View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0661_high_16 (Length: 308)

Name: NF0661_high_16
Description: NF0661
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0661_high_16
NF0661_high_16
[»] chr3 (196 HSPs)
chr3 (1-301)||(10621491-10621791)
chr3 (1-301)||(746753-747053)
chr3 (3-301)||(458282-458580)
chr3 (1-301)||(28412992-28413293)
chr3 (1-290)||(50493995-50494284)
chr3 (3-301)||(455905-456203)
chr3 (3-301)||(6063407-6063705)
chr3 (3-301)||(6065757-6066055)
chr3 (1-301)||(38210366-38210666)
chr3 (1-282)||(25388902-25389182)
chr3 (3-301)||(4103858-4104154)
chr3 (3-301)||(38890038-38890335)
chr3 (3-301)||(5191651-5191946)
chr3 (3-282)||(3859526-3859804)
chr3 (9-301)||(1321483-1321774)
chr3 (3-279)||(4308264-4308540)
chr3 (4-279)||(53917647-53917922)
chr3 (3-301)||(10084351-10084648)
chr3 (3-279)||(43228289-43228565)
chr3 (3-279)||(1313407-1313683)
chr3 (33-301)||(5522589-5522855)
chr3 (3-301)||(10955989-10956286)
chr3 (3-279)||(18099153-18099429)
chr3 (3-282)||(25533440-25533719)
chr3 (3-279)||(42990302-42990578)
chr3 (3-267)||(43226084-43226347)
chr3 (3-301)||(10958285-10958582)
chr3 (3-301)||(51726969-51727265)
chr3 (3-290)||(9604578-9604866)
chr3 (3-267)||(11170402-11170666)
chr3 (27-282)||(7606568-7606822)
chr3 (3-279)||(45882937-45883214)
chr3 (3-279)||(18096883-18097159)
chr3 (3-279)||(30005839-30006115)
chr3 (3-301)||(22114267-22114564)
chr3 (3-279)||(27101164-27101440)
chr3 (3-279)||(43423446-43423722)
chr3 (3-301)||(10191274-10191568)
chr3 (3-279)||(18162661-18162937)
chr3 (3-279)||(1626666-1626942)
chr3 (3-279)||(28101985-28102261)
chr3 (3-279)||(43421398-43421674)
chr3 (5-279)||(3314684-3314959)
chr3 (4-279)||(53915479-53915754)
chr3 (3-301)||(26720546-26720842)
chr3 (3-279)||(880434-880711)
chr3 (3-279)||(5926748-5927023)
chr3 (3-267)||(51943369-51943632)
chr3 (1-171)||(35777417-35777587)
chr3 (4-279)||(24979706-24979982)
chr3 (66-279)||(5886261-5886472)
chr3 (66-279)||(5899734-5899945)
chr3 (3-264)||(32264035-32264298)
chr3 (4-279)||(36011826-36012101)
chr3 (4-279)||(48361654-48361929)
chr3 (18-279)||(6484372-6484634)
chr3 (4-226)||(29956685-29956907)
chr3 (3-221)||(6561808-6562028)
chr3 (3-267)||(47148890-47149154)
chr3 (11-279)||(12267958-12268216)
chr3 (3-279)||(53468436-53468714)
chr3 (33-279)||(51674749-51674995)
chr3 (3-279)||(39715467-39715739)
chr3 (69-301)||(11168165-11168396)
chr3 (56-279)||(25688143-25688367)
chr3 (3-262)||(35917944-35918208)
chr3 (3-279)||(42992284-42992544)
chr3 (27-279)||(32219106-32219359)
chr3 (4-267)||(28761422-28761686)
chr3 (7-256)||(889779-890029)
chr3 (6-267)||(54691569-54691830)
chr3 (53-279)||(6231849-6232074)
chr3 (1-161)||(28100143-28100302)
chr3 (4-267)||(31151347-31151607)
chr3 (4-279)||(23633458-23633727)
chr3 (20-267)||(15780886-15781141)
chr3 (33-264)||(53591212-53591442)
chr3 (45-279)||(4666554-4666788)
chr3 (12-258)||(13420189-13420432)
chr3 (12-269)||(561767-562024)
chr3 (4-166)||(28181021-28181182)
chr3 (4-269)||(36871293-36871557)
chr3 (12-267)||(17795269-17795521)
chr3 (12-267)||(19103709-19103961)
chr3 (4-182)||(23637025-23637199)
chr3 (4-258)||(53597238-53597491)
chr3 (12-269)||(25635391-25635646)
chr3 (129-279)||(27635641-27635792)
chr3 (27-154)||(28137415-28137541)
chr3 (67-265)||(1620457-1620657)
chr3 (5-268)||(1673975-1674228)
chr3 (133-267)||(47701666-47701801)
chr3 (198-301)||(53894018-53894121)
chr3 (3-207)||(54884155-54884357)
chr3 (4-97)||(41849151-41849244)
chr3 (112-269)||(24181486-24181646)
chr3 (83-279)||(3306839-3307034)
chr3 (49-146)||(4560401-4560497)
chr3 (198-282)||(35919095-35919179)
chr3 (85-267)||(29913952-29914132)
chr3 (3-73)||(11163148-11163218)
chr3 (85-289)||(10897008-10897210)
chr3 (190-279)||(41849244-41849333)
chr3 (200-264)||(1736324-1736388)
chr3 (200-264)||(18552902-18552966)
chr3 (200-264)||(30709809-30709873)
chr3 (82-271)||(10094068-10094256)
chr3 (67-268)||(14634434-14634638)
chr3 (200-264)||(8370505-8370569)
chr3 (200-264)||(27974971-27975035)
chr3 (200-264)||(27986465-27986529)
chr3 (201-264)||(1417510-1417573)
chr3 (82-271)||(10100085-10100273)
chr3 (82-271)||(10200948-10201136)
chr3 (4-110)||(24177278-24177380)
chr3 (85-280)||(54193229-54193423)
chr3 (200-261)||(48438221-48438282)
chr3 (200-264)||(16264354-16264418)
chr3 (200-264)||(21711227-21711291)
chr3 (200-264)||(32143325-32143389)
chr3 (200-264)||(33386685-33386749)
chr3 (82-271)||(10207994-10208182)
chr3 (4-234)||(13419883-13420110)
chr3 (82-271)||(27544273-27544461)
chr3 (201-264)||(37466295-37466358)
chr3 (82-280)||(22625969-22626166)
chr3 (5-59)||(27635830-27635884)
chr3 (85-267)||(47878168-47878350)
chr3 (200-264)||(26298992-26299056)
chr3 (200-264)||(27452962-27453026)
chr3 (200-264)||(36029097-36029161)
chr3 (3-58)||(6231447-6231502)
chr3 (201-264)||(25795785-25795848)
chr3 (85-287)||(27761965-27762165)
chr3 (85-280)||(54188512-54188705)
chr3 (149-268)||(25634030-25634151)
chr3 (200-264)||(3716021-3716085)
chr3 (82-280)||(6303310-6303506)
chr3 (200-264)||(6794732-6794796)
chr3 (99-241)||(11007544-11007679)
chr3 (67-145)||(11066652-11066731)
chr3 (200-264)||(40592801-40592865)
chr3 (3-59)||(47701798-47701854)
chr3 (200-264)||(47923925-47923989)
chr3 (12-110)||(25633930-25634024)
chr3 (90-267)||(4535622-4535800)
chr3 (67-258)||(7768632-7768825)
chr3 (85-267)||(10612775-10612957)
chr3 (201-258)||(25929463-25929519)
chr3 (99-288)||(46966624-46966816)
chr3 (200-264)||(26928620-26928683)
chr3 (200-264)||(39040011-39040075)
chr3 (200-264)||(40844656-40844719)
chr3 (201-264)||(3328376-3328439)
chr3 (82-256)||(5858546-5858718)
chr3 (82-145)||(16462203-16462264)
chr3 (82-145)||(47883003-47883064)
chr3 (85-267)||(10595031-10595213)
chr3 (199-287)||(48390281-48390368)
chr3 (204-277)||(2671619-2671691)
chr3 (204-277)||(7167236-7167308)
chr3 (49-94)||(7606828-7606873)
chr3 (204-277)||(8739096-8739168)
chr3 (204-277)||(9091334-9091406)
chr3 (82-240)||(11079517-11079674)
chr3 (82-283)||(16996875-16997078)
chr3 (204-277)||(40372828-40372900)
chr3 (204-264)||(2672952-2673011)
chr3 (204-264)||(2677108-2677167)
chr3 (204-264)||(8477367-8477426)
chr3 (204-264)||(8512222-8512281)
chr3 (204-264)||(8517102-8517161)
chr3 (204-264)||(18656440-18656499)
chr3 (204-264)||(22173216-22173275)
chr3 (200-264)||(24695183-24695247)
chr3 (204-264)||(32475490-32475549)
chr3 (204-264)||(32480348-32480407)
chr3 (220-264)||(40913417-40913461)
chr3 (220-264)||(44331669-44331713)
chr3 (201-247)||(3323710-3323756)
chr3 (200-264)||(9666466-9666531)
chr3 (220-277)||(30236249-30236305)
chr3 (45-108)||(31021300-31021361)
chr3 (4-48)||(3306798-3306842)
chr3 (204-240)||(4386950-4386986)
chr3 (3-31)||(15780858-15780886)
chr3 (220-264)||(16499153-16499197)
chr3 (85-145)||(20031439-20031497)
chr3 (220-264)||(23391909-23391953)
chr3 (220-264)||(29196386-29196430)
chr3 (220-264)||(29813187-29813231)
chr3 (224-264)||(32744436-32744476)
chr3 (220-264)||(39153361-39153405)
chr3 (220-264)||(40734622-40734666)
chr3 (220-260)||(40735507-40735547)
chr3 (220-264)||(51398938-51398982)
[»] chr1 (145 HSPs)
chr1 (1-301)||(16226183-16226483)
chr1 (1-301)||(47179729-47180028)
chr1 (3-282)||(9463228-9463507)
chr1 (4-282)||(9459401-9459679)
chr1 (1-301)||(47177378-47177677)
chr1 (5-301)||(28840700-28840994)
chr1 (3-301)||(51750057-51750354)
chr1 (4-301)||(10399794-10400090)
chr1 (3-301)||(31735487-31735784)
chr1 (3-282)||(46431690-46431970)
chr1 (52-301)||(16231630-16231878)
chr1 (3-301)||(15294800-15295097)
chr1 (3-279)||(27336927-27337201)
chr1 (5-301)||(51752385-51752678)
chr1 (3-282)||(20302477-20302755)
chr1 (3-301)||(13761855-13762151)
chr1 (3-301)||(28842513-28842809)
chr1 (3-277)||(6823033-6823306)
chr1 (3-301)||(20291475-20291771)
chr1 (3-279)||(17324623-17324899)
chr1 (3-279)||(47906288-47906564)
chr1 (3-303)||(24325681-24325980)
chr1 (3-279)||(27339118-27339393)
chr1 (3-279)||(15823564-15823840)
chr1 (81-290)||(23785935-23786144)
chr1 (4-295)||(2617535-2617825)
chr1 (3-301)||(39932091-39932389)
chr1 (3-279)||(12302492-12302768)
chr1 (3-279)||(50307532-50307810)
chr1 (3-267)||(13215099-13215368)
chr1 (3-282)||(2510309-2510587)
chr1 (3-279)||(39462537-39462813)
chr1 (3-279)||(38925468-38925741)
chr1 (3-279)||(6995687-6995963)
chr1 (3-279)||(16428671-16428948)
chr1 (3-228)||(21948226-21948450)
chr1 (4-279)||(50076659-50076934)
chr1 (3-279)||(14097956-14098233)
chr1 (3-267)||(41646938-41647202)
chr1 (3-267)||(9241084-9241349)
chr1 (3-279)||(17186114-17186391)
chr1 (3-267)||(18839605-18839870)
chr1 (4-279)||(2949219-2949493)
chr1 (4-279)||(11457462-11457737)
chr1 (4-279)||(28998240-28998515)
chr1 (4-279)||(29003956-29004231)
chr1 (3-279)||(18307127-18307403)
chr1 (7-279)||(50078807-50079080)
chr1 (77-301)||(51757623-51757845)
chr1 (3-279)||(25127890-25128167)
chr1 (3-279)||(4131362-4131642)
chr1 (3-267)||(6756545-6756810)
chr1 (4-279)||(25251261-25251537)
chr1 (7-277)||(3579606-3579875)
chr1 (3-279)||(31425002-31425282)
chr1 (3-207)||(48665195-48665400)
chr1 (4-279)||(28207055-28207328)
chr1 (5-279)||(31489935-31490206)
chr1 (4-279)||(50248557-50248834)
chr1 (12-275)||(14183581-14183843)
chr1 (4-279)||(40133963-40134239)
chr1 (3-182)||(6823903-6824088)
chr1 (9-279)||(15669379-15669648)
chr1 (25-267)||(17324103-17324346)
chr1 (4-268)||(42922252-42922515)
chr1 (3-279)||(17318911-17319181)
chr1 (70-279)||(16429042-16429252)
chr1 (3-262)||(47451666-47451919)
chr1 (52-277)||(25248540-25248766)
chr1 (3-199)||(31422940-31423137)
chr1 (33-279)||(16432442-16432690)
chr1 (4-253)||(8347284-8347532)
chr1 (127-279)||(23816027-23816180)
chr1 (65-279)||(6115089-6115304)
chr1 (4-268)||(8349048-8349311)
chr1 (4-269)||(18800568-18800832)
chr1 (12-267)||(49495209-49495461)
chr1 (11-269)||(27916525-27916782)
chr1 (12-269)||(13125453-13125711)
chr1 (67-269)||(30738623-30738830)
chr1 (65-265)||(30790401-30790602)
chr1 (190-301)||(13358778-13358888)
chr1 (63-269)||(16561544-16561753)
chr1 (67-268)||(26613236-26613440)
chr1 (67-228)||(155788-155950)
chr1 (4-174)||(26520206-26520379)
chr1 (45-279)||(28279326-28279563)
chr1 (85-267)||(21353345-21353525)
chr1 (200-264)||(13598402-13598466)
chr1 (200-264)||(16124545-16124609)
chr1 (200-264)||(47703965-47704029)
chr1 (201-264)||(19072932-19072995)
chr1 (201-264)||(19120822-19120885)
chr1 (201-264)||(47098854-47098917)
chr1 (82-280)||(2232597-2232787)
chr1 (85-289)||(2401198-2401400)
chr1 (158-268)||(15916562-15916675)
chr1 (200-261)||(29651818-29651879)
chr1 (200-264)||(9476265-9476329)
chr1 (204-264)||(26644930-26644990)
chr1 (201-264)||(47102871-47102934)
chr1 (203-261)||(3281715-3281773)
chr1 (67-143)||(26332613-26332688)
chr1 (200-264)||(27104401-27104465)
chr1 (200-264)||(37069774-37069838)
chr1 (201-264)||(775676-775739)
chr1 (85-280)||(9526469-9526663)
chr1 (201-264)||(32889443-32889506)
chr1 (82-287)||(4144662-4144865)
chr1 (199-264)||(21536597-21536662)
chr1 (200-264)||(13604652-13604716)
chr1 (67-145)||(14353047-14353126)
chr1 (85-289)||(2393260-2393461)
chr1 (243-295)||(13447245-13447296)
chr1 (200-264)||(19358872-19358935)
chr1 (200-264)||(19361461-19361524)
chr1 (200-264)||(19380101-19380164)
chr1 (200-264)||(24202798-24202861)
chr1 (211-267)||(31422859-31422915)
chr1 (180-269)||(13127683-13127774)
chr1 (82-145)||(14997040-14997101)
chr1 (71-238)||(43104245-43104414)
chr1 (220-264)||(834167-834211)
chr1 (220-264)||(13137976-13138020)
chr1 (85-145)||(25134074-25134132)
chr1 (204-264)||(25445110-25445169)
chr1 (220-264)||(28220226-28220270)
chr1 (220-264)||(28265554-28265598)
chr1 (204-264)||(39445505-39445564)
chr1 (204-264)||(44023894-44023953)
chr1 (128-288)||(46783189-46783350)
chr1 (85-280)||(9521718-9521912)
chr1 (9-110)||(26332719-26332814)
chr1 (222-264)||(45644354-45644396)
chr1 (204-277)||(24787397-24787469)
chr1 (204-264)||(1055032-1055091)
chr1 (220-264)||(3156989-3157033)
chr1 (220-264)||(4552637-4552681)
chr1 (220-264)||(13659336-13659380)
chr1 (203-258)||(22819438-22819494)
chr1 (220-264)||(28223421-28223465)
chr1 (220-264)||(31659362-31659406)
chr1 (204-264)||(41390586-41390645)
chr1 (204-264)||(41398241-41398300)
chr1 (204-264)||(43988485-43988544)
[»] chr8 (123 HSPs)
chr8 (1-290)||(43079674-43079963)
chr8 (1-290)||(43082045-43082334)
chr8 (3-301)||(44720917-44721214)
chr8 (3-301)||(27829371-27829667)
chr8 (3-282)||(24873165-24873442)
chr8 (3-301)||(32339383-32339680)
chr8 (3-301)||(18810782-18811078)
chr8 (3-301)||(27827060-27827356)
chr8 (4-282)||(3874085-3874363)
chr8 (3-296)||(608808-609101)
chr8 (3-301)||(4424092-4424389)
chr8 (3-301)||(15809293-15809589)
chr8 (3-301)||(28283185-28283480)
chr8 (3-279)||(28251552-28251828)
chr8 (4-301)||(22684617-22684916)
chr8 (27-301)||(18812980-18813252)
chr8 (3-279)||(30480488-30480764)
chr8 (3-279)||(14807825-14808111)
chr8 (3-277)||(27106884-27107158)
chr8 (3-279)||(15072784-15073061)
chr8 (27-296)||(43530213-43530481)
chr8 (3-278)||(15068055-15068330)
chr8 (3-267)||(27911088-27911351)
chr8 (3-267)||(27957507-27957770)
chr8 (4-279)||(1225241-1225517)
chr8 (3-279)||(14419175-14419452)
chr8 (4-267)||(41384819-41385082)
chr8 (3-279)||(13858470-13858745)
chr8 (3-267)||(36865612-36865875)
chr8 (3-280)||(5372160-5372439)
chr8 (3-279)||(25952595-25952871)
chr8 (4-279)||(41382748-41383012)
chr8 (3-174)||(14477350-14477520)
chr8 (12-269)||(21482397-21482651)
chr8 (19-267)||(15956051-15956296)
chr8 (12-258)||(21480589-21480832)
chr8 (64-269)||(31162344-31162553)
chr8 (12-267)||(3005627-3005880)
chr8 (3-146)||(33541507-33541649)
chr8 (8-267)||(15185711-15185966)
chr8 (64-269)||(31035252-31035461)
chr8 (52-200)||(181622-181772)
chr8 (67-268)||(31578272-31578476)
chr8 (3-126)||(5622877-5622999)
chr8 (17-148)||(37214317-37214438)
chr8 (3-107)||(26775275-26775378)
chr8 (67-257)||(17847661-17847848)
chr8 (136-269)||(2468124-2468259)
chr8 (13-92)||(35872555-35872634)
chr8 (67-145)||(31573847-31573924)
chr8 (82-280)||(16757253-16757449)
chr8 (82-268)||(6376141-6376329)
chr8 (200-264)||(4696625-4696689)
chr8 (200-264)||(9765848-9765912)
chr8 (200-264)||(26403259-26403323)
chr8 (82-280)||(28327908-28328104)
chr8 (200-269)||(7412340-7412409)
chr8 (82-267)||(9021104-9021289)
chr8 (85-280)||(25684646-25684839)
chr8 (168-272)||(33541403-33541507)
chr8 (200-264)||(23799606-23799670)
chr8 (200-264)||(31071258-31071322)
chr8 (201-264)||(19752424-19752487)
chr8 (4-98)||(31035144-31035235)
chr8 (82-280)||(28895502-28895699)
chr8 (200-264)||(5702512-5702576)
chr8 (82-280)||(16752509-16752704)
chr8 (200-264)||(19175783-19175847)
chr8 (82-280)||(28332631-28332827)
chr8 (82-271)||(4812481-4812669)
chr8 (82-168)||(13985176-13985262)
chr8 (214-277)||(37214251-37214314)
chr8 (199-280)||(28890881-28890962)
chr8 (85-289)||(23179538-23179740)
chr8 (200-260)||(4456036-4456096)
chr8 (200-264)||(6127225-6127289)
chr8 (85-287)||(33032657-33032857)
chr8 (85-240)||(29554810-29554964)
chr8 (200-264)||(1261983-1262046)
chr8 (200-264)||(26287906-26287969)
chr8 (200-264)||(26301163-26301226)
chr8 (200-264)||(26313157-26313220)
chr8 (152-227)||(35872477-35872553)
chr8 (63-110)||(2468261-2468307)
chr8 (67-144)||(13985933-13986011)
chr8 (82-145)||(30423212-30423274)
chr8 (85-267)||(590797-590979)
chr8 (199-287)||(17799403-17799490)
chr8 (199-277)||(18853196-18853273)
chr8 (199-277)||(18870590-18870667)
chr8 (204-290)||(33037839-33037923)
chr8 (204-277)||(10689176-10689248)
chr8 (220-277)||(10930187-10930243)
chr8 (3-40)||(12517248-12517285)
chr8 (201-258)||(28307571-28307628)
chr8 (221-269)||(31566552-31566601)
chr8 (204-277)||(36979369-36979441)
chr8 (67-269)||(3895957-3896164)
chr8 (200-263)||(4733809-4733873)
chr8 (204-264)||(6311302-6311361)
chr8 (204-264)||(6813687-6813747)
chr8 (204-264)||(7289947-7290006)
chr8 (204-264)||(10684285-10684344)
chr8 (220-264)||(15212910-15212954)
chr8 (204-264)||(25328299-25328358)
chr8 (220-264)||(27811402-27811446)
chr8 (220-264)||(33352274-33352318)
chr8 (204-264)||(35745396-35745455)
chr8 (204-264)||(39784843-39784902)
chr8 (220-264)||(40321204-40321248)
chr8 (206-277)||(30655638-30655708)
chr8 (67-145)||(33839043-33839120)
chr8 (220-261)||(40221869-40221910)
chr8 (85-145)||(3276347-3276405)
chr8 (220-264)||(4743214-4743258)
chr8 (204-264)||(4760108-4760167)
chr8 (220-264)||(5689395-5689439)
chr8 (220-264)||(6599096-6599140)
chr8 (220-264)||(6674549-6674593)
chr8 (201-253)||(9054867-9054919)
chr8 (220-264)||(12702634-12702678)
chr8 (243-279)||(35872438-35872474)
chr8 (220-264)||(43036547-43036591)
[»] chr5 (132 HSPs)
chr5 (3-289)||(31545098-31545384)
chr5 (1-301)||(15552261-15552561)
chr5 (3-290)||(31542753-31543039)
chr5 (3-301)||(31179337-31179632)
chr5 (3-301)||(34477017-34477315)
chr5 (3-301)||(34479382-34479680)
chr5 (3-282)||(2174937-2175215)
chr5 (3-282)||(38882124-38882402)
chr5 (3-301)||(10529062-10529360)
chr5 (3-301)||(21684416-21684712)
chr5 (4-301)||(25921437-25921733)
chr5 (3-303)||(4236647-4236945)
chr5 (1-279)||(6745085-6745362)
chr5 (3-301)||(25804043-25804339)
chr5 (3-279)||(39854501-39854777)
chr5 (3-301)||(18466702-18466999)
chr5 (52-282)||(4410090-4410319)
chr5 (3-279)||(16776176-16776451)
chr5 (4-279)||(18511197-18511472)
chr5 (3-282)||(27910468-27910747)
chr5 (3-301)||(27912554-27912851)
chr5 (81-290)||(3373111-3373320)
chr5 (1-290)||(6747322-6747608)
chr5 (81-290)||(10749796-10750004)
chr5 (4-279)||(21948045-21948320)
chr5 (81-303)||(15354537-15354757)
chr5 (81-303)||(23665140-23665360)
chr5 (81-303)||(23793227-23793447)
chr5 (3-267)||(40221540-40221805)
chr5 (3-301)||(18469029-18469324)
chr5 (81-303)||(15356813-15357033)
chr5 (81-290)||(10757273-10757480)
chr5 (4-279)||(18509303-18509578)
chr5 (4-279)||(25904122-25904397)
chr5 (7-279)||(658341-658610)
chr5 (81-283)||(38960113-38960314)
chr5 (4-279)||(24126875-24127150)
chr5 (3-279)||(1189592-1189870)
chr5 (4-278)||(18596664-18596939)
chr5 (88-303)||(23741821-23742034)
chr5 (3-290)||(31472585-31472874)
chr5 (3-279)||(10474308-10474584)
chr5 (27-282)||(10586873-10587129)
chr5 (4-267)||(17072902-17073166)
chr5 (5-279)||(2818320-2818595)
chr5 (3-279)||(16092184-16092461)
chr5 (7-279)||(2954438-2954710)
chr5 (3-279)||(26097751-26098025)
chr5 (3-279)||(17818477-17818751)
chr5 (61-282)||(39798123-39798344)
chr5 (33-279)||(695926-696172)
chr5 (3-279)||(6756512-6756786)
chr5 (64-279)||(20505828-20506041)
chr5 (3-267)||(37705777-37706041)
chr5 (12-279)||(36402313-36402580)
chr5 (3-279)||(39397978-39398254)
chr5 (52-279)||(41585729-41585956)
chr5 (9-267)||(31465986-31466233)
chr5 (3-182)||(34530749-34530927)
chr5 (4-279)||(12555908-12556183)
chr5 (47-279)||(2723964-2724187)
chr5 (2-267)||(21288781-21289043)
chr5 (1-148)||(20045026-20045172)
chr5 (4-269)||(6661179-6661443)
chr5 (3-144)||(20043068-20043208)
chr5 (81-287)||(23667415-23667620)
chr5 (9-279)||(9020246-9020514)
chr5 (66-267)||(36208656-36208858)
chr5 (3-137)||(26098379-26098512)
chr5 (67-269)||(15143547-15143752)
chr5 (11-279)||(20053872-20054131)
chr5 (45-253)||(17413176-17413385)
chr5 (85-283)||(4897828-4898028)
chr5 (112-200)||(42770936-42771025)
chr5 (82-280)||(1170811-1171007)
chr5 (67-255)||(2144570-2144763)
chr5 (82-280)||(35385437-35385634)
chr5 (200-264)||(9353361-9353425)
chr5 (200-264)||(36932379-36932443)
chr5 (201-264)||(28832263-28832326)
chr5 (199-264)||(11917000-11917065)
chr5 (116-269)||(15445261-15445417)
chr5 (200-264)||(10281755-10281819)
chr5 (200-264)||(15464536-15464600)
chr5 (200-264)||(17003989-17004053)
chr5 (87-267)||(25445501-25445681)
chr5 (85-267)||(22672837-22673019)
chr5 (200-264)||(19588750-19588814)
chr5 (180-267)||(26098285-26098373)
chr5 (201-264)||(31300626-31300689)
chr5 (201-264)||(42127440-42127503)
chr5 (64-154)||(42770847-42770934)
chr5 (85-267)||(25452498-25452680)
chr5 (200-264)||(12084204-12084268)
chr5 (200-264)||(14520234-14520298)
chr5 (85-287)||(17841228-17841428)
chr5 (82-280)||(2297986-2298183)
chr5 (67-145)||(4754235-4754312)
chr5 (217-279)||(20043222-20043284)
chr5 (199-287)||(42238376-42238463)
chr5 (200-264)||(38192178-38192241)
chr5 (200-264)||(38219403-38219466)
chr5 (82-145)||(31782578-31782639)
chr5 (67-280)||(35430259-35430477)
chr5 (200-266)||(36263810-36263877)
chr5 (3-61)||(20507665-20507723)
chr5 (85-267)||(28786407-28786589)
chr5 (67-143)||(34033691-34033768)
chr5 (4-140)||(29748370-29748502)
chr5 (204-277)||(31180206-31180278)
chr5 (204-264)||(1457183-1457242)
chr5 (204-264)||(2785380-2785439)
chr5 (200-264)||(3880303-3880367)
chr5 (82-287)||(10627364-10627569)
chr5 (220-264)||(19806487-19806531)
chr5 (204-264)||(28807593-28807652)
chr5 (204-264)||(31397014-31397073)
chr5 (220-264)||(32636948-32636992)
chr5 (204-264)||(37556643-37556702)
chr5 (204-264)||(37561465-37561524)
chr5 (204-264)||(43592284-43592343)
chr5 (201-264)||(24553537-24553599)
chr5 (201-254)||(11181862-11181916)
chr5 (201-255)||(33030970-33031024)
chr5 (204-277)||(15044678-15044750)
chr5 (204-277)||(30631398-30631470)
chr5 (81-145)||(32520533-32520597)
chr5 (220-264)||(533893-533937)
chr5 (204-264)||(27449819-27449878)
chr5 (204-264)||(31401871-31401930)
chr5 (200-264)||(35387667-35387730)
chr5 (220-264)||(42428430-42428474)
[»] chr4 (176 HSPs)
chr4 (1-290)||(44599812-44600101)
chr4 (1-301)||(22780336-22780636)
chr4 (1-301)||(22782701-22783001)
chr4 (3-301)||(18709127-18709424)
chr4 (1-282)||(16934125-16934406)
chr4 (1-282)||(16931771-16932052)
chr4 (3-301)||(18847225-18847521)
chr4 (1-301)||(9176438-9176737)
chr4 (3-301)||(11008532-11008827)
chr4 (1-301)||(9174110-9174409)
chr4 (3-301)||(8631383-8631680)
chr4 (3-282)||(11006219-11006498)
chr4 (3-301)||(2484837-2485133)
chr4 (3-301)||(22046650-22046946)
chr4 (3-301)||(22132355-22132651)
chr4 (3-301)||(22044355-22044651)
chr4 (3-301)||(38409277-38409573)
chr4 (3-301)||(51015318-51015614)
chr4 (3-282)||(9148325-9148603)
chr4 (3-301)||(11435027-11435323)
chr4 (3-301)||(22134582-22134876)
chr4 (3-301)||(37089336-37089632)
chr4 (4-295)||(26085947-26086236)
chr4 (3-301)||(31849563-31849860)
chr4 (3-301)||(7941393-7941692)
chr4 (3-279)||(40637146-40637422)
chr4 (3-282)||(24348290-24348569)
chr4 (3-301)||(14633391-14633687)
chr4 (3-282)||(5198492-5198771)
chr4 (3-301)||(6764911-6765213)
chr4 (3-303)||(47868473-47868772)
chr4 (3-277)||(24888868-24889142)
chr4 (3-277)||(48486391-48486665)
chr4 (3-267)||(24880523-24880788)
chr4 (4-267)||(24879062-24879326)
chr4 (4-279)||(22800847-22801122)
chr4 (3-279)||(38928162-38928439)
chr4 (3-279)||(22802719-22802995)
chr4 (33-279)||(17662230-17662476)
chr4 (3-279)||(36921478-36921755)
chr4 (3-279)||(12395830-12396106)
chr4 (4-279)||(40091400-40091675)
chr4 (3-279)||(36919569-36919846)
chr4 (3-279)||(12400792-12401068)
chr4 (3-282)||(47274799-47275076)
chr4 (5-279)||(33415473-33415746)
chr4 (3-279)||(36378364-36378641)
chr4 (4-279)||(19095955-19096231)
chr4 (3-267)||(14787426-14787692)
chr4 (1-207)||(3824627-3824833)
chr4 (3-279)||(16453381-16453658)
chr4 (3-260)||(47210756-47211001)
chr4 (3-205)||(5637524-5637726)
chr4 (4-279)||(619433-619707)
chr4 (4-267)||(19322769-19323031)
chr4 (7-279)||(36380425-36380698)
chr4 (3-267)||(37313062-37313327)
chr4 (4-260)||(56030517-56030770)
chr4 (4-240)||(13544032-13544268)
chr4 (44-267)||(16455354-16455578)
chr4 (5-269)||(41997566-41997830)
chr4 (3-296)||(53405202-53405497)
chr4 (127-301)||(5635440-5635614)
chr4 (126-301)||(11437557-11437731)
chr4 (12-268)||(18537469-18537724)
chr4 (79-279)||(13547302-13547502)
chr4 (12-269)||(18534826-18535082)
chr4 (11-269)||(38890219-38890476)
chr4 (3-269)||(18409342-18409608)
chr4 (109-279)||(4215483-4215654)
chr4 (73-279)||(2891433-2891640)
chr4 (14-279)||(27499128-27499390)
chr4 (4-268)||(8756246-8756510)
chr4 (3-150)||(6132944-6133090)
chr4 (3-182)||(52942542-52942707)
chr4 (3-160)||(3937314-3937470)
chr4 (66-269)||(12102221-12102427)
chr4 (67-269)||(28453818-28454022)
chr4 (82-269)||(16185829-16186018)
chr4 (11-269)||(9863791-9864051)
chr4 (65-254)||(15032557-15032748)
chr4 (19-279)||(30136640-30136898)
chr4 (67-279)||(25357772-25357991)
chr4 (11-258)||(10112952-10113198)
chr4 (133-279)||(5101130-5101276)
chr4 (66-269)||(31983522-31983727)
chr4 (70-253)||(3982186-3982374)
chr4 (3-92)||(38270158-38270247)
chr4 (13-92)||(24446756-24446835)
chr4 (200-264)||(10047383-10047447)
chr4 (200-264)||(39245998-39246062)
chr4 (67-182)||(47150977-47151092)
chr4 (82-271)||(11853549-11853737)
chr4 (200-264)||(5269220-5269284)
chr4 (4-230)||(9022380-9022605)
chr4 (200-263)||(36315258-36315321)
chr4 (200-263)||(36329467-36329530)
chr4 (4-145)||(40999071-40999208)
chr4 (150-269)||(3578666-3578786)
chr4 (200-264)||(5396700-5396764)
chr4 (200-264)||(38152468-38152532)
chr4 (4-67)||(5101070-5101133)
chr4 (200-263)||(6743444-6743507)
chr4 (180-279)||(47563010-47563109)
chr4 (82-287)||(4570094-4570296)
chr4 (85-267)||(8529270-8529452)
chr4 (85-267)||(18586969-18587151)
chr4 (85-267)||(31300427-31300608)
chr4 (82-287)||(5336757-5336964)
chr4 (200-264)||(5143263-5143327)
chr4 (200-264)||(16623322-16623386)
chr4 (170-268)||(26557823-26557923)
chr4 (200-264)||(31985663-31985726)
chr4 (200-264)||(54867188-54867251)
chr4 (82-240)||(7050282-7050439)
chr4 (210-267)||(14789425-14789484)
chr4 (200-264)||(24333813-24333877)
chr4 (200-264)||(25862051-25862115)
chr4 (85-267)||(4556057-4556238)
chr4 (85-280)||(15831144-15831338)
chr4 (85-267)||(16489352-16489533)
chr4 (82-271)||(55822265-55822452)
chr4 (85-267)||(4558314-4558495)
chr4 (85-267)||(15316961-15317142)
chr4 (85-267)||(16688937-16689119)
chr4 (201-255)||(39774335-39774389)
chr4 (201-258)||(1983330-1983387)
chr4 (3-48)||(2891389-2891434)
chr4 (199-267)||(4884990-4885059)
chr4 (201-254)||(34495853-34495906)
chr4 (200-264)||(3777553-3777617)
chr4 (200-264)||(3796548-3796612)
chr4 (204-264)||(5147681-5147741)
chr4 (199-279)||(6133105-6133185)
chr4 (200-264)||(16630709-16630773)
chr4 (152-227)||(24446678-24446754)
chr4 (85-145)||(25699752-25699810)
chr4 (200-264)||(28468558-28468621)
chr4 (215-269)||(10114601-10114656)
chr4 (180-269)||(22295413-22295504)
chr4 (67-195)||(54906722-54906852)
chr4 (199-287)||(36769595-36769682)
chr4 (117-155)||(38270120-38270158)
chr4 (225-279)||(52942473-52942527)
chr4 (222-279)||(3937259-3937316)
chr4 (201-258)||(5112247-5112304)
chr4 (45-125)||(10114443-10114520)
chr4 (204-277)||(24741932-24742004)
chr4 (204-277)||(29760633-29760705)
chr4 (204-264)||(3814029-3814088)
chr4 (204-264)||(5732670-5732729)
chr4 (204-264)||(9224428-9224487)
chr4 (220-264)||(12739550-12739594)
chr4 (204-264)||(18855732-18855791)
chr4 (220-264)||(26175636-26175680)
chr4 (220-264)||(36463389-36463433)
chr4 (220-264)||(48893638-48893682)
chr4 (204-264)||(51520462-51520521)
chr4 (85-267)||(15312319-15312501)
chr4 (225-267)||(49088865-49088907)
chr4 (201-258)||(18377369-18377426)
chr4 (220-264)||(5429803-5429847)
chr4 (220-264)||(5871944-5871988)
chr4 (204-264)||(9229215-9229274)
chr4 (220-264)||(9927458-9927502)
chr4 (220-264)||(12743925-12743969)
chr4 (220-264)||(12745314-12745358)
chr4 (243-279)||(24446639-24446675)
chr4 (220-264)||(27416965-27417009)
chr4 (81-145)||(29609591-29609654)
chr4 (204-264)||(45347838-45347897)
chr4 (204-264)||(45357317-45357376)
chr4 (220-264)||(46147391-46147435)
chr4 (220-264)||(47038411-47038455)
chr4 (85-145)||(47566496-47566554)
chr4 (220-264)||(52467354-52467398)
[»] chr7 (157 HSPs)
chr7 (3-301)||(7351615-7351913)
chr7 (3-282)||(31155893-31156172)
chr7 (3-301)||(7349240-7349534)
chr7 (1-301)||(1046888-1047187)
chr7 (3-301)||(40836707-40837003)
chr7 (3-296)||(1049264-1049556)
chr7 (3-301)||(38394014-38394311)
chr7 (1-303)||(7471942-7472243)
chr7 (3-303)||(7469984-7470283)
chr7 (3-301)||(48457681-48457978)
chr7 (3-301)||(3035749-3036049)
chr7 (3-301)||(20297390-20297687)
chr7 (4-301)||(20299488-20299785)
chr7 (3-296)||(1850009-1850301)
chr7 (4-301)||(3878606-3878902)
chr7 (5-303)||(25542560-25542855)
chr7 (3-279)||(44724607-44724883)
chr7 (3-301)||(40946356-40946653)
chr7 (3-279)||(20626066-20626342)
chr7 (3-279)||(20629957-20630233)
chr7 (3-279)||(20642376-20642652)
chr7 (3-301)||(18345569-18345866)
chr7 (4-301)||(35658-35954)
chr7 (5-296)||(28487583-28487873)
chr7 (81-290)||(2935374-2935583)
chr7 (3-301)||(44592-44889)
chr7 (3-279)||(13099459-13099737)
chr7 (3-279)||(443623-443900)
chr7 (81-303)||(22137184-22137404)
chr7 (81-303)||(40552211-40552431)
chr7 (4-301)||(43253481-43253776)
chr7 (81-290)||(1606486-1606694)
chr7 (3-279)||(20137094-20137370)
chr7 (81-303)||(22108173-22108393)
chr7 (3-296)||(28485594-28485885)
chr7 (81-303)||(40549933-40550153)
chr7 (4-279)||(4295919-4296195)
chr7 (45-301)||(7092177-7092431)
chr7 (3-267)||(27306227-27306490)
chr7 (4-279)||(42330982-42331259)
chr7 (81-283)||(9027175-9027376)
chr7 (3-279)||(9680847-9681124)
chr7 (3-279)||(31435031-31435308)
chr7 (3-279)||(21592128-21592404)
chr7 (4-279)||(21990179-21990454)
chr7 (3-267)||(11355286-11355550)
chr7 (4-279)||(24748623-24748899)
chr7 (53-301)||(38396713-38396959)
chr7 (45-301)||(7094424-7094678)
chr7 (3-279)||(37412110-37412389)
chr7 (4-277)||(9679088-9679361)
chr7 (4-208)||(11757258-11757463)
chr7 (3-267)||(42223185-42223450)
chr7 (3-255)||(21680055-21680307)
chr7 (3-240)||(27832656-27832894)
chr7 (3-267)||(21678094-21678358)
chr7 (4-279)||(39145971-39146247)
chr7 (3-207)||(25276169-25276374)
chr7 (4-268)||(24813493-24813755)
chr7 (3-252)||(24258491-24258744)
chr7 (4-254)||(24817362-24817610)
chr7 (3-169)||(26804597-26804765)
chr7 (9-231)||(20091580-20091797)
chr7 (3-182)||(22828716-22828894)
chr7 (3-174)||(22251641-22251803)
chr7 (4-268)||(7188571-7188834)
chr7 (12-269)||(24465578-24465831)
chr7 (130-279)||(22393876-22394027)
chr7 (67-269)||(6332311-6332516)
chr7 (3-93)||(18567641-18567731)
chr7 (67-279)||(16297006-16297222)
chr7 (109-267)||(26295580-26295740)
chr7 (4-268)||(11081540-11081804)
chr7 (124-252)||(6046641-6046772)
chr7 (82-267)||(25351353-25351536)
chr7 (66-289)||(2120881-2121104)
chr7 (12-123)||(22392502-22392608)
chr7 (106-182)||(6348912-6348988)
chr7 (82-280)||(25405393-25405589)
chr7 (82-271)||(3320044-3320232)
chr7 (82-271)||(3324792-3324980)
chr7 (201-264)||(9190038-9190101)
chr7 (201-264)||(20284093-20284156)
chr7 (82-267)||(25357047-25357230)
chr7 (212-301)||(11759364-11759452)
chr7 (82-267)||(25410130-25410315)
chr7 (82-280)||(7069780-7069976)
chr7 (200-264)||(21983288-21983352)
chr7 (200-264)||(46516339-46516403)
chr7 (201-264)||(2580394-2580457)
chr7 (70-268)||(40281378-40281572)
chr7 (4-267)||(6048903-6049166)
chr7 (68-269)||(13290468-13290672)
chr7 (200-264)||(2647725-2647789)
chr7 (82-280)||(7074787-7074983)
chr7 (200-264)||(29159807-29159871)
chr7 (100-267)||(6067195-6067365)
chr7 (201-264)||(9185195-9185258)
chr7 (201-264)||(28617255-28617318)
chr7 (201-264)||(33332480-33332543)
chr7 (82-280)||(8378489-8378686)
chr7 (67-145)||(11084467-11084544)
chr7 (200-261)||(55955-56015)
chr7 (82-285)||(15540976-15541177)
chr7 (82-271)||(21369642-21369831)
chr7 (199-289)||(34546857-34546946)
chr7 (200-264)||(35960820-35960884)
chr7 (200-264)||(44848713-44848777)
chr7 (200-264)||(4796696-4796760)
chr7 (199-289)||(7464496-7464585)
chr7 (67-145)||(26210631-26210710)
chr7 (85-267)||(30246973-30247155)
chr7 (199-264)||(21639813-21639877)
chr7 (82-267)||(42006663-42006848)
chr7 (85-289)||(44512503-44512704)
chr7 (200-264)||(47263682-47263744)
chr7 (200-264)||(49091665-49091729)
chr7 (201-264)||(5817300-5817362)
chr7 (201-264)||(23403043-23403106)
chr7 (199-287)||(44010729-44010816)
chr7 (204-277)||(2057957-2058029)
chr7 (215-267)||(2075247-2075300)
chr7 (45-124)||(12310157-12310234)
chr7 (200-264)||(2479341-2479404)
chr7 (204-264)||(4866735-4866794)
chr7 (204-264)||(16880078-16880137)
chr7 (204-264)||(16884934-16884993)
chr7 (204-264)||(18408768-18408827)
chr7 (204-264)||(19992318-19992377)
chr7 (204-264)||(24024347-24024406)
chr7 (204-264)||(24261344-24261403)
chr7 (204-264)||(24266223-24266282)
chr7 (227-279)||(26804762-26804814)
chr7 (220-264)||(27347941-27347985)
chr7 (220-264)||(41317434-41317478)
chr7 (221-264)||(21988912-21988955)
chr7 (215-287)||(44016640-44016711)
chr7 (85-134)||(44143997-44144045)
chr7 (204-264)||(1533477-1533536)
chr7 (217-280)||(2990612-2990676)
chr7 (220-264)||(8153466-8153510)
chr7 (220-264)||(12097867-12097911)
chr7 (204-264)||(12396916-12396975)
chr7 (220-264)||(14069833-14069877)
chr7 (220-264)||(14379861-14379905)
chr7 (220-264)||(18126768-18126812)
chr7 (200-264)||(18413645-18413707)
chr7 (204-264)||(20357580-20357639)
chr7 (200-264)||(21646011-21646074)
chr7 (204-264)||(21812259-21812318)
chr7 (220-264)||(30814560-30814604)
chr7 (204-264)||(31109604-31109663)
chr7 (220-264)||(31732969-31733013)
chr7 (85-145)||(34546984-34547042)
chr7 (220-264)||(41649011-41649055)
chr7 (220-264)||(43864368-43864412)
chr7 (220-264)||(48489555-48489599)
[»] chr6 (123 HSPs)
chr6 (1-301)||(12195478-12195778)
chr6 (3-301)||(20915321-20915617)
chr6 (3-301)||(19704531-19704830)
chr6 (1-286)||(26932539-26932825)
chr6 (3-301)||(4816195-4816492)
chr6 (3-301)||(14507140-14507436)
chr6 (3-301)||(2628850-2629146)
chr6 (3-296)||(28241290-28241582)
chr6 (49-290)||(5273190-5273431)
chr6 (3-279)||(11983014-11983290)
chr6 (3-301)||(14458731-14459026)
chr6 (4-301)||(30967255-30967551)
chr6 (3-301)||(1230213-1230510)
chr6 (3-301)||(30034567-30034864)
chr6 (81-290)||(33308988-33309196)
chr6 (3-279)||(26065039-26065310)
chr6 (3-279)||(26085008-26085279)
chr6 (3-279)||(9019979-9020255)
chr6 (81-290)||(33311257-33311465)
chr6 (3-279)||(13057247-13057524)
chr6 (81-290)||(29754683-29754892)
chr6 (81-289)||(26066099-26066307)
chr6 (3-279)||(3629850-3630125)
chr6 (81-290)||(26068369-26068578)
chr6 (3-267)||(3390432-3390697)
chr6 (3-279)||(13039807-13040084)
chr6 (3-267)||(32280049-32280314)
chr6 (3-277)||(3631926-3632199)
chr6 (3-221)||(15530166-15530383)
chr6 (3-267)||(25477327-25477599)
chr6 (3-279)||(15541125-15541401)
chr6 (4-277)||(30728811-30729088)
chr6 (4-279)||(3233710-3233991)
chr6 (5-267)||(15532679-15532940)
chr6 (3-279)||(12161543-12161816)
chr6 (9-269)||(3027846-3028106)
chr6 (11-269)||(16455419-16455676)
chr6 (3-159)||(19227514-19227669)
chr6 (70-267)||(1069715-1069913)
chr6 (12-269)||(15719708-15719963)
chr6 (3-182)||(22490693-22490871)
chr6 (3-277)||(24338435-24338709)
chr6 (45-268)||(15367129-15367350)
chr6 (66-279)||(12186056-12186271)
chr6 (27-267)||(14466399-14466641)
chr6 (65-269)||(26945258-26945465)
chr6 (67-269)||(22857947-22858152)
chr6 (12-269)||(17012105-17012360)
chr6 (67-269)||(19696556-19696761)
chr6 (126-269)||(15346522-15346666)
chr6 (146-268)||(25465586-25465710)
chr6 (82-280)||(13878727-13878923)
chr6 (82-280)||(16785919-16786115)
chr6 (67-225)||(20526922-20527081)
chr6 (68-267)||(28037722-28037927)
chr6 (3-74)||(1072067-1072138)
chr6 (200-264)||(5757507-5757571)
chr6 (200-264)||(10077194-10077258)
chr6 (82-271)||(13883475-13883663)
chr6 (201-264)||(31979517-31979580)
chr6 (190-279)||(10584235-10584325)
chr6 (82-268)||(12911441-12911629)
chr6 (67-268)||(25078553-25078755)
chr6 (200-264)||(5572270-5572334)
chr6 (200-264)||(21356040-21356104)
chr6 (3-78)||(13870608-13870683)
chr6 (201-264)||(31936591-31936654)
chr6 (3-77)||(32447502-32447577)
chr6 (67-143)||(11138423-11138499)
chr6 (82-268)||(12937189-12937376)
chr6 (82-280)||(26887212-26887406)
chr6 (85-267)||(17694849-17695030)
chr6 (199-289)||(25941785-25941874)
chr6 (82-271)||(35201320-35201508)
chr6 (67-195)||(7542452-7542581)
chr6 (127-256)||(30445699-30445832)
chr6 (200-264)||(5017498-5017562)
chr6 (200-264)||(22709022-22709086)
chr6 (200-264)||(22963704-22963767)
chr6 (200-264)||(23824626-23824689)
chr6 (90-269)||(11262596-11262779)
chr6 (90-258)||(5165819-5165989)
chr6 (3-49)||(8995532-8995578)
chr6 (4-58)||(17852596-17852650)
chr6 (12-95)||(15346445-15346524)
chr6 (85-289)||(22342778-22342980)
chr6 (85-289)||(22351830-22352031)
chr6 (201-258)||(24436001-24436058)
chr6 (199-289)||(3577467-3577555)
chr6 (200-264)||(18232849-18232913)
chr6 (210-277)||(30443548-30443616)
chr6 (200-264)||(31086502-31086566)
chr6 (82-280)||(31248700-31248896)
chr6 (204-264)||(33335963-33336022)
chr6 (201-264)||(4629958-4630021)
chr6 (201-256)||(21801374-21801429)
chr6 (199-284)||(25465881-25465965)
chr6 (199-280)||(17038350-17038431)
chr6 (85-267)||(33215830-33216012)
chr6 (82-145)||(3577636-3577696)
chr6 (204-264)||(5674803-5674862)
chr6 (204-264)||(6005422-6005481)
chr6 (1-41)||(10584172-10584212)
chr6 (204-264)||(14742457-14742516)
chr6 (85-145)||(17036058-17036116)
chr6 (204-264)||(22010718-22010777)
chr6 (204-264)||(28155590-28155649)
chr6 (220-264)||(33211185-33211229)
chr6 (204-264)||(33330466-33330525)
chr6 (170-266)||(22870100-22870196)
chr6 (191-288)||(24501425-24501524)
chr6 (199-287)||(13467446-13467532)
chr6 (150-269)||(28078189-28078310)
chr6 (206-264)||(28184510-28184567)
chr6 (217-277)||(7294062-7294123)
chr6 (204-277)||(11856966-11857038)
chr6 (220-264)||(603088-603132)
chr6 (204-264)||(6438506-6438565)
chr6 (89-145)||(12166267-12166321)
chr6 (207-263)||(14521679-14521735)
chr6 (204-264)||(14737597-14737656)
chr6 (220-264)||(16569146-16569190)
chr6 (204-264)||(16838749-16838808)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-290)||(6224-6513)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-282)||(66-347)
[»] chr2 (140 HSPs)
chr2 (1-283)||(35215567-35215849)
chr2 (1-283)||(35217944-35218226)
chr2 (3-301)||(27104793-27105088)
chr2 (3-301)||(23452201-23452498)
chr2 (3-301)||(13910009-13910305)
chr2 (3-296)||(19501980-19502272)
chr2 (3-283)||(42064509-42064789)
chr2 (3-295)||(19504316-19504606)
chr2 (1-282)||(45279966-45280247)
chr2 (81-301)||(45332144-45332364)
chr2 (3-295)||(24162193-24162473)
chr2 (81-290)||(36561115-36561324)
chr2 (3-282)||(42452777-42453053)
chr2 (81-282)||(36558846-36559047)
chr2 (3-279)||(19007634-19007910)
chr2 (3-279)||(42923494-42923770)
chr2 (3-279)||(21520678-21520954)
chr2 (3-279)||(22287321-22287597)
chr2 (3-279)||(28196631-28196905)
chr2 (3-267)||(40032050-40032319)
chr2 (4-279)||(11739544-11739820)
chr2 (17-279)||(6264133-6264396)
chr2 (3-279)||(43623565-43623829)
chr2 (3-279)||(6258802-6259076)
chr2 (4-279)||(17848438-17848710)
chr2 (59-279)||(5375331-5375550)
chr2 (5-279)||(34979562-34979838)
chr2 (8-240)||(45239001-45239232)
chr2 (4-279)||(14837268-14837538)
chr2 (3-279)||(44289052-44289329)
chr2 (5-279)||(17849113-17849387)
chr2 (3-279)||(3022157-3022442)
chr2 (4-174)||(15539566-15539735)
chr2 (4-269)||(11578102-11578365)
chr2 (15-279)||(18800298-18800559)
chr2 (4-269)||(20146602-20146866)
chr2 (3-267)||(31732773-31733026)
chr2 (4-269)||(17897240-17897502)
chr2 (12-267)||(22874137-22874389)
chr2 (19-279)||(28459175-28459435)
chr2 (123-279)||(22407439-22407596)
chr2 (65-269)||(40699429-40699636)
chr2 (136-261)||(7462950-7463077)
chr2 (3-167)||(38020196-38020349)
chr2 (4-279)||(35107294-35107566)
chr2 (3-94)||(22163117-22163208)
chr2 (3-82)||(22407591-22407670)
chr2 (19-182)||(27136208-27136368)
chr2 (146-279)||(22707736-22707872)
chr2 (52-152)||(38414194-38414291)
chr2 (180-279)||(22163007-22163106)
chr2 (82-182)||(20589763-20589863)
chr2 (67-199)||(43139432-43139564)
chr2 (82-280)||(2736205-2736401)
chr2 (200-264)||(14699036-14699100)
chr2 (82-289)||(20054742-20054947)
chr2 (85-267)||(17943540-17943720)
chr2 (85-289)||(27517616-27517818)
chr2 (66-269)||(37962936-37963137)
chr2 (82-280)||(2740941-2741137)
chr2 (200-264)||(13569332-13569396)
chr2 (82-280)||(17462436-17462632)
chr2 (200-264)||(20522224-20522288)
chr2 (82-280)||(39686983-39687179)
chr2 (85-289)||(30478997-30479199)
chr2 (199-264)||(34682362-34682427)
chr2 (200-264)||(8040064-8040128)
chr2 (200-264)||(10445473-10445537)
chr2 (67-145)||(17921754-17921833)
chr2 (200-264)||(28259206-28259270)
chr2 (145-267)||(23870951-23871074)
chr2 (201-277)||(2838060-2838135)
chr2 (200-264)||(8390179-8390243)
chr2 (200-264)||(17865207-17865271)
chr2 (200-264)||(33118140-33118204)
chr2 (200-264)||(34388862-34388926)
chr2 (200-264)||(39482935-39482999)
chr2 (3-62)||(5377631-5377690)
chr2 (82-145)||(28458949-28459011)
chr2 (202-264)||(1345572-1345634)
chr2 (66-143)||(26345661-26345738)
chr2 (199-280)||(45679838-45679919)
chr2 (66-199)||(15693958-15694094)
chr2 (199-289)||(20049998-20050088)
chr2 (68-125)||(27583479-27583535)
chr2 (200-264)||(10707281-10707345)
chr2 (200-264)||(16940238-16940302)
chr2 (200-264)||(17010903-17010967)
chr2 (200-264)||(21629948-21630011)
chr2 (200-264)||(25398500-25398563)
chr2 (200-264)||(33528650-33528714)
chr2 (67-145)||(34575230-34575308)
chr2 (201-264)||(2869723-2869786)
chr2 (201-264)||(31056048-31056111)
chr2 (82-271)||(39680045-39680233)
chr2 (85-267)||(12781218-12781400)
chr2 (68-269)||(13828336-13828542)
chr2 (199-280)||(33670952-33671033)
chr2 (200-264)||(3491755-3491818)
chr2 (218-269)||(8173539-8173591)
chr2 (220-264)||(17057369-17057413)
chr2 (220-264)||(17085352-17085396)
chr2 (200-264)||(25403638-25403701)
chr2 (200-264)||(42039698-42039762)
chr2 (81-143)||(10942634-10942696)
chr2 (81-143)||(10948503-10948565)
chr2 (82-145)||(22712637-22712698)
chr2 (82-145)||(22717346-22717407)
chr2 (200-263)||(23078499-23078562)
chr2 (199-254)||(27149322-27149377)
chr2 (82-145)||(45567409-45567470)
chr2 (67-143)||(7502975-7503052)
chr2 (215-268)||(34575132-34575186)
chr2 (204-277)||(11098960-11099032)
chr2 (204-277)||(14291480-14291552)
chr2 (67-173)||(30720703-30720811)
chr2 (220-264)||(723744-723788)
chr2 (85-145)||(17932637-17932695)
chr2 (220-264)||(34139770-34139814)
chr2 (67-143)||(35028632-35028707)
chr2 (204-264)||(36757795-36757855)
chr2 (220-264)||(39284960-39285004)
chr2 (200-264)||(40738848-40738910)
chr2 (204-264)||(44312645-44312704)
chr2 (221-264)||(11151591-11151634)
chr2 (219-269)||(20592288-20592339)
chr2 (82-230)||(33603994-33604143)
chr2 (215-287)||(38191144-38191215)
chr2 (204-277)||(9296434-9296506)
chr2 (200-237)||(25407653-25407690)
chr2 (220-264)||(11067429-11067473)
chr2 (220-264)||(14633825-14633869)
chr2 (243-279)||(15539514-15539550)
chr2 (204-264)||(19344426-19344485)
chr2 (204-264)||(19349284-19349343)
chr2 (220-264)||(36773686-36773730)
chr2 (85-145)||(37170873-37170931)
chr2 (220-264)||(38312364-38312408)
chr2 (204-264)||(39812009-39812068)
chr2 (100-143)||(41303155-41303199)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (3-301)||(69256-69552)
scaffold0025 (3-80)||(73207-73284)
scaffold0025 (43-91)||(73160-73208)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (3-301)||(2907-3203)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-296)||(41452-41744)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (3-301)||(29198-29494)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (3-301)||(183605-183901)
scaffold0005 (3-267)||(52038-52304)
scaffold0005 (219-267)||(50257-50305)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (4-279)||(11458-11733)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (43-293)||(1425-1673)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (3-279)||(79212-79488)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (4-267)||(14379-14642)
scaffold0131 (3-267)||(15046-15310)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (81-303)||(22221-22441)
scaffold0140 (81-303)||(24496-24716)
scaffold0140 (200-264)||(8448-8512)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (3-282)||(4024-4301)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (3-228)||(2069-2293)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (4-267)||(79887-80150)
scaffold0004 (82-145)||(188363-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (4-279)||(85258-85534)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (4-268)||(15816-16079)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (45-269)||(1636-1860)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (3-157)||(35666-35819)
scaffold0011 (199-279)||(35817-35897)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (9-268)||(16645-16903)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (67-258)||(4901-5095)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (210-290)||(4653-4733)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (200-264)||(5687-5751)
scaffold0006 (200-264)||(2496-2560)
scaffold0006 (200-264)||(133309-133373)
scaffold0006 (82-145)||(224819-224880)
scaffold0006 (220-264)||(149097-149141)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (200-264)||(43990-44054)
scaffold0087 (200-264)||(36861-36925)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (85-286)||(16328-16528)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (201-261)||(10736-10796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (200-264)||(45257-45321)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (199-280)||(3055-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (199-267)||(16983-17052)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (203-264)||(85687-85748)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (82-254)||(57437-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (230-301)||(1415-1485)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (3-97)||(993-1092)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (200-264)||(17981-18044)
scaffold0188 (200-264)||(24074-24137)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (204-264)||(368-427)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (204-264)||(9663-9722)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (204-264)||(14330-14389)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (204-264)||(17267-17327)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (220-264)||(20415-20459)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (204-264)||(181985-182044)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (204-264)||(2272-2331)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (204-264)||(35083-35142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (204-264)||(148977-149036)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 196)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10621791 - 10621491
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621791 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 10621692  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621691 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 10621592  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621591 tagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 10621492  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  10621491 c 10621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 746753 - 747053
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746753 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 746852  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746853 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 746952  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  746953 tagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 747052  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  747053 c 747053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 458282 - 458580
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458282 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 458381  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  458382 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 458481  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  458482 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 458580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28413293 - 28412992
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28413293 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 28413194  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28413193 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 28413094  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc-tttgtgttcttcttcttctttgtgttcatc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28413093 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtgttcttc 28412994  T
Q  300 tc 301  Q
    ||    
T  28412993 tc 28412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 50493995 - 50494284
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 50494194  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50494195 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttcttt 50494284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 455905 - 456203
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455905 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 456004  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  456005 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 456104  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  456105 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 456203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6063705 - 6063407
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063705 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 6063606  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6063605 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 6063506  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6063505 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctc 6063407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6066055 - 6065757
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066055 gcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 6065956  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6065955 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 6065856  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6065855 gtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctc 6065757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 38210366 - 38210666
