View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0662_low_3 (Length: 512)

Name: NF0662_low_3
Description: NF0662
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0662_low_3
NF0662_low_3
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (15-512)||(9524472-9524969)
chr1 (15-512)||(2396195-2396692)
chr1 (15-500)||(41395132-41395617)
chr1 (15-457)||(47701801-47702243)
chr1 (159-457)||(13599892-13600190)
chr1 (15-192)||(47101036-47101213)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (15-512)||(13881483-13881980)
chr6 (15-512)||(35203003-35203500)
chr6 (15-512)||(17691792-17692289)
chr6 (15-512)||(25944413-25944910)
chr6 (14-512)||(22347912-22348412)
chr6 (15-459)||(14740334-14740778)
chr6 (15-459)||(33333838-33334282)
chr6 (214-309)||(24434226-24434321)
chr6 (36-76)||(24714689-24714729)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (15-512)||(4568087-4568584)
chr4 (15-512)||(15315061-15315558)
chr4 (15-340)||(16637077-16637402)
chr4 (351-512)||(36770334-36770495)
chr4 (342-512)||(16635217-16635387)
chr4 (351-512)||(47565457-47565617)
chr4 (15-459)||(18857457-18857901)
chr4 (15-457)||(16626756-16627198)
chr4 (15-457)||(3790897-3791339)
chr4 (105-458)||(9227164-9227517)
chr4 (214-434)||(5144988-5145208)
chr4 (15-73)||(5144791-5144849)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (15-512)||(25408158-25408655)
chr7 (15-512)||(7072795-7073292)
chr7 (15-512)||(3321728-3322225)
chr7 (15-329)||(25403584-25403898)
chr7 (15-459)||(24264085-24264529)
chr7 (15-459)||(16881808-16882252)
chr7 (351-512)||(44011801-44011968)
chr7 (15-457)||(18410538-18410980)
chr7 (15-457)||(24272664-24273110)
chr7 (15-385)||(21641571-21641941)
chr7 (15-457)||(21985800-21986242)
chr7 (15-310)||(12404851-12405146)
chr7 (159-396)||(9187970-9188207)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (15-512)||(4814166-4814663)
chr8 (15-512)||(28330639-28331136)
chr8 (15-512)||(16754200-16754697)
chr8 (15-511)||(28893509-28894005)
chr8 (105-511)||(21040175-21040581)
chr8 (15-355)||(25682808-25683148)
chr8 (15-512)||(15947407-15947903)
chr8 (314-512)||(33035387-33035585)
chr8 (15-459)||(33035695-33036139)
chr8 (15-500)||(35742270-35742755)
chr8 (15-459)||(10687026-10687470)
chr8 (15-457)||(26401114-26401556)
chr8 (15-500)||(18868391-18868876)
chr8 (15-434)||(26298263-26298682)
chr8 (15-434)||(26311520-26311939)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (15-512)||(10095746-10096243)
chr3 (15-512)||(10899753-10900250)
chr3 (15-512)||(54191252-54191749)
chr3 (15-512)||(10202632-10203129)
chr3 (15-512)||(16460208-16460705)
chr3 (15-512)||(10609713-10610209)
chr3 (15-512)||(47879829-47880325)
chr3 (282-512)||(29911160-29911390)
chr3 (318-512)||(22623226-22623420)
chr3 (15-177)||(22623065-22623227)
chr3 (15-459)||(32477221-32477665)
chr3 (15-459)||(8513975-8514419)
chr3 (15-459)||(22171070-22171514)
chr3 (15-459)||(2674982-2675426)
chr3 (15-490)||(3326257-3326732)
chr3 (15-457)||(1307752-1308194)
chr3 (15-457)||(16256950-16257392)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (15-512)||(20051702-20052198)
chr2 (15-512)||(2738949-2739446)
chr2 (15-512)||(39684991-39685488)
chr2 (15-511)||(22714174-22714670)
chr2 (115-511)||(17934829-17935225)
chr2 (15-459)||(19346159-19346603)
chr2 (26-385)||(39484649-39485008)
chr2 (15-457)||(39485975-39486417)
chr2 (15-73)||(17942004-17942062)
chr2 (15-457)||(31057839-31058281)
chr2 (214-296)||(31134509-31134591)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (82-512)||(150-580)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (17-338)||(25450675-25450996)
chr5 (328-512)||(25448232-25448416)
chr5 (15-459)||(31399754-31400198)
chr5 (15-459)||(37559355-37559799)
chr5 (15-450)||(33769920-33770355)
chr5 (18-459)||(28805484-28805925)
chr5 (15-459)||(27446704-27447148)
chr5 (15-459)||(43594002-43594446)
chr5 (15-459)||(43626796-43627240)
chr5 (15-434)||(24558371-24558790)
chr5 (15-434)||(24599403-24599822)
chr5 (15-76)||(28833940-28834001)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (18-459)||(147-588)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (15-459)||(17071-17515)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (15-459)||(33920-34364)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (159-457)||(7689-7987)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9524969 - 9524472
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  9524969 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 9524870  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9524869 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 9524770  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524769 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 9524670  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524669 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 9524570  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9524569 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 9524472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 2396195 - 2396692
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2396195 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 2396294  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2396295 gttgttgcatatagatagtttcttccaaatctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 2396394  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2396395 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgagaagatttcattgtaataaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 2396494  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2396495 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 2396594  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2396595 tctggttcttttccaatgaaagaatttcctcattcattgccttcagccggtcattgttttcattgctttctaatgcttccctggagttctttggttcc 2396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Original strand, 41395132 - 41395617
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  41395132 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 41395231  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  |  |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  41395232 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtgaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 41395331  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  41395332 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagttctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 41395431  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||    |||||||||||||    
T  41395432 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtaacttcacaagtttccaag 41395531  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaag 500  Q
    | |||||| |||||||||||  ||| || |||||||  ||||||| | | | |||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  41395532 tttggttcctctccaatgaatccatctcttcattcactgccttcaaccaatacttgctttctttgctctcaaatgcctccttgaag 41395617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 47702243 - 47701801
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || |  || || |||||||||     
T  47702243 tcatcaaactgatgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgttctccacaaaaccttctg 47702144  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  47702143 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 47702044  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| | ||     
T  47702043 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccactttagtgaaacccttggctacaagtctttctttg 47701944  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||| |   |||||||||||||    
T  47701943 tacctaggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaaccaccctttgatgtttaggtagtttcacaagtttccaag 47701844  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  47701843 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcattgcctt 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 457
Target Start/End: Original strand, 13599892 - 13600190
Alignment:
Q  159 gcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagattt 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13599892 gcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgagaagatct 13599991  T
Q  259 cattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaa 358  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||| || || || |||||||| || ||||| ||    
T  13599992 cattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaa 13600091  T
Q  359 cacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
     | |||||||| ||| |||| ||| || |  |||||||     |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  13600092 gatccacttgcatccgactatcctatggtgtttaggtagcttcacaagtttccaagtttggttcttttccaatgaattcatctcttcattcaccgcctt 13600190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47101213 - 47101036
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||| |    
T  47101213 tcatcaaaccgacgataccattgtctatggctttgcttcaacctatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttcca 47101114  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagat 192  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47101113 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagat 47101036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13881980 - 13881483
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  13881980 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 13881881  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13881880 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 13881781  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881780 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 13881681  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13881680 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 13881581  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13881580 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 13881483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 35203003 - 35203500
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  35203003 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 35203102  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35203103 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 35203202  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203203 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 35203302  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35203303 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 35203402  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35203403 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 35203500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 17691792 - 17692289
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17691792 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaataaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 17691891  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17691892 gttgttgcatatagatggtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 17691991  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691992 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 17692091  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17692092 tacctcggtgcttcgacccgtggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttccaaataccctttgattcttaggtaatgaagcaagtttccaag 17692191  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17692192 tctggttcttctccaatgaaagcattttctcattcatggccttcagctagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 17692289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25944910 - 25944413
