q  290 atgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaac 389  Q
    || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20579221 ataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaac 20579319  T
Q  390 tcaactacgacaac 403  Q
    ||||||||||||||    
T  20579320 tcaactacgacaac 20579333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2333545 - 2333147
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccccc-aacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacaga 187  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2333545 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaac-ga 2333447  T
Q  188 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||    
T  2333446 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacactccagg 2333348  T
Q  288 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2333347 gcacgagccctcgacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac-ggttcctaatcatgaaaagactccacttgtgtatatcagcatac 2333249  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacataggtgacg------acaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 478  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |  |||      |||||||  ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333248 aacttaactacgacaacgacaacatgtgcaacgacaaccacaacgacggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 2333149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 296178 - 296464
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccag 286  Q
    |||||||| ||| |||||| |||| | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||  | ||||||||    
T  296178 ttgaatgactaagcattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 296276  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  296277 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 296376  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296377 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 296464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Original strand, 20630980 - 20631261
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  20630980 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 20631078  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20631079 caacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 20631177  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20631178 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 20631261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 207 - 480
Target Start/End: Original strand, 36181245 - 36181520
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36181245 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 36181344  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36181345 tgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga 36181443  T
Q  406 caacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36181444 caacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 36181520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22900745 - 22900426
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22900745 cattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 22900647  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22900646 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa- 22900549  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaact 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22900548 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaact 22900449  T
Q  458 tggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     | ||||||||||| ||||||||    
T  22900448 cgatcaacatcaaccacctatga 22900426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14432818 - 14432528
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  14432818 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14432719  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14432718 gggcatgagcccccaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 14432620  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| | |||       |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14432619 caactcaactacgacaacgataac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14432528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22900777 - 22900566
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  22900777 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaac-ggtt 22900679  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  22900678 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 22900580  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22900579 catgagccctcaac 22900566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 18823462 - 18823655
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  18823462 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 18823561  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  18823562 ggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 18823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 410
Target Start/End: Original strand, 293782 - 294086
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||     
T  293782 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccaa 293881  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca-gggcatgagccctcaac-ag 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| | |     
T  293882 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattccaggggcataagccatcaccaat 293979  T
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaa 402  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293980 ttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccacttt-atgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaa 294078  T
Q  403 caacaaca 410  Q
    | ||||||    
T  294079 cgacaaca 294086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 403
Target Start/End: Original strand, 24087129 - 24087306
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24087129 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattctag 24087228  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24087229 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaac 24087306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 318 - 480
Target Start/End: Original strand, 37358254 - 37358417
Alignment:
Q  318 cattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  37358254 cattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaa 37358352  T
Q  418 cgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358353 cgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 37358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21181628 - 21181391
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  21181628 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaaccttccagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 21181529  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-tt 306  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||| | |||||||||||  |||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21181528 ggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataaacattctagggcatgagccctcaacagttt 21181431  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21181430 caatgacaaggcattccagggcatgagccctcaatagttt 21181391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 304
Target Start/End: Original strand, 20630927 - 20631123
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  20630927 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 20631026  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20631027 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 20631123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 296178 - 296331
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  296178 ttgaatgactaagcattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 296276  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  296277 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 296331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 341
Target Start/End: Original strand, 18823475 - 18823655
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18823475 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgaaccctc 18823574  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18823575 aacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 18823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 20901018 - 20901214
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||  || |||||||     
T  20901018 ttgaatgactaagcattccggggcataag-ccccaacaatttgaatgataaacattgaagggaataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccat 20901115  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901116 ggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagtt 20901214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14432818 - 14432658
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  14432818 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 14432719  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14432718 gggcatgagcccccaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagatt 14432658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21181549 - 21181336
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| || ||||||| |||    
T  21181549 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgattaacattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataaacattctagg 21181451  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacag-t 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||| || ||||| |||||| ||||| |    
T  21181450 gcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcacaaggcataagcccttaacagtt 21181351  T
Q  306 tgaatgacaaagcat 320  Q
    |||||||||| ||||    
T  21181350 tgaatgacaaggcat 21181336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 36181225 - 36181385
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||    
T  36181225 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 36181324  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagatt 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36181325 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagatt 36181385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21181615 - 21181430
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21181615 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaaccttccagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 21181516  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttc 347  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21181515 aacag-ttgaatgattaacattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataaa-cattctagggcatgagccctcaacagtttc 21181430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28204815 - 28204698
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  28204815 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 28204716  T
Q  208 ggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28204715 ggcataagccctcaacag 28204698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Original strand, 20901031 - 20901215
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  20901031 cattccggggcataagccc-caacaatttgaatgataaacattgaagggaataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccatggcataagccctc 20901128  T
Q  261 aacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20901129 aacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagttt 20901215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 16400612 - 16400729
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-ca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||    
T  16400612 ttgaatgactaagcattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattcaca 16400711  T
Q  207 gggcatgagccctcaaca 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16400712 gggcatgagccctcaaca 16400729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 24087110 - 24087246
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24087110 tggtactatttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacag-t 24087208  T
Q  189 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24087209 tgaatgacaaagcattctagggcatgagccctcaacag 24087246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18270200 - 18270315
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |  ||||||||    
T  18270200 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccag 18270299  T
Q  208 ggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18270300 ggcataagccctcaac 18270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18274854 - 18274969
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |  ||||||||    
T  18274854 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccag 18274953  T
Q  208 ggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18274954 ggcataagccctcaac 18274969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Original strand, 37358183 - 37358279
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37358183 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaataatgatcattccagggcatgagccctcaacag 37358279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Original strand, 36181278 - 36181382
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36181278 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 36181376  T
Q  299 caacag 304  Q
    ||||||    
T  36181377 caacag 36181382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 28312084 - 28312195
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  || |||| |||    
T  28312084 ttgaatgactaagcattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatttcag 28312182  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  28312183 ggcatgagccctc 28312195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Original strand, 18823462 - 18823621
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  18823462 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 18823560  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18823561 gggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 18823621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28204802 - 28204698
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28204802 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 28204703  T
Q  261 aacag 265  Q
    |||||    
T  28204702 aacag 28204698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22900758 - 22900643
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | || | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22900758 ttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagg 22900659  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  22900658 gcatgagccctcaaca 22900643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 19209424 - 19209511
Alignment:
Q  109 ttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19209424 ttgaatgacttaagcattccaggggataagcccccaacaatttgaataataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatga 19209511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 293853 - 294014
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-a 199  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  293853 tcaacagattgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaac-agttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaagg 293951  T
Q  200 cattcca-gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  293952 cattccaggggcataagccatcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 294014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Original strand, 18270213 - 18270315
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18270213 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctc 18270312  T
Q  261 aac 263  Q
    |||    
T  18270313 aac 18270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Original strand, 18274867 - 18274969
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18274867 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctc 18274966  T
Q  261 aac 263  Q
    |||    
T  18274967 aac 18274969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 18823462 - 18823582
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18823462 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 18823561  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18823562 ggcatgaaccctcaacagttt 18823582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 306
Target Start/End: Original strand, 24087129 - 24087248
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  24087129 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcta 24087227  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24087228 gggcatgagccctcaacagtt 24087248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28204815 - 28204696
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28204815 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 28204716  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  28204715 ggcataagccctcaacagtt 28204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 19209438 - 19209536
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    |||||||||| || ||||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  19209438 cattccaggggataagcccccaacaatttgaataataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 28312084 - 28312195
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   ||||| |||||  ||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28312084 ttgaatgactaagcattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcatttcagg 28312183  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  28312184 gcatgagccctc 28312195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 18270200 - 18270320
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18270200 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccag 18270299  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  18270300 ggcataagccctcaacggttt 18270320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 18274854 - 18274974
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18274854 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccag 18274953  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  18274954 ggcataagccctcaacggttt 18274974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44823202 - 44823105
Alignment:
Q  131 gcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44823202 gcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 44823105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Original strand, 28312097 - 28312195
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  28312097 cattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctc 28312195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 20630938 - 20631008
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630938 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 20631008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Original strand, 24087299 - 24087364
Alignment:
Q  417 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087299 acgacaacgatcgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 24087364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Original strand, 16400625 - 16400729
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccct 259  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||||| ||||||||    
T  16400625 cattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattcacagggcatgagccct 16400724  T
Q  260 caaca 264  Q
    |||||    
T  16400725 caaca 16400729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44823197 - 44823105
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44823197 agccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 44823105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 337
Target Start/End: Original strand, 19209437 - 19209536
Alignment:
Q  239 gcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 337  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||  |||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19209437 gcattccaggggataagcccccaacaatttgaataataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Original strand, 16400612 - 16400729
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-ca 324  Q
    ||||||||| | ||||||| |||  | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||    
T  16400612 ttgaatgactaagcattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattcaca 16400711  T
Q  325 gggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16400712 gggcatgagccctcaaca 16400729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21528948 - 21528853
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21528948 agccctcaac-gattgaatgaactagcattcacagggcataagacctcaacagttggaatgataaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 21528853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 24475316 - 24475431
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||     ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  24475316 ttgaatgacaaggcattacagggcgtgagccctcaccaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 24475415  T
Q  323 cagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||| |||||||    
T  24475416 cagggcataagccctc 24475431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 24475376 - 24475526
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  24475376 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcacca 24475474  T
Q  343 gtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
     |||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24475475 attt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 24475526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Original strand, 294090 - 294143
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  294090 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 294143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 37358202 - 37358280
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37358202 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaataatgatcattccagggcatgagccctcaacagt 37358280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 8683035 - 8683136
