View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0662_low_4 (Length: 482)

Name: NF0662_low_4
Description: NF0662
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0662_low_4
NF0662_low_4
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (11-482)||(25205-25676)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-482)||(14719-15190)
scaffold0162 (11-392)||(11198-11579)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (11-482)||(7825669-7826140)
chr7 (11-482)||(27105804-27106275)
chr7 (11-482)||(27172050-27172521)
chr7 (11-482)||(4441697-4442168)
chr7 (11-482)||(17925419-17925890)
chr7 (11-479)||(13457807-13458275)
chr7 (28-477)||(15716950-15717399)
chr7 (256-482)||(14938115-14938341)
chr7 (256-482)||(15365708-15365934)
chr7 (59-478)||(17143354-17143760)
chr7 (11-167)||(13378969-13379123)
chr7 (67-339)||(48813338-48813609)
chr7 (107-476)||(19614451-19614820)
chr7 (170-446)||(11770430-11770706)
chr7 (107-476)||(20748386-20748755)
chr7 (355-476)||(13354924-13355045)
chr7 (178-425)||(11551299-11551546)
chr7 (181-443)||(12689309-12689572)
chr7 (107-476)||(14262349-14262717)
chr7 (107-476)||(19148987-19149356)
chr7 (107-380)||(11386533-11386806)
chr7 (107-339)||(14139592-14139824)
chr7 (178-425)||(14956380-14956627)
chr7 (169-431)||(11235401-11235662)
chr7 (107-449)||(23503974-23504316)
chr7 (107-479)||(49154074-49154446)
chr7 (107-326)||(12204904-12205123)
chr7 (107-458)||(13023151-13023502)
chr7 (107-458)||(13966772-13967123)
chr7 (173-431)||(8709426-8709683)
chr7 (169-476)||(14334171-14334478)
chr7 (124-340)||(15122170-15122384)
chr7 (107-339)||(15626437-15626669)
chr7 (169-476)||(16070461-16070768)
chr7 (169-339)||(15159245-15159415)
chr7 (107-467)||(18052057-18052417)
chr7 (107-319)||(13675385-13675597)
chr7 (107-458)||(26116694-26117045)
chr7 (107-476)||(15100707-15101076)
chr7 (181-339)||(15147085-15147243)
chr7 (169-431)||(44789539-44789800)
chr7 (190-337)||(15559-15706)
chr7 (107-320)||(16948576-16948789)
chr7 (107-329)||(26092902-26093124)
chr7 (159-404)||(10872537-10872782)
chr7 (13-237)||(39178-39402)
chr7 (220-479)||(15342204-15342463)
chr7 (107-329)||(11301317-11301539)
chr7 (181-447)||(14041499-14041765)
chr7 (169-479)||(14284542-14284852)
chr7 (181-447)||(14351529-14351795)
chr7 (374-479)||(23649629-23649734)
chr7 (169-266)||(13688026-13688123)
chr7 (178-305)||(12458587-12458714)
chr7 (283-431)||(8200449-8200596)
chr7 (169-245)||(18588359-18588435)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (11-482)||(16380539-16381010)
chr6 (11-482)||(16648135-16648606)
chr6 (11-482)||(1646980-1647451)
chr6 (11-482)||(23997892-23998363)
chr6 (11-482)||(16099653-16100130)
chr6 (11-482)||(14130113-14130584)
chr6 (11-482)||(23025912-23026362)
chr6 (194-482)||(18836257-18836545)
chr6 (234-482)||(19985805-19986053)
chr6 (234-482)||(18577853-18578101)
chr6 (256-482)||(16234672-16234898)
chr6 (256-482)||(21928849-21929074)
chr6 (124-479)||(23080116-23080471)
chr6 (107-476)||(19880948-19881317)
chr6 (127-476)||(34643868-34644217)
chr6 (161-476)||(18196049-18196364)
chr6 (67-446)||(18406166-18406545)
chr6 (180-339)||(22828690-22828849)
chr6 (169-431)||(24294106-24294367)
chr6 (124-425)||(20634219-20634520)
chr6 (67-254)||(23085993-23086180)
chr6 (107-458)||(24366080-24366431)
chr6 (169-338)||(2873127-2873296)
chr6 (107-479)||(14378178-14378550)
chr6 (107-479)||(14379728-14380100)
chr6 (179-339)||(18965629-18965789)
chr6 (188-446)||(22760798-22761056)
chr6 (179-425)||(25114253-25114499)
chr6 (107-320)||(18796496-18796709)
chr6 (169-476)||(5837543-5837850)
chr6 (172-339)||(16925965-16926132)
chr6 (169-458)||(10467173-10467462)
chr6 (22-178)||(14643664-14643817)
chr6 (172-476)||(27564160-27564462)
chr6 (178-338)||(28261530-28261690)
chr6 (178-338)||(28284226-28284386)
chr6 (178-338)||(28340279-28340439)
chr6 (187-426)||(25608203-25608442)
chr6 (169-326)||(19454824-19454981)
chr6 (67-339)||(19487504-19487766)
chr6 (107-479)||(25769491-25769863)
chr6 (169-479)||(15460983-15461293)
chr6 (172-339)||(16961809-16961976)
chr6 (107-329)||(28281075-28281297)
chr6 (82-403)||(18450226-18450547)
chr6 (212-443)||(27189119-27189350)
chr6 (212-443)||(27259890-27260121)
chr6 (212-479)||(5295573-5295840)
chr6 (344-479)||(21568490-21568625)
chr6 (169-339)||(19866474-19866644)
chr6 (212-320)||(19436808-19436916)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (11-482)||(30139215-30139686)
chr3 (11-482)||(30148766-30149237)
chr3 (11-482)||(8272659-8273130)
chr3 (11-482)||(15611512-15611983)
chr3 (11-482)||(13965612-13966084)
chr3 (11-482)||(25767727-25768198)
chr3 (11-482)||(6151113-6151584)
chr3 (11-317)||(15948730-15949036)
chr3 (256-482)||(12795645-12795871)
chr3 (260-482)||(16258552-16258774)
chr3 (256-482)||(18915135-18915361)
chr3 (256-482)||(55514237-55514463)
chr3 (199-482)||(6710865-6711144)
chr3 (280-482)||(18751352-18751554)
chr3 (107-476)||(14088088-14088457)
chr3 (109-446)||(15261065-15261402)
chr3 (107-476)||(13970465-13970834)
chr3 (107-467)||(11950253-11950613)
chr3 (169-425)||(15340725-15340981)
chr3 (169-425)||(15400935-15401191)
chr3 (169-476)||(15346663-15346970)
chr3 (202-476)||(12358967-12359241)
chr3 (107-458)||(28755751-28756102)
chr3 (107-380)||(17187885-17188158)
chr3 (169-476)||(13254095-13254402)
chr3 (118-446)||(41178967-41179295)
chr3 (107-458)||(11959514-11959865)
chr3 (124-431)||(15723307-15723613)
chr3 (173-476)||(16379339-16379642)
chr3 (187-426)||(17491305-17491544)
chr3 (178-443)||(6602174-6602439)
chr3 (67-476)||(15014072-15014481)
chr3 (159-339)||(20060462-20060642)
chr3 (107-254)||(11889636-11889783)
chr3 (179-476)||(5423358-5423655)
chr3 (169-458)||(10385104-10385393)
chr3 (190-431)||(48426898-48427138)
chr3 (178-446)||(16693599-16693867)
chr3 (172-443)||(53383439-53383710)
chr3 (159-476)||(15587800-15588117)
chr3 (178-443)||(3687381-3687646)
chr3 (178-339)||(10007142-10007303)
chr3 (107-296)||(15229198-15229387)
chr3 (107-296)||(15235066-15235255)
chr3 (178-422)||(5109038-5109282)
chr3 (178-426)||(12888164-12888412)
chr3 (88-479)||(13318828-13319219)
chr3 (107-339)||(13943576-13943808)
chr3 (107-479)||(47125356-47125728)
chr3 (212-326)||(12179903-12180017)
chr3 (178-339)||(10907752-10907913)
chr3 (190-339)||(16637315-16637464)
chr3 (202-339)||(16834950-16835087)
chr3 (107-467)||(44778671-44779031)
chr3 (187-339)||(14874935-14875087)
chr3 (169-479)||(10418452-10418762)
chr3 (190-425)||(12499704-12499939)
chr3 (169-376)||(16328067-16328274)
chr3 (169-476)||(16755119-16755426)
chr3 (223-476)||(16805419-16805672)
chr3 (173-257)||(55498486-55498570)
chr3 (107-326)||(31693530-31693749)
chr3 (256-410)||(13952223-13952377)
chr3 (183-252)||(55498665-55498734)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (11-482)||(20829485-20829956)
chr1 (11-429)||(20926917-20927320)
chr1 (11-478)||(41215949-41216417)
chr1 (37-478)||(21200998-21201439)
chr1 (11-182)||(20527148-20527319)
chr1 (322-482)||(22133961-22134121)
chr1 (19-125)||(22133857-22133963)
chr1 (169-476)||(51331744-51332051)
chr1 (107-479)||(31538186-31538558)
chr1 (107-479)||(48424702-48425074)
chr1 (178-425)||(19108220-19108467)
chr1 (107-458)||(52987591-52987942)
chr1 (169-431)||(21838797-21839058)
chr1 (172-447)||(430370-430645)
chr1 (169-476)||(33389280-33389587)
chr1 (172-443)||(41351916-41352187)
chr1 (169-431)||(21832149-21832410)
chr1 (11-80)||(35930918-35930987)
chr1 (166-446)||(50618646-50618926)
chr1 (169-479)||(20855011-20855321)
chr1 (107-305)||(21743741-21743939)
chr1 (178-443)||(16348856-16349121)
chr1 (65-446)||(21750771-21751152)
chr1 (124-339)||(20140021-20140236)
chr1 (172-479)||(24097857-24098164)
chr1 (172-305)||(20834154-20834287)
chr1 (107-479)||(38911015-38911387)
chr1 (107-458)||(21952728-21953079)
chr1 (187-426)||(22360513-22360752)
chr1 (119-337)||(21862574-21862792)
chr1 (425-482)||(20915396-20915453)
chr1 (202-339)||(41308611-41308748)
chr1 (107-458)||(37678899-37679250)
chr1 (178-404)||(17043275-17043501)
chr1 (181-339)||(21026111-21026269)
chr1 (172-476)||(19661390-19661694)
chr1 (212-404)||(21234025-21234217)
chr1 (187-339)||(24792885-24793037)
chr1 (107-458)||(20296231-20296582)
chr1 (202-326)||(20938347-20938471)
chr1 (172-464)||(19856118-19856410)
chr1 (181-337)||(22503552-22503708)
chr1 (212-326)||(23196543-23196657)
chr1 (313-446)||(22116744-22116877)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (11-482)||(42069-42540)
scaffold0076 (107-476)||(31797-32166)
scaffold0076 (172-479)||(55085-55392)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (11-482)||(16875559-16876030)
chr8 (11-482)||(21848801-21849272)
chr8 (11-482)||(20650819-20651290)
chr8 (11-482)||(22436149-22436620)
chr8 (11-482)||(23155506-23155975)
chr8 (11-482)||(21195004-21195474)
chr8 (24-482)||(23902010-23902468)
chr8 (268-482)||(22317027-22317241)
chr8 (109-479)||(22422454-22422824)
chr8 (54-455)||(24631173-24631574)
chr8 (109-476)||(20394695-20395061)
chr8 (113-426)||(22988632-22988945)
chr8 (107-458)||(27356406-27356757)
chr8 (107-446)||(31569402-31569741)
chr8 (11-117)||(16414302-16414408)
chr8 (67-473)||(23886879-23887289)
chr8 (107-479)||(20008481-20008853)
chr8 (169-476)||(17672645-17672952)
chr8 (178-443)||(22131672-22131937)
chr8 (172-443)||(19482689-19482960)
chr8 (169-431)||(18858475-18858736)
chr8 (107-476)||(21323839-21324207)
chr8 (109-446)||(22376015-22376352)
chr8 (169-476)||(20016885-20017192)
chr8 (109-339)||(23652030-23652260)
chr8 (107-476)||(19861287-19861656)
chr8 (202-467)||(23656788-23657053)
chr8 (187-447)||(21252825-21253085)
chr8 (212-404)||(30311809-30312001)
chr8 (217-431)||(19114588-19114801)
chr8 (212-404)||(15535307-15535499)
chr8 (107-458)||(6605528-6605879)
chr8 (109-404)||(19979891-19980186)
chr8 (107-305)||(21927450-21927649)
chr8 (169-431)||(22118797-22119058)
chr8 (169-431)||(22127581-22127842)
chr8 (109-446)||(22246995-22247332)
chr8 (118-446)||(16269795-16270123)
chr8 (135-287)||(20390140-20390292)
chr8 (107-458)||(28987999-28988351)
chr8 (178-425)||(32602047-32602295)
chr8 (32-203)||(19869818-19869989)
chr8 (172-425)||(22041730-22041983)
chr8 (107-479)||(22372780-22373152)
chr8 (107-458)||(28982779-28983132)
chr8 (187-339)||(21392501-21392653)
chr8 (187-339)||(21783060-21783212)
chr8 (187-339)||(21786995-21787147)
chr8 (187-339)||(21920388-21920540)
chr8 (88-377)||(4983993-4984282)
chr8 (235-476)||(29302114-29302355)
chr8 (202-326)||(22052865-22052989)
chr8 (181-339)||(19864727-19864886)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (11-482)||(21935391-21935862)
chr5 (11-482)||(24582904-24583375)
chr5 (11-482)||(23507378-23507849)
chr5 (256-482)||(23504938-23505164)
chr5 (67-476)||(20466358-20466767)
chr5 (109-476)||(23472945-23473312)
chr5 (107-476)||(21679077-21679446)
chr5 (82-449)||(21408883-21409246)
chr5 (107-479)||(14885290-14885662)
chr5 (181-425)||(22349688-22349932)
chr5 (107-339)||(17267633-17267865)
chr5 (172-476)||(27666854-27667158)
chr5 (169-476)||(19771678-19771985)
chr5 (118-476)||(20343982-20344340)
chr5 (169-431)||(22331248-22331509)
chr5 (172-476)||(27612072-27612376)
chr5 (169-476)||(14998100-14998407)
chr5 (118-458)||(22504397-22504737)
chr5 (107-479)||(24796696-24797068)
chr5 (124-443)||(25428184-25428503)
chr5 (169-404)||(37289857-37290092)
chr5 (169-431)||(22136432-22136693)
chr5 (169-431)||(40710544-40710805)
chr5 (169-476)||(27520124-27520431)
chr5 (33-180)||(20250509-20250656)
chr5 (169-476)||(41772560-41772867)
chr5 (169-422)||(29474434-29474687)
chr5 (212-443)||(18780865-18781096)
chr5 (169-479)||(22463648-22463958)
chr5 (109-446)||(21337595-21337935)
chr5 (107-464)||(22234219-22234576)
chr5 (109-339)||(26737028-26737258)
chr5 (190-339)||(16358357-16358506)
chr5 (187-404)||(20801187-20801404)
chr5 (190-339)||(34568349-34568498)
chr5 (107-458)||(25849793-25850144)
chr5 (169-323)||(20823306-20823460)
chr5 (217-479)||(24618704-24618966)
chr5 (217-479)||(24714935-24715197)
chr5 (217-479)||(24747963-24748225)
chr5 (169-476)||(27683761-27684068)
chr5 (107-479)||(37541680-37542052)
chr5 (312-479)||(16064280-16064447)
chr5 (169-339)||(28893303-28893473)
chr5 (169-339)||(28914774-28914944)
chr5 (169-339)||(28922129-28922299)
chr5 (169-339)||(28930042-28930212)
chr5 (107-260)||(21562323-21562476)
chr5 (240-332)||(20777757-20777849)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (11-482)||(15291179-15291650)
chr4 (37-482)||(12340912-12341357)
chr4 (256-482)||(14999095-14999321)
chr4 (256-482)||(9292615-9292841)
chr4 (67-446)||(14695929-14696308)
chr4 (107-446)||(51604909-51605248)
chr4 (109-479)||(14849225-14849595)
chr4 (107-380)||(15323099-15323372)
chr4 (178-408)||(14682421-14682651)
chr4 (107-478)||(1647394-1647765)
chr4 (107-479)||(3262911-3263283)
chr4 (64-340)||(8322850-8323126)
chr4 (67-479)||(8707694-8708106)
chr4 (124-404)||(40474898-40475178)
chr4 (169-431)||(14301898-14302159)
chr4 (107-476)||(15072145-15072514)
chr4 (107-458)||(44659983-44660334)
chr4 (169-431)||(23957579-23957840)
chr4 (169-404)||(27713194-27713429)
chr4 (172-479)||(27902169-27902476)
chr4 (169-339)||(8051542-8051712)
chr4 (107-298)||(15001482-15001673)
chr4 (107-458)||(29451654-29452005)
chr4 (178-404)||(12478458-12478684)
chr4 (178-404)||(19776721-19776947)
chr4 (212-431)||(8388244-8388462)
chr4 (124-403)||(15145759-15146038)
chr4 (67-237)||(18547696-18547866)
chr4 (212-425)||(18613786-18613999)
chr4 (169-305)||(16149668-16149804)
chr4 (169-305)||(16153814-16153950)
chr4 (212-404)||(18225408-18225600)
chr4 (202-305)||(15357332-15357435)
chr4 (217-425)||(16353474-16353683)
chr4 (169-266)||(17093068-17093165)
chr4 (178-266)||(16234920-16235008)
chr4 (283-339)||(29037437-29037493)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (11-482)||(24829749-24830220)
chr2 (6-482)||(22279516-22279992)
chr2 (11-482)||(24568229-24568700)
chr2 (11-482)||(22760130-22760601)
chr2 (11-479)||(25130023-25130491)
chr2 (256-482)||(12639039-12639265)
chr2 (45-479)||(10037927-10038361)
chr2 (45-479)||(10098312-10098746)
chr2 (82-393)||(30010816-30011127)
chr2 (67-446)||(24818847-24819226)
chr2 (107-340)||(23112289-23112522)
chr2 (178-425)||(21143769-21144016)
chr2 (181-404)||(24875481-24875704)
chr2 (172-479)||(27208894-27209201)
chr2 (169-443)||(41607104-41607378)
chr2 (107-339)||(27789294-27789526)
chr2 (107-458)||(1065186-1065537)
chr2 (172-447)||(23106450-23106725)
chr2 (169-404)||(24711523-24711758)
chr2 (124-431)||(27372732-27373038)
chr2 (107-479)||(23098675-23099047)
chr2 (107-479)||(31832072-31832444)
chr2 (169-476)||(27219433-27219740)
chr2 (82-320)||(30209549-30209787)
chr2 (169-476)||(10870267-10870574)
chr2 (187-446)||(22734511-22734770)
chr2 (190-431)||(16926823-16927063)
chr2 (190-431)||(17000463-17000703)
chr2 (178-443)||(44384298-44384563)
chr2 (167-426)||(23073330-23073589)
chr2 (169-320)||(23295508-23295659)
chr2 (187-318)||(24950165-24950296)
chr2 (169-431)||(24263833-24264094)
chr2 (107-320)||(23278349-23278562)
chr2 (181-425)||(24706213-24706457)
chr2 (202-476)||(25264471-25264745)
chr2 (178-404)||(23189408-23189633)
chr2 (190-339)||(9485770-9485919)
chr2 (107-467)||(12575779-12576139)
chr2 (223-380)||(45534453-45534610)
chr2 (212-431)||(22323618-22323836)
chr2 (181-425)||(24676957-24677201)
chr2 (181-339)||(21323997-21324155)
chr2 (169-266)||(9337209-9337306)
chr2 (346-458)||(20829694-20829806)
chr2 (221-305)||(19717788-19717872)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (11-478)||(5830-6299)
scaffold0124 (212-326)||(14167-14281)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (11-482)||(6964-7435)
scaffold0302 (11-482)||(22-493)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (11-482)||(26290-26761)
scaffold0077 (349-482)||(25317-25450)
scaffold0077 (172-290)||(19819-19937)
scaffold0077 (256-301)||(25270-25315)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (11-479)||(33899-34367)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (11-482)||(132513-132984)
scaffold0008 (177-479)||(25640-25942)
scaffold0008 (11-122)||(25938-26049)
scaffold0008 (208-338)||(85451-85581)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (11-482)||(23987-24458)
scaffold0120 (124-426)||(7887-8189)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (11-479)||(7885-8353)
scaffold0266 (107-326)||(16079-16298)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (11-482)||(1976-2447)
scaffold0218 (15-351)||(26270-26605)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (11-482)||(1908-2370)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (11-478)||(6953-7419)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (11-482)||(827-1297)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (11-482)||(970-1441)
scaffold0876 (256-482)||(4345-4571)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (11-482)||(15869-16340)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (11-371)||(8850-9210)
scaffold0022 (166-446)||(55602-55882)
scaffold0022 (67-337)||(40588-40858)
scaffold0022 (67-337)||(74308-74578)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (11-482)||(31447-31908)
scaffold0021 (69-482)||(7025-7438)
scaffold0021 (11-306)||(21871-22165)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (11-420)||(7029-7434)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (11-254)||(1645-1888)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (22-297)||(103-378)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (234-482)||(25024-25272)
scaffold0244 (220-326)||(19319-19425)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (234-478)||(2087-2323)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (255-482)||(54210-54437)
scaffold0023 (118-446)||(2636-2964)
scaffold0023 (208-426)||(150977-151195)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (45-479)||(8709-9143)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (256-482)||(13093-13319)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (256-482)||(10979-11205)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (255-466)||(1-212)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (280-482)||(181735-181937)
scaffold0011 (109-446)||(24655-24992)
scaffold0011 (187-479)||(150383-150675)
scaffold0011 (236-476)||(193953-194193)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (306-482)||(104892-105068)
scaffold0028 (107-468)||(48634-48995)
scaffold0028 (181-425)||(16804-17048)
scaffold0028 (181-425)||(10342-10586)
scaffold0028 (178-425)||(45019-45266)
scaffold0028 (271-310)||(94054-94093)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (256-478)||(46682-46904)
scaffold0102 (67-305)||(41685-41922)
scaffold0102 (169-266)||(51527-51624)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (11-149)||(6888-7026)
scaffold0369 (415-482)||(1273-1340)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (145-477)||(76239-76571)
scaffold0058 (76-378)||(27337-27638)
scaffold0058 (23-86)||(76630-76693)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (11-115)||(2117-2221)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (118-476)||(14285-14643)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (310-482)||(2798-2970)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (107-476)||(121-490)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (107-476)||(114376-114745)
scaffold0029 (178-339)||(108002-108163)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (67-339)||(9114-9386)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (76-476)||(4929-5328)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (124-446)||(84656-84978)
scaffold0007 (172-339)||(268562-268729)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (112-476)||(6014-6378)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (67-446)||(147-526)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (82-339)||(2853-3110)
scaffold0647 (187-446)||(7859-8118)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (109-449)||(494861-495202)
scaffold0001 (107-479)||(515473-515845)
scaffold0001 (67-305)||(453293-453531)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (181-425)||(9234-9478)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (109-404)||(15343-15638)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (172-479)||(24927-25234)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (67-446)||(10821-11200)
scaffold0018 (67-446)||(17013-17392)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (67-446)||(103080-103459)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (109-479)||(7209-7579)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (124-426)||(38085-38387)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (178-339)||(115172-115333)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (107-467)||(1695-2055)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (107-339)||(1969-2201)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (107-305)||(5209-5407)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (113-446)||(3761-4094)
scaffold0010 (107-479)||(40453-40825)
scaffold0010 (217-476)||(45630-45888)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (107-479)||(31439-31811)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (172-339)||(11424-11591)
scaffold0080 (187-476)||(49907-50196)
scaffold0080 (187-266)||(53662-53741)
scaffold0080 (212-425)||(30750-30963)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (172-479)||(69184-69491)
scaffold0034 (202-305)||(3168-3271)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (169-431)||(8801-9062)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (107-476)||(48921-49290)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (107-305)||(176464-176662)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (109-446)||(5718-6055)
scaffold0270 (109-446)||(12848-13185)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (124-476)||(9918-10270)
scaffold0149 (124-326)||(5487-5689)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (109-294)||(16876-17061)
scaffold0040 (283-479)||(111784-111980)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (109-446)||(217542-217879)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (124-446)||(916-1235)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (169-476)||(6567-6874)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (107-479)||(8928-9300)
scaffold0130 (190-339)||(44846-44995)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (107-479)||(24028-24400)
scaffold0104 (107-326)||(44537-44756)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (107-446)||(2563-2902)
scaffold0079 (217-308)||(35481-35572)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (59-446)||(613-1000)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (109-339)||(10782-11012)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (109-339)||(14601-14831)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (107-476)||(20666-21035)
scaffold0090 (107-476)||(24828-25197)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (111-337)||(22661-22887)
scaffold0042 (181-425)||(38014-38258)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (108-476)||(811-1179)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (107-404)||(22305-22602)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (107-476)||(50627-50996)
scaffold0026 (187-426)||(30812-31051)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (59-339)||(881-1161)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (124-476)||(6468-6820)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (124-339)||(3386-3601)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (67-446)||(3428-3807)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (112-446)||(64633-64967)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (33-95)||(4785-4847)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (212-426)||(17521-17735)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (107-476)||(11610-11979)
scaffold0309 (109-447)||(16486-16825)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (159-425)||(195659-195925)
scaffold0017 (178-404)||(57904-58130)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (212-476)||(44-308)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (107-380)||(1665-1938)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (67-476)||(16058-16466)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (67-260)||(201548-201741)
scaffold0004 (202-326)||(324671-324795)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (169-305)||(42905-43041)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (107-326)||(1605-1824)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (212-443)||(23299-23530)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (107-458)||(14833-15184)
scaffold0089 (169-326)||(458-615)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (219-458)||(28768-29007)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (124-426)||(8239-8541)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (202-320)||(9034-9152)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (59-425)||(35894-36260)
scaffold0081 (124-425)||(20470-20771)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (107-476)||(49995-50364)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (187-339)||(10986-11138)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (169-476)||(52862-53169)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (240-479)||(1697-1936)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (217-404)||(4083-4270)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (181-476)||(7866-8161)
scaffold0358 (181-476)||(17062-17357)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (172-339)||(13-180)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (172-339)||(10242-10409)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (181-339)||(1576-1734)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (82-404)||(886-1208)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (169-479)||(250434-250744)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (186-447)||(13410-13671)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (178-339)||(40107-40268)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (107-470)||(707-1070)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (67-479)||(28339-28751)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (220-455)||(1067-1302)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (107-326)||(21635-21854)
scaffold0261 (107-326)||(13456-13675)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (169-320)||(12481-12632)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (202-476)||(37465-37739)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (172-299)||(50365-50492)
scaffold0067 (172-299)||(59399-59526)
scaffold0067 (172-299)||(65787-65914)
scaffold0067 (107-305)||(28610-28808)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (190-425)||(16026-16261)
scaffold0044 (172-338)||(2375-2542)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (220-475)||(262042-262297)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (107-305)||(4164-4362)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (187-476)||(20055-20344)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (169-326)||(422-579)
scaffold0180 (169-326)||(4742-4899)
scaffold0180 (133-339)||(33899-34105)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (202-479)||(56062-56339)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (187-339)||(7175-7327)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (82-330)||(42202-42450)
scaffold0035 (202-326)||(4716-4840)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (107-326)||(2392-2611)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (172-339)||(10074-10241)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (107-326)||(29405-29624)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (256-410)||(4363-4517)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (11-69)||(13649-13707)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (188-446)||(298-555)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (190-404)||(3556-3770)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (169-339)||(109584-109754)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (217-326)||(1084-1193)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (172-476)||(16334-16638)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (232-305)||(9702-9775)
scaffold0235 (232-305)||(19916-19989)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (190-339)||(28774-28923)
scaffold0215 (161-266)||(28637-28742)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (240-476)||(35930-36166)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (169-326)||(80013-80170)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (107-320)||(99682-99895)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (107-339)||(1278-1510)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (187-379)||(966-1158)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (169-304)||(634-769)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (268-327)||(34682-34741)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (220-326)||(195207-195313)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (190-339)||(7896-8045)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (238-339)||(4587-4688)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (269-376)||(5975-6082)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (172-299)||(33328-33455)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (67-140)||(5259-5332)


Alignment Details
Target: scaffold0225 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25676 - 25205
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25676 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 25577  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 25477  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 25377  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25376 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 25277  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25276 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 25205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15190 - 14719
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15091  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15090 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 14991  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14990 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 14891  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 14791  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14790 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 14719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 11198 - 11579
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11198 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacaaggtatggacactatgagtattctttgatgccatttggagtgtctaa 11297  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11298 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 11397  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11398 tctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaagg 11497  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtggga 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11498 aagtgagtttccttggtcaagtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcaaaggttgatgcagtgttgcagtggga 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7826140 - 7825669
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826140 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 7826041  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826040 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 7825941  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825940 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 7825841  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825840 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 7825741  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7825740 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 7825669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 27105804 - 27106275
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105804 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 27105903  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105904 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 27106003  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106004 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 27106103  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106104 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 27106203  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27106204 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 27106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27172521 - 27172050
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172521 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 27172422  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172421 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 27172322  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172321 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 27172222  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172221 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 27172122  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27172121 tgagattagaagctttcttggtttgaccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 27172050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4442168 - 4441697
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4442168 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccggtcgaggtatgaacactaagagtattctgtgatgccattcggagtatccaa 4442069  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4442068 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatataatattccatccttttctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 4441969  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  4441968 tctggggaggagcatgtcgagcatttgaggatggtgttgcgagtcttgaaggaaaatcggttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 4441869  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4441868 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatcagtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 4441769  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4441768 tgagattagaagctttcttggattggcaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggcgtt 4441697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17925890 - 17925419
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17925890 atcatcagattagagtgaagacggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaatgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 17925791  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  17925790 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttttctagaccgttttgtggtggtgtttatagattatattttggtatattcaaag 17925691  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||  ||| ||||||| || |||||| || ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  17925690 tctagggaggagcatgttgtgcatttaagaattgtgttgcgcgtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgcgtg 17925591  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17925590 aagtgagtttccttggtcatgtgatttcgaagggtggtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgctgtgggaatcacctaagtctgtttt 17925491  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     ||  ||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17925490 cgaggttagaagttttcttggattagcaggttattatcagaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 17925419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13458275 - 13457807
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  13458275 atcattagattagagtgaaggcgaaagatatatccgaaaccgtgttccgaacaaggtatggacactatgagtattttgtgatgtcatttggagtatccaa 13458176  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |    
T  13458175 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaacattccatccttttcaggatcgttttgtggtggtgtttatcgatgatattttggtgtattcgagg 13458076  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13458075 tcagaggaggagtatgctgagcatttgaggattgtgttgcgtgtcttgaaagagaatcatttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcggg 13457976  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  13457975 aagtgagtttccttgatcatgtgatttcgaaggatggtattgtcgtggatccatcgaaggttgatgcagtgttgcagttggaatcacctaagtctatttt 13457876  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  13457875 tgagattagaagctttcttggattggcatattattatcggaggttgattgagggattctctgagttggc 13457807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 477
Target Start/End: Original strand, 15716950 - 15717399
Alignment:
Q  28 aaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtcttta 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||| |||  ||||||| |    
T  15716950 aaggcggaggatatatccaaaactgcgttccgaactagatatggtcactatgaatattctgtaatgccatttggtctaactaatgtgcctagtgtcttca 15717049  T
Q  128 tggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgc 227  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15717050 tggaatatatgaatagaatattccatccttttctggaccagtttttggtagtgtttatagacgatatcttggtttattcaatgtcggaggaggagcatgc 15717149  T
Q  228 tgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggt 327  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||   |||||| |||||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  15717150 tgaacattttaggaccgtgttgcagaccttgaaggagaagaagttgtttgctaatttgtcgaagtgtgagttttgattgcaggaagtgagttttcttggt 15717249  T
Q  328 catgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttc 427  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||| || |    
T  15717250 catgtgatttcaaagggcggtattgtggtggatccgtcgaaagttgatgtagtgttacagtgggagactctgaagtctgtttttgagatcagaagtttac 15717349  T
Q  428 ttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttg 477  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  15717350 ttagtttggcgggttattaccggaggtttattgaatgattctctaagttg 15717399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14938341 - 14938115
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14938341 ttgaaagacaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtattttcg 14938242  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14938241 tggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggattggcaggttattatcggaggtt 14938142  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     || || ||||||||||||||||||||    
T  14938141 tattgaaggattctctaagttggcgtt 14938115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15365934 - 15365708
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  15365934 ttgaaagacaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtattttcg 15365835  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15365834 tggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggattggcaggttattatcggaggtt 15365735  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     || || ||||||||||||||||||||    
T  15365734 tattgaaggattctctaagttggcgtt 15365708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 478
Target Start/End: Original strand, 17143354 - 17143760
Alignment:
Q  59 gaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatcctta 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17143354 gaacgaggtatggacactatgaatattctgcgatgtcatttggtgtgactaatacgcccggtgtcttcatggaatatatgaatagaatcttccatcctta 17143453  T
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    | |||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||     |||    
T  17143454 tttggatcagtttgtggtggtgtttatagacgatatcttggtgtattcgaagtcagaggaggatcatgcggagcatatgaggattgtgttgcgtacgttg 17143553  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    || |||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||             |||| ||  | ||||    
T  17143554 aaggagaagaagttgtttgataagttgtcgaagtgtgagttttggttgcgtgaagggagtttccttggtcat-------------gtggaatagcggtgg 17143640  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||| ||  |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17143641 atccgtctaaggttgatgtagtgttgcagtgggagactctgaagtctatttttgagattataaattttctttgtttggcgggttattattggaagttcat 17143740  T
Q  459 cgagggattctctaagttgg 478  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  17143741 tgaaggattttctaagttgg 17143760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13379123 - 13378969
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13379123 atcatcagatcagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacact--gagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 13379026  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccg 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13379025 tgcgccaggtgtcttcatgaaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccg 13378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 339
Target Start/End: Original strand, 48813338 - 48813609
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| | || |    
T  48813338 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatc 48813437  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||    
T  48813438 gcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaa 48813537  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
      |||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  48813538 gaagttatatgccaa-ttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttct 48813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19614820 - 19614451
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  19614820 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 19614721  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  19614720 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 19614621  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  19614620 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 19614521  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19614520 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 19614451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 446
Target Start/End: Original strand, 11770430 - 11770706
Alignment:
Q  170 ttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacca 269  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  11770430 ttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 11770529  T
Q  270 gttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaag 369  Q
    ||| | ||  || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || ||     
T  11770530 gttatatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccatctaaa 11770629  T
Q  370 gttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || ||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  11770630 gttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaaactttttgggtttggctggttatta 11770706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20748755 - 20748386
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  20748755 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 20748656  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||     
T  20748655 taagactgatgaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggtta 20748556  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||  |||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  20748555 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatctaaaattgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcag 20748456  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||   || |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  20748455 ttacagagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 20748386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 355 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13355045 - 13354924
Alignment:
Q  355 gtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggt 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  13355045 gtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttttgagatcagaaactttcttggattagcaggttattatcgaaggt 13354946  T
Q  455 tcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  13354945 tcattgagggattcactaagtt 13354924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Original strand, 11551299 - 11551546
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  11551299 gtgttcatcgatgatattttgatttattccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 11551398  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  11551399 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 11551498  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  11551499 ggtatcgcaatgggagactcctaagtccgttacggagattagaagctt 11551546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12689572 - 12689309
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  12689572 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 12689473  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || || ||||| || ||    
T  12689472 aattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaaagttgaagcggt 12689373  T
Q  381 gttgcagt-gggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     | ||| | ||||| |||||||||| |||   || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  12689372 atcgcaatggggagactcctaagtccgttacagagattagaagcttcttgggtttagccggtta 12689309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 14262349 - 14262717
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  14262349 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 14262448  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     | | |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  14262449 ta-gactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggtta 14262547  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||   |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| || || |    
T  14262548 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctagtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaaatcag 14262647  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||   || |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  14262648 ttacagagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 14262717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19149356 - 19148987
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  19149356 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 19149257  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||     
T  19149256 taagactgatgaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggtta 19149157  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||  |||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  19149156 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatctaaaattgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcag 19149057  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||   || |||||||| |||||| |||||||  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  19149056 ttacagagattagaag-tttcttgggtttggttggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 19148987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 380
Target Start/End: Original strand, 11386533 - 11386806
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||| ||| ||||||  | || ||||||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  11386533 ctaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattc 11386632  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||     
T  11386633 taagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggtta 11386732  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    |  ||||||||||| || || ||  | ||||||    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  11386733 agtgaagtgagttttctcggccacattatttctggtagtggtattgctgttgatccttcgaaagttgatgcagt 11386806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14139824 - 14139592
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || |||||||||||| | |||||    
T  14139824 ctaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattc 14139725  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |     
T  14139724 taagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggcta 14139625  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  14139624 agtgaagtaagtttccttggtcatattatttct 14139592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14956627 - 14956380
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| |||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  14956627 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 14956528  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  14956527 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 14956428  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  14956427 ggtatcgcaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 14956380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 11235401 - 11235662
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  11235401 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 11235500  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  11235501 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 11235600  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  11235601 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 11235662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 449
Target Start/End: Original strand, 23503974 - 23504316
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  23503974 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 23504073  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||  |||| || |||||||||||| |     
T  23504074 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggcta 23504173  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  23504174 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcagtcgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 23504273  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcg 449  Q
    |   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  23504274 tgactgaaataagaagcttcttgggtttggctggttattatcg 23504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 49154446 - 49154074
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  49154446 ctaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 49154347  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  49154346 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 49154247  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  49154246 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 49154147  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  49154146 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 49154074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 12204904 - 12205123
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    | |||||| ||||| || |||||||| ||  | ||||     
T  12204904 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattt 12205003  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||     
T  12205004 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtta 12205103  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  12205104 agtgaagtaagttttcttgg 12205123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13023502 - 13023151
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | || |||||  |||| || ||| ||| ||||||    |||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||    
T  13023502 ctaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataatttgatttattc 13023403  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||     
T  13023402 taagactgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttgtggtta 13023303  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || |||||  | ||||||    |||||||| |  | ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||||||    
T  13023302 agtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcatttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtctg 13023203  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   |||||| ||||||||| | |||||| | | |||||| || ||||||||    
T  13023202 taactgaaatcagaagctttttgggtttgtctgtttattaccgcaggttcat 13023151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 13966772 - 13967123
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  13966772 ctaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 13966871  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  13966872 caagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 13966971  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | |||||| |||| || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  13966972 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatacttcgaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcgg 13967071  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13967072 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 13967123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8709683 - 8709426
Alignment:
Q  173 tggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagtt 272  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || |    
T  8709683 tggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagct 8709584  T
Q  273 gtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggtt 372  Q
     | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| ||||| |||    
T  8709583 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtccaaagtt 8709484  T
Q  373 gatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
    || || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8709483 gaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 8709426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14334478 - 14334171
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  14334478 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 14334379  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  14334378 aactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 14334279  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||| ||||| |||   || |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  14334278 agttgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttacagagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 14334180  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  14334179 ttctaagtt 14334171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 340
Target Start/End: Original strand, 15122170 - 15122384
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15122170 tttatggaatacatgaataggatttttcgtctttatttggattagtttgtggtcgtgttcatataagatatcttggtgtattcaaagttggaggaggagc 15122269  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
     ||| |||||| |||| |||||||||| || |||  | |||||  |||||| ||  ||| |||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  15122270 ttgcggagcatatgagaattgtgttgc-agactt-taggagaataagttgtatgttaaggtgtcgaagtgtgagttctagttgcaagaagtgagtttcct 15122367  T
Q  324 tggtcatgtgatttcta 340  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  15122368 tggtcatatgatatcta 15122384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15626669 - 15626437
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||| ||||| | || || || ||||| | |||||| |||||||||||  | || |     
T  15626669 ctaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatacta 15626570  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  15626569 taagtctgaagaagaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 15626470  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  15626469 aatgaggtgagtttccttggccatattatttct 15626437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 16070461 - 16070768