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  25944910 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaaaatttcttaaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 25944811  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25944810 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcataaatgttaacaatcgccat 25944711  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25944710 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacttgagtaaaaccctttgctagaagtcttgcctta 25944611  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25944610 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaaaacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 25944511  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25944510 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatacttccctgaagttctttggttcc 25944413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Original strand, 22347912 - 22348412
Alignment:
Q  14 atcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttct 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22347912 atcagcaaaccgacgatacctctgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttct 22348011  T
Q  114 agttgtttcatat--agatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgc 211  Q
     |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22348012 ggttgttgcatatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgt 22348111  T
Q  212 cttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcc 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22348112 cataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttacacctaagtaaaaccctttgctacaagtcatgcc 22348211  T
Q  312 ttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttcc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22348212 ttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactagcctttaattcttaggtaatgaaacaagtttcc 22348311  T
Q  412 aagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22348312 aagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagctagtcattcttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttc 22348411  T
Q  512 c 512  Q
    |    
T  22348412 c 22348412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14740778 - 14740334
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  14740778 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 14740679  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  14740678 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 14740579  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  14740578 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 14740479  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  14740478 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 14740379  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| ||||||||    
T  14740378 tttggttcctttccaatgaatccatctcttcattcaccgccttca 14740334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33334282 - 33333838
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  33334282 tcatcaaactgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccgtacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 33334183  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  33334182 gttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatctgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 33334083  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||     
T  33334082 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttttccacaagtcttgctttg 33333983  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||  |  ||||||||    |||||||||||||    
T  33333982 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactacccttttgtgattaggtaacttcacaagtttccaag 33333883  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  33333882 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 33333838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24434321 - 24434226
Alignment:
Q  214 taagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttg 309  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| || | ||||||||    
T  24434321 taagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtaaatcccctccacttgagtgaaacccttggccataagtcttg 24434226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 24714689 - 24714729
Alignment:
Q  36 tgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaa 76  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24714689 tgcctagggctttgcttcaatccatacaaagatttcttcaa 24714729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4568584 - 4568087
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4568584 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctg 4568485  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4568484 gttgttgcatatagatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 4568385  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568384 aagtacccttatagaacaatgttttatcaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 4568285  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568284 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttctcactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 4568185  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4568184 tctggttcttttccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 4568087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15315558 - 15315061
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15315558 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttctattatcttctacgaaaccttctg 15315459  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15315458 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 15315359  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315358 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtagtcaatcccttcaacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 15315259  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315258 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcataaacacccacttgcttctcactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 15315159  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15315158 tctggttcttctccaatgaaagcgtttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttaattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 15315061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16637402 - 16637077
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  16637402 tcatcaaacagacgataccactgccttggactttgattcaatccatacaaagatttcttcaacaaacataattttatattatcttctacgaaaccttttg 16637303  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16637302 gttgttacatatagatagttacttccaaatctccatgtagaaatgtggtcttcacatctatctgttttaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16637203  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16637202 aagtacccttattgaacaatgttttaccaccgctgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacatgagtaaaaccctttgctacaagccttgcctta 16637103  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16637102 taccttggtgcttcgacccctggtat 16637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 351 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36770495 - 36770334
Alignment:
Q  351 ttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattca 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36770495 ttcttaaacactcacttgcttcccactaccctttgattcttagataatgaaacaagtttccaagtctggttcttttccaatgaaagtatttcctcattca 36770396  T
Q  451 tcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36770395 ttgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 36770334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16635387 - 16635217
Alignment:
Q  342 ccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcattt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  16635387 ccttctttcttcttaaacacccacttgcttccgactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctatttcttttccaatgaaagtattt 16635288  T
Q  442 cctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16635287 cctcattcattgccttctgctagtccttgctttcatttctttctaacgcttccctgaagttctttggttcc 16635217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 351 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47565617 - 47565457
Alignment:
Q  351 ttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattca 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  47565617 ttcttaaacactcacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagattctaagtctggttctt-ttcaatgaaagtatttcctaattca 47565519  T
Q  451 tcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47565518 ttgccttcagtcagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 47565457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 18857457 - 18857901
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  18857457 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 18857556  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  18857557 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 18857656  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  18857657 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 18857756  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  18857757 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 18857856  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  18857857 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 18857901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16627198 - 16626756
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || ||||| |||||||| |    
T  16627198 tcatcaaaccgacgataccattgccttgggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctctacaaaaccttcca 16627099  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| |  || |||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  16627098 gttgctccatgtagattgtcttttcaaggtcaccatgtaagaaaacggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 16626999  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  16626998 aagtatccttatggaacaatgtttcaccatcggtgagaagatctcattgtagtccatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 16626899  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||     |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||| ||||    
T  16626898 tacctaaaaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagttttcaag 16626799  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  16626798 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 16626756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3791339 - 3790897
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || |  ||||||||      
T  3791339 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttacttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccaaaaaaccttccg 3791240  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| |||||  | | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  3791239 gttgctccatgtagattttctcttcaaggtcaccatgtaacaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 3791140  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||  | ||||||||||| ||     