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210366 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 38210465  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38210466 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 38210565  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38210566 tagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcctcttctttgtgttcttct 38210665  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  38210666 c 38210666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 25388902 - 25389182
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25388902 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgga 25389000  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25389001 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 25389100  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389101 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 25389182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4104154 - 4103858
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4104154 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 4104056  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4104055 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 4103956  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4103955 gtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 4103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 38890038 - 38890335
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38890038 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 38890136  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38890137 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 38890236  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38890237 agtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 38890335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 5191651 - 5191946
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5191651 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 5191749  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5191750 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 5191849  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5191850 gtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 3859526 - 3859804
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3859526 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 3859624  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3859625 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 3859724  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3859725 gtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3859804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321774
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 1321581  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtgga 207  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  208 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 1321774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4308540 - 4308264
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4308540 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 4308442  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4308441 ctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 4308342  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4308341 agtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4308264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53917922 - 53917647
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53917922 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 53917824  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  53917823 tcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 53917724  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53917723 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53917647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10084648 - 10084351
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10084648 gcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagt 10084550  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10084549 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 10084450  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10084449 agtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10084351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 43228289 - 43228565
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43228289 gcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 43228387  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43228388 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 43228487  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43228488 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 1313407 - 1313683
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1313407 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 1313505  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1313506 ctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 1313605  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1313606 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 33 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5522855 - 5522589
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5522855 ttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 5522757  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccaga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5522756 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcaga 5522657  T
Q  233 ctaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5522656 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10956286 - 10955989
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10956286 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggatt-gagt 10956188  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10956187 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 10956088  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10956087 agtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10955989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18099429 - 18099153
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18099429 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18099331  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18099330 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatat 18099231  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18099230 agtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 25533440 - 25533719
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25533440 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 25533538  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25533539 cttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 25533638  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25533639 agtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 25533719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 42990302 - 42990578
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990302 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 42990400  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42990401 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 42990500  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42990501 ggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 43226084 - 43226347
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43226084 gcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 43226181  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43226182 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 43226281  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43226282 agtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10958582 - 10958285
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10958582 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 10958484  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  10958483 ctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatat 10958384  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10958383 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10958285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51727265 - 51726969
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51727265 gcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 51727168  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51727167 ctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 51727068  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51727067 agtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51726969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9604866 - 9604578
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9604866 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 9604768  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9604767 ctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 9604668  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tcttcttcttt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  9604667 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttcttt 9604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 11170402 - 11170666
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11170402 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 11170500  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11170501 gtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 11170600  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11170601 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 11170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606568
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  227 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 7606568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 45882937 - 45883214
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45882937 gcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 45883035  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45883036 ctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 45883135  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45883136 agtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18097159 - 18096883
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18097159 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18097061  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18097060 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatat 18096961  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  18096960 agtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttct 18096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 30005839 - 30006115
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30005839 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaat 30005937  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30005938 ctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 30006037  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30006038 agtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30006115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22114564 - 22114267
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114564 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 22114466  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22114465 ctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 22114366  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    | || || |||||| || ||||||||||| || | || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22114365 aatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttttttgtgttcttctc 22114267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27101440 - 27101164
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101440 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 27101342  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  27101341 ctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatat 27101242  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  27101241 agtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43423722 - 43423446
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43423722 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 43423624  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43423623 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 43423524  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   ||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43423523 agtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43423446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10191568 - 10191274
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10191568 gcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagt 10191470  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10191469 ctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatat 10191371  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10191370 agtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt--attgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10191274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 18162661 - 18162937
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18162661 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18162759  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctttgt-aacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||    
T  18162760 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcata 18162859  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18162860 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 18162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1626942 - 1626666
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1626942 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agt 1626844  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  1626843 ctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 1626744  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1626743 agtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28102261 - 28101985
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28102261 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagt 28102163  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  28102162 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatat 28102063  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28102062 agtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43421674 - 43421398
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43421674 gcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagt 43421576  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43421575 ctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 43421476  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43421475 agtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43421398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Original strand, 3314684 - 3314959
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3314684 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtct 3314782  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tata 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| ||||    
T  3314783 cttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattata 3314882  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3314883 gtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53915754 - 53915479
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  53915754 caacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattg-agtc 53915656  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||    
T  53915655 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattta 53915556  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53915555 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 26720546 - 26720842
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  26720546 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattg-agt 26720643  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26720644 ttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 26720743  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26720744 agtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 26720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 880711 - 880434
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  880711 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattg-ag 880613  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  880612 tctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 880513  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  880512 tagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 880434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5927023 - 5926748
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5927023 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggatt-gagt 5926925  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||||||||||||    
T  5926924 ctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatat 5926825  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    | || |  ||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5926824 aatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttct 5926748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 51943369 - 51943632
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51943369 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 51943467  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51943468 ctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatat 51943566  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51943567 agtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51943632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 35777417 - 35777587
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 24979706 - 24979982
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24979706 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtc 24979804  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||| |||| ||||||||||||    
T  24979805 tcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatat 24979904  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24979905 agtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24979982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 265  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5886359 cccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  266 tttctttgtgttct 279  Q
    ||  ||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 265  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5899832 cccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  266 tttctttgtgttct 279  Q
    ||  ||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32264298 - 32264035
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32264298 gcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 32264200  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |    
T  32264199 ctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcatt 32264100  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||    
T  32264099 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 36011826 - 36012101
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  36011826 caacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggatt-gaata 36011924  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36011925 tcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 36012024  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  36012025 gtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 36012101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48361929 - 48361654
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48361929 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtc 48361831  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  48361830 tcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatata 48361731  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48361730 gtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484634
Alignment:
Q  18 gggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  117 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 215  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  216 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 29956685 - 29956907
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  29956685 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatc 29956783  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29956784 tcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 29956883  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcc 226  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  29956884 gtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 6561808 - 6562028
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6561808 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 6561906  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |    
T  6561907 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcatt 6562006  T
Q  200 atagtggattggagggctgctc 221  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  6562007 atagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47149154 - 47148890
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  47149154 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattg-ag 47149057  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  47149056 tctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcata 47148957  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47148956 tagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12268216 - 12267958
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12268216 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattg-agtctcttgg 12268118  T
Q  110 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatt 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||| |||||||||||||||| |      
T  12268117 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-tttgtaacgttactcatcatatagtgaaac 12268028  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12268027 agagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53468714 - 53468436
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  53468714 gcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-t 53468617  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  53468616 ctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 53468517  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccag--actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53468516 tagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51674995 - 51674749
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51674995 ttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggatttt 51674897  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  51674896 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccat 51674797  T
Q  232 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51674796 accaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 51674749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 39715467 - 39715739
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  39715467 gcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agt 39715565  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||    
T  39715566 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--at 39715663  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   || || ||  |||||||||| ||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  39715664 agtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39715739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 301
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168396
Alignment:
Q  69 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  169 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  268 tctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
      |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11168364 cttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 11168396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688143
Alignment:
Q  56 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  156 attcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaac 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  254 tgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35918208 - 35917944
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35918208 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaat 35918109  T
Q  97 tggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactca 195  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35918108 tg-agtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 35918010  T
Q  196 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    | ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  35918009 ttatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 42992284 - 42992544
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42992284 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagt 42992382  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  42992383 ctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatat 42992466  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42992467 agtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttct 42992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219359
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-agtctcttggttgcgggaagagattgg 32219204  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  32219205 gactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 32219304  T
Q  225 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32219305 ctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 32219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28761686 - 28761422
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28761686 caacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtc 28761589  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  28761588 tcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 28761489  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  28761488 agtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaatt 28761422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 890029 - 889779
Alignment:
Q  7 caacaaaac-tagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  890029 caacaaaacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtct 889931  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  889930 cttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 889832  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgg 256  Q
    || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  889831 tgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54691830 - 54691569
Alignment:
Q  6 acaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |     
T  54691830 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatttt 54691732  T
Q  106 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagt 204  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  54691731 ttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagt 54691632  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
      |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||||||    
T  54691631 taaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaatt 54691569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232074
Alignment:
Q  53 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttg-agtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  153 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  251 aactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6232074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28100302 - 28100143
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  28100302 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggatt-ga 28100204  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100203 gtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 31151347 - 31151607
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31151347 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 31151442  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactca-tcatat 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| | |||||| |  |||    
T  31151443 tcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttat 31151540  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||    
T  31151541 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaatt 31151607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 23633458 - 23633727
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23633458 caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtc 23633551  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tata 202  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23633552 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattata 23633651  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23633652 gtgaaaaggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781141
Alignment:
Q  20 gtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 119  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttacgggaag 15780984  T
Q  120 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg----atttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggag 213  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| | || | |||| |||||||||  | ||    
T  15780985 aggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaag 15781084  T
Q  214 gg---ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15781085 ggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15781141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 264
Target Start/End: Original strand, 53591212 - 53591442
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  53591212 ttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattg-agtctcttggttacgagaatagatttggatttt 53591310  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | |||| |||||||| ||||||    
T  53591311 gggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccccag 53591409  T
Q  232 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  53591410 actaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 279
Target Start/End: Original strand, 4666554 - 4666788
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4666554 aacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 4666652  T
Q  145 gcgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4666653 gcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtca 4666749  T
Q  241 gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
      |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  4666750 atttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 4666788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420189
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 13420338  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |||| ||||      
T  13420337 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaac 13420238  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  13420237 ggagagctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561767
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 561929  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||||||||| |||||||||      
T  561928 acgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 561829  T
Q  210 ggagggctgctctctccc-ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  561828 gaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttc 561767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 28181021 - 28181182
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28181021 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggatt-gagtc 28181119  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181120 tattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871293
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattg-agtc 36871462  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| | || |||||| |||    
T  36871461 tcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattat 36871362  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36871361 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttc 36871293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795521
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 17795363  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| || |      
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaatt 17795521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103961
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 19103803  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| || |      
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaatt 19103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 23637025 - 23637199
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23637025 caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattg-agtc 23637120  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    ||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637121 tcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 258
Target Start/End: Original strand, 53597238 - 53597491
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53597238 caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 53597333  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| | | ||| |||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||| |||    
T  53597334 tcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattat 53597433  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  53597434 agtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635646
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-atagtggatt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||| || ||| |      
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaac 25635586  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
     ||||| ||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25635587 agagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatttc 25635646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635641
Alignment:
Q  129 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  228 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27635641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattgg 28137443  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagact 154  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137442 ggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||  |||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaa 1620559  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    ||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  1620558 ccctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  264 aa 265  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674228
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtct 1674070  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| | |||        |      
T  1674071 cttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------ttt 1674162  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1674163 tggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaattt 1674228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701666
Alignment:
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  232 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaatt 47701666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894018
Alignment:
Q  198 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttca 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 53894022  T
Q  298 tctc 301  Q
    ||||    
T  53894021 tctc 53894018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 54884155 - 54884357
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  54884155 gcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggatt-gagt 54884251  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  54884252 ctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 54884350  T
Q  201 tagtgga 207  Q
    |||||||    
T  54884351 tagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 41849151 - 41849244
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849151 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 269
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181646
Alignment:
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||| |||||||||      
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttc 24181646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 279
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  83 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttt 3306937  T
Q  182 tgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  3306938 tgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919095
Alignment:
Q  198 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 35919095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913952
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  29914132 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 29914038  T
Q  184 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 29913952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 11163148 - 11163218
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163148 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897210
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  10897008 cactattaggattg-attctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 10897102  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 10897200  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  10897201 tcttcttctt 10897210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Original strand, 41849244 - 41849333
Alignment:
Q  190 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41849244 tactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41849333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094068
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10094256 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10094162  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 10094068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634434
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
     || ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||  |  |||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||    
T  14634539 acctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaactaggtaaac 14634440  T
Q  263 aaattt 268  Q
    ||||||    
T  14634439 aaattt 14634434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100085
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10100273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10100179  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 10100085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200948
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10201136 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10201042  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    ||| || |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 10200948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177380
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 24177373  T
Q  104 tcttggt 110  Q
    |||||||    
T  24177374 tcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193423
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  54193229 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 54193323  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  || |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  54193324 taaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 54193422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207994
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10208182 aaacactattacgattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10208088  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 10207994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420110
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattagga-tcaagtc 13419976  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac-ccattgatttctctttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||| ||  || ||| | ||| |||||||    ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||    
T  13419977 tcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctctttgtaaagttactcatcatta 13420076  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagact 234  Q
    ||||||| | | || || ||||||||||||||||    
T  13420077 tagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544461
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  27544273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagcgtggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 27544367  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27544368 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 27544461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625969
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || | || ||||||| ||| ||||    |||||    
T  22626166 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcatta---tctct 22626072  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22626071 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgt 22625973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27635884 - 27635830
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635884 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878168
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  47878350 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 47878256  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatt 47878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 6231447 - 6231502
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231447 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761965
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 27762071  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  ||||  | ||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 27761973  T
Q  280 tcttcttc 287  Q
    ||||||||    
T  27761972 tcttcttc 27761965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188705
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  54188512 cactattagaattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 54188606  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  54188607 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 54188704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634151
Alignment:
Q  149 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||| |  | | ||||||||||||| |||||||||| ||  |||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  247 accgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaattt 25634151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 3716021 - 3716085
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3716021 atagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303506
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| | |||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  6303310 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 6303404  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  6303405 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccaaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 6303503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794796
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaa 6794796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007544
Alignment:
Q  99 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||| | ||||  |||| ||||||| | ||||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttactcatc 11007589  T
Q  198 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 241  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11007588 attatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcag 11007544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 40592801 - 40592865
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40592801 atagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 47701854 - 47701798
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701854 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 47923925 - 47923989
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47923925 atagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 267
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535800
Alignment:
Q  90 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |    
T  4535622 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaag 4535716  T
Q  189 gtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcc-cccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
      ||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4535717 aaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4535800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 258
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768825
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||   | ||||| |||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 7768730  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    ||  || || |  |||||||| | ||||||| | |||||||||  | |||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  7768731 ccttttaatatacctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaattgggt 7768825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612775
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || ||||||||    
T  10612957 cactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttg 10612863  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10612862 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10612775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929519
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggt 25929519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966624
Alignment:
Q  99 gagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcat 196  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcat 46966717  T
Q  197 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttct 288  Q
    || |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  46966716 cattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttcttcttcttct 46966624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928683
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26928683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 39040011 - 39040075
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39040011 atagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844656
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaa 40844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 3328376 - 3328439
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  3328376 tagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858718
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  5858546 aaacactattaggattg-agtct--tggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 5858638  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgg 256  Q
    |||||| |  ||||||  ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  5858639 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgg 5858718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595031
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || ||||||||    
T  10595213 cactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttg 10595119  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10595031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390281
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 48390281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 2671619 - 2671691
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2671619 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 2671691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7167308 - 7167236
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  7167308 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 7167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 94  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 8739096 - 8739168
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  8739096 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 8739168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 9091334 - 9091406
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  9091334 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 9091406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| || ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  11079517 aaacactatcaggattg-agtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttagg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 11079611  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11079612 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 283
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997078
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||||| |||||| |||  |  | || |||||    
T  16996875 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctct 16996972  T
Q  181 ttgt-aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| || |  || ||||| |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||   |||||||    
T  16996973 ttgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgtt 16997072  T
Q  278 cttctt 283  Q
    ||||||    
T  16997073 cttctt 16997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 40372828 - 40372900