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |  | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||| ||      
T  16070461 tttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcatgcagagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaga 16070560  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| || |||||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||    
T  16070561 agttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgggtcatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaa 16070660  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  16070661 agttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggatt 16070759  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     || |||||    
T  16070760 ttcgaagtt 16070768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 15159245 - 15159415
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  15159245 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 15159344  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  15159345 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 15159415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 467
Target Start/End: Original strand, 18052057 - 18052417
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||| ||| || | |||||    
T  18052057 ctaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattc 18052156  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||  |||| || |||||||||||| |     
T  18052157 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggcta 18052256  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  18052257 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtataacggttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 18052356  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    |   |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  18052357 tgactgaaatcagaag-tttcttgggcttggctggttattatcgtagattcatagaaggatt 18052417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13675597 - 13675385
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    |||||||| || || || ||||| ||| || | |||||    
T  13675597 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattctgatttattc 13675498  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  13675497 aaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 13675398  T
Q  307 aaggaagtgagtt 319  Q
    |  ||||||||||    
T  13675397 agtgaagtgagtt 13675385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 26116694 - 26117045
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    ||| | |||||||| || || ||||||||  | |||||    
T  26116694 ctaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatattttaatctattc 26116793  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  26116794 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtta 26116893  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | |||| |    ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||  ||||| |    
T  26116894 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttttggtagtgatattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacagtgggagactctgaagtcgg 26116993  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  26116994 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 26117045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 15100707 - 15101076
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    || ||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  15100707 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 15100806  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||| || |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||     
T  15100807 taagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 15100906  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||  |||||||||| |  || |||||| | || ||||| |    
T  15100907 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaaattgatgcagtatcacaatgggagaccccgaagtcag 15101006  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15101007 tgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatcgagggattttcgaagtt 15101076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Original strand, 15147085 - 15147243
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  15147085 ttcattgatgatatttttatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaa 15147184  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15147185 aattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 15147243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 44789539 - 44789800
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||  |||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  44789539 tttgtggttatgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaaga 44789638  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| | |||||||| || ||    
T  44789639 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgcagtggatccgtctaa 44789738  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44789739 agttgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttactgagattagaag-tttcttgg 44789800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 337
Target Start/End: Original strand, 15559 - 15706
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||    
T  15559 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 15658  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  15659 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttattt 15706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 320
Target Start/End: Original strand, 16948576 - 16948789
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||  |||| || ||| ||| ||||||    |||||||| ||||| || ||||||||| || | |||||    
T  16948576 ctaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattc 16948675  T
Q  207 -aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     ||| || || || ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  16948676 taaaatc-gaagaggagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggtt 16948774  T
Q  306 gaaggaagtgagttt 320  Q
     |  |||||||||||    
T  16948775 aagtgaagtgagttt 16948789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Original strand, 26092902 - 26093124
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  26092902 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 26093001  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  26093002 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 26093101  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtca 329  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  26093102 aatgaagtaagttttctgggtca 26093124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10872782 - 10872537
Alignment:
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||    
T  10872782 tctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttg 10872683  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    ||||||||  |  | | | | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | ||||    
T  10872682 aaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtgg 10872583  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    |||| || || ||||| ||  | |  ||||||||| ||||||||||    
T  10872582 atccgtctaaagttgaagcgatatcacagtgggagactcctaagtc 10872537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 39178 - 39402
Alignment:
Q  13 catcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatg 112  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||||||||  || ||||| ||| ||||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |    
T  39178 catcagatacgagtgaagtcggaagatatattgaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacg 39277  T
Q  113 cgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtc 212  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || |  || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  39278 cgccaggagtttttatggagtatatgaacagaattttccatccatatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttggtgtactctaaatc 39377  T
Q  213 tgaggaagagcatgctgagcatttg 237  Q
     ||||| || ||||| || ||||||    
T  39378 agaggaggaacatgcagaacatttg 39402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15342463 - 15342204
Alignment:
Q  220 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtt 319  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  15342463 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 15342364  T
Q  320 tccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattag 419  Q
    | ||||| ||  | ||||||    ||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||    || || ||    
T  15342363 ttcttggccacattatttctggtagtggtattgttgttgatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgacagagatcag 15342264  T
Q  420 aagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15342263 aagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgaaggattttcgaagttggc 15342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Original strand, 11301317 - 11301539
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  11301317 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 11301416  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||| | |||||     
T  11301417 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagatctggtta 11301516  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtca 329  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  11301517 aatgaagtaagttttctgggtca 11301539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14041765 - 14041499
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  14041765 ttcattgatgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgcta 14041666  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | || || |||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| | | ||    |||||||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  14041665 aattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgagttttcttggacatgttactactggtagtggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcagt 14041566  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
     | | | |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| | |||||||    
T  14041565 atcgaaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctgattattat 14041499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Original strand, 14284542 - 14284852
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||| || |||||| | || ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||      
T  14284542 tttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagactgaagaggagcatacagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaaga 14284641  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || ||| ||| |||||||| || |||||||| | ||| |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| || | |||||||| ||    
T  14284642 agctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcttttgatccttcaaa 14284741  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||    || || ||||||||  | |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||     
T  14284742 agttgatgcagtatcacaatgggaggctccgaagtcagtgacagagatcagaagcttcttgggtttggctggttattactgcaggttcattgagggtttt 14284841  T
Q  469 tctaagttggc 479  Q
    || ||||||||    
T  14284842 tcaaagttggc 14284852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14351795 - 14351529
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  14351795 ttcattgatgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgcta 14351696  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | || || |||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| | | ||    |||||||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  14351695 aattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgagttttcttggacatgttactactggtagtggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcagt 14351596  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
     | | | |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| | |||||||    
T  14351595 atcgaaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctgattattat 14351529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23649734 - 23649629
Alignment:
Q  374 atgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaa 473  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| || || ||||| | |||    
T  23649734 atgcagtgttgtagtgggagacttcgaagtctgtttttgagatcataagttttcttggtttggagggttattaccggaggtttattgaaggattttttaa 23649635  T
Q  474 gttggc 479  Q
    ||||||    
T  23649634 gttggc 23649629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13688123 - 13688026
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  13688123 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 13688026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12458714 - 12458587
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||| |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| ||    
T  12458714 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatg 12458615  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||    
T  12458614 caaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 12458587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8200596 - 8200449
Alignment:
Q  283 ttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgt 382  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |    
T  8200596 ttgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtat 8200497  T
Q  383 tgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8200496 cgcaatgggatactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 8200449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 18588359 - 18588435
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgt 245  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18588359 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 18588435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 16380539 - 16381010
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380539 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16380638  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380639 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16380738  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380739 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16380838  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380839 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 16380938  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16380939 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 16381010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 16648135 - 16648606
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648135 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16648234  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648235 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16648334  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648335 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16648434  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648435 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggacccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 16648534  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16648535 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 16648606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 1646980 - 1647451
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646980 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 1647079  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1647080 tgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcgaag 1647179  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647180 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 1647279  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647280 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 1647379  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1647380 tgagattagaagctttcttggtttggccagttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 1647451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23998363 - 23997892
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23998363 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 23998264  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23998263 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaaag 23998164  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23998163 tccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttggagg 23998064  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23998063 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttacagtgggagtctcctaagtctgtttt 23997964  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23997963 tgagattagaagctttcttggtttggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 23997892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16100130 - 16099653
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  16100130 atcatcagattatagtgaaggcggaagatatatccaaaacatcgttacgaacgaggtatggacactatgagtattatgtaatgccatttggagtgtctaa 16100031  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttat------ggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtat 204  Q
    || |||||||||||||||      ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16100030 tgtgccaggtgtctttatctttatggagtatatgaatagaatatttcatccatatttggaccgttttgtggtggtgtttatagatgataatttggtgtat 16099931  T
Q  205 tcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggt 304  Q
    || |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16099930 tcgaagtctaaggaggagcacgctgagcatttaaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggt 16099831  T
Q  305 tgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16099830 tgcaggaagtgaatttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtc 16099731  T
Q  405 tgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16099730 tatttttgagattagaagctttcttggttttgcaggttattatcggaggttcattgatggattctctaagttggcgtt 16099653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14130584 - 14130113
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  14130584 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggatactatgagtattatgtgatgtcatttggattatccaa 14130485  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    || || ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  14130484 tgtgctaggtgtcttcatggaatatatgaatagaacatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttagagatgatattttggtgtattcgaag 14130385  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14130384 tttgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttacgagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgag 14130285  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||    
T  14130284 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtatttctgtggatccgttgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagattttttt 14130185  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14130184 tgagattataagctttcttggattagcaggttattatcggaggttcattgagggattttctaagttagcgtt 14130113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 23025912 - 23026362
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  23025912 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactacgtctcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatat-- 23026009  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
                       ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  23026010 -------------------gaatatatgaatagaatatttcatccttttatgaaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtatttgaag 23026090  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23026091 tctgaggaggagcatgcttcgcatttgaggattgtgttgcgagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcggg 23026190  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  23026191 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttgatgtatagttgcagtgggaatcacctaagtctatttt 23026290  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  23026291 tgagattagaagctttcttggactggcaggctattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggcgtt 23026362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 194 - 482
Target Start/End: Original strand, 18836257 - 18836545
Alignment:
Q  194 ttttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtg 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18836257 ttttggtgtattcaaaatctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttggaagagaaccagttatgtgctaagttatctaagtg 18836356  T
Q  294 tgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggag 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  18836357 tgagttttggttgaagggagtgagcttccttggtcacgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaa 18836456  T
Q  394 tctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18836457 tctcctaagtctgtttttgagattataagttttcttggattggcgggttactatcagaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 18836545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 234 - 482
Target Start/End: Original strand, 19985805 - 19986053
Alignment:
Q  234 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19985805 tttgaggattgtgttgcaggtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagcgagttttcttggtcatgtg 19985904  T
Q  334 atttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  19985905 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttttgggtt 19986004  T
Q  434 tggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19986005 tggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 19986053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 234 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18578101 - 18577853
Alignment:
Q  234 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18578101 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccaattatgtgctaagttgtctaagtatgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 18578002  T
Q  334 atttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18578001 atttctaagggtggtatttctgcagatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagactgattttgagattagaagttttcttggtt 18577902  T
Q  434 tggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18577901 tagcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 18577853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16234898 - 16234672
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234898 ttgaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagggagtttcctgggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 16234799  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234798 tggatcctcctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttattggtttggccggttattatcggaggtt 16234699  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16234698 cattgagggattctctaagttggcgtt 16234672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21929074 - 21928849
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  21929074 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttgcgggaagggagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgtca 21928975  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| | ||| ||| |||   |||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21928974 tggatccgt-caaagttaatgtcatgttacagtgggaatcacctaagtcaatttttgagatcaaaagctttcttggattggcaggttattatcggaggtt 21928876  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21928875 cattaagggattctctaagttggcgtt 21928849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23080471 - 23080116
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| |    
T  23080471 tttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaac 23080372  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |  | | ||| || || || |||| ||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23080371 atgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttcct 23080272  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| |||| |    |||||||| | || ||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||    
T  23080271 tggccatgttatttttggtagtggtattgcagtagatccctctaaagttgatgtagtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagaaattagaagc 23080172  T
Q  424 tttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| | |||||||| ||||||||  | || || || || |||||||| ||||||||    
T  23080171 tttttgggtttggctggttattacagaagatttatagaaggattctccaagttggc 23080116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19881317 - 19880948
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |||||| |||| |||||    |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  19881317 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattc 19881218  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |  ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  19881217 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggtta 19881118  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  19881117 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccaaagtcgg 19881018  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||    
T  19881017 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggccggttattaccgcaggtttattgaggtattctcaaagtt 19880948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 476
Target Start/End: Original strand, 34643868 - 34644217
Alignment:
Q  127 atggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatg 226  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||| |   | |||||||||||||    
T  34643868 atggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcatg 34643967  T
Q  227 ctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    | || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  34643968 cagaacatctaagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttgg 34644067  T
Q  327 tcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
     ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||    || || ||||| |||    
T  34644068 ccatattatttctggaagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccaaagtcagtgacggagatcagaag-ttt 34644166  T
Q  427 ctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  34644167 cttgggtttagctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 34644217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 476
Target Start/End: Original strand, 18196049 - 18196364
Alignment:
Q  161 tggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaa 260  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || || ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||    
T  18196049 tggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaa 18196148  T
Q  261 agagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggat 360  Q
    ||||||  || | | ||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||     ||||||| | || |||    
T  18196149 agagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttatttctggtaatggtattgcggtagat 18196248  T
Q  361 ccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcg 460  Q
    || || || ||||||||| | | ||| |||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  18196249 ccatctaaagttgatgcaatatcgcaatgggagactcataagtcggttatagaaattagaagctttttgggtttggcaggttattaccgcaggtttatag 18196348  T
Q  461 agggattctctaagtt 476  Q
    | ||||| || |||||    
T  18196349 aaggattttccaagtt 18196364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Original strand, 18406166 - 18406545
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||| || || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  18406166 tatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatc 18406265  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| |||||||||||    
T  18406266 gttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaa 18406365  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      |  | | ||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||     
T  18406366 gaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtcg 18406465  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18406466 aaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttactgagattagaagcttttttggattggctggttatta 18406545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 339
Target Start/End: Original strand, 22828690 - 22828849
Alignment:
Q  180 gttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcc 279  Q
    |||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||||    
T  22828690 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcc 22828789  T
Q  280 aagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22828790 aaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttct 22828849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 24294106 - 24294367
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  24294106 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 24294205  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||  | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  24294206 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctagtgatggaattgcagtggatccgtctaa 24294305  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24294306 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 24294367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 425
Target Start/End: Original strand, 20634219 - 20634520
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||| | ||||| |    
T  20634219 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctaaagaagaac 20634318  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||    
T  20634319 atgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttct 20634418  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  20634419 tggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcggtattgcaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagc 20634518  T
Q  424 tt 425  Q
    ||    
T  20634519 tt 20634520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Original strand, 23085993 - 23086180
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||| |||| |    
T  23085993 tatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatc 23086092  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 254  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23086093 gcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtatgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagt 23086180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24366431 - 24366080
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  24366431 ctaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 24366332  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  24366331 caagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 24366232  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | || |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||| || || |    
T  24366231 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtagatccttcaaaggttgatgcggtatcacagtgggagactccgaaatcgg 24366132  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24366131 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 24366080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Original strand, 2873127 - 2873296
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||  |||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||      
T  2873127 tttgtggttatgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaaga 2873226  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2873227 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 14378178 - 14378550
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| ||| ||||||    |||||||| || || || ||||||| | || | |||||    
T  14378178 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattc 14378277  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||     
T  14378278 taagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggtta 14378377  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    || ||||| | || ||||| |  || ||||||||||| |  || |||||| | || ||||| |    
T  14378378 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagttgtattgcagttgatccattgaaagttgatgcagtatcacaatgggagaccccgaagtcag 14378477  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14378478 tgactgagatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttatcgagggattttcgaagttggc 14378550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 14379728 - 14380100
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| ||| ||||||    |||||||| || || || ||||||| | || | |||||    
T  14379728 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattc 14379827  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||     
T  14379828 taagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggtta 14379927  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    || ||||| | || ||||| |  || ||||||||||| |  || |||||| | || ||||| |    
T  14379928 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagttgtattgcagttgatccattgaaagttgatgcagtatcacaatgggagaccccgaagtcag 14380027  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14380028 tgactgagatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttatcgagggattttcgaagttggc 14380100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 339
Target Start/End: Original strand, 18965629 - 18965789
Alignment:
Q  179 tgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgc 278  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||  |||| | |||    
T  18965629 tgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttttcaagtgatgaaagagaagaagttatatgc 18965728  T
Q  279 caagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  18965729 taagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttct 18965789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 446
Target Start/End: Original strand, 22760798 - 22761056
Alignment:
Q  188 atgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtc 287  Q
    ||||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||| |||||||||||  || | | ||| || |||||    
T  22760798 atgatattttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtc 22760897  T
Q  288 taagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcag 387  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |    |||||||| | || ||||  || || ||||| ||| | | |||     
T  22760898 taagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttgtggtagtggtattgcagtagatctgtctaaagttgaagcaatatcgcaa 22760997  T
Q  388 tgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  22760998 tgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggattggctggttatta 22761056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25114499 - 25114253
Alignment:
Q  179 tgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgc 278  Q
    ||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||     
T  25114499 tgttcatcgatgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgt 25114400  T
Q  279 caagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgca 378  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||   || ||||||| | |||||||| || || ||||| ||     
T  25114399 caaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttccggggatggtattgccgtggatccgtctaaagttgaagcg 25114300  T
Q  379 gtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  25114299 gtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 25114253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18796709 - 18796496
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||||||    |||||||| || ||||| ||| | |||||| | |||||    
T  18796709 ctaatgtgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattc 18796610  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  18796609 tagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 18796510  T
Q  307 aaggaagtgagttt 320  Q
    || |||||||||||    
T  18796509 aatgaagtgagttt 18796496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 5837543 - 5837850
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || ||||| || || ||| || | ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| ||      
T  5837543 tttgtggttgtcttcattgacgacattctgatttattccaagactgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaaga 5837642  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||||     ||||||| | || ||||| || ||    
T  5837643 agctttatgccaagttgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttctggtaatggtattgcagtcgatccgtctaa 5837742  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     ||||| || || | | | |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||  | || ||||| ||||||||     
T  5837743 agttgaagcggtatcgtaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggtttggcgggttactacagaagattcatagagggattt 5837842  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    || |||||    
T  5837843 tccaagtt 5837850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Original strand, 16925965 - 16926132
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |      
T  16925965 gtggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaac 16926064  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16926065 tttatgccaagttatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttct 16926132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 458
Target Start/End: Original strand, 10467173 - 10467462
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| |  | ||||| |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||      
T  10467173 tttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaaga 10467272  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
     ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||  | |||||| |  |||||||| | || ||||| || ||    
T  10467273 ggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaagtgagttttctgggtcacattatttctgatagtggtattgcagttgatccatcaaa 10467372  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
     ||||||||||| |  || |||||| |||| || || ||   |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  10467373 agttgatgcagtatcacaatgggagactccgaaatcagtaactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggttcat 10467462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Original strand, 14643664 - 14643817
Alignment:
Q  22 agagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtg 121  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||  || ||||||  ||||    
T  14643664 agagtgaagacggaggatatttccaagactgcattccgaactagatatggacact--ga-tattctgtgatgccatttggtgttactgatgcgcatggtg 14643760  T
Q  122 tctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtgg 178  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  14643761 tcttcatggaatatatgaatagaatcttccatccttatttggatcagtttgtggtgg 14643817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 476
Target Start/End: Original strand, 27564160 - 27564462
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |      
T  27564160 gtggttgtgttcatcgatgaaattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaac 27564259  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || |  |     
T  27564260 tttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtcta--gc 27564357  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    ||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||| | || || || || ||||| |||    
T  27564358 tgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttactgagattagaagcttcttgggtttagctggttattatagaagatttattgaaggattttct 27564457  T
Q  472 aagtt 476  Q
    |||||    
T  27564458 aagtt 27564462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 28261530 - 28261690
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  28261530 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 28261629  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  28261630 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28284386 - 28284226
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  28284386 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 28284287  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  28284286 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 28340279 - 28340439
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  28340279 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 28340378  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  28340379 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 426
Target Start/End: Original strand, 25608203 - 25608442
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  25608203 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 25608302  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| || || |||||    
T  25608303 caaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcggtattgca 25608402  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
     |||||| || ||||||| |||   || ||||||||||||    
T  25608403 atgggagactactaagtcggttacggagattagaagcttt 25608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19454981 - 19454824
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||| | ||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||| |||||||| ||      
T  19454981 tttgtggttgtatttattgatgacatcttgatttattcaaagactaaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaaga 19454882  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||    
T  19454881 agttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 19454824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 339
Target Start/End: Original strand, 19487504 - 19487766
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||          | ||||| |||| |    
T  19487504 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaata----------tgcttatttggatc 19487593  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | |||||||| || || || ||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  19487594 ggtttgtggttgtttttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggtaaa 19487693  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
      |||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  19487694 gaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 19487766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25769863 - 25769491
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| |||||| |||    |||||||| ||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  25769863 ctaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattc 25769764  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |   |||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||     
T  25769763 taagtatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaattctggtta 25769664  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  25769663 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 25769564  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||    | |||||||| || ||  ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  25769563 ttacaaagattagaagtttcctaagtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagttggc 25769491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15461293 - 15460983
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||  |||| || || || || || || |||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  15461293 tttgtggtggtgtttatagatgatattctgatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 15461194  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||     ||||||  | || |||||||| ||    
T  15461193 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgatttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtaatggtatagcggttgatccttcgaa 15461094  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| ||   |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||    
T  15461093 agttgatgcagtatctcagtgggaaactccgaagtcggtaactgaaattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtagattcatagaaggatt 15460995  T
Q  468 ctctaagttggc 479  Q
     || ||||||||    
T  15460994 ttcaaagttggc 15460983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Original strand, 16961809 - 16961976
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |      
T  16961809 gtggttgttttcattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaac 16961908  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | | ||||||||  ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16961909 tttatgccaagtcatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttct 16961976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 329
Target Start/End: Original strand, 28281075 - 28281297
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||| ||| || | |||||    
T  28281075 ctaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattc 28281174  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| | ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||  |||| || ||||| |||||| |     
T  28281175 gaagactgaaggagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggcta 28281274  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtca 329  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  28281275 agtgaagtgagtttccttggtca 28281297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18450547 - 18450226
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    |||| ||||||||| || || ||  |||||||||  || || ||||||||||| || ||  | || |||||| ||||||| || |||||||| || ||||    
T  18450547 tattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtatttatggaatatattaaccgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgt 18450448  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | |||||||||||| || | || || || |   |||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| | |||  |||| | ||||||    
T  18450447 ttatagatgatattctgatatactctaaattcaaggaggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaa 18450348  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtg 381  Q
    ||| || ||||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||     ||||||| |||| || || || ||||||||||| ||     
T  18450347 gttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttggtcatattatttctggtaatggtattgctgtagacccatctaaggttgatgcggta 18450248  T
Q  382 ttgcagtgggagtctcctaagt 403  Q
    ||||| |||||| |||| ||||    
T  18450247 ttgcaatgggagactccgaagt 18450226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27189350 - 27189119
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  27189350 ctgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaaga 27189251  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || || || | ||| |||||  | |||||||| |||  |    
T  27189250 agtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagctgtatcgcaatgggatacccctaagtccgttact 27189151  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
    || |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27189150 gagattagaagctttttgggtctggccggtta 27189119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 27259890 - 27260121
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  27259890 ctgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaaga 27259989  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || || || | ||| |||||  | |||||||| |||  |    
T  27259990 agtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagctgtatcgcaatgggatacccctaagtccgttact 27260089  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
    || |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27260090 gagattagaagctttttgggtctggccggtta 27260121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 479
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295840
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || || | ||| ||||| |  ||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||| ||||| ||||| ||  | ||||||     ||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttctggtaatggtatagcagttgatccatcaaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtaact 5295772  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  5295773 gaaatcagatgctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 5295840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 479
Target Start/End: Original strand, 21568490 - 21568625
Alignment:
Q  344 gtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
    ||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||    
T  21568490 gtggtattgttgttgatccttcgaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcggtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggtta 21568589  T
Q  444 ttatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21568590 ttaccgcaggttcattgaggggttttcgaagttggc 21568625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19866644 - 19866474
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| | || || ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  19866644 tttgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaaga 19866545  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  | | ||| ||  | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19866544 aactttatgctaaactatctaagcgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 19866474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19436916 - 19436808
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |  | ||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||    
T  19436916 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctgcttaagtga 19436817  T
Q  312 agtgagttt 320  Q
    |||||||||    
T  19436816 agtgagttt 19436808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30139686 - 30139215
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139686 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 30139587  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139586 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 30139487  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139486 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 30139387  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139386 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 30139287  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30139286 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 30139215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30149237 - 30148766
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149237 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 30149138  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149137 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 30149038  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149037 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 30148938  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30148937 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 30148838  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30148837 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 30148766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 8272659 - 8273130
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272659 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 8272758  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272759 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 8272858  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272859 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 8272958  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272959 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 8273058  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8273059 tgagattagaagctttcttggtttggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 8273130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15611983 - 15611512
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611983 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15611884  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15611883 tgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 15611784  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15611783 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaagg 15611684  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611683 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 15611584  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15611583 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 15611512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 13965612 - 13966084
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13965612 atcatcagattagagtaaaggcggtagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 13965711  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13965712 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 13965811  T
Q  211 tctgaggaaga-gcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaag 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13965812 tctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttgaag 13965911  T
Q  310 gaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965912 gaagtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttt 13966011  T
Q  410 ttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13966012 ttgagattagaagctgtcttggtttggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 13966084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25768198 - 25767727
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25768198 atcatcagattagagtgaaagcagatgatatatccaaaaccgcgttccaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattcggagtatctaa 25768099  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25768098 ttcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcaaaa 25767999  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767998 tctgagaaggagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 25767899  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25767898 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctcagggtggtatttatgtggatccttcgaaagttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 25767799  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25767798 tgagattagaagttttcttggtttagcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 25767727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 6151113 - 6151584
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6151113 atcatcagattagagtgaaggcagaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 6151212  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  6151213 tgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaaa 6151312  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6151313 tctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagttttggttgaagg 6151412  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6151413 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaagatcgatgcagtgttgcaatgggagtctcctaaatctgtttt 6151512  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6151513 cgagattagaaattttcttggtttggcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 6151584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Original strand, 15948730 - 15949036
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15948730 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatttggagtatccaa 15948829  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15948830 tgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcgaag 15948929  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15948930 tctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttgaagg 15949029  T
Q  311 aagtgag 317  Q
    |||||||    
T  15949030 aagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12795871 - 12795645
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12795871 ttgaaagagaaccaattgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtcttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtagtatttctg 12795772  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12795771 tggatccttctaaggttgatgcagtgttacagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 12795672  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12795671 cattgagggattctctaagttggcgtt 12795645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 260 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16258774 - 16258552