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | |||| ||||    
T  8683035 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccttcaa 8683134  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  8683135 ca 8683136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21528917 - 21528816
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  21528917 cagggcataagacctcaacagttggaatgataaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 21528818  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  21528817 ca 21528816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25092528 - 25092495
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25092528 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 25092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44823202 - 44823105
Alignment:
Q  170 gcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  44823202 gcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 44823105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 24959986 - 24960081
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24959986 cagggcataagccctcacca-attgaatgtactagcattcacagggcatcagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 24960081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 37358215 - 37358279
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37358215 cattccggggcataagcccccaacaatttgaataatgatcattccagggcatgagccctcaacag 37358279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 19209436 - 19209505
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19209436 agcattccaggggataagcccccaacaatttgaataataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 19209505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28204804 - 28204735
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28204804 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattctagggcatgagccctcaacagttt 28204735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 8682995 - 8683099
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8682995 cagggcataagccctcaacaaatt-aatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaa 8683093  T
Q  341 cagttt 346  Q
    | ||||    
T  8683094 cggttt 8683099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20852063 - 20852030
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20852063 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20852030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20858689 - 20858656
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20858689 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20858656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 21705401 - 21705434
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21705401 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 21705434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 260
Target Start/End: Original strand, 24959926 - 24959959
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24959926 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 24959959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 24959926 - 24959959
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24959926 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 24959959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 410
Target Start/End: Original strand, 32650339 - 32650388
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  32650339 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgacaaca 32650388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44823202 - 44823105
Alignment:
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44823202 gcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 44823105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7792803 - 7792755
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaa 408  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7792803 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaa 7792755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 479
Target Start/End: Original strand, 20579359 - 20579391
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatg 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20579359 actccccaacttggccaacatcaacaacctatg 20579391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 341
Target Start/End: Original strand, 45918166 - 45918237
Alignment:
Q  274 acgagcattc-cagggcatgagccctcaaca--gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45918166 acgagcattcacagggcatgagccctcaacaattttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaac 45918237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Original strand, 43120803 - 43121120
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | |||||||    
T  43120803 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcataagccctc 43120901  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43120902 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttccctaatcatgaaag 43121000  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43121001 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 43121100  T
Q  461 tcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43121101 tcaacatcaacaacctatga 43121120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Original strand, 43124336 - 43124653
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | |||||||    
T  43124336 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcataagccctc 43124434  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag 360  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43124435 aacgg-ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttccctaatcatgaaag 43124533  T
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124534 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttgg 43124633  T
Q  461 tcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43124634 tcaacatcaacaacctatga 43124653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16256498 - 16256108
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  16256498 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaac-ggtt 16256400  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagg 287  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  16256399 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaggcattccagg 16256301  T
Q  288 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16256300 gcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcataca 16256203  T
Q  388 actcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16256202 actcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 16256108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 29325811 - 29325412
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325811 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 29325712  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  29325711 gaatgacaaggcaattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 29325614  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29325613 ggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcagcggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 29325515  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325514 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 29325415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 26495416 - 26495815
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495416 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 26495515  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  26495516 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 26495613  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  26495614 ggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatatcaacatac 26495712  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26495713 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaaccta 26495812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 200 - 480
Target Start/End: Original strand, 23693122 - 23693403
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23693122 cattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacgg-ttgaatgacgaagcattccagggcatgagccct 23693219  T
Q  299 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 398  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23693220 caacggttgaatgacgaggcattccagggcaagagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaggatacaactcaactacg 23693319  T
Q  399 acaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693320 acagcgacaatataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 23693403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16260060 - 16259741
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16260060 cattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 16259962  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16259961 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa- 16259864  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaact 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16259863 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaact 16259764  T
Q  458 tggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     | ||||||||||| ||||||||    
T  16259763 cgatcaacatcaaccacctatga 16259741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22593779 - 22593460
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22593779 cattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 22593681  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22593680 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa- 22593583  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaact 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22593582 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaact 22593483  T
Q  458 tggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     | ||||||||||| ||||||||    
T  22593482 cgatcaacatcaaccacctatga 22593460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22597334 - 22597015
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22597334 cattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 22597236  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22597235 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa- 22597138  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaact 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22597137 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaact 22597038  T
Q  458 tggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     | ||||||||||| ||||||||    
T  22597037 cgatcaacatcaaccacctatga 22597015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22590224 - 22589905
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22590224 cattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattctagggcataagcccacaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 22590126  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa 359  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22590125 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa- 22590028  T
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaact 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22590027 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaact 22589928  T
Q  458 tggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     | ||||||||||| ||||||||    
T  22589927 cgatcaacatcaaccacctatga 22589905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 90 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22759253 - 22759004
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  22759253 tggtactatttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgg-t 22759155  T
Q  189 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  22759154 tgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaacattccaggg 22759056  T
Q  289 catgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22759055 catgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattctagggcatgtgccctca 22759004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Original strand, 43120772 - 43120985
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120772 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 43120871  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  43120872 aatgattaacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggc 43120968  T
Q  290 atgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||    
T  43120969 atgagccctcaacagtt 43120985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 306
Target Start/End: Original strand, 43124305 - 43124518
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124305 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattg 43124404  T
Q  191 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  43124405 aatgattaacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggc 43124501  T
Q  290 atgagccctcaacagtt 306  Q
    |||||||||||||||||    
T  43124502 atgagccctcaacagtt 43124518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26361552 - 26361256
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||  |||||| ||    
T  26361552 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcatttca 26361453  T
Q  286 gggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcat 384  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26361452 gggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcatgagccctccaccgtgccctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 26361354  T
Q  385 acaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361353 acaactcaactacggcaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactataactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 26361256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27869925 - 27869691
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  27869925 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgat-aacatttcagggcatgagtcctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 27869827  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27869826 ggcatgagctctcaacaattagaatgataa--cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgataaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 27869730  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27869729 gaatgac-aagcattccagggcataagccctcaacagttt 27869691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16260092 - 16259881
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  16260092 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaac-ggtt 16259994  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  16259993 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 16259895  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  16259894 catgagccctcaac 16259881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 480
Target Start/End: Original strand, 4397478 - 4397654
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaaca 404  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4397478 ttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacg 4397576  T
Q  405 acaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4397577 acaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 4397654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22593811 - 22593600
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  22593811 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaac-ggtt 22593713  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  22593712 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 22593614  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22593613 catgagccctcaac 22593600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22597366 - 22597155
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  22597366 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaac-ggtt 22597268  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  22597267 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 22597169  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22597168 catgagccctcaac 22597155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22590256 - 22590045
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  22590256 tggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattctagggcataagcccacaac-ggtt 22590158  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccaggg 288  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  22590157 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 22590059  T
Q  289 catgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||    
T  22590058 catgagccctcaac 22590045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 275
Target Start/End: Original strand, 22469777 - 22469943
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  22469777 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 22469875  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22469876 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccagggcatgagccctcaacagtttgaatgac 22469943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 341
Target Start/End: Original strand, 23671472 - 23671633
Alignment:
Q  180 tcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag 278  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23671472 tcaacacattgaatggctaagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgacgag 23671569  T
Q  279 -cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23671570 gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaac 23671633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953034
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcaagg 8953049  T
Q  209 gcatgagccctcaac 223  Q
    |||||||||||||||    
T  8953048 gcatgagccctcaac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22759194 - 22758892
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22759194 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccag 22759096  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  22759095 ggcataagccctcaacag-ttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattctagggcatgtgccctcaccaatt 22758998  T
Q  307 -gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
     ||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  |  | ||| || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758997 tgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc-accgctttatgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac 22758899  T
Q  404 aacaaca 410  Q
     ||||||    
T  22758898 gacaaca 22758892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22358093 - 22357860
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacat--tccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccc 258  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  22358093 cattctagggcataagacctcaacaatttgaatgataaaaatattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccc 22357995  T
Q  259 tcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg- 356  Q
    ||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |  |||     
T  22357994 tcaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt-atgagtatgc 22357896  T
Q  357 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactca 392  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22357895 aatggactcaacttgtgtatatcaacatacaactca 22357860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22759234 - 22759076
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccag 286  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||    
T  22759234 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccag 22759136  T
Q  287 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22759135 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 22759076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Original strand, 23693109 - 23693223
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23693109 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattccag 23693207  T
Q  326 ggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||||||||||||||    
T  23693208 ggcatgagccctcaac 23693223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22358117 - 22357911
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgat--gaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 195  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22358117 ttttcaacatgttgaataactaagcattctagggcataagacctcaacaatttgaatgataaaaatattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatga 22358019  T
Q  196 ttaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatga 293  Q
      || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  22358018 caaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatga 22357920  T
Q  294 gccctcaac 302  Q
    |||||||||    
T  22357919 gccctcaac 22357911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24277762 - 24277605
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  24277762 ttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 24277663  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  24277662 ggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24277605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 24384451 - 24384608
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  24384451 ttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccag 24384550  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  24384551 ggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24384608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 23671493 - 23671644
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23671493 cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgacgaggcattccagggcatgagccct 23671590  T
Q  260 caacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgac 313  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23671591 caacgg-ttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaacggttgactgac 23671644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24277749 - 24277605
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24277749 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 24277650  T
