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Alignment Overview

Query: NF0657_low_1 (Length: 778)

Name: NF0657_low_1
Description: NF0657
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0657_low_1
NF0657_low_1
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (205-751)||(44692217-44692763)
chr4 (1-205)||(22132783-22132987)
chr4 (1-205)||(22135015-22135219)
chr4 (1-207)||(56030187-56030393)
chr4 (1-206)||(24347958-24348162)
chr4 (1-205)||(5100743-5100947)
chr4 (4-207)||(44600227-44600430)
chr4 (1-205)||(14787817-14788021)
chr4 (1-206)||(17662622-17662827)
chr4 (473-751)||(44653527-44653796)
chr4 (481-751)||(44632049-44632315)
chr4 (473-751)||(44682536-44682804)
chr4 (451-735)||(44636542-44636825)
chr4 (1-189)||(30136331-30136519)
chr4 (55-207)||(47211158-47211310)
chr4 (1-206)||(38890514-38890702)
chr4 (5-206)||(9022059-9022252)
chr4 (1-205)||(10112626-10112818)
chr4 (51-205)||(9863499-9863650)
chr4 (1-98)||(19322547-19322644)
chr4 (104-203)||(19322410-19322510)
chr4 (1-77)||(53404998-53405074)
chr4 (39-125)||(54929094-54929180)
chr4 (134-205)||(14789500-14789571)
chr4 (39-193)||(38209098-38209257)
chr4 (46-125)||(10979676-10979755)
chr4 (212-296)||(44636412-44636496)
chr4 (127-189)||(5516771-5516833)
chr4 (251-349)||(44654120-44654217)
chr4 (122-191)||(29609914-29609983)
chr4 (86-125)||(14647175-14647214)
chr4 (63-122)||(29609838-29609897)
chr4 (124-171)||(54929198-54929245)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (1-205)||(25803707-25803911)
chr5 (1-205)||(18468698-18468902)
chr5 (1-205)||(27912219-27912423)
chr5 (1-205)||(27910135-27910339)
chr5 (1-205)||(3373426-3373630)
chr5 (1-205)||(15551925-15552129)
chr5 (1-203)||(18511598-18511800)
chr5 (1-202)||(18509703-18509904)
chr5 (1-185)||(10586549-10586733)
chr5 (1-205)||(26098637-26098841)
chr5 (4-205)||(26097421-26097624)
chr5 (22-208)||(21288526-21288713)
chr5 (1-207)||(18596324-18596541)
chr5 (1-125)||(18466453-18466577)
chr5 (53-198)||(17415748-17415893)
chr5 (101-206)||(6661929-6662034)
chr5 (7-125)||(15143262-15143373)
chr5 (126-205)||(40221282-40221361)
chr5 (2-72)||(40221340-40221410)
chr5 (122-189)||(5779144-5779211)
chr5 (151-205)||(18466411-18466465)
chr5 (151-206)||(15143219-15143274)
chr5 (124-159)||(2532750-2532785)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-205)||(746422-746626)
chr3 (1-205)||(25533107-25533311)
chr3 (1-208)||(455570-455777)
chr3 (1-205)||(457950-458154)
chr3 (1-205)||(10621923-10622127)
chr3 (1-205)||(53915878-53916082)
chr3 (1-205)||(41848804-41849008)
chr3 (1-205)||(42991953-42992157)
chr3 (1-206)||(1313081-1313286)
chr3 (1-203)||(42989954-42990156)
chr3 (1-209)||(4104279-4104487)
chr3 (1-205)||(27636008-27636212)
chr3 (1-205)||(51943042-51943246)
chr3 (1-207)||(53918046-53918252)
chr3 (131-205)||(6561613-6561687)
chr3 (122-193)||(53974124-53974195)
chr3 (39-122)||(11066346-11066429)
chr3 (122-193)||(11072646-11072717)
chr3 (50-173)||(54287487-54287627)
chr3 (55-120)||(53974011-53974077)
chr3 (122-193)||(11066257-11066329)
chr3 (55-125)||(11072731-11072801)
chr3 (165-206)||(27000082-27000123)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-205)||(3035415-3035619)
chr7 (1-205)||(11756925-11757129)
chr7 (1-205)||(20299155-20299359)
chr7 (4-205)||(7092567-7092768)
chr7 (1-205)||(31156296-31156500)
chr7 (1-205)||(38395986-38396190)
chr7 (5-205)||(47865328-47865528)
chr7 (1-207)||(7352042-7352248)
chr7 (4-205)||(7094814-7095015)
chr7 (1-205)||(1606171-1606375)
chr7 (1-205)||(7470417-7470621)
chr7 (1-205)||(7472370-7472574)
chr7 (1-205)||(28487249-28487453)
chr7 (4-206)||(20625733-20625935)
chr7 (4-206)||(20629624-20629826)
chr7 (4-206)||(20642043-20642245)
chr7 (1-205)||(1849665-1849869)
chr7 (1-205)||(7349663-7349867)
chr7 (1-205)||(18345237-18345441)
chr7 (1-205)||(21470679-21470883)
chr7 (4-205)||(28485261-28485462)
chr7 (1-206)||(37412512-37412717)
chr7 (4-207)||(21989851-21990052)
chr7 (1-205)||(38393683-38393887)
chr7 (1-205)||(42331389-42331593)
chr7 (1-193)||(24258170-24258361)
chr7 (57-205)||(443326-443474)
chr7 (1-136)||(13099861-13099996)
chr7 (3-206)||(3676996-3677180)
chr7 (1-125)||(43253911-43254035)
chr7 (1-101)||(20297163-20297263)
chr7 (39-207)||(40281824-40281994)
chr7 (122-193)||(10690686-10690756)
chr7 (142-193)||(20297110-20297161)
chr7 (39-125)||(12310442-12310528)
chr7 (122-188)||(12310542-12310608)
chr7 (151-192)||(43254023-43254064)
chr7 (1-33)||(443461-443493)
chr7 (127-159)||(6628852-6628884)
chr7 (128-168)||(12485044-12485084)
chr7 (128-168)||(12506475-12506515)
chr7 (127-159)||(12657667-12657699)
chr7 (78-125)||(12484976-12485023)
chr7 (78-125)||(12506407-12506454)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-205)||(5275724-5275928)
chr6 (1-205)||(12195900-12196104)
chr6 (4-205)||(2629278-2629479)
chr6 (1-208)||(30034992-30035199)
chr6 (1-206)||(26932954-26933159)
chr6 (1-206)||(19704961-19705166)
chr6 (1-205)||(30966923-30967127)
chr6 (1-206)||(18317750-18317955)
chr6 (2-207)||(17852265-17852469)
chr6 (8-203)||(17011781-17011973)
chr6 (1-205)||(22858340-22858536)
chr6 (39-203)||(20526548-20526708)
chr6 (39-125)||(30445318-30445404)
chr6 (122-183)||(30445243-30445304)
chr6 (122-193)||(30443024-30443097)
chr6 (39-125)||(30443111-30443195)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-205)||(31735911-31736115)
chr1 (1-205)||(47905956-47906160)
chr1 (1-206)||(24325346-24325551)
chr1 (1-207)||(15295235-15295441)
chr1 (1-205)||(39931762-39931966)
chr1 (1-205)||(9463636-9463840)
chr1 (7-205)||(48664852-48665050)
chr1 (1-205)||(9459809-9460013)
chr1 (5-205)||(27337332-27337532)
chr1 (1-206)||(17325023-17325228)
chr1 (5-205)||(27339526-27339730)
chr1 (1-206)||(28998640-28998845)
chr1 (1-206)||(29004356-29004561)
chr1 (4-176)||(21948582-21948754)
chr1 (7-206)||(2949617-2949816)
chr1 (13-205)||(4131690-4131882)
chr1 (20-205)||(6115532-6115718)
chr1 (15-205)||(45693834-45694024)
chr1 (17-205)||(6997214-6997395)
chr1 (7-167)||(6996067-6996221)
chr1 (90-205)||(46432521-46432636)
chr1 (1-93)||(46432115-46432207)
chr1 (52-205)||(16561131-16561284)
chr1 (4-81)||(2510722-2510799)
chr1 (39-125)||(11693580-11693666)
chr1 (39-193)||(13785662-13785833)
chr1 (1-71)||(26520510-26520580)
chr1 (1-66)||(6115476-6115541)
chr1 (39-122)||(14352759-14352842)
chr1 (124-193)||(32260748-32260817)
chr1 (86-138)||(13112047-13112099)
chr1 (122-168)||(10115509-10115555)
chr1 (76-125)||(32260833-32260882)
chr1 (39-122)||(10115572-10115653)
chr1 (127-174)||(16855265-16855312)
chr1 (128-193)||(11693686-11693751)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (1-208)||(15808959-15809166)
chr8 (1-205)||(28283609-28283813)
chr8 (1-206)||(3873749-3873955)
chr8 (1-205)||(43529871-43530075)
chr8 (1-205)||(608470-608674)
chr8 (5-205)||(41384493-41384692)
chr8 (1-204)||(41382420-41382623)
chr8 (47-205)||(32339094-32339252)
chr8 (88-205)||(3265635-3265752)
chr8 (2-54)||(181434-181486)
chr8 (39-125)||(11701364-11701447)
chr8 (51-122)||(13986214-13986285)
chr8 (124-193)||(13986304-13986372)
chr8 (124-193)||(30679186-30679254)
chr8 (124-153)||(27820149-27820178)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (1-207)||(42452447-42452653)
chr2 (1-206)||(35218361-35218566)
chr2 (1-205)||(23452625-23452829)
chr2 (1-205)||(35215980-35216184)
chr2 (2-205)||(42923891-42924094)
chr2 (1-205)||(27583710-27583907)
chr2 (1-193)||(28568553-28568738)
chr2 (76-207)||(27136368-27136507)
chr2 (110-198)||(34575608-34575696)
chr2 (39-189)||(15693589-15693755)
chr2 (130-193)||(28568348-28568411)
chr2 (39-124)||(7502638-7502723)
chr2 (1-71)||(34575525-34575588)
chr2 (122-193)||(41303549-41303621)
chr2 (54-125)||(39286971-39287042)
chr2 (46-125)||(41304806-41304884)
chr2 (47-125)||(41303457-41303535)
chr2 (127-168)||(39286911-39286952)
chr2 (141-192)||(7502582-7502633)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-206)||(11857-12062)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-205)||(51709-51913)
scaffold0005 (134-205)||(50159-50230)
scaffold0005 (86-125)||(170076-170115)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (1-206)||(1734-1939)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (4-205)||(78883-79084)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (90-204)||(2070-2184)
scaffold0468 (1-62)||(2019-2080)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (57-205)||(4546-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (111-205)||(1-95)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (52-122)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (127-168)||(2232-2273)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 205 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44692763 - 44692217
Alignment:
Q  205 aattccaaaataaattttgcaacaaaattagacttaggatcagatgcttaataacaagagcttgtatattacaagcatccctacatagtttttcgataca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44692763 aattccaaaataaattttgcaacaaaattagacttaggatcagatgcttaataacaagagcttgtatattacaagcatccctacatagtttttcgataca 44692664  T
Q  305 tgtaagacgtaccgtaaggaaaaaggtaggctttcttaaacacttattgacctcttttggagaataattaatgtaaattatgaacagaaactgagcatac 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44692663 tgtaagacgtaccgtaaggaaaaaggtaggctttcttaaacacttattgacctcttttggagaataattcatgtaaattatgaacagaaactgagcatac 44692564  T
Q  405 caagtttaactcatataaatataatagc----aatgttgtggggacatatatctcatggttttaaaataacttaccagcattgatttcattcatagccgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44692563 caagtttaactcatataaatataatagctatatatgttgtggggac----atctcatggttttaaaaaaacttaccagcattgatttcattcatggccgt 44692468  T
Q  501 cttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagcgggcatagcctgttgagacgattcaaagttatataaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44692467 cttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagcggacatagcctgttgcgacgattcaaagttatataaa 44692368  T
Q  601 tcctccgttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaaaacaaaaaagaaccttctcaagttcttcttccacagcttttgcgatttcatttttct 700  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44692367 tcctcagttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaaaacaaaaaagaaccttctcacgttcttcttccacagcttttgcgatttcatttttct 44692268  T
Q  701 gctcgaaagtatcatccaagttgagttttggaacactggccctaattactg 751  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44692267 gctcaaaagtatcatccaagttgagttttggaacactggccctaattactg 44692217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22132783 - 22132987
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22132783 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 22132882  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22132883 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatacta 22132982  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  22132983 caaca 22132987  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22135015 - 22135219