Alignment:
Q  260 aagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgga 359  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16258774 aagagaatcagttgtgtgcaaagttgtctaagtgcgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttacgtgga 16258675  T
Q  360 tccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatc 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16258674 tccttctaaggttgatgcagtgttacagtgggaatctcctaagtctgtttttgaggttagaagctttcttggtttggcaggttactatcggaggttcatt 16258575  T
Q  460 gagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16258574 gagggattctctaagttggcgtt 16258552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18915361 - 18915135
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18915361 ttgaaggagaactagttatgtgctaagttgtccaagtgtgaattttggttgaaggaagtaagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 18915262  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18915261 ttgatccttccaaggttgatgtagtgttgcaatgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggccggttattatcgaaggtt 18915162  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18915161 cattgagggattctctaagttggcgtt 18915135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Original strand, 55514237 - 55514463
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  55514237 ttgaaggagaatcatttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatctccg 55514336  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  55514337 tggatccatcaaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttttgagataagaaactttcttggtttatcaggttattatcagaggtt 55514436  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  55514437 cattgaggaattctctaatttggcgtt 55514463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 482
Target Start/End: Original strand, 6710865 - 6711144
Alignment:
Q  199 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6710865 gtgtattcaaagtcagaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcgtgttttgaaggagaatcagttgtttgctaagttgtctaagtgtgagt 6710964  T
Q  299 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcc 398  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6710965 tttggttttgggaagtgagtttccttggttatgtgatttcgaaagggtgtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacc 6711064  T
Q  399 taagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
        ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6711065 ----tctgttttttaggttagaagctttcttggattgacaagttagtatcggaggtttatggagggattctctaagttggcgtt 6711144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 280 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18751554 - 18751352
Alignment:
Q  280 aagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcag 379  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | |    
T  18751554 aagttgtcgaagtgtgagtttttgttgcgggaagtgagtttcctttgtcatgtgatttctaagggtggtatctctgtggatccgttgaaggttgataccg 18751455  T
Q  380 tgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18751454 tgttgcagcgggaatcacctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggattggtaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggc 18751355  T
Q  480 gtt 482  Q
    |||    
T  18751354 gtt 18751352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14088457 - 14088088
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  14088457 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 14088358  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  14088357 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 14088258  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  14088257 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 14088158  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  14088157 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 14088088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15261402 - 15261065
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  15261402 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattcca 15261303  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  || | | ||| || ||||  |||||||| || ||||||||    
T  15261302 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaattctggttgaa 15261203  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||     ||||||| | || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  15261202 agaggtgagttttcttggccatgttatttctggtaatggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 15261103  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     | || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  15261102 atagagattagaagctttttgggtttagctggttatta 15261065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 13970465 - 13970834
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  13970465 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 13970564  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  13970565 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 13970664  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| | || ||||| |    
T  13970665 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagacgccgaagtcgg 13970764  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  13970765 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 13970834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 467
Target Start/End: Original strand, 11950253 - 11950613
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    || ||||| ||||| || ||||||||| || | |||||    
T  11950253 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattc 11950352  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  11950353 taagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 11950452  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||| | | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  11950453 agtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtagtgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 11950552  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    |   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11950553 tgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggatt 11950613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15340981 - 15340725
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||      
T  15340981 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaaga 15340882  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15340881 aactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattactgtggatccgtctaa 15340782  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     ||||| || || | | | |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  15340781 agttgaagcggtatcgaaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 15340725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 425
Target Start/End: Original strand, 15400935 - 15401191
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||      
T  15400935 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaaga 15401034  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15401035 aactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaa 15401134  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     ||||| || || | | | |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  15401135 agttgaagcggtatcgaaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 15401191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 15346663 - 15346970
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  15346663 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 15346762  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15346763 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaa 15346862  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||     
T  15346863 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattt 15346962  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  15346963 tctaagtt 15346970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 476
Target Start/End: Original strand, 12358967 - 12359241
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  12358967 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttct 12359066  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaa 401  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||    
T  12359067 ggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattacagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaa 12359166  T
Q  402 gtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  12359167 gtcagtgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtaggttcattgagggattttcgaagtt 12359241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28756102 - 28755751
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  28756102 ctaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 28756003  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  28756002 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 28755903  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  28755902 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 28755803  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28755802 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 28755751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17188158 - 17187885
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| ||||    |||||||| || ||||| ||||| ||| || | |||||    
T  17188158 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattc 17188059  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    || | |||||||||||||||| || ||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  17188058 aaggactgaggaagagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 17187959  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  17187958 agtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagtggatccgtcaaaagttgatgcagt 17187885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13254402 - 13254095
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  13254402 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 13254303  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  13254302 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 13254203  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  13254202 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 13254104  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  13254103 ttctaagtt 13254095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41179295 - 41178967
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | ||||| ||| |||| |    
T  41179295 ggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaag 41179196  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    |||||||| | || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| | |  ||||||||    
T  41179195 aagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgag 41179096  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
    ||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||||||     
T  41179095 tttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcggttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcggtgactgaaatc 41178996  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  41178995 agaagcttcttgggtttggctggttatta 41178967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 11959514 - 11959865
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||||    ||| | || ||||| || |||||||||||  | |||||    
T  11959514 ctaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatattttaatctattc 11959613  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||     
T  11959614 caagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaattctggtta 11959713  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || |||||  | |||| |    |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  11959714 agtgaagtgagttttctgggtcacattatttgtggtagtggtattgctgttgatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 11959813  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11959814 taactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattattgcaggttcat 11959865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 431
Target Start/End: Original strand, 15723307 - 15723613
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| || |||||| | || |||||| | | | |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  15723307 tttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 15723406  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  15723407 atgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 15723506  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
     || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||     
T  15723507 aggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag- 15723605  T
Q  424 tttcttgg 431  Q
    ||||||||    
T  15723606 tttcttgg 15723613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 476
Target Start/End: Original strand, 16379339 - 16379642
Alignment:
Q  173 tggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagtt 272  Q
    ||||||| || || ||||||||| || | ||||| ||| || | ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  16379339 tggtggtatttattgatgatattctgatttattctaagacttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagtt 16379438  T
Q  273 gtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggtt 372  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||   | |||||| || || ||||| || || |||    
T  16379439 gtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatatcagttgatccatcaaaagtt 16379538  T
Q  373 gatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctcta 472  Q
    |||||||| | ||| |||||  |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || || || || |||||||| || |    
T  16379539 gatgcagtatcgcaatgggatactccgaagtcggtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcagatttatagagggattttcaa 16379638  T
Q  473 agtt 476  Q
    ||||    
T  16379639 agtt 16379642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17491544 - 17491305
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||  | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  17491544 gatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgt 17491445  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||| ||| | |||    
T  17491444 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgatgtagtatcgca 17491345  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
     |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  17491344 atgggagactcctaagtcggttactgagattagaagcttt 17491305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6602439 - 6602174
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  6602439 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 6602340  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  6602339 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttctggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 6602240  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| || |||||    
T  6602239 tgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagctggtta 6602174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 15014072 - 15014481
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| |||| |    
T  15014072 tatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatc 15014171  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| |  | || || ||| | ||||| || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||  |||| |||||    
T  15014172 gatttgttgttgtgtttatagatgatattctaatatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcattgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaa 15014271  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      |||| | ||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     |||||||  ||| || || ||     
T  15014272 gaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttggccatattatttcttgtaatggtattgatgtagacccatct 15014371  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggat 466  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||| | |||||||  |||||||| || || || || |||||||    
T  15014372 aaggttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcggttaccgaagttagaagctttttgggtttggttggttattaccgaagatttattgagggat 15014471  T
Q  467 tctctaagtt 476  Q
    | || |||||    
T  15014472 tttccaagtt 15014481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 339
Target Start/End: Original strand, 20060462 - 20060642
Alignment:
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  20060462 tctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttg 20060561  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  20060562 aaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 20060642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 11889636 - 11889783
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||    
T  11889636 ctaatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactc 11889735  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 254  Q
     |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11889736 taagtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagt 11889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 476
Target Start/End: Original strand, 5423358 - 5423655
Alignment:
Q  179 tgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgc 278  Q
    ||||||| || ||||| ||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | |||    
T  5423358 tgttcatcgacgatatcttgatttactctaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgc 5423457  T
Q  279 caagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgca 378  Q
     || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||     
T  5423458 taaattgtctaagtgtgaattcttgttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagct 5423557  T
Q  379 gtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  5423558 gtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattttctaagtt 5423655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10385393 - 10385104
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||   |||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||      
T  10385393 tttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagggcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaaga 10385294  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
     ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||    
T  10385293 ggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaa 10385194  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    ||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  10385193 ggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcggtaactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 10385104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48427138 - 48426898
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  48427138 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 48427039  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  |||||    
T  48427038 agtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtg 48426939  T
Q  390 ggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  48426938 ggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 48426898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16693867 - 16693599
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| ||||| || |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  16693867 gtgtttatagacgaaattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 16693768  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  16693767 ctaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggtcatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 16693668  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     || | |||  ||||| ||| |||||| |||   || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  16693667 ggtatcgcaacgggagactcttaagtcggttacagagattagaagctttttgggtttagctggttatta 16693599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 443
Target Start/End: Original strand, 53383439 - 53383710
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||| || || || |||||||||||  |      
T  53383439 gtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaac 53383538  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || ||    
T  53383539 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagt 53383638  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  53383639 cgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagccggtta 53383710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 476
Target Start/End: Original strand, 15587800 - 15588117
Alignment:
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| || ||||| |||    
T  15587800 tctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttg 15587899  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    ||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | ||||    
T  15587900 aaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtgg 15587999  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttca 457  Q
    |||| || || ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| |    
T  15588000 atccgtctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggttta 15588098  T
Q  458 tcgagggattctctaagtt 476  Q
    | || ||||| ||||||||    
T  15588099 ttgaaggattttctaagtt 15588117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3687646 - 3687381
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  3687646 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 3687547  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  3687546 ctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 3687447  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  3687446 tgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagccggtta 3687381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10007303 - 10007142
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||    
T  10007303 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatg 10007204  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  10007203 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 10007142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15229387 - 15229198
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    |||||||| ||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  15229387 ctaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattc 15229288  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtga 296  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||| || |||||    
T  15229287 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtga 15229198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15235255 - 15235066
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    |||||||| ||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  15235255 ctaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattc 15235156  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtga 296  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||| || |||||    
T  15235155 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtga 15235066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 422
Target Start/End: Original strand, 5109038 - 5109282
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||| ||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  || | | ||    
T  5109038 gtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatg 5109137  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||||  ||||||||| || || ||||| ||    
T  5109138 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgttgtggatccgtctaaagttgaagc 5109237  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaag 422  Q
     || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  5109238 ggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag 5109282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12888412 - 12888164
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  12888412 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 12888313  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  12888312 caaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttacttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 12888213  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
    ||| | ||| |||||  |||||||||| |||   || ||||||||||||    
T  12888212 agtatcgcaatgggatactcctaagtccgttacagagattagaagcttt 12888164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 479
Target Start/End: Original strand, 13318828 - 13319219
Alignment:
Q  88 gtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatag 187  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| |||||| ||| ||||||    ||||||||||| || || |    
T  13318828 gtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattg 13318927  T
Q  188 atgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtc 287  Q
    ||||||||||  | ||||| ||| || | || |||||||| || ||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||   | |||| ||| || |||||    
T  13318928 atgatattttaatttattccaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagagagaaatttgtatgctaaattgtc 13319027  T
Q  288 taagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcag 387  Q
     ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||  | || ||||||    |||||||| | || |||||||| || ||||| ||||| | ||||    
T  13319028 gaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggctacgttatttctggtagtggtattgcagttgatccttcgaaagttgacgcagtatcgcag 13319127  T
Q  388 tgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||||| |||| ||||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  13319128 tgggagactccgaagtcagtgactgagattagaag-tttcttaggtttggctggttactatcacaggtttattgagggattttcgaagttggc 13319219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13943808 - 13943576
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  13943808 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 13943709  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| ||| || ||||||| |||||||| |   |||||| ||||||  |||| || |||||||||||| |     
T  13943708 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattatgctgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggcta 13943609  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13943608 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttct 13943576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 47125728 - 47125356
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || ||||||||| |  | |||||    
T  47125728 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattc 47125629  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||     
T  47125628 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggtta 47125529  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
     | ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  47125528 catgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 47125429  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| || || || || ||||||||    
T  47125428 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggctcatagaagggttttcgaagttggc 47125356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12180017 - 12179903
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  12180017 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattga 12179918  T
Q  312 agtgagtttccttgg 326  Q
    ||||||||| |||||    
T  12179917 agtgagttttcttgg 12179903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10907913 - 10907752
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||    
T  10907913 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatg 10907814  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  10907813 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 10907752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16637464 - 16637315
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  16637464 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 16637365  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  16637364 agtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 16637315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 339
Target Start/End: Original strand, 16834950 - 16835087
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  16834950 tattctaagactgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 16835049  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || | |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  16835050 ggctaagtgaagtgagtttccttggccatattatttct 16835087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 44779031 - 44778671
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |  |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||| ||| || | |||||    
T  44779031 ctaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattc 44778932  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |   | |||| ||||||  |||| || |||||||||||| |     
T  44778931 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaaattgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggcta 44778832  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  44778831 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcggttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 44778732  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    |   |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  44778731 tgactgaaatcagaag-tttcttgggcttggctggttattatcgtagattcatagaaggatt 44778671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 14874935 - 14875087
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || |    
T  14874935 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattat 14875034  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14875035 ctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccttgttatttct 14875087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Original strand, 10418452 - 10418762
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||       
T  10418452 tttgtggtggtatttatagatgatatcttgatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagagga 10418551  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||      |||||  | || |||||||| ||    
T  10418552 agttgtatgccaagctgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtaacggtatcgcggttgatccttcgaa 10418651  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| ||   |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||    
T  10418652 agttgatgcagtatctcagtgggaaactccgaagtcggtaactgaaattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtagattcatagaaggatt 10418750  T
Q  468 ctctaagttggc 479  Q
     || ||||||||    
T  10418751 ttcaaagttggc 10418762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12499939 - 12499704
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||  |  | | ||| || || ||||    
T  12499939 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatcta 12499840  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| |||||||| || ||||| || || | ||| ||    
T  12499839 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccttctaaagttgaagcggtatcgcaatg 12499740  T
Q  390 ggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    |||| ||| |||||| |||   || |||||||||||    
T  12499739 ggagactcataagtcagttacagagattagaagctt 12499704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 376
Target Start/End: Original strand, 16328067 - 16328274
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||      
T  16328067 tttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaaga 16328166  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
     ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||| | ||||||    |||||||  | ||||||||||| ||    
T  16328167 ggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgggtcatattatttctggtagtggtatcgcagtggatccttcgaa 16328266  T
Q  369 ggttgatg 376  Q
     |||||||    
T  16328267 agttgatg 16328274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 16755119 - 16755426
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  16755119 tttgtggttgtgtttattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaaga 16755218  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||| |  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16755219 aactttatgctaaattgtttgtgtgtgaattctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaa 16755318  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||  | || || ||||| |||||     
T  16755319 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagctggttactacagaagatttatcgaaggattt 16755418  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  16755419 tctaagtt 16755426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 476
Target Start/End: Original strand, 16805419 - 16805672
Alignment:
Q  223 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcc 322  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  16805419 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttc 16805518  T
Q  323 ttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaag 422  Q
    |||| ||||| |||||||  | |||||||   |||||||| || || ||||| |  || | ||| |||||| |||||||||| |||   || ||||||||    
T  16805519 ttggccatgttatttctagtgatggtattgtagtggatccgtctaaagttgaagtggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaag 16805618  T
Q  423 ctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16805619 -tttcttgggtttggctggttactacagaaggtttatcgaaggattttccaagtt 16805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55498570 - 55498486
Alignment:
Q  173 tggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtctt 257  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55498570 tggtggtgtttatcgatgatatcttagtgtattcgaagtcggaggagcagcatgcagagcatttcaggattgtgttgcaaatctt 55498486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 31693530 - 31693749
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    || ||||| || || || ||||| ||  || | ||||     
T  31693530 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttattt 31693629  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  31693630 aaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 31693729  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  31693730 agtgaagtaagttttcttgg 31693749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13952377 - 13952223
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||    |    
T  13952377 ttgaaggagaagaagttgtttgctaagtcgtcaaagtgtgagttttggttgcaaaaagtgagttttcttaatcatgtgatttcgaagagtggtatagtag 13952278  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||| || || || |||||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  13952277 tggatccgtcaaaagtggatgcaatgttgcggtgggagactcagaagtctatttt 13952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 55498734 - 55498665
Alignment:
Q  183 catagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaa 252  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  55498734 catagatgatatcttagtgtattgaaagtcggaggaggagcttgtggagcatttgaggattttgttgcaa 55498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 20829485 - 20829956
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829485 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20829584  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829585 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 20829684  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829685 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 20829784  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829785 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 20829884  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20829885 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 20829956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20927320 - 20926917
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20927320 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20927221  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20927220 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 20927121  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20927120 tctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaagg 20927021  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||| |||||||||||| |||               ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20927020 aagtgattttccttggtcacgtg---------------atttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 20926936  T
Q  411 tgaaattagaagctttctt 429  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  20926935 tgagattagaagttttctt 20926917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 478
Target Start/End: Original strand, 41215949 - 41216417
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41215949 atcatcagattagagtgaaggtgtaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggaaactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 41216048  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  41216049 tgcgccaggtgttttcatgcaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttatggtggtgtttattgatgatattttggtgtattcgaag 41216148  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  41216149 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcgagtcttgaaggagaattggttatgttctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 41216248  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg-ttt 409  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  41216249 aagtgagtttccttagtcatatgatttctaagggtagtatctacgtggatccatcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttt 41216348  T
Q  410 ttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  41216349 ttgagattagaagctttcttggattggcaggttattatcggagggtcattgagggattctctaggttgg 41216417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 478
Target Start/End: Original strand, 21200998 - 21201439
Alignment:
Q  37 gatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaataca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||| |||||||| |    
T  21200998 gatatatccaaaactgcgttccgaacgagatatggtcactatgaatattctgtgatgccatttagtgtgactaatacgccgagtgtcttcatggaatata 21201097  T
Q  137 tgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcattt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||| |    
T  21201098 tgaatagaatatttcatccttatctgtactggtttgtggaggcttttatagatgatatcttggtgtattcgaagttggaggaggagcatgttaagcatct 21201197  T
Q  237 gaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatt 336  Q
    |||||||||||||||   |||||| || ||  |||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| || |||||||||| || | |||||||||||||    
T  21201198 gaggattgtgttgcataccttgaaggataagaagttgtttgctaacttgtcgaagtgtgaattttggctgcaggaagtgagcttacctggtcatgtgatt 21201297  T
Q  337 tctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttgg 436  Q
    || | |||||||||   | ||||||| |  ||| ||||| |||||||| | |||||| |||| | || | ||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  21201298 tcgatgggtggtataattatggatccgttgaagattgatccagtgttgtattgggagactccaacgtttatttttgagatcaaaagttttcttggtttgg 21201397  T
Q  437 ccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
      | ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  21201398 aggattattatcggaggtttatttaaggattctctaagttgg 21201439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20527319 - 20527148
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527319 atcatctgattagagtgaaggcagaagataaatccaaaaccgcattccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20527220  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtt 182  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527219 tgcaccaggtgtctttatagaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtt 20527148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 322 - 482
Target Start/End: Original strand, 22133961 - 22134121
Alignment:
Q  322 cttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22133961 cttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgaggatccgttgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagataagaa 22134060  T
Q  422 gctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22134061 gctttcttggattggctggttattatcggagattcattgaaggattctctaagttggcgtt 22134121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Original strand, 22133857 - 22133963
Alignment:
Q  19 attagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133857 attagagtaaaggcggaagatatatccaagaccgcgttatgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaatgcgccag 22133956  T
Q  119 gtgtctt 125  Q
    |||||||    
T  22133957 gtgtctt 22133963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 51331744 - 51332051
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  51331744 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 51331843  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||| | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||| || ||    
T  51331844 agttttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctagtgatggtattgcagtggatccgtctaa 51331943  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  51331944 agttgaagcggtatcacagtgggaggctcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 51332042  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  51332043 ttctaagtt 51332051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 31538186 - 31538558
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  31538186 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 31538285  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  31538286 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 31538385  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  31538386 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 31538485  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  31538486 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 31538558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 48425074 - 48424702
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  48425074 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 48424975  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  48424974 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 48424875  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  48424874 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 48424775  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  48424774 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 48424702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19108467 - 19108220
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  19108467 gtgtttatcgatgatattttgatttactctaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatg 19108368  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || || ||||| ||    
T  19108367 ccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaaagttgaagc 19108268  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  19108267 ggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 19108220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 52987942 - 52987591
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  52987942 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 52987843  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  52987842 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 52987743  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  52987742 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 52987643  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  52987642 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 52987591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21839058 - 21838797
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  21839058 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 21838959  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  21838958 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 21838859  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  21838858 agttgaagcggtatcacaatgggagactcctaagtcagttattgagattagaag-tttcttgg 21838797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 447
Target Start/End: Original strand, 430370 - 430645
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  ||     
T  430370 gtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagc 430469  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | |||||||| || || ||    
T  430470 tttatgcgaaattatctaagtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtattgcagtggatccgtctaaagt 430569  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
    ||| || || | ||| || ||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  430570 tgaagcggtatcgcaatgagagactcctaagtcagttactgagattagaagctttttgggattggctggttattat 430645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 33389280 - 33389587
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  33389280 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 33389379  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||  || ||    
T  33389380 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatctgtctaa 33389479  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||  | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||     
T  33389480 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagcttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattt 33389579  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  33389580 tctaagtt 33389587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 443
Target Start/End: Original strand, 41351916 - 41352187
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |      
T  41351916 gtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaac 41352015  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || ||    
T  41352016 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtcaaaagt 41352115  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || || || | ||| |||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  41352116 cgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtctgttactgagattagaagctttttgggtttagccggtta 41352187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21832410 - 21832149
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  21832410 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 21832311  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  21832310 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 21832211  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  21832210 agttgaagcggtatcacaatgggagactcctaagtcagttattgagattagaag-tttcttgg 21832149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 35930918 - 35930987
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatga 80  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930918 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccacgttccgaacgaggtatggacactatga 35930987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 446
Target Start/End: Original strand, 50618646 - 50618926
Alignment:
Q  166 cgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagaga 265  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  50618646 cgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagaga 50618745  T
Q  266 accagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttc 365  Q
    |  |  | | ||| || || || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||    
T  50618746 agaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccctc 50618845  T
Q  366 caaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  50618846 taaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 50618926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Original strand, 20855011 - 20855321
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||  |||| || |||||||| || || |||| ||||||||||||  | ||||| ||||       
T  20855011 tttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaa 20855110  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||  | || |||||||| ||    
T  20855111 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtatcgcggttgatccttcgaa 20855210  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||    
T  20855211 agttgatgcagtatctcagtgggaaactccgaagtcggtgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtagattcatagaaggatt 20855309  T
Q  468 ctctaagttggc 479  Q
     || ||||||||    
T  20855310 ttcaaagttggc 20855321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Original strand, 21743741 - 21743939
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||| | || ||  | |||||    
T  21743741 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattc 21743840  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21743841 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggtt 21743939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Original strand, 16348856 - 16349121
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  16348856 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 16348955  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  16348956 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 16349055  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16349056 tgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagccggtta 16349121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21751152 - 21750771
Alignment:
Q  65 ggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctgga 164  Q
    |||||||||| |||||||||   || ||||| ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | ||||    
T  21751152 ggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgga 21751053  T
Q  165 ccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagag 264  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||| ||    
T  21751052 tcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaag 21750953  T
Q  265 aaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatcctt 364  Q
    ||  || | | ||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||     ||||||| | || ||||| |    
T  21750952 aagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttctggcaatggtattgcagtagatccgt 21750853  T
Q  365 ccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    | || ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  21750852 ctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 21750771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20140236 - 20140021
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  20140236 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 20140137  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||  || | | ||| || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| || ||    
T  20140136 atgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtgagctttct 20140037  T
Q  324 tggtcatgtgatttct 339  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  20140036 tggccatgttatttct 20140021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Original strand, 24097857 - 24098164
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || || ||||| ||| || | ||||| ||| |||| || |||||||| ||  || ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||    
T  24097857 gtggtggtatttattgatgacattctgatctattctaagactgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagt 24097956  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||    
T  24097957 tgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagt 24098056  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    ||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||     
T  24098057 tgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattttcg 24098156  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  24098157 aagttggc 24098164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 20834154 - 20834287
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||   ||    
T  20834154 gtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggt 20834253  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20834254 tgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 20834287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 38911015 - 38911387
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| |||  |||||    ||||| ||||| || || |||||||||||  | |||||    
T  38911015 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattc 38911114  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||| |||| || |||||||| |||||     
T  38911115 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgagttctggtta 38911214  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||| | ||||||    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  38911215 agtgaagtgagctttctgggtcatattatttctggtagtggtattgcagtggattcttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 38911314  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  38911315 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 38911387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21953079 - 21952728
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  21953079 ctaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 21952980  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||   || || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  21952979 caagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 21952880  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | |||| |   |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||  ||||| |    
T  21952879 agcgaagtgagctttctgggtcacattatttatggtggtggttttgcagtggatccttcgaaggttgatgcagtatcacaatgggagactctgaagtcag 21952780  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21952779 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 21952728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 426
Target Start/End: Original strand, 22360513 - 22360752
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||   | || ||||| || |||||||||||   | | | ||| || ||||    
T  22360513 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgt 22360612  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || || || || || ||||||||||| | |||    
T  22360613 ctaagtgtgaattctggttgaaggaagtgagctatcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagaaccgtctaaagttgatgcagtatcgca 22360712  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
     |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  22360713 atgggagactcctaagtcggttactgagattagaagcttt 22360752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 337
Target Start/End: Original strand, 21862574 - 21862792
Alignment:
Q  119 gtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagga 218  Q
    |||| ||||||||  |||||||| | || |||||| | | | |||||||||| ||||| || || || ||||| |||||  | || || ||| |||||||    
T  21862574 gtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacattttaatttactccaagactgagga 21862673  T
Q  219 agagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagt 318  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||  || | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  21862674 agaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagt 21862773  T
Q  319 ttccttggtcatgtgattt 337  Q
    || ||||| ||||| ||||    
T  21862774 tttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 425 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20915453 - 20915396
Alignment:
Q  425 ttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20915453 ttcttggtttggcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttgacgtt 20915396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41308748 - 41308611
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  41308748 tattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaatttt 41308649  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  41308648 ggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 41308611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37679250 - 37678899