Q  261 aacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24277649 aacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24277605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 24384464 - 24384608
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24384464 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 24384563  T
Q  261 aacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24384564 aacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24384608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26361571 - 26361399
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  26361571 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatt 26361472  T
Q  189 tgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||||  || |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26361471 tgaatgacatagcatttcagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcatgagccctc 26361399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 22469777 - 22469896
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22469777 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 22469876  T
Q  327 gcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22469877 gcatgagccctcaacagttt 22469896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 23671469 - 23671633
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23671469 ttttcaacacattgaatggctaagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-gattgaatgac 23671566  T
Q  197 ta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
     |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  23671567 gaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaac 23671633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Original strand, 23693122 - 23693262
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  23693122 cattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccct 23693219  T
Q  260 caacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23693220 caac-ggttgaatgacgaggcattccagggcaagagccctcaac 23693262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 22469777 - 22469936
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22469777 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-catttcagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 22469874  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22469875 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccagggcatgagccctcaacagttt 22469936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16260073 - 16259958
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | || | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16260073 ttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagg 16259974  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  16259973 gcatgagccctcaaca 16259958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21559562 - 21559443
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21559562 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 21559463  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  21559462 gtttgaacgacaaggcattc 21559443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22593792 - 22593677
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | || | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22593792 ttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagg 22593693  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  22593692 gcatgagccctcaaca 22593677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22597347 - 22597232
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | || | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22597347 ttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagg 22597248  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  22597247 gcatgagccctcaaca 22597232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22590237 - 22590122
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| | || | ||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22590237 ttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattctagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagg 22590138  T
Q  327 gcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  22590137 gcatgagccctcaaca 22590122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24277762 - 24277605
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  24277762 ttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 24277664  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24277663 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24277605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Original strand, 24384451 - 24384608
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  24384451 ttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 24384549  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24384550 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24384608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 480
Target Start/End: Original strand, 22880122 - 22880171
Alignment:
Q  431 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880122 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 22880171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 4397438 - 4397516
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  4397438 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaataatttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacag 4397516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21559564 - 21559459
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21559564 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 21559465  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  21559464 cagttt 21559459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 394
Target Start/End: Original strand, 22469836 - 22470122
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaga 226  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||     
T  22469836 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccagggcatgagccctcaacagt 22469934  T
Q  227 ttga---------------atgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaat--gacgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttga 308  Q
    ||||               |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  22469935 ttgaatgacaaaggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcataagccctcaacgattga 22470034  T
Q  309 atgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |  |||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||  | || ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22470035 acaacaaggcgttcacagggcataagccctcaacaattt-atgattatgcaatggactccactttgtgtatatcaacatacaactcaac 22470122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8953135 - 8953034
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| || || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||| |||||||||    
T  8953135 cattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgatta-acattcaagggcatgagccctc 8953037  T
Q  261 aac 263  Q
    |||    
T  8953036 aac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 23693081 - 23693146
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23693081 agcattccagggcatcatccttcacccgttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 23693146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953029
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | || || |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaa-cattcaag 8953050  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  8953049 ggcatgagccctcaacggttt 8953029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21559564 - 21559456
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||    
T  21559564 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 21559465  T
Q  263 cagattgaa 271  Q
    ||| |||||    
T  21559464 cagtttgaa 21559456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953034
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccag 286  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| || || |||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcaag 8953050  T
Q  287 ggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953049 ggcatgagccctcaac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 7785121 - 7785224
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7785121 cagggcataagccctcaac-gattgaatgacttgcattcacagggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 7785219  T
Q  342 agttt 346  Q
     ||||    
T  7785220 ggttt 7785224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21981155 - 21981036
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |    
T  21981155 gggcataagccatcaacaatttaaatgaagtagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcataaaccctcaata 21981056  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
    | ||||| |||||| |||||    
T  21981055 gtttgaacgacaagacattc 21981036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Original strand, 26706359 - 26706458
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-catt-ccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  26706359 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26706458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Original strand, 26976093 - 26976192
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-catt-ccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  26976093 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26976192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24277751 - 24277682
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277751 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 24277682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 24384462 - 24384531
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384462 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 24384531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17023037 - 17023001
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17023037 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17023001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17023037 - 17023001
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17023037 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17023001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 345
Target Start/End: Original strand, 23671480 - 23671520
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23671480 ttgaatggctaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 23671520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 26706359 - 26706418
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26706359 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 26706418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 26976093 - 26976152
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26976093 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 26976152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 265
Target Start/End: Original strand, 4397478 - 4397516
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4397478 ttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacag 4397516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 7785160 - 7785234
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaag 238  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7785160 cagggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaag 7785234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22758888 - 22758839
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 476  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758888 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacct 22758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 184
Target Start/End: Original strand, 7785162 - 7785219
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-catt-ccagggcatgagccctcaac 184  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  7785162 gggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 7785219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 19236026 - 19236059
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19236026 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 19236059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11440 - 11049
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11440 ggtactattttcaactcgttgaatgactaagcagtccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagttt 11341  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagg 287  Q
    ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  11340 gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagg 11243  T
Q  288 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 387  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11242 gcataagccctcaacggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcataca 11144  T
Q  388 actcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11143 actcaactacgacaacgacaacataggcgacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 8722 - 9100
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  8722 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgagcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccag 8819  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  8820 ggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggtt 8917  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8918 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 9017  T
Q  407 aacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9018 aacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacatggtcaacatcaacaacctatga 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 109 - 338
Target Start/End: Original strand, 8682 - 8910
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||    
T  8682 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgagcattccag 8780  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8781 ggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatt 8878  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8879 gaatgacaaagcattccagggcataagccctc 8910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 8522462 - 8522861
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522462 tggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 8522561  T
Q  190 gaatgattaac--attccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccag 286  Q
    ||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  8522562 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 8522659  T
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  8522660 ggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatatcaacatac 8522758  T
Q  387 aactcaactacgacaacaacaacatagg------tgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522759 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 8522858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 15538832 - 15539216
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||    
T  15538832 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatccca 15538931  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| | || | ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15538932 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagctttccggagcataagcccccaacaatttgaatggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagt 15539031  T
Q  306 t-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaaca 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  15539032 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaacacaactacgacaacg 15539131  T
Q  405 acaacataggt------gacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||       ||||||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15539132 acaacataggtaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatcacttactccccaacttcgtcaacatcaacaacctatga 15539216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 16101993 - 16102288
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  16101993 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 16102092  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16102093 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 16102191  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16102192 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 16102288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Original strand, 12595608 - 12595902
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |    
T  12595608 ttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcta 12595706  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12595707 gagcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 12595805  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12595806 cacctcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 12595902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 188 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15686582 - 15686289
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15686582 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 15686484  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 385  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15686483 gggcataagccctcaactgttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatggaaggactcaacttgtgtatatcagcata 15686384  T
Q  386 caactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 477  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15686383 caactcaactacgacaacgacaacataggcaactacaacaactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 15686289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 16829488 - 16829743
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829488 ttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 16829587  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  16829588 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacg 16829686  T
Q  426 atcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829687 actgtgcacaataactatcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16829743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 228 - 480
Target Start/End: Original strand, 29492446 - 29492700
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    |||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29492446 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagg 29492545  T
Q  327 gcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacga 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  29492546 gcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacga 29492644  T
Q  427 tcgtgcataataact--cactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
     |||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29492645 ccgtgcacaatgactacgactcactccccaacttggtcaacgtcaacaacttatga 29492700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 16812468 - 16812723
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16812468 ttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccag 16812567  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacg 425  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  16812568 ggcatgagccctcaatagtttcctaatcatgaaa-gactcaacttgtgtatatcatcataaaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacg 16812666  T
Q  426 atcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16812667 attgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16812723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 342
Target Start/End: Original strand, 13763959 - 13764191
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |    
T  13763959 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaaca-attgaatgataaaaattccacg 13764057  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttg 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13764058 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaaca-attgaatgataaacaatccagggcatgagccctcaacagtttg 13764156  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13764157 aatgacaaatcattccagggcataagccctcaaca 13764191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2288393 - 2288090
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  2288393 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaatag-ttgaatgacaaggcattcca 2288295  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcat 384  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2288294 gggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccttcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacat 2288195  T
Q  385 acaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------cgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 475  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2288194 acaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacaccaacaacc 2288095  T
Q  476 tatga 480  Q
    |||||    
T  2288094 tatga 2288090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 13764245 - 13764425
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||    
T  13764245 cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccatc 13764343  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  13764344 aaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaaca 13764425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 13764114 - 13764347
Alignment:
Q  108 attgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattcca 206  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13764114 attgaatga-taaacaatccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattccagggcataagccctcaaca-attgaatgataaacattcca 13764211  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-t 305  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13764212 gagcatgagccctcggcagtttgaacgaccaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtt 13764310  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13764311 tgaatgacaaagcattccagggcataagccatcaaca 13764347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 13764076 - 13764311