T  3791139 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtactcgatcccctccacttgagtgaaacccttgaccacaagtcttgctttg 3791040  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||  |||| || || || ||||| || || | |  ||| | |||||||| ||| ||||||||||| |  ||| |||     |||||||||||||    
T  3791039 tacctaggaccttcaacacccggaataccatccttttacaaaaagatccacttgcatccaactaccctttggtatttaagtagcttcacaagtttccaag 3790940  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  3790939 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 3790897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9227517 - 9227164
Alignment:
Q  105 aaaccttctagttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaa 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || |    
T  9227517 aaaccttctagttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattca 9227418  T
Q  205 caatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaag 304  Q
    |||| ||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  9227417 caatagccataagtatccttatggaacaatgcttcaccactggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaag 9227318  T
Q  305 tcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaaca 404  Q
    |||||| || ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||    
T  9227317 tcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcaca 9227218  T
Q  405 agtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttc 458  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| |||||||    
T  9227217 agtttccaagtttggttcctttccaatgaatccatctcttcattcaccgccttc 9227164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 434
Target Start/End: Original strand, 5144988 - 5145208
Alignment:
Q  214 taagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctt 313  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || | |||| |||| ||    
T  5144988 taagtatcgttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccataagtattgcttt 5145087  T
Q  314 ataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaa 413  Q
     ||||||||  |||| || || || |||||||  || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     ||||||||||||    
T  5145088 gtaccttggaccttcaacacccggaatacctttctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaa 5145187  T
Q  414 gtctggttcttctccaatgaa 434  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  5145188 gttcggttcttttccaatgaa 5145208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Original strand, 5144791 - 5144849
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctt 73  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144791 tcatcaaactgatgataccattgcccagggatttgcttcaacccatacaaagatttctt 5144849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25408655 - 25408158
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25408655 tcatcaaaccgacgataccactgcctaggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 25408556  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25408555 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaataatcgccat 25408456  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25408455 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccgatgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 25408356  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25408355 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 25408256  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25408255 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 25408158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7073292 - 7072795
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  7073292 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaatccatacaaatatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 7073193  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7073192 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 7073093  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073092 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 7072993  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7072992 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcgtaaacacccacttgcttcccactaccctttgattttcaggtaatgaaacaagtttccaag 7072893  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7072892 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcactgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 7072795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 3321728 - 3322225
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  3321728 tcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 3321827  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3321828 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 3321927  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3321928 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 3322027  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3322028 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaacctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 3322127  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3322128 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 3322225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25403898 - 25403584
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25403898 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacatggatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 25403799  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25403798 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaataatcgccat 25403699  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25403698 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtcttgcctta 25403599  T
Q  315 taccttggtgcttcg 329  Q
    |||||||||||||||    
T  25403598 taccttggtgcttcg 25403584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24264529 - 24264085
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  24264529 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 24264430  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  24264429 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 24264330  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  24264329 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 24264230  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  24264229 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 24264130  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  24264129 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 24264085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 16881808 - 16882252
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  16881808 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 16881907  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  16881908 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccat 16882007  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  16882008 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 16882107  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  16882108 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtggttaggtagcttcacaagtttccaag 16882207  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  16882208 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 16882252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 351 - 512
Target Start/End: Original strand, 44011801 - 44011968
Alignment:
Q  351 ttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttctt------ctccaatgaaagcatttcct 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||| |||||||    
T  44011801 ttcttaaacactcacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtatggttttttttttcttccaatgaaagtatttcct 44011900  T
Q  445 cattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  44011901 cattcattgccttcagccaatccttgttttcattgctttgtaatgcttccctgatgttctttggttcc 44011968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 18410538 - 18410980
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || ||||||||      
T  18410538 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcgtccacaaaaccttccg 18410637  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  18410638 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcaatcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccat 18410737  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  18410738 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 18410837  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  18410838 taccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 18410937  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  18410938 tttggttcctttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 18410980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24273110 - 24272664
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | || || |  || || || || ||| |||||     
T  24273110 tcatcaaaccgacgataccattgcctaagactttacttcaacccatacaaagatttcttcaatagatataccttagacttgtcctccacaaaatcttctg 24273011  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactc----aagatcatacatgttaacaatcg 210  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| || || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||   |    || ||||| |    
T  24273010 gttgctccatgtagattgtctcttcaaagtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcgatcaagattgaattgattcacaatag 24272911  T
Q  211 ccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgc 310  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| | |||||| || |||||||||||    
T  24272910 ccataagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgacacccttagccacaagtcttgc 24272811  T
Q  311 cttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttc 410  Q
     || |||||||   |||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  ||| |||     |||||||||    
T  24272810 tttgtaccttgaaccttcaacacccggaataccttcttttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaagtagcttcacaagtttc 24272711  T
Q  411 caagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  24272710 caagtttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 24272664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 385
Target Start/End: Original strand, 21641571 - 21641941
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  21641571 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 21641670  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || | | |    
T  21641671 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagtcat 21641770  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| || | | |||||||| || ||||||||||| ||     
T  21641771 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttaaatgaaacccttagccacaagtcttgctttg 21641870  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttg 385  Q
    ||||||||  |||| || |  || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||    
T  21641871 taccttggaccttcaacactcggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 21641941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 21985800 - 21986242
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || |  || ||||  |  |||||||||     