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22135015 tttctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 22135114  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22135115 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 22135214  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  22135215 caaca 22135219  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 56030393 - 56030187
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  56030393 tttctccttcagtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 56030294  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  56030293 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 56030194  T
Q  201 caacaat 207  Q
    |||||||    
T  56030193 caacaat 56030187  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24348162 - 24347958
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24348162 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatattt 24348063  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24348062 attgtccataaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 24347964  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  24347963 caacaa 24347958  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5100947 - 5100743
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5100947 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 5100848  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5100847 gttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 5100748  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  5100747 caaca 5100743  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 44600227 - 44600430
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44600227 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 44600326  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  44600327 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 44600426  T
Q  204 caat 207  Q
    ||||    
T  44600427 caat 44600430  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14787817 - 14788021
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  14787817 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatattt 14787916  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14787917 attgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatacta 14788016  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  14788017 caaca 14788021  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 17662622 - 17662827
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17662622 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatattt 17662721  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  17662722 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttgtagtcatacta 17662821  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  17662822 caacaa 17662827  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 473 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44653796 - 44653527
Alignment:
Q  473 taccagcattgatttcattcatagccgtcttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagcgggcatagc 572  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44653796 tacctgcattgatttcattcatagcccgcttcacatggacatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagctgacatagc 44653697  T
Q  573 ctgttgagacgattcaaagttatataaatcctccgttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaaaacaaaaaagaaccttctcaagttcttct 672  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||        |||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44653696 ctgttgagatgattcaaagttacataaatccacagttcaccatatcaa-------taaataatattcgtaa--caaaaaagaaccttctcaagttcttct 44653606  T
Q  673 tccacagcttttgcgatttcatttttctgctcgaaagtatcatccaagttgagttttggaacactggccctaattactg 751  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44653605 tccacagcttttgcaatttcatttttctgctcaaaagtatcatccaagttgagttttggaacacttgccctaattactg 44653527  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 481 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44632315 - 44632049
Alignment:
Q  481 ttgatttcattcatagccgtcttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagcgggcatagcctgttgag 580  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  44632315 ttgatttcattcatagcccgcttcacatgctcatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagctgacatagcctgttgag 44632216  T
Q  581 acgattcaaagttatataaatcctccgttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaa-aacaaaa--aagaaccttctcaagttcttcttccac 677  Q
       ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||       | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  44632215 gttattcaaagttacataaaccctcagttcaccttatc-------aataaatactaattgtaataacaaaaataaaaaccttctcaagttcttcttccac 44632123  T
Q  678 agcttttgcgatttcatttttctgctcgaaagtatcatccaagttgagttttggaacactggccctaattactg 751  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44632122 agcttttgcaatttcatttttctgctcaaaagcatcatccaagtagagttttggaacactggccctaattactg 44632049  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 473 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44682804 - 44682536
Alignment:
Q  473 taccagcattgatttcattcatagccgtcttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagcgggcatagc 572  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44682804 tacctgcattgatttcattcatagcccgcttcacatggacatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaatttcatatccataagctgacatagc 44682705  T
Q  573 ctgttgagacgattcaaagttatataaatcctccgttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaaaacaaaaaagaaccttctcaagttcttct 672  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  ||||| ||        | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44682704 ctgttgagatgattcaaagttacataaatccacagttcaccatatcaataaataata--------tcgtaa--caaaaaagaaccttctcaagttcttct 44682615  T
Q  673 tccacagcttttgcgatttcatttttctgctcgaaagtatcatccaagttgagttttggaacactggccctaattactg 751  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44682614 tccacagcttttgcaatttcatttttctgctcaaaagtatcatccaagttgagttttggaacacttgccctaattactg 44682536  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 451 - 735
Target Start/End: Original strand, 44636542 - 44636825
Alignment:
Q  451 atctcatggttttaaaataacttaccagcattgatttcattcatagccgtcttcacatgctgatctggctctatatcagtaatcagtgtttgaacaattt 550  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44636542 atctcatggtcttaaaaaaacataccggcattgatttcattcatagcccgtttcacatgctcgtctggctctatatcaacaatcagtgtttgaacaattt 44636641  T
Q  551 catatccataagcgggcatagcctgttgagacgattcaaagttatataaatcctccgttcaccttatcaggaaatagtaaatactaattgtaaaacaa-a 649  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||  ||||   ||||||| |    
T  44636642 catagccataagctgacatagcctgttaagacgatccaaagttacataaatcctcagttcaccttatcaacaaat-gaaaattgtaat--aaaaacaaca 44636738  T
Q  650 aaagaaccttctcaagttcttcttccacagcttttgcgatttca-tttttctgctcgaaagtatcatccaagttgagttttggaaca 735  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44636739 aaaaaaccttctcaagttcttcttccacagcttttgcgatttcattttttctgctcaaaagtatcatccaagttgagttttggaaca 44636825  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30136519 - 30136331
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  30136519 tttctccttcaatgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatattt 30136420  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30136419 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 30136331  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211310
Alignment:
Q  55 atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  155 ttttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaacaat 47211310  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38890514 - 38890702
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  38890514 tttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatt 38890613  T
Q  100 tattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatact 199  Q
    |||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  38890614 tattgtccata------------------aatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatgct 38890695  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9022252 - 9022059
Alignment:
Q  5 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  9022252 tcctttagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattg 9022160  T
Q  105 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaac 204  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  9022159 tc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcatttatattttcaacaacaatatttctcatccataaaattttgaatcatactacaac 9022061  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10112818 - 10112626
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||       ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  10112818 tttctcctttagtgaaataatatttgcatcaaa-------tattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatattt 10112727  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||| ||| ||||||    
T  10112726 attgtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttgaaac----cttttatatttttagcaacaatattcttcattcaacaaattttaagtcatacta 10112631  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863499
Alignment:
Q  51 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 150  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc---acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcatt 9863554  T
Q  151 tatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||| || ||||||||  | || ||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  9863553 tatatttttagtaacaatatatttcatccaacaaattttgagtcatattacaaca 9863499  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19322644 - 19322547
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||    
T  19322644 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322410
Alignment:
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagc-aacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactaca 202  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 19322411  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  19322410 a 19322410  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 53405074 - 53404998
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 77  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405074 tttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 53404998  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 54929094 - 54929180
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54929094 aatattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789571
Alignment:
Q  134 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 14789571  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 38209098 - 38209257