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  40372828 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 40372900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 2672952 - 2673011
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2672952 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2673011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 2677108 - 2677167
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2677108 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2677167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8477426 - 8477367
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8477426 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 8477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8512281 - 8512222
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8512281 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8517161 - 8517102
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8517161 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18656499 - 18656440
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18656499 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18656440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 22173216 - 22173275
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22173216 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 24695183 - 24695247
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24695183 atagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32475549 - 32475490
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32475549 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32475490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32480407 - 32480348
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32480407 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32480348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 3323710 - 3323756
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  3323710 tagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9666531 - 9666466
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9666531 atagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236305
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaac-aatttcttggtgtt 30236305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 3306798 - 3306842
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaaca 48  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  3306798 caacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Original strand, 4386950 - 4386986
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4386950 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtca 4386986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 15780858 - 15780886
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780858 gcaacaacaaaactagggtttgtatagag 15780886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 29813187 - 29813231
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaa 29813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  224 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 260
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 260  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 145)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16226183 - 16226483
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226183 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 16226282  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16226283 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16226382  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16226383 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 16226482  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  16226483 c 16226483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 47179729 - 47180028
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179729 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 47179828  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47179829 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 47179928  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47179929 tagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 47180027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9463507 - 9463228
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9463507 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagt 9463408  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463407 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 9463308  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463307 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9463228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9459679 - 9459401
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9459679 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtc 9459580  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459579 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 9459480  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9459401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 47177378 - 47177677
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47177378 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatggga 47177477  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47177478 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 47177577  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47177578 tagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 47177676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 28840700 - 28840994
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28840700 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtct 28840798  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840799 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagt 28840898  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28840899 ggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 28840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 51750057 - 51750354
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750057 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 51750155  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51750156 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 51750255  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51750256 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51750354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10400090 - 10399794
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10400090 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 10399992  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10399991 tcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 10399892  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10399891 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10399794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31735784 - 31735487
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  31735784 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggtt-gagt 31735686  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31735685 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 31735586  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31735585 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 31735487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46431970 - 46431690
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46431970 gcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 46431872  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431871 ctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 46431772  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctc--ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46431771 gtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 46431690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 52 - 301
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231878
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  252 actgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16231878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15295097 - 15294800
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295097 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 15294999  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15294998 ctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 15294899  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15294898 agtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 15294800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27337201 - 27336927
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27337201 gcaacaacaaaactagggtttttatagat-ttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg-gt 27337104  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337103 ctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 27337004  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27337003 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 51752385 - 51752678
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  51752385 aacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attg-agtct 51752482  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagt 204  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51752483 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagt 51752582  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51752583 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51752678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 20302477 - 20302755
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20302477 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 20302575  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20302576 ctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagata 20302675  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20302676 gtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttcttct 20302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 13761855 - 13762151
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13761855 gcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattg-agt 13761953  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13761954 ctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 13762053  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13762054 gtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 13762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 28842513 - 28842809
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattg-agt 28842611  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28842612 ctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 28842711  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28842712 gtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 28842809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 6823033 - 6823306
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6823033 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agt 6823130  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6823131 ctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 6823230  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6823231 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 20291475 - 20291771
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20291475 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 20291573  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20291574 ctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatata 20291673  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20291674 gtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 20291771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17324899 - 17324623
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17324899 gcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 17324801  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17324800 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 17324701  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17324700 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 47906288 - 47906564
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47906288 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agt 47906386  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47906387 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 47906486  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47906487 agtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 47906564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Original strand, 24325681 - 24325980
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24325681 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagt 24325779  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24325780 ctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatat 24325879  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  24325880 agtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctc 24325978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27339393 - 27339118
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  27339393 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattg-agt 27339295  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339294 ctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 27339195  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27339194 gtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 15823564 - 15823840
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  15823564 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatatt-gagt 15823662  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15823663 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatat 15823762  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15823763 agtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786144
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 23786134  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  23786135 cttcttcttt 23786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 2617535 - 2617825
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2617535 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 2617633  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2617634 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 2617733  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  2617734 gtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttc-tcttcattgtgtt 2617825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 39932091 - 39932389
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  39932091 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggatt-gaat 39932189  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39932190 ctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 39932289  T
Q  202 agtggattggagggctgctctc-tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39932290 agtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 39932388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12302768 - 12302492
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12302768 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 12302670  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12302669 ctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 12302570  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12302569 agtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12302492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50307810 - 50307532
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50307810 gcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 50307712  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  50307711 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 50307612  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-tctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50307611 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttct 50307532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 13215099 - 13215368
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13215099 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagt 13215197  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||   ||||||||    
T  13215198 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatc 13215297  T
Q  198 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13215298 attatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaatt 13215368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2510587 - 2510309
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2510587 gcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagt 2510489  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2510488 cttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatat 2510390  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2510389 agtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 2510309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 39462537 - 39462813
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39462537 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 39462635  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| || | || |||||||||    
T  39462636 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatat 39462735  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39462736 agtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39462813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38925741 - 38925468
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38925741 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agt 38925643  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  38925642 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata- 38925544  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  38925543 -gtaaaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 38925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6995963 - 6995687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6995963 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagt 6995865  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  6995864 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatat 6995765  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6995764 agtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 16428671 - 16428948
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16428671 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agt 16428769  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |     
T  16428770 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattt 16428869  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16428870 tagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 16428948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21948450 - 21948226
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21948450 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattg-agt 21948353  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21948352 ctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 21948253  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccc 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21948252 agtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50076934 - 50076659
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50076934 caacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 50076836  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  50076835 tcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 50076736  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50076735 agtggaacggatgactgctctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 50076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14098233 - 14097956
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14098233 gcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 14098135  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14098134 ctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcata 14098035  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14098034 tagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 41646938 - 41647202
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41646938 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 41647036  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41647037 cacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 41647136  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41647137 agtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41647202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9241349 - 9241084
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9241349 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggatt-gagt 9241251  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  9241250 ctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 9241151  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  9241150 tagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaatt 9241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17186391 - 17186114
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17186391 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagt 17186293  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  17186292 ctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcatta 17186193  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17186192 taatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 18839605 - 18839870
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18839605 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18839703  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  18839704 ctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 18839803  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |   |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18839804 tagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 18839870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2949493 - 2949219
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2949493 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 2949395  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2949394 tcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 2949295  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2949294 gtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2949219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11457737 - 11457462
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11457737 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtc 11457639  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11457638 tcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 11457539  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11457538 gtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 11457462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28998515 - 28998240
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28998515 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 28998417  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||     
T  28998416 tcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatg 28998317  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28998316 gtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29004231 - 29003956
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29004231 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 29004133  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||     
T  29004132 tcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatg 29004033  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29004032 gtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 18307127 - 18307403
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18307127 gcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagt 18307225  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  18307226 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 18307325  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  18307326 tagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50079080 - 50078807
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  50079080 caacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctct 50078982  T
Q  107 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagt 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||    
T  50078981 tggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagt 50078882  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||   || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||    
T  50078881 ggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttct 50078807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757845
Alignment:
Q  77 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  177 ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  51757722 ctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  277 tcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||    
T  51757822 tcttc-tcttctttgtgttcttctc 51757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 25127890 - 25128167
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25127890 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggatt-gagt 25127988  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  25127989 ctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 25128088  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || || |  |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25128089 tattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4131642 - 4131362
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4131642 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagt 4131544  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcatc 197  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| | ||||||||    
T  4131543 ctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatc 4131445  T
Q  198 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  4131444 attatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 6756545 - 6756810
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6756545 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 6756643  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    |||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  6756644 tct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 6756741  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6756742 atagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaatt 6756810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25251537 - 25251261
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25251537 caacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtc 25251439  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||| |||| |||    
T  25251438 tctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattat 25251339  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   ||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25251338 agtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3579875 - 3579606
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3579875 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggatt-gagtctct 3579777  T
Q  107 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtg 205  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  3579776 tgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtg 3579678  T
Q  206 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
     |  ||| |  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3579677 aaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31425282 - 31425002
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  31425282 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 31425183  T
Q  101 g-tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca 198  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  31425182 gatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca 31425083  T
Q  199 -tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31425082 ttatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 48665195 - 48665400
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48665195 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagt 48665293  T
Q  103 ctcttggtta-cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  48665294 ctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 48665393  T
Q  201 tagtgga 207  Q
    |||||||    
T  48665394 tagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28207328 - 28207055
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28207328 caacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtc 28207230  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  28207229 tcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--ata 28207132  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28207131 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Original strand, 31489935 - 31490206
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  31489935 aacaacaaaactagggtttgtatagt--ttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatt-t 31490031  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| |    
T  31490032 cttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatgg 31490131  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  31490132 tgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50248834 - 50248557
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50248834 caacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtc 50248736  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  50248735 tcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatata 50248636  T
Q  203 gtggattggagggctg--ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   || || ||  |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  50248635 gtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14183843 - 14183581
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  14183843 aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattg-agtctcttggtt 14183748  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||      
T  14183747 acgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 14183648  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtg 275  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14183647 ggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 40133963 - 40134239
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  40133963 caacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggatt-gagtc 40134061  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  40134062 tcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 40134161  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  40134162 agtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 6823903 - 6824088
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  6823903 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gaat 6824001  T
Q  103 ctctt-------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    |||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824002 ctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669379
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 15669553  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||    
T  15669552 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgg 15669453  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||| || |||||||||  |||||||||    
T  15669452 aacggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttct 15669379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324346
Alignment:
Q  25 tatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 124  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgaatatgggaagagatt 17324201  T
Q  125 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctct 222  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  ||| ||||| |||    
T  17324202 ggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtct 17324301  T
Q  223 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  17324302 ctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 17324346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 42922252 - 42922515
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  42922252 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtc 42922347  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||     
T  42922348 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattag 42922447  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  42922448 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattt 42922515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 17318911 - 17319181
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
T  17318911 gcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattg-agt 17319003  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| | | ||||||||| ||    
T  17319004 ctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcatta 17319103  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||  |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17319104 tagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 279
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429252
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccca 16429140  T
Q  170 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16429141 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T
Q  268 tctttgtgttct 279  Q
      ||||||||||    
T  16429241 cttttgtgttct 16429252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Original strand, 47451666 - 47451919
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         ||||||||| |||    
T  47451666 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattg-agt 47451758  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47451759 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 47451858  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    |||| |  | | | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47451859 agtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |  ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  250 gaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31423137 - 31422940
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaac-aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31423137 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattg-ag 31423039  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||    
T  31423038 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Original strand, 16432442 - 16432690
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  16432442 ttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaa-tctcttggttatgggaagagattgaaacttt 16432540  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc- 229  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || || ||||||||||||||     
T  16432541 gggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccca 16432640  T
Q  230 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16432641 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 16432690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8347532 - 8347284
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  8347532 caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtc 8347437  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |||    
T  8347436 tcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattat 8347337  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaac 253  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  8347336 agtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816180
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  226 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23816180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115089
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 164  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T
Q  165 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| |||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  6115205 accaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  263 aaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||  ||||||||||    
T  6115105 aaattattttgtgttct 6115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8349311 - 8349048
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8349311 caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattg-agtt 8349216  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | | ||||||||| |||    
T  8349215 tgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattat 8349116  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  8349115 agtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaattt 8349048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18800832 - 18800568
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  18800832 caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattg-agtc 18800737  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  18800736 tctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 18800637  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||| |  ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  18800636 agtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttc 18800568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495209
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||     
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtc 49495367  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |      
T  49495366 acggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaac 49495267  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | ||||||  ||||||||| |||||| ||||  || ||||||||| ||| || |||||    
T  49495266 gaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaatt 49495209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916782
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27916525 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattg-agtctcttggt 27916618  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc--cattgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtgg 206  Q
     ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  27916619 cacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtgg 27916718  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27916719 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatttc 27916782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13125711 - 13125453
Alignment:
Q  12 aaactagggtttg-tatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  13125711 aaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggt 13125616  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgga 207  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13125615 caagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 13125516  T
Q  208 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
      |||| | ||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13125515 acggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttc 13125453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738623
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  30738731 ccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaa 30738632  T
Q  261 acaaatttc 269  Q
    |||||||||    
T  30738631 acaaatttc 30738623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 30790505  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  30790504 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 30790406  T
Q  261 acaaa 265  Q
    |||||    
T  30790405 acaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 301
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358888
Alignment:
Q  190 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctt 13358876  T
Q  290 tgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||    
T  13358877 tgtgttcttctc 13358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 269
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561753
Alignment:
Q  63 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  162 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgt 16561742  T
Q  259 caacaaatttc 269  Q
     ||||||||||    
T  16561743 aaacaaatttc 16561753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613236
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggatt-gagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| ||||| |||| |||| || | |||| |||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  26613341 ccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  263 aaattt 268  Q
    ||||||    
T  26613241 aaattt 26613236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaa 155886  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 228  Q
    ||  ||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  155887 ccttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26520379 - 26520206
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26520379 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattga--ggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtc 26520284  T
Q  104 tcttggttac------gggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 174  Q
    ||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520283 tcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 279
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279563
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaatta 28279422  T
Q  144 gg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtc 239  Q
    ||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| | || ||| |||||| ||||||||||    
T  28279423 ggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtc 28279522  T
Q  240 ag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || ||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  28279523 agtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttct 28279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353345
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  21353525 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 21353431  T
Q  184 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaatt 21353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232787
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2232597 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2232691  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| |  ||||||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  2232692 ttgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 2232786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401198
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  2401400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 2401306  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  2401305 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 2401208  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  2401207 tcttcttctt 2401198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 268
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916675
Alignment:
Q  158 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaact 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  255 gggtcaacaaattt 268  Q
    |||| |||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattt 15916675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775676
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 775676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526663
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  9526469 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 9526563  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||| ||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  9526564 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 9526662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889443
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144662
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || | |||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatatct 4144771  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  4144770 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgt 4144673  T
Q  277 tcttcttcttc 287  Q
    ||| |||||||    
T  4144672 tctccttcttc 4144662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604716
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 13604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393260
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  2393461 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaatagtctgggactt-gggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 2393367  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||   |||||||||    
T  2393366 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc--ttgtgttct 2393270  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  2393269 tcttcttctt 2393260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13447296 - 13447245
Alignment:
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13447296 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtt 13447245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 19358872 - 19358935
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19358872 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19358935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 19361461 - 19361524
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19361461 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 19380101 - 19380164
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19380101 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19380164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 24202798 - 24202861
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24202798 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31422915 - 31422859
Alignment:
Q  211 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31422915 gagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaatt 31422859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127683
Alignment:
Q  180 tttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 238
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104414
Alignment:
Q  71 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccc 168  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||  || ||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattg-agtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccc 43104343  T
Q  169 attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggt 238  Q
     ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  43104344 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc-ctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 25445110 - 25445169
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  25445110 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25445169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39445564 - 39445505
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  39445564 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39445505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 44023894 - 44023953
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44023894 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44023953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783350
Alignment:
Q  128 actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  226 ccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttct 288  Q
    | ||||| || ||| | |||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt--attgtgttcttcttcttct 46783350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521912
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  9521718 cactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 9521812  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||| ||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  9521813 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 9521911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatt-tagtctcttg 26332721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  222 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 24787397 - 24787469
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  24787397 tggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 24787469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 1055032 - 1055091
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1055032 tggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1055091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22819494 - 22819438
Alignment:
Q  203 gtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  22819494 gtggattggagggctactctctccccccagagtaggtcatattggaccaaattgggt 22819438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41390645 - 41390586
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||||||    
T  41390645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgatctgggtcaacaa 41390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41398300 - 41398241
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||||||    
T  41398300 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 41398241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988544
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  43988485 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtaaacaa 43988544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 123)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 43079674 - 43079963