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  37679250 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 37679151  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||     
T  37679150 caagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggtta 37679051  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
       ||||| |||||  | |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  37679050 ggtgaagtaagttttttgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 37678951  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  37678950 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 37678899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 404
Target Start/End: Original strand, 17043275 - 17043501
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| || | ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  17043275 gtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatg 17043374  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  17043375 ctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 17043474  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || |  || |||||| ||||||||||    
T  17043475 ggtatcacaatgggagactcctaagtc 17043501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21026269 - 21026111
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  21026269 ttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcta 21026170  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  21026169 aaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttct 21026111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 476
Target Start/End: Original strand, 19661390 - 19661694
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||| ||| |||| || ||||| ||  |||    
T  19661390 gtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaggactgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagt 19661489  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | ||| ||  | ||||||    |||||||| | || |||||||| || ||    
T  19661490 tgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcctggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccttcaaaagt 19661589  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctc 470  Q
    ||||||||| |  || |||||  | || ||||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  19661590 tgatgcagtatcacaatgggaaaccccgaagtcagtgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttc 19661688  T
Q  471 taagtt 476  Q
     |||||    
T  19661689 gaagtt 19661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 21234025 - 21234217
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  21234025 ctgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 21234124  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  || |||||| ||||||||||    
T  21234125 agtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtttctcaatgggagactcctaagtc 21234217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 24792885 - 24793037
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |  | | ||| || || |    
T  24792885 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattat 24792984  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24792985 ctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttct 24793037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20296582 - 20296231
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  20296582 ctaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 20296483  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || |||||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| || ||    |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  20296482 taagaatgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 20296383  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||| ||||| |    
T  20296382 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacagtgggagactccgaagtcgg 20296283  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |    || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20296282 taacagagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 20296231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Original strand, 20938347 - 20938471
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||  |||||| |||| || || || ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  20938347 tattcgaagactgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttct 20938446  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  20938447 ggttaattgaagtaagttttcttgg 20938471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 19856410 - 19856118
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || | ||| |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||  || ||| ||| ||| || |||||| | || ||||| ||  |||    
T  19856410 gtggttgtgtttattggtgacattttgatttattctaagactgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagt 19856311  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||| ||  | ||||||    |||||||| | || |||||||| || ||    
T  19856310 tgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctagttaagtgaagtgagtttccttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccttcgaaagt 19856211  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgaggg 464  Q
    ||||||| | |  || |||||| |||| |||||  |   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  19856210 tgatgcaatatcacaatgggagactccgaagtcaatgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgaggg 19856118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Original strand, 22503552 - 22503708
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||  |  | | ||| |    
T  22503552 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgcta 22503651  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22503652 aaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcattt 22503708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 23196543 - 23196657
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||    
T  23196543 ctgaagaagagcatgtagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtga 23196642  T
Q  312 agtgagtttccttgg 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  23196643 agtaagttttcttgg 23196657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22116877 - 22116744
Alignment:
Q  313 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttg 412  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | ||  |||| || || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||    
T  22116877 gtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtaaatccatctaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggttactg 22116778  T
Q  413 aaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  22116777 agattagaagctttttgggtttggctggttatta 22116744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42540 - 42069
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42540 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 42441  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42440 tgcgctaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 42341  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42340 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 42241  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42240 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 42141  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42140 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 42069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 31797 - 32166
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  31797 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 31896  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  31897 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 31996  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  31997 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 32096  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  32097 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 32166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Original strand, 55085 - 55392
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || || ||||||||| |  | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||    
T  55085 gtggtggtatttattgatgatattctaatctattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagt 55184  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| ||| |||||||| || |  ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||    
T  55185 tgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagt 55284  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    ||| ||| | |  || |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||     
T  55285 tgaagcaatatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagcttcttgggattggctggttattaccgcaggtttattgagggattttcg 55384  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  55385 aagttggc 55392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 16875559 - 16876030
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875559 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16875658  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875659 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16875758  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875759 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16875858  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16875859 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtcccctaagtctgtttt 16875958  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16875959 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctcaaagttggcgtt 16876030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 21848801 - 21849272
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21848801 atcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 21848900  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21848901 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 21849000  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21849001 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaagg 21849100  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21849101 aagtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggtggatgcagtgttgtagtgggagtctcctaagtctgtttt 21849200  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21849201 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 21849272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 20650819 - 20651290
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650819 atcatcaaattagagtaaaggcagaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20650918  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20650919 tgcgccaggtgtcttcatagagtatatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtagtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaa 20651018  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20651019 tctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagatttggttgaagg 20651118  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651119 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaagttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 20651218  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20651219 tgagattaaaaactttcttggattggcaggttattatcggaggttcattgaaggattctctaagttggcgtt 20651290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22436620 - 22436149
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22436620 atcatcatattagagtgaaagcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggacagtatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 22436521  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22436520 tgcgccaggtgtcttaatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 22436421  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22436420 tctgaggagaagcatgctgagcatttgaggatagtgttgcgagtcttaaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtggg 22436321  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22436320 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctatttt 22436221  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  22436220 tgatattagaagctttcttggattggcaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggcgtt 22436149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 23155506 - 23155975
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  23155506 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacact--gagtattctgtgatgccatttggagcacccaa 23155603  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23155604 tgcgctaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttattgatgatattttagtgtattcgaag 23155703  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23155704 tctgaggaggatcatgttgagcatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaggataatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 23155803  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23155804 aagtgagtttccttagtcatgtgatttctaaggatggtatttctgcggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 23155903  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23155904 tgagattagaagttttcttggtttggcttgttattatcgtaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 23155975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 21195004 - 21195474
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  21195004 atcatcataatagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgtgttccgaacaaggtatggacactatgagtattttgtgatgcaatttggagtatataa 21195103  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    || |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  21195104 tgtgccaggta-cttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtatttatagatgctattttggtgtattcgaaa 21195202  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21195203 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagagtgagttttggttgcagg 21195302  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21195303 aagtaagtttccttggtcatgtgatttctcagggtggtattttcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 21195402  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  21195403 tgagattagaagctgtcttggattggcaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggcgtt 21195474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23902468 - 23902010
Alignment:
Q  24 agtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtc 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  23902468 agtaaaggtggaagatatatccaaaaccgcgttccaaacgaggcatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaatgcactaggtgtc 23902369  T
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23902368 ttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttatggtagtgtttatcgatgatattttggtgtattcgaagtttgaggaggagc 23902269  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  23902268 atgctgagcatttgaggattatgttgcgtgtcttgaaggaaaattagttgtgtgctaagtggtcgaagtgcgagctttggttgcgagaagtgagtttcct 23902169  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23902168 tggtcatgtgatttctaagggtggtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgttgtgttacagtgggaatcccctaagtctgtttttgagcttagaagc 23902069  T
Q  424 tttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23902068 tttcttggattgacaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 23902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 268 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22317241 - 22317027
Alignment:
Q  268 cagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcca 367  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| || |    
T  22317241 cagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggaaagttggtttccttggtaatgtgatttctaagggtggtattgtcgtggatccgtcga 22317142  T
Q  368 aggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22317141 aggttgatgcagtgttacagtgggaatcacctaagtctgtttttgaggttaaaagctttcttagattggcaggttattatcggaggttcattgagggatt 22317042  T
Q  468 ctctaagttggcgtt 482  Q
    ||||| |||||||||    
T  22317041 ctctaggttggcgtt 22317027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 479
Target Start/End: Original strand, 22422454 - 22422824
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |    
T  22422454 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactcca 22422553  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  22422554 agtccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattatggttgaa 22422653  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||||   | ||||||| | || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  22422654 agaggtgagtttccttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagtt 22422753  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
       || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || ||||| || ||||||||    
T  22422754 acagagattagaagctttttgggtttggctggttattaccgaagatttatagaaggattttccaagttggc 22422824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 455
Target Start/End: Original strand, 24631173 - 24631574
Alignment:
Q  54 gttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcat 153  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||| || |||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24631173 gttctgaactaggtatagtcactatgagtattctgtaatgtcatttggtgtgactaatgtgctaggattatttatggaatacatgaatatgatattccat 24631272  T
Q  154 ccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaag 253  Q
      ||||  ||| |  | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||| |||      
T  24631273 tattattgggatcagtgtgtggttgtgttcatagacgatatcttggtgtcttcgaagtcggaggaggagcatgcagagcatctgatgatcgtgtcgcaga 24631372  T
Q  254 tcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttc 353  Q
     |||||| |||||  | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | || ||       
T  24631373 ccttgaaggagaagaaattgtatgccatgttgtttaagtgtgagttttggttgtgataagtgagcttccttaatcatgtgatatctagaagaggaataga 24631472  T
Q  354 tgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggagg 453  Q
     || || |  || ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24631473 agttgacctgtctaagtttgatgcagtgttgtagtgggagacgcctaagtcagttattgagatcaaaagttttctaggtttggctggttattatcggagg 24631572  T
Q  454 tt 455  Q
    ||    
T  24631573 tt 24631574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 476
Target Start/End: Original strand, 20394695 - 20395061
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || || ||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20394695 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 20394794  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20394795 agtctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 20394894  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
      | |||||||| ||||| ||| | ||||||     |||||||  ||| ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| ||| ||||||||||    
T  20394895 taaggtgagttttcttggccatattatttctggtaatggtattgttgtagatccgtctaaagttgatgcagt-taacaatgggagactcataagtctgtt 20394993  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
       ||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  20394994 accgaggttagaagctttttgggtttggcaggttattaccgcaggtttatagaaggattttcaaagtt 20395061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22988945 - 22988632
Alignment:
Q  113 cgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtc 212  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||| | | | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |    
T  22988945 cgccacgtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagac 22988846  T
Q  213 tgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaa 312  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  22988845 tgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagag 22988746  T
Q  313 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttg 412  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||     ||||||| | || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||   |    
T  22988745 gtgagttttcttggccatgttatttctggtaatggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacag 22988646  T
Q  413 aaattagaagcttt 426  Q
    | ||||||||||||    
T  22988645 agattagaagcttt 22988632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27356757 - 27356406
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  27356757 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 27356658  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  27356657 caagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgagttctggtta 27356558  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||| | |||| |    |||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  27356557 agtgaagtgagctttctgggtcatattatttttggtagtggtattgcagtggatcctttgaaggttgatgtagtattgcagtgggagactccgaagtccg 27356458  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27356457 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 27356406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 446
Target Start/End: Original strand, 31569402 - 31569741
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  31569402 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 31569501  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |     
T  31569502 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggcta 31569601  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  31569602 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcggttgatccatcaaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcgg 31569701  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    |   |||||| ||||||||  | ||||||||  |||||||    
T  31569702 tgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctagttatta 31569741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16414408 - 16414302
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16414408 atcatcatactagaggaaaggtagaagatatatccaaaaccgcattccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggaatatccaa 16414309  T
Q  111 tgcgcca 117  Q
    |||||||    
T  16414308 tgcgcca 16414302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23887289 - 23886879
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||||| ||||| | || |    
T  23887289 tatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatc 23887190  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgc----tgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaag 262  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||| | ||||| ||||     ||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |    
T  23887189 gcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaagg 23887090  T
Q  263 agaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatcc 362  Q
    ||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||| |    ||||||||  ||| |||||    
T  23887089 agaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctagttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttttcgtagtggtattgttgtagatcc 23886990  T
Q  363 ttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgag 462  Q
     || || |||||||| || |  || |||||| |||||||||| |||   || |||| ||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || ||     
T  23886989 gtctaaagttgatgcggtatcacaatgggagactcctaagtcggttaccgagattataagctttttgggtttagcaggttattaccgcaggtttatagaa 23886890  T
Q  463 ggattctctaa 473  Q
    ||||| |||||    
T  23886889 ggattttctaa 23886879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 20008481 - 20008853
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| |  ||||||||  |  | |||||    
T  20008481 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattc 20008580  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  20008581 taagaatgaagaagagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggtta 20008680  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    ||||||||   || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  20008681 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgtggtagatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 20008780  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||   || |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20008781 ttacagagattagaagtttcctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagttggc 20008853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 17672645 - 17672952
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  17672645 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 17672744  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || ||    
T  17672745 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaa 17672844  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||     
T  17672845 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattt 17672944  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  17672945 tctaagtt 17672952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Original strand, 22131672 - 22131937
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  22131672 gtgtttatcgatgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 22131771  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  22131772 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 22131871  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
      | | ||| |||||| |||||||||| ||  | || |||||||||||  | |||||||| |||||    
T  22131872 gttatcgcaatgggagactcctaagtcagtcatagagattagaagcttcttgggtttggctggtta 22131937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 443
Target Start/End: Original strand, 19482689 - 19482960
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |      
T  19482689 gtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaac 19482788  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || ||    
T  19482789 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtcaaaagt 19482888  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || || || | ||| |||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19482889 cgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtctgttactgagattagaagctttttgggtttagccggtta 19482960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18858736 - 18858475
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || || |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  18858736 tttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 18858637  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || ||    
T  18858636 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaa 18858537  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     || || || || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  18858536 agtcgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 18858475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 21323839 - 21324207
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    || ||||| ||||| || ||||| ||| || | |||||    
T  21323839 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattctgatctattc 21323938  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  21323939 aaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaa-aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 21324037  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || || || || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  21324038 agtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgacccgtcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 21324137  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  21324138 tgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagtt 21324207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Original strand, 22376015 - 22376352
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || || |    
T  22376015 aatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatatttttatatactcca 22376114  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| || ||||| || | | | || ||||||||    
T  22376115 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaattctggttgaa 22376214  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
      |  ||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||| | |  || |||||| | |||||||| |||    
T  22376215 atagatgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcaatatcacaatgggagacccctaagtcggtt 22376314  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  22376315 accgagattagaagctttttgggtttggctggttatta 22376352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 20016885 - 20017192
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  20016885 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 20016984  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  20016985 aactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 20017084  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||| ||||| |||   || |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  20017085 agttgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttacagagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 20017183  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  20017184 ttctaagtt 20017192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23652260 - 23652030
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| || ||||| ||||||| |||| | || || |    
T  23652260 aatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactcca 23652161  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  23652160 agactgaagaggaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaa 23652061  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23652060 agaggtaagttttcttggccatgtcatttct 23652030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19861656 - 19861287
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  19861656 ctaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattc 19861557  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  19861556 taagaatgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggtta 19861457  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||     ||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  19861456 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtattggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcag 19861357  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||    | |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  19861356 ttacacagattagaagtttcctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 19861287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23657053 - 23656788
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  23657053 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttat 23656954  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaa 401  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||| |    |||||||| | || ||||| || ||  |||||||||| |  || |||||| |||| ||    
T  23656953 ggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttatggtagtggtattgcagttgatccatcaaaatttgatgcagtttcacaatgggagactccgaa 23656854  T
Q  402 gtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    ||| ||   | |||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23656853 gtcagtgactaaaatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggatt 23656788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21253085 - 21252825
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||  ||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  21253085 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgt 21252986  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | ||  |||| || || ||||| || || | |||    
T  21252985 ctaagtgagaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtatatccgtctaaagttgaagcggtatcgca 21252886  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
     |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  21252885 atgggagactcctaagtcagttactgagattagaagctttttgggattggctggttattat 21252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 30311809 - 30312001
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  30311809 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 30311908  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  30311909 agtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtgtcgcaatgggagactcctaagtc 30312001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19114801 - 19114588
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  19114801 gaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtga 19114702  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaat 416  Q
    |||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||    
T  19114701 gttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttactgagat 19114602  T
Q  417 tagaagctttcttgg 431  Q
    |||||| ||||||||    
T  19114601 tagaag-tttcttgg 19114588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15535499 - 15535307
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  15535499 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 15535400  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || ||||  || |||||| ||||||||||    
T  15535399 agtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtgtcacaatgggagactcctaagtc 15535307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6605879 - 6605528
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| ||||| || || |||||||||||  | |||||    
T  6605879 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattc 6605780  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  6605779 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 6605680  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  6605679 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 6605580  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  6605579 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 6605528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19980186 - 19979891
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| || || || || ||||||||| | || || |    
T  19980186 aatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactcca 19980087  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||  | || | ||| || || ||||||| ||| || ||||||||    
T  19980086 agactgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgatttctggttgaa 19979987  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||    
T  19979986 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccctctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagacacctaagtc 19979891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21927649 - 21927450
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  21927649 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 21927550  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcat-gctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     ||| |||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  21927549 taagactgaagaagagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggtt 21927450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 22118797 - 22119058
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  22118797 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 22118896  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  22118897 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 22118996  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22118997 agttgaagcggtatcacattgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 22119058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 22127581 - 22127842
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  22127581 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 22127680  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  22127681 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 22127780  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22127781 agttgaagcggtatcacattgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 22127842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Original strand, 22246995 - 22247332
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||| | | | | |||| |||||  |||| |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  22246995 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcca 22247094  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||  ||| | ||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  22247095 agattgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaa 22247194  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || | |||||| | ||| ||||| ||||||     ||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  |  |||||| |||||||||| |||    
T  22247195 agaggcgagttttcatggccatgttatttctggtaatggtattgcggtagatccctctaaagttgatgcagtatcacgatgggagactcctaagtcggtt 22247294  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  22247295 acagagattagaagctttttgggtttggctggttatta 22247332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 446
Target Start/End: Original strand, 16269795 - 16270123
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||  ||| |    
T  16269795 ggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaatgaag 16269894  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    | |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  16269895 aggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgag 16269994  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
     || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||  |||| ||||| ||    || ||     
T  16269995 ctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacagtgggacactccgaagtcggtaacagagatc 16270094  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16270095 agaagttttctgggtttggctggttatta 16270123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20390292 - 20390140
Alignment:
Q  135 catgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcat 234  Q
    |||||||||||| || ||| |||   |||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  20390292 catgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcat 20390193  T
Q  235 ttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtc 287  Q
    || | ||||||||||||||| ||||| || ||  |||||| ||||||||||||    
T  20390192 ttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtc 20390140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28988351 - 28987999
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||||||||| || || ||||||||| |  | |||||    
T  28988351 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattctaatctattc 28988252  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| ||  | ||||| || |||||     
T  28988251 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaattctggtta 28988152  T
Q  307 aaggaagtgagtttcctt-ggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtct 405  Q
       ||||| ||||| ||| |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||     
T  28988151 cgtgaagtaagttttcttgggtcacattatttctggtagtggtattgcggtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtca 28988052  T
Q  406 gtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    ||   ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28988051 gtaactgagattagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 28987999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32602295 - 32602047
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  32602295 gtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 32602196  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagtt-ttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatg 376  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||||     ||||||| | |||||||| || || ||||| |    
T  32602195 ctaaattgtcaaagtgtgaattcttggttgaaagaagtaagtttttttggccatgttatttctggtaatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaag 32602096  T
Q  377 cagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    | || | ||| |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  32602095 cggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagaaattagaagctt 32602047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19869989 - 19869818
Alignment:
Q  32 cggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatgga 131  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  19869989 cggaagatatatcgaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatgga 19869890  T
Q  132 atacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgta 203  Q
     || ||||| ||||| || ||||| ||| | || |  || || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  19869889 gtatatgaacagaattttccatccgtatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttggtgta 19869818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22041983 - 22041730
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| |||| || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||  |      
T  22041983 gtggttgtgtttatcgacgatattttgatgtactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaac 22041884  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || || |||||||| || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||    
T  22041883 tttatgctaaattatctaagtgagaattctggttgaaagaaataagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagt 22041784  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    ||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  22041783 tgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 22041730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22373152 - 22372780
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| |  ||||||||  |  | |||||    
T  22373152 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatgatatcctaatttattc 22373053  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||| ||| || ||||| || |||||     
T  22373052 taagaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaaatgtgaattatggtta 22372953  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
       ||||| ||||| ||||||||  | |||| |    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  22372952 cgtgaagtaagttttcttggtcacattatttttggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 22372853  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||    | |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  22372852 ttacaaagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcaaagttggc 22372780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28983132 - 28982779
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||||||||| || || ||||||||| |  | |||||    
T  28983132 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattctaatctattc 28983033  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| ||  | ||||| || |||||     
T  28983032 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaattctggtta 28982933  T
Q  307 aaggaagtgagtttcctt-ggtcatgtgatttctaag-ggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
       ||||| ||||| ||| |||||  | ||||||  |  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| |||||    
T  28982932 cgtgaagtaagttttcttgggtcacattatttcttggtagtggtattgcggtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtc 28982833  T
Q  405 tgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
     ||   ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28982832 agtaactgagattagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 28982779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 21392501 - 21392653
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  21392501 gatgatatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgt 21392600  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  21392601 ctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 21392653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 21783060 - 21783212
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  21783060 gatgatatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 21783159  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  21783160 ctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 21783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 21786995 - 21787147
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  21786995 gatgatatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgt 21787094  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  21787095 ctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 21787147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 21920388 - 21920540
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || |  ||| |||| |||||  ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||    
T  21920388 gatgatattttgatttacttcaagactgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgt 21920487  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  21920488 ctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 21920540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4984282 - 4983993
Alignment:
Q  88 gtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatag 187  Q
    |||||||| || || ||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||    ||||| |||||||||||      
T  4984282 gtgatgcctttcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcatta 4984183  T
Q  188 atgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtc 287  Q
    ||||||  ||| | ||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| |  |||| ||  ||||||||    
T  4984182 atgataccttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtc 4984083  T
Q  288 taagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
     || |||||||| ||||| |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  4984082 aaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgc 4983993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 476
Target Start/End: Original strand, 29302114 - 29302355
Alignment:
Q  235 ttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtga 334  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| || || |    
T  29302114 ttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttgagtgaagtaagttttcttggccacgtta 29302213  T
Q  335 tttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggttt 434  Q
    |||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| || ||||   | |||||| |||  ||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||    
T  29302214 tttctggtagtggtattgcagttgatccgtcaaaagttgaagctgtgtccgaatgggagactctgaagtcggtgactgagattagaagttttcttggttt 29302313  T
Q  435 ggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||    
T  29302314 ggctggttattaccgtagattcattgaaggattttcgaagtt 29302355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22052989 - 22052865
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||  || ||||| || |    
T  22052989 tattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaattct 22052890  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||    
T  22052889 ggttaagtgaagtgagttttcttgg 22052865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Original strand, 19864727 - 19864886
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttg-caagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcc 279  Q
    ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||  |||||||||||   | || ||  ||||| |||||||||||  || | | |||     
T  19864727 ttcattgatgatattttgatttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcg 19864826  T
Q  280 aagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19864827 aaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttct 19864886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 21935391 - 21935862
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935391 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 21935490  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935491 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 21935590  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935591 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 21935690  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935691 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 21935790  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21935791 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 21935862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24583375 - 24582904
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583375 atcatcagattagagtaaaggcaaaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24583276  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583275 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 24583176  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583175 tttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 24583076  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583075 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctatagatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 24582976  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24582975 tcatattagaagctttcttggtttggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 24582904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23507849 - 23507378
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507849 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 23507750  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23507749 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 23507650  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507649 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 23507550  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23507549 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcactgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 23507450  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23507449 tgagattagaagctttcttggtttggccggttaatatcaaaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 23507378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23505164 - 23504938
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23505164 ttgaaggagaatcggttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatg 23505065  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||  ||||| |||||||||||    
T  23505064 tggatccttcaaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttataggaatggaaggttaatatcggaggtt 23504965  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23504964 cattgagggattctctaagttggcgtt 23504938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 20466358 - 20466767
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | || |||||| | ||| | || |    
T  20466358 tatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatc 20466457  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | || ||||| ||| |||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||    
T  20466458 gcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaa 20466557  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||     
T  20466558 gaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcggtagatccgtct 20466657  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggat 466  Q
    || ||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||    
T  20466658 aaagttgatgcagtatcacaatgggagactcctaagtcggttaccgatattagaagctttttgggtttggcaggttattaccgcaggtttatagaaggat 20466757  T
Q  467 tctctaagtt 476  Q
    | ||||||||    
T  20466758 tttctaagtt 20466767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23473312 - 23472945
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  23473312 aatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatgtactcaa 23473213  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| |   |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  23473212 agtctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaa 23473113  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||   ||||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  |  |||||| |||||||||| |||    
T  23473112 tgaggtgagttttcttggccatgttatttctggtggtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcagtatcacgatgggagactcctaagtcggtt 23473013  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
       || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  23473012 acagagattagaagctttttcggtttggctggttattaccgaagatttatagaaggattttctaagtt 23472945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 21679077 - 21679446
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| || ||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  21679077 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgtttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 21679176  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  21679177 gagaactgaggaagagcatgcagaacatccgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 21679276  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  21679277 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 21679376  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  21679377 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctcaaagtt 21679446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21409246 - 21408883
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    |||||||||||||| || || ||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || |||||||| || ||||    
T  21409246 tattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatttatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgt 21409147  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | |||||||||||| ||   || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||   ||||  | || | ||||||    
T  21409146 ttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaa 21409050  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtg 381  Q
    ||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    ||||||||  ||| || || || ||||||||||||||     
T  21409049 gttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttggtcatattatttctggtagtggtattgttgtagacccatctaaggttgatgcagta 21408950  T
Q  382 ttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcg 449  Q
    | ||| | |||| |||| ||||| |||   ||  |||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21408949 tcgcaat-ggagactccgaagtcggttaccgaggttaggagctttttgggtttggcaggttattatcg 21408883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 14885290 - 14885662
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||    
T  14885290 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatcttaatttattc 14885389  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| || || || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  14885390 caagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 14885489  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| |||||||| |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  14885490 aatgaagtaagtttcctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 14885589  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  14885590 taactgagattagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 14885662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22349932 - 22349688
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  22349932 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 22349833  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |   | ||||||| |||||||| | || || ||||| || ||    
T  22349832 aattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttatggtgatggtattgctgtggatacgtctaaagttgaagcggt 22349733  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  22349732 atcgcaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 22349688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Original strand, 17267633 - 17267865
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| | | ||||||    ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  17267633 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 17267732  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||| ||||| || ||| |||||||| |     
T  17267733 aaagactgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtaagttttggcta 17267832  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17267833 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttct 17267865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 476