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaa-atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttat--tgtccataaatatattttc--agcacaaaatat 133  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  | || | ||  || || |   ||||||||||||    
T  38209098 aatattccttttcaaatatatatttgcatcaaatcttccttcatacagtacaaaaatatatttatattttcaacaacaatcttcttgaagcacaaaatat 38209197  T
Q  134 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  38209198 atttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatttttcatccatcaaattttgagt 38209257  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  46 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 44636412 - 44636496
Alignment:
Q  212 aaataaattttgcaacaaaattagacttaggatcagatgcttaataacaagagcttgtatattacaagcatccctacatagtttt 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  44636412 aaataatttttgcaacaaaattagatttaggatcaaatacttaataattagaacttgtatattacaagtatccccgcatagtttt 44636496  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516833
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 5516833  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44654217 - 44654120
Alignment:
Q  251 cttaataacaagagcttgtatattacaagcatccctacatagtttttcgatacatgtaagacgtaccgtaaggaaaaaggtaggctttcttaaacactt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  44654217 cttaataataagagcttgtatattaaaagcatcctctcatag-ttttcaatacatgcatgacgaaccgtgaggaaaagggtaggcattctcaaacactt 44654120  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Original strand, 29609914 - 29609983
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttga 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29609914 agcacaaaatatatttgaaaaaaatcaagaatacttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 29609983  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 125
Target Start/End: Original strand, 14647175 - 14647214
Alignment:
Q  86 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647175 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 29609838 - 29609897
Alignment:
Q  63 gcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  29609838 gcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactcttcataaatatattttca 29609897  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 171
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929245
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatatt 171  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatatt 54929245  T

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Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25803911 - 25803707
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25803911 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 25803812  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25803811 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 25803712  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  25803711 caaca 25803707  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18468902 - 18468698
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18468902 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 18468803  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18468802 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 18468703  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  18468702 caaca 18468698  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27912423 - 27912219
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27912423 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatattt 27912324  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27912323 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 27912224  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  27912223 caaca 27912219  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27910339 - 27910135
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27910339 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatattt 27910240  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27910239 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 27910140  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  27910139 caaca 27910135  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 3373426 - 3373630
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3373426 tttctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 3373525  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  3373526 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattctgagtcatacta 3373625  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  3373626 caaca 3373630  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15552129 - 15551925
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15552129 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 15552030  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15552029 attgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 15551930  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  15551929 caaca 15551925  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18511598 - 18511800
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18511598 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 18511697  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  18511698 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatacta 18511797  T
Q  201 caa 203  Q
    |||    
T  18511798 caa 18511800  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18509703 - 18509904
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  18509703 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatattt 18509802  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18509803 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 18509902  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  18509903 ca 18509904  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10586733 - 10586549
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10586733 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 10586634  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10586633 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaa 10586549  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 26098637 - 26098841
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  26098637 tttctccttcaatgaaagaatttttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatattt 26098736  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26098737 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 26098836  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  26098837 caaca 26098841  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26097624 - 26097421
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctt--tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26097624 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattta 26097525  T
Q  102 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactac 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26097524 ttgtccataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactac 26097425  T
Q  202 aaca 205  Q
    ||||    
T  26097424 aaca 26097421  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288526
Alignment:
Q  22 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgataca-aaaatatatttattgtccataaatatatttt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  121 cagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaatt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagttatactacaacaatt 21288526  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18596541 - 18596324
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18596541 tttctccttcagtgatagaatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatattt 18596442  T
Q  101 at-----------tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    ||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18596441 atggtatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 18596342  T
Q  190 gagtgatactacaacaat 207  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  18596341 gagtcatagtacaacaat 18596324  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18466577 - 18466453
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18466577 tttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 18466478  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  18466477 attgtccataaatatatttttagca 18466453  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 198
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  53 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 152  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  153 tattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatac 198  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662034
Alignment:
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaagttttaagtcatacta 6662028  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  6662029 caacaa 6662034  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15143373 - 15143262
Alignment:
Q  7 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  15143373 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtc 15143281  T
Q  107 cataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15143280 cataaatatatttttagca 15143262  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221282
Alignment:
Q  126 caaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatcaattaaattttgagtcatactacaaca 40221282  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 40221410 - 40221340
Alignment:
Q  2 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221410 ttctcctgcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779211
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttcttcatctatcaaatttt 5779211  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466411
Alignment:
Q  151 tatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18466411  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143219
Alignment:
Q  151 tatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacaa 15143219  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 159
Target Start/End: Original strand, 2532750 - 2532785
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532750 cacaagatatatttgaaacaaatcttttatattttc 2532785  T

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Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 746626 - 746422
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  746626 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 746527  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  746526 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 746427  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  746426 caaca 746422  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25533311 - 25533107