T  21985800 tcatgaaaccgacgatagcattgcctagggctttgcttcaaccgatacaaagatttctttaaaaaacataccttagacttgtctttcaaaaaaccttctg 21985899  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||  | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  21985900 gtttctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 21985999  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  21986000 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 21986099  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || |   | |||||||| || ||||| || | |||| ||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  21986100 taccttggaccttcaacactcagaataccttcctttttcttgaagatccacctgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 21986199  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  21986200 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 21986242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 12404851 - 12405146
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || |  ||||||||      
T  12404851 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggcttttcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccataaaaccttccg 12404950  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  12404951 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 12405050  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgc 310  Q
    || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12405051 aactatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtctatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgc 12405146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9188207 - 9187970
Alignment:
Q  159 gcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagattt 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  9188207 gcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaacaatgtttcactaccagtgaaaagatct 9188108  T
Q  259 cattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaa 358  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| ||    
T  9188107 cattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtaccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaa 9188008  T
Q  359 cacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggta 396  Q
     | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||    
T  9188007 gatccacttgcatccaactaccctttgatgtttaggta 9187970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 4814166 - 4814663
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  4814166 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 4814265  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4814266 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 4814365  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4814366 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 4814465  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4814466 taccttggtgcttcgacccctggtatacgttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtttccaag 4814565  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4814566 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagtcagtcctttttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 4814663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28331136 - 28330639
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28331136 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttcta 28331037  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28331036 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaacaatcgccat 28330937  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28330936 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtcttgcctta 28330837  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28330836 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 28330737  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28330736 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcctccctgaagttctttggttcc 28330639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 16754200 - 16754697
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  16754200 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 16754299  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16754300 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16754399  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16754400 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaagccctttgctacaagtcttgcctta 16754499  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16754500 taccttggtgcttcggcccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 16754599  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16754600 tctggttcttctctaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcctccctgaagttctttggttcc 16754697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28894005 - 28893509
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||     
T  28894005 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctataaaaccttctg 28893906  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28893905 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcagtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 28893806  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  28893805 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagttttgcttta 28893706  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28893705 tacattggtgcttcgacccctagtataccttctttcttcttaaacaccctcttgcttcctactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttcgaag 28893606  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28893605 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttc 28893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21040581 - 21040175
Alignment:
Q  105 aaaccttctagttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaa 204  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21040581 aaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttcttactcaagatcatacatgttaa 21040482  T
Q  205 caatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaag 304  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21040481 caatctccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaactgagtaaaaccctttgctacaag 21040382  T
Q  305 tcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21040381 tcttgcctgataccttggtgcttcgacccctggtatacattcttacttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaaca 21040282  T
Q  405 agtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatct 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  21040281 agtttccaagtctggttcttttccaatgaaagcatttcctcattcattgcctttagccagtcattgttttcatgtctttctaatgcttccctgaagttct 21040182  T
Q  505 ttggttc 511  Q
    |||||||    
T  21040181 ttggttc 21040175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25683148 - 25682808
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25683148 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttcta 25683049  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25683048 gttattgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctagctcaagatcatacatgttaacaatcgccat 25682949  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25682948 aagtacctttatagaacaatgctttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 25682849  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25682848 taccttggtgcttcgacccctagtataccttctttcttctt 25682808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15947903 - 15947407
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  15947903 tcatcaaaccgaagaaaccactgccttggactttgcttcaacctatagaaagatttcttcaacatacatacctttgaattatcttctatgaaaccttctg 15947804  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  15947803 gttgttccatacatatattttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatctattttaacttaagatcatacatgttaacaaacgccat 15947704  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15947703 aagtatccttatacaagaatgttttaccatcggtgaaaagattttgttgtaatcgatcccttccacctgagtaaaacccttagccacaagtcttgcctta 15947604  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15947603 taccttggtgattcgacccctgatattccttctttcttcttaagcaccc-cttccttcccactaacatttgtttcttaggtaatgtgacaattttccaag 15947505  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | | | |||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15947504 tctggttcttttccaatgaaagtatttcctcattaattgccttcaaccaattcttgctttcgtttctttctaatgcttctctgaagttctttggttcc 15947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 314 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33035585 - 33035387
Alignment:
Q  314 ataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaa 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33035585 ataccttggtgcttcgacccctagtataccttatttccttttaaacatccacttgcttcccactaccctttgattcttaagtaatgaaacaagtttccac 33035486  T
Q  414 gtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33035485 gtctggttcttttccaacgaaagtatttcctcattcattgccttcatccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 33035387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33036139 - 33035695
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  33036139 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcctccacaaaaccttccg 33036040  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  33036039 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccat 33035940  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  33035939 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttg 33035840  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||    |||||||||||||    
T  33035839 taccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtaacttcacaagtttccaag 33035740  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| ||||||||    
T  33035739 tttggttcctttccaatgaatccatctcttcattcaccgccttca 33035695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Original strand, 35742270 - 35742755
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  35742270 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 35742369  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  35742370 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 35742469  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35742470 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgcttta 35742569  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || ||  | || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  35742570 taccttggaccttcaacacccagaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 35742669  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaag 500  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| |||||||| | | | |||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  35742670 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttcaaccaatacttgctttctttgctctcaaatgcctccttgaag 35742755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 10687470 - 10687026
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  10687470 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 10687371  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  10687370 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 10687271  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  10687270 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 10687171  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  10687170 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 10687071  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  10687070 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 10687026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26401556 - 26401114