Target Start/End: Original strand, 27666854 - 27667158
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |      
T  27666854 gtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaac 27666953  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || ||    
T  27666954 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagt 27667053  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
     || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || ||||| |||    
T  27667054 cgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattttct 27667153  T
Q  472 aagtt 476  Q
    |||||    
T  27667154 aagtt 27667158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19771985 - 19771678
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  19771985 tttgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 19771886  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||| |   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  19771885 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttttggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 19771786  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||     
T  19771785 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattt 19771686  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  19771685 tctaagtt 19771678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20344340 - 20343982
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||| |||  ||| |    
T  20344340 ggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaag 20344241  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20344240 aggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgag 20344141  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
     || || |||||  | ||||||     ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||   ||| ||     
T  20344140 ctttctgggtcacattatttctggtaatggtattgcagtggatccttcgaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcggtgactgagatc 20344041  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  20344040 agaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 20343982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 22331248 - 22331509
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  22331248 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 22331347  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  22331348 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggctatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 22331447  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22331448 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 22331509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27612376 - 27612072
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |      
T  27612376 gtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaac 27612277  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || || ||    
T  27612276 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaaagt 27612177  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctc 470  Q
    ||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || ||||||||    
T  27612176 tgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattctc 27612078  T
Q  471 taagtt 476  Q
    ||||||    
T  27612077 taagtt 27612072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 14998100 - 14998407
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  14998100 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 14998199  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  14998200 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 14998299  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||   || |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  14998300 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtccgttacagagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 14998398  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  14998399 ttctaagtt 14998407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 22504737 - 22504397
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||| |||   || |    
T  22504737 ggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaacgaag 22504638  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  22504637 aggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgag 22504538  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
    ||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   | | ||     
T  22504537 ttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcgaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtccgtaactaagatc 22504438  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22504437 agaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 22504397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 24796696 - 24797068
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || ||||||||| |  | |||||    
T  24796696 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatttattc 24796795  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||     
T  24796796 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggtta 24796895  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
     | ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  24796896 catgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 24796995  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  24796996 taactgagattagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 24797068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25428503 - 25428184
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |    
T  25428503 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 25428404  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||||||||||||||   | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || | |||||| |||||||| || ||    
T  25428403 atgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaagaagtgagctttct 25428304  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||| | || || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  25428303 tggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttaaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagc 25428204  T
Q  424 tttcttggtttggccggtta 443  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  25428203 tttttgggattggctggtta 25428184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 404
Target Start/End: Original strand, 37289857 - 37290092
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  37289857 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 37289956  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  37289957 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 37290056  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     ||||| || || | ||| |||||| ||||||||||    
T  37290057 agttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtc 37290092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22136693 - 22136432
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || || |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  22136693 tttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 22136594  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  22136593 aactttttgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 22136494  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22136493 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 22136432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40710805 - 40710544
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  40710805 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaaga 40710706  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| | |||||||| || ||    
T  40710705 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgcagtggatccgtctaa 40710606  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  40710605 agttgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttactgagattagaag-tttcttgg 40710544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27520431 - 27520124
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  27520431 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaaga 27520332  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  27520331 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 27520232  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  27520231 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 27520133  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
    |||||||||    
T  27520132 ctctaagtt 27520124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Original strand, 20250509 - 20250656
Alignment:
Q  33 ggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaa 132  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||| | | |||||  ||||||||||    
T  20250509 ggaagatatttctaagactgcgtttcgaacaaggtatggacattatgagtattttattatgccatttggtgtaactaacgtgtcaggtaactttatggaa 20250608  T
Q  133 tacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtg 180  Q
    || |||||||| || || ||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  20250609 tatatgaataggattttccatccttatttggatcaatttgtggtggtg 20250656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41772867 - 41772560
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  41772867 tttgtggttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 41772768  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    | || | ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  41772767 atttttatgctaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 41772668  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     ||||| || || | ||| |||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||||     
T  41772667 agttgaagcggtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgagattagaagctttttgggtttagctggttactacaggagatttatcgagggattt 41772568  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    || |||||    
T  41772567 tccaagtt 41772560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 29474434 - 29474687
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  29474434 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 29474533  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||  || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  29474534 aactttatgataaattatcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 29474633  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaag 422  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  29474634 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag 29474687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18781096 - 18780865
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  18781096 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaattctgattgaagga 18780997  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||| | || || | ||| |||||| |||||||||| |||       
T  18780996 agtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttaaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttaca 18780897  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
    || |||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18780896 gagattagaagcttcttgggtttggctggtta 18780865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22463958 - 22463648
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||  |||| || |||||||| || || |||| ||||||||||||  | ||||| ||||       
T  22463958 tttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaa 22463859  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||  | || |||||||| ||    
T  22463858 agttgtatgccaagttgtcgaagtacgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtatcgcggttgatccttcgaa 22463759  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||  ||   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||    
T  22463758 agttgatgcagtatctcagtgggaaactccgaagttggtgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtagattcatagaaggatt 22463660  T
Q  468 ctctaagttggc 479  Q
     || ||||||||    
T  22463659 ttcaaagttggc 22463648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Original strand, 21337595 - 21337935
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| | | | ||||  | || ||||| || ||||| || ||||||||| | || || |    
T  21337595 aatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttgatttactcca 21337694  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |  | | ||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  21337695 agtttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaa 21337794  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc---taagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtct 405  Q
     || |||||||| || || || || |||||   ||  |||  |||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||     
T  21337795 agaggtgagttttctcggccacgttatttctggtagtggtaatattgcagtagatccctcgaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcg 21337894  T
Q  406 gtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  21337895 gttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 21337935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 464
Target Start/End: Original strand, 22234219 - 22234576
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| | ||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  22234219 ctaatgcgcctggtgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 22234318  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||| || || ||||| || |||||     
T  22234319 taagactgaagaagagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggtta 22234418  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||   |||||||| | || ||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||  |||| ||||| |    
T  22234419 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctagtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgtagtatcgcaatgggaaactccgaagtcag 22234518  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttgg-tttggccggttattatcggaggttcatcgaggg 464  Q
    |   |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22234519 tgactgaaatcagaag-tttcttggctttggctggttattaccgcaggttcattgaggg 22234576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 339
Target Start/End: Original strand, 26737028 - 26737258
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||| | | | | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |    
T  26737028 aatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 26737127  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||  ||||||| ||  |||| | ||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  26737128 agtccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaa 26737227  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26737228 agaggtaagttttcttggccatgttatttct 26737258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16358506 - 16358357
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  16358506 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 16358407  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  16358406 agtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 16358357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20801404 - 20801187
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |  | | ||| || || |    
T  20801404 gatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattat 20801305  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||   | |||||||  ||| |||||||| || ||||| || || | |||    
T  20801304 ctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagtttccttggccatgtcatttctggtgatggtattgttgtagatccttctaaagttgaagcggtatcgca 20801205  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtc 404  Q
     |||||| ||||||||||    
T  20801204 atgggagactcctaagtc 20801187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34568498 - 34568349
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  34568498 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 34568399  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  34568398 agtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 34568349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25850144 - 25849793
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| ||| ||||||    ||||| || |||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  25850144 ctaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatcttgatttattc 25850045  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || |||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  25850044 gaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtta 25849945  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | || |||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  25849944 agtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtagatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 25849845  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25849844 taactgagatcataagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 25849793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20823460 - 20823306
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  20823460 tttgtggtggtgtttatagatgatatattgatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 20823361  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20823360 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagtttcct 20823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 479
Target Start/End: Original strand, 24618704 - 24618966
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| |    
T  24618704 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24618803  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaat 416  Q
    |||| || || ||| | ||| ||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||||||    
T  24618804 gttttctgggccatattattcctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtaactgaaat 24618903  T
Q  417 tagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24618904 cagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 24618966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 479
Target Start/End: Original strand, 24714935 - 24715197
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| |    
T  24714935 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24715034  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaat 416  Q
    |||| || || ||| | ||| ||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||||||    
T  24715035 gttttctgggccatattattcctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtaactgaaat 24715134  T
Q  417 tagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24715135 cagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 24715197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 479
Target Start/End: Original strand, 24747963 - 24748225
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| |    
T  24747963 gaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaa 24748062  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaat 416  Q
    |||| || || ||| | ||| ||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||||||    
T  24748063 gttttctgggccatattattcctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtaactgaaat 24748162  T
Q  417 tagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24748163 cagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 24748225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Original strand, 27683761 - 27684068
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||      
T  27683761 tttgtggttgtgtttatcgacaatattttgatttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaaga 27683860  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  27683861 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttcaaagaagtgagttttctaggccatgttatctctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 27683960  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||   || |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  27683961 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtccgttacagagattagaag-tttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggatt 27684059  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     ||||||||    
T  27684060 ttctaagtt 27684068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 37541680 - 37542052
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| | | ||||||    ||||| ||||| || || ||||||||| |  | |||||    
T  37541680 ctaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattctaatctattc 37541779  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| || || || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  37541780 caagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 37541879  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | |||| |    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  37541880 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttatggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 37541979  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||  | |||||||| || || || || ||||||||    
T  37541980 taactgagatcagaagttttctgggtttggatggttattactgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 37542052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 479
Target Start/End: Original strand, 16064280 - 16064447
Alignment:
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||  ||  | |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || | || || ||  ||    
T  16064280 agtgagtttccttggtcatataatttcaagaggtgaaatagcggtggatccgtataaggttgatgtagtgttgcagtgggagacttcgaattcagtactt 16064379  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    || || ||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16064380 gatatcagaagttatcttggtttgactggttattattggaggtttatcgaaggattttctaacttggc 16064447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 28893303 - 28893473
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  28893303 tttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 28893402  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28893403 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttct 28893473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 28914774 - 28914944
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  28914774 tttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 28914873  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28914874 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttct 28914944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 28922129 - 28922299
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  28922129 tttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 28922228  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28922229 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttct 28922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 28930042 - 28930212
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||       
T  28930042 tttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaa 28930141  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28930142 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttct 28930212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 260
Target Start/End: Original strand, 21562323 - 21562476
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| | ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||  || | |||||    
T  21562323 ctaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcctgatttattc 21562422  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaa 260  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| |||||    
T  21562423 taagactgaagaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaa 21562476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20777849 - 20777757
Alignment:
Q  240 gattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgt 332  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||    
T  20777849 gattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgt 20777757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 15291179 - 15291650
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291179 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15291278  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291279 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 15291378  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291379 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 15291478  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291479 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 15291578  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15291579 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 15291650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 482
Target Start/End: Original strand, 12340912 - 12341357
Alignment:
Q  37 gatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaataca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12340912 gatatatccaaaaccgcgttccgaacagggaatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtgactaatgcgccaggtgtcttcatggaatata 12341011  T
Q  137 tgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcattt 236  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  | || || |||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  12341012 tgaataggatattccatccttttctggactgttttgtggtaatatttatcgatgatatcttcgtgtatacgaagtcagaggaggagcatgctgagcatct 12341111  T
Q  237 gaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatt 336  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||| | | ||| | || || ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12341112 gaggattgtgttgcgtgtcttgaaggaaaagaagttgttttctaagctttcaaattgtgagttttggttacgggaagtaagtttccttggtcatatgatt 12341211  T
Q  337 tctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttgg 436  Q
    |  |||||||||||| |  ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12341212 ttgaagggtggtattgcgatggatccatcaatggttgatgtagtgttgcagtgggaatcgccgaagtctgtttttgagattagaagctttcttgggttgg 12341311  T
Q  437 ccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
      ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  12341312 taggttattatcggaggtttattgaacgattctctaagttggcgtt 12341357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14999321 - 14999095
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999321 ttgaaggagaatcagttctgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttttg 14999222  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14999221 tggatccttccaaggttgatgtagtgttgcagtaggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggtttggccggttattattggaggtt 14999122  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14999121 cattgagggattctctaagttggcgtt 14999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9292841 - 9292615
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9292841 ttgaaggagaatcagttatgtgcgaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaaatgactttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 9292742  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9292741 tggatccttcaaaggataatacaatgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcgaaggtt 9292642  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9292641 cattgagggattctctaagttggcgtt 9292615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14696308 - 14695929
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    || |||||| | ||| ||||      
T  14696308 tatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggatt 14696209  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  14696208 gcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaa 14696109  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      | || | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||| | || ||||| ||     
T  14696108 gaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctagtagtggtattgcagtagatccatct 14696009  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||    | |||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  14696008 aaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacccagattagaagctttttgggtttggctagttatta 14695929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 446
Target Start/End: Original strand, 51604909 - 51605248
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  51604909 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 51605008  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |     
T  51605009 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggcta 51605108  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  51605109 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcggttgatccatcaaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcgg 51605208  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    |   |||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  51605209 tgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggttatta 51605248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 479
Target Start/End: Original strand, 14849225 - 14849595
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  14849225 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcca 14849324  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14849325 agtccgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaa 14849424  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || || ||||| ||||| || || ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  14849425 agaggtaagttttcttggccaagttatttctggtagtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 14849524  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
       || | |||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || ||||| || ||||||||    
T  14849525 acagagaatagaagctttttgggtttggctggttattaccgaagatttatagaaggattttccaagttggc 14849595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15323372 - 15323099
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||| |  | |||||    
T  15323372 ctaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattgtaatttattc 15323273  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||     
T  15323272 taagagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtta 15323173  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  15323172 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagt 15323099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14682651 - 14682421
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  14682651 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 14682552  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  14682551 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 14682452  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14682451 ggtatcgcaatgggagactcctaagtctgtt 14682421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 478
Target Start/End: Original strand, 1647394 - 1647765
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||| ||| ||||||    || |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  1647394 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattc 1647493  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| || ||  ||| |||||||||||   |  ||||||| |   |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  1647494 taagactgaagaggagcatgcagaacacctgaagattgtgttgcggattctgaaagaaagaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggtta 1647593  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||||||  |||| || |||||||||    |||||||| ||||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  1647594 agtgaagtgagttttgttggccacgtgatttctggtagtggtattgctgtggatccttcaaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactccgaagtcag 1647693  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
    |   |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  1647694 tgactgaaattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttatagaaggattttcgaagttgg 1647765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 3262911 - 3263283
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  3262911 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 3263010  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  3263011 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 3263110  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  3263111 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 3263210  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  3263211 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 3263283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 340
Target Start/End: Original strand, 8322850 - 8323126
Alignment:
Q  64 aggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctgg 163  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||  |  |||||||| |||  || |||||||||||||  ||||  || |||||||| |||  ||    
T  8322850 aggtatggacactataaatattcggtaatgccgtttggtatgactaatgcgtcagacgtatttatggaatacacaaatatgatctttcatccctattcgg 8322949  T
Q  164 accgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaaga 263  Q
    | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  8322950 atcagtttgtggtggtgttcatagacgatattttggtgtattcgaagttggaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattggagatcttgaagga 8323049  T
Q  264 gaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttcta 340  Q
    |||  | |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||   |||||| |||| |||  ||||||||| ||||    
T  8323050 gaagaaattgtatgctaagttgtcgaagtgtgatttctggttgcgagaagtgggttttcttaatcatgtgatatcta 8323126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8708106 - 8707694
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| |    
T  8708106 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatc 8708007  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| ||||| || ||    
T  8708006 ggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaa 8707907  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || ||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||  |||| ||| | ||||||    |||||||| | || || || ||     
T  8707906 gaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttattggccatattatttctggtagtggtattgcagtagacccgtca 8707807  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggat 466  Q
    || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||  |||   || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  8707806 aaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagttagttacagagattagaagttttctgggtttggcgggttattaccgcagatttatagaaggat 8707707  T
Q  467 tctctaagttggc 479  Q
    | || ||||||||    
T  8707706 tttcgaagttggc 8707694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40475178 - 40474898
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| || |||||| | || |||||| | | | |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  40475178 tttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 40475079  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  40475078 atgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 40474979  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || || ||||| || || | ||| |||||| ||||||||||    
T  40474978 aggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtc 40474898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Original strand, 14301898 - 14302159
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  14301898 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 14301997  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  14301998 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 14302097  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14302098 agttgaagcggtatcacaatgggagactcctaagtcagttattgagattagaag-tttcttgg 14302159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15072514 - 15072145
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  15072514 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattc 15072415  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||     
T  15072414 taagaatgaataagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtta 15072315  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||  |||| ||||| |    
T  15072314 agtgaagtaagttttcttggtcacattatttcttgtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggaaactccgaagtcag 15072215  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    || | || |||||||| || || |||||||| |||||||| || | |||||| || ||||| || |||||    
T  15072214 ttatagagattagaagtttcctgggtttggctggttattaccgcaagttcatagaaggattttcgaagtt 15072145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 44659983 - 44660334
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || || ||||||||  | |||||    
T  44659983 ctaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatattttaatctattc 44660082  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||| |     
T  44660083 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggcta 44660182  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || | |||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  44660183 agtgaagtgagctttctggatcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 44660282  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  44660283 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 44660334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23957840 - 23957579
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  23957840 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 23957741  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  23957740 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 23957641  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23957640 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 23957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27713429 - 27713194
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  27713429 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 27713330  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  27713329 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 27713230  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     ||||| || || |  ||||||||| ||||||||||    
T  27713229 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtc 27713194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27902476 - 27902169
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || || ||| |||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||   |||    
T  27902476 gtggtggtatttattgatcatattttgatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagt 27902377  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || || ||  | ||||||    |||||||| | || |||||||| || ||    
T  27902376 tgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctagttaaatgaagtgagttttctaggccacattatttctggtagtggtattgcggttgatccttcgaaagt 27902277  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||     
T  27902276 tgatgcagtatcgcagtgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgtagattcatagaaggattttca 27902177  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  27902176 aagttggc 27902169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Original strand, 8051542 - 8051712
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  8051542 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 8051641  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  8051642 aactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 8051712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 298
Target Start/End: Original strand, 15001482 - 15001673
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  15001482 ctaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 15001581  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 298  Q
     |||  ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15001582 taagattgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtgagt 15001673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 29451654 - 29452005
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| ||||| || || |||||||||||  | |||||    
T  29451654 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattc 29451753  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||    |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  29451754 caagaatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtta 29451853  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  29451854 agtgaagtgagctttctgggtcatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 29451953  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  29451954 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggctattaccgcaggttcat 29452005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12478684 - 12478458
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| | || ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  12478684 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 12478585  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  12478584 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 12478485  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || |  ||||||||| |||| |||||    
T  12478484 ggtatcacagtgggagactccaaagtc 12478458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 404
Target Start/End: Original strand, 19776721 - 19776947
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| | || ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  19776721 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 19776820  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  19776821 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagc 19776920  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || |  ||||||||| |||| |||||    
T  19776921 ggtatcacagtgggagactccaaagtc 19776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8388462 - 8388244
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  8388462 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatga 8388363  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || || || |  ||||||||| |||| ||||| |||  |    
T  8388362 ggtgagtttccttggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagcggtatcacagtgggagactccaaagtccgttgct 8388263  T
Q  412 gaaattagaagctttcttgg 431  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  8388262 gagattagaag-tttcttgg 8388244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Original strand, 15145759 - 15146038
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| || || || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  15145759 tttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 15145858  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||   |  | | ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  15145859 atgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 15145958  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagt 403  Q
    ||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||    
T  15145959 tggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagt 15146038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 18547696 - 18547866
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||| | ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || |    
T  18547696 tatggtcattatgagtattcggtgaagcctttcggaatgtctaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaacagaatcttccatccgtatttagatc 18547795  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttg 237  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||||    
T  18547796 agtttgttgtggtattcattgatgatattttggtgtactctaaatcggaggaggaacatgcagaacatttg 18547866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 18613786 - 18613999
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || ||||||||  |    
T  18613786 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaa 18613885  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||| ||||| || || ||||| || |||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||       
T  18613886 agtaagttttctaggccatgttatatctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttaca 18613985  T
Q  412 gaaattagaagctt 425  Q
    || |||||||||||    
T  18613986 gagattagaagctt 18613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16149804 - 16149668
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| || | ||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||      
T  16149804 tttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaaga 16149705  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  16149704 agttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggtt 16149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16153950 - 16153814
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| || | ||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||      
T  16153950 tttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaaga 16153851  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  16153850 agttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggtt 16153814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 18225408 - 18225600
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  18225408 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 18225507  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    |||   ||| ||||| ||||| ||||||   | || |||| | |||||||| || || ||||| || || | ||| |||||| ||||||||||    
T  18225508 agtaccttttcttggccatgttatttctggtgatgatattgcagtggatccatctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtc 18225600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 305
Target Start/End: Original strand, 15357332 - 15357435
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  15357332 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttct 15357431  T
Q  302 ggtt 305  Q
    ||||    
T  15357432 ggtt 15357435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 425
Target Start/End: Original strand, 16353474 - 16353683
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |    
T  16353474 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttaaaagaggtaa 16353573  T
Q  317 gtttcct-tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaa 415  Q
    |||| || ||| ||||| ||||||   | |||||||  ||| ||||| || || || |||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || |    
T  16353574 gttttctntggccatgttatttctggtgatggtattgttgtagatccctctaaagtcgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagaga 16353673  T
Q  416 ttagaagctt 425  Q
    ||||||||||    
T  16353674 ttagaagctt 16353683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Original strand, 17093068 - 17093165
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  17093068 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 17093165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Original strand, 16234920 - 16235008
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  16234920 gtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 16235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Original strand, 29037437 - 29037493
Alignment:
Q  283 ttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  29037437 ttgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 29037493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 24829749 - 24830220
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24829749 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24829848  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24829849 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 24829948  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24829949 tctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttcaagg 24830048  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24830049 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctatttt 24830148  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24830149 tgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 24830220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22279992 - 22279516
Alignment:
Q  6 tggacatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagta 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22279992 tggatatcatcagatcagagtaaagactgaatatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagta 22279893  T
Q  106 tctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtatt 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22279892 tctaatgcgccatgtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtatt 22279793  T
Q  206 caaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22279792 cgaaatcgaaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggtt 22279693  T
Q  306 gaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22279692 gaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagtgtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcggtgttgcaatgggattctcctaagtct 22279593  T
Q  406 gtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22279592 gttttcgagattagaagctttttgggtttgaccggttactatcggaggtttattgagggaatctctaagttggcgtt 22279516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 24568229 - 24568700
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24568229 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccacgttccaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24568328  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  24568329 tgcatcaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtgttgtttatagattatattttggtgtattcgaag 24568428  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  24568429 tctgaggaggagcatgttgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttagttgcggg 24568528  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24568529 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctagggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 24568628  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  24568629 tgaaattagaagctttcttggattggcaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaaattggcgtt 24568700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 22760130 - 22760601
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22760130 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgtgttcaaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccga 22760229  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  22760230 tgcgctaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttacctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtatttgaaa 22760329  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22760330 tctgaggaggagcatgctaagcatctgaggattgtgttgcaagttttggaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtaagttttggttgcagg 22760429  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22760430 aagtgagtttccttggtcatgtgatttttaagggtgatatttccgtggatccgtcgaaggttgatgcggtgttgcaatgggaatctcctaagtctgtttt 22760529  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22760530 tgagattagaagttttcttggtttagcgggttattatcggaggttcattgagggattctttaagttggcgtt 22760601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25130491 - 25130023
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25130491 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctatgatgccatttggagtatccaa 25130392  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  25130391 tgcgccaggtgtcttcctggaatatatgaatagaatatttcatcctttcctggaccgctttgtggtggtgtttatatatgatattttggtatatacgaag 25130292  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |     
T  25130291 tctgaggaggagcatgctgagcatttgagggttgtgttgcgagtcttaaaggagaatcggttatgtgctaagttgttgaagtgtgagttttggttgcgga 25130192  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  25130191 aagtgagtttctttggtcatgtgatttctaagggtggtatctccgtggatccgacgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcagctaagtctgtttt 25130092  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  25130091 tgagattagaagctttcttagattggcaggttattatcgggggtttattgaaggattctctaagttggc 25130023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Original strand, 12639039 - 12639265
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12639039 ttgaaagagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 12639138  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12639139 tggatccgtctaaggtcgatgcggtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 12639238  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12639239 catcgagggattctctaagttggcgtt 12639265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 479
Target Start/End: Original strand, 10037927 - 10038361
Alignment:
Q  45 caaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataga 144  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10037927 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 10038026  T
Q  145 atatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattg 244  Q
    || || ||||||||| |||| |  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  10038027 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattg 10038126  T
Q  245 tgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 344  Q
    |||||||    |||||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  10038127 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgtcaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 10038226  T
Q  345 tggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttat 444  Q
    ||| ||    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10038227 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagactctgaagtctgtgtttgagattagaagttttcttggtttggcgggttat 10038326  T
Q  445 tatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  10038327 tatcagaggttcattgaagaattttctaagttggc 10038361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 479
Target Start/End: Original strand, 10098312 - 10098746
Alignment:
Q  45 caaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataga 144  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10098312 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 10098411  T
Q  145 atatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattg 244  Q
    || || ||||||||| |||| |  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  10098412 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcggagcatctaaggattg 10098511  T
Q  245 tgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 344  Q
    |||||||    |||||||||||  |||||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  10098512 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgttaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 10098611  T
Q  345 tggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttat 444  Q
    ||| ||    |||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10098612 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgtagtgttgcagtgggagactatgaagtctgtgtttgagattagaagttttcttgatttggcaggttat 10098711  T
Q  445 tatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||    
T  10098712 tatcggagtttcattgaagaattttctaaattggc 10098746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 393
Target Start/End: Original strand, 30010816 - 30011127
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    |||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| || ||||    
T  30010816 tattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgt 30010915  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||  |||| | ||||||    
T  30010916 ttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggaggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaa 30011015  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtg 381  Q
    ||| || | ||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||    ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||     
T  30011016 gttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttctcggtcatattatttctggtagtgatattgttgtggatccatctaaggttgatgcagta 30011115  T
Q  382 ttgcagtgggag 393  Q
    | ||| ||||||    