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079674 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 43079773  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43079774 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 43079873  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43079874 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttt 43079963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 43082045 - 43082334
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43082045 aagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgga 43082144  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43082145 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 43082244  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082245 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 43082334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 44720917 - 44721214
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44720917 gcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattg-ag 44721015  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721016 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 44721115  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44721116 agtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 44721214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 27829371 - 27829667
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27829371 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 27829469  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27829470 ctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 27829569  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27829570 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27829667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24873442 - 24873165
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24873442 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagt 24873343  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24873342 ctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 24873243  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  24873242 gtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatttc--tgtgttcttct 24873165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 32339383 - 32339680
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32339383 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagt 32339481  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32339482 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatat 32339581  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32339582 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 32339680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 18810782 - 18811078
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18810782 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 18810880  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18810881 ctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 18810980  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18810981 gtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18811078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 27827060 - 27827356
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27827060 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 27827158  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27827159 ctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 27827258  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27827259 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27827356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 3874085 - 3874363
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3874085 caacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattt-agtc 3874183  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3874184 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 3874283  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3874284 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3874363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 608808 - 609101
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  608808 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagt 608906  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  608907 ctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 609006  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-tctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  609007 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 609101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 4424092 - 4424389
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4424092 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggatt-gagt 4424190  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  4424191 ctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatat 4424290  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4424291 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 4424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 15809293 - 15809589
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15809293 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agt 15809390  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15809391 ctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 15809490  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15809491 agtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 15809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28283480 - 28283185
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  28283480 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaa-t 28283382  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28283381 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 28283282  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28283281 gtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 28283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28251828 - 28251552
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251828 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 28251730  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  28251729 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatat 28251630  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28251629 agtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22684916 - 22684617
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684916 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 22684818  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-ttgtaacggtactcatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22684817 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcat 22684718  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22684717 atagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttc 22684619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 301
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813252
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||     
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgggtacgggaagaggctgt 18813078  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813079 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 18813178  T
Q  227 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18813179 cccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18813252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30480764 - 30480488
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30480764 gcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 30480666  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||    
T  30480665 ctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatat 30480566  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30480565 agtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30480488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 14807825 - 14808111
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14807825 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 14807923  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14807924 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 14808023  T
Q  202 agtggattggagggctg----------ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14808024 agtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14808111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27107158 - 27106884
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27107158 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 27107060  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||||||||||||    
T  27107059 ctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatat 27106960  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27106959 agtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 15072784 - 15073061
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15072784 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 15072882  T
Q  103 ctcttggttacgggaaga-gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15072883 ctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 15072982  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15072983 cagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 15073061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530481
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctcggttacgggaagaggctgg 43530311  T
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43530312 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctc 43530411  T
Q  226 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43530412 tcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 43530481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 15068055 - 15068330
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15068055 gcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggatt-gagt 15068153  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15068154 cttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 15068253  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 278  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15068254 aatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 27911088 - 27911351
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27911088 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 27911186  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27911187 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatat 27911286  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27911287 agtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27911351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 27957507 - 27957770
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27957507 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 27957605  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27957606 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatat 27957705  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27957706 agtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27957770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 1225241 - 1225517
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1225241 caacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 1225339  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1225340 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatat 1225439  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| ||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1225440 agtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1225517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14419452 - 14419175
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14419452 gcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agt 14419354  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||||||||| ||    
T  14419353 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcatta 14419254  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14419253 tagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 41384819 - 41385082
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41384819 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtc 41384917  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41384918 tcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 41385017  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41385018 gtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13858745 - 13858470
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13858745 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 13858647  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  13858646 ttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcatta 13858548  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13858547 tagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaa-ttctttgtgttct 13858470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 36865612 - 36865875
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36865612 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 36865710  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  36865711 ctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcatta 36865807  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36865808 tagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5372439 - 5372160
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5372439 gcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 5372341  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||||||||| ||    
T  5372340 ctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcatta 5372241  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    ||||| |  |||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||    
T  5372240 tagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 25952595 - 25952871
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  25952595 gcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattg-agt 25952692  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||    
T  25952693 ctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcatta 25952792  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25952793 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 41382748 - 41383012
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |||| ||||| ||||    
T  41382748 caacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattg-agtc 41382835  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41382836 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 41382935  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  41382936 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 41383012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Original strand, 14477350 - 14477520
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14477350 gcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagt 14477448  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477449 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482651
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggtt 21482491  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||  | |      
T  21482492 atgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaac 21482591  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21482592 ggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttc 21482651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956296
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  119 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||     
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | ||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 15956296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480832
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggtt 21480683  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |      
T  21480684 acgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaac 21480783  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21480784 agagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 31162344 - 31162553
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31162344 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgt 31162442  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct--cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31162443 aactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 31162542  T
Q  259 caacaaatttc 269  Q
     ||||||||||    
T  31162543 aaacaaatttc 31162553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3005880 - 3005627
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||   |||||||| |||||||   || ||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  3005880 aaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattg-agtctcttggtc 3005786  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||      
T  3005785 acggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaac 3005686  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3005685 ggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 3005627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33541649 - 33541507
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33541649 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagt 33541551  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 146  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33541550 atcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15185966 - 15185711
Alignment:
Q  8 aacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-gagtctct 106  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||    
T  15185966 aacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctct 15185867  T
Q  107 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagt 204  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  15185866 tggttacgggaagagatt-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagt 15185774  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | |  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15185773 gaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15185711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035461
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  163 taacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac--taggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  259 caacaaatttc 269  Q
     ||||||||||    
T  31035451 aaacaaatttc 31035461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttacg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  149 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578272
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||  ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  31578377 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaac 31578278  T
Q  263 aaattt 268  Q
    ||||||    
T  31578277 aaattt 31578272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5622999 - 5622877
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  5622999 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggatt-gagt 5622901  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgg 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  5622900 ctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  17 agggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacggg 37214349  T
Q  117 aagagattgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214348 aagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 26775275 - 26775378
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26775275 gcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaatt-gagt 26775373  T
Q  103 ctctt 107  Q
    |||||    
T  26775374 ctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 257
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 163  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 17847759  T
Q  164 aacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggg 257  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||    | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17847760 aacct-ttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468124
Alignment:
Q  136 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  234 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatttc 2468124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 35872634 - 35872555
Alignment:
Q  13 aactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872634 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573847
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757253
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  16757449 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 16757355  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 16757256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376329
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||||||||   || |||| |||||||| |||  ||||| |||||    
T  6376141 aaacactgttaagattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctct 6376239  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattt 6376329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328104
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  28327908 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 28328002  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 28328101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412340
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttc 7412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021104
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  9021289 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 9021195  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 9021104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684839
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttg 25684740  T
Q  184 taacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    ||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  25684741 taaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttctt 25684839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541403
Alignment:
Q  168 cattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 266  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa-aaat 33541409  T
Q  267 ttcttt 272  Q
    ||||||    
T  33541408 ttcttt 33541403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035235
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895699
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||    
T  28895502 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctct 28895596  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  28895597 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgt 28895695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752509
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  16752704 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 16752610  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16752609 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 16752512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332827
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  28332631 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 28332725  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  28332726 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 28332824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812481
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  4812669 aaacactattaggattg-agtcttttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 4812575  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  | |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4812574 ttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 4812481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214251
Alignment:
Q  214 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890962
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttctt 28890962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179538
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||||| || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  23179740 cactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 23179646  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  23179645 taaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 23179548  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  23179547 tcttcttctt 23179538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456036
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtca 4456036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032857
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  33032657 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 33032751  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||  |||||||||||| || ||| |  ||||||||||    
T  33032752 taaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaaaaaaat--tttgtgttct 33032849  T
Q  280 tcttcttc 287  Q
     |||||||    
T  33032850 ccttcttc 33032857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag-acttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |   ||  ||||||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  29554964 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttg 29554870  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29554869 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 1261983 - 1262046
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  1261983 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ttgaactgggtcaacaa 1262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26287969 - 26287906
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26287969 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26301226 - 26301163
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26301226 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26313220 - 26313157
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26313220 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26313157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 227  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2468307 - 2468261
Alignment:
Q  63 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2468307 tgggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590979
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||||    
T  590797 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttg 590891  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || |||||    
T  590892 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactgggtaaataaatt 590979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17799490 - 17799403
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  17799490 tatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 17799403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 277
Target Start/End: Original strand, 18853196 - 18853273
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  18853196 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 18853273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 277
Target Start/End: Original strand, 18870590 - 18870667
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  18870590 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgga-tgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 18870667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 33037839 - 33037923
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  33037839 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt-ttgttcttcttt 33037923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 10689176 - 10689248
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  10689176 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 10689248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930187
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaac-aatttcttggtgtt 10930187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 12517285 - 12517248
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctct 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307571
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggt 28307571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31566601 - 31566552
Alignment:
Q  221 ctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31566601 ctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 31566552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36979441 - 36979369
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  36979441 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 36979369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896164
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgta 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||   || | || |||||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattg-agtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgta 3896055  T
Q  165 acccat-tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    || | | |||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||| || || |    
T  3896056 actcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaa 3896155  T
Q  261 acaaatttc 269  Q
    |||||||||    
T  3896156 acaaatttc 3896164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 4733809 - 4733873
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4733809 atagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6311361 - 6311302
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  6311361 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 6311302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6813747 - 6813687
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6813747 tggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaa 6813687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 7289947 - 7290006
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7289947 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 7290006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 10684285 - 10684344
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10684285 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 10684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 25328299 - 25328358
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  25328299 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25328358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35745455 - 35745396
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35745455 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 35745396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 39784843 - 39784902
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  39784843 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30655708 - 30655638
Alignment:
Q  206 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  30655708 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 30655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 4760108 - 4760167
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4760108 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4760167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 253
Target Start/End: Original strand, 9054867 - 9054919
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaac 253  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  9054867 tagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattggactgaac 9054919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35872474 - 35872438
Alignment:
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35872474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35872438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 132)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 289
Target Start/End: Original strand, 31545098 - 31545384
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31545098 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagt 31545197  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31545198 ctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatata 31545297  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545298 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 31545384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15552261 - 15552561
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552261 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 15552360  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15552361 gtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 15552460  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15552461 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 15552560  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  15552561 c 15552561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 290
Target Start/End: Original strand, 31542753 - 31543039
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542753 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31542852  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31542853 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatata 31542951  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31542952 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttt 31543039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31179632 - 31179337
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179632 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31179533  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31179532 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatata 31179433  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31179432 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc--tgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 31179337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34477315 - 34477017
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34477315 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagt 34477216  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34477215 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 34477116  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34477115 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 34477017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34479680 - 34479382
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34479680 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagt 34479581  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34479580 ctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 34479481  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34479480 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 34479382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 2174937 - 2175215
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2174937 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agt 2175035  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2175036 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatata 2175135  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2175136 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 2175215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 38882124 - 38882402
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38882124 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 38882222  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38882223 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 38882322  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38882323 gtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 38882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10529360 - 10529062
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10529360 gcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 10529262  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10529261 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 10529162  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-tctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10529161 agtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 10529063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21684712 - 21684416
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21684712 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattg-agt 21684614  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21684613 ctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 21684514  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  21684513 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttc-tcttttttgtgttcttctc 21684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25921733 - 25921437
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25921733 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtc 25921635  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25921634 tcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 25921535  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25921534 gtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 25921437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Original strand, 4236647 - 4236945
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4236647 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 4236745  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4236746 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 4236845  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4236846 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctc 4236943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6745085 - 6745362
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6745085 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 6745182  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6745183 gtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 6745282  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6745283 atagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 25804043 - 25804339
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25804043 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 25804141  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25804142 ctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 25804241  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25804242 agtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctt-gtcttctttgtgttcttctc 25804339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 39854501 - 39854777
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39854501 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 39854599  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39854600 ctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatat 39854699  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  39854700 agtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 18466702 - 18466999
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466702 gcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18466800  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18466801 ctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 18466900  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  18466901 aatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18466999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410319
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  252 actgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4410319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 16776176 - 16776451
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16776176 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 16776274  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16776275 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatat 16776373  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16776374 agtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18511472 - 18511197
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18511472 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 18511374  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  18511373 tcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 18511274  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18511273 gtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18511197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 27910468 - 27910747
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27910468 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaat 27910566  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27910567 ctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 27910666  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    | ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27910667 aatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 27910747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 27912554 - 27912851
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27912554 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 27912652  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27912653 ctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 27912752  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27912753 agtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373111
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 3373121  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  3373120 cttcttcttt 3373111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 6747322 - 6747608
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6747322 aagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 6747419  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  6747420 gtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcata 6747519  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6747520 tagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tcttcttcttt 6747608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10750004
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttctt 10749994  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  10749995 cttcttcttt 10750004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 21948045 - 21948320
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948045 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 21948143  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21948144 tcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 21948243  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21948244 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354537
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15354559  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  15354558 cttcttcttt-tgttcttctcac 15354537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665360
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23665338  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  23665339 cttcttcttt-tgttcttctcac 23665360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793227
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23793249  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  23793248 cttcttcttt-tgttcttctcac 23793227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 40221540 - 40221805
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40221540 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 40221638  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  40221639 ctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 40221738  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40221739 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 18469029 - 18469324
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18469029 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18469127  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  18469128 ctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatct 18469227  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18469228 agtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356813
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15356835  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  15356834 cttcttcttt-tgttcttctcac 15356813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757480
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttctt 10757470  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  10757471 cttcttcttt 10757480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18509578 - 18509303
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18509578 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 18509480  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| | |||||||||||||    
T  18509479 tcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatata 18509380  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18509379 gtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18509303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 25904122 - 25904397
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25904122 caacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 25904220  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  25904221 tcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatata 25904320  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25904321 gtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttct 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658341
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcg-agtctct 658512  T
Q  107 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtg 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  206 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     |  ||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 81 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960113
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 38960116  T
Q  281 ctt 283  Q
    |||    
T  38960115 ctt 38960113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 24126875 - 24127150
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24126875 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggatta-agtc 24126973  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  24126974 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 24127073  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24127074 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1189870 - 1189592
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  1189870 gcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgatt-gagt 1189772  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||    
T  1189771 ctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataatta 1189672  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcc-cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1189671 tagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 18596664 - 18596939
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18596664 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtc 18596762  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  18596763 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 18596862  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 278  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  18596863 agtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741821
Alignment:
Q  88 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  188 ggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 23741836  T
Q  288 tttgtgttcatctcac 303  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  23741835 ttt-tgttcttctcac 23741821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31472874 - 31472585
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31472874 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 31472776  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  31472775 ctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 31472676  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tcttcttcttt 290  Q
    ||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  31472675 tagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttcttt 31472585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10474584 - 10474308
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |    
T  10474584 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagatt-gaat 10474486  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  10474485 ctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatat 10474386  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10474385 agtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587129
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 125  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaagagattg 10586971  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct- 224  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10586972 agactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10587071  T
Q  225 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10587072 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttct 10587129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 17072902 - 17073166
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17072902 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatc 17073000  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  17073001 tcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 17073100  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17073101 agtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2818595 - 2818320