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25533311 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 25533212  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25533211 attgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 25533112  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  25533111 caaca 25533107  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 455777 - 455570
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  455777 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 455678  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  455677 attgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatacta 455578  T
Q  201 caacaatt 208  Q
    ||||||||    
T  455577 caacaatt 455570  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 458154 - 457950
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  458154 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 458055  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  458054 attgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatacta 457955  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  457954 caaca 457950  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10621923 - 10622127
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10621923 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 10622022  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10622023 attgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 10622122  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  10622123 caaca 10622127  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 53915878 - 53916082
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53915878 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 53915977  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  53915978 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccctcaaattttgagtcatacta 53916077  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  53916078 caaca 53916082  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41849008 - 41848804
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41849008 tttctctttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 41848909  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41848908 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 41848809  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  41848808 caaca 41848804  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42992157 - 42991953
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42992157 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatattt 42992058  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42992057 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 42991958  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  42991957 caaca 42991953  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1313286 - 1313081
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  1313286 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatattt 1313187  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1313186 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 1313087  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  1313086 caacaa 1313081  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42990156 - 42989954
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42990156 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 42990057  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42990056 attgtccataaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 42989957  T
Q  201 caa 203  Q
    |||    
T  42989956 caa 42989954  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 4104279 - 4104487
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4104279 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 4104378  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  4104379 attgtccataaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 4104478  T
Q  201 caacaattc 209  Q
    |||||||||    
T  4104479 caacaattc 4104487  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27636008 - 27636212
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27636008 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 27636107  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||    
T  27636108 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaaatcatacta 27636207  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  27636208 caaca 27636212  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51943246 - 51943042
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  51943246 tttctccttcaatgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatattt 51943147  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  51943146 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatacta 51943047  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  51943046 caaca 51943042  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 53918046 - 53918252
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  53918046 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatattt 53918145  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  53918146 attgtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 53918245  T
Q  201 caacaat 207  Q
     ||||||    
T  53918246 taacaat 53918252  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561613
Alignment:
Q  131 tatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttcgagtcatactacaaca 6561613  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974195
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattcttcatccatcaaattttgagt 53974195  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066346
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttca 11066346  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11072717 - 11072646
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  11072717 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagt 11072646  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287627
Alignment:
Q  50 tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca-----------------gcacaaaata 132  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||                 |||| |||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttcaacagcaatcttttggaagcacgaaata 54287586  T
Q  133 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54287587 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 120
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  55 atatatttgcatcaaatcgttctt-catgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11066329 - 11066257
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttat-attttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  11066329 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatcttttttagcaacaatattcttcatccatcaaattatgagt 11066257  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  55 atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||||||||| | | | || || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27000123 - 27000082
Alignment:
Q  165 caatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaa 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27000123 caatattctccatccatcaaattttcagtcatactacaacaa 27000082  T

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Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3035619 - 3035415
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3035619 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatattt 3035520  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3035519 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 3035420  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  3035419 caaca 3035415  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11757129 - 11756925
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757129 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatattt 11757030  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11757029 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 11756930  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  11756929 caaca 11756925  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20299359 - 20299155
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20299359 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 20299260  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20299259 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 20299160  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  20299159 caaca 20299155  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 7092567 - 7092768
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7092567 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7092666  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7092667 gtccataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7092766  T
Q  204 ca 205  Q
    ||    
T  7092767 ca 7092768  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 31156296 - 31156500
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31156296 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 31156395  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  31156396 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatacta 31156495  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  31156496 caaca 31156500  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38396190 - 38395986
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38396190 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 38396091  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  38396090 attgtacataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatacta 38395991  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  38395990 caaca 38395986  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47865528 - 47865328
Alignment:
Q  5 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47865528 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattg 47865429  T
Q  105 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47865428 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaac 47865329  T
Q  205 a 205  Q
    |    
T  47865328 a 47865328  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 7352042 - 7352248
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7352042 tttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 7352141  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  7352142 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatacta 7352241  T
Q  201 caacaat 207  Q
    |||||||    
T  7352242 caacaat 7352248  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 7094814 - 7095015