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||||     
T  26401556 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 26401457  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  26401456 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccttgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 26401357  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| | |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  26401356 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatctcctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 26401257  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||     ||| |||||||||    
T  26401256 taccttggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttgatgtttaggtagcttcacacgtttccaag 26401157  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  26401156 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 26401114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18868876 - 18868391
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || ||  |||||||      
T  18868876 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacctatacaaagatttcttcaaaagacacaccttggacttgtcctccacagaaccttccg 18868777  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  18868776 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 18868677  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  18868676 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttg 18868577  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  18868576 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 18868477  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaag 500  Q
    | |||| | | |||||||||  ||| || ||||||| |||||||| | | | |||| | || ||||| || ||||||||| |||||    
T  18868476 tttggtccctttccaatgaatccatctcttcattcaccgccttcaaccaatacttgctctctttgctctcaaatgcttccttgaag 18868391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Original strand, 26298263 - 26298682
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||       
T  26298263 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaacctttcg 26298362  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||  |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  26298363 gttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccat 26298462  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  26298463 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 26298562  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  26298563 taccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatcaaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 26298662  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaa 434  Q
    | |||| | | |||||||||    
T  26298663 tttggtccctttccaatgaa 26298682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Original strand, 26311520 - 26311939
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||       
T  26311520 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaacctttcg 26311619  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||  |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  26311620 gttgctccatgtagattgtctctttaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccat 26311719  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  26311720 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 26311819  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  26311820 taccttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatcaaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 26311919  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaa 434  Q
    | |||| | | |||||||||    
T  26311920 tttggtccctttccaatgaa 26311939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 10095746 - 10096243
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  10095746 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaagatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 10095845  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10095846 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10095945  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10095946 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 10096045  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10096046 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcatcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtttccaag 10096145  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10096146 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagtcagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 10096243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10900250 - 10899753
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  10900250 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttatacgaaaccttctg 10900151  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10900150 gttgctgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10900051  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10900050 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctgcaagtcttgcctta 10899951  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10899950 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttctttttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaataagtttccaag 10899851  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10899850 tctggttcttctccaatgaaagcattttctcattcattgccttcagccagtcattgtttttattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 10899753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 54191749 - 54191252
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  54191749 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 54191650  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54191649 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 54191550  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54191549 aagtacccttatagaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 54191450  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54191449 taccttggtgcttcgacccccggtataccttcttttttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 54191350  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54191349 tctggttcttctccaatgaaagtatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 54191252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 10202632 - 10203129
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  10202632 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccgtacaaatatttcttgaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 10202731  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10202732 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 10202831  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10202832 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 10202931  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10202932 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcatcttgaacacccatttgcttcccactaccctttgattctcaagtaatgaaacaagtttccaag 10203031  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10203032 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 10203129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16460705 - 16460208
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |     
T  16460705 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttatg 16460606  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16460605 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 16460506  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460505 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 16460406  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16460405 taccttagtgcttcgacccctggtataccatgtttcttcttaaacacccacttgcttcccactacactttgattcttaggtaatgtaacaagtttccaag 16460306  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16460305 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcctccctgaagttctttggttcc 16460208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 10609713 - 10610209
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10609713 tcatcaaaccgacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaaaacaaacttttgtattgtcttctacgaaaccttctg 10609812  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  10609813 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccattcgttctaactcaagatcatacatgttaacaattaccat 10609912  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10609913 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaatcctttgctacaagtcttgcctta 10610012  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10610013 taccttggtgatacgaccccgaatataccttctttcttcttaaacacccacttgtttcccactaccctttgattctta-gtaatgaaacaagtttccaag 10610111  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10610112 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcaaccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 10610209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 47879829 - 47880325
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  47879829 tcatcaatccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 47879928  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47879929 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatatgttctaactcaagatcatacatattaacaatcgccat 47880028  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47880029 aagtacccttatagaacaatgttttaccatcggtgaaaagatttcattgtaatcaatccattccacctgagtaaaacccattgctacaagtcttgcctta 47880128  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47880129 taccttggtgcttcgacccctgatataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctctgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 47880228  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47880229 tctgattcttttccaatgaaagtatttcctcattcattgccttcagtcagtcattg-tttcattgaaaactaatgcttccctgaagttctttggttcc 47880325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 282 - 512
Target Start/End: Original strand, 29911160 - 29911390
Alignment:
Q  282 tgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29911160 tgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttgatgcttcgacccctggtataccttctttcttcttcaacacccacttgcttcccactaccc 29911259  T
Q  382 tttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgct 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29911260 tttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccagtgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgct 29911359  T
Q  482 ttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29911360 ttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 29911390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 318 - 512
Target Start/End: Original strand, 22623226 - 22623420
Alignment:
Q  318 cttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22623226 cttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttctaagtct 22623325  T
Q  418 ggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22623326 ggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttataatgcttccctgaagttctttggttcc 22623420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 22623065 - 22623227