T  30011116 tcgcaatgggag 30011127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Original strand, 24818847 - 24819226
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | || |||||| | ||| | || |    
T  24818847 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatc 24818946  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | ||  |||| |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  24818947 gcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaa 24819046  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||  | || ||||| ||     
T  24819047 gaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatcgcggtagatccatct 24819146  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||||| ||| |  || |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  24819147 aaagttgatgtagtatcacaatgggagactcctaagtcggttaccgagattagaagctttttgggtttggcaggttatta 24819226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23112522 - 23112289
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  23112522 ctaatgcgcctagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattc 23112423  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||     
T  23112422 taagactgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtta 23112323  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttcta 340  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  23112322 agtgaagtaagttttcttggccatattatttcta 23112289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Original strand, 21143769 - 21144016
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  21143769 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 21143868  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | |||||||  ||||||||  || || ||||| ||    
T  21143869 ccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgttgtggatctgtctaaagttgaagc 21143968  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  21143969 ggtatcgcaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 21144016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 404
Target Start/End: Original strand, 24875481 - 24875704
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  24875481 ttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 24875580  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || ||    
T  24875581 aattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggt 24875680  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     | ||| |||||| ||||||||||    
T  24875681 atcgcaatgggagactcctaagtc 24875704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Original strand, 27208894 - 27209201
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || | |||||| |||||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||   |||    
T  27208894 gtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggtgcatgcagagcacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagt 27208993  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||    |||||||  | || |||||||| || ||    
T  27208994 tgtatgccaacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtggtatcgcggttgatccttcgaaagt 27209093  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  27209094 tgatgcggtatcgcagtgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattaccgtaggttcatagaaggattttca 27209193  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  27209194 aagttggc 27209201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 443
Target Start/End: Original strand, 41607104 - 41607378
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  41607104 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 41607203  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||| || ||    
T  41607204 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctagtgatggtattgcagtggatccgtctaa 41607303  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | ||||| || |||||    
T  41607304 agttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctttttgggtttagctggtta 41607378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27789526 - 27789294
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| ||||||    || |||||||| || || ||||||||| || | |||||    
T  27789526 ctaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattc 27789427  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |     
T  27789426 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggcta 27789327  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27789326 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttct 27789294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1065537 - 1065186
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| ||||||    ||||||||||| || || |||||||||||  | |||||    
T  1065537 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattttaatctattc 1065438  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| || ||     
T  1065437 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctgatta 1065338  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  1065337 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 1065238  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  1065237 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 1065186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 447
Target Start/End: Original strand, 23106450 - 23106725
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  ||     
T  23106450 gtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagc 23106549  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    | | ||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | |||||||| || || ||    
T  23106550 tttatgcgaaattgtctaagtgcgaattatggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtggatccgtctaaagt 23106649  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
    ||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  23106650 tgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaagctttttgggattggctggttattat 23106725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24711758 - 24711523
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  24711758 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 24711659  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  24711658 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 24711559  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     ||||| || || | |||||||||| ||||||||||    
T  24711558 agttgaagcggtatcgcagtgggagactcctaagtc 24711523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27373038 - 27372732
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    ||||||||||| |||||| | || || ||| | | | |||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  27373038 tttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 27372939  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  27372938 atgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 27372839  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
     || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||     
T  27372838 aggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtccgttactgagattagaag- 27372740  T
Q  424 tttcttgg 431  Q
    ||||||||    
T  27372739 tttcttgg 27372732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 23098675 - 23099047
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||| ||||||  | || ||||||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  23098675 ctaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattc 23098774  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||  ||||||||||   ||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||     
T  23098775 taagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggtta 23098874  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || || ||  | ||||||    |||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  23098875 agtgaagtgagttttctcggccacattatttctggtagtggtattgctgttgattcttcgaaagttaatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcag 23098974  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  23098975 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattttcaaagttggc 23099047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 31832444 - 31832072
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  31832444 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattc 31832345  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  31832344 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtta 31832245  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  31832244 agtgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcag 31832145  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  31832144 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcaaagttggc 31832072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27219740 - 27219433
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  27219740 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaaga 27219641  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27219640 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaa 27219541  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || || ||     
T  27219540 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagctttttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaagggttt 27219441  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  27219440 tctaagtt 27219433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 320
Target Start/End: Original strand, 30209549 - 30209787
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    |||| ||||||||| || || ||  |||||||||  || || ||||||||||| ||||||   || |||||| |||||||||| |||||||| || ||||    
T  30209549 tattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgt 30209648  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||||  || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||  |||| | ||||||    
T  30209649 ttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggaggaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaa 30209748  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 320  Q
    ||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  30209749 gttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttt 30209787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10870574 - 10870267
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||      
T  10870574 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaaga 10870475  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || ||    
T  10870474 aactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaa 10870375  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     || || || || | ||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||  | ||||| || ||||| ||| | ||||| || || |||||     
T  10870374 agtcgaagctgtatcgcaatgggatactcctaagtccgttactgaaattagaagcttcttgggtttagctggttactatagaaggtttattgaaggattt 10870275  T
Q  469 tctaagtt 476  Q
    ||||||||    
T  10870274 tctaagtt 10870267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 22734511 - 22734770
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||  | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  22734511 gatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgt 22734610  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||||| || ||| | || || ||||| || || | |||    
T  22734611 ctaagtgtaaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatttcagtagattcgtctaaagttgaagcggtatcgca 22734710  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  22734711 atgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggattggctggttatta 22734770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16927063 - 16926823
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  16927063 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 16926964  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  |||||    
T  16926963 agtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttccgaagatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtg 16926864  T
Q  390 ggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
    |||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  16926863 ggagactccaaagtccgttactgagattagaag-tttcttgg 16926823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17000703 - 17000463
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  17000703 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 17000604  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || |  |||||    
T  17000603 agtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttccgaagatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtg 17000504  T
Q  390 ggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
    |||| |||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  17000503 ggagactccaaagtccgttactgagattagaag-tttcttgg 17000463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Original strand, 44384298 - 44384563
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  44384298 gtgttcatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 44384397  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  44384398 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttccggagatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 44384497  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
     || | ||| |||||  ||||||||||  ||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  44384498 tgtatcgcaatgggatactcctaagtccattactgaaattagaagctttttgggtttagccggtta 44384563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23073589 - 23073330
Alignment:
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| ||| ||   ||||||| | | || || ||||| |||||||||||    
T  23073589 gtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaa 23073490  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||     
T  23073489 gaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtct 23073390  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
    || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  23073389 aaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcagttaatgagattagaagcttt 23073330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23295659 - 23295508
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  || | ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||      
T  23295659 tttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaa 23295560  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 320  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  23295559 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttt 23295508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24950296 - 24950165
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    ||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  24950296 gatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgt 24950197  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagt 318  Q
    | ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24950196 cgaagtgtgagttatggttaagtgaagtgagt 24950165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24264094 - 24263833
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| || || |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  24264094 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 24263995  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||| ||| | |||||||| || ||    
T  24263994 agctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaa 24263895  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24263894 agttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttactgagattagaag-tttcttgg 24263833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23278562 - 23278349
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||   ||| ||||| || || || ||||| ||| || | |||||    
T  23278562 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattc 23278463  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  23278462 taagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggtta 23278363  T
Q  307 aaggaagtgagttt 320  Q
    |  |||||||||||    
T  23278362 agtgaagtgagttt 23278349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Original strand, 24706213 - 24706457
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  24706213 ttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcta 24706312  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || ||    
T  24706313 aattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgcggtggatccgtctaaagttgaagcggt 24706412  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  24706413 atcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 24706457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25264745 - 25264471
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  25264745 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttct 25264646  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaa 401  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || || ||| |||| ||    
T  25264645 ggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgcgagactccgaa 25264546  T
Q  402 gtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  25264545 gtcagtgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagtt 25264471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23189633 - 23189408
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  23189633 gtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatg 23189534  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| ||    
T  23189533 ctaaattgtctaagtgtga-ttctggttgaagaaagtaagttttctgggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaggc 23189435  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || | ||| |||||| ||||||||||    
T  23189434 ggtatcgcaatgggagactcctaagtc 23189408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9485919 - 9485770
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||    
T  9485919 gatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcta 9485820  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  9485819 agtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 9485770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12576139 - 12575779
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| ||| | ||||    || |||||||| || || ||||| ||| || | |||||    
T  12576139 ctaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattc 12576040  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||  |||| || ||||| |||||| |     
T  12576039 gaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggcta 12575940  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||   | ||||||  | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  12575939 agtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatggtatagcggttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 12575840  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    |   |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  12575839 tgactgaaatcagaag-tttcttgggcttggctggttattatcgtagattcatagaaggatt 12575779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45534610 - 45534453
Alignment:
Q  223 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcc 322  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  45534610 catgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttc 45534511  T
Q  323 ttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | |||||| | ||||||    ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  45534510 tcggtcatattatttctggtagtggtattgatgtggatccatttaaggttgatgcagt 45534453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 431
Target Start/End: Original strand, 22323618 - 22323836
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  22323618 ctgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 22323717  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||| || || |||||  |||||   | ||| ||| | |||||||| || || ||||| || || |  ||||||||| |||||||||| |||  |    
T  22323718 agtgagttttctaggccatgttgtttctggtgatggaattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcacagtgggagactcctaagtcagttact 22323817  T
Q  412 gaaattagaagctttcttgg 431  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  22323818 gagattagaag-tttcttgg 22323836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24677201 - 24676957
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||  |  | | ||| |    
T  24677201 ttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgcta 24677102  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || || ||||||||    
T  24677101 aattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttctgggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccctctaaagtcgatgcagt 24677002  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| | |||||||| |||   || |||||||||||    
T  24677001 atcgcattgggagacgcctaagtcagttacagagattagaagctt 24676957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Original strand, 21323997 - 21324155
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||  |  | | ||| |    
T  21323997 ttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgcta 21324096  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21324097 aactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttct 21324155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9337306 - 9337209
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  9337306 tttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 9337209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20829806 - 20829694
Alignment:
Q  346 ggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatt 445  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||| ||||| ||   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20829806 ggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacagtgggagactccgaagtcggtaactgagatcagaagttttctgggtttggctggttatt 20829707  T
Q  446 atcggaggttcat 458  Q
    | || ||||||||    
T  20829706 accgcaggttcat 20829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 305
Target Start/End: Original strand, 19717788 - 19717872
Alignment:
Q  221 agcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  || ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  19717788 agcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 19717872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 478
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6299
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 5929  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaa-tacatgaata-gaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5930 tgcgccaggtgtctttattgaaatacatgaataagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 6029  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6030 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 6129  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6130 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttttgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 6229  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6230 tttgagattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttgg 6299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14281 - 14167
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  14281 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattga 14182  T
Q  312 agtgagtttccttgg 326  Q
    ||||||||| |||||    
T  14181 agtgagttttcttgg 14167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7435 - 6964
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7435 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttggagtatctaa 7336  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7335 tgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 7236  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7235 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 7136  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  7135 aagtgagtttccttggtcatttgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgtaatgggagtctcttaagtctgtttt 7036  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7035 tgagattagaagctttcttggttaggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 6964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 493 - 22
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  493 atcaccagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttggagtatctaa 394  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  393 tgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 294  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  293 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaagg 194  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  193 aagtgagtttccttggtcatttgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgtaatgggagtctcttaagtctgtttt 94  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  93 tgagattagaagctttcttggttaggccggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 26290 - 26761
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26290 atcatcagattagagtgaaggcggaagagatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 26389  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26390 tgcgccaggtgtctttctggaatgcatgaatagagtatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 26489  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26490 tctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 26589  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26590 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggcatttctgtggatccatttaaggttgatgcagtgtcgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 26689  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26690 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatcggaggttcattgagggattttctaagttggcgtt 26761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Original strand, 25317 - 25450
Alignment:
Q  349 atttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatc 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25317 atttctgtggatccttctaaggttgatgtggtgaggcagcaggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatc 25416  T
Q  449 ggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25417 cgaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 25450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 19819 - 19937
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| |||  ||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  19819 gtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagaatgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagt 19918  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaa 290  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19919 tgtatgccaagttgtctaa 19937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 25270 - 25315
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25270 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagtttt 25315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34367 - 33899
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34367 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 34268  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34267 tgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 34168  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  34167 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttggagg 34068  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  34067 aagtaagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcggtgttgcaatgggattctcctacgtctgtttt 33968  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33967 tgagattagaagctttcttggtttgaccggttattatcggaggttcattgagggattcactaagttggc 33899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 132513 - 132984
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  132513 atcatcagattagagtaaaggctgaagatatatcccaaaccgcgttccgaacgagatatggacactatgagtactctgtgatgccatttggagtatctaa 132612  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  132613 tgcgcccggtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggactgttttgtggtggtctttatagatgatattttagtgtattcgaag 132712  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132713 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 132812  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132813 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctatgggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 132912  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  132913 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatcggaggtacattgagggattccctaagttggcgtt 132984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 177 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25942 - 25640
Alignment:
Q  177 ggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||    
T  25942 ggtgttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagatttgaaggagaaccagctatgt 25843  T
Q  277 gccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatg 376  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  25842 gctaagtttcctaagtgtgagttttggttgcaggaagtaagtttcattggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaaggttgatg 25743  T
Q  377 cagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25742 cagtgttgtagtgggaatctcctaagtctgttttttagattagtagttttcttggtttggcgggttattatcggaggttcattgagggattctctaagtt 25643  T
Q  477 ggc 479  Q
    |||    
T  25642 ggc 25640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25938
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  26049 atcatccgattagagtgaaggcggaagatatatccataaccgcgttccaaacgaagtatggacactatgagtattctgtgatgccatttagagtatgcaa 25950  T
Q  111 tgcgccaggtgt 122  Q
    ||||||||||||    
T  25949 tgcgccaggtgt 25938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 338
Target Start/End: Original strand, 85451 - 85581
Alignment:
Q  208 aagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttga 307  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  85451 aagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttga 85550  T
Q  308 aggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  85551 aagaagtgagctttcttggacatgttatttc 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24458 - 23987
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24458 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtatgctgtgatgccatttggagtatcgaa 24359  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  24358 tgcgctaggtgtctttgtggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtatattcgaaa 24259  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24258 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaggggaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcagg 24159  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24158 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 24059  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24058 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 23987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8189 - 7887
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || || | |||||| ||||| |    
T  8189 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccatgtctgaagaagaac 8090  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||| ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||    
T  8089 atgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttct 7990  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||||||    ||||||||   |||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||    
T  7989 tggacatgttatttctggtagtggtattgtagtggatccgtctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttatagagattagaagc 7890  T
Q  424 ttt 426  Q
    |||    
T  7889 ttt 7887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Original strand, 7885 - 8353
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7885 atcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 7984  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  7985 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcgaag 8084  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8085 tcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaagg 8184  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8185 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaatggtggtattgctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctatttt 8284  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8285 tgagattagaagttttcttggtttggcgagttattattggaggttcatttagggattctctaagttggc 8353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16079
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  16298 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 16199  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     | | |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  16198 tacgactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggtta 16099  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  16098 agtgaagtaagttttcttgg 16079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 1976 - 2447
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1976 atcatcaaattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacgaggtatagacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 2075  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2076 tgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaaag 2175  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2176 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttggagg 2275  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2276 aagtgagtttccttggtcatgtgatttataagggtggtatttatgtggatccgtctaaggttgatgtagtgttgcagtgggaatctcctaactctgtttt 2375  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2376 tgagattagaagttttcttggtttggtaggttattaccggaggttcatcaagggattctctaatttggcgtt 2447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26605 - 26270
Alignment:
Q  15 tcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcg 114  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26605 tcagatgagagtgaaggcggaagatatatccaataccgctttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttagagtatctaatgcg 26506  T
Q  115 ccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctg 214  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||| |||   |    
T  26505 ccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttgtggtgatgtttatttatgacattttggtgtattcgaagatcg 26406  T
Q  215 aggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagt 314  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| ||  ||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26405 aggagtagcatgttgagca-ttgagaattgtgttgggtgtcttgaaagaaaagaagttgttagctaagttttcgaagtgtgagttttggttgcgggaagt 26307  T
Q  315 gagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatt 351  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26306 gactttccttggtcatgtgatttcgaaaggtggtatt 26270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2370
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1908 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttctgatcgaggtatggacactatgagtattcggtgatgccatttggagtatctaa 2007  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2008 tgcaccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaa 2107  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2108 tctgaggacgagc---------atttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgcggg 2198  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2199 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcggtgttgcaatgggaatctcctaagtctgtttt 2298  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2299 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 2370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 478
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7419
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6953 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 7052  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  7053 tgcaccaggtgtcttcattgagtatatgaataaaatatttcatccttatctggaccgttttatggtggtgtttataaatgatattttggtgtatttgaag 7152  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7153 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcagg 7252  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7253 aagtgagtttccttggtcatatgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtggtaatctccaaagtctgtttt 7352  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
    ||| |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  7353 tgagattataagctttcatggattggaaggttattatcggaggctcattg-gggattctctaagttgg 7419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 827 - 1297
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  827 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatgaacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 926  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  927 tgcgccagttgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgatattt-ggtgtattcgaag 1025  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  1026 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcagg 1125  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1126 aagtgagtttccttggtcacgtgatttcgaagggaggtatttccgtggatccgtcgaatgctgatgcggtgttgcagtgagaatctcctaagtctgtttt 1225  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1226 tgagattagaagctttcttggattgccaggttattatcggaggtttatcgagggattctctaagtttgcgtt 1297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 970 - 1441
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  970 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatacctaaaaccatgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttgcagtatccaa 1069  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1070 tgcgccaggtatcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttatggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 1169  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  1170 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccaattatgtgctaaattgtcgaagtgtgagttttagttgcaga 1269  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1270 aagtgagtttcctttgtcatgtgatttctaagggtggtatttttgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 1369  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    | | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1370 ttagattagaagctttcttggattagcaggttattatcgaaggtttatcgaaggattctctaagttggcgtt 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4571 - 4345
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  4571 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtgttatttatt 4472  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4471 tggatccttctaaggttgatgcagtatggcagtgggaatctcctaagtttgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggttattatccgaggtt 4372  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4371 catcgagggattctctaaggtggcgtt 4345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16340 - 15869
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16340 atcatcaaattagaatgaatgcggaagatatatctaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattttgagtatccaa 16241  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16240 tgcgtcaggtgtcttcatggaatacatgaatagaatatttcaaccttatctggaccgttttgtggtgatgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 16141  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||    
T  16140 tctgaggaggagcatgttgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtttacgtgtgaattttggttgcagg 16041  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16040 aagtgagtttccctggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaatgttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttt 15941  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15940 cgagattagaagctttcttggattggcaggttattatcggaggtttattgagggtttctctaagttggcgtt 15869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 371
Target Start/End: Original strand, 8850 - 9210
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8850 atcatcagataagggtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 8949  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8950 tgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 9049  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9050 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaagg 9149  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 9210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 55882 - 55602
Alignment:
Q  166 cgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagaga 265  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  55882 cgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagaga 55783  T
Q  266 accagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttc 365  Q
    |  |  | | ||| || || || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||    
T  55782 agaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccctc 55683  T
Q  366 caaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  55682 taaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 55602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40858 - 40588
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||| || || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  40858 tatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 40759  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| |||||  | ||||| ||||| |||||  | || || ||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  40758 gtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaa 40659  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
      |  | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40658 gaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 40588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 74578 - 74308
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||| || || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  74578 tatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 74479  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| |||||  | ||||| ||||| |||||  | || || ||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  74478 gtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaa 74379  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
      |  | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  74378 gaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 74308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Original strand, 31447 - 31908
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  31447 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatattcaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttaaagtatccaa 31546  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31547 tgcaccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtttttatagatgatattttggtgtattcgaag 31646  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  31647 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgt-atgcgaatcttgaacgagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 31745  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31746 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttga--------tgcagtgggagtcccctaagtctgtttt 31837  T
Q  411 tgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31838 tgggattagaagctttcttagattggcaggttattat-gaaggttcattgagggattttctaagttggcgtt 31908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 69 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7438 - 7025
Alignment:
Q  69 tggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgt 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7438 tggacactatgagtattatgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatataatatttcatccttatctgaaccgt 7339  T
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7338 tttgtggtggagttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgaggaggagcatgttgagcatatgaggattgtgttgtaagtcttaaaagagaacc 7239  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  7238 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgagtttcctgggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaa 7139  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||    
T  7138 ggtcgatgcagtgttgcagtgggaatctcttaagtctgtttttgagatcagaagttttcttggattggcaggttactatcggagatttattgagggattc 7039  T
Q  469 tctaagttggcgtt 482  Q
    ||||||||||||||    
T  7038 tctaagttggcgtt 7025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 21871 - 22165
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  21871 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatattcaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttaaagtatccaa 21970  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21971 tgcaccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtttttatagatgatattttggtgtattcgaag 22070  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22071 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgt-atgcgaatcttgaacgagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttg 22165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 420
Target Start/End: Original strand, 7029 - 7434
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7029 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaacagcgttccaaacgaggtatggacactatgggtattctgtgatgccatttggagtatccaa 7128  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  7129 tgcgccaggtatcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatatggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaaa 7228  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||     ||||| | | ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  7229 tctgaggaggagcatgctgagcattt----tttgtgctacgagtcttgaaggagaatcagttatgtgttaagttgtctaagtttgagttttggttatagg 7324  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||    
T  7325 aagtgagtttccttggtcatgtgatttcgaagggtggcattgtcgtggatccgtcaaaggttgatgcagtgctgcagtgggaatcacctaagtgtatttt 7424  T
Q  411 tgaaattaga 420  Q
    ||| ||||||    
T  7425 tgagattaga 7434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 1645 - 1888
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  1645 atcatcagattagagtgaaggcagaagatgtatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggaaactatgagtattccgtaatgccatttggagtttccaa 1744  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1745 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 1844  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1845 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 103
Alignment:
Q  22 agagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtg 121  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  378 agagtgaaggcggaatatatatccaaaatcgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtg 279  T
Q  122 tctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaaga 221  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  278 tcttcatagagtatatgaatagaatatttcatccttatctgtactgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggggtatttgaaatctgaggaaga 179  T
Q  222 gcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  178 gcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaactagttatgtgctaagttgtctaagtgtgag 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 234 - 482
Target Start/End: Original strand, 25024 - 25272
Alignment:
Q  234 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25024 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgcaaagttatctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 25123  T
Q  334 atttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25124 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtggaagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggat 25223  T
Q  434 tggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||  ||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25224 tggtaggttactatcgaaggttcattgaggaatactctaagttggcgtt 25272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19425 - 19319
Alignment:
Q  220 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtt 319  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||    
T  19425 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19326  T
Q  320 tccttgg 326  Q
    | |||||    
T  19325 ttcttgg 19319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 234 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2323 - 2087
Alignment:
Q  234 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2323 tttgaggattgtgttgcaagccttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtt 2224  T
Q  334 atttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2223 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgc--------agtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtt 2132  T
Q  434 tggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttgg 478  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2131 tggcaggttattatcggaggttcattgagggattctctaagttgg 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 255 - 482
Target Start/End: Original strand, 54210 - 54437
Alignment:
Q  255 cttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttct 354  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  54210 cttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaatggtggtattttt 54309  T
Q  355 gtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggt 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  54310 gtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggaaggttattagcggaggt 54409  T
Q  455 tcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54410 tcattgagggattttctaagttggcgtt 54437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 446
Target Start/End: Original strand, 2636 - 2964
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || || ||||||||||    
T  2636 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtctgagg 2735  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    |||| |||||||||||||||| || |   |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || || |||||||| || |||||||| ||  ||||    
T  2736 aagaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagagatgag 2835  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||   |||||||| | || ||||| || || ||||||||| | |  || |||||| |||||||||| ||     | |||    
T  2836 ttttcttggccatgttatttctagtagtggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcaatatcacaatgggagactcctaagtcggtcacatagatt 2935  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  2936 agaagctttttgggtttggctggttatta 2964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 151195 - 150977
Alignment:
Q  208 aagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttga 307  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  151195 aagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttga 151096  T
Q  308 aggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgt 407  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| ||    
T  151095 aagaagtgagctttctaggacatgtaatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagt 150996  T
Q  408 ttttgaaattagaagcttt 426  Q
    |  ||| |||| |||||||    
T  150995 tactgagattataagcttt 150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9143 - 8709
Alignment:
Q  45 caaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataga 144  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9143 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 9044  T
Q  145 atatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattg 244  Q
    || || ||||||||| |||| |  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  9043 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattg 8944  T
Q  245 tgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 344  Q
    |||||||    |||||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  8943 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgtcaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 8844  T
Q  345 tggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttat 444  Q
    ||| ||    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8843 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagactctgaagtctgtgtttgagattagaagttttcttggtttggcgggttat 8744  T
Q  445 tatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  8743 tatcagaggttcattgaagaattttctaagttggc 8709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Original strand, 13093 - 13319
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13093 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttcttagggtggtatttctg 13192  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13193 tggatccttctaaggttgatgcagtgtggcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggtaggttattatccgaggtt 13292  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||    
T  13293 catcaagggattctctaagctggcgtt 13319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 256 - 482
Target Start/End: Original strand, 10979 - 11205
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10979 ttgaaggaaaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgaattttggttgaagggagtgattttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatg 11078  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11079 tggatccttctaaggttgacgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagtttacttggtttggccggttattatcggaggtt 11178  T
Q  456 catcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11179 cattgagggattctctaagatggcgtt 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 255 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 1
Alignment:
Q  255 cttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttct 354  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  212 cttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtatttat 113  T
Q  355 gtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggt 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  112 gtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggaaggttattagcggaggt 13  T
Q  455 tcatcgagggat 466  Q
    |||| |||||||    
T  12 tcattgagggat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 280 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 181937 - 181735
Alignment:
Q  280 aagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcag 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  181937 aagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgtag 181838  T
Q  380 tgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  181837 tgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttaagattagaagctttttgggtttggccggttactatcggaggtttattgagggattctctaagttagc 181738  T
Q  480 gtt 482  Q
    |||    
T  181737 gtt 181735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Original strand, 24655 - 24992
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |    
T  24655 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcga 24754  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||| | ||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  24755 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaa 24854  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||| | || ||||| || || ||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  24855 agaggtaagttttcttggccatgttatttctagtagtggtattgcagtagatccatctaaagttaatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 24954  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  24955 acagatattagaagctttttgcgtttggctggttatta 24992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 150675 - 150383
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  150675 gatgacattttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgt 150576  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    | |||||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  ||    
T  150575 caaagtgtgaattctggttaagtgaggtaagttttcttggccacattatttctggaagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcaca 150476  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
     |||||| |||  ||||  ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  150475 atgggagactctgaagttagtgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagttggc 150383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 476