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7094814 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7094913  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7094914 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7095013  T
Q  204 ca 205  Q
    ||    
T  7095014 ca 7095015  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1606375 - 1606171
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606375 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 1606276  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  1606275 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 1606176  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  1606175 caaca 1606171  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7470417 - 7470621
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7470417 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 7470516  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7470517 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 7470616  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  7470617 caaca 7470621  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7472370 - 7472574
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7472370 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatattt 7472469  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7472470 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 7472569  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  7472570 caaca 7472574  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28487453 - 28487249
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  28487453 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatattt 28487354  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28487353 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 28487254  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  28487253 caaca 28487249  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20625935 - 20625733
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20625935 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20625836  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20625835 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20625736  T
Q  204 caa 206  Q
    |||    
T  20625735 caa 20625733  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20629826 - 20629624
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20629826 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20629727  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20629726 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20629627  T
Q  204 caa 206  Q
    |||    
T  20629626 caa 20629624  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20642245 - 20642043
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20642245 ctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 20642146  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20642145 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaa 20642046  T
Q  204 caa 206  Q
    |||    
T  20642045 caa 20642043  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1849869 - 1849665
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1849869 tttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 1849770  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  1849769 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 1849670  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  1849669 caaca 1849665  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7349663 - 7349867
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349663 tttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 7349762  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  7349763 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatacta 7349862  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  7349863 caaca 7349867  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18345441 - 18345237
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18345441 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 18345342  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18345341 attgtcaataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 18345242  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  18345241 caaca 18345237  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21470679 - 21470883
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21470679 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatattt 21470778  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||    
T  21470779 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcaaacta 21470878  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  21470879 caaca 21470883  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28485462 - 28485261
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485462 ctccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 28485363  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  28485362 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaa 28485263  T
Q  204 ca 205  Q
    ||    
T  28485262 ca 28485261  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 37412512 - 37412717
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||    
T  37412512 tttctccttcagtggaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatattt 37412611  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37412612 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 37412711  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  37412712 caacaa 37412717  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21990052 - 21989851
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21990052 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 21989953  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  21989952 gtccataaatatattttca--acacaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgggtcatactacaa 21989855  T
Q  204 caat 207  Q
    ||||    
T  21989854 caat 21989851  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38393887 - 38393683
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38393887 tttcaccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 38393788  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  38393787 attgtccataaataaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttagaatcatacta 38393688  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  38393687 caaca 38393683  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 42331389 - 42331593
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  42331389 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatactt 42331488  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  42331489 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcattcatcaaattttaagtcatacta 42331588  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  42331589 caaca 42331593  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24258361 - 24258170
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  24258361 tttctccttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatattt 24258263  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24258262 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagt 24258170  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443326
Alignment:
Q  57 atatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  157 ttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 443326  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 13099861 - 13099996
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  13099861 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatattt 13099960  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099961 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 13099996  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3677180 - 3676996
Alignment:
Q  3 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||          
T  3677180 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatat------ 3677087  T
Q  103 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactaca 202  Q
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  3677086 -------------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatctatcaaattttgagtcatactaca 3677000  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 43253911 - 43254035
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43253911 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 43254010  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  43254011 attgtccataaatatatttttagca 43254035  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 20297263 - 20297163
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20297263 tttctccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 20297164  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  20297163 a 20297163  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 40281824 - 40281994
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 138  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40281824 aatattccttttaaaaatatatccgtatcaaatattctttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttg 40281923  T
Q  139 aaacaaatcttttatattttcagcaacaa--tattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaat 207  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40281924 aaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttcttcatccatcaaattttgagtcatactacaccaat 40281994  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10690756 - 10690686
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10690756 agcacaaaatatatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctccctccatcaaattttgagt 10690686  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297110
Alignment:
Q  142 caaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagt 20297110  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310608
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatcagtagcaacaatcttcttcatccattaaattt 12310608  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254064
Alignment:
Q  151 tatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgag 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgag 43254064  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 443493 - 443461
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443493 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 443461  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6628884 - 6628852
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628884 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 6628852  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Original strand, 12485044 - 12485084
Alignment:
Q  128 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12485044 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttctacaacaat 12485084  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Original strand, 12506475 - 12506515
Alignment:
Q  128 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12506475 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttctacaacaat 12506515  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 12657667 - 12657699
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657667 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 12657699  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Original strand, 12484976 - 12485023
Alignment:
Q  78 tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12484976 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12485023  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Original strand, 12506407 - 12506454
Alignment:
Q  78 tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12506407 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12506454  T

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Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5275724 - 5275928
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5275724 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 5275823  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5275824 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 5275923  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  5275924 caaca 5275928  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 12195900 - 12196104
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12195900 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 12195999  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  12196000 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatacta 12196099  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  12196100 caaca 12196104  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 2629278 - 2629479
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2629278 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 2629377  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  2629378 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 2629477  T
Q  204 ca 205  Q
    ||    
T  2629478 ca 2629479  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 30034992 - 30035199
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30034992 tttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 30035091  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30035092 attgtctataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 30035191  T
Q  201 caacaatt 208  Q
    ||||||||    
T  30035192 caacaatt 30035199  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26932954 - 26933159
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26932954 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 26933053  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  26933054 attgtccataataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatacta 26933153  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  26933154 caacaa 26933159  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19704961 - 19705166
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19704961 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 19705060  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  19705061 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 19705160  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  19705161 caacaa 19705166  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30967127 - 30966923
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30967127 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatattt 30967028  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30967027 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatacta 30966928  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  30966927 caaca 30966923  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18317955 - 18317750
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  18317955 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatattt 18317856  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  18317855 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatacta 18317756  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  18317755 caacaa 18317750  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17852469 - 17852265
Alignment:
Q  2 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattta 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  17852469 ttctctttcagtgaaataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatattta 17852370  T
Q  102 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagca--acaatattctccaaccatcaaattttgagtgatact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |    
T  17852369 ttgtccataaatatattttcagcataaa--atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctcc-atcatcaaattttgagtcatatt 17852273  T
Q  200 acaacaat 207  Q
     |||||||    
T  17852272 tcaacaat 17852265  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17011973 - 17011781
Alignment:
Q  8 ttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtcc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17011973 ttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtcc 17011874  T
Q  108 ataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17011873 ataaatatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-cttttatatttttagcaataatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22858340 - 22858536
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||    
T  22858340 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa--------ttccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatattt 22858431  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  22858432 attgtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaacaaatcttttatatttttattaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatacta 22858531  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20526708 - 20526548
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 137  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20526708 aatattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  138 gaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445318
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 30445318  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30445304 - 30445243
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  30445304 agcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattcttcatccatca 30445243  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30443097 - 30443024
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatc--aaattttgagt 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  30443097 agcaaaaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattcttcatccatcataaattttgagt 30443024  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatattt--tgtccataaatatattttcagca 30443111  T

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Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 31735911 - 31736115
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31735911 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 31736010  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  31736011 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccttccatcaaattttgagtcatacta 31736110  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  31736111 caaca 31736115  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47906160 - 47905956
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47906160 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 47906061  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  47906060 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 47905961  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  47905960 caaca 47905956  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24325551 - 24325346
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24325551 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 24325452  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24325451 attgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 24325352  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  24325351 caacaa 24325346  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15295235 - 15295441
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15295235 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 15295334  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  15295335 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 15295434  T
Q  201 caacaat 207  Q
    |||||||    
T  15295435 caacaat 15295441  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39931966 - 39931762
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39931966 tttctccttcaataaaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 39931867  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39931866 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 39931767  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  39931766 caaca 39931762  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9463636 - 9463840
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9463636 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatattt 9463735  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9463736 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 9463835  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  9463836 caaca 9463840  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48665050 - 48664852
Alignment:
Q  7 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48665050 cttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtc 48664951  T
Q  107 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48664950 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 48664852  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9459809 - 9460013
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  9459809 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatattt 9459908  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9459909 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 9460008  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  9460009 caaca 9460013  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Original strand, 27337332 - 27337532
Alignment:
Q  5 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27337332 tccttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattg 27337431  T
Q  105 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27337432 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattccccatccatcaaatttggagtcatactacaac 27337531  T