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  2818595 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattg-agtc 2818497  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2818496 tcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 2818397  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2818396 gtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 2818320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16092461 - 16092184
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16092461 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 16092363  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  16092362 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcatta 16092263  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16092262 tagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 16092184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 2954438 - 2954710
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctc 105  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2954438 caacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattg-agtctc 2954536  T
Q  106 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtg 205  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2954537 ttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtg 2954636  T
Q  206 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     |  |||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2954637 aagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2954710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 26097751 - 26098025
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  26097751 gcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatg-agt 26097848  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26097849 ctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 26097948  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26097949 agtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17818751 - 17818477
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||    
T  17818751 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactg-agt 17818653  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||     
T  17818652 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatac 17818553  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17818552 agtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798344
Alignment:
Q  61 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  161 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtc 39798321  T
Q  260 aacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  39798322 aacaaattcttttgtgttcttct 39798344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Original strand, 695926 - 696172
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  695926 ttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagacttt 696023  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  696024 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccca 696123  T
Q  231 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  696124 gacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 696172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 6756512 - 6756786
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6756512 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggatt-gagt 6756610  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| ||||| ||    
T  6756611 atcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcatta 6756708  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  6756709 tagt-gaaacgagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttct 6756786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505828
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  263 aaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37706041 - 37705777
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37706041 gcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 37705943  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  37705942 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 37705843  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  | | ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37705842 agtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 37705777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36402580 - 36402313
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36402580 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-gaatctcttggtt 36402482  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattg 210  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |       
T  36402481 acgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaaca 36402382  T
Q  211 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36402381 gatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39398254 - 39397978
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39398254 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 39398157  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||  || |||    
T  39398156 tctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattata 39398057  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||  |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  39398056 tagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 250  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  251 aactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31466233 - 31465986
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31466233 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggatt-gagtctcttg 31466135  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatcatatagtgga 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||          
T  31466134 gttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat------ 31466042  T
Q  208 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
        |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31466041 ----agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 31465986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34530927 - 34530749
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34530927 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 34530829  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34530828 ctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttt 34530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12556183 - 12555908
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12556183 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtc 12556085  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||     
T  12556084 tcttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaa 12555986  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || | |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12555985 agcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 279
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  47 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggc 2724053  T
Q  147 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 245  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2724054 gggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  246 gaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 267
Target Start/End: Original strand, 21288781 - 21289043
Alignment:
Q  2 agcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 95  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21288781 agcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattagga 21288879  T
Q  96 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactca 195  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||      ||| ||||||||| ||||||    
T  21288880 ttg-agtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct-tttgtaacgttactca 21288971  T
Q  196 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  21288972 tcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 21289043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 20045026 - 20045172
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20045026 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-ga 20045124  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045125 gtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6661443 - 6661179
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6661443 caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtc 6661348  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||| | |||    
T  6661347 tcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattat 6661248  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6661247 agtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttc 6661179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 20043068 - 20043208
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20043068 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 20043166  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20043167 ctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 287
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667620
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattcctgtgcgtcctt 23667613  T
Q  281 cttcttc 287  Q
    |||||||    
T  23667614 cttcttc 23667620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 279
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020514
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagag-ttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttg 9020340  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  9020341 gtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgg 9020440  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || ||| ||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||    
T  9020441 atcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208858
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 164  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattg-agtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgta 36208754  T
Q  165 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  36208755 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 36208853  T
Q  263 aaatt 267  Q
    |||||    
T  36208854 aaatt 36208858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26098512 - 26098379
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  26098512 gcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgatt-gagt 26098414  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26098413 ctcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143752
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||    
T  15143646 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaac 15143745  T
Q  263 aaatttc 269  Q
    |||||||    
T  15143746 aaatttc 15143752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 20053872 - 20054131
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    |||||||| |||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20053872 aaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggt 20053967  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggat 208  Q
    |  |     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||     
T  20053968 ttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaa 20054059  T
Q  209 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  20054060 cggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttct 20054131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17413385 - 17413176
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17413385 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattag 17413289  T
Q  145 g-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 241  Q
    |   | | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17413288 gtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcag 17413189  T
Q  242 -attggaccgaac 253  Q
      |||||||||||    
T  17413188 tgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 283
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898028
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-tt 182  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctatt 4897926  T
Q  183 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |||   | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  4897927 gtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattt-tttgtgttcct 4898025  T
Q  281 ctt 283  Q
    |||    
T  4898026 ctt 4898028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1171007
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  1170811 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 1170905  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 1171004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144570
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgt 2144665  T
Q  164 aacc-cattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactg 255  Q
    ||||   || || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||   ||| ||||||||||||||    
T  2144664 aaccttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattggaccgaactg 2144570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385437
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  35385634 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 35385540  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  35385539 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgt 35385441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445261
Alignment:
Q  116 gaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattgga 212  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  | |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  213 gggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15445317 gggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttc 15445261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 267
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445681
Alignment:
Q  87 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || ||||||||||    
T  25445501 ctattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgta 25445595  T
Q  186 acggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25445681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673019
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  22672837 cactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 22672931  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 22673019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098285
Alignment:
Q  180 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaatt 26098285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300689
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127503
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 42127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 154
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770934
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 154  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452680
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || ||||||||    
T  25452498 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttg 25452592  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25452593 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25452680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14520298 - 14520234
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14520298 atagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841228
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17841428 cactattaggattg-agtctctaggtcacgggaagaggctggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17841334  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  17841333 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--attgtgttct 17841236  T
Q  280 tcttcttc 287  Q
     |||||||    
T  17841235 ccttcttc 17841228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2297986
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2298183 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2298089  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    || ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  2298088 ttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatatc-ttgtgt 2297990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754312
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattg-agcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 279
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043284
Alignment:
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238463
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 42238463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38192241 - 38192178
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38192241 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38192178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38219466 - 38219403
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38219466 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38219403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430477
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattg-agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 35430357  T
Q  164 aa-cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    ||  |  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||  ||| || |||||   ||| |||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  35430358 aattcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataa 35430457  T
Q  261 acaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||   ||||||||||    
T  35430458 acaaattctcttgtgttctt 35430477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36263877 - 36263810
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagac-taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36263877 atagtggattggagagctgctctctcccctagacataggtcatattgggccggactgggtaaacaaat 36263810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20507723 - 20507665
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt 61  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507723 gcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786589
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||   || || | ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  28786407 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctctttg 28786501  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28786502 taaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 28786589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748502
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaaacactaataggattg-agt 29748463  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaa 140  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748464 ctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31180278 - 31180206
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  31180278 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 31180206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 1457183 - 1457242
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1457183 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 1457242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2785439 - 2785380
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2785439 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3880367 - 3880303
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  3880367 atagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaa 3880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627569
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || |||||    
T  10627364 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tgaatatctct 10627460  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    ||||||    ||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||   ||||||    
T  10627461 ttgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcatcattagactgaactgggtaaacagatt--cttgtgt 10627558  T
Q  277 tcttcttcttc 287  Q
    ||| |||||||    
T  10627559 tctccttcttc 10627569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 28807593 - 28807652
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28807593 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 31397014 - 31397073
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31397014 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 37556643 - 37556702
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37556643 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 37561465 - 37561524
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37561465 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43592343 - 43592284
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43592343 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 43592284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 24553537 - 24553599
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24553537 tagtggagtggagg-ctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 11181862 - 11181916
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaact 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11181862 tagtggattggagggttgctctctccccctagagtaggtcatattagaccgaact 11181916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 255
Target Start/End: Original strand, 33030970 - 33031024
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 255  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  33030970 tagtgaattggagagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccgaactg 33031024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15044750 - 15044678
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15044750 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 15044678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30631470 - 30631398
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  30631470 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgagtcaacaatcttcttggtgtt 30631398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattg-agtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27449878 - 27449819
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| | |||||||||||||||    
T  27449878 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgg-ctgaactgggtcaacaa 27449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 31401871 - 31401930
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31401871 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35387730 - 35387667
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||| |||||||||||    
T  35387730 atagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaattgggtcaacaa 35387667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 176)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44600101 - 44599812
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600101 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 44600002  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44600001 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 44599902  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44599901 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttcttt 44599812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22780636 - 22780336
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22780636 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgga 22780537  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22780536 gtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 22780437  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22780436 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 22780337  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  22780336 c 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22783001 - 22782701
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22783001 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgga 22782902  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22782901 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 22782802  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22782801 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 22782702  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  22782701 c 22782701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18709424 - 18709127
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18709424 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttg-agt 18709326  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18709325 ctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 18709226  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18709225 gtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 18709127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16934406 - 16934125
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16934207  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934206 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 16934125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16932052 - 16931771
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16931853  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931852 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 16931771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 18847225 - 18847521
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18847225 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagt 18847324  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847325 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 18847424  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  18847425 gtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tgttctttgtgttcttctc 18847521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9176737 - 9176438
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9176538  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  9176537 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattc-tcttctttgtgttcttct 9176439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11008827 - 11008532
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008827 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 11008728  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11008727 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatata 11008630  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11008629 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 11008532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9174409 - 9174110
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9174210  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9174209 tagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 9174111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8631680 - 8631383
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8631680 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 8631582  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8631581 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 8631482  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8631481 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 8631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11006498 - 11006219
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006498 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 11006399  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11006398 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatata 11006299  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11006298 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttcttct 11006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2485133 - 2484837
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2485133 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 2485035  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2485034 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 2484935  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2484934 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 2484837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22046946 - 22046650
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22046946 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 22046848  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22046847 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 22046748  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22046747 gtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 22046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22132651 - 22132355
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22132651 gcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 22132554  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132553 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 22132454  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttt-gtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  22132453 gtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttcttc-tcttctttgtgttcttctc 22132355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22044651 - 22044355
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22044651 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattg-agt 22044553  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22044552 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 22044453  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22044452 gtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 22044355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 38409277 - 38409573
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38409277 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 38409375  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38409376 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 38409475  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  38409476 gtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttc-tcttctttttgttcttctc 38409573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 51015318 - 51015614
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51015318 gcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 51015416  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51015417 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 51015516  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51015517 gtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 9148325 - 9148603
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9148325 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 9148423  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148424 ctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 9148523  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9148524 gtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 9148603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11435027 - 11435323
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11435027 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 11435125  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11435126 ctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 11435225  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11435226 gtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttccttgtgttcttctc 11435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22134876 - 22134582
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22134876 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 22134779  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134778 ctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 22134679  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  22134678 gtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttcttc-tcttctttgtgttcttctc 22134582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37089632 - 37089336
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37089632 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 37089534  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37089533 ctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 37089434  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37089433 gtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 37089336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085947
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 26086138  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtt 26085947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31849860 - 31849563
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31849860 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 31849762  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31849761 tctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 31849662  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31849661 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 31849563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 7941393 - 7941692
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7941393 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 7941491  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7941492 gtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 7941591  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7941592 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt-ttcttctttgtgttcttc 7941690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 40637146 - 40637422
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40637146 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagt 40637244  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40637245 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 40637344  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40637345 agtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40637422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 24348290 - 24348569
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24348290 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 24348388  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24348389 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 24348488  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24348489 agtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 24348569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 14633391 - 14633687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14633391 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 14633489  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  14633490 ctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatat 14633588  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14633589 agtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 5198492 - 5198771
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5198492 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattg-agt 5198590  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5198591 cttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 5198690  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5198691 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttct 5198771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 6764911 - 6765213
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6764911 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggatt 6765010  T
Q  98 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcat 196  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6765011 g-agtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 6765109  T
Q  197 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6765110 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttggtgttc 6765208  T
Q  297 atctc 301  Q
     ||||    
T  6765209 ttctc 6765213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Original strand, 47868473 - 47868772
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  47868473 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 47868571  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47868572 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 47868671  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  47868672 agtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattc-tcttctttgtgttcttctc 47868770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 24888868 - 24889142
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24888868 gcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 24888966  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24888967 ctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatat 24889066  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24889067 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 48486391 - 48486665
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48486391 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 48486489  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48486490 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatat 48486589  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48486590 agtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 24880523 - 24880788
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24880523 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 24880621  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  24880622 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcata 24880721  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24880722 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24880788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 24879062 - 24879326
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24879062 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 24879160  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  24879161 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatat 24879260  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24879261 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24879326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22801122 - 22800847
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22801122 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 22801024  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22801023 tcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 22800924  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22800923 gtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22800847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38928439 - 38928162
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38928439 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 38928341  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38928340 tctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 38928241  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38928240 tagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38928162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22802995 - 22802719
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22802995 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 22802897  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22802896 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatat 22802797  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22802796 agtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17662476 - 17662230
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 132  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17662476 ttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagactgggacttt 17662378  T
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17662377 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 17662278  T
Q  232 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17662277 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36921755 - 36921478
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36921755 gcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 36921657  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  36921656 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 36921557  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36921556 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12396106 - 12395830
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12396106 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 12396008  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12396007 ctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 12395908  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12395907 agtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40091675 - 40091400
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40091675 caacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtc 40091577  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  40091576 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatata 40091477  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40091476 gtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40091400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36919846 - 36919569
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36919846 gcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 36919748  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  36919747 tctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcata 36919648  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36919647 tagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12401068 - 12400792
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12401068 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agt 12400970  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12400969 ctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 12400870  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12400869 agtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 47274799 - 47275076
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47274799 gcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattg-agt 47274896  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  47274897 ctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 47274996  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  47274997 agtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 47275076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33415746 - 33415473
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  33415746 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcg-agtct 33415649  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  33415648 cttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 33415549  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    || |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33415548 tgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 33415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 36378364 - 36378641
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  36378364 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagt 36378462  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  36378463 ctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcatta 36378562  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36378563 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttct 36378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 19095955 - 19096231
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19095955 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattg-agt 19096053  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19096054 ctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatat 19096153  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19096154 agtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14787692 - 14787426
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14787692 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 14787594  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14787593 ctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 14787494  T
Q  202 agtggattggagggctg--ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  14787493 agtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 14787426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3824833 - 3824627
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3824833 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 3824735  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3824734 gtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 3824635  T
Q  200 atagtgga 207  Q
    ||||||||    
T  3824634 atagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 16453381 - 16453658
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453381 gcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 16453479  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  16453480 ctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 16453579  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |   || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||    
T  16453580 tagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttct 16453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47211001 - 47210756
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||    
T  47211001 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattg-agt 47210915  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47210914 ctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 47210815  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  47210814 agtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5637726 - 5637524
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5637726 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 5637628  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5637627 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 5637528  T
Q  202 agtg 205  Q
    ||||    
T  5637527 agtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 619707 - 619433
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |     
T  619707 caacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gactg 619609  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  619608 tcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 619509  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||| | ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  619508 gtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 619433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 19322769 - 19323031
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19322769 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 19322864  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  19322865 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 19322964  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  19322965 agtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaatt 19323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380698
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatct 36380523  T
Q  107 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagt 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 36380698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37313327 - 37313062
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  37313327 gcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agt 37313229  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  37313228 ctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcatta 37313129  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  37313128 tagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaatt 37313062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 56030517 - 56030770
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  56030517 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtt 56030615  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || ||||||||     
T  56030616 tcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata- 56030713  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 260  Q
      || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56030714 --tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 13544032 - 13544268
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13544032 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 13544129  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  13544130 ctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 13544229  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    |||| |  ||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  13544230 agtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455578
Alignment:
Q  44 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 16455452  T
Q  144 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  16455453 ggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaa 16455552  T
Q  242 attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  16455553 tttggaccgaactgggtcaacaaatt 16455578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 41997566 - 41997830
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41997566 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtct 41997664  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat-ata 202  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  41997665 cttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcata 41997764  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  41997765 gtgaaacggagggccgctctct-ccccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatttc 41997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 53405202 - 53405497