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  13764076 ttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaacaatt-gaatgataaacaatccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattccag 13764174  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || |||||||||  ||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13764175 ggcataagccctcaaca-attgaatgataaa-cattccagagcatgagccctcggcagtttgaacgaccaggcattccagggcataagccctcaacagtt 13764272  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13764273 gaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 13764311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23621381 - 23621195
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23621381 cattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccct 23621283  T
Q  260 caacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttc 347  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23621282 caacag-ttgaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttc 23621195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 346
Target Start/End: Original strand, 13764244 - 13764467
Alignment:
Q  121 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccct 219  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||| |    
T  13764244 gcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccat 13764342  T
Q  220 caacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagc 318  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |    
T  13764343 caaca-attgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataaa-c 13764439  T
Q  319 attccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  13764440 attccagagaatgagccctcagcagttt 13764467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 16101993 - 16102150
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  16101993 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 16102092  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  16102093 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 16102150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 24440865 - 24440978
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24440865 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccc-aacaatttcaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattccagg 24440963  T
Q  209 gcatgagccctcaac 223  Q
    |||||||||||||||    
T  24440964 gcatgagccctcaac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621200
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 23621296  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattccagggcatgagccctcaaca 303  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23621295 gggcatgaaccctcaacag-ttgaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatag-ttgaatgaaaaagcattccagggcatgagccctcaaca 23621200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2288393 - 2288238
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |  |||||||    
T  2288393 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaatag-ttgaatgacaaggcattcca 2288295  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  2288294 gggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccttcaac 2288238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15686582 - 15686428
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  15686582 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattcca 15686484  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  15686483 gggcataagccctcaactg-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 15686428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 23352132 - 23352243
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||     
T  23352132 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccaa 23352230  T
Q  208 ggcatgagccctc 220  Q
    |||||||||||||    
T  23352231 ggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 29492446 - 29492562
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  29492446 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccag 29492544  T
Q  208 ggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29492545 ggcatgagccctcaacag 29492562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 16829470 - 16829605
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16829470 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-tt 16829568  T
Q  190 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16829569 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 16829605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 13764310 - 13764502
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  13764310 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacaatt-gaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctag 13764408  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |  |||||||||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13764409 ggcataagccctcaaca-attgaatgataa-acattccagagaatgagccctcagcagtttaaatgaccaggcattacagggcataagccctcaac 13764502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 303
Target Start/End: Original strand, 12389463 - 12389644
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389463 gggcatgagcccttaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtctgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 12389562  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389563 gtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacactttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 12389644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 16812450 - 16812582
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16812450 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-tt 16812548  T
Q  190 gaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaa 222  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16812549 gaatgacatagcattccagggcatgagccctcaa 16812582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9186074 - 9185881
Alignment:
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9186074 ggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaaca 9185975  T
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9185974 attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 9185881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 12595608 - 12595764
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |    
T  12595608 ttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcta 12595706  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  12595707 gagcataagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 12595764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 221635 - 221747
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||  || ||||||||    
T  221635 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaaca-attgagtgacgaagcattccag 221733  T
Q  208 ggcatgagccctca 221  Q
    ||||||| ||||||    
T  221734 ggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 23352132 - 23352243
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23352132 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaag 23352231  T
Q  327 gcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||||    
T  23352232 gcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 16829508 - 16829607
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829508 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagt 16829606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 342
Target Start/End: Original strand, 12389461 - 12389644
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    |||||| |||||| |||||||||||    
T  12389461 cagggcatgagcccttaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtctgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaa 12389560  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca-gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389561 cagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacactttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 12389644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29848613 - 29848499
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  29848613 ttgaatgactaagcatttcgaggcataagccctcaaaaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcaag 29848515  T
Q  208 ggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||| ||||||||||    
T  29848514 ggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Original strand, 21469739 - 21469879
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccc 297  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21469739 cattccagggcatgagccctatccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgactagcattccagggcatgagccc 21469837  T
Q  298 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21469838 tcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 1639059 - 1639199
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  1639059 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaata 1639158  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  1639159 gtttgaatgacaaggcattcacagggcataaaccctcaaca 1639199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Original strand, 16812488 - 16812587
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16812488 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaatagt 16812586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Original strand, 23352145 - 23352243
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23352145 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccaaggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 29492458 - 29492564
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29492458 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 29492556  T
Q  299 caacagtt 306  Q
    ||||||||    
T  29492557 caacagtt 29492564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Original strand, 16804631 - 16804752
Alignment:
Q  91 ggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16804631 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagaccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-tt 16804729  T
Q  190 gaatga-ttaacattccagggca 211  Q
    ||||||  || ||||||||||||    
T  16804730 gaatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Original strand, 25772628 - 25772770
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  25772628 cattccagggcatgagccctctccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggaatgagcc 25772727  T
Q  297 ctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25772728 ctcaccaattgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 25772770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 21469726 - 21469879
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattcc 205  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    || |||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  21469726 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctatccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgactagcattcc 21469824  T
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21469825 agggcatgagccctcacca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 25806861 - 25807001
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatg-atgaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  25806861 gggcataagccttcaacaatttgaatggactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaata 25806960  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25806961 gtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 25807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29848586 - 29848494
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||| |  ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  29848586 agccctcaaaaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaacggttt 29848494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Original strand, 24266676 - 24266746
Alignment:
Q  109 ttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagcc 178  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24266676 ttgaatgacttaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagcc 24266746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 13763959 - 13764077
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||| |    
T  13763959 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaaa-attccacg 13764057  T
Q  327 gcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13764058 gcatgagccctcaacagttt 13764077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 16804701 - 16804752
Alignment:
Q  278 gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16804701 gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29848592 - 29848499
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  29848592 ggcataagccctcaaaaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Original strand, 1584259 - 1584359
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1584259 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 1584358  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  1584359 g 1584359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Original strand, 21469739 - 21469879
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21469739 cattccagggcatgagccctatccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgacta-gcattccagggcatgagcc 21469836  T
Q  258 ctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctca 300  Q
    |||| || |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  21469837 ctcacca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 411
Target Start/End: Original strand, 1584266 - 1584428
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcct 349  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  1584266 agccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt-at 1584364  T
Q  350 aatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
     | |||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  1584365 gagcatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacatctacaacat 1584428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9186074 - 9185933
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  9186074 ggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaaca 9185975  T
Q  265 gattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
     |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9185974 -attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagtt 9185933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9186035 - 9185938
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9186035 cagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaaca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaa 9185938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 16812521 - 16812582
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16812521 cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaa 16812582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 397
Target Start/End: Original strand, 18137580 - 18137693
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaagga-ctccacttgtgtatatcagc 382  Q
    |||||||| |||||||  || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || || |||||||||||||||||| |    
T  18137580 cagggcataagccctctccaattgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttta-tgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaac 18137678  T
Q  383 atacaactcaactac 397  Q
    |||||||||||||||    
T  18137679 atacaactcaactac 18137693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 411
Target Start/End: Original strand, 1639057 - 1639269
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  1639057 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 1639156  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaag-gactccactt-gtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
     |||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||   | | ||| ||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1639157 tagtttgaatgacaaggcattcacagggcataaaccctcaacaatttatgagt-atgcaattgactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactac 1639255  T
Q  398 gacaacaacaacat 411  Q
     ||||| |||||||    
T  1639256 aacaacgacaacat 1639269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Original strand, 221635 - 221747
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||||||| | ||||||  |||| | ||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  221635 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacaattgagtgacgaagcattccagg 221734  T
Q  327 gcatgagccctca 339  Q
    |||||| ||||||    
T  221735 gcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13751472 - 13751332
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaac-attc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac- 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  13751472 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagtattcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaaca 13751373  T
Q  224 agattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  13751372 attttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 13751332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Original strand, 16804689 - 16804752
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  16804689 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Original strand, 25772628 - 25772770
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||    |||||||||||  ||||||    
T  25772628 cattccagggcatgagccctctccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggaatgagcc 25772727  T
Q  258 ctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctca 300  Q
    |||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25772728 ctcacca-attgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 25772770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Original strand, 1639057 - 1639199
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||    
T  1639057 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 1639156  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
     || ||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||    
T  1639157 tagtttgaatgacaaggcattcacagggcataaaccctcaaca 1639199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Original strand, 24440878 - 24440978
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||    
T  24440878 cattccggggcataagccc-caacaatttcaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgatta-acattccagggcatgagccctc 24440975  T
Q  261 aac 263  Q
    |||    
T  24440976 aac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 302
Target Start/End: Original strand, 24440916 - 24440978
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  24440916 cattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 261
Target Start/End: Original strand, 221655 - 221747
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  221655 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccatcaaca-attgagtgacgaagcattccagggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 12389461 - 12389566
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagt-tgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12389461 cagggcatgagcccttaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtctgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaa 12389560  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  12389561 cagttt 12389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 345
Target Start/End: Original strand, 16804689 - 16804729
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804689 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 16804729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Original strand, 22346652 - 22346743
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 335  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22346652 cagggcataagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgacaaggcgttccagggcatgagcc 22346743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 24440916 - 24440983
Alignment:
Q  279 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24440916 cattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 24440983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17027304 - 17027209
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  17027304 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 17027209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1590581 - 1590539
Alignment:
Q  369 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1590581 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacat 1590539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 250
Target Start/End: Original strand, 16804702 - 16804751
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  16804702 cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacatagcattccagggc 16804751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 346
Target Start/End: Original strand, 24266781 - 24266823
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24266781 gttgaatgataaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 24266823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Original strand, 25806859 - 25807001
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25806859 cagggcataagccttcaacaatttgaatggactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 25806958  T
Q  263 cagattgaatgacgag-cattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
     || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25806959 tagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 25807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Original strand, 1584258 - 1584359
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1584258 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 1584357  T
Q  264 ag 265  Q
    ||    
T  1584358 ag 1584359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 17526287 - 17526388
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| | | |||||||    
T  17526287 cagggcatgagcccacaatagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataacccctcaa 17526386  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  17526387 ca 17526388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 257