Q  205 a 205  Q
    |    
T  27337532 a 27337532  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 17325023 - 17325228
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17325023 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatattt 17325122  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17325123 attgtccataaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 17325222  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  17325223 caacaa 17325228  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Original strand, 27339526 - 27339730
Alignment:
Q  5 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339526 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattg 27339625  T
Q  105 tccataa----atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  27339626 tccataaatatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccgtcaaatttggagtcatacta 27339725  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  27339726 caaca 27339730  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 28998640 - 28998845
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| |||||    
T  28998640 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtattt 28998739  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28998740 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 28998839  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  28998840 caacaa 28998845  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29004356 - 29004561
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| |||||    
T  29004356 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtattt 29004455  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29004456 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 29004555  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  29004556 caacaa 29004561  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 21948582 - 21948754
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21948582 ctccttctgtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 21948681  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948682 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 21948754  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 2949617 - 2949816
Alignment:
Q  7 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2949617 cttcagtgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtc 2949716  T
Q  107 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  2949717 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatgaaattttgagtcatactataacaa 2949816  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131882
Alignment:
Q  13 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt-gtccataa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatcaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  112 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 4131882  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 6115532 - 6115718
Alignment:
Q  20 atatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115532 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 6115631  T
Q  120 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaa-ttttgagtgatactacaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  6115632 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttttgagtcatcctacaaca 6115718  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Original strand, 45693834 - 45694024
Alignment:
Q  15 aaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaata 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693834 aaagaatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaata 45693933  T
Q  115 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  45693934 tatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatagtacaaca 45694024  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6997395 - 6997214
Alignment:
Q  17 agaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997395 agaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tata 6997303  T
Q  117 ttttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6997302 tttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactataaca 6997214  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6996221 - 6996067
Alignment:
Q  7 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  6996221 cttcagtgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtc 6996128  T
Q  107 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6996127 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432636
Alignment:
Q  90 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 46432620  T
Q  190 gagtgatactacaaca 205  Q
    |||| |||||||||||    
T  46432621 gagtcatactacaaca 46432636  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 46432115 - 46432207
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46432115 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaa 46432207  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561131
Alignment:
Q  52 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 151  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  152 atattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattcttcatccaacaaattttgaatcatacaacaaca 16561131  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 2510722 - 2510799
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510722 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 2510799  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785833
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcag--------------- 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||                   
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctaga 13785761  T
Q  124 --cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13785762 aacacaaaatatatttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctccatccatcaatttttgagt 13785833  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 26520510 - 26520580
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 71  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520510 tttcttcttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 6115476 - 6115541
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115476 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352759
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32260817 - 32260748
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  32260817 cacaaaatatattttaaacaattcttttatatttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagt 32260748  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 13112047 - 13112099
Alignment:
Q  86 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13112047 tacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacatttg 13112099  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32260882 - 32260833
Alignment:
Q  76 cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32260882 cttcatacggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 32260833  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10115653 - 10115572
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115653 aatattccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaa--atatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 174
Target Start/End: Original strand, 16855265 - 16855312
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16855265 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcatcaatcttctc 16855312  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 11693686 - 11693751
Alignment:
Q  128 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  11693686 aaatatatttaaaacaaaatttttataattttagcaataatcttcttcatccatcaaattttgagt 11693751  T

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Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15809166 - 15808959
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15809166 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 15809067  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15809066 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 15808967  T
Q  201 caacaatt 208  Q
     |||||||    
T  15808966 aaacaatt 15808959  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 28283609 - 28283813
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28283609 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 28283708  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28283709 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 28283808  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  28283809 caaca 28283813  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3873955 - 3873749
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt-cttcatgcgatacaaaaatatatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3873955 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatt 3873856  T
Q  100 tattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3873855 tattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatact 3873756  T
Q  200 acaacaa 206  Q
    |||||||    
T  3873755 acaacaa 3873749  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43530075 - 43529871
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43530075 tttctccttcagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatattt 43529976  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43529975 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 43529876  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  43529875 caaca 43529871  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 608674 - 608470
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  608674 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 608575  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  608574 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtgatacta 608475  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  608474 caaca 608470  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41384692 - 41384493
Alignment:
Q  5 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41384692 tccttcaatgaaagaatatttgcat-aaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattg 41384594  T
Q  105 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaac 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41384593 tccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41384494  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41382623 - 41382420
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  41382623 tttctcattcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatattt 41382524  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41382523 attgtccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 41382424  T
Q  201 caac 204  Q