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  53405202 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattg-agt 53405299  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactca 195  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  53405300 ctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactca 53405399  T
Q  196 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    ||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  53405400 tcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgtt 53405496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635440
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  226 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5635440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 301
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437731
Alignment:
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  226 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttccttgtgttcttctc 11437731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18537724 - 18537469
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18537724 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 18537629  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||      
T  18537628 acgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 18537529  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||||||    
T  18537528 ggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattt 18537469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 279
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547502
Alignment:
Q  79 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  179 c-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  278 ct 279  Q
    ||    
T  13547501 ct 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534826
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtc 18534987  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||| | |||||||||      
T  18534986 acgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaac 18534887  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18534886 ggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttc 18534826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890219
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggat 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  209 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttc 38890219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18409608 - 18409342
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  18409608 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggatt-gagt 18409510  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||    
T  18409509 ctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcatta 18409411  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||| |   ||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18409410 tagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatttc 18409342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtgga 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  208 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 279
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  73 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattg 2891531  T
Q  173 atttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 270  Q
    || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   || | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||  |    
T  2891532 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  271 ttgtgttct 279  Q
    |||||||||    
T  2891632 ttgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499390
Alignment:
Q  14 actagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  114 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattgga 212  Q
    |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| | ||||||||| |||| || |  | |    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  213 gggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8756510 - 8756246
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8756510 caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtc 8756415  T
Q  104 tctt-ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| |||| ||    
T  8756414 tctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcatta 8756315  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  8756314 tagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattt 8756246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 6132944 - 6133090
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6132944 gcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggatt-gagt 6133042  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6133043 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 52942707 - 52942542
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52942707 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 52942609  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942608 ctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3937470 - 3937314
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  3937470 gcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-ggaattgagt 3937372  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937371 ctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102427
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 12102319  T
Q  165 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  12102320 acccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaa 12102419  T
Q  262 caaatttc 269  Q
    ||||||||    
T  12102420 caaatttc 12102427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454022
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||     
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaa 28453916  T
Q  167 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    |  ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28453917 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaaca 28454016  T
Q  264 aatttc 269  Q
    ||||||    
T  28454017 aatttc 28454022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185829
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  16186018 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatct 16185920  T
Q  181 ttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttc 16185829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9864051
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattg-agtcttttggt 9863884  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca----tatagtg 205  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||    |||||||    
T  9863885 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtg 9863984  T
Q  206 gattggagggctgctctct--cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9863985 gaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 9864051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032557
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 164  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattg-agtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgta 15032650  T
Q  165 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaact 254  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15032649 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136898
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  119 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 216  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |   || |||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||| | | |||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 279
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357991
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta----gaattaggcggga-gacttattctt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    |||||| |   || |||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattctt 25357870  T
Q  162 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25357871 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggt 25357970  T
Q  259 caacaaatttctttgtgttct 279  Q
     ||||||||| | ||||||||    
T  25357971 aaacaaatttttgtgtgttct 25357991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 10112952 - 10113198
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10112952 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttggt 10113045  T
Q  111 tacggg-aagagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  10113046 cacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtgg 10113145  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10113146 aatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  133 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 231  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||   |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  232 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983522
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  165 acccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 261  Q
    |||| ||||| || | |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||| |||| |||||||| ||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaa 31983530  T
Q  262 caaatttc 269  Q
    ||||||||    
T  31983529 caaatttc 31983522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  70 attcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaac 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||    
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaac 3982276  T
Q  167 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaac 253  Q
     | ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  3982275 actttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38270247 - 38270158
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270247 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24446835 - 24446756
Alignment:
Q  13 aactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446835 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150977
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  166 cccattgatttctcttt 182  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  47150993 ccctttgatatctcttt 47150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853737
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  11853549 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 11853643  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 11853737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022605
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |    
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatttctctttgtaacggtactcatca- 198  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  9022475 -tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctttgtaaagttactcatcat 9022573  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctccccca 230  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  9022574 tatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999071
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtc 40999113  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40999112 tcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578666
Alignment:
Q  150 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attgga 247  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  248 ccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatttc 3578666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 5101070 - 5101133
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101070 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 279
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563109
Alignment:
Q  180 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570296
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  4570094 aaacactattaggatcg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 4570188  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| || ||||||||   ||||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaaatt--cttgtgt 4570285  T
Q  277 tcttcttcttc 287  Q
    |||||||||||    
T  4570286 tcttcttcttc 4570296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529452
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  8529270 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 8529364  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 8529452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587151
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || ||||  ||||||| || ||   || ||||||||    
T  18586969 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttg 18587063  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18587064 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 18587151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  31300427 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 31300521  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336757
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || |||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  181 ttgt-aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| || |  | |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||| | ||||||| ||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgtt 5336767  T
Q  278 cttcttcttc 287  Q
    || |||||||    
T  5336766 ctccttcttc 5336757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 268
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557923
Alignment:
Q  170 ttgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  26557923 t 26557923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54867251 - 54867188
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54867251 atagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  7050439 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 7050345  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14789484 - 14789425
Alignment:
Q  210 ggagggctgctc--tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14789484 ggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14789425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333813
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 24333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556057
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4556238 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4556144  T
Q  184 taacggtactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||     |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||    
T  4556143 taaaga-actcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt 4556057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831338
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  15831144 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttg 15831238  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  15831239 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatatc-ttgtgttct 15831337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489533
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 16489446  T
Q  184 taacggtactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||    ||||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  16489447 taaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822452
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  55822265 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 55822359  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 55822452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558495
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4558314 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4558408  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4558409 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4558495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317142
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  15316961 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 15317055  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 15317142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688937
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  16689119 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 16689025  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16688937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 255
Target Start/End: Original strand, 39774335 - 39774389
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 255  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39774335 tagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaactg 39774389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Original strand, 1983330 - 1983387
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  1983330 tagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactgggt 1983387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 2891389 - 2891434
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaaca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2891389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885059
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4885059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3777617 - 3777553
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3777617 atagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 3777553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 3796548 - 3796612
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3796548 atagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5147741 - 5147681
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5147741 tggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133185
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 6133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  152 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 227  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468621
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 10114601 - 10114656
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  10114601 gctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttc 10114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Original strand, 22295413 - 22295504
Alignment:
Q  180 tttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22295413 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttc 22295504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 195
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 163  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattg-agtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 54906820  T
Q  164 aacccattgatttctctttgtaacggtactca 195  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  54906821 aactctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769682
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 36769682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  117 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942473
Alignment:
Q  225 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 52942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937259
Alignment:
Q  222 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5112304 - 5112247
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  5112304 tagtggattggagagctgctctcacccccaaagtagatcatattggaccgaactgggt 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114520
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 125  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24742004 - 24741932
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  24742004 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 24741932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29760705 - 29760633
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  29760705 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 29760633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3814088 - 3814029
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3814088 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3814029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5732729 - 5732670
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  5732729 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 9224428 - 9224487
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9224428 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18855791 - 18855732
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18855791 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18855732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51520521 - 51520462
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  51520521 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-cagaactgggtcaacaa 51520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312501
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||   || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  15312319 cactattaggattg-agtcgcttggtcacgggaagatgctgtgactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 15312413  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15312414 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 15312501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Original strand, 49088865 - 49088907
Alignment:
Q  225 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  49088865 cccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 49088907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18377426 - 18377369
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | || |||||||||    
T  18377426 tagtggaatggagggctgctctctcctccagagtaggtcatatagaactgaactgggt 18377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 9229215 - 9229274
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  9229215 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 9229274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24446675 - 24446639
Alignment:
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24446675 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24446639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27417009 - 27416965
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27417009 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattg-agtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 45347838 - 45347897
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  45347838 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45347897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 45357317 - 45357376
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  45357317 tggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45357376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 157)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7351913 - 7351615
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351913 gcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 7351814  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7351813 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 7351714  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7351713 gtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 7351615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31156172 - 31155893
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156172 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31156073  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156072 ctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155972 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 31155893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7349534 - 7349240
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349534 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 7349435  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7349434 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 7349335  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7349334 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgcgttcttctc 7349240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1047187 - 1046888
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1047187 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 1047089  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1047088 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 1046989  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| |||    
T  1046988 tagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttct 1046889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40837003 - 40836707
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40837003 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 40836905  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40836904 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 40836805  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  40836804 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 40836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1049556 - 1049264
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1049556 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-agt 1049458  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1049457 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 1049358  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  1049357 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttc 1049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 38394014 - 38394311
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38394014 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 38394112  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38394113 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 38394212  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38394213 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 38394311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7472243 - 7471942
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7472243 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 7472145  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7472144 gtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 7472045  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatc 299  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  7472044 atagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttc 7471946  T
Q  300 tcac 303  Q
    ||||    
T  7471945 tcac 7471942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7470283 - 7469984
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7470283 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagt 7470185  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7470184 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 7470085  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  7470084 agtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctc 7469986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 48457681 - 48457978
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48457681 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggatt-gagt 48457779  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48457780 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 48457879  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48457880 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 48457978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 3035749 - 3036049
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3035749 gcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 3035847  T
Q  103 ctcttggttacgggaaga---gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatca 198  Q
    ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  3035848 ctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatca 3035947  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |    
T  3035948 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcctc-tcttctttgtgttctt 3036046  T
Q  299 ctc 301  Q
    |||    
T  3036047 ctc 3036049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 20297390 - 20297687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20297390 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 20297488  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20297489 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 20297588  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20297589 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcctctttgtgttcttctc 20297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Original strand, 20299488 - 20299785
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20299488 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 20299586  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20299587 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 20299686  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  20299687 agtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctc 20299785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 1850009 - 1850301
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1850009 gcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 1850107  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1850108 ttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 1850207  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850208 agtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 1850301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Original strand, 3878606 - 3878902
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3878606 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtc 3878704  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3878705 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 3878804  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3878805 gtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 3878902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 25542560 - 25542855
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  25542560 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattg-agtct 25542657  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagt 204  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542658 cttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagt 25542757  T
Q  205 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  25542758 ggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttc-tcttctttgtgttcttctcac 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 44724607 - 44724883
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44724607 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 44724705  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44724706 ctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 44724805  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44724806 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 40946356 - 40946653
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  40946356 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattg-agt 40946454  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40946455 ctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 40946554  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40946555 agtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttcttctc 40946653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 20626066 - 20626342
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20626066 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 20626164  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20626165 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 20626264  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20626265 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 20629957 - 20630233
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20629957 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 20630055  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20630056 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 20630155  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20630156 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 20642376 - 20642652
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20642376 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 20642474  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20642475 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 20642574  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20642575 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 18345569 - 18345866
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18345569 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 18345667  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18345668 ctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 18345767  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18345768 agtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18345866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Original strand, 35658 - 35954
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35658 caacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtc 35756  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35757 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 35856  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35857 gtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 35954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 28487583 - 28487873
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28487583 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattg-agtct 28487681  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28487682 cttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 28487781  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28487782 tgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttc 28487873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935583
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 2935573  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  2935574 cttcttcttt 2935583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 44592 - 44889
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  44592 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgatt-gagt 44690  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44691 cttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 44790  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44791 agtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 44889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13099737 - 13099459
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13099737 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagt 13099639  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |    
T  13099638 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcatt 13099539  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13099538 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 443623 - 443900
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  443623 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 443721  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  443722 ctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatat 443821  T
Q  202 agtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  443822 agtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137404
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22137382  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  22137383 cttcttcttt-tgttcttctcac 22137404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552431
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40552409  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  40552410 cttcttcttt-tgttcttctcac 40552431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43253776 - 43253481
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253776 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 43253679  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||| |||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43253678 tcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 43253579  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43253578 gtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 43253481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606694
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 1606684  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  1606685 cttcttcttt 1606694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20137370 - 20137094
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20137370 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agt 20137272  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  20137271 ctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 20137172  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20137171 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20137094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108393
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22108371  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  22108372 cttcttcttt-tgttcttctcac 22108393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 28485594 - 28485885
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28485594 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagt 28485692  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28485693 ctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 28485792  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    | || ||  ||||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28485793 aatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattc-tcttctttgtgttc 28485885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550153
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40550131  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  40550132 cttcttcttt-tgttcttctcac 40550153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4296195 - 4295919
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4296195 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 4296097  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4296096 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 4295997  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4295996 agtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttct 4295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092177
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  145 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  244 tggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 7092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27306490 - 27306227
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27306490 gcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 27306393  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27306392 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 27306293  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  27306292 agtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42331259 - 42330982
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42331259 caacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 42331161  T
Q  104 tcttggtt--acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||    
T  42331160 tcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattata 42331061  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42331060 tagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027175
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttctt 9027178  T
Q  281 ctt 283  Q
    |||    
T  9027177 ctt 9027175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 9680847 - 9681124
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9680847 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-ag 9680945  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| | |||||||||||    
T  9680946 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcata 9681045  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  9681046 tagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31435308 - 31435031
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435308 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 31435210  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  31435209 ctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 31435110  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31435109 tagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31435031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21592404 - 21592128
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||    
T  21592404 gcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatt-tagt 21592306  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21592305 ctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 21592206  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21592205 agtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21592128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 21990179 - 21990454
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  21990179 caacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaatt-gagtc 21990277  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21990278 tcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 21990377  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21990378 gtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 11355286 - 11355550
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11355286 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 11355384  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||||||||||    
T  11355385 ctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatat 11355484  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11355485 agtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11355550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 24748623 - 24748899
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24748623 caacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattg-agtc 24748721  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  24748722 tcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 24748821  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  24748822 agtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396959
Alignment:
Q  53 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  153 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  253 ctgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 38396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094424
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  145 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  244 tggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 7094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37412389 - 37412110
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37412389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 37412291  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca- 198  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  37412290 tctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcat 37412191  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  37412190 tatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Original strand, 9679088 - 9679361
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9679088 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 9679185  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9679186 ctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 9679285  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |  ||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9679286 agtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11757258 - 11757463
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11757258 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 11757356  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11757357 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 11757456  T
Q  202 agtggat 208  Q
    |||||||    
T  11757457 agtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 42223185 - 42223450
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42223185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-ag 42223283  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42223284 tctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 42223383  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  42223384 tagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaatt 42223450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Original strand, 21680055 - 21680307
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21680055 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagt 21680153  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  21680154 ctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 21680253  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 255  Q
    |||| |   ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21680254 agtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27832894 - 27832656
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27832894 gcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 27832796  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt-tgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  27832795 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcatta 27832696  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27832695 tagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 21678094 - 21678358
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21678094 gcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 21678192  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||| |||||||    
T  21678193 ctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatat 21678292  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |   | |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21678293 agtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaatt 21678358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39146247 - 39145971
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  39146247 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtc 39146149  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  39146148 tcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 39146049  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  || |||||||||| | ||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39146048 agtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 25276169 - 25276374
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25276169 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagt 25276267  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  25276268 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 25276367  T
Q  201 tagtgga 207  Q
    |||||||    
T  25276368 tagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813493
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattt 24813493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 24258491 - 24258744
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24258491 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 24258589  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca--- 198  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||       
T  24258590 ctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 24258689  T
Q  199 -tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 252  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||    
T  24258690 ttatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24817610 - 24817362
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  24817610 caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtc 24817516  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  24817515 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattat 24817416  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaact 254  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24817415 agtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 26804597 - 26804765
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactag---ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26804597 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattt- 26804695  T
Q  100 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804696 agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091580
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa-tctcttg 20091702  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtgga 207  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  20091701 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgga 20091604  T
Q  208 ttggagggctgctctctcccccag 231  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  20091603 acggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22828894 - 22828716
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||    
T  22828894 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattg-agt 22828796  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828795 ctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22251803 - 22251641
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||| |||    
T  22251803 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattg-agt 22251713  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251712 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 7188571 - 7188834