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  22623065 tcatcaaaccgacgataccattgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacatacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 22623164  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatct 177  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22623165 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatct 22623227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 32477221 - 32477665
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || ||||| |||||||||     
T  32477221 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttctg 32477320  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  32477321 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccat 32477420  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  32477421 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 32477520  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  32477521 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 32477620  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  32477621 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 32477665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 8513975 - 8514419
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || ||||| |||||||||     
T  8513975 tcatcaaaccgacgataccattgcctagtgctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttctg 8514074  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  8514075 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcactatagccat 8514174  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8514175 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 8514274  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  8514275 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 8514374  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  8514375 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 8514419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22171514 - 22171070
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  22171514 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 22171415  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  22171414 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 22171315  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  22171314 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaaaatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 22171215  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  22171214 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 22171115  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  22171114 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 22171070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2675426 - 2674982
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  2675426 tcatcaaaccgaccataccattgcctaaggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 2675327  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |    || || || ||| |    
T  2675326 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattgattcactatagccat 2675227  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  2675226 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 2675127  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  2675126 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 2675027  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  2675026 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 2674982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3326732 - 3326257
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | || |  || |||||||| |||||||||     
T  3326732 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacattccttagatttgtcttctacaaaaccttctg 3326633  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||  |    
T  3326632 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagcgat 3326533  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  3326532 atgtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtaagaagatctcattgtagtcgatcccctccatttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 3326433  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || ||  | ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     ||||||||  |||    
T  3326432 taccttggaccttcaacaccctgaataccttcttttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttagaag 3326333  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgc 490  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||| | | | | ||||||||| ||||| || |||||    
T  3326332 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctttaaccaatacttgttttctttgctctcaaatgc 3326257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 1307752 - 1308194
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||||     
T  1307752 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 1307851  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||  |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || || || ||| |    
T  1307852 gttgctccatgtagattgtctcttgaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacgatagccat 1307951  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||     
T  1307952 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcattgtagtcgatcccctccacttaagtgaaacccttggccacaagtcttgttttg 1308051  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || ||  | |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  1308052 taccttggaccttcaacacccagaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 1308151  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  1308152 tttggttcctttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 1308194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 16256950 - 16257392
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||||     
T  16256950 tcatcaaatcgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 16257049  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| | | |    
T  16257050 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcat 16257149  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| || | |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  16257150 aagtatccttatggtacaatgtttcaccaccggtgaaaatatcttattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttg 16257249  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  | |  || || || |||| ||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  16257250 taccttggaccattaacacccggaatacgttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagctttacaagtttccaag 16257349  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  16257350 tttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 16257392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Original strand, 20051702 - 20052198
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20051702 tcatcaaaccgacgatac-actgccttggactttgcttcaaccgatacaaagttttcttcaacaaacacactttggtattatcttctacgaaaccttctg 20051800  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20051801 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 20051900  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20051901 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattataatcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 20052000  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20052001 taccttggtgcttcgacccctggtatacctcctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 20052100  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20052101 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 20052198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2739446 - 2738949
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  2739446 tcatcataccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctattacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctg 2739347  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2739346 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgtggtcttcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 2739247  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2739246 aagtacccttatagaacaatgttttaccagcggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttagctacaagtcttgcctta 2739147  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2739146 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggaaatgaaacaagtttccaag 2739047  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2739046 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttattttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 2738949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39685488 - 39684991
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |     
T  39685488 tcatcaaaccgacgataccactgctttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaacgttatg 39685389  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39685388 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattatacatgttaacaatcgccat 39685289  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39685288 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccacctgagtaaaacccttcgctacaagtcttgcctta 39685189  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39685188 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttgaacacccacttgcttcccactaccctttgattctcaggtaatgaaacaagtctccaag 39685089  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39685088 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcctccctgaagttctttggttcc 39684991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 511
Target Start/End: Original strand, 22714174 - 22714670
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |     
T  22714174 tcatcaaaccgacgataccaatgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttatg 22714273  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22714274 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtattcacatccatttgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 22714373  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22714374 aagtacccttatagaacaatgttttactaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcacttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 22714473  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22714474 taccttagtgcttcgacccctggtataccatgtttcttcttaaacacccacttgcttcccactacactttgattcttaggtaatgtaacaagtttccaag 22714573  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22714574 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcctccctgaagttctttggttc 22714670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17935225 - 17934829
Alignment:
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17935225 gttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccat 17935126  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17935125 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtagtcaatcccttccacctgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 17935026  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17935025 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacctgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgtaacaagtttccaag 17934926  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttc 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17934925 tctggttcttctccaatgaaatcatttcctcattcattgccttcagccagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagttctttggttc 17934829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 19346159 - 19346603