    ||||    
T  41382423 caac 41382420  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339094
Alignment:
Q  47 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  147 cttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 32339094  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265752
Alignment:
Q  88 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatt 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 3265734  T
Q  188 ttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||| |||||||||||    
T  3265735 ttgagtcatactacaaca 3265752  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 181486 - 181434
Alignment:
Q  2 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 54  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181486 ttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 181434  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||  ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattc-ttc--catacggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  51 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986372
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatcttcttcatccataaaattttgagt 13986372  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 30679186 - 30679254
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30679186 cacaaaatatatctaaaacaaatcttttttatttttaccaac-atattcttcatccatcaaattttgagt 30679254  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 153
Target Start/End: Original strand, 27820149 - 27820178
Alignment:
Q  124 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820149 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 27820178  T

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Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42452653 - 42452447
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42452653 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattt 42452554  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  42452553 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttaagtcatacta 42452454  T
Q  201 caacaat 207  Q
    |||||||    
T  42452453 caacaat 42452447  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 35218361 - 35218566
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35218361 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatattt 35218460  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  35218461 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatacta 35218560  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  35218561 caacaa 35218566  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23452625 - 23452829
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23452625 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 23452724  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23452725 attgtccataaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 23452824  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  23452825 caaca 23452829  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 35215980 - 35216184
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35215980 tttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatattt 35216079  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  35216080 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatacta 35216179  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  35216180 caaca 35216184  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 42923891 - 42924094
Alignment:
Q  2 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42923891 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattta 42923990  T
Q  102 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42923991 ttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactac 42924090  T
Q  202 aaca 205  Q
    ||||    
T  42924091 aaca 42924094  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27583710 - 27583907
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  | || ||||||||||||    
T  27583710 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatattt 27583802  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  27583803 attgttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaaatttgagtcatacta 27583902  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28568553 - 28568738
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  28568553 tttctccttcggtgaaagaatatatgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatattt 28568645  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  28568646 attgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttgaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattcttcatctatcaaattttgagt 28568738  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27136368 - 27136507
Alignment:
Q  76 cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatat--------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaa 167  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27136368 cttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaccaa 27136467  T
Q  168 tattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaacaat 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27136468 tattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaacaat 27136507  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  110 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15693755 - 15693589
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc----------------- 121  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                     
T  15693755 aatatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagcaacaagtttttgga 15693656  T
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatattattcatccatcaaatttt 15693589  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568348
Alignment:
Q  130 atatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattcttcatccatcaaattttgagt 28568348  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  39 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct-tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 124  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatc-ttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 34575525 - 34575588
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575525 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 34575588  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 41303549 - 41303621
Alignment:
Q  122 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata-ttttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  41303549 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattctgagt 41303621  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286971
Alignment:
Q  54 aatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagca 39286971  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 125
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  46 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg-tacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303535
Alignment:
Q  47 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || | |||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39286952 - 39286911
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39286952 aaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaat 39286911  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7502633 - 7502582
Alignment:
Q  141 acaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgag 192  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  7502633 acaaatcttttatactttgagcaacaatcttcttcatccatcaaattttgag 7502582  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 11857 - 12062
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11857 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 11956  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11957 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatacta 12056  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  12057 caacaa 12062  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51913 - 51709
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  51913 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatattt 51814  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51813 attgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatacta 51714  T
Q  201 caaca 205  Q
    |||||    
T  51713 caaca 51709  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50159
Alignment:
Q  134 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 50159  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 170115 - 170076
Alignment:
Q  86 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170115 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1939 - 1734
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  1939 tttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatattt 1840  T
Q  101 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  1839 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatacta 1740  T
Q  201 caacaa 206  Q
    ||||||    
T  1739 caacaa 1734  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 79084 - 78883
Alignment:
Q  4 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  79084 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 78985  T
Q  104 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaa 203  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  78984 atccataaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaa 78885  T
Q  204 ca 205  Q
    ||    
T  78884 ca 78883  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2184
Alignment:
Q  90 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 2169  T
Q  190 gagtgatactacaac 204  Q
    |||| ||||||||||    
T  2170 gagtcatactacaac 2184  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 2019 - 2080
Alignment:
Q  1 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2019 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4546
Alignment:
Q  57 atatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 156  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  157 ttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagttatactgcaaca 4546  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 1 - 95
Alignment:
Q  111 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctccaaccatcaaattttgagtgatactacaaca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 95  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  52 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaatt-ttcttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2273
Alignment:
Q  127 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2232 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcaacaat 2273  T

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