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7188571 caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtc 7188666  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| | || |||||| |||    
T  7188667 tcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattat 7188766  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7188767 agtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaattt 7188834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465831
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtc 24465672  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| | || |||||||  |||||||||| |||| || |      
T  24465673 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaa-agtactcatcattataatgaaac 24465771  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| || ||||||||||    
T  24465772 gggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatttc 24465831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  130 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  228 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332516
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaa 6332409  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| || || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6332410 ccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 6332509  T
Q  263 aaatttc 269  Q
    |||||||    
T  6332510 aaatttc 6332516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 18567641 - 18567731
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567641 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297006
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||| | ||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaa 16297124  T
Q  166 ccc-attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 261  Q
    |||  || || |||| |||| || | ||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  16297123 cccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaa 16297024  T
Q  262 caaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  16297023 caaatttccgtgtgttct 16297006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295740
Alignment:
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |   || | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaatt 26295740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081804
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtc 11081633  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt-tgtaacggtactcatc-a 198  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| |||||| ||||| | ||||||||      
T  11081634 tcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctt 11081733  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    || | ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11081734 taaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattt 11081804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 252
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  124 tgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  222 tctcccccagactaggtcag-attggaccgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351536
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25351353 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25351447  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25351536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 289
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121104
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 162  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 2120978  T
Q  163 taacccattgatttctctttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggt 258  Q
    |||| ||   || ||||||||||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  2120979 taactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggt 2121075  T
Q  259 caacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
     ||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  2121076 aaacaaatt--cttgtgttcatcttcttctt 2121104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392608
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtc 22392596  T
Q  112 acgggaagagat 123  Q
    ||||||||||||    
T  22392597 acgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348988
Alignment:
Q  106 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttt 6348988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405589
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  25405393 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 25405487  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 25405586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320044
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  3320232 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 3320138  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 3320044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324792
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  3324980 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 3324886  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 3324792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357230
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25357047 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25357141  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25357230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759452
Alignment:
Q  212 agggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctc 11759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410315
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25410130 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25410224  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25410315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069976
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  7069780 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 7069874  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatat-tttgtgtt 7069973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281378
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc 168  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  169 attgatttctctttgtaacggtactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 266  Q
     ||||      ||||||| | ||||||||  | | |||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  40281473 tttga------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaat 40281380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049166
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggatt-gaat 6048996  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatc---a 198  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| | ||||||||   |    
T  6048997 ctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttgtaaagttactcatcatta 6049096  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||||  |||| | ||||||  |||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||  |||||||    
T  6049097 tatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaatt 6049166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13290672 - 13290468
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 165  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||   || || | ||||||||||    
T  13290672 tgattcaccttcgagaaacactattagaattt-agtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaa 13290574  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||   ||| ||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13290573 ccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 13290474  T
Q  264 aatttc 269  Q
    ||||||    
T  13290473 aatttc 13290468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074983
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  7074787 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 7074881  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 7074980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6067365 - 6067195
Alignment:
Q  100 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt-aacggtactcatc 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||| || || |||| ||    
T  6067365 agtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtc 6067267  T
Q  198 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | ||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6067266 attatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaatt 6067195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378489
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  8378686 aaacactattaagattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 8378592  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8378591 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgt 8378493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540976
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  15541177 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 15541083  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15541082 ttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 15540984  T
Q  278 cttcttct 285  Q
    ||| ||||    
T  15540983 ctttttct 15540976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369831
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || |||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctct 21369736  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21369737 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaattttctt 21369831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546857
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttcttcttcttctt 34546857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464496
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttcttcttcttctt 7464496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattg-agtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247155
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  30246973 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttg 30247067  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30247068 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatt 30247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21639877 - 21639813
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21639877 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006848
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||||    
T  42006663 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctct 42006757  T
Q  181 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||    
T  42006758 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatt 42006848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512503
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  44512704 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 44512610  T
Q  184 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||| |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||| |    
T  44512609 taaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttat 44512513  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  44512512 tcttcttctt 44512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47263744 - 47263682
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47263744 atagtggattggagagctgctctc--ccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 49091729 - 49091665
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49091729 atagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817362
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 5817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 23403043 - 23403106
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23403043 tagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaa 23403106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44010816 - 44010729
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  44010816 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt--attgtgttctccttcttc 44010729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2058029 - 2057957
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2058029 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 2057957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 2075247 - 2075300
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2075247 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 2075300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 124  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2479404 - 2479341
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2479404 atagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 2479341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4866794 - 4866735
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4866794 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4866735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880078
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16880137 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16884993 - 16884934
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16884993 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18408827 - 18408768
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18408827 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19992377 - 19992318
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19992377 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 19992318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 24024347 - 24024406
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24024347 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24024406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 24261344 - 24261403
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24261344 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24261403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 24266223 - 24266282
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24266223 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 279
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804814
Alignment:
Q  227 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26804814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21988955 - 21988912
Alignment:
Q  221 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21988955 ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21988912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44016711 - 44016640
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  44016711 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 44016640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 1533477 - 1533536
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1533477 tggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2990676 - 2990612
Alignment:
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  2990676 tgctccctcccccagagtaggtcggtattggaccgaactgggtaaacaaacttgcttgtgttctt 2990612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12396975 - 12396916
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12396975 tggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 12396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18413707 - 18413645
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18413707 atagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18413645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 20357580 - 20357639
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  20357580 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 20357639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21646074 - 21646011
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21646074 atagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21646011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 21812259 - 21812318
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21812259 tggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 21812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 31109604 - 31109663
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31109604 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 31109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864412
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 123)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12195778 - 12195478
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195778 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 12195679  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12195678 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 12195579  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12195578 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 12195479  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  12195478 c 12195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20915617 - 20915321
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915617 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 20915518  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915517 ctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 20915418  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20915417 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctctgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 20915321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19704830 - 19704531
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704830 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 19704731  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt--ctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19704730 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcata 19704631  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19704630 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 19704532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26932825 - 26932539
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26932825 aagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 26932726  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26932725 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 26932626  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc-tttgtgttcttcttctt 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26932625 tagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttctt 26932539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4816492 - 4816195
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4816492 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 4816394  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816393 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatat 4816294  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4816293 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 4816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14507436 - 14507140
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 14507338  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14507337 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatata 14507238  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14507237 gtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14507140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2629146 - 2628850
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2629146 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 2629048  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629047 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 2628948  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2628947 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 2628850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28241582 - 28241290
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28241582 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 28241484  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28241483 ctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 28241384  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28241383 agtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 28241290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273190
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  149 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggac 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  249 cgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatttctcagtgttcttcttcttcttt 5273190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11983290 - 11983014
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11983290 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 11983192  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11983191 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 11983092  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11983091 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11983014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14459026 - 14458731
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14459026 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattg-agt 14458930  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14458929 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 14458830  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14458829 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14458731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Original strand, 30967255 - 30967551
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30967255 caacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 30967353  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30967354 tcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 30967453  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967454 gtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 30967551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1230510 - 1230213
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1230510 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gact 1230412  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1230411 ctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 1230312  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1230311 agtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcattgtgttcttctc 1230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30034864 - 30034567
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30034864 gcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 30034766  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30034765 caattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 30034666  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  30034665 agcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatt-atcttctttgtgttcttctc 30034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309196
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33309186  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  33309187 cttcttcttt 33309196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 26065039 - 26065310
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26065039 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 26065134  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  26065135 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatata 26065234  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26065235 gtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 26085008 - 26085279
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26085008 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 26085103  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  26085104 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatata 26085203  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26085204 gtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 9019979 - 9020255
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9019979 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 9020077  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9020078 ctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 9020177  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9020178 agtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311465
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33311455  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  33311456 cttcttcttt 33311465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 13057247 - 13057524
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13057247 gcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagt 13057345  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  13057346 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 13057445  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13057446 tagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754683
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 29754693  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  29754692 cttcttcttt 29754683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 81 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066099
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26066108  T
Q  281 cttcttctt 289  Q
    |||||||||    
T  26066107 cttcttctt 26066099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3630125 - 3629850
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3630125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaat 3630027  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||    
T  3630026 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatat 3629927  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3629926 agtgaaactgagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3629850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068369
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26068379  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  26068378 cttcttcttt 26068369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 3390432 - 3390697
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390432 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 3390530  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  3390531 ctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 3390630  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
     |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  3390631 cagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaatt 3390697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 13039807 - 13040084
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  13039807 gcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagt 13039905  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  13039906 ctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 13040005  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13040006 tagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 32280049 - 32280314
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32280049 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 32280147  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||    
T  32280148 ctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgtta 32280247  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  32280248 tagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaatt 32280314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3632199 - 3631926
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3632199 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagt 3632101  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  3632100 ctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 3632001  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    ||||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3632000 tagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15530383 - 15530166
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15530383 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 15530285  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15530284 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 15530186  T
Q  202 agtggattggagggctgctc 221  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  15530185 agtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 25477327 - 25477599
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477327 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 25477425  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa-------cggtactc 194  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       || |||||    
T  25477426 ctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactc 25477525  T
Q  195 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| ||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  25477526 atcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaatt 25477599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15541401 - 15541125
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15541401 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagt 15541303  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||    
T  15541302 ctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatat 15541203  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |   ||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15541202 agtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30729088 - 30728811
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30729088 caacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactc 30728990  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcatca 198  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||| ||||||| | |||||||      
T  30728989 tcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatat 30728890  T
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  30728889 tatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3233991 - 3233710
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3233991 caacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 3233893  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||| | |||    
T  3233892 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtat 3233793  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc-----gaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||     ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3233792 agtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15532940 - 15532679
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15532940 aacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtct 15532842  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 203  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  15532841 cttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 15532742  T
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    || |  ||||||||||||| | ||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||    
T  15532741 tgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaatt 15532679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12161816 - 12161543
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  12161816 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcg-agt 12161720  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12161719 ctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatat 12161620  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||  | |||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  12161619 agtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttct 12161543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3028106 - 3027846
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3028106 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 3028011  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
    || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3028010 gtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 3027911  T
Q  207 attggagggctgctctct-cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||    
T  3027910 aacggagggctgctctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttc 3027846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16455676 - 16455419
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  16455676 aaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggatta-agtctcttgct 16455581  T
Q  111 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggat 208  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||     
T  16455580 cacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaa 16455481  T
Q  209 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16455480 cggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttc 16455419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19227669 - 19227514
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19227669 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 19227571  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 159  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227570 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069715
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1069815  T
Q  170 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  1069814 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719963
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtc 15719802  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |      
T  15719803 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaac 15719902  T
Q  210 ggagggctgctctct-cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
     ||| | |||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15719903 agagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatttc 15719963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 22490693 - 22490871
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22490693 gcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattg-agt 22490791  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22490792 ctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24338709 - 24338435
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24338709 gcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattg-ag 24338611  T
Q  102 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    ||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  24338610 tcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatt 24338511  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  24338510 atagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgtt 24338435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 268
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367350
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||     
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaa 15367224  T
Q  145 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcaga 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||      
T  15367225 tcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaat 15367324  T
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  15367325 ttggaccgaactgggtaaacaaattt 15367350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgta 12186173  T
Q  165 acccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 262  Q
    || ||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  12186172 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaac 12186073  T
Q  263 aaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12186072 aaattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466641
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 125  Q
    ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattg 14466497  T
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 223  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  ||| | ||||| |     
T  14466498 ggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtt 14466597  T
Q  224 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  14466598 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaatt 14466641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 269
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945465
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgt 26945356  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtca 260  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||| |    
T  26945357 aactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaa 26945456  T
Q  261 acaaatttc 269  Q
    |||||||||    
T  26945457 acaaatttc 26945465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857947
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| |||||   || |||| ||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaa 22858054  T
Q  166 cccatt-gatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| || ||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  22858053 cccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 22857954  T
Q  263 aaatttc 269  Q
    |||||||    
T  22857953 aaatttc 22857947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012360
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtc 17012200  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-atatagtggatt 209  Q
    ||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||||| |||      
T  17012201 acgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaac 17012299  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
      || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17012300 atagagatcatctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatttc 17012360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696761
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 19696654  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
     || ||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19696655 tcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 19696754  T
Q  263 aaatttc 269  Q
    |||||||    
T  19696755 aaatttc 19696761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 269
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346666
Alignment:
Q  126 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 224  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  225 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttc 15346666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465586
Alignment:
Q  146 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-at 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  244 tggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaattt 25465586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878923
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  13878727 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 13878821  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 13878920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786115
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  16785919 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 16786013  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 16786112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 20527020  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 225  Q
    ||  ||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  20527021 ccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaac 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaac 28037829  T
Q  167 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat-atagtgga---ttggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    || ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||     | | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  28037828 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaa 28037729  T
Q  261 acaaatt 267  Q
    |||||||    
T  28037728 acaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1072138 - 1072067
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 74  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072138 gcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883663
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||  ||||    |||||    
T  13883475 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcatta---tctct 13883569  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 13883663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Original strand, 10584235 - 10584325
Alignment:
Q  190 tactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10584235 tactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 10584325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911441
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||  || |||||| |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12911629 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattt 12911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078553
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||  |||||||||||   || |||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 25078658  T
Q  166 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 262  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| ||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25078657 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 25078559  T
Q  263 aaattt 268  Q
    ||||||    
T  25078558 aaattt 25078553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13870683 - 13870608
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870683 gcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 32447577 - 32447502
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447577 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattg-agtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937189
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12937376 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattt 12937189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887212
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  26887406 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 26887312  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  26887311 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 26887215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694849
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17695030 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17694936  T
Q  184 taacggtactc-atcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  |||  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17694849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941874
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttcttcttcttctt 25941874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201320
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  35201508 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 35201414  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    ||| || |  ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35201413 ttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 35201320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 164  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||   || |||| ||| |||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattg-agtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgta 7542483  T
Q  165 acccattgatttctctttgtaacggtactca 195  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  7542482 accctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 256
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445832
Alignment:
Q  127 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 223  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  224 tcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 256  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 5017498 - 5017562
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5017498 atagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262779
Alignment:
Q  90 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatttctctttgta 185  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||| ||||||||||    
T  11262596 ttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgta 11262693  T
Q  186 acggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    | |  ||||||||| ||| || |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11262694 aagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttc 11262779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165819
Alignment:
Q  90 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||||| |  || ||||||||||| |    
T  5165989 ttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc-tgaatatctctttgtaaag 5165893  T
Q  189 gtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggt 258  Q
      ||||  |||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  5165892 aaactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggt 5165819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 8995532 - 8995578
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8995532 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Original strand, 17852596 - 17852650
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  17852596 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346524
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 95  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342778
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  22342980 cactattaggattgc-gtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 22342886  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  22342885 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 22342788  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    || |||||||    
T  22342787 tcatcttctt 22342778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351830
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||   || ||||||||    
T  22352031 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctttg 22351937  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattaga-cgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 22351840  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  22351839 tcttcttctt 22351830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3577555 - 3577467
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3577555 tatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttcttcttcttctt 3577467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18232913 - 18232849
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  18232913 atagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaa 18232849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 277
Target Start/End: Original strand, 30443548 - 30443616
Alignment:
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  30443548 ggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgtt 30443616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 31086502 - 31086566
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31086502 atagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaa 31086566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248700
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  31248896 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 31248802  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||  |||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  31248801 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtcatcattataccgaacttggtaaacaaatatc-ttgtgtt 31248703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336022
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33336022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4630021 - 4629958
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  4630021 tagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaa 4629958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 21801374 - 21801429
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  21801374 tagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25465965 - 25465881
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttc 284  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  25465965 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--attgtgttcttcttc 25465881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Original strand, 17038350 - 17038431
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  17038350 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttctt 17038431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216012
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| || ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  33215830 cactattaggattg-agtctcttggtcacggcaagaggctgggactt-ggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 33215924  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33215925 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 33216012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 5674803 - 5674862
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  5674803 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5674862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6005481 - 6005422
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  6005481 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 6005422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 10584172 - 10584212
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctctt 41  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10584172 aagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 14742457 - 14742516
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14742457 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 14742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 22010718 - 22010777
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22010718 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 28155590 - 28155649