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  19346159 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagattttttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 19346258  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |  || |||| ||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  19346259 gttgttccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatataagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 19346358  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  19346359 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttaccacaagtcttgcttta 19346458  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  19346459 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 19346558  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  19346559 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 19346603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 385
Target Start/End: Original strand, 39484649 - 39485008
Alignment:
Q  26 acgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctagttgtttcata 125  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || ||||| ||||||||  |||| | |||     
T  39484649 acgataccattgcctaaggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctctacaaaaccttccggttgctccatg 39484748  T
Q  126 tagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaagtaccctta 225  Q
    ||||| || | ||| |  |  |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    || ||||| ||| |||||| |||||    
T  39484749 tagattgtctcttcaaggttaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttctaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatcctta 39484848  T
Q  226 tagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgc 325  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |  |    
T  39484849 tggaacaatgtttcaccaccggtgagaatatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttgtacctttgacc 39484948  T
Q  326 ttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttg 385  Q
    ||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||    
T  39484949 ttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttg 39485008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39486417 - 39485975
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  || |  || || || || |||||||||     
T  39486417 tcatcaaaccgacgatatcattgtctagggctttgcttcaacccatacaaagatatcttcaaaagacatatcttagacttgtcctccacaaaaccttctg 39486318  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||  | ||| ||||| || | ||| |  ||  ||||||  || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  39486317 gttactccatgtagattgtctcttcaaggtcaacatgtaagaaagcggtcttcacatccatttcttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 39486218  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  39486217 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcgatcccctccacttgagtgaaacccttagccacaagtcttgctttg 39486118  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| |    ||| || || || |||||||| || ||||| || | | |||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  39486117 tacctagtactttcaacacccggaataccttcctttttcttgaagatcgacttgcatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaag 39486018  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    | || ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  39486017 tttgattcttttccaatgaattcatctcttcattcatcgcctt 39485975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17942062 - 17942004
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942062 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttctt 17942004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 457
Target Start/End: Original strand, 31057839 - 31058281
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |  || || || || |||||||| |    
T  31057839 tcatcaaaccgacgataccatttcctagggttttgcttcaactcatacaaagatttcttcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttcca 31057938  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgt-agaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcct 213  Q
     ||| | ||| ||||| || | |||    ||  ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||   |    || ||||| | |     
T  31057939 attgctccatgtagattgtctcttcatggtcagcatgtaagaaat-cagtcttcacatccatttgttccaacttaagattgaattgattcacaatggtca 31058037  T
Q  214 taagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctt 313  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  31058038 taagtatccttatggaacaatgtttcaccaccgatgagaagatctgattgtagtggatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgcttt 31058137  T
Q  314 ataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaa 413  Q
     |||||  |  |||| || || |  |||||||| || ||||| || | |||||||  ||| ||||||||||| |  |||||||     ||||||||||||    
T  31058138 ctacctacgaccttcaacacccgaaataccttcctttttcttgaagatccacttgaatccaactaccctttggtgtttaggtagcttcacaagtttccaa 31058237  T
Q  414 gtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
    || |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  31058238 gtttggttcttttccaatgaatccatctcttcattcaccgcctt 31058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31134591 - 31134509
Alignment:
Q  214 taagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaacccttt 296  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  31134591 taagtaaccttatggaacaatgcttcaccacatgtgaaaagatctcatagtagtcaatcccttcaactagagtgaaacccttt 31134509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 512
Target Start/End: Original strand, 150 - 580
Alignment:
Q  82 acacttttgtattatcttctacgaaaccttctagttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttc 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150 acacttttgtattgtcttctacaaaaccttctggttgttgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttc 249  T
Q  182 taactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaat 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  250 taactcaagatcatacatattaacaatcgccataagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaaaatttcattgtaatcaatcccttccacc 349  T
Q  282 tgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccc 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  350 tgagtaaaaccctttactacaagtcttgctttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccc 449  T
Q  382 tttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgct 481  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  450 tttgattcttaggtaatggaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcattaccttcagccagtccttgttttcattgct 549  T
Q  482 ttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  550 ttctaatgcttccctgaagttctttggttcc 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25450996 - 25450675
Alignment:
Q  17 atcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctagt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  25450996 atcaaaccgacgataccactaccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattgtcttctacaaaaccttctggt 25450897  T
Q  117 tgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaa 216  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25450896 tattgcatatagatagtttcttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccataa 25450797  T
Q  217 gtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttata 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25450796 gtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcgttgtaatcaatcccttccacctaagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttata 25450697  T
Q  317 ccttggtgcttcgacccctggt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25450696 ccttggtgcttcgacccctggt 25450675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 328 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25448416 - 25448232
Alignment:
Q  328 cgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctc 427  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25448416 cgacacctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgcaacaagtttccaagtctggttcttctc 25448317  T
Q  428 caatgaaagcatttcctcattcatcgccttcagctagtccttgttttcattgctttctaatgcttccctgaagatctttggttcc 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25448316 caatgaaaacatttcctcattcattgccttcagccagtcattgttttcattgctttctaatgcttccctgaaattctttggttcc 25448232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31400198 - 31399754
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  31400198 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 31400099  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |    || || || ||| |    
T  31400098 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagatcgaattgattcactatagccat 31399999  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31399998 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctacacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgcttta 31399899  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |   |||||||||||||    
T  31399898 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagtttcacaagtttccaag 31399799  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  31399798 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 31399754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 37559799 - 37559355
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |  || || || || |||||||||     
T  37559799 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacgccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 37559700  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  37559699 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattaattcacaatagccat 37559600  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37559599 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgcttta 37559500  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  37559499 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 37559400  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  37559399 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 37559355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 450
Target Start/End: Original strand, 33769920 - 33770355
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  33769920 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 33770019  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  33770020 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 33770119  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33770120 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgaccccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgcttta 33770219  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  33770220 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 33770319  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattca 450  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| |||||||    
T  33770320 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattca 33770355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28805925 - 28805484
Alignment:
Q  18 tcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctagtt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |  || || || || ||||||||  |||    