Target Start/End: Original strand, 22346652 - 22346743
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22346652 cagggcataagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgacaaggcgttccagggcatgagcc 22346743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 23352143 - 23352211
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23352143 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 23352211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 25806859 - 25806964
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||| ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25806859 cagggcataagccttcaacaatttgaatggactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 25806958  T
Q  341 cagttt 346  Q
     |||||    
T  25806959 tagttt 25806964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 25806900 - 25807001
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  25806900 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 25806999  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  25807000 ca 25807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17027304 - 17027209
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  17027304 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcacca-attgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 17027209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Original strand, 17526256 - 17526351
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17526256 agccctcaaca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagcccacaatagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 17526351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 337
Target Start/End: Original strand, 21469726 - 21469758
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21469726 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 21469758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 248
Target Start/End: Original strand, 24266697 - 24266776
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 248  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  24266697 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccgttaac-ggttgaatgacaaaacattccagg 24266776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 24266704 - 24266776
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    ||||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24266704 agcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccgttaacggttgaatgacaaaacattccagg 24266776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Original strand, 29265487 - 29265602
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga--gcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |   |||||||   |  |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  29265487 ttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcc 29265586  T
Q  324 agggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  29265587 agggcatgagccctca 29265602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 1584258 - 1584361
Alignment:
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1584258 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 1584357  T
Q  303 agtt 306  Q
    ||||    
T  1584358 agtt 1584361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 18137480 - 18137514
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18137480 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 18137514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Original strand, 18137480 - 18137514
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18137480 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 18137514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 300
Target Start/End: Original strand, 21476346 - 21476380
Alignment:
Q  266 attgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21476346 attgaatgactagcattccagggcatgagccctca 21476380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1590710 - 1590641
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatga 312  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1590710 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaaagttgaatga 1590641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Original strand, 4476544 - 4476577
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4476544 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 4476577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20008877 - 20008844
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20008877 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20008844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21365465 - 21365432
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21365465 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 21365432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 21476266 - 21476299
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21476266 ttgaatgacaaagcattccatggcatgagccctc 21476299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621357
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 23621357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23969447 - 23969414
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23969447 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 23969414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 21476266 - 21476380
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattcc 205  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |  || |||||||| | ||  ||||| |||||||||| |||| | || ||||||||| || ||||||    
T  21476266 ttgaatgacaaagcattccatggcatgagccctctccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgaaccctaacca-attgaatgactagcattcc 21476364  T
Q  206 agggcatgagccctca 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  21476365 agggcatgagccctca 21476380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 261
Target Start/End: Original strand, 21476279 - 21476380
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21476279 cattccatggcatgagccctctccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgaaccctaacca-attgaatgactag-cattccagggcatgagcc 21476376  T
Q  258 ctca 261  Q
    ||||    
T  21476377 ctca 21476380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 9)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 59166 - 59402
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  59166 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaattttaatgat-aacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaaacattccag 59263  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaaca-gt 305  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  59264 agcatgagccctcaacag-gtgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaataggt 59361  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  59362 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttt 59402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 205483 - 205343
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  205483 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaaca 205384  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
      |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  205383 atttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 205343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 397
Target Start/End: Original strand, 384104 - 384304
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattcc-agggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  384104 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcatagggcatgagc 384202  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||  || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||  || |||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  384203 cctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcttaagccctctccaattt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 384301  T
Q  395 tac 397  Q
    |||    
T  384302 tac 384304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 384091 - 384206
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  384091 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 384190  T
Q  323 cagggcatgagccctc 338  Q
     |||||||||||||||    
T  384191 tagggcatgagccctc 384206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 205485 - 205343
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  205485 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaa 205386  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    || || ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  205385 caatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 205343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 205485 - 205343
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||| |||||| |||||||||||    
T  205485 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaa 205386  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  205385 caatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 205343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 384091 - 384245
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc 204  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||    
T  384091 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattc 384189  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
      |||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  384190 atagggcatgagccctctcca-attgaacgacaaggcgttccagggcttaagccctc 384245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Original strand, 384091 - 384128
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  384091 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 384128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 339
Target Start/End: Original strand, 384103 - 384167
Alignment:
Q  278 gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgac-aaagcattc-cagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  384103 gcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctca 384167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9123 - 8881
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatt 197  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9123 ttttcaacggattgaatgactgagctttccggggcttaagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacattttgaatgatt 9024  T
Q  198 aacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagcc 296  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  9023 ttcattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-aaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagcc 8925  T
Q  297 ctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||| |   ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8924 ctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctca 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9021 - 8729
Alignment:
Q  122 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 220  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  9021 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgaaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctc 8922  T
Q  221 aacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagc 318  Q
    | |   ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||    
T  8921 accgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggc 8822  T
Q  319 attccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
     ||| ||||||| |||||||| || |||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8821 gttctagggcataagccctcaccaattt-atgtttatgtaacgaactcgactttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 8729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8725 - 8672
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8725 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10101 - 10055
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10101 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagcccccaacagtttgaatg 10055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10101 - 10060
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10101 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagcccccaacagttt 10060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10088 - 10013
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10088 cattccagggcatgagcccccaacagtttgaatggttaaagcattcacagggaatgagccctcacca-attgaatga 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40368 - 40131
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||  | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  40368 ttgaatgacataacattctgggccttaagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagcccttaacagtttgaatgacaaggcattccag 40269  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40268 ggagtaagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 40171  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40170 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagttt 40131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 252 - 469
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1634
Alignment:
Q  252 tgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttccta 350  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1415 tgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttaccta 1514  T
Q  351 atcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcac 448  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  1515 aacatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcac 1613  T
Q  449 tccccaacttggtcaacatca 469  Q
    |||| |||| | |||||||||    
T  1614 tcccaaactcgatcaacatca 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 302
Target Start/End: Original strand, 1414 - 1505
Alignment:
Q  211 atgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1414 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 263
Target Start/End: Original strand, 1414 - 1505
Alignment:
Q  172 atgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1414 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Original strand, 1417 - 1505
Alignment:
Q  136 agcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1417 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 391
Target Start/End: Original strand, 149 - 179
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149 gactccacttgtgtatatcagcatacaactc 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 339
Target Start/End: Original strand, 137484 - 137714
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  137484 tgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaataatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagg 137583  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttg 307  Q
    |||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  137584 gcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactg-ttgaatgattaacattccagagcatgagccctcaacagattg 137682  T
Q  308 aatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  137683 aatgacaaagcattccagggaataagccctca 137714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 137554 - 137754
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||  |  | ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  137554 tcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactg-ttgaatgattaa 137652  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  137653 cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggaataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccct 137752  T
Q  299 ca 300  Q
    ||    
T  137753 ca 137754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 343
Target Start/End: Original strand, 137496 - 137678
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  137496 cattccggagcataagcccccaacaatttgaataatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 137595  T
Q  261 aacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    | ||  ||||| ||| || | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  137596 accaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactgttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacag 137678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 339
Target Start/End: Original strand, 137653 - 137754
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccct 337  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  137653 cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggaataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccct 137752  T
Q  338 ca 339  Q
    ||    
T  137753 ca 137754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 410
Target Start/End: Original strand, 137788 - 137826
Alignment:
Q  372 tgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  137788 tgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 137826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 8)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12688 - 12455
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  12688 cattccagggcataagccctcaaca-attgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctc 12590  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aa 358  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||  ||| ||    
T  12589 aacagtttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacggttttataagtatgcaa 12490  T
Q  359 aggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactca 392  Q
     |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  12489 tggactcaactttgtgtatatcaacatacaactca 12455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13071
Alignment:
Q  116 actaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatga 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |    
T  13296 actaagcattctggggcataagccccaaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataa 13198  T
Q  215 gccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatga 312  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  13197 gccgtcaacaga-tgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatca 13099  T
Q  313 caaagcattccagggcatgagccctcaa 340  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||    
T  13098 cgaggcattccagggcataagccctcaa 13071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12508
Alignment:
Q  120 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccc 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||||| |||||    
T  12690 agcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccc 12592  T
Q  219 tcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12591 tcaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaac 12508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13263 - 13025
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  || |||| ||    
T  13263 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagat-gaatgacaaagcatttca 13167  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  13166 gggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatcacgaggcattccagggcataagccctcaatggt 13067  T
Q  306 t-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    | ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  13066 ttgaatgacaaggctatccaaggcataagccctcaacagttt 13025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12623 - 12508
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||     
T  12623 ttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctcaacagtttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaa 12524  T
Q  208 ggcatgagccctcaac 223  Q
    ||||| ||||||||||    
T  12523 ggcataagccctcaac 12508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12622
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690 agcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 12622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13185 - 13015
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |  ||||||||    
T  13185 tgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatcacgaggcattccag 13086  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag 278  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  13085 ggcataagccctcaatggtttgaatgacaaggctatccaaggcataagccctcaacagtttgaatcacgag 13015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 125072 - 125038
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125072 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 125038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 4317 - 4554
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  4317 ttgaatgactaagcattccagggcacaagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 4415  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4416 gggcattagccctcaatag-ttggatgacaaggcatcccagggcataagcccgcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 4513  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4514 tggatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagttt 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 343
Target Start/End: Original strand, 2009 - 2242
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||    
T  2009 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctag 2108  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| | |||||||| | ||||||||  |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2109 ggcataatccctcaac-ggttgaatgatta-atattccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggtt 2206  T
Q  307 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 343  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2207 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 2242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2278
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  2101 cattctagggcataatccctcaacgg-ttgaatgattaatattccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattccagggcataagccctc 2199  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2200 aacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 410
Target Start/End: Original strand, 2080 - 2390
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa- 199  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2080 tcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacggtt-gaatgattaatattccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaag 2178  T