Target Start/End: Original strand, 193953 - 194193
Alignment:
Q  236 tgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgat 335  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||  | ||    
T  193953 tgaggattgtgttacaagttttgaaagaaaagaagtcgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattat 194052  T
Q  336 ttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggttt 434  Q
    ||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||    
T  194053 ttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaag-tttcttgggttt 194151  T
Q  435 ggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  194152 ggctggctattaccgcaggttcattgaaggattttcgaagtt 194193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 306 - 482
Target Start/End: Original strand, 104892 - 105068
Alignment:
Q  306 gaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  104892 gaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaaggtttatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtct 104991  T
Q  406 gtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  104992 gtttttgagattagaagcttccttggattggcaggttactatcggaggttcattgagggattctctaagttggcgtt 105068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 468
Target Start/End: Original strand, 48634 - 48995
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  48634 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 48733  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  48734 gagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggtta 48833  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  48834 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 48933  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  48934 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattc 48995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17048 - 16804
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  17048 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 16949  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||| |||||||||| || || ||||| |||||    
T  16948 aattgtctaagtgtgagttctggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttctagtgatggtattgctgtggatccatctaaagttgaagcagt 16849  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| ||||||  ||||||||| |||   || |||||||||||    
T  16848 atcgcaatgggagattcctaagtccgttacagagattagaagctt 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10586 - 10342
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||  |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  10586 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 10487  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||| |||||||||| || || ||||| |  ||    
T  10486 aattgtctaagtgtgagttctggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttctagtgatggtattgctgtggatccatctaaagttgaagtggt 10387  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| ||||||||||||||   || |||||||||||    
T  10386 atcgcaatgggagactcctaagtctgttacagagattagaagctt 10342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45266 - 45019
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  45266 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatg 45167  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    | ||||||| |||||||||| || || || || ||    
T  45166 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttccggtgatggtattgctgtggatccgtctaaagtcgaagc 45067  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     || | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  45066 ggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 45019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 310
Target Start/End: Original strand, 94054 - 94093
Alignment:
Q  271 ttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94054 ttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 94093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 256 - 478
Target Start/End: Original strand, 46682 - 46904
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  46682 ttgaaggagaatcaattgtgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagagtggtatctccg 46781  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46782 tggatccgtctaaagttgtggcagtgttgcagtgggaatctcctaggtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggttactatcggaggtt 46881  T
Q  456 catcgagggattctctaagttgg 478  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  46882 tattgagggattctctaagttgg 46904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41922 - 41685
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| ||||      
T  41922 tatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggata 41823  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
      |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  41822 aatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttg-aagaaaa 41724  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
      |||||| || |||| |||| |||||||| || |||||    
T  41723 gaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaattctggtt 41685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Original strand, 51527 - 51624
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||| |||| |||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  51527 tttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 51624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6888
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7026 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatattcaaaacttcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 6927  T
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatt 149  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6926 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatt 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 415 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1340 - 1273
Alignment:
Q  415 attagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1340 attagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcattgaaggattctctaagttggcgtt 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 76571 - 76239
Alignment:
Q  145 atatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattg 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||  ||     
T  76571 atattccatccttatctggaccagtttttggtagtgtttatagacgatatcttggtgtattcaaagtcagaggaggagcatgttgagcatcttagagtta 76472  T
Q  245 tgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 344  Q
    |||||||    || ||  ||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||||||| | |||    
T  76471 tgttgcacacttttaagaagaagaagttgtttgctaagttttcgaagtgtgagttttggctgcgggaagtgagttttcttagttatgtgatttcgatggg 76372  T
Q  345 tggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttat 444  Q
    ||||||  | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || || | | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  76371 tggtatagcagtggatccgtcgaaggttgatgtagtgttgcagtggcagacttcgacgtctgtttttgagataagaagttttcttggtttggcgggttat 76272  T
Q  445 tatcggaggttcatcgagggattctctaagttg 477  Q
    || ||||| || || || |||||||||||||||    
T  76271 taccggagttttattgaaggattctctaagttg 76239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 378
Target Start/End: Original strand, 27337 - 27638
Alignment:
Q  76 tatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtgg 175  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||  |||||||||| || || ||| ||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || |||||||| |    
T  27337 tatgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttg 27436  T
Q  176 tggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtg 275  Q
    | ||||| |||||||||||  || | || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  |||| |     
T  27437 ttgtgtttatagatgatatcctgatatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttata 27536  T
Q  276 tgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgat 375  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||    ||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  27537 tgccaagttatcaaagtgagaattctggttgaacg-agtgagttttcttggtcatattatttctggtagtggtattgttgtggatccatctaaggttgat 27635  T
Q  376 gca 378  Q
    |||    
T  27636 gca 27638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 76693 - 76630
Alignment:
Q  23 gagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattc 86  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| |||||    
T  76693 gagtaaaggcggagtatatatccaaaactgcattccggactagatatggacactttgaatattc 76630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2221 - 2117
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2221 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttggagtatctaa 2122  T
Q  111 tgcgc 115  Q
    |||||    
T  2121 tgcgc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14643 - 14285
Alignment:
Q  118 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | | | |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| || |    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  218 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | | | | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttag 14444  T
Q  318 tttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatt 417  Q
    ||| ||||| ||||| |||||      ||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||    
T  14443 ttttcttggccatgttatttcgggtaatggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttatagagatt 14344  T
Q  418 agaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14343 agaagctttttgggtttggcaggttattaccgcaggtttatagaaggattttctaagtt 14285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 310 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2970 - 2798
Alignment:
Q  310 gaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttt 409  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| |    
T  2970 gaagtaagttttcttcgtcttgtgatttcgaagggtggtattgcggtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtggaaatcgccgaagtctgtat 2871  T
Q  410 ttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggcgtt 482  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2870 ttgagattagaagctttcttgggttgacaggttattatcggaggtttattgaaggattctctaagttggcgtt 2798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 121 - 490
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||    
T  121 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattc 220  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  221 gacaacggaggaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 320  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  321 agtgaagtaagtttccttggccatattatttctggaagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgaagcagtatcacaatgggagactccaaagtcag 420  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  421 tgacggagatcagaag-tttcttgggtttagctggttattaccgcaggttcattgagggattctcaaagtt 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 114745 - 114376
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  114745 ctaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattc 114646  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    ||   |||||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  114645 aagaactgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcgagttctggtta 114546  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  114545 aatgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgtggtggatccttcaaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 114446  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  114445 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgtaggtttattgagggattctcaaagtt 114376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Original strand, 108002 - 108163
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||  ||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  108002 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 108101  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  108102 ccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 108163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 339
Target Start/End: Original strand, 9114 - 9386
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||| | || |    
T  9114 tatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatc 9213  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  9214 gtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtgctgaaggagaa 9313  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
      |||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9314 gaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatgaggtgagttttcttggccatgttatttct 9386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 4929
Alignment:
Q  76 tatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtgg 175  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| || ||| | ||||||||| | || |||||| | ||| |||| || |||||||    
T  5328 tatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtgg 5230  T
Q  176 tggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtg 275  Q
    | |||||||| || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| |     
T  5229 ttgtgttcattgacgatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttata 5130  T
Q  276 tgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgat 375  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || |||||     
T  5129 tgcaaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctgctagtggtattgcagtagatccatctaaagttgaa 5030  T
Q  376 gcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagt 475  Q
    ||||| |  || |||||| ||||| |||| |||   || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||    
T  5029 gcagtatcacaatgggagactccttagtcggttaccgagattagaagctttttgggtttggcaggttattaccgcagatttatagaaggattttctaagt 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 446
Target Start/End: Original strand, 84656 - 84978
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| || | || || ||| |  |||| ||||    
T  84656 tttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccaaggaggagc 84755  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||| || ||||| || || ||||||||  |||||||||||||    
T  84756 atgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaattctggttgaacaaagtgagtttcct 84855  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||||||| | |||||     ||||||||  |||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||    
T  84856 tggtcatattatttcagttagtggtattgttgtggacccatctaaggttgatgcagtatcgcagtgggagactccgaagtcggttaccgagtttagaagc 84955  T
Q  424 tttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||| | |||||||| ||||||||    
T  84956 tttttgggtttggcgggttatta 84978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 268729 - 268562
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  |||| || || || || || ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||   |||    
T  268729 gtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagt 268630  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  268629 tgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgttatttct 268562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 476
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6378
Alignment:
Q  112 gcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagt 211  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||     
T  6014 gcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactctaagg 6113  T
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  6114 ctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 6213  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
     || | ||| ||||||||||| ||||||     ||||||| | || ||||| || || || |||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||       
T  6214 ggtcatttttcttggtcatgttatttctggtaatggtattgcggtagatccatctaaagtggatgcagtatcacagtgggagactcctaagtcggttgcc 6313  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  6314 gagattagaagctttttgggtttggcaggttattaccgcagatttatagaaggattttctaagtt 6378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Original strand, 147 - 526
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||| || || ||  | ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  147 tatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggtgtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 246  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  247 gtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaa 346  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| |  | ||||| ||     
T  347 gaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcaatagatccctct 446  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  447 aaagttgatgcggtattgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttaggattggctggttatta 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3110 - 2853
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    ||||| |||||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||    
T  3110 tattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgt 3011  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    |||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||  |||| | |||  |    
T  3010 tcatcgatgatattttgatataatctaagtctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctca 2911  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  2910 attgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccgtggccatattatttct 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 7859 - 8118
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  7859 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgt 7958  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||| ||| || |||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||||    ||||||||   || ||||| || || ||||| || || | |||    
T  7959 ctaagtatgaattctggttgaaaggagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgaagtagatccgtctaaagttgaagcggtatcgca 8058  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  8059 atgggagactcctaagtcggttactgaaattagaagctttttgggattggctggttatta 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 495202 - 494861
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  495202 aatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcga 495103  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  495102 agtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagttctggttgaa 495003  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtg-atttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgt 407  Q
     || |||||||| ||||| |||||  ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  |  |||||| |||||||||| ||    
T  495002 tgaggtgagttttcttggccatgtttatttctggtagtggtattgcggtagatccatctaaagttgatgcagtatcacgatgggagactcctaagtcggt 494903  T
Q  408 ttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcg 449  Q
    |   || ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  494902 taccgagattagcagctttttgggtttggctggttattatcg 494861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 515473 - 515845
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| || ||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  515473 ctaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatcttaatttattc 515572  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| || || || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  515573 caagaatgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 515672  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  515673 agtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtccg 515772  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  515773 tgactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 515845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 305
Target Start/End: Original strand, 453293 - 453531
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| || || ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||| | ||||||||      
T  453293 tatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggata 453392  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
      |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||  ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  453393 aatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaa 453492  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
      |||||| || ||||||||| || |||||||| |||||    
T  453493 gaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 453531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9234
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||    
T  9478 ttcatcgatgatatttttatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 9379  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | | ||||||| |||||||||| || || ||||| || ||    
T  9378 aattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgatgatggtattgctgtggatccatctaaagttgaagcggt 9279  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  9278 atcgcaatgggagactcctaagtccgttacagagattagaagctt 9234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 404
Target Start/End: Original strand, 15343 - 15638
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15343 aatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgatatactcca 15442  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||| || | ||||||    
T  15443 agactgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaa 15542  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  15543 agaggtgagttttcttggccatgtaatttctggtagtggtatttcagtagatccctctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtc 15638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25234 - 24927
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||   |||    
T  25234 gtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagt 25135  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||    |||||||  | || |||||||| || ||    
T  25134 tgtatgccaagttgtcgaagtgggagttctggttaactgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtggtatcacggttgatccttcgaaagt 25035  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  25034 tgatgcggtatcgcagtgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagttttttgggtttggctggttattaccgtaggttcatagaaggattttca 24935  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  24934 aagttggc 24927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Original strand, 10821 - 11200
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | || |||||| | ||| | || |    
T  10821 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatc 10920  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | ||  |||| |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  10921 gcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaa 11020  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||  | || ||||| ||     
T  11021 gaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatcgcggtagatccatct 11120  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||||| ||| |  || |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  11121 aaagttgatgtagtatcacaatgggagactcctaagtcggttaccgagattagaagctttttgggtttggcaggttatta 11200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Original strand, 17013 - 17392
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | || |||||| | ||| | || |    
T  17013 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatc 17112  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    | ||  |||| |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  17113 gcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaa 17212  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||  | || ||||| ||     
T  17213 gaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatcgcggtagatccatct 17312  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||||| ||| |  || |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  17313 aaagttgatgtagtatcacaatgggagactcctaagtcggttaccgagattagaagctttttgggtttggcaggttatta 17392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 103459 - 103080
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  103459 tatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 103360  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||    
T  103359 gtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaa 103260  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      || | | ||| || || || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| ||     
T  103259 gaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaattctgattgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccctct 103160  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  103159 aaagttgaagcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 103080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 479
Target Start/End: Original strand, 7209 - 7579
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| | | | |||| |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  7209 aatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactcca 7308  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  7309 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaa 7408  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||    |||| ||| | || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  7409 tgaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggaattgcagtagatccctctaaagttgatgcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 7508  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
       ||||||||||||||| | || ||||| |||||||| || || || || || ||||| || ||||||||    
T  7509 acagaaattagaagctttttgggattggctggttattaccgaagatttatagaaggattttccaagttggc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 426
Target Start/End: Original strand, 38085 - 38387
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |  |||||||| ||||| |    
T  38085 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactacaagtctgaagaagaac 38184  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||    
T  38185 atgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttct 38284  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||| | || |||||||||    
T  38285 tggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagacttctaagtcggttatagagattagaagc 38384  T
Q  424 ttt 426  Q
    |||    
T  38385 ttt 38387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Original strand, 115172 - 115333
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| | ||    
T  115172 gtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatatg 115271  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  115272 ccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttct 115333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2055 - 1695
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||     ||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  2055 ctaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 1956  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  1955 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggtta 1856  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||  ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |    
T  1855 agtgaagtaagttttcttgaccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactccgaagtcag 1756  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
    ||  ||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  1755 ttactgagattagaagtttcctaggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggatt 1695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Original strand, 1969 - 2201
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||| | || || ||  |||| |||||||| |||||||||||| | || ||    
T  1969 ctaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactc 2068  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  ||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  2069 taagtctcaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 2168  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2169 aatgaggtgagttttcttggtcatgttatttct 2201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Original strand, 5209 - 5407
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  5209 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattc 5308  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  5309 taagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggtt 5407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4094 - 3761
Alignment:
Q  113 cgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtc 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||| |    
T  4094 cgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagac 3995  T
Q  213 tgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaa 312  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  3994 tgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagag 3895  T
Q  313 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttg 412  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  |  |||||| |||||||||| |||        
T  3894 gtgagttttcttggcaatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcagtatcacgatgggagactcctaagtcggttacaa 3795  T
Q  413 aaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
      |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  3794 tgattagaagctttttgggtttggctggttatta 3761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 40453 - 40825
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  40453 ctaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 40552  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||     
T  40553 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggtta 40652  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    || ||||| ||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  40653 aatgaagtaagttttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 40752  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  40753 taactgagatcagaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaagggttttcgaagttggc 40825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 476
Target Start/End: Original strand, 45630 - 45888
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    |||||||||||  | ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  45630 gaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgctaa-ttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaa 45728  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaat 416  Q
    |||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| |  || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||   ||||||    
T  45729 gttttcttggccacattatttctggttgtggtattgcagttgatccattgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtctgtgactgaaat 45828  T
Q  417 tagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  45829 cagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagtt 45888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 31439 - 31811
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||| ||| |||||     |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||    
T  31439 ctaatgcgcctggggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattc 31538  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||     
T  31539 taagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggtta 31638  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| || |||||  | ||||||     ||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  31639 agtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggtattggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 31738  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  31739 taactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 31811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Original strand, 11424 - 11591
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  11424 gtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaat 11523  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | | ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11524 tttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttct 11591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 50196 - 49907
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||    
T  50196 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgt 50097  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| ||  | | |||    
T  50096 ctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttcttggacatgttatttctcgtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcgatatcgca 49997  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     |||||| ||| |||||| |||  | | |||||||||||| | || ||||| ||||||||| | || || || || ||||| ||||||||    
T  49996 atgggagactcataagtcagttactaagattagaagctttttgggattggctggttattatagaagatttatagaaggattttctaagtt 49907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53741 - 53662
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||    
T  53741 gatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaa 53662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30963 - 30750
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| || || ||||| ||  |  | | ||| || || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30963 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaaga 30864  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||||   | |||||||  ||| ||||| || || || |||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||       
T  30863 ggtcagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgttgtagatccctctaaagtcgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcagttaca 30764  T
Q  412 gaaattagaagctt 425  Q
    || |||||||||||    
T  30763 gagattagaagctt 30750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 69491 - 69184
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||| || |  |||| ||||||||||||  | ||||||||||   |||    
T  69491 gtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagt 69392  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||| |  ||||||||||| || || || || ||||||    |||||||| | || |||||||| || ||    
T  69391 tgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttcttgttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtggtattgcggttgatccttcaaaagt 69292  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctct 471  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  69291 tgatgcagtatcgcagtgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgtaggttcatagaaggattttca 69192  T
Q  472 aagttggc 479  Q
    ||||||||    
T  69191 aagttggc 69184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 305
Target Start/End: Original strand, 3168 - 3271
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  3168 tattcaaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttct 3267  T
Q  302 ggtt 305  Q
    ||||    
T  3268 ggtt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9062 - 8801
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  9062 tttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaaga 8963  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |  | | ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || ||    
T  8962 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatggtattgcagtggatccgtctaa 8863  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttgg 431  Q
     ||||| || || |  || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8862 agttgaagcggtatcacaatgggagactcctaagtcagttattgagattagaag-tttcttgg 8801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 49290 - 48921
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  49290 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 49191  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||     
T  49190 taagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 49091  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |   |||| ||||| ||||| ||| | |||| |    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||||      
T  49090 agtcaagtaagttttcttggccatatcatttatggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcat 48991  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    || |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  48990 ttattgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 48921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Original strand, 176464 - 176662
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||||| || || || || ||||| || ||| | |||||    
T  176464 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattc 176563  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||| || ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  176564 taagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtt 176662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6055 - 5718
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||  | | | | || || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |    
T  6055 aatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcga 5956  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| ||  |||  |||||| | || ||||||||    
T  5955 agtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaa 5856  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||  ||||||||| | || ||||| || || |||||||||   | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  5855 agaggtaagttttcttggccacgttatttctagtggtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcaagatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 5756  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5755 acagagattagaagctttttgggtttggctggttatta 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13185 - 12848
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||  | | | | || || || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || |    
T  13185 aatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcga 13086  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||  || | | ||| ||  |||  |||||| | || ||||||||    
T  13085 agtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaa 12986  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || || ||||| ||||| || || |||||||  ||||||||| | || ||||| || || |||||||||   | ||| |||||| |||||||||| |||    
T  12985 agaggtaagttttcttggccacgttatttctagtggtggtattgcagtagatccatctaaagttgatgcaagatcgcaatgggagactcctaagtcggtt 12886  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  12885 acagagattagaagctttttgggtttggctggttatta 12848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 476
Target Start/End: Original strand, 9918 - 10270
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  9918 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 10017  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||    
T  10018 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 10117  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||  | | ||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| ||||||||     
T  10118 tggccacattagttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgagattagaag- 10216  T
Q  424 tttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  10217 tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 10270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 326
Target Start/End: Original strand, 5487 - 5689
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  5487 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 5586  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||    
T  5587 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 5686  T
Q  324 tgg 326  Q
    |||    
T  5687 tgg 5689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16876
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||| | || || || ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  17061 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcca 16962  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgt 294  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  16961 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgt 16876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 479
Target Start/End: Original strand, 111784 - 111980
Alignment:
Q  283 ttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgt 382  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||   ||||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |    
T  111784 ttgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctggtggtggtattgcagtagatccctctaaagttgatgcagtat 111883  T
Q  383 tgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
     ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || || || ||||||||  | || ||||| || ||||| || ||||||||    
T  111884 cgcaatgggagactcctaagtcggttacggagattagaagctttttgggattagctggttattacagaagattcattgaaggattttccaagttggc 111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 446
Target Start/End: Original strand, 217542 - 217879
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||   || |||||| | | | | || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | || || |    
T  217542 aatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgatatactcga 217641  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    |||  || ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | | ||  || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  217642 agttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaa 217741  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 408  Q
     || |||||||| ||||| || || ||||||    |||||||| | || ||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  217742 tgaggtgagttttcttggccacgttatttctggtagtggtattgcagtagatccctctaaatttgatgcagtattgcaatgggagactcctaagtcggtt 217841  T
Q  409 tttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
       || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  217842 accgagattagaagctttttgggtttggctggttatta 217879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 446
Target Start/End: Original strand, 916 - 1235
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||   |    
T  916 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaa---c 1012  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || ||    
T  1013 atgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgagagaagtgagctttct 1112  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| |||| |    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||   || |||||||||    
T  1113 tggacatgttatttttggtagtggtattacagtagatccgtctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttacagagattagaagc 1212  T
Q  424 tttcttggtttggccggttatta 446  Q
    ||| | || ||||| ||||||||    
T  1213 tttttgggattggctggttatta 1235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6567
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||||||||  || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  6874 tttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaga 6775  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||    
T  6774 agttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattacagttgatccatcgaa 6675  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||| | |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  6674 agttgatgcaatatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattatcgtaggttcatagaaggatt 6576  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     || |||||    
T  6575 ttcgaagtt 6567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Original strand, 8928 - 9300
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||   ||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  8928 ctaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatgcttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattc 9027  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||     
T  9028 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtta 9127  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
       |||||| |||| ||| | ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  9128 tgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatctaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 9227  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    || |||| |||||||| || || | |||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9228 ttattgagattagaagtttcctcgttttggctggttattaccgcaggtttatagaaggattttcgaagttggc 9300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 44846 - 44995
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||  |  | | |||||| |||||||    
T  44846 gatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 44945  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44946 agtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttct 44995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24400 - 24028
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||  |||| || ||| ||| ||||||    |||||||| ||||| || ||||||||| || | |||||    
T  24400 ctaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattc 24301  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  24300 taagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 24201  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  24200 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggttgtggtattgcagttgatccatcgaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 24101  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    |   |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24100 taactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgaaggattttcgaagttggc 24028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 44537 - 44756
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  44537 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 44636  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| || | ||||||||| |  | ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  44637 taagactaaagaagagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggtta 44736  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  44737 agtgaagtaagttttcttgg 44756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2902 - 2563
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    || ||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  2902 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 2803  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  2802 aaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgagttctggtta 2703  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  2702 agtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcag 2603  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttatta 446  Q
    |   ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  2602 tgactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttatta 2563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35572 - 35481
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  35572 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 35481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 613
Alignment:
Q  59 gaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatcctta 158  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||   |||||||| || || ||  | |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | |     
T  1000 gaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatt 901  T
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    | |||| || || ||||| || || || |||||||||||| | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||    
T  900 tttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttacttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttg 801  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    ||||||||  |  | | ||| || ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || |    
T  800 aaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtag 701  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    |||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  700 atccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggattggctggttatta 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11012 - 10782
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| || ||| | ||||| |    
T  11012 aatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatcttgatttattcta 10913  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    || |||| ||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |     
T  10912 agactgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaag 10813  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  10812 tgaagtaagttttcttggccatatcatttct 10782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 339
Target Start/End: Original strand, 14601 - 14831
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  14601 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcca 14700  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||| || | ||||||    
T  14701 agattgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaa 14800  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14801 agaggtgagttttcttggccatgttatttct 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21035 - 20666
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || |||||    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  21035 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacattttgatctattc 20936  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||| || | ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  20935 tagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 20836  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  20835 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggacccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 20736  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  20735 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttaattgagggattttcaaagtt 20666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25197 - 24828
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || |||||    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  25197 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacattttgatctattc 25098  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||| || | ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  25097 tagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 24998  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  24997 agtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggacccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcgg 24898  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  24897 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttaattgagggattttcaaagtt 24828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22887 - 22661
Alignment:
Q  111 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 210  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||| |||| |  || ||||| ||||||||  ||||||||||| | || || |||    
T  22887 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttgatatactctaag 22788  T
Q  211 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 310  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||   ||| || ||  |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  22787 tctgaagaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatg 22688  T
Q  311 aagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22687 aggtaagttttcttggccatgttattt 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 425
Target Start/End: Original strand, 38014 - 38258
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| |    
T  38014 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcta 38113  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || || |||||| |    
T  38114 aattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccctctaaagtagatgcaat 38213  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
     | ||| |||||| | |||||||| |||   || |||||||||||    
T  38214 atcgcaatgggagacgcctaagtcagttacagagattagaagctt 38258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1179 - 811
Alignment:
Q  108 taatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattca 207  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||    
T  1179 taatgtgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattca 1080  T
Q  208 aagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttga 307  Q
    ||| |||| ||||||||||| || ||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||||||| | ||| |    
T  1079 aagactgaagaagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaa 980  T
Q  308 aggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgt 407  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| |  | ||||| || || ||||||||||| |  || ||||||  ||| ||||| ||    
T  979 atgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcaattgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagaatccgaagtcagt 880  T
Q  408 ttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
       ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  879 gactgagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattttcgaagtt 811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 404
Target Start/End: Original strand, 22305 - 22602
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| | || | |||| ||||| | || ||  |||| || |||||||| |||||||||||| | || ||    
T  22305 ctaatgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttgatatactc 22404  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||   ||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22405 taagtctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 22504  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    || || ||||||||  |||| ||| | ||||||    |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| ||||||||||    
T  22505 aatgaggtgagtttttttggccatattatttctggtagtggtattgctgtagatccgtctaaagttgatgcagtatcacaatgggagactcctaagtc 22602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 50996 - 50627
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    ||| |||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  50996 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 50897  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     | | |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || | |||     
T  50896 tatgactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgtta 50797  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    | |||||| | || ||||| || || ||||||| ||| |  || |||||| |||| ||||| |    
T  50796 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagaggtattgcagttgatccatctaaagttgatgtagtatcacaatgggagactccgaagtcag 50697  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||  ||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  50696 ttactgagattagaagtttcctaggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 50627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31051 - 30812
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || |||||| |  |||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||  || ||||    
T  31051 gatgatattttgatttactccaagtcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgttaaattgt 30952  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || |||||| |||| | |||    
T  30951 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgatacagtatcgca 30852  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagcttt 426  Q
     |||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  30851 atgggagactcctaagtcggttatagagattagaagcttt 30812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 339
Target Start/End: Original strand, 881 - 1161
Alignment:
Q  59 gaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatcctta 158  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||   |||||||| || || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || |||||| | |     
T  881 gaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatt 980  T