T  28805925 tcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacgcaccttagacttgtcctccacaaaaccttccggtt 28805826  T
Q  118 gtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaag 217  Q
    | | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| ||||    
T  28805825 gctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtattcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataag 28805726  T
Q  218 tacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttatac 317  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  28805725 tatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttgtac 28805626  T
Q  318 cttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtct 417  Q
    |||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||| |    
T  28805625 cttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaagttt 28805526  T
Q  418 ggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    ||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  28805525 ggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 28805484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 27446704 - 27447148
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  27446704 tcatcaaaacgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 27446803  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  27446804 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 27446903  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  27446904 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 27447003  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    |||||| |  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  27447004 taccttagaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 27447103  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  27447104 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 27447148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 43594002 - 43594446
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  43594002 tcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 43594101  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| | | |    
T  43594102 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcat 43594201  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    || || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  43594202 aaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 43594301  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  43594302 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 43594401  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  43594402 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 43594446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 43626796 - 43627240
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  43626796 tcatcaaaacgacgataccattgcgtagggctttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 43626895  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| | | |    
T  43626896 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagtcat 43626995  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    || || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  43626996 aaatatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 43627095  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  43627096 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 43627195  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  43627196 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 43627240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24558790 - 24558371
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || || |  || || || || |||||||||     
T  24558790 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatataaagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 24558691  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  |  || ||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  24558690 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaagcggtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 24558591  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  24558590 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 24558491  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |   ||||||     ||||||||| |||    
T  24558490 tacctaggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtataggtagcttcacaagtttcaaag 24558391  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaa 434  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  24558390 tttggttcttttccaatgaa 24558371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24599822 - 24599403
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || || |  || || || || |||||||||     
T  24599822 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttggttcaacccatataaagatttattcaaaagacataccttagacttgtcctccacaaaaccttctg 24599723  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  |  || ||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  24599722 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtaaccgtgtaagaaagcggtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 24599623  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  24599622 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattgtagtcaatcccctccacttgagtgaaacccttggccacaagtcttgctttg 24599523  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||  |||| || || || |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |   ||||||     ||||||||| |||    
T  24599522 tacctaggaccttcaactcccggaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgtataggtagcttcacaagtttcaaag 24599423  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaa 434  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  24599422 tttggttcttttccaatgaa 24599403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 28833940 - 28834001
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaa 76  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28833940 tcatcaaaccgacgatatcattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaa 28834001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 588 - 147
Alignment:
Q  18 tcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttctagtt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || ||||| || ||||||||  |||    
T  588 tcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcttccacaaaaccttcaggtt 489  T
Q  118 gtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaag 217  Q
    | | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| ||||    
T  488 gctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataag 389  T
Q  218 tacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttatac 317  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  388 tatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgaaaagatctctttgtagtcgatcccctccacttgggtgaaaccctttgccacaagtcttgctttatac 289  T
Q  318 cttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtct 417  Q
    |||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||| |    
T  288 cttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaagttt 189  T
Q  418 ggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    ||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  188 ggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17515 - 17071
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |  || || || || ||||||||      
T  17515 tcatcaaaccgacgataccattgcctagggctttgcttcaacccatacaaagatttcttcaaaagacacaccttagacttgtcctccacaaaaccttccg 17416  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |  || |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |    
T  17415 gttgctccatgtagattgtctcttcaaggtcaccatgtaagaaagcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccat 17316  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  17315 aagtatccttatggaacaatgcttcaccaccggtgaaaagatctcgttgtagtcgatcccctccacttgagtgaaaccctttgccacaagtcttgctttg 17216  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||||||  |||| || || || || || || || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||     |||||||||||||    
T  17215 taccttggaccttcaacacccggaatgccatcctttttcttgaagatccacttgcatccaactaccctttggtgattaggtagcttcacaagtttccaag 17116  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  17115 tttggttcctttccaatgaatccatttcttcattcaccgccttca 17071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 33920 - 34364
Alignment:
Q  15 tcatcaaaccgacgataccactgccttggactttgcttcaacccatacaaagatttcttcaacaaacacacttttgtattatcttctacgaaaccttcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |  || || ||  | |||||||||     
T  33920 tcatcaaaccgacgataccatttcctaggactttgcttcaacccatacaaagatttctttaaaagacacaccttagacttgtcctccccaaaaccttctg 34019  T
Q  115 gttgtttcatatagatagttttttccaactctccatgtagaaatgcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgcctt 214  Q
    |||| | ||| ||||| || | ||| |     |||||||  || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||   |    || |||||  || |    
T  34020 gttgctccatgtagattgtctcttcaagggtaccatgtaagaaagcagtctttacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatatccat 34119  T
Q  215 aagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagatttcattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgcctta 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  | ||| |||||||| || ||||||||||  ||     
T  34120 aagtatccttatggaacaatgtttcaccaccggtgagaagatctcattatactcgatcccctccacctaagttaaacccttggccacaagtcttgttttg 34219  T
Q  315 taccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaacacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaag 414  Q
    ||||| ||  |||| || ||| | |||||||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||  || |||||||     ||||||||||| |    
T  34220 tacctaggaccttcaactcctagaataccttcctttttcttgaagatccacttgcatccaactacccttttgtttttaggtatcttcacaagtttccatg 34319  T
Q  415 tctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgccttca 459  Q
    | |||||| | |||||||||  ||| || ||||||| ||||||||    
T  34320 tttggttcctttccaatgaattcatctcttcattcaccgccttca 34364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 457
Target Start/End: Original strand, 7689 - 7987
Alignment:
Q  159 gcggtcttcacatccatctgttctaactcaagatcatacatgttaacaatcgccttaagtacccttatagaacaatgttttaccaccggtgaaaagattt 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |    || ||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  7689 gcggtcttcacatccatttgttccaactcaagattgaattgattcacaatagccataagtatccttatggaataatgtttcaccactggtgagaagatct 7788  T
Q  259 cattgtaatcaatcccttccaattgagtaaaaccctttgctacaagtcttgccttataccttggtgcttcgacccctggtataccttctttcttcttaaa 358  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||| || || || |||||||| || ||||| ||    
T  7789 cattgtagtcgatcccctccacttgattgaaacccttggccacaagtcttgctttgtatcttggaccttcaacacccggaataccttcctttttcttgaa 7888  T
Q  359 cacccacttgcttcccactaccctttgattcttaggtaatgaaacaagtttccaagtctggttcttctccaatgaaagcatttcctcattcatcgcctt 457  Q
     | |||||||| ||| |||| ||| || |  |||||||     |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||    
T  7889 gatccacttgcatccgactatcctatggtgtttaggtagcttcacaagtttccaagtttggttcttttccaatgaattcatctcttcattcaccgcctt 7987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 546 times since January 2019
Visitors: 4087