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccct 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  2179 cattccagggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccct 2276  T
Q  299 caacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaact 395  Q
    || || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2277 caccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctc-accgctttatgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagcataaaactcaact 2375  T
Q  396 acgacaacaacaaca 410  Q
    |||||||| ||||||    
T  2376 acgacaacgacaaca 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 480
Target Start/End: Original strand, 2394 - 2447
Alignment:
Q  429 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2394 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 2447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 50697 - 50936
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  50697 ttgaatgactgagcattccggggcataagccccaaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattctag 50795  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacag 304  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| |||||||| ||||||||||      
T  50796 ggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaacga 50895  T
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50896 ttgaacgataaa-catttcagggcatgagccctcaacagttt 50936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 50775 - 51015
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc- 204  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||     
T  50775 ttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattca 50874  T
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaa-tgacgag-cattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||  |||| |||||| |||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  50875 cagggcataagccctcaac-gattgaacgataaa-catttcagggcatgagccctcaacagtttaaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 50972  T
Q  303 agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50973 agttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 51015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 15)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 345
Target Start/End: Original strand, 20803 - 21042
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||    
T  20803 ttgaatgactaagcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 20902  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agt 305  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| | |    
T  20903 gggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagtttgaatgataaacattccagggcatgaaccctcaacaatt 21002  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21003 tgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagtt 21042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 20883 - 21079
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 207  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20883 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagtttgaatgataaacattccag 20982  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20983 ggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacag-ttaaatgattaacattccagggcatga-ccctcaacagtt 21079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 346
Target Start/End: Original strand, 20823 - 20964
Alignment:
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20823 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaat 20922  T
Q  306 t-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  20923 ttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagttt 20964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Original strand, 20843 - 21080
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  |||||||    
T  20843 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 20942  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    |||||| |  ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  20943 gggcataaatcctcaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagt 21041  T
Q  306 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    | |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21042 taaatgattaa-cattccagggcatga-ccctcaacagttt 21080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 23894 - 24026
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  23894 cattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccct 23993  T
Q  260 caacagattgaatgacgagcattccagggcatg 292  Q
    ||| || ||||||||  | ||||||||||||||    
T  23994 caatagtttgaatgataaacattccagggcatg 24026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 23881 - 24002
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  23881 ttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcta 23980  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  23981 gggcataagccctcaatagttt 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 394
Target Start/End: Original strand, 35578 - 35745
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |   ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35578 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcacca-attggataaattagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgacaaggcattcca 35676  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    || |||||||||||| ||||||  | || ||| || ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  35677 ggacatgagccctcaccagttt-atgattatgcaatgactccagttgtgtatatctacatataactcaac 35745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 20814 - 20884
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20814 agcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 20884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 23881 - 24008
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| |    
T  23881 ttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcta 23980  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23981 gggcataagccctcaatagtttgaatga 24008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 35636 - 35691
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35636 cagggcatgagccctcacca-attgaatgacaaggcattccaggacatgagccctca 35691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Original strand, 23961 - 24026
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatg 174  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23961 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaacattccagggcatg 24026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Original strand, 24768 - 24863
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24768 cagggcatgagccgtcacc-gattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 24863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 339
Target Start/End: Original strand, 24808 - 24863
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24808 cagggcatgagccctcaccaattgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 24863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 346
Target Start/End: Original strand, 23880 - 23922
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23880 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagttt 23922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 24708 - 24742
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24708 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 24742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11883 - 11688
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  11883 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 11785  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11784 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11870 - 11683
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11870 cattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 11772  T
Q  260 caacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11771 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttt 11683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11883 - 11767
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11883 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 11784  T
Q  326 ggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||||||||||    
T  11783 ggcatgagccctcaaca 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11884 - 11846
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11884 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 11846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 1503 - 1657
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  1503 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaatt-gaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 1601  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1602 ggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Original strand, 1516 - 1657
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1516 cattccagggcataagcccccagca-attgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 1614  T
Q  261 aacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1615 aacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 1503 - 1662
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1503 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagca-attgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 1600  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1601 gggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35070 - 34873
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||    
T  35070 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctag 34971  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34970 ggcataatccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaactg-ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 34873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35050 - 34873
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagat 267  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |    
T  35050 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacag-t 34952  T
Q  268 tgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34951 tgaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaactgttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 34873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34807
Alignment:
Q  369 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34849 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacatcaacaacat 34807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 8)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 2122 - 2277
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||    
T  2122 tgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 2221  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2222 gcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9121
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||    
T  8966 tgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 9065  T
Q  209 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9066 gcataagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 411
Target Start/End: Original strand, 2173 - 2346
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2173 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 2272  T
Q  339 aacagtttcctaatcatgaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    ||||||||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2273 aacagtttatgagtgtacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacat 2346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 411
Target Start/End: Original strand, 9017 - 9190
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9017 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 9116  T
Q  339 aacagtttcctaatcatgaaaggactccac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    ||||||||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9117 aacagtttatgagtgtacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacat 9190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 2122 - 2240
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    |||||||| | |||||||  ||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  2122 tgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 2221  T
Q  327 gcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  2222 gcataagccctcaacagtt 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9084
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagg 326  Q
    |||||||| | |||||||  ||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  8966 tgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 9065  T
Q  327 gcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9066 gcataagccctcaacagtt 9084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 2200 - 2277
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2200 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 9044 - 9121
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9044 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Original strand, 165 - 350
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  165 cattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 263  T
Q  260 caacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  264 caacag-ttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattctagggcatgagccctcaacagttt 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 152 - 349
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  || |||||||    
T  152 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatag-ttgaatgacaaagcattcca 250  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  251 gggcatgagccctcaacag-ttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacag-ttggatgacaaagcattctagggcatgagccctcaacagt 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Original strand, 152 - 310
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  152 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatag-ttgaatgacaaagcattcca 250  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  251 gggcatgagccctcaacagttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacagtt 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 151 - 189
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  151 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4136 - 3943
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||     
T  4136 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccat 4037  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  4036 ggcataagccctcaaca-attgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 3943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 168 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4116 - 3888
Alignment:
Q  168 gggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagat 267  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  4116 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaaca-at 4018  T
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaa-tgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactc 365  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  | |  ||| || ||||||    
T  4017 tgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactc 3918  T
Q  366 cac-ttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||    
T  3917 aactttgtgtatatcaacatacaactcaac 3888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 263
Target Start/End: Original strand, 2759 - 2931
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagatt 189  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2759 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccgcggcataagcccctaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagatt 2858  T
Q  190 gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2859 gaatgacaagacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 2818 - 2931
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagg 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  2818 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaacattccagg 2916  T
Q  288 gcatgagccctcaac 302  Q
    |||||||||||||||    
T  2917 gcatgagccctcaac 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 346
Target Start/End: Original strand, 2830 - 2936
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  2830 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 2928  T
Q  339 aacagttt 346  Q
    ||| ||||    
T  2929 aacggttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 2818 - 2897
Alignment:
Q  267 ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2818 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagtt 2897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 5700 - 5855
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  5700 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttaaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataagtcattccag 5799  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5800 ggcataagccctcgaca-attgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 5855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Original strand, 5713 - 5857
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  5713 cattccggggcataagcccccaacaatttaaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataagtcattccagggcataagccctc 5812  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
     ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5813 gaca-attgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 5857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 411
Target Start/End: Original strand, 5700 - 5924
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  || ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  5700 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttaaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataagtcattcca 5798  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcat-gaaaggactccac-ttgtgtatatcagca 383  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || |||||| || |||||||||||| ||    
T  5799 gggcataagccctcgacaattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaaca 5896  T
Q  384 tacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5897 tacaactcaactacaacaacaacaacat 5924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14142 - 13981
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  14142 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 14043  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14042 gggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttt 13981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14142 - 13986
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  |||||||    
T  14142 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 14043  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14042 gggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 13986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14129 - 13986
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14129 cattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 14030  T
Q  260 caacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14029 caacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 13986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14143 - 14105
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14143 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaaca 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 6087
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||    
T  6242 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctag 6143  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6142 ggcataagccctcaac-ggttgaatg-cttaacattccagggcatgagccctcaacag 6087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 240 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6190 - 6032
Alignment:
Q  240 cattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  6190 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacggttgaatgcttaa-cattccagggcatgagccctc 6092  T
Q  339 aacagtttcctaatcatgaaa-ggactccactt-gtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6091 aacagtt-cctaattatgaaatggactcaactttgtgtatatcagcatacaactcaactac 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6229 - 6085
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  6229 cattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataagccctc 6130  T
Q  261 aacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||| | |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6129 aac-ggttgaatgcttaacattccagggcatgagccctcaacagtt 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 6127
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  6242 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctag 6143  T
Q  326 ggcatgagccctcaac 341  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6142 ggcataagccctcaac 6127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6087
Alignment:
Q  101 tcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171 tcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacggtt-gaatgcttaacattccagggcatgagccctcaacag 6087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Original strand, 13902 - 14143
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatt 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  13902 ttttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataagcccc-aacaatttgaatgataaatattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgaca 13999  T
Q  198 a-acattccagggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatg 292  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||| ||||||||     
T  14000 atgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactaccattcacagggcata 14099  T
Q  293 agccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagcc 335  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||    
T  14100 agccctcaacaattgaacgacaaggcgttcacagggcataagcc 14143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Original strand, 13965 - 14031
Alignment:
Q  280 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13965 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagttt 14031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 13965 - 14073
Alignment:
Q  241 attccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccc 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13965 attccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccc 14063  T
Q  337 tcaacagttt 346  Q
    ||||| ||||    
T  14064 tcaacggttt 14073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Original strand, 11897 - 12138
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatt 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  11897 ttttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataagcccc-aacaatttgaatgataaatattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgaca 11994  T
Q  198 a-acattccagggcatgagccctcaacagattgaat-gacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatg-acgagcattc-cagggcatg 292  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||| ||||||||     
T  11995 atgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactaccattcacagggcata 12094  T
Q  293 agccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagcc 335  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||    
T  12095 agccctcaacaattgaacgacaaggcgttcacagggcataagcc 12138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12026
Alignment:
Q  280 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11960 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagttt 12026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12068
Alignment:
Q  241 attccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccc 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11960 attccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccc 12058  T
Q  337 tcaacagttt 346  Q
    ||||| ||||    
T  12059 tcaacggttt 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 10569 - 10725
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||||||||    
T  10569 ttgaatgagtaagcattccggggcataagcccccaataatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccag 10668  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||    
T  10669 ggcataagccctcaatag-ttgaatgacagggtattctagggcataagccctcaacag 10725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 346
Target Start/End: Original strand, 10569 - 10728
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  10569 ttgaatgagtaagcattccggggcataagcccccaataatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcca 10667  T
Q  286 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10668 gggcataagccctcaatagttgaatgacagggtattctagggcataagccctcaacagttt 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Original strand, 113 - 209
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 tggtactgttttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 145 - 209
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  145 cattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Original strand, 132 - 211
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  132 ttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagtt 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 411
Target Start/End: Original strand, 143 - 278
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccac-ttgtg 373  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||| || |||||    
T  143 agcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtg 240  T
Q  374 tatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacat 411  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  241 tatatcaacataaaactcaactacaacaacgacaacat 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1800
Alignment:
Q  175 agccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga 274  Q
    ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  1971 agcccccaacaatttgaatgataaatattccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacag-ttgaatga 1873  T
Q  275 cgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
      | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  1872 ttaacattctagggtatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaacgcataagccctcaacagttt 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1801
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  1998 ttgaatgactaagcattccggggtgtaagcccccaacaatttgaatgataaatattccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccag 1899  T
Q  208 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  1898 ggcatcagtcctcaacag-ttgaatgatta-acattctagggtatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaacgcataagccctcaacagtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1879
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1998 ttgaatgactaagcattccggggtgtaagcccccaacaatttgaatgataaatattccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccag 1899  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  1898 ggcatcagtcctcaacagtt 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 134379 - 134142
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  134379 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattcca 134280  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaac 424  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| ||               ||||||||    
T  134279 gggcatgagccctcaaccgtgtcttaatcatg-aaggactcaact----tatatcagcatacaactcaactacggca---------------acgacaac 134200  T
Q  425 gatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    || |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134199 gaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 134142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 134398 - 134263
Alignment:
Q  90 tggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 188  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  134398 tggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatt 134299  T
Q  189 tgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  134298 tgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaac 134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 134379 - 134263
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattcca 285  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||  |||||||||    
T  134379 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattcca 134280  T
Q  286 gggcatgagccctcaac 302  Q
    |||||||||||||||||    
T  134279 gggcatgagccctcaac 134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6836
Alignment:
Q  110 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  6725 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagg 6823  T
Q  209 gcatgagccctca 221  Q
    |||| ||||||||    
T  6824 gcataagccctca 6836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 6737 - 6918
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6737 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 6835  T
Q  261 aac-agattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    | | |  |||||||     ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6836 accgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 339
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6836
Alignment:
Q  228 tgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaggg 327  Q
    |||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||  ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6725 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaggg 6824  T
Q  328 catgagccctca 339  Q
    ||| ||||||||    
T  6825 cataagccctca 6836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 6735 - 6803
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6735 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattcctgggcatgagccctcaacagtt 6803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 9619 - 9739
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 325  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9619 ttgaatgacaaagcatacaagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttaatgacaaagcattccag 9718  T
Q  326 ggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  9719 ggcatgagccgtcaacagttt 9739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 9638 - 9738
Alignment:
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9638 agggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggtttaatgacaaagcattccagggcatgagccgtcaacag 9736  T
Q  305 tt 306  Q
    ||    
T  9737 tt 9738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Original strand, 9638 - 9736
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  9638 agggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac-ggtttaatgacaaagcattccagggcatgagccgtcaacag 9736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Original strand, 9563 - 9608
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 154  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9563 ttgaatgactaggcattctggggcataagcccccaacaatttgaat 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 9612 - 9660
Alignment:
Q  298 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  9612 tcaacagttgaatgacaaagcatacaagggcatgagccctcaacggttt 9660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 403
Target Start/End: Original strand, 10478 - 10605
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccac-ttgtgta 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |    || |||||| || |||||||    
T  10478 agcattccggggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttatgagtgtacaatggactcgactttgtgta 10577  T
Q  376 tatcagcatacaactcaactacgacaac 403  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10578 tatcaacatacaactcaactacaacaac 10605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Original strand, 10456 - 10542
Alignment:
Q  98 ttttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaac 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10456 ttttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 263
Target Start/End: Original strand, 10467 - 10542
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10467 ttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Original strand, 10467 - 10542
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaac 302  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10467 ttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 10480 - 10542
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10480 cattccggggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 345
Target Start/End: Original strand, 10466 - 10507
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10466 gttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacagtt 10507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21913 - 21715
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||  |||||||| |||    
T  21913 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattaacagggcataagc 21814  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21813 cctcaacgattaaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagttt-atgattatgcaatggactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 21715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21913 - 21764
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcatt-ccagggcgtgagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||  |||||| | |||    
T  21913 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattaacagggcataagc 21814  T
Q  257 cctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 306  Q
    ||||||| |||| || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21813 cctcaac-gattaaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagtt 21764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21926 - 21885
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21926 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 21885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21926 - 21807
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatt- 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||     
T  21926 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatta 21827  T
Q  322 ccagggcatgagccctcaac 341  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  21826 acagggcataagccctcaac 21807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21915 - 21843
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21915 agcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 21843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 223742 - 223630
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccag 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  223742 ttgaatgactaagcattctgggacacaagcccccaacaatttgaatgataaacattccatggcataacccctcaaca-attgaatgacaaagcattccag 223644  T
Q  208 ggcatgagccctca 221  Q
    ||||||||||||||    
T  223643 ggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 223715 - 223630
Alignment:
Q  254 agccctcaacagattgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||||  ||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  223715 agcccccaacaatttgaatgataaacattccatggcataacccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 223715 - 223630
Alignment:
Q  175 agccctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  223715 agcccccaacaatttgaatgataaacattccatggcataacccctcaaca-attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 8)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1210
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccct 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  1078 cattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccct 1177  T
Q  260 caacagattgaatgacgagcattccagggcatg 292  Q
    ||| || ||||||||  | ||||||||||||||    
T  1178 caatagtttgaatgataaacattccagggcatg 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 346
Target Start/End: Original strand, 1065 - 1186
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 324  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  1065 ttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcta 1164  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  1165 gggcataagccctcaatagttt 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 1065 - 1192
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattcca 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| |    
T  1065 ttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcta 1164  T
Q  207 gggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1165 gggcataagccctcaatagtttgaatga 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Original strand, 1145 - 1210
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatg 174  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1145 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaacattccagggcatg 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2047
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1952 cagggcatgagccgtcacc-gattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 339
Target Start/End: Original strand, 1992 - 2047
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1992 cagggcatgagccctcaccaattgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 346
Target Start/End: Original strand, 1064 - 1106
Alignment:
Q  304 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1064 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagttt 1106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 1892 - 1926
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1892 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 397
Target Start/End: Original strand, 34476 - 34649
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga--gcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |  ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||    
T  34476 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcagtcacagggcataagccctcaacaattaaatgacaaggtgttcc 34575  T
Q  324 agggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34576 agggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaattcaactac 34649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 397
Target Start/End: Original strand, 29298 - 29411
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagc 382  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||||||||||||| |    
T  29298 cagggcataacccctcaacaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaac 29396  T
Q  383 atacaactcaactac 397  Q
    |||||||||||||||    
T  29397 atacaactcaactac 29411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 34489 - 34595
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34489 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcagtcacagggcataagccctcaaca-attaaatgacaaggtgttccagggcatgagcc 34587  T
Q  258 ctcaacag 265  Q
    ||||||||    
T  34588 ctcaacag 34595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29357
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--catt 203  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| || | ||| ||||| |||||||| | ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  29196 ttgaatgacaaagcatttcagggaatgaaccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgggtcctcaacagtttgaatggttaaagcatt 29295  T
Q  204 c-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacag 265  Q
    | |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29296 cacagggcataacccctcaaca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacag 29357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 346
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29237
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  29196 ttgaatgacaaagcatttcagggaatgaaccctcaacagttt 29237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 165742 - 165629
Alignment:
Q  179 ctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatgacgag 278  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |     
T  165742 ctcaacagtttgaatgataaaattttccgggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgattaa 165644  T
Q  279 cattccagggcatga 293  Q
    |||||||||||||||    
T  165643 cattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165629
Alignment:
Q  247 gggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatga 332  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165654
Alignment:
Q  286 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagtt 165654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 165694 - 165629
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatga 175  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  165694 ttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgattaacattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 165740 - 165648
Alignment:
Q  142 caacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatga 234  Q
    ||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  165740 caacagtttgaatgataaaattttccgggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatga 165648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29459 - 29340
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29459 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 29360  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
      ||||||||||||| ||||    
T  29359 atttgaatgacaaggaattc 29340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29461 - 29360
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29461 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 29362  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  29361 ca 29360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29461 - 29349
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||    
T  29461 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 29362  T
Q  263 cagattgaatgac 275  Q
    ||  |||||||||    
T  29361 caatttgaatgac 29349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 7087 - 7187
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  7087 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 7185  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  7186 ca 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 342
Target Start/End: Original strand, 7046 - 7187
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||| | |  |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  7046 cagggcataagccctcaacaatttaaataaaatagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 7145  T
Q  302 cagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  7146 cagttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Original strand, 7087 - 7150
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7087 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 7150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 186
Target Start/End: Original strand, 7089 - 7148
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7089 gggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacag 7148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1528
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  1668 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaaca 1569  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  1568 gtttgaacgacaaggcattcacagggcacaagccctcaaca 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1565
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||    
T  1670 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaa 1571  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  1570 cagttt 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1528
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||| || ||||||| |||||||    
T  1670 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaa 1571  T
Q  302 cag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  1570 cagtttgaacgacaaggcattcacagggcacaagccctcaaca 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1528
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| || ||| ||| |||||||    
T  1670 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaa 1571  T
Q  263 cagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||| ||||| ||| | |||||| |||||||  |||||||||||    
T  1570 cagtttgaacgacaaggcattcacagggcacaagccctcaaca 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6674