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    | |||| |  |||||||| || |||||||||| ||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||    
T  981 tttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttg 1080  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||  || | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1081 aaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttct 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 476
Target Start/End: Original strand, 6468 - 6820
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| || || ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |    
T  6468 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 6567  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||| | || ||    
T  6568 atgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgtgctttct 6667  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||| |||   |||||||| | || ||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||  |||  ||| |||||||||    
T  6668 tggacatgttattgctagtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtgagttactgagattagaagc 6767  T
Q  424 tttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| | || ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||    
T  6768 tttttgggattggctggttattatagaaggtttatagaaggattttccaagtt 6820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3601 - 3386
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  3601 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaactctgaagaagaac 3502  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||| | |||||||||||  |  | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  3501 atgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 3402  T
Q  324 tggtcatgtgatttct 339  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  3401 tggccatgttatttct 3386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3807 - 3428
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| || || ||  | ||||| || | ||| |||||||| ||| ||||| | || |||||| | | | |||| |    
T  3807 tatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 3708  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||    
T  3707 gtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaa 3608  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      |||| | ||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||     ||||||| | || ||||| ||     
T  3607 aaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgagttttcttagacatgttatttctggcaatggtattgcagtagatccgtct 3508  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
    || ||||||||||| | ||| ||| || || ||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3507 aaagttgatgcagtatcgcaatggaagacttctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttatta 3428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 446
Target Start/End: Original strand, 64633 - 64967
Alignment:
Q  112 gcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagt 211  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||||||     
T  64633 gcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaaga 64732  T
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||    
T  64733 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtga 64832  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||| ||||| ||||| ||  | |||||||   |||||||| | || ||||| || || | ||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |    
T  64833 agtaagttttcttggccacattatttctattagtggtattgcagttgatccatcgaaagctgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgact 64932  T
Q  412 gaaattagaagctttctt-ggtttggccggttatta 446  Q
    || |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  64933 gagattagaag-tttcttgggtttggctggttatta 64967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4847 - 4785
Alignment:
Q  33 ggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgcc 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4847 ggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctatgatgcc 4785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17735 - 17521
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  17735 ctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaaga 17636  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| |     
T  17635 agtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgatgcagtatcgcaatgggagactcctaagtcggttata 17536  T
Q  412 gaaattagaagcttt 426  Q
    || ||||||||||||    
T  17535 gagattagaagcttt 17521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11979 - 11610
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||||||  |  | |||||    
T  11979 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattc 11880  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  11879 taagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttg 11780  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||| |    
T  11779 agtgaattaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcaatatcacagtgggagactccgaagtcag 11680  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     |   || |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  11679 ctgcagagattagaag-tttcttgggttgggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 11610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16825 - 16486
Alignment:
Q  109 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 208  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||| |   | |||| || || |||||||| || || |||||||||||| | || || |    
T  16825 aatgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttgatttactcca 16726  T
Q  209 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 308  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || ||| |||| |||||||||||  || | | ||| || |||||||| || || || ||||||||    
T  16725 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaattctggttgaa 16626  T
Q  309 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgc-agtgggagtctcctaagtctgt 407  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||||| || || | || | |||||| |||||||||  ||    
T  16625 agaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtattgcagtagatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaaatgggagactcctaagtgagt 16526  T
Q  408 ttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
    |  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  16525 tactgagattagaagctttttgggattggctggttattat 16486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Original strand, 195659 - 195925
Alignment:
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    |||||| ||||||||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||    
T  195659 tctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatctgaaggttgtcttgcaagtgttg 195758  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    ||||||||  |  | | ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   |  |||||| |||| |    
T  195759 aaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctggtgacggtattgctgtag 195858  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    |||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  195859 atccgtctaaagttgaagcggtatggcaatgggaggctcctaagtcagttatagagattagaagctt 195925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 58130 - 57904
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || ||||| |||||| | || || ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  58130 gtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatg 58031  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgc 377  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||| || || ||||| ||    
T  58030 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtggatccgtctaaagttgaagc 57931  T
Q  378 agtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
     || | ||| |||||| ||||||||||    
T  57930 ggtatcgcaatgggagactcctaagtc 57904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 44
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |  ||    
T  308 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgatttctggttaagtga 209  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
     || ||||| ||||| ||  | ||||||    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |    
T  208 tgttagttttcttggccacattatttcttgtagtggtatttctgttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgact 109  T
Q  412 gaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  108 gaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcaaagtt 44  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 380
Target Start/End: Original strand, 1665 - 1938
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || |||||    ||||||||  | ||||| ||||| ||| || |  ||||    
T  1665 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattcattgatgacattctgattaattc 1764  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    || | | || ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  1765 aaggacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggtta 1864  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  1865 agtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaagttgatgcagt 1938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 16058 - 16466
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||| | ||||| || |    
T  16058 tatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatc 16157  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
    |||| |||||  | ||||| |||||||||||| | || || ||| |||| || ||  ||||||||||||||| |||| | |||||||| || || |||||    
T  16158 gtttcgtggttatattcatcgatgatattttgatatactctaagactgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaa 16256  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      |||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||  | ||| ||||||     |||||||   || ||||| ||     
T  16257 gaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtaagttttcttgaccgtgttatttctggtaatggtattgtggtagatccgtct 16356  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggat 466  Q
    || ||||||| ||| |  ||||| ||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | |||||| | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  16357 aaagttgatgtagtatcacagtgcgagactcctaagtcggttaccgagattagaagctttttgggtttgacaggttattaccgcaggtttatagaaggat 16456  T
Q  467 tctctaagtt 476  Q
    | ||||||||    
T  16457 tttctaagtt 16466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 260
Target Start/End: Original strand, 201548 - 201741
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| |    
T  201548 tatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatc 201647  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaa 260  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  201648 ggtttgtggttgtgtttattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaa 201741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 324795 - 324671
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||  || ||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||| || |    
T  324795 tattcaaggactgaagaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattct 324696  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  324695 ggttaagtgaagtaagttttcttgg 324671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43041 - 42905
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||  |||||||||||| | |||||||||||      
T  43041 tttgtggttgtgtttattgatgatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaaga 42942  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  42941 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 42905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 1605 - 1824
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| || ||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  1605 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 1704  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| ||  || ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||     
T  1705 taagactgaagaagagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 1804  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  1805 aatgaagttagttttcttgg 1824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 23299 - 23530
Alignment:
Q  212 ctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||  |  | | ||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||    
T  23299 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaagtgtgaattctggttgaaaga 23398  T
Q  312 agtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttt 411  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||       
T  23399 agtgagttttcttggccatgttatttctggagatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttaca 23498  T
Q  412 gaaattagaagctttcttggtttggccggtta 443  Q
    || |||||||||||| | ||||| || |||||    
T  23499 gagattagaagctttttgggtttagctggtta 23530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 458
Target Start/End: Original strand, 14833 - 15184
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||| ||| ||||||    ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||    
T  14833 ctaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattc 14932  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| | |||     
T  14933 caagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctagtta 15032  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  |||||||| || || |||||  | ||||||    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| ||||| |    
T  15033 agtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcgg 15132  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |   ||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||||||    
T  15133 taactgagatcagaagttttctgggtttgactggttattaccgcaggttcat 15184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 458 - 615
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| || | ||||||| | |||| ||| ||||| | || ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||      
T  458 tttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcattcagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaa 557  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||    
T  558 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 29007 - 28768
Alignment:
Q  219 agagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagt 318  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||     
T  29007 agagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagc 28908  T
Q  319 ttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaatta 418  Q
    || || |||||  | ||||||    |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||  |||| || |    
T  28907 tttctgggtcacattatttctggtagtggtattgcaatggatccttcgaaggttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtccgtaattgagatca 28808  T
Q  419 gaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcat 458  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28807 gaagttttctgggtttggctggttattaccgcaggttcat 28768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8541 - 8239
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | | | |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||| ||||||| |    
T  8541 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagtctaaggaagaac 8442  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    || |||||||||||| | | || |||||||| |||||||| ||  ||   | ||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||    
T  8441 attctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttct 8342  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| |||||||   |||||||| | || ||||| || || ||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||| ||||    
T  8341 tggacatgttatttctagtagtggtattgcagtagatccatctaaagttgaagcggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttactgagattataagc 8242  T
Q  424 ttt 426  Q
    |||    
T  8241 ttt 8239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 9034
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  9152 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagttct 9053  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagttt 320  Q
     ||| |  |||||||||||    
T  9052 agttaagtgaagtgagttt 9034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36260 - 35894
Alignment:
Q  59 gaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatcctta 158  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||| || || ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||   || |||||| | |     
T  36260 gaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatt 36161  T
Q  159 tctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttg 258  Q
    | |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||     
T  36160 tttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtta 36061  T
Q  259 aaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtgg 358  Q
    | ||||||  |  | | ||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| |    
T  36060 atagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtag 35961  T
Q  359 atccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    |||| || || |||||||  || | ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  35960 atccctctaaagttgatgtggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttatagagattagaagctt 35894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20771 - 20470
Alignment:
Q  124 tttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagc 223  Q
    |||||||| |||||||||   || |||||| | | | |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||  | || || ||| |||| ||||| |    
T  20771 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatttactctaagactgaagaagaac 20672  T
Q  224 atgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttcct 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| || | ||||||  |  | | ||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||    
T  20671 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttct 20572  T
Q  324 tggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagc 423  Q
    ||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || |||||||  || | ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||    
T  20571 tggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccctctaaagttgatgtggtatcgcaatgggagactcctaagtcagttatagagattagaagc 20472  T
Q  424 tt 425  Q
    ||    
T  20471 tt 20470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 476
Target Start/End: Original strand, 49995 - 50364
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||    
T  49995 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattc 50094  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||| || | |||     
T  50095 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgtta 50194  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | || ||| | || || ||||||||||| |  || |||||| |||| || || |    
T  50195 agtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagttgattcatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaaatcag 50294  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    || | || |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  50295 ttatagagattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcatagaaggattttcgaagtt 50364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 10986 - 11138
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  10986 gatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgt 11085  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | || |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  11086 caaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttct 11138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 53169 - 52862
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || || || ||||||||| || | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||      
T  53169 tttgtggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaa 53070  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||  | ||||||    |||||||| | || || || || ||    
T  53069 agttgtatgttaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctggtagtggtattgcagttgacccgtcaaa 52970  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggatt 467  Q
     ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  52969 agttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggatt 52871  T
Q  468 ctctaagtt 476  Q
     || |||||    
T  52870 ttcgaagtt 52862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1936 - 1697
Alignment:
Q  240 gattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||  | ||||||    
T  1936 gattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatttct 1837  T
Q  340 aagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccg 439  Q
        |||||||| | || |||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||  | |||||||| |    
T  1836 ggtagtggtattgcggttgatccttcgaaagttgatgcagtatcgcagtgggagactccgaagtcagtgactgaaatcagaagcttcttgggtttggctg 1737  T
Q  440 gttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  1736 gttattaccgtaggttcatagaagggttttcaaagttggc 1697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4270 - 4083
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |    
T  4270 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaa 4171  T
Q  317 gtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |   | ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  4170 gttttcttggccatgttatttttggtgatggtattgctgtagatccctctaaagttgatgcagtgtcgcaatgggagacgcctaagtc 4083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7866
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||  ||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| |    
T  8161 ttcattgatgatattttgatttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcga 8062  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||  |||| ||||||    ||||||||   || ||||| || || ||||| || ||    
T  8061 aattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtattgaagtagatccgtctaaagttgaagcggt 7962  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||    
T  7961 atcgcaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggattggctggttattatagaaggtttatagaaggattttccaagtt 7866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17357 - 17062
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || |||| ||| |||||  ||  ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| |    
T  17357 ttcattgatgatattttgatttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcga 17258  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagt 380  Q
    | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||  |||| ||||||    ||||||||   || ||||| || || ||||| || ||    
T  17257 aattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtattgaagtagatccgtctaaagttgaagcggt 17158  T
Q  381 gttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     | ||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||    
T  17157 atcgcaatgggagactcctaagtcggttactgagattagaagctttttgggattggctggttattatagaaggtttatagaaggattttccaagtt 17062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 13
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  ||     
T  180 gtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagc 81  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | | ||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  80 tttatgcgaaattatctaagtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttct 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Original strand, 10242 - 10409
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||    
T  10242 gtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagt 10341  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  10342 tgtatgtcaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 10409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1734
Alignment:
Q  181 ttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgcca 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| |    
T  1576 ttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcga 1675  T
Q  281 agttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  1676 aattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttct 1734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1208 - 886
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| |||| |  ||||| || ||||    
T  1208 tattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgt 1109  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | |||||||||||| || | || || ||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  |||| | ||||||    
T  1108 ttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacatgcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaa 1009  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtg 381  Q
     || || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||    ||||||||  ||| || || || |||||||||| |||     
T  1008 attatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttcttggccatatcatttctggtagtggtattgttgtagacccatctaaggttgatgtagta 909  T
Q  382 ttgcagtgggagtctcctaagtc 404  Q
    | ||| |||||| |||| |||||    
T  908 tcgcaatgggagactccaaagtc 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 250744 - 250434
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| |||| || |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || ||      
T  250744 tttgttgttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaaga 250645  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
     ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || ||    
T  250644 ggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctggcagtggtattgcagttgatccatcgaa 250545  T
Q  369 ggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattc 468  Q
     ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||     
T  250544 agttgatgcagtatcacaatgggagactccaaagtcagtaactgaaatcagaagctttttgggtttggctggttattaccgtaggttcatagaaggtttt 250445  T
Q  469 tctaagttggc 479  Q
    || ||||||||    
T  250444 tcaaagttggc 250434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 447
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13671
Alignment:
Q  186 agatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttg 285  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  || | | ||| || |||    
T  13410 agatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattg 13509  T
Q  286 tctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgc 385  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||     ||||||| | |||||||| || || ||||| || || | ||    
T  13510 tctaagtgcgaattctggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtaatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcgc 13609  T
Q  386 agtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattat 447  Q
    | |||| | | |||||||| |||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  13610 aatgggtgacgcctaagtcagttactgagattagaagctttttgggattggctggttattat 13671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40268 - 40107
Alignment:
Q  178 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtg 277  Q
    ||||| || ||||| |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  40268 gtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 40169  T
Q  278 ccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  40168 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttct 40107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 470
Target Start/End: Original strand, 707 - 1070
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| |||| || ||    |||||||| || ||||| ||||| |||||  | |||||    
T  707 ctaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacatttttatctattc 806  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
    ||   | ||||||||||| || || ||   || ||||||||||||  | |||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| | ||| |||||     
T  807 aagaaccgaggaagagcacgcagaacaccagaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttttcgaagtgcgggttctggtta 906  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctg 406  Q
    | |||||||| ||| ||||| ||| | ||||||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||  ||  ||||| |||| ||||| |    
T  907 agggaagtgaattttcttggccatattatttctggtagtggtattgcagtggatccttcaaaggttgatgaagtgtcacaacgggagactccgaagtcgg 1006  T
Q  407 tttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctc 470  Q
    |    || || ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  1007 tgacagagatcagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggtttattgagggattctc 1070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28751 - 28339
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacc 166  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||| || || ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||||||      
T  28751 tatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggata 28652  T
Q  167 gttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 266  Q
      |||||||| ||||| || ||||||||  |  | ||||| | |  ||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28651 aatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaaaagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaa 28552  T
Q  267 ccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcc 366  Q
      | |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||| |    ||||||||   || ||||| ||     
T  28551 gaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttatggtagtggtattgtagttgatccatca 28452  T
Q  367 aaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggat 466  Q
    || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||  |||  ||| |||||||| || || ||||||   |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28451 aaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagttagttactgagattagaagtttcctaggtttgcttggttattaccgcaggttcatagaaggat 28352  T
Q  467 tctctaagttggc 479  Q
    | || ||||||||    
T  28351 tttcgaagttggc 28339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 455
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1302
Alignment:
Q  220 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtt 319  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  1067 gagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 1166  T
Q  320 tccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattag 419  Q
    | || |||||| | ||||||    |||||||| | || ||||| || || |||||||| || |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| || ||    
T  1167 ttctgggtcatattatttctggtagtggtattgcagtagatccatcgaaagttgatgcggtatcacaatgggagactccgaagtcggtaactgagatcag 1266  T
Q  420 aagctttcttggtttggccggttattatcggaggtt 455  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  1267 aagttttctgggtttggctggttattaccgcaggtt 1302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 21635 - 21854
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||  | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  21635 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 21734  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| | || ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||     
T  21735 gaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtta 21834  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  21835 agtgaagtaagttttcttgg 21854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 13456 - 13675
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||  | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  13456 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 13555  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| | || ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  13556 gaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgagttctggtta 13655  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  13656 agtgaagtaagttttcttgg 13675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Original strand, 12481 - 12632
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || || || ||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||      
T  12481 tttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaa 12580  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 320  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||    
T  12581 agttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttt 12632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37739 - 37465
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| ||  |||| |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37739 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagtttt 37640  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaa 401  Q
    |||| |   |||||||||| ||||| ||  | |||| |    |||||||| | || ||||| || || ||||||||| | | ||| || ||| |||| ||    
T  37639 ggttaagtaaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcaatatcgcaatgtgagactccaaa 37540  T
Q  402 gtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    ||| ||   |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  37539 gtcagtaactgaaatcagaag-tttcttaggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagtt 37465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Original strand, 50365 - 50492
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| | || ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  50365 gtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagt 50464  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtt 299  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  50465 tgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 50492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Original strand, 59399 - 59526
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| | || ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  59399 gtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagt 59498  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtt 299  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  59499 tgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 59526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Original strand, 65787 - 65914
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| | || ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  65787 gtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagt 65886  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtt 299  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  65887 tgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 65914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28808 - 28610
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| || |||||  |||| || ||| |||| |||||    |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  28808 ctaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattc 28709  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||| |||| |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  28708 taagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 28610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16261 - 16026
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||    
T  16261 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtcta 16162  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    ||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||    | ||||||| | |||||||| || || ||||| || || | ||| ||    
T  16161 agtgtgaattctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttccggtgatggtattgcagtggatccgtctaaagttgaagcggtatcgcaatg 16062  T
Q  390 ggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctt 425  Q
    |||| |||||||||| |||   || |||||||||||    
T  16061 ggagactcctaagtcagttacagagattagaagctt 16026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2542 - 2375
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |      
T  2542 gtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacc 2443  T
Q  272 tgtgtgccaagtt-gtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 338  Q
    | | ||| || || |||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  2442 tttatgctaacttggtctaagtgtgaattctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 262297 - 262042
Alignment:
Q  220 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtt 319  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  262297 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 262198  T
Q  320 tccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattag 419  Q
    | ||||| ||  | ||||||    ||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||    || || |     
T  262197 ttcttggccacattatttctggtagtggtattgttgttgatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgacagagatcat 262098  T
Q  420 aagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagt 475  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  262097 aagcttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattctcgaagt 262042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4362 - 4164
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||| | || ||| | ||||     
T  4362 ctaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttatta 4263  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
     ||| |||| |||||||||||  | ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4262 taagactgaagaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggtt 4164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20344 - 20055
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||    
T  20344 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgt 20245  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgca 386  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||| || ||||| ||||  ||||||    ||||||||   || ||||| || || |||||||  || | |||    
T  20244 ctaagtgtgaattctggttgaaagaattgagctttcttggacatgctatttctggtagtggtattgtagtagatccgtctaaagttgatgttgtatcgca 20145  T
Q  387 gtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
     |||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| | || ||||| ||||||||  | || ||||| |||||||| || |||||    
T  20144 atgggagactcctaagtcggttacagagattagaagctttttgggattggctggttattacagaagattcatagagggattttccaagtt 20055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 422 - 579
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| || | ||||||| | |||| ||| ||||| | || ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||      
T  422 tttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcattcagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaa 521  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||    
T  522 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 4742 - 4899
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| || | ||||||| | |||| ||| ||||| | || ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||      
T  4742 tttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcattcagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaa 4841  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||    
T  4842 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 4899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 339
Target Start/End: Original strand, 33899 - 34105
Alignment:
Q  133 tacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagc 232  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||| ||||  | || ||||| || || || ||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  33899 tacatgaataaaattttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagc 33998  T
Q  233 atttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgt 332  Q
    |||| | |||| |||||||||| || || || ||  || ||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  33999 atttaaagattatgttgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatat 34098  T
Q  333 gatttct 339  Q
     ||||||    
T  34099 tatttct 34105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 479
Target Start/End: Original strand, 56062 - 56339
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| || |    
T  56062 tattccaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattct 56161  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaa 401  Q
    |||| |  ||||||||||| ||| | ||  | ||||||    ||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| ||    
T  56162 ggttaagtgaagtgagttttcttagccacattatttctggtagtggtattgttgttgatccttcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagactccgaa 56261  T
Q  402 gtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagttggc 479  Q
    ||| ||    || || ||||||||  | |||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  56262 gtcagtgacagagatcagaagcttcttgggtttggctggttattaccgcaagttcattgagggtttctcaaagttggc 56339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7327 - 7175
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    |||||||||||| | || || ||| | |||||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || ||||    
T  7327 gatgatattttgatttactccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgt 7228  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  7227 ctaagtgtgaattctggttaaaagaagtgagttttcttggacatgttatttct 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 330
Target Start/End: Original strand, 42202 - 42450
Alignment:
Q  82 tattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgt 181  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||   || |||||| ||||| |||| || |||||  | ||||    
T  42202 tattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgt 42301  T
Q  182 tcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaa 281  Q
    | |||||||||||| || | || || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||  |||| | |||||     
T  42302 ttatagatgatattctgatatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccag 42401  T
Q  282 gttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcat 330  Q
     || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42402 tttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttggtcat 42450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4840 - 4716
Alignment:
Q  202 tattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtttt 301  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||| |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| || |||||||| |    
T  4840 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagttct 4741  T
Q  302 ggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  4740 ggttaagtgaagtcagttttcttgg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2611
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| ||||| ||||    |||||||| ||||| || ||||||||| |  | |||||    
T  2392 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattc 2491  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || ||||| |   |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  2492 taagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtta 2591  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  2592 agtgaagtaagttttcttgg 2611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Original strand, 10074 - 10241
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    |||||||| || || |||||||| ||  | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||  |||    
T  10074 gtggtggtatttattgatgatatgttaatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtgttacgtgttttgaaagaaaagaagt 10173  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  10174 tgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttct 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 29405 - 29624
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| || ||| ||||| ||||    |||||||| ||||| || ||||||||| |  | |||||    
T  29405 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattc 29504  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || ||||| |   |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  29505 taagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtta 29604  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |  ||||| ||||| |||||    
T  29605 agtgaagtaagttttcttgg 29624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4517 - 4363
Alignment:
Q  256 ttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 355  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||    |    
T  4517 ttgaaggagaagaagttgtttgctaagtcgtcaaagtgtgagttttggttgcaaaaagtgagttttcttaatcatgtgatttcgaagagtggtatagtag 4418  T
Q  356 tggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 410  Q
    ||||||| || || || |||||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  4417 tggatccgtcaaaagtggatgcaatgttgcggtgggagactcagaagtctatttt 4363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 13649 - 13707
Alignment:
Q  11 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtat 69  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13649 atcatcagattacagtgaaggcaaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtat 13707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 298
Alignment:
Q  188 atgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtc 287  Q
    ||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||  |  | | ||| ||||| ||    
T  555 atgatattttgatttactctaagtctgaagaagaacata-tgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatc 457  T
Q  288 taagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcag 387  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    |||||||| |  | ||||| || || ||||||| ||| | |||     
T  456 taactgtgaattttggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttcttgtagtggtattgcattagatccatctaaagttgatgtagtatcgcaa 357  T
Q  388 tgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttcttggtttggccggttatta 446  Q
     ||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  356 cgggagactcctaagtcggttatagagattagaagctttttgggattggctggttatta 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3770
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || ||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtg 389  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | |||||||  ||| ||||| || || || |||||||| | ||| ||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgatgtagatccctctaaagtcgatgcagtatcgcaatg 3755  T
Q  390 ggagtctcctaagtc 404  Q
    |||| | ||||||||    
T  3756 ggagacgcctaagtc 3770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 109754 - 109584
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  || | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||      
T  109754 tttgtggttgtgtttattgatgacatcgtgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaga 109655  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||| ||||| || || ||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  109654 agttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 109584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 326
Target Start/End: Original strand, 1084 - 1193
Alignment:
Q  217 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 316  Q
    |||||| |||| || ||| ||| |||||| |||||||| || || |||||  |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||    
T  1084 gaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaattttggttaagtgaagtga 1183  T
Q  317 gtttccttgg 326  Q
    |||| |||||    
T  1184 gttttcttgg 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 476
Target Start/End: Original strand, 16334 - 16638
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||  ||| |||||  || ||| ||| ||| || |||||| | ||||| || ||  |||    
T  16334 gtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaaaaagtgcatgtagaacatctgaagatagtattgcaaatattgaaggaaaagaagt 16433  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggt 371  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||| | || ||||| || || ||    
T  16434 tgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtattgcagttgatccatcgaaagt 16533  T
Q  372 tgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggccggttattatcggaggttcatcgagggattctc 470  Q
    ||||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  16534 tgatgcagtatcacaatgggagactccgaagtcagtgactgatattagaag-tttcttgggtttggctggttattaccgcaggttcattgagggattttc 16632  T
Q  471 taagtt 476  Q
     |||||    
T  16633 gaagtt 16638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Original strand, 9702 - 9775
Alignment:
Q  232 catttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  9702 catttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 9775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Original strand, 19916 - 19989
Alignment:
Q  232 catttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt 305  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  19916 catttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 19989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 28774 - 28923
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || ||||    
T  28774 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 28873  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    ||||| |||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28874 agtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 28923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 28637 - 28742
Alignment:
Q  161 tggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaa 260  Q
    |||| ||||| ||||| || || || || ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  28637 tggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaa 28736  T
Q  261 agagaa 266  Q
    ||||||    
T  28737 agagaa 28742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36166 - 35930
Alignment:
Q  240 gattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| | |||| |    
T  36166 gattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttat 36067  T
Q  340 aagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgaaattagaagctttctt-ggtttggcc 438  Q
        |||||||| | || ||||| || || ||||||||||| |  || |||||| || | ||||| ||    || |||||||| |||||| ||||||||     
T  36066 ggtagtggtattgcagttgatccatcaaaagttgatgcagtatcacaatgggagacttcgaagtcagtgacggagattagaag-tttcttgggtttggct 35968  T
Q  439 ggttattatcggaggttcatcgagggattctctaagtt 476  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  35967 ggttattaccgcaggttcattgagggattttcgaagtt 35930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 80013 - 80170
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||||| || || || |||||||| ||      
T  80013 tttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaaga 80112  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttgg 326  Q
    |||||| ||| || ||||| || || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  80113 agttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttgg 80170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 320
Target Start/End: Original strand, 99682 - 99895
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| || ||| | ||||||||    |||||||| ||||| || ||||| ||| || | |||||    
T  99682 ctaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattc 99781  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     |   |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |  | ||||||||  |||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  99782 tagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 99881  T
Q  307 aaggaagtgagttt 320  Q
    |  |||||||||||    
T  99882 agtgaagtgagttt 99895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1510 - 1278
Alignment:
Q  107 ctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattc 206  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| |||||| ||| ||||||    || ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||    
T  1510 ctaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgatattttaatttattc 1411  T
Q  207 aaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg 306  Q
     ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||||| || || || |||||||| ||  |||||| ||| || ||||| || || |||||||||||     
T  1410 taagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggtta 1311  T
Q  307 aaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  1310 agtgaagtaagtttccttggccatattatttct 1278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 966
Alignment:
Q  187 gatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgt 286  Q
    ||||||||| || | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |  | | ||| ||  | |    
T  1158 gatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaactat 1059  T
Q  287 ctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcag 379  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||   | ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||    
T  1058 ctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatggtattgctgtagatccctctaaagttgatgcag 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 769 - 634
Alignment:
Q  169 tttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaacc 268  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |  | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||      
T  769 tttgtggtggtgtttattgatgacattctaatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaga 670  T
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggt 304  Q
    |||||| ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  669 agttgtatgctaaattgtcgaaatgtgagttttggt 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Original strand, 34682 - 34741
Alignment:
Q  268 cagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggt 327  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34682 cagttgtgtgctaagtagtcgaagtgcgagttttggttgcaagaagtgagtttccttggt 34741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 195313 - 195207
Alignment:
Q  220 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtt 319  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  195313 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 195214  T
Q  320 tccttgg 326  Q
    | |||||    
T  195213 ttcttgg 195207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 7896 - 8045
Alignment:
Q  190 gatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtcta 289  Q
    ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| ||  | ||||    
T  7896 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatcta 7995  T
Q  290 agtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 339  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  7996 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgttatttct 8045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 339
Target Start/End: Original strand, 4587 - 4688
Alignment:
Q  238 aggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 337  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  4587 aggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggtcatattattt 4686  T
Q  338 ct 339  Q
    ||    
T  4687 ct 4688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 376
Target Start/End: Original strand, 5975 - 6082
Alignment:
Q  269 agttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaa 368  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    |||||||  | ||||||||||| ||    
T  5975 agttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatagcagtggatccttcaaa 6074  T
Q  369 ggttgatg 376  Q
    ||||||||    
T  6075 ggttgatg 6082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33455 - 33328
Alignment:
Q  172 gtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagt 271  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | | |||||| || || || |||||||||||  |||    
T  33455 gtggttgtgttcattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagt 33356  T
Q  272 tgtgtgccaagttgtctaagtgtgagtt 299  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  33355 tgtatgccaagttgttaaaatgtgagtt 33328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5332 - 5259
Alignment:
Q  67 tatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaa 140  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  5332 tatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaa 5259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 504 times since January 2019
Visitors: 4087