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28155590 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 33330466 - 33330525
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33330466 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33330525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870100
Alignment:
Q  170 ttgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 266  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22870196 ttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaat 22870100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24501524 - 24501425
Alignment:
Q  191 actcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttct 288  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| || |||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  24501524 actcatcattatagtggaatagagagctgctctcttcccctgaataggtcagtattataccgaactgggtaaacaacttcttttgtgtttttcttcttct 24501425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13467532 - 13467446
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  13467532 tatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 13467446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078189
Alignment:
Q  150 agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattgg 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||| |  || |    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  247 accgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatttc 28078189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28184567 - 28184510
Alignment:
Q  206 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28184567 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 277
Target Start/End: Original strand, 7294062 - 7294123
Alignment:
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||    
T  7294062 tgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaatttttgtgtgtt 7294123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11857038 - 11856966
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  11857038 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 11856966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6438565 - 6438506
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||||    
T  6438565 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggacaacaa 6438506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  89 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14521735 - 14521679
Alignment:
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14521735 attggagaggtgctctctcctcgagagtaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 14521679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 14737597 - 14737656
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  14737597 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggatcaacaa 14737656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16838808 - 16838749
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  16838808 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16838749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 6224 - 6513
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 6323  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6324 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaa 6423  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 6513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 66 - 347
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 165  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  166 gtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 265  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  266 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 140)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35215849 - 35215567
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215849 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35215750  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35215749 gtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 35215650  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35215649 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttctt 35215567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35218226 - 35217944
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218226 aagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35218127  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35218126 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcata 35218027  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35218026 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttctt 35217944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 27104793 - 27105088
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27104793 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 27104890  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27104891 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatata 27104990  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27104991 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27105088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23452498 - 23452201
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23452498 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagt 23452400  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23452399 ctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 23452300  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23452299 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 23452201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13910305 - 13910009
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13910305 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agt 13910207  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13910206 ctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 13910107  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13910106 gtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 13910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19502272 - 19501980
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502272 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 19502174  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19502173 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 19502074  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19502073 agtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 19501980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 42064509 - 42064789
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42064509 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 42064607  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42064608 ctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 42064707  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga-ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctt 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42064708 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt 42064789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19504606 - 19504316
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19504606 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 19504508  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19504507 ctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatat 19504409  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  19504408 agtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtt 19504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45280247 - 45279966
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  45280247 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattg-a 45280149  T
Q  101 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45280148 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 45280049  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45280048 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 45279966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 81 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332144
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttctt 45332165  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  45332164 cttcttctttgtgttcttctc 45332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24162473 - 24162193
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24162473 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agt 24162375  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24162374 ctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatata 24162285  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgtt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  24162284 gtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtt 24162193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561115
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36561125  T
Q  281 cttcttcttt 290  Q
    ||||||||||    
T  36561124 cttcttcttt 36561115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 42452777 - 42453053
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42452777 gcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 42452873  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42452874 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 42452973  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42452974 agtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 42453053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558846
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36558848  T
Q  281 ct 282  Q
    ||    
T  36558847 ct 36558846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 19007634 - 19007910
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19007634 gcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagt 19007732  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19007733 ttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 19007832  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19007833 agtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42923770 - 42923494
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42923770 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 42923672  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  42923671 ctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatat 42923572  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42923571 agtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42923494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21520954 - 21520678
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21520954 gcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagt 21520856  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21520855 ctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 21520756  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  21520755 agtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttct 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22287597 - 22287321
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  22287597 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattg-agt 22287499  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22287498 ctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 22287399  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22287398 agtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 28196631 - 28196905
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28196631 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 28196729  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  28196730 ctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatat 28196829  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28196830 agtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtca-att-gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28196905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40032319 - 40032050
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40032319 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 40032221  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcatc 197  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| || | ||||||||    
T  40032220 ctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatc 40032121  T
Q  198 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40032120 attatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40032050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11739820 - 11739544
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11739820 caacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattc 11739722  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || | ||||||||| |||    
T  11739721 tcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattat 11739622  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11739621 agtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11739544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6264396 - 6264133
Alignment:
Q  17 agggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  6264396 agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgat 6264298  T
Q  117 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagg 214  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||    
T  6264297 aaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagg 6264198  T
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6264197 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43623829 - 43623565
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43623829 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agt 43623743  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43623742 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 43623643  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43623642 agtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 43623565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6259076 - 6258802
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6259076 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 6258978  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||    
T  6258977 ctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatta 6258880  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6258879 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 17848438 - 17848710
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17848438 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattg-agt 17848536  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17848537 ctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 17848632  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17848633 agtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375331
Alignment:
Q  59 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 158  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttatt 5375453  T
Q  159 cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggg 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  258 tcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttct 5375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34979838 - 34979562
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34979838 aacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtct 34979740  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tata 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | | ||||||| ||||    
T  34979739 cttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattata 34979640  T
Q  203 gtggattggagggctgctct-ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||  | |||||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34979639 gtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45239232 - 45239001
Alignment:
Q  8 aacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45239232 aacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctt 45239135  T
Q  108 ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||     
T  45239134 ggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 45239035  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtca 240  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239034 aacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 14837268 - 14837538
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14837268 caacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 14837366  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||      |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  14837367 tcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 14837460  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14837461 agtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44289329 - 44289052
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44289329 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 44289231  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-a 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||||||| |    
T  44289230 cacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcatta 44289131  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |   || || |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44289130 tagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 279
Target Start/End: Original strand, 17849113 - 17849387
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  17849113 aacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattg-agtct 17849211  T
Q  105 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tata 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  17849212 cttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 17849311  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  || ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17849312 gtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 3022157 - 3022442
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3022157 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagt 3022255  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca---- 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||        
T  3022256 ctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattat 3022355  T
Q  199 ------tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
          |||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3022356 catcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15539735 - 15539566
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15539735 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattc 15539637  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539636 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11578365 - 11578102
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11578365 caacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtc 11578271  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  11578270 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 11578171  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  11578170 agtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttc 11578102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800298
Alignment:
Q  15 ctagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaca 18800465  T
Q  115 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattgga 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| ||||||| |  |||    
T  18800464 ggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacgga 18800365  T
Q  213 gggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18800364 gggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146602
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattg-agtc 20146771  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  20146770 tcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 20146671  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20146670 agtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttc 20146602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31733026 - 31732773
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  31733026 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattg-agt 31732928  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-ta 200  Q
    |||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  31732927 ctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 31732840  T
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    | ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31732839 ttgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaatt 31732773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897240
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 17897408  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| | | ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | ||||||||| |||    
T  17897407 tcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattat 17897308  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17897307 agtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttc 17897240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874389
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtc 22874231  T
Q  112 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 209  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |      
T  22874232 acgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaac 22874331  T
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  22874332 tgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaatt 22874389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459175
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  119 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 216  Q
    ||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  217 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    | ||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  28459236 ttctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407439
Alignment:
Q  123 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 221  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  222 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 269
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699636
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 260  Q
    || || ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  40699528 aatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaa 40699627  T
Q  261 acaaatttc 269  Q
    |||||||||    
T  40699628 acaaatttc 40699636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  136 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  235 aggtc-agattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 167
Target Start/End: Original strand, 38020196 - 38020349
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  38020196 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggatt-gagt 38020294  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 167  Q
    ||||||||           ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020295 ctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107566
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg-agtc 35107386  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  35107387 tcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatt 35107485  T
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||  ||| || || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||    
T  35107486 atagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22163208 - 22163117
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22163208 gcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22407670 - 22407591
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407670 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136208
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  119 gagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 182  Q
    || |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 27136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  146 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc--cagactaggtcaga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||  ||||||||||||      
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 151  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163007
Alignment:
Q  180 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589863
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  181 tt 182  Q
    ||    
T  20589862 tt 20589863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaa 43139530  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcat 199  Q
    ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43139531 ccttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736401
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2736205 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2736299  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 2736398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054742
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  20054947 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 20054853  T
Q  181 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 276  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgt 20054755  T
Q  277 tcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||||||    
T  20054754 tcttcttcttctt 20054742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943720
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17943540 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 17943634  T
Q  184 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 17943720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517616
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  27517818 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 27517724  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt--cttgtgttct 27517626  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  27517625 tcttcttctt 27517616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962936
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 165  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattg-agtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaa 37963039  T
Q  166 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
     |||||||||  | ||||||| | || |||||| ||||||| |   | || ||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  37963038 tccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaa 37962941  T
Q  265 atttc 269  Q
    |||||    
T  37962940 atttc 37962936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741137
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  2740941 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctct 2741035  T
Q  181 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatatc-ttgtgtt 2741134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462632
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| | ||    |||||    
T  17462436 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcctta---tctct 17462530  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 17462629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687179
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  39686983 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 39687077  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgtt 39687176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479199
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  30478997 cactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 30479091  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||| ||||    
T  30479092 taaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtattct 30479189  T
Q  280 tcttcttctt 289  Q
    ||||||||||    
T  30479190 tcttcttctt 30479199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871074
Alignment:
Q  145 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| |||||||  |    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  244 tggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| | |||| ||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaatt 23871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Original strand, 2838060 - 2838135
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2838060 tagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaac-aatttcttggtgtt 2838135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5377690 - 5377631
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377690 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345634
Alignment:
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 143
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679919
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttctt 45679919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 162  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 15694056  T
Q  163 taacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 199  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  15694057 taaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20050088 - 20049998
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 289  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20050088 tatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttcttcttcttctt 20049998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707345
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940302
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17010967
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629948
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398500
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 2869723 - 2869786
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2869723 tagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31056048
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680233
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || || | ||||||| ||| ||||    |||||    
T  39680045 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatta---tctct 39680139  T
Q  181 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 271  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatctt 39680233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781218
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || | || ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  12781400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctctttg 12781306  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  12781305 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 12781218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13828542 - 13828336
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-ggagtctctt--ggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgt 163  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  13828542 tgattcaccttaggaaacactgtta--attaggagtctcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgt 13828445  T
Q  164 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat-tggaccgaactgggtca 260  Q
    | ||| ||||| |||| |||||||   ||||||| | |||||||||   |   ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  13828444 agccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataa 13828345  T
Q  261 acaaatttc 269  Q
    |||||||||    
T  13828344 acaaatttc 13828336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670952
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatatc-ttgtgttctt 33670952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3491818 - 3491755
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3491818 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 269
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173591
Alignment:
Q  218 gctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 8173591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25403701 - 25403638
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  25403701 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgagtcaacaa 25403638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039762
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078562
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 263  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 23078562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 254
Target Start/End: Original strand, 27149322 - 27149377
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  27149322 tatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattggaccaaact 27149377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggatt-gagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34575186 - 34575132
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  34575186 gctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaattt 34575132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 11098960 - 11099032
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  11098960 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 11099032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14291552 - 14291480
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14291552 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 14291480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 163  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattg-agtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 30720713  T
Q  164 aacccattga 173  Q
    ||||| ||||    
T  30720712 aaccctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 36757795 - 36757855
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36757795 tggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 36757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40738910 - 40738848
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  40738910 atagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 40738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 44312645 - 44312704
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44312645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  221 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 269
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592339
Alignment:
Q  219 ctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttc 20592339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||| || |||||||||   || |||| |||||| |||||  ||||| | |||    
T  33603994 aaacactattataattg-agtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatct 33604092  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctccccca 230  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  33604093 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 38191144 - 38191215
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttc 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  38191144 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 38191215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Original strand, 9296434 - 9296506
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  9296434 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 9296506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25407690 - 25407653
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25407690 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15539550 - 15539514
Alignment:
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15539550 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19344485 - 19344426
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19344485 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19349343 - 19349284
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19349343 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19349284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 39812009 - 39812068
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  39812009 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggttcaacaa 39812068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41303199 - 41303155
Alignment:
Q  100 agtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41303199 agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 69552 - 69256
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  69552 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 69454  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  69453 ctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 69354  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  69353 gtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 69256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 73284 - 73207
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73284 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  43 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3203
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2907 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agt 3005  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3006 ctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 3105  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3106 gtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41744 - 41452
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41744 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 41646  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41645 ctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 41546  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttc 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41545 agtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 29198 - 29494
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  29198 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattg-agt 29296  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29297 ctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 29396  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  29397 gtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttc-tcttttttgtgttcttctc 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 183901 - 183605
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  183901 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 183803  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  183802 ctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatat 183704  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  183703 agtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 52038 - 52304
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52038 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 52136  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52137 ctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 52236  T
Q  202 agtggattggagggctg--ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  52237 agtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 52304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 267
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50305
Alignment:
Q  219 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaatt 50305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11733 - 11458
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11733 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattg-agtc 11635  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11634 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 11535  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  11534 gtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 43 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1425
Alignment:
Q  43 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  143 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  243 ttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtg 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 79212 - 79488
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79212 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 79310  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  79311 ctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 79410  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  79411 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttct 79488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14642 - 14379
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14642 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtc 14544  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 202  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14543 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 14444  T
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14443 gtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 15046 - 15310
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15046 gcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 15144  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  15145 ctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 15244  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    ||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  15245 agtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaatt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22441
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22419  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  22420 cttcttcttt-tgttcttctcac 22441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24716
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  181 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 24694  T
Q  281 cttcttctttgtgttcatctcac 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  24695 cttcttcttt-tgttcttctcac 24716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 4024 - 4301
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4024 gcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattg-agt 4121  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  4122 ctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 4221  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 282  Q
    |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  4222 agtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 2069 - 2293
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2069 gcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 2166  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 201  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  2167 ctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatat 2266  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccc 228  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||    
T  2267 agtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 79887 - 80150
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  79887 caacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatta-agt 79985  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  79986 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 80084  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  80085 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaatt 80150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 85258 - 85534
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  85258 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggatt-gagtc 85356  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatca-tat 201  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||    
T  85357 ttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattat 85456  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||| ||||||||  ||||||||||    
T  85457 agtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttct 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16079 - 15816
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  16079 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtc 15984  T
Q  104 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||     
T  15983 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattag 15884  T
Q  202 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  15883 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattt 15816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1636
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 144  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattag 1764  T
Q  145 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag- 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1763 gcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagt 1664  T
Q  242 attggaccgaactgggtcaacaaatttc 269  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||    
T  1663 ttttgaccgaactgggtaaacaaatttc 1636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 35666 - 35819
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  35666 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggatt-aagt 35764  T
Q  103 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 157  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35765 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35897
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttct 35897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16645
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16903 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttg 16808  T
Q  109 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgg 206  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16807 gtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 16708  T
Q  207 attggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattt 268  Q
         |||| |  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16707 gacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattt 16645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 258
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5095
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 166  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 4999  T
Q  167 ccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 258  Q
    |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5000 ccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4653
Alignment:
Q  210 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttcttcttcttt 4653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133373
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 36861 - 36925
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36861 atagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 286
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16528
Alignment:
Q  85 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  16328 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttg 16422  T
Q  184 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 279  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16423 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttct 16521  T
Q  280 tcttctt 286  Q
    | |||||    
T  16522 ttttctt 16528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  201 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3055
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 280  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatc-ttgtgttctt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 16983
Alignment:
Q  199 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 267  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85687
Alignment:
Q  203 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57437
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc 179  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  57613 aaacactattaggattgaa-tctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  180 ttt-gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaact 254  Q
    ||| |||| | ||||||| | |||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaact 57437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1415
Alignment:
Q  230 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcatctc 301  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 993
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1092 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 17981 - 18044
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  17981 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 24074 - 24137
Alignment:
Q  200 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24074 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 368
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  427 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 9663 - 9722
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9663 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 14330 - 14389
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  14330 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 17267
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17327 tggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 17267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  220 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 181985 - 182044
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  181985 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 182044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2331
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2272 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 35083 - 35142
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  35083 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 148977 - 149036
Alignment:
Q  204 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 264  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  148977 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1218 times since January 2019
Visitors: 4114