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatg-aacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac- 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  6554 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaaca 6653  T
Q  224 agattgaatgacaaggcattc 244  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  6654 attttgaatgacaaggcattc 6674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Original strand, 6552 - 6653
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||| | |||||||||    
T  6552 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaa 6651  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  6652 ca 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 6552 - 6653
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  6552 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaa 6651  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  6652 ca 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Original strand, 20683 - 20802
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20683 gggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 20782  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  20783 atttgaatgacgaggcattc 20802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 278
Target Start/End: Original strand, 20681 - 20796
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||    
T  20681 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 20780  T
Q  263 cagattgaatgacgag 278  Q
    ||  ||||||||||||    
T  20781 caatttgaatgacgag 20796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 303
Target Start/End: Original strand, 20681 - 20782
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  20681 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 20780  T
Q  302 ca 303  Q
    ||    
T  20781 ca 20782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 20681 - 20782
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacg-agcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20681 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 20780  T
Q  341 ca 342  Q
    ||    
T  20781 ca 20782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 406
Target Start/End: Original strand, 28778 - 28823
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  28778 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacaacaacaac 28823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 405
Target Start/End: Original strand, 36363 - 36408
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  36363 ggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacaacaacaa 36408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 789
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  957 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagtcctcacca-attgaatgaactaccattcacagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcca 859  T
Q  325 gggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
     |||||||||| ||| || |||  | || ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  858 aggcatgagccttcaccaattt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 848
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagcc 257  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  944 cattccagggcatgagtcctcacca-attgaatgaactaccattcacagggcatgagccctcacca-attgaacgacaaggcgttccaaggcatgagcc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 33623 - 33727
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 341  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  33623 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaac 33722  T
Q  342 agttt 346  Q
    |||||    
T  33723 agttt 33727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 411
Target Start/End: Original strand, 33623 - 33834
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |  | | |||| || |||||||||||||||    
T  33623 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaa 33721  T
Q  302 cagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaa-ggactccactt-gtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| |||   | | ||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33722 cagtttgaatgactaagcattcacagtgcataagccctaaacaatttatgagt-atgcaatggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactac 33820  T
Q  398 gacaacaacaacat 411  Q
     ||||| |||||||    
T  33821 aacaacgacaacat 33834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 244
Target Start/End: Original strand, 33625 - 33743
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  33625 gggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaaca 33723  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc 244  Q
    | ||||||||| | ||||||    
T  33724 gtttgaatgactaagcattc 33743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Original strand, 33623 - 33734
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||| || ||| |||||||||||    
T  33623 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacag-ttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaa 33721  T
Q  263 cagattgaatgac 275  Q
    ||| |||||||||    
T  33722 cagtttgaatgac 33734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15779 - 15731
Alignment:
Q  138 cccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacag 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15779 cccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15768 - 15731
Alignment:
Q  267 ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacag 304  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15768 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15768 - 15731
Alignment:
Q  188 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15768 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 183147 - 183052
Alignment:
Q  255 gccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  183147 gccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 183052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 183116 - 183041
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-catt-ccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  183116 cagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaagg 183041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Original strand, 120036 - 120082
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  120036 ttgaatgactgagcattctggggcatgagcccccaacaatttgaatg 120082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Original strand, 120131 - 120174
Alignment:
Q  268 tgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatg 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  120131 tgaatgacaagcattccagggcatgagcccccaacaattgaatg 120174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 183147 - 183057
Alignment:
Q  176 gccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc-agggcgtgagccctcaac 263  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  183147 gccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 183057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 5)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2811
Alignment:
Q  285 agggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2811
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2811
Alignment:
Q  206 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaaca 264  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2811
Alignment:
Q  246 agggcgtgagccctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaaca 303  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2811
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaaca 185  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2868 gggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 21261 - 21322
Alignment:
Q  277 agcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21261 agcattccgaggcataagccctcaacagttgaatgaaaaagcattctagggcatgagccctc 21322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 21352 - 21404
Alignment:
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21352 ggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 21404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 21250 - 21404
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacaga-ttgaatgattaa--cattc 204  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||| |||||||||||||||  | || ||||| | ||||  |||||    
T  21250 ttgaataactaagcattccgaggcataagccctcaac-agttgaatgaaaaagcattctagggcatgagccctc-ccggatttgaaaggttaaagcattc 21347  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
      | ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21348 atacggcataagccctcacca-attgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 21404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Original strand, 30 - 170
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaac-attc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac- 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  30 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagtattcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaaca 129  T
Q  224 agattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  130 attttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 165
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 244  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  245 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaataatttgaatgccaaggcattc 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 187
Alignment:
Q  253 gagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||| |||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  278 gagctctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 187
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaa 183  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  243 gggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 2954 - 3094
Alignment:
Q  129 gggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaaca 224  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  2954 gggcatgagccctcaataatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctaaacaatttgaatcattaagcattcatagggcatgagccctcaaca 3053  T
Q  225 gattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaaca 264  Q
      ||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  3054 atttgaaggacaaggcattcacagggcataacccctcaaca 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Original strand, 2953 - 3094
Alignment:
Q  167 agggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagccctcaac 263  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |  | ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  2953 agggcatgagccctcaataatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctaaacaatttgaatcattaagcattcatagggcatgagccctcaac 3052  T
Q  264 agattgaatgacga-gcattc-cagggcatgagccctcaaca 303  Q
    |  ||||| ||| | |||||| |||||||| | |||||||||    
T  3053 aatttgaaggacaaggcattcacagggcataacccctcaaca 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 8649 - 8802
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 342  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  8649 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaacgagcattcacagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgtttcagggcatgagccctcacca 8747  T
Q  343 gtttcctaatcatg-aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 397  Q
     |||  | || ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8748 attt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactcaactac 8802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 177923 - 178060
Alignment:
Q  200 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgac-aaggcattc-cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||   || |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  177923 cattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagc 178021  T
Q  296 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagc 334  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  178022 cctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagc 178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Original strand, 177910 - 178026
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctcaacagattgaatg--acgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||     ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  177910 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 178009  T
Q  323 cagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||||||    
T  178010 cagggcatgagccctca 178026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 295
Target Start/End: Original strand, 177923 - 178060
Alignment:
Q  161 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc-cagggcgtgagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    |||||| |||||| |||||    
T  177923 cattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcatgagc 178021  T
Q  257 cctcaacagattgaatgacga-gcattccagggcatgagc 295  Q
    ||||| || |||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  178022 cctcacca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagc 178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 5)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 346
Target Start/End: Original strand, 5320 - 5416
Alignment:
Q  252 tgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  5320 tgagccctcaaca-attgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagttt 5416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 345
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5375
Alignment:
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5316 ggcatgagccctcaacaattgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 5375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5373
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5316 ggcatgagccctcaaca-attgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacag 5373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7227
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7260 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 7227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7227
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7260 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 7227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 20776 - 20930
Alignment:
Q  109 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatg-attaacattc 204  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||| | | ||  | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||    
T  20776 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaacggttaaagcgttcacagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattc 20874  T
Q  205 -cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctc 260  Q
     |||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20875 acagggcataagccctcacca-attgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc 20930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 20836 - 20930
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20836 cagggcatgagccctcacca-attgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc 20930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28155 - 28059
Alignment:
Q  252 tgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagttt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28155 tgagccctcaaca-attgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagttt 28059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28159 - 28100
Alignment:
Q  287 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28159 ggcatgagccctcaacaattgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 28100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28159 - 28102
Alignment:
Q  169 ggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacag 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28159 ggcatgagccctcaaca-attgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacag 28102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 19339 - 19434
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  19339 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 19434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Original strand, 19339 - 19434
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  19339 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcacca-attgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 19434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 410
Target Start/End: Original strand, 4843 - 4972
Alignment:
Q  281 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatga-aaggactccacttgtgtatatc 379  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||  ||   |||| | |||||| |||||||||||||    
T  4843 ttccagggcatgagccctcacgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc-accgctttatatatatgacatggactcaacttgtgtatatc 4941  T
Q  380 agcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4942 tacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16215 - 16110
Alignment:
Q  245 cagggcgtgagccctcaacagattgaatga-cgagcattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaa 340  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  16215 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaa 16116  T
Q  341 cagttt 346  Q
    ||||||    
T  16115 cagttt 16110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16215 - 16071
Alignment:
Q  166 cagggcatgagccctcaacagattgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc-agggcgtgagccctcaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||| | | | |||||||||||    
T  16215 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaa 16116  T
Q  263 cagattgaatgac-gagcattc-cagggcatgagccctcaacagt 305  Q
    ||| ||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16115 cagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaacagt 16071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 480
Target Start/End: Original strand, 162359 - 162392
Alignment:
Q  447 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162359 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 162392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 524712 - 524768
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  524712 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 339
Target Start/End: Original strand, 524712 - 524768
Alignment:
Q  284 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  524712 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 339
Target Start/End: Original strand, 524746 - 524809
Alignment:
Q  278 gcattccagggcatgagccctca--acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  524746 gcattccagggcatgagccctcaccgcttttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 524809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 261
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18023
Alignment:
Q  202 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17964 ttccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 18023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 17866 - 17900
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17866 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Original strand, 17866 - 17900
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17866 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 30
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 30
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  64 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 339
Target Start/End: Original strand, 8674 - 8728
Alignment:
Q  285 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8674 agggcatgagccctgaccaattgaatgacaaggtgttccagggcatgagccctca 8728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6054
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6004 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Original strand, 8156 - 8206
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaaca 410  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8156 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 884 - 918
Alignment:
Q  360 ggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  884 ggactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27077 - 27043
Alignment:
Q  305 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27077 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27077 - 27043
Alignment:
Q  227 ttgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27077 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2847 - 2814
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2847 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 13698 - 13755
Alignment:
Q  281 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 338  Q
    |||||||||||||||||||     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13698 ttccagggcatgagccctcccgctttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctc 13755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 406
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2168
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaac 406  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  2123 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacaacaacaac 2168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 80423 - 80390
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80423 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 80390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 92132 - 92099
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  92132 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 92099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 97858 - 97825
Alignment:
Q  361 gactccacttgtgtatatcagcatacaactcaac 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  97858 gactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 97825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3722 - 3666
Alignment:
Q  205 cagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcgtgagccctca 261  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3722 cagggcataagctctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 3666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 869 times since January 2019
Visitors